View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10070_low_2 (Length: 746)

Name: NF10070_low_2
Description: NF10070
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10070_low_2
NF10070_low_2
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (83-729)||(41041311-41041969)
chr8 (83-729)||(40338399-40339065)
chr8 (139-703)||(29237959-29238536)
chr8 (139-703)||(15307058-15307634)
chr8 (139-703)||(15487427-15488003)
chr8 (139-703)||(27404926-27405501)
chr8 (329-729)||(27691905-27692305)
chr8 (279-669)||(5037235-5037625)
chr8 (329-729)||(33707795-33708195)
chr8 (407-729)||(42942533-42942855)
chr8 (407-729)||(22272998-22273328)
chr8 (321-729)||(13485114-13485493)
chr8 (406-710)||(26239504-26239808)
chr8 (296-668)||(3152483-3152863)
chr8 (406-729)||(7744193-7744516)
chr8 (545-729)||(8609008-8609192)
chr8 (545-729)||(38547966-38548150)
chr8 (545-729)||(13107574-13107758)
chr8 (406-710)||(41824733-41825037)
chr8 (461-700)||(9672292-9672531)
chr8 (545-729)||(13283135-13283314)
chr8 (528-703)||(35510181-35510356)
chr8 (528-703)||(33761643-33761818)
chr8 (528-703)||(600809-600984)
chr8 (151-313)||(9672095-9672270)
chr8 (307-664)||(11720339-11720697)
chr8 (139-225)||(41824644-41824730)
chr8 (147-228)||(7744112-7744193)
chr8 (139-228)||(26239415-26239504)
chr8 (325-444)||(12515887-12516006)
chr8 (139-228)||(11720132-11720221)
chr8 (83-140)||(26239309-26239366)
chr8 (325-390)||(28432939-28433004)
chr8 (322-390)||(25371236-25371304)
chr8 (83-126)||(42942874-42942917)
chr8 (83-140)||(13107404-13107461)
chr8 (83-140)||(15307683-15307740)
chr8 (83-140)||(15488052-15488109)
chr8 (83-140)||(27404820-27404877)
chr8 (83-140)||(38548263-38548320)
chr8 (83-140)||(41824539-41824595)
chr8 (83-135)||(22273338-22273390)
chr8 (83-140)||(13283427-13283484)
chr8 (83-133)||(7743998-7744048)
chr8 (322-364)||(10770940-10770982)
chr8 (139-196)||(13107510-13107567)
chr8 (139-196)||(13283321-13283378)
chr8 (139-196)||(38548157-38548214)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (83-729)||(11254657-11255315)
chr4 (139-729)||(35402453-35403053)
chr4 (147-729)||(51012666-51013261)
chr4 (254-729)||(41760637-41761112)
chr4 (279-729)||(49523871-49524321)
chr4 (147-729)||(2692076-2692671)
chr4 (329-728)||(43520178-43520577)
chr4 (345-729)||(42981359-42981743)
chr4 (83-383)||(41760326-41760638)
chr4 (406-729)||(48645809-48646130)
chr4 (406-729)||(54386880-54387203)
chr4 (385-692)||(834096-834402)
chr4 (139-463)||(11641094-11641431)
chr4 (385-692)||(5438561-5438863)
chr4 (83-321)||(42981742-42981993)
chr4 (528-729)||(41782261-41782462)
chr4 (528-703)||(319846-320021)
chr4 (528-703)||(4172686-4172861)
chr4 (528-703)||(33265350-33265525)
chr4 (528-703)||(43507993-43508168)
chr4 (576-729)||(11602416-11602569)
chr4 (551-680)||(11640838-11640967)
chr4 (590-679)||(52867414-52867503)
chr4 (140-228)||(48645721-48645809)
chr4 (166-228)||(54387203-54387265)
chr4 (325-390)||(32652936-32653001)
chr4 (322-390)||(4614587-4614655)
chr4 (322-444)||(28101484-28101606)
chr4 (322-435)||(7150446-7150559)
chr4 (83-140)||(54387335-54387392)
chr4 (139-225)||(833939-834028)
chr4 (83-136)||(48645607-48645660)
chr4 (83-140)||(833833-833890)
chr4 (139-274)||(5438869-5439020)
chr4 (83-140)||(5439069-5439126)
chr4 (83-140)||(51013318-51013375)
chr4 (84-140)||(35402348-35402404)
chr4 (322-377)||(27385571-27385626)
chr4 (325-379)||(13449570-13449624)
chr4 (575-659)||(7150221-7150305)
chr4 (88-140)||(11641480-11641532)
chr4 (227-274)||(834043-834090)
chr4 (87-133)||(2691966-2692012)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (83-729)||(38472851-38473508)
chr7 (83-729)||(46438235-46438895)
chr7 (83-729)||(24227147-24227806)
chr7 (139-729)||(22154639-22155242)
chr7 (139-729)||(22210554-22211157)
chr7 (139-729)||(45360076-45360678)
chr7 (139-729)||(34775745-34776346)
chr7 (139-729)||(35692132-35692735)
chr7 (292-729)||(6604264-6604701)
chr7 (324-729)||(23905232-23905637)
chr7 (139-710)||(47384989-47385576)
chr7 (329-729)||(27665031-27665431)
chr7 (329-729)||(29995501-29995901)
chr7 (372-729)||(39858271-39858627)
chr7 (407-729)||(37114591-37114913)
chr7 (428-729)||(13168822-13169122)
chr7 (270-460)||(69132-69322)
chr7 (515-724)||(38550441-38550650)
chr7 (157-468)||(48310948-48311273)
chr7 (460-729)||(37792150-37792419)
chr7 (528-703)||(35402545-35402719)
chr7 (470-729)||(48851450-48851708)
chr7 (139-312)||(48851253-48851439)
chr7 (535-637)||(69032-69134)
chr7 (139-228)||(38550227-38550316)
chr7 (515-628)||(20478921-20479034)
chr7 (139-222)||(6604699-6604782)
chr7 (633-703)||(66845-66915)
chr7 (322-444)||(11683621-11683743)
chr7 (139-273)||(77252-77399)
chr7 (325-390)||(4321800-4321865)
chr7 (83-140)||(45360727-45360784)
chr7 (337-480)||(7402878-7403021)
chr7 (321-380)||(32840551-32840610)
chr7 (24-78)||(41354213-41354267)
chr7 (325-390)||(34691873-34691938)
chr7 (83-140)||(38550121-38550178)
chr7 (566-681)||(48310750-48310867)
chr7 (328-400)||(34784575-34784647)
chr7 (339-438)||(23168652-23168751)
chr7 (83-132)||(6604839-6604888)
chr7 (83-140)||(34775639-34775696)
chr7 (322-399)||(40360951-40361028)
chr7 (83-140)||(48851147-48851204)
chr7 (575-659)||(13035621-13035705)
chr7 (88-140)||(22155291-22155343)
chr7 (88-140)||(22211206-22211258)
chr7 (279-323)||(23905125-23905169)
chr7 (83-140)||(77448-77505)
chr7 (83-140)||(20479111-20479168)
chr7 (334-390)||(13035937-13035993)
chr7 (325-389)||(48302873-48302936)
chr7 (372-411)||(13169123-13169162)
chr7 (83-126)||(37114529-37114572)
chr7 (683-729)||(30939748-30939794)
chr7 (83-140)||(47384883-47384940)
chr7 (86-140)||(35692029-35692083)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (83-729)||(6798264-6798923)
chr2 (83-710)||(2767691-2768331)
chr2 (83-729)||(17696965-17697624)
chr2 (186-729)||(14387923-14388487)
chr2 (280-729)||(16763704-16764153)
chr2 (83-555)||(34400909-34401394)
chr2 (139-703)||(6784070-6784648)
chr2 (279-729)||(39455918-39456367)
chr2 (139-703)||(24206313-24206900)
chr2 (83-438)||(42518156-42518522)
chr2 (139-498)||(44708604-44708976)
chr2 (372-729)||(19907308-19907664)
chr2 (407-734)||(40560978-40561305)
chr2 (557-729)||(39663994-39664166)
chr2 (583-729)||(44708996-44709142)
chr2 (635-729)||(42518524-42518618)
chr2 (139-228)||(39663847-39663936)
chr2 (322-444)||(4047377-4047499)
chr2 (515-628)||(37021388-37021501)
chr2 (322-493)||(20941686-20941856)
chr2 (139-221)||(19581872-19581954)
chr2 (322-390)||(26581545-26581613)
chr2 (406-485)||(19581960-19582039)
chr2 (322-435)||(161441-161554)
chr2 (83-140)||(39663741-39663798)
chr2 (80-140)||(37021578-37021638)
chr2 (83-126)||(40561324-40561367)
chr2 (83-140)||(6783964-6784021)
chr2 (83-140)||(19581766-19581823)
chr2 (620-665)||(37646238-37646283)
chr2 (325-390)||(38149341-38149406)
chr2 (575-659)||(161216-161300)
chr2 (329-400)||(7744707-7744778)
chr2 (227-274)||(39663948-39663995)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (83-729)||(7371710-7372367)
chr6 (139-729)||(32437864-32438465)
chr6 (139-710)||(18644031-18644623)
chr6 (146-729)||(11355948-11356530)
chr6 (329-729)||(20524126-20524526)
chr6 (279-667)||(32517672-32518060)
chr6 (406-729)||(7050498-7050821)
chr6 (139-451)||(9399135-9399460)
chr6 (406-729)||(10569141-10569462)
chr6 (279-628)||(33267813-33268155)
chr6 (83-312)||(20524583-20524825)
chr6 (406-619)||(6901999-6902212)
chr6 (613-729)||(6900225-6900341)
chr6 (139-228)||(7050821-7050910)
chr6 (139-228)||(10569462-10569551)
chr6 (146-228)||(6902212-6902294)
chr6 (515-618)||(32455022-32455125)
chr6 (83-140)||(7050959-7051016)
chr6 (83-140)||(33267624-33267681)
chr6 (83-140)||(6902350-6902407)
chr6 (83-136)||(9399513-9399566)
chr6 (322-390)||(17935548-17935616)
chr6 (85-140)||(10569599-10569654)
chr6 (83-140)||(11356586-11356643)
chr6 (139-185)||(33267730-33267776)
chr6 (83-124)||(32454888-32454929)
chr6 (86-140)||(32437761-32437815)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (88-729)||(30598940-30599592)
chr3 (89-729)||(43765880-43766533)
chr3 (83-729)||(46198479-46199137)
chr3 (83-729)||(21349453-21350112)
chr3 (86-729)||(44274947-44275601)
chr3 (141-729)||(27897899-27898499)
chr3 (226-729)||(17516069-17516570)
chr3 (166-729)||(2377755-2378324)
chr3 (329-729)||(2660973-2661373)
chr3 (139-607)||(53188482-53188963)
chr3 (329-729)||(44794958-44795358)
chr3 (280-671)||(54899250-54899649)
chr3 (345-729)||(2225165-2225555)
chr3 (320-729)||(46113226-46113635)
chr3 (296-729)||(610353-610786)
chr3 (407-729)||(23292232-23292554)
chr3 (139-445)||(35904531-35904850)
chr3 (406-729)||(48829886-48830209)
chr3 (406-729)||(51685350-51685673)
chr3 (470-729)||(35904851-35905113)
chr3 (545-729)||(41978487-41978671)
chr3 (455-729)||(42280246-42280521)
chr3 (545-729)||(7884094-7884278)
chr3 (528-701)||(38192457-38192630)
chr3 (530-703)||(46609724-46609897)
chr3 (528-703)||(53093197-53093372)
chr3 (528-703)||(46309776-46309951)
chr3 (603-729)||(53190118-53190247)
chr3 (323-493)||(13466154-13466324)
chr3 (575-681)||(24845668-24845776)
chr3 (139-228)||(51685673-51685762)
chr3 (147-228)||(42281795-42281876)
chr3 (173-228)||(48829831-48829886)
chr3 (322-390)||(32843436-32843504)
chr3 (322-389)||(23876220-23876287)
chr3 (83-140)||(2378374-2378431)
chr3 (83-140)||(27897791-27897848)
chr3 (325-390)||(41945414-41945479)
chr3 (83-140)||(51685811-51685868)
chr3 (322-390)||(35862440-35862508)
chr3 (83-136)||(42281937-42281990)
chr3 (139-303)||(13466364-13466547)
chr3 (84-140)||(48829711-48829767)
chr3 (339-390)||(2976359-2976410)
chr3 (83-140)||(7883925-7883982)
chr3 (83-140)||(35904425-35904482)
chr3 (83-140)||(41978784-41978841)
chr3 (83-140)||(53188376-53188433)
chr3 (86-138)||(23292173-23292225)
chr3 (87-138)||(24846009-24846060)
chr3 (671-729)||(54899172-54899230)
chr3 (139-219)||(24845879-24845959)
chr3 (575-659)||(35862691-35862775)
chr3 (328-400)||(49495067-49495139)
chr3 (83-126)||(1847132-1847175)
chr3 (575-664)||(22219218-22219308)
chr3 (94-140)||(35862131-35862177)
chr3 (139-196)||(41978678-41978735)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (139-729)||(50554885-50555488)
chr1 (139-729)||(27088026-27088628)
chr1 (139-729)||(26224327-26224938)
chr1 (83-729)||(15105185-15105841)
chr1 (139-703)||(33599925-33600511)
chr1 (292-729)||(6817664-6818101)
chr1 (279-667)||(45045438-45045826)
chr1 (279-667)||(37345137-37345525)
chr1 (279-667)||(25277302-25277698)
chr1 (329-729)||(46582573-46582973)
chr1 (407-729)||(3012516-3012838)
chr1 (386-729)||(31237556-31237891)
chr1 (407-729)||(51895228-51895550)
chr1 (83-381)||(37087316-37087627)
chr1 (450-729)||(2870338-2870617)
chr1 (545-729)||(34777338-34777522)
chr1 (406-691)||(52642698-52642981)
chr1 (545-729)||(4855167-4855351)
chr1 (528-703)||(8168515-8168690)
chr1 (139-228)||(52642609-52642698)
chr1 (515-628)||(9120813-9120926)
chr1 (147-222)||(6817591-6817666)
chr1 (515-628)||(1443400-1443513)
chr1 (515-628)||(47012213-47012326)
chr1 (322-390)||(42558848-42558916)
chr1 (83-140)||(50554779-50554836)
chr1 (83-140)||(6817477-6817534)
chr1 (83-140)||(31237418-31237475)
chr1 (322-390)||(3369967-3370035)
chr1 (83-138)||(51895166-51895221)
chr1 (83-140)||(1443590-1443647)
chr1 (83-140)||(9120679-9120736)
chr1 (83-140)||(33599819-33599876)
chr1 (83-140)||(52642503-52642560)
chr1 (83-126)||(3012454-3012497)
chr1 (83-126)||(26224221-26224264)
chr1 (83-140)||(4854997-4855054)
chr1 (83-124)||(34777168-34777209)
chr1 (83-140)||(47012079-47012136)
chr1 (575-659)||(3370338-3370422)
chr1 (328-400)||(51122987-51123059)
chr1 (83-124)||(27088693-27088734)
chr1 (139-196)||(34777274-34777331)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (139-729)||(21841740-21842344)
chr5 (139-729)||(2180514-2181113)
chr5 (139-703)||(42472265-42472841)
chr5 (129-502)||(28821360-28821746)
chr5 (329-729)||(2853253-2853653)
chr5 (372-729)||(12737844-12738200)
chr5 (372-729)||(12800667-12801023)
chr5 (386-729)||(30464679-30465022)
chr5 (407-733)||(32134897-32135223)
chr5 (407-729)||(8540410-8540732)
chr5 (83-427)||(18624044-18624398)
chr5 (139-423)||(17577011-17577309)
chr5 (139-423)||(17575700-17575998)
chr5 (516-729)||(28821119-28821332)
chr5 (139-423)||(17574980-17575278)
chr5 (545-729)||(7268584-7268768)
chr5 (83-283)||(34328108-34328321)
chr5 (578-729)||(24540425-24540576)
chr5 (426-643)||(41494524-41494741)
chr5 (515-628)||(40781430-40781543)
chr5 (516-628)||(29620912-29621024)
chr5 (325-390)||(1344283-1344348)
chr5 (322-388)||(28036377-28036443)
chr5 (83-140)||(2181162-2181219)
chr5 (329-390)||(18341214-18341275)
chr5 (325-435)||(1343744-1343854)
chr5 (83-140)||(21842393-21842450)
chr5 (83-140)||(42472159-42472216)
chr5 (328-400)||(27349967-27350039)
chr5 (83-140)||(17575326-17575383)
chr5 (83-140)||(17576046-17576103)
chr5 (83-140)||(17577357-17577414)
chr5 (83-140)||(29620778-29620835)
chr5 (83-140)||(30464541-30464598)
chr5 (83-124)||(40781636-40781677)
chr5 (87-140)||(41494437-41494490)
chr5 (87-126)||(18341571-18341610)
chr5 (83-133)||(32134835-32134885)
chr5 (139-196)||(7268782-7268839)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (279-729)||(9008-9458)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (146-729)||(107376-107970)
scaffold0004 (83-140)||(107263-107320)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (146-729)||(301-891)
scaffold0345 (83-140)||(947-1004)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (515-729)||(4043-4257)
scaffold0058 (515-729)||(5215-5429)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (227-581)||(1403-1752)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 474; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 41041311 - 41041969
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041311 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 41041410  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||             |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  41041411 gattttgtcttttgattgtataggatgacggtgaaaattgtaaaatttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactatgttattttaaaaacaatggtgt 41041510  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041511 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaaggatagggggagagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 41041610  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
T  41041611 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtccatgtaatgttgtaatg 41041710  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41041711 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtc-caaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaat 41041809  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041810 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagataccattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 41041909  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  41041910 gacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatctgatgt 41041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 40338399 - 40339065
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40338399 gagagtttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatgattatgtgatgcgtgaatgatttgtttaaatagtact 40338498  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||             |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40338499 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtaaaaattgtaatttttttgtgtgagttgatgaagctgaagaactagactattttaaaaacaatggtgt 40338598  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338599 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccagaggatacggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 40338698  T
Q  370 agt--------gagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatg 461  Q
    |||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  40338699 agttaggaagtgagcttaggctgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcc-tgtaatg 40338797  T
Q  462 ttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgat 561  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  40338798 ttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgat 40338897  T
Q  562 cctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt 661  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338898 cctcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt 40338997  T
Q  662 aaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  40338998 aaaagacagacactttgattataaaaagacatacatttgcataccatcataactcatatatttgatgt 40339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 29238536 - 29237959
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              
T  29238536 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaatttttttgtgtgg 29238437  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29238436 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaag 29238337  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29238336 aggtttgaagggcaaggttggtggataaagttgattgtgtaggaagtaagcttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttggttgagttatt 29238237  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  29238236 taaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacat 29238137  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  29238136 tggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 29238037  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29238036 catttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 29237959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15307634 - 15307058
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              
T  15307634 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaatttttttgcgtgg 15307535  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15307534 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaag 15307435  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15307434 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 15307335  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  15307334 taaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacat 15307235  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  15307234 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 15307135  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15307134 catttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15307058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 15488003 - 15487427
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              
T  15488003 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaatttttttgcgtgg 15487904  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15487903 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaag 15487804  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15487803 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 15487704  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  15487703 taaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacat 15487604  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  15487603 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 15487504  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    | || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15487503 catttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15487427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Original strand, 27404926 - 27405501
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||              
T  27404926 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaactgtaatttttttgtgtgg 27405025  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  27405026 gttgatgaagctgaagaa-taggctattttaaaaacaatgatgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatcaagaagccaaatgataggggcagagaag 27405124  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405125 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaagtgaacttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 27405224  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  27405225 taaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacat 27405324  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  27405325 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 27405424  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27405425 cctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 27405501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 27692305 - 27691905
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27692305 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttaaa 27692206  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  27692205 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 27692106  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692105 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 27692006  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27692005 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 27691906  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  27691905 t 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 279 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5037625 - 5037235
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037625 aagaaatgcaaggttgatggataagccaaatgataggggaagagaagaggtttggaaggcaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 5037526  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5037525 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggt 5037426  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    ||||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037425 tgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaagaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 5037326  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5037325 tatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 5037235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Original strand, 33707795 - 33708195
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33707795 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaa 33707894  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  33707895 aatgatattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 33707994  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33707995 tcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgttcct 33708094  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  33708095 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacagacattttcatatcatcataagtcatatatttgatg 33708194  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  33708195 t 33708195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42942855 - 42942533
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  42942855 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 42942756  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942755 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 42942656  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  42942655 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcatacc 42942556  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  42942555 atcataagtcatatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22273328 - 22272998
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22273328 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatcaaac 22273229  T
Q  499 atttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttg 598  Q
     ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273228 ctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttg 22273129  T
Q  599 aattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatt 698  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22273128 aattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaagagacaggcaat 22273029  T
Q  699 tgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22273028 tgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22272998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 321 - 729
Target Start/End: Original strand, 13485114 - 13485493
Alignment:
Q  321 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgag 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  13485114 agaaaaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagcgaacttatgttgattaagatattgatatgagtattttattcgattgag 13485213  T
Q  421 ttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaat 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          |||    
T  13485214 ttgtttaaaatgctattgtattgtaccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaa----aat 13485309  T
Q  521 caaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcact 620  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||                    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13485310 caaattggtccttgaattatgtacatatccatcatatcgat--------------------catcaaataggtccttcaattttcacaacagatatcact 13485389  T
Q  621 gtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatat 720  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||||||    
T  13485390 gtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgattataaaaa-acagacatttgcataccatcataaatcatat 13485484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 406 - 710
Target Start/End: Original strand, 26239504 - 26239808
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  26239504 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtatcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 26239603  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       ||||||| |||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26239604 tcaaaaaatttcaatccaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttc 26239703  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||     
T  26239704 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcatac 26239803  T
Q  706 catca 710  Q
    |||||    
T  26239804 catca 26239808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 296 - 668
Target Start/End: Original strand, 3152483 - 3152863
Alignment:
Q  296 tggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatatt 395  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3152483 tggagaagccaaaggatagtgttagagaagaggcttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtataggaagtgagcttaggttgattaaaatatt 3152582  T
Q  396 gataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttg--------taataaaaagaggttgtcaatga 487  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||   ||||||||||        |||| |||||| |||||||||||    
T  3152583 gataggagtaatttgtttgattaagtcgtttaaaatgttattttattgtgtcaagtgtgtgtaatgttgtaatgttataatgaaaagaagttgtcaatga 3152682  T
Q  488 atgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaa 587  Q
    ||||||  |||  |||| ||       |||||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3152683 atgaattcaacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccccaaattagtgaaattaccatcaa 3152782  T
Q  588 ataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 668  Q
    ||  || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3152783 atcagttcttgaattttcacaacataaatcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaaagac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Original strand, 7744193 - 7744516
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||  ||||     
T  7744193 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtataatgttgtaatgaaaagaggctgtcaatgaatgaatttaacccttctg 7744292  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7744293 tcaaaaaatttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttc 7744392  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    ||| || || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  7744393 acatcatatttcacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 7744492  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | |||||| |||||||||    
T  7744493 catcataagtcatacatttgatgt 7744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Original strand, 8609008 - 8609192
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609008 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 8609107  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  8609108 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgt 8609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 38548150 - 38547966
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548150 atatccatcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 38548051  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  38548050 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Original strand, 13107574 - 13107758
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107574 atatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13107673  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  13107674 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgt 13107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 406 - 710
Target Start/End: Original strand, 41824733 - 41825037
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||     
T  41824733 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagcctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctg 41824832  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||| ||  ||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41824833 tcaaaaaaattcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttc 41824932  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||     
T  41824933 acaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcatac 41825032  T
Q  706 catca 710  Q
    |||||    
T  41825033 catca 41825037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 461 - 700
Target Start/End: Original strand, 9672292 - 9672531
Alignment:
Q  461 gttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcga 560  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||| ||||||    
T  9672292 gttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatccaacccttctgtcgaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcga 9672391  T
Q  561 tcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaag 660  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9672392 tccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaag 9672491  T
Q  661 taaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttg 700  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9672492 taaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttg 9672531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13283314 - 13283135
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283314 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13283220  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13283219 tcaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 13283135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 35510356 - 35510181
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||    
T  35510356 gtccttaaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtcc 35510257  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35510256 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 33761643 - 33761818
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33761643 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 33761742  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  33761743 tttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcat 33761818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 600809 - 600984
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  600809 gtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcc 600908  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600909 tttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 600984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 313
Target Start/End: Original strand, 9672095 - 9672270
Alignment:
Q  151 gtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagct 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||||||||    
T  9672095 gtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataagatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagct 9672194  T
Q  238 ggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggata 313  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9672195 gaagaactaagttattttaaaaacaatggtgctgatcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccacaggata 9672270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 307 - 664
Target Start/End: Original strand, 11720339 - 11720697
Alignment:
Q  307 aaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtat 406  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||     
T  11720339 aaggatagtggcagtgaagaggtttgaaggacaaggttgatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttaataggagtaa 11720438  T
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaat-caaacatttctc 505  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||  || ||  |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| |     
T  11720439 tttgtttgtttaagttgtttaacatgctactgtattgtgctaattctgtgtaatattgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaatgcaaccattt-tg 11720537  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtg-aaaataccatcaaataggtccttgaatttt 604  Q
    ||       ||| |||||||| |||||| |||| | | | |||  |||| |||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  11720538 tcaaaatctttccatcaaattggtccttaaattgtttgtctatatatcaaatcgattcctacattagtgaaaaatatcatcaaataagtccttgaagttt 11720637  T
Q  605 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 664  Q
       || | ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720638 ttaaaaatatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 41824644 - 41824730
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaa 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824644 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaa 41824730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 228
Target Start/End: Original strand, 7744112 - 7744193
Alignment:
Q  147 ttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744112 ttatgtgatgtgtgaatgatttgttaaaataatactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 7744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 26239415 - 26239504
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239415 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaagtaatactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 26239504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 444
Target Start/End: Original strand, 12515887 - 12516006
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 424  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||   || |||| ||| ||||||| |    
T  12515887 gaggtttggagggaaatgttgatggacaaagttgattgtatgggaagtgagcttaggttgattaagtttttaatagtcataatttgcttgtttgagtttt 12515986  T
Q  425 ttaaaatgctattgcattgt 444  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  12515987 ttaacatgctattgtattgt 12516006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 11720132 - 11720221
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  11720132 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaagttctactgattttgaattttctttgtacaagatgatggtgaaaattgtgaatt 11720221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 26239309 - 26239366
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26239309 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgtagtaagaaaagccaacactgtcaa 26239366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Original strand, 28432939 - 28433004
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  28432939 gaggtttggagggcaaggttgatgggcaaagttgattgtataagaagtgagctgagggtgattaag 28433004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Original strand, 25371236 - 25371304
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25371236 gaagatgtttggagagcaagattgatggacaaagttgagtgtgtaggaagtgaacttaggttgaataag 25371304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 42942917 - 42942874
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42942917 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaa 42942874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 13107404 - 13107461
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13107404 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 13107461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15307740 - 15307683
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15307740 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 15307683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15488109 - 15488052
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  15488109 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 15488052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 27404820 - 27404877
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  27404820 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 27404877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38548320 - 38548263
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  38548320 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagcaaacactgtcaa 38548263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 41824539 - 41824595
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41824539 gagagtttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaagt-aacactgtcaa 41824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22273390 - 22273338
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  22273390 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacact 22273338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13283484 - 13283427
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||||    
T  13283484 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacaacaaacactgtcaa 13283427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Original strand, 7743998 - 7744048
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaaca 133  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7743998 gagagcttcattgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaaca 7744048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 364
Target Start/End: Original strand, 10770940 - 10770982
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10770940 gaagaggtttggaaggcaaggttgatggacaaagttgactgtg 10770982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 13107510 - 13107567
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttg 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13107510 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttg 13107567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13283378 - 13283321
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttg 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13283378 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttg 13283321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38548214 - 38548157
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttg 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  38548214 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttg 38548157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 469; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 11254657 - 11255315
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11254657 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatgattatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 11254756  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11254757 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtggttgatgaagccgaagaactatgctattttaaaaacaatggtgct 11254856  T
Q  271 ggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaa 370  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11254857 ggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgttggataaagttaattgtgtaggaa 11254956  T
Q  371 gtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataa 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  11254957 gtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattatattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatga 11255056  T
Q  471 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||       ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11255057 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaatttcaatcaaattgatcgttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaatt 11255156  T
Q  571 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaa 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  11255157 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattagtgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaagacag 11255256  T
Q  671 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11255257 acactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Original strand, 35402453 - 35403053
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||              
T  35402453 aacaatggtcatgtgatgtgtcaatggtttgtttaaatagtactgattttgtcttttgat---ataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 35402549  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35402550 gttgatgaagctgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaaggataggggcagagaag 35402649  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35402650 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttttttgattgagttgtt 35402749  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||    
T  35402750 taaaatgctattgtactgtgccaagtccgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaatttcaatcaaat 35402849  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402850 tggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 35402949  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  35402950 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacgacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 35403049  T
Q  726 atgt 729  Q
    ||||    
T  35403050 atgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 51013261 - 51012666
Alignment:
Q  147 ttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattg-------------atga 233  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||    
T  51013261 ttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttaatga 51013162  T
Q  234 agctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttgg 333  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51013161 agctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttgg 51013062  T
Q  334 agggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51013061 agggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtaagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgggttgtttaaaatgc 51012962  T
Q  434 tattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtcctt 533  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| ||||||    
T  51012961 tattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctatcaaaaaaattcaatcacattggtcctt 51012862  T
Q  534 gaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtg 633  Q
    |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51012861 gaattatatgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaattttcacaacagatattactgcgatccttggtg 51012762  T
Q  634 catacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  51012761 catacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 729
Target Start/End: Original strand, 41760637 - 41761112
Alignment:
Q  254 ttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataa 353  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760637 ttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataa 41760736  T
Q  354 agttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  41760737 agttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgttgaaaatgctattgtattgtgccaagtcc 41760836  T
Q  454 atgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatc 553  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  41760837 atgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctggcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatc 41760936  T
Q  554 atatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760937 atatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataccagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaag 41761036  T
Q  654 taaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  41761037 taaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 279 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 49524321 - 49523871
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524321 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 49524222  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49524221 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatattattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggt 49524122  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524121 tgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 49524022  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49524021 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatataactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 49523922  T
Q  679 attataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  49523921 attataaaaacacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 147 - 729
Target Start/End: Original strand, 2692076 - 2692671
Alignment:
Q  147 ttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatga 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||             |||||    
T  2692076 ttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaattgtactgattttgaattttctttgtataggacgacggtgaaaattgtcaattttttgtctgggttgatga 2692175  T
Q  234 agctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttgg 333  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  2692176 agctgaagaactaggttattttaaaaacaatgatgcaggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagctaaaggatagtggcagagaagaggtttgg 2692275  T
Q  334 agggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  2692276 agggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtcagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattaagttgtttaaaatgt 2692375  T
Q  434 tattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtcctt 533  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||   |||| ||       ||| |||||||| ||||||    
T  2692376 tattgtattgtgccaagtctctgtaatgttgtaattaaaagaggttgtcaacgaatgaattcaatccttctgtcaaaaaatttccatcaaattggtcctt 2692475  T
Q  534 gaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtg 633  Q
      ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  2692476 ctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtt 2692575  T
Q  634 catacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  2692576 catacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 2692671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 329 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 43520577 - 43520178
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520577 tttggaggacaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 43520478  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  43520477 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 43520378  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520377 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 43520278  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  43520277 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 345 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42981743 - 42981359
Alignment:
Q  345 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgt 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42981743 gatggataaagttgattgtgtaggaaatgagcttagattgattaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgt 42981644  T
Q  445 gtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatat 544  Q
    | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42981643 gccaagttcatgtattgttgtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatac 42981544  T
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981543 atatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggtatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 42981444  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42981443 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 83 - 383
Target Start/End: Original strand, 41760326 - 41760638
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760326 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaatccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 41760425  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41760426 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactgagctattttaaaaacaatggtgc 41760525  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41760526 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggata-ggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatgcataaagttgattgggtagga 41760624  T
Q  370 agtgagcttaggtt 383  Q
    ||||||||||||||    
T  41760625 agtgagcttaggtt 41760638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Original strand, 48645809 - 48646130
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||  ||||     
T  48645809 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaacccttctg 48645908  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48645909 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 48646008  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||     
T  48646009 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcatac 48646106  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  48646107 catcataagtcatatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 54387203 - 54386880
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  54387203 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 54387104  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54387103 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttcgattgtatgtctctccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 54387004  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  54387003 acaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 54386904  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | |||||| |||||||||    
T  54386903 catcataagtcatacatttgatgt 54386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 385 - 692
Target Start/End: Original strand, 834096 - 834402
Alignment:
Q  385 attaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaa 484  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  834096 attaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaa 834195  T
Q  485 tgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccat 584  Q
    |||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||    
T  834196 tgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacat 834295  T
Q  585 caaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattata 684  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  834296 caaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatata 834394  T
Q  685 aaaagaca 692  Q
    ||||||||    
T  834395 aaaagaca 834402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 139 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11641431 - 11641094
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||              
T  11641431 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttttttaaattgtactgattttgaattttctttgtataggatgatggtgaaaattgtcaattttttgtctgg 11641332  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | | |||||    
T  11641331 gttgatgaagctgaataactaggttattttaaaaacaatggtgatggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaaggatactagcaaagaag 11641232  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11641231 aggattggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaacttaggttgattaagatgttgataggagtaatttgtttgattgagttgtt 11641132  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgtt 463  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||  |||||||||    
T  11641131 taaaatgttattgtattgtgaaaagtctgtgtaatgtt 11641094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 385 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5438863 - 5438561
Alignment:
Q  385 attaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaa 484  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5438863 attaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaa 5438764  T
Q  485 tgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccat 584  Q
    |||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||    
T  5438763 tgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacat 5438664  T
Q  585 caaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattata 684  Q
    ||||    |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5438663 caaa----tccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatata 5438569  T
Q  685 aaaagaca 692  Q
    ||||||||    
T  5438568 aaaagaca 5438561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42981993 - 42981742
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42981993 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgttttgtaaggaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttatttaaatagtact 42981894  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||             ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981893 gattttgccttttgattgtacaggatgaaggtaaaaattgtaaattttttgtgtggcttgatgaagttgaagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 42981794  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggaga 321  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981793 tggtcatggaagaaatccaatgttgatggagaagccaaaggatagggggaga 42981742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 528 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41782462 - 41782261
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41782462 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatcc 41782363  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 727  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||| | ||||||||||||||    
T  41782362 ttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttgat 41782263  T
Q  728 gt 729  Q
    ||    
T  41782262 gt 41782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 319846 - 320021
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  319846 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 319945  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  319946 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 320021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 4172686 - 4172861
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4172686 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 4172785  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4172786 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 4172861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 33265525 - 33265350
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33265525 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 33265426  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33265425 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 33265350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 43508168 - 43507993
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  43508168 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatcc 43508069  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43508068 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 43507993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 576 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11602569 - 11602416
Alignment:
Q  576 aaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacact 675  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11602569 aaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 11602470  T
Q  676 ttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||||||||    
T  11602469 ttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgt 11602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 551 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 11640967 - 11640838
Alignment:
Q  551 atcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaaca 650  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11640967 atcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaaca 11640868  T
Q  651 aagtaaaaagtaaaagacaaacactttgat 680  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11640867 aagtaaaaagtaaaaaacatacactttgat 11640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 590 - 679
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867503
Alignment:
Q  590 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttga 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttga 52867503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 228
Target Start/End: Original strand, 48645721 - 48645809
Alignment:
Q  140 acaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48645721 acaatggttatgcgatgtgtgaatgatttgttaaaatagtactgattttgccttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 48645809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54387265 - 54387203
Alignment:
Q  166 tttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387265 tttgttaaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 54387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32653001 - 32652936
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32653001 gaggtttggagggcaaggttgatggaaaaagttgattgtataggaagtgagcttagggtgattaag 32652936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4614655 - 4614587
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4614655 gaagaggtttggagggcatggttgatggacaaagttgactatgtaggaagtgagcttaagttgattaag 4614587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 444
Target Start/End: Original strand, 28101484 - 28101606
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||||   || | | | || ||||||    
T  28101484 gaagaggtttggagggcaaggtcgatggacaaagttgactgtgtagaaaatgaacttaggttgattaagtatttgatagtcataatatatctgtttgagt 28101583  T
Q  422 tgtttaaaatgctattgcattgt 444  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  28101584 tgtttaacatgctattgtattgt 28101606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7150559 - 7150446
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||   || |||| ||  ||||||    
T  7150559 gaagaggtttagagggcaaggttgatggacaaagttgactatgtaagaagtgaggttaggttgattaagtatttgatagtcataatttggttttttgagt 7150460  T
Q  422 tgtttaaaatgcta 435  Q
    ||||||| ||||||    
T  7150459 tgtttaacatgcta 7150446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54387392 - 54387335
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54387392 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 54387335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 833939 - 834028
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttt---tgattgtataggatgatggtgaaaattgtaa 225  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  833939 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgatgattgtataggatgattgtgaaaactgtaa 834028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 48645607 - 48645660
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48645607 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactg 48645660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 833833 - 833890
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  833833 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 833890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5439020 - 5438869
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgat---tgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||| ||           
T  5439020 aacaatggttatttgatgtataaatattttgtttaaattatactgattttgtcttttgatgattgtataggatgattgtgaaaactgtaatttttttgtg 5438921  T
Q  229 ------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtc 274  Q
          |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5438920 tgggttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgctggtc 5438869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5439126 - 5439069
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  5439126 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 5439069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 51013375 - 51013318
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  51013375 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 51013318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 35402348 - 35402404
Alignment:
Q  84 agagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35402348 agagcttcgatgttggtgtccaagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactatcaa 35402404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27385626 - 27385571
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagct 377  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  27385626 gaagaggtttggaagacaaggttgatggacaaagttgattgtataggaactgagct 27385571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 379
Target Start/End: Original strand, 13449570 - 13449624
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctta 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  13449570 gaggtttggagggcaaagttgatggacaaagttgattgcatatgaagtgagctta 13449624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 659  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11641532 - 11641480
Alignment:
Q  88 cttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11641532 cttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaa 11641480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 834043 - 834090
Alignment:
Q  227 ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtc 274  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  834043 ttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgatggtc 834090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 133
Target Start/End: Original strand, 2691966 - 2692012
Alignment:
Q  87 gcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaaca 133  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  2691966 gcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaaca 2692012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 38472851 - 38473508
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38472851 gagagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaacaatact 38472950  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||            |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38472951 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaattttttgtgtgggttgatgaagctgaataactaggcaattttaaaaacaatggtgct 38473050  T
Q  271 ggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaa 370  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473051 ggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaa 38473150  T
Q  371 gtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataa 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  38473151 gtgaacttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtccatgtaatgttgtaatga 38473250  T
Q  471 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  38473251 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctcaaatt 38473350  T
Q  571 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaa 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  38473351 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa-acat 38473449  T
Q  671 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  38473450 acactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38473508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 46438235 - 46438895
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46438235 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaaaaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 46438334  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||             ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46438335 gaatttgtcttttgattgcattggatgatggtgaaaattgtaatttttttgtgtgggttgatgaagttgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgc 46438434  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggg-gagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg 368  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46438435 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatagagaagccaaaggataggggggagagaagaagtttggaggacaaggttgatggataaagttgactgtgtagg 46438534  T
Q  369 aagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaat 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  46438535 aagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttggttgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtact 46438634  T
Q  469 aaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaa 568  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||       |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46438635 gaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctatatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaa 46438734  T
Q  569 ttagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 668  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  46438735 taagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaagac 46438834  T
Q  669 aaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  46438835 aaacactttgattatagaaagacggacatttgcataccatcataagtcatatatttaatgt 46438895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 24227147 - 24227806
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24227147 gagagcttcaatgttagtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgttaacaatgattatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatattact 24227246  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24227247 gattttgtcttttgattgtataggatgacggtggaaattgtgaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggctattttaaaaacaatggtac 24227346  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    | ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227347 tagtcatggaagaaatgcaagtttgatggagaagtcaaacgataaggggagagaagaagtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 24227446  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  24227447 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgcaatg 24227546  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||       ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  24227547 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccttgttgtcaaaaaatttcaatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctcaaat 24227646  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227647 tagtgaaaataccatcaaataggacatttaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 24227746  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  24227747 gacactttgattacaaaaagacagacatttgtataccatcataaatcatatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22155242 - 22154639
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  22155242 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgaatttgtcctttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaatatttttttgtgg 22155143  T
Q  227 -ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
     ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22155142 gttgatgaagttgaagaactaggttattttaaaaacaatgatgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaag 22155043  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22155042 aggtttggaggacaaggttgatggataaagttgatcgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgaattgtt 22154943  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||    
T  22154942 taaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaat 22154843  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154842 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 22154743  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22154742 ccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 22154643  T
Q  726 atgt 729  Q
    ||||    
T  22154642 atgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 22211157 - 22210554
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  22211157 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgaatttgtcctttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaatatttttttgtgg 22211058  T
Q  227 -ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
     ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22211057 gttgatgaagttgaagaactaggttattttaaaaacaatgatgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaag 22210958  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22210957 aggtttggaggacaaggttgatggataaagttgatcgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgaattgtt 22210858  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||    
T  22210857 taaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaat 22210758  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210757 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 22210658  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22210657 ccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatatttg 22210558  T
Q  726 atgt 729  Q
    ||||    
T  22210557 atgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 45360678 - 45360076
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  45360678 aacaatggttatgtgatgtgcgaatggtctgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 45360579  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  45360578 gtggatgaagctgaaaaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaaggataggggcggagaag 45360479  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45360478 aggtttggagggcaaggttgatggaaaaagttgattgtataggaagtgagtttaggttgattaagatattgataggagtattttgttggattgagttgtt 45360379  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||    
T  45360378 taaaatgctaatg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaatttcaatcaaat 45360280  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45360279 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaattttcacaacatatatcactgtgat 45360180  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  45360179 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagataaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttg 45360080  T
Q  726 atgt 729  Q
    ||||    
T  45360079 atgt 45360076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Original strand, 34775745 - 34776346
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||              
T  34775745 aacaatggttatatgatgtgcgaatggtttgtttaaatagtattgattttgtcttttggttgtataggatgatggtgaaaattgtaaatttttgtgtggg 34775844  T
Q  229 --gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaaga 326  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  34775845 ttgatgaagctgaagaactaggttattttaaaaataatggtactagtcatggaagaaatgtaaggttgatggagaagccaaatgataggggcaaagaaga 34775944  T
Q  327 ggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttt 426  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34775945 ggtttggagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggtgtattttgtttgattgagttgttt 34776044  T
Q  427 aaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatt 526  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       || |||||||||    
T  34776045 aaaatgctattg-attgtcccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaactcttctgtcaaatttttttaatcaaatt 34776143  T
Q  527 tgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 626  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34776144 ggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaattttcacaacagatatcactgtgatc 34776243  T
Q  627 cttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttga 726  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  34776244 cttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaagacagacactcagattataaaaagacaaacatttgcataccatcataaatcatatatttga 34776343  T
Q  727 tgt 729  Q
    |||    
T  34776344 tgt 34776346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Original strand, 35692132 - 35692735
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||              
T  35692132 aacaatggttatgtgatgtgtgaatgttttctttaaattatattgattttgtcttttgattgtataagatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 35692231  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctatttt-aaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaa 324  Q
       |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||||||    
T  35692232 gttgatgaagctgaagaactagactatttttaaaaacaacggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaatgatggggacagagaa 35692331  T
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 424  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  35692332 gaggtttggagggcaaggttggtggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataaaagtattttgtttgattgtgttgt 35692431  T
Q  425 ttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaa 524  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||    
T  35692432 ttaaa-tgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaa 35692530  T
Q  525 tttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 624  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692531 ttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtga 35692630  T
Q  625 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatattt 724  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  35692631 tccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaagacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcatatattt 35692730  T
Q  725 gatgt 729  Q
    |||||    
T  35692731 gatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 292 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 6604701 - 6604264
Alignment:
Q  292 ttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaaga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6604701 ttgatggagaagccaaaggataggggcaaagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtataggaagtgagcttaggttgattgaga 6604602  T
Q  392 tattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatga 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6604601 tattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatga 6604502  T
Q  492 atcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatag 591  Q
    ||||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604501 atcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatag 6604402  T
Q  592 gtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagac 691  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6604401 gtccttgacttttcacaacatatatcactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagac 6604302  T
Q  692 aggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6604301 agacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 324 - 729
Target Start/End: Original strand, 23905232 - 23905637
Alignment:
Q  324 agaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttg 423  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23905232 agaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattcagttg 23905331  T
Q  424 tttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaa 523  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       || ||||||    
T  23905332 tttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttaaatcaa 23905431  T
Q  524 atttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtg 623  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23905432 attggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtg 23905531  T
Q  624 atccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatt 723  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23905532 atctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatt 23905631  T
Q  724 tgatgt 729  Q
    ||||||    
T  23905632 tgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 139 - 710
Target Start/End: Original strand, 47384989 - 47385576
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaat----------- 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||               
T  47384989 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatggtactgattttgtcttttgattgtacaggataatggtgaaaattgtaaatcttttgtgtgg 47385088  T
Q  228 --tgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47385089 gttgatgaagctgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagtggcagagaag 47385188  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47385189 aggtttggaaggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtgatttgtttgattgagttgtt 47385288  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtc--------catgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttc 517  Q
    || |||  ||||  |||||| ||||||          |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||       |||    
T  47385289 tagaattttattttattgtgccaagtctgtgtaatgctgtaatgttgtaatgaacagtggttgtcaatgaatgaattcaacctttctgtcaaaaaaattc 47385388  T
Q  518 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 617  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  47385389 aatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaattaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatacatc 47385488  T
Q  618 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 710  Q
    | |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47385489 a-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacattgattgtaaaaagacagacatttacataccatca 47385576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Original strand, 27665031 - 27665431
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665031 tttggaggacaaggttgatggataaaattaactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 27665130  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       || ||||||||| |    
T  27665131 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattgg 27665230  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665231 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 27665330  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27665331 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaggcagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 27665430  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  27665431 t 27665431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Original strand, 29995501 - 29995901
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995501 tttggaggacaaggttgatggataaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 29995600  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||       ||||||||||||      
T  29995601 aatgatattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaacagaggttttcaatgaatgaaccaaacatttctgtcaaaatatttcaatcaaattga 29995700  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29995701 tccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatcct 29995800  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  29995801 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 29995900  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  29995901 t 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 372 - 729
Target Start/End: Original strand, 39858271 - 39858627
Alignment:
Q  372 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39858271 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 39858369  T
Q  472 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39858370 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatga 39858469  T
Q  572 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 671  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39858470 gtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 39858569  T
Q  672 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  39858570 cactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 39858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Original strand, 37114591 - 37114913
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |    
T  37114591 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtattgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatctttttgt 37114690  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114691 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 37114790  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37114791 caacagatatcattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 37114890  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  37114891 atcataagtcatatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 428 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 13169122 - 13168822
Alignment:
Q  428 aaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaattt 527  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||||     
T  13169122 aaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattg 13169024  T
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13169023 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatcc 13168924  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 727  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  13168923 ttggtgcatacattcgctgaacaaaataaaaactaaaagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaatcatatatttgat 13168824  T
Q  728 gt 729  Q
    ||    
T  13168823 gt 13168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 270 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 69322 - 69132
Alignment:
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  69322 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttcattgtgtagga 69223  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaat 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  69222 agtgagcttaggttgattaagatattaatatgagtattttgtttgattgagttgttttaaatactattgtactgtgccaagtccatgtaat 69132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 515 - 724
Target Start/End: Original strand, 38550441 - 38550650
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  38550441 ttcaatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatat 38550540  T
Q  615 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  38550541 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataag 38550640  T
Q  715 tcatatattt 724  Q
    ||||| ||||    
T  38550641 tcatacattt 38550650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 157 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 48311273 - 48310948
Alignment:
Q  157 tgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaa 243  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||             |||||||||| ||||    
T  48311273 tgtgaatggtttgtttaaattgtactgattttaaattttctttgtataagatgatggtgaaaattgtcaattttttatctgggttgatgaagctgaagaa 48311174  T
Q  244 ctaggctattttaa-aaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaagg 342  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| |    
T  48311173 ctatgttatttttataaacaatggtgctggtcatggaaggaatgcaaggttaatggagaagcctaagaatagtggcggagaagaggtttggagggcaatg 48311074  T
Q  343 ttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcatt 442  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  48311073 ttgatggataaagtcgattgtgtaggaagtgaacttaggttgattaagatattgacatgagtaatttgtttgattgaattgtttaaaatgctattatatt 48310974  T
Q  443 gtgtcaagtccatgtaatgttgtaat 468  Q
     |||||||||  ||||||||||||||    
T  48310973 atgtcaagtctgtgtaatgttgtaat 48310948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 460 - 729
Target Start/End: Original strand, 37792150 - 37792419
Alignment:
Q  460 tgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcg 559  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       ||| |||||||| ||||||  |||  || | |||||||||||| |    
T  37792150 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgcatgtctatccatcatattg 37792249  T
Q  560 atcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 659  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37792250 atccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgttgtacaaagtaaaaa 37792349  T
Q  660 gtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  37792350 gtaaaagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgt 37792419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 35402545 - 35402719
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  35402545 gtccttgaattatattca-atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 35402643  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35402644 tttgagcatatatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35402719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 470 - 729
Target Start/End: Original strand, 48851450 - 48851708
Alignment:
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       ||| |||||||| |||| |  ||| ||| | || ||||||||| |||||  ||||    
T  48851450 aaaagaggttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtcaaaatctttccatcaaattggtccctctattgtatgtctacccatcatattgatcca-aaat 48851548  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48851549 tagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgaccaaagtaaaaagtaaaagaca 48851648  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  48851649 gacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgt 48851708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 312
Target Start/End: Original strand, 48851253 - 48851439
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                
T  48851253 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataagatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 48851352  T
Q  227 -ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggat 312  Q
     |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48851353 gttgatgaagctgaagaactagattatttcaaaaacaatggtgctggtaatggaagaaatgcaaggttgatggagaaaccaaaggat 48851439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 535 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  535 aattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 634  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  635 ata 637  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 38550227 - 38550316
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550227 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgattttgtcttttgattttataggatgatggtgaaaattgtaaatt 38550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20479034 - 20478921
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  20479034 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 20478935  T
Q  615 atcactgtgatcct 628  Q
    |||| |||||||||    
T  20478934 atcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6604782 - 6604699
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattg 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604782 aacaatggttatgtgatgtgtgaatagtttgtttaaatagtacttattttatcttttgattgtataggatgatggtgaaaattg 6604699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 633 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66845
Alignment:
Q  633 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcat 66845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 322 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11683743 - 11683621
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||  ||| ||||||    
T  11683743 gaagaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgagtgtataggaagtgagcttaggttgattaagtttttgatagtcataatttacttgtttgagt 11683644  T
Q  422 tgtttaaaatgctattgcattgt 444  Q
    | ||||| ||||||||| |||||    
T  11683643 tttttaacatgctattgtattgt 11683621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 77399 - 77252
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ 226  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                
T  77399 aacaatggttatttaatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 77300  T
Q  227 -ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggt 273  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  77299 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggt 77252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Original strand, 4321800 - 4321865
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4321800 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtaagcttagggtgattaag 4321865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45360784 - 45360727
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45360784 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 45360727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7403021 - 7402878
Alignment:
Q  337 gcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctat 436  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||   |||||||   || |||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  7403021 gcaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggatgtaagattaggttgattaagtatttgatagtcataatttgtttgtttgggttgtttaacatgctac 7402922  T
Q  437 tgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttg 480  Q
    || |||||   | ||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  7402921 tgtattgtactatgtgtgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttg 7402878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32840610 - 32840551
Alignment:
Q  321 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttag 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32840610 agaataggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgaacttag 32840551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 41354213 - 41354267
Alignment:
Q  24 acttattcatcatcaaaacctaaaatacttgtcaattagctgccgaaggtgtgca 78  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354213 acttatacatcatcaaaacttaaaatacttgtcaattagctgccgaaggtgtgca 41354267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34691938 - 34691873
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  34691938 gaggtttggagggcaacgttgatggacaaagttgattgtatatgaagtgaacttaggttgattaag 34691873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 38550121 - 38550178
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38550121 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 38550178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 566 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 48310867 - 48310750
Alignment:
Q  566 aaattagtgaaaa-taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaa 663  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48310867 aaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatcaatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaa 48310768  T
Q  664 aagacaaacactttgatt 681  Q
    |||||| |||||||||||    
T  48310767 aagacagacactttgatt 48310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Original strand, 34784575 - 34784647
Alignment:
Q  328 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 400  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34784575 gtttgaagggcaatgttgatggacaaagttgattgtataagaagtgagcttaggttgattaagtttttgatag 34784647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23168751 - 23168652
Alignment:
Q  339 aaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   ||||||| |||| || |||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  23168751 aaggttgacggataaagttgattgtgtacgaagtgagtttagattgattaagtatttgatagaagtaattcgtttgattggattgtttaacatgttattg 23168652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6604888 - 6604839
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaac 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6604888 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaagaaaagtcaac 6604839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 34775639 - 34775696
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34775639 gagagcttcaatgttggtggcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacagtgtcaa 34775696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40361028 - 40360951
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgata 399  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  40361028 gaagaagtttggagagcaaggttgatggacaaagttgattgtttagaaagtgagcttagattgataaagtaattgata 40360951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 48851147 - 48851204
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48851147 gagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 48851204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 575 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 659  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22155343 - 22155291
Alignment:
Q  88 cttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22155343 cttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 22155291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22211258 - 22211206
Alignment:
Q  88 cttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22211258 cttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 22211206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 323
Target Start/End: Original strand, 23905125 - 23905169
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23905125 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagaga 23905169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 77505 - 77448
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  77505 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 77448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20479168 - 20479111
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  20479168 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 20479111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13035993 - 13035937
Alignment:
Q  334 agggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13035993 aggggaaggttgatggagaaagttgactatgtaggaagtgagattaggttgattaag 13035937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 389
Target Start/End: Original strand, 48302873 - 48302936
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaa 389  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  48302873 gaggtttggagg-caacgttgatggacaaagttgattgtacaggaagtgagcttagggtgattaa 48302936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13169162 - 13169123
Alignment:
Q  372 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13169162 tgagcttaggttgattaagatattgataggaatattttgt 13169123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 37114529 - 37114572
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37114529 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 37114572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 683 - 729
Target Start/End: Original strand, 30939748 - 30939794
Alignment:
Q  683 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30939748 taaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 30939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 47384883 - 47384940
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  47384883 gagagattcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacattgtcaa 47384940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 140
Target Start/End: Original strand, 35692029 - 35692083
Alignment:
Q  86 agcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  35692029 agcttcaatgttggtgtccaagaatttgcgttgtaagaaaagcaaacactgtcaa 35692083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 6798923 - 6798264
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798923 gagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaagacaacactatcaacaacggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 6798824  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaat-------------tgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6798823 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatattttgtgtaggttgatgaagctgacgaactaggctattttaaaaacaatggtgt 6798724  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6798723 tggtcatggaagaaatgcaaggttgacggagaagccaagagatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtagga 6798624  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6798623 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatg 6798524  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6798523 aaaagaggttgtcaatgaatgagtcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctcaaat 6798424  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6798423 tagtgaaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 6798324  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  6798323 gacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagttatatatttgatgt 6798264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 2768331 - 2767691
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2768331 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaaaaaaagccaacactatcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 2768232  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2768231 ggttttgtcttttgattatataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 2768132  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2768131 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 2768032  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||     
T  2768031 agtaagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattaagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaaacccatgtaatgttgtaatg 2767932  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||       |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2767931 aaaagaggttgtcaatgaatgaataaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaatt 2767832  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2767831 tagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 2767732  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 710  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2767731 aactctttgattataaaaagacagacatttgcataccatca 2767691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 17697624 - 17696965
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697624 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtcagaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 17697525  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||| |||             |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17697524 gattttgtcttttgattgtataatatatttgtgaaaattgtagattttttgtgtaggttgatgaagctgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgt 17697425  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697424 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 17697325  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||     
T  17697324 agtgagcttaagttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgaattgtttaaaatgctattgtattatgccaagtccatgtaatgttgttatg 17697225  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||       |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17697224 aaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaaaat 17697125  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17697124 tggtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatacatcactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaagaca 17697025  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  17697024 gacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 186 - 729
Target Start/End: Original strand, 14387923 - 14388487
Alignment:
Q  186 tttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctgg 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||             ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14387923 tttgtcttttgattgtacaggatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaggaattaggctattttaaaaacaatggtgctgg 14388022  T
Q  273 tcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagt 372  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388023 taatggaagaaatgcaaggttgatggagaagctaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagt 14388122  T
Q  373 gagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcca--------tgtaatgttg 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        ||||||||||    
T  14388123 gagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttg 14388222  T
Q  465 taataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcct 564  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |        |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14388223 taatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtaaaaaaacttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcct 14388322  T
Q  565 caaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 664  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388323 caaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 14388422  T
Q  665 agacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  14388423 agatagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 280 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 16764153 - 16763704
Alignment:
Q  280 agaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctta 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16764153 agaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttagagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaactta 16764054  T
Q  380 ggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggtt 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16764053 ggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggtt 16763954  T
Q  480 gtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaat 579  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16763953 gtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaat 16763854  T
Q  580 accatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttga 679  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  16763853 accatcaaataggtcattgaatttacacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatagacactttga 16763754  T
Q  680 ttataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  16763753 ttataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 16763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 83 - 555
Target Start/End: Original strand, 34400909 - 34401394
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34400909 gagagcttcaatgttggtgtcttagaattcgtgttttaagaaaagccaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaataatttgtttaaatagtaca 34401008  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||             |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34401009 tattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaagttgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggctattttaaaaataatggtgc 34401108  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34401109 tggtcatggaagaaatagaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgagtagga 34401208  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  34401209 agtgagcttaggttgattaagatattgataggattattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatg 34401308  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |        |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34401309 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcat 34401394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Original strand, 6784070 - 6784648
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              
T  6784070 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaatttttttggttgg 6784169  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||    
T  6784170 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgttggtcatggaagaaatgcaaagttgatcgagaagccaaatgataggggcaaagaag 6784269  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784270 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtttaggaagtgaacttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 6784369  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  6784370 taaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacat 6784469  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagt-gaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 624  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |  ||    
T  6784470 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatctttaaattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaattgga 6784569  T
Q  625 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6784570 tcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 6784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 279 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 39456367 - 39455918
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39456367 aagaaatgcaaggttgatggaaaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 39456268  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39456267 aggttaattaagatattgataagagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggt 39456168  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    ||||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  39456167 tgtcaatgaatgaatcaaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattctcaaatgagtgaaaa 39456068  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttg 678  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39456067 tatcatcaaataggtccttaaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga-actttg 39455969  T
Q  679 attataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  39455968 attataaaaagacagacatttgtataccatcataagtcatatacttgatgt 39455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Original strand, 24206313 - 24206900
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||              
T  24206313 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttatttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaatttttttgtgtgg 24206412  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24206413 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgctggtcatggaaaaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaag 24206512  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24206513 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattatgtaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 24206612  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtcca--------tgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttc 517  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||    
T  24206613 taaaatgctattgtattgttctaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattc 24206712  T
Q  518 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagt--gaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 615  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| | |||||||| |||||||||||| | | |||||| |    
T  24206713 aatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacagaaa 24206812  T
Q  616 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    ||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24206813 tcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattataaaaagacaaacatttgcat 24206900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 83 - 438
Target Start/End: Original strand, 42518156 - 42518522
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518156 gagagctttaatgttggtgtcctaaaatttttgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgcgtgaatgatttgtttaaatagtact 42518255  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42518256 gatt--gtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctaaagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 42518353  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42518354 tgatcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaagtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaaga 42518453  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg 438  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42518454 agtgatcttaggtttattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg 42518522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 139 - 498
Target Start/End: Original strand, 44708604 - 44708976
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||              
T  44708604 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtacttattttgtcttttgattgtatatgatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 44708703  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44708704 gttgatgaagctgaagaattaggttattttaaaaataatggtgctggtcatggaacacatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcagagaag 44708803  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708804 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttaattgtgtaggaagtgggcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 44708903  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 498  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708904 taaaatgttattgtattgcgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 44708976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 372 - 729
Target Start/End: Original strand, 19907308 - 19907664
Alignment:
Q  372 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19907308 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 19907406  T
Q  472 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 571  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19907407 aagaggttatcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatga 19907506  T
Q  572 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 671  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19907507 gtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 19907606  T
Q  672 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  19907607 cactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 19907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 407 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 40561305 - 40560978
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  40561305 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgt 40561206  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
            |||||| ||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561205 taaaaaatttcaattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 40561106  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40561105 caacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatc 40561006  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgtccatc 734  Q
    |||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  40561005 atcataaatcatatatttgatgttcatc 40560978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 557 - 729
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664166
Alignment:
Q  557 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  657 aaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgt 39664166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 583 - 729
Target Start/End: Original strand, 44708996 - 44709142
Alignment:
Q  583 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatta 682  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44708996 atcaaattggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgatta 44709095  T
Q  683 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||  ||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  44709096 taaaaatgcagacatttgcataccatcataagacatatatttgatgt 44709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 635 - 729
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518618
Alignment:
Q  635 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 39663847 - 39663936
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39663847 aacaatggttatgtgatgtgcgaatggtttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatagtgaaaattgtaaatt 39663936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 322 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4047499 - 4047377
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   || |||| ||| ||||||    
T  4047499 gaagaggtttggagggcaaagttaatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgtttgagt 4047400  T
Q  422 tgtttaaaatgctattgcattgt 444  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  4047399 tgtttaacatgctattgtattgt 4047377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 515 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 37021501 - 37021388
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  37021501 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagat 37021402  T
Q  615 atcactgtgatcct 628  Q
    |||| |||||||||    
T  37021401 atcaatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 20941856 - 20941686
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   || |||| ||| ||||||    
T  20941856 gaagaggtttggatg-caaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgtttgagt 20941758  T
Q  422 tgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaat 493  Q
    ||||||| ||| || || ||||||  | ||   ||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  20941757 tgtttaacatgttactgtattgtgctaggtgtgtgtaacgttgtaatgaaaagaggttgaagatgaatgaat 20941686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 19581872 - 19581954
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaatt 221  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19581872 aacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgattttgtcttttaattgtgtaggatgatggtgaaaatt 19581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Original strand, 26581545 - 26581613
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26581545 gaagaggtttagaggggaaggttgatggacaaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 26581613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 406 - 485
Target Start/End: Original strand, 19581960 - 19582039
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaat 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19581960 ttttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctctgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaat 19582039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 161554 - 161441
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||   |||||||   || |||| ||| ||||||    
T  161554 gaagaggtttagagggcaaggttgatggacaaagttgactatgtagaaagtgaggtttggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgtttgagt 161455  T
Q  422 tgtttaaaatgcta 435  Q
    ||||||| ||||||    
T  161454 tgtttaacatgcta 161441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 39663741 - 39663798
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  39663741 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacaccgtcaa 39663798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 37021638 - 37021578
Alignment:
Q  80 tgggagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  37021638 tgggagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 37021578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 40561367 - 40561324
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40561367 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaa 40561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 6783964 - 6784021
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  6783964 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 6784021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 19581766 - 19581823
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  19581766 gagagcttcaatgttggcgtcctagaatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaa 19581823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 620 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  620 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 665  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 38149406 - 38149341
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||    
T  38149406 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataaaaagtgagattggggtgattaag 38149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 659  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7744778 - 7744707
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 400  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  7744778 tttggagggtgaggttgatggacaaagttgatactttaggaattgagcttaggtttattaagtttttgatag 7744707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 39663948 - 39663995
Alignment:
Q  227 ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtc 274  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  39663948 ttgatgaagctgaagaactaggttattttgaaaacaatggtgttggtc 39663995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Original strand, 7371710 - 7372367
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7371710 gagagcttcaatgctggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatagttatgtgacatgtgaatgatttgtttaaatagtact 7371809  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||             ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371810 gattttgtcttttgattgtatagaatgatggtgaaaattgtaatattttgtgtgggttgatgaagttgaggaactaggctattttaaaaacaatggtgct 7371909  T
Q  271 ggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaa 370  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371910 ggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataaggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaa 7372009  T
Q  371 gtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataa 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7372010 gtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatga 7372109  T
Q  471 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7372110 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatatcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaatt 7372209  T
Q  571 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaa 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7372210 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatcga-atcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacag 7372308  T
Q  671 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  7372309 acactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Original strand, 32437864 - 32438465
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||              
T  32437864 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggataattttgaaaattgtaaattttttgtgtgg 32437963  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||    
T  32437964 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagc-aaatgctaggggcaaagaag 32438062  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32438063 -ggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtt 32438161  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  32438162 taaaatgctattgcattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcatat 32438261  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32438262 tggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactatgat 32438361  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  32438362 ccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttg 32438461  T
Q  726 atgt 729  Q
    ||||    
T  32438462 atgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18644623 - 18644031
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||              
T  18644623 aacaattgttatttgatatatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataagataattgtgaaaattgtaatttttttgtgagg 18644524  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  18644523 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaatgctaggggcagagaag 18644424  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18644423 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgagtaggaagtgaacttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtt 18644324  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttg--------taataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttc 517  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||    
T  18644323 taaaatgctattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattc 18644224  T
Q  518 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 617  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644223 aatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 18644124  T
Q  618 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18644123 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 146 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 11356530 - 11355948
Alignment:
Q  146 gttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||             ||||    
T  11356530 gttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtacttattttgtcttttgattgtatatgatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgagttgatg 11356431  T
Q  233 aagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttg 332  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11356430 aagctgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatagaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaagaggtttg 11356331  T
Q  333 gagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatg 432  Q
    |||||||||||||||             |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356330 gagggcaaggttgat-------------tgtgtaggaagtcagcttaggttgattacgatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatg 11356244  T
Q  433 ctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaa 524  Q
    |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||       ||||||||||    
T  11356243 ctattctattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaa 11356144  T
Q  525 tttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 624  Q
    || |||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356143 ttggtccttgaattatatg---------catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 11356053  T
Q  625 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatattt 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||    
T  11356052 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatattt 11355953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 20524526 - 20524126
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20524526 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattatgatattgatatgagtattttgttttattgagttgtttaa 20524427  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |        |||||||||||| |    
T  20524426 aatgctattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtaaaaaaaattcaatcaaattgg 20524327  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20524326 tccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactatgatcct 20524227  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20524226 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 20524127  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  20524126 t 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 279 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 32518060 - 32517672
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32518060 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatatgggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 32517961  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32517960 aggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggt 32517861  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    ||||||||| |||| |||||  || | ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32517860 tgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaa 32517761  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517760 taccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 32517672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7050821 - 7050498
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||  || |     
T  7050821 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatggatgaatttaacccttttg 7050722  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7050721 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttc 7050622  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  7050621 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 7050522  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  7050521 catcataagtcatatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 139 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 9399460 - 9399135
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaat----------- 227  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||               
T  9399460 aacaatggttatgtaatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactaattttgtcttttgattgtataggacgatggtgaaaattataaatcttttgtgtgg 9399361  T
Q  228 --tgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9399360 gttgatgaagctgaagaactaggttattttaaaaacaagggtgctggtcatggtagaaaagcaaggttgatggagaagccaaaggatagtggcagagaag 9399261  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  9399260 aggtttggaaggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaaatgagcttaggttgattaagatattgataggagtgatttgtttgtttgagttgtt 9399161  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagt 451  Q
    || |||| ||||  |||||| |||||    
T  9399160 tagaatgttattttattgtgccaagt 9399135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 10569462 - 10569141
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  10569462 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttcta 10569363  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       ||||||||||||  |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10569362 tcaaaaaatttcaatcaaattgatccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 10569263  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10569262 a--acatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatat 10569165  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  10569164 catcataagtcatatatttgatgt 10569141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 279 - 628
Target Start/End: Original strand, 33267813 - 33268155
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33267813 aagaaatgcaaggttgatgaagaaggcaaaggatagtggcagagtataggtttgg-ggtcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 33267911  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtc-catgtaatgttgtaataaaaagagg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  33267912 aggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgaatgagctgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgttgtaatgttgtaatgaaaagagg 33268011  T
Q  478 ttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaa 577  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||       ||||||  |||| ||||        ||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  33268012 ttgtcaatgaatgaattcaacccttctctcaaaaaatttcaattgaattggtcc-------gtatgtctatccatcatatcgatccctaaattattgaaa 33268104  T
Q  578 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268105 ataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20524825 - 20524583
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20524825 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaggcaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtaca 20524726  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20524725 aattttgtcttctgcttgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactatgctattttaaaaacaacggtgc 20524626  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggat 312  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524625 tcgtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggat 20524583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 6902212 - 6901999
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  6902212 ttttgtgtgattgagttgtttaaaaagttattgtattgtgtcaagtctgcgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 6902113  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6902112 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttc 6902013  T
Q  606 acaacagatatcac 619  Q
    |||||| |||||||    
T  6902012 acaacatatatcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 613 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900225
Alignment:
Q  613 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcaga 712  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | |    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  713 ggtcatatatttgatgt 729  Q
     |||||| |||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgt 6900225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7050910 - 7050821
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050910 aacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtattgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 7050821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10569551 - 10569462
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10569551 aacaatggttatgcgatgtgtgaatggtttgttaaaatagtactgattttgtcttttgattgtacaggatgatggtgaaaattgtaaatt 10569462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6902294 - 6902212
Alignment:
Q  146 gttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6902294 gttatgtgatgtgtgaatggtttgttaaaatagaactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaatttgtaaatt 6902212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 618
Target Start/End: Original strand, 32455022 - 32455125
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  32455022 ttcaattacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 32455121  T
Q  615 atca 618  Q
    ||||    
T  32455122 atca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7051016 - 7050959
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7051016 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 7050959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 33267624 - 33267681
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33267624 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacattgtcaa 33267681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6902407 - 6902350
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6902407 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgtagtaagaaaagccaacactgtcaa 6902350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9399566 - 9399513
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9399566 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactg 9399513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17935616 - 17935548
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17935616 gaagagttttggagggtaaggttgagggacaaagttgactgagtaggatgtgagcttaggttgattaag 17935548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10569654 - 10569599
Alignment:
Q  85 gagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10569654 gagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaa 10569599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11356643 - 11356586
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11356643 gagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaa 11356586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 33267730 - 33267776
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgat 185  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33267730 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtattgat 33267776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Original strand, 32454888 - 32454929
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32454888 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 32454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 140
Target Start/End: Original strand, 32437761 - 32437815
Alignment:
Q  86 agcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  32437761 agcttcaatgttgttgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 32437815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 729
Target Start/End: Original strand, 30598940 - 30599592
Alignment:
Q  88 cttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattt 187  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30598940 cttcaatgttggtgacctagaatttgtgttgtaagaaaagctaacactgtcaacaatggttatgt-atgtgtgaatgatttgtttaaatagtacttattt 30599038  T
Q  188 tgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtc 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||             ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30599039 tgtcttttgattgtataagatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagttgaagaactagactattttaaaaacaatggtgctggtc 30599138  T
Q  275 ttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtga 374  Q
     || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599139 atggaagaaatgcaagattgatggagaagtcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtga 30599238  T
Q  375 gcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaag 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30599239 gcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaag 30599338  T
Q  475 aggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30599339 aggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc-aaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctcaaattagtg 30599437  T
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacac 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599438 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacac 30599537  T
Q  675 tttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  30599538 tttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 43766533 - 43765880
Alignment:
Q  89 ttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgatttt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  43766533 ttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaaggcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaagtagtacaaatttt 43766434  T
Q  189 gtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtct 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43766433 gtctttttattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagttgaagaactaggcaattttaaaaacaatggtgctggtca 43766334  T
Q  276 tgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgag 375  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43766333 tggatgaaatgcaagattgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagctgattgtgtaggaagtgag 43766234  T
Q  376 cttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaaga 475  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  43766233 cttagattgattaatatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattttattgtgtcaagttcatgtaacattgtaatgaaaaga 43766134  T
Q  476 ggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtga 575  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43766133 ggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatcaaattagtga 43766034  T
Q  576 aaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacact 675  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766033 aaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacact 43765934  T
Q  676 ttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  43765933 ttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 43765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 46199137 - 46198479
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46199137 gagagcttcaatgttggtgccctataatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaacaatggctatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 46199038  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  46199037 gattttgtcttttaattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactagcctattttaaaaacaatggttc 46198938  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198937 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 46198838  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  46198837 agtggacttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattatattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatg 46198738  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||       |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46198737 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttatgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctcaaat 46198638  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198637 tagtaaaaataccatcaaataggtcc-tggatttttacaacagatatcattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 46198539  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  46198538 gacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21350112 - 21349453
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21350112 gagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgtactaagaaaaaccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtaca 21350013  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21350012 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggctattttaaaaacaatggtga 21349913  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21349912 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaagttttgagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtagga 21349813  T
Q  370 agtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata 469  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||     
T  21349812 agtgagcttatgttgattaagacattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgcgccaagtccatgtaatgttgtaatg 21349713  T
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |         ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21349712 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtaaaaaaaaatcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaat 21349613  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349612 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaattatcactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 21349513  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  21349512 aacactttgattataaaaagatagacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 729
Target Start/End: Original strand, 44274947 - 44275601
Alignment:
Q  86 agcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgat 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  44274947 agcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaataatttgtttaaatagtacatat 44275046  T
Q  186 tttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctgg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44275047 tttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggctattttacaaacaatggttctgg 44275146  T
Q  273 tcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagt 372  Q
    || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  44275147 tcatcgaagaaatggaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagacgtttggagggcaaggttgatggataaatttgattgtgaaggaagg 44275246  T
Q  373 gagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  44275247 gagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaa 44275346  T
Q  473 agaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattag 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||        |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275347 agaggttgtcaatgaatgaatcaaacctt--tctgaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaattag 44275444  T
Q  573 tgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaac 672  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44275445 tgaaaataccatcaaataggttcttgaattttcacaatagatatcattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaagacaaac 44275544  T
Q  673 actttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  44275545 actttgattataaaaagacagtcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 141 - 729
Target Start/End: Original strand, 27897899 - 27898499
Alignment:
Q  141 caatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt------------ 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  27897899 caatggttatgtgatgtgcgaatggtttgtgtaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggt 27897998  T
Q  229 -gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagag 327  Q
     ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  27897999 tgatgaagttgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaatgataggggcagagaagag 27898098  T
Q  328 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttta 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27898099 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaatatattgataggagtattttgtttgattaagttgttta 27898198  T
Q  428 aaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaattt 527  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||       ||||||||| ||     
T  27898199 aaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttttgtcaaaaaaattcaatcaagttg 27898297  T
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898298 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 27898397  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 727  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  27898398 ctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatcatatatttgat 27898497  T
Q  728 gt 729  Q
    ||    
T  27898498 gt 27898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 226 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 17516570 - 17516069
Alignment:
Q  226 attgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17516570 attgttgaagctgaagaactaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggat-gggggagagaag 17516472  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17516471 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtt 17516372  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||    
T  17516371 taaaatgctattgtattgtgccaattccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaat 17516272  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17516271 tggtccttgaattatat-catatccatcatatcgatactcaaattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 17516173  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17516172 ccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaagacagatactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttg 17516073  T
Q  726 atgt 729  Q
    ||||    
T  17516072 atgt 17516069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2378324 - 2377755
Alignment:
Q  166 tttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||| ||||||||| |||    
T  2378324 tttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaaatttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggttat 2378225  T
Q  253 tttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggata 352  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2378224 tttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggataagtcaaaggataggggcagagaagaggtttggagagcaaggttgatggata 2378125  T
Q  353 aagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtc 452  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2378124 aagttgattgcgtaggaaatgagcttaggttgattaagatattgataggagtatttt-tttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtc 2378027  T
Q  453 catgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccat 552  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  || | |        |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2378026 catgtaatgttgtaatgaaaagaggttgt-----aatgaatcaaacccttatgttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccat 2377932  T
Q  553 catatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 652  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377931 cataacgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 2377832  T
Q  653 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  2377831 gtaaaaactaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaatatttgcatatcatcataaatcatatatttgatgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2661373 - 2660973
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2661373 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggggtattttgtttgattgagttgtttaa 2661274  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       || ||||||||| |    
T  2661273 aatgatattgtattgtgccatgtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattgg 2661174  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661173 tccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 2661074  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  2661073 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 2660974  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  2660973 t 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 139 - 607
Target Start/End: Original strand, 53188482 - 53188963
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  53188482 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 53188581  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53188582 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaacggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaag 53188681  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53188682 aggtttggagggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttagattgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtt 53188781  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  53188782 taaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatgaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacat 53188881  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcac 607  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53188882 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 44795358 - 44794958
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795358 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 44795259  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||       |||||||||||| |    
T  44795258 aataatattgtattatgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaaccaaaccattatgtcaaaatatttcaatcaaattgg 44795159  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795158 ttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 44795059  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  44795058 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacggacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 44794959  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  44794958 t 44794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 280 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 54899649 - 54899250
Alignment:
Q  280 agaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctta 379  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899649 agaaatacaaggttgatggagaagccaaatgataagggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatgggtaaagttgattgtgtaggaagtgagctta 54899550  T
Q  380 ggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttg--------taataaa 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        |||| ||    
T  54899549 ggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaa 54899450  T
Q  472 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||       |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54899449 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttccgtcaaaaaaattcaatcacatcggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaatta 54899350  T
Q  572 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899349 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 54899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 345 - 729
Target Start/End: Original strand, 2225165 - 2225555
Alignment:
Q  345 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgt 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2225165 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaatatattgataggagtattttgcttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgt 2225264  T
Q  445 gtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaa 536  Q
    | ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||| ||  ||| |||||||||    
T  2225265 gccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtcaaaaaaattcattcgcattggtccttgaa 2225364  T
Q  537 ttatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcat 636  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225365 ttatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcat 2225464  T
Q  637 acatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  2225465 acatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttgatgt 2225555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 320 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 46113635 - 46113226
Alignment:
Q  320 gagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattga 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46113635 gagaagaggcttggagggcaaggctgatggataaagttgattgtgcgggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattga 46113536  T
Q  420 gttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaa 519  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||       |||||    
T  46113535 gttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaaggaatgaatccaacccttctgtcaaaaaatttcaa 46113436  T
Q  520 tcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 619  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||    
T  46113435 tcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatccctaaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacataaatcac 46113336  T
Q  620 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcata 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  46113335 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcata 46113236  T
Q  720 tatttgatgt 729  Q
     |||||||||    
T  46113235 catttgatgt 46113226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 296 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 610786 - 610353
Alignment:
Q  296 tggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatatt 395  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  610786 tggagaagccaaaagatagtgttagagaaaaggcttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggtttattaagatatt 610687  T
Q  396 gataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatca 495  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  610686 gataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtatgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattc 610587  T
Q  496 aacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcc 595  Q
    |||  |||| ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  610586 aacccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcc 610487  T
Q  596 ttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggc 695  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |    
T  610486 ttgaattttcacaacataaatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaaagcagac 610387  T
Q  696 atttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  610386 atttgcatataatcataagtcatacatttgatgt 610353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Original strand, 23292232 - 23292554
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23292232 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgacaagtccatataatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacttttctgt 23292331  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23292332 caaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 23292431  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23292432 caacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 23292531  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  23292532 atcataagtcatatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 139 - 445
Target Start/End: Original strand, 35904531 - 35904850
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  35904531 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtctttttattgtataggatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 35904630  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||     
T  35904631 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaaggcaaacgataggggcagagaac 35904730  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35904731 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtt 35904830  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtg 445  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  35904831 taaaatgttattgtattgtg 35904850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Original strand, 48829886 - 48830209
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  || |     
T  48829886 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagtggttgtcaatgaatgaatttaacccttatg 48829985  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48829986 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttc 48830085  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  48830086 acaacatatatcactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatat 48830185  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  48830186 catcataagtcatatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 406 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 51685673 - 51685350
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||     
T  51685673 ttttgtgtgattgagttgtttgaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacctttctg 51685574  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51685573 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 51685474  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 705  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |     
T  51685473 acaacatatatcactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaac 51685374  T
Q  706 catcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| | |||||| |||||||||    
T  51685373 catcataagtcatacatttgatgt 51685350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 470 - 729
Target Start/End: Original strand, 35904851 - 35905113
Alignment:
Q  470 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  35904851 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaat 35904950  T
Q  570 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904951 tagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 35905050  T
Q  670 aacactttgattataaaaagacaggcatt---tgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||   || ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  35905051 gacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcataagtcatatatttgatgt 35905113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41978671 - 41978487
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978671 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 41978572  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  41978571 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 455 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 42280521 - 42280246
Alignment:
Q  455 tgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatca 554  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||    
T  42280521 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatca 42280422  T
Q  555 tatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt 654  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280421 tatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt 42280322  T
Q  655 a-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  42280321 aaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 42280246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Original strand, 7884094 - 7884278
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884094 atatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7884193  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||    
T  7884194 tgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgt 7884278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 528 - 701
Target Start/End: Original strand, 38192457 - 38192630
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  38192457 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 38192556  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgc 701  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38192557 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgc 38192630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 530 - 703
Target Start/End: Original strand, 46609724 - 46609897
Alignment:
Q  530 ccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 629  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46609724 ccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctt 46609823  T
Q  630 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46609824 tgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46609897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 53093197 - 53093372
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  53093197 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 53093296  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53093297 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcat 53093372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 46309951 - 46309776
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  46309951 gtccatgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatca 46309852  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46309851 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46309776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 603 - 729
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190247
Alignment:
Q  603 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaa---agtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcattt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  700 gcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 323 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 13466324 - 13466154
Alignment:
Q  323 aagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagata-ttgataggagtattttgtttgattgagt 421  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  13466324 aagaggattggagggaaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaa-atatttgataggtgtaatttgtttgattggat 13466226  T
Q  422 tgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaat 493  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13466225 tgtttaacatgctactgtattatgctaagtttgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaat 13466154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 575 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 24845776 - 24845668
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaaagacaaac 672  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  24845776 aaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaaagacatac 24845677  T
Q  673 actttgatt 681  Q
    |||||||||    
T  24845676 actttgatt 24845668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51685762 - 51685673
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51685762 aacaatggttatgtgacgtgtgaatggtttgttaaaatagtaccgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 51685673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42281876 - 42281795
Alignment:
Q  147 ttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42281876 ttatttgatgtgcgaatggtttgttaaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 42281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Original strand, 48829831 - 48829886
Alignment:
Q  173 aaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48829831 aaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 48829886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Original strand, 32843436 - 32843504
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32843436 gaagagttttggagggcaaggttgatcgacaaagttgactgtgtaggatgtgagcttaggttgattaag 32843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 389
Target Start/End: Original strand, 23876220 - 23876287
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaa 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  23876220 gaagaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgactctgtatgaagtgagtttaggttgattaa 23876287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2378431 - 2378374
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2378431 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 2378374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 27897791 - 27897848
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27897791 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 27897848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41945479 - 41945414
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41945479 gaggtttagaggacaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtgagcttagggtgattaag 41945414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 51685868 - 51685811
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51685868 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 51685811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Original strand, 35862440 - 35862508
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35862440 gaagaggtttgcatggcaaggttgatgaacaaagttgattgtgtaggaagcgagcttaagttgattaag 35862508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42281990 - 42281937
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42281990 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactg 42281937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13466547 - 13466364
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ 226  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |  |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||                
T  13466547 aacaatggttatgtgatgtgggaatggtttgttaaacttttactgattttgaattttctttgtataggatgatggtgaaaactataaattttttgtctgg 13466448  T
Q  227 -ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatg------gtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaag 303  Q
     |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||      ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13466447 gttgatgaagctgaagagctaggttattttaaaaacaatggaatttgtggtggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaag 13466364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 48829711 - 48829767
Alignment:
Q  84 agagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48829711 agagcttcaatgttggtgtcttagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 48829767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 390
Target Start/End: Original strand, 2976359 - 2976410
Alignment:
Q  339 aaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2976359 aaggttgatggacaaagttgagtgtgtaggaattgagcttaggttgattaag 2976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 7883925 - 7883982
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  7883925 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgcaagaaaagcaaacactgtcaa 7883982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 35904425 - 35904482
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  35904425 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 35904482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41978841 - 41978784
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  41978841 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagcaaacactgtcaa 41978784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 53188376 - 53188433
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  53188376 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 53188433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Original strand, 23292173 - 23292225
Alignment:
Q  86 agcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtc 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  23292173 agcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtc 23292225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24846060 - 24846009
Alignment:
Q  87 gcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtc 138  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24846060 gcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtc 24846009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 671 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 54899230 - 54899172
Alignment:
Q  671 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  54899230 acactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 54899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24845959 - 24845879
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaa 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||  ||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  24845959 aacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaattttatggattttgaattttctttgcataagatgatggtgaaaa 24845879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 659
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 659  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Original strand, 49495067 - 49495139
Alignment:
Q  328 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 400  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49495067 gtttggagggtgaggtagatggacaaagttgatattttaggaactgagcttaggttgattaagtttttgatag 49495139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1847175 - 1847132
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1847175 gagagcttgaatgttggtgtcctataatttgtgttgttagaaaa 1847132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 575 - 664
Target Start/End: Original strand, 22219218 - 22219308
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaa 664  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22219218 aaaatatcatcaaataaatccttgaattatttaaacagatgtcaatgcgatccttggtgcatatatgtgcagaacaaagtacaaaagtaaa 22219308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 140
Target Start/End: Original strand, 35862131 - 35862177
Alignment:
Q  94 tgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35862131 tgttggtgtcccataatttgtgttttaagaaaagtcaatactgtcaa 35862177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41978735 - 41978678
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttg 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  41978735 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttg 41978678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Original strand, 50554885 - 50555488
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  50554885 aacaatagttatgtgatgtgcgaatggtttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 50554984  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50554985 gttgatgaaactgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaagattgatggagaagccaaaggataggggcagagaag 50555084  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50555085 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgatggagttgtt 50555184  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||       |||||||||||    
T  50555185 taaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatcattctgtcaaaaaatttcaatcaaat 50555283  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50555284 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgat 50555383  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatattt 724  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |  ||||||||||    
T  50555384 ccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatgccatcataaatcatatattt 50555483  T
Q  725 gatgt 729  Q
    |||||    
T  50555484 gatgt 50555488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 27088628 - 27088026
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||              
T  27088628 aacaatagttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataagataattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 27088529  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  27088528 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgttaggggcagagaag 27088429  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27088428 aggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtt 27088329  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  27088328 taaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc--aaaaattcaatcacat 27088231  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27088230 tggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacagatatcactgtgat 27088131  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattat-aaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatattt 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27088130 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaagacacatatttgcatatcatcataagtcatatattt 27088031  T
Q  725 gatgt 729  Q
    |||||    
T  27088030 gatgt 27088026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Original strand, 26224327 - 26224938
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||              
T  26224327 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggataattatgaaaattgtaaattttttgtgtgg 26224426  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  26224427 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagacaaaagataggggaagagaag 26224526  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26224527 aggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgtt 26224626  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaa--------taaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttc 517  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||       |||    
T  26224627 taaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtactgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtcaaaaaaattc 26224726  T
Q  518 aatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 617  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26224727 aatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaagaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatatc 26224826  T
Q  618 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||    
T  26224827 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtca 26224926  T
Q  718 tatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||    
T  26224927 tatatttgatgt 26224938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 15105841 - 15105185
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaag-tcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtac 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |     | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15105841 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaaggtttat----ttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtac 15105746  T
Q  182 tgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtg 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15105745 tgattttttcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttatgtgggttgatgaagctgaagaattaggttattttaaaaacaatggtg 15105646  T
Q  269 ctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg 368  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15105645 ttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgatagtgtcagagaagaggtttggatgacaaggttgatggatgaagttgattgtgtagg 15105546  T
Q  369 aagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaat 468  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15105545 aaatgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaat 15105446  T
Q  469 aaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaa 568  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |        |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15105445 gaaaagaggttgtcaatgaatgaatccaaccattctgttaagaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaa 15105346  T
Q  569 ttagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 668  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105345 ttagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 15105246  T
Q  669 aaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    | |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  15105245 atacactttgattgcaaaaagacagacattcgcataccatcatgagtcatatatttgatgt 15105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Original strand, 33599925 - 33600511
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  33599925 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaattgtaaatttttttgtgtg 33600024  T
Q  229 ----gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaa 324  Q
        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||    
T  33600025 ggttgatgaatctgaagaactaggctattttaaaaacaatggtgatggtcatggaagaaatgcaaggttgatagagaaggcaaatgataggggcagggaa 33600124  T
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600125 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaaggcagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 33600224  T
Q  425 ttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaat--------gttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctc-nnnnnnnt 515  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||        |    
T  33600225 ttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaaagttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatc-aacctttctgtcaaaaaaaat 33600323  T
Q  516 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 615  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33600324 tcaatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagata 33600423  T
Q  616 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33600424 tcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattgtaaaaagacagacatttgcat 33600511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 292 - 729
Target Start/End: Original strand, 6817664 - 6818101
Alignment:
Q  292 ttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaaga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6817664 ttgatggagaagccaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgagcttaggttgattaaga 6817763  T
Q  392 tattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatga 491  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6817764 tattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtacatataatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatga 6817863  T
Q  492 atcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatag 591  Q
    ||||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6817864 atcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatag 6817963  T
Q  592 gtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagac 691  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6817964 gtccttggtttttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttgattataaaaagac 6818063  T
Q  692 aggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    || ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6818064 agacatgtgcataccatcataagtcatatatttgatgt 6818101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 279 - 667
Target Start/End: Original strand, 45045438 - 45045826
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045438 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcaaagaagaggtttggagggcaagcttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 45045537  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  45045538 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaagt 45045637  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    |||||||||||||| |||||  || | ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45045638 tgtcaatgaatgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcttcaaattagtgaaaa 45045737  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045738 tatcatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaaga 45045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 279 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37345525 - 37345137
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345525 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatatgggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 37345426  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37345425 aggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggt 37345326  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    ||||||||| |||| |||||  || | ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37345325 tgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaa 37345226  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345225 taccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37345137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 279 - 667
Target Start/End: Original strand, 25277302 - 25277698
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277302 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 25277401  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcca--------tgtaatgttgtaataa 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||| |    
T  25277402 aggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatga 25277501  T
Q  471 aaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatt 570  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  || | ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25277502 aaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatt 25277601  T
Q  571 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277602 agtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 25277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Original strand, 46582573 - 46582973
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582573 tttggaggacaaggttgatggataaacttgattttgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaa 46582672  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  46582673 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtattgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 46582772  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582773 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 46582872  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| | || ||||||||||||    
T  46582873 tggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagactgatattttcataccatcataagtaatatatttgatg 46582972  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  46582973 t 46582973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Original strand, 3012516 - 3012838
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3012516 tttgtttgattgagttatttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtgatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 3012615  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3012616 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttca 3012715  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3012716 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 3012815  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  3012816 atcataagtcatatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 386 - 729
Target Start/End: Original strand, 31237556 - 31237891
Alignment:
Q  386 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaat 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  31237556 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtaccaagtccatgtaatg--------aaaagaggttgtcaat 31237647  T
Q  486 gaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 585  Q
    |||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31237648 gaatgaatcaaacccttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcctcaaattagtgataataccatc 31237747  T
Q  586 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31237748 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacattcactttgactataa 31237847  T
Q  686 aaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31237848 aaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 31237891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Original strand, 51895228 - 51895550
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  51895228 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattatgtcatgtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgt 51895327  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51895328 caaaaaaattcaatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 51895427  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  51895428 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 51895527  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||| | ||||||||||| ||||    
T  51895528 atcataagtcatatattttatgt 51895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 83 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37087627 - 37087316
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37087627 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtattgtaagaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgctttgtttaaatagtact 37087528  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||| ||  |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  37087527 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatattttgtgtgggttgatgaagttgaggaatgaggctattttaataacaatggtgc 37087428  T
Q  270 tggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 369  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37087427 tggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagga 37087328  T
Q  370 agtgagcttagg 381  Q
    ||||||||||||    
T  37087327 agtgagcttagg 37087316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 450 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2870617 - 2870338
Alignment:
Q  450 gtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatc 549  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2870617 gtccatgtaatgttgtaacgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatc 2870518  T
Q  550 catcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870517 catcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 2870418  T
Q  650 aaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  2870417 aaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Original strand, 34777338 - 34777522
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777338 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 34777437  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  34777438 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 406 - 691
Target Start/End: Original strand, 52642698 - 52642981
Alignment:
Q  406 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||     
T  52642698 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctg 52642797  T
Q  506 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 605  Q
    ||       |||||||||||| ||| ||  |||  || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52642798 tcaaaaaatttcaatcaaattggtctttctattgcatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 52642897  T
Q  606 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagac 691  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  52642898 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac--acactttgattgtaaaaagac 52642981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Original strand, 4855167 - 4855351
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4855167 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatttgc 4855266  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  4855267 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 528 - 703
Target Start/End: Original strand, 8168515 - 8168690
Alignment:
Q  528 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8168515 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 8168614  T
Q  628 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8168615 tttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 8168690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 228
Target Start/End: Original strand, 52642609 - 52642698
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52642609 aacaatggttatgtgatgtgtcaatggtttgttaaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 52642698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 628
Target Start/End: Original strand, 9120813 - 9120926
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  9120813 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 9120912  T
Q  615 atcactgtgatcct 628  Q
    |||| |||||||||    
T  9120913 atcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 222
Target Start/End: Original strand, 6817591 - 6817666
Alignment:
Q  147 ttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattg 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6817591 ttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactaattttgtcttttgattgtatatgatgatggtgaaaattg 6817666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 515 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 1443513 - 1443400
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  1443513 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 1443414  T
Q  615 atcactgtgatcct 628  Q
    |||| ||| |||||    
T  1443413 atcaatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 515 - 628
Target Start/End: Original strand, 47012213 - 47012326
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  47012213 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatcaatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 47012312  T
Q  615 atcactgtgatcct 628  Q
    |||| |||||||||    
T  47012313 atcaatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Original strand, 42558848 - 42558916
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42558848 gaagaggtttggagggcatggttgatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 42558916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 50554779 - 50554836
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50554779 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 50554836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 6817477 - 6817534
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6817477 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 6817534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 31237418 - 31237475
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31237418 gagagcttcaatgttgctgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaagactgtcaa 31237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Original strand, 3369967 - 3370035
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3369967 gaagaggtttggaggacaaggttgatggacaaagttgactacgtagggagtgagctttggttgattaag 3370035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 138
Target Start/End: Original strand, 51895166 - 51895221
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  51895166 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtc 51895221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1443647 - 1443590
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  1443647 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 1443590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 9120679 - 9120736
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9120679 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 9120736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 33599819 - 33599876
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  33599819 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagcaaacactatcaa 33599876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 52642503 - 52642560
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  52642503 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttatgttgtaaaaaaagccaacaccgtcaa 52642560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 3012454 - 3012497
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3012454 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 3012497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Original strand, 26224221 - 26224264
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26224221 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaa 26224264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 4854997 - 4855054
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||||    
T  4854997 gagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaataccaaacactgtcaa 4855054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Original strand, 34777168 - 34777209
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34777168 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 34777209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 47012079 - 47012136
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47012079 gagagcttcaatgttggtgtcctagaaattgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 47012136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 659
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  575 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 659  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51123059 - 51122987
Alignment:
Q  328 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 400  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51123059 gtttggagggtgaggtagatggacaaagttgatactttaggaactgagcttaggttgattaagtttttgatag 51122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27088734 - 27088693
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  27088734 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtgagaa 27088693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Original strand, 34777274 - 34777331
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttg 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  34777274 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttg 34777331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 21842344 - 21841740
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||              
T  21842344 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttatcttttgattgtataggataactgtgaaaattgtaaatttttttgtgtg 21842245  T
Q  229 ----gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaa 324  Q
        |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  21842244 ggttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagtcaaatgctaggggcagagaa 21842145  T
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 424  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21842144 gaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgactaagatattgataggagtattttgtttgactgagttgt 21842045  T
Q  425 ttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaa 524  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| |    
T  21842044 ttaaaatgttattgtattgtggcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcaca 21841945  T
Q  525 tttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtga 624  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21841944 ttggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtga 21841845  T
Q  625 tccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatattt 724  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21841844 ttcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatattt 21841745  T
Q  725 gatgt 729  Q
    |||||    
T  21841744 gatgt 21841740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 2181113 - 2180514
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||              
T  2181113 aacaatggttatgtgatgtccgaatggtttatttaaatagtactgattttgtcttttgattgcataagatgatggtgaaaattgtaaattttttatgtgg 2181014  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||    
T  2181013 gttgatgaagttgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatgaaagaaatgcaaggttaatggagaagtcaaaggacaggggcaaagaag 2180914  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2180913 aggtttggaggacaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt--tt 2180816  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||    
T  2180815 taaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttgtgtcaaaaaatttcaatcaaat 2180717  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180716 tggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 2180617  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttg 725  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  |||||| ||||    
T  2180616 ccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagac-tttgcataccatcataaatcatatctttg 2180518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 703
Target Start/End: Original strand, 42472265 - 42472841
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa------------ 226  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||                 
T  42472265 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtataggatgattgtgaaaactgtaatatttttgtgtgg 42472364  T
Q  227 -ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42472365 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatcgagaagccaaatgataggggcagagaag 42472464  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42472465 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtt 42472564  T
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||    
T  42472565 taaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacat 42472664  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||    
T  42472665 tggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgat 42472764  T
Q  626 ccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 703  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42472765 cctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 42472841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 129 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28821746 - 28821360
Alignment:
Q  129 caacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt 228  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28821746 caacaatgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtctattgattgcataggatgatggtgaaaattgtaaatt 28821647  T
Q  229 -------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagg 315  Q
                 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28821646 ttttgtgtgggttgatgaagctgaagaactaggctattttaaaaacaatggtgttggtcaaggaagaaatgcaaggttgatggagaaaccaaaggataga 28821547  T
Q  316 gggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttga 415  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821546 gggatataagaggtttggagggaaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttga 28821447  T
Q  416 ttgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacattt 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821446 ttgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatctaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacattt 28821360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 329 - 729
Target Start/End: Original strand, 2853253 - 2853653
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2853253 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgaatattttgtttgattgagttgtttaa 2853352  T
Q  429 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 528  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||| | ||       |||||| ||||| |    
T  2853353 aatgatattgtaatgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaatagattgtcaatgaatgaaccaaacctttatgtcaaaatatttcaatgaaattgg 2853452  T
Q  529 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 628  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853453 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 2853552  T
Q  629 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 728  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  2853553 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcatattatcataagtcatatatttgatg 2853652  T
Q  729 t 729  Q
    |    
T  2853653 t 2853653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 372 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12738200 - 12737844
Alignment:
Q  372 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12738200 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaataaa 12738102  T
Q  472 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 571  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12738101 aagaggttgtcgatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaatta 12738002  T
Q  572 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 671  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12738001 gtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 12737902  T
Q  672 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  12737901 cactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12737844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 372 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 12801023 - 12800667
Alignment:
Q  372 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12801023 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 12800925  T
Q  472 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12800924 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaatta 12800825  T
Q  572 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 671  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12800824 gtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 12800725  T
Q  672 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  12800724 cactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12800667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 386 - 729
Target Start/End: Original strand, 30464679 - 30465022
Alignment:
Q  386 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaat 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30464679 ttaagatattcataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 30464778  T
Q  486 gaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 585  Q
    |||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30464779 gaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgataataccatc 30464878  T
Q  586 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  30464879 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgactataa 30464978  T
Q  686 aaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  30464979 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 407 - 733
Target Start/End: Original strand, 32134897 - 32135223
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32134897 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtcgatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 32134996  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32134997 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 32135096  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32135097 caacggagatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataac 32135196  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgtccat 733  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||    
T  32135197 atcctaagtcatatatttgatgtccat 32135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 407 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 8540732 - 8540410
Alignment:
Q  407 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8540732 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaaatccatgtaatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 8540633  T
Q  507 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 606  Q
    |       ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8540632 caaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 8540533  T
Q  607 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 706  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8540532 caacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 8540433  T
Q  707 atcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  8540432 atcataagtcatatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 83 - 427
Target Start/End: Original strand, 18624044 - 18624398
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa-gtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtac 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |     | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18624044 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttgtgttgtaagaaaaagtttat----ttaacaatggttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtac 18624139  T
Q  182 tgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtg 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18624140 tgattttgtcttttgattgtataggatgatagtgaaaattgtaaattttttatgtgggttgatgaagctaaagaactaggttattttaaaaacaatggtg 18624239  T
Q  269 ctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg 368  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18624240 ctggtcatggaagaaatgcaaggttgatagagaatccaaaggatagtgtcagagaagaggtttggatgacaaggttgatggatgaagttgattgtgtagg 18624339  T
Q  369 aagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttta 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18624340 aagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgttta 18624398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 139 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17577309 - 17577011
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||              
T  17577309 aacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtatatgatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 17577210  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17577209 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatgatgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaag 17577110  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg-aagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17577109 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttg 17577011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 139 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17575998 - 17575700
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||              
T  17575998 aacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtatatgatgattgtgaaaattgtaaatttttgtgtggg 17575899  T
Q  229 --gatgaagctggagaactaggctatttt-aaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
      |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17575898 ttgatgaagctgaagaattaggctatttttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaag 17575799  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg-aagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17575798 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgactgagttg 17575700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 516 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 28821332 - 28821119
Alignment:
Q  516 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821332 tcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 28821233  T
Q  616 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 715  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  28821232 tcactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagt 28821133  T
Q  716 catatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||    
T  28821132 catatatttgatgt 28821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 139 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17575278 - 17574980
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt---------- 228  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||              
T  17575278 aacaatggttatttgatgtatgaatgatttgtttaaattatactgattttgtcttttgattgtatatgatgattgtgaaaattgtaaattttttgtgtgg 17575179  T
Q  229 ---gatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaag 325  Q
       |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17575178 gttgatgaagctgaagaattaggctattttaaaaacaatggtgttggtcatggaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggcagagaag 17575079  T
Q  326 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg-aagtgagcttaggttgattaag-atattgataggagtattttgtttgattgagttg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17575078 aggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtgagcttaggttgattaagtatattgataggagta-tttgtttgactgagttg 17574980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 545 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7268768 - 7268584
Alignment:
Q  545 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 644  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268768 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7268669  T
Q  645 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  7268668 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgt 7268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 83 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34328321 - 34328108
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtact 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34328321 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaacaatggttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaataatact 34328222  T
Q  183 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaa-------------ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34328221 gattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatattttgtgtgggttgatgaagctgaggaactaggctattttaaaaacaatggtgc 34328122  T
Q  270 tggtcttgtaagaa 283  Q
    ||||| || |||||    
T  34328121 tggtcatggaagaa 34328108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 578 - 729
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540576
Alignment:
Q  578 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacacttt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  678 gattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 24540576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 426 - 643
Target Start/End: Original strand, 41494524 - 41494741
Alignment:
Q  426 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || | ||       ||| |||||||    
T  41494524 taaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgtagtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttttatcaaaatctttccatcaaat 41494623  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 625  Q
    | ||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41494624 tggtccttctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaat 41494723  T
Q  626 ccttggtgcatacatttg 643  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  41494724 ccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 40781543 - 40781430
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  40781543 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 40781444  T
Q  615 atcactgtgatcct 628  Q
    |||| |||||||||    
T  40781443 atcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 516 - 628
Target Start/End: Original strand, 29620912 - 29621024
Alignment:
Q  516 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 615  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  29620912 tcaatcacattggtccttgaattacaatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaga 29621011  T
Q  616 tcactgtgatcct 628  Q
    ||| |||||||||    
T  29621012 tcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1344348 - 1344283
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1344348 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtgagcttaggctgattaag 1344283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 322 - 388
Target Start/End: Original strand, 28036377 - 28036443
Alignment:
Q  322 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgatta 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28036377 gaagaagtttggagggcaaggttgatggacaaaattgattgtgtaggaagtgagcttagattgatta 28036443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2181219 - 2181162
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2181219 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactgtcaa 2181162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18341275 - 18341214
Alignment:
Q  329 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 390  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18341275 tttggagggcaatgttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaaattgattaag 18341214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 435
Target Start/End: Original strand, 1343744 - 1343854
Alignment:
Q  325 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 424  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||   || |||| ||| ||||||| |    
T  1343744 gaggtttgaaggacaaggttgatggacaaagttgattgtatagaaagtgagcttatgctgattaagtttttgatagtcataatttgcttgtttgagtttt 1343843  T
Q  425 ttaaaatgcta 435  Q
    |||| ||||||    
T  1343844 ttaacatgcta 1343854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21842450 - 21842393
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21842450 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaatagctaacactgtcaa 21842393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 42472159 - 42472216
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  42472159 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 42472216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27350039 - 27349967
Alignment:
Q  328 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 400  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27350039 gtttggagggtgaggttgatggacaaagttgatactttaggaattgagcttaggttgattaagtttttgatag 27349967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17575383 - 17575326
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17575383 gagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 17575326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17576103 - 17576046
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17576103 gagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 17576046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17577414 - 17577357
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  17577414 gagagcttccatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaacagcaaacactgtcaa 17577357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 29620778 - 29620835
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  29620778 gagagtttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaagagcaaacactgtcaa 29620835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 30464541 - 30464598
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30464541 gagagcttcaatgttgctgacctagaatttgtgttgtaagagaagccaacactgtcaa 30464598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40781677 - 40781636
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40781677 gagagcttcaatgttggtgtcctagaatttgtgttgtaagaa 40781636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Original strand, 41494437 - 41494490
Alignment:
Q  87 gcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  41494437 gcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaaaccaacactgtcaa 41494490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18341610 - 18341571
Alignment:
Q  87 gcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaa 126  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18341610 gcttgaatgttggtgtcccataatttttgttgtaagaaaa 18341571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Original strand, 32134835 - 32134885
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaaca 133  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32134835 gagagcttcaacaatggtgtcctagaatttgtgttgtaagaaaagtcaaca 32134885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7268839 - 7268782
Alignment:
Q  139 aacaatagttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttg 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  7268839 aacaatggttatttgatgtatgaatgttttgtttaaattatactgattttgccttttg 7268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 279 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 9458 - 9008
Alignment:
Q  279 aagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 378  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9458 aagaaatgtaaggttgatggagaagccaaatgataggagcagagaagaggtttggagggcaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagctt 9359  T
Q  379 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggt 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9358 aggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggt 9259  T
Q  479 tgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 578  Q
    ||||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9258 tgtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattagtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaa 9159  T
Q  579 taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9158 taccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttg 9059  T
Q  679 attataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  9058 attataaaaagacagacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 146 - 729
Target Start/End: Original strand, 107376 - 107970
Alignment:
Q  146 gttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||    
T  107376 gttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgggttgatg 107475  T
Q  233 aagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttg 332  Q
    ||| || ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||     
T  107476 aagttgaagaactaggttagtttaaaa-caatggtgctggtcatggaagaaatgcaaggttgatgaagaagccaaaggatagtgtcagcgaagaggtttt 107574  T
Q  333 gagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  107575 gagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattgagttgtttaaaatg 107674  T
Q  433 ctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtcct 532  Q
     ||||| |||||| |||||   |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||       |||||||||||| ||| |    
T  107675 ttattgtattgtgccaagtttgtgtaatgtagtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatc-aacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtcat 107773  T
Q  533 tgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggt 632  Q
    |  ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  107774 tctattgtatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaattttcacaatataaatcactgtgatcattggt 107873  T
Q  633 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  107874 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 107263 - 107320
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  107263 gagagcttcaatgttggtgtcctaaaatttgtgttgtaagaaaattcaacattgtcaa 107320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 146 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 891 - 301
Alignment:
Q  146 gttatgtgatgtgtgaatgatttgtttaaatagtactgattttgtcttttgattgtataggatgatggtgaaaattgtaaatt-------------gatg 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||             ||||    
T  891 gttatgtgatgtgtgaatggtttgtttaaatagtacttattttgtcttttgattgtatatgatgatggtgaaaattgtaaattttttgtgtgagttgatg 792  T
Q  233 aagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaagaggtttg 332  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  791 aagctgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgctggtcatagaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaatgataggggtagagaagaggtttg 692  T
Q  333 gagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatg 432  Q
    |||||||||||||||             |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691 gagggcaaggttgat-------------tgtgtaggaagtcagcttaggttgattacgatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatg 605  T
Q  433 ctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata----------------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnntt 516  Q
    |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||                 ||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||       ||    
T  604 ctattctattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagttt 505  T
Q  517 caatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 616  Q
    |||||||||| |||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  504 caatcaaattggtccttgaattatatg---------catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatat 414  T
Q  617 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  413 cactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtc 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1004 - 947
Alignment:
Q  83 gagagcttcaatgttggtgtcctataatttttgttgtaagaaaagtcaacactgtcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1004 gagagcttcaatgttggtgtcatagaatttgtgttgtaagaaaagccaacactatcaa 947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 515 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4043
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4257 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 4158  T
Q  615 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  4157 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 4058  T
Q  715 tcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||    
T  4057 tcatatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 515 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 5429 - 5215
Alignment:
Q  515 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 614  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 5330  T
Q  615 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  5329 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 5230  T
Q  715 tcatatatttgatgt 729  Q
    |||||||||||||||    
T  5229 tcatatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 227 - 581
Target Start/End: Original strand, 1403 - 1752
Alignment:
Q  227 ttgatgaagctggagaactaggctattttaaaaacaatggtgctggtcttgtaagaaatgcaaggttgatggagaagccaaaggatagggggagagaaga 326  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   | | ||||||    
T  1403 ttgatgaagctgaagaactaggttattttaaaaacaatggtgatgagcatggaagaaatgcaaggttgatgcagaagtcaaaggatacttgcaaagaaga 1502  T
Q  327 ggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttt 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1503 ggtttggagggcaaggt--atggataaagttgattgtgtaggaagtgaatttaggctgattaagatgttgataggagtaatttgtttgattgagttgttt 1600  T
Q  427 aaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaat-aaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 525  Q
    |||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||| || |||| ||       ||| |||||||    
T  1601 aaaatgttattgtattatgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaaagatgttgtcaatgaat---tcaacca-ttctatcaaaatatttccatcaaat 1696  T
Q  526 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac 581  Q
    | ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1697 tggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaatac 1752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University