View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10070_low_41 (Length: 343)

Name: NF10070_low_41
Description: NF10070
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10070_low_41
NF10070_low_41
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (27-324)||(30775362-30775655)
chr4 (76-308)||(9335701-9335933)
chr4 (75-266)||(35132616-35132807)
chr4 (76-275)||(23596395-23596594)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (36-324)||(16661766-16662050)
chr2 (75-324)||(16657326-16657575)
chr2 (57-270)||(7542390-7542599)
chr2 (76-272)||(12234851-12235047)
chr2 (79-263)||(12245219-12245403)
chr2 (76-272)||(14703570-14703766)
chr2 (224-323)||(12258539-12258638)
chr2 (82-270)||(11999558-11999746)
chr2 (119-191)||(17716546-17716618)
chr2 (76-270)||(43625576-43625770)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (36-320)||(8628646-8628926)
chr7 (27-320)||(8585471-8585760)
chr7 (75-283)||(8602125-8602333)
chr7 (75-308)||(13333265-13333498)
chr7 (76-324)||(8659473-8659721)
chr7 (75-324)||(8667529-8667778)
chr7 (76-283)||(8382686-8382893)
chr7 (82-272)||(17268101-17268291)
chr7 (75-308)||(10494183-10494416)
chr7 (75-323)||(8654561-8654809)
chr7 (79-272)||(17260403-17260596)
chr7 (79-278)||(8570467-8570666)
chr7 (79-278)||(8581856-8582055)
chr7 (75-204)||(6789742-6789871)
chr7 (76-324)||(27830685-27830933)
chr7 (75-278)||(8576482-8576685)
chr7 (75-308)||(8636152-8636385)
chr7 (75-283)||(8610068-8610276)
chr7 (79-204)||(3147502-3147627)
chr7 (79-272)||(8538198-8538391)
chr7 (79-283)||(8559484-8559688)
chr7 (75-270)||(1301624-1301823)
chr7 (76-204)||(8671440-8671568)
chr7 (236-278)||(8590794-8590836)
chr7 (236-278)||(29581811-29581853)
chr7 (75-204)||(7877542-7877671)
chr7 (79-275)||(8545792-8545987)
chr7 (76-278)||(29577479-29577684)
chr7 (79-185)||(8102916-8103022)
chr7 (226-275)||(3147423-3147472)
chr7 (75-144)||(8647167-8647236)
chr7 (239-278)||(7877706-7877745)
chr7 (82-197)||(8017229-8017344)
chr7 (76-113)||(29581651-29581688)
chr7 (117-202)||(39985878-39985963)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (36-324)||(34466567-34466851)
chr1 (76-270)||(15595198-15595399)
chr1 (75-270)||(4678367-4678562)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (75-272)||(43745011-43745206)
chr8 (76-275)||(12528663-12528862)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (75-192)||(28220193-28220310)
chr5 (226-272)||(28220113-28220159)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (84-205)||(28910811-28910932)
chr6 (118-191)||(11276197-11276270)
chr6 (130-197)||(11156507-11156574)
chr6 (118-197)||(11170807-11170886)
chr6 (130-197)||(11196960-11197027)
chr6 (118-197)||(11200125-11200204)
chr6 (118-191)||(11209635-11209708)
[»] scaffold1207 (1 HSPs)
scaffold1207 (118-191)||(1128-1201)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30775655 - 30775362
Alignment:
Q  27 gcagagatgtatttggaatccccagttaaaaatgcagttgtcactgtatgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775655 gcagagatgtatttggaatccccagttaaaaatgcagttatcactgt----gcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggt 30775560  T
Q  127 gccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagagga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30775559 gccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagagga 30775460  T
Q  227 atatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30775459 atatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaactgctggaaacact 30775362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 308
Target Start/End: Original strand, 9335701 - 9335933
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |    
T  9335701 gtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctg 9335800  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  |   ||||||| | |  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||    
T  9335801 cagctattgcatatggccttgataagagaaatgactgtgatggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcggtacttttgatgtgtctatcct 9335900  T
Q  276 caccattagagatgatgtgtttgaagttaaagc 308  Q
    ||| ||||  | |||| | |||||||| |||||    
T  9335901 cacaattaagggtgatctatttgaagtaaaagc 9335933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35132807 - 35132616
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    ||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  35132807 tgtgcctgcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgctggtgctattgctggtcccaatgttatgagagtaatgaatgaacctactgcc 35132708  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgt 266  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||  |   |||| ||  ||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35132707 gcagcggttgcatatggccttgacaagagatctgattgtgctggagaacaaaatatttttgtcttcgatcttggtggtggcacttttgatgt 35132616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Original strand, 23596395 - 23596594
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  23596395 gtgcctgcatacttcaacgattcacaacgtcaagctactaaggatgctggtgtcatttctggactcaatgtgatgagaattattaacgagcccactgctg 23596494  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||| || ||   ||  || ||||| |||  || || | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23596495 ccgctattgcttatggtcttgataagaaagctacaagtactggtgagaagaacgttcttattttcgatcttggtggtggaacttttgatgtttcacttct 23596594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 324
Target Start/End: Original strand, 16661766 - 16662050
Alignment:
Q  36 tatttggaatccccagttaaaaatgcagttgtcactgtatgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgct 135  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16661766 tatttggaatcaccggttaaaaatgcagttgtcactgtt----cctgcttattttaacgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgct 16661861  T
Q  136 ggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttg 235  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||||| ||| || ||||||||||    
T  16661862 ggccttaacgttgtgaggataatcaatgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaaaagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttg 16661961  T
Q  236 tctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16661962 tctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccacttctggaaacact 16662050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 324
Target Start/End: Original strand, 16657326 - 16657575
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || ||||| || |||||     
T  16657326 tgtgccagcttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccatcgctggccttaatgtcattcgaattatcaatgaacctactgct 16657425  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |    
T  16657426 gcagctattgcatatggtcttgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatcc 16657525  T
Q  275 tcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
    | || ||||  | |||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||    
T  16657526 ttacaattaagggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacact 16657575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7542599 - 7542390
Alignment:
Q  57 aatgcagttgtcactgtatgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaata 156  Q
    ||||||||||| ||||||    ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||   |    
T  7542599 aatgcagttgttactgta----cctgcttattttaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcgggtgccattgctggcctcaatgttatgagggca 7542504  T
Q  157 attaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtggga 256  Q
    || ||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||  |   | |||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  7542503 atgaatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagcgaaatatttttgtttttgatcttggcggtggca 7542404  T
Q  257 cttttgatgtgtct 270  Q
    ||||||||||||||    
T  7542403 cttttgatgtgtct 7542390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12235047 - 12234851
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||| || || ||||  ||||    
T  12235047 gtgcctgcttatttcaatgattctcaacgaaaagcaactatagatgctggtgtcattgctggcctcaatgttatgagggtaatgaacgaacccatggcag 12234948  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    | ||| |||||||||| ||||| ||||||  |   |||| ||  ||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  12234947 ccgctgttgcatatggtcttgacaagagaactgattgtgttggagaacgaaatatttttgtttttgatctcggcggtggcacttttgatgtgtctct 12234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 263
Target Start/End: Original strand, 12245219 - 12245403
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    ||||||||||| | |||| | ||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||    
T  12245219 cctgcttattttagtgattctcagcgaaaagcaacgatagatgctggctcaattgctggtctcaatgttatgagggtaatgaatgaacccactgctgcag 12245318  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttga 263  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| |   |||| ||  || || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12245319 ctgttgcatatggccttgaaaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatttttgtgtttgatcttggtggtggcacttttga 12245403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14703766 - 14703570
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||  |||| ||||| || || || |    
T  14703766 gtgcctgcttattttagtgattctcaaagaaaagccactatggatgctggtgttattgccggcctcaatgttatgagggtaatgaatgaacctacagctg 14703667  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  |   | || ||  ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14703666 cagctattgcatatggccttgacaagagaactgattatggtggagaacgtaatatatttgtctttgatcttggtggtggtacttttgacgtgtctct 14703570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 323
Target Start/End: Original strand, 12258539 - 12258638
Alignment:
Q  224 ggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacac 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||| ||| ||||||| || ||  ||||||||||    
T  12258539 ggaatatttttgtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctctactaaccattaaggataatgtctttcaagttaaggctacagctggaaacac 12258638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11999746 - 11999558
Alignment:
Q  82 gcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagcta 181  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | |||||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||| ||     
T  11999746 gcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgccggtgcaattgctggcatcaatgttataagggtaatgaatgaacccactgctgcaactg 11999647  T
Q  182 ttgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 270  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |   |||| ||  || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  11999646 ttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaagaaacattttagtctttgatcttggcggtggcacttttgatttgtct 11999558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Original strand, 17716546 - 17716618
Alignment:
Q  119 atgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatgg 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  17716546 atgctggtgctattgctggtcttaatttcatgagaattattaatgagcccactgctgcagccattgcttatgg 17716618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43625770 - 43625576
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||| |||||  || ||||||||| |  || |||| ||||| || || || |    
T  43625770 gtgcctgcttacttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgttggtgtcattgtcggccttaatgttttacgagtaatcaatgaaccaacagctg 43625671  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 270  Q
    | ||| | ||||| || ||| | ||||||  ||  |||| ||  ||  | ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43625670 ctgctctagcatacggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattttcatctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtct 43625576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8628926 - 8628646
Alignment:
Q  36 tatttggaatccccagttaaaaatgcagttgtcactgtatgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgct 135  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8628926 tatttgaaatcacctgtaaaaaatgcagttgtcac----cgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatgaatgctggtgccattgct 8628831  T
Q  136 ggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttg 235  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  8628830 ggccttaatgttatgaggataatcaatgaccccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaggtgtgatggtgaacgaaatatttttg 8628731  T
Q  236 tctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaa 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  8628730 tgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccactgctggaaa 8628646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 320
Target Start/End: Original strand, 8585471 - 8585760
Alignment:
Q  27 gcagagatgtatttggaatccccagttaaaaatgcagttgtcactgtatgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggt 126  Q
    |||||||  |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8585471 gcagagacatatttgaaatcacctgttcaaaatgcagttgtgactgt----gcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggt 8585566  T
Q  127 gccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagagga 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||  ||||||| |||  | |    
T  8585567 gccattgctggccttaatgttatgaggataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaacgaa 8585666  T
Q  227 atatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaa 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  8585667 atatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagcaaccgctggaaa 8585760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8602333 - 8602125
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  8602333 tgtgccggcttattttaatgattctcagcgaaaagccacaaaagatgctggtgccattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgagccaactgca 8602234  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    || ||| |||||||||| ||| | ||||||| ||  |||| ||  ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8602233 gctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaatattttcatatttgatcttggtggtggaacttttgatgtttctcttc 8602134  T
Q  275 tcaccatta 283  Q
    |||| ||||    
T  8602133 tcacaatta 8602125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 308
Target Start/End: Original strand, 13333265 - 13333498
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| | ||  ||||||| ||||| || |||||     
T  13333265 tgtgccggcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtgctattgctggccttaatatcattcgaataatcaatgaacctactgct 13333364  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||| | || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |    
T  13333365 gcagctattgcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaagcgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgtgtctatcc 13333464  T
Q  275 tcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagc 308  Q
    | || ||||  | |||||| |||||||| |||||    
T  13333465 ttacaattatgggtgatgtctttgaagtaaaagc 13333498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8659721 - 8659473
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    |||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||| ||    ||||||||||| || ||||| |    
T  8659721 gtgcctgcatagttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagattccggtgccattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctactgctg 8659622  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||   ||||||| | |    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  8659621 cagctattgcatatggttttgacaagagaggtgactgtgatggtaaacaaaatattttggtctttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtctatcct 8659522  T
Q  276 caccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
     || || |  | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8659521 tacaatgaagggtgatgtctttgaagtaaaagccacttctggaaacact 8659473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8667778 - 8667529
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| || |||||     
T  8667778 tgtgccagcttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgcg 8667679  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |   ||||||| |    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |    
T  8667678 gcagctattgcatatggccttgacaagagaaatgactgtgatggtagccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcgggacttttgatgtgtctatcc 8667579  T
Q  275 tcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  8667578 tcacaattaagggtgatgtctttgaagtgaaagccactgcaggaaacact 8667529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 283
Target Start/End: Original strand, 8382686 - 8382893
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |    
T  8382686 gtgcctgcatatttcaatgattctcaacggaaagccacaaaagatgctggtgcgattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgagccaactgccg 8382785  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    | ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  |||  ||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8382786 ctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagagagaaatattttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgtgtctctcct 8382885  T
Q  276 caccatta 283  Q
    ||| ||||    
T  8382886 cacaatta 8382893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17268291 - 17268101
Alignment:
Q  82 gcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagcta 181  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||   |||| ||||| || ||||| |||||||    
T  17268291 gcttacttcaacgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgtcattgctggccttaatgtattgaaggtaatcaatgaaccaactgctgcagcta 17268192  T
Q  182 ttgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||  |||| ||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17268191 ttgcatatggccttggcaagagaactaactgtgttgaagaacggaatatttttgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctct 17268101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 308
Target Start/End: Original strand, 10494183 - 10494416
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| || |||||     
T  10494183 tgtgccggcttacttcaacgattctcaacgaaaggctactattgatgctggtgctattgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgct 10494282  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||| | | |  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |    
T  10494283 gcagctattgcatatggccttgacaagagaagtgattgtgagggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgtgtctatcc 10494382  T
Q  275 tcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagc 308  Q
    |||| ||||  | |||||| |||||||| |||||    
T  10494383 tcacaattaagggtgatgtctttgaagtaaaagc 10494416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 8654809 - 8654561
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| || || ||||||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  | ||| | ||||| || |||||     
T  8654809 tgtgccggcatacttcaatgactctcagcgaaaagcaaccatagatgctggtgccattgctggacttaacgtcattcggatactcaatgaacctactgcc 8654710  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||  | ||||| | |  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  8654709 gcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaacggaatattttggtatttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtctatac 8654610  T
Q  275 tcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacac 323  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  8654609 tcacaattaagggtgatgtctttgacgtaaaagccactgctggaaacac 8654561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17260596 - 17260403
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||   |||||||||| || | ||| ||||    
T  17260596 cctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgttattgctggcctttatgttttgaagttaattaatgaacctattgctgcag 17260497  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||  ||  |||| |   |   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17260496 ctattgcatatggccttgtcaagagaactaattgtgtttaagtacggaatatttttgtctttgaccttggtggggggacttttgatgtgtctct 17260403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8570666 - 8570467
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  8570666 cctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcag 8570567  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcac 278  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||| ||  | || || | |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8570566 ctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattttgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattctcac 8570467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8582055 - 8581856
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||  ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  8582055 cctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgcaggtctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccgactgcggcag 8581956  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcac 278  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||| ||  |||| || | |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8581955 ctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggaggtggaacttttgatgtgtctattctcac 8581856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6789871 - 6789742
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || || ||     
T  6789871 tgtgcctgcttatttcaatgattctcaacggaaagccactttagatgctggtgccattgctggtcttaatgttatacgaataatcaatgaaccaacagct 6789772  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagaga 204  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  6789771 gctgctcttgcatatggccttgataagaga 6789742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 324
Target Start/End: Original strand, 27830685 - 27830933
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |  ||||| ||||| |    
T  27830685 gtgccagcttatttcaatgactctcaacgaaaagccactgtagattccggtgccattgctggccttaatgttatgcggataataagcgagcctactgctg 27830784  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | ||   |  | |  ||  ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27830785 cagctattgcatatggccttgacacgggaacaaaatatactggagaacggaatatttttgtgtttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctcttgt 27830884  T
Q  276 caccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
     || ||||  ||| | || ||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  27830885 tacaattaaggataaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacact 27830933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8576685 - 8576482
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |||||     
T  8576685 tgtgcctgcttattttaatgattcccaacgaagagccactaaagatgcaggtgcaattgctggtctcaatgtcatgcagataatcaatgaaccgactgcg 8576586  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    |||||| |||| ||||| ||| | ||||||| ||  |||| || | | || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  8576585 gcagctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaaagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattc 8576486  T
Q  275 tcac 278  Q
    ||||    
T  8576485 tcac 8576482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 308
Target Start/End: Original strand, 8636152 - 8636385
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| || |||||     
T  8636152 tgtgcccgcttatttcaatgattctcagcgtaaatccaccaaagatgctggtgccattgccggccttaatgtaattcggataatcaatgaaccaactgct 8636251  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||  |||| |   ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||| | |    
T  8636252 gcagcttttgcgtatggacttcaaaagagaggtaactgtgttaaagagagaaacattttcgtatttgatcttggtggtggtacattcgacgtgtctatac 8636351  T
Q  275 tcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagc 308  Q
    |||  |||| || ||| || ||||||||||||||    
T  8636352 tcaaaattaaaggtgaagtctttgaagttaaagc 8636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8610276 - 8610068
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |  |||||||||| |||| |||| |||||||| ||  | || || ||||| || || ||     
T  8610276 tgtgcctgcttattttaatgattctcagcggaaagccacaaaagatgctggtgtcatttctggccttaatgtaatccggattatcaatgaaccaacggct 8610177  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttc 274  Q
    || ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||  |   | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8610176 gcggctcttgcatatggtcttcagaagagagctaattgtgtggaaaatagaaatatttttatctttgatcttggtggtgggactttcgatgtgtctgttc 8610077  T
Q  275 tcaccatta 283  Q
    |||| ||||    
T  8610076 tcacaatta 8610068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3147627 - 3147502
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||  |||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  3147627 cctgcttatttcaatgatgctcagcggaaagcgacaatagatgctggtgttattgctggccttaatattatgcggataatcaatgaacctactgctgcag 3147528  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagaga 204  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||    
T  3147527 ctattgcgtatggactggacaagaga 3147502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8538391 - 8538198
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |    
T  8538391 cctgcttatttcaatgattcacagcgaagagccaccaaagatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctg 8538292  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    || ||||||| || ||| | ||||||| ||  |||| ||  ||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8538291 ctcttgcatacggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaaagttttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgtatctct 8538198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8559688 - 8559484
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    ||||||||||| |||||| | ||  ||| |||||| |  ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| || |||||||| |    
T  8559688 cctgcttattttaatgattctcaaagaagagccaccaaagatgcaggtgaaattgctggtcttaatgtaatgcagataatcaatgaaccaactgcagctg 8559589  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcac 278  Q
    || |||||||||||||| | ||||||  ||  |||| |   ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8559588 ctcttgcatatggacttcaaaagagatctaattgtgttaaagagagaaatattttcatctttgatctcggtggtggaacttttgatgtttctcttctcac 8559489  T
Q  279 catta 283  Q
     ||||    
T  8559488 aatta 8559484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1301823 - 1301624
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagc----ccac 170  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||||||| |    | ||    
T  1301823 tgtgcctgcacatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgccggtgcaattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctagctac 1301724  T
Q  171 tgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 270  Q
    ||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| ||   ||||||| | |  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1301723 tgctgcagctattgcgtatggttttgacaagagaagtgactgtgatggtaaacggaatattttggtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtct 1301624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 204
Target Start/End: Original strand, 8671440 - 8671568
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||||  ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |    
T  8671440 gtgccagcttacttcaatgattctcagcgaacggccaccattgatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctg 8671539  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagaga 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8671540 cagctattgcatatggccttgacaagaga 8671568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8590836 - 8590794
Alignment:
Q  236 tctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcac 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8590836 tctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctcttctcac 8590794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 278
Target Start/End: Original strand, 29581811 - 29581853
Alignment:
Q  236 tctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcac 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29581811 tctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgtctcttctcac 29581853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 7877542 - 7877671
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||  |||| || || ||||||||| | ||||||||||| || |||||     
T  7877542 tgtgccggcttatttcaatgattctcaacgaaaagccacaaaagatgctggtgcagttgccggcctcaatgttatgcggataattaatgaaccaactgct 7877641  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagaga 204  Q
    || ||  |||||||||| ||| | ||||||    
T  7877642 gctgcccttgcatatggccttcaaaagaga 7877671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8545987 - 8545792
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | || | |||| |  ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| || |    
T  8545987 cctgcttattttaatgattcacaacaaagatccacaaaagatgcaggtgaaattgccggtctaaatgtcatgcggataatcaatgaaccgactgcggcgg 8545888  T
Q  179 ctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    || |||||||||| ||| | ||||||| ||  || | || | |||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8545887 ctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattg-gttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattct 8545792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 278
Target Start/End: Original strand, 29577479 - 29577684
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||| ||    |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |    
T  29577479 gtgccagcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgccggcattattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccaactgctg 29577578  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctg---agaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    | ||  ||||||||||| || | ||||||||||  | || || ||   || | ||| | ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29577579 ctgcacttgcatatggaattcaaaagagaggtaattttgttgttggaaagcgaaatgtattcatctttgatcttggtggtggcacctttgatgtgtctct 29577678  T
Q  273 tctcac 278  Q
    ||||||    
T  29577679 tctcac 29577684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8103022 - 8102916
Alignment:
Q  79 cctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcag 178  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||  |||| ||||  ||||||||||  || |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  8103022 cctgcttacttcaatgattctcagcgtcaagcaactaaagatgctggtgttatcgctggtttaaatgttttgagaattattaatgagccaactgctgctg 8102923  T
Q  179 ctattgc 185  Q
    |||||||    
T  8102922 ctattgc 8102916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3147472 - 3147423
Alignment:
Q  226 aatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3147472 aatatttttatctttgacttgggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 3147423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8647236 - 8647167
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaat 144  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8647236 tgtgcctgcatacttcaatgattatcagcgaaaagccactatagatgccggggccattgctggccttaat 8647167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 278
Target Start/End: Original strand, 7877706 - 7877745
Alignment:
Q  239 ttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcac 278  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7877706 ttgatcttggtggtggcactttcgatgtgtctcttctcac 7877745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 197
Target Start/End: Original strand, 8017229 - 8017344
Alignment:
Q  82 gcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagcta 181  Q
    ||||| ||||||||| | |||||  ||||||| | |||||| |||| |||||| || || |||||| ||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  8017229 gcttacttcaatgattcgcagcgtcaagccacaaaggatgccggtgtcattgcaggactcaatgttttgagaattatcaacgagccaacagctgcagcta 8017328  T
Q  182 ttgcatatggacttga 197  Q
    |||| || ||||||||    
T  8017329 ttgcgtacggacttga 8017344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 113
Target Start/End: Original strand, 29581651 - 29581688
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccac 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29581651 gtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccac 29581688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39985963 - 39985878
Alignment:
Q  117 ggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaaga 202  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  39985963 ggatgctggagttattgccggtcttaatgtcatgcgaattatcaatgagcccactgctgctgccattgcttatggtcttgacaaga 39985878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 324
Target Start/End: Original strand, 34466567 - 34466851
Alignment:
Q  36 tatttggaatccccagttaaaaatgcagttgtcactgtatgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgct 135  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||     |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  34466567 tatttggaatcaccaattaagaatgcagttatcac----cgtgcctgcttattttaatgattctcagcgaaaagctactgtggatgctggtactattgct 34466662  T
Q  136 ggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttg 235  Q
    || ||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |   | ||  |  ||  | |||||||| |    
T  34466663 ggccttaatgttttgcaaataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttgtggaagaaggaaatattttcg 34466762  T
Q  236 tctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaacttctggaaacact 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  34466763 tctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctctccttacaattaaggataatgtctttgaagttaaggccacttctggtaacact 34466851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15595399 - 15595198
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatg-------agccc 168  Q
    |||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||       |||      
T  15595399 gtgcctgcttatctcaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcaggtgccattgctggccttaatgttatacgggtaatcaatgaaccgacagctg 15595300  T
Q  169 actgcagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgt 268  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||   ||  |||| ||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15595299 acagctgcagctattgcatatggccttgacaagaggattaactgtgttggagaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtggcacttttgatgtgt 15595200  T
Q  269 ct 270  Q
    ||    
T  15595199 ct 15595198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Original strand, 4678367 - 4678562
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    ||||||||| || ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||| || || || ||||      
T  4678367 tgtgcctgcatacttcaatgattctcaacgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgtt 4678466  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtct 270  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| ||    |||||  | |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4678467 gcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgattgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtct 4678562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43745206 - 43745011
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||     
T  43745206 tgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccacta--gatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaagataatcaatgaacccactgct 43745109  T
Q  175 gcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgag--aggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||  ||  | || ||| |||  || ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43745108 gcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctg-tgc-gaggaagaaatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtctct 43745011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12528862 - 12528663
Alignment:
Q  76 gtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcag 175  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||  | ||||| || || || |||||||    
T  12528862 gtgccagcgtatttcaatgattcgcagcgacgagccaccaaggatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatacggataatcaacgaaccaactgcag 12528763  T
Q  176 cagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctcttct 275  Q
    | ||| ||||||||||  || | ||||||| ||  |||  ||  ||||| |  |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12528762 ctgctcttgcatatggcattcaaaagagagctaattgtcttgaagagagaaggatttttatttttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctcttct 12528663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28220310 - 28220193
Alignment:
Q  75 tgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| | || ||| | ||||| ||||||||     
T  28220310 tgtgcctgcttatttcaatgattatcagcggaaagccaccatagatgcaggtaccattgctggtctaaatgttctaaggatagtcaatgaacccactgct 28220211  T
Q  175 gcagctattgcatatgga 192  Q
    || |||||||||||||||    
T  28220210 gctgctattgcatatgga 28220193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28220159 - 28220113
Alignment:
Q  226 aatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 272  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28220159 aatattttcatctttgacctgggtggtgggacttttgatgtgtctct 28220113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28910932 - 28910811
Alignment:
Q  84 ttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctatt 183  Q
    ||||||||||||| |  || | |||||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  28910932 ttatttcaatgattcttagaggaaagccaccatagatgctggtgccattgtcaggcttaatgttatgcggataatcaatgagctcactgctgtagctatt 28910833  T
Q  184 gcatatggacttgagaagagag 205  Q
     ||||||| || || |||||||    
T  28910832 tcatatggcctcgacaagagag 28910811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11276270 - 11276197
Alignment:
Q  118 gatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatgg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11276270 gatgcgggtgctattgctggcctaaacgttatgcgaataataaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 11276197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11156574 - 11156507
Alignment:
Q  130 attgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttga 197  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11156574 attgctggcctcaatgttatgcgaataatcaatgagccttctgcagctgcaattgcatatggtcttga 11156507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11170886 - 11170807
Alignment:
Q  118 gatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttga 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| || ||||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11170886 gatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatggccttga 11170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11197027 - 11196960
Alignment:
Q  130 attgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttga 197  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11197027 attgctggcctcaatgttatgcgaataatcaatgagccttctgcagctgcaattgcatatggtcttga 11196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11200204 - 11200125
Alignment:
Q  118 gatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatggacttga 197  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| || ||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11200204 gatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaataatcaatgagccttctgcagctgcaattgcatatggtcttga 11200125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11209708 - 11209635
Alignment:
Q  118 gatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatgg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| || ||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11209708 gatgcgggtgctattgctggcctcaatgttttgcgaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 11209635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1207
Description:

Target: scaffold1207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1201 - 1128
Alignment:
Q  118 gatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactgcagcagctattgcatatgg 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| || ||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  1201 gatgcaggtgctattgctggcctcaatgttttgggaatactcaatgagcctactgcagctgcaattgcatatgg 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University