View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10070_low_5 (Length: 611)

Name: NF10070_low_5
Description: NF10070
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10070_low_5
NF10070_low_5
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (139-593)||(14291337-14291791)
chr2 (137-593)||(9296196-9296651)
chr2 (115-593)||(11098721-11099196)
chr2 (85-472)||(39811894-39812280)
chr2 (85-471)||(32246575-32246966)
chr2 (87-434)||(44312567-44312910)
chr2 (292-587)||(3491751-3492044)
chr2 (180-507)||(25398386-25398710)
chr2 (180-507)||(25403524-25403848)
chr2 (322-507)||(25407653-25407837)
chr2 (292-587)||(40738844-40739124)
chr2 (87-388)||(19344212-19344518)
chr2 (87-388)||(19349070-19349376)
chr2 (292-587)||(28258984-28259274)
chr2 (292-587)||(36757569-36757859)
chr2 (291-545)||(8040059-8040314)
chr2 (292-586)||(23078279-23078567)
chr2 (293-576)||(10707070-10707348)
chr2 (295-587)||(13569331-13569619)
chr2 (293-587)||(34388859-34389141)
chr2 (291-584)||(21629943-21630232)
chr2 (295-545)||(8389996-8390244)
chr2 (291-587)||(14698816-14699105)
chr2 (291-587)||(34682138-34682432)
chr2 (292-470)||(42039588-42039766)
chr2 (291-436)||(10445397-10445542)
chr2 (291-389)||(20522219-20522319)
chr2 (291-419)||(17865202-17865330)
chr2 (291-587)||(39482930-39483223)
chr2 (292-587)||(31056044-31056335)
chr2 (291-587)||(33118135-33118425)
chr2 (291-587)||(33528431-33528719)
chr2 (291-376)||(16940221-16940307)
chr2 (291-376)||(17010886-17010972)
chr2 (505-587)||(25409842-25409923)
chr2 (295-389)||(2869691-2869787)
chr2 (313-379)||(27149303-27149369)
chr2 (528-586)||(39811832-39811890)
chr2 (295-389)||(2838028-2838124)
chr2 (295-376)||(1345552-1345635)
chr2 (296-355)||(35215586-35215646)
chr2 (296-355)||(35217963-35218023)
chr2 (497-587)||(10445274-10445361)
chr2 (498-587)||(2837834-2837923)
chr2 (497-546)||(35397712-35397760)
chr2 (296-352)||(45332181-45332238)
chr2 (296-355)||(23452237-23452297)
chr2 (296-355)||(36558864-36558924)
chr2 (296-355)||(36561141-36561201)
[»] chr8 (42 HSPs)
chr8 (137-593)||(4759868-4760325)
chr8 (137-593)||(33037602-33038056)
chr8 (115-593)||(36979205-36979679)
chr8 (115-593)||(6311121-6311601)
chr8 (137-593)||(30655488-30655949)
chr8 (115-593)||(10688934-10689412)
chr8 (137-593)||(18852961-18853418)
chr8 (137-593)||(18870355-18870809)
chr8 (87-472)||(25328184-25328568)
chr8 (292-587)||(1261757-1262050)
chr8 (85-387)||(39784813-39785116)
chr8 (87-472)||(7289831-7290210)
chr8 (292-584)||(31071035-31071326)
chr8 (292-587)||(26287902-26288184)
chr8 (292-587)||(26301159-26301441)
chr8 (292-587)||(26313153-26313435)
chr8 (295-587)||(7412344-7412630)
chr8 (292-587)||(19175561-19175851)
chr8 (292-587)||(4456028-4456318)
chr8 (110-388)||(35745208-35745488)
chr8 (110-388)||(10684252-10684533)
chr8 (291-587)||(23799383-23799675)
chr8 (291-587)||(26403034-26403328)
chr8 (291-587)||(19752201-19752492)
chr8 (291-587)||(5702287-5702581)
chr8 (295-587)||(6127224-6127515)
chr8 (291-375)||(4696609-4696694)
chr8 (294-355)||(9765852-9765914)
chr8 (528-593)||(7289762-7289827)
chr8 (292-389)||(6813683-6813782)
chr8 (313-389)||(9054835-9054912)
chr8 (471-587)||(4696415-4696529)
chr8 (497-583)||(9054231-9054314)
chr8 (528-586)||(25327996-25328054)
chr8 (528-586)||(25328122-25328180)
chr8 (296-355)||(43079877-43079937)
chr8 (296-355)||(43082248-43082308)
chr8 (327-389)||(3051156-3051219)
chr8 (322-355)||(18810982-18811015)
chr8 (291-389)||(28307560-28307660)
chr8 (528-568)||(39784685-39784725)
chr8 (296-355)||(44721118-44721178)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (137-593)||(24741788-24742243)
chr4 (115-593)||(29760470-29760944)
chr4 (87-472)||(9224312-9224698)
chr4 (78-471)||(45347723-45348118)
chr4 (87-472)||(9229099-9229484)
chr4 (78-471)||(45357203-45357597)
chr4 (87-472)||(51520258-51520637)
chr4 (87-468)||(5732458-5732839)
chr4 (85-472)||(3813814-3814202)
chr4 (87-424)||(56146664-56146995)
chr4 (87-387)||(18855519-18855821)
chr4 (292-587)||(28468341-28468625)
chr4 (292-587)||(31985440-31985730)
chr4 (292-587)||(5396478-5396768)
chr4 (291-587)||(16623100-16623391)
chr4 (291-587)||(36315037-36315327)
chr4 (291-587)||(36329246-36329536)
chr4 (293-587)||(3777550-3777839)
chr4 (293-587)||(5143260-5143550)
chr4 (293-514)||(5147678-5147898)
chr4 (291-587)||(10047378-10047671)
chr4 (291-587)||(38152245-38152537)
chr4 (289-587)||(5269007-5269291)
chr4 (291-545)||(24333808-24334061)
chr4 (291-389)||(39245993-39246093)
chr4 (292-436)||(3796472-3796616)
chr4 (292-587)||(8689303-8689580)
chr4 (297-583)||(6743226-6743507)
chr4 (446-587)||(16628679-16628815)
chr4 (291-419)||(16630650-16630778)
chr4 (291-375)||(25862035-25862120)
chr4 (528-593)||(51520641-51520706)
chr4 (291-585)||(42599383-42599672)
chr4 (528-593)||(18712602-18712667)
chr4 (327-388)||(34495822-34495884)
chr4 (291-376)||(54867183-54867268)
chr4 (313-389)||(1983298-1983375)
chr4 (329-389)||(5112275-5112336)
chr4 (528-593)||(9224243-9224308)
chr4 (528-593)||(9229030-9229095)
chr4 (313-389)||(39774303-39774380)
chr4 (497-587)||(25861840-25861927)
chr4 (296-355)||(16931789-16931849)
chr4 (296-355)||(16934143-16934203)
chr4 (296-355)||(22780373-22780433)
chr4 (296-355)||(44599838-44599898)
chr4 (497-583)||(5112440-5112523)
chr4 (147-177)||(3813734-3813764)
chr4 (316-389)||(18377384-18377458)
chr4 (296-355)||(6765117-6765177)
chr4 (296-355)||(7941596-7941656)
chr4 (296-355)||(18709164-18709224)
chr4 (296-355)||(22782738-22782798)
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (137-593)||(2671380-2671836)
chr3 (115-593)||(7167072-7167548)
chr3 (137-593)||(9091095-9091552)
chr3 (137-593)||(8738857-8739314)
chr3 (274-593)||(40372590-40372908)
chr3 (87-472)||(22173100-22173484)
chr3 (134-589)||(28503662-28504107)
chr3 (137-593)||(8477212-8477667)
chr3 (87-468)||(18656228-18656609)
chr3 (269-587)||(26928395-26928709)
chr3 (292-584)||(1305949-1306239)
chr3 (292-587)||(32143321-32143613)
chr3 (335-589)||(28501495-28501750)
chr3 (292-545)||(27452958-27453210)
chr3 (292-587)||(27974748-27975039)
chr3 (292-587)||(27986252-27986533)
chr3 (292-587)||(16264350-16264639)
chr3 (292-587)||(33386471-33386753)
chr3 (292-587)||(8370285-8370573)
chr3 (108-388)||(2677075-2677358)
chr3 (291-587)||(6794511-6794801)
chr3 (110-388)||(8512032-8512314)
chr3 (110-388)||(8516912-8517194)
chr3 (108-388)||(2672919-2673202)
chr3 (291-587)||(21711222-21711512)
chr3 (293-587)||(36029094-36029383)
chr3 (291-587)||(40592578-40592870)
chr3 (110-388)||(32475301-32475580)
chr3 (110-388)||(32480158-32480438)
chr3 (141-388)||(24967957-24968204)
chr3 (110-340)||(10207750-10207983)
chr3 (291-545)||(3715838-3716090)
chr3 (291-545)||(18552721-18552971)
chr3 (292-587)||(35925483-35925768)
chr3 (295-587)||(1736100-1736389)
chr3 (291-545)||(48438213-48438466)
chr3 (292-545)||(30709625-30709877)
chr3 (292-587)||(25795781-25796072)
chr3 (291-436)||(3328300-3328444)
chr3 (291-389)||(37466290-37466389)
chr3 (291-587)||(24694962-24695252)
chr3 (291-389)||(26298987-26299087)
chr3 (379-587)||(39032351-39032551)
chr3 (291-436)||(40844651-40844795)
chr3 (291-389)||(1417479-1417578)
chr3 (291-583)||(47923704-47923994)
chr3 (292-375)||(39039995-39040079)
chr3 (292-389)||(4386915-4387014)
chr3 (528-593)||(22173031-22173096)
chr3 (313-389)||(3323679-3323755)
chr3 (400-587)||(47649677-47649862)
chr3 (471-587)||(3323487-3323601)
chr3 (296-355)||(38210569-38210629)
chr3 (139-203)||(40372980-40373043)
chr3 (296-355)||(50494198-50494258)
chr3 (296-359)||(53894055-53894119)
chr3 (497-587)||(1417287-1417374)
chr3 (497-587)||(3328153-3328240)
chr3 (518-587)||(4386773-4386840)
chr3 (502-587)||(26299196-26299278)
chr3 (333-389)||(21353604-21353661)
chr3 (296-355)||(458483-458543)
chr3 (296-355)||(6063444-6063504)
chr3 (497-584)||(8126833-8126917)
chr3 (296-355)||(10621528-10621588)
chr3 (292-339)||(39153357-39153405)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (115-593)||(2057786-2058271)
chr7 (137-593)||(20357341-20357797)
chr7 (87-472)||(31109489-31109872)
chr7 (137-593)||(1533238-1533690)
chr7 (109-473)||(12406149-12406512)
chr7 (87-472)||(12396710-12397091)
chr7 (180-587)||(21639701-21640102)
chr7 (87-472)||(24024232-24024618)
chr7 (180-587)||(21645899-21646300)
chr7 (269-587)||(18408742-18409056)
chr7 (87-382)||(4866528-4866820)
chr7 (269-587)||(18413619-18413932)
chr7 (86-387)||(19992103-19992408)
chr7 (108-360)||(21812254-21812508)
chr7 (293-545)||(21983285-21983536)
chr7 (292-587)||(2479337-2479626)
chr7 (110-388)||(16879889-16880169)
chr7 (110-388)||(16884745-16885025)
chr7 (87-388)||(24261311-24261617)
chr7 (291-545)||(29159802-29160055)
chr7 (110-388)||(24266190-24266471)
chr7 (292-508)||(44848567-44848781)
chr7 (292-587)||(47263678-47263956)
chr7 (291-436)||(9189961-9190106)
chr7 (291-587)||(2580389-2580679)
chr7 (293-583)||(21988909-21989194)
chr7 (291-587)||(20284088-20284379)
chr7 (291-587)||(2647504-2647794)
chr7 (291-545)||(49091660-49091913)
chr7 (291-541)||(55947-56195)
chr7 (291-436)||(46516263-46516408)
chr7 (291-587)||(33332257-33332548)
chr7 (291-545)||(35960815-35961067)
chr7 (291-585)||(4796477-4796765)
chr7 (292-587)||(23402820-23403110)
chr7 (291-375)||(9185178-9185263)
chr7 (295-389)||(28617223-28617319)
chr7 (528-593)||(4873312-4873377)
chr7 (528-593)||(12397095-12397160)
chr7 (528-593)||(12406515-12406580)
chr7 (528-586)||(31109427-31109485)
chr7 (292-389)||(5817268-5817366)
chr7 (530-593)||(24024163-24024226)
chr7 (497-587)||(46516112-46516199)
chr7 (296-355)||(31155911-31155971)
chr7 (497-587)||(9184981-9185068)
chr7 (501-587)||(44847932-44848015)
chr7 (296-355)||(1049296-1049356)
chr7 (296-355)||(2935497-2935557)
chr7 (296-355)||(3035953-3036013)
chr7 (296-355)||(7351652-7351712)
chr7 (292-339)||(8153466-8153514)
chr7 (296-355)||(9027194-9027254)
chr7 (497-545)||(9189854-9189901)
chr7 (296-355)||(22108295-22108355)
chr7 (296-355)||(22137306-22137366)
chr7 (296-355)||(40550055-40550115)
chr7 (296-355)||(40552333-40552393)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (115-593)||(24135680-24136149)
chr5 (115-593)||(30631231-30631709)
chr5 (214-593)||(31180138-31180516)
chr5 (180-587)||(38219289-38219692)
chr5 (86-472)||(43592079-43592459)
chr5 (87-472)||(15044484-15044865)
chr5 (87-472)||(43598525-43598904)
chr5 (87-472)||(43604017-43604396)
chr5 (87-472)||(43609509-43609888)
chr5 (87-472)||(1457067-1457445)
chr5 (84-472)||(27444768-27445150)
chr5 (292-587)||(35387663-35387956)
chr5 (87-472)||(27449615-27449994)
chr5 (180-488)||(38192064-38192369)
chr5 (87-467)||(28807485-28807868)
chr5 (292-587)||(15464532-15464824)
chr5 (109-386)||(37561435-37561715)
chr5 (113-386)||(37556613-37556889)
chr5 (292-587)||(36932155-36932447)
chr5 (292-587)||(9353139-9353429)
chr5 (292-587)||(14520230-14520520)
chr5 (110-388)||(2785192-2785472)
chr5 (110-388)||(31401838-31402118)
chr5 (110-388)||(31396981-31397261)
chr5 (110-388)||(33791133-33791413)
chr5 (293-587)||(11916779-11917068)
chr5 (110-388)||(33767996-33768276)
chr5 (292-587)||(10281751-10282044)
chr5 (291-587)||(17003766-17004058)
chr5 (295-587)||(12083984-12084269)
chr5 (291-585)||(31300404-31300694)
chr5 (291-545)||(3880298-3880550)
chr5 (291-389)||(28832258-28832357)
chr5 (291-436)||(42127364-42127508)
chr5 (292-587)||(19588746-19589035)
chr5 (528-593)||(1456998-1457063)
chr5 (528-593)||(27445154-27445219)
chr5 (528-593)||(27449998-27450063)
chr5 (528-593)||(43592463-43592528)
chr5 (528-593)||(43598908-43598973)
chr5 (528-593)||(43604400-43604465)
chr5 (528-593)||(43609892-43609957)
chr5 (291-389)||(24553506-24553604)
chr5 (471-588)||(24553333-24553448)
chr5 (471-584)||(28832433-28832544)
chr5 (330-585)||(11181641-11181890)
chr5 (528-593)||(15044869-15044935)
chr5 (296-355)||(4410241-4410301)
chr5 (497-585)||(42127179-42127264)
chr5 (314-389)||(6741875-6741951)
chr5 (296-355)||(15552464-15552524)
chr5 (296-355)||(31179371-31179431)
chr5 (296-355)||(31542953-31543013)
chr5 (296-355)||(31545299-31545359)
chr5 (327-389)||(33030938-33031001)
chr5 (332-385)||(2630272-2630326)
chr5 (296-349)||(27910675-27910729)
chr5 (314-379)||(7160912-7160977)
chr5 (296-355)||(3373137-3373197)
chr5 (296-355)||(10749919-10749979)
chr5 (296-355)||(15354575-15354635)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (137-593)||(5674564-5675017)
chr6 (87-472)||(14737482-14737866)
chr6 (87-472)||(14742342-14742725)
chr6 (87-472)||(28184297-28184684)
chr6 (87-472)||(11856765-11857154)
chr6 (87-472)||(22010602-22010983)
chr6 (87-471)||(28155477-28155861)
chr6 (87-387)||(6438294-6438595)
chr6 (314-587)||(22709041-22709300)
chr6 (292-587)||(5757285-5757575)
chr6 (110-388)||(6005234-6005514)
chr6 (292-545)||(21356036-21356287)
chr6 (110-471)||(16838561-16838923)
chr6 (110-388)||(33330433-33330715)
chr6 (110-388)||(33335930-33336212)
chr6 (291-587)||(31979512-31979802)
chr6 (291-587)||(31086281-31086571)
chr6 (110-337)||(5343297-5343527)
chr6 (291-587)||(5572050-5572339)
chr6 (313-545)||(18232867-18233096)
chr6 (291-436)||(10077118-10077263)
chr6 (304-587)||(21801149-21801429)
chr6 (292-545)||(4629954-4630203)
chr6 (291-587)||(22963699-22963989)
chr6 (291-587)||(23824404-23824694)
chr6 (291-375)||(5017482-5017567)
chr6 (528-593)||(11857158-11857223)
chr6 (528-593)||(14737413-14737478)
chr6 (528-593)||(22010533-22010598)
chr6 (137-236)||(30125944-30126044)
chr6 (291-375)||(31936586-31936671)
chr6 (531-593)||(14742273-14742335)
chr6 (497-587)||(5017303-5017390)
chr6 (497-587)||(31936778-31936865)
chr6 (313-545)||(24435818-24436046)
chr6 (296-355)||(12195515-12195575)
chr6 (498-545)||(14521877-14521924)
chr6 (296-355)||(4816231-4816291)
chr6 (296-355)||(5273216-5273276)
chr6 (498-589)||(5385799-5385886)
chr6 (296-355)||(19704567-19704627)
chr6 (296-355)||(20915356-20915416)
chr6 (296-355)||(26932562-26932622)
chr6 (296-355)||(29754709-29754769)
chr6 (296-355)||(33309110-33309170)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (180-587)||(24202572-24202973)
chr1 (137-593)||(24787158-24787617)
chr1 (87-472)||(41398032-41398415)
chr1 (292-587)||(19358647-19358939)
chr1 (292-587)||(19361236-19361528)
chr1 (82-471)||(25444996-25445387)
chr1 (292-546)||(19379916-19380168)
chr1 (87-387)||(44023864-44024163)
chr1 (87-387)||(39445292-39445594)
chr1 (86-387)||(1055002-1055305)
chr1 (189-472)||(41390483-41390760)
chr1 (292-585)||(3281708-3281995)
chr1 (292-587)||(26644705-26644994)
chr1 (400-587)||(19366111-19366297)
chr1 (292-587)||(13604429-13604720)
chr1 (292-587)||(21536377-21536666)
chr1 (292-585)||(37069770-37070055)
chr1 (110-388)||(43988452-43988734)
chr1 (291-587)||(47703740-47704034)
chr1 (87-193)||(41386543-41386650)
chr1 (291-587)||(29651810-29652103)
chr1 (291-586)||(9476260-9476551)
chr1 (291-585)||(13598397-13598688)
chr1 (291-545)||(16124361-16124614)
chr1 (292-587)||(19072928-19073220)
chr1 (292-587)||(19120818-19121110)
chr1 (291-587)||(47098632-47098922)
chr1 (291-587)||(32889438-32889728)
chr1 (291-389)||(27104370-27104470)
chr1 (20-86)||(50958683-50958747)
chr1 (291-376)||(775671-775757)
chr1 (295-389)||(47102840-47102935)
chr1 (528-586)||(41398419-41398477)
chr1 (528-583)||(41390764-41390819)
chr1 (360-587)||(40816621-40816842)
chr1 (497-587)||(47102646-47102733)
chr1 (498-585)||(9022715-9022799)
chr1 (296-355)||(9459419-9459479)
chr1 (296-355)||(9463246-9463306)
chr1 (296-355)||(16226386-16226446)
chr1 (471-585)||(27104211-27104322)
chr1 (345-389)||(48382479-48382524)
chr1 (296-355)||(23786058-23786118)
chr1 (296-355)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (87-472)||(34967-35352)
scaffold0135 (528-593)||(34898-34963)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (180-587)||(17755-18157)
scaffold0188 (292-587)||(23848-24141)
[»] scaffold0355 (4 HSPs)
scaffold0355 (87-472)||(9549-9930)
scaffold0355 (88-234)||(28-170)
scaffold0355 (528-586)||(3692-3750)
scaffold0355 (393-472)||(3754-3833)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (87-387)||(155-457)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (292-587)||(8224-8516)
scaffold0140 (296-355)||(22343-22403)
scaffold0140 (296-355)||(24618-24678)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (292-587)||(133086-133377)
scaffold0006 (291-585)||(5682-5973)
scaffold0006 (291-587)||(2491-2784)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (292-587)||(36639-36929)
scaffold0087 (292-587)||(43768-44058)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (110-388)||(148944-149224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (110-388)||(2239-2519)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (110-388)||(19153-19433)
scaffold0197 (87-388)||(14297-14603)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (293-587)||(85684-85973)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (110-360)||(181980-182233)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (87-193)||(34132-34239)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (137-324)||(300-487)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (291-585)||(10728-11021)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (292-375)||(45253-45337)
scaffold0098 (470-545)||(45374-45448)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (87-172)||(13141-13229)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (295-433)||(17266-17404)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (296-355)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (322-355)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (296-355)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 139 - 593
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291791
Alignment:
Q  139 tgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-a 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatg-ggcaaaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  236 agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 335  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 14291532  T
Q  336 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291533 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca 14291632  T
Q  436 tatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggtga 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  14291633 tatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtga 14291732  T
Q  535 ttacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14291733 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccctttggtt 14291791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9296651 - 9296196
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9296651 gatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacac 9296553  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     |||||||  ||||||| |||||||| ||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9296552 aaagagataacaaagca-aaacaagaaaagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggg 9296456  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9296455 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttatacaagaacaagccctagattctacc 9296356  T
Q  434 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtg 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9296355 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggtg 9296256  T
Q  534 attacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9296255 attacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaaccctttggtt 9296196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11098721
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-a 212  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  11099196 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctaga 11099101  T
Q  213 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11099100 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 11099004  T
Q  312 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11099003 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacaca 11098904  T
Q  412 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tgg 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  11098903 agaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 11098804  T
Q  511 tgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098803 tgtactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 11098721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 85 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 39812280 - 39811894
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39812280 agtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 39812181  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812180 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 39812081  T
Q  283 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 382  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39812080 acaccg-agaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtta 39811983  T
Q  383 caagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39811982 caag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 85 - 471
Target Start/End: Original strand, 32246575 - 32246966
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32246575 agtgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggt 32246674  T
Q  182 ctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagc---ggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||      ||||| ||||    
T  32246675 ctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaaga 32246774  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32246775 acaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 32246873  T
Q  378 ggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 471  Q
    |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  32246874 ggttacaag--actctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 32246966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44312910 - 44312567
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44312910 tgttgtgaatccggttcaaaa---atcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 44312814  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44312813 agcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaac 44312715  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44312714 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 44312617  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 434  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44312616 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 44312567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3492044
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 3491849  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3491850 atagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 3491949  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  3491950 cttaagatccttccaatggtggaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 3492044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 180 - 507
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398710
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  25398386 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25398481  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25398482 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25398580  T
Q  377 gggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398581 gggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 25398679  T
Q  477 agacactagaggaagctttagatccttccaa 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25398680 agacacaagaggaagctttagatccttccaa 25398710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 180 - 507
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403848
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  25403524 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25403619  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25403620 acaaacacaccaaa-aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25403718  T
Q  377 gggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403719 gggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 25403817  T
Q  477 agacactagaggaagctttagatccttccaa 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25403818 agacacaagaggaagctttagatccttccaa 25403848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 322 - 507
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407837
Alignment:
Q  322 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagcc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  422 ctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa 507  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagatccttccaa 25407837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40739124
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-a 40738931  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  40738932 atagcttgcaagcttacacaagaacaagtcttagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaatagtaag 40739031  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40739032 cttttgatccttccaatggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 40739124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 388
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344518
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19344311  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaaga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||    
T  19344312 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaaga 19344407  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaa 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  19344408 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaa 19344506  T
Q  377 gggttacaagaa 388  Q
    | ||||||||||    
T  19344507 gagttacaagaa 19344518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 388
Target Start/End: Original strand, 19349070 - 19349376
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19349070 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19349169  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaaga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||    
T  19349170 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaaga 19349265  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaa 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  19349266 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaa 19349364  T
Q  377 gggttacaagaa 388  Q
    | ||||||||||    
T  19349365 gagttacaagaa 19349376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28258984
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 28259177  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||    
T  28259176 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgacccct-aaagagaagacacaaaagga 28259079  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  28259078 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccct 28258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757569
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||      
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaa-- 36757762  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  36757761 aaaagctttcaagcttacacaagaacaaaacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 36757664  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  36757663 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 36757569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040314
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa---agggttacaag 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaag 8040158  T
Q  387 aaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactag 485  Q
    ||  | |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||  |     
T  8040159 aa--attagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaagaga-aaaacataaa 8040254  T
Q  486 aggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8040255 aggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 8040314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 292 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078279
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaa-- 23078470  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| ||| |||||||| |  |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  23078469 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacttaatttctacccatttgtgttacccacactctca-atgatgaaccct--aagagaagacacaaaagga 23078373  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||||   |||||||||||||||||    
T  23078372 agcttttgatccttccaatgatgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagattctcatcacaaagacactcaaccc 23078279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 293 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707070
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa-- 10707251  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||||    
T  10707250 attagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatctgtg-tcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaa 10707154  T
Q  491 gc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaaga 576  Q
    || ||| |||||||| ||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  10707153 gctttttgatccttctaatggtgaaat-ctaactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaaga 10707070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 587
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569619
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaa 392  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||       
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-- 13569428  T
Q  393 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||||||    
T  13569429 tagcttataagtttacacaagaacaagacctaatttctaccc-tttgtttgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaag 13569525  T
Q  492 c-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    | ||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  13569526 ctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttataatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccct 13569619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34389141
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa- 34388957  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
           ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||||    
T  34388958 -------tt--agcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaagga 34389045  T
Q  490 agc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  34389046 agctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacacaaccct 34389141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 584
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630232
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21630041  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | |||  |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  21630042 --attagtttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 21630136  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  21630137 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 21630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8389996
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt-acaaagggttacaagaaacaa 392  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||  |     
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaa--at 8390147  T
Q  393 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||    
T  8390146 tagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaagaggaag 8390050  T
Q  492 c-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    | ||| ||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  8390049 ctttttgattcttccaatggtaaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatgttt 8389996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14698816
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaa 14699007  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  14699006 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 14698914  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  14698913 gaagctttttgatccttccaatagtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccgagagatcctcactacaaagacactcaaccc 14698817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682138
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34682333  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | || ||||||||||||||||| | ||  |||||||||| | ||| || |||||||||||||  |||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  34682332 --attagcttacaggcttacacaagaacaagacttaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaaggtgaatcct--aagagaaaacacaaaag 34682238  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||| | ||| |||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |    | |||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  34682237 gaaacattttgatccttcaagtggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttttccaactctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 34682139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039588
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaagaaa- 42039668  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaa 470  Q
    | |||| | ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  42039667 attagcttgcaagcttacacaaaaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaa 42039588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445397
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10445443  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
      | |||| | ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10445442 --attagcttacaatcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 10445397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522319
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaa 20522318  T
Q  389 a 389  Q
    |    
T  20522319 a 20522319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 419
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865330
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 17865301  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaag 419  Q
    |   |||| |  |||||||||||||||||||    
T  17865302 at--tagcttataagcttacacaagaacaag 17865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483223
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaa 39483029  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | | | || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  39483030 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttatgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 39483124  T
Q  487 ggaag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||  ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  | |||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||    
T  39483125 ggaagttttttgatcattccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaa--tatttcccaacccaagagatcctcacaacaaagacactcaacc 39483221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056335
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| ||     
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaataa- 31056142  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | |||    
T  31056143 -attagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaagg 31056236  T
Q  489 aagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31056237 aagctttttgatcctttcaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaacc 31056333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118425
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaa 33118234  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca-tatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||  ||| ||||||||    ||||| | |  ||||||| |||| | |    
T  33118235 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctacccattttgtgtcaccctcactctca----atgaatctt--aagagaaaacacaaaa 33118326  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||  || | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  33118327 ggaagctttttgatccttccaatggcgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--ttccccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 33118423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528431
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33528620  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | |||| |  |||||     ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  33528619 --attagcttataagct-----aagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccaaactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 33528530  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  33528529 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaatgtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 33528433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940221
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16940221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010886
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 17010886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 587
Target Start/End: Original strand, 25409842 - 25409923
Alignment:
Q  505 caatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25409842 caatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccct 25409923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869691
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaa 389  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaaa 2869691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149303
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 379  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaaggg 27149303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 39811890 - 39811832
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39811890 aaggtgattacaatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 39811832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838028
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 2838028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345552
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca-atatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||| ||||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatccacttaagatgaaagtgatacaaa 1345552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10445361 - 10445274
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||| || ||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  10445361 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccgagagaacctcactacaaagacattcaaccct 10445274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2837923 - 2837834
Alignment:
Q  498 atccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaaccc--aagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||  | ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2837923 atccttccaatggtgaaattctcactatccaaggtgtttacaatgttt--cccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccct 2837834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 546
Target Start/End: Original strand, 35397712 - 35397760
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttt 546  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35397712 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtaattacaatgtttt 35397760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 352
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 352  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 42)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4759868
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgag-caaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacatc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggg 4760130  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760129 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 4760030  T
Q  434 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  4760029 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 4759930  T
Q  533 gattacaatg-tttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759929 gattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 4759868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037602
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaa--aacagcccta-actagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa-caacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 33037959  T
Q  234 caa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037958 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 33037862  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctac 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33037861 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctac 33037763  T
Q  433 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaagg 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  33037762 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct-aaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaagg 33037664  T
Q  532 tgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33037663 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactcaaccctttggtt 33037602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979679
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-a 212  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  36979205 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctaga 36979300  T
Q  213 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 311  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36979301 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 36979397  T
Q  312 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979398 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 36979497  T
Q  412 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tgg 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  36979498 agaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 36979597  T
Q  511 tgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979598 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 36979679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311601
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6311121 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 6311220  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6311221 tagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 6311318  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacaca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  6311319 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 6311417  T
Q  412 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct--aaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-t 508  Q
    || |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6311418 ag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaaaagagaagtcactagaggaagcttttgatccttccaact 6311516  T
Q  509 ggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6311517 aatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 6311601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655949
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 30655585  T
Q  234 ca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa---agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 329  Q
    || ||||||  ||||||| |||||||||||||   |||   ||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655586 catagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 30655684  T
Q  330 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattc 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30655685 gggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattc 30655784  T
Q  430 tacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactaccta 528  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |    
T  30655785 taccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactaccca 30655884  T
Q  529 aggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30655885 aggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 30655949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10689412 - 10688934
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccctaac 213  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||      
T  10689412 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctagt 10689317  T
Q  214 -tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 309  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10689316 gtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag---taagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagtt 10689222  T
Q  310 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttaca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689221 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagcttaca 10689122  T
Q  410 caagaacaagccctagattctacccatatg-tgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttcc--- 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  10689121 caagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatcctccccca 10689022  T
Q  506 aatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689021 actaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 10688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18853418 - 18852961
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca-gcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  18853418 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacac 18853320  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853319 aaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 18853223  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18853222 gagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaaaccctagattttac 18853123  T
Q  433 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaagg 531  Q
    || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  18853122 cctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaagg 18853023  T
Q  532 tgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18853022 tgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 18852961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18870809 - 18870355
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac- 234  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || |||||||||||||     
T  18870809 gatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgag-ttaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacaca 18870713  T
Q  235 aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 334  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18870712 aagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctggggg 18870616  T
Q  335 agagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870615 agagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagcttacacaagaacaaaccctagattctacc 18870516  T
Q  434 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggt 532  Q
    | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  18870515 ctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 18870416  T
Q  533 gattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18870415 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 18870355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25328568 - 25328184
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25328568 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 25328469  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaaaac 284  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  25328468 aagccaacaacaacaaaacaaccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaac 25328369  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25328368 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 25328271  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25328270 ag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaa 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261757
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 1261952  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261951 atagcttgcaagcttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 1261852  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1261851 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccct 1261757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 85 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 39785116 - 39784813
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39785116 agtgttgtgaatctggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 39785017  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaa 281  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39785016 ccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 39784917  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 381  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  39784916 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggtt 39784819  T
Q  382 acaaga 387  Q
    ||||||    
T  39784818 acaaga 39784813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 7290210 - 7289831
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7290210 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 7290117  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  7290116 aacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 7290017  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7290016 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 7289919  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289918 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 292 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071035
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa- 31071228  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31071227 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaa 31071128  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  31071127 gcttaagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26288184
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-a 26287990  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26287991 atagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 26288089  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26288090 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccct 26288184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301441
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-a 26301247  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26301248 atagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 26301346  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26301347 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccct 26301441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313435
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-a 26313241  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26313242 atagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 26313340  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26313341 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccct 26313435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 587
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412630
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 393  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--aat 7412441  T
Q  394 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 492  Q
    | | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||  | |||||||    
T  7412442 aacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct--aagagaagacataaaaggaagc 7412538  T
Q  493 tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7412539 ttttgatcctttcaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccct 7412630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175561
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 19175753  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  19175752 aatagcctgcaagcttacacaagaacaagacctaacttctacacatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagga 19175656  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    | |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19175655 aacttttgatccttccaatagtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 19175561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456318
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 4456125  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  4456126 aatagctggcaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 4456223  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  4456224 agcttttgatccttctaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacagagacactcaaccct 4456318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 35745208 - 35745488
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35745208 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 35745307  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35745308 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 35745402  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  35745403 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 35745488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10684533 - 10684252
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  10684533 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 10684434  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  10684433 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 10684339  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  10684338 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 10684252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799383
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23799576  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| |||  ||| ||| |||| | ||    
T  23799575 --attagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactgtcacaatatgaatcct--aagggaaaacacaaaag 23799481  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||  |||||| ||||||||  || | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  23799480 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctccctactcaaggtgtttacaatg--ttccccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23799384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403034
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaa 26403229  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||| | ||    
T  26403228 --attagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcactcactctcacaatatgaatc--ataagagaaaacacaaaag 26403134  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  26403133 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaac 26403037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752201
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 19752393  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgt-gtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |  | || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  19752392 -aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacac-aaag 19752299  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||  | |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19752298 gaagctttttgatccttccaatgatgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaa--tatttcacaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 19752202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702287
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5702482  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | |||| |  |||||||||||||| |||  ||||  |||||||||| | ||  || ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| || |||| | |    
T  5702481 --attagcttataagcttacacaagagcaaaacctaatttctacccat-tttgagtcacccacactctcaataatgaatcctaagaga-aaaacacaaaa 5702386  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  | |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  5702385 ggaagctttttgatcattccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaa--tatttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 5702289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 587
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127515
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaa 392  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |     
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--at 6127321  T
Q  393 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | || ||    
T  6127322 tagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaagaaa 6127418  T
Q  491 gc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||  || ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  6127419 gctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaaatgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccct 6127515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696609
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  294 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7289827 - 7289762
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7289827 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 7289762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 389
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813782
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaataagatgaaagtgacacaaaggggttacaagaaa 6813782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 9054912 - 9054835
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag-ggttacaagaaa 389  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9054912 ccaatatgacctactctggaggagagagcagctctctaatccactaagatgaaagtgatacaaagtggttacaagaaa 9054835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 471 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 4696529 - 4696415
Alignment:
Q  471 aagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctct 569  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||    
T  4696529 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatctttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcact 4696433  T
Q  570 acaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4696432 acaaagacactcaaccct 4696415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 9054314 - 9054231
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaa 583  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  9054314 gatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgattataatgtttt--ccaacccaagagaatctcactacaaaaacactcaa 9054231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25328054 - 25327996
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  25328054 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaaccc 25327996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25328180 - 25328122
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  25328180 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaaccc 25328122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 389
Target Start/End: Original strand, 3051156 - 3051219
Alignment:
Q  327 tctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3051156 tctggaggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 3051219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  322 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Original strand, 28307560 - 28307660
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca-aagggttacaagaa 388  Q
    |||||||| | ||||||||| | |||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||| | ||||||||||||    
T  28307560 caagattggtaacccagttcggtccaaaatgacctactctggggatgagagcagctctccaatccactaagatggaagtaatacacatgggttacaagaa 28307659  T
Q  389 a 389  Q
    |    
T  28307660 a 28307660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 39784725 - 39784685
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctc 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  39784725 aaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagactctctc 39784685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Original strand, 24741788 - 24742243
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24741788 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 24741885  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741886 aaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 24741982  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24741983 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctacc 24742082  T
Q  434 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggt 532  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  24742083 ctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 24742182  T
Q  533 gattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742183 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 24742243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760944
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  29760470 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaat-aaacaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagac 29760565  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29760566 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 29760662  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29760663 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagcttacacaa 29760762  T
Q  413 g-aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tgg 510  Q
    | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  29760763 gaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccct--aagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 29760860  T
Q  511 tgaactcctcactacctaaggtgattacaatg-tttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760861 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 29760944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9224698 - 9224312
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa--ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctc 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9224698 tgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 9224599  T
Q  185 caagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9224598 caagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaa 9224500  T
Q  283 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 382  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9224499 acaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtta 9224402  T
Q  383 caagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
     ||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9224401 gaag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 78 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45348118 - 45347723
Alignment:
Q  78 cacaggtagtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagca 175  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  45348118 cacaggttctgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaaca 45348019  T
Q  176 aatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-ga 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45348018 aatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagga 45347919  T
Q  274 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 373  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45347918 aagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 45347821  T
Q  374 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 471  Q
    ||| ||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45347820 aaaaggttacaag-acctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9229484 - 9229099
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9229484 tgttgtgaatccggttaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 9229385  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9229384 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 9229286  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttac 383  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  9229285 caccg-agaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttag 9229188  T
Q  384 aagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9229187 aag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 78 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45357597 - 45357203
Alignment:
Q  78 cacaggtagtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagca 175  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  45357597 cacaggttctgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaaca 45357498  T
Q  176 aatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-ga 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45357497 aatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagga 45357398  T
Q  274 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 373  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45357397 aagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 45357300  T
Q  374 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 471  Q
    ||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45357299 aaaaggttacaag--actctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45357203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 51520258 - 51520637
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51520258 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 51520351  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  51520352 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 51520451  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51520452 accg-agaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 51520549  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  51520550 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 5732458 - 5732839
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5732458 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 5732556  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa- 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  5732557 agctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaa 5732654  T
Q  284 ---caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggt 380  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5732655 aaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggt 5732753  T
Q  381 tacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 468  Q
    ||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  5732754 tacaag--actctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaaccct 5732839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 85 - 472
Target Start/End: Original strand, 3813814 - 3814202
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813814 agtgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 3813913  T
Q  182 ctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagc-aaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||||    |||| |||||    
T  3813914 ctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaa 3814011  T
Q  279 caaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg 378  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3814012 caaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 3814110  T
Q  379 gttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3814111 gttacaag--actctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 87 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 56146995 - 56146664
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  56146995 tgttgtgaatccggttccaaa------ttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 56146902  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  56146901 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 56146802  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  56146801 accg-agaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 56146704  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagcccta 424  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  56146703 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 87 - 387
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855821
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 18855618  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaaca 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18855619 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 18855716  T
Q  281 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  18855717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggt 18855814  T
Q  381 tacaaga 387  Q
    |||||||    
T  18855815 tacaaga 18855821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468341
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaaa 28468536  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28468535 atagtttgcaagcttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 28468436  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  28468435 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccct 28468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985440
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa- 31985633  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  31985632 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaa 31985534  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  |||  |||||| ||||||||||||    
T  31985533 gcttttgatccttcccatggtgaaat-ttcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcaatacaaaaacactcaaccct 31985440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396478
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||      
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaa-- 5396671  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | || |    
T  5396670 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttactcactctctcaatgatgaaccct-aaagagaagacacaaaagaa 5396573  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  5396572 agcttttgattcttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 5396478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623100
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16623292  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   ||||    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | ||    
T  16623291 at--tagctaataagcttacagaagaacaagacctaatttctacccattt-tgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaaaagaaaacaca--aaag 16623197  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  16623196 gaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 16623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315037
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 36315228  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
       |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||| |  ||||| |||  | || || |||| | |||    
T  36315227 t--tagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctca-ataatgaatcct--acgaaaaaacacaaaagg 36315133  T
Q  489 aagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  36315132 aagcttttgatccttccaatggttaaat-ctcactacccaatgtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccct 36315037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329246
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 36329437  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
       |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||| |  ||||| |||  | || || |||| | |||    
T  36329436 t--tagcttagaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttacccacactctca-ataatgaatcct--acgaaaaaacacaaaagg 36329342  T
Q  489 aagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  36329341 aagcttttgatccttccaatggttaaat-ctcactacccaatgtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactaaaccct 36329246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777839
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--a 3777647  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| | || | |||||    
T  3777648 atagcttgcaaacttacacaagaacaagatctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaatacaaaaggaa 3777744  T
Q  491 gc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  3777745 gctttttgatcattccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 3777839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143550
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||      
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaa-- 5143357  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||| | ||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||    
T  5143358 aatagcttgcaagcatacacaagaacaagacctaatttctactcat-tttgtgtcagccactctcagaatatgaaccct-aaagagaaaacacaaaagga 5143455  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  5143456 agcttatgatccttccaatggtgaaat-ctcactacctaaggtgtttacaaag--tttcccaatccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 5143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 293 - 514
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147898
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||      
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaa-- 5147775  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||    
T  5147776 aatagcttgcaagcttacacaagaacaaggcctaatttctacccat-tttgtgtcacccattctcacaatatgaaccct-aaagagaaaacacaaaagga 5147873  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaa 514  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  5147874 agcttatgatccttccaatggtgaa 5147898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047671
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10047477  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  |||| || |||| | |    
T  10047478 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagacaaaacacaaaa 10047572  T
Q  487 ggaag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||    
T  10047573 ggaagttttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcattacaaagacactcaacc 10047669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152245
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaa 38152438  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| |      
T  38152437 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaat 38152343  T
Q  487 ggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||  | |||| || |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  38152342 ggaagcttttgatccttccaatggtgaa-ttgtcactacccaaggtgtttacaa--tatttcccatcccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 38152246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5269291 - 5269007
Alignment:
Q  289 aacaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 387  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||          ||||||    
T  5269291 aacaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgtt----------acaaga 5269202  T
Q  388 aacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactag 485  Q
    |  | |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| |     
T  5269201 a--attagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tgtgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaa 5269107  T
Q  486 aggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  5269106 aggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 5269010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24334061
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |  ||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaagagttata--aa 24333905  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaag-aacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    | | |||| | |||||||||||||| || ||  ||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  24333906 aaattagcttacaagcttacacaagaaaaaaaacctaatttctacccat-tttgtgtcagccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 24334002  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24334003 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 24334061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246093
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 39246092  T
Q  389 a 389  Q
    |    
T  39246093 a 39246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796472
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa- 3796518  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
     | |||| | ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3796517 -attagcttacaagcttgcacaagaacaagacctaatttctacccat 3796472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8689580 - 8689303
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||          ||||     
T  8689580 aagattgttgatccagttcggtccaatatgatctaatatgggggagagg--agctctcctatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa- 8689494  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  8689493 -atagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctaccaatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagga 8689398  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    | |||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  8689397 aacttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttaaaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactaaaccct 8689303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743226
Alignment:
Q  297 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaata 394  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||| | ||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctaca--aaaaatta 6743410  T
Q  395 gccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc 492  Q
    | |||  |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | ||||||     
T  6743409 g-cttatagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagt 6743314  T
Q  493 tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaa 583  Q
    ||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  6743313 ttttgatccttccaatggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcgctacaaagacactcaa 6743226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 446 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 16628815 - 16628679
Alignment:
Q  446 cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |    
T  16628815 cccactctcacaatatgaatcctaaaagaaaacaca--aaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--t 16628721  T
Q  546 ttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  16628720 ttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 16628679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630650
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16630679  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaag 419  Q
    |   |||| |  |||||||||||||||||||    
T  16630678 at--tagcttataagcttacacaagaacaag 16630650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25862120 - 25862035
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25862120 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 51520641 - 51520706
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51520641 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 51520706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 42599672 - 42599383
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagag--cagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 387  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  || | |||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||    
T  42599672 caagattgttgacccaattcagtccaatatgacataatatgggggagagagagcaaccctccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaaga 42599573  T
Q  388 aacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca-tatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactag 485  Q
    |  | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| | |||||  ||| ||||||||    ||||| |||  ||||||| |||| |     
T  42599572 a--attagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccattttgtgtcacccgcactctca----atgaatcct--aagagaaaacacaaa 42599481  T
Q  486 aggaag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    ||||||  |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||  |||| ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  42599480 aggaagtttttttatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttagaatg--tttcccaaccgaagagaacctcactacaaagacactcaac 42599384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18712667 - 18712602
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18712667 aaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 18712602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34495884 - 34495822
Alignment:
Q  327 tctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34495884 tctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgggttacaagaa 34495822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 54867183 - 54867268
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  54867183 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggg-agagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaa 54867268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1983375 - 1983298
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1983375 ccaatatgacctactatgggggagatagcagctctccaatccactaggatcaaagtgatacaaaggggttacaagaaa 1983298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Original strand, 5112275 - 5112336
Alignment:
Q  329 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5112275 tgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatgggttacaagaaa 5112336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9224308 - 9224243
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9224308 aaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 9224243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9229095 - 9229030
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9229095 aaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 9229030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774303
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaagaaa 39774303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 25861927 - 25861840
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  25861927 gatccttccaatggtgaaatc-tcactactcaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 25861840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 583
Target Start/End: Original strand, 5112440 - 5112523
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaa 583  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||    
T  5112440 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaa 5112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 177
Target Start/End: Original strand, 3813734 - 3813764
Alignment:
Q  147 gcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813734 gcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaa 3813764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 389
Target Start/End: Original strand, 18377384 - 18377458
Alignment:
Q  316 atatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  18377384 atatgacctactctggaggagagagcagccctccattccactaagatgaaagtgatacaaatgggttataagaaa 18377458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671380
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacac 2671738  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671737 aaagagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 2671641  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2671640 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagcttacacaagaccaagccctagattctacc 2671541  T
Q  434 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  2671540 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 2671441  T
Q  533 gattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671440 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 2671380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 7167072 - 7167548
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7167072 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-caaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagac 7167167  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7167168 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 7167265  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167266 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 7167365  T
Q  413 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggt 511  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  7167366 gaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaat 7167465  T
Q  512 gaactcctcactacctaaggtgattacaatg-tttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7167466 gaactcctcactacccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 7167548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9091552 - 9091095
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccaca 233  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||| || || | ||||| |||||    
T  9091552 gatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccaca 9091454  T
Q  234 caa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091453 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 9091357  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9091356 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaatccctagattctac 9091257  T
Q  433 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaagg 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  9091256 ccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaagg 9091157  T
Q  532 tgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091156 tgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaaccctttggtt 9091095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8739314 - 8738857
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccaca 233  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||| || || | ||||| |||||    
T  8739314 gatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccaca 8739216  T
Q  234 caa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739215 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 8739119  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8739118 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaatccctagattctac 8739019  T
Q  433 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaagg 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  8739018 ccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagctttagatcctttcaactaatgaactcctcactacccaagg 8738919  T
Q  532 tgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8738918 tgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccattggtt 8738857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 274 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372590
Alignment:
Q  274 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 373  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  374 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 473  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40372809 aaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaag 40372711  T
Q  474 agaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctaca 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  40372710 agaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctaca 40372611  T
Q  573 aagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40372610 aagacactcaaccctttggtt 40372590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22173484 - 22173100
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22173484 tgttgtgaatccggtttcaaacaaatcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 22173385  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22173384 agcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaac 22173286  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22173285 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 22173188  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22173187 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaa 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 134 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28504107 - 28503662
Alignment:
Q  134 aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccac 232  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28504107 aatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccac 28504010  T
Q  233 acaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 331  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||||||          ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504009 acaaagagataacaaagcataaacaaga----------aaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 28503921  T
Q  332 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattct 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  28503920 ggaagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattct 28503822  T
Q  431 acccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaa 529  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  28503821 accctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaa 28503722  T
Q  530 ggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacccttt 589  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28503721 ggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttt 28503662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Original strand, 8477212 - 8477667
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc-aagcaaacaacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||  || ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  8477212 gatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaa--agagtaaaaagtttcccaagcaa-caacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca 8477308  T
Q  234 caagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
     |||| |   |||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477309 -aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 8477403  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa-gaacaagccctagattcta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  8477404 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaataaacaagacctagattcta 8477503  T
Q  432 cccatatgtgttt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaa 529  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  8477504 ccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaa 8477603  T
Q  530 ggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477604 ggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 8477667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 87 - 468
Target Start/End: Original strand, 18656228 - 18656609
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18656228 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 18656326  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa- 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  18656327 agctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaa 18656424  T
Q  284 ---caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggt 380  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18656425 aaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggt 18656523  T
Q  381 tacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 468  Q
    ||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  18656524 tacaag--actctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaaccct 18656609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 269 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26928709 - 26928395
Alignment:
Q  269 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaag 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26928709 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaag 26928612  T
Q  368 tgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 467  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928611 tgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 26928512  T
Q  468 taaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctct 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  |||     
T  26928511 taaaagagaagacacaagaggaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcattacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctca 26928415  T
Q  568 ctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26928414 ctacaaagacactcaaccct 26928395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 292 - 584
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306239
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 1306047  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1306048 atagtttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 1306147  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  1306148 cttaagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143613
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa- 32143419  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32143420 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaa 32143519  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||    
T  32143520 gcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcatcactacaaagacactcaaccct 32143613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 335 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501495
Alignment:
Q  335 agagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctacc 28501652  T
Q  434 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaaggt 532  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  28501651 ctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaaggt 28501552  T
Q  533 gattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacccttt 589  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28501551 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttt 28501495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 292 - 545
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453210
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa- 27453056  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  27453057 aatagcttgcaagcttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaaggaa 27453156  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27453157 gcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 27453210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974748
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 27974941  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27974940 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccattctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 27974843  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| | ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  27974842 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccgacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 27974748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986252
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||     
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaaa 27986444  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  27986443 aa-agcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaatatcaaccctaaaagagaagacacaaaaggaa 27986346  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  27986345 gcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 27986252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264639
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 16264447  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  16264448 aatagcttgcaagcttccacaagaacaagacctaatttctacacatttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagga 16264544  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||    
T  16264545 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcattacaaagacactcaaccct 16264639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386471
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          ||||     
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa- 33386665  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33386664 aatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgtttccc-actctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagga 33386566  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  33386565 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 33386471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370285
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat 8370474  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
      |||| |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||| | |||||    
T  8370473 --tagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccatttgtgtcaccc-actctcacaatatgaatcctaa--gagaaaacacaaaaggaa 8370379  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
     |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8370378 acttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 8370285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2677358 - 2677075
Alignment:
Q  108 gaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2677358 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2677259  T
Q  206 gccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgtt 300  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  2677258 gcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgtt 2677163  T
Q  301 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2677162 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2677075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794511
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 6794702  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
     | |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||| | || | ||||    
T  6794701 -attagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtg-tcacccactctcacaatatgaaccct--aagagaaaatacaaaagga 6794606  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| | || ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  6794605 agcttttgttcattccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaactcaagagaacctcactacaatgacactcaaccct 6794511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 8512032 - 8512314
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8512032 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 8512131  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataag-cggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8512132 c-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaag---catacaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 8512227  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8512228 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8512314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 8516912 - 8517194
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8516912 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 8517011  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataag-cggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8517012 c-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaag---catacaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 8517107  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8517108 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 8517194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2673202 - 2672919
Alignment:
Q  108 gaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2673202 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2673103  T
Q  206 gccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgtt 300  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  2673102 gcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgtt 2673007  T
Q  301 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2673006 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2672919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711512
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa 21711321  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
       |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| || ||| ||||| |||| |||||  ||||| |||| | |||    
T  21711322 t--tagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatttgtgttaccc-acactctcaataatgaatcctaa--gagaaaacacaaaagg 21711416  T
Q  489 aagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21711417 aagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactactcaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 21711512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029383
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa-- 36029191  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    | |||| | ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || | |||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| | ||||    
T  36029192 attagcttacaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcactcactctcaaaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaagga 36029288  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  36029289 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 36029383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592578
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40592771  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | |||||||||||||||||||   |||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  40592770 --attagcttacaagcttacacaagaacaaaatctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaag 40592676  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40592675 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 40592579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 32475301 - 32475580
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  32475301 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacag 32475400  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  32475401 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 32475495  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  32475496 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32475580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 32480158 - 32480438
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat--aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  32480158 aaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaaca 32480257  T
Q  206 gccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgtt 300  Q
    ||| |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  32480258 gcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgtt 32480352  T
Q  301 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  32480353 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgt-ttacaaagagttacaagaa 32480438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 388
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968204
Alignment:
Q  141 tgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aag 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  238 agatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 335  Q
    || |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||    
T  24968056 agctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttgggga 24968151  T
Q  336 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24968152 gagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24968204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Original strand, 10207750 - 10207983
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  10207750 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag- 10207848  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  10207849 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttga 10207945  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207946 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715838
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 3715991  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | ||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  3715990 --attagcttacaaacttacacaagaacaagacttaatttctacccat-tttgtgtcacccactttcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaag 3715896  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3715895 aaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 3715838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552721
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18552872  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  18552871 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 18552779  T
Q  488 gaag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18552778 gaagttttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 18552721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 35925483 - 35925768
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||| | |   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35925483 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatttgggaggg---gcagttctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat 35925579  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
      |||  |  |||||||||| |||||||  ||||  |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||| | |||||    
T  35925580 --tagtttataagcttacactagaacaaaacctaatttctacccatttgtgtcaccc-actctcacaatatgaatcctaa--gagaaaacacaaaaggaa 35925674  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  35925675 gcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacattcaaccct 35925768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736100
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaa 392  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |     
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--at 1736292  T
Q  393 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
    || | |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || || || ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | | |||    
T  1736291 taacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcaccaacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaaagaa 1736195  T
Q  491 gc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1736194 gctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaatagatcctcactacaaagacactcaaccct 1736100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438466
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 48438312  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  48438313 at--tagcatataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 48438407  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48438408 ggaagctttttgatcattccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 48438466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709625
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaaa 30709778  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
       |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  30709777 t--tagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccatct-tgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaag 30709683  T
Q  488 gaagct-ttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||| | |||||| || |||||| |||||||||||    
T  30709682 gaagctatttgatcattccaatgatgaaat-ctcactccccaaggtgtttacaatgttt 30709625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25796072
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaa- 25795879  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||  | |||    
T  25795880 -attagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacataaaagg 25795973  T
Q  489 aagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  25795974 aagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacattg--tttcccaaccctcaagagagcctcactacaaagacactcaacc 25796070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328300
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||     
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa- 3328346  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  3328345 -attagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccat 3328300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466389
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 37466389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24695252 - 24694962
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24695252 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 24695153  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| |  || |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| ||||||  |||| |||| | ||    
T  24695152 --attagcttataaacttacaaaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcctaaa--agaaaacacaaaag 24695060  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24695059 gaagctttttgatcattccaatggtgaaat-ctcaccacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 24694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299087
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 26299086  T
Q  389 a 389  Q
    |    
T  26299087 a 26299087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 39032551 - 39032351
Alignment:
Q  379 gttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaa 477  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||  ||||| |||| | |||||| | |||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  39032551 gttacaagaaa--atagcttgcaagcttacgcaagagcaagatctaatttctatccatttatgtttctc-actctctcaatgatgaaccctaa--gagaa 39032457  T
Q  478 gacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagac 577  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  39032456 gacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttaccaacccaagaga-tctcactacaaagac 39032361  T
Q  578 actcaaccct 587  Q
    ||||||||||    
T  39032360 actcaaccct 39032351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Original strand, 40844651 - 40844795
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40844651 caagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40844749  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  40844750 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat 40844795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417479
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaatgagttataagaaa 1417479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923704
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaa 47923895  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacac-aagaacaagccctagattctaccca-tatgtgt-ttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactag 485  Q
      | |||| |  ||| |||||| |||| |||  ||||  || |||||| | |||||  ||| |||||||| |  ||||| |||  | ||||| |||| |     
T  47923894 --attagcttaaaagtttacacaaagagcaaaacctaatttatacccattttgtgtcatccacactctca-ataatgaatcct--acgagaaaacacaaa 47923800  T
Q  486 aggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaa 583  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  47923799 aggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagattctcactacaaagacactcaa 47923704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386915
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaataagataaaagtgatacaaatgggttacaagaaa 4386915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22173096 - 22173031
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22173096 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 22173031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323679
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 3323679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 587
Target Start/End: Original strand, 47649677 - 47649862
Alignment:
Q  400 caagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-g 497  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||| | ||||||||||  |    
T  47649677 caagcttccacaagaacaagacctaatttctacccattt-tgtgtcacccactctcgcaatatgaatcctaa--gagaaaacacaaaaggaagctttttg 47649773  T
Q  498 atccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaaccc--aagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||  | ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  47649774 atccttcaaatggtgaaatc-taactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccct 47649862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 3323601 - 3323487
Alignment:
Q  471 aagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctct 569  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||    
T  3323601 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatcattccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcact 3323505  T
Q  570 acaaagacactcaaccct 587  Q
    | ||||||||||||||||    
T  3323504 ataaagacactcaaccct 3323487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40373043 - 40372980
Alignment:
Q  139 tgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40373043 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatg-ggcaaaatggtttccaagcaaacaacatcaaaa 40372980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 1417374 - 1417287
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1417374 gatcctttcaatggtgaaatc-tcactacctaaagtgtttacaatgttt--cccaacccaagataacctcactacaaagacactcaaccct 1417287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 3328240 - 3328153
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  3328240 gatccttccaatgctgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaagctcactacaaagacattcaaccct 3328153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 518 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 4386840 - 4386773
Alignment:
Q  518 ctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  4386840 ctcactactcaaggtgattacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccct 4386773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 502 - 587
Target Start/End: Original strand, 26299196 - 26299278
Alignment:
Q  502 ttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26299196 ttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacattcaaccct 26299278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 389
Target Start/End: Original strand, 21353604 - 21353661
Alignment:
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21353604 ggagagagcacctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaa 21353661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 584
Target Start/End: Original strand, 8126833 - 8126917
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||  |  ||| |||||||||||||||||    
T  8126833 gatccttccaatgatgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaaaacctcactacaaagacactcaac 8126917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 2057786 - 2058271
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-a 212  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  2057786 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctaga 2057882  T
Q  213 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaa----caagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 307  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2057883 cttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccag 2057981  T
Q  308 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctta 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2057982 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagctta 2058081  T
Q  408 cacaagaacaagccctagattctacccatatg-tgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttcc- 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  2058082 cacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatcctcccc 2058181  T
Q  506 --aatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
      | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058182 caactaatgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 2058271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357341
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  235 aa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
    || |||||  |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20357698 aaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaatacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggg 20357602  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctac 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357601 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctac 20357503  T
Q  433 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactacctaagg 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  20357502 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactacccaagg 20357403  T
Q  532 tgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20357402 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 20357341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 31109872 - 31109489
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31109872 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 31109773  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacac 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  31109772 agccaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacac 31109673  T
Q  287 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31109672 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 31109574  T
Q  387 aaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
      ||  |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |   | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31109573 --actctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1533690 - 1533238
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaac-agccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| ||||||     
T  1533690 gatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaa-caacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca- 1533595  T
Q  235 aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
    ||||||   |||||||  ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533594 aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 1533499  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaa-caagccctagattctac 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1533498 gagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattctac 1533399  T
Q  433 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggt 532  Q
    || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1533398 cctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaaggt 1533299  T
Q  533 gattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533298 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 1533238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 109 - 473
Target Start/End: Original strand, 12406149 - 12406512
Alignment:
Q  109 aaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12406149 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcc 12406248  T
Q  209 cta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12406249 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgaccca 12406346  T
Q  307 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-t 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |    
T  12406347 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-aactctagccttcaagctt 12406444  T
Q  406 tacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 473  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406445 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 12406512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 12396710 - 12397091
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12396710 tgttgtgaatccggttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 12396806  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12396807 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaac 12396905  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12396906 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 12397003  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  ||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12397004 ag-aactctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaa 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 180 - 587
Target Start/End: Original strand, 21639701 - 21640102
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21639701 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21639794  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21639795 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21639893  T
Q  377 gggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639894 gggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 21639992  T
Q  477 agacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaaga 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21639993 agacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaaga 21640091  T
Q  577 cactcaaccct 587  Q
    |||||||||||    
T  21640092 cactcaaccct 21640102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24024618 - 24024232
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24024618 tgttgtgaatccggttccaaagaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 24024519  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccc-taactagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  24024518 aagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaa 24024420  T
Q  284 -caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 382  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  24024419 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaatgtta 24024321  T
Q  383 caagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  24024320 caag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaa 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 180 - 587
Target Start/End: Original strand, 21645899 - 21646300
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||   ||||  |||||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21645899 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaa--acaaacaagataagcaagaaaggaa-ga 21645992  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  21645993 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaa 21646091  T
Q  377 gggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21646092 gggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 21646190  T
Q  477 agacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaaga 576  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  21646191 agacactagaggaagatttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaaga 21646289  T
Q  577 cactcaaccct 587  Q
    |||||||||||    
T  21646290 cactcaaccct 21646300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 269 - 587
Target Start/End: Original strand, 18408742 - 18409056
Alignment:
Q  269 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaag 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18408742 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaag 18408839  T
Q  368 tgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 467  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408840 tgttacaaagggttacaagaaa-aataacttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 18408938  T
Q  468 taaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctct 567  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||     
T  18408939 taaaag-gaagacacaagaggaagcttaagatccttttaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctca 18409036  T
Q  568 ctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18409037 ctacaaagacactcaaccct 18409056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 87 - 382
Target Start/End: Original strand, 4866528 - 4866820
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4866528 tgttgtgaatccggttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctcca 4866624  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagc-aaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4866625 agcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 4866723  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 382  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4866724 caccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 269 - 587
Target Start/End: Original strand, 18413619 - 18413932
Alignment:
Q  269 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaag 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18413619 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaag 18413715  T
Q  368 tgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 467  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413716 tgttacaaagggttacaagaaa-aatagattgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 18413814  T
Q  468 taaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctct 567  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||  |||     
T  18413815 taaaag-gaagacacaagaggaagcttaagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagagatcctca 18413912  T
Q  568 ctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18413913 ctacaaagacactcaaccct 18413932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Original strand, 19992103 - 19992408
Alignment:
Q  86 gtgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 181  Q
    |||||||||||||||||| |   | | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  19992103 gtgttgtgaatccggttcaactaatggaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 19992202  T
Q  182 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaa 278  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19992203 ttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaa 19992300  T
Q  279 caaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19992301 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 19992399  T
Q  379 gttacaaga 387  Q
    |||||||||    
T  19992400 gttacaaga 19992408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21812508 - 21812254
Alignment:
Q  108 gaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  21812508 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cag 21812410  T
Q  207 ccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttgac 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21812409 ccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 21812311  T
Q  304 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21812310 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatg 21812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 293 - 545
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983536
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac--aaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||     
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaa- 21983383  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| | |||    
T  21983384 -aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagtttctacccat-tttgtgtcacccactctcaaaatatgaaccct-aaagagaaaacacaaaagg 21983480  T
Q  489 aagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21983481 aagcttatgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 21983536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479626
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaa-- 2479433  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |  | ||||    
T  2479434 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatgtgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagatataaaagga 2479531  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2479532 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccct 2479626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 16879889 - 16880169
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  16879889 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16879988  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16879989 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 16880083  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  16880084 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16880169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 16884745 - 16885025
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  16884745 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16884844  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16884845 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 16884939  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  16884940 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgttttacaaagagttacaagaa 16885025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24261617 - 24261311
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca--aagaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  24261617 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24261518  T
Q  183 tccaagcaaa-caacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--g 276  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |    
T  24261517 tccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacg 24261423  T
Q  277 aacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aa 375  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  24261422 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaa 24261324  T
Q  376 agggttacaagaa 388  Q
    || ||||||||||    
T  24261323 agagttacaagaa 24261311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29160055
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 29159901  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  29159902 --attagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaag 29159997  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29159998 gaagctttttgatccttccaatgttgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 29160055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24266471 - 24266190
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  24266471 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 24266372  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  24266371 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 24266277  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24266276 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24266190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 292 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848567
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 44848684  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| | ||||    
T  44848683 aaaagcttgcaagcttacacaagaataagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaactct-aaagagaagacacaaaagga 44848586  T
Q  490 agctttagatccttccaat 508  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  44848585 agcttttgatccttccaat 44848567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263956
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||          ||||     
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag--cagctctccaatccactatgatgaaagtgttataa----------gaaa- 47263764  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  47263765 -atagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaatagaagacacaaaagga 47263861  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  47263862 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtatttacaatg--tttcccaaccgaagagattctcactacaaagacactcaaccct 47263956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9189961
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 9190007  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  9190006 -aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccat 9189961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580679
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||     
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa- 2580487  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgt-gtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |  | || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  2580488 -aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttttcatatcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 2580582  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||    
T  2580583 gaagctttttgatcctttcaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaacctcac-acaaagacactcaaccc 2580678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 293 - 583
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21989194
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac--aaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||     
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag--caactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaa- 21989005  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     |||||  | |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||| | ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||| || |||    
T  21989006 -aatagattgcaagcttatacaagaataaaacctagtttctacccat-tttgtgtcacccactctaaaaatatgaaccct-aaagagaaaacaataaagg 21989102  T
Q  489 aagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaa 583  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||    
T  21989103 aagcttatgatccttccaatggtaaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa 21989194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284379
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||     
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgcgttacaagaa- 20284186  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgt-gtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| | | |  | || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  20284187 -attagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccttttttcatatcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 20284281  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  20284282 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 20284378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647504
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 2647695  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | |     
T  2647694 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaat 2647602  T
Q  488 gaag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  2647601 gaagttttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgcttaccatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 2647505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091913
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 49091759  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca-tatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | || | |  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||  ||| ||||||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  49091760 --attaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattctgtgtcacccacactctc-cataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 49091854  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  49091855 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgttttcaatgttt 49091913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 541
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56195
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 56045  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  56046 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 56140  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaat 541  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||    
T  56141 agaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaat 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516263
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 46516309  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  46516308 at--tagcttaaaagcttacacaagaacaagacataatttctacccat 46516263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332257
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33332449  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||| | ||| || | ||| ||| ||  ||||  |||  ||||||| |||| |  |    
T  33332448 --attagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttttgtatcacgcacactctca--atgattcct--aagagaaaacacaaagg 33332355  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||| ||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  33332354 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttctcaacccaagagaaccttactacaaaaacactcaaccc 33332258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35961067
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaa 35960914  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| |  ||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |   | || ||||| |||| || ||||| | |  ||||||| || | | ||    
T  35960915 --attagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccattttcatatcacccacactca-aagatgaatctt--aagagaaaacgcaaaag 35961009  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35961010 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacctaaggtgtttacaatgttt 35961067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796477
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaa 4796666  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| |||   || ||||||| | ||| || || ||  || ||  ||||| |||  ||||||| |||| | |     
T  4796665 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctcatttatacccat-tttgtgtcacctacattctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaaa 4796573  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4796572 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 4796477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23403110 - 23402820
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| | ||||||||||      
T  23403110 aagattgttgacccaattcggtctaatatgacctaatctgagggagtgagcagccctccaatctactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa-- 23403013  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat----atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    | |||| |  | |||||| |    ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  23403012 attagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctaccca----tttttcacatcactcacactctcaatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 23402919  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  23402918 ggaagctttttgatcattccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 23402822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185178
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617223
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa-agggttacaagaaa 389  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaatggggttacaagaaa 28617223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 4873312 - 4873377
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4873312 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 4873377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 12397095 - 12397160
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12397095 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 12397160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 12406515 - 12406580
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12406515 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 12406580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31109485 - 31109427
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31109485 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 31109427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817268
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaaggggttacaagaaa 5817268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24024226 - 24024163
Alignment:
Q  530 ggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24024226 ggtgattacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 24024163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 46516199 - 46516112
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | |||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  46516199 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaactcaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 46516112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9185068 - 9184981
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||||||    
T  9185068 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaaccttactacaaagatactcaaccct 9184981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 44848015 - 44847932
Alignment:
Q  501 cttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||| || |||||| | |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  44848015 cttccaatggtgaaatc-tcactatccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 44847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 9189901 - 9189854
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||    
T  9189901 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt 9189854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 24135680 - 24136149
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24135680 tcacaccaatgaaa---ataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagt--aaagagtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 24135774  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||| |   |||||||  ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24135775 tagtgtagagcaacaccaca--agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacacc-aagaagattgttgacccagttcag 24135869  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  24135870 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaa 24135968  T
Q  413 gaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtg 512  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135969 gaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtg 24136068  T
Q  513 aactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24136069 aactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactcaaccctttggtt 24136149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 115 - 593
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631709
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30631231 tcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaa-caacaacaaaacagccctagac 30631329  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacaca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 310  Q
    ||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30631330 tagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataag---taagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgactcagttc 30631425  T
Q  311 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttaca 409  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  30631426 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttaca 30631524  T
Q  410 caagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-t 508  Q
    || |||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30631525 catgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccct-aaagagaagtcactagaggaagctttagatccttccaact 30631623  T
Q  509 ggtgaactcct-cactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
      ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30631624 aatgaactcctccactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 30631709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 214 - 593
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180516
Alignment:
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 31180235  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acaca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 31180334  T
Q  412 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tgg 510  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  31180335 aga-caaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaa 31180433  T
Q  511 tgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31180434 tgaactcctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 31180516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 180 - 587
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219692
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  38219289 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38219384  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38219385 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 38219483  T
Q  377 gggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38219484 gggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 38219582  T
Q  477 agacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaaga 576  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  38219583 agacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaaga 38219681  T
Q  577 cactcaaccct 587  Q
    |||||||||||    
T  38219682 cactcaaccct 38219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 86 - 472
Target Start/End: Original strand, 43592079 - 43592459
Alignment:
Q  86 gtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43592079 gtgttgtgaatccggttccaaag------tcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 43592172  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  43592173 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaa 43592272  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttac 383  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43592273 caccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttac 43592370  T
Q  384 aagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43592371 aag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 15044484 - 15044865
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15044484 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataca--atgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 15044581  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaaca 285  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  15044582 aaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaca 15044681  T
Q  286 ccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 385  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15044682 cc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 15044779  T
Q  386 gaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    |  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15044780 g--actctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598904
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 43598618  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43598619 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 43598718  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43598719 accg-agaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 43598816  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43598817 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604396
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 43604110  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43604111 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 43604210  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43604211 accg-agaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 43604308  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43604309 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609888
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 43609602  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43609603 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 43609702  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43609703 accg-agaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 43609800  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43609801 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 1457445 - 1457067
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1457445 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 1457352  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    ||| ||| |||||||||    
T  1457351 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaa-gaacaaaac 1457253  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1457252 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 1457155  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457154 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 84 - 472
Target Start/End: Original strand, 27444768 - 27445150
Alignment:
Q  84 tagtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27444768 tagtgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtct 27444861  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaa 281  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27444862 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 27444961  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 381  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27444962 aacaccg-agaagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 27445059  T
Q  382 acaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27445060 acaag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387956
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 35387761  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387762 atagcttgcaagcttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 35387861  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35387862 ttttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccct 35387956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27449994
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctcca 27449708  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  27449709 agcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 27449808  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27449809 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 27449906  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27449907 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 180 - 488
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192369
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  38192064 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38192159  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38192160 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 38192258  T
Q  377 gggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 476  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38192259 gggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagaga 38192357  T
Q  477 agacactagagg 488  Q
    |||||| |||||    
T  38192358 agacacaagagg 38192369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28807868 - 28807485
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  28807868 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 28807769  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaa--ccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaaga 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28807768 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaaga 28807671  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  28807670 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaa 28807573  T
Q  378 ggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 467  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28807572 ggttacaagaatc--tagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 28807485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464824
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 15464630  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15464631 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagga 15464729  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  15464730 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacgatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 15464824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 109 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37561715 - 37561435
Alignment:
Q  109 aaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37561715 aaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 37561616  T
Q  207 cc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgac 303  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37561615 cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 37561517  T
Q  304 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 386  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37561516 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37561435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 113 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37556889 - 37556613
Alignment:
Q  113 cttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc-c 209  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||      
T  37556889 cttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagccta 37556790  T
Q  210 taactagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 307  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37556789 tgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 37556691  T
Q  308 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 386  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37556690 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag 37556613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932155
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 36932349  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36932348 aatagcttgcaagtttacataagaacaagacttaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccctaaaacagaagacacaagagga 36932250  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||    
T  36932249 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcatcactataaagacactcaaccct 36932155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353139
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 9353332  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  9353331 aaaagcttgcaagcttacacaagaacaagatctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaa-ccttaaagagaagacacaaaagga 9353234  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  9353233 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccct 9353139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520520
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 14520327  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaa-tatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  14520328 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactctctcaattatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 14520425  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  14520426 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 14520520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 2785192 - 2785472
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2785192 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 2785291  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2785292 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 2785386  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2785387 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2785472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31402118 - 31401838
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31402118 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 31402019  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31402018 c-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 31401924  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31401923 cccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31401838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 31397261 - 31396981
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  31397261 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatc 31397162  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaaca-aaacaccgaacaagattgttgac 303  Q
    | |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  31397161 c-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgac 31397066  T
Q  304 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31397065 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 31396981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 33791133 - 33791413
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33791133 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 33791232  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33791233 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 33791327  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33791328 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33791413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916779
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||      
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa-- 11916971  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || |||||||||| |  |||||||||  ||||||| |||| | ||||    
T  11916970 aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcaaacgatgaaccct--aagagaaaacacaaaagga 11916874  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  11916873 agtttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaaactcaaccct 11916779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 33767996 - 33768276
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33767996 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagc 33768095  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||    || ||| ||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33768096 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaag---catacaggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 33768190  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33768191 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10282044
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10281850  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
       |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||| | ||     
T  10281851 t--tagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-tgtgtcacccacactcacaatatgaatcctaa--gagaaaacacaaaaga 10281945  T
Q  489 aagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaaccc--aagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||  ||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10281946 aagctttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cacaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaacc 10282042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003766
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||| ||||||  ||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaagagttaca--aa 17003961  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
    | | || | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |   ||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| | |||    
T  17003960 aaattaacttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttaatttcactcactctcacaatatgaatcct--aagagaaaacacaaaagg 17003863  T
Q  489 aagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17003862 aagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttccaaacccaagagaacctcactacaaagacattcaaccct 17003766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12083984
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaat 393  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa--att 12084172  T
Q  394 agccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagct 493  Q
    | | |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||  |||| || |||| | ||||||||    
T  12084171 aacttaaaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-tcacccactctcacaatatgaatcct--aagaaaaaacacaaaaggaagct 12084075  T
Q  494 ttagatccttcc-aatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||  |||  ||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12084074 tt-tatccttccaaatggtgaa-ttctcactacccaaggtgtttaaaatg--tttaccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccct 12083984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300404
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgttataatgagttgcaagaaa 31300595  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgt-gtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
     |||||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |  | || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  31300594 -aatagtttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttctcatatcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 31300500  T
Q  488 gaag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31300499 gaagccttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 31300404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880550
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 3880397  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||  | ||||| | || | ||    
T  3880398 --attagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccactctcacaatatgaatcct--aggagaaaaaacaaaag 3880492  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  3880493 gaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcacaacccaatgtgtttacaatgttt 3880550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832357
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 28832357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127364
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||     
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa- 42127410  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  42127409 -attagcttataagcttacaaaagaacaagtcctactttctacccat 42127364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19589035
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa- 19588844  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | || | |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | | ||| || |||||  || ||  ||||| |||  ||||||| |||| | |||    
T  19588845 -attaccttataagcttacacaagaacaagacctaatttctaccc-tttttgtgtcacccacaatctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaagg 19588938  T
Q  489 aag-ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||| || ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19588939 aagatttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactgcccaagatgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 19589035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 1457063 - 1456998
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1457063 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 1456998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 27445154 - 27445219
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27445154 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 27445219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 27449998 - 27450063
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27449998 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 27450063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 43592463 - 43592528
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43592463 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 43592528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 43598908 - 43598973
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43598908 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 43598973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 43604400 - 43604465
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43604400 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 43604465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 43609892 - 43609957
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43609892 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 43609957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24553604 - 24553506
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24553604 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 24553506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 24553448 - 24553333
Alignment:
Q  471 aagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctct 569  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||    
T  24553448 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttctaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcact 24553352  T
Q  570 acaaagacactcaaccctt 588  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24553351 acaaagacactcaaccctt 24553333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 584
Target Start/End: Original strand, 28832433 - 28832544
Alignment:
Q  471 aagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctct 569  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||    
T  28832433 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcact 28832529  T
Q  570 acaaagacactcaac 584  Q
    |||||||||||||||    
T  28832530 acaaagacactcaac 28832544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 330 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 11181890 - 11181641
Alignment:
Q  330 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagatt 428  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||   ||||||  |||||  || | ||||||| ||||  ||    
T  11181890 gggggagagagcaaccctccaatccactaagatgaaagtgatacaaatgagttacaagaaat--tagcctaaaagctctcaaatgaacaagacctaattt 11181793  T
Q  429 ctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacc 526  Q
    |||||||| |   | || ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  11181792 ctacccattttcatgtcacccacactcacaat--gaatcctaa--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatt-tcactacc 11181698  T
Q  527 taaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
     |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  11181697 caaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 11181641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 15044869 - 15044935
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaa-cccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15044869 aaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 15044935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 42127264 - 42127179
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  42127264 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtatacaatgttt--ctcaacccaagagaacctcactacaaagatactcaacc 42127179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 389
Target Start/End: Original strand, 6741875 - 6741951
Alignment:
Q  314 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag-ggttacaagaaa 389  Q
    ||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  6741875 caatatgacatactctgggggatagagcagctctccaatccattaagatggaagtgatacaaagaagttacaagaaa 6741951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33031001 - 33030938
Alignment:
Q  327 tctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa-agggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  33031001 tctgggggagagagcagctctccaattcactaagatgaaagtgatgcaatggggttacaagaaa 33030938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 385
Target Start/End: Original strand, 2630272 - 2630326
Alignment:
Q  332 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaa 385  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2630272 gggagatagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgatacaaaagggttacaa 2630326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 349  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 7160977 - 7160912
Alignment:
Q  314 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 379  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  7160977 caatatgacctactataggggagagatcagctctccaatccactcagatgaaagtgatacaaaggg 7160912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5675017 - 5674564
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc-aagcaaacaacaacaaaac-agccctaa-ctagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||  || ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  5675017 gatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaa--agagtaaaaagtttcccaagcaa-caacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca 5674921  T
Q  234 caagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
     ||||||   |||||||  ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674920 -aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacaccaaaga-gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 5674826  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaa-caagccctagattcta 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5674825 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagcttacacaagaaacaagacctagattcta 5674726  T
Q  432 cccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaagg 531  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5674725 ccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacccaagg 5674626  T
Q  532 tgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674625 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggtt 5674564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14737866 - 14737482
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14737866 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 14737767  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac--aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737766 agcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 14737668  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttac 383  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14737667 caccg-agaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttac 14737570  T
Q  384 aagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    |||  ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14737569 aag--actctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14742725 - 14742342
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14742725 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 14742626  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742625 agcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 14742527  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14742526 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 14742429  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||  ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14742428 ag--actctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 28184297 - 28184684
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaa--tggtct 183  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
T  28184297 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtct 28184396  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaa 28184496  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 381  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28184497 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 28184594  T
Q  382 acaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    |||| |  |  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28184595 acaacactc--tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 11856765 - 11857154
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa--ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctc 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11856765 tgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 11856864  T
Q  185 caagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac--- 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||       
T  11856865 caagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaa 11856963  T
Q  280 aaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 379  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11856964 aaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 11857061  T
Q  380 ttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857062 ttacaag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22010983 - 22010602
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22010983 tgttgtgaatccggttcaaaa---atcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 22010887  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22010886 agcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaac 22010788  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22010787 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 22010690  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    || |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010689 ag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 87 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28155861 - 28155477
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28155861 tgttgtgaatccggttctaaacaaaaccttcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttc 28155762  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaa 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28155761 aagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaa 28155663  T
Q  283 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtta 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28155662 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtta 28155564  T
Q  383 caagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 471  Q
    ||||||    |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28155563 caagaa--tttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 28155477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 87 - 387
Target Start/End: Original strand, 6438294 - 6438595
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctc 184  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||    
T  6438294 tgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttc 6438393  T
Q  185 caagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaa 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6438394 caagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaa 6438491  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 381  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  6438492 aacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggtt 6438589  T
Q  382 acaaga 387  Q
    ||||||    
T  6438590 acaaga 6438595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 314 - 587
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709300
Alignment:
Q  314 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaag 413  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa----------gaaa-aatagcttgcaagcttacacaag 22709129  T
Q  414 aacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtga 513  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22709130 aacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagtttttgatccttccaatggtga 22709229  T
Q  514 actcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    | | ||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22709230 aat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 22709300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757285
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 5757477  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaata-tgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  5757476 -atagcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtt-ccactctctctcaataatgaaccctaaa-gagaagacacggaagga 5757380  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||   |||||||||||||||||||    
T  5757379 agcttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctaaatacaaagacactcaaccct 5757285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Original strand, 6005234 - 6005514
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6005234 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 6005333  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6005334 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 6005428  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  6005429 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 6005514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 292 - 545
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356287
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaagaaa- 21356134  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||    
T  21356135 aataacttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-ctcactctctcaataatgaaccct-aaagaaaagacacaaaagga 21356232  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21356233 agcttttgattcttccaatgatgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 21356287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 471
Target Start/End: Original strand, 16838561 - 16838923
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16838561 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 16838660  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16838661 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 16838755  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttc 400  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  |||    
T  16838756 cccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattc 16838852  T
Q  401 aagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 471  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| ||||  |||||| |||||||||||||    
T  16838853 aagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 16838923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33330715 - 33330433
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33330715 aaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 33330616  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  33330615 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttg 33330520  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33330519 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33330433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33336212 - 33335930
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  33336212 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagc 33336113  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  33336112 c-taagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttg 33336017  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  33336016 acccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 33335930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979802
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaa 31979611  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | || | |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  31979612 --attaacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccatttttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 31979705  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31979706 gaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacccaaaagaacctcactacaaagacactcaaccct 31979802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086281
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaa 31086472  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| |||| |  ||||| |||  ||||||| |||  | |     
T  31086471 at--tagcttataagcttacacaagagcaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactca-ataatgaatcct--aagagaaaacataaaaa 31086378  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31086377 gaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcacaacccaaggtgtttacaatg--tttctcaacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 31086281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 337
Target Start/End: Original strand, 5343297 - 5343527
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  5343297 aaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag- 5343395  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    |||||  |||  ||||||| |||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5343396 cctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttg 5343491  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343492 acccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572050
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5572240  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| | ||| || ||||| ||| ||  ||||| |||  ||||||| |||| | ||    
T  5572239 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacgcat-tttgtgtcacccacactctca--atgaatcct--aagagaaaacacaaaag 5572147  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||    
T  5572146 gaagcttttgatcattccaatagtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatccccactacaaagacacccaaccct 5572050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 313 - 545
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18233096
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |  ||| |  |||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa--atcagcttataagcttacaca 18232964  T
Q  412 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatg 509  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  18232965 agaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaaggaagcttttgatccttccaatg 18233061  T
Q  510 gtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18233062 gtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 18233096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077118
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaa 10077164  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccat 436  Q
      | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||    
T  10077163 --attagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacccat 10077118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801149
Alignment:
Q  304 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagccttca 401  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||||||  | || | |  |    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaa--attatcttata 21801332  T
Q  402 agcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagc-tttagat 499  Q
    |||||||| ||||||||| | ||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| ||| |||||||||  ||||||| |||| | ||||||| ||| |||    
T  21801331 agcttacaaaagaacaagacttaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaa-atgaaccct--aagagaaaacacaaaaggaagctttttgat 21801236  T
Q  500 ccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21801235 ccttccaatgttgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaaccct 21801149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 545
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630203
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||     
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaa- 4630052  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | || | |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| || | ||| || ||||  ||| ||| ||||| |||  ||||||| |||| | |||    
T  4630053 -attaacttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctacctat-tttgtgtcacccaaactctcaa-atgaatcct--aagagaaaacacaaaagg 4630147  T
Q  489 aagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  4630148 aagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaatgtgtttaaaatgttt 4630203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963989
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 22963797  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| |  || ||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | |  |  | ||| ||| |||| ||||| ||||||  |||| |||| |  |    
T  22963798 --attagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactcacactctcaataatgaatcctaaa--agaaaacacaaagg 22963892  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||| ||||| ||   || ||||||||||||||||||||    
T  22963893 gaaatttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagagatcttcactacaaagacactcaaccct 22963989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824404
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23824596  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| |  || ||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | |  |  | ||| ||| |||| ||||| ||||||  |||| |||| |  |    
T  23824595 --attagcttataaccttacacaa-aacaagccgtaatttctacccattttttgtcactcacactctcaataatgaatcctaaa--agaaaacacaaagg 23824501  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||| ||||| ||   || ||||||||||||||||||||    
T  23824500 gaaatttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaatccaagagatcttcactacaaagacactcaaccct 23824404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017482
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Original strand, 11857158 - 11857223
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11857158 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 11857223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 14737478 - 14737413
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14737478 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 14737413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22010598 - 22010533
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22010598 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 22010533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125944
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30125946  T
Q  235 aa 236  Q
    ||    
T  30125945 aa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936671
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaa 31936671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 14742335 - 14742273
Alignment:
Q  531 gtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  14742335 gtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccattggtt 14742273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5017390 - 5017303
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  5017390 gatccttccaatggtgaaatc-tcattacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 5017303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Original strand, 31936778 - 31936865
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31936778 gatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaatagatcctcactacaaagacactcaaccct 31936865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 24436046 - 24435818
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg-ttacaagaaacaatagccttcaagcttacaca 411  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||| |  ||||||||||   |||| |  ||||||||| |    
T  24436046 ccaatatgacctactctaggggagagagcagccctccgatccactaggatgaaaatgttacaaatgaattacaagaaat--tagcttataagcttacaaa 24435949  T
Q  412 agaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatg 509  Q
    | |||||| ||||  |||||||||| | | | || |||||  ||| |||  ||| |||||  ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||    
T  24435948 aaaacaagacctaatttctacccatttttatatcacccacattcataat--gaatcctaa--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatg 24435853  T
Q  510 gtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24435852 gtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt 24435818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 545
Target Start/End: Original strand, 14521877 - 14521924
Alignment:
Q  498 atccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14521877 atccttccaatggtgaaattctcactacccaaggtgtttacaatgttt 14521924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273276
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 589
Target Start/End: Original strand, 5385799 - 5385886
Alignment:
Q  498 atccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacccttt 589  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5385799 atccttctaatggtgaaatc-tcactacttaaggtgattgcaatgttt--cttaacccaa-tgaacctcactacaaagacactcaactcttt 5385886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 180 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202572
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-gaa 24202879  T
Q  279 caaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag 377  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24202878 caaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 24202780  T
Q  378 ggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaa 477  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202779 ggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaa 24202681  T
Q  478 gacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagac 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24202680 gacactagaggaagctttagatccttccaatggtgagat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagac 24202582  T
Q  578 actcaaccct 587  Q
    ||||||||||    
T  24202581 actcaaccct 24202572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 137 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787158
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaa--acaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaacca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  232 cacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 330  Q
    ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 24787422  T
Q  331 ggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattc 429  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24787421 ggggggagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattc 24787323  T
Q  430 tacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaa-tggtgaactcctcactaccta 528  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |    
T  24787322 taccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaactaatgaactcctcactgccca 24787223  T
Q  529 aggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24787222 aggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggtt 24787158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Original strand, 41398032 - 41398415
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  41398032 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctcc 41398131  T
Q  186 aagca---aacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagc--aaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac 279  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||      ||| ||||||    
T  41398132 aagcaaacaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag------aaggaagaac 41398225  T
Q  280 aaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 379  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  41398226 aaaacaccg-agaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 41398323  T
Q  380 ttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    |||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41398324 ttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358647
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 19358841  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19358840 atagcttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 19358741  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19358740 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg-ttttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccct 19358647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361236
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 19361430  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19361429 atagtttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 19361330  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19361329 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg-ttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 19361236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 25445387 - 25444996
Alignment:
Q  82 ggtagtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  25445387 ggtagtgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaat 25445288  T
Q  179 ggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaa 275  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||||||| |||    
T  25445287 ggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaa 25445190  T
Q  276 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25445189 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 25445091  T
Q  376 agggttacaagaaacaatagcct-tcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 471  Q
    | |||||||||  ||  |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25445090 aaggttacaag--actctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 25444996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 292 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19379916
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 19380070  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19380069 atagtttgcaagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 19379970  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19379969 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt 19379916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 87 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 44024163 - 44023864
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  44024163 tgttgtgaatccgattccaaataaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttcc 44024064  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  44024063 aagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaa 44023966  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttac 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  44023965 caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggttac 44023868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 87 - 387
Target Start/End: Original strand, 39445292 - 39445594
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  |    
T  39445292 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggctt 39445391  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaaca 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39445392 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 39445489  T
Q  281 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  39445490 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggt 39445587  T
Q  381 tacaaga 387  Q
    |||||||    
T  39445588 tacaaga 39445594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 86 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1055305 - 1055002
Alignment:
Q  86 gtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||       
T  1055305 gtgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtct 1055206  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaac 279  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1055205 tccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 1055108  T
Q  280 aaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  1055107 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaagg 1055010  T
Q  380 ttacaaga 387  Q
    ||||||||    
T  1055009 ttacaaga 1055002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 189 - 472
Target Start/End: Original strand, 41390483 - 41390760
Alignment:
Q  189 caaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaaca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||      ||| ||||||||||||    
T  41390483 caaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaaca 41390576  T
Q  286 ccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 385  Q
     |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41390577 tcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 41390674  T
Q  386 gaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    |  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41390675 g--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 292 - 585
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281995
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 3281805  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  3281806 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagga 3281902  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  3281903 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 3281995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644705
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 26644896  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  26644895 -atagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgtttctc-actctctcaatgatgaaccctaa--gagaagacacaaaagga 26644800  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||  | ||||||||  ||   || ||||||||||||||||||||    
T  26644799 agcttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactactcaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaaaagatcttcactacaaagacactcaaccct 26644705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 400 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 19366297 - 19366111
Alignment:
Q  400 caagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagctttagat 499  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19366297 caagcttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagctttagat 19366198  T
Q  500 ccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19366197 ccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 19366111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604429
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaa- 13604622  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  13604621 aatagcttgcaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 13604524  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  13604523 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagatactcaaccct 13604429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536377
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 21536569  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | ||  |||||||| | |||| || ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  21536568 aatagcttgcaagcttacacaagaacaatacttaatttctacccgtttgtg-ttacccactctctcaatgatgaaccct--aagagaagacacaaaagga 21536472  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||   ||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21536471 agctttcgatccttccaatggtgaaat-cttactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 21536377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 292 - 585
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37070055
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||         
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa----- 37069864  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| || ||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  37069865 aatagtttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttacccactcactcaataatgaaccat-aaagagaagacacaaaagga 37069962  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||| || | |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  37069963 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcattatccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 37070055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43988734 - 43988452
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  43988734 aaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 43988635  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||   |   |||||||| |||||||||||| | ||||||||||     
T  43988634 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttt 43988539  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  43988538 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 43988452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703740
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaaggg-ttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 47703935  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| | ||    
T  47703934 at--tagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctacccattt-tgtgtcacccactctcacaatatgaatcctaa--gagaaaacacaaaag 47703840  T
Q  488 gaagctttag-atccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaaccc--aagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
    |||| |||   ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||  ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  47703839 gaagtttttttatcattccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaac 47703743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 41386543 - 41386650
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41386543 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 41386642  T
Q  186 aagcaaac 193  Q
    ||||||||    
T  41386643 aagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29652103
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 29651909  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | || | |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  29651910 --attaacttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 29652004  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  29652005 ggaaactttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaacc 29652101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 586
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476551
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||| |||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaa 9476359  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
      | |||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||| || | |||||||||||| |||| | |  ||||||| |||| | ||    
T  9476360 --attagcttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatccat-tttgtgtcactcactctcacaatgtgaatctt--aagagaaaacacaaaag 9476454  T
Q  488 gaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||| ||| ||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  9476455 gaagctttttgatccttcaaatggtgaaat-ctcactacccaagatgtttacaatg--tttcccaaccaaagagaacctcactacaaagacattcaaccc 9476551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 585
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598688
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaa 13598496  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  13598497 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcat-tttgtgtcacccacactctcaatgatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 13598591  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  13598592 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttgccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 13598688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124361
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16124515  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctaccca-tatgtgtttccc-cactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| ||| |||| ||| |  ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  16124514 --attagcttataagcttacataagaacaagacctaatttctacccattttgtgttacccacactttca-ataatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 16124420  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16124419 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 16124361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073220
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa- 19073026  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| | ||| || | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| |||| | |||    
T  19073027 -attagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccat-tttgtgtcactcacactctcaa-atgaaccct--aagagaaaacacaaaagg 19073121  T
Q  489 aagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  19073122 aagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaacc 19073218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19121110
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa- 19120916  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||| | ||| || | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| |||| | |||    
T  19120917 -attagcttataagcttacaaaagaacaatacctaatttctacccat-tttgtgtcactcacactctcaa-atgaaccct--aagagaaaacacaaaagg 19121011  T
Q  489 aagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacc--caagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  19121012 aagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactatccaaggtgtttacaatg--tttcccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaacc 19121108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098632
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||     
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaa- 47098824  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 488  Q
     | |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |     || ||||| ||| ||  ||||| |||  |||| || |||| | |||    
T  47098823 -attagcttataagcttacaaaagaacaagtcctaatttctacccattttcacatcacccacactctca--atgaaacct--aagaaaaaacacaaaagg 47098729  T
Q  489 aagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  47098728 aagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagaacctcgctacaaagacactcaaccct 47098632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889728
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 32889537  T
Q  390 caatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtt-tc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |  | || ||||| ||| ||||  ||| |||||  ||||| |||| | ||    
T  32889538 -aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttttcatatcacccacactctcaat--gaatcctaa--gagaaaacacaaaag 32889632  T
Q  488 gaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
     ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||   |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  32889633 -aagcttttgaaccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaaaaaaacctcactacaaagacactcaaccct 32889728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104370
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 27104371  T
Q  389 a 389  Q
    |    
T  27104370 a 27104370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 50958683 - 50958747
Alignment:
Q  20 aacacaagatgcatcctcccttgcttttatatgacagtgatacgttaattgtttttaacacaggtag 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50958683 aacacaagatgcatcctcccttgcttttat--gacagtgatacgttaattgtttttaacacaggtag 50958747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775757
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa 376  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaa 775757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102840
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa 389  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccactaagatgaaaatgttacaatgagttacaagaaa 47102840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Original strand, 41398419 - 41398477
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41398419 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 41398477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 583
Target Start/End: Original strand, 41390764 - 41390819
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaa 583  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  41390764 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 41390819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 40816842 - 40816621
Alignment:
Q  360 gatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccc-cactctcaca 457  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||| |||||  ||| ||||||||      
T  40816842 gatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat--tagcttataagcttacaaaagaacaagacctaatttctactcatttgtgtcacccacactctca-- 40816747  T
Q  458 atatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaaccc- 555  Q
      ||||| |||||  ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||     
T  40816746 --atgaatcctaa--gagaaaacacaaaaggaagctttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaaccct 40816654  T
Q  556 -aagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
     ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  40816653 caagagaacctcactacaaagacactcaaccct 40816621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 47102733 - 47102646
Alignment:
Q  497 gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  47102733 gatccttccaatgatgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccct 47102646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9022799 - 9022715
Alignment:
Q  498 atccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  9022799 atccttccaatggtgaaatc-tcactacgaaaggtgtttacaatgttt--ctcaacccaagagaacctcactacaaagacattcaacc 9022715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 27104322 - 27104211
Alignment:
Q  471 aagagaagacactagaggaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctct 569  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||  | ||||||||| ||| ||| ||    
T  27104322 aagagaaaacacaaaaggaagctttttgattcttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgcttataatgttt--cccaacccaagagac-ctcact 27104227  T
Q  570 acaaagacactcaacc 585  Q
    ||||||||||||||||    
T  27104226 acaaagacactcaacc 27104211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 48382524 - 48382479
Alignment:
Q  345 tctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaa-gggttacaagaaa 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  48382524 tctccaatccaatatgatgaaagtgatacaaataggttacaagaaa 48382479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 35352 - 34967
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35352 tgttgtgaatccggttaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 35253  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35252 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 35154  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttac 383  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  35153 caccg-agaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttag 35056  T
Q  384 aagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35055 aag-aactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34963 - 34898
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccctttggtt 593  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34963 aaggtgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggtt 34898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 180 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18157 - 17755
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaag 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |    
T  18157 gtctccaagcaa-caacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-g 18064  T
Q  277 aacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18063 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 17965  T
Q  376 agggttacaagaaacaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagag 475  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17964 agggttacaagaaa-aatagcttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagag 17866  T
Q  476 aagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaag 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  17865 aagacacaagaggaagctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaag 17767  T
Q  576 acactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||    
T  17766 acactcaaccct 17755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 23848
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaa-a 24043  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaag 491  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24042 atagcttgcaagcttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 23943  T
Q  492 ctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23942 ctttagatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccct 23848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 4)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 87 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9549
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9930 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctcc 9831  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  9830 aaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaac 9733  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9732 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 9635  T
Q  385 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    ||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9634 ag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 28
Alignment:
Q  88 gttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  170 gttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctcca 77  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76 agtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3750 - 3692
Alignment:
Q  528 aaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccc 586  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3750 aaggtgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 3692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3833 - 3754
Alignment:
Q  393 tagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 472  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3833 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 87 - 387
Target Start/End: Original strand, 155 - 457
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |    
T  155 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggctt 254  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaaca 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  255 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 352  T
Q  281 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  353 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tg-aagtgttacaaaaggt 450  T
Q  381 tacaaga 387  Q
    |||||||    
T  451 tacaaga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8224
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaa- 8418  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8417 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacctaatttctacgtatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagga 8319  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8318 agcttttaatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 8224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133086
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaagaaa- 133279  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  133278 aatagcttgcaaacttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 133181  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  133180 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaaactcaaccct 133086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 585
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5973
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaa 5781  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
    |   |||| |  ||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  ||||||| |||| | |    
T  5782 at--tagcttataagcttacacaagaacaagacttaatttctactcat-tttgtgtcacccacactctcaatgatgaatcct--aagagaaaacacaaaa 5876  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||  ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  5877 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttgccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 5973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 587
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2784
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaa 2590  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactaga 486  Q
      | |||| |  |||||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| |||  |||| || |||| | |    
T  2591 --attagcttataagcttacacaagaacaagaactaatttctacccat-tttgtgtcacccacactctcaatgatgaatcct--aagataaaacacaaaa 2685  T
Q  487 ggaagc-tttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaacc 585  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||||    
T  2686 ggaagctttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacgcaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagagatcctcactacaaagaaacttaacc 2782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36639
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 36832  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  36831 aatagcttgcaagcttacacaagaacaagacatgatttctacccatttgtgttt-cccactctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 36734  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  36733 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 36639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 292 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43768
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaac 390  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-- 43961  T
Q  391 aatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaat-atgaaccctaaaagagaagacactagagga 489  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  43960 aatagcttgcaagcttatacaagaacaagacctaatttctacccatttgtg-ttccactctctctcaataatgaaccct-aaagagaagacacaaaagga 43863  T
Q  490 agctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  43862 agcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccct 43768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 149224 - 148944
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  149224 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 149125  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  149124 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 149030  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  149029 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 148944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2519 - 2239
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2519 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 2420  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2419 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 2325  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2324 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 2239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19433 - 19153
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19433 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 19334  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19333 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 19239  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 388  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  19238 cccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatg-tgagtgtgttacaaaagagttacaagaa 19153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14603 - 14297
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca--aagaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  14603 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 14504  T
Q  183 tccaagcaaa-caacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--g 276  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |    
T  14503 tccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacg 14409  T
Q  277 aacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aa 375  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  14408 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaa 14310  T
Q  376 agggttacaagaa 388  Q
    || ||||||||||    
T  14309 agagttacaagaa 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 293 - 587
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85973
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaca 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaat- 85782  T
Q  392 atagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 490  Q
     |||| |  |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||  |||| ||| || |||| | |||||    
T  85783 -tagcttaaaagcttacacaagagcaagacctaatttctacccattt-tgtgtctcccactcccacaatatgaattctaagagaaaa-acacaaaaggaa 85879  T
Q  491 gctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaacccaagtgactctctctacaaagacactcaaccct 587  Q
    | ||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||  | ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  85880 gtttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaagtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccct 85973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 182233 - 181980
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  182233 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 182134  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  182133 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 182039  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182038 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34239 - 34132
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34239 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 34140  T
Q  186 aagcaaac 193  Q
    ||||||||    
T  34139 aagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 300
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagca--aacaacaacaaaacagccct-aactagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  487 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaacaacaacaa-aaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccaca 389  T
Q  234 c-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggta-aaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 324  Q
    | |||||||   |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  388 caaagagataataaagca-aaacaagataagc--tagaaagaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 291 - 585
Target Start/End: Original strand, 10728 - 11021
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10827  T
Q  389 acaatagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttc-cccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 487  Q
    |   |||  | |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | || | ||| || ||||||||||  ||||||| ||||| ||| || | |  | ||    
T  10828 at--tagtttacaagcttacacaagaacaagacctaatttctatctattt-tgtgtcacccactctcatgatatgaatcctaagagaaaacagaaaaaag 10924  T
Q  488 gaagcttta-gatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgtttttctcaaccc--aagtgactctctctacaaagacactcaac 584  Q
     |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||  ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  10925 -aagctttttgatccttccaatggtgaaatc-tcactacccaaggtgtttacaatgttt--cccaaccctcaagagaacctcactacaaagacactcaac 11020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaa 375  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 545
Target Start/End: Original strand, 45374 - 45448
Alignment:
Q  470 aaagagaagacactagaggaagctttagatccttccaatggtgaactcctcactacctaaggtgattacaatgttt 545  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45374 aaagagaagacacaaaaggaagcttttgatccttccaatggtgaaat-ctcactacccaaggtgtttacaatgttt 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 172
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13229
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgaga 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13141 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgaga 13229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 433
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17404
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagg-gttacaagaaacaa 392  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||       
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat-- 17363  T
Q  393 tagccttcaagcttacacaagaacaagccctagattctacc 433  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  17364 tagcttataagcttacacaagaacaagacctaatttctacc 17404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  322 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University