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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10102_low_31 (Length: 228)

Name: NF10102_low_31
Description: NF10102
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10102_low_31
NF10102_low_31
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (1-228)||(32817954-32818182)
chr7 (1-228)||(14644479-14644708)
chr7 (1-228)||(33292178-33292407)
chr7 (1-228)||(14634779-14635008)
chr7 (1-228)||(15947374-15947603)
chr7 (1-228)||(9736903-9737132)
chr7 (10-228)||(11634340-11634559)
chr7 (1-139)||(13874433-13874571)
chr7 (1-223)||(7592968-7593193)
chr7 (1-223)||(15174502-15174727)
chr7 (1-122)||(48710008-48710131)
chr7 (1-177)||(19352590-19352768)
chr7 (118-228)||(48711401-48711511)
chr7 (26-209)||(4306585-4306765)
chr7 (160-228)||(28344163-28344232)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-228)||(20044775-20045004)
chr8 (1-228)||(42712179-42712408)
chr8 (1-228)||(20030136-20030365)
chr8 (1-228)||(12925311-12925540)
chr8 (1-228)||(12767588-12767819)
chr8 (1-228)||(18143430-18143658)
chr8 (1-228)||(25037027-25037255)
chr8 (1-228)||(25051064-25051292)
chr8 (3-228)||(18883163-18883389)
chr8 (1-228)||(31575412-31575637)
chr8 (1-228)||(4843723-4843953)
chr8 (10-228)||(18251787-18252006)
chr8 (10-228)||(18232885-18233104)
chr8 (10-228)||(18242336-18242555)
chr8 (1-146)||(12915499-12915645)
chr8 (1-223)||(20714031-20714256)
chr8 (1-139)||(33592135-33592274)
chr8 (1-139)||(33601774-33601913)
chr8 (10-139)||(24634015-24634145)
chr8 (33-139)||(42896183-42896289)
chr8 (1-223)||(7789079-7789304)
chr8 (1-205)||(15833931-15834137)
chr8 (1-64)||(20714417-20714481)
chr8 (2-82)||(24096077-24096159)
chr8 (3-60)||(26194048-26194106)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (1-228)||(2066-2295)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-228)||(22066250-22066479)
chr6 (2-228)||(23884449-23884677)
chr6 (1-228)||(17512224-17512452)
chr6 (1-223)||(23895617-23895842)
chr6 (1-180)||(18420557-18420738)
chr6 (15-180)||(14102312-14102480)
chr6 (28-158)||(11421480-11421611)
chr6 (1-163)||(10259780-10259944)
chr6 (36-180)||(23110256-23110401)
chr6 (109-228)||(13218310-13218429)
chr6 (35-142)||(24564649-24564756)
chr6 (1-205)||(12173401-12173607)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (1-228)||(33955501-33955730)
chr5 (1-228)||(11223333-11223561)
chr5 (4-228)||(20834388-20834614)
chr5 (1-228)||(20035956-20036185)
chr5 (1-228)||(13815374-13815602)
chr5 (1-228)||(42732578-42732803)
chr5 (10-228)||(24244053-24244272)
chr5 (10-228)||(24290677-24290896)
chr5 (1-136)||(22448331-22448467)
chr5 (1-228)||(26652580-26652805)
chr5 (1-228)||(26924165-26924390)
chr5 (1-223)||(18569001-18569226)
chr5 (1-223)||(24412790-24413015)
chr5 (1-223)||(30454202-30454427)
chr5 (1-223)||(30459260-30459485)
chr5 (1-223)||(22489147-22489372)
chr5 (1-223)||(24422239-24422464)
chr5 (1-223)||(30444830-30445055)
chr5 (1-180)||(4635951-4636132)
chr5 (31-205)||(22118134-22118310)
chr5 (33-176)||(31150669-31150813)
chr5 (33-176)||(5600587-5600731)
chr5 (33-176)||(5610233-5610377)
chr5 (72-139)||(22457720-22457788)
chr5 (1-82)||(37514860-37514942)
chr5 (33-69)||(16111002-16111038)
chr5 (106-207)||(16110860-16110962)
chr5 (35-80)||(17553829-17553874)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-228)||(20884450-20884679)
chr4 (1-228)||(50516499-50516727)
chr4 (10-228)||(11482272-11482492)
chr4 (1-223)||(3242288-3242513)
chr4 (1-223)||(26812470-26812695)
chr4 (1-223)||(26821937-26822162)
chr4 (1-223)||(37059048-37059273)
chr4 (1-223)||(54689914-54690139)
chr4 (1-223)||(54699345-54699570)
chr4 (1-180)||(3918072-3918253)
chr4 (1-180)||(15842899-15843080)
chr4 (33-176)||(23622926-23623070)
chr4 (120-205)||(18125530-18125616)
chr4 (118-208)||(21667754-21667845)
chr4 (118-208)||(21676518-21676609)
chr4 (35-82)||(45609551-45609598)
chr4 (123-228)||(41902641-41902745)
chr4 (38-82)||(41902572-41902616)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-228)||(35877473-35877702)
chr2 (1-228)||(35884962-35885191)
chr2 (1-228)||(36724675-36724904)
chr2 (2-228)||(3396880-3397108)
chr2 (1-223)||(31710467-31710692)
chr2 (1-180)||(14273210-14273391)
chr2 (10-180)||(24022752-24022924)
chr2 (33-176)||(22632409-22632553)
chr2 (33-176)||(1800500-1800644)
chr2 (33-176)||(1791006-1791146)
chr2 (12-83)||(16446667-16446739)
chr2 (1-69)||(29911278-29911347)
chr2 (1-163)||(18578708-18578872)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (1-228)||(14272019-14272248)
chr1 (4-228)||(14281888-14282114)
chr1 (12-228)||(3470949-3471167)
chr1 (1-139)||(21919432-21919571)
chr1 (1-205)||(5378425-5378632)
chr1 (26-228)||(21633539-21633740)
chr1 (1-201)||(40999036-40999239)
chr1 (1-228)||(26906247-26906473)
chr1 (45-228)||(15810030-15810213)
chr1 (37-208)||(30676766-30676938)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (3-228)||(5385647-5385874)
chr3 (1-228)||(13328279-13328508)
chr3 (1-228)||(46305575-46305803)
chr3 (1-228)||(23486998-23487229)
chr3 (1-223)||(24794547-24794772)
chr3 (1-223)||(28367654-28367879)
chr3 (1-223)||(28375472-28375697)
chr3 (1-223)||(28383294-28383519)
chr3 (1-223)||(28351721-28351946)
chr3 (1-223)||(38529178-38529403)
chr3 (92-205)||(7784101-7784215)
chr3 (1-228)||(4951550-4951780)
chr3 (33-176)||(17529895-17530039)
chr3 (33-176)||(32877877-32878021)
chr3 (33-176)||(54624662-54624806)
chr3 (33-176)||(48978677-48978817)
chr3 (33-176)||(48988217-48988357)
chr3 (15-86)||(19388864-19388936)
chr3 (120-205)||(4361634-4361720)
chr3 (36-86)||(24285487-24285537)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (3-228)||(256916-257142)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-190)||(124043-124233)
scaffold0021 (117-228)||(143126-143238)
scaffold0021 (33-163)||(100003-100134)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-139)||(2262-2401)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (1-139)||(12549-12688)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-223)||(30824-31049)
scaffold0040 (1-180)||(10048-10228)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (1-223)||(94432-94657)
scaffold0028 (1-223)||(103873-104098)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-223)||(3495-3720)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-223)||(408290-408515)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (33-176)||(14848-14992)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (34-209)||(27088-27269)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (36-176)||(24600-24741)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32818182 - 32817954
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32818182 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccggtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 32818083  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32818082 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttgttttcgcacaagaa 32817983  T
Q  200 aggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32817982 aggttcgaactttcctatcttaaactatt 32817954  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14644479 - 14644708
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14644479 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 14644578  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14644579 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 14644678  T
Q  200 aggttggaac-tttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14644679 aggttggaacttttcctatctcaaactatt 14644708  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33292178 - 33292407
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33292178 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 33292277  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33292278 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 33292377  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33292378 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 33292407  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14634779 - 14635008
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14634779 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagctggtagaaactt 14634878  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14634879 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 14634978  T
Q  200 aggttggaac-tttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14634979 aggttggaacttttcctatctcaaactatt 14635008  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15947374 - 15947603
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15947374 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtcaccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 15947473  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15947474 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 15947573  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15947574 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 15947603  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9737132 - 9736903
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9737132 ataacacaggagagttatcctggttcactaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccattatagtattcagtttgtagaaactt 9737033  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9737032 ctaaccaacactataaggccttgatcacaccagatcagtctgtagcccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 9736933  T
Q  200 aggttggaac-tttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9736932 aggttggaacttttcctatctcaaactatt 9736903  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 11634340 - 11634559
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11634340 gagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggcagaaacttctaaccaac 11634439  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaaggttgga 207  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||    
T  11634440 actataacgtcttgatcacacccgatcagtttgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttcttacaattctttgcactagcaaaagaaaggttgga 11634539  T
Q  208 actttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  11634540 a-ttttctatctcaaactatt 11634559  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13874571 - 13874433
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13874571 ataacacaggagagttatcctggttcacccaatccg-ctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagttttcagttggtagaaactt 13874473  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13874472 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 13874433  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7593193 - 7592968
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |   |||||    
T  7593193 ataacacaagagagttatcctggttcaccaaacctggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccattatagttttc--ttgctaacagaaa 7593096  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  7593095 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacacctgtattatcaacctcatcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 7592996  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7592995 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 7592968  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15174727 - 15174502
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   | |||    
T  15174727 ataacacaggagatttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacaaaaa 15174630  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||  ||  | |||     
T  15174629 cttctgactagcactacaagatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcagcaggcttatataattctttgcacactagcaa 15174530  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15174529 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 15174502  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 48710008 - 48710131
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtcccc-acacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaact 98  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48710008 ataacacaggagagatattctggttcaccaaactcggatacttccagtcccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagctagtagaaact 48710107  T
Q  99 tctaaccaacactataaggtcttg 122  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  48710108 tctaactagcactataaggtcttg 48710131  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 19352590 - 19352768
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | | |   ||||||||    
T  19352590 ataatacaggagagttatactggttcaccaaattcggctacttccagtcctcacacttcgtgtgagattatccactatagtctcctgctaacagaaactt 19352689  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctaca 177  Q
    || ||    |||||||  || |||||||||||||||  || || || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  19352690 ctgacttgtactataaattcctgatcacaccagatctttccgttacaccctgtattatgaacctcatcaggcttctaca 19352768  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Original strand, 48711401 - 48711511
Alignment:
Q  118 tcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaactttcctat 217  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  48711401 tcttgatcacaccatatcagttcggaacacatgtattatcaacctcaacaggcttctataattctttgctttcacacaagaaaggttaaaacttttctat 48711500  T
Q  218 ctcaaactatt 228  Q
    |||||||||||    
T  48711501 ctcaaactatt 48711511  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 209
Target Start/End: Original strand, 4306585 - 4306765
Alignment:
Q  26 accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatc 125  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  |   |||||||| | |  | ||||||  | | ||||||    
T  4306585 accaaagccagctacttccagttcccacacttcgagtgagattttctactatagtatccaactatcagaaacttatgaatagcactat--gttgttgatc 4306682  T
Q  126 acaccagatcagtctg--taacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaac 209  Q
    |||||||||||||| |  ||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |   || ||||||||||||||||||    
T  4306683 acaccagatcagtccgattacactctgtattatcaacctcagcagacttctacaattattga---tcacacaagaaaggttggaac 4306765  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28344232 - 28344163
Alignment:
Q  160 cctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28344232 cctcagcagacttctacaattatttgcttttgcacaagaaaggctggaactcttcctatctcaaactatt 28344163  T

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Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20045004 - 20044775
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20045004 ataacacatgagagttatcctggttcaccaaacccggctacatccagtccccacacttcgtgtgagattatccacgatagtatacagttggtagaaactt 20044905  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20044904 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaacccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 20044805  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20044804 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 20044775  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42712179 - 42712408
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42712179 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 42712278  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42712279 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 42712378  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42712379 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 42712408  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20030365 - 20030136
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20030365 ataacacaagagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagttggtataaactt 20030266  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20030265 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaatccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 20030166  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20030165 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 20030136  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12925540 - 12925311
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12925540 ataacacaggagagttatcctggttcacgaaacccgactacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 12925441  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  12925440 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgttttcgcacaagaa 12925341  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12925340 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 12925311  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12767819 - 12767588
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttcca--gtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaac 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12767819 ataacacaggagagttatcctggttcaccaatcccggttacttccacagtccccacatttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaac 12767720  T
Q  98 ttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12767719 ttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaacccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaag 12767620  T
Q  198 aaaggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12767619 aaaggttggaactcttcctatctcaaactatt 12767588  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18143430 - 18143658
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18143430 ataacacaggagagttatcttggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagcattcagttggtaaaaactt 18143529  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |  | ||| ||||    
T  18143530 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccttgtattatcaacctcagtaggcttcttacaattctttgcactagcaaaaga 18143629  T
Q  199 aaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18143630 aaggttggaa-ttttctatctcaaactatt 18143658  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25037027 - 25037255
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037027 ataacacaagagagttatcttggttcacccaatctggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 25037126  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  | ||| ||||    
T  25037127 ctaaccaacactataaagtcttgatcacaccagatcagtctgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttcttacaattctttgcactagcaaaaga 25037226  T
Q  199 aaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25037227 aaggttggaa-ttttctatctcaaactatt 25037255  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25051064 - 25051292
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25051064 ataacacaagagagttatcttggttcacccaatctggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 25051163  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  | ||| ||||    
T  25051164 ctaaccaacactataatgtcttgatcacaccagatcagtctgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttcttacaattctttgcactagcaaaaga 25051263  T
Q  199 aaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25051264 aaggttggaa-ttttctatctcaaactatt 25051292  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 18883163 - 18883389
Alignment:
Q  3 aacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttct 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18883163 aacacaggagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaaattct 18883262  T
Q  102 aaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |  | ||| ||||||    
T  18883263 aaccaacactataaagtcttgatcacaccagatcagttcgtaccctctgtattatcaacctcagcaggcttcttacaattctttgcactagcaaaagaaa 18883362  T
Q  201 ggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18883363 ggttggaa-ttttctatctcaaactatt 18883389  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31575412 - 31575637
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31575412 ataacacaagagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagctagtagaaactt 31575511  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |   || ||||||||    
T  31575512 ctaactagcactataaggtcttgatcacaccaaatcagtccagaacccctgtattatcaacctcagcaagcttctacaattcttga---tcacacaagaa 31575608  T
Q  200 aggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31575609 aggttggaactcttctatctcaaactatt 31575637  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4843723 - 4843953
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4843723 ataacaaaggagagttatcctggttcactaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaattt 4843822  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctg--tattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaa 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |  | ||| ||    
T  4843823 ctaaccaagactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccttgtatattatcaacctcatcaggcttcttacaattctttgcactagcaaaa 4843922  T
Q  197 gaaaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4843923 gaaaggttggaa-ttttctatctcaaactatt 4843953  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18252006 - 18251787
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18252006 gagagttatcctgattcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggcagaaacttctaaccaac 18251907  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaaggttgga 207  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||    
T  18251906 actataacgtcttgatcacacccgatcagtttgtaacctctgtattatcaacctcagcaggattcttacaattctttgcactagcaaaagaaaggttgga 18251807  T
Q  208 actttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  18251806 a-ttttctatctcaaactatt 18251787  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18233104 - 18232885
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18233104 gagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggcagaaacttctaatcaac 18233005  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaaggttgga 207  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||    
T  18233004 actacaacgtcttgatcacacccgatcagtttgtaacctctgtattatcaacctcagcaggattcttacaattctttgcactagcaaaagaaaggttgga 18232905  T
Q  208 actttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  18232904 a-ttttctatctcaaactatt 18232885  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18242555 - 18242336
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18242555 gagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggcagaaacttctaatcaac 18242456  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaaggttgga 207  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||    
T  18242455 actacaacgtcttgatcacacccgatcagtttgtaacctctgtattatcaacctcagcaggattcttacaattctttgcactagcaaaagaaaggttgga 18242356  T
Q  208 actttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  18242355 a-ttttctatctcaaactatt 18242336  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12915645 - 12915499
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12915645 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 12915546  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12915545 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaacc 12915499  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20714256 - 20714031
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||  ||| ||   ||||    
T  20714256 ataacacatgagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgacattatccattatagttgtc--ttgctaacagaaa 20714159  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||  | |||     
T  20714158 cttctgactagcactataagatcttgatcacaccagatcagtctgttacacctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgcacactagcaa 20714059  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20714058 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 20714031  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 33592135 - 33592274
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33592135 ataacacaggagagttatcctggttcacccaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagttttcagttgacagaaactt 33592234  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33592235 ctgaccaacactataaggtcttgatcacactagatcagtc 33592274  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 33601774 - 33601913
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33601774 ataacacaggagagttatcctggttcacccaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagttttcagttgacagaaactt 33601873  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33601874 ctgaccaacactataaggtcttgatcacactagatcagtc 33601913  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24634145 - 24634015
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggttac-caaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |    
T  24634145 gagagttatcctggttcctcaaacccgactacttccagtccccacacttcgtgtgatattatccactatagtattcagctagtagaaacttctaactagc 24634046  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24634045 actataaggtcttgatcacaccagatcagtc 24634015  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 139
Target Start/End: Original strand, 42896183 - 42896289
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42896183 ccggctacttccagtctccacacttcgtgtgagattatccactatagatttcagttgatagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 42896282  T
Q  133 atcagtc 139  Q
    |||||||    
T  42896283 atcagtc 42896289  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 7789079 - 7789304
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  7789079 ataacacaggagaattattctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 7789176  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  7789177 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtctgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 7789276  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7789277 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 7789304  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15834137 - 15833931
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||   | |    |||||||    
T  15834137 ataacacaagagatttatcttggttcaccaaatccggctactttcagtccacacacctcgtgtgagattatccattatagtatcatgctaactgaaactt 15834038  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
    || || | ||||||||| |||||| || ||||||| |||  || || ||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  15834037 ctgactagcactataagttcttgaccataccagataagttcgttactccctgtattatcaacatcagtaggtttctacaattctttgctttcacacatga 15833938  T
Q  199 aaggttg 205  Q
    |||||||    
T  15833937 aaggttg 15833931  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20714481 - 20714417
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtga 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20714481 ataacacatgagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtga 20714417  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Original strand, 24096077 - 24096159
Alignment:
Q  2 taacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtcccc-acacttcgtgtgagattatccactatagtat 82  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24096077 taacacaggagatttattctggttcaccaaactcgactacttccagtcccccacacctcgtgtgagattatccactatagtat 24096159  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Original strand, 26194048 - 26194106
Alignment:
Q  3 aacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgt 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  26194048 aacacatgagagttatcctggttcatcaaacccaactacttctagtccccacacttcgt 26194106  T

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Target: scaffold0206 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2295 - 2066
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2295 ataacacaagagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagttggtataaactt 2196  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2195 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaatccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 2096  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2095 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 2066  T

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Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22066479 - 22066250
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22066479 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 22066380  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22066379 ctaaccaacactataaggtcttgatcacactagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 22066280  T
Q  200 aggttggaac-tttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22066279 aggttggaacttttcctatctcaaactatt 22066250  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23884677 - 23884449
Alignment:
Q  2 taacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23884677 taacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattgtccactatagtatgcagttggtagaaacttc 23884578  T
Q  101 taaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23884577 taaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaaa 23884478  T
Q  201 ggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23884477 ggttggaactcttcctatctcaaactatt 23884449  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17512224 - 17512452
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17512224 ataacacagaagagttatcctggttcaccaaactcggctactttcagtccccacacttcttgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaactt 17512323  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || ||||| ||||    
T  17512324 ctaaccaacactataaagtcttgatcacactagatcagtctgtaa-ccctgtattatcaaccttagcaggcttctacaattctttgtttacgcacgagaa 17512422  T
Q  200 aggttggaac-tttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17512423 aggttggaacttttcctatctaaaactatt 17512452  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23895617 - 23895842
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  23895617 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 23895714  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  23895715 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 23895814  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23895815 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 23895842  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18420738 - 18420557
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  18420738 ataacacaggatagttatcctggttcacaaaacccggctacttccagtcccgacacctcgtgtgagattatacactatagttttc--ttgctaacagaaa 18420641  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| || | |||||  |  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18420640 cttctgactagcactaacaaatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaatt 18420557  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14102480 - 14102312
Alignment:
Q  15 ttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaacttctaaccaacac 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||||| | || | |||    
T  14102480 ttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcttgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaacttttgactagcac 14102383  T
Q  111 tataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  14102382 tgtaaggtcttgatcacaacagatcagcctgttacaccctgtattattaacctcagcagacttctacaatt 14102312  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 11421480 - 11421611
Alignment:
Q  28 caaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcac 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||   | ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11421480 caaatccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagtatcatgttaacaaaaaattctgactaacactataagatcttgatcac 11421579  T
Q  128 accagatcagtctgtaac-ccctgtattatca 158  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  11421580 accagatcagtctgttacaccatgtattatca 11421611  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 10259780 - 10259944
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |   ||||||||    
T  10259780 ataacacaggagaattattctggttcaccaaatccagctacttccagtcctcacacttcgtgtgggattctccactatagtatcctgctaagagaaactt 10259879  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctc 163  Q
    || || | ||||||||  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  10259880 ctgactagcactataaattcttgatcacaccagatcagtccgttacaccctgtattataaacctc 10259944  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 180
Target Start/End: Original strand, 23110256 - 23110401
Alignment:
Q  36 gctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |   |||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||||     
T  23110256 gctacttccagtccccacaccccgtgttagattatccactatagtattcggctaacagaaacttctgactagcactatatgttcttgatcacaccagata 23110355  T
Q  136 agtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| | || |||  |||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  23110356 agtctattacacccaatattatcaacatcaacaggcttctaaaatt 23110401  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13218429 - 13218310
Alignment:
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaa 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  | || | || |||||||||||||  || |||| |||||| || | |||| |||||||||| |||||||    
T  13218429 actataaggtattgatcacaccagaccagttcggaatcactatattatcaacctcaacaagcttatacaatcttatgcttttgcacaagaaaagttggaa 13218330  T
Q  209 ctttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  13218329 cttttctatctcaaattatt 13218310  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Original strand, 24564649 - 24564756
Alignment:
Q  35 ggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagat 134  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  24564649 ggctactttcagtctccacacttcgtatgagattgtccactataatattcaactactagaaacttctgaataacactatatgttcttgatcacatcagat 24564748  T
Q  135 cagtctgt 142  Q
    || |||||    
T  24564749 caatctgt 24564756  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12173607 - 12173401
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||   | |   ||||||||    
T  12173607 ataacacctgagatttatcatagttcaccaaactcggctactttcagtccccacaccttgtgtaagattatccactatagtatcatgctaacagaaactt 12173508  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcag-tctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
     | || | ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  12173507 atgactagcaccataaattcttgatcacaccagatcagttcgttaaatcctgtaaaataaaccttagtaggcttctacaattttttaattctggacaaga 12173408  T
Q  199 aaggttg 205  Q
    |||||||    
T  12173407 aaggttg 12173401  T

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Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33955501 - 33955730
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33955501 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 33955600  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33955601 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtacgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 33955700  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33955701 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 33955730  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11223561 - 11223333
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  11223561 ataacacaaaagagttatcctggttcaccaaactcggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccattatagtatacagt-ggtagaaactt 11223463  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11223462 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 11223363  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11223362 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 11223333  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20834614 - 20834388
Alignment:
Q  4 acacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttcta 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20834614 acacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacactccgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaacttcta 20834515  T
Q  103 accaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20834514 accaacactataaggtcttgatcataccagatcagttcgtaaccactgtataatcaacctcagcaggcttctccaattctttgctttcgcacaagaaagg 20834415  T
Q  203 ttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20834414 ttggaactcttcctatgtcaaactatt 20834388  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20036185 - 20035956
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20036185 ataacataggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacatcatgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaactt 20036086  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  20036085 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccataaccactatattatcaaccttagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaaaaa 20035986  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20035985 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 20035956  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13815374 - 13815602
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13815374 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcatgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 13815473  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |  | ||| ||||    
T  13815474 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcattctgtaacccttgtattatcaacctcaacaggcttcttacaattctttgcactagcaaaaga 13815573  T
Q  199 aaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  13815574 aaggttggaa-ttttctatcttaaactatt 13815602  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 42732578 - 42732803
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42732578 ataacacaagagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagctagtagaaactt 42732677  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   || ||||||||    
T  42732678 ctaactagcactataaggtcttgatcacaccagatcagtccagaacccctgtattatcaacctcaacaggcttctacaattcttga---tcacacaagaa 42732774  T
Q  200 aggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  42732775 aggttgaaactcttctatctcaaactatt 42732803  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 24244053 - 24244272
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24244053 gagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggcagaaacttctaatcaac 24244152  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaaggttgga 207  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||    
T  24244153 actacaacgtcttgatcacacccgatcagtttgtaacctctgtattatcaacctcagcaggattcttacaattctttgcactagcaaaagaaaggttgga 24244252  T
Q  208 actttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  24244253 a-ttttctatctcaaactatt 24244272  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 24290677 - 24290896
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24290677 gagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggcagaaacttctaatcaac 24290776  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaaggttgga 207  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |  | ||| |||||||||||||    
T  24290777 actacaacgtcttgatcacacccgatcagtttgtaacctctgtattatcaacctcagcaggattcttacaattctttgcactagcaaaagaaaggttgga 24290876  T
Q  208 actttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||| |||||||||||||||    
T  24290877 a-ttttctatctcaaactatt 24290896  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 22448331 - 22448467
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22448331 ataacacaagagagttatcctggttcacccaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaactt 22448430  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatca 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22448431 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatca 22448467  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26652805 - 26652580
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26652805 ataacacaggagagttatgctggttcaccaaacctgactacttccagtccccacacttcgtgtgagataatccactatagtattcagctaatagaaactt 26652706  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || |   || ||||||||    
T  26652705 ctaactagcactattaggtcttgatcacaccatatcagttcagaacccttgtattatcaacctcggtggacttctacaattcttga---tcacacaagaa 26652609  T
Q  200 aggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26652608 aggttgtaactcttctatctcaaactatt 26652580  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26924390 - 26924165
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26924390 ataacacaggagagttatgctggttcaccaaacctgactacttccagtccccacacttcgtgtgagataatccactatagtattcagctaatagaaactt 26924291  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || |   || ||||||||    
T  26924290 ctaactagcactattaggtcttgatcacaccatatcagttcagaacccttgtattatcaacctcggtggacttctacaattcttga---tcacacaagaa 26924194  T
Q  200 aggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26924193 aggttgtaactcttctatctcaaactatt 26924165  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18569226 - 18569001
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  18569226 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 18569129  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  18569128 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 18569029  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18569028 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 18569001  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24413015 - 24412790
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  24413015 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 24412918  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  24412917 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtctgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 24412818  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24412817 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 24412790  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30454202 - 30454427
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  30454202 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 30454299  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  30454300 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 30454399  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30454400 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 30454427  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30459260 - 30459485
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  30459260 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 30459357  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  30459358 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacacctgtattatcaacctcggcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 30459457  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30459458 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 30459485  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22489372 - 22489147
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  22489372 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 22489275  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||  | |||     
T  22489274 cttatgactagcactataagatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcagcagacttctacaattctttgcacactagcaa 22489175  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22489174 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 22489147  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24422464 - 24422239
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  24422464 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 24422367  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  24422366 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 24422267  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24422266 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 24422239  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30444830 - 30445055
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  30444830 ataacacaggagagttatcctgattcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 30444927  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  30444928 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccataacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 30445027  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30445028 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 30445055  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4636132 - 4635951
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||  ||| ||   ||||    
T  4636132 ataacacatgagagttatcctggttcaccaaacccggctattttcagtccccacacctcacgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 4636035  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4636034 cttctgaccagcactataagatcttgatcacaccatatcagtccgttacacctgttttatcaacctcagcaggcttctacaatt 4635951  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Original strand, 22118134 - 22118310
Alignment:
Q  31 acccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcac 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| ||   ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22118134 acccgactacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccattatagttgtc--ttgctaacagaaacttctgaataacactataaggtcttgatcac 22118231  T
Q  128 accagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttg 205  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  22118232 accagatcagtctgttacatcctgtattatcaacatcagcatgcttctacaattatttgctttcgcacaagaaacgttg 22118310  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Original strand, 31150669 - 31150813
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  31150669 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 31150768  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31150769 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 31150813  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5600731 - 5600587
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  5600731 ccggctacgtccagtccccacaccacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 5600632  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5600631 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 5600587  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5610377 - 5610233
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  5610377 ccggctacgtccagtccccacaccacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 5610278  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5610277 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 5610233  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 139
Target Start/End: Original strand, 22457720 - 22457788
Alignment:
Q  72 cactatagtattcagttgg-tagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22457720 cactatagtatacagttgggtagaaacttctaaccaacactataaggtcatgatcacaccagatcagtc 22457788  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 37514860 - 37514942
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtat 82  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37514860 ataacacatgagatttatactggttcatcaaagccggctacttctagtccccacaccttgtgtgagattatccactatagtat 37514942  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16111038 - 16111002
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagatta 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16111038 ccggctacttccagtcccgacacttcgtgtgagatta 16111002  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16110962 - 16110860
Alignment:
Q  106 aacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaaccc-ctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggtt 204  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||   ||||||||||||| ||  |||| || ||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  16110962 aacactatatgttcttgatcacaccagaccaatctgttacattctgtattatcaacatcaacaggtttatacaattatttgctttcgttcaagaaaggtt 16110863  T
Q  205 gga 207  Q
    |||    
T  16110862 gga 16110860  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Original strand, 17553829 - 17553874
Alignment:
Q  35 ggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagt 80  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17553829 ggctacgtctagtccccacactttgtgtgagattttccactatagt 17553874  T

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Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20884450 - 20884679
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggttacc-aaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20884450 ataacacaggagagttatcctggttccccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 20884549  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20884550 ctaaccaacactataaggttttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 20884649  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20884650 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 20884679  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 50516499 - 50516727
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggttacc-aaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  50516499 ataacacaggagagttatcctggttccccaaacccgactacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattccgttggtagaaattt 50516598  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  50516599 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaacccttgtattatcaacctcagcaggctgttacaattctttgctttcgctcaagaa 50516698  T
Q  200 aggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50516699 aggttggaactttcctatctcaaactatt 50516727  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11482492 - 11482272
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtta-ccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaac 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11482492 gagagttatcctggttgtccaaacccggctacttctagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaacttctaaccaac 11482393  T
Q  109 actataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaa 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11482392 actataaggtctttatcacaccatatcagtccgtaacccctgtattatcaacctcagccggcttctacaattctttgctttcgcacaagaaaggttggaa 11482293  T
Q  209 ct-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  11482292 ctcttcctatctcaaactatt 11482272  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 3242288 - 3242513
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  3242288 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 3242385  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  3242386 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 3242485  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3242486 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 3242513  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26812695 - 26812470
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  26812695 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 26812598  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  26812597 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 26812498  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26812497 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 26812470  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26822162 - 26821937
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  26822162 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 26822065  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  26822064 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 26821965  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26821964 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 26821937  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37059273 - 37059048
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  37059273 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 37059176  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  37059175 cttctgactagcactacaagatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 37059076  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37059075 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 37059048  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 54689914 - 54690139
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  54689914 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 54690011  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  54690012 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 54690111  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54690112 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 54690139  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 54699345 - 54699570
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  54699345 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 54699442  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  54699443 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 54699542  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  54699543 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 54699570  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3918253 - 3918072
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  3918253 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 3918156  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| || | || || ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3918155 cttctgactagcattacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaatt 3918072  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 15842899 - 15843080
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  15842899 ataacacaggagagttatcttggttcaccaaactcggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 15842996  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15842997 cttctgactagcactataagatcttgatcacatcagatcagtctgttacacctgtattatcaacctaagcaggcttctacaatt 15843080  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23623070 - 23622926
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  23623070 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 23622971  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23622970 atcagtctgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 23622926  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 205
Target Start/End: Original strand, 18125530 - 18125616
Alignment:
Q  120 ttgatcacaccagatcagtctgtaacccct-gtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttg 205  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18125530 ttgatcacaacagatcattctgttacaccttgtattatcaacctcagcagacttcttcaattctttactttcgcacaagaaaggttg 18125616  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Original strand, 21667754 - 21667845
Alignment:
Q  118 tcttgatcacaccagatcagtctgtaacccct-gtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaa 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || | | ||||| ||||| || | | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21667754 tcttgatcacactagatcagtctattacacattgtattgtcaacttcagtaagcttctacaattctttgttttcgcacaagaaaggttggaa 21667845  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Original strand, 21676518 - 21676609
Alignment:
Q  118 tcttgatcacaccagatcagtctgtaacccct-gtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaa 208  Q
    |||||||||||| |||||||||| | || | | ||||| ||||| || | | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21676518 tcttgatcacactagatcagtctattacacattgtattgtcaacttcagtaagcttctacaattctttgttttcgcacaagaaaggttggaa 21676609  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 45609598 - 45609551
Alignment:
Q  35 ggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtat 82  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45609598 ggctacttccagtcctcgcacttcgtatgagattatccactatggtat 45609551  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 228
Target Start/End: Original strand, 41902641 - 41902745
Alignment:
Q  123 atcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaactttcctatctcaa 222  Q
    ||||||||||||||||| || || | | |||||||||| ||  || |||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||  | || ||||||    
T  41902641 atcacaccagatcagtcagttacac-tctattatcaacttcaacatgcttatacaattctttgcttttgcacaggaaaggttggaacagttctttctcaa 41902739  T
Q  223 actatt 228  Q
    ||||||    
T  41902740 actatt 41902745  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 82
Target Start/End: Original strand, 41902572 - 41902616
Alignment:
Q  38 tacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtat 82  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  41902572 tacttccagtccccaggctccttgtgagattatccactatagtat 41902616  T

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Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35877702 - 35877473
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35877702 ataacataggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 35877603  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35877602 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagttcgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 35877503  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35877502 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 35877473  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35885191 - 35884962
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35885191 ataacataggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 35885092  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35885091 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagttcgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 35884992  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35884991 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 35884962  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36724904 - 36724675
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36724904 ataacataggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 36724805  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36724804 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagttcgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 36724705  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36724704 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 36724675  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3397108 - 3396880
Alignment:
Q  2 taacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttc 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3397108 taacacaggagagttatcatggttcaccaaacccagctacttctagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaacttc 3397009  T
Q  101 taaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  3397008 taaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccattgtattatcaacctcagcagacttctaaaattctttgctttcgcacaagaaa 3396909  T
Q  201 ggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3396908 ggttggaactcttcctatctcaaactatt 3396880  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 31710467 - 31710692
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  31710467 ataacacatgagagttatccttgttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 31710564  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||  | |||     
T  31710565 cttctgactagcactataagatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcagcagacttctacaattctttgcacactagcaa 31710664  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31710665 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 31710692  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14273391 - 14273210
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  14273391 ataacacacgagaattatcctggttcaccaaacccggctactttcagtctccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 14273294  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14273293 cttctgactagcactataagatcttaatcacaccatatcagtctgttacacctatattatcaacctcagcaggcttctacaatt 14273210  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 24022752 - 24022924
Alignment:
Q  10 gagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaacttctaacc 105  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||   ||||||||| ||     
T  24022752 gagagttatcctcgttcaccaaacccggctacttccaattcccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaacttctgact 24022849  T
Q  106 aacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24022850 agcactataagatcttgatcacaccagatcagtccgttacacctgtattatcaacctcaacaggcttctacaatt 24022924  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22632553 - 22632409
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||    
T  22632553 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgactaacactataatatgttgatcacaccag 22632454  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22632453 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 22632409  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1800644 - 1800500
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  1800644 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 1800545  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1800544 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 1800500  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1791146 - 1791006
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  1791146 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcca----tcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 1791051  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1791050 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 1791006  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16446739 - 16446667
Alignment:
Q  12 gagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatt 83  Q
    |||||||||||| | || ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446739 gagttatcctggatcactaaatccgactactttcagtccccacatttcgtgtgagattatccactatagtatt 16446667  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29911347 - 29911278
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtta-ccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagatta 69  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29911347 ataacacatgagatttatcatggttaaccaaatccagctgcttccagtcccctcacctcgtgtgagatta 29911278  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18578872 - 18578708
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||  || ||| |   |   ||||||||    
T  18578872 ataacacatgagatttatccatgttcatcaaacccgactactttcagtccccacaccttgtgtgagattattcacagtaatatcctcctaacagaaactt 18578773  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctc 163  Q
     | || |  |||||||| ||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  18578772 ttgactaggactataagttcttgataacaccagaccaatctgttacaccctgtattatcaacctc 18578708  T

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Target: chr1 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14272019 - 14272248
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14272019 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 14272118  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  14272119 ctaacaaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaggaa 14272218  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14272219 atgttggaactcttcctatctcaaactatt 14272248  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 14281888 - 14282114
Alignment:
Q  4 acacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttcta 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14281888 acacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaacttcta 14281987  T
Q  103 accaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaagg 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |    
T  14281988 acaaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaggaaatg 14282087  T
Q  203 ttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14282088 ttggaactcttcctatctcaaactatt 14282114  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 3470949 - 3471167
Alignment:
Q  12 gagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  3470949 gagttatcctggttcaccaaacccggttacttccagcccccacacttcatgtgagattatccactgtagtatacaattggtagaaacttctaaccaacat 3471048  T
Q  111 tataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaact 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3471049 tataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaaaggttagaact 3471148  T
Q  211 -ttcctatctcaaactatt 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3471149 cttcctatctcaaactatt 3471167  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 21919432 - 21919571
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919432 ataacacaggagagttatcctgattcacccaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagttttcagttggtagaaactt 21919531  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919532 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 21919571  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5378425 - 5378632
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaa 96  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||   ||||    
T  5378425 ataacacaggagaattatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 5378522  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcaca 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5378523 cttctaactagcactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgttacaccctatattataaacctcagcagacttctacaattctttgctttcgcaca 5378622  T
Q  196 agaaaggttg 205  Q
    ||||||||||    
T  5378623 agaaaggttg 5378632  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21633740 - 21633539
Alignment:
Q  26 accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatc 125  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| || | || |||||||||||| ||    
T  21633740 accaaacccggctacgtctagtccccacactttttgtgagattatccactatagtattctactagtagaaacttctgactagcattataaggtcttggtc 21633641  T
Q  126 acaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaactttcctatctcaaact 225  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21633640 acaccagatcagtccggaacaactgtattatcaacctcagcaggcttcta-aattccttgctttcacacaagaaatgttggaacttttctatctcaaact 21633542  T
Q  226 att 228  Q
    |||    
T  21633541 att 21633539  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 40999036 - 40999239
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaa 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||   ||||    
T  40999036 ataacacataagagttatcctggttcaccaaacccgacaacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacggaaa 40999133  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcaca 195  Q
    ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  40999134 cttatgactagcactataaggttttgatcacaccagatcagtttgttacaccatgtattatcaacctcaacagacttctacaattctttgctttcacaca 40999233  T
Q  196 agaaag 201  Q
    ||||||    
T  40999234 agaaag 40999239  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26906247 - 26906473
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||   |||   ||||||||    
T  26906247 ataacacacgagatttatcctggttcaccaaaccaggctacttctagtccccatacctcgtgtgagattatccattataatatcttgttaacagaaactt 26906346  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaaga 198  Q
    || || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |   || |||||||    
T  26906347 ctgactagcactataagttcttggtcacaccagatcagtctgttacactctgtattatcaacctcagcagacttttacaattcttga---tcacacaaga 26906443  T
Q  199 aaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||    
T  26906444 aaggttggaacaattctttctcaaactatt 26906473  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 15810030 - 15810213
Alignment:
Q  45 agtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||   ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15810030 agtccccacacctcgtgtgagattatccactataattatc--ttggtaacagaaacttctgagtagcactataaggtcttgatcacaccagatcagtccg 15810127  T
Q  142 taacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    | || |||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||      ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15810128 ttacacctgtattatcaacttcggcatgcttctacaattctttgaaccagcaaaagaaaggttggaa-ttttctatctcaaactatt 15810213  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30676938 - 30676766
Alignment:
Q  37 ctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatca 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |   |||||||| | |  | ||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  30676938 ctactttcagtccccacacttcgtgtgagattatccattacaatattcagctataagaaacttatgaatagcactatatgttcttgatcacacaagatca 30676839  T
Q  137 gtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaa 208  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||  ||  ||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30676838 gtctgttacactctgtattatcaatctcaacatacttatataattctttgctttcacacaagaaaggttggaa 30676766  T

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Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5385874 - 5385647
Alignment:
Q  3 aacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttct 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  5385874 aacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagctgatagaaacttct 5385775  T
Q  102 aaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5385774 aaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtatgtaaccactgtatcatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaaag 5385675  T
Q  202 gttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5385674 gttggaactcttcctatctcaaactatt 5385647  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13328279 - 13328508
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13328279 ataacacaggagagttatcttggttcaccaaacccgactacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaactt 13328378  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13328379 ctaaccaacactattaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaacccttgtattatcaacctcagcaagcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 13328478  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13328479 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 13328508  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 46305575 - 46305803
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46305575 ataacacaggagagttatcttggttcatcaaacccggctacttccagtccccacacttcgt-tgagattatccactttagtatacagttggtagaaactt 46305673  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46305674 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaa 46305773  T
Q  200 aggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46305774 aggttggaactcttcctatctcaaactatt 46305803  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23487229 - 23486998
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttcca--gtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaac 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487229 ataacacaggagagttatcctggttcaccaatcccggttacttccacagtccccacatttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaac 23487130  T
Q  98 ttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  23487129 ttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccttgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgcttttgcacaag 23487030  T
Q  198 aaaggttggaact-ttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23487029 aaagcttggaactcttcctatctcaaactatt 23486998  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24794547 - 24794772
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  24794547 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 24794644  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  24794645 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 24794744  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24794745 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 24794772  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28367654 - 28367879
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  28367654 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 28367751  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  28367752 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 28367851  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28367852 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 28367879  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28375472 - 28375697
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  28375472 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 28375569  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  28375570 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 28375669  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28375670 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 28375697  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28383294 - 28383519
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  28383294 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 28383391  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  28383392 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 28383491  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28383492 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 28383519  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28351721 - 28351946
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  28351721 ataacacaggagagttatgctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 28351818  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  28351819 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaaccttagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 28351918  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28351919 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 28351946  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38529178 - 38529403
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  38529178 ataatacaggagagttatcatagttcaccaaacccggctacttccagtgcccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 38529275  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
     |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||  | |||     
T  38529276 tttctgactagcactataagatcttgatcacaccagatgagtctgttacacttgtattatcaacctcagtaggcttctacaattctttgcacactagcaa 38529375  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38529376 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 38529403  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 205
Target Start/End: Original strand, 7784101 - 7784215
Alignment:
Q  92 agaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttc 190  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||    
T  7784101 agaaacttatgactaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgttacaccctgtattatcaacctcagcaggcttctacaattcttttccttc 7784200  T
Q  191 gcacaagaaaggttg 205  Q
      |||||||||||||    
T  7784201 ctacaagaaaggttg 7784215  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4951780 - 4951550
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  ||| |   |||||    
T  4951780 ataacacatgagagttatcttggttcaccaaactcgactacttcaagtcctcacacctcgtgtgagattatccactatatttgtc--ttgctaacagaaa 4951683  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
     |||| || | ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||  ||  | |||     
T  4951682 tttctgactagcactacaaggtattggtcacaccagatcagtctgttacacctgtattatcaacctcaacagccttctacaattctttacacactagcaa 4951583  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4951582 aagaaaggtt-gaaattttctatctcaaactatt 4951550  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Original strand, 17529895 - 17530039
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  17529895 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 17529994  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17529995 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 17530039  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32878021 - 32877877
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |   | |||||||| |  ||||||||||  | |||||||||||||    
T  32878021 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcatgctatcataaacttctgaataacactataatttgttgatcacaccag 32877922  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32877921 atcagtctgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 32877877  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54624806 - 54624662
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | ||||||| |||||    
T  54624806 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcataccag 54624707  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54624706 atcagtctgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 54624662  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48978817 - 48978677
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  48978817 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcca----tcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 48978722  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48978721 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 48978677  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48988357 - 48988217
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  48988357 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcca----tcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 48988262  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48988261 atcagtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 48988217  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19388936 - 19388864
Alignment:
Q  15 ttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcag 86  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19388936 ttatcctggttcaccaaaatcggctacttcaagtccccacacttcgtgtgagattatcgactatagtattcag 19388864  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 205
Target Start/End: Original strand, 4361634 - 4361720
Alignment:
Q  120 ttgatcacaccagatcagtctgtaacccct-gtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttg 205  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4361634 ttgatcacaacagatcattctgttacaccttgtattatcaacctcagcagacttcttcaattctttactttcgcacaagaaaggttg 4361720  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24285537 - 24285487
Alignment:
Q  36 gctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcag 86  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24285537 gctacttccactccctacacttcgtgtgagattatccactatagtattcag 24285487  T

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Target: scaffold0010 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 257142 - 256916
Alignment:
Q  3 aacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttct 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257142 aacacaggagagttatcctggttcaccaaatccggctacttccagtccccacacttcgtgtgaaattatccactatagtattcagttggtagaaacttct 257043  T
Q  102 aaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttc-tacaattttttactttcgcacaagaaa 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |  | ||| ||||||    
T  257042 aaccaacactataaagtcttgatcacaccagatcagttcgtaacctctgtattatcaacctcagcaagcttcttacaattctttgcactagcaaaagaaa 256943  T
Q  201 ggttggaactttcctatctcaaactatt 228  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  256942 ggttggaa-ttttctatctcaaactatt 256916  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 124233 - 124043
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  124233 ataacacaggagagttatcctggttcatcaaatcctgttacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtatgcagttggtagaaactt 124134  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  124133 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttc 124043  T

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Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 143238 - 143126
Alignment:
Q  117 gtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaattttttactttcgcacaagaaaggttggaact-ttcct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  143238 gtcttgatcacaccagatcagtccgtaaccactgtattatcaacctcagcaggcttctacaattctttgctttcgcacaagaaaggttggaactcttcct 143139  T
Q  216 atctcaaactatt 228  Q
    |||||||||||||    
T  143138 atctcaaactatt 143126  T

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Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 100134 - 100003
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | ||||||||||||     
T  100134 ccggctatgtccagtccccacactacgtgtgagattatccattatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccaa 100035  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctc 163  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  100034 atcagtctgttacactctgtattatcaacctc 100003  T

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Target: scaffold0053 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 2262 - 2401
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2262 ataacacaggagagttatcctggttcacccaatccggctacttctagtccccacacttcttgtgagattatccactatagtatacagttggtagaaactt 2361  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 2401  T

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Target: scaffold0334 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 12549 - 12688
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaactt 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12549 ataacataggagagttatcctggttcacccaatccggctacttccagtccctacacttcgtgtgagattatccactatagtttttagttggtagaaactt 12648  T
Q  100 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12649 ctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagattagtc 12688  T

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Target: scaffold0040 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30824 - 31049
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  30824 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 30921  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  30922 cttctgactaacactacaatattttgatcacaccagatcagtcagtaacacctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 31021  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31022 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 31049  T

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Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10228 - 10048
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggta---gaaa 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||   ||||    
T  10228 ataacacatgagagttatcttggttcaccaaacacggcta-ttccagtccccacaccccgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 10132  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatt 180  Q
    ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  10131 cttctgactagcactataaggtctagatcacaccagatcagtctgttacacctgtattatcaacctcaataggcttctacaatt 10048  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 94432 - 94657
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  94432 ataacacaggagagttatcctggttcactaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 94529  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  94530 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 94629  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  94630 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 94657  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 103873 - 104098
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  103873 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccggctaattccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 103970  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  103971 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtccgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 104070  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  104071 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 104098  T

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Target: scaffold0482 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3720 - 3495
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |   |||||    
T  3720 ataacacaggagaattattctggttcaccaaacccggctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttgtc--ttgctaacagaaa 3623  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  3622 cttctgactagcactacaatttcttgatcacaccagatcagtctgtaacctctgtattatcaacctcagcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 3523  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3522 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 3495  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 408515 - 408290
Alignment:
Q  1 ataacacatgagagttatcctggtt-accaaacccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggt---agaaa 96  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |   |||||    
T  408515 ataacacaggagagttatcctggttcaccaaacccgtctacttccagtccccacacctcgtgtgagattatccactatagttttc--ttgctaacagaaa 408418  T
Q  97 cttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatcagtctgtaacccctgtattatcaacctccgcaggcttctacaatttttt--actttcgcac 194  Q
    ||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||  ||  | |||     
T  408417 cttctgactagcactacaatatcttgatcacaccagattagtccgtaacacctgtattatcaacctcttcaggcttatacaattctttgcacactagcaa 408318  T
Q  195 aagaaaggttggaactttcctatctcaaa 223  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  408317 aagaaaggttggaa-ttttctatctcaaa 408290  T

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Target: scaffold0269 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 176
Target Start/End: Original strand, 14848 - 14992
Alignment:
Q  33 ccggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccag 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | |||||||||||||    
T  14848 ccggctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccag 14947  T
Q  133 atcagtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14948 atcagtctgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 14992  T

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Target: scaffold0223 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 27088 - 27269
Alignment:
Q  34 cggctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatcca----ctatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacac 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||  |   |||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||    
T  27088 cggctacttccagtccccatacttcgtgtgagattatccatccactatagtatccaactatcagaaacttcttaataacactatatgttcttgatcacac 27187  T
Q  130 cagatcagtctgtaaccc-ctgtattatcaacctccgcaggcttct-acaattttttactttcgcacaagaaaggttggaac 209  Q
     |||||| |  || || | |||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27188 tagatcaattcgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttattacaattctttgctttcgcacaagaaaggttggaac 27269  T

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Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24741 - 24600
Alignment:
Q  36 gctacttccagtccccacacttcgtgtgagattatccactatagtattcagttggtagaaacttctaaccaacactataaggtcttgatcacaccagatc 135  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||||||||| |  | ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  24741 gctacgtccagtccccacactacgtgtgagattatccactatagtatcctgctatcagaaacttctgaatagcactataatatgttgatcacaccagatc 24642  T
Q  136 agtctgtaac-ccctgtattatcaacctccgcaggcttctac 176  Q
    |||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24641 agtccgttacactctgtattatcaacctcagcaggcttctac 24600  T

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