View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10102_low_5 (Length: 440)

Name: NF10102_low_5
Description: NF10102
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10102_low_5
NF10102_low_5
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (17-427)||(30131065-30131472)
chr3 (156-417)||(30135759-30136026)
chr3 (156-417)||(30141888-30142155)
chr3 (156-417)||(30145310-30145577)
chr3 (18-259)||(30132956-30133194)
chr3 (18-259)||(30134352-30134590)
chr3 (18-259)||(30143903-30144141)
chr3 (183-390)||(30049489-30049702)
chr3 (176-270)||(30157310-30157404)
chr3 (222-386)||(30072372-30072542)
chr3 (183-265)||(30459716-30459795)
chr3 (199-390)||(30068773-30068970)
chr3 (181-270)||(30173256-30173345)
chr3 (181-270)||(30086107-30086196)
chr3 (215-334)||(30055983-30056108)
chr3 (275-390)||(30462971-30463086)
chr3 (221-270)||(30079714-30079763)
chr3 (223-270)||(30171975-30172022)
chr3 (17-49)||(30136136-30136168)
chr3 (17-49)||(30142265-30142297)
chr3 (17-49)||(30145687-30145719)
chr3 (354-390)||(30173130-30173166)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30131472 - 30131065
Alignment:
Q  17 cagtgatattcccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttccgtgttccttgcaatccggattatggatgtaatggcgattgtgtctgcgcgttaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30131472 cagtgatattcccaatgaagaaagttgaagcagcattttgtttccgtgttccttgcaatccggattatggatgtaatggcgattgtgtctgcgcgttaac 30131373  T
Q  117 ttggcagcatccacttattcctatatatgaatgttatgatcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtct 216  Q
    ||||||   |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30131372 ttggca---tccagttgttcctatgtatgaatgttatgatcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaaccacctaagttatgttggtct 30131276  T
Q  217 catgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaatcttcaatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30131275 catgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaatcttcaatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacg 30131176  T
Q  317 cattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnnnnnncttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtactactttaaata 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30131175 cattcaagatggcctctagcttgaaattcgaaaaagacttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtactactttaaata 30131076  T
Q  417 agtagcggtct 427  Q
    |||||||||||    
T  30131075 agtagcggtct 30131065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 156 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30136026 - 30135759
Alignment:
Q  156 tcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30136026 tcctcattcatctgcagagcttaagaagaaggtagaggaacaacctaagttatgttggtctcatactgaatgcacagaaaagggtagtgggaattattgt 30135927  T
Q  256 gctcgttttcctaat------cttcaatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacgcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnn 349  Q
    |||||||||||||||      ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30135926 gctcgttttcctaattccaatctcaaatatggcttgtgttttccctctatctctgaagcagtaaacacattcaagatggcctctagcttgaaattcgaaa 30135827  T
Q  350 nnnncttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtactactttaaataa 417  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30135826 aagacttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtacaactttaaataa 30135759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 156 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30142155 - 30141888
Alignment:
Q  156 tcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30142155 tcctcattcatctgcagagcttaagaagaaggtagaggaacaacctaagttatgttggtctcatactgaatgcacagaaaagggtagtgggaattattgt 30142056  T
Q  256 gctcgttttcctaat------cttcaatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacgcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnn 349  Q
    |||||||||||||||      ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30142055 gctcgttttcctaattccaatctcaaatatggcttgtgttttccctctatctctgaagcagtaaacacattcaagatggcctctagcttgaaattcgaaa 30141956  T
Q  350 nnnncttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtactactttaaataa 417  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30141955 aagacttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtacaactttaaataa 30141888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 156 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30145577 - 30145310
Alignment:
Q  156 tcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30145577 tcctcattcatctgcagagcttaagaagaaggtagaggaacaacctaagttatgttggtctcatactgaatgcacagaaaagggtagtgggaattattgt 30145478  T
Q  256 gctcgttttcctaat------cttcaatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacgcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnn 349  Q
    |||||||||||||||      ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  30145477 gctcgttttcctaattccaatctcaaatatggcttgtgttttccctctatctctgaagcagtaaacacattcaagatggcctctagcttgaaattcgaaa 30145378  T
Q  350 nnnncttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtactactttaaataa 417  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30145377 aagacttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatattatgcatttatgtacaactttaaataa 30145310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30133194 - 30132956
Alignment:
Q  18 agtgatattcccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttccgtgttccttgcaatccggattatggatgtaatggcgattgtgtctgcgcgttaact 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |  | | |||||| |||| |||||||||||| ||    |    
T  30133194 agtgatatttccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttcagtgttccttgcgattatgcatttagatgtactggcaattgtgtctgcgagtacgtt 30133095  T
Q  118 tggcagcatccacttattcctatatatgaatgttatgatcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctc 217  Q
    |||||   |||| || |||||  ||||  ||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30133094 tggca---tccagttgttcctcaatatatatgtggtcctcctcgttcatctgcagagcttaagaagaaggttgaggaacaacctaacttatgttggtctc 30132998  T
Q  218 atgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctc 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30132997 atgctgaatgcacataaaagggtagtggtaattattgtgctc 30132956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30134590 - 30134352
Alignment:
Q  18 agtgatattcccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttccgtgttccttgcaatccggattatggatgtaatggcgattgtgtctgcgcgttaact 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |  | | |||||| |||| |||||||||||| ||    |    
T  30134590 agtgatatttccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttcagtgttccttgcgattatgcatttagatgtactggcaattgtgtctgcgagtacgtt 30134491  T
Q  118 tggcagcatccacttattcctatatatgaatgttatgatcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctc 217  Q
    |||||   |||| || |||||  ||||  ||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30134490 tggca---tccagttgttcctcaatatatatgtggtcctcctcgttcatctgcagagcttaagaagaaggttgaggaacaacctaacttatgttggtctc 30134394  T
Q  218 atgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctc 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30134393 atgctgaatgcacataaaagggtagtggtaattattgtgctc 30134352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30144141 - 30143903
Alignment:
Q  18 agtgatattcccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttccgtgttccttgcaatccggattatggatgtaatggcgattgtgtctgcgcgttaact 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |  | | |||||| |||| |||||||||||| ||    |    
T  30144141 agtgatatttccaatgaagaaagttgaagcagctatatgtttcagtgttccttgcgattatgcatttagatgtactggcaattgtgtctgcgagtacgtt 30144042  T
Q  118 tggcagcatccacttattcctatatatgaatgttatgatcctcgttcatatgcagagcttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctc 217  Q
    |||||   |||| || |||||  ||||  ||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  30144041 tggca---tccagttgttcctcaatatatatgtggtcctcctcgttcatctgcagagcttaagaagaaggttgaggaacaacctaacttatgttggtctc 30143945  T
Q  218 atgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctc 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30143944 atgctgaatgcacataaaagggtagtggtaattattgtgctc 30143903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30049702 - 30049489
Alignment:
Q  183 gaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttc------ctaatcttcaa 276  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||      |||||||  ||    
T  30049702 gaaggttgaggaacatcctaagttatgtatgtctcatgatgaatgcacaaaaaagggtagtgggaattattgtgctcactttccaaattctaatctcaaa 30049603  T
Q  277 tatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacgcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnnnnnncttcttgaagatgtctcttcctg 376  Q
    |||||||  |||||  |||||||||||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  30049602 tatggctactgttttgcctctgtctctgaagcacaagacgcatacaagatagcctctagcttgaaattcaagaaagacttcttgaagatgtctcttcctg 30049503  T
Q  377 cttaatatcgatat 390  Q
    ||||||||||||||    
T  30049502 cttaatatcgatat 30049489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30157404 - 30157310
Alignment:
Q  176 ttaagaagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaat 270  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30157404 ttaaaaagaaggttgaggaacaacctaacttatgttggtctcatgatgaatgcacaaaaaagggtagtgggaattattgtgctcgctttcctaat 30157310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30072542 - 30072372
Alignment:
Q  222 tgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaa-tct----tc-aatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaac 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    || |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||  | ||    
T  30072542 tgaatgcaccaaaaagggtagtggaaattattgtgctcattttcctaattctgatatcaaatatggcttctgttttgcctctgtctctaaagcacaagac 30072443  T
Q  316 gcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnnnnnncttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcg 386  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30072442 gcattcaagatggcctctagctataaattcaagaatgacttcttgaagatgtctcttcccgcttaatatcg 30072372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 30459716 - 30459795
Alignment:
Q  183 gaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttc 265  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30459716 gaaggttgaggaa---cctaagttatgttggtctcatgatgaatgcacaaaaaagggtagtgggaattattgtgctcgttttc 30459795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30068970 - 30068773
Alignment:
Q  199 cctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttc------ctaatcttcaatatggcttgtgtttcc 292  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||      |||||||  || ||||||| |||||      
T  30068970 cctaagttatgtatgtctcatgatgaatgcacgaaaaagggtagtgggaattattgtgctcactttccaaattctaatctcaaacatggcttctgttttg 30068871  T
Q  293 cctctgtctctgaagcagtaaacgcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnnnnnncttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatat 390  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    ||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30068870 cctctgtctctgaagcataagacgcatacaagatggcctctagtaataaattcaagaatgacttcttgaagatgtctgttcctgcttaataccgatat 30068773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30173345 - 30173256
Alignment:
Q  181 aagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaat 270  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  30173345 aagaaggttgaggaacaacctaacttatgttggtctcatgctgaatgcataagaaagggtagtgggaattattgtgctcatcttcctaat 30173256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30086196 - 30086107
Alignment:
Q  181 aagaaggttgaggaagcacctaagttatgttggtctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaat 270  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  30086196 aagaaggttgaggaactacctaacttatgttggtctcatgctgaatgcataagaaagggtagtggaaattactgtgctcatcttcctaat 30086107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30056108 - 30055983
Alignment:
Q  215 ctcatgctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaat-ct----tcaa-tatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagc 308  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||    |||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  30056108 ctcatactgaatgcacaaagaagggtagtgggaatttttgtgctcgttttgctaattctgatatcaaatatggctggtgttttgcctctatctctgaagc 30056009  T
Q  309 agtaaacgcattcaagatggcctcta 334  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  30056008 agaaaacgcattcaagatagcctcta 30055983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 390
Target Start/End: Original strand, 30462971 - 30463086
Alignment:
Q  275 aatatggcttgtgtttcccctctgtctctgaagcagtaaacgcattcaagatggcctctagcttgaaattcgnnnnnnncttcttgaagatgtctcttcc 374  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||  || |||        |||||||||||||||||||||    
T  30462971 aatatggcttctgttttgcctctgtctctgaagcacaagacgcatacaagatggcctctacctataagttcaagaaagacttcttgaagatgtctcttcc 30463070  T
Q  375 tgcttaatatcgatat 390  Q
     ||||||||| |||||    
T  30463071 cgcttaatattgatat 30463086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30079763 - 30079714
Alignment:
Q  221 ctgaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaat 270  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30079763 ctgaatgcacaaagaaaggtagtgggaatttttgtgctcgttttcctaat 30079714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30172022 - 30171975
Alignment:
Q  223 gaatgcacaaaaaagggtagtggcaattattgtgctcgttttcctaat 270  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30172022 gaatgcacaaagaagtgtagtgggaattattgtcctcgttttcctaat 30171975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 30136168 - 30136136
Alignment:
Q  17 cagtgatattcccaatgaagaaagttgaagcag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30136168 cagtgatattcccaatgaagaaagtagaagcag 30136136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 30142297 - 30142265
Alignment:
Q  17 cagtgatattcccaatgaagaaagttgaagcag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30142297 cagtgatattcccaatgaagaaagtagaagcag 30142265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 30145719 - 30145687
Alignment:
Q  17 cagtgatattcccaatgaagaaagttgaagcag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30145719 cagtgatattcccaatgaagaaagtagaagcag 30145687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30173166 - 30173130
Alignment:
Q  354 cttcttgaagatgtctcttcctgcttaatatcgatat 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30173166 cttcttgaagatgtctgttcctgcttaatatcaatat 30173130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University