View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10104A_low_60 (Length: 386)

Name: NF10104A_low_60
Description: NF10104A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10104A_low_60
NF10104A_low_60
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (14-237)||(44241355-44241579)
chr1 (15-237)||(29001730-29001953)
chr1 (11-237)||(9869100-9869327)
chr1 (14-237)||(31072316-31072540)
chr1 (15-239)||(4599527-4599753)
chr1 (15-237)||(1174604-1174828)
chr1 (15-237)||(6238654-6238877)
chr1 (15-237)||(39053338-39053561)
chr1 (15-237)||(39059710-39059933)
chr1 (15-237)||(42091895-42092118)
chr1 (15-237)||(45015780-45016003)
chr1 (15-237)||(26621468-26621692)
chr1 (15-237)||(41305514-41305738)
chr1 (15-237)||(44916329-44916560)
chr1 (15-237)||(41297515-41297739)
chr1 (20-237)||(11913262-11913479)
chr1 (15-206)||(27240161-27240354)
chr1 (15-237)||(43686626-43686851)
chr1 (15-237)||(32797735-32797945)
chr1 (15-237)||(41299188-41299412)
chr1 (16-237)||(1115982-1116206)
chr1 (15-148)||(23764521-23764655)
chr1 (15-173)||(5445028-5445186)
chr1 (15-232)||(28413678-28413897)
chr1 (158-237)||(23762336-23762415)
chr1 (16-232)||(39806057-39806274)
chr1 (15-215)||(38672788-38672991)
chr1 (15-232)||(2824824-2825042)
chr1 (102-228)||(47646755-47646883)
chr1 (15-231)||(23251342-23251568)
chr1 (125-232)||(5357752-5357861)
chr1 (125-232)||(45620149-45620258)
chr1 (189-233)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (14-237)||(2643-2867)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (14-237)||(37026046-37026270)
chr7 (15-237)||(26601911-26602134)
chr7 (15-237)||(15914637-15914860)
chr7 (15-237)||(39432907-39433129)
chr7 (15-237)||(15949158-15949381)
chr7 (15-237)||(3924093-3924316)
chr7 (15-237)||(36875544-36875767)
chr7 (15-237)||(5049912-5050135)
chr7 (15-237)||(14287714-14287937)
chr7 (16-237)||(14298900-14299122)
chr7 (15-237)||(6795437-6795660)
chr7 (15-237)||(23612388-23612611)
chr7 (15-237)||(9642916-9643141)
chr7 (15-237)||(1948633-1948857)
chr7 (15-237)||(6020864-6021088)
chr7 (15-237)||(8185392-8185616)
chr7 (15-237)||(8192952-8193176)
chr7 (15-237)||(48353480-48353704)
chr7 (15-237)||(2446645-2446868)
chr7 (14-234)||(45433583-45433805)
chr7 (33-237)||(21642535-21642740)
chr7 (15-237)||(19089806-19090030)
chr7 (15-237)||(48347096-48347320)
chr7 (16-237)||(33850643-33850865)
chr7 (15-237)||(5056307-5056531)
chr7 (15-237)||(1378946-1379169)
chr7 (15-237)||(8142446-8142669)
chr7 (235-380)||(42422112-42422257)
chr7 (15-232)||(10831130-10831349)
chr7 (15-232)||(11024922-11025141)
chr7 (163-237)||(13774130-13774204)
chr7 (15-232)||(21901193-21901413)
chr7 (14-66)||(1942043-1942095)
chr7 (171-232)||(27954243-27954303)
chr7 (189-232)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (15-237)||(13671817-13672040)
chr6 (18-237)||(27670096-27670316)
chr6 (15-237)||(31547894-31548117)
chr6 (15-237)||(32328493-32328716)
chr6 (15-237)||(1428423-1428646)
chr6 (15-237)||(34711557-34711780)
chr6 (15-237)||(9864760-9864984)
chr6 (15-237)||(4186684-4186907)
chr6 (15-237)||(11058150-11058373)
chr6 (18-237)||(21262574-21262795)
chr6 (15-237)||(4020235-4020459)
chr6 (15-237)||(4026661-4026885)
chr6 (15-237)||(34655249-34655473)
chr6 (15-237)||(34648798-34649022)
chr6 (15-237)||(4738323-4738547)
chr6 (25-237)||(7069702-7069916)
chr6 (14-170)||(29906888-29907045)
chr6 (14-170)||(30117335-30117492)
chr6 (15-142)||(7062578-7062707)
chr6 (94-237)||(1167480-1167630)
chr6 (39-232)||(10081567-10081762)
chr6 (175-237)||(7062516-7062578)
chr6 (96-232)||(9846601-9846738)
chr6 (200-237)||(29907044-29907081)
chr6 (200-237)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (15-237)||(22359963-22360186)
chr5 (16-237)||(4973563-4973785)
chr5 (15-237)||(22313829-22314052)
chr5 (16-237)||(5876218-5876440)
chr5 (15-237)||(34357288-34357511)
chr5 (15-237)||(34359079-34359302)
chr5 (15-237)||(2957857-2958081)
chr5 (15-237)||(2966326-2966550)
chr5 (15-237)||(29980458-29980681)
chr5 (15-237)||(30041244-30041467)
chr5 (15-237)||(40958617-40958840)
chr5 (15-237)||(25894649-25894873)
chr5 (14-237)||(2438799-2439022)
chr5 (15-235)||(42150817-42151039)
chr5 (15-237)||(12505765-12505996)
chr5 (15-237)||(29414669-29414892)
chr5 (15-232)||(33794091-33794309)
chr5 (15-232)||(9843348-9843566)
chr5 (15-232)||(2156125-2156341)
chr5 (126-228)||(19853484-19853588)
chr5 (125-232)||(12918955-12919064)
chr5 (125-232)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (15-237)||(21341882-21342105)
chr2 (18-237)||(2021448-2021668)
chr2 (15-237)||(21331994-21332217)
chr2 (15-237)||(42931372-42931595)
chr2 (15-237)||(16856487-16856709)
chr2 (15-237)||(12950795-12951018)
chr2 (15-237)||(16817330-16817552)
chr2 (15-237)||(36782184-36782408)
chr2 (15-237)||(34834812-34835035)
chr2 (15-237)||(34841256-34841479)
chr2 (15-237)||(29484925-29485149)
chr2 (15-237)||(45011981-45012205)
chr2 (14-237)||(2164026-2164250)
chr2 (15-237)||(15852548-15852772)
chr2 (15-237)||(43267857-43268081)
chr2 (15-237)||(2157611-2157834)
chr2 (15-237)||(13901957-13902180)
chr2 (15-237)||(21067958-21068181)
chr2 (88-237)||(45700644-45700793)
chr2 (14-232)||(41455604-41455823)
chr2 (73-237)||(11909950-11910116)
chr2 (73-232)||(17784443-17784604)
chr2 (90-228)||(13162892-13163032)
chr2 (73-232)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (14-237)||(16405340-16405568)
chr4 (15-237)||(55462772-55462995)
chr4 (15-237)||(16838359-16838581)
chr4 (15-237)||(27590304-27590527)
chr4 (14-237)||(41372984-41373209)
chr4 (15-236)||(37368315-37368538)
chr4 (15-237)||(13594105-13594330)
chr4 (15-237)||(7780406-7780629)
chr4 (15-237)||(8103880-8104104)
chr4 (15-237)||(30238259-30238482)
chr4 (15-237)||(17456853-17457077)
chr4 (20-237)||(36754791-36755017)
chr4 (43-237)||(30211536-30211731)
chr4 (90-237)||(5660549-5660696)
chr4 (14-214)||(13003809-13004011)
chr4 (15-232)||(2947844-2948062)
chr4 (15-111)||(48914898-48914996)
chr4 (15-47)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (15-237)||(12768743-12768966)
chr8 (15-237)||(11358193-11358417)
chr8 (15-237)||(7311348-7311571)
chr8 (15-237)||(8013320-8013543)
chr8 (15-237)||(36005482-36005705)
chr8 (14-237)||(36075965-36076189)
chr8 (15-237)||(36425730-36425954)
chr8 (15-237)||(6464576-6464799)
chr8 (21-237)||(15012393-15012610)
chr8 (15-237)||(36021799-36022023)
chr8 (15-237)||(41242116-41242339)
chr8 (15-237)||(1238212-1238436)
chr8 (15-237)||(16710668-16710892)
chr8 (11-237)||(31017394-31017608)
chr8 (94-237)||(26250591-26250734)
chr8 (45-237)||(45068416-45068609)
chr8 (15-232)||(7933931-7934150)
chr8 (15-68)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (15-237)||(4311486-4311709)
chr3 (14-237)||(10941304-10941528)
chr3 (15-237)||(32746369-32746592)
chr3 (15-237)||(6036265-6036488)
chr3 (15-237)||(24179072-24179296)
chr3 (14-237)||(9570548-9570774)
chr3 (15-237)||(27501967-27502191)
chr3 (15-237)||(13014985-13015208)
chr3 (14-237)||(9577050-9577276)
chr3 (15-237)||(43995068-43995300)
chr3 (15-237)||(25893229-25893458)
chr3 (15-237)||(43931581-43931799)
chr3 (14-237)||(23068462-23068686)
chr3 (15-141)||(41353860-41353987)
chr3 (90-227)||(20651135-20651272)
chr3 (15-165)||(41354142-41354293)
chr3 (14-232)||(4590792-4591012)
chr3 (14-81)||(3577095-3577162)
chr3 (14-232)||(20952759-20952987)
chr3 (125-232)||(4644354-4644463)
chr3 (175-232)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (14-237)||(49689-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (14-237)||(15169-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (15-237)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (15-237)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (15-237)||(8881-9105)
scaffold0510 (15-237)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (96-237)||(12014-12155)
scaffold0513 (15-79)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (15-121)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (14-214)||(24268-24470)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 44241355 - 44241579
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44241355 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggcgtg 44241454  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44241455 aaacttgttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 44241554  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44241555 caacaccattcgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 29001730 - 29001953
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29001730 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaa 29001829  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29001830 aacttgttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29001929  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||    
T  29001930 aacactattcatgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 9869100 - 9869327
Alignment:
Q  11 catagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  9869100 cataaaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggt 9869199  T
Q  110 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9869200 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccct 9869299  T
Q  210 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||    
T  9869300 cgacaacatctttcgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 31072316 - 31072540
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  31072316 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatg 31072415  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31072416 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 31072515  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31072516 caacaccattcgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 4599527 - 4599753
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  4599527 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 4599626  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4599627 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4599726  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaatact 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599727 caacaccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 1174604 - 1174828
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1174604 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 1174703  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1174704 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1174803  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1174804 caacaccattcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 6238654 - 6238877
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6238654 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6238753  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238754 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6238853  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238854 aacaccattcgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39053561 - 39053338
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39053561 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39053462  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39053461 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39053362  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39053361 aacactattcgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39059933 - 39059710
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39059933 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39059834  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39059833 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39059734  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39059733 aacactattcgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 42091895 - 42092118
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  42091895 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 42091994  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42091995 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42092094  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42092095 aacaccattcgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 45015780 - 45016003
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  45015780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 45015879  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45015880 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 45015979  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015980 aacaccattcgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 26621468 - 26621692
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  26621468 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 26621567  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26621568 aaacttgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 26621667  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621668 caacaccattcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41305738 - 41305514
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41305738 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41305639  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41305638 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 41305539  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  41305538 caacaccattcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 44916329 - 44916560
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaata 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  44916329 gaccattcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaata 44916428  T
Q  106 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916429 aggcgtgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtat 44916528  T
Q  206 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44916529 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 41297515 - 41297739
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  41297515 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41297614  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41297615 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 41297714  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41297715 caacaccattcgtgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913262
Alignment:
Q  20 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  117 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  217 accattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27240354 - 27240161
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  27240354 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtg 27240255  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240254 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 43686626 - 43686851
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  43686626 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 43686725  T
Q  112 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43686726 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcg 43686825  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43686826 acaacaccattcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 32797735 - 32797945
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||    
T  32797735 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaa 32797821  T
Q  115 a-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32797822 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32797921  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32797922 aacacaattcgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41299412 - 41299188
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41299412 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41299313  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41299312 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 41299213  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  41299212 caacaccattcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1116206 - 1115982
Alignment:
Q  16 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1116206 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaa 1116108  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 214  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1116107 acttcttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 1116008  T
Q  215 ac---accattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||    
T  1116007 acactaccatttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23764655 - 23764521
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23764655 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 23764556  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtc 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23764555 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5445186 - 5445028
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5445186 gaccgttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtga 5445088  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445087 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28413897 - 28413678
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  28413897 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 28413799  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||    
T  28413798 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctca 28413699  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  28413698 acaagattattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762336
Alignment:
Q  158 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 39806057 - 39806274
Alignment:
Q  16 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  39806057 accgtttgacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgt-aa 39806154  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  39806155 aaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 39806254  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  39806255 caagattattcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38672991 - 38672788
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  38672991 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 38672893  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    |||    || | |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  38672892 aaaaacattggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 38672793  T
Q  211 aacaa 215  Q
    |||||    
T  38672792 aacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2825042 - 2824824
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  2825042 gaccattcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aa 2824944  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| ||  |||| ||| |||||||| |||     ||||||||||||||| |||||    
T  2824943 aaacgttggaattagagttccttgattatgcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttacccatattatcacgtatcgctcaa 2824844  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||| |  |||| ||||||||    
T  2824843 caagattattcatgtccaaa 2824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646883
Alignment:
Q  102 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 199  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  200 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaacatcattcatgtc 47646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 23251342 - 23251568
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||     |||  ||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  23251342 gaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaaagagtagttgtttgtttgtttgtaactaagttaactaattcgcaagaataaaagttgagagtaata 23251441  T
Q  106 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttctttgatattatcacgt 203  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  23251442 aggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgt 23251540  T
Q  204 atccctcaacaacaccattcgtgtccaa 231  Q
    ||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23251541 atcgctcaacaagattattcgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  125 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  223 cgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45620149
Alignment:
Q  125 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 222  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  |||    
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  223 cgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||    
T  45620158 cgtgtccaaa 45620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 9316137 - 9316181
Alignment:
Q  189 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 233  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9316137 ttgatattatcacatattgctcaacaacatcattcgtgtccaaac 9316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2867
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2643 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 2742  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2743 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2842  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  2843 caacaccattcgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 37026046 - 37026270
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37026046 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 37026145  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37026146 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 37026245  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37026246 caacaccattcgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 26601911 - 26602134
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26601911 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 26602010  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602011 aacttgttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 26602110  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  26602111 aacactattcgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 15914637 - 15914860
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15914637 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15914736  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15914737 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15914836  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15914837 aacactattcgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 39432907 - 39433129
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39432907 gaccgttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaa 39433006  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39433007 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 39433106  T
Q  215 acaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  39433107 acgccattcgtgtccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 15949158 - 15949381
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15949158 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15949257  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15949258 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15949357  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15949358 aacactattcgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3924316 - 3924093
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  3924316 gaccgttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 3924217  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3924216 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3924117  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3924116 aacaccattcgtgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 36875544 - 36875767
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36875544 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36875643  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36875644 aacttgttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36875743  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875744 aacaccattcgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5050135 - 5049912
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5050135 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5050036  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5050035 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5049936  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5049935 aacaccattcgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 14287714 - 14287937
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14287714 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 14287813  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14287814 atcttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 14287913  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287914 aacaccattcgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 14298900 - 14299122
Alignment:
Q  16 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14298900 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaa 14298999  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299000 acttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 14299099  T
Q  215 acaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14299100 acaccattcgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 6795437 - 6795660
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6795437 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6795536  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795537 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6795636  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795637 aacaccattcgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 23612388 - 23612611
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  23612388 gaccgttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 23612487  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23612488 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 23612587  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  23612588 aacactattcgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9643141 - 9642916
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  9643141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 9643042  T
Q  112 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9643041 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 9642942  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9642941 acaacaccattcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1948857 - 1948633
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948857 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtg 1948758  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1948757 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcga 1948658  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1948657 caacactattcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6021088 - 6020864
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6021088 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 6020989  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6020988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 6020889  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  6020888 caacactattcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8185616 - 8185392
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8185616 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8185517  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8185516 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8185417  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8185416 caacactattcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8193176 - 8192952
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8193176 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8193077  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8192977  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8192976 caacactattcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48353704 - 48353480
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  48353704 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 48353605  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353604 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48353505  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48353504 caacactattcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 2446645 - 2446868
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2446645 gaccattcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 2446744  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446745 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2446844  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2446845 aacaccattcgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 45433583 - 45433805
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| |||||||||||     
T  45433583 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgta 45433682  T
Q  113 aaa-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  45433683 aaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcg 45433782  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45433783 acaacaccattcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  33 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  132 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 231  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  232 acaata 237  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 19089806 - 19090030
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  19089806 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 19089905  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089906 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 19090005  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  19090006 caacactattcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 48347320 - 48347096
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  48347320 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatg 48347221  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48347220 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48347121  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48347120 caacactattcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33850865 - 33850643
Alignment:
Q  16 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||    
T  33850865 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaa 33850766  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33850765 acttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 33850666  T
Q  215 acaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33850665 acaccattcgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5056531 - 5056307
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  5056531 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 5056432  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5056431 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 5056332  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5056331 caacaccattcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 1378946 - 1379169
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  1378946 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 1379045  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1379046 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 1379145  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1379146 aacaccattcgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8142669 - 8142446
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  8142669 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 8142570  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8142569 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 8142470  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142469 aacaccattcgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 380
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422257
Alignment:
Q  235 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  335 ccgatgttggactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctc 380  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctc 42422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10831349 - 10831130
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  10831349 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 10831251  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  10831250 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 10831151  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  10831150 acaagattattcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11025141 - 11024922
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  11025141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 11025043  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  11025042 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 11024943  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  11024942 acaagattattcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  163 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21901413 - 21901193
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  21901413 gaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt- 21901315  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    |||   ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  21901314 aaaaacgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 21901215  T
Q  211 aacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  21901214 aacaagattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 66
Target Start/End: Original strand, 1942043 - 1942095
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942043 agaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 232
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  171 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  189 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13672040 - 13671817
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13672040 gaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtga 13671941  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13671940 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13671841  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13671840 aacactattagtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Original strand, 27670096 - 27670316
Alignment:
Q  18 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27670096 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaac 27670195  T
Q  117 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670196 ttgttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 27670295  T
Q  217 accattcgtgtccaaacaata 237  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  27670296 atcattcgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 31547894 - 31548117
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31547894 gaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 31547993  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31547994 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 31548093  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  31548094 aacactattcgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32328716 - 32328493
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32328716 gaccgttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32328617  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328616 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32328517  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32328516 aacaccattcgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1428646 - 1428423
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1428646 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 1428547  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1428546 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 1428447  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428446 aacaccattcgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34711780 - 34711557
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34711780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34711681  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34711680 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34711581  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711580 aacaccattcgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9864984 - 9864760
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9864984 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 9864885  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864884 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 9864785  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  9864784 caatactattcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 4186684 - 4186907
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||      
T  4186684 gaccgttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtag 4186783  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4186784 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgac 4186883  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4186884 aacaccattcgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11058373 - 11058150
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  11058373 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 11058274  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11058273 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 11058174  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058173 aacaccattcgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21262795 - 21262574
Alignment:
Q  18 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21262795 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa 21262696  T
Q  116 cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262695 cttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaa 21262596  T
Q  216 caccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262595 caccattcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4020459 - 4020235
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4020459 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4020360  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4020359 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4020260  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4020259 caacactattcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4026885 - 4026661
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4026885 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4026786  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026785 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4026686  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4026685 caacactattcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 34655249 - 34655473
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34655249 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34655348  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34655349 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34655448  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34655449 caacactattcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 34648798 - 34649022
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34648798 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34648897  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34648898 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34648997  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34648998 caacactattcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4738547 - 4738323
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4738547 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4738448  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4738447 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 4738348  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4738347 caacactattcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  25 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 122  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  123 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  223 cgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 29906888 - 29907045
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29906888 agaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtg 29906987  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30117492 - 30117335
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30117492 agaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtg 30117393  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117392 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 7062707 - 7062578
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7062707 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 7062608  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatca 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062607 aaacttgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167480
Alignment:
Q  94 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------t 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       |    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttat 1167531  T
Q  187 ctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  1167530 tttttatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaataata 1167480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  39 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagtt-gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  138 gatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  175 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Original strand, 9846601 - 9846738
Alignment:
Q  96 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgat 193  Q
    |||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || || |||| | ||  |||||||||| |||  | |||    
T  9846601 gagattaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatacggattctagcattttatcgat 9846699  T
Q  194 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9846700 attatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaa 9846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907081
Alignment:
Q  200 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 29907081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117299
Alignment:
Q  200 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30117299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 22359963 - 22360186
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22359963 gaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22360062  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22360063 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22360162  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22360163 aacactattcgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 4973563 - 4973785
Alignment:
Q  16 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4973563 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaa 4973662  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 214  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4973663 acttgttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgaca 4973762  T
Q  215 acaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4973763 acatcattcgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 22313829 - 22314052
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22313829 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22313928  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22313929 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22314028  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22314029 aacactattcgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Original strand, 5876218 - 5876440
Alignment:
Q  16 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5876218 accgttcaacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaa 5876317  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5876318 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgaca 5876417  T
Q  215 acaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  5876418 acactattcgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34357511 - 34357288
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34357511 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34357412  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357411 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34357312  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357311 aacaccattcgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34359302 - 34359079
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34359302 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34359203  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359202 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34359103  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359102 aacaccattcgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 2957857 - 2958081
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2957857 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2957956  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2957957 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2958056  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2958057 caacactattcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 2966326 - 2966550
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2966326 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2966425  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2966426 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2966525  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2966526 caacactattcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 29980458 - 29980681
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  29980458 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 29980557  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29980558 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29980657  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980658 aacaccattcgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30041467 - 30041244
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  30041467 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 30041368  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30041367 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 30041268  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041267 aacaccattcgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40958840 - 40958617
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  40958840 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 40958741  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40958740 cacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgac 40958641  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40958640 aacactattcgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25894873 - 25894649
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25894873 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25894774  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894773 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 25894674  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  25894673 caacactattcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 2438799 - 2439022
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2438799 agaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggcgtg 2438898  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2438899 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2438997  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2438998 caacatcatttgtgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 42150817 - 42151039
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  42150817 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 42150916  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42150917 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 42151016  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaa 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  42151017 caacactattcgtgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12505996 - 12505765
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaata 105  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12505996 gacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaata 12505897  T
Q  106 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505896 aggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtat 12505797  T
Q  206 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12505796 ccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29414892 - 29414669
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |    
T  29414892 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaa 29414793  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29414792 aacttattaggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29414693  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||    
T  29414692 aacatcattcatgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 33794091 - 33794309
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  33794091 gaccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 33794188  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||  |||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  33794189 aaaatgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctca 33794288  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||||| ||||||    
T  33794289 acaagattattcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 9843348 - 9843566
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9843348 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 9843446  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  9843447 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 9843546  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  9843547 caagattattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2156341 - 2156125
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  2156341 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaa 2156245  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  2156244 aaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctca 2156146  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  2156145 acaagattattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853484
Alignment:
Q  126 ttagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 223  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  224 gtgtc 228  Q
     ||||    
T  19853488 atgtc 19853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12919064 - 12918955
Alignment:
Q  125 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||| | ||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12919064 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacctaataaccacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactatt 12918965  T
Q  223 cgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||    
T  12918964 cgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  125 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 222  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  223 cgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21342105 - 21341882
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21342105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21342006  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342005 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21341906  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21341905 aacaccattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2021668 - 2021448
Alignment:
Q  18 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  2021668 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaac 2021569  T
Q  117 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2021568 ttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 2021469  T
Q  217 accattcgtgtccaaacaata 237  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2021468 actattcgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21332217 - 21331994
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21332217 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21332118  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21332117 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21332018  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21332017 aacaccattcatgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42931595 - 42931372
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42931595 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 42931496  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42931495 aacttgttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42931396  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  42931395 aacactattcgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16856709 - 16856487
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16856709 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16856611  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16856610 nacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16856511  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16856510 aacaccattcgtgtccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 12950795 - 12951018
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12950795 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 12950894  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12950895 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 12950994  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950995 aacaccattcgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16817552 - 16817330
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16817552 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16817454  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16817453 cacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16817354  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16817353 aacaccattcgtgtccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36782408 - 36782184
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36782408 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36782309  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36782308 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36782209  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36782208 caacaccattcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34835035 - 34834812
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34835035 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34834936  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834935 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34834836  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34834835 aacaccattcgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34841479 - 34841256
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34841479 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34841380  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841379 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34841280  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841279 aacaccattcgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 29484925 - 29485149
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  29484925 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 29485024  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29485025 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 29485124  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  29485125 caacactattcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 45011981 - 45012205
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  45011981 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 45012080  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45012081 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 45012180  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  45012181 caacactattcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 2164026 - 2164250
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||     
T  2164026 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgta 2164125  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2164126 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2164225  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2164226 caacaccattcgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 15852548 - 15852772
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15852548 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 15852647  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852648 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 15852747  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  15852748 caacactattcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 43267857 - 43268081
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  43267857 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 43267956  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43267957 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 43268056  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43268057 caacaccattcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 2157611 - 2157834
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  2157611 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 2157710  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157711 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2157810  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157811 aacaccattcgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13902180 - 13901957
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  13902180 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 13902081  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13902080 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 13901981  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13901980 aacaccattcgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21068181 - 21067958
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || |||    
T  21068181 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtg 21068082  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068081 aaactt-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 21067983  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21067982 caacaccattcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  88 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  188 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 41455604 - 41455823
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  41455604 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 41455702  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| ||||    
T  41455703 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcactca 41455802  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  41455803 acaagattattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909950
Alignment:
Q  73 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatac 170  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  171 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  || |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaataata 11909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  73 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 169  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  ||    
T  17784604 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacata 17784506  T
Q  170 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
     ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17784505 tatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 228
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163032
Alignment:
Q  90 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 187  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  188 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 228  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtc 13163032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17789096
Alignment:
Q  73 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 169  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  ||    
T  17789257 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacata 17789159  T
Q  170 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
     |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17789158 tatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 16405340 - 16405568
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16405340 agaccgttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgta 16405439  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacgtatccc 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||    
T  16405440 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtatccc 16405539  T
Q  209 tcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405540 tcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55462995 - 55462772
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55462995 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 55462896  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55462895 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 55462796  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  55462795 aacactattcgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16838581 - 16838359
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  16838581 gaccgttagacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 16838483  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16838482 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgac 16838383  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16838382 aacaccattcgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 27590304 - 27590527
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27590304 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 27590403  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27590404 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 27590503  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  27590504 aacactattcgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 41372984 - 41373209
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgt 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  41372984 agaccgttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 41373083  T
Q  112 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41373084 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 41373183  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  41373184 acaacatcattcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37368538 - 37368315
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37368538 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 37368439  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37368438 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 37368339  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaat 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  37368338 caacactattcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 13594105 - 13594330
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  13594105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 13594204  T
Q  112 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594205 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 13594304  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594305 acaacaccattcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 7780406 - 7780629
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  7780406 gaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgta 7780504  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7780505 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 7780604  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  7780605 caacatcattcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 8103880 - 8104104
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8103880 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8103979  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103980 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8104079  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8104080 caacactattcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 30238259 - 30238482
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  30238259 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 30238358  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  30238359 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgac 30238458  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  30238459 aacactattcgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 17456853 - 17457077
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||    
T  17456853 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtg 17456952  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17456953 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 17457052  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  17457053 caacactattcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754791
Alignment:
Q  20 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  111 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  211 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30211731 - 30211536
Alignment:
Q  43 gttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30211731 gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatc 30211632  T
Q  142 aagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30211631 aagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  90 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  190 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13004011 - 13003809
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  13004011 agactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 13003913  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  13003912 aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactc 13003813  T
Q  211 aaca 214  Q
    ||||    
T  13003812 aaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 2947844 - 2948062
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2947844 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 2947942  T
Q  115 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  2947943 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 2948042  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  2948043 caagattattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Original strand, 48914898 - 48914996
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914898 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 5660775 - 5660743
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaa 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5660775 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaa 5660743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 12768743 - 12768966
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768743 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtga 12768842  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12768843 aacttgttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgac 12768942  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  12768943 aagaccattcgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11358417 - 11358193
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  11358417 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 11358318  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11358317 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 11358218  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11358217 caacactattcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 7311348 - 7311571
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  7311348 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 7311447  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311448 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 7311547  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311548 aacaccattcgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8013543 - 8013320
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8013543 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 8013444  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013443 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 8013344  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013343 aacaccattcgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36005705 - 36005482
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36005705 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36005606  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36005605 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36005506  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005505 aacaccattcgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 36075965 - 36076189
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36075965 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36076064  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36076065 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36076164  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36076165 caacaccattcgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36425954 - 36425730
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  36425954 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 36425855  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36425854 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36425755  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36425754 caacactattcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6464799 - 6464576
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6464799 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6464700  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6464699 aactcgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6464600  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464599 aacaccattcgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012610
Alignment:
Q  21 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  120 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  220 attcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36022023 - 36021799
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36022023 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36021924  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36021923 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36021824  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36021823 caacaccattcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41242339 - 41242116
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  41242339 gaccgtttgacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 41242240  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41242239 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 41242140  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41242139 aacaccattcgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 1238212 - 1238436
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  ||||     
T  1238212 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgta 1238311  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238312 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1238411  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1238412 caacactattcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16710892 - 16710668
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| |     
T  16710892 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcata 16710793  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710792 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 16710693  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16710692 caacaccattcgtgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 31017394 - 31017608
Alignment:
Q  11 catagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || ||||||||||    
T  31017394 catagaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataaggcg 31017479  T
Q  111 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccc 208  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31017480 tgaaactagttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccc 31017579  T
Q  209 tcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31017580 tcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250591
Alignment:
Q  94 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  194 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  45 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  144 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7934150 - 7933931
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  7934150 gaccgttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaa 7934051  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    ||    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  7934050 aaaca-ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 7933952  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  7933951 acaagattattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Original strand, 14393733 - 14393786
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393733 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4311709 - 4311486
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4311709 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 4311610  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4311609 aacttgttaggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 4311510  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  4311509 aacactattcgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10941528 - 10941304
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10941528 agaccgtttgacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtg 10941429  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10941428 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 10941329  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10941328 caacaccattcgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 32746369 - 32746592
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32746369 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32746468  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32746469 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32746568  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32746569 aacactattcgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 6036265 - 6036488
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6036265 gaccgtttgacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 6036364  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6036365 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6036464  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  6036465 aacactattcgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 24179072 - 24179296
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24179072 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 24179171  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24179172 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 24179271  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  24179272 caacactattcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9570774 - 9570548
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9570774 agaccgttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9570675  T
Q  111 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570674 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9570575  T
Q  211 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9570574 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27501967
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27502191 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 27502092  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502091 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 27501992  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27501991 caacactattcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 13014985 - 13015208
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |    
T  13014985 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaa 13015084  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015085 aacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13015184  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13015185 aacactattcgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9577276 - 9577050
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 110  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9577276 agaccgttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9577177  T
Q  111 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9577176 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9577077  T
Q  211 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9577076 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 43995068 - 43995300
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaata 105  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  43995068 gaccattcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaata 43995167  T
Q  106 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgta 204  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43995168 aggcgtgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgta 43995267  T
Q  205 tccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43995268 tccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 25893229 - 25893458
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25893229 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25893328  T
Q  113 aaacttgttagtattagagtt-----ccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 207  Q
    ||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893329 aaacttgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 25893428  T
Q  208 ctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25893429 ctcaacaatactattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 43931581 - 43931799
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43931581 gaccgtccgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtga 43931680  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  43931681 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcg 43931773  T
Q  212 acaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  43931774 acaacaccattcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 23068462 - 23068686
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcg 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| ||||    
T  23068462 agaccgttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg 23068561  T
Q  111 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068562 -gaaacttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctc 23068659  T
Q  211 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  23068660 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 41353860 - 41353987
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41353860 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaa 41353959  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatc 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41353960 aacttgttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20651272 - 20651135
Alignment:
Q  90 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20651272 aaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctt 20651173  T
Q  190 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651172 tgatattatcacgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41354293 - 41354142
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41354293 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 41354195  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354194 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 4590792 - 4591012
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| |||||     
T  4590792 agaccgttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgt- 4590890  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    |||   ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  4590891 aaaaacgttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 4590990  T
Q  211 aacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  4590991 aacaagattattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3577162 - 3577095
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 81  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577162 agaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20952987 - 20952759
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacga-taatttgttgtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgat-aaagttgagattaat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||     |||  ||||||| ||||||  || |||||||||| ||||    
T  20952987 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagagtaattgtttgtttctttgcaactaagttaactaatttgcaagaataaaagttgagagtaat 20952888  T
Q  105 aaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacg 202  Q
    ||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    ||||||||||||    
T  20952887 aaggcgt-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgctttaccgatattatcacg 20952789  T
Q  203 tatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    |||| |||||||| |  |||| ||||||||    
T  20952788 tatcgctcaacaagattattcatgtccaaa 20952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4644463 - 4644354
Alignment:
Q  125 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  4644463 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactatt 4644364  T
Q  223 cgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||    
T  4644363 cgtgtccaaa 4644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 232
Target Start/End: Original strand, 2785865 - 2785922
Alignment:
Q  175 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 232  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785865 attctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 49689 - 49912
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  49689 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgta 49787  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49788 aaacttgttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 49887  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  49888 caacactattcgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 15169 - 15393
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15169 agacctttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggcgtg 15268  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15269 aaacttgttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 15368  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  15369 caacaccgttcgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5005
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5228 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5129  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5029  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5028 aacaccattcgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3486 - 3264
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  3486 gaccattcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 3388  T
Q  114 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3387 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3288  T
Q  214 aacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  3287 aacatcattcgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9105 - 8881
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  9105 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 9006  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9005 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 8906  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8905 caacaccattcgtgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2560
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  2784 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 2685  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2684 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2585  T
Q  213 caacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  2584 caacaccattcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12155
Alignment:
Q  96 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 195  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  196 tatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12014
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11949 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Original strand, 99913 - 100020
Alignment:
Q  15 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  99913 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtga 100012  T
Q  114 aacttgtt 121  Q
    ||||||||    
T  100013 aacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24470 - 24268
Alignment:
Q  14 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  24470 agactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 24372  T
Q  113 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 210  Q
    |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  24371 aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactc 24272  T
Q  211 aaca 214  Q
    ||||    
T  24271 aaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University