View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10105_low_10 (Length: 238)

Name: NF10105_low_10
Description: NF10105
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10105_low_10
NF10105_low_10
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (1-134)||(4232913-4233046)
chr3 (1-134)||(16008868-16009001)
chr3 (1-134)||(41101751-41101884)
chr3 (9-134)||(15084405-15084530)
chr3 (1-134)||(30043321-30043454)
chr3 (1-134)||(37219931-37220064)
chr3 (1-134)||(47912776-47912909)
chr3 (1-134)||(50548317-50548450)
chr3 (3-134)||(45170075-45170206)
chr3 (1-134)||(18410296-18410429)
chr3 (1-134)||(27321088-27321221)
chr3 (1-134)||(30440125-30440258)
chr3 (1-134)||(37785517-37785650)
chr3 (1-134)||(44843031-44843164)
chr3 (1-134)||(45053553-45053686)
chr3 (2-134)||(41697931-41698063)
chr3 (1-134)||(13213541-13213675)
chr3 (9-134)||(11121681-11121806)
chr3 (9-134)||(16463999-16464124)
chr3 (1-134)||(22428773-22428906)
chr3 (9-134)||(8851626-8851750)
chr3 (9-134)||(27126290-27126415)
chr3 (1-134)||(51722634-51722767)
chr3 (2-134)||(43338429-43338561)
chr3 (1-131)||(53778205-53778335)
chr3 (1-134)||(37181804-37181937)
chr3 (9-134)||(27325501-27325626)
chr3 (9-134)||(27331738-27331863)
chr3 (10-134)||(40423774-40423898)
chr3 (1-134)||(38235588-38235721)
chr3 (1-121)||(23019881-23020001)
chr3 (1-103)||(6175483-6175585)
chr3 (9-134)||(3892526-3892655)
chr3 (1-117)||(10827561-10827677)
chr3 (9-134)||(22604946-22605073)
chr3 (2-134)||(42826077-42826209)
chr3 (13-134)||(30363526-30363647)
chr3 (9-134)||(38696931-38697050)
chr3 (28-134)||(40906243-40906349)
chr3 (16-131)||(55411280-55411391)
chr3 (12-134)||(2218794-2218916)
chr3 (13-134)||(22732468-22732589)
chr3 (11-134)||(22605664-22605790)
chr3 (13-134)||(18762737-18762862)
chr3 (13-134)||(31312749-31312874)
chr3 (13-134)||(37181112-37181237)
chr3 (61-134)||(2218118-2218191)
chr3 (12-134)||(16464722-16464848)
chr3 (12-134)||(27126981-27127107)
chr3 (12-134)||(30042609-30042735)
chr3 (12-134)||(44842316-44842442)
chr3 (12-134)||(50610242-50610368)
chr3 (17-134)||(16009597-16009718)
chr3 (13-134)||(38236323-38236448)
chr3 (14-134)||(53777486-53777610)
chr3 (12-134)||(40906941-40907068)
chr3 (12-134)||(11122405-11122531)
chr3 (12-126)||(27331049-27331167)
chr3 (17-134)||(18411024-18411145)
chr3 (17-134)||(30362721-30362842)
chr3 (13-134)||(42826792-42826917)
chr3 (75-134)||(27238956-27239015)
chr3 (14-96)||(55412018-55412100)
chr3 (12-134)||(41697214-41697340)
chr3 (12-134)||(45052837-45052963)
chr3 (12-134)||(45170794-45170920)
chr3 (17-134)||(4232043-4232164)
chr3 (13-134)||(38697657-38697782)
chr3 (17-126)||(43339165-43339278)
chr3 (14-134)||(51721926-51722051)
chr3 (12-124)||(30439450-30439566)
chr3 (12-134)||(8850902-8851028)
chr3 (12-134)||(37219320-37219446)
chr3 (40-134)||(37786243-37786341)
chr3 (12-134)||(41102476-41102600)
chr3 (83-134)||(53845380-53845431)
chr3 (13-126)||(22731604-22731717)
chr3 (12-134)||(23020590-23020716)
chr3 (12-134)||(50547601-50547727)
chr3 (12-134)||(52746435-52746561)
chr3 (13-134)||(10826852-10826977)
chr3 (12-94)||(27324848-27324930)
chr3 (21-134)||(22428043-22428160)
chr3 (17-83)||(47912133-47912199)
chr3 (94-133)||(37786397-37786436)
chr3 (67-134)||(54409533-54409600)
chr3 (65-134)||(22977994-22978063)
chr3 (65-134)||(32001059-32001128)
chr3 (65-134)||(39131801-39131870)
chr3 (65-134)||(42877156-42877225)
chr3 (65-121)||(41889535-41889591)
chr3 (65-121)||(43359396-43359451)
chr3 (65-121)||(50938351-50938407)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (1-134)||(25583438-25583571)
chr8 (1-134)||(2082111-2082244)
chr8 (1-134)||(3704967-3705100)
chr8 (3-134)||(23347002-23347133)
chr8 (12-134)||(44256196-44256318)
chr8 (1-134)||(276835-276968)
chr8 (1-134)||(638881-639014)
chr8 (1-134)||(824687-824820)
chr8 (1-134)||(3850130-3850263)
chr8 (9-134)||(15883266-15883391)
chr8 (2-134)||(41545075-41545207)
chr8 (9-134)||(4622588-4622713)
chr8 (1-134)||(6093427-6093560)
chr8 (1-134)||(16096012-16096145)
chr8 (1-126)||(17948330-17948455)
chr8 (9-134)||(27912497-27912622)
chr8 (9-134)||(27958916-27959041)
chr8 (1-134)||(13141142-13141275)
chr8 (1-134)||(18955347-18955480)
chr8 (1-134)||(39858113-39858246)
chr8 (9-134)||(43695012-43695137)
chr8 (9-131)||(28085745-28085867)
chr8 (1-134)||(42735697-42735830)
chr8 (9-134)||(30556534-30556658)
chr8 (9-134)||(42645419-42645544)
chr8 (9-131)||(30105846-30105968)
chr8 (18-134)||(38576901-38577016)
chr8 (13-134)||(5586963-5587084)
chr8 (9-134)||(45409061-45409184)
chr8 (9-111)||(40304220-40304325)
chr8 (13-134)||(45408344-45408469)
chr8 (58-134)||(18089325-18089401)
chr8 (13-134)||(42646152-42646277)
chr8 (13-134)||(43694279-43694404)
chr8 (12-134)||(277560-277686)
chr8 (12-134)||(638163-638289)
chr8 (12-134)||(823969-824095)
chr8 (12-134)||(23346282-23346408)
chr8 (12-134)||(26949965-26950091)
chr8 (12-134)||(38060360-38060486)
chr8 (13-134)||(6095630-6095755)
chr8 (17-134)||(13140427-13140548)
chr8 (13-134)||(30555801-30555926)
chr8 (13-134)||(39858815-39858940)
chr8 (13-134)||(42736411-42736536)
chr8 (18-134)||(41545669-41545789)
chr8 (12-127)||(18956277-18956396)
chr8 (12-134)||(15882553-15882679)
chr8 (12-134)||(27913220-27913346)
chr8 (12-134)||(27959639-27959765)
chr8 (12-134)||(44256918-44257044)
chr8 (17-134)||(40303483-40303604)
chr8 (13-134)||(40617323-40617448)
chr8 (14-134)||(18088650-18088774)
chr8 (14-134)||(30111563-30111687)
chr8 (13-134)||(3850853-3850978)
chr8 (13-126)||(36192256-36192373)
chr8 (13-126)||(5587835-5587948)
chr8 (56-134)||(16096540-16096622)
chr8 (65-121)||(15825750-15825806)
chr8 (66-134)||(26951129-26951197)
chr8 (65-134)||(19143036-19143105)
chr8 (76-121)||(23625979-23626024)
chr8 (65-134)||(39068998-39069067)
chr8 (97-134)||(40304349-40304386)
chr8 (66-134)||(26920411-26920479)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (1-134)||(20120085-20120218)
chr7 (1-134)||(44459093-44459226)
chr7 (1-134)||(47909177-47909310)
chr7 (1-134)||(4925000-4925133)
chr7 (9-134)||(16277368-16277493)
chr7 (1-134)||(41858339-41858472)
chr7 (9-134)||(725331-725456)
chr7 (1-134)||(3415945-3416078)
chr7 (1-134)||(9663391-9663524)
chr7 (9-134)||(28589395-28589520)
chr7 (1-134)||(40015477-40015610)
chr7 (1-134)||(46555285-46555418)
chr7 (1-134)||(48951968-48952101)
chr7 (1-134)||(41336361-41336495)
chr7 (1-134)||(18994757-18994890)
chr7 (9-134)||(21815461-21815586)
chr7 (9-134)||(33246437-33246562)
chr7 (9-134)||(48683320-48683445)
chr7 (9-134)||(17968116-17968240)
chr7 (1-134)||(44882813-44882946)
chr7 (1-134)||(46000770-46000903)
chr7 (1-134)||(48607421-48607554)
chr7 (9-134)||(23594367-23594493)
chr7 (9-134)||(30759891-30760019)
chr7 (9-134)||(46936082-46936208)
chr7 (9-131)||(21729766-21729887)
chr7 (9-134)||(47503681-47503809)
chr7 (35-134)||(41289428-41289527)
chr7 (17-134)||(16274346-16274467)
chr7 (13-134)||(44521169-44521294)
chr7 (13-134)||(46935360-46935485)
chr7 (14-134)||(21736276-21736400)
chr7 (14-134)||(41289231-41289355)
chr7 (19-134)||(41857727-41857846)
chr7 (12-134)||(3415229-3415353)
chr7 (12-134)||(20120807-20120933)
chr7 (12-134)||(21816184-21816310)
chr7 (12-134)||(41337086-41337212)
chr7 (13-134)||(5373616-5373741)
chr7 (17-134)||(40014761-40014882)
chr7 (12-128)||(724613-724733)
chr7 (12-128)||(48684044-48684164)
chr7 (12-134)||(28588688-28588814)
chr7 (17-134)||(17967385-17967506)
chr7 (13-134)||(48606696-48606821)
chr7 (12-134)||(33245713-33245839)
chr7 (12-134)||(48951356-48951482)
chr7 (13-134)||(47504414-47504539)
chr7 (13-128)||(8392548-8392667)
chr7 (13-94)||(30759204-30759285)
chr7 (13-134)||(9662670-9662795)
chr7 (17-134)||(46554570-46554692)
chr7 (84-134)||(5374365-5374415)
chr7 (12-134)||(44883526-44883652)
chr7 (58-134)||(44458377-44458457)
chr7 (11-50)||(44522734-44522773)
chr7 (20-126)||(47908089-47908198)
chr7 (65-134)||(596220-596289)
chr7 (93-134)||(4658175-4658216)
chr7 (65-121)||(1602240-1602295)
chr7 (13-84)||(23593697-23593762)
chr7 (9-52)||(8393280-8393323)
chr7 (65-134)||(19064084-19064153)
chr7 (93-134)||(30758334-30758375)
chr7 (65-134)||(37708205-37708274)
chr7 (65-134)||(38224504-38224573)
chr7 (65-134)||(41408008-41408077)
chr7 (65-134)||(43543154-43543223)
chr7 (65-134)||(43545010-43545079)
chr7 (65-134)||(47254591-47254660)
chr7 (65-121)||(33982429-33982485)
chr7 (65-121)||(38229619-38229675)
chr7 (65-121)||(46160609-46160665)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-134)||(11837479-11837612)
chr6 (1-134)||(4589713-4589846)
chr6 (1-134)||(16918447-16918580)
chr6 (1-134)||(17550719-17550852)
chr6 (1-134)||(955477-955610)
chr6 (2-131)||(11154512-11154641)
chr6 (1-134)||(27782519-27782652)
chr6 (1-134)||(14104042-14104175)
chr6 (1-134)||(28578659-28578792)
chr6 (3-134)||(24083174-24083305)
chr6 (9-134)||(27438449-27438574)
chr6 (1-134)||(25109592-25109724)
chr6 (1-134)||(23580329-23580461)
chr6 (9-134)||(21861165-21861293)
chr6 (13-134)||(28579368-28579493)
chr6 (20-134)||(14104763-14104881)
chr6 (13-134)||(11153798-11153923)
chr6 (13-133)||(24083887-24084011)
chr6 (12-134)||(27783240-27783366)
chr6 (13-134)||(954752-954877)
chr6 (13-134)||(1090505-1090630)
chr6 (12-126)||(16918936-16919054)
chr6 (12-134)||(23573838-23573964)
chr6 (13-134)||(15288230-15288355)
chr6 (12-134)||(4589015-4589141)
chr6 (20-134)||(11836766-11836884)
chr6 (14-134)||(5687432-5687560)
chr6 (12-134)||(27440673-27440803)
chr6 (13-71)||(25119043-25119101)
chr6 (14-134)||(21860509-21860630)
chr6 (62-134)||(25119520-25119596)
chr6 (65-134)||(5090198-5090267)
chr6 (65-134)||(32562525-32562594)
chr6 (65-121)||(24159167-24159223)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (1-134)||(3035665-3035798)
chr4 (1-134)||(4653035-4653168)
chr4 (1-134)||(16664723-16664856)
chr4 (1-134)||(20786886-20787019)
chr4 (1-134)||(23419156-23419289)
chr4 (1-134)||(54919461-54919594)
chr4 (1-133)||(17361205-17361337)
chr4 (1-134)||(8939479-8939612)
chr4 (1-134)||(13534415-13534548)
chr4 (9-134)||(30827362-30827487)
chr4 (1-134)||(46717772-46717905)
chr4 (3-131)||(49873801-49873929)
chr4 (3-134)||(35824600-35824731)
chr4 (9-134)||(52447452-52447577)
chr4 (9-134)||(20353934-20354059)
chr4 (9-134)||(31292461-31292586)
chr4 (20-134)||(31309706-31309820)
chr4 (1-131)||(49970075-49970205)
chr4 (1-134)||(23933406-23933539)
chr4 (9-134)||(34073096-34073220)
chr4 (1-134)||(27962295-27962426)
chr4 (1-98)||(7487383-7487480)
chr4 (9-119)||(50496043-50496158)
chr4 (1-78)||(35045118-35045195)
chr4 (61-134)||(41041352-41041425)
chr4 (12-134)||(54920185-54920311)
chr4 (13-134)||(35825332-35825457)
chr4 (13-134)||(46718505-46718630)
chr4 (12-134)||(4653758-4653884)
chr4 (12-134)||(20786227-20786353)
chr4 (12-134)||(52448175-52448301)
chr4 (12-134)||(20342475-20342601)
chr4 (12-134)||(20353200-20353326)
chr4 (12-134)||(27958617-27958743)
chr4 (17-134)||(17361893-17362014)
chr4 (13-134)||(23932681-23932806)
chr4 (13-134)||(31291820-31291945)
chr4 (13-126)||(34073801-34073918)
chr4 (13-134)||(49874532-49874657)
chr4 (12-128)||(23418444-23418564)
chr4 (13-128)||(35045757-35045876)
chr4 (12-134)||(3034951-3035075)
chr4 (12-134)||(16665446-16665572)
chr4 (12-134)||(41040680-41040806)
chr4 (12-134)||(7488052-7488178)
chr4 (14-134)||(50495393-50495514)
chr4 (13-134)||(13533694-13533819)
chr4 (83-134)||(7487316-7487367)
chr4 (35-134)||(9368025-9368128)
chr4 (56-134)||(55450525-55450607)
chr4 (1-52)||(55450972-55451023)
chr4 (64-134)||(47650676-47650746)
chr4 (40-134)||(30824815-30824913)
chr4 (65-134)||(43590450-43590519)
chr4 (65-134)||(43594122-43594191)
chr4 (76-134)||(38623463-38623521)
chr4 (65-134)||(8081040-8081109)
chr4 (65-134)||(31624512-31624581)
chr4 (65-121)||(31623346-31623402)
chr4 (65-121)||(49645954-49646010)
chr4 (65-121)||(50792530-50792586)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (1-134)||(33704653-33704786)
chr1 (1-134)||(14488645-14488778)
chr1 (1-134)||(24781117-24781250)
chr1 (1-130)||(36307899-36308028)
chr1 (1-134)||(7152977-7153110)
chr1 (9-134)||(10772786-10772911)
chr1 (1-134)||(29521748-29521881)
chr1 (9-134)||(48127827-48127952)
chr1 (1-134)||(31030143-31030276)
chr1 (9-134)||(44512251-44512376)
chr1 (9-134)||(29649523-29649648)
chr1 (3-134)||(36730719-36730850)
chr1 (9-134)||(25655903-25656028)
chr1 (9-134)||(5326771-5326897)
chr1 (1-130)||(33006283-33006412)
chr1 (9-134)||(35954470-35954595)
chr1 (9-119)||(12768308-12768418)
chr1 (17-134)||(30302860-30302977)
chr1 (2-134)||(46118290-46118422)
chr1 (1-134)||(52404654-52404784)
chr1 (35-134)||(51086827-51086926)
chr1 (58-134)||(30838589-30838665)
chr1 (28-134)||(7556315-7556419)
chr1 (13-134)||(30302114-30302239)
chr1 (3-134)||(29648666-29648801)
chr1 (12-134)||(10773511-10773637)
chr1 (12-134)||(36308622-36308748)
chr1 (13-134)||(25656626-25656751)
chr1 (17-134)||(33705385-33705506)
chr1 (12-126)||(7153700-7153818)
chr1 (13-134)||(46119024-46119149)
chr1 (14-134)||(46463910-46464038)
chr1 (12-134)||(44511532-44511658)
chr1 (20-134)||(52405378-52405496)
chr1 (20-134)||(52406811-52406929)
chr1 (13-134)||(35955205-35955330)
chr1 (13-134)||(36731452-36731576)
chr1 (13-134)||(51087506-51087631)
chr1 (15-134)||(33005547-33005670)
chr1 (13-134)||(29521100-29521225)
chr1 (12-126)||(14487933-14488051)
chr1 (12-126)||(14536522-14536640)
chr1 (14-134)||(9135171-9135292)
chr1 (14-134)||(12768954-12769075)
chr1 (58-134)||(7556852-7556932)
chr1 (72-121)||(23259014-23259063)
chr1 (98-134)||(48128600-48128636)
chr1 (64-134)||(44299234-44299304)
chr1 (65-134)||(23260885-23260954)
chr1 (65-134)||(44300058-44300127)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-134)||(745433-745566)
chr5 (1-134)||(9591855-9591988)
chr5 (1-134)||(12499455-12499588)
chr5 (1-134)||(19665008-19665141)
chr5 (1-134)||(20546015-20546148)
chr5 (1-134)||(42612080-42612213)
chr5 (1-134)||(30130781-30130914)
chr5 (1-134)||(37270483-37270616)
chr5 (9-134)||(7180925-7181050)
chr5 (9-134)||(9987189-9987314)
chr5 (9-134)||(27019966-27020091)
chr5 (13-134)||(27550834-27550955)
chr5 (1-134)||(824673-824806)
chr5 (2-134)||(39588504-39588637)
chr5 (3-133)||(15420435-15420569)
chr5 (1-134)||(13305289-13305422)
chr5 (13-134)||(11984696-11984817)
chr5 (28-134)||(11076973-11077079)
chr5 (9-134)||(31551996-31552126)
chr5 (12-134)||(744714-744840)
chr5 (13-134)||(9986458-9986583)
chr5 (13-134)||(27551562-27551687)
chr5 (12-134)||(9592578-9592704)
chr5 (12-134)||(15421121-15421247)
chr5 (12-134)||(20545319-20545445)
chr5 (13-126)||(37271196-37271313)
chr5 (12-134)||(12500178-12500304)
chr5 (12-134)||(27019242-27019368)
chr5 (12-134)||(39589210-39589336)
chr5 (17-126)||(30130073-30130186)
chr5 (12-128)||(19665731-19665851)
chr5 (12-126)||(823960-824078)
chr5 (12-134)||(37939610-37939736)
chr5 (13-134)||(11985427-11985552)
chr5 (13-134)||(13304567-13304692)
chr5 (12-134)||(42611374-42611500)
chr5 (20-126)||(31551275-31551385)
chr5 (55-134)||(7180780-7180863)
chr5 (65-134)||(8520413-8520482)
chr5 (102-134)||(19503901-19503933)
chr5 (64-134)||(6719643-6719713)
chr5 (65-134)||(5100395-5100464)
chr5 (1-42)||(34654209-34654250)
chr5 (65-121)||(29390808-29390864)
chr5 (65-121)||(34858449-34858505)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-132)||(37725343-37725474)
chr2 (1-131)||(4738080-4738210)
chr2 (9-134)||(3906741-3906866)
chr2 (1-131)||(15152635-15152765)
chr2 (1-134)||(25223533-25223666)
chr2 (9-134)||(2292150-2292275)
chr2 (17-134)||(14005921-14006038)
chr2 (1-134)||(15399042-15399175)
chr2 (9-134)||(3754732-3754860)
chr2 (1-134)||(42080640-42080776)
chr2 (13-134)||(6644719-6644840)
chr2 (11-134)||(27551448-27551571)
chr2 (9-134)||(3851575-3851703)
chr2 (1-134)||(38282102-38282226)
chr2 (1-116)||(77444-77559)
chr2 (20-134)||(28391662-28391776)
chr2 (9-119)||(39774952-39775060)
chr2 (13-134)||(2291418-2291543)
chr2 (12-134)||(76757-76881)
chr2 (12-134)||(37724630-37724756)
chr2 (13-134)||(15399779-15399904)
chr2 (13-134)||(27550733-27550858)
chr2 (12-134)||(38281386-38281512)
chr2 (13-134)||(1054261-1054386)
chr2 (13-126)||(15153354-15153471)
chr2 (17-134)||(28391072-28391193)
chr2 (1-79)||(39967000-39967078)
chr2 (14-134)||(39774306-39774427)
chr2 (14-134)||(3850919-3851040)
chr2 (12-134)||(3906029-3906155)
chr2 (12-134)||(39966284-39966410)
chr2 (17-134)||(40494619-40494736)
chr2 (13-134)||(39068123-39068248)
chr2 (13-88)||(4737406-4737481)
chr2 (9-128)||(40495272-40495391)
chr2 (13-83)||(6645449-6645519)
chr2 (65-121)||(33178890-33178946)
chr2 (14-117)||(42080005-42080109)
chr2 (65-120)||(36602846-36602901)
chr2 (54-134)||(38551990-38552069)
chr2 (65-134)||(6319453-6319522)
chr2 (93-134)||(6645951-6645992)
chr2 (65-134)||(18246607-18246676)
chr2 (65-134)||(18248495-18248564)
chr2 (65-134)||(33853101-33853170)
chr2 (65-134)||(36600853-36600922)
chr2 (65-121)||(14454476-14454532)
chr2 (65-121)||(38932352-38932408)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (9-134)||(5619-5744)
scaffold0208 (13-134)||(4937-5062)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (9-134)||(48788-48913)
scaffold0003 (12-134)||(46558-46688)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (1-134)||(20956-21088)
scaffold0115 (12-134)||(22764-22890)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (9-134)||(5916-6041)
scaffold0259 (13-134)||(5094-5219)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (9-134)||(56369-56497)
scaffold0060 (14-134)||(57037-57158)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (20-134)||(18423-18541)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (65-134)||(902-971)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 4232913 - 4233046
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232913 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 4233012  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233013 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 4233046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16009001 - 16008868
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16009001 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 16008902  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16008901 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 16008868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41101884 - 41101751
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41101884 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 41101785  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41101784 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 41101751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 15084405 - 15084530
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15084405 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 15084504  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15084505 ttaattaagattgaacaccttaatat 15084530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30043321 - 30043454
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30043321 ggttctggaatggaagaaatttcatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 30043420  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30043421 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 30043454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 37219931 - 37220064
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37219931 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatacagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 37220030  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37220031 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 37220064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 47912776 - 47912909
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47912776 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggaaatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 47912875  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47912876 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 47912909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 50548317 - 50548450
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50548317 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 50548416  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50548417 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 50548450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45170206 - 45170075
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170206 ttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 45170107  T
Q  103 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170106 tataaattaattaagattgaacaccttaatat 45170075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18410429 - 18410296
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18410429 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgt 18410330  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18410329 agtgtaaattaattaagattgaactccttaatat 18410296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27321221 - 27321088
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27321221 ggttctggaatgaaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 27321122  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27321121 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 27321088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30440125 - 30440258
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  30440125 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttga 30440224  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30440225 agtgtaaattaattaagattgaacgccttaatat 30440258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37785650 - 37785517
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37785650 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttacaagtcttgt 37785551  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37785550 agtgtaaattaattaagattgaacactttaatat 37785517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 44843031 - 44843164
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44843031 ggttctggaattgaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 44843130  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44843131 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 44843164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 45053553 - 45053686
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45053553 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 45053652  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45053653 agtgtaaattaattaggattgaataccttaatat 45053686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 41697931 - 41698063
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgta 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41697931 gttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaacgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgta 41698030  T
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41698031 gtgtaaattaatcaagattgaacaccttaatat 41698063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13213675 - 13213541
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaa-tgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttg 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13213675 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaaatgatgaatttaaggatatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataaatcttg 13213576  T
Q  100 tagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213575 tagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 13213541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11121806 - 11121681
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11121806 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtattgtagtgtaaa 11121707  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11121706 ttaattaagattgaacaccttaatat 11121681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16464124 - 16463999
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16464124 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttataagtcttgtagtgtaaa 16464025  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16464024 ttaattaagattgaacaccttaatat 16463999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22428773 - 22428906
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22428773 ggttctgaaatgtaagaaattttatgaatgcaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttacaagtcttgt 22428872  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428873 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 22428906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 8851626 - 8851750
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8851626 aatggaagaaattt-atgaatgtaaatgatgaatttaaggagatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgtagtgtaaa 8851724  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8851725 ttaattaagattgaacaccttaatat 8851750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27126415 - 27126290
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27126415 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtttaaa 27126316  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27126315 ttaattaagattgaacaccttaatat 27126290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 51722634 - 51722767
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51722634 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgaaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 51722733  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51722734 tgtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 51722767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43338561 - 43338429
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgta 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  43338561 gttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttatgaacatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtg 43338462  T
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43338461 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 43338429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 53778205 - 53778335
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||    
T  53778205 ggttttgaaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttataactcatgt 53778304  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53778305 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 53778335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 37181804 - 37181937
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37181804 ggttttgaaatggacgaaattttatgaatgtaagtgatgaattcaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 37181903  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37181904 agtgtaaattaattaagattaaacaccttaatat 37181937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 27325501 - 27325626
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  27325501 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgagagaaatttgatttaaaatttgattttttataagtgttgtagtgtaaa 27325600  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27325601 ttaattaagattgaacaccttaatat 27325626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 27331738 - 27331863
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  27331738 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgagagaaatttgatttaaaatttgattttttataagtgttgtagtgtaaa 27331837  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27331838 ttaattaagattgaacaccttaatat 27331863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40423898 - 40423774
Alignment:
Q  10 atggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40423898 atggaagaaattttatgaatgtaagtgaggaatttaaggacatccagatgaaagaaactcgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtggtgtaaat 40423799  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40423798 taattaagattgaacaccttaatat 40423774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38235721 - 38235588
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38235721 ggttctggaatggaagaacttttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaatttcatttgttataagtcttgt 38235622  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38235621 ggtgtaaattagttaagattgaacatcttaatat 38235588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23020001 - 23019881
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23020001 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaagtacatccatattaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 23019902  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23019901 agtgtaaattaattaagattg 23019881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 6175483 - 6175585
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6175483 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 6175582  T
Q  101 agt 103  Q
    |||    
T  6175583 agt 6175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3892526 - 3892655
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaa----tttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3892526 aatgaaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggatatccagatgaaaaaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtg 3892625  T
Q  105 taaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3892626 taaattaattaagattgaacaccttaatat 3892655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 10827561 - 10827677
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10827561 ggttctggaatagaagaaattttatgaatgtatgtcatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattataagtcttgt 10827660  T
Q  101 agtgtaaattaattaag 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  10827661 agtgtaaattaattaag 10827677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22605073 - 22604946
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgt--tataagtcttgtagtgta 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22605073 aatggaagaaattttatgaaagtaaatgatgaatttaaggacattcggatgaaagaaatttgatgtaaaatttcatttgttatataagtcttgtagtgta 22604974  T
Q  107 aattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22604973 aattaattaagattgaacacctaaatat 22604946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42826209 - 42826077
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgta 101  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42826209 gttctggaatggaagatattttatgaatgtaagtgatgaatttaaagacattcagatgaaagaaatttaatataaaattttatttattatgagtcttgta 42826110  T
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42826109 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 42826077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 30363526 - 30363647
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30363526 gaagacattttatgaatgtaattgatgaatctaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttatagtgcaaattaa 30363625  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  30363626 ttaagattgaacatcttaatat 30363647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38697050 - 38696931
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      | ||| |||    
T  38697050 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataa------tggtgaaaa 38696957  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38696956 ttaattaagattgaacaccttaatat 38696931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40906349 - 40906243
Alignment:
Q  28 atgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacc 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40906349 atgtaaatgatgaatttaaggaaatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttatagtgtaaattaactaaggttgaacacc 40906250  T
Q  128 ttaatat 134  Q
    |||||||    
T  40906249 ttaatat 40906243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 55411391 - 55411280
Alignment:
Q  16 gaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaatta 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  55411391 gaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacat----atgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcatgcagtgtaaattaatta 55411296  T
Q  116 agattgaacaccttaa 131  Q
    ||| ||||||||||||    
T  55411295 agactgaacaccttaa 55411280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 2218794 - 2218916
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaatta 111  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2218794 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcctgtagtgtaaatta 2218893  T
Q  112 attaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  2218894 attaagattgaacacctaaatat 2218916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 22732468 - 22732589
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||||||    
T  22732468 gaagaaattttatgaatgtaaccgatggatttaaggacatctaaatgaaagaaaattgatgtgaaattttaattgttataagccctatagtgtaaattaa 22732567  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  22732568 ttaagattgaacacctaaatat 22732589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 22605664 - 22605790
Alignment:
Q  11 tggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata---agtcttgtagtgtaa 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  22605664 tggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataaccagtcctgtagtgtaa 22605763  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22605764 attaattaagattgaacacctaaatat 22605790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 18762737 - 18762862
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||    |||||||||||||||    
T  18762737 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgctctaagccggtcttgtagtgtaaa 18762836  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  18762837 ttaattaagattgaacacctaaatat 18762862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31312874 - 31312749
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  31312874 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 31312775  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  31312774 ttaattaagattgaacacctaaatat 31312749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37181237 - 37181112
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  37181237 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 37181138  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  37181137 ttaattaagattgaacacctaaatat 37181112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2218191 - 2218118
Alignment:
Q  61 aagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2218191 aagaaattttatgtaaaattgtatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 2218118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 16464722 - 16464848
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  16464722 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 16464821  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16464822 attaattaagattgaacacctaaatat 16464848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 27126981 - 27127107
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  27126981 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 27127080  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27127081 attaattaagattgaacacctaaatat 27127107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30042735 - 30042609
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  30042735 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 30042636  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30042635 attaattaagattgaacacctaaatat 30042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44842442 - 44842316
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  44842442 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcctgtagtgtaa 44842343  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44842342 attaattaagattgaacacctaaatat 44842316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 50610242 - 50610368
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  50610242 ggaataaattttatgaatataattgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 50610341  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50610342 attaattaagattgaacacctaaatat 50610368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 16009597 - 16009718
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  16009597 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaa 16009696  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  16009697 ttaagattgaacatctaaatat 16009718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 38236323 - 38236448
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  38236323 gaagaaattttatgaatataacagataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcatgtagtgtaaa 38236422  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  38236423 ttaattaagattgaacacctaaatat 38236448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 53777610 - 53777486
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||| |||||    
T  53777610 aagaaattttatgaatgtaaatgataaacttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtctaaat 53777511  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||| |||| |||||    
T  53777510 taattaagattgaatacctaaatat 53777486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 40906941 - 40907068
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaatttta-tttgttataagtct----tgtagtgta 106  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||     |||||||||    
T  40906941 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaatttgttctaagtcagtcatgtagtgta 40907040  T
Q  107 aattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40907041 aattaattaagattgaacacctaaatat 40907068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 11122405 - 11122531
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  11122405 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaa 11122504  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11122505 attaattaagattgaacacctaaatat 11122531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27331167 - 27331049
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||||||||||||||    
T  27331167 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtagtgtaa 27331068  T
Q  108 attaattaagattgaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27331067 attaattaagattgaacac 27331049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 18411024 - 18411145
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||| ||||||||    
T  18411024 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtttaaattaa 18411123  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  18411124 ttaagattgaacacctaaatat 18411145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30362842 - 30362721
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||| ||||||||| |||||    
T  30362842 aaatgttatgaatgtaactgataaatgtaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtagattaa 30362743  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  30362742 ttaagattgaacacctaaatat 30362721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 42826792 - 42826917
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  42826792 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcatatgaaggaaatttaatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaa 42826891  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  42826892 ttaattaagattgaacacctaaatat 42826917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 134
Target Start/End: Original strand, 27238956 - 27239015
Alignment:
Q  75 aaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27238956 aaaattttatttattataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 27239015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Original strand, 55412018 - 55412100
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  55412018 aagaaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtc 55412100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41697340 - 41697214
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  41697340 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaatacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 41697241  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41697240 attaattaagattgaacacctaaatat 41697214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45052963 - 45052837
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  45052963 ggaataaattttatgaatataacagataaatttaaggacattcagaagaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaa 45052864  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45052863 attaattaagattgaacacctaaatat 45052837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 45170794 - 45170920
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  45170794 ggaataaattttatgaatataactaataaatttaaggaaattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 45170893  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45170894 attaattaagattgaacacctaaatat 45170920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4232164 - 4232043
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||    || | |||||||||||||    
T  4232164 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaacttttaattgttctaagccagtcatctagtgtaaattaa 4232065  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  4232064 ttaagattgaacacctaaatat 4232043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 38697657 - 38697782
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  38697657 gaagaaattttatgaatatgactgataaatttaaatacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaa 38697756  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  38697757 ttaattaagattgaacacctgaatat 38697782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 43339165 - 43339278
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  43339165 aaattttatgaatataactgataaatttaaggatattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaaccagtcctgtagtgtaaattaa 43339264  T
Q  113 ttaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||    
T  43339265 ttaagattgaacac 43339278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51722051 - 51721926
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||| ||    
T  51722051 aagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttaatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtagat 51721952  T
Q  110 taattaagattg-aacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||    
T  51721951 taattaagattgtaacacctaaatat 51721926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30439566 - 30439450
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  30439566 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 30439467  T
Q  108 attaattaagattgaac 124  Q
    |||||||||||||||||    
T  30439466 attaattaagattgaac 30439450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8851028 - 8850902
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| || |||| | | |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||    
T  8851028 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaattttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaa 8850929  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8850928 attaattaagattgaacacctaaatat 8850902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37219446 - 37219320
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||| ||    
T  37219446 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaatgacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtggaa 37219347  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37219346 attaattaagactgaacacctaaatat 37219320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 134
Target Start/End: Original strand, 37786243 - 37786341
Alignment:
Q  40 aatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37786243 aatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcggtcttgtagtgcaaattaattaagattgaacacctaaatat 37786341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 41102476 - 41102600
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgt--tataagtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||  | | |||| ||||||||||||    
T  41102476 ggaataaattttatgaatataaccgataaatttaaggacattcagatgaaacaaatttgatgtgaaattttaattgttctgtcagtcctgtagtgtaaat 41102575  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  41102576 taattaagattgaacagctaaatat 41102600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 53845431 - 53845380
Alignment:
Q  83 atttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53845431 atttgttttaagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 53845380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22731717 - 22731604
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||  | | ||||||| |||||    
T  22731717 gaagaaattctatgaatgtaacagatggatttaaggacacctagataaaagaaatttaatgtgaaattttaattgttagaaaccctatagtgtagattaa 22731618  T
Q  113 ttaagattgaacac 126  Q
    |||| |||||||||    
T  22731617 ttaatattgaacac 22731604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 23020590 - 23020716
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| | | |||||||| ||||| ||    |||| |||| |||||    
T  23020590 ggaataaaatttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaatgaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtaatgtaa 23020689  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23020690 attaattaagattgaacacctaaatat 23020716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 50547727 - 50547601
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| |||||||| |||| ||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||     | ||||||||||    
T  50547727 ggaataaattttaggaatataacttataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccatacctgtagtgtaa 50547628  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| || |||||    
T  50547627 attaattaagattgaacatctaaatat 50547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52746561 - 52746435
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||| |||    
T  52746561 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcatatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtataa 52746462  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| || |||||    
T  52746461 attaattaagattgaacatctaaatat 52746435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10826977 - 10826852
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||  ||||| || ||||| ||||||     |||||||||||    
T  10826977 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggatattcagataaaagaaatttgatgcgaaattataattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaa 10826878  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  10826877 ttaattaaaatttaacacctaaatat 10826852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27324930 - 27324848
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag 94  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  27324930 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 27324848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22428160 - 22428043
Alignment:
Q  21 tttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaattaattaa 116  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||  | ||| || ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     || ||||||||||||||||    
T  22428160 tttatgcatgtaactgatatatttaaggacattcatatggaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgcagtgtaaattaattaa 22428061  T
Q  117 gattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22428060 gattgaacacctaaatat 22428043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 47912199 - 47912133
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaatttta 83  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47912199 aaatcttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttta 47912133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 133
Target Start/End: Original strand, 37786397 - 37786436
Alignment:
Q  94 gtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaata 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37786397 gtcttgtagtgcaaattaattaagattgaacacctaaata 37786436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 54409600 - 54409533
Alignment:
Q  67 tttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54409600 tttgatgtgaaattttaattgttacaagacctatagtgtaaattaattaagattgaatacctaaatat 54409533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22978063 - 22977994
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  22978063 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcatatagtgtgaattaattaagattgtatacctaaatat 22977994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 32001059 - 32001128
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32001059 aatttgatgtgaaattttaattgttgcaagacatatagtgtaaattaattaagattgaatacctaaatat 32001128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 39131801 - 39131870
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  39131801 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgcatacctaaatat 39131870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42877225 - 42877156
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  42877225 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 42877156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 41889535 - 41889591
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  41889535 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattg 41889591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 43359396 - 43359451
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  43359396 aatttggtgtgaaattttaattgttacaagccta-tagtgtaaattaattaagattg 43359451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 50938351 - 50938407
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  50938351 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattg 50938407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25583438 - 25583571
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25583438 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaattttatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 25583537  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25583538 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 25583571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 2082111 - 2082244
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2082111 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagttttgt 2082210  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2082211 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 2082244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 3704967 - 3705100
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3704967 ggttctggaatgaaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 3705066  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3705067 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 3705100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 23347002 - 23347133
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23347002 ttctggaatggaagaaactttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 23347101  T
Q  103 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23347102 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 23347133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44256318 - 44256196
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaatta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44256318 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaatta 44256219  T
Q  112 attaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44256218 attaagattgaacaccttaatat 44256196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 276968 - 276835
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  276968 ggttctggaatggaagaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 276869  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  276868 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 276835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 638881 - 639014
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  638881 ggttctggaatggaagaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 638980  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  638981 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 639014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 824687 - 824820
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  824687 ggttctggaatggaagaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 824786  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824787 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 824820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3850263 - 3850130
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3850263 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 3850164  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3850163 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 3850130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 15883266 - 15883391
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15883266 aatggaagaaattctatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 15883365  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15883366 ttaattaagattgaacaccttaatat 15883391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41545207 - 41545075
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgta 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  41545207 gttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataaatcttata 41545108  T
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41545107 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 41545075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 4622588 - 4622713
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4622588 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttatcagtcttgtagtgtaaa 4622687  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4622688 ttaattaagattgaacaccttaatat 4622713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6093560 - 6093427
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6093560 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaataaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 6093461  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093460 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 6093427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16096145 - 16096012
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16096145 ggttctggaatggaagaaattttataaatgtaaatgatgaatttaagcacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgt 16096046  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096045 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 16096012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 17948330 - 17948455
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17948330 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgacgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 17948429  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17948430 agtgtaaattaattaagattgaacac 17948455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27912622 - 27912497
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912622 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggatatctagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgtagtgtaaa 27912523  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27912522 ttaattaagattgaacaccttaatat 27912497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27959041 - 27958916
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27959041 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggatatctagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgtagtgtaaa 27958942  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27958941 ttaattaagattgaacaccttaatat 27958916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13141142 - 13141275
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13141142 ggttctggaatagaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaagtacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 13141241  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13141242 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 13141275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18955480 - 18955347
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18955480 ggttctggaatagaagaaattttatgaatgtaaatgatgaattcaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 18955381  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18955380 agtgtaaattaattaagattgaaaaccttaatat 18955347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39858246 - 39858113
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39858246 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgctataagttttgt 39858147  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39858146 ggtgtaaattagttaagattgaacaccttaatat 39858113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 43695012 - 43695137
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43695012 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtggtgtaaa 43695111  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43695112 ttaattaagattgaacaccttaatat 43695137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 28085745 - 28085867
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28085745 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcatatagtgtaaa 28085844  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28085845 ttaattaagattgaacaccttaa 28085867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42735830 - 42735697
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42735830 ggttctggaatggaagaaattttataaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatctgttataagtcttgt 42735731  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42735730 ggtgtagattaattaagattgaacaccttaatat 42735697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 30556534 - 30556658
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30556534 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa-aaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 30556632  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
T  30556633 ttaattaagattgaacttcttaatat 30556658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42645544 - 42645419
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42645544 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaagaaaatttgctgtaaaattttatttgttataagtattgtagtgcaaa 42645445  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42645444 ttaattaagattgaacaccttaatat 42645419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30105968 - 30105846
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30105968 aatgaaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacattcagattaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcatgtagtgtaaa 30105869  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30105868 ttaattaagattgaacaccttaa 30105846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 38576901 - 38577016
Alignment:
Q  18 aattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaag 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  38576901 aattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaa-tttatttgttataagtcttctagtgtaaattaattatg 38576999  T
Q  118 attgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||    
T  38577000 attgaacaccttaatat 38577016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5587084 - 5586963
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||||||    
T  5587084 gaagaaattttatgaatgtaaccgatggatttaaggacatctaaatgaaagaaaattgatgtgaaattttaattgttataagccctatagtgtaaattaa 5586985  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  5586984 ttaagattgaacacctaaatat 5586963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 45409061 - 45409184
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45409061 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgattttt-ggacatccaaatgaaa-aaagttgatgtaaaattttattagttataagtcttgtagtgtaaa 45409158  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  45409159 ttaattaagattgatcaccttaatat 45409184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 111
Target Start/End: Original strand, 40304220 - 40304325
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttat---ttgttataagtcttgtagtgt 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  40304220 aatgaaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttgttataagtcttgtggtgt 40304319  T
Q  106 aaatta 111  Q
    ||||||    
T  40304320 aaatta 40304325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45408469 - 45408344
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  45408469 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctatgccagtcatgtagtgtaaa 45408370  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  45408369 ttaattaagattgaacacctaaatat 45408344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 18089325 - 18089401
Alignment:
Q  58 tgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18089325 tgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattatgattgagcaccttaatat 18089401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 42646152 - 42646277
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  42646152 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaa 42646251  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  42646252 ttaattaggattgaacacctaaatat 42646277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43694404 - 43694279
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  43694404 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaa 43694305  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  43694304 ttaattaagattgaacacctaaatat 43694279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 277560 - 277686
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  277560 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaa 277659  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  277660 attaattaagattgaacacctaaatat 277686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 638289 - 638163
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  638289 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 638190  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  638189 attaattaagattgaacacctaaatat 638163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 824095 - 823969
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  824095 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaa 823996  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  823995 attaattaagattgaacacctaaatat 823969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23346408 - 23346282
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    |||| ||||||||||    
T  23346408 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcaggtgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataagccagtcatgtagtgtaa 23346309  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23346308 attaattaagattgaacacctaaatat 23346282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26950091 - 26949965
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  26950091 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 26949992  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26949991 attaattaagattgaacacctaaatat 26949965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38060486 - 38060360
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  38060486 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttgtaagccagtcctgtagtgtaa 38060387  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38060386 attaattaagattgaacacctaaatat 38060360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 6095630 - 6095755
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  6095630 gaagaaattgtatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatctaaaattttaattgttttaagccagtcctgtagtgtaaa 6095729  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  6095730 ttaattaagattgaacacctaaatat 6095755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13140548 - 13140427
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||| ||||    
T  13140548 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaagttaa 13140449  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  13140448 ttaagattgaacacctaaatat 13140427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30555926 - 30555801
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  30555926 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 30555827  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    
T  30555826 ttaattaagattgaacaactaaatat 30555801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 39858815 - 39858940
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || | |||||||||    
T  39858815 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatttagtgtaaa 39858914  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  39858915 ttaattaagattgaacacctaaatat 39858940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 42736411 - 42736536
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc----ttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  42736411 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaagacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcaattatgtagtgtaaa 42736510  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  42736511 ttaattaagattgaacacctaaatat 42736536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 41545669 - 41545789
Alignment:
Q  18 aattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaat 113  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||||||||    
T  41545669 aattttatgaatataactgattaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaat 41545768  T
Q  114 taagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  41545769 taagattgaacacctaaatat 41545789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 18956277 - 18956396
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||||||| ||||||    
T  18956277 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtcgtgtaa 18956376  T
Q  108 attaattaagattgaacacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18956377 attaattaagattgaacacc 18956396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15882679 - 15882553
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  15882679 ggaataaattttatgaatttaactgataaatttaaggacattcagatgaatgaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 15882580  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15882579 attaattaagattgaacacctaaatat 15882553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 27913220 - 27913346
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  27913220 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaa 27913319  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27913320 attaattaagattgaacacctaaatat 27913346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 27959639 - 27959765
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  27959639 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaa 27959738  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27959739 attaattaagattgaacacctaaatat 27959765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 44256918 - 44257044
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  44256918 ggaataaattttatgagtataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaa 44257017  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44257018 attaattaagattgaacacctaaatat 44257044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40303604 - 40303483
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  40303604 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaaattaa 40303505  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  40303504 ttaagactgaacacctaaatat 40303483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 40617323 - 40617448
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||    
T  40617323 gaagacattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatttgaaattttaattgttctaagcgagtcttgtaatgtaaa 40617422  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||    
T  40617423 ttaattaaggttgaacacctaaatat 40617448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18088774 - 18088650
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||||    
T  18088774 aagaaattttatgaatgtaaatgataaacctaaggatattcatatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaat 18088675  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  18088674 taattaagattgaacacctaaatat 18088650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 30111563 - 30111687
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||| |||||    
T  30111563 aagaaattttatgaatataaatgataaacttaaggacattcagatcaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagttagtcatgtagtctaaat 30111662  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  30111663 taattaagattgaacacctaaatat 30111687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 3850853 - 3850978
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||| ||    |||| |||||||||||    
T  3850853 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggactttcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaaatgttctaagtcagtcatgtagtgtaaa 3850952  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||    
T  3850953 ttaattaagattaaacacctaaatat 3850978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 36192256 - 36192373
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  36192256 gaagaaattttatgaatataaccgataaatttaaggatattcatatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaa 36192355  T
Q  109 ttaattaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36192356 ttaattaagattgaacac 36192373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 5587835 - 5587948
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||| ||  | | ||||||| |||||    
T  5587835 gaagaaattctatgaatgtaacagatggatttaaggacacctagataaaagaaatttaatgtgaaattttaattgttagaaaccctatagtgtagattaa 5587934  T
Q  113 ttaagattgaacac 126  Q
    |||| |||||||||    
T  5587935 ttaatattgaacac 5587948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Original strand, 16096540 - 16096622
Alignment:
Q  56 gatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16096540 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 16096622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 15825750 - 15825806
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15825750 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcatatagtgtaaattaattaagattg 15825806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 26951129 - 26951197
Alignment:
Q  66 atttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  26951129 atttgatgtgaaattttaattgttacaagtcctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 26951197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 19143036 - 19143105
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  19143036 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 19143105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Original strand, 23625979 - 23626024
Alignment:
Q  76 aaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23625979 aaattttaattgttacaagtcatatagtgtaaattaattaagattg 23626024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39069067 - 39068998
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39069067 aatttgatgtgaaattttaattgttgcaagacctatagtgtaaattaattaagattgaatacctaaatat 39068998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 134
Target Start/End: Original strand, 40304349 - 40304386
Alignment:
Q  97 ttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40304349 ttgtggtgtaaattagttaagattgaacaccttaatat 40304386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 26920411 - 26920479
Alignment:
Q  66 atttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  26920411 atttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 26920479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20120218 - 20120085
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20120218 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 20120119  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20120118 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 20120085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 44459093 - 44459226
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44459093 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 44459192  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44459193 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 44459226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 47909177 - 47909310
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47909177 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgttgtaaaattttatttgttataagtcttgt 47909276  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47909277 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 47909310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4925133 - 4925000
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4925133 ggttctggaattgaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 4925034  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4925033 agtctaaattaattaagattgaacaccttaatat 4925000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 16277368 - 16277493
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277368 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 16277467  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16277468 ttaattaagattgaacaccttaatat 16277493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 41858339 - 41858472
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41858339 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatacagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 41858438  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41858439 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 41858472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 725331 - 725456
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  725331 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattataagtcttgtagtgtaaa 725430  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  725431 ttaattaagattgaacaccttaatat 725456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 3415945 - 3416078
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3415945 ggttctggaatggaagaaattttatgaaagtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttataagtcttgt 3416044  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3416045 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 3416078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 9663391 - 9663524
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9663391 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 9663490  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9663491 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 9663524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 28589395 - 28589520
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28589395 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 28589494  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28589495 ttaattaagattgaacaccttaatat 28589520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 40015477 - 40015610
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40015477 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 40015576  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40015577 agtgtaaattaattaagattgagcaccttaatat 40015610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 46555285 - 46555418
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46555285 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgt 46555384  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46555385 aatgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 46555418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 48951968 - 48952101
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  48951968 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatacagatgaaagaaatttgatttaaaattttatttgttataagtcttgt 48952067  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48952068 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 48952101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41336495 - 41336361
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaa-ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttg 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41336495 ggttctgaaatggaaaaaaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttg 41336396  T
Q  100 tagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41336395 tagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 41336361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 18994757 - 18994890
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18994757 ggttctggaatggaataaattttatgaatgtaaatgatgaagttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 18994856  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18994857 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 18994890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21815586 - 21815461
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815586 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttataagtcttgtagtgtaaa 21815487  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21815486 ttaattaagattgaacaccttaatat 21815461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 33246437 - 33246562
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33246437 aatggaagaaattttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagttttgtagtgtaaa 33246536  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33246537 ttaattaagattgaacaccttaatat 33246562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48683445 - 48683320
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48683445 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttacaagtcttgtagtgtaaa 48683346  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  48683345 ttaattaagattgaacactttaatat 48683320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 17968116 - 17968240
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17968116 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa-aaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 17968214  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17968215 ttaattaagattgaacaccttaatat 17968240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44882946 - 44882813
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44882946 ggttctggaatggatgaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatttagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagacttgt 44882847  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  44882846 agtgtaaattaattaagattcaacatcttaatat 44882813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46000903 - 46000770
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46000903 ggttctggaattgaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaactttatttgttataagtcttgt 46000804  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46000803 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 46000770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 48607421 - 48607554
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  48607421 ggttctggaatggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaatttgatgtgttataagtcttgt 48607520  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48607521 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 48607554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 23594367 - 23594493
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaat-ttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23594367 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccacatgaaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaa 23594466  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23594467 attacttaagattgaacaccttaatat 23594493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 30759891 - 30760019
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaat---ttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759891 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacattcaaatgaaaaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgt 30759990  T
Q  106 aaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759991 aaattaattaagattgaacaccttaatat 30760019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 46936082 - 46936208
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaa-tttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaa 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46936082 aatggaagaaattttataaatataagtgatgaatttaagaacatccagataaaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaa 46936181  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  46936182 attaattaagattgaacaccttaatat 46936208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21729887 - 21729766
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  21729887 aatggaagaaattttatgaatgtaattgatgaatttaaggacatccagataaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttat-agtcatgtagtgtaga 21729789  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21729788 ttaattaagattgaacaccttaa 21729766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 47503809 - 47503681
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaa---tttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgt 105  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47503809 aatggaagaaattttatgcaagtaagtgatgaagaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttttagtgt 47503710  T
Q  106 aaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47503709 aaattaattaagattgaataccttaatat 47503681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Original strand, 41289428 - 41289527
Alignment:
Q  35 tgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41289428 tgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaattttatgtaaaattttatttgttataagtcttgtggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 41289527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16274467 - 16274346
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||    
T  16274467 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaattaa 16274368  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16274367 ttaagattgaacacctaaatat 16274346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44521294 - 44521169
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||    |||| |||||||||||    
T  44521294 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgctctaagccagtcatgtagtgtaaa 44521195  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  44521194 ttaattaagattgaacacctaaatat 44521169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46935485 - 46935360
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  46935485 gaagaaattttatgaatgtaacagataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcatgtagtgtaaa 46935386  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  46935385 ttaattaagattgaacacctaaatat 46935360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 21736276 - 21736400
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || |||||| |||||    
T  21736276 aagaaattttatgaatgtaaatgataaacttaaggacatttagatgacagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcattcatgtagtctaaat 21736375  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  21736376 taattaagattgaacacctaaatat 21736400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41289355 - 41289231
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||||    
T  41289355 aagaaattttatgaatgtaactgataaacttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaat 41289256  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  41289255 taattaagattgaacacctaaatat 41289231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41857846 - 41857727
Alignment:
Q  19 attttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaatt 114  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  41857846 attttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtagtgtaaattaatt 41857747  T
Q  115 aagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  41857746 aagattgaacacctaaatat 41857727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3415353 - 3415229
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgtt--ataagtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||     |||||||||||||||||    
T  3415353 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttcagccagtcttgtagtgtaaat 3415254  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  3415253 taattaagattgaacacctaaatat 3415229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 20120807 - 20120933
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  20120807 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 20120906  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20120907 attaattaagattgaacacctaaatat 20120933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 21816184 - 21816310
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  21816184 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 21816283  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21816284 attaattaagattgaacacctaaatat 21816310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 41337086 - 41337212
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  41337086 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 41337185  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41337186 attaattaagattgaacacctaaatat 41337212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5373741 - 5373616
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||    
T  5373741 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcacatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaa 5373642  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5373641 ttaattaaaattgaacacctaaatat 5373616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40014882 - 40014761
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  40014882 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaa 40014783  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  40014782 ttaagattgaacacctaaatat 40014761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 724733 - 724613
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  724733 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtagtgtaa 724634  T
Q  108 attaattaagattgaacacct 128  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  724633 attaattaagattgaacacct 724613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Original strand, 48684044 - 48684164
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||||||| ||||||    
T  48684044 ggaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcggatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcttgttgtgtaa 48684143  T
Q  108 attaattaagattgaacacct 128  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48684144 attaattaagattgaacacct 48684164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28588814 - 28588688
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  28588814 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggaaattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 28588715  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28588714 attaattaagattgaacacctaaatat 28588688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17967506 - 17967385
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    ||| |||||||||||||||    
T  17967506 aaattttatgaatgtaactgataaatttaagcacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcctgtcatgtagtgtaaattaa 17967407  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  17967406 ttaggattgaacacctaaatat 17967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48606821 - 48606696
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||| ||||||    
T  48606821 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagataaaagaaatttgatgtcaaattttaattgttctaagtcagtcctgtaatgtaaa 48606722  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  48606721 ttaattaagattgaacacctaaatat 48606696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33245839 - 33245713
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc----ttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| || || ||||||     ||||||||||    
T  33245839 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgggaaattttaattattctaagtcagttctgtagtgtaa 33245740  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33245739 attaattaagattgaacacctaaatat 33245713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48951482 - 48951356
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  48951482 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaatgacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaggcagtcatgtagtgtaa 48951383  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48951382 attaattaagactgaacacctaaatat 48951356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 47504414 - 47504539
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    ||||  ||||||||||    
T  47504414 gaagaaattttatgaatgtaaccgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcaggtagtgtaaa 47504513  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  47504514 ttaattaggattgaacgcctaaatat 47504539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8392667 - 8392548
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||    || |||||||||||    
T  8392667 gaagaaagtttatgaatgtaaccgataaatttaaggacattcagatgaaataaagttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcatgtagtgtaaa 8392568  T
Q  109 ttaattaagattgaacacct 128  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8392567 ttaattaagattgaacacct 8392548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30759285 - 30759204
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  30759285 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 30759204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9662795 - 9662670
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||  |  ||| |||||||| ||||| ||||    |||| |||||||||    
T  9662795 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaaaattatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttatagtgtaaa 9662696  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  9662695 ttaattaagattgaacacctaaatat 9662670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46554692 - 46554570
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgt-aaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaatta 111  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||    |||| | ||||||||||||    
T  46554692 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttttaaatgttctaagccagtcctatagtgtaaatta 46554593  T
Q  112 attaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  46554592 attaagattgaacacctaaatat 46554570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 134
Target Start/End: Original strand, 5374365 - 5374415
Alignment:
Q  84 tttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5374365 tttgttataagtcttgtggtgtaaattaattaagattgaacgccttaatat 5374415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 44883526 - 44883652
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |  | |||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     | ||||||||    
T  44883526 ggaataaattttatgaatataactagtaaatttaaatacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatatagtgtaa 44883625  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44883626 attaattaagattgaacacctaaatat 44883652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44458457 - 44458377
Alignment:
Q  58 tgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44458457 tgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaaaacctaaatat 44458377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 50
Target Start/End: Original strand, 44522734 - 44522773
Alignment:
Q  11 tggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggac 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44522734 tggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggac 44522773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47908198 - 47908089
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc---ttgtagtgtaaattaattaa 116  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||| |   |  |||||||| ||||||||    
T  47908198 ttttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaatcgttctaagccagttcttagtgtaatttaattaa 47908099  T
Q  117 gattgaacac 126  Q
    ||||||||||    
T  47908098 gattgaacac 47908089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 596220 - 596289
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  596220 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 596289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4658216 - 4658175
Alignment:
Q  93 agtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4658216 agtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 4658175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 1602240 - 1602295
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1602240 aatttgatgtaaaattttaattgttacaag-cttatagtgtaaattaattaagattg 1602295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23593762 - 23593697
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttat 84  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23593762 gaagaaattttatgaatgtaaa------atttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttat 23593697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Original strand, 8393280 - 8393323
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacat 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  8393280 aatggaagaaattttatgaatgtatgtgatgactttaaggacat 8393323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19064153 - 19064084
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  19064153 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccttatagtgtaaattaattaaaattgtatacctaaatat 19064084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30758375 - 30758334
Alignment:
Q  93 agtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30758375 agtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatat 30758334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 37708205 - 37708274
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  37708205 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 37708274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38224573 - 38224504
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  38224573 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcctatagtctaaattaattaagattgtagacctaaatat 38224504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 41408008 - 41408077
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  41408008 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 41408077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43543223 - 43543154
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  43543223 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 43543154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 43545010 - 43545079
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  43545010 aatttgatgtgaaattttaattgttaaaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 43545079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 47254591 - 47254660
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  47254591 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagacctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 47254660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 33982429 - 33982485
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33982429 aatttgatgtgaaatgttaattgttacaagtcctatagtgtaaattaattaagattg 33982485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 38229619 - 38229675
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  38229619 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattg 38229675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 46160609 - 46160665
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  46160609 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcatataatgtaaattaattaagattg 46160665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 11837479 - 11837612
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11837479 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaatgacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 11837578  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11837579 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 11837612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 4589713 - 4589846
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589713 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagaagaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 4589812  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589813 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 4589846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16918580 - 16918447
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918580 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 16918481  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16918480 agtgtaaattaattaaaattgaacaccttaatat 16918447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 17550719 - 17550852
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17550719 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcataagtcttgt 17550818  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17550819 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 17550852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 955477 - 955610
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  955477 ggttctggaatgtaagaaattttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 955576  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  955577 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 955610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 131
Target Start/End: Original strand, 11154512 - 11154641
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgta 101  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11154512 gttctggaatcgaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgta 11154611  T
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11154612 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 11154641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27782652 - 27782519
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27782652 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagttttgt 27782553  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782552 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 27782519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14104175 - 14104042
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104175 ggttctggaatgaaagaaattttatgaaagtaaatgatgaatttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 14104076  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104075 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 14104042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28578792 - 28578659
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28578792 ggttctgaaatggaagaaatgttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 28578693  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28578692 attgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 28578659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24083305 - 24083174
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 102  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24083305 ttctcaaatgaaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 24083206  T
Q  103 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24083205 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 24083174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27438574 - 27438449
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27438574 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaacgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaag 27438475  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27438474 ttaattaagattgaacaccttaatat 27438449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25109724 - 25109592
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25109724 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgcat-tgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 25109626  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25109625 ggtttaaattaattaagattgaacaccttaatat 25109592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23580461 - 23580329
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23580461 ggttctggaatgaaagaaattgtatggatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttg-tataagccttgt 23580363  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23580362 agtgtaaattaattaagagtgaacaccttaatat 23580329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 21861165 - 21861293
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21861165 aatggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtataattttatttgttataagtcttgttgtgtaaa 21861264  T
Q  109 ttaattaaga---ttgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21861265 ttaattaagatatttgaacaccttaatat 21861293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 28579368 - 28579493
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  28579368 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaa 28579467  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  28579468 ttaattaagattgaacacctaaatat 28579493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 14104763 - 14104881
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaatta 115  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||||||    
T  14104763 ttttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaattaatta 14104862  T
Q  116 agattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14104863 agattgaacacctaaatat 14104881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11153923 - 11153798
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  11153923 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcatgtagtgtaaa 11153824  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11153823 ttaattaaaattgaacacctaaatat 11153798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 24083887 - 24084011
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  24083887 gaagaaattttatgaatgtaattgataaatttaaggacattcaaatgaaacaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaa 24083986  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaata 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  24083987 ttaattaagattgaacacctaaata 24084011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 27783240 - 27783366
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  27783240 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagttgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 27783339  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27783340 attaattaagattgaacacctaaatat 27783366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 954877 - 954752
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  954877 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagataaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 954778  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  954777 ttaattaagattgaacacctaaatat 954752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1090630 - 1090505
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||| || ||||| ||||| ||||    ||||||||||||||    
T  1090630 gaagaaattgtatgaatgtaactgataaatttaaggacattcaaatgaaagaaatttaatgtgaatttttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaa 1090531  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1090530 ttaattaagattgaacacctaaatat 1090505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 16918936 - 16919054
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  16918936 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtagtgtaa 16919035  T
Q  108 attaattaagattgaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16919036 attaattaagattgaacac 16919054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 23573838 - 23573964
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  23573838 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagtactttcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaa 23573937  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23573938 attaattaagattgaacacctaaatat 23573964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15288355 - 15288230
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||  ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||| |    
T  15288355 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaagaacattcaaatgaaagaaattttatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtata 15288256  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  15288255 ttaattaagattgaacacctaaatat 15288230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4589141 - 4589015
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||    |||||||||||||    
T  4589141 ggaataaattttataaatataattgataaatttaagaacattcagattaaagaaatttgatgtgaaatttttattgttctaagccaatcttgtagtgtaa 4589042  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4589041 attaattaagattgaacacctaaatat 4589015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11836884 - 11836766
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaatta 115  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||| |||||||||||||    
T  11836884 ttttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtaatgtaaattaatta 11836785  T
Q  116 agattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  11836784 agattgaacacctaaatat 11836766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5687560 - 5687432
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata--------agtcttgtagtgt 105  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||        |||| ||| ||||    
T  5687560 aagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagttagttagtcctgtggtgt 5687461  T
Q  106 aaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5687460 aaattaattaagattgagcacctaaatat 5687432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 27440673 - 27440803
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata--------agtcttgtagt 103  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||        |||| ||||||    
T  27440673 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagggcattcagatgaaagaattttgatgtgaaattttaattgttctaattaagccagtcatgtagt 27440772  T
Q  104 gtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27440773 gtagattaattaagattgaacacctaaatat 27440803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 25119043 - 25119101
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgg 71  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25119043 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgg 25119101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21860630 - 21860509
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | ||   | ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |     ||||||||||||    
T  21860630 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcaaat---ataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacaataatgtagtgtaaat 21860534  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  21860533 taattaagattgaacacctaaatat 21860509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 134
Target Start/End: Original strand, 25119520 - 25119596
Alignment:
Q  62 agaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25119520 agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 25119596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 5090198 - 5090267
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  5090198 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 5090267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 32562525 - 32562594
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  32562525 aatttgatgtcaaattttaattgttataagccatatagtgtagattaattaagattgtatacctaaatat 32562594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24159223 - 24159167
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| | | || |||||||||||||||||||    
T  24159223 aatttgatgtaaaattttaattgttacaagccctataatgtaaattaattaagattg 24159167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 3035665 - 3035798
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3035665 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtctttt 3035764  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035765 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 3035798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4653168 - 4653035
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4653168 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgacgtaaaattttatttgttataagtcttgt 4653069  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4653068 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 4653035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16664856 - 16664723
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16664856 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 16664757  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16664756 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 16664723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20786886 - 20787019
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20786886 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaataatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 20786985  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20786986 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 20787019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 23419156 - 23419289
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23419156 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattataagtcttgt 23419255  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23419256 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 23419289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 54919594 - 54919461
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54919594 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatctgttataagtcttgt 54919495  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54919494 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 54919461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17361337 - 17361205
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17361337 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 17361238  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17361237 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaata 17361205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8939612 - 8939479
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  8939612 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtattat 8939513  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8939512 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 8939479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13534415 - 13534548
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13534415 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 13534514  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13534515 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 13534548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 30827362 - 30827487
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30827362 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagataaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 30827461  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  30827462 tcaattaagattgaacaccttaatat 30827487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46717905 - 46717772
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46717905 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaatgacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattataagtcttgt 46717806  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46717805 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 46717772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49873929 - 49873801
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49873929 ttctggaatgaaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 49873830  T
Q  103 tgtaaattaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49873829 tgtaaattaattaagattgaacaccttaa 49873801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35824731 - 35824600
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35824731 ttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatctggatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtgg 35824632  T
Q  103 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35824631 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 35824600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52447577 - 52447452
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52447577 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccatatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 52447478  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52447477 ttaattaagattgaacaccttaatat 52447452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 20353934 - 20354059
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353934 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgttgttaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 20354033  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20354034 ttaattaagattgaacatcttaatat 20354059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 31292461 - 31292586
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31292461 aatgaaagaaatttaatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaaatttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 31292560  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31292561 ttaattaggattgaacaccttaatat 31292586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31309820 - 31309706
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31309820 ttttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagat 31309721  T
Q  120 tgaacaccttaatat 134  Q
     ||||||||||||||    
T  31309720 cgaacaccttaatat 31309706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 49970075 - 49970205
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  49970075 ggttctggaatggaagaaaatttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttataaatcttgt 49970174  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49970175 agtgtaaattatttaagattgaacaccttaa 49970205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 23933406 - 23933539
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23933406 ggttctggaatggaaggaattttataaatgtaagtgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 23933505  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23933506 ggtataaattaattaagattgaacaccttaatat 23933539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34073220 - 34073096
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34073220 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa-aattttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtggtgtaaa 34073122  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34073121 ttaattaagattgaacaccttaatat 34073096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 27962295 - 27962426
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||     
T  27962295 ggttctggaatgaaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggatatccagataaaagaaatttgatgtaaaatttgatttgt--taagtcttgc 27962392  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27962393 agtgtaaattaattaagattgaataccttaatat 27962426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7487480 - 7487383
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtctt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7487480 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtgaaattttatttgttataaatctt 7487383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Original strand, 50496043 - 50496158
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaa-----agaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||     | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50496043 aatggatgaaattttatgaatgtaagcgatgaatttaaggacatccagatgaagaaaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagt 50496142  T
Q  104 gtaaattaattaagat 119  Q
    ||||||||||||||||    
T  50496143 gtaaattaattaagat 50496158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35045195 - 35045118
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaa 78  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35045195 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaa 35045118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 41041352 - 41041425
Alignment:
Q  61 aagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041352 aagaaatttgatgtaaaattttatttgttataaatcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 41041425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 54920185 - 54920311
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    ||||||||||||||    
T  54920185 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttttaagccggtcttgtagtgtaa 54920284  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  54920285 attaattaagattgaacacctaaatat 54920311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 35825332 - 35825457
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  35825332 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaa 35825431  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  35825432 ttaattaagattgaacacctaaatat 35825457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 46718505 - 46718630
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  46718505 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttttaagccagtcatgtagtgtaaa 46718604  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  46718605 ttaattaagattgaacacctgaatat 46718630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 4653758 - 4653884
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttat----aagtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    ||||| ||||||||||    
T  4653758 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaccaagtcctgtagtgtaa 4653857  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4653858 attaattaagattgaacacctaaatat 4653884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20786353 - 20786227
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    ||||||||||| ||    
T  20786353 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcggtcttgtagtgcaa 20786254  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20786253 attaattaagattgaacacctaaatat 20786227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 52448175 - 52448301
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  52448175 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 52448274  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  52448275 attaattaagattgaacacctaaatat 52448301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20342601 - 20342475
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  20342601 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 20342502  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20342501 attaattaagattgaacacctaaatat 20342475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20353326 - 20353200
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  20353326 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 20353227  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20353226 attaattaagattgaacacctaaatat 20353200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27958743 - 27958617
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     | ||||||||    
T  27958743 ggaagaaattttatgaatataatttataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctttagtgtaa 27958644  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27958643 attaattaagattgaacacctaaatat 27958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 17361893 - 17362014
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || | |||||||||||||    
T  17361893 aaattttatgaatataagtgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcctatagtgtaaattaa 17361992  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  17361993 ttaagattgaacacctaaatat 17362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23932806 - 23932681
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||     |||||||||||    
T  23932806 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagctgaaagaaatttgatgtgaaatttttattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaa 23932707  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  23932706 ttaattaagattgaacacctaaatat 23932681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31291945 - 31291820
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     | |||||||||    
T  31291945 gaagaaattttatgaatataactgatagatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctttagtgtaaa 31291846  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  31291845 ttaattaagattgaacacctaaatat 31291820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 34073801 - 34073918
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||    |||  |||||||||||    
T  34073801 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgtaattttaattgttctaagctagttatgtagtgtaaa 34073900  T
Q  109 ttaattaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34073901 ttaattaagattgaacac 34073918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 49874532 - 49874657
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||    |||| |||||||||||    
T  49874532 gaagaaattttatgaatataactgataattttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattaatctaagccagtcctgtagtgtaaa 49874631  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  49874632 ttaattaagattgaacacctaaatat 49874657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23418564 - 23418444
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttat----aagtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    ||||| |||| |||||    
T  23418564 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcaagtcatgtactgtaa 23418465  T
Q  108 attaattaagattgaacacct 128  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23418464 attaattaagattgaacacct 23418444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Original strand, 35045757 - 35045876
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  35045757 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaa 35045856  T
Q  109 ttaattaagattgaacacct 128  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  35045857 ttaactaagattgaacacct 35045876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3035075 - 3034951
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgt--tataagtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  | | |||| ||| || |||||    
T  3035075 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctgtcagtcctgtcgtataaat 3034976  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  3034975 taattaagattgaacacctaaatat 3034951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 16665446 - 16665572
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||| ||||    
T  16665446 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagcgtaa 16665545  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16665546 attaattaagattgaacgcctaaatat 16665572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 41040806 - 41040680
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||    |||| ||||||||||    
T  41040806 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagccagtcctgtagtgtaa 41040707  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41040706 attaattaaaattgaacacctaaatat 41040680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 7488052 - 7488178
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||   |||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  7488052 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaatgcattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 7488151  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7488152 attaattaagattgaacacctaaatat 7488178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 50495514 - 50495393
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||    
T  50495514 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcagat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaat 50495418  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  50495417 taattaagattgaacacctaaatat 50495393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13533819 - 13533694
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||  |  ||| |||||||| ||||| ||||    |||| |||||||||    
T  13533819 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaaaattatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttatagtgtaaa 13533720  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  13533719 ttaattaagattgaacacctaaatat 13533694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7487367 - 7487316
Alignment:
Q  83 atttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7487367 atttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacatcttaatat 7487316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9368128 - 9368025
Alignment:
Q  35 tgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctta 130  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9368128 tgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcgtacagtgtaaattaattaagattgaacacctaa 9368029  T
Q  131 atat 134  Q
    ||||    
T  9368028 atat 9368025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 55450607 - 55450525
Alignment:
Q  56 gatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55450607 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 55450525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 55450972 - 55451023
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacat 52  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  55450972 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtagattatgaattcaaggacat 55451023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Original strand, 47650676 - 47650746
Alignment:
Q  64 aaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  47650676 aaatttgatgtgaaattttaattgttacaagacctatagtgtaaattaattaagattgaatacctaaatat 47650746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30824913 - 30824815
Alignment:
Q  40 aatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||| |||||||  | |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30824913 aatttgaggacattcaaatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacgcctaaatat 30824815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43590519 - 43590450
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  43590519 aatttgatgttaaattttaattgttacaagtcctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 43590450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 43594122 - 43594191
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43594122 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtacacctaaatat 43594191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 134
Target Start/End: Original strand, 38623463 - 38623521
Alignment:
Q  76 aaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  38623463 aaattttaattgttacaagccttatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 38623521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 8081040 - 8081109
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  | | |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  8081040 aatttgatgtaaaattttaattgttataaaccctatagtgtaaattaatcaagattgtatacctaaatat 8081109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 31624512 - 31624581
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  31624512 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcctataatgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 31624581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31623402 - 31623346
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  31623402 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcctatagcgtaaattaattaagattg 31623346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 49646010 - 49645954
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  49646010 aatttgatgtgaaattttaattgttaaaagccatatagtgtaaattaattaagattg 49645954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 50792530 - 50792586
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  50792530 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattg 50792586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33704786 - 33704653
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33704786 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 33704687  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33704686 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 33704653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 14488645 - 14488778
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14488645 ggttctggaatgaaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 14488744  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14488745 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 14488778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24781250 - 24781117
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781250 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgattaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 24781151  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781150 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 24781117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36308028 - 36307899
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36308028 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 36307929  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacacctta 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36307928 agtgtaaattaattaagattgaacacctta 36307899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7153110 - 7152977
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7153110 ggttctggaatggaagaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 7153011  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7153010 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 7152977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10772911 - 10772786
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10772911 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagttttgtagtgtaaa 10772812  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10772811 ttaattaagattgaacaccttaatat 10772786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 29521748 - 29521881
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29521748 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 29521847  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29521848 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 29521881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 48127952 - 48127827
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48127952 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 48127853  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48127852 ttaattaagattgaacaccttaatat 48127827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31030276 - 31030143
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030276 ggttctggaattgaagaaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacatcgagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 31030177  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030176 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 31030143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 44512251 - 44512376
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44512251 aatggaataaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 44512350  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  44512351 ttaattaagattgaacactttaatat 44512376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 29649523 - 29649648
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29649523 aatggaagaaattttatgaatgttagtgatgaatttaaggacatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 29649622  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29649623 ttaattaagattgaacatcttaatat 29649648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36730850 - 36730719
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtag 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36730850 ttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattataagtcttgtgg 36730751  T
Q  103 tgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36730750 tgtaaattaattaagattgaacacgttaatat 36730719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25656028 - 25655903
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656028 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 25655929  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  25655928 ttaattaagattaaacaccttaatat 25655903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5326897 - 5326771
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc-ttgtagtgtaa 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5326897 aatgaaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaagacatctggatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtctttgtagtgtaa 5326798  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5326797 attaattaagattgaacaccttaatat 5326771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 33006283 - 33006412
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  33006283 ggttttgaaatggaagaaattttatgaatgtaagtgaagaatttgaggacatccagatgaaagaaatttgatgcaaaattttatttgttataagtcatgt 33006382  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacacctta 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33006383 agtgtaaattaattaagattgaacacctta 33006412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35954595 - 35954470
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35954595 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaagtacatccagatgacagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttatggtgtaaa 35954496  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35954495 ttaattaagattgaacaccttaatat 35954470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12768418 - 12768308
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768418 aatggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 12768319  T
Q  109 ttaattaagat 119  Q
    |||||||||||    
T  12768318 ttaattaagat 12768308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 30302860 - 30302977
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30302860 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagattaaataaatttgatttaaaattttatttgttataattcttgtagtgtaaattaattaa 30302959  T
Q  117 gattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30302960 gattgaacaccttaatat 30302977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46118422 - 46118290
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgta 101  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46118422 gttctggaatggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccaaattaaataaatttgatttaaaattttatttgttataagtcctgta 46118323  T
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46118322 gtgtaaattaattaagattgaaccccttaatat 46118290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52404784 - 52404654
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52404784 ggttctggaatggaagaaattt-atgaatgtaagtgatggatt-aaggacatccaaatgata-aaatttgatgtaaaattttgtttgttataagtcttgt 52404688  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52404687 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 52404654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51086926 - 51086827
Alignment:
Q  35 tgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51086926 tgatgaatttaaggacatccggatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtggtgtaaattaattaagattgaatgccttaatat 51086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 30838589 - 30838665
Alignment:
Q  58 tgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838589 tgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 30838665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7556419 - 7556315
Alignment:
Q  28 atgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacc 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7556419 atgtaactgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaattttt--ttgttataagtcttgtggtgtaaattaatttagattgaacacc 7556322  T
Q  128 ttaatat 134  Q
    |||||||    
T  7556321 ttaatat 7556315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30302239 - 30302114
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || |||||||||||    
T  30302239 gaagaaattttatgaatgtaattgataaatttaaggacattgaaatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcatgtagtgtaaa 30302140  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  30302139 ttaattaagattgaacacctaaatat 30302114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29648801 - 29648666
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtctt 98  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  | ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||    ||||||    
T  29648801 ttctggaatagaagaaattttatgaatgaaattgataaatttaaggacattcaaatgaaagaactttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtctt 29648702  T
Q  99 gtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29648701 gtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 29648666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 10773511 - 10773637
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  10773511 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 10773610  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10773611 attaattaagattgaacacctaaatat 10773637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 36308622 - 36308748
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  36308622 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaa 36308721  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36308722 attaattaagattgaacacctaaatat 36308748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 25656626 - 25656751
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  25656626 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 25656725  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  25656726 ttaattaggattgaacacctaaatat 25656751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 33705385 - 33705506
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    || |||||||||||||||    
T  33705385 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagccaatcctgtagtgtaaattaa 33705484  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| || |||||    
T  33705485 ttaagattgaacatctaaatat 33705506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 7153700 - 7153818
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  7153700 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtagtgtaa 7153799  T
Q  108 attaattaagattgaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7153800 attaattaagattgaacac 7153818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 46119024 - 46119149
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||||||||    
T  46119024 gaagaaattttatgaatgtaattgataaatttaaagatattgaaatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcaatcgtgtagtgtaaa 46119123  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  46119124 ttaattaagattgaacacctaaatat 46119149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 46463910 - 46464038
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata--------agtcttgtagtgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||        |||| |||||| |    
T  46463910 aagaaattttatgaatgtaaatgataaaattaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcagtcatgtagtct 46464009  T
Q  106 aaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46464010 aaattaattaagattgaacacctaaatat 46464038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44511658 - 44511532
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||    |||| ||||||||||    
T  44511658 ggaataaattttatgaatataactggtaaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagccagtcctgtagtgtaa 44511559  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44511558 attaattaagattgaacacctaaatat 44511532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 52405378 - 52405496
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaaattaatta 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||    ||| ||||||||||||||||||    
T  52405378 ttttatgaacgtaattgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttgaattgttctaagcctgtcgtgtagtgtaaattaatta 52405477  T
Q  116 agattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  52405478 agattgaacacctaaatat 52405496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 52406811 - 52406929
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataa----gtcttgtagtgtaaattaatta 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||    ||| ||||||||||||||||||    
T  52406811 ttttatgaacgtaattgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttgaattgttctaagcctgtcgtgtagtgtaaattaatta 52406910  T
Q  116 agattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  52406911 agattgaacacctaaatat 52406929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 35955205 - 35955330
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || |||||||||||    
T  35955205 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagaagaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcctgtagtgtaaa 35955304  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||    
T  35955305 ttaactaagattgaatacctaaatat 35955330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 36731452 - 36731576
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||    || |||||| ||||    
T  36731452 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttaatt-gttctaagccagtcctgtagtctaaa 36731550  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  36731551 ttaattaagattgaacacctaaatat 36731576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 51087506 - 51087631
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||     
T  51087506 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagattaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaac 51087605  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||    
T  51087606 ttaattaagattggacacctaaatat 51087631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33005670 - 33005547
Alignment:
Q  15 agaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     |||||| ||||||    
T  33005670 agaaattttatgaatgtaaatgataaacttaaggacattcatatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtctaaatt 33005571  T
Q  111 aattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    || || |||||||||||| |||||    
T  33005570 aaatatgattgaacacctaaatat 33005547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29521225 - 29521100
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  29521225 gaagaaattttatgaatataactaataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 29521126  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||    
T  29521125 ttcattaagattaaacacctaaatat 29521100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14488051 - 14487933
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||     ||| ||||||    
T  14488051 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagattaaagaaatttgatgtgaaaatttaattgttctaagtcagtcctgtcgtgtaa 14487952  T
Q  108 attaattaagattgaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14487951 attaattaagattgaacac 14487933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14536640 - 14536522
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||     ||| ||||||    
T  14536640 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagattaaagaaatttgatgtgaaaatttaattgttctaagtcagtcctgtcgtgtaa 14536541  T
Q  108 attaattaagattgaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14536540 attaattaagattgaacac 14536522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 9135171 - 9135292
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | ||    |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||||    
T  9135171 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcaaatt---gaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaat 9135267  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  9135268 taattaagattgaacacctaaatat 9135292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 12768954 - 12769075
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc----ttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||  | ||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |    |||||||||||||    
T  12768954 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggaaattcaaat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtattgtagtgtaaat 12769050  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  12769051 taattaagattgaacacctaaatat 12769075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 134
Target Start/End: Original strand, 7556852 - 7556932
Alignment:
Q  58 tgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7556852 tgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 7556932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23259063 - 23259014
Alignment:
Q  72 tgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23259063 tgtaaaattttaattgttacaagtcatatagtgtaaattaattaagattg 23259014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 134
Target Start/End: Original strand, 48128600 - 48128636
Alignment:
Q  98 tgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48128600 tgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 48128636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44299304 - 44299234
Alignment:
Q  64 aaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  44299304 aaatttgatgtgaaattttaattgttacaagtcctacagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 44299234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 23260885 - 23260954
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  23260885 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 23260954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 44300058 - 44300127
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  44300058 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 44300127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 745433 - 745566
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  745433 ggttctggaatggaagaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 745532  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  745533 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 745566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9591988 - 9591855
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591988 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaacaacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 9591889  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591888 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 9591855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12499588 - 12499455
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499588 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcgagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 12499489  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499488 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 12499455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19665141 - 19665008
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19665141 ggttctgtaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 19665042  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19665041 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 19665008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20546015 - 20546148
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20546015 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 20546114  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20546115 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 20546148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 42612080 - 42612213
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42612080 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttat 42612179  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42612180 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 42612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 30130781 - 30130914
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  30130781 ggttctggaatggaagaaattttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagttttat 30130880  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30130881 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 30130914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37270616 - 37270483
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37270616 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatataaaattttatttgttataagtcttgt 37270517  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37270516 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 37270483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 7180925 - 7181050
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7180925 aatggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 7181024  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7181025 ttaattaagattgaacaccttaatat 7181050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 9987189 - 9987314
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9987189 aatggaagaaattttatgaatgtaattgatgaatttaaggacatctagatgaaaaatatttgatgtaaaattttatttgttaaaagtcttgtagtgtaaa 9987288  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9987289 ttaattaagattgaacaccttaatat 9987314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 27019966 - 27020091
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019966 aatggaaaaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 27020065  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  27020066 ttaattaagattgaacactttaatat 27020091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27550955 - 27550834
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27550955 gaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 27550856  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27550855 ttaagattgaacaccttaatat 27550834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 824673 - 824806
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  824673 ggttctggaatgaaagaaattgtatggatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttct 824772  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  824773 agtgtaaattaattaagagtgaacaccttaatat 824806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39588637 - 39588504
Alignment:
Q  2 gttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaa-ttttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39588637 gttctggaatgaaagaaaatttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaatttttatttgttataagtcttgt 39588538  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39588537 aatgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 39588504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15420569 - 15420435
Alignment:
Q  3 ttctgaaatggaagaa-----attttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct 97  Q
    ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15420569 ttctgaaatggaagaaatttaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagt-t 15420471  T
Q  98 tgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaata 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15420470 tgtagtgtaaattaattaagatttaacaccttaata 15420435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13305289 - 13305422
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13305289 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaatttaatttgttataagtgttgt 13305388  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13305389 ggtgtaaatcaattatgattgaacaccttaatat 13305422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11984817 - 11984696
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11984817 gaagacattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtaatgtaatttaa 11984718  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  11984717 ttaaaattgaacatcttaatat 11984696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11077079 - 11076973
Alignment:
Q  28 atgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11077079 atgtaaatgatgaatttaaggacattcaaatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacc 11076980  T
Q  128 ttaatat 134  Q
    |||||||    
T  11076979 ttaatat 11076973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 31551996 - 31552126
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaat----gatgaatttaaggacatctagatgaaagaaa-tttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31551996 aatggaagaaattttatgaatgtaattaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttattagtcttgtagt 31552095  T
Q  104 gtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31552096 gtaaattaattaagattgaacaccttaatat 31552126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 744840 - 744714
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    |||| ||||||||||    
T  744840 ggaataaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataagccagtcctgtagtgtaa 744741  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  744740 attaattaagattgaacacctaaatat 744714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9986583 - 9986458
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||    |||| |||||||||||    
T  9986583 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacatttagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaatcgttataagccagtcatgtagtgtaaa 9986484  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  9986483 ttaattaggattgaacacctaaatat 9986458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 27551562 - 27551687
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  27551562 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 27551661  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  27551662 ttaattaggattgaacacctaaatat 27551687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 9592578 - 9592704
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||     ||| ||||||    
T  9592578 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagtcagtcctgtggtgtaa 9592677  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9592678 attaattaagattgaacacctaaatat 9592704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 15421121 - 15421247
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  15421121 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 15421220  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15421221 attaattaagattgaacacctaaatat 15421247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20545445 - 20545319
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  20545445 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtagtgtaa 20545346  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20545345 attaattaagattgaacacctaaatat 20545319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 37271196 - 37271313
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||    
T  37271196 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgcgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtagtgtaaa 37271295  T
Q  109 ttaattaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37271296 ttaattaagattgaacac 37271313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 12500178 - 12500304
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  12500178 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcggatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaa 12500277  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12500278 attaattaagattgaacacctaaatat 12500304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27019368 - 27019242
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  27019368 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaa 27019269  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27019268 attaattaagattgaacacctaaatat 27019242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 39589210 - 39589336
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  39589210 ggaataaattttatgaatataactaataaatttaaggacatttagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 39589309  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39589310 attaattaagattgaaaacctaaatat 39589336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 30130186 - 30130073
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  30130186 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaa 30130087  T
Q  113 ttaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||    
T  30130086 ttaagattgaacac 30130073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Original strand, 19665731 - 19665851
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||| ||    
T  19665731 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcggtcctgtagtgcaa 19665830  T
Q  108 attaattaagattgaacacct 128  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19665831 attaattaagattgaacacct 19665851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 824078 - 823960
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  824078 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagtacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcctgtagtgtaa 823979  T
Q  108 attaattaagattgaacac 126  Q
    |||||||||||||||||||    
T  823978 attaattaagattgaacac 823960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37939736 - 37939610
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| || |  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  37939736 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagaacgttcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaa 37939637  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37939636 attaattaagattgaacacctaaatat 37939610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 11985427 - 11985552
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||  |||||||||||    
T  11985427 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggaaattcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagttctgtagtgtaaa 11985526  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  11985527 ttaattaagattgaacacctaaatat 11985552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13304692 - 13304567
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||| ||||||    
T  13304692 gaagaaattttataaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtaatgtaaa 13304593  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  13304592 ttagttaagattgaacacctaaatat 13304567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42611500 - 42611374
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||    
T  42611500 ggaataaattttatgaatataactaataaatttaaggacattcaaatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaa 42611401  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  42611400 attaattaagattgaaaacctaaatat 42611374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31551385 - 31551275
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaatta 115  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||    |||  ||||||||||||||||||    
T  31551385 ttttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaaattgatgtgaaattttaattgttctaagctagttatgtagtgtaaattaatta 31551286  T
Q  116 agattgaacac 126  Q
    |||||||||||    
T  31551285 agattgaacac 31551275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7180863 - 7180780
Alignment:
Q  55 agatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7180863 agatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 7180780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8520482 - 8520413
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  8520482 aatttgatgtaaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 8520413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 134
Target Start/End: Original strand, 19503901 - 19503933
Alignment:
Q  102 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503901 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 19503933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6719713 - 6719643
Alignment:
Q  64 aaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6719713 aaatttgatgtgaaattttaattgtagtaagacctttagtgtaaattaattaagattgaatacctaaatat 6719643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5100464 - 5100395
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  5100464 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagacctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 5100395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 34654209 - 34654250
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaat 42  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34654209 ggttctggaatggaagaaattttatgagtgtaagtgatgaat 34654250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 29390808 - 29390864
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  29390808 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattg 29390864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34858505 - 34858449
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  34858505 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattg 34858449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 37725343 - 37725474
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37725343 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 37725442  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37725443 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaat 37725474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 4738080 - 4738210
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738080 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 4738179  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738180 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 4738210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3906741 - 3906866
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3906741 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 3906840  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3906841 ttaattaagattgaacaccttaatat 3906866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15152765 - 15152635
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152765 ggttctggaatagaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcctgatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 15152666  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15152665 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaa 15152635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25223666 - 25223533
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25223666 ggttctggaatcgaagaaattttataaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 25223567  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25223566 agagtaaattaattaagattgaacaccttaatat 25223533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 2292150 - 2292275
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2292150 aatggaagaaattttatgaatgtaactgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattataagtcttgtggtgtaaa 2292249  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2292250 ttaattaagattgaacaccttaatat 2292275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 14005921 - 14006038
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14005921 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaa 14006020  T
Q  117 gattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14006021 gattgaacactttaatat 14006038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15399175 - 15399042
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399175 ggttctggaatggaagaagttttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagttgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 15399076  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399075 ggtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 15399042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3754732 - 3754860
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3754732 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagttttgtagtgtaaa 3754831  T
Q  109 ttaattaaga---ttgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3754832 ttaattaagatatttgaacaccttaatat 3754860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 42080640 - 42080776
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42080640 ggttttgaaatgaaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaagtttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 42080739  T
Q  101 agtgtaaattaattaaga---ttgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  42080740 agtgtaaattaattaagatatttgaacaccttaatat 42080776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6644840 - 6644719
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6644840 gaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaa 6644741  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| ||| || ||||||||||    
T  6644740 ttaaaatttaaaaccttaatat 6644719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 27551448 - 27551571
Alignment:
Q  11 tggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551448 tggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaagagatccagatggaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaatt 27551547  T
Q  111 aattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27551548 aattaagattgaacaccttaatat 27551571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3851575 - 3851703
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3851575 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 3851674  T
Q  109 ttaattaaga---ttgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  3851675 ttaattatgatatttgaacaccttaatat 3851703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 38282102 - 38282226
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38282102 ggttctggaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttg- 38282200  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
            ||||||||||||||||||||||||||    
T  38282201 --------ttaattaagattgaacaccttaatat 38282226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 77444 - 77559
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  77444 ggttctggaatagaaaaaattttacgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcatgt 77543  T
Q  101 agtgtaaattaattaa 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  77544 agtgtaaattaattaa 77559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Original strand, 28391662 - 28391776
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagat 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  28391662 ttttatgaatgtaagtgatgaatttaaggagatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtggtgtaaattagtttagat 28391761  T
Q  120 tgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||    
T  28391762 tgaacaccttaatat 28391776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Original strand, 39774952 - 39775060
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39774952 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa--aatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgcagtgtaaa 39775049  T
Q  109 ttaattaagat 119  Q
    |||||||||||    
T  39775050 ttaattaagat 39775060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2291543 - 2291418
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||     |||||||||||    
T  2291543 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaggaatttgatgtgaaattttaattgttataagtcaatcctgtagtgtaaa 2291444  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  2291443 ttaattaagattgaacacctaaatat 2291418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 76881 - 76757
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttat--aagtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |   |||| ||||||||||||    
T  76881 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctgccagtcctgtagtgtaaat 76782  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  76781 taattaagattgaacacctaaatat 76757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37724756 - 37724630
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||    
T  37724756 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaggcaatcctgtagtgtaa 37724657  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37724656 attaattaagattgaacacctaaatat 37724630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 15399779 - 15399904
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  15399779 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 15399878  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  15399879 ttaattaagattgaacacctaaatat 15399904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27550858 - 27550733
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  27550858 gaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 27550759  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||    
T  27550758 ttaattaggaatgaacacctaaatat 27550733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38281512 - 38281386
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||| ||    
T  38281512 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttttaaaccagtcctgtagtgcaa 38281413  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  38281412 attaattaagattgaacacctaaatat 38281386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1054386 - 1054261
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     | |||||||||    
T  1054386 gaagaaattttatgaatataactgataaattcaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatttagtgtaaa 1054287  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1054286 ttaattaagattgaacacctaaatat 1054261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 15153354 - 15153471
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  15153354 gaagaaattctatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaa 15153453  T
Q  109 ttaattaagattgaacac 126  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15153454 ttaattaagattgaacac 15153471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28391193 - 28391072
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||| ||||||||    
T  28391193 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtataaattaa 28391094  T
Q  113 ttaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  28391093 ttaagattgaacacctaaatat 28391072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 39967000 - 39967078
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaat 79  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  39967000 ggttctggaattgaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaataaatttgatgtaaaat 39967078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39774427 - 39774306
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||   ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||     ||||||||||||    
T  39774427 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattaagat---agaaatttgatgtgaaattttatttgttctaagtcagtcctgtagtgtaaat 39774331  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  39774330 taattaagattgaacacctaaatat 39774306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3851040 - 3850919
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||||    
T  3851040 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcagat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttttaagcgagtcatgtagtgtaaat 3850944  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  3850943 taattaagattgaacacctaaatat 3850919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3906155 - 3906029
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||    |||| ||||||||||    
T  3906155 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacaatcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagtcagtcctgtagtgtaa 3906056  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3906055 attaattaaaattgaacacctaaatat 3906029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39966410 - 39966284
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  39966410 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaataaatttgatgtgtaattttaattgttctaagcgagtcctgtagtgtaa 39966311  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  39966310 attaattaagattgaatacctaaatat 39966284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40494736 - 40494619
Alignment:
Q  17 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaa 116  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  40494736 aaattttattaacataactgatggatttaaggacatctaaatgaaagaaatttgaagtgaaattttaattgttataagcactatagtgtaaattaattaa 40494637  T
Q  117 gattgaacaccttaatat 134  Q
     ||| ||||||| |||||    
T  40494636 aattaaacacctaaatat 40494619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39068248 - 39068123
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||  ||| |||||||| ||| | ||    |||| |||| ||||||    
T  39068248 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcaaatgaaagaaatttaatgtgaaattttaattgctctaagtcagtcatgtaatgtaaa 39068149  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||    
T  39068148 ttaactaagattgaacacctaaatat 39068123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 4737481 - 4737406
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgt 88  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  4737481 gaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgt 4737406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 40495272 - 40495391
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||| |||   ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||| ||||    
T  40495272 aatggaagaaattgtatgaaggtaaccgatgtatttaaggtcatacggatcaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttataagccctatagtttaaa 40495371  T
Q  109 ttaattaagattgaacacct 128  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  40495372 ttaattaagattgaccacct 40495391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 6645449 - 6645519
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaatttta 83  Q
    |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6645449 gaagaaattttatgaacgtaactcataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttta 6645519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33178946 - 33178890
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33178946 aatttgatgtaaaattttaattgttacaagccttatagtgtaaattaattaagattg 33178890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 42080109 - 42080005
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||||    
T  42080109 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcagat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaat 42080013  T
Q  110 taattaag 117  Q
    ||||||||    
T  42080012 taattaag 42080005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 120
Target Start/End: Original strand, 36602846 - 36602901
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagatt 120  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  36602846 aatttgatgtgaaattttaattgttataagccttatagtgtaaattaattaagatt 36602901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38552069 - 38551990
Alignment:
Q  54 tagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||  ||  || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38552069 tagatgaaagaaatttaatgtaaaattttaattgatataaaccta-taatgtaaattcattaagatttaacaccttaatat 38551990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6319522 - 6319453
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  6319522 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 6319453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Original strand, 6645951 - 6645992
Alignment:
Q  93 agtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6645951 agtcctgttgtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 6645992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18246676 - 18246607
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  18246676 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 18246607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 18248495 - 18248564
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  18248495 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 18248564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33853170 - 33853101
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| ||||||   | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33853170 aatttgatgtgaaattttaattgatataagctatatggtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 33853101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36600922 - 36600853
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  36600922 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 36600853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 14454476 - 14454532
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  14454476 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccatatagtgtaaattaattaagattg 14454532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 121
Target Start/End: Original strand, 38932352 - 38932408
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattg 121  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  38932352 aatttgatgtaaaattttaattgttacaaaccctatagtgtaaattaattaagattg 38932408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 5619 - 5744
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5619 aatggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 5718  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  5719 ttaaataagattgaacaccttaatat 5744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5062 - 4937
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||    |||| |||||||||||    
T  5062 gaagaaattttatgaatgtaactaataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatcttaattgttttaagctagtcatgtagtgtaaa 4963  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  4962 ttaattaagattgaacacctaaatat 4937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 48788 - 48913
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48788 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaacgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaag 48887  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48888 ttaattaagattgaacaccttaatat 48913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46688 - 46558
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata--------agtcttgtagt 103  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||        |||| ||||||    
T  46688 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaagggcattcagatgaaagaattttgatgtgaaattttaattgttctaattaagccagtcatgtagt 46589  T
Q  104 gtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46588 gtagattaattaagattgaacacctaaatat 46558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 20956
Alignment:
Q  1 ggttctgaaatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgt 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21088 ggttctggaatggaaaaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcc-gttgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgt 20990  T
Q  101 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989 agtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 20956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 22764 - 22890
Alignment:
Q  12 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    |||| ||||||| ||    
T  22764 ggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataagccagtcatgtagtgaaa 22863  T
Q  108 attaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22864 attaattaagattgaacacctaaatat 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 5916 - 6041
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5916 aatggaagaaagtttatgaatgtaaatgatgaatttagggaaatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataagtcttgcagtgtaaa 6015  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  6016 ttaattaagattaaacaccttaatat 6041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5219 - 5094
Alignment:
Q  13 gaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc----ttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | |||||| |  |||| ||| ||||| || ||||||||||||     |||||||||||    
T  5219 gaagaaattttatgaatgtaattgataaatttaaggacattcaaatgaaacagttttgatgtgaaattataattgttataagtcagttctgtagtgtaaa 5120  T
Q  109 ttaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  5119 ttaattaagattgaacacctaaatat 5094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 56497 - 56369
Alignment:
Q  9 aatggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56497 aatggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatatgatgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaa 56398  T
Q  109 ttaattaaga---ttgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  56397 ttaattaagatatttgaacaccttaatat 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 57037 - 57158
Alignment:
Q  14 aagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtc----ttgtagtgtaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | ||   ||||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |    |||||||||||||    
T  57037 aagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcaaat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtattgtagtgtaaat 57133  T
Q  110 taattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  57134 taattaagattgaacacctaaatat 57158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18541 - 18423
Alignment:
Q  20 ttttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttggtgtaaaattttatttgttataagtct----tgtagtgtaaattaatta 115  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||     ||||||||||||||||||    
T  18541 ttttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaatta 18442  T
Q  116 agattgaacaccttaatat 134  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  18441 agattaaacacctaaatat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 902 - 971
Alignment:
Q  65 aatttggtgtaaaattttatttgttataagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacaccttaatat 134  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  902 aatttgatgtgaaattttaattgttacaagccctatagtgtaaattaattaagattgtatacctaaatat 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University