View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10119_low_28 (Length: 241)

Name: NF10119_low_28
Description: NF10119
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10119_low_28
NF10119_low_28
[»] chr8 (93 HSPs)
chr8 (7-178)||(17794946-17795117)
chr8 (7-154)||(22145743-22145892)
chr8 (29-154)||(44523194-44523320)
chr8 (7-153)||(28853525-28853671)
chr8 (7-153)||(44431648-44431794)
chr8 (7-140)||(45135291-45135425)
chr8 (7-140)||(44431543-44431676)
chr8 (10-157)||(17614528-17614675)
chr8 (39-154)||(17614609-17614724)
chr8 (10-154)||(17795049-17795191)
chr8 (7-154)||(7301457-7301603)
chr8 (6-170)||(20459858-20460021)
chr8 (7-151)||(6608678-6608822)
chr8 (7-140)||(7301535-7301668)
chr8 (10-153)||(6608603-6608745)
chr8 (7-153)||(19881766-19881912)
chr8 (38-153)||(32949583-32949697)
chr8 (7-154)||(22059737-22059884)
chr8 (10-153)||(28853604-28853745)
chr8 (7-153)||(19881845-19881990)
chr8 (38-153)||(43111949-43112063)
chr8 (39-154)||(45135245-45135359)
chr8 (39-153)||(7301372-7301485)
chr8 (42-169)||(38186102-38186230)
chr8 (10-168)||(21415555-21415713)
chr8 (42-170)||(21861647-21861775)
chr8 (38-153)||(22145695-22145811)
chr8 (10-168)||(363599-363758)
chr8 (7-153)||(22145704-22145851)
chr8 (38-168)||(43111894-43112025)
chr8 (7-166)||(19881713-19881872)
chr8 (78-157)||(15004830-15004909)
chr8 (7-113)||(32949543-32949650)
chr8 (73-153)||(19881962-19882042)
chr8 (7-113)||(363614-363721)
chr8 (7-113)||(43111909-43112016)
chr8 (39-168)||(44431476-44431606)
chr8 (7-112)||(44431492-44431598)
chr8 (39-154)||(7301410-7301525)
chr8 (34-153)||(28853643-28853761)
chr8 (77-153)||(45135402-45135477)
chr8 (67-170)||(20454246-20454348)
chr8 (39-140)||(21415544-21415647)
chr8 (7-153)||(22059698-22059843)
chr8 (77-156)||(32949540-32949618)
chr8 (38-129)||(362181-362273)
chr8 (10-168)||(362193-362351)
chr8 (38-152)||(22059689-22059803)
chr8 (77-153)||(19881923-19881998)
chr8 (38-113)||(24708121-24708197)
chr8 (7-113)||(45135369-45135477)
chr8 (39-153)||(20459915-20460028)
chr8 (29-133)||(22434671-22434778)
chr8 (79-153)||(363693-363767)
chr8 (29-114)||(15267117-15267206)
chr8 (39-153)||(43111988-43112100)
chr8 (79-153)||(44431766-44431840)
chr8 (77-142)||(6608592-6608657)
chr8 (7-113)||(7301613-7301720)
chr8 (77-154)||(7301645-7301721)
chr8 (7-75)||(15004837-15004906)
chr8 (73-154)||(20459952-20460032)
chr8 (77-154)||(24708122-24708198)
chr8 (57-153)||(44523183-44523279)
chr8 (7-153)||(7301418-7301563)
chr8 (73-153)||(21415540-21415620)
chr8 (10-113)||(21861655-21861758)
chr8 (79-154)||(44431726-44431800)
chr8 (39-100)||(17795140-17795202)
chr8 (29-114)||(22521956-22522045)
chr8 (73-154)||(17795127-17795206)
chr8 (77-154)||(22059690-22059766)
chr8 (13-113)||(38186114-38186214)
chr8 (73-153)||(7301368-7301446)
chr8 (73-153)||(45135241-45135319)
chr8 (34-133)||(22434594-22434697)
chr8 (79-154)||(44431608-44431682)
chr8 (77-143)||(15004076-15004141)
chr8 (7-133)||(20385147-20385277)
chr8 (10-75)||(44523254-44523320)
chr8 (7-75)||(21861691-21861759)
chr8 (29-95)||(22434630-22434699)
chr8 (10-113)||(44523215-44523319)
chr8 (38-101)||(15004075-15004139)
chr8 (10-100)||(44431739-44431831)
chr8 (7-113)||(362229-362336)
chr8 (79-114)||(20012323-20012358)
chr8 (28-62)||(15267131-15267165)
chr8 (28-62)||(22521997-22522031)
chr8 (116-153)||(17272816-17272853)
chr8 (80-133)||(33088880-33088933)
chr8 (7-75)||(38186147-38186215)
chr8 (77-133)||(22521886-22521941)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (7-178)||(33848456-33848627)
chr4 (7-178)||(9388389-9388558)
chr4 (17-178)||(16278635-16278796)
chr4 (7-154)||(28382474-28382621)
chr4 (10-154)||(33848559-33848701)
chr4 (10-153)||(16278432-16278573)
chr4 (7-140)||(41791273-41791407)
chr4 (39-175)||(53388033-53388171)
chr4 (10-154)||(15280408-15280552)
chr4 (10-153)||(10313366-10313508)
chr4 (7-140)||(15989930-15990063)
chr4 (7-152)||(14698268-14698413)
chr4 (10-154)||(16359114-16359259)
chr4 (7-154)||(16278506-16278654)
chr4 (7-152)||(4170576-4170721)
chr4 (7-140)||(15242465-15242599)
chr4 (40-157)||(21190078-21190195)
chr4 (10-153)||(4170654-4170796)
chr4 (7-153)||(6511435-6511580)
chr4 (10-153)||(14698346-14698488)
chr4 (7-153)||(14942671-14942817)
chr4 (7-138)||(56116035-56116166)
chr4 (10-140)||(56116156-56116286)
chr4 (38-157)||(13881362-13881482)
chr4 (38-154)||(15242418-15242533)
chr4 (38-154)||(47127139-47127257)
chr4 (10-140)||(55503054-55503183)
chr4 (7-154)||(286739-286887)
chr4 (36-153)||(15449756-15449872)
chr4 (10-153)||(16359155-16359298)
chr4 (38-133)||(14942624-14942719)
chr4 (67-157)||(13877703-13877793)
chr4 (35-153)||(15448432-15448549)
chr4 (42-170)||(24047832-24047960)
chr4 (10-153)||(31117359-31117498)
chr4 (35-170)||(15989740-15989875)
chr4 (39-154)||(41791339-41791453)
chr4 (7-153)||(27027587-27027739)
chr4 (40-168)||(33684861-33684989)
chr4 (38-153)||(286780-286896)
chr4 (73-168)||(20899755-20899849)
chr4 (77-168)||(27027532-27027622)
chr4 (38-119)||(3337084-3337166)
chr4 (10-154)||(6511394-6511538)
chr4 (29-153)||(6511474-6511598)
chr4 (10-153)||(56115918-56116063)
chr4 (38-153)||(6511514-6511628)
chr4 (73-153)||(15990035-15990115)
chr4 (38-153)||(16359195-16359310)
chr4 (62-153)||(3336989-3337079)
chr4 (9-113)||(27027547-27027652)
chr4 (38-153)||(28382515-28382630)
chr4 (7-74)||(3336989-3337056)
chr4 (77-168)||(15242576-15242666)
chr4 (7-74)||(15448482-15448549)
chr4 (7-113)||(33684868-33684974)
chr4 (39-152)||(55503120-55503234)
chr4 (6-84)||(15449804-15449882)
chr4 (7-112)||(55503128-55503234)
chr4 (7-150)||(15989960-15990103)
chr4 (7-154)||(56115955-56116103)
chr4 (38-153)||(55503042-55503156)
chr4 (7-113)||(6511395-6511502)
chr4 (77-168)||(56116263-56116353)
chr4 (20-113)||(15989835-15989928)
chr4 (39-154)||(15989995-15990111)
chr4 (38-153)||(15280396-15280511)
chr4 (7-113)||(16359115-16359223)
chr4 (10-113)||(24047840-24047943)
chr4 (39-126)||(31117463-31117550)
chr4 (74-168)||(18221088-18221183)
chr4 (70-133)||(27027691-27027754)
chr4 (77-153)||(8710573-8710651)
chr4 (7-110)||(15242543-15242648)
chr4 (77-154)||(28382553-28382629)
chr4 (77-153)||(41791220-41791296)
chr4 (73-141)||(53388029-53388097)
chr4 (10-62)||(53388044-53388096)
chr4 (39-153)||(16278421-16278534)
chr4 (39-113)||(20899759-20899834)
chr4 (38-100)||(31117347-31117410)
chr4 (39-153)||(33848599-33848712)
chr4 (7-62)||(47127148-47127203)
chr4 (7-113)||(56116231-56116338)
chr4 (79-153)||(56115909-56115983)
chr4 (77-142)||(4170742-4170807)
chr4 (77-154)||(6511551-6511627)
chr4 (77-154)||(10313443-10313519)
chr4 (7-75)||(13877706-13877775)
chr4 (77-142)||(14698434-14698499)
chr4 (7-113)||(41791220-41791329)
chr4 (39-154)||(56116105-56116221)
chr4 (7-113)||(16278664-16278771)
chr4 (10-62)||(21190126-21190178)
chr4 (38-152)||(15448397-15448509)
chr4 (7-56)||(13881385-13881434)
chr4 (73-154)||(16278417-16278496)
chr4 (7-75)||(16278703-16278772)
chr4 (73-154)||(33848637-33848716)
chr4 (7-95)||(8710551-8710643)
chr4 (7-74)||(31117471-31117537)
chr4 (38-129)||(3336973-3337065)
chr4 (38-113)||(10313444-10313520)
chr4 (6-62)||(18221116-18221173)
chr4 (77-153)||(27027711-27027787)
chr4 (34-95)||(10704512-10704576)
chr4 (34-95)||(10918282-10918346)
chr4 (39-86)||(13877805-13877853)
chr4 (73-113)||(13877817-13877857)
chr4 (121-153)||(31131813-31131845)
chr4 (35-95)||(32489794-32489857)
chr4 (10-76)||(47127191-47127258)
chr4 (31-133)||(18079535-18079641)
chr4 (10-75)||(20899770-20899835)
chr4 (10-75)||(53388084-53388150)
chr4 (77-133)||(10704514-10704571)
chr4 (77-133)||(10918284-10918341)
chr4 (81-133)||(15416856-15416909)
chr4 (77-154)||(31117348-31117423)
chr4 (29-57)||(4616136-4616164)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (7-178)||(23339567-23339738)
chr2 (10-154)||(25035995-25036139)
chr2 (7-154)||(44620583-44620730)
chr2 (39-175)||(20591424-20591561)
chr2 (10-154)||(23339493-23339635)
chr2 (7-140)||(21239491-21239625)
chr2 (7-140)||(21242041-21242175)
chr2 (7-140)||(28348743-28348876)
chr2 (7-152)||(31503137-31503282)
chr2 (38-154)||(24274238-24274354)
chr2 (7-153)||(31503215-31503360)
chr2 (7-152)||(31505703-31505848)
chr2 (7-153)||(31505781-31505926)
chr2 (38-154)||(41685076-41685194)
chr2 (38-168)||(23374868-23374998)
chr2 (10-140)||(31755602-31755731)
chr2 (34-154)||(21239440-21239559)
chr2 (34-154)||(21241990-21242109)
chr2 (7-120)||(24274285-24274399)
chr2 (77-154)||(12628184-12628261)
chr2 (10-140)||(24504344-24504473)
chr2 (7-168)||(10040197-10040361)
chr2 (38-140)||(28352568-28352670)
chr2 (38-168)||(28348676-28348807)
chr2 (38-153)||(44620624-44620739)
chr2 (77-156)||(22109435-22109513)
chr2 (39-152)||(24504293-24504407)
chr2 (77-168)||(28352501-28352591)
chr2 (39-152)||(31755551-31755665)
chr2 (7-112)||(31755551-31755657)
chr2 (77-153)||(21239602-21239677)
chr2 (77-153)||(21242152-21242227)
chr2 (10-113)||(23374883-23374986)
chr2 (88-156)||(24275717-24275784)
chr2 (77-153)||(31503332-31503408)
chr2 (77-153)||(31505898-31505974)
chr2 (38-153)||(31755629-31755743)
chr2 (38-142)||(31503303-31503409)
chr2 (38-142)||(31505869-31505975)
chr2 (7-113)||(21239569-21239677)
chr2 (7-113)||(21242119-21242227)
chr2 (38-153)||(24504371-24504485)
chr2 (7-153)||(25035952-25036098)
chr2 (7-153)||(31503254-31503400)
chr2 (7-113)||(41685085-41685193)
chr2 (10-112)||(24504293-24504396)
chr2 (7-113)||(28348691-28348798)
chr2 (29-153)||(31518274-31518403)
chr2 (77-154)||(44620662-44620738)
chr2 (38-113)||(22109438-22109514)
chr2 (7-153)||(31505820-31505966)
chr2 (39-153)||(23339482-23339595)
chr2 (7-113)||(28352516-28352623)
chr2 (75-153)||(25035942-25036020)
chr2 (73-133)||(31518500-31518561)
chr2 (7-95)||(23085379-23085470)
chr2 (79-154)||(28348808-28348882)
chr2 (7-133)||(31518254-31518385)
chr2 (7-75)||(22109437-22109505)
chr2 (73-154)||(23339478-23339557)
chr2 (77-153)||(24274317-24274392)
chr2 (18-133)||(31518418-31518537)
chr2 (18-133)||(21903105-21903221)
chr2 (10-76)||(41685128-41685195)
chr2 (10-75)||(12628195-12628261)
chr2 (77-153)||(20353407-20353485)
chr2 (77-115)||(23148578-23148616)
chr2 (77-115)||(23560368-23560406)
chr2 (31-114)||(24682706-24682794)
chr2 (7-75)||(20591471-20591540)
chr2 (42-114)||(22840916-22840992)
chr2 (29-62)||(23148593-23148626)
chr2 (29-62)||(23560383-23560416)
chr2 (10-95)||(31518252-31518341)
chr2 (39-153)||(25035944-25036059)
chr2 (7-46)||(24274364-24274403)
chr2 (79-133)||(24528480-24528534)
chr2 (77-133)||(23085421-23085478)
chr2 (77-113)||(43708198-43708235)
chr2 (77-133)||(22841020-22841075)
chr2 (29-57)||(24160205-24160233)
chr2 (42-113)||(24275709-24275781)
[»] scaffold0525 (9 HSPs)
scaffold0525 (10-178)||(8657-8824)
scaffold0525 (7-154)||(11275-11423)
scaffold0525 (7-142)||(8771-8905)
scaffold0525 (38-154)||(11188-11304)
scaffold0525 (39-153)||(8838-8952)
scaffold0525 (7-153)||(11197-11342)
scaffold0525 (10-153)||(8799-8941)
scaffold0525 (73-153)||(8877-8956)
scaffold0525 (7-75)||(8681-8750)
[»] chr1 (74 HSPs)
chr1 (10-178)||(296153-296320)
chr1 (10-154)||(2333382-2333527)
chr1 (7-140)||(45306915-45307049)
chr1 (10-157)||(22900615-22900762)
chr1 (7-154)||(20630926-20631074)
chr1 (39-154)||(22900566-22900681)
chr1 (7-154)||(14432671-14432819)
chr1 (10-153)||(20586733-20586876)
chr1 (7-154)||(36181224-36181372)
chr1 (10-153)||(20579040-20579183)
chr1 (38-165)||(24087117-24087245)
chr1 (13-140)||(293834-293961)
chr1 (10-153)||(2333304-2333446)
chr1 (39-153)||(18823541-18823655)
chr1 (30-131)||(21181466-21181567)
chr1 (7-153)||(20630967-20631113)
chr1 (39-154)||(45306981-45307095)
chr1 (10-170)||(20901001-20901159)
chr1 (7-169)||(28312068-28312232)
chr1 (7-153)||(18823462-18823609)
chr1 (38-153)||(36181265-36181381)
chr1 (39-153)||(20579158-20579271)
chr1 (39-153)||(20586851-20586964)
chr1 (38-153)||(20631007-20631122)
chr1 (38-168)||(28204699-28204830)
chr1 (38-168)||(21181512-21181643)
chr1 (34-154)||(16400611-16400733)
chr1 (77-170)||(18270183-18270275)
chr1 (77-170)||(18274837-18274929)
chr1 (38-168)||(293767-293898)
chr1 (38-153)||(14432662-14432778)
chr1 (10-113)||(20901095-20901199)
chr1 (7-113)||(28204708-28204815)
chr1 (10-114)||(18823461-18823566)
chr1 (7-113)||(18270200-18270307)
chr1 (7-113)||(18274854-18274961)
chr1 (39-153)||(20579119-20579233)
chr1 (39-153)||(20586812-20586926)
chr1 (7-113)||(21181521-21181628)
chr1 (38-154)||(20901094-20901211)
chr1 (77-154)||(37358201-37358277)
chr1 (10-153)||(21181407-21181549)
chr1 (77-153)||(45306863-45306938)
chr1 (7-113)||(293782-293889)
chr1 (7-101)||(19209437-19209532)
chr1 (77-170)||(19209407-19209500)
chr1 (77-154)||(20631045-20631121)
chr1 (73-133)||(18270259-18270319)
chr1 (73-133)||(18274913-18274973)
chr1 (7-113)||(45306863-45306971)
chr1 (7-100)||(20579131-20579225)
chr1 (7-100)||(20586824-20586918)
chr1 (34-131)||(44823101-44823202)
chr1 (81-140)||(19209477-19209536)
chr1 (39-100)||(296269-296331)
chr1 (73-154)||(296256-296335)
chr1 (29-113)||(16400612-16400697)
chr1 (79-153)||(293939-294014)
chr1 (78-133)||(21181397-21181452)
chr1 (18-154)||(21181375-21181511)
chr1 (73-113)||(45918252-45918293)
chr1 (73-113)||(2333289-2333329)
chr1 (73-153)||(20579197-20579275)
chr1 (73-153)||(20586890-20586968)
chr1 (38-113)||(37358202-37358278)
chr1 (10-76)||(36181223-36181290)
chr1 (79-133)||(5380765-5380819)
chr1 (81-150)||(21181359-21181429)
chr1 (10-75)||(24087128-24087194)
chr1 (80-114)||(24959925-24959959)
chr1 (7-75)||(296177-296246)
chr1 (73-113)||(20043868-20043909)
chr1 (7-95)||(8683035-8683127)
chr1 (73-141)||(45307033-45307099)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (7-165)||(22759088-22759246)
chr5 (10-157)||(16256336-16256483)
chr5 (10-157)||(16259930-16260077)
chr5 (7-140)||(26495487-26495621)
chr5 (10-157)||(22593649-22593796)
chr5 (10-157)||(22597204-22597351)
chr5 (39-154)||(16259881-16259996)
chr5 (39-154)||(22590045-22590160)
chr5 (39-154)||(22593600-22593715)
chr5 (39-154)||(22597155-22597270)
chr5 (10-154)||(26361407-26361553)
chr5 (7-140)||(29325606-29325740)
chr5 (10-157)||(22590094-22590241)
chr5 (10-156)||(22469774-22469920)
chr5 (10-154)||(22759013-22759156)
chr5 (29-178)||(27869801-27869950)
chr5 (10-139)||(22357922-22358051)
chr5 (39-154)||(16256286-16256402)
chr5 (34-154)||(26495553-26495672)
chr5 (39-153)||(8953034-8953148)
chr5 (34-153)||(16256243-16256361)
chr5 (39-153)||(43120790-43120904)
chr5 (39-153)||(43124323-43124437)
chr5 (29-168)||(24277637-24277777)
chr5 (29-168)||(24384436-24384576)
chr5 (41-154)||(29325562-29325674)
chr5 (77-165)||(4397426-4397514)
chr5 (10-153)||(23671480-23671622)
chr5 (39-154)||(23693108-23693223)
chr5 (10-170)||(22357962-22358123)
chr5 (39-154)||(23671518-23671633)
chr5 (7-153)||(27869704-27869847)
chr5 (10-100)||(43120881-43120970)
chr5 (10-100)||(43124414-43124503)
chr5 (10-133)||(27869745-27869867)
chr5 (7-101)||(24277655-24277750)
chr5 (7-101)||(24384463-24384558)
chr5 (39-154)||(22357911-22358027)
chr5 (77-153)||(26495435-26495510)
chr5 (77-153)||(29325717-29325792)
chr5 (77-154)||(22469854-22469931)
chr5 (73-153)||(22357907-22357986)
chr5 (10-113)||(23693109-23693212)
chr5 (7-113)||(26495435-26495543)
chr5 (38-153)||(43120869-43120982)
chr5 (38-153)||(43124402-43124515)
chr5 (38-140)||(27869695-27869796)
chr5 (10-153)||(22758973-22759116)
chr5 (23-133)||(22469836-22469947)
chr5 (10-113)||(27869822-27869925)
chr5 (7-113)||(29325684-29325792)
chr5 (29-115)||(8953063-8953150)
chr5 (18-133)||(21559443-21559562)
chr5 (39-153)||(23693148-23693262)
chr5 (7-113)||(43120790-43120896)
chr5 (7-113)||(43124323-43124429)
chr5 (42-150)||(26361399-26361509)
chr5 (10-140)||(16256297-16256427)
chr5 (7-61)||(22357998-22358051)
chr5 (73-154)||(23693186-23693266)
chr5 (29-114)||(17022948-17023038)
chr5 (7-95)||(26706359-26706451)
chr5 (7-95)||(26976093-26976185)
chr5 (29-95)||(7785121-7785188)
chr5 (79-153)||(22758964-22759038)
chr5 (71-153)||(23671558-23671639)
chr5 (77-114)||(22469949-22469986)
chr5 (77-153)||(24277606-24277683)
chr5 (77-153)||(24384530-24384607)
chr5 (80-153)||(26361399-26361472)
chr5 (73-153)||(29325556-29325634)
chr5 (79-154)||(22759004-22759078)
chr5 (78-151)||(26706383-26706458)
chr5 (78-151)||(26976117-26976192)
chr5 (79-133)||(21495001-21495055)
chr5 (73-133)||(7785162-7785223)
chr5 (80-133)||(10035181-10035234)
chr5 (70-153)||(22469950-22470035)
chr5 (7-62)||(22469963-22470020)
[»] chr7 (129 HSPs)
chr7 (7-175)||(13395865-13396035)
chr7 (10-154)||(38827797-38827941)
chr7 (7-154)||(16006007-16006153)
chr7 (7-154)||(48784846-48784993)
chr7 (7-140)||(16005941-16006075)
chr7 (10-154)||(13733852-13733996)
chr7 (17-175)||(17506158-17506316)
chr7 (17-175)||(17546898-17547056)
chr7 (7-140)||(4993111-4993245)
chr7 (7-140)||(8775925-8776059)
chr7 (7-153)||(13849928-13850074)
chr7 (38-168)||(35365924-35366053)
chr7 (7-152)||(21743709-21743854)
chr7 (10-170)||(14189366-14189525)
chr7 (10-154)||(8775991-8776133)
chr7 (38-154)||(13849881-13849996)
chr7 (7-153)||(13395787-13395933)
chr7 (7-168)||(13850006-13850168)
chr7 (10-153)||(21743634-21743776)
chr7 (7-154)||(48784925-48785071)
chr7 (38-153)||(16573169-16573284)
chr7 (38-153)||(16592378-16592493)
chr7 (38-153)||(38827916-38828031)
chr7 (10-140)||(124498-124627)
chr7 (38-152)||(48743284-48743398)
chr7 (39-140)||(4993190-4993291)
chr7 (7-166)||(14192118-14192276)
chr7 (7-154)||(48784964-48785110)
chr7 (39-154)||(16006085-16006199)
chr7 (7-153)||(13255668-13255811)
chr7 (38-131)||(709609-709702)
chr7 (7-169)||(13255414-13255578)
chr7 (7-99)||(21065508-21065600)
chr7 (7-168)||(16573075-16573237)
chr7 (7-168)||(16592425-16592587)
chr7 (38-154)||(48785003-48785119)
chr7 (38-153)||(13395778-13395893)
chr7 (10-153)||(14192083-14192223)
chr7 (10-153)||(17506111-17506254)
chr7 (10-153)||(17546960-17547103)
chr7 (39-154)||(14192072-14192186)
chr7 (8-113)||(14189324-14189430)
chr7 (73-154)||(17506096-17506177)
chr7 (73-154)||(17547037-17547118)
chr7 (46-166)||(47976002-47976121)
chr7 (42-153)||(16458947-16459056)
chr7 (35-170)||(48743227-48743363)
chr7 (34-154)||(16573208-16573326)
chr7 (34-154)||(16592336-16592454)
chr7 (39-152)||(124564-124678)
chr7 (10-113)||(11660764-11660866)
chr7 (7-114)||(13255628-13255734)
chr7 (39-154)||(14189278-14189392)
chr7 (7-112)||(124572-124678)
chr7 (77-167)||(711021-711110)
chr7 (7-170)||(11660747-11660911)
chr7 (35-154)||(14189311-14189431)
chr7 (38-153)||(124486-124600)
chr7 (35-154)||(13255705-13255823)
chr7 (78-153)||(8775873-8775947)
chr7 (29-113)||(711011-711096)
chr7 (38-153)||(13733840-13733955)
chr7 (7-153)||(38827838-38827984)
chr7 (7-101)||(16458919-16459013)
chr7 (73-153)||(40555752-40555834)
chr7 (7-120)||(40555764-40555882)
chr7 (77-154)||(13395779-13395855)
chr7 (39-153)||(8776031-8776144)
chr7 (7-113)||(14189402-14189508)
chr7 (38-133)||(15731803-15731902)
chr7 (7-140)||(709656-709777)
chr7 (39-153)||(4993059-4993175)
chr7 (107-157)||(13407736-13407786)
chr7 (39-156)||(16458904-16459021)
chr7 (79-153)||(21065462-21065536)
chr7 (7-64)||(709722-709779)
chr7 (38-133)||(15725457-15725554)
chr7 (77-142)||(21743623-21743688)
chr7 (7-113)||(8775873-8775981)
chr7 (77-153)||(16005889-16005964)
chr7 (74-168)||(13865390-13865485)
chr7 (7-62)||(17506187-17506241)
chr7 (7-62)||(17546973-17547027)
chr7 (29-132)||(22122709-22122816)
chr7 (29-132)||(40555910-40556017)
chr7 (10-74)||(4993099-4993164)
chr7 (73-154)||(14192068-14192147)
chr7 (77-132)||(8757396-8757452)
chr7 (7-74)||(16005929-16005997)
chr7 (73-153)||(16006125-16006203)
chr7 (35-114)||(16668616-16668699)
chr7 (35-114)||(17642986-17643069)
chr7 (107-167)||(21735541-21735601)
chr7 (7-133)||(4324975-4325106)
chr7 (7-133)||(7507505-7507636)
chr7 (30-133)||(7507570-7507677)
chr7 (7-133)||(7507628-7507759)
chr7 (79-154)||(21065502-21065576)
chr7 (35-114)||(21519342-21519424)
chr7 (7-62)||(48743296-48743351)
chr7 (38-72)||(47975967-47976001)
chr7 (7-75)||(17506226-17506295)
chr7 (7-75)||(17546919-17546988)
chr7 (6-62)||(21735517-21735574)
chr7 (7-95)||(12202057-12202149)
chr7 (35-114)||(14038579-14038662)
chr7 (35-114)||(14348609-14348692)
chr7 (39-114)||(15689865-15689944)
chr7 (39-114)||(15697458-15697537)
chr7 (10-95)||(15725455-15725542)
chr7 (10-100)||(21065471-21065563)
chr7 (8-54)||(22122769-22122816)
chr7 (8-54)||(40555970-40556017)
chr7 (77-153)||(4324913-4324991)
chr7 (77-153)||(4325036-4325114)
chr7 (80-114)||(17065655-17065689)
chr7 (10-153)||(22122648-22122797)
chr7 (79-133)||(23442324-23442378)
chr7 (77-133)||(7507497-7507554)
chr7 (73-142)||(8776080-8776148)
chr7 (29-153)||(40555869-40555998)
chr7 (34-113)||(44190974-44191058)
chr7 (18-54)||(8757416-8757452)
chr7 (77-151)||(12202049-12202125)
chr7 (29-95)||(12202121-12202189)
chr7 (7-95)||(12208671-12208763)
chr7 (121-153)||(12757143-12757175)
chr7 (7-62)||(13407753-13407809)
chr7 (7-62)||(13865401-13865457)
[»] chr3 (126 HSPs)
chr3 (7-168)||(179747-179909)
chr3 (7-175)||(16799347-16799516)
chr3 (7-154)||(23396066-23396214)
chr3 (10-154)||(15010461-15010605)
chr3 (34-153)||(52338959-52339078)
chr3 (10-140)||(54972935-54973066)
chr3 (10-140)||(54975545-54975676)
chr3 (10-140)||(54978155-54978286)
chr3 (7-133)||(10989921-10990047)
chr3 (7-154)||(2035345-2035493)
chr3 (7-154)||(2039086-2039234)
chr3 (7-154)||(2042827-2042975)
chr3 (7-154)||(14037826-14037974)
chr3 (7-154)||(14041294-14041442)
chr3 (10-153)||(10554073-10554215)
chr3 (38-154)||(603939-604056)
chr3 (38-153)||(14951842-14951958)
chr3 (7-152)||(18958546-18958693)
chr3 (39-154)||(179701-179816)
chr3 (7-153)||(2039047-2039193)
chr3 (7-153)||(2042788-2042934)
chr3 (38-153)||(6806018-6806132)
chr3 (7-114)||(10553994-10554101)
chr3 (10-132)||(52339053-52339175)
chr3 (39-154)||(16799487-16799604)
chr3 (38-154)||(39230430-39230546)
chr3 (7-154)||(2038852-2038998)
chr3 (7-154)||(2038930-2039076)
chr3 (7-154)||(2038969-2039115)
chr3 (7-154)||(2042593-2042739)
chr3 (7-154)||(2042671-2042817)
chr3 (7-154)||(2042710-2042856)
chr3 (7-153)||(2035306-2035452)
chr3 (7-154)||(2038813-2038959)
chr3 (7-154)||(2042554-2042700)
chr3 (39-153)||(54973081-54973194)
chr3 (39-153)||(54975691-54975804)
chr3 (39-153)||(54978301-54978414)
chr3 (77-154)||(7631933-7632010)
chr3 (10-153)||(16799409-16799553)
chr3 (77-178)||(55292743-55292843)
chr3 (7-170)||(23396145-23396308)
chr3 (77-157)||(30206558-30206638)
chr3 (7-113)||(6806065-6806172)
chr3 (38-154)||(2038804-2038920)
chr3 (38-154)||(2042545-2042661)
chr3 (77-154)||(54046463-54046540)
chr3 (7-154)||(54973001-54973148)
chr3 (7-154)||(54975611-54975758)
chr3 (7-154)||(54978221-54978368)
chr3 (38-153)||(2035297-2035412)
chr3 (38-153)||(14037867-14037983)
chr3 (38-153)||(14041335-14041451)
chr3 (10-153)||(16799449-16799593)
chr3 (38-168)||(6806056-6806187)
chr3 (43-170)||(10834465-10834592)
chr3 (28-169)||(1989349-1989491)
chr3 (7-133)||(3395009-3395140)
chr3 (39-153)||(54973041-54973156)
chr3 (39-153)||(54975651-54975766)
chr3 (39-153)||(54978261-54978376)
chr3 (8-133)||(6819033-6819160)
chr3 (39-168)||(10989991-10990121)
chr3 (77-168)||(17211123-17211213)
chr3 (73-154)||(18958625-18958705)
chr3 (38-168)||(52339119-52339250)
chr3 (73-153)||(3394997-3395079)
chr3 (7-75)||(30206566-30206635)
chr3 (10-113)||(1989371-1989475)
chr3 (38-153)||(10554113-10554227)
chr3 (38-153)||(15010449-15010564)
chr3 (73-153)||(16799528-16799608)
chr3 (39-138)||(18958602-18958701)
chr3 (73-153)||(23396054-23396133)
chr3 (7-113)||(10989999-10990106)
chr3 (7-62)||(52339010-52339065)
chr3 (7-113)||(52339128-52339235)
chr3 (77-152)||(54972884-54972958)
chr3 (77-152)||(54975494-54975568)
chr3 (77-152)||(54978104-54978178)
chr3 (10-130)||(6818963-6819078)
chr3 (77-154)||(2035298-2035374)
chr3 (39-154)||(10554033-10554149)
chr3 (7-74)||(14951890-14951958)
chr3 (77-168)||(6818887-6818976)
chr3 (7-113)||(39230431-39230537)
chr3 (7-112)||(54972884-54972991)
chr3 (7-112)||(54975494-54975601)
chr3 (7-112)||(54978104-54978211)
chr3 (79-153)||(10989875-10989949)
chr3 (10-153)||(14951789-14951918)
chr3 (38-154)||(52339001-52339118)
chr3 (10-113)||(14951854-14951958)
chr3 (39-101)||(14951778-14951841)
chr3 (73-142)||(14951774-14951842)
chr3 (77-154)||(15010450-15010526)
chr3 (10-62)||(603951-604002)
chr3 (38-113)||(17211138-17211214)
chr3 (73-153)||(54973120-54973198)
chr3 (73-153)||(54975730-54975808)
chr3 (73-153)||(54978340-54978418)
chr3 (38-113)||(55292742-55292818)
chr3 (79-114)||(9884-9919)
chr3 (10-76)||(2035427-2035494)
chr3 (10-76)||(2039168-2039235)
chr3 (10-76)||(2042909-2042976)
chr3 (79-154)||(10989915-10989989)
chr3 (10-75)||(7631933-7631999)
chr3 (28-62)||(12856058-12856092)
chr3 (39-133)||(15232141-15232239)
chr3 (39-133)||(15238009-15238107)
chr3 (77-126)||(43928391-43928441)
chr3 (10-75)||(54046463-54046529)
chr3 (10-153)||(10989884-10990027)
chr3 (10-74)||(10834472-10834535)
chr3 (79-115)||(35984717-35984753)
chr3 (10-153)||(12855959-12856105)
chr3 (18-57)||(18367772-18367811)
chr3 (7-57)||(52213463-52213514)
chr3 (10-75)||(603990-604056)
chr3 (12-74)||(6818941-6819003)
chr3 (96-153)||(18367772-18367830)
chr3 (77-114)||(12856069-12856106)
chr3 (80-133)||(42109185-42109238)
chr3 (29-57)||(3395114-3395142)
chr3 (38-74)||(15446424-15446460)
[»] scaffold0500 (4 HSPs)
scaffold0500 (7-157)||(11736-11887)
scaffold0500 (7-153)||(11696-11843)
scaffold0500 (39-154)||(11688-11805)
scaffold0500 (73-153)||(11684-11764)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (7-175)||(2288246-2288415)
chr6 (7-175)||(15538810-15538980)
chr6 (7-170)||(13763942-13764104)
chr6 (7-165)||(15686436-15686594)
chr6 (7-140)||(8522533-8522667)
chr6 (7-154)||(16101992-16102140)
chr6 (10-153)||(23621251-23621394)
chr6 (38-152)||(29492446-29492561)
chr6 (38-154)||(16829487-16829604)
chr6 (40-154)||(16812467-16812582)
chr6 (7-114)||(13764231-13764338)
chr6 (7-154)||(13764270-13764416)
chr6 (7-154)||(12595607-12595754)
chr6 (42-170)||(23352115-23352243)
chr6 (39-154)||(8522599-8522713)
chr6 (7-132)||(13764057-13764182)
chr6 (51-154)||(16804648-16804752)
chr6 (41-170)||(221618-221747)
chr6 (39-153)||(15538952-15539068)
chr6 (38-153)||(16102033-16102149)
chr6 (39-153)||(24440865-24440978)
chr6 (7-133)||(13764134-13764260)
chr6 (7-153)||(15538912-15539060)
chr6 (7-153)||(13764349-13764494)
chr6 (39-155)||(29848499-29848615)
chr6 (34-154)||(23621196-23621316)
chr6 (77-153)||(8522481-8522556)
chr6 (10-153)||(23621212-23621354)
chr6 (67-170)||(24266659-24266762)
chr6 (39-153)||(15686428-15686542)
chr6 (7-113)||(8522481-8522589)
chr6 (38-153)||(12595648-12595763)
chr6 (73-141)||(15539004-15539072)
chr6 (10-113)||(23352132-23352235)
chr6 (73-154)||(2288234-2288315)
chr6 (38-133)||(1584259-1584358)
chr6 (34-133)||(12389545-12389648)
chr6 (73-153)||(13751328-13751411)
chr6 (8-133)||(1639059-1639189)
chr6 (73-154)||(15686424-15686504)
chr6 (7-74)||(23621326-23621394)
chr6 (73-153)||(29848495-29848573)
chr6 (7-133)||(12389463-12389594)
chr6 (7-74)||(29848507-29848573)
chr6 (77-154)||(12595686-12595762)
chr6 (10-113)||(221635-221738)
chr6 (39-153)||(2288238-2288353)
chr6 (73-153)||(8522639-8522717)
chr6 (35-153)||(13764076-13764194)
chr6 (10-62)||(16829541-16829592)
chr6 (29-114)||(24440864-24440949)
chr6 (77-153)||(25806922-25807000)
chr6 (10-141)||(13764244-13764373)
chr6 (10-95)||(21469786-21469870)
chr6 (10-114)||(29265486-29265593)
chr6 (10-62)||(16812521-16812572)
chr6 (7-133)||(25806861-25806992)
chr6 (10-62)||(29492498-29492549)
chr6 (78-133)||(9185938-9185992)
chr6 (11-62)||(16804702-16804752)
chr6 (10-76)||(16812466-16812533)
chr6 (10-76)||(16829486-16829553)
chr6 (79-114)||(18137479-18137514)
chr6 (29-114)||(9186007-9186096)
chr6 (28-62)||(18137493-18137527)
chr6 (79-153)||(21469807-21469879)
chr6 (65-133)||(1590639-1590708)
chr6 (73-110)||(13764469-13764506)
chr6 (73-113)||(24266782-24266822)
chr6 (10-62)||(29492458-29492510)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (7-157)||(13994-14146)
scaffold0381 (73-153)||(13982-14062)
[»] scaffold0026 (9 HSPs)
scaffold0026 (8-168)||(20788-20950)
scaffold0026 (8-153)||(20883-21029)
scaffold0026 (38-153)||(20963-21076)
scaffold0026 (10-168)||(23866-24025)
scaffold0026 (49-153)||(23921-24026)
scaffold0026 (7-62)||(20856-20911)
scaffold0026 (14-114)||(35577-35678)
scaffold0026 (7-113)||(23881-23989)
scaffold0026 (79-114)||(24707-24742)
[»] scaffold0003 (6 HSPs)
scaffold0003 (7-153)||(137562-137708)
scaffold0003 (7-168)||(137468-137630)
scaffold0003 (79-153)||(137680-137754)
scaffold0003 (79-133)||(81269-81323)
scaffold0003 (79-155)||(137639-137714)
scaffold0003 (10-100)||(137653-137745)
[»] scaffold0109 (7 HSPs)
scaffold0109 (7-139)||(2140-2272)
scaffold0109 (7-140)||(2061-2194)
scaffold0109 (77-168)||(1994-2084)
scaffold0109 (79-153)||(2244-2318)
scaffold0109 (8-113)||(2009-2115)
scaffold0109 (10-153)||(2166-2309)
scaffold0109 (79-154)||(2204-2278)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (7-152)||(32741-32886)
scaffold0141 (10-133)||(32838-32960)
scaffold0141 (38-153)||(32858-32972)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (7-152)||(81926-82071)
scaffold0049 (10-133)||(81852-81974)
scaffold0049 (38-153)||(81840-81954)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (39-154)||(134263-134380)
scaffold0021 (10-113)||(134274-134379)
scaffold0021 (10-76)||(134314-134381)
[»] scaffold0004 (8 HSPs)
scaffold0004 (10-168)||(59151-59307)
scaffold0004 (7-154)||(59242-59389)
scaffold0004 (7-133)||(205352-205483)
scaffold0004 (73-154)||(59320-59401)
scaffold0004 (77-153)||(205344-205422)
scaffold0004 (39-152)||(59283-59397)
scaffold0004 (35-114)||(384090-384173)
scaffold0004 (28-62)||(384104-384138)
[»] scaffold0008 (10 HSPs)
scaffold0008 (7-153)||(12516-12662)
scaffold0008 (7-101)||(12595-12689)
scaffold0008 (7-146)||(13158-13296)
scaffold0008 (7-154)||(13078-13226)
scaffold0008 (73-153)||(12504-12583)
scaffold0008 (73-153)||(13066-13146)
scaffold0008 (10-142)||(12559-12690)
scaffold0008 (11-114)||(124965-125073)
scaffold0008 (77-141)||(13030-13094)
scaffold0008 (89-133)||(124965-125009)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (10-166)||(50684-50840)
scaffold0042 (39-110)||(50939-51010)
scaffold0042 (7-153)||(50815-50964)
scaffold0042 (39-154)||(50774-50893)
[»] scaffold0860 (2 HSPs)
scaffold0860 (7-157)||(148-298)
scaffold0860 (38-154)||(230-346)
[»] scaffold0609 (3 HSPs)
scaffold0609 (7-157)||(4313-4463)
scaffold0609 (10-154)||(4395-4538)
scaffold0609 (40-154)||(4434-4548)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (7-153)||(3951-4096)
scaffold0338 (10-170)||(3994-4153)
scaffold0338 (73-153)||(3939-4018)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (38-140)||(6088-6190)
scaffold0044 (77-154)||(6167-6243)
scaffold0044 (7-113)||(6135-6242)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (39-140)||(2830-2931)
scaffold0107 (38-154)||(2777-2894)
scaffold0107 (7-74)||(2818-2885)
[»] scaffold0825 (4 HSPs)
scaffold0825 (7-139)||(1813-1945)
scaffold0825 (38-168)||(1882-2013)
scaffold0825 (10-74)||(1894-1958)
scaffold0825 (77-126)||(1805-1854)
[»] scaffold0586 (3 HSPs)
scaffold0586 (10-168)||(1488-1646)
scaffold0586 (39-140)||(1554-1657)
scaffold0586 (73-153)||(1581-1661)
[»] scaffold0151 (6 HSPs)
scaffold0151 (38-153)||(2161-2276)
scaffold0151 (38-153)||(9005-9120)
scaffold0151 (10-168)||(2106-2264)
scaffold0151 (10-168)||(8950-9108)
scaffold0151 (7-74)||(2161-2228)
scaffold0151 (7-74)||(9005-9072)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (7-153)||(40183-40328)
scaffold0058 (40-154)||(40137-40251)
scaffold0058 (10-153)||(40147-40289)
scaffold0058 (10-173)||(40225-40388)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (7-168)||(6709-6873)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (39-126)||(1417-1505)
scaffold0131 (73-153)||(1430-1509)
scaffold0131 (7-51)||(1414-1458)
scaffold0131 (10-62)||(1443-1494)
[»] scaffold0126 (3 HSPs)
scaffold0126 (35-168)||(5685-5819)
scaffold0126 (38-140)||(5752-5854)
scaffold0126 (7-113)||(5700-5807)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (48-133)||(165629-165714)
scaffold0007 (7-55)||(165666-165714)
[»] scaffold0395 (7 HSPs)
scaffold0395 (7-153)||(8967-9112)
scaffold0395 (10-141)||(8850-8983)
scaffold0395 (10-100)||(8930-9021)
scaffold0395 (7-153)||(8807-8955)
scaffold0395 (7-140)||(8887-9021)
scaffold0395 (79-153)||(8801-8875)
scaffold0395 (35-114)||(10019-10102)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (8-157)||(34925-35074)
scaffold0034 (7-133)||(34885-35011)
scaffold0034 (38-153)||(34876-34991)
scaffold0034 (77-154)||(34877-34953)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (41-170)||(223630-223759)
scaffold0012 (10-74)||(223639-223702)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (30-168)||(13898-14035)
scaffold0447 (35-154)||(13989-14113)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (30-168)||(11893-12030)
scaffold0383 (35-154)||(11984-12108)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (38-154)||(9618-9735)
scaffold0556 (108-170)||(9546-9608)
scaffold0556 (10-113)||(9619-9723)
[»] scaffold1098 (4 HSPs)
scaffold1098 (10-168)||(1050-1209)
scaffold1098 (49-153)||(1105-1210)
scaffold1098 (7-113)||(1065-1173)
scaffold1098 (79-114)||(1891-1926)
[»] scaffold0413 (4 HSPs)
scaffold0413 (78-168)||(10554-10643)
scaffold0413 (7-74)||(10609-10676)
scaffold0413 (67-153)||(10609-10694)
scaffold0413 (77-153)||(10648-10723)
[»] scaffold0491 (3 HSPs)
scaffold0491 (73-154)||(10466-10546)
scaffold0491 (39-113)||(10467-10542)
scaffold0491 (10-75)||(10466-10531)
[»] scaffold1276 (2 HSPs)
scaffold1276 (77-157)||(128-207)
scaffold1276 (38-113)||(132-208)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (29-133)||(29351-29459)
scaffold0180 (80-153)||(29323-29398)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (29-133)||(20683-20791)
scaffold0106 (81-153)||(20744-20818)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (73-153)||(91-174)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (107-168)||(120021-120082)
scaffold0016 (73-113)||(174911-174952)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (5-120)||(151-271)
[»] scaffold0216 (3 HSPs)
scaffold0216 (80-170)||(21233-21322)
scaffold0216 (79-132)||(21352-21404)
scaffold0216 (42-101)||(21262-21322)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (18-133)||(33625-33743)
scaffold0117 (29-57)||(33623-33651)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (29-114)||(21838-21927)
scaffold0011 (28-62)||(21879-21913)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (79-133)||(524714-524768)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (75-153)||(6615-6696)
scaffold0273 (7-95)||(6552-6644)
scaffold0273 (77-133)||(6595-6652)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (35-94)||(2808-2869)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (35-114)||(177909-177992)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (79-114)||(20775-20810)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (79-133)||(3666-3720)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (79-133)||(17929-17983)
scaffold0165 (79-114)||(17865-17900)
[»] scaffold1336 (1 HSPs)
scaffold1336 (35-114)||(877-958)
[»] scaffold0453 (2 HSPs)
scaffold0453 (77-133)||(3036-3093)
scaffold0453 (8-133)||(2954-3084)
[»] scaffold0069 (4 HSPs)
scaffold0069 (35-114)||(34475-34558)
scaffold0069 (28-62)||(34489-34523)
scaffold0069 (77-133)||(29300-29355)
scaffold0069 (77-133)||(34538-34593)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (18-133)||(1549-1668)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (79-114)||(30-65)
[»] scaffold0364 (4 HSPs)
scaffold0364 (38-133)||(7048-7147)
scaffold0364 (34-133)||(7089-7191)
scaffold0364 (77-153)||(7109-7186)
scaffold0364 (29-57)||(7087-7115)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (79-114)||(27043-27078)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (31-133)||(16107-16213)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (80-114)||(7227-7261)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (79-133)||(25570-25624)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (79-133)||(92723-92776)
scaffold0028 (7-114)||(92729-92840)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (73-101)||(2742-2770)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (35-114)||(8572-8655)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (38-74)||(15732-15768)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 93)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17795117 - 17794946
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795117 cttatgccctggaatgttttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 17795018  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795017 cattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 17794946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 22145743 - 22145892
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22145743 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 22145842  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145843 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 22145892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Original strand, 44523194 - 44523320
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44523194 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 44523293  T
Q  128 atgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44523294 atgccccggaatgcttagtcattcaac 44523320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28853671 - 28853525
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |       
T  28853671 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgtc-ca 28853573  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853572 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 28853525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44431794 - 44431648
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  44431794 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccattgagggcttatgccctgtaacgccttgt 44431695  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||  | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44431694 cattcaaagcggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 44431648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 45135291 - 45135425
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45135291 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaactgccttg 45135390  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45135391 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 45135425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44431676 - 44431543
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44431676 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgaaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 44431577  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  44431576 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 44431543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17614675 - 17614528
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  17614675 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-ttcatca 17614577  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17614576 ttcaaattgttgggggcttacgctccggaatgcttagtcattcaacacg 17614528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17614724 - 17614609
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17614724 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 17614625  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17614624 tgctttgtcattcaac 17614609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17795191 - 17795049
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17795191 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgttttgtcat 17795093  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17795092 tcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 17795049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 7301457 - 7301603
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301457 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 7301556  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||| | |||||| ||| |||||||||    
T  7301557 cattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-ttaatcattcaac 7301603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20460021 - 20459858
Alignment:
Q  6 acttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20460021 acttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-tt 20459924  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20459923 atcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 20459858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 6608678 - 6608822
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  6608678 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 6608776  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattc 151  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6608777 tcattcaaagtgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattc 6608822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 7301535 - 7301668
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7301535 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgaattgccttgt 7301634  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  7301635 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 7301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 6608603 - 6608745
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608603 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 6608702  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6608703 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 6608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19881912 - 19881766
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19881912 cttatgccctggaatgctttttcattcaaactgttgagggcttatgccatggaatgtttatcattcaaactgttgacggcttatgccctggaatgccttg 19881813  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  19881812 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 19881766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32949697 - 32949583
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  32949697 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 32949598  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  32949597 atgttta-tcattcaa 32949583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 22059737 - 22059884
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22059737 cttatgcccagggatgctatgtcattcaact-gttgatggcttatgccctggaatgctttgtcattcagctgttgagggctcatgccctggaatgccttg 22059835  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22059836 tcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaac 22059884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28853745 - 28853604
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853745 atgccctggaatgctttgtcgttcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 28853647  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  28853646 tcaatttgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 28853604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19881990 - 19881845
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || |    
T  19881990 cttatgccccggaatgccttgtcattcaaattgtcgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagtgcttatgccctggaatgcttttt 19881891  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  19881890 cattcaaactgttgagggcttatgccatggaatgttta-tcattcaa 19881845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43112063 - 43111949
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  43112063 tgttgagggctcatgccttggaatattaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 43111964  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  43111963 atgttta-tcattcaa 43111949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 45135245 - 45135359
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  45135245 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 45135344  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    || ||| |||||||||    
T  45135345 tg-ttaatcattcaac 45135359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 7301372 - 7301485
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7301372 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 7301470  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  7301471 tgccttgtcattcaa 7301485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 169
Target Start/End: Original strand, 38186102 - 38186230
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccc-tggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38186102 gagggctcatgcccctggaatgctttgtcattcaaccgttgatggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 38186200  T
Q  140 gcttagtcattcaacacgatggaaatggtg 169  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  38186201 gcttagtcattcaacatgttgaaaatggtg 38186230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 21415555 - 21415713
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  21415555 atgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttcatc 21415653  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21415654 attc-aattgctgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 21415713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 21861647 - 21861775
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21861647 gagggctcatgccctagaatgctttgtcattcaactactgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatg 21861745  T
Q  141 cttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21861746 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 21861775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 22145695 - 22145811
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  22145695 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcatttaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctgg 22145794  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22145795 aatgctttgtcattcaa 22145811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 363758 - 363599
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  363758 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggactgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatc 363660  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  363659 attcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 363599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 22145704 - 22145851
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22145704 cttatgccctggaatgctatgtcatt-taactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgcttt 22145802  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  22145803 gtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 22145851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43112025 - 43111894
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43112025 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatcccccg 43111927  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43111926 gaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 43111894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19881872 - 19881713
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||| |||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  19881872 cttatgccatggaatg-tttatcattcaaactgttgacggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-tt 19881775  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 166  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19881774 atcattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatg 19881713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 157
Target Start/End: Original strand, 15004830 - 15004909
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15004830 ttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggtttatgctctggaatgcttagtcattcaacacg 15004909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 32949650 - 32949543
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||| | |    
T  32949650 cttatgccttggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctagaatgcttag 32949551  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  32949550 tcattcaa 32949543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19882042 - 19881962
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19882042 aaccgttgagggcttatgccctagaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccccggaatgccttgtcattcaa 19881962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 363721 - 363614
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | |    
T  363721 cttatgccctggactgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttag 363622  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  363621 tcattcaa 363614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43112016 - 43111909
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| | |    
T  43112016 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatcccccggaatgcttag 43111917  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  43111916 tcattcaa 43111909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44431606 - 44431476
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44431606 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgagggcttatgccccgg 44431508  T
Q  137 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  44431507 aatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 44431476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 44431598 - 44431492
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  44431598 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttag 44431499  T
Q  106 tcattca 112  Q
    |||||||    
T  44431498 tcattca 44431492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 7301410 - 7301525
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||    
T  7301410 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctgga 7301509  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  7301510 atg-ttaatcattcaac 7301525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28853761 - 28853643
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  28853761 aaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcgttcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgcc 28853664  T
Q  133 ccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    | ||||||| | |||||||||    
T  28853663 ctggaatgccttgtcattcaa 28853643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 45135402 - 45135477
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135402 gttgagggctcatgccctggaatgtcca-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 45135477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20454348 - 20454246
Alignment:
Q  67 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20454348 tcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgt-ttatcattcaaattatcaggggcttatgccctgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatg 20454250  T
Q  167 gtgc 170  Q
    ||||    
T  20454249 gtgc 20454246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Original strand, 21415544 - 21415647
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||    
T  21415544 gttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 21415643  T
Q  137 aatg 140  Q
    ||||    
T  21415644 aatg 21415647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 22059698 - 22059843
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| || ||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22059698 cttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgctttg 22059796  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |  ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  22059797 tcattc-agctgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 22059843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32949618 - 32949540
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32949618 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccctagaatgcttagtcattcaacac 32949540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 362181 - 362273
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  362181 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccctataataccttgtcattcaaactgttgagggcttat 362273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 362193 - 362351
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||||||  |||   |  |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||  || ||    
T  362193 atgccctggaatgctttgtcattcaacta-ttgagggcttatgccctataataccttgtcattcaaactgttgagggcttataccctagaatgt-ttatc 362290  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||    
T  362291 attcaaattgttgggggcttaagccccggaatacctagtcattcaacacgttgaaaatggt 362351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Original strand, 22059689 - 22059803
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || |||||  ||||||||||| ||    
T  22059689 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattc-aactgttgatggcttatgccctgg 22059787  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22059788 aatgctttgtcattca 22059803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19881998 - 19881923
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  19881998 gttgagggcttatgccccggaatgccttgtcattcaaattgtcgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 19881923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Original strand, 24708121 - 24708197
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24708121 tgttgagggctcatgccctagaatgctatgtcattcaaccgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 24708197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 45135369 - 45135477
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaa-tgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  45135369 cttatgccctggaactgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgtccatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 45135468  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  45135469 gtcattcaa 45135477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20460028 - 20459915
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  20460028 gttgaggacttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgga 20459930  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  20459929 atgttta-tcattcaa 20459915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 22434671 - 22434778
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggc 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||    
T  22434671 cattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggc 22434770  T
Q  126 ttatgccc 133  Q
    ||||||||    
T  22434771 ttatgccc 22434778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 363767 - 363693
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  363767 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggactgctttgtcattcaa 363693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15267206 - 15267117
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15267206 cattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 15267117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43112100 - 43111988
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||   |  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  43112100 gttgaggactcatgtcctggaatgttaatcattcaactgttgagggctcatgccttggaat-attaatcattc-aactgttgagggcttatgccctggaa 43112003  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  43112002 tgccttgtcattcaa 43111988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44431840 - 44431766
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44431840 tgagggctcatgccttggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 44431766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 142
Target Start/End: Original strand, 6608592 - 6608657
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  6608592 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 6608657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 7301613 - 7301720
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa--ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||| | ||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  7301613 cttatgccctgaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaatttgttg-gggcttatgccccggaatgctta 7301711  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  7301712 gtcattcaa 7301720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 7301645 - 7301721
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301645 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaatttgttggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7301721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 15004837 - 15004906
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  15004837 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggtttatgctctggaatgcttagtcattcaac 15004906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20460032 - 20459952
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20460032 aaccgttgaggacttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgacggcttatgccctagaatgctttgtcattcaac 20459952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 24708122 - 24708198
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708122 gttgagggctcatgccctagaatgctatgtcattcaacc-gttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 24708198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Original strand, 44523183 - 44523279
Alignment:
Q  57 ggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  44523183 ggaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 44523279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 7301418 - 7301563
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||  |     
T  7301418 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-tta 7301515  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7301516 atcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 7301563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 21415540 - 21415620
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  21415540 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 21415620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 21861655 - 21861758
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  21861655 atgccctagaatgctttgtcattcaactact-gagggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtca 21861753  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  21861754 ttcaa 21861758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44431800 - 44431726
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  44431800 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 44431726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17795202 - 17795140
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  17795202 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 17795140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 22521956 - 22522045
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22521956 cattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaa 22522045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17795206 - 17795127
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17795206 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 17795127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 22059690 - 22059766
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||  ||||||||||    
T  22059690 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgcccagggatgctatgtcattcaac 22059766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 38186114 - 38186214
Alignment:
Q  13 ccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  38186114 ccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgatggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattc 38186212  T
Q  112 aa 113  Q
    ||    
T  38186213 aa 38186214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 7301368 - 7301446
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7301368 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 7301446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 45135241 - 45135319
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  45135241 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 45135319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Original strand, 22434594 - 22434697
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttat 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22434594 aaatcgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcat 22434693  T
Q  130 gccc 133  Q
    ||||    
T  22434694 gccc 22434697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44431682 - 44431608
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| | |||| ||| |||||||||    
T  44431682 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgaaatg-ttaatcattcaac 44431608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 143
Target Start/End: Original strand, 15004076 - 15004141
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctt 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15004076 gttgagggcttatgccctagaatgctttgttattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctt 15004141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20385277 - 20385147
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgcc 102  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||     
T  20385277 cttatgccctgtgaaggccttgtcgttcaaactgttgagggctcatgccttgtggatgttaatcattcaaactgttgaggactcatgccctgtgaatgct 20385178  T
Q  103 ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
       || |||||||||||| ||||||||||||    
T  20385177 agttcgttcaaattgttgagggcttatgccc 20385147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 44523254 - 44523320
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  44523254 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 44523320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 21861691 - 21861759
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21861691 cttatgccctggaatg-tttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 21861759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Original strand, 22434630 - 22434699
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  22434630 cattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctg 22434699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 44523215 - 44523319
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  44523215 atgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 44523313  T
Q  108 attcaa 113  Q
    ||||||    
T  44523314 attcaa 44523319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 101
Target Start/End: Original strand, 15004075 - 15004139
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15004075 tgttgagggcttatgccctagaatgctttgttattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 15004139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44431831 - 44431739
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    ||||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  44431831 atgccttggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 44431739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 362229 - 362336
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||  ||| | ||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||| |||| ||||| ||| |    
T  362229 cttatgccctataataccttgtcattcaaactgttgagggcttataccctagaatgtttatcattcaaattgttgggggcttaagccccggaatacctag 362328  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  362329 tcattcaa 362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Original strand, 20012323 - 20012358
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20012323 tgagggcttaagccctggaatgccttgtcattcaaa 20012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15267165 - 15267131
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15267165 ccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 15267131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Original strand, 22521997 - 22522031
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22521997 ccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 22522031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 17272816 - 17272853
Alignment:
Q  116 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17272816 tgttgggggtttatgctccggaatgcttagtcattcaa 17272853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33088933 - 33088880
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  33088933 gagggcttatgccctggaacaccttgttgttcaaattggtgagggcttatgccc 33088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 38186147 - 38186215
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  38186147 cttatgccctggaatg-tttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 38186215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Original strand, 22521886 - 22521941
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22521886 gttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttc-aatcgttgagggcttatgccc 22521941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33848627 - 33848456
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33848627 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgtcttgt 33848528  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33848527 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatagaattggtgctaccttga 33848456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 9388389 - 9388558
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388389 cttatgccatggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 9388487  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9388488 cattc-aactgttgggggcttatgccccggaatgcgtagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 9388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 16278635 - 16278796
Alignment:
Q  17 ggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    ||||||||||| |||||||   || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278635 ggaatgctttgtcattcaacc-gtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 16278733  T
Q  116 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278734 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 16278796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28382621 - 28382474
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28382621 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 28382523  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382522 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 28382474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33848701 - 33848559
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848701 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 33848603  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  33848602 tcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 33848559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 16278432 - 16278573
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16278432 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcat 16278530  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16278531 tc-aattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 16278573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41791407 - 41791273
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41791407 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 41791308  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  41791307 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 41791273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Original strand, 53388033 - 53388171
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53388033 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattgttgggggcttatgccccgg 53388132  T
Q  137 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53388133 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 53388171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 15280408 - 15280552
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15280408 atgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaacgccttgtca 15280506  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15280507 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 15280552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10313508 - 10313366
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  10313508 atgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttgtgctctggaatgcttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctgggatgc-ttgtcat 10313410  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10313409 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 10313366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15990063 - 15989930
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15990063 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgt 15989964  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  15989963 cattaaaaatgttgagggtttatgccctggaatg 15989930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14698413 - 14698268
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  14698413 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 14698315  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14698314 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 14698268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16359259 - 16359114
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359259 atgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtc 16359161  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359160 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16359114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 16278506 - 16278654
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16278506 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 16278604  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  16278605 gtcattcaaaatgttgggggcttacgctccggaatgctttgtcattcaac 16278654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4170721 - 4170576
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||   |      
T  4170721 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaat-tttca 4170623  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4170622 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 4170576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 15242465 - 15242599
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15242465 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaattgccttg 15242564  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15242565 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 15242599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Original strand, 21190078 - 21190195
Alignment:
Q  40 ttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||    
T  21190078 ttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctagaat 21190177  T
Q  140 gcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21190178 gcttggtcattcaacacg 21190195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4170796 - 4170654
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170796 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 4170697  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4170696 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 4170654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6511580 - 6511435
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6511580 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttg 6511482  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  6511481 tcattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatgttta-tcattcaa 6511435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14698488 - 14698346
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698488 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 14698389  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14698388 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 14698346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 14942671 - 14942817
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||     
T  14942671 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttta 14942769  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14942770 tcattcaaattgttgggggcttatgcacctgaatgcttagtcattcaa 14942817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Original strand, 56116035 - 56116166
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  56116035 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctgtaatgatttgt 56116134  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||    
T  56116135 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 56116166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 56116156 - 56116286
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56116156 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcgt 56116255  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||  ||||| ||||| |||| | ||||||    
T  56116256 tcaatctgttgagggctcatgcactggaatg 56116286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13881482 - 13881362
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  13881482 tgttgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaaccattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctag 13881383  T
Q  137 aatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13881382 attgcttagtcattcaacacg 13881362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 15242418 - 15242533
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  15242418 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcatttaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 15242517  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  15242518 atg-ttaatcattcaac 15242533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 47127139 - 47127257
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47127139 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgtcgggggcttatgccccg 47127238  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47127239 gaatgcttagtcattcaac 47127257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 55503054 - 55503183
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503054 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 55503152  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  55503153 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 55503183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 286887 - 286739
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccg-ttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  286887 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgcttt 286789  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  286788 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatacttagtcattcaac 286739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Original strand, 15449756 - 15449872
Alignment:
Q  36 attgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  15449756 attgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactattgaggacttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctg 15449855  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  15449856 gaatgttta-tcattcaa 15449872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16359298 - 16359155
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16359298 atgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtca 16359200  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  16359199 ttcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16359155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Original strand, 14942624 - 14942719
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  14942624 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccc 14942719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13877793 - 13877703
Alignment:
Q  67 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13877793 tcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgccttgtcactcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 13877703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Original strand, 15448432 - 15448549
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcccc 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||     
T  15448432 aattgttgagggcacatgccctagaatgttaatcattcaagtgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcagattgttgagggctcatgccct 15448531  T
Q  135 ggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  15448532 ggaatg-ttaatcattcaa 15448549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Original strand, 24047832 - 24047960
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24047832 gagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatg 24047930  T
Q  141 cttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  24047931 cttagtcattcaacaagttgaaaatggtgc 24047960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 31117359 - 31117498
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31117359 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcat 31117456  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    || ||  |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  31117457 tc-aaccgttgagggcttatgccctggaatg-ttaatcattcaa 31117498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15989875 - 15989740
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||| ||  |||||||||  |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15989875 aattgttgaggacttataccctagaatgctttgtcattcaactattgaaggctcatgccctggaatgc-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccc 15989777  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15989776 cggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 15989740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41791453 - 41791339
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  41791453 gttgagggctcatgccttggaacgctcgtcattcaaccgatgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 41791354  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    || ||| |||||||||    
T  41791353 tg-ttaatcattcaac 41791339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27027739 - 27027587
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggct------tatgccctggaat 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||      |||||||||||||    
T  27027739 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgaaatgtttgtcattcaaactgttgagggctcatgcctatgccctggaat 27027640  T
Q  100 gccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27027639 gccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 27027587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 33684861 - 33684989
Alignment:
Q  40 ttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33684861 ttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccatggaa 33684959  T
Q  139 tgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||    
T  33684960 tgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 33684989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 286896 - 286780
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||    
T  286896 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactattgagggctcatgccctgg 286797  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  286796 aatgctttgtcattcaa 286780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Original strand, 20899755 - 20899849
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20899755 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 20899849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27027622 - 27027532
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27027622 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 27027532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3337166 - 3337084
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgtt 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3337166 tgttgagggctcataccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaattgtt 3337084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6511538 - 6511394
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  || ||    
T  6511538 atgccctggaatg-tttatcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatgt-ttatc 6511441  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6511440 attcaaattgttgggggattatgccccggaatgcttagtcattcaac 6511394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6511598 - 6511474
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||    
T  6511598 cattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-tttatcattcaaactgttgagggctt 6511500  T
Q  128 atgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||    
T  6511499 atgccctggaatgccttgtcattcaa 6511474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 56115918 - 56116063
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  56115918 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgctctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttgtc 56116017  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  56116018 gttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 56116063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6511628 - 6511514
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  6511628 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgg 6511530  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  6511529 aatgttta-tcattcaa 6511514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15990115 - 15990035
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15990115 aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 15990035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16359310 - 16359195
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  16359310 tgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 16359212  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  16359211 aatgctttgtcattcaa 16359195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3337079 - 3336989
Alignment:
Q  62 gttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  3337079 gttaattattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 3336989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27027652 - 27027547
Alignment:
Q  9 tatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  27027652 tatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 27027553  T
Q  108 attcaa 113  Q
    ||||||    
T  27027552 attcaa 27027547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28382630 - 28382515
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  28382630 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgg 28382532  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  28382531 aatgccttgtcattcaa 28382515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3337056 - 3336989
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3337056 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 3336989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Original strand, 15242576 - 15242666
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15242576 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcatttaacacgttgaaaatggt 15242666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 15448482 - 15448549
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15448482 cttatgccctggaatgccttgtcattcagattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 15448549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 33684868 - 33684974
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| | |    
T  33684868 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccatggaatgcttag 33684966  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  33684967 tcattcaa 33684974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Original strand, 55503120 - 55503234
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503120 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 55503218  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||    
T  55503219 aatgcttagtcattca 55503234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 84
Target Start/End: Original strand, 15449804 - 15449882
Alignment:
Q  6 acttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgaggg 84  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  15449804 acttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgaggg 15449882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 55503128 - 55503234
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  55503128 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 55503227  T
Q  106 tcattca 112  Q
    |||||||    
T  55503228 tcattca 55503234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15990103 - 15989960
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  15990103 cttatgccctggaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttt 15990005  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcatt 150  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15990004 atcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcatt 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 56115955 - 56116103
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |  || |||||   | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  56115955 cttatgctctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgcttt 56116054  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  56116055 gtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatg-ttaatcattcaac 56116103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 55503042 - 55503156
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  55503042 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 55503139  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  55503140 aatgccttgtcattcaa 55503156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6511502 - 6511395
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |    
T  6511502 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcgtgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggattatgccccggaatgcttag 6511403  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  6511402 tcattcaa 6511395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Original strand, 56116263 - 56116353
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  56116263 gttgagggctcatgcactggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 56116353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15989928 - 15989835
Alignment:
Q  20 atgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15989928 atgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctgaaatgtttatcattcaattgttgaggacttataccctagaatgctttgtcattcaa 15989835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15990111 - 15989995
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  15990111 gttgagggcttatgccctggaatgcctcgtcattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 15990012  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  15990011 aatgttta-tcattcaac 15989995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 15280396 - 15280511
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  15280396 tgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgg 15280494  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    || || | |||||||||    
T  15280495 aacgccttgtcattcaa 15280511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16359223 - 16359115
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  16359223 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 16359124  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  16359123 gtcattcaa 16359115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 24047840 - 24047943
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  24047840 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ttgttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtca 24047938  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  24047939 ttcaa 24047943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Original strand, 31117463 - 31117550
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  31117463 gttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggct 31117550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18221183 - 18221088
Alignment:
Q  74 accgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  18221183 accgttggggacttatgtcctggaatgctttaaccattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatggt 18221088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27027754 - 27027691
Alignment:
Q  70 ttcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27027754 ttcaatcgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 27027691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8710651 - 8710573
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8710651 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttaagggctcatgccccgtgaatgcttaatcattcaa 8710573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Original strand, 15242543 - 15242648
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  15242543 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 15242642  T
Q  105 gtcatt 110  Q
    ||||||    
T  15242643 gtcatt 15242648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28382629 - 28382553
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28382629 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 28382553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41791296 - 41791220
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg-ccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41791296 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcccccggaatgcttagtcattcaa 41791220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Original strand, 53388029 - 53388097
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  53388029 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 53388097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 53388044 - 53388096
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53388044 atgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 53388096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 16278421 - 16278534
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| |||    
T  16278421 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctgga 16278518  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  16278519 atgctttgtcattcaa 16278534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Original strand, 20899759 - 20899834
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20899759 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 20899834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 31117347 - 31117410
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31117347 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg 31117410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33848712 - 33848599
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  33848712 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aactgttgagggcttatgccctgga 33848615  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| | |||||||||    
T  33848614 atgccttgtcattcaa 33848599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Original strand, 47127148 - 47127203
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47127148 cttatgccctggaatgctatgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 47127203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 56116231 - 56116338
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  56116231 cttatgccctggaatgccttgtcgttcaatctgttgagggctcatgcactggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 56116330  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  56116331 tcattcaa 56116338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 56115909 - 56115983
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  56115909 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgctctggaatgctttgtcattcaa 56115983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4170807 - 4170742
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4170807 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 4170742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6511627 - 6511551
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6511627 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 6511551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10313519 - 10313443
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  10313519 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttgtgctctggaatgctt-gtcattcaac 10313443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13877775 - 13877706
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13877775 cttatgccctggaatgccttgtcactcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 13877706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14698499 - 14698434
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14698499 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 14698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 41791329 - 41791220
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatg-ccctggaatgcct 103  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||| ||| ||||||| |    
T  41791329 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgcccccggaatgctt 41791230  T
Q  104 tgtcattcaa 113  Q
     |||||||||    
T  41791229 agtcattcaa 41791220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 56116105 - 56116221
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||| ||    
T  56116105 gttgagggcttatgccctgtaatgatttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggctcatgccctgg 56116204  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  56116205 aatg-ttaatcattcaac 56116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 16278664 - 16278771
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  16278664 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 16278762  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  16278763 gtcattcaa 16278771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 21190126 - 21190178
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21190126 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctagaatg 21190178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Original strand, 15448397 - 15448509
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||  |  |||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  15448397 tgttaagggctcatgctctggaatgttaatcattcaattgttgagggcacatgccctagaatg-ttaatcattc-aagtgttgagggcttatgccctgga 15448494  T
Q  138 atgcttagtcattca 152  Q
    |||| | ||||||||    
T  15448495 atgccttgtcattca 15448509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 13881434 - 13881385
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccct 56  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13881434 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccct 13881385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 16278417 - 16278496
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16278417 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 16278496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 16278703 - 16278772
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16278703 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16278772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33848716 - 33848637
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  33848716 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 33848637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8710643 - 8710551
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  8710643 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttaagggctcatgccccgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggcttatgccctg 8710551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 31117471 - 31117537
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31117471 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 31117537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3337065 - 3336973
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttat 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  3337065 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttat 3336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10313520 - 10313444
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  10313520 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggcttgtgctctggaatg-cttgtcattcaa 10313444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18221173 - 18221116
Alignment:
Q  6 acttatgccctggaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18221173 acttatgtcctggaatgctttaaccattcaaattgttgggggctcatgccccggaatg 18221116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27027787 - 27027711
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  27027787 gttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaa-tcgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 27027711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10704576 - 10704512
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10704576 aaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggcttatgccctg 10704512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10918346 - 10918282
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10918346 aaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggcttatgccctg 10918282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13877853 - 13877805
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggct 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  13877853 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggct 13877805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 13877857 - 13877817
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13877857 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 13877817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 153
Target Start/End: Original strand, 31131813 - 31131845
Alignment:
Q  121 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131813 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 31131845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32489857 - 32489794
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctgg-aatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32489857 aattgttgagggcttatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 32489794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 47127191 - 47127258
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  47127191 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgtcgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 47127258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18079641 - 18079535
Alignment:
Q  31 ttcaaattgttgagggctcatgccctgg-aatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  18079641 ttcaaactgttgagggctcatgtcgtgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagtgct 18079542  T
Q  127 tatgccc 133  Q
     ||||||    
T  18079541 catgccc 18079535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 20899770 - 20899835
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20899770 atgccctggaatgccttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 20899835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 53388084 - 53388150
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  53388084 atgccctggaatgccttgtcgttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 53388150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10704571 - 10704514
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10704571 gttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggcttatgccc 10704514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10918341 - 10918284
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10918341 gttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggcttatgccc 10918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 133
Target Start/End: Original strand, 15416856 - 15416909
Alignment:
Q  81 agggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  15416856 agggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaaccgttgcgggcttatgccc 15416909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 31117348 - 31117423
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  31117348 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 31117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Original strand, 4616136 - 4616164
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4616136 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 4616164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 23339567 - 23339738
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23339567 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgtcttgt 23339666  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23339667 cattcaaattgttgggggcttatgccacggaatgcttagtcattcaacacgatggaattggtgctaccttga 23339738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 25035995 - 25036139
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25035995 atgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 25036094  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25036095 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 25036139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44620730 - 44620583
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620730 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttg 44620632  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620631 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 44620583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Original strand, 20591424 - 20591561
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591424 gttgagggctcataccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgccatgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 20591523  T
Q  138 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20591524 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 20591561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 23339493 - 23339635
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339493 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 23339591  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23339592 tcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 23339635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 21239491 - 21239625
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21239491 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 21239590  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21239591 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21239625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 21242041 - 21242175
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21242041 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 21242140  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  21242141 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21242175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28348876 - 28348743
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348876 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 28348777  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  28348776 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 28348743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31503282 - 31503137
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  31503282 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tca 31503184  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31503183 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 31503137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 24274238 - 24274354
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  24274238 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctcgaataccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 24274337  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| ||||||||||    
T  24274338 atgctttgtcattcaac 24274354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31503360 - 31503215
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503360 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 31503261  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  31503260 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 31503215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31505848 - 31505703
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  31505848 cttatgccatggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tca 31505750  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31505749 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 31505703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31505926 - 31505781
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31505926 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccatggaatgccttgt 31505827  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  31505826 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 31505781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 41685076 - 41685194
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41685076 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 41685175  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41685176 gaatgcttagtcattcaac 41685194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23374998 - 23374868
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374998 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 23374900  T
Q  137 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  23374899 aatgcttagtcattcaacaagttgaaaatggt 23374868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31755731 - 31755602
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755731 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 31755633  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31755632 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 31755602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 21239440 - 21239559
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21239440 aaatcgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 21239539  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     |||||| ||| |||||||||    
T  21239540 tggaatg-ttaatcattcaac 21239559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 21241990 - 21242109
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21241990 aaatcgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 21242089  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     |||||| ||| |||||||||    
T  21242090 tggaatg-ttaatcattcaac 21242109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 24274285 - 24274399
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274285 cttatgccctcgaataccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggcttatgccctggaatgccttg 24274384  T
Q  106 tcattcaaattgttg 120  Q
    |||||||||||||||    
T  24274385 tcattcaaattgttg 24274399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 12628184 - 12628261
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12628184 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 12628261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24504473 - 24504344
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24504473 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 24504375  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||  ||||| ||||| || ||| ||||||    
T  24504374 tcaatctgttgagggctcataccctggaatg 24504344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 10040197 - 10040361
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttg-ccattcaaatt-gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||      
T  10040197 cttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgt- 10040295  T
Q  103 ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  10040296 ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 10040361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28352670 - 28352568
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  28352670 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgatggcttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 28352571  T
Q  138 atg 140  Q
    |||    
T  28352570 atg 28352568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28348807 - 28348676
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348807 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 28348709  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  28348708 gaatgattagtcattcaacccgttgaaaatggt 28348676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44620739 - 44620624
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  44620739 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 44620641  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  44620640 aatgccttgtcattcaa 44620624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22109513 - 22109435
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22109513 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacac 22109435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24504407 - 24504293
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| || ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504407 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcataccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 24504309  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||    
T  24504308 aatgcttagtcattca 24504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28352591 - 28352501
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  28352591 gttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 28352501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31755665 - 31755551
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755665 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 31755567  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||    
T  31755566 aatgcttagtcattca 31755551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31755657 - 31755551
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  31755657 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 31755558  T
Q  106 tcattca 112  Q
    |||||||    
T  31755557 tcattca 31755551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 21239602 - 21239677
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239602 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 21239677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 21242152 - 21242227
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21242152 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 21242227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23374986 - 23374883
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  23374986 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 23374888  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  23374887 ttcaa 23374883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 156
Target Start/End: Original strand, 24275717 - 24275784
Alignment:
Q  88 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 156  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275717 atgccctggaatgtcta-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 24275784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31503408 - 31503332
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31503408 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 31503332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31505974 - 31505898
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31505974 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 31505898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31755743 - 31755629
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  31755743 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 31755646  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  31755645 aatgccttgtcattcaa 31755629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31503409 - 31503303
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |    
T  31503409 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 31503310  T
Q  136 gaatgct 142  Q
    |||||||    
T  31503309 gaatgct 31503303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31505975 - 31505869
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |    
T  31505975 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctg 31505876  T
Q  136 gaatgct 142  Q
    |||||||    
T  31505875 gaatgct 31505869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 21239569 - 21239677
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  21239569 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 21239668  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  21239669 gtcattcaa 21239677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 21242119 - 21242227
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  21242119 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 21242218  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  21242219 gtcattcaa 21242227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24504485 - 24504371
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||    
T  24504485 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctgg 24504388  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  24504387 aatgccttgtcattcaa 24504371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 25035952 - 25036098
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |     
T  25035952 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-tta 25036050  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     |||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  25036051 atcattc-aatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 25036098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31503400 - 31503254
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||     
T  31503400 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ctc 31503302  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  31503301 gtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 31503254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 41685085 - 41685193
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  41685085 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 41685184  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  41685185 gtcattcaa 41685193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24504396 - 24504293
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  24504396 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcataccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 24504297  T
Q  109 ttca 112  Q
    ||||    
T  24504296 ttca 24504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28348798 - 28348691
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||  | |    
T  28348798 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgattag 28348699  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  28348698 tcattcaa 28348691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31518403 - 31518274
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttggggg 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31518403 cattcaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgaggg 31518304  T
Q  125 cttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    || |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  31518303 ctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 31518274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44620738 - 44620662
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  44620738 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaac 44620662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22109514 - 22109438
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22109514 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 22109438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31505966 - 31505820
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||     
T  31505966 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ctc 31505868  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  31505867 gtcattc-aaccgttgagggcttatgccatggaatgccttgtcattcaa 31505820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 23339482 - 23339595
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  23339482 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aactgttgagggcttatgccctgga 23339579  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| | |||||||||    
T  23339580 atgccttgtcattcaa 23339595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28352623 - 28352516
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  28352623 cttatgtcctggaatgacttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 28352524  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  28352523 tcattcaa 28352516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 153
Target Start/End: Original strand, 25035942 - 25036020
Alignment:
Q  75 ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||| || |||||||||    
T  25035942 ccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaa 25036020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31518561 - 31518500
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31518561 aaccgttgagggcttttgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 31518500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23085470 - 23085379
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23085470 cttatgccctgtgaatgctttttcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgagggctcatgccctg 23085379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28348882 - 28348808
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  28348882 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 28348808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31518385 - 31518254
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |  |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31518385 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgc 31518286  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
     |  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31518285 ttaatcattcaaattgttgagggctcatgccc 31518254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22109505 - 22109437
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22109505 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 22109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 23339478 - 23339557
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23339478 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 23339557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 24274317 - 24274392
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24274317 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaacta-ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 24274392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31518537 - 31518418
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa--tgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||    
T  31518537 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgacttcttaatcattcaaattgttgagggctaatgccctgtgaatgctagttcattcaa 31518438  T
Q  114 attgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  31518437 attgtttagggcttatgccc 31518418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21903221 - 21903105
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||   |||||| ||||||    |||||||||    
T  21903221 gaatgcttagtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatacttaattattcaactgttgagggct--cgccctgtgaatgctagttcattcaaa 21903124  T
Q  115 ttgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  21903123 ttgttgagggcttatgccc 21903105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 41685128 - 41685195
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  41685128 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 41685195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 12628195 - 12628261
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12628195 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 12628261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 20353407 - 20353485
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc-cggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||   ||||||||| ||||||||    
T  20353407 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagtgcttatgccctatgaatgcttaatcattcaa 20353485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23148616 - 23148578
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148616 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaat 23148578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23560406 - 23560368
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23560406 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaat 23560368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 114
Target Start/End: Original strand, 24682706 - 24682794
Alignment:
Q  31 ttcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac--cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||   || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24682706 ttcaaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 24682794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 20591471 - 20591540
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  20591471 cttatgccctggaatgccatgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 20591540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22840992 - 22840916
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22840992 gagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctgtaatgccttgtcattcaaa 22840916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23148626 - 23148593
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148626 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 23148593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23560416 - 23560383
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23560416 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 23560383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31518341 - 31518252
Alignment:
Q  10 atgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  31518341 atgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctg 31518252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 25035944 - 25036059
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||  ||||| ||||| |||||| ||    
T  25035944 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 25036043  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  25036044 aatg-ttaatcattcaa 25036059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 46
Target Start/End: Original strand, 24274364 - 24274403
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgaggg 46  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24274364 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgaggg 24274403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24528534 - 24528480
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  24528534 tgagggctcatgccctggaacggcttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 24528480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23085478 - 23085421
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23085478 gttgagggcttatgccctgtgaatgctttttcattcaaactgttgagggctcatgccc 23085421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 113
Target Start/End: Original strand, 43708198 - 43708235
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43708198 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 43708235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22841075 - 22841020
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22841075 gttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttc-aatcgttgagggcttatgccc 22841020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24160233 - 24160205
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24160233 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 24160205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Original strand, 24275709 - 24275781
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24275709 gagggttcatgccctggaatgtctatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 24275781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 9)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8824 - 8657
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8824 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 8726  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8725 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgaaggaaatggtgctaccttga 8657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 11275 - 11423
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11275 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgcctt 11373  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11374 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggactgcttagtcattcaac 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8905 - 8771
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8905 cttatgccctggaatgctttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttg 8807  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8806 tcattc-aattgttgagggctcatgccctggaatgct 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 11188 - 11304
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  11188 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 11286  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11287 aatgctttgtcattcaac 11304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8952 - 8838
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  8952 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctgga 8854  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  8853 atgctttgtcattcaa 8838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 11197 - 11342
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11197 cttatgccctggaatgccttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 11295  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11296 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 11342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8941 - 8799
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8941 atgccctggaatgctttgtcattc-aaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 8843  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  8842 ttc-aattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 8799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8956 - 8877
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8956 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 8877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 8750 - 8681
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  8750 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 8681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 74)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 296320 - 296153
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  296320 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcat 296222  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  296221 tcaaattgttgggggcttaagccccggaatgcttagtcattcaacacgatagaaatggtgataccttga 296153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 2333382 - 2333527
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2333382 atgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccttggaatgccttgtcat 2333481  T
Q  110 tcaaattgtt-gggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333482 tcaaattgttggggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2333527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 45307049 - 45306915
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45307049 cttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 45306950  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45306949 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 45306915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 22900615 - 22900762
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  22900615 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgt-tcatca 22900713  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22900714 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22900762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20631074 - 20630926
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20631074 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 20630976  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630975 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 20630926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 22900566 - 22900681
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22900566 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22900665  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22900666 tgctttgtcattcaac 22900681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 14432671 - 14432819
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14432671 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgggggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 14432769  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14432770 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14432819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20586876 - 20586733
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  20586876 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttcatca 20586778  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20586777 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 20586733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36181372 - 36181224
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36181372 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 36181274  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36181273 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaac 36181224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20579183 - 20579040
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  |  |||    
T  20579183 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaacg-ttcatca 20579085  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579084 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 20579040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24087245 - 24087117
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087245 tgttgagggctcatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 24087146  T
Q  137 aatgcttagtcattcaacacgatggaaat 165  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24087145 aatgcttagtcattcaacatgttggaaat 24087117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 293961 - 293834
Alignment:
Q  13 ccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattca 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  293961 ccctggaatgccttgtcattcaatttgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattca 293862  T
Q  113 aattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  293861 atctgttgagggctcatgccctggaatg 293834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 2333304 - 2333446
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2333304 atgccctggaatgctttgtcattcaatctgtcgagggctcgtgccctggagtgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 2333403  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  2333404 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 2333446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18823655 - 18823541
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||    
T  18823655 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaa 18823556  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  18823555 tgccttgtcattcaa 18823541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 21181466 - 21181567
Alignment:
Q  30 attcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  21181466 attcaaattgttgagggcttatgccatggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcat 21181565  T
Q  130 gc 131  Q
    ||    
T  21181566 gc 21181567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20631113 - 20630967
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20631113 cttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 20631015  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  20631014 tcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 20630967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 45307095 - 45306981
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  45307095 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 45306996  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    || ||| |||||||||    
T  45306995 tg-ttaatcattcaac 45306981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 20901159 - 20901001
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||  || |||    
T  20901159 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccatggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttattcccttcaatgt-ttatca 20901062  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20901061 ttcaaattgttgggg-cttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 20901001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28312232 - 28312068
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |    
T  28312232 cttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatccgggagggctcatgccctgaaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccttggaatgt-t 28312134  T
Q  104 tgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtg 169  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28312133 tatcattcaaattgttgggggcttttgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 28312068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 18823609 - 18823462
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  18823609 cttatgccctggaatgccttttcattcaaactgttgagggttcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-tt 18823511  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823510 atcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 18823462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36181381 - 36181265
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  36181381 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 36181282  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  36181281 aatgccttgtcattcaa 36181265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20579271 - 20579158
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20579271 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaa 20579173  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  20579172 tgccttgtcattcaa 20579158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20586964 - 20586851
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20586964 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattc-aattgttgagggctcatgccctggaa 20586866  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  20586865 tgccttgtcattcaa 20586851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20631122 - 20631007
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  20631122 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 20631024  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20631023 aatgctttgtcattcaa 20631007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 28204699 - 28204830
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28204699 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 28204797  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28204798 gaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 28204830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 21181512 - 21181643
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21181512 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctggaaggt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 21181610  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21181611 gaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 21181643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16400733 - 16400611
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||     
T  16400733 aaattgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatt 16400635  T
Q  131 ccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16400634 ccccggaatgcttagtcattcaac 16400611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18270275 - 18270183
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  18270275 gttgagggctcatgccctggagtgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 18270183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18274929 - 18274837
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  18274929 gttgagggctcatgccctggagtgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 18274837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 293898 - 293767
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  293898 tgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 293800  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  293799 gaatgcttagtcattcaactcgttgaaaatggt 293767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 14432662 - 14432778
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  14432662 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgggggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 14432761  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  14432762 aatgccttgtcattcaa 14432778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20901199 - 20901095
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20901199 atgccctgtaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccatggaatgctttgtca 20901100  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  20901099 ttcaa 20901095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 28204708 - 28204815
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  28204708 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 28204807  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  28204808 tcattcaa 28204815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18823566 - 18823461
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  18823566 atgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 18823467  T
Q  109 ttcaaa 114  Q
    ||||||    
T  18823466 ttcaaa 18823461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18270307 - 18270200
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  18270307 cttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccctggagtgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 18270208  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  18270207 tcattcaa 18270200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18274961 - 18274854
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  18274961 cttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccctggagtgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 18274862  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  18274861 tcattcaa 18274854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20579233 - 20579119
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  20579233 gttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 20579134  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  20579133 atg-ttaatcattcaa 20579119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20586926 - 20586812
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  20586926 gttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 20586827  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  20586826 atg-ttaatcattcaa 20586812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 21181521 - 21181628
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  21181521 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgctctggaaggtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 21181620  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  21181621 tcattcaa 21181628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20901211 - 20901094
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||  |    
T  20901211 tgttgagggctcatgccctgtaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccatg 20901113  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20901112 gaatgctttgtcattcaac 20901094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37358277 - 37358201
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358277 gttgagggctcatgccctggaatga-tcattattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 37358201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 21181407 - 21181549
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||||||||||| |||||||  |  |||    
T  21181407 atgccctggaatgccttgtcattgaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatgattcaaattgttgagggcttatgccatggaatg-ttaatca 21181505  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  21181506 ttc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 21181549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45306938 - 45306863
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306938 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgtggggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 45306863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 293889 - 293782
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  293889 cttatgccttggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 293790  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  293789 tcattcaa 293782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19209532 - 19209437
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19209532 cttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttattattcaaattgttgggggcttatcccctggaatgc 19209437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19209500 - 19209407
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctt-agtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  19209500 gttgagggctcatgccctggaatgt-ttattattcaaattgttgggggcttatcccctggaatgcttaagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 19209407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20631121 - 20631045
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20631121 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 20631045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18270319 - 18270259
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18270319 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccc 18270259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18274973 - 18274913
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18274973 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtctttcaaactgttgagggctcatgccc 18274913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 45306971 - 45306863
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || | |||||||||||| ||||||| |     
T  45306971 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgtggggggcttatgccccggaatgctta 45306872  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  45306871 gtcattcaa 45306863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20579225 - 20579131
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  20579225 cttatgccctggaatgttttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 20579131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20586918 - 20586824
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  20586918 cttatgccctggaatgttttgtcattcaa-ttgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 20586824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 44823101 - 44823202
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||    
T  44823101 aaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttat 44823200  T
Q  130 gc 131  Q
    ||    
T  44823201 gc 44823202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19209536 - 19209477
Alignment:
Q  81 agggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19209536 agggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 19209477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 296331 - 296269
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  296331 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg 296269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 296335 - 296256
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  296335 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 296256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 16400697 - 16400612
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  16400697 cattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttattccccggaatgcttagtcattcaa 16400612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 294014 - 293939
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcccc-ggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  294014 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgatggcttatgcccctggaatgccttgtcattcaa 293939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Original strand, 21181397 - 21181452
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||    
T  21181397 ttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattgaaactgttgagggctcatgccc 21181452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Original strand, 21181375 - 21181511
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |  |||||  ||| |||||||||| ||||||| |||||  || | ||||||||    
T  21181375 gaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgccttgtcattgaaactgttgagggctcatgccctagaatg-tttatgattcaaat 21181473  T
Q  116 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  21181474 tgttgagggcttatgccatggaatg-ttaatcattcaac 21181511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 45918293 - 45918252
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45918293 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 45918252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 2333289 - 2333329
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2333289 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 2333329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20579275 - 20579197
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  20579275 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaa 20579197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20586968 - 20586890
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  20586968 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgttttgtcattcaa 20586890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37358278 - 37358202
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  37358278 tgttgagggctcatgccctggaatgatcattattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 37358202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 36181290 - 36181223
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||    
T  36181290 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacc 36181223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 5380819 - 5380765
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  5380819 tgagggctcatgtcctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 5380765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Original strand, 21181359 - 21181429
Alignment:
Q  81 agggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcatt 150  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  21181359 agggcttatgccttgtgaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgccttgtcatt 21181429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24087194 - 24087128
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  24087194 atgccctggaatgccttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 24087128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24959959 - 24959925
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24959959 gagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 24959925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 296246 - 296177
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||    
T  296246 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaaattgttgggggcttaagccccggaatgcttagtcattcaac 296177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20043909 - 20043868
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20043909 aaccgttgagggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 20043868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8683127 - 8683035
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctgg-aatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8683127 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcgttccaactgttgagggcttatgccctg 8683035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45307099 - 45307033
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  45307099 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 45307033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 22759088 - 22759246
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22759088 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgt 22759187  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22759188 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacatgttggaaat 22759246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 16256336 - 16256483
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  16256336 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgt-tcatca 16256434  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16256435 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 16256483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 16259930 - 16260077
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  16259930 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgt-tcatca 16260028  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16260029 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 16260077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26495621 - 26495487
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26495621 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 26495522  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  26495521 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 26495487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 22593649 - 22593796
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||    
T  22593649 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctggaatgt-tcatca 22593747  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22593748 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22593796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 22597204 - 22597351
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |  |||    
T  22597204 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctggaatgt-tcatca 22597302  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22597303 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22597351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 16259881 - 16259996
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16259881 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 16259980  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  16259981 tgctttgtcattcaac 16259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 22590045 - 22590160
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22590045 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22590144  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22590145 tgctttgtcattcaac 22590160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 22593600 - 22593715
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22593600 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22593699  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22593700 tgctttgtcattcaac 22593715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 22597155 - 22597270
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22597155 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 22597254  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22597255 tgctttgtcattcaac 22597270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 26361407 - 26361553
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26361407 atgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctgaaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtc 26361506  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361507 attgaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 26361553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 29325606 - 29325740
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29325606 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccttggaattgccttg 29325705  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29325706 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 29325740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 22590094 - 22590241
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  |||    
T  22590094 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgtgggcttatgccctagaatgt-tcatca 22590192  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22590193 ttcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcaacacg 22590241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22469920 - 22469774
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  22469920 atgccctggaaagccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgaaatgt-ttatca 22469822  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22469821 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacac 22469774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 22759013 - 22759156
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22759013 atgccctagaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcat 22759112  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  22759113 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 22759156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 27869801 - 27869950
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||| | ||||||| || |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  27869801 cattctaattgttgagagctcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgaggactcatgccctgaaatg--ttatcattcaaattgttgggggct 27869898  T
Q  127 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctaccttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27869899 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtggtaccttga 27869950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Original strand, 22357922 - 22358051
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22357922 atgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtca 22358021  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||| |||||    
T  22358022 ttc-aactgttgagggctcatgccctggaat 22358051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 16256286 - 16256402
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  16256286 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 16256385  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| ||||||||||    
T  16256386 atgctttgtcattcaac 16256402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26495672 - 26495553
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26495672 aaatcgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 26495573  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     |||||| ||| |||||||||    
T  26495572 tggaatg-ttaatcattcaac 26495553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 8953034 - 8953148
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8953034 gttgagggctcatgcccttgaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttggggacttatgccccgga 8953132  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||    
T  8953133 atgcttagtcattcaa 8953148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Original strand, 16256243 - 16256361
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||    
T  16256243 aaatcgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattc-aaccgttgagggctcatgccc 16256341  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     ||||||| | |||||||||    
T  16256342 tggaatgccttgtcattcaa 16256361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43120904 - 43120790
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43120904 gttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 43120806  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||    
T  43120805 atgcttagtcattcaa 43120790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43124437 - 43124323
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124437 gttgagggcttatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 43124339  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||    
T  43124338 atgcttagtcattcaa 43124323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Original strand, 24277637 - 24277777
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24277637 cattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggct 24277735  T
Q  127 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24277736 tatgccccggaatgcttattcattcaacacgttgaaaatggt 24277777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24384576 - 24384436
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24384576 cattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggct 24384478  T
Q  127 tatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24384477 tatgccccggaatgcttattcattcaacacgttgaaaatggt 24384436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 154
Target Start/End: Original strand, 29325562 - 29325674
Alignment:
Q  41 tgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29325562 tgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 29325661  T
Q  141 cttagtcattcaac 154  Q
     ||| |||||||||    
T  29325662 -ttaatcattcaac 29325674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4397514 - 4397426
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 165  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4397514 gttgagggctcatgccctgaaatgccttgtcattcaaattattgggggcttatgccccagaatgcttagtcattcaacccgttggaaat 4397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23671622 - 23671480
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23671622 atgccctggaatgcttcgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtca 23671524  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  23671523 ttc-aactgttgagggctcatgccctggaatgcttagccattcaa 23671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23693223 - 23693108
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||    
T  23693223 gttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattc-aattgttgagggctcatgccctgga 23693125  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    |||| | ||||||||||    
T  23693124 atgccttgtcattcaac 23693108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 22357962 - 22358123
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg-tc 107  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||  ||    
T  22357962 atgccctggaatg-tttatcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatatttttatc 22358060  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||| | || |||||||||    
T  22358061 attcaaattgttgaggtcttatgccctagaatgcttagttattcaacatgttgaaaatggtgc 22358123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23671633 - 23671518
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||    
T  23671633 gttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattc-aatcgttgagggctcatgccctgga 23671535  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    |||| | ||||||||||    
T  23671534 atgccttgtcattcaac 23671518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 27869704 - 27869847
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||     
T  27869704 cttatgccctggaatgc-ttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg--tta 27869799  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  27869800 tcattctaattgttgagagctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 27869847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43120970 - 43120881
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43120970 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 43120881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 43124503 - 43124414
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124503 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg 43124414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 27869745 - 27869867
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27869745 atgccctggaatgctttatcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgtta-tcattctaattgttgagagctcatgccctggaatgccttgtca 27869842  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||| ||||| || || ||||||    
T  27869843 ttcaaactgttgaggactcatgccc 27869867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 24277655 - 24277750
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  24277655 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 24277750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24384558 - 24384463
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  24384558 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 24384463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 22357911 - 22358027
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22357911 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgagggcttatgccctgg 22358009  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  22358010 aatgctttgtcattcaac 22358027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26495510 - 26495435
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495510 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 26495435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 29325717 - 29325792
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325717 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 29325792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22469931 - 22469854
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22469931 gttgagggctcatgccctggaaagccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaac 22469854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 22357907 - 22357986
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  22357907 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 22357986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23693212 - 23693109
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23693212 atgccctggaatgcttcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtca 23693114  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  23693113 ttcaa 23693109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26495543 - 26495435
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  26495543 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 26495444  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  26495443 gtcattcaa 26495435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43120982 - 43120869
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  43120982 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 43120885  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  43120884 aatg-ttaatcattcaa 43120869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43124515 - 43124402
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  43124515 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 43124418  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  43124417 aatg-ttaatcattcaa 43124402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Original strand, 27869695 - 27869796
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  27869695 tgttgagggcttatgccctggaatgcttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattc-aactgttgagggctcatgccctgga 27869793  T
Q  138 atg 140  Q
    |||    
T  27869794 atg 27869796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 22758973 - 22759116
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  22758973 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcacatgccctagaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg-tttatc 22759071  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22759072 attc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 22759116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22469947 - 22469836
Alignment:
Q  23 ctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttg 120  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  22469947 ctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaaagccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttg 22469849  T
Q  121 ggggcttatgccc 133  Q
     ||||||||||||    
T  22469848 agggcttatgccc 22469836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 27869822 - 27869925
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  27869822 atgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgaggactcatgccctgaaatgtt-atcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 27869920  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  27869921 ttcaa 27869925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 29325684 - 29325792
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  29325684 cttatgccttggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 29325783  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  29325784 gtcattcaa 29325792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 115
Target Start/End: Original strand, 8953063 - 8953150
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  8953063 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttggggacttatgccccggaatgcttagtcattcaaat 8953150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 21559443 - 21559562
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||    
T  21559443 gaatgccttgtcgttcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaa 21559542  T
Q  114 attgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  21559543 attgttgagggcttatgccc 21559562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23693262 - 23693148
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||||| |||||| |||    
T  23693262 gttgagggctcttgccctggaatgcctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctgga 23693164  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| | |||||||||    
T  23693163 atgcctcgtcattcaa 23693148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43120896 - 43120790
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  43120896 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 43120798  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  43120797 tcattcaa 43120790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 43124429 - 43124323
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  43124429 cttatgccctggaatg-ttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 43124331  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  43124330 tcattcaa 43124323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 26361399 - 26361509
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatgtta-atcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  26361399 gagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctgaaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaat 26361498  T
Q  140 gcttagtcatt 150  Q
    || | ||||||    
T  26361499 gccttgtcatt 26361509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 16256297 - 16256427
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16256297 atgccctggaatgccttgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtc 16256395  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  16256396 attc-aaccgttgagggcttatgccctggaatg 16256427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Original strand, 22357998 - 22358051
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaat 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22357998 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaat 22358051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23693266 - 23693186
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23693266 aaccgttgagggctcttgccctggaatgcctcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattcaac 23693186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 17022948 - 17023038
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac--cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17022948 cattcaaattggtgagggcttatgccttgtgaatgctttaaccattcaaattcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 17023038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26706451 - 26706359
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26706451 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 26706359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26976185 - 26976093
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26976185 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 26976093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7785188 - 7785121
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7785188 cattccaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcaagtcattcaatcgttgagggcttatgccctg 7785121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 22758964 - 22759038
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||||  |||||||| |||||||||    
T  22758964 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcacatgccctagaatgctttgtcattcaa 22759038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23671639 - 23671558
Alignment:
Q  71 tcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  23671639 tcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcttcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaa 23671558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22469986 - 22469949
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22469986 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 22469949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 24277606 - 24277683
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24277606 gttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 24277683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24384607 - 24384530
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  24384607 gttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 24384530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 26361399 - 26361472
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  |||||||||    
T  26361399 gagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctgaaatgctatgtcattcaa 26361472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 29325556 - 29325634
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  29325556 aaccgctgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 29325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 22759004 - 22759078
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  22759004 tgagggcacatgccctagaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaac 22759078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26706458 - 26706383
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc-cggaatgcttagtcattc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  26706458 ttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattc 26706383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26976192 - 26976117
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc-cggaatgcttagtcattc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  26976192 ttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaatcgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattc 26976117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21495055 - 21495001
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  21495055 tgagggatcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 21495001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7785223 - 7785162
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctgg-aatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7785223 aaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaattgttgagggcttatgccc 7785162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10035234 - 10035181
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  10035234 gagggctcatgccctggaataccttgttgttcaaattggtgagggcttatgccc 10035181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22470035 - 22469950
Alignment:
Q  70 ttcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  22470035 ttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgctttaactattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 22469950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22470020 - 22469963
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgcc-attcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22470020 cttatgccctgtgaatgctttaactattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 22469963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 129)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 13395865 - 13396035
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13395865 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 13395964  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13395965 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 13396035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38827941 - 38827797
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38827941 atgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcat 38827842  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38827841 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 38827797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16006153 - 16006007
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16006153 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttataccctggaatgccttgt 16006054  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  16006053 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 16006007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48784993 - 48784846
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48784993 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 48784895  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48784894 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 48784846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16006075 - 16005941
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16006075 cttataccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 16005976  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16005975 tcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatg 16005941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 13733852 - 13733996
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13733852 atgccctggaatgctatgtcattcaa-tcgttgagggctcatgccctggaatactatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtca 13733950  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733951 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 13733996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Original strand, 17506158 - 17506316
Alignment:
Q  17 ggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    ||||||||||| |||||||   || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17506158 ggaatgctttgtcattcaacc-gtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 17506256  T
Q  116 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17506257 tgttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaacaggatggaaatggtgttacct 17506316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17547056 - 17546898
Alignment:
Q  17 ggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    ||||||||||| |||||||   || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547056 ggaatgctttgtcattcaacc-gtggagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 17546958  T
Q  116 tgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17546957 tgttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaacaggatggaaatggtgttacct 17546898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4993245 - 4993111
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4993245 cttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattgaaccgttgagggctcatgccctggaattgccttg 4993146  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4993145 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 4993111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8776059 - 8775925
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8776059 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaactgccttg 8775960  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||    
T  8775959 tcattcaatctattgagggctcatgccctggaatg 8775925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 13849928 - 13850074
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13849928 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactattgagggcttatgccctagattgccttgt 13850027  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  13850028 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 13850074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35366053 - 35365924
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| | | |    
T  35366053 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgaggggttatgccctggaatgccttgtcattc-aactggtgagggcttatgctctgca 35365955  T
Q  138 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35365954 atgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 35365924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 21743709 - 21743854
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  21743709 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 21743807  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21743808 tcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 21743854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 14189366 - 14189525
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  14189366 atgccctagaatgccttgtcattcaactt-ttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgaaggcttatgccctggaatgt-ttatca 14189463  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14189464 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaacgcctagtcattcaacacgttggaaatggtgc 14189525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8776133 - 8775991
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776133 atgccctggaatgctc-gccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 8776035  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  8776034 tcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 8775991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 13849881 - 13849996
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  13849881 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 13849980  T
Q  138 atgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  13849981 atg-ttaatcattcaac 13849996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 13395787 - 13395933
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13395787 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 13395885  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  13395886 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 13395933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 13850006 - 13850168
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  13850006 cttatgccctagattgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-tt 13850104  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13850105 atcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 13850168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 21743634 - 21743776
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743634 atgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 21743733  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21743734 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 21743776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48785071 - 48784925
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48785071 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 48784973  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48784972 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 48784925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16573284 - 16573169
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  16573284 tgttgagggcttataccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctgga 16573185  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  16573184 atgctttgtcattcaa 16573169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 16592378 - 16592493
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  16592378 tgttgagggcttataccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctgga 16592477  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  16592478 atgctttgtcattcaa 16592493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38828031 - 38827916
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||    
T  38828031 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctaga 38827932  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| || |||||||||    
T  38827931 atgattcgtcattcaa 38827916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Original strand, 124498 - 124627
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124498 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 124596  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  124597 tcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 124627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 48743398 - 48743284
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||    
T  48743398 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctgga 48743299  T
Q  138 atgcttagtcattca 152  Q
    |||||| ||||||||    
T  48743298 atgctttgtcattca 48743284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4993291 - 4993190
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4993291 gttgagggctcatgccctggaatattaatcattcaaccattgagggcttatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 4993192  T
Q  139 tg 140  Q
    ||    
T  4993191 tg 4993190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Original strand, 14192118 - 14192276
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||     
T  14192118 cttatgccctagaatgctttgtcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactggtgagggcttatgccccggaatgt-tta 14192215  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14192216 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcctagtcattcaacacgttggaaatg 14192276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48785110 - 48784964
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48785110 cttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 48785012  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  48785011 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 48784964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16006199 - 16006085
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16006199 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 16006100  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    || ||| |||||||||    
T  16006099 tg-ttaatcattcaac 16006085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13255811 - 13255668
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13255811 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgctttgg 13255713  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13255712 cattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgttta-tcattcaa 13255668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 131
Target Start/End: Original strand, 709609 - 709702
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  709609 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgttgagggcttatgccctggaattccttgtcattcaaattgttgagggctcatgc 709702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13255578 - 13255414
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |    
T  13255578 cttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatccgggagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgaaggcttatgccctggaatgt-t 13255480  T
Q  104 tgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtg 169  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13255479 tatctttcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 13255414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Original strand, 21065508 - 21065600
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaat 99  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21065508 cttatgccctggaatgctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccatggaat 21065600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16573237 - 16573075
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  ||    
T  16573237 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaaccgttgatggctcatgtcctggaatgt-tt 16573139  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16573138 atcattcaaattgttgggggctcatgcccaggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 16573075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 16592425 - 16592587
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  ||    
T  16592425 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaacctgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaaccgttgatggctcatgtcctggaatgt-tt 16592523  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16592524 atcattcaaattgttgggggctcatgcccaggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 16592587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48785119 - 48785003
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  48785119 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 48785021  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  48785020 aatgctttgtcattcaac 48785003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 13395778 - 13395893
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  13395778 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 13395876  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13395877 aatgctttgtcattcaa 13395893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 14192083 - 14192223
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192083 atgccctggaatg-tttatcattcaa-ttgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 14192180  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14192181 ttc-aactggtgagggcttatgccccggaatgttta-tcattcaa 14192223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 17506111 - 17506254
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | | || |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17506111 atgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtca 17506210  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17506211 ttc-aattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 17506254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17547103 - 17546960
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | | || |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17547103 atgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccctggaatgctttgtca 17547004  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17547003 ttc-aattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 17546960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 14192072 - 14192186
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||    
T  14192072 gttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaa 14192170  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| | ||||||||||    
T  14192171 tgccttgtcattcaac 14192186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 14189324 - 14189430
Alignment:
Q  8 ttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14189324 ttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaacttttgagggcttatgccctggaatgctttgt 14189423  T
Q  107 cattcaa 113  Q
    |||||||    
T  14189424 cattcaa 14189430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 17506096 - 17506177
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  17506096 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaac 17506177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17547118 - 17547037
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  17547118 aaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgggggcttacgtcccggaatgctttgtcattcaac 17547037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 166
Target Start/End: Original strand, 47976002 - 47976121
Alignment:
Q  46 gctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 145  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47976002 gctcatgtcctgaaatgttaatcgttcaactgttgaggactcatgccttggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgattag 47976100  T
Q  146 tcattcaacacgatggaaatg 166  Q
    | |||||||||| || |||||    
T  47976101 taattcaacacgttgaaaatg 47976121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16459056 - 16458947
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||     
T  16459056 gagggctcatgccctagaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatg-gttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatg- 16458959  T
Q  142 ttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||||||||    
T  16458958 ttaatcattcaa 16458947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48743363 - 48743227
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |  |||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48743363 aattgttgagggcttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctggaatgctttgtcattcagattgttgggg-cttatgcc 48743265  T
Q  133 ccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    || |||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  48743264 ccagaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggtgc 48743227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16573326 - 16573208
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  16573326 aaattgttgatggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatg-ttaatcattc-aactgttgagggcttatgccc 16573229  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     ||||||  | ||||||||||    
T  16573228 tggaatgtcttgtcattcaac 16573208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 16592336 - 16592454
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  16592336 aaattgttgatggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttataccctggaatg-ttaatcattc-aactgttgagggcttatgccc 16592433  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     ||||||  | ||||||||||    
T  16592434 tggaatgtcttgtcattcaac 16592454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Original strand, 124564 - 124678
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124564 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 124662  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||    
T  124663 aatgcttagtcattca 124678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11660866 - 11660764
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  | |||||    
T  11660866 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ttgttgagagcttatgccctggaatgtttatcattcaattgtttagggcttatgccctggaatgtttagtcat 11660768  T
Q  110 tcaa 113  Q
    ||||    
T  11660767 tcaa 11660764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13255734 - 13255628
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  13255734 cttatgccctggaatgctttggcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaattggtgagggctcatgcccgggaacgccttgt 13255636  T
Q  107 cattcaaa 114  Q
    | ||||||    
T  13255635 cgttcaaa 13255628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 14189278 - 14189392
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||    
T  14189278 gttgagggc-catgccctagaatgtttatcattcaattgttgagggattatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaa 14189376  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| | ||||||||||    
T  14189377 tgccttgtcattcaac 14189392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Original strand, 124572 - 124678
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  124572 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 124671  T
Q  106 tcattca 112  Q
    |||||||    
T  124672 tcattca 124678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 167
Target Start/End: Original strand, 711021 - 711110
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatgg 167  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  711021 gttgagggctcatgcactggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatgg 711110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11660911 - 11660747
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcct 103  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |    
T  11660911 cttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatccgggagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgagagcttatgccctggaatgt-t 11660813  T
Q  104 tgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    | |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  11660812 tatcattcaa-ttgtttagggcttatgccctggaatgtttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 11660747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 14189311 - 14189431
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  14189311 aattgttgagggattatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaactt-ttgagggcttatgcc 14189409  T
Q  133 ccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    | ||||||||| ||||||||||    
T  14189410 ctggaatgctttgtcattcaac 14189431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 124486 - 124600
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  124486 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 124583  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  124584 aatgccttgtcattcaa 124600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13255823 - 13255705
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13255823 aattgttgagtgcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaa-ttgttgagggcttatgccc 13255726  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     ||||||||| | ||||||||    
T  13255725 tggaatgctttggcattcaac 13255705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8775947 - 8775873
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775947 ttgagggctcatgccctggaatgtcca-tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 8775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Original strand, 711011 - 711096
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  711011 cattcaaattgttgagggctcatgcactggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 711096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 13733840 - 13733955
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||    
T  13733840 tgttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaatcgttgagggctcatgccctggaatactatgtcattc-aatcgttgagggctcatgccctgg 13733938  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  13733939 aatgccttgtcattcaa 13733955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38827984 - 38827838
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |     
T  38827984 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgattcgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-tta 38827886  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     |||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  38827885 atcattc-aatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 38827838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16459013 - 16458919
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16459013 cttatgccctggaatggttatc-attcaaactgttgaggtctcatgccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggcgtatgctctggaatgc 16458919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 40555752 - 40555834
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||| ||||||||    
T  40555752 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccttgtgaatgcttaatcattcaa 40555834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 40555764 - 40555882
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||     
T  40555764 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccttgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggttcatgccctgtgaatgt 40555863  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttg 120  Q
    |||||||||||||||||||    
T  40555864 cttgtcattcaaattgttg 40555882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 13395779 - 13395855
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13395779 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 13395855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8776144 - 8776031
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| |||    
T  8776144 gttgagggctcatgccctggaatgctcgccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgga 8776047  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| | |||||||||    
T  8776046 atgccttgtcattcaa 8776031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 14189402 - 14189508
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  14189402 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgaaggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaacgcctag 14189500  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  14189501 tcattcaa 14189508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Original strand, 15731803 - 15731902
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15731803 tgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 15731902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 709656 - 709777
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||             |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  709656 cttatgccctggaattccttgtcattcaaattgttgagggctcatgc-------------tcattcaaactgttgatggcttatgccctggaatgccttg 709742  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  709743 tcatttaaactgttgagggctcatgccctggaatg 709777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4993175 - 4993059
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt--taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    |||||||||||||||||||||||    |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  4993175 gttgagggctcatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgtagggggcttatgccaag 4993077  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4993076 gaatgcttagtcattcaa 4993059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13407786 - 13407736
Alignment:
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13407786 cattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgctcagtcattcaacacg 13407736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16459021 - 16458904
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  16459021 gttgagggcttatgccctggaatggttatcattcaaactgttgaggtctcatgccctggaatgt-taatcattcaaactgttgagggcgtatgctctgga 16458923  T
Q  138 atgcttagtcattcaacac 156  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  16458922 atgcttagttattcaacac 16458904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 21065462 - 21065536
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21065462 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctctgtcattcaa 21065536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Original strand, 709722 - 709779
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtt 64  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  709722 cttatgccctggaatgccttgtcatttaaactgttgagggctcatgccctggaatgtt 709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15725554 - 15725457
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15725554 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaacttttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 15725457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 142
Target Start/End: Original strand, 21743623 - 21743688
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  21743623 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 21743688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8775981 - 8775873
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaa-tgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  8775981 cttatgccctggaactgccttgtcattcaatctattgagggctcatgccctggaatgtccatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 8775882  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  8775881 gtcattcaa 8775873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16005964 - 16005889
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16005964 gttgggggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggagcttatgccccggaatgtttagtcattcaa 16005889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Original strand, 13865390 - 13865485
Alignment:
Q  74 accgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||| || |||||||    
T  13865390 accgttgggggcttatgtcctggaatgctttaaccattcaaattgttgggggctcatgcgccggaatgctcagtcattcgatacgttgaaaatggt 13865485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Original strand, 17506187 - 17506241
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17506187 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aattgttgagggcttatgccctggaatg 17506241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 17547027 - 17546973
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17547027 cttatgccctggaatgctttgtcattc-aattgttgagggcttatgccctggaatg 17546973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 22122709 - 22122816
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttggggg 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22122709 cattcaaattgttgagggatcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgaggg 22122808  T
Q  125 cttatgcc 132  Q
    || |||||    
T  22122809 ctcatgcc 22122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 40555910 - 40556017
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttggggg 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40555910 cattcaaattgttgagggatcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgaggg 40556009  T
Q  125 cttatgcc 132  Q
    || |||||    
T  40556010 ctcatgcc 40556017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4993164 - 4993099
Alignment:
Q  10 atgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4993164 atgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 4993099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 14192068 - 14192147
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  14192068 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-tttatcattc-aattgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaac 14192147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 132
Target Start/End: Original strand, 8757396 - 8757452
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8757396 gttgagggcttatgcactgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 8757452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16005997 - 16005929
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16005997 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgggggctcatgccctggaatgttcatcattcaa 16005929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16006203 - 16006125
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  16006203 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 16006125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Original strand, 16668616 - 16668699
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16668616 aattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 16668699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Original strand, 17642986 - 17643069
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17642986 aattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 17643069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 21735541 - 21735601
Alignment:
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatgg 167  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21735541 cattcaaatcgttgggggctcatgccctggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatgg 21735601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4325106 - 4324975
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||    
T  4325106 cttatgccctgtgaatgcattgtcattcaaactgttgatggctcataccctgtgaatgcttaatcattcaagttgttgggggcttatgccctgtgaatgc 4325007  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4325006 tagttgattcaaattgttgagggcttatgccc 4324975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7507505 - 7507636
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  7507505 cttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggttcatgccctgtgaatacttaattattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgc 7507604  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7507605 tagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 7507636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Original strand, 7507570 - 7507677
Alignment:
Q  30 attcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggc 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||     
T  7507570 attcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggt 7507669  T
Q  126 ttatgccc 133  Q
    | ||||||    
T  7507670 tcatgccc 7507677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 7507628 - 7507759
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||    
T  7507628 cttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggttcatgccctgtgaatacttaattattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgc 7507727  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7507728 tagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 7507759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 21065502 - 21065576
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  21065502 tgagggcttatgccctggaatgctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 21065576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Original strand, 21519342 - 21519424
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21519342 aattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttgactattcaactgttgagggctcatgccctggaatgtcttgtcattcaaa 21519424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48743351 - 48743296
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  48743351 cttatgccctggaatcccttgtcattcaaactgtggagggctcatgccctggaatg 48743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 72
Target Start/End: Original strand, 47975967 - 47976001
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975967 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc 47976001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 17506226 - 17506295
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||| |||||||||    
T  17506226 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaac 17506295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17546988 - 17546919
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||| |||||||||    
T  17546988 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgtcccggaatgcttagtcattcaac 17546919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 21735517 - 21735574
Alignment:
Q  6 acttatgccctggaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21735517 acttatgtcctggaatgctttaaccattcaaatcgttgggggctcatgccctggaatg 21735574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 12202057 - 12202149
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12202057 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctg 12202149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14038662 - 14038579
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14038662 aattggtgagggctcatgccttgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 14038579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14348692 - 14348609
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14348692 aattggtgagggctcatgccttgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 14348609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15689944 - 15689865
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15689944 gttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgtcttgtcattcaaa 15689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15697537 - 15697458
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15697537 gttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgtcttgtcattcaaa 15697458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15725542 - 15725455
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15725542 atgccctggaatgctttgtcattcaactt-ttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccctg 15725455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Original strand, 21065471 - 21065563
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  21065471 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctctgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 21065563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Original strand, 22122769 - 22122816
Alignment:
Q  8 ttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgcc 54  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22122769 ttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 22122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 54
Target Start/End: Original strand, 40555970 - 40556017
Alignment:
Q  8 ttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgcc 54  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40555970 ttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 40556017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4324991 - 4324913
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  4324991 gttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgaggtcttatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 4324913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4325114 - 4325036
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||| || ||| | ||||||||| ||||||||    
T  4325114 gttgagggcttatgccctgtgaatgcattgtcattcaaactgttgatggctcataccctgtgaatgcttaatcattcaa 4325036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17065689 - 17065655
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17065689 gagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 17065655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 22122648 - 22122797
Alignment:
Q  10 atgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgcctt 104  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||       
T  22122648 atgccctgtgaatgtnttgtcattcaaattgttgagggtccatgccatgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggatcatgccctgtgaatgctag 22122747  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||    
T  22122748 ttcattcaaattgttgggggtttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 22122797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23442378 - 23442324
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23442378 tgagggctcttgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 23442324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Original strand, 7507497 - 7507554
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7507497 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactgttgagggttcatgccc 7507554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8776148 - 8776080
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8776148 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgccattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgct 8776080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 153
Target Start/End: Original strand, 40555869 - 40555998
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttggggg 124  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||||    
T  40555869 cattcaaattgttgagggtccatgccatgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggatcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttggggg 40555968  T
Q  125 cttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
     |||||||| | |||||| | |||||||||    
T  40555969 tttatgccctgtgaatgccttgtcattcaa 40555998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 113
Target Start/End: Original strand, 44190974 - 44191058
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc--aaccgttgagggcttatgcc-ctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  44190974 aaattgttgggggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaaaccgttgagggcttatgccacgtgaatgccttgtcattcaa 44191058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 54
Target Start/End: Original strand, 8757416 - 8757452
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgcc 54  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8757416 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgcc 8757452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 151
Target Start/End: Original strand, 12202049 - 12202125
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc-cggaatgcttagtcattc 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  12202049 gttgagggcttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcattc 12202125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Original strand, 12202121 - 12202189
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12202121 cattccaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaatcgttgagggcttatgccctg 12202189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 12208671 - 12208763
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| ||| || ||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  12208671 cttatgccctgtgaacgccttgtcgttcaaaccgttgagggctcatgccctgggaatgcttaatcgttccaactgttgagggcttatgccctg 12208763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 153
Target Start/End: Original strand, 12757143 - 12757175
Alignment:
Q  121 ggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12757143 ggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaa 12757175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13407809 - 13407753
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13407809 cttatgtcttggaatgctttaaccattcaaattgttgggggctcatgccccggaatg 13407753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Original strand, 13865401 - 13865457
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttg-ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  13865401 cttatgtcctggaatgctttaaccattcaaattgttgggggctcatgcgccggaatg 13865457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 126)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 179747 - 179909
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  179747 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgatttgtcattcaactgttgagggcttacgccctggaatgccttg 179846  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  179847 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 179909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16799516 - 16799347
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16799516 cttatgccccggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 16799418  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16799417 gtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 16799347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 23396066 - 23396214
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23396066 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaattgttgggggcttatgccctagaatgccttg 23396165  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23396166 tcattcaaattgttgggggattatgccctggaatgctttgtcattcaac 23396214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 15010461 - 15010605
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15010461 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttcagggctcatgccctggaatgccttgtca 15010559  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010560 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 15010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 153
Target Start/End: Original strand, 52338959 - 52339078
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52338959 aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 52339058  T
Q  134 cggaatgcttagtcattcaa 153  Q
     ||||||| | |||||||||    
T  52339059 tggaatgccttgtcattcaa 52339078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54973066 - 54972935
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtca 108  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54973066 atgctctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtca 54972967  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54972966 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54972935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54975676 - 54975545
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtca 108  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54975676 atgctctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtca 54975577  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54975576 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54975545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 54978286 - 54978155
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttgtca 108  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54978286 atgctctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttgtca 54978187  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  54978186 ttcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 54978155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 10989921 - 10990047
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989921 cttatgccctgtaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 10990020  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  10990021 cattcaatctgttgagggctcatgccc 10990047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2035345 - 2035493
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2035345 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgcctt 2035443  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2035444 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2035493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2039086 - 2039234
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2039086 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgcctt 2039184  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2039185 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2042827 - 2042975
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2042827 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgcctt 2042925  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042926 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 2042975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14037974 - 14037826
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14037974 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 14037876  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037875 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14037826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14041442 - 14041294
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14041442 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 14041344  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041343 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 14041294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10554215 - 10554073
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10554215 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctagaatgctcgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 10554117  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10554116 tcaaattgttgggggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 10554073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 603939 - 604056
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  603939 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccag 604038  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||    
T  604039 aatgcttagtcattcaac 604056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 14951842 - 14951958
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14951842 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccgg 14951941  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||    
T  14951942 aatgcttagtcattcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18958693 - 18958546
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18958693 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaaatgcctt 18958595  T
Q  105 gtcatt-caaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958594 gtcatttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 18958546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 179701 - 179816
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  179701 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaa 179800  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    || || ||||||||||    
T  179801 tgatttgtcattcaac 179816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 2039047 - 2039193
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2039047 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2039145  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  2039146 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 2039193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 2042788 - 2042934
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2042788 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2042886  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  2042887 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 2042934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 6806018 - 6806132
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  6806018 tgttgagggctcatgccctggaatgctaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgga 6806117  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  6806118 atgttta-tcattcaa 6806132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10554101 - 10553994
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10554101 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggctcatgccctggaacgccttgt 10554002  T
Q  107 cattcaaa 114  Q
    | ||||||    
T  10554001 cgttcaaa 10553994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Original strand, 52339053 - 52339175
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52339053 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagagctcatgccctgaaatgttaatcattcaactgttgatggcttatgccctggaatgccttgtcat 52339152  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    ||||  ||||| ||||| |||||    
T  52339153 tcaatctgttgagggctcatgcc 52339175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16799604 - 16799487
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799604 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 16799505  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  16799504 aatgctttgtcattcaac 16799487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39230546 - 39230430
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39230546 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattc-aactgttgggggcttatgccccgg 39230448  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39230447 aatgcttagtcattcaac 39230430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2038852 - 2038998
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2038852 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2038950  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2038951 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2038998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2038930 - 2039076
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2038930 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2039028  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2039029 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2038969 - 2039115
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2038969 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2039067  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2039068 tcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2039115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2042593 - 2042739
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2042593 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2042691  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042692 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2042671 - 2042817
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2042671 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2042769  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042770 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2042710 - 2042856
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2042710 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2042808  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042809 tcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 2035306 - 2035452
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2035306 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2035404  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  2035405 tcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 2035452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2038813 - 2038959
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2038813 cttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2038911  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2038912 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2038959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 2042554 - 2042700
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2042554 cttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttg 2042652  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2042653 tcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2042700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54973194 - 54973081
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54973194 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 54973096  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  54973095 tgccttgtcattcaa 54973081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54975804 - 54975691
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54975804 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 54975706  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  54975705 tgccttgtcattcaa 54975691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54978414 - 54978301
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  54978414 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaa-tgttgagggcttatgccctggaa 54978316  T
Q  139 tgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| | |||||||||    
T  54978315 tgccttgtcattcaa 54978301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7632010 - 7631933
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7632010 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7631933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16799553 - 16799409
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16799553 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 16799454  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  16799453 ttcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16799409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 178
Target Start/End: Original strand, 55292743 - 55292843
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacctt 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292743 gttgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcaacc-gtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacctt 55292841  T
Q  177 ga 178  Q
    ||    
T  55292842 ga 55292843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 23396145 - 23396308
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||  |||| | ||||||||||||||||  ||     
T  23396145 cttatgccctagaatgccttgtcattcaaattgttgggggattatgccctggaatgctttgtcattcaactattgatgacttatgccctggaatgt-tta 23396243  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  23396244 tcattcaaattgttgggggcttatgccccgatatacttagtcattcaacacgttgaaaatagtgc 23396308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Original strand, 30206558 - 30206638
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30206558 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 30206638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 6806065 - 6806172
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  6806065 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgggggcttatgccccggaatgcttag 6806164  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  6806165 tcattcaa 6806172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 2038804 - 2038920
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  2038804 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 2038902  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  2038903 aatgctttgtcattcaac 2038920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 2042545 - 2042661
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  2042545 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 2042643  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  2042644 aatgctttgtcattcaac 2042661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54046540 - 54046463
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54046540 gttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcgaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 54046463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54973148 - 54973001
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  54973148 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaat-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgcttt 54973050  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54973049 gtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 54973001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54975758 - 54975611
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  54975758 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaat-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgcttt 54975660  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54975659 gtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 54975611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54978368 - 54978221
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  54978368 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaat-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgcttt 54978270  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54978269 gtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 54978221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 2035297 - 2035412
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||    
T  2035297 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctgg 2035395  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2035396 aatgctttgtcattcaa 2035412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14037983 - 14037867
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  14037983 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 14037884  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  14037883 aatgccttgtcattcaa 14037867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14041451 - 14041335
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  14041451 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 14041352  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  14041351 aatgccttgtcattcaa 14041335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16799593 - 16799449
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16799593 atgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctttgtc 16799494  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16799493 attc-aactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 16799449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 6806056 - 6806187
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6806056 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaactgttgggggcttatgccccg 6806154  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6806155 gaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 6806187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 170
Target Start/End: Original strand, 10834465 - 10834592
Alignment:
Q  43 agggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10834465 agggctcatgccctggagtgttttgtcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccataatgc 10834563  T
Q  142 ttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||    
T  10834564 ttagtcattcaacatgttgaaaatggtgc 10834592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Original strand, 1989349 - 1989491
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggc 125  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |  |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  1989349 ccattcaaattggtgggggcgcatgccctggaatgtcttgtcattcaaactgttgagggttcatgccctagaatgt-ttatcattcacattgttgggggc 1989447  T
Q  126 ttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtg 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1989448 ttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtg 1989491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 3395009 - 3395140
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  3395009 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatga 3395108  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3395109 cttgtcattcaaattgttgagggctcatgccc 3395140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54973156 - 54973041
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||    
T  54973156 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctgga 54973057  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  54973056 atgctttgtcattcaa 54973041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54975766 - 54975651
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||    
T  54975766 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctgga 54975667  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  54975666 atgctttgtcattcaa 54975651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54978376 - 54978261
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||    
T  54978376 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaatgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctgga 54978277  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||| |||||||||    
T  54978276 atgctttgtcattcaa 54978261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6819160 - 6819033
Alignment:
Q  8 ttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  6819160 ttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccatgaaatgtttatcattcaaactatttagggctcatgccctggaatgccttg 6819061  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6819060 tcattcaaactgttgagggctcatgccc 6819033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 168
Target Start/End: Original strand, 10989991 - 10990121
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989991 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 10990089  T
Q  137 aatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||    
T  10990090 aatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 10990121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17211213 - 17211123
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  17211213 gttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 17211123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18958705 - 18958625
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18958705 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 18958625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 52339119 - 52339250
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    |||||| |||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52339119 tgttgatggcttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccatggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccg 52339217  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  52339218 gaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 52339250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 3394997 - 3395079
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3394997 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 3395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Original strand, 30206566 - 30206635
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30206566 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaac 30206635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 1989371 - 1989475
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattca-accgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  1989371 atgccctggaatgtcttgtcattcaaactgttgagggttcatgccctagaatgtttatcattcacattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtca 1989470  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  1989471 ttcaa 1989475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10554227 - 10554113
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||    
T  10554227 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctagaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctgg 10554130  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  10554129 aatgctttgtcattcaa 10554113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 15010449 - 15010564
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||| ||    
T  15010449 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttcagggctcatgccctgg 15010547  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  15010548 aatgccttgtcattcaa 15010564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16799608 - 16799528
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  16799608 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 16799528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18958701 - 18958602
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  18958701 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgga 18958603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 23396054 - 23396133
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  23396054 aaccgttgagcgcttatgccctggaatgccttgtcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 23396133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 10989999 - 10990106
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  10989999 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 10990098  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  10990099 tcattcaa 10990106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Original strand, 52339010 - 52339065
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52339010 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 52339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 52339128 - 52339235
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  52339128 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccatggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 52339227  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  52339228 tcattcaa 52339235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54972958 - 54972884
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54972958 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 54972884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54975568 - 54975494
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54975568 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 54975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54978178 - 54978104
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54978178 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgcttagtcattca 54978104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6819078 - 6818963
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||      ||||| |||||| ||||||    
T  6819078 atgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgtttatcattcaaactgtagagg------gccctagaatgcattgtca 6818985  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatg 130  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  6818984 ttcaaactgttgagggcttatg 6818963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 2035298 - 2035374
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2035298 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 2035374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10554149 - 10554033
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||    
T  10554149 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 10554050  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  10554049 aatg-ttaatcattcaac 10554033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 14951890 - 14951958
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  14951890 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6818976 - 6818887
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6818976 gttgagggcttatgtcctgtaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttataccc-ggaattcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 6818887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39230537 - 39230431
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  39230537 cttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgggggcttatgccccggaatgcttag 39230439  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  39230438 tcattcaa 39230431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54972991 - 54972884
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||| |     
T  54972991 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgctta 54972892  T
Q  105 gtcattca 112  Q
    ||||||||    
T  54972891 gtcattca 54972884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54975601 - 54975494
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||| |     
T  54975601 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgctta 54975502  T
Q  105 gtcattca 112  Q
    ||||||||    
T  54975501 gtcattca 54975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54978211 - 54978104
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||| |     
T  54978211 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgcctcggaatgctta 54978112  T
Q  105 gtcattca 112  Q
    ||||||||    
T  54978111 gtcattca 54978104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 10989875 - 10989949
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  10989875 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctgtaatgctttgtcattcaa 10989949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 14951789 - 14951918
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||            | |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14951789 atgcccttgaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatg------------ctgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcat 14951875  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    || || ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14951876 tc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 14951918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 52339001 - 52339118
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  52339001 tgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagagctcatgccctg 52339100  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaac 154  Q
     |||| ||| |||||||||    
T  52339101 aaatg-ttaatcattcaac 52339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 14951854 - 14951958
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14951854 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccccggaatgcttagtc 14951952  T
Q  108 attcaa 113  Q
    ||||||    
T  14951953 attcaa 14951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 101
Target Start/End: Original strand, 14951778 - 14951841
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14951778 gttgagggctcatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgc 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 14951774 - 14951842
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14951774 aaccgttgagggctcatgcccttgaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgct 14951842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 15010450 - 15010526
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15010450 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgctgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaac 15010526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 603951 - 604002
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  603951 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 604002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17211214 - 17211138
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  17211214 tgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 17211138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54973198 - 54973120
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54973198 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54973120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54975808 - 54975730
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54975808 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54975730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54978418 - 54978340
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54978418 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 54978340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Original strand, 55292742 - 55292818
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  55292742 tgttgagggcttatgccctgaaatgctttgtcattcaaccgtggagggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 55292818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9919 - 9884
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9919 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 9884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 2035427 - 2035494
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  2035427 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 2035494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 2039168 - 2039235
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  2039168 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 2039235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 2042909 - 2042976
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  2042909 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 2042976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 10989915 - 10989989
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10989915 tgagggcttatgccctgtaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 10989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 7631999 - 7631933
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  7631999 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 7631933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Original strand, 12856058 - 12856092
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856058 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 12856092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15232239 - 15232141
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15232239 gttgagggctcatgacctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaatttgttgagggcttatgccc 15232141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15238107 - 15238009
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15238107 gttgagggctcatgacctaggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaatttgttgagggcttatgccc 15238009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 43928441 - 43928391
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43928441 gttgagggcttatgccatgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggct 43928391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 54046529 - 54046463
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  54046529 atgccctggaatgccttgtcattcgaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 54046463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 10989884 - 10990027
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  10989884 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctgtaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatc 10989982  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  10989983 attc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 10990027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 10834472 - 10834535
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    |||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10834472 atgccctggagtgttttgtcattcaa-ttgttgagggcttatgccctagaatgtttatcattcaa 10834535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35984753 - 35984717
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35984753 tgagggcttacgccctggaatgccttgtcattcaaat 35984717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 12855959 - 12856105
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| |||||||| ||||| || | |||||||  | |||||||| |||||||  |||||| ||      
T  12855959 atgccctggaatgccttgccgttcaa-ttggagagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaattggtgagggctcatgccctatgaatgctttaa 12856057  T
Q  107 c-attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  12856058 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 12856105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 57
Target Start/End: Original strand, 18367772 - 18367811
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367772 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctg 18367811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 52213463 - 52213514
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52213463 cttatgccctgtgaatgcttgatcattcaaattgttgagggctcatgccctg 52213514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 603990 - 604056
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  603990 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtcattcaac 604056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6819003 - 6818941
Alignment:
Q  12 gccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  6819003 gccctagaatgcattgtcattcaaactgttgagggcttatgtcctgtaatgtttatcattcaa 6818941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Original strand, 18367772 - 18367830
Alignment:
Q  96 gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | ||||||||    
T  18367772 gaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgctaaatcattcaa 18367830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 114
Target Start/End: Original strand, 12856069 - 12856106
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12856069 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaa 12856106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42109238 - 42109185
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  42109238 gagggcttatgccctggaacaccttgttgttcaaattggtgagggcttatgccc 42109185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Original strand, 3395114 - 3395142
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395114 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 3395142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15446460 - 15446424
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15446460 tgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 15446424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 11736 - 11887
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11736 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttg 11835  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11836 tcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 11887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 11696 - 11843
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11696 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgcttt 11795  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  11796 gtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 11843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 11688 - 11805
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  11688 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgg 11787  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11788 aatgctttgtcattcaac 11805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 11684 - 11764
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  11684 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 11764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 2288246 - 2288415
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  2288246 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaactattgagggttcatgccctggaatgctttg 2288345  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2288346 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 2288415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15538980 - 15538810
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15538980 cttatgctccggaaagctttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgggatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 15538881  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctacct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15538880 gtcattcaaattgttgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgttacct 15538810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13764104 - 13763942
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |    
T  13764104 cttatgccctggtatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccgtggaatttttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatg-tttat 13764006  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13764005 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 13763942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 15686436 - 15686594
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15686436 cttatgccctggaatgctatgtcattcaaca-gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 15686534  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15686535 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacccgttggaaat 15686594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8522667 - 8522533
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaa-tgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8522667 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaattgccttg 8522568  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8522567 tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 8522533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16102140 - 16101992
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16102140 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgcctt 16102042  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16102041 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 16101992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 23621251 - 23621394
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23621251 atgccctggaatgctttgacattcaact-gttgagggttcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctgtaatgccttgtca 23621349  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23621350 ttcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 23621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29492561 - 29492446
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29492561 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatgcctcgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 29492462  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||||||||||||    
T  29492461 aatgcttagtcattca 29492446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16829604 - 16829487
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829604 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 16829505  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    | ||||||||||||||||    
T  16829504 attgcttagtcattcaac 16829487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16812582 - 16812467
Alignment:
Q  40 ttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16812582 ttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggat 16812483  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||    
T  16812482 tgcttagtcattcaac 16812467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 13764338 - 13764231
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13764338 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcctggt 13764239  T
Q  107 cattcaaa 114  Q
    | ||||||    
T  13764238 cgttcaaa 13764231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13764416 - 13764270
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13764416 cttatgccctagaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgatggcttatgccctggaatgctttgt 13764317  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13764316 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaac 13764270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12595754 - 12595607
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12595754 cttatgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 12595656  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12595655 tcattcaaattgttggggacttatgccctagaatgcttagtcattcaac 12595607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23352243 - 23352115
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23352243 gagggctcatgccttggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 23352145  T
Q  141 cttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23352144 cttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 23352115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8522713 - 8522599
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  8522713 gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaa 8522614  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    || ||| |||||||||    
T  8522613 tg-ttaatcattcaac 8522599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13764182 - 13764057
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13764182 cttatgccctggaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggattgtttatcattcaattgttgatggcttatgccctggtatgctttgt 13764083  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13764082 cattcaaactgttgagggctcatgcc 13764057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16804752 - 16804648
Alignment:
Q  51 tgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcat 149  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16804752 tgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttggggtcttatgccccggattgcttagtcat 16804653  T
Q  150 tcaac 154  Q
    |||||    
T  16804652 tcaac 16804648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 221747 - 221618
Alignment:
Q  41 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  221747 tgagggatcatgccctggaatgcttcgtcactcaattgttgatggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaat 221649  T
Q  140 gcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  221648 gcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 221618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15539068 - 15538952
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15539068 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgggggcttatgctccgg 15538969  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    || |||| |||||||||    
T  15538968 aaagctttgtcattcaa 15538952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16102149 - 16102033
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  16102149 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgg 16102050  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  16102049 aatgccttgtcattcaa 16102033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24440978 - 24440865
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24440978 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaactgttgagggctcatgccttggaatg-tttatcattgaaattgtt-ggggcttatgccccgga 24440881  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| |||||||||||    
T  24440880 atgcgtagtcattcaa 24440865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13764260 - 13764134
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13764260 cttatgccctggaatgcctggtcgttcaaactgccgagggctcatgctctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgatttgt 13764161  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13764160 cattcaaactgttgagggctcatgccc 13764134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15539060 - 15538912
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||  |||| |||||||||| | |||| || ||    
T  15539060 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttgccattcaaattgttgggggcttatgctccggaaagcttt 15538961  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||    
T  15538960 gtcattcaaattgttgagggctcatgccctgggatgctttgtcattcaa 15538912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13764494 - 13764349
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||| ||| || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  13764494 cttatgccctgtaatgcctggtcatttaaactgctgagggctcattctctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctagaatgatttgt 13764395  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13764394 cattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 13764349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 29848499 - 29848615
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  29848499 gttgagggcttatgcccttgaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatcattcaaatttttgagggcttatgcctcgaa 29848597  T
Q  138 atgcttagtcattcaaca 155  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29848598 atgcttagtcattcaaca 29848615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 154
Target Start/End: Original strand, 23621196 - 23621316
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| | |||||    
T  23621196 aaattgttgagggctcatgccctggaatgctttttcattcaactattgagggctcatgccctggaatgctttgacattc-aactgttgagggttcatgcc 23621294  T
Q  133 ccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    | ||||||||| ||||||||||    
T  23621295 ctggaatgctttgtcattcaac 23621316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8522556 - 8522481
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522556 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 8522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 23621212 - 23621354
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  23621212 atgccctggaatgctttttcattc-aactattgagggctcatgccctggaatgctttgacattcaactgttgagggttcatgccctggaatgctttgtca 23621310  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| || ||||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  23621311 ttc-aactgttgagggcttatgccctgtaatgccttgtcattcaa 23621354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24266762 - 24266659
Alignment:
Q  67 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctt-agtcattcaacacgatggaaat 165  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  24266762 tcattcaaccgttaacggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccataatgcttaagtcattcaacacgttgaaaat 24266664  T
Q  166 ggtgc 170  Q
    |||||    
T  24266663 ggtgc 24266659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 15686428 - 15686542
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  15686428 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaacagttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgga 15686526  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| | |||||||||    
T  15686527 atgccttgtcattcaa 15686542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8522589 - 8522481
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaat-gctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |     
T  8522589 cttatgccctggaattgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgctta 8522490  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  8522489 gtcattcaa 8522481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12595763 - 12595648
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgtta-atcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  12595763 tgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaactgttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgg 12595665  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  12595664 aatgccttgtcattcaa 12595648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15539072 - 15539004
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15539072 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgc 15539004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23352235 - 23352132
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  23352235 atgccttggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtca 23352137  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  23352136 ttcaa 23352132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 2288234 - 2288315
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||||||||    
T  2288234 aaccgttgaaggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattcaac 2288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1584358 - 1584259
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1584358 tgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 1584259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12389648 - 12389545
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  12389648 aaattgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaagtgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcat 12389549  T
Q  130 gccc 133  Q
    ||||    
T  12389548 gccc 12389545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 13751328 - 13751411
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattc-aaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  13751328 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaattattcaa 13751411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1639189 - 1639059
Alignment:
Q  8 ttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaaccg-ttgagggcttatgccctg-gaatgcc 102  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||     
T  1639189 ttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgct 1639090  T
Q  103 ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1639089 agttcattcaaattgttgagggcttatgccc 1639059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 15686424 - 15686504
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15686424 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aacagttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattcaac 15686504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 23621326 - 23621394
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23621326 cttatgccctgtaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaa 23621394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 29848495 - 29848573
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  29848495 aaccgttgagggcttatgcccttgaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgttta-tcattcaa 29848573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12389594 - 12389463
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattca-accgttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12389594 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcagactgttgagggctcatgccctgtgaatgc 12389495  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
     |  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  12389494 ttaatcattcaaattgttaagggctcatgccc 12389463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 29848507 - 29848573
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29848507 cttatgcccttgaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgtttatcattcaa 29848573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12595762 - 12595686
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  12595762 gttgagggcttatgccctggaatgctatgtcattc-aactgttgagggcttatgctctagaatgctttgtcattcaac 12595686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 221738 - 221635
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||| | ||||    
T  221738 atgccctggaatgcttcgtcactcaa-ttgttgatggcttatgccctggaatgtttatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtca 221640  T
Q  109 ttcaa 113  Q
    |||||    
T  221639 ttcaa 221635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 153
Target Start/End: Original strand, 2288238 - 2288353
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | |||||| ||    
T  2288238 gttgaaggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcaagccctggaatgccttgtcattc-aactattgagggttcatgccctgg 2288336  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2288337 aatgctttgtcattcaa 2288353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8522717 - 8522639
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  8522717 aaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 8522639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13764194 - 13764076
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||  || |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  13764194 aattgttgagggcttatgccctggaatgatttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggattgt-ttatcattcaa-ttgttgatggcttatgcc 13764097  T
Q  133 ccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    | || |||||| |||||||||    
T  13764096 ctggtatgctttgtcattcaa 13764076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16829592 - 16829541
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16829592 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaatg 16829541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24440949 - 24440864
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24440949 cattcaaactgttgagggctcatgccttggaatgtttatcattgaaattgttg-gggcttatgccccggaatgcgtagtcattcaaa 24440864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 25807000 - 25806922
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25807000 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 25806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13764373 - 13764244
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  13764373 atgccctggaatg-tttatcattcaa-ttgttgatggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatc 13764277  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||||||    
T  13764276 attcaact-gttgagggcttatgccctggaatgc 13764244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21469870 - 21469786
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  21469870 atgccctggaacgccttgtcgttcaa-ttggtgagggctcatgccctggaatgctagtcattcaattggtgagggctcatgccctg 21469786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 29265593 - 29265486
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29265593 atgccctggaacgccttgtcgttcaa-ttggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggcttatgccttggaatgccttg 29265495  T
Q  106 tcattcaaa 114  Q
    |||||||||    
T  29265494 tcattcaaa 29265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16812572 - 16812521
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16812572 atgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg 16812521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25806992 - 25806861
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  25806992 cttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaaactattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatg- 25806894  T
Q  102 cttgt-cattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    || || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  25806893 ctagtccattcaaattgttgaaggcttatgccc 25806861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29492549 - 29492498
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29492549 atgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggctcatgccctggaatg 29492498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 133
Target Start/End: Original strand, 9185938 - 9185992
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  9185938 ttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttc-aattgttgagggcttatgccc 9185992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16804752 - 16804702
Alignment:
Q  11 tgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16804752 tgccctggaatgctatgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatg 16804702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16812533 - 16812466
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  16812533 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggattgcttagtcattcaacc 16812466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16829553 - 16829486
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  16829553 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggattgcttagtcattcaacc 16829486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18137514 - 18137479
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18137514 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 18137479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 9186007 - 9186096
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9186007 cattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccttgaaattccttgtcattcaaa 9186096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18137527 - 18137493
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18137527 ccattcaaattggtgagggctcatgccctggaatg 18137493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21469879 - 21469807
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  21469879 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttc-aattggtgagggctcatgccctggaatgc-tagtcattcaa 21469807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Original strand, 1590639 - 1590708
Alignment:
Q  65 aatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1590639 aatcattcaacttttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 1590708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 13764506 - 13764469
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13764506 aaccgttgagggcttatgccctgtaatgcctggtcatt 13764469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24266822 - 24266782
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  24266822 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttatcattcaa 24266782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29492510 - 29492458
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29492510 atgccctggaatgcctcgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 29492458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14146
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13994 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcctt 14093  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14094 gtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 14146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 13982 - 14062
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  13982 aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 14062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 9)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20950 - 20788
Alignment:
Q  8 ttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20950 ttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 20851  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20850 tcattcaaattgttgagggctcatgccccgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 20788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21029 - 20883
Alignment:
Q  8 ttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21029 ttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggttcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgaggatttatgccctggaatgccttgt 20930  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20929 cattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 20883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21076 - 20963
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||    
T  21076 tgttgaggg-tcatgccctggaatgttaatcatttaactgttgagggtttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggttcatgccctgga 20978  T
Q  138 atgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  20977 atgttta-tcattcaa 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24025 - 23866
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24025 atgccctggaatg-tttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 23927  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23926 attcaaactattgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 23866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24026 - 23921
Alignment:
Q  49 catgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| | |||    
T  24026 catgccctggaatgtttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 23927  T
Q  148 attcaa 153  Q
    ||||||    
T  23926 attcaa 23921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 20911 - 20856
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20911 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 20856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 35678 - 35577
Alignment:
Q  14 cctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaatc-attcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattc 111  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35678 cctggaatgccttgtcattcaa-ttggtgagggctcatgccctgtgaatgctaatttatccaattggtgagggcttacgccctggaatgccttgtcattc 35580  T
Q  112 aaa 114  Q
    |||    
T  35579 aaa 35577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 23989 - 23881
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |  |||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| |     
T  23989 cttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctagaatgctta 23890  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  23889 gtcattcaa 23881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 24742 - 24707
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24742 tgagggcttacgccctggaatgccttgtcattcaaa 24707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 6)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 137708 - 137562
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  137708 cttattccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatgttaatcattcaacagttgagggcttatgccctagaacgccttgt 137609  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  137608 cgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 137562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 137630 - 137468
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |     
T  137630 cttatgccctagaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tc 137532  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
     | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  137531 attattcaaattgttgggggcttatgctccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 137468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 137754 - 137680
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  137754 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttattccctggaatgctttgtcattcaa 137680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 81269 - 81323
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  81269 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 81323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 137714 - 137639
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaaca 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  137714 tgagggcttattccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg-ttaatcattcaaca 137639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 137745 - 137653
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||    
T  137745 atgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttattccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgctctggaatg 137653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 7)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2272 - 2140
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  2272 cttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgctttat 2173  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||    
T  2172 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaat 2140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2194 - 2061
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2194 cttatgccctggaatgctttatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatattaatcattcaaccgttgagggattatgccctagaatgccttgt 2095  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
    |||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2094 cattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 1994
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  2084 gttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagtcattcaacccgttgaaaatggt 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2318 - 2244
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2318 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaa 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 2115 - 2009
Alignment:
Q  8 ttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||| | ||    
T  2115 ttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcttagt 2016  T
Q  107 cattcaa 113  Q
    |||||||    
T  2015 cattcaa 2009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2309 - 2166
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  2309 atgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatc 2211  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  2210 attc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgctttatcattcaa 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2278 - 2204
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||    
T  2278 tgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 2204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 32886 - 32741
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  32886 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 32788  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32787 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 32741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32960 - 32838
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32960 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 32862  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||    
T  32861 tcaatctgttgagggctcatgccc 32838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32972 - 32858
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  32972 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 32875  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  32874 aatgccttgtcattcaa 32858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 81926 - 82071
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |      
T  81926 cttatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctagaatgttaatcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttca 82024  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82025 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattca 82071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 81852 - 81974
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81852 atgccctggaatgctttgtcattcaacc-gttgagggctcatgccctggaatgctcgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcat 81950  T
Q  110 tcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||  ||||| ||||| ||||||    
T  81951 tcaatctgttgagggctcatgccc 81974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 81840 - 81954
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||    
T  81840 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggctcatgccctggaatg-ctcgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctgg 81937  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  81938 aatgccttgtcattcaa 81954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Original strand, 134263 - 134380
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134263 gttgagggctcatgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 134362  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||    
T  134363 aatgcttagtcattcaac 134380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 134274 - 134379
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  134274 atgccctggaatgctatgtcattcaaatcgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 134373  T
Q  108 attcaa 113  Q
    ||||||    
T  134374 attcaa 134379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 76
Target Start/End: Original strand, 134314 - 134381
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc 76  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  134314 atgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacc 134381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 8)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 59307 - 59151
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaa-tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  59307 atgccctggaatgctttgtcattcacct-gttgagggctcatgctctggaatgttttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatg--ttatca 59211  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  59210 ttaaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 59151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 59389 - 59242
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  59389 cttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttg 59290  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||| |  ||||| ||||| |||| | |||||| || ||||||||||    
T  59289 tcattc-acctgttgagggctcatgctctggaatgttttgtcattcaac 59242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 205352 - 205483
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgc 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  205352 cttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgtttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgc 205451  T
Q  102 cttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  205452 tagttcattcaaattgttgagggcttatgccc 205483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 59401 - 59320
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  59401 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattcaac 59320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 205344 - 205422
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  205344 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgtttaatcattcaa 205422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 59397 - 59283
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||    
T  59397 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaacctattgagggctcatgctctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctgg 59299  T
Q  137 aatgcttagtcattca 152  Q
    ||||||| ||||||||    
T  59298 aatgctttgtcattca 59283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 384173 - 384090
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  384173 aattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 384090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 384138 - 384104
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  384138 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 384104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 10)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 12516 - 12662
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12516 cttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaaactgttgagggcttatgccctgaaatgccttg 12615  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  12616 tcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 12662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 12595 - 12689
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12595 cttatgccctgaaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccctggaatgc 12689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 13158 - 13296
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  13158 cttatgccctgaaatgctttgtcattcatct-gttgacggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-tta 13255  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagt 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13256 tcattcaaattgtttggggcttatgccccagaatgcttagt 13296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 13078 - 13226
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13078 cttatgccctggaatgcctcgtgattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgctgagggcttatgccctgaaatgcttt 13177  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| |  |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13178 gtcattc-atctgttgacggcttatgccctggaatgctttgtcattcaac 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 12504 - 12583
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  12504 aaccgttgagggcttatgccttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 12583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 13066 - 13146
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  13066 aaccattgagggcttatgccctggaatgcctcgtgattcaaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 13146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Original strand, 12559 - 12690
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  12559 atgccctggaatg-tttatcattcaaactgttgagggcttatgccctgaaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatc 12656  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgct 142  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12657 attcaa-ttgttgagggcttatgccctggaatgct 12690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 124965 - 125073
Alignment:
Q  11 tgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac--cgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  124965 tgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgagggcttacgccctggaatgccttg 125064  T
Q  106 tcattcaaa 114  Q
    |||||||||    
T  125065 tcattcaaa 125073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 141
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13094
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||    
T  13030 gttgagggcttatgccttggatagccttgtcattcaaaccattgagggcttatgccctggaatgc 13094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 133
Target Start/End: Original strand, 124965 - 125009
Alignment:
Q  89 tgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  124965 tgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 125009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 50840 - 50684
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  50840 atgcccttgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccctagaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgt-ttatca 50742  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  50741 ttcaaattgtttggggcttatgccccggaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatg 50684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 51010 - 50939
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51010 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatt 50939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 50964 - 50815
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattc-aaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgcctt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  50964 cttatgccctggaatgccttgtcattttaaactgttgagggctcatgccctgaaatgtttatcgttcaatcgttgagggcttatgccctgtgaatgcttt 50865  T
Q  105 -gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
       |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||||||    
T  50864 aaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgccttgtcattcaa 50815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 50893 - 50774
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcccc 134  Q
    |||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  50893 gttgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgcccttgaatgccttgtcattcaaactgttgagggcttatgccct 50794  T
Q  135 ggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  50793 agaatgctttgtcattcaac 50774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0860
Description:

Target: scaffold0860; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 148
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  298 cttatgccctgggatgccttgtcatccaact-gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactattgagggatcatgccctggaatgtcttg 200  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  199 tcattcaaattgttgagggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacg 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 230
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||    
T  346 tgttgagggctcatgccctagaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctgggatgccttgtca-tccaactgttgagggctcatgccctgg 248  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  247 aatgctttgtcattcaac 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4463 - 4313
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4463 cttatgccctgggatgccttgtcatccaacta-ttgagggctaatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgccttg 4365  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4364 tcattcaaattgttgagggcttgtgccctggaatgcttagtcattcaacacg 4313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4538 - 4395
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4538 atgccctggaatgctttgtcatccaact-gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgcgggcttatgccctgggatgccttgtca 4440  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
     || || | ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4439 -tccaactattgagggctaatgccctggaatgctttgtcattcaac 4395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4548 - 4434
Alignment:
Q  40 ttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| || |    
T  4548 ttgagggctcatgccctggaatgctttgtcatccaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgcgggcttatgccctggga 4450  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||| | ||||| ||||    
T  4449 tgccttgtcatccaac 4434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 3951 - 4096
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3951 cttatgccctggaatgccttgtcatttaaaccgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaattgttgagggcttatgccatggaatgccttgt 4050  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  4051 cattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 4096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 3994 - 4153
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  3994 atgccctggaatg-tttatcattcaa-ttgttgagggcttatgccatggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatc 4090  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4091 attcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 4153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 3939 - 4018
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  3939 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcatttaaaccgttgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 4018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Original strand, 6088 - 6190
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| |||    
T  6088 tgttgagggctcatgccctggaatgttaagcattcaaccgttgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgga 6187  T
Q  138 atg 140  Q
    |||    
T  6188 atg 6190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6243
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6167 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatctttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 6243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Original strand, 6135 - 6242
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  6135 cttatgccctagaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgttcatctttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 6234  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  6235 tcattcaa 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2931 - 2830
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||    
T  2931 gttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaa 2832  T
Q  139 tg 140  Q
    ||    
T  2831 tg 2830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2894 - 2777
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2894 tgttgagggcttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatga-tcatcattcaaattgttaggggcttatgccgcg 2796  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2795 gaatgcttagtcattcaac 2777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2885 - 2818
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2885 cttatgccctggaatgtcttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Original strand, 1813 - 1945
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgt 106  Q
    |||||||  |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1813 cttatgcgttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcataccctagaatgttaatcattcaactgttgaggactgatgccctggaatgccttgt 1912  T
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||| |||||    
T  1913 cattcaaactgttgatggctcatgccctggaat 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 1882 - 2013
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg 135  Q
    |||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1882 tgttgaggactgatgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggggcttacaccccg 1980  T
Q  136 gaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1981 gaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 1894 - 1958
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1894 atgccctggaatgccttgtcattcaaactgttgatggctcatgccctggaatatttatcattcaa 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 126
Target Start/End: Original strand, 1805 - 1854
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1805 gttgagggcttatgcgttggaatgccttgtcattcaaactgttgagggct 1854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1646 - 1488
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||    
T  1646 atgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg-ttcatc 1548  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1547 attc-aattgctgggggcttatgccctggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1657 - 1554
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||| ||    
T  1657 gttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaatctgttgagggctcatgccctgg 1558  T
Q  137 aatg 140  Q
    ||||    
T  1557 aatg 1554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1661 - 1581
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  1661 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgccattcaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaa 1581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 6)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2276 - 2161
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  2276 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgg 2177  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  2176 aatgttta-tcattcaa 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9120 - 9005
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  9120 tgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgg 9021  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  9020 aatgttta-tcattcaa 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2264 - 2106
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  2264 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatc 2167  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  2166 attcaaattgttgggggcttaagcctcggaatgcttagtcattcagcacgttgaaaatggt 2106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9108 - 8950
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||  || ||    
T  9108 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatc 9011  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  9010 attcaaattgttgggggcttaagcctcggaatgcttagtcattcagcacgttgaaaatggt 8950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2228 - 2161
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2228 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9072 - 9005
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9072 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 9005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 40183 - 40328
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40183 cttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttactccctggaatgccttg 40281  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  40282 tcattcaaactgttaagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 40328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Original strand, 40137 - 40251
Alignment:
Q  40 ttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||    
T  40137 ttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccctggaa 40235  T
Q  139 tgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||| ||||||||||    
T  40236 tgctttgtcattcaac 40251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 40147 - 40289
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtca 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40147 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtca 40245  T
Q  109 ttcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| || ||||| |||||||  ||| ||||||| | |||||||||    
T  40246 ttc-aactgttgagggcttactccctggaatgccttgtcattcaa 40289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 40225 - 40388
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||||||||||  |  |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||  || ||    
T  40225 atgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggcttactccctggaatgccttgtcattcaaactgttaagggctcatgccctggaatgt-ttatc 40322  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgctac 173  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  40323 attcaaattgttgggggcttaaggcccagaatgttatgtcattcaacacgttgaaaatggtactac 40388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6873 - 6709
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttg-ccattcaaatt-gttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgcc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||      
T  6873 cttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaactgttgagggctcatgcccaggaatgt- 6775  T
Q  103 ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  6774 ttatcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcatcacgttgaaaatggt 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1417
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1505 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggct 1417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1430
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  1509 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1458 - 1414
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcat 51  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1458 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgagggctcat 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1443
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  1494 atgccctggaatgctttgtcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatg 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5819 - 5685
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5819 aattgtcgagggcttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcatttaaattgttgggggcttatgcc 5721  T
Q  133 ccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5720 ccggaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 5685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5854 - 5752
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  5854 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaattgtcgagggcttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctgga 5755  T
Q  138 atg 140  Q
    |||    
T  5754 atg 5752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5807 - 5700
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatca-ttcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  |||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  5807 cttatgccctggaatgacttatcattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgtttatcatttaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttag 5708  T
Q  106 tcattcaa 113  Q
    ||||||||    
T  5707 tcattcaa 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 133
Target Start/End: Original strand, 165629 - 165714
Alignment:
Q  48 tcatgccctggaatgttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  165629 tcatgccctggaatgttaatcattcaactgttgagggcttatgccctggaatgcattgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Original strand, 165666 - 165714
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccc 55  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  165666 cttatgccctggaatgcattgtcattcaaactgttgagggctcatgccc 165714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 7)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 8967 - 9112
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||  |      
T  8967 cttatgccctggaatgcctttc-attcaatctgttgagggctcatgccctggaatgaaaatcattcaaaatgttgagggctcatgccctggaatgt-tca 9064  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  9065 tcattcaaattgttgggggcttaagccccggaaagctcagtcattcaa 9112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 8850 - 8983
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |  || ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8850 atgccctggaatgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgagggctcatgccctgaaatgctttgtc 8949  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgc 141  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  8950 attcaaattggtgagggcttatgccctggaatgc 8983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Original strand, 8930 - 9021
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa-ccgttgagggcttatgccctggaatg 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  8930 atgccctgaaatgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaatgcctttcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 9021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Original strand, 8807 - 8955
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||| ||| || ||| | ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||    
T  8807 cttatgccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaacgcctt 8906  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||| ||||||  | || ||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  8907 gtcgttcaaagcggtgagggctcatgccctgaaatgctttgtcattcaa 8955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 8887 - 9021
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8887 cttatgccctggaacgccttgtcgttcaaagcggtgagggctcatgccctgaaatgctttgtcattcaaattggtgagggcttatgccctggaatgcctt 8986  T
Q  105 gtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatg 140  Q
     ||||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8987 -tcattcaatctgttgagggctcatgccctggaatg 9021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 153
Target Start/End: Original strand, 8801 - 8875
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||  | || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  8801 tgagggcttatgccctagaacgccttgtcgttcaaagcggtgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaa 8875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Original strand, 10019 - 10102
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10019 aattggtgagggctcattccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgggggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 10102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 157
Target Start/End: Original strand, 34925 - 35074
Alignment:
Q  8 ttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||  ||     
T  34925 ttatgccctggaatgctttgtcattcaact-gttgagggattatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgt-tta 35022  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35023 tcattcaaattgttgggggcttatgccccgaaatgcttagtcattcaacacg 35074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Original strand, 34885 - 35011
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34885 cttatgccctggaatgctttgtcattcaaca-gttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggattatgccctagaatgccttg 34983  T
Q  106 tcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34984 tcattcaaactgttgagggctcatgccc 35011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 34876 - 34991
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||  |    
T  34876 tgttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattcaacagttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggattatgccctag 34974  T
Q  137 aatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| | |||||||||    
T  34975 aatgccttgtcattcaa 34991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 154
Target Start/End: Original strand, 34877 - 34953
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34877 gttgagggcttatgccctggaatgctttgtcattc-aacagttgagggtttatgccctggaatgctttgtcattcaac 34953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 223630 - 223759
Alignment:
Q  41 tgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaat 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  223630 tgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaattgttgaggggttatgccatggaatgt-ttatcattcaaattgttgggggcttgtgtcccagaat 223728  T
Q  140 gcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  223729 gcttagtcattcaacacgttgaaaatggtgc 223759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 223639 - 223702
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  223639 atgccctggaatgctttgtcattcaa-ttgttgaggggttatgccatggaatgtttatcattcaa 223702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14035 - 13898
Alignment:
Q  30 attcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||    
T  14035 attcaaactgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggg-ctta 13938  T
Q  129 tgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  13937 tgccccgaaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 13898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14113 - 13989
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaa-ccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||  | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  14113 aattgttgagggcttatgccctgtgaatggtagttcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaactattcaaactgttgagggctcat 14014  T
Q  130 gccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||  ||||||| | ||||||||||    
T  14013 gccttggaatgcattgtcattcaac 13989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12030 - 11893
Alignment:
Q  30 attcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggctta 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||    
T  12030 attcaaactgttgagggctcatgccttggaatgcattgtcattcaactgttgagggctcatgccctggaatat-ttatcattcaaattgttgggg-ctta 11933  T
Q  129 tgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  11932 tgccccgaaatgcttagtcattcaacatgttgaaaatggt 11893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 11984
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaa-ccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtc-attcaaattgttgggggcttat 129  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||  | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  12108 aattgttgagggcttatgccctgtgaatggtagttcattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaactattcaaactgttgagggctcat 12009  T
Q  130 gccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||  ||||||| | ||||||||||    
T  12008 gccttggaatgcattgtcattcaac 11984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9735 - 9618
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccgg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||  |    
T  9735 tgttgacggctcatgccctggaatgctttgtcattaaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgcccttg 9636  T
Q  137 aatgcttagtcattcaac 154  Q
     |||||| ||||||||||    
T  9635 tatgctttgtcattcaac 9618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9608 - 9546
Alignment:
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9608 attcaaattgttgggggcttatgccccagaatgcctagtcattcaacacattggaaatggtgc 9546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 9723 - 9619
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  9723 atgccctggaatgctttgtcatt-aaaccgttgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaaccgttgagggctcatgcccttgtatgctttgtc 9625  T
Q  108 attcaa 113  Q
    ||||||    
T  9624 attcaa 9619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1209 - 1050
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgt-taatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtc 107  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  |  |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1209 atgccctggaatg-tttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 1111  T
Q  108 attcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1110 attcaaacttttgagggctcatgccctagaatgcttagtcattcaacacgttgaaaatggt 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1210 - 1105
Alignment:
Q  49 catgccctggaatgttaatcattcaaccg-ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtc 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| | |||    
T  1210 catgccctggaatgtttatcattcaaactattgagggcttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtc 1111  T
Q  148 attcaa 153  Q
    ||||||    
T  1110 attcaa 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1065
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgcctt 104  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |  |||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| |     
T  1173 cttatgccctagaatgccttgtcattcaaactgttgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaaacttttgagggctcatgccctagaatgctta 1074  T
Q  105 gtcattcaa 113  Q
    |||||||||    
T  1073 gtcattcaa 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1926 - 1891
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1926 tgagggcttacgccctggaatgccttgtcattcaaa 1891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10643 - 10554
Alignment:
Q  78 ttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  10643 ttgagggctcatgccctggaatgt-ttatcattcaaattattgggggcttatgccccggaatgcttactcattcaacacgttgaaaatggt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 10676 - 10609
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10676 cttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgtttatcattcaa 10609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10694 - 10609
Alignment:
Q  67 tcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10694 tcattcaactattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaactattgagggctcatgccctggaatgttta-tcattcaa 10609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10723 - 10648
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  10723 gttgagggcttatgccctagaataccctgtcattc-aactattgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 10648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10466
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaac 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10546 aaccgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10542 - 10467
Alignment:
Q  39 gttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  10542 gttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaa 10467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10531 - 10466
Alignment:
Q  10 atgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaac 75  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  10531 atgccctggaatgctttgtcattc-aactgttgagggctcatgccccggaatgcttagtcattcaac 10466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 207 - 128
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  207 gttgagggctcatgccctggaatgt-tcatcattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaacacg 128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 132
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||||    
T  208 tgttgagggctcatgccctggaatgttcatcattcaaattgttgggggctcatgccccggaatgcttagtcattcaa 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 29351 - 29459
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttggggg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||||||||| |||    
T  29351 cattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgaggg 29450  T
Q  125 cttatgccc 133  Q
    |||||||||    
T  29451 cttatgccc 29459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 29323 - 29398
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29323 gagggcttatgccctatgaattccttgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 29398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20791 - 20683
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttggggg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| || ||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  20791 cattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcattccctgcgaatgctatttcattcaaattgttgaggg 20692  T
Q  125 cttatgccc 133  Q
    |||||||||    
T  20691 cttatgccc 20683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20818 - 20744
Alignment:
Q  81 agggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20818 agggcttatgccttgtgaatgcctcgtcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 20744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 91
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattc-aaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  174 aaccgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaattattcaa 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 120082 - 120021
Alignment:
Q  107 cattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggt 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  120082 cattcaaattgttgggggctcatgccccagaatgctcagtcattcaacacgttgaaaatggt 120021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 113
Target Start/End: Original strand, 174911 - 174952
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  174911 aaccgttgagggcttatgccttgtgaatgccttgtcattcaa 174952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 151 - 271
Alignment:
Q  5 cacttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaat 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  151 cacttatgccctgtgaatgccttggcattcaaattattgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaat 250  T
Q  100 gccttgtcattcaaattgttg 120  Q
    ||    |||||||||||||||    
T  251 gctagttcattcaaattgttg 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21322 - 21233
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccggaatgcttagtcattcaacacgatggaaatggtgc 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  21322 gagggctcatgccctagaatgctttttcattcaact-gttgagggcttatgcctcggaatgcttagttattcaacacgttaaaaatggtgc 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21404 - 21352
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgcc 132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  21404 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttc-aattggtgagggcttatgcc 21352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21322 - 21262
Alignment:
Q  42 gagggctcatgccctggaatg-ttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21322 gagggctcatgccctagaatgctttttcattcaactgttgagggcttatgcctcggaatgc 21262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33743 - 33625
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaat-gttaatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    |||||||||    
T  33743 gaatgcttagtcattcaaactgttgagggctcatgccatgtgaatacttaattattcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaaa 33644  T
Q  115 ttgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  33643 ttgttgagggctcatgccc 33625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33651 - 33623
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33651 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 33623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 114
Target Start/End: Original strand, 21838 - 21927
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21838 cattcaaaccgttgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaa 21927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Original strand, 21879 - 21913
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21879 ccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 21913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 524768 - 524714
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  524768 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 524714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6696 - 6615
Alignment:
Q  75 ccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattc-aaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  6696 ccgttaagggcttatgccccgtgaatgccttgtcattcaaaattgttgagggcttatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6644 - 6552
Alignment:
Q  7 cttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatgtta-atcattc-aaccgttgagggcttatgccctg 95  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  6644 cttatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgttagttcattcaaattgttgagggcttatgccctg 6552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6652 - 6595
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6652 gttgagggcttatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccc 6595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2869
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctggaatg-ttaatcatt-caaccgttgagggcttatgccct 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  2808 aattgttgagggctcatgccctggaatgcttaatcattccaactgttgagggctcatgccct 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 177992 - 177909
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  177992 aattggtgagggctcatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 177909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20810 - 20775
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20810 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 20775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 3666 - 3720
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  3666 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcgttcaaattggtgagagcttatgccc 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17983 - 17929
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  17983 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattggtgagggcttatgccc 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17900 - 17865
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17900 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 17865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Original strand, 877 - 958
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatgttaat-cattcaaccgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  877 aattggtgagggctcatgccctgtgaatggtagttcattcaattggtgaggactcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3093 - 3036
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3093 gttgaggggttatgccctgtgaatgccttgtccttcaaattgttgagggctcatgccc 3036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3084 - 2954
Alignment:
Q  8 ttatgccctg-gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccct-ggaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgcc 102  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||     
T  3084 ttatgccctgtgaatgccttgtccttcaaattgttgagggctcatgccctatgaatgcttaatgattcaaattgtttagggctcatgccctgtgaatgct 2985  T
Q  103 ttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |  ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  2984 taatcattcaaattattgagggctcatgccc 2954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 34558 - 34475
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||  |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34558 aattgttgagggcttatgccctgtgactgctttaaccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatgctttgtcattcaaa 34475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 34523 - 34489
Alignment:
Q  28 ccattcaaattgttgagggctcatgccctggaatg 62  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34523 ccattcaaactgttgagggctcatgccctggaatg 34489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 29355 - 29300
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  29355 gttgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttc-aattgttgaggggttatgccc 29300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34593 - 34538
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  34593 gttgagggctcatgccctggaacaccttgtcatt-taattgttgagggcttatgccc 34538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1668
Alignment:
Q  18 gaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattcaacc-gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaa 113  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||    ||||||||    
T  1549 gaatgccttgtcgttcaaactgttgagggatcatgccttgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgctagttcattcaa 1648  T
Q  114 attgttgggggcttatgccc 133  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  1649 attgttgagggcttatgccc 1668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Original strand, 30 - 65
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 4)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7147 - 7048
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctg-gaatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||  | | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7147 tgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatgccctgtgaatgctattttatttaaattgttgagggcttatgccc 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7191 - 7089
Alignment:
Q  34 aaattgttgagggctcatgccctg-gaatgt-taatcattcaaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatg 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |  || |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||    
T  7191 aaattgttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttcaactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaaattgttgagggctcatg 7092  T
Q  131 ccc 133  Q
    |||    
T  7091 ccc 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7186 - 7109
Alignment:
Q  77 gttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccccg-gaatgcttagtcattcaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7186 gttgagggcttatgccctgtgaatgccttgtcgttc-aactgttgagggctcatgccctgtgaatgcttaatcattcaa 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 7115 - 7087
Alignment:
Q  29 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7115 cattcaaattgttgagggctcatgccctg 7087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 114
Target Start/End: Original strand, 27043 - 27078
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27043 tgagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 27078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Original strand, 16107 - 16213
Alignment:
Q  31 ttcaaattgttgagggctcatgccctgg-aatg-ttaatcattc-aaccgttgagggcttatgccctg-gaatgccttgtcattcaaattgttgggggct 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  16107 ttcaaactgttgagggctcatgtcgtgggaatgcttaatcattccaactgttgagggcttatgccctgtgaatgctagttcattcaaattgttgagtgct 16206  T
Q  127 tatgccc 133  Q
     ||||||    
T  16207 catgccc 16213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 114
Target Start/End: Original strand, 7227 - 7261
Alignment:
Q  80 gagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7227 gagggctcatgccctggaatgccttgtcattcaaa 7261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25624 - 25570
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  25624 tgagggctcatgccctggaacgccttgtcgttcaaattagtgagggcttatgccc 25570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 133
Target Start/End: Original strand, 92723 - 92776
Alignment:
Q  79 tgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaattgttgggggcttatgccc 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  92723 tgagggcttatgccctggaacgccttgtcgttc-aattggtgagggcttatgccc 92776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 92729 - 92840
Alignment:
Q  7 cttatgccctggaatgctttgccattcaaattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac--cgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||   || || ||||| ||||||||||||||    
T  92729 cttatgccctggaacgccttgtcgttcaa-ttggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaattcggtgtgggctcatgccctggaatgc 92827  T
Q  102 cttgtcattcaaa 114  Q
    |||||||||||||    
T  92828 cttgtcattcaaa 92840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 2770 - 2742
Alignment:
Q  73 aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2770 aaccgttgagggcttatgccctggaatgc 2742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8655 - 8572
Alignment:
Q  35 aattgttgagggctcatgccctg-gaatg--ttaatcattcaac-cgttgagggcttatgccctggaatgccttgtcattcaaa 114  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8655 aattggtgagggcttatgccctgtgaatgctttaaccattcaaatcggtgagggctcatgccctagaatgccttgtcattcaaa 8572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 15732 - 15768
Alignment:
Q  38 tgttgagggctcatgccctggaatgttaatcattcaa 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15732 tgttgagggctcatgccctggaatgatcatcattcaa 15768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University