View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10120_low_5 (Length: 449)

Name: NF10120_low_5
Description: NF10120
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10120_low_5
NF10120_low_5
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (11-435)||(41760688-41761112)
chr4 (11-435)||(11254891-11255315)
chr4 (11-435)||(49523871-49524295)
chr4 (10-435)||(35402628-35403053)
chr4 (11-435)||(51012666-51013090)
chr4 (35-434)||(43520178-43520577)
chr4 (51-435)||(42981359-42981743)
chr4 (4-435)||(2692239-2692671)
chr4 (112-435)||(48645809-48646130)
chr4 (112-435)||(54386880-54387203)
chr4 (91-398)||(834096-834402)
chr4 (91-398)||(5438561-5438863)
chr4 (234-435)||(41782261-41782462)
chr4 (234-409)||(319846-320021)
chr4 (234-409)||(4172686-4172861)
chr4 (234-409)||(33265350-33265525)
chr4 (234-409)||(43507993-43508168)
chr4 (27-169)||(11641094-11641236)
chr4 (282-435)||(11602416-11602569)
chr4 (257-386)||(11640838-11640967)
chr4 (296-385)||(52867414-52867503)
chr4 (11-89)||(41760561-41760638)
chr4 (31-96)||(32652936-32653001)
chr4 (28-96)||(4614587-4614655)
chr4 (28-150)||(28101484-28101606)
chr4 (28-141)||(7150446-7150559)
chr4 (28-83)||(27385571-27385626)
chr4 (31-85)||(13449570-13449624)
chr4 (281-365)||(7150221-7150305)
chr4 (44-96)||(10544180-10544232)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (10-435)||(41041545-41041969)
chr8 (35-435)||(27691905-27692305)
chr8 (35-435)||(33707795-33708195)
chr8 (14-435)||(40338637-40339065)
chr8 (11-375)||(5037235-5037599)
chr8 (11-409)||(29237959-29238357)
chr8 (11-409)||(15307058-15307455)
chr8 (11-409)||(15487427-15487824)
chr8 (11-409)||(27405104-27405501)
chr8 (113-435)||(42942533-42942855)
chr8 (113-435)||(22272998-22273328)
chr8 (27-435)||(13485114-13485493)
chr8 (112-416)||(26239504-26239808)
chr8 (112-435)||(7744193-7744516)
chr8 (11-374)||(3152492-3152863)
chr8 (251-435)||(8609008-8609192)
chr8 (251-435)||(38547966-38548150)
chr8 (251-435)||(13107574-13107758)
chr8 (112-416)||(41824733-41825037)
chr8 (167-406)||(9672292-9672531)
chr8 (251-435)||(13283135-13283314)
chr8 (234-409)||(35510181-35510356)
chr8 (234-409)||(33761643-33761818)
chr8 (234-409)||(600809-600984)
chr8 (13-370)||(11720339-11720697)
chr8 (31-150)||(12515887-12516006)
chr8 (31-96)||(28432939-28433004)
chr8 (28-96)||(25371236-25371304)
chr8 (28-70)||(10770940-10770982)
chr8 (67-150)||(24285797-24285880)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (11-435)||(30599169-30599592)
chr3 (11-435)||(17516069-17516491)
chr3 (11-435)||(43765880-43766304)
chr3 (10-435)||(27898075-27898499)
chr3 (11-435)||(46198479-46198902)
chr3 (11-435)||(44275179-44275601)
chr3 (11-435)||(21349453-21349877)
chr3 (35-435)||(2660973-2661373)
chr3 (11-435)||(2377755-2378172)
chr3 (35-435)||(44794958-44795358)
chr3 (51-435)||(2225165-2225555)
chr3 (11-377)||(54899250-54899624)
chr3 (26-435)||(46113226-46113635)
chr3 (25-435)||(610353-610763)
chr3 (113-435)||(23292232-23292554)
chr3 (11-313)||(53188661-53188963)
chr3 (112-435)||(48829886-48830209)
chr3 (112-435)||(51685350-51685673)
chr3 (176-435)||(35904851-35905113)
chr3 (251-435)||(41978487-41978671)
chr3 (161-435)||(42280246-42280521)
chr3 (251-435)||(7884094-7884278)
chr3 (234-407)||(38192457-38192630)
chr3 (236-409)||(46609724-46609897)
chr3 (234-409)||(53093197-53093372)
chr3 (234-409)||(46309776-46309951)
chr3 (10-151)||(35904709-35904850)
chr3 (309-435)||(53190118-53190247)
chr3 (29-199)||(13466154-13466324)
chr3 (281-387)||(24845668-24845776)
chr3 (28-96)||(32843436-32843504)
chr3 (28-95)||(23876220-23876287)
chr3 (31-96)||(41945414-41945479)
chr3 (28-96)||(35862440-35862508)
chr3 (45-96)||(2976359-2976410)
chr3 (377-435)||(54899172-54899230)
chr3 (281-365)||(35862691-35862775)
chr3 (34-106)||(49495067-49495139)
chr3 (281-370)||(22219218-22219308)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (11-435)||(38473085-38473508)
chr7 (11-435)||(6604264-6604688)
chr7 (11-435)||(22154639-22155063)
chr7 (11-435)||(22210554-22210978)
chr7 (30-435)||(23905232-23905637)
chr7 (11-435)||(45360076-45360499)
chr7 (25-435)||(35692326-35692735)
chr7 (11-435)||(24227382-24227806)
chr7 (35-435)||(27665031-27665431)
chr7 (11-435)||(34775923-34776346)
chr7 (35-435)||(29995501-29995901)
chr7 (11-435)||(46438470-46438895)
chr7 (78-435)||(39858271-39858627)
chr7 (113-435)||(37114591-37114913)
chr7 (134-435)||(13168822-13169122)
chr7 (11-416)||(47385168-47385576)
chr7 (221-430)||(38550441-38550650)
chr7 (166-435)||(37792150-37792419)
chr7 (11-166)||(69132-69287)
chr7 (234-409)||(35402545-35402719)
chr7 (176-435)||(48851450-48851708)
chr7 (26-174)||(48310948-48311096)
chr7 (241-343)||(69032-69134)
chr7 (221-334)||(20478921-20479034)
chr7 (339-409)||(66845-66915)
chr7 (28-150)||(11683621-11683743)
chr7 (31-96)||(4321800-4321865)
chr7 (43-186)||(7402878-7403021)
chr7 (27-86)||(32840551-32840610)
chr7 (31-96)||(34691873-34691938)
chr7 (272-387)||(48310750-48310867)
chr7 (34-106)||(34784575-34784647)
chr7 (45-144)||(23168652-23168751)
chr7 (28-105)||(40360951-40361028)
chr7 (281-365)||(13035621-13035705)
chr7 (40-96)||(13035937-13035993)
chr7 (31-95)||(48302873-48302936)
chr7 (78-117)||(13169123-13169162)
chr7 (389-435)||(30939748-30939794)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (4-435)||(6798264-6798696)
chr2 (4-435)||(14388047-14388487)
chr2 (11-416)||(2767691-2768096)
chr2 (11-435)||(16763704-16764128)
chr2 (11-435)||(17696965-17697389)
chr2 (11-435)||(39455918-39456341)
chr2 (78-435)||(19907308-19907664)
chr2 (11-409)||(6784249-6784648)
chr2 (113-440)||(40560978-40561305)
chr2 (11-409)||(24206492-24206900)
chr2 (11-261)||(34401144-34401394)
chr2 (11-204)||(44708783-44708976)
chr2 (263-435)||(39663994-39664166)
chr2 (11-144)||(42518389-42518522)
chr2 (289-435)||(44708996-44709142)
chr2 (341-435)||(42518524-42518618)
chr2 (28-150)||(4047377-4047499)
chr2 (221-334)||(37021388-37021501)
chr2 (28-199)||(20941686-20941856)
chr2 (28-96)||(26581545-26581613)
chr2 (112-191)||(19581960-19582039)
chr2 (28-141)||(161441-161554)
chr2 (326-371)||(37646238-37646283)
chr2 (31-96)||(38149341-38149406)
chr2 (281-365)||(161216-161300)
chr2 (35-106)||(7744707-7744778)
chr2 (28-56)||(11022252-11022280)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (11-435)||(9008-9432)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (11-435)||(7371944-7372367)
chr6 (35-435)||(20524126-20524526)
chr6 (4-435)||(32438035-32438465)
chr6 (18-416)||(18644031-18644437)
chr6 (11-373)||(32517672-32518034)
chr6 (61-435)||(11355948-11356321)
chr6 (112-435)||(7050498-7050821)
chr6 (112-435)||(10569141-10569462)
chr6 (10-334)||(33267838-33268155)
chr6 (112-325)||(6901999-6902212)
chr6 (11-157)||(9399135-9399281)
chr6 (319-435)||(6900225-6900341)
chr6 (221-324)||(32455022-32455125)
chr6 (28-96)||(17935548-17935616)
chr6 (11-53)||(11356316-11356358)
chr6 (281-365)||(24431587-24431671)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (11-435)||(6817677-6818101)
chr1 (18-435)||(27088026-27088442)
chr1 (11-435)||(26224506-26224938)
chr1 (11-435)||(50555064-50555488)
chr1 (35-435)||(46582573-46582973)
chr1 (11-373)||(45045464-45045826)
chr1 (11-373)||(37345137-37345499)
chr1 (11-373)||(25277328-25277698)
chr1 (10-409)||(33600104-33600511)
chr1 (25-435)||(15105185-15105595)
chr1 (113-435)||(3012516-3012838)
chr1 (92-435)||(31237556-31237891)
chr1 (113-435)||(51895228-51895550)
chr1 (156-435)||(2870338-2870617)
chr1 (251-435)||(34777338-34777522)
chr1 (112-397)||(52642698-52642981)
chr1 (251-435)||(4855167-4855351)
chr1 (234-409)||(8168515-8168690)
chr1 (11-87)||(37087316-37087392)
chr1 (221-334)||(9120813-9120926)
chr1 (221-334)||(1443400-1443513)
chr1 (221-334)||(47012213-47012326)
chr1 (28-96)||(42558848-42558916)
chr1 (28-96)||(3369967-3370035)
chr1 (281-365)||(3370338-3370422)
chr1 (34-106)||(51122987-51123059)
chr1 (28-56)||(5784211-5784239)
chr1 (28-92)||(32086009-32086073)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (18-435)||(21841740-21842157)
chr5 (11-435)||(2180514-2180934)
chr5 (35-435)||(2853253-2853653)
chr5 (78-435)||(12737844-12738200)
chr5 (78-435)||(12800667-12801023)
chr5 (11-409)||(42472444-42472841)
chr5 (92-435)||(30464679-30465022)
chr5 (113-439)||(32134897-32135223)
chr5 (113-435)||(8540410-8540732)
chr5 (222-435)||(28821119-28821332)
chr5 (11-208)||(28821360-28821557)
chr5 (251-435)||(7268584-7268768)
chr5 (284-435)||(24540425-24540576)
chr5 (11-129)||(17575700-17575819)
chr5 (11-129)||(17577011-17577130)
chr5 (11-133)||(18624276-18624398)
chr5 (11-129)||(17574980-17575099)
chr5 (132-349)||(41494524-41494741)
chr5 (221-334)||(40781430-40781543)
chr5 (222-334)||(29620912-29621024)
chr5 (31-96)||(1344283-1344348)
chr5 (28-94)||(28036377-28036443)
chr5 (35-96)||(18341214-18341275)
chr5 (31-141)||(1343744-1343854)
chr5 (34-106)||(27349967-27350039)
chr5 (281-365)||(27076733-27076817)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (11-435)||(107547-107970)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (61-435)||(301-682)
scaffold0345 (11-53)||(677-719)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (221-435)||(4043-4257)
scaffold0058 (221-435)||(5215-5429)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (27-287)||(1497-1752)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 41760688 - 41761112
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41760688 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagt 41760787  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41760788 attttgtttgattgagttgttgaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 41760887  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
      |       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760888 ggcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 41760987  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41760988 cataccagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcata 41761087  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  41761088 ccatcataagtcatatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 11254891 - 11255315
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11254891 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgttggataaagttaattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 11254990  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11254991 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattatattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttat 11255090  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       ||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255091 gtcaaaaaatttcaatcaaattgatcgttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 11255190  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11255191 cacaacagatatcactgtgatcattagtgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcata 11255290  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  11255291 ccatcataagtcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49524295 - 49523871
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524295 caaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 49524196  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  49524195 attttgtttgattgagttgtttaaaatattattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttct 49524096  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524095 gtcaaaatatttcaatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 49523996  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49523995 cacaacaaatataactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaacacagacatttgcata 49523896  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  49523895 ccatcataagtcatatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Original strand, 35402628 - 35403053
Alignment:
Q  10 gcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402628 gcaaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 35402727  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttc 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  35402728 tattttttttgattgagttgtttaaaatgctattgtactgtgccaagtccgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccctta 35402827  T
Q  210 tctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 309  Q
    | ||       |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35402828 tgtcaaaaaatttcaatcaaattggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattt 35402927  T
Q  310 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35402928 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacgacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35403027  T
Q  410 atcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||    
T  35403028 accatcataagtcatatatttgatgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51013090 - 51012666
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013090 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtaagcttaggttgattaagatattgataggagt 51012991  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51012990 attttgtttgactgggttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 51012891  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51012890 atcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaatttt 51012791  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51012790 cacaacagatattactgcgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcata 51012691  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  51012690 ccatcataagtcatatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 35 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43520577 - 43520178
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520577 tttggaggacaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 43520478  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  43520477 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 43520378  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520377 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 43520278  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  43520277 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 51 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42981743 - 42981359
Alignment:
Q  51 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42981743 gatggataaagttgattgtgtaggaaatgagcttagattgattaagatattgataggagtattttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgt 42981644  T
Q  151 gtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatat 250  Q
    | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||       |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42981643 gccaagttcatgtattgttgtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatac 42981544  T
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42981543 atatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggtatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 42981444  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42981443 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 2692239 - 2692671
Alignment:
Q  4 ggagaagc-aaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattg 102  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2692239 ggagaagctaaaggatagtggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtcagcttaggttgattaagatattg 2692338  T
Q  103 ataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  2692339 ataggagtaatttgtttgattaagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctctgtaatgttgtaattaaaagaggttgtcaacgaatgaattca 2692438  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    |   |||| ||       ||| |||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2692439 atccttctgtcaaaaaatttccatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtcct 2692538  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggca 402  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2692539 tgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggttcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagaca 2692638  T
Q  403 tttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  2692639 tttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 2692671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Original strand, 48645809 - 48646130
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||  ||||     
T  48645809 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatttaacccttctg 48645908  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48645909 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 48646008  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||     
T  48646009 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcatac 48646106  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  48646107 catcataagtcatatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54387203 - 54386880
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  54387203 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 54387104  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54387103 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttcgattgtatgtctctccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 54387004  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  54387003 acaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 54386904  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | |||||| |||||||||    
T  54386903 catcataagtcatacatttgatgt 54386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 398
Target Start/End: Original strand, 834096 - 834402
Alignment:
Q  91 attaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaa 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  834096 attaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaa 834195  T
Q  191 tgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccat 290  Q
    |||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||    
T  834196 tgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacat 834295  T
Q  291 caaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattata 390  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  834296 caaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatata 834394  T
Q  391 aaaagaca 398  Q
    ||||||||    
T  834395 aaaagaca 834402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5438863 - 5438561
Alignment:
Q  91 attaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaa 190  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5438863 attaagttattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaa 5438764  T
Q  191 tgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccat 290  Q
    |||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||    
T  5438763 tgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacat 5438664  T
Q  291 caaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattata 390  Q
    ||||    |||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5438663 caaa----tccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatata 5438569  T
Q  391 aaaagaca 398  Q
    ||||||||    
T  5438568 aaaagaca 5438561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41782462 - 41782261
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41782462 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatcc 41782363  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||| | ||||||||||||||    
T  41782362 ttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttgat 41782263  T
Q  434 gt 435  Q
    ||    
T  41782262 gt 41782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 319846 - 320021
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  319846 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 319945  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  319946 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 320021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 4172686 - 4172861
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  4172686 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 4172785  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4172786 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 4172861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33265525 - 33265350
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33265525 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 33265426  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33265425 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 33265350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43508168 - 43507993
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  43508168 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatcc 43508069  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43508068 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 43507993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11641236 - 11641094
Alignment:
Q  27 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgag 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11641236 agaagaggattggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaacttaggttgattaagatgttgataggagtaatttgtttgattgag 11641137  T
Q  127 ttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgtt 169  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||  |||||||||    
T  11641136 ttgtttaaaatgttattgtattgtgaaaagtctgtgtaatgtt 11641094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 282 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11602569 - 11602416
Alignment:
Q  282 aaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacact 381  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11602569 aaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 11602470  T
Q  382 ttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||||||||    
T  11602469 ttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgt 11602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 257 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11640967 - 11640838
Alignment:
Q  257 atcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaaca 356  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11640967 atcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaaca 11640868  T
Q  357 aagtaaaaagtaaaagacaaacactttgat 386  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11640867 aagtaaaaagtaaaaaacatacactttgat 11640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 385
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867503
Alignment:
Q  296 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttga 52867503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 41760561 - 41760638
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggtt 89  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41760561 caaaggatagggg-agagaagaggtttggagggcaaggttgatgcataaagttgattgggtaggaagtgagcttaggtt 41760638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 32653001 - 32652936
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32653001 gaggtttggagggcaaggttgatggaaaaagttgattgtataggaagtgagcttagggtgattaag 32652936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 4614655 - 4614587
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4614655 gaagaggtttggagggcatggttgatggacaaagttgactatgtaggaagtgagcttaagttgattaag 4614587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Original strand, 28101484 - 28101606
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||||   || | | | || ||||||    
T  28101484 gaagaggtttggagggcaaggtcgatggacaaagttgactgtgtagaaaatgaacttaggttgattaagtatttgatagtcataatatatctgtttgagt 28101583  T
Q  128 tgtttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  28101584 tgtttaacatgctattgtattgt 28101606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7150559 - 7150446
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||   || |||| ||  ||||||    
T  7150559 gaagaggtttagagggcaaggttgatggacaaagttgactatgtaagaagtgaggttaggttgattaagtatttgatagtcataatttggttttttgagt 7150460  T
Q  128 tgtttaaaatgcta 141  Q
    ||||||| ||||||    
T  7150459 tgtttaacatgcta 7150446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27385626 - 27385571
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagct 83  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  27385626 gaagaggtttggaagacaaggttgatggacaaagttgattgtataggaactgagct 27385571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 85
Target Start/End: Original strand, 13449570 - 13449624
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagctta 85  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  13449570 gaggtttggagggcaaagttgatggacaaagttgattgcatatgaagtgagctta 13449624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10544232 - 10544180
Alignment:
Q  44 caaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  10544232 caagattgatggagaaagttgattgtgtagatagtgagcttagattcattaag 10544180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Original strand, 41041545 - 41041969
Alignment:
Q  10 gcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041545 gcaaaggatagggggagagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 41041644  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041645 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttc 41041744  T
Q  210 tctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 309  Q
    | ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041745 tgtc-caaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 41041843  T
Q  310 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41041844 tcacaacagataccattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcat 41041943  T
Q  410 atcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||||    
T  41041944 accatcataagtcatatatctgatgt 41041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27692305 - 27691905
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27692305 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgttaaa 27692206  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  27692205 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 27692106  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692105 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 27692006  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27692005 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 27691906  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  27691905 t 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Original strand, 33707795 - 33708195
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33707795 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaa 33707894  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  33707895 aatgatattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 33707994  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33707995 tcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgttcct 33708094  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  33708095 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacagacattttcatatcatcataagtcatatatttgatg 33708194  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  33708195 t 33708195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 435
Target Start/End: Original strand, 40338637 - 40339065
Alignment:
Q  14 aggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagt--------gagcttaggttgattaagatattgata 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40338637 aggatacggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagttaggaagtgagcttaggctgattaagatattgata 40338736  T
Q  106 ggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40338737 ggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtcc-tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacc 40338835  T
Q  206 tttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttga 305  Q
    ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40338836 tttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgatcctcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttga 40338935  T
Q  306 attttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcattt 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40338936 attttcacaacagatatcactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacatacattt 40339035  T
Q  406 gcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  40339036 gcataccatcataactcatatatttgatgt 40339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5037599 - 5037235
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037599 caaatgataggggaagagaagaggtttggaaggcaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 5037500  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  5037499 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttat 5037400  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5037399 gtcaaagaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaatttt 5037300  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5037299 cacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 5037235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29238357 - 29237959
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29238357 caaatgataggggcagagaagaggtttgaagggcaaggttggtggataaagttgattgtgtaggaagtaagcttaggttgattaagttattgataggagt 29238258  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29238257 attttgtttggttgagttatttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 29238158  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29238157 gtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattat 29238058  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29238057 cataacagaaatcaatttgatcatttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 29237959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15307455 - 15307058
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15307455 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagt 15307356  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15307355 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 15307256  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  15307255 gtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattat 15307156  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||| |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15307155 cataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15307058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15487824 - 15487427
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15487824 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagt 15487725  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15487724 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 15487625  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  15487624 gtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattat 15487525  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||| |||| | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15487524 cataacagaaatcaatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15487427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 27405104 - 27405501
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27405104 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaagtgaacttaggttgattaagttattgataggagt 27405203  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27405204 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 27405303  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |    
T  27405304 gtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattat 27405403  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27405404 cataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 27405501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42942855 - 42942533
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  42942855 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 42942756  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942755 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 42942656  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  42942655 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcatacc 42942556  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  42942555 atcataagtcatatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22273328 - 22272998
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22273328 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaataaatgaatcaaac 22273229  T
Q  205 atttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttg 304  Q
     ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273228 ctttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttg 22273129  T
Q  305 aattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatt 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22273128 aattttcacaacagatatcattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaagagacaggcaat 22273029  T
Q  405 tgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  22273028 tgcataccatcataagtcatatatttgatgt 22272998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 435
Target Start/End: Original strand, 13485114 - 13485493
Alignment:
Q  27 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgag 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  13485114 agaaaaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagcgaacttatgttgattaagatattgatatgagtattttattcgattgag 13485213  T
Q  127 ttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaat 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||          |||    
T  13485214 ttgtttaaaatgctattgtattgtaccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaa----aat 13485309  T
Q  227 caaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcact 326  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||                    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13485310 caaattggtccttgaattatgtacatatccatcatatcgat--------------------catcaaataggtccttcaattttcacaacagatatcact 13485389  T
Q  327 gtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatat 426  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |  ||||||    
T  13485390 gtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgattataaaaa-acagacatttgcataccatcataaatcatat 13485484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 112 - 416
Target Start/End: Original strand, 26239504 - 26239808
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  26239504 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtatcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 26239603  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       ||||||| |||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26239604 tcaaaaaatttcaatccaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttc 26239703  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||     
T  26239704 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctcaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcatac 26239803  T
Q  412 catca 416  Q
    |||||    
T  26239804 catca 26239808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Original strand, 7744193 - 7744516
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||  ||||     
T  7744193 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtataatgttgtaatgaaaagaggctgtcaatgaatgaatttaacccttctg 7744292  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7744293 tcaaaaaatttcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttc 7744392  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    ||| || || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  7744393 acatcatatttcacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 7744492  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | |||||| |||||||||    
T  7744493 catcataagtcatacatttgatgt 7744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 3152492 - 3152863
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3152492 caaaggatagtgttagagaagaggcttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtataggaagtgagcttaggttgattaaaatattgataggagt 3152591  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttg--------taataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||||||   ||||||||||        |||| |||||| |||||||||||||||||  |    
T  3152592 aatttgtttgattaagtcgtttaaaatgttattttattgtgtcaagtgtgtgtaatgttgtaatgttataatgaaaagaagttgtcaatgaatgaattca 3152691  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    ||  |||| ||       |||||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||    
T  3152692 acccttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccccaaattagtgaaattaccatcaaatcagttct 3152791  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 374  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3152792 tgaattttcacaacataaatcaatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaaagac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Original strand, 8609008 - 8609192
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609008 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 8609107  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  8609108 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgt 8609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 38548150 - 38547966
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548150 atatccatcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 38548051  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  38548050 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Original strand, 13107574 - 13107758
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107574 atatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13107673  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  13107674 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgt 13107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 112 - 416
Target Start/End: Original strand, 41824733 - 41825037
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||     
T  41824733 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagcctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctg 41824832  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||| ||  ||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41824833 tcaaaaaaattcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttc 41824932  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||     
T  41824933 acaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcatac 41825032  T
Q  412 catca 416  Q
    |||||    
T  41825033 catca 41825037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 167 - 406
Target Start/End: Original strand, 9672292 - 9672531
Alignment:
Q  167 gttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcga 266  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||| ||||||    
T  9672292 gttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatccaacccttctgtcgaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcga 9672391  T
Q  267 tcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaag 366  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9672392 tccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaag 9672491  T
Q  367 taaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttg 406  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9672492 taaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttg 9672531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13283314 - 13283135
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283314 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13283220  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13283219 tcaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 13283135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35510356 - 35510181
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||    
T  35510356 gtccttaaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtcc 35510257  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35510256 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 33761643 - 33761818
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33761643 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 33761742  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  33761743 tttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcat 33761818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 600809 - 600984
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  600809 gtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatcc 600908  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600909 tttgtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 600984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 370
Target Start/End: Original strand, 11720339 - 11720697
Alignment:
Q  13 aaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtat 112  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||     
T  11720339 aaggatagtggcagtgaagaggtttgaaggacaaggttgatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttaataggagtaa 11720438  T
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaat-caaacatttctc 211  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||  || ||  |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| |     
T  11720439 tttgtttgtttaagttgtttaacatgctactgtattgtgctaattctgtgtaatattgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaatgcaaccattt-tg 11720537  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtg-aaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
    ||       ||| |||||||| |||||| |||| | | | |||  |||| |||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  11720538 tcaaaatctttccatcaaattggtccttaaattgtttgtctatatatcaaatcgattcctacattagtgaaaaatatcatcaaataagtccttgaagttt 11720637  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 370  Q
       || | ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720638 ttaaaaatatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 12515887 - 12516006
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 130  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||   || |||| ||| ||||||| |    
T  12515887 gaggtttggagggaaatgttgatggacaaagttgattgtatgggaagtgagcttaggttgattaagtttttaatagtcataatttgcttgtttgagtttt 12515986  T
Q  131 ttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  12515987 ttaacatgctattgtattgt 12516006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 28432939 - 28433004
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  28432939 gaggtttggagggcaaggttgatgggcaaagttgattgtataagaagtgagctgagggtgattaag 28433004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 25371236 - 25371304
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25371236 gaagatgtttggagagcaagattgatggacaaagttgagtgtgtaggaagtgaacttaggttgaataag 25371304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 70
Target Start/End: Original strand, 10770940 - 10770982
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtg 70  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10770940 gaagaggtttggaaggcaaggttgatggacaaagttgactgtg 10770982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24285880 - 24285797
Alignment:
Q  67 tgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatatt-gataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||   || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24285880 tgtgtaggaagtgagattaagttgattaa-atatttgatagtcataatttgcttgtttgagttgtttaacatgctattgtattgt 24285797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 30599169 - 30599592
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30599169 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagt 30599268  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30599269 attttgtttcattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 30599368  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599369 gtcaaaaat-ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 30599467  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30599468 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcata 30599567  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  30599568 ccatcataagtcatatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17516491 - 17516069
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17516491 caaaggat-gggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatagaagt 17516393  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17516392 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaattccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 17516293  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516292 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatat-catatccatcatatcgatactcaaattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 17516194  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17516193 cacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaagacagatactttgattataaaaagacagacatttgcata 17516094  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  17516093 tcatcataagtcatatatttgatgt 17516069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43766304 - 43765880
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43766304 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagctgattgtgtaggaagtgagcttagattgattaatatattgataggagt 43766205  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43766204 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattttattgtgtcaagttcatgtaacattgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 43766105  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43766104 atcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaatttt 43766005  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43766004 cacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcata 43765905  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| |  |||||||||||||||    
T  43765904 ccatcataaatcatatatttgatgt 43765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 435
Target Start/End: Original strand, 27898075 - 27898499
Alignment:
Q  10 gcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27898075 gcaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaatatattgataggag 27898174  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttc 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  27898175 tattttgtttgattaagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttt 27898273  T
Q  210 tctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 309  Q
    | ||       ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898274 tgtcaaaaaaattcaatcaagttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 27898373  T
Q  310 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27898374 tcacaacagatatcactgtgatccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcat 27898473  T
Q  410 atcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||    
T  27898474 accatcataaatcatatatttgatgt 27898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46198902 - 46198479
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198902 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtggacttaggttgattaagatattgataggagt 46198803  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46198802 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattatattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttat 46198703  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  46198702 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaataggtcc-tggatttt 46198604  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46198603 tacaacagatatcattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaaacagacatttgcata 46198504  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  46198503 ccatcataagtcatatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 44275179 - 44275601
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275179 caaaggatagggggagagaagacgtttggagggcaaggttgatggataaatttgattgtgaaggaagggagcttaggttgattaagatattgataggagt 44275278  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44275279 attttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 44275378  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
              |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44275379 g--aaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggttcttgaatttt 44275476  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44275477 cacaatagatatcattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaagacaaacactttgattataaaaagacagtcatttgcata 44275576  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  44275577 ccatcataagtcatatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21349877 - 21349453
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  21349877 caaaggatagggggagagaagaagttttgagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttatgttgattaagacattgatatgagt 21349778  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21349777 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgcgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 21349678  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     |         ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21349677 gtaaaaaaaaatcaatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 21349578  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21349577 cacaacaattatcactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagatagacatttgcata 21349478  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
      |||| | ||||||||||||||||    
T  21349477 ctatcataagtcatatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2661373 - 2660973
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2661373 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggggtattttgtttgattgagttgtttaa 2661274  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       || ||||||||| |    
T  2661273 aatgatattgtattgtgccatgtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattgg 2661174  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661173 tccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 2661074  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  2661073 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 2660974  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  2660973 t 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2378172 - 2377755
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378172 caaaggataggggcagagaagaggtttggagagcaaggttgatggataaagttgattgcgtaggaaatgagcttaggttgattaagatattgataggagt 2378073  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||  || |    
T  2378072 atttt-tttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgt-----aatgaatcaaacccttat 2377980  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     |        |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377979 gttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 2377880  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  2377879 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaatatttgcata 2377780  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| |  |||||||||||||||    
T  2377779 tcatcataaatcatatatttgatgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44795358 - 44794958
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795358 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 44795259  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||       |||||||||||| |    
T  44795258 aataatattgtattatgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcgatgaatgaaccaaaccattatgtcaaaatatttcaatcaaattgg 44795159  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795158 ttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 44795059  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  44795058 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacggacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 44794959  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  44794958 t 44794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 51 - 435
Target Start/End: Original strand, 2225165 - 2225555
Alignment:
Q  51 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2225165 gatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaatatattgataggagtattttgcttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgt 2225264  T
Q  151 gtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaa 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||| ||  ||| |||||||||    
T  2225265 gccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctgtcaaaaaaattcattcgcattggtccttgaa 2225364  T
Q  243 ttatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcat 342  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225365 ttatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcat 2225464  T
Q  343 acatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  2225465 acatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttgatgt 2225555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 54899624 - 54899250
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899624 caaatgataagggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatgggtaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 54899525  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttg--------taataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54899524 attttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 54899425  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    || ||||  ||       |||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899424 acctttccgtcaaaaaaattcaatcacatcggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 54899325  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899324 tgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 54899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 26 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 46113635 - 46113226
Alignment:
Q  26 gagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattga 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46113635 gagaagaggcttggagggcaaggctgatggataaagttgattgtgcgggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattga 46113536  T
Q  126 gttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaa 225  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||       |||||    
T  46113535 gttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaaggaatgaatccaacccttctgtcaaaaaatttcaa 46113436  T
Q  226 tcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcac 325  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||    
T  46113435 tcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatccctaaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacataaatcac 46113336  T
Q  326 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcata 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  46113335 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcata 46113236  T
Q  426 tatttgatgt 435  Q
     |||||||||    
T  46113235 catttgatgt 46113226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 610763 - 610353
Alignment:
Q  25 agagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattg 124  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  610763 agagaaaaggcttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggtttattaagatattgataggagtaatttgtttgattg 610664  T
Q  125 agttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttca 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       ||||    
T  610663 agttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtatgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaaaaattca 610564  T
Q  225 atcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 324  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  610563 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatca 610464  T
Q  325 ctgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcat 424  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||| | |||||    
T  610463 ctatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaaagcagacatttgcatataatcataagtcat 610364  T
Q  425 atatttgatgt 435  Q
    | |||||||||    
T  610363 acatttgatgt 610353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Original strand, 23292232 - 23292554
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23292232 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgacaagtccatataatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacttttctgt 23292331  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23292332 caaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 23292431  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23292432 caacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 23292531  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  23292532 atcataagtcatatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 53188661 - 53188963
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53188661 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttagattgattaagatattgataggagt 53188760  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53188761 attttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatgaaacctttct 53188860  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  53188861 gtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaatttt 53188960  T
Q  311 cac 313  Q
    |||    
T  53188961 cac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Original strand, 48829886 - 48830209
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  || |     
T  48829886 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagtggttgtcaatgaatgaatttaacccttatg 48829985  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48829986 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttc 48830085  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  48830086 acaacatatatcactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatat 48830185  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  48830186 catcataagtcatatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 51685673 - 51685350
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||     
T  51685673 ttttgtgtgattgagttgtttgaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacctttctg 51685574  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51685573 tcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 51685474  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |     
T  51685473 acaacatatatcactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaac 51685374  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | |||||| |||||||||    
T  51685373 catcataagtcatacatttgatgt 51685350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 176 - 435
Target Start/End: Original strand, 35904851 - 35905113
Alignment:
Q  176 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  35904851 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaat 35904950  T
Q  276 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904951 tagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 35905050  T
Q  376 aacactttgattataaaaagacaggcatt---tgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||||   || ||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  35905051 gacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcataagtcatatatttgatgt 35905113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41978671 - 41978487
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978671 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 41978572  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  41978571 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 161 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42280521 - 42280246
Alignment:
Q  161 tgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatca 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||    
T  42280521 tgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatca 42280422  T
Q  261 tatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt 360  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42280421 tatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt 42280322  T
Q  361 a-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  42280321 aaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 42280246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Original strand, 7884094 - 7884278
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884094 atatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7884193  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||    
T  7884194 tgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgt 7884278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 234 - 407
Target Start/End: Original strand, 38192457 - 38192630
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  38192457 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 38192556  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgc 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38192557 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgc 38192630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 409
Target Start/End: Original strand, 46609724 - 46609897
Alignment:
Q  236 ccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcctt 335  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  46609724 ccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctt 46609823  T
Q  336 ggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46609824 tgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46609897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 53093197 - 53093372
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  53093197 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 53093296  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53093297 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcat 53093372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 46309951 - 46309776
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||     
T  46309951 gtccatgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatca 46309852  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46309851 tttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46309776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 35904709 - 35904850
Alignment:
Q  10 gcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35904709 gcaaacgataggggcagagaacaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaagatattgataggag 35904808  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35904809 tattttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtg 35904850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 309 - 435
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190247
Alignment:
Q  309 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaa---agtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcattt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  406 gcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13466324 - 13466154
Alignment:
Q  29 aagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagata-ttgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||  |    
T  13466324 aagaggattggagggaaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaa-atatttgataggtgtaatttgtttgattggat 13466226  T
Q  128 tgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaat 199  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13466225 tgtttaacatgctactgtattatgctaagtttgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgaaaatgaatgaat 13466154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24845776 - 24845668
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaaagacaaac 378  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  24845776 aaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaaagacatac 24845677  T
Q  379 actttgatt 387  Q
    |||||||||    
T  24845676 actttgatt 24845668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 32843436 - 32843504
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32843436 gaagagttttggagggcaaggttgatcgacaaagttgactgtgtaggatgtgagcttaggttgattaag 32843504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Original strand, 23876220 - 23876287
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||    
T  23876220 gaagaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgactctgtatgaagtgagtttaggttgattaa 23876287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 41945479 - 41945414
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41945479 gaggtttagaggacaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtgagcttagggtgattaag 41945414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 35862440 - 35862508
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35862440 gaagaggtttgcatggcaaggttgatgaacaaagttgattgtgtaggaagcgagcttaagttgattaag 35862508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 2976359 - 2976410
Alignment:
Q  45 aaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2976359 aaggttgatggacaaagttgagtgtgtaggaattgagcttaggttgattaag 2976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 54899230 - 54899172
Alignment:
Q  377 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  54899230 acactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 54899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 49495067 - 49495139
Alignment:
Q  34 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 106  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49495067 gtttggagggtgaggtagatggacaaagttgatattttaggaactgagcttaggttgattaagtttttgatag 49495139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 370
Target Start/End: Original strand, 22219218 - 22219308
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaa 370  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22219218 aaaatatcatcaaataaatccttgaattatttaaacagatgtcaatgcgatccttggtgcatatatgtgcagaacaaagtacaaaagtaaa 22219308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 38473085 - 38473508
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473085 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaacttaggttgattaagatattgataggagt 38473184  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  38473185 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattttgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccttttt 38473284  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473285 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 38473384  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38473385 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa-acatacactttgattataaaaagacagacatttgcata 38473483  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  38473484 ccatcataagtcatatatttgatgt 38473508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6604688 - 6604264
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6604688 caaaggataggggcaaagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtataggaagtgagcttaggttgattgagatattgataggagt 6604589  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6604588 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 6604489  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6604488 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgactttt 6604389  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6604388 cacaacatatatcactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcata 6604289  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  6604288 ccatcataagtcatatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22155063 - 22154639
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22155063 caaaggataggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgatcgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 22154964  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22154963 attttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 22154864  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154863 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 22154764  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22154763 cacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcata 22154664  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  22154663 ccatcataagtcatatatttgatgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22210978 - 22210554
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210978 caaaggataggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgatcgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 22210879  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22210878 attttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 22210779  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210778 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 22210679  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22210678 cacaacagatatcactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcata 22210579  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  22210578 ccatcataagtcatatatttgatgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 30 - 435
Target Start/End: Original strand, 23905232 - 23905637
Alignment:
Q  30 agaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttg 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23905232 agaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattcagttg 23905331  T
Q  130 tttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaa 229  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       || ||||||    
T  23905332 tttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttaaatcaa 23905431  T
Q  230 atttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtg 329  Q
    ||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23905432 attggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtg 23905531  T
Q  330 atccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatt 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23905532 atctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatt 23905631  T
Q  430 tgatgt 435  Q
    ||||||    
T  23905632 tgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45360499 - 45360076
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45360499 caaaggataggggcggagaagaggtttggagggcaaggttgatggaaaaagttgattgtataggaagtgagtttaggttgattaagatattgataggagt 45360400  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  45360399 attttgttggattgagttgtttaaaatgctaatg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttat 45360301  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45360300 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaatttt 45360201  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45360200 cacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagataaacactttgattataaaaagacagacatttgcata 45360101  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| |  |||||||||||||||    
T  45360100 ccatcataaatcatatatttgatgt 45360076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 435
Target Start/End: Original strand, 35692326 - 35692735
Alignment:
Q  25 agagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35692326 agagaagaggtttggagggcaaggttggtggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataaaagtattttgtttgattg 35692425  T
Q  125 agttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttca 224  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||    
T  35692426 tgttgtttaaa-tgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttca 35692524  T
Q  225 atcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35692525 atcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatatca 35692624  T
Q  325 ctgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcat 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||    
T  35692625 ctgtgatccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaagacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtcat 35692724  T
Q  425 atatttgatgt 435  Q
    |||||||||||    
T  35692725 atatttgatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 24227382 - 24227806
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24227382 caaacgataaggggagagaagaagtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 24227481  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  24227482 attttgtttcattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgcaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccttgtt 24227581  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  24227582 gtcaaaaaatttcaatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggacatttaatttt 24227681  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  24227682 cacaacagatatcactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattacaaaaagacagacatttgtata 24227781  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| |  |||||||||||||||    
T  24227782 ccatcataaatcatatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Original strand, 27665031 - 27665431
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665031 tttggaggacaaggttgatggataaaattaactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 27665130  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       || ||||||||| |    
T  27665131 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatattttaatcaaattgg 27665230  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665231 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 27665330  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  27665331 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaggcagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 27665430  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  27665431 t 27665431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 34775923 - 34776346
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34775923 caaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggtgt 34776022  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34776023 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtcccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaactcttct 34776121  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       || ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34776122 gtcaaatttttttaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaatttt 34776221  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||    
T  34776222 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaagacagacactcagattataaaaagacaaacatttgcata 34776321  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| |  |||||||||||||||    
T  34776322 ccatcataaatcatatatttgatgt 34776346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Original strand, 29995501 - 29995901
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995501 tttggaggacaaggttgatggataaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 29995600  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||       ||||||||||||      
T  29995601 aatgatattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaacagaggttttcaatgaatgaaccaaacatttctgtcaaaatatttcaatcaaattga 29995700  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29995701 tccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaatatcactgtgatcct 29995800  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  29995801 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatg 29995900  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  29995901 t 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 46438470 - 46438895
Alignment:
Q  11 caaaggataggggg-agagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46438470 caaaggataggggggagagaagaagtttggaggacaaggttgatggataaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgag 46438569  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttc 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |     
T  46438570 tattttgtttggttgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtactgaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctata 46438669  T
Q  210 tctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 309  Q
    | ||       |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46438670 tgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaataagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattt 46438769  T
Q  310 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  46438770 tcacaacagatatcactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaagacaaacactttgattatagaaagacggacatttgcat 46438869  T
Q  410 atcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||    
T  46438870 accatcataagtcatatatttaatgt 46438895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 435
Target Start/End: Original strand, 39858271 - 39858627
Alignment:
Q  78 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39858271 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 39858369  T
Q  178 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39858370 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatga 39858469  T
Q  278 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39858470 gtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 39858569  T
Q  378 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  39858570 cactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 39858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Original strand, 37114591 - 37114913
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |    
T  37114591 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtattgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatctttttgt 37114690  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114691 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 37114790  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37114791 caacagatatcattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 37114890  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  37114891 atcataagtcatatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 134 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13169122 - 13168822
Alignment:
Q  134 aaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaattt 233  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       ||||||||||||     
T  13169122 aaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaaaatttcaatcaaattg 13169024  T
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13169023 gtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcaatgtgatcc 13168924  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgat 433  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||    
T  13168923 ttggtgcatacattcgctgaacaaaataaaaactaaaagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaatcatatatttgat 13168824  T
Q  434 gt 435  Q
    ||    
T  13168823 gt 13168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Original strand, 47385168 - 47385576
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47385168 caaaggatagtggcagagaagaggtttggaaggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 47385267  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtc--------catgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
      ||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||| ||||||          |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  |    
T  47385268 gatttgtttgattgagttgtttagaattttattttattgtgccaagtctgtgtaatgctgtaatgttgtaatgaacagtggttgtcaatgaatgaattca 47385367  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    || ||||| ||       |||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  47385368 acctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaattaccatcaaataagtcct 47385467  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggca 402  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  47385468 tgaattttcacaacatacatca-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacattgattgtaaaaagacagaca 47385562  T
Q  403 tttgcatatcatca 416  Q
    ||| |||| |||||    
T  47385563 tttacataccatca 47385576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 38550441 - 38550650
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  38550441 ttcaatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatat 38550540  T
Q  321 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  38550541 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataag 38550640  T
Q  421 tcatatattt 430  Q
    ||||| ||||    
T  38550641 tcatacattt 38550650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 166 - 435
Target Start/End: Original strand, 37792150 - 37792419
Alignment:
Q  166 tgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcg 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       ||| |||||||| ||||||  |||  || | |||||||||||| |    
T  37792150 tgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttctgtcaaaatatttccatcaaattggtccttctattgcatgtctatccatcatattg 37792249  T
Q  266 atcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37792250 atccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgttgtacaaagtaaaaa 37792349  T
Q  366 gtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  37792350 gtaaaagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgt 37792419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 69287 - 69132
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  69287 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttcattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattaatatgagt 69188  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  69187 attttgtttgattgagttgttttaaatactattgtactgtgccaagtccatgtaat 69132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 35402545 - 35402719
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  35402545 gtccttgaattatattca-atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 35402643  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35402644 tttgagcatatatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35402719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 435
Target Start/End: Original strand, 48851450 - 48851708
Alignment:
Q  176 aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaat 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |||| ||       ||| |||||||| |||| |  ||| ||| | || ||||||||| |||||  ||||    
T  48851450 aaaagaggttgtcaatgaatgaattcaaccattctgtcaaaatctttccatcaaattggtccctctattgtatgtctacccatcatattgatcca-aaat 48851548  T
Q  276 tagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 375  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48851549 tagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgaccaaagtaaaaagtaaaagaca 48851648  T
Q  376 aacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  48851649 gacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgt 48851708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48311096 - 48310948
Alignment:
Q  26 gagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattga 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  48311096 gagaagaggtttggagggcaatgttgatggataaagtcgattgtgtaggaagtgaacttaggttgattaagatattgacatgagtaatttgtttgattga 48310997  T
Q  126 gttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaat 174  Q
     |||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  48310996 attgtttaaaatgctattatattatgtcaagtctgtgtaatgttgtaat 48310948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  241 aattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 340  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  341 ata 343  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20479034 - 20478921
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  20479034 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 20478935  T
Q  321 atcactgtgatcct 334  Q
    |||| |||||||||    
T  20478934 atcaatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 339 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66845
Alignment:
Q  339 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcat 66845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11683743 - 11683621
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||  ||| ||||||    
T  11683743 gaagaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgagtgtataggaagtgagcttaggttgattaagtttttgatagtcataatttacttgtttgagt 11683644  T
Q  128 tgtttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    | ||||| ||||||||| |||||    
T  11683643 tttttaacatgctattgtattgt 11683621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Original strand, 4321800 - 4321865
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4321800 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtaagcttagggtgattaag 4321865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7403021 - 7402878
Alignment:
Q  43 gcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctat 142  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||   |||||||   || |||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  7403021 gcaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggatgtaagattaggttgattaagtatttgatagtcataatttgtttgtttgggttgtttaacatgctac 7402922  T
Q  143 tgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttg 186  Q
    || |||||   | ||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  7402921 tgtattgtactatgtgtgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttg 7402878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 32840610 - 32840551
Alignment:
Q  27 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttag 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32840610 agaataggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgaacttag 32840551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 34691938 - 34691873
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  34691938 gaggtttggagggcaacgttgatggacaaagttgattgtatatgaagtgaacttaggttgattaag 34691873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 48310867 - 48310750
Alignment:
Q  272 aaattagtgaaaa-taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaa 369  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48310867 aaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatcaatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaa 48310768  T
Q  370 aagacaaacactttgatt 387  Q
    |||||| |||||||||||    
T  48310767 aagacagacactttgatt 48310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 34784575 - 34784647
Alignment:
Q  34 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34784575 gtttgaagggcaatgttgatggacaaagttgattgtataagaagtgagcttaggttgattaagtttttgatag 34784647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23168751 - 23168652
Alignment:
Q  45 aaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   ||||||| |||| || |||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  23168751 aaggttgacggataaagttgattgtgtacgaagtgagtttagattgattaagtatttgatagaagtaattcgtttgattggattgtttaacatgttattg 23168652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40361028 - 40360951
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgata 105  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  40361028 gaagaagtttggagagcaaggttgatggacaaagttgattgtttagaaagtgagcttagattgataaagtaattgata 40360951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13035993 - 13035937
Alignment:
Q  40 agggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13035993 aggggaaggttgatggagaaagttgactatgtaggaagtgagattaggttgattaag 13035937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 95
Target Start/End: Original strand, 48302873 - 48302936
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaa 95  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  48302873 gaggtttggagg-caacgttgatggacaaagttgattgtacaggaagtgagcttagggtgattaa 48302936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13169162 - 13169123
Alignment:
Q  78 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13169162 tgagcttaggttgattaagatattgataggaatattttgt 13169123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Original strand, 30939748 - 30939794
Alignment:
Q  389 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30939748 taaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 30939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6798696 - 6798264
Alignment:
Q  4 ggagaagcaaag-gatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattg 102  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798696 ggagaagccaagagatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatgaataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattg 6798597  T
Q  103 ataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6798596 ataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgagtcaa 6798497  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    || ||||| ||       |||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6798496 acctttctgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatatgtcct 6798397  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6798396 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagaca 6798297  T
Q  403 tttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  6798296 tttgcatatcatcataagttatatatttgatgt 6798264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 14388047 - 14388487
Alignment:
Q  4 ggagaagc-aaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattg 102  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388047 ggagaagctaaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattg 14388146  T
Q  103 ataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  14388147 ataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaa 14388246  T
Q  195 tgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaa 294  Q
    |||||||||| ||| | |        |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14388247 tgaatcaaacctttatgtaaaaaaacttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaa 14388346  T
Q  295 taggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14388347 taggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaa 14388446  T
Q  395 gacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  14388447 aacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2768096 - 2767691
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2768096 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtaagcttaggttgattaagatattgataggagt 2767997  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  2767996 attttgtttgattaagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaaacccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaataaaacctttat 2767897  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2767896 gtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaatttagtgaaaataccatcaaattggtccttgaatttt 2767797  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2767796 cacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaactctttgattataaaaagacagacatttgcata 2767697  T
Q  411 tcatca 416  Q
     |||||    
T  2767696 ccatca 2767691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 16764128 - 16763704
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16764128 caaatgataggggcagagaagaggtttagagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgaacttaggttgattaagatattgataggagt 16764029  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16764028 attttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttat 16763929  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16763928 gtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattta 16763829  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16763828 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcata 16763729  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
      |||| | ||||||||||||||||    
T  16763728 ctatcataagtcatatatttgatgt 16763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17697389 - 17696965
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17697389 caaatgatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaagttgattaagatattgatatgagt 17697290  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17697289 attttgtttgattgaattgtttaaaatgctattgtattatgccaagtccatgtaatgttgttatgaaaagaggttgtcaacgaatgaatcaaacctttct 17697190  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697189 gtcaaaaaatttcaatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaaaattggtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 17697090  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17697089 cacaacatacatcactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcata 17696990  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  17696989 ccatcataagtcatatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39456341 - 39455918
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39456341 caaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttaattaagatattgataagagt 39456242  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  39456241 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccctttt 39456142  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39456141 gtcaaaaaaattcaatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattctcaaatgagtgaaaatatcatcaaataggtccttaaatttt 39456042  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39456041 cacaacagatatcactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga-actttgattataaaaagacagacatttgtata 39455943  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | |||||||| |||||||    
T  39455942 ccatcataagtcatatacttgatgt 39455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 78 - 435
Target Start/End: Original strand, 19907308 - 19907664
Alignment:
Q  78 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19907308 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 19907406  T
Q  178 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19907407 aagaggttatcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatga 19907506  T
Q  278 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19907507 gtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 19907606  T
Q  378 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  19907607 cactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 19907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 6784249 - 6784648
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6784249 caaatgataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtttaggaagtgaacttaggttgattaagttattgataggagt 6784348  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6784349 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 6784448  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagt-gaaaataccatcaaataggtccttgaattt 309  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||     
T  6784449 gtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatctttaaattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaatta 6784548  T
Q  310 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    ||| |||||| |||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6784549 tcataacagaaatcaattggatcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 6784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 113 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40561305 - 40560978
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  40561305 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagatgttgtcaatgaatgaatcaaacctttttgt 40561206  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
            |||||| ||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561205 taaaaaatttcaattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 40561106  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40561105 caacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatc 40561006  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgtccatc 440  Q
    |||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  40561005 atcataaatcatatatttgatgttcatc 40560978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 24206492 - 24206900
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24206492 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattatgtaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagt 24206591  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcca--------tgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24206592 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgttctaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 24206691  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagt--gaaaataccatcaaataggtc 300  Q
    || ||||| ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| | |||||||| ||||    
T  24206692 acctttctgtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtc 24206791  T
Q  301 cttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagg 400  Q
    |||||||| | | |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  24206792 cttgaattattataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattataaaaagacaaa 24206891  T
Q  401 catttgcat 409  Q
    |||||||||    
T  24206892 catttgcat 24206900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 34401144 - 34401394
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34401144 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgagtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggatt 34401243  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  34401244 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccttttt 34401343  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcat 261  Q
     |        |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34401344 gttaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcat 34401394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Original strand, 44708783 - 44708976
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708783 caaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttaattgtgtaggaagtgggcttaggttgattaagatattgataggagt 44708882  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44708883 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgcgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaac 44708976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 263 - 435
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664166
Alignment:
Q  263 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  363 aaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgt 39664166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 42518389 - 42518522
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42518389 caaaggatagggggagagaagaagtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgatcttaggtttattaagatattgataggagt 42518488  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42518489 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattg 42518522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 289 - 435
Target Start/End: Original strand, 44708996 - 44709142
Alignment:
Q  289 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatta 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44708996 atcaaattggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgatta 44709095  T
Q  389 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||  ||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  44709096 taaaaatgcagacatttgcataccatcataagacatatatttgatgt 44709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 341 - 435
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518618
Alignment:
Q  341 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4047499 - 4047377
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   || |||| ||| ||||||    
T  4047499 gaagaggtttggagggcaaagttaatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgtttgagt 4047400  T
Q  128 tgtttaaaatgctattgcattgt 150  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  4047399 tgtttaacatgctattgtattgt 4047377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 37021501 - 37021388
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  37021501 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagat 37021402  T
Q  321 atcactgtgatcct 334  Q
    |||| |||||||||    
T  37021401 atcaatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20941856 - 20941686
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   || |||| ||| ||||||    
T  20941856 gaagaggtttggatg-caaggttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgtttgagt 20941758  T
Q  128 tgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaat 199  Q
    ||||||| ||| || || ||||||  | ||   ||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  20941757 tgtttaacatgttactgtattgtgctaggtgtgtgtaacgttgtaatgaaaagaggttgaagatgaatgaat 20941686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 26581545 - 26581613
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26581545 gaagaggtttagaggggaaggttgatggacaaagttgattgtgtatgaagtgagcttaggttgattaag 26581613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 19581960 - 19582039
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaat 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19581960 ttttgtttgattgaattgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctctgtaatgttgtaatgaaaagaggttttcaat 19582039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 161554 - 161441
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagt 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||   |||||||   || |||| ||| ||||||    
T  161554 gaagaggtttagagggcaaggttgatggacaaagttgactatgtagaaagtgaggtttggttgattaagtatttgatagtcataatttgcttgtttgagt 161455  T
Q  128 tgtttaaaatgcta 141  Q
    ||||||| ||||||    
T  161454 tgtttaacatgcta 161441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  326 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 38149406 - 38149341
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| || || ||||||||    
T  38149406 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataaaaagtgagattggggtgattaag 38149341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7744778 - 7744707
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 106  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  7744778 tttggagggtgaggttgatggacaaagttgatactttaggaattgagcttaggtttattaagtttttgatag 7744707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 56
Target Start/End: Original strand, 11022252 - 11022280
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatgga 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022252 gaagaggtttggagggcaaggttgatgga 11022280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 9432 - 9008
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432 caaatgataggagcagagaagaggtttggagggcaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 9333  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  9332 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttat 9233  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9232 gtcaaaaaaattcaatcaaattagtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 9133  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9132 cacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcata 9033  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
      |||| | ||||||||||||||||    
T  9032 ctatcataagtcatatatttgatgt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 7371944 - 7372367
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371944 caaaggataaggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 7372043  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7372044 attttgtttgattgagttgtttaaaatggtattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 7372143  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372144 gtcaaaaaatatcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 7372243  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7372244 cacaatcga-atcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcata 7372342  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  7372343 ccatcataagtcatatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20524526 - 20524126
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20524526 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattatgatattgatatgagtattttgttttattgagttgtttaa 20524427  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |        |||||||||||| |    
T  20524426 aatgctattgtattgtgccaagttcatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgtaaaaaaaattcaatcaaattgg 20524327  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20524326 tccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactatgatcct 20524227  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20524226 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatg 20524127  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  20524126 t 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 4 - 435
Target Start/End: Original strand, 32438035 - 32438465
Alignment:
Q  4 ggagaagcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattga 103  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438035 ggagaagcaaatgctaggggcaaagaag-ggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattga 32438133  T
Q  104 taggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaa 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32438134 taggagtattttgtttgactgagttgtttaaaatgctattgcattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaa 32438233  T
Q  204 catttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 303  Q
    | ||||| ||       |||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438234 cctttctgtcaaaaaaattcaatcatattggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcctt 32438333  T
Q  304 gaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcat 403  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  32438334 gaattttcacaatagatatcactatgatccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacat 32438433  T
Q  404 ttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  32438434 ttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18644437 - 18644031
Alignment:
Q  18 tagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644437 taggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgagtaggaagtgaacttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 18644338  T
Q  118 ttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttc 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18644337 ttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagagattgtcaatgaatgaatcaaacctttc 18644238  T
Q  210 tctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 309  Q
    | ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644237 tgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattt 18644138  T
Q  310 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18644137 tcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcat 18644038  T
Q  410 atcatca 416  Q
    | |||||    
T  18644037 accatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32518034 - 32517672
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32518034 caaaggatatgggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagt 32517935  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || |    
T  32517934 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttat 32517835  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32517834 gtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaatttt 32517735  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517734 cacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 32517672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 61 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 11356321 - 11355948
Alignment:
Q  61 gttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  11356321 gttgattgtgtaggaagtcagcttaggttgattacgatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgtgccaagttca 11356222  T
Q  161 tgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatat 252  Q
    ||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||| |||||||||||||||        
T  11356221 tgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaattggtccttgaattatatg--- 11356125  T
Q  253 atccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctg 352  Q
          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356124 ------catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctg 11356031  T
Q  353 aacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  11356030 aacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatatttgatgt 11355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7050821 - 7050498
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||  || |     
T  7050821 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatggatgaatttaacccttttg 7050722  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7050721 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttc 7050622  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  7050621 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatac 7050522  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  7050521 catcataagtcatatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10569462 - 10569141
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  10569462 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttcta 10569363  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       ||||||||||||  |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10569362 tcaaaaaatttcaatcaaattgatccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 10569263  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatat 411  Q
    |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  10569262 a--acatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatat 10569165  T
Q  412 catcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  10569164 catcataagtcatatatttgatgt 10569141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 334
Target Start/End: Original strand, 33267838 - 33268155
Alignment:
Q  10 gcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    ||||||||||| || |||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33267838 gcaaaggatagtggcagagtataggtttgg-ggtcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 33267936  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtc-catgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacattt 208  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  33267937 taatttgtttgaatgagctgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtctgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaaccctt 33268036  T
Q  209 ctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatt 308  Q
    |||||       ||||||  |||| ||||        ||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33268037 ctctcaaaaaatttcaattgaattggtcc-------gtatgtctatccatcatatcgatccctaaattattgaaaataccatcaaataagtccttgaatt 33268129  T
Q  309 ttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268130 ttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6902212 - 6901999
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||     
T  6902212 ttttgtgtgattgagttgtttaaaaagttattgtattgtgtcaagtctgcgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatttaacccttctg 6902113  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||||||  ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6902112 tcaaaaaaattcaatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttc 6902013  T
Q  312 acaacagatatcac 325  Q
    |||||| |||||||    
T  6902012 acaacatatatcac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9399281 - 9399135
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9399281 caaaggatagtggcagagaagaggtttggaaggcaaagttgatggataaagttgattgtgtaggaaatgagcttaggttgattaagatattgataggagt 9399182  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagt 157  Q
      |||||||| |||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||    
T  9399181 gatttgtttgtttgagttgtttagaatgttattttattgtgccaagt 9399135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 319 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900225
Alignment:
Q  319 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcaga 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | |    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  419 ggtcatatatttgatgt 435  Q
     |||||| |||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgt 6900225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 324
Target Start/End: Original strand, 32455022 - 32455125
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  32455022 ttcaattacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 32455121  T
Q  321 atca 324  Q
    ||||    
T  32455122 atca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 17935616 - 17935548
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17935616 gaagagttttggagggtaaggttgagggacaaagttgactgagtaggatgtgagcttaggttgattaag 17935548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 11356358 - 11356316
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgat 53  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356358 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgat 11356316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Original strand, 24431587 - 24431671
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||| || |||  ||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  24431587 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacaaatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcagaattaagtaaaaa 24431671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 6817677 - 6818101
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6817677 caaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagt 6817776  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6817777 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtacatataatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 6817876  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6817877 gtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggttttt 6817976  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6817977 cacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttgattataaaaagacagacatgtgcata 6818076  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | ||||||||||||||||    
T  6818077 ccatcataagtcatatatttgatgt 6818101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27088442 - 27088026
Alignment:
Q  18 tagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088442 taggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 27088343  T
Q  118 ttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnn 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||        
T  27088342 ttgactgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtc--aa 27088245  T
Q  218 nnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaaca 317  Q
       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27088244 aaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaaca 27088145  T
Q  318 gatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattat-aaaaagacaggcatttgcatatcatca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  27088144 gatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaagacacatatttgcatatcatca 27088045  T
Q  417 gaggtcatatatttgatgt 435  Q
     | ||||||||||||||||    
T  27088044 taagtcatatatttgatgt 27088026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 26224506 - 26224938
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224506 caaaagataggggaagagaagaggtttgaagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 26224605  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaata--------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||    
T  26224606 attttgtttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgttgtactgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 26224705  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    || ||| | ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26224706 acctttatgtcaaaaaaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaagaccatcaaataggtcct 26224805  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggca 402  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  26224806 tgaattttcacaacaaatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacaca 26224905  T
Q  403 tttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26224906 tttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 26224938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 50555064 - 50555488
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555064 caaaggataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagtttaggttgattaagatattgataggagt 50555163  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  50555164 attttgtttgatggagttgtttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaatcattct 50555262  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50555263 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaatttt 50555362  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50555363 cacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcat 50555462  T
Q  410 atcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
      ||||| |  |||||||||||||||    
T  50555463 gccatcataaatcatatatttgatgt 50555488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Original strand, 46582573 - 46582973
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582573 tttggaggacaaggttgatggataaacttgattttgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagtattttgtttgattgagttgtttaa 46582672  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |    
T  46582673 aatgatattgtattgtgccaagtccatgtattgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattgg 46582772  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582773 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 46582872  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| | || ||||||||||||    
T  46582873 tggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagactgatattttcataccatcataagtaatatatttgatg 46582972  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  46582973 t 46582973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 45045464 - 45045826
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045464 caaaggataggggcaaagaagaggtttggagggcaagcttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 45045563  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  || |    
T  45045564 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaagttgtcaatgaatgaaccaaacccttat 45045663  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045664 gtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcttcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaatttt 45045763  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045764 cacaatagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaaga 45045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37345499 - 37345137
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37345499 caaaggatatgggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagt 37345400  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || |    
T  37345399 attttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaaacccttat 37345300  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37345299 gtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaatttt 37345200  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345199 cacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37345137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 25277328 - 25277698
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25277328 caaaggataggggcaaagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgagt 25277427  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcca--------tgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  25277428 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgactgaaccaa 25277527  T
Q  203 acatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 302  Q
    ||  || | ||       |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277528 acccttatgtcaaaaaaattcaatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcct 25277627  T
Q  303 tgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277628 tgaattttcacaacagacatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 25277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 10 - 409
Target Start/End: Original strand, 33600104 - 33600511
Alignment:
Q  10 gcaaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600104 gcaaatgataggggcagggaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaaggcagcttaggttgattaagatattgataggag 33600203  T
Q  110 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaa--------taaaaagaggttgtcaatgaatgaatca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33600204 tattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaaagttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatca 33600303  T
Q  202 aacatttctctcnnnnnnn-ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtc 300  Q
    | | ||||| ||        |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33600304 acc-tttctgtcaaaaaaaattcaatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtc 33600402  T
Q  301 cttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  33600403 cttgaattttcacaacagatatcaatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattgtaaaaagacaga 33600502  T
Q  401 catttgcat 409  Q
    |||||||||    
T  33600503 catttgcat 33600511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15105595 - 15105185
Alignment:
Q  25 agagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattg 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15105595 agagaagaggtttggatgacaaggttgatggatgaagttgattgtgtaggaaatgagcttaggttgattaagatattgataggagtaatttgtttgattg 15105496  T
Q  125 agttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttca 224  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |        ||||    
T  15105495 agttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatccaaccattctgttaagaaatttca 15105396  T
Q  225 atcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 324  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  15105395 atcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaatca 15105296  T
Q  325 ctgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcat 424  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||   |||||    
T  15105295 ttgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgcaaaaagacagacattcgcataccatcatgagtcat 15105196  T
Q  425 atatttgatgt 435  Q
    |||||||||||    
T  15105195 atatttgatgt 15105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Original strand, 3012516 - 3012838
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3012516 tttgtttgattgagttatttaaaatgttattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtgatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 3012615  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3012616 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttca 3012715  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3012716 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 3012815  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  3012816 atcataagtcatatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 92 - 435
Target Start/End: Original strand, 31237556 - 31237891
Alignment:
Q  92 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  31237556 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtaccaagtccatgtaatg--------aaaagaggttgtcaat 31237647  T
Q  192 gaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 291  Q
    |||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31237648 gaatgaatcaaacccttctatcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcctcaaattagtgataataccatc 31237747  T
Q  292 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  31237748 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacattcactttgactataa 31237847  T
Q  392 aaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31237848 aaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 31237891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Original strand, 51895228 - 51895550
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  51895228 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattatgtcatgtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttatgt 51895327  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51895328 caaaaaaattcaatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 51895427  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  51895428 caacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 51895527  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||| | ||||||||||| ||||    
T  51895528 atcataagtcatatattttatgt 51895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 156 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2870617 - 2870338
Alignment:
Q  156 gtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatc 255  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2870617 gtccatgtaatgttgtaacgaaaagaggttgtcaatgaatgaaccaaacctttctgtcaaaatatttcaatcaaattggtccttgaattatatacatatc 2870518  T
Q  256 catcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870517 catcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcattgtgatccttggtgcatacatttgctgaac 2870418  T
Q  356 aaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  2870417 aaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Original strand, 34777338 - 34777522
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777338 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 34777437  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  34777438 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 112 - 397
Target Start/End: Original strand, 52642698 - 52642981
Alignment:
Q  112 ttttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctc 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||     
T  52642698 ttttgtgtgattgagttgtttaaaatgttattgcattgtgccaagtctgtgtaatgttgtaatgaaaagaggttgccaatgaatgaatttaacccttctg 52642797  T
Q  212 tcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttc 311  Q
    ||       |||||||||||| ||| ||  |||  || | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52642798 tcaaaaaatttcaatcaaattggtctttctattgcatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttc 52642897  T
Q  312 acaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagac 397  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  52642898 acaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac--acactttgattgtaaaaagac 52642981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Original strand, 4855167 - 4855351
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4855167 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatttgc 4855266  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  4855267 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 409
Target Start/End: Original strand, 8168515 - 8168690
Alignment:
Q  234 gtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcc 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8168515 gtccttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatcc 8168614  T
Q  334 ttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8168615 tttgtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 8168690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37087392 - 37087316
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttagg 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37087392 caaatgatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttagg 37087316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 9120813 - 9120926
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  9120813 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 9120912  T
Q  321 atcactgtgatcct 334  Q
    |||| |||||||||    
T  9120913 atcaatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1443513 - 1443400
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  1443513 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 1443414  T
Q  321 atcactgtgatcct 334  Q
    |||| ||| |||||    
T  1443413 atcaatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Original strand, 47012213 - 47012326
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  47012213 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatcaatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 47012312  T
Q  321 atcactgtgatcct 334  Q
    |||| |||||||||    
T  47012313 atcaatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 42558848 - 42558916
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42558848 gaagaggtttggagggcatggttgatggacaaagttgactgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 42558916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Original strand, 3369967 - 3370035
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3369967 gaagaggtttggaggacaaggttgatggacaaagttgactacgtagggagtgagctttggttgattaag 3370035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 51123059 - 51122987
Alignment:
Q  34 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 106  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51123059 gtttggagggtgaggtagatggacaaagttgatactttaggaactgagcttaggttgattaagtttttgatag 51122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 5784239 - 5784211
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatgga 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784239 gaagaggtttggagggcaaggttgatgga 5784211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 32086073 - 32086009
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgat 92  Q
    |||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  32086073 gaagagttttggaaggaaatgttgatggacaaagttgattgtttagtaagtgagtttagattgat 32086009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21842157 - 21841740
Alignment:
Q  18 tagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21842157 taggggcagagaagaggtttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgactaagatattgataggagtattttgt 21842058  T
Q  118 ttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnn 217  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||        
T  21842057 ttgactgagttgtttaaaatgttattgtattgtggcaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgtcaaaa 21841958  T
Q  218 nnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaaca 317  Q
       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21841957 aaattcaatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaata 21841858  T
Q  318 gatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcag 417  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21841857 gatatcactgtgattcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcat 21841758  T
Q  418 aggtcatatatttgatgt 435  Q
    | ||||||||||||||||    
T  21841757 aagtcatatatttgatgt 21841740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2180934 - 2180514
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180934 caaaggacaggggcaaagaagaggtttggaggacaaggttgatcgataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 2180835  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  2180834 attttgtttgattgagtt--ttaaaatgttattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacccttgt 2180738  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180737 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 2180638  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2180637 cacaacagatatcactgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagac-tttgcata 2180539  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| |  |||||| ||||||||    
T  2180538 ccatcataaatcatatctttgatgt 2180514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 35 - 435
Target Start/End: Original strand, 2853253 - 2853653
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaa 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2853253 tttggaggacaaggttgatggataaagttgattgtgtaagaagtgagcttaggttgattaagatattgatatgaatattttgtttgattgagttgtttaa 2853352  T
Q  135 aatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttg 234  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||| | ||       |||||| ||||| |    
T  2853353 aatgatattgtaatgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaatagattgtcaatgaatgaaccaaacctttatgtcaaaatatttcaatgaaattgg 2853452  T
Q  235 tccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2853453 tccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 2853552  T
Q  335 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatg 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  2853553 tggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcatattatcataagtcatatatttgatg 2853652  T
Q  435 t 435  Q
    |    
T  2853653 t 2853653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12738200 - 12737844
Alignment:
Q  78 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12738200 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaataaa 12738102  T
Q  178 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12738101 aagaggttgtcgatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaatta 12738002  T
Q  278 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 377  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12738001 gtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 12737902  T
Q  378 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  12737901 cactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12737844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12801023 - 12800667
Alignment:
Q  78 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaa 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12801023 tgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattg-attgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaa 12800925  T
Q  178 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaatta 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12800924 aagaggttgtcaatgaatgaatcaaaccattctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaatta 12800825  T
Q  278 gtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 377  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12800824 gtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaga 12800725  T
Q  378 cactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  12800724 cactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatcatatatttgatgt 12800667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 42472444 - 42472841
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42472444 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtctaggaagtgagcttaggttgattaagttattgataggagt 42472543  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42472544 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttct 42472643  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |    
T  42472644 gtcaaaaatattcaatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattat 42472743  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 409  Q
    || |||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42472744 cataacagaaatcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 42472841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 92 - 435
Target Start/End: Original strand, 30464679 - 30465022
Alignment:
Q  92 ttaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaat 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30464679 ttaagatattcataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgatattgtattgtgccaagtccatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaat 30464778  T
Q  192 gaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatc 291  Q
    |||||||||||||  |||| ||       |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30464779 gaatgaatcaaacccttctgtcaaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgataataccatc 30464878  T
Q  292 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  30464879 aaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgactataa 30464978  T
Q  392 aaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  30464979 aaagacagacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 113 - 439
Target Start/End: Original strand, 32134897 - 32135223
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32134897 tttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgtcaagtcgatgtaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 32134996  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32134997 caaaaaatttcaatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 32135096  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32135097 caacggagatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataac 32135196  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgtccat 439  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||    
T  32135197 atcctaagtcatatatttgatgtccat 32135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 113 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 8540732 - 8540410
Alignment:
Q  113 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8540732 tttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgtcaaatccatgtaatgttgtaatgaaaataggttgtcaatgaatgaatcaaacctttctgt 8540633  T
Q  213 cnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttca 312  Q
    |       ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8540632 caaaaaatttcaatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttca 8540533  T
Q  313 caacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatc 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8540532 caacagatatcattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcatacc 8540433  T
Q  413 atcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  8540432 atcataagtcatatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 222 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28821332 - 28821119
Alignment:
Q  222 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821332 tcaatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 28821233  T
Q  322 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 421  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  28821232 tcactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagt 28821133  T
Q  422 catatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||    
T  28821132 catatatttgatgt 28821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28821557 - 28821360
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821557 caaaggatagagggatataagaggtttggagggaaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 28821458  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacattt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821457 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgtattgtgccaagtccatctaatgttgtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacattt 28821360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7268768 - 7268584
Alignment:
Q  251 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 350  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268768 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7268669  T
Q  351 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  7268668 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgt 7268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 284 - 435
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540576
Alignment:
Q  284 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacacttt 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  384 gattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 24540576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17575819 - 17575700
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg-aagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575819 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 17575720  T
Q  110 tattttgtttgattgagttg 129  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  17575719 tattttgtttgactgagttg 17575700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17577130 - 17577011
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg-aagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 109  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577130 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtgagcttaggttgattaagatattgataggag 17577031  T
Q  110 tattttgtttgattgagttg 129  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  17577030 tattttgtttgactgagttg 17577011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Original strand, 18624276 - 18624398
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18624276 caaaggatagtgtcagagaagaggtttggatgacaaggttgatggatgaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 18624375  T
Q  111 attttgtttgattgagttgttta 133  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  18624376 aatttgtttgattgagttgttta 18624398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17575099 - 17574980
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtagg-aagtgagcttaggttgattaag-atattgatagga 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17575099 caaatgataggggcagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaaagtgagcttaggttgattaagtatattgatagga 17575000  T
Q  109 gtattttgtttgattgagttg 129  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  17574999 gta-tttgtttgactgagttg 17574980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 349
Target Start/End: Original strand, 41494524 - 41494741
Alignment:
Q  132 taaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaat 231  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || | ||       ||| |||||||    
T  41494524 taaaatgttattgtattgtgccaagtctgtgtaatgtagtaatgaaaagaggttgtcaatgaatgaattcaacccttttatcaaaatctttccatcaaat 41494623  T
Q  232 ttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgat 331  Q
    | ||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41494624 tggtccttctattgtatgtctatccatcatattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaat 41494723  T
Q  332 ccttggtgcatacatttg 349  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  41494724 ccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 40781543 - 40781430
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  40781543 ttcaatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagag 40781444  T
Q  321 atcactgtgatcct 334  Q
    |||| |||||||||    
T  40781443 atcaatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 334
Target Start/End: Original strand, 29620912 - 29621024
Alignment:
Q  222 tcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagata 321  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  29620912 tcaatcacattggtccttgaattacaatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaga 29621011  T
Q  322 tcactgtgatcct 334  Q
    ||| |||||||||    
T  29621012 tcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 1344348 - 1344283
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1344348 gaggtttggagggcaaggttgatggacaaagttgattgtataggaagtgagcttaggctgattaag 1344283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 28036377 - 28036443
Alignment:
Q  28 gaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgatta 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28036377 gaagaagtttggagggcaaggttgatggacaaaattgattgtgtaggaagtgagcttagattgatta 28036443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18341275 - 18341214
Alignment:
Q  35 tttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaag 96  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18341275 tttggagggcaatgttgatggacaaagttgattgtgtaggaagtgagcttaaattgattaag 18341214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Original strand, 1343744 - 1343854
Alignment:
Q  31 gaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgt 130  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||| | |||||||   || |||| ||| ||||||| |    
T  1343744 gaggtttgaaggacaaggttgatggacaaagttgattgtatagaaagtgagcttatgctgattaagtttttgatagtcataatttgcttgtttgagtttt 1343843  T
Q  131 ttaaaatgcta 141  Q
    |||| ||||||    
T  1343844 ttaacatgcta 1343854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27350039 - 27349967
Alignment:
Q  34 gtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgatag 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27350039 gtttggagggtgaggttgatggacaaagttgatactttaggaattgagcttaggttgattaagtttttgatag 27349967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27076817 - 27076733
Alignment:
Q  281 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 365  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||    
T  27076817 aaaataccatcaaataaatcattgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcaaatatgtgcagaataaagtaaaaa 27076733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Original strand, 107547 - 107970
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 110  Q
    |||||||||| |  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107547 caaaggatagtgtcagcgaagaggttttgagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagt 107646  T
Q  111 attttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaataaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttct 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||   |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  107647 aatttgtttgattgagttgtttaaaatgttattgtattgtgccaagtttgtgtaatgtagtaatgaaaaaaggttgtcaatgaatgaatc-aacccttct 107745  T
Q  211 ctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaatttt 310  Q
     ||       |||||||||||| ||| ||  ||| ||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  107746 gtcaaaaaatttcaatcaaattggtcattctattgtatgtctatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaatttt 107845  T
Q  311 cacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcata 410  Q
    ||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  107846 cacaatataaatcactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcata 107945  T
Q  411 tcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
     ||||| | |||||| |||||||||    
T  107946 ccatcataagtcatacatttgatgt 107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 61 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 682 - 301
Alignment:
Q  61 gttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtcca 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  682 gttgattgtgtaggaagtcagcttaggttgattacgatattgatagaagtattttgtttgattgagttgtttaaaatgctattctattgtgccaagttca 583  T
Q  161 tgtaatgttgtaata----------------aaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaatcaaatttgtccttgaatt 244  Q
    ||||||||||||||                 ||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||       |||||||||||| |||||||||||    
T  582 tgtaatgttgtaatgttgtaatgttgtaatgaaaagaggtggtcaatgaatgaatcaaacccttatgtcaaaaagtttcaatcaaattggtccttgaatt 483  T
Q  245 atatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatac 344  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482 atatg---------catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatac 392  T
Q  345 atttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  391 atttgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtcatatatttgatgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 719 - 677
Alignment:
Q  11 caaaggatagggggagagaagaggtttggagggcaaggttgat 53  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  719 caaatgataggggtagagaagaggtttggagggcaaggttgat 677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4257 - 4043
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4257 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 4158  T
Q  321 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  4157 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 4058  T
Q  421 tcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||||    
T  4057 tcatatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5429 - 5215
Alignment:
Q  221 ttcaatcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429 ttcaatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagat 5330  T
Q  321 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagagg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |    
T  5329 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataag 5230  T
Q  421 tcatatatttgatgt 435  Q
    |||||||||||||||    
T  5229 tcatatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 287
Target Start/End: Original strand, 1497 - 1752
Alignment:
Q  27 agaagaggtttggagggcaaggttgatggataaagttgattgtgtaggaagtgagcttaggttgattaagatattgataggagtattttgtttgattgag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1497 agaagaggtttggagggcaaggt--atggataaagttgattgtgtaggaagtgaatttaggctgattaagatgttgataggagtaatttgtttgattgag 1594  T
Q  127 ttgtttaaaatgctattgcattgtgtcaagtccatgtaatgttgtaat-aaaaagaggttgtcaatgaatgaatcaaacatttctctcnnnnnnnttcaa 225  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||| || |||| ||       ||| |    
T  1595 ttgtttaaaatgttattgtattatgccaagtctatgtaatgttgtaatgaaaaagatgttgtcaatgaat---tcaacca-ttctatcaaaatatttcca 1690  T
Q  226 tcaaatttgtccttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac 287  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1691 tcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaatac 1752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University