View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10124_1 (Length: 754)
Name: NF10124_1
Description: NF10124
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10124_1 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 609; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 4290123 - 4289423
Alignment:
| Q |
34 |
tcacttttatcctcttttgggtcatctcatttggcctaatgattctcacaaaccaatcattaaattcataagaggaaacactctttcacttaccatagct |
133 |
Q |
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| T |
4290123 |
tcacttttatcctcttttgggtcatctcatttggcctaatgattctcacaaaccaatcattaaattcataagaggaaacactctttcacttaccatagct |
4290024 |
T |
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| Q |
134 |
gaatctcatgatgatttcaatcatttatctggtaagaatctttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaag |
233 |
Q |
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|
| T |
4290023 |
gaatctcatgctgatttcaatcatttatctggtaagaatctttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaag |
4289924 |
T |
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| Q |
234 |
cttctgttttggctcttcaagttaccgtatttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttc |
333 |
Q |
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| T |
4289923 |
cttctgttttggctcttcaagttaccatttttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttc |
4289824 |
T |
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| Q |
334 |
ttttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaaataaagtatctgaattagaatcacccctttgtttgccacatgagtattgtcctttctat |
433 |
Q |
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| T |
4289823 |
ttttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaaatgaagtatctgaattagtatcacccctttgtttgccacatgagttttgtcctttctat |
4289724 |
T |
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| Q |
434 |
gatagaaaagtaatcaaggatccaaatcaaatagaggcaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttggg |
533 |
Q |
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| T |
4289723 |
gatagaaaagtaataaaggatccaaatgaattagaggcaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttggg |
4289624 |
T |
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| Q |
534 |
atcttgaagttccagaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatattgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtac |
633 |
Q |
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| T |
4289623 |
atcttcaagttccagaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatatcgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtaa |
4289524 |
T |
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| Q |
634 |
taggaatgagaataaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaaaat |
733 |
Q |
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| T |
4289523 |
taggaacgagaaaaaaaatcttcacctgtcaacttttgttgtatctatagcttatgcatgggtatgcagagtgaaagcagaagaaattgagaacaaaaat |
4289424 |
T |
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| Q |
734 |
g |
734 |
Q |
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| |
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| T |
4289423 |
g |
4289423 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 742
Target Start/End: Original strand, 4260054 - 4260762
Alignment:
| Q |
34 |
tcacttttatcctcttttgggtcatctcatttggcctaatgattctcacaaaccaatcattaaattcataagaggaaacactctttcacttaccatagct |
133 |
Q |
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| T |
4260054 |
tcacttttatcctcttttgggtcatctcatttggcctcatgattctcacaagccaatcattaaattcatcaaaggaaacactctttcacttaccgtagct |
4260153 |
T |
|
| Q |
134 |
gaatctcatgatgatttcaatcatttatctggtaagaatctttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaag |
233 |
Q |
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|
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| T |
4260154 |
gaatctcatgctgatttcaatcatttctctggtaagaatctttctgaagctacacagattcatgattttttacctaacttgaatatttctcatgatcaag |
4260253 |
T |
|
| Q |
234 |
cttctgttttggctcttcaagttaccgtatttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttc |
333 |
Q |
| |
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|
| T |
4260254 |
cttcttttttggctcttcaagttactttttttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttc |
4260353 |
T |
|
| Q |
334 |
ttttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaaataaagtatctgaattagaatcacccctttgtttgccacatgagtattgtcctttctat |
433 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4260354 |
ttttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaattgaagtatctgaattagtattacccctttgtttgccacatgagttttgtcctttctat |
4260453 |
T |
|
| Q |
434 |
gatagaaaagtaatcaaggatccaaatcaaatagaggcaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttggg |
533 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4260454 |
gatagaaaattaattaaggatccaaatgaattagaggctaaatatttgagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttggg |
4260553 |
T |
|
| Q |
534 |
atcttgaagttccagaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatattgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtac |
633 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4260554 |
atcttgaagttccagaagattcatttagagggttatttcaattatctcgtttggatatcgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtac |
4260653 |
T |
|
| Q |
634 |
taggaatgagaataaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaaaat |
733 |
Q |
| |
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| T |
4260654 |
taggactgagaataaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagagaaaattgagaacaaaaat |
4260753 |
T |
|
| Q |
734 |
gttgtgatg |
742 |
Q |
| |
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||||||||| |
|
|
| T |
4260754 |
gttgtgatg |
4260762 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 734
Target Start/End: Original strand, 4265602 - 4266300
Alignment:
| Q |
36 |
acttttatcctcttttgggtcatctcatttggcctaatgattctcacaaaccaatcattaaattcataagaggaaacactctttcacttaccatagctga |
135 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4265602 |
acttttatcctcttttgggtcatctcacttggcctaatgattctcacaagccaatcatcaaattcatcaagggaaaccctctttcacttaccatagctga |
4265701 |
T |
|
| Q |
136 |
atctcatgatgatttcaatcatttatctggtaagaatctttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaagct |
235 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4265702 |
atctgatgctgatttcaatcatctttcaggtaagaatcttactgaagctaaacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaagct |
4265801 |
T |
|
| Q |
236 |
tctgttttggctcttcaagttaccgtatttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttctt |
335 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4265802 |
tctattttggctcttcaagttactctttttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttctt |
4265901 |
T |
|
| Q |
336 |
ttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaaataaagtatctgaattagaatcacccctttgtttgccacatgagtattgtcctttctatga |
435 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4265902 |
ttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaaatgaagtatctgaattagaattacccctttgtttgccacatgagttttgtcctttctatga |
4266001 |
T |
|
| Q |
436 |
tagaaaagtaatcaaggatccaaatcaaatagaggcaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttgggat |
535 |
Q |
| |
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|
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| T |
4266002 |
tagaaaaataatcaaggatccaaatgaattagaggcgaaatatttgagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtctgggat |
4266101 |
T |
|
| Q |
536 |
cttgaagttccagaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatattgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtacta |
635 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4266102 |
cttcaagtcccagaagattcatttagagggttatttcaattatctcgttcgaatatcgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtacta |
4266201 |
T |
|
| Q |
636 |
ggaatgagaataaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaaaatg |
734 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4266202 |
ggaatgagaataaaaatcttcacctgtcaacttttgttgtatctatagcttatgcatgggtatgcagagtgaaaacagaagaaattgagaacaaaaatg |
4266300 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 4298705 - 4298010
Alignment:
| Q |
36 |
acttttatcctcttttgggtcatctcatttggcctaatgattctcacaaaccaatcattaaattcat-aagaggaaacactctttcacttaccatagctg |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4298705 |
acttttatcctcttttgggtcatctcacttggcctaatgattctcacaaaccaatcatcaaattcttcaagag-aaacactctttcacttaccatagctg |
4298607 |
T |
|
| Q |
135 |
aatctcatgatgatttcaatcatttatctggtaagaatctttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaagc |
234 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4298606 |
aatctgattctgatttcaattatctatctggtaagaatccttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaagc |
4298507 |
T |
|
| Q |
235 |
ttctgttttggctcttcaagttaccgtatttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttct |
334 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4298506 |
ttatgttttggctcttcaagttaccgtttttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatggtaaaacttcaacttct |
4298407 |
T |
|
| Q |
335 |
tttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaagcttgaaaataaagtatctgaattagaatcacccctttgtttgccacatgagtattgtcctttctatg |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4298406 |
tttatcaaatcttgggcttacctatgtagaaatattggaaaggaaatatctgaatcagaatcatccatttgtttgcctcatgagttttgtcctttctatg |
4298307 |
T |
|
| Q |
435 |
atagaaaagtaatcaaggatccaaatcaaatagaggcaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttggga |
534 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4298306 |
atagaaaagtaatcaaggatccaaacgaattagaggaaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaataaaagcttaatggtttggga |
4298207 |
T |
|
| Q |
535 |
tcttgaagttccagaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatattgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtact |
634 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4298206 |
tcttcaagttccagaagattcatttagagggttatttcaattatctcgttcggatatcaaaaagcttaaggaatttgtagtgttaaaacaagagggtact |
4298107 |
T |
|
| Q |
635 |
aggaatgagaataaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaaaatg |
734 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4298106 |
aggaacgagaataaaagtcttcatttgtcaacatttgtactatct-----------attggtatgtagaatgaaagccgagaaaattgagaacaaaaatg |
4298018 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 347 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 4285111 - 4284724
Alignment:
| Q |
347 |
tgggcttacctatgtagaaagcttgaaaataaagtatctgaattagaatcacccctttgtttgccacatgagtattgtcctttctatgatagaaaagtaa |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4285111 |
tgggcttacctatgtagaaagcttgaaaatgaagtttctgaattagaatcacccctttctttgccacatgaattttgtcctttctatgatagaaatgtaa |
4285012 |
T |
|
| Q |
447 |
tcaaggatccaaatcaaatagaggcaaaatatttaagtgattggttaaagcaaggtggaaccaacaatagaagtttaatggtttgggatcttgaagttcc |
546 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4285011 |
tcacggatccaaatgaattagaggcaaaatatttgagggattggtcaaagcaaggtggaaccaacaatagaagcttaatggtttgggatcttcaagttcc |
4284912 |
T |
|
| Q |
547 |
agaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatattgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtactaggaatgagaat |
646 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4284911 |
agaagattcatttagagggttatttcaatgatctcgtttggatatcgtatagcttaaggaatttttagtgtcaaaacaaaaggctactaggaatgagaaa |
4284812 |
T |
|
| Q |
647 |
aaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaaaatg |
734 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4284811 |
aaataccttcacttgtcaacttttgttgtatccatagcttatgcctgggtatacagaatgaaagctaaagaaattgagaacaaaaatg |
4284724 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4285293 - 4285109
Alignment:
| Q |
134 |
gaatctcatgatgatttcaatcatttatctggtaagaatctttctgaagctacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttctcatgatcaag |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4285293 |
gaatctcatgctgctttcaatcatttatctgctaagaatctttcagaagccacacaaattcatgatcttttacctaacttgaatatttcacatgatcaag |
4285194 |
T |
|
| Q |
234 |
cttctgttttggctcttcaagttaccgtatttccaaactatggattttcaattggtattacttcacatcatgctgttttagatgg |
318 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4285193 |
ctactgttttggctcttcaagttactgtttttccaaactatggattttcaatgggcattacttcacatcatgctgttttagatgg |
4285109 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 540 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 4255912 - 4255719
Alignment:
| Q |
540 |
aagttccagaagattcatttagaggattatttcaattatctcgtttggatattgaaaagcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtactaggaa |
639 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4255912 |
aagttcctgaagattcatttagagggttatttgaaatatctcgttcggatatcgaaa-gcttaaggaatttgtagtgtcaaaacaaaagggtactaggaa |
4255814 |
T |
|
| Q |
640 |
tgagaataaaaatcttcacttgtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaaaatg |
734 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
4255813 |
tgagaataaaaatcttcaattgtcaacatttgtggcatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagccgagaaaattgagaacaagaatg |
4255719 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 661 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 4258388 - 4258319
Alignment:
| Q |
661 |
gtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagaatgaaagcagaaaaacttgagaacaaa |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4258388 |
gtcaacatttgtggtatctattgcttatgcattggtatgtagactgaaagcagaaaaacttgagaacaaa |
4258319 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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