View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10131_high_21 (Length: 269)

Name: NF10131_high_21
Description: NF10131
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10131_high_21
NF10131_high_21
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-255)||(7014-7268)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-255)||(40146947-40147201)
chr5 (1-255)||(27015218-27015472)
chr5 (1-255)||(5057734-5057987)
chr5 (1-255)||(213154-213405)
chr5 (1-255)||(38746691-38746945)
chr5 (1-255)||(28278001-28278256)
chr5 (1-252)||(27637845-27638096)
chr5 (11-253)||(316462-316700)
chr5 (20-207)||(33906305-33906491)
chr5 (10-204)||(35615867-35616060)
chr5 (10-254)||(4160330-4160571)
chr5 (10-153)||(16642208-16642349)
chr5 (14-157)||(10055032-10055175)
chr5 (22-156)||(30802649-30802782)
chr5 (11-156)||(30792937-30793080)
chr5 (10-245)||(14689649-14689880)
chr5 (59-253)||(21205883-21206076)
chr5 (160-255)||(16641169-16641263)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (1-255)||(2389968-2390222)
chr7 (1-255)||(6431657-6431911)
chr7 (12-255)||(34310944-34311187)
chr7 (1-255)||(4512618-4512871)
chr7 (1-255)||(29608427-29608676)
chr7 (1-255)||(6360140-6360394)
chr7 (1-255)||(48599562-48599806)
chr7 (12-255)||(3258693-3258934)
chr7 (9-255)||(2361200-2361445)
chr7 (12-255)||(22269672-22269913)
chr7 (1-255)||(4508934-4509179)
chr7 (1-255)||(4510776-4511021)
chr7 (10-246)||(22328636-22328872)
chr7 (1-130)||(32358189-32358318)
chr7 (92-248)||(8359553-8359708)
chr7 (10-206)||(5116330-5116526)
chr7 (23-139)||(22552782-22552897)
chr7 (1-55)||(30814451-30814505)
chr7 (11-82)||(37545307-37545379)
chr7 (133-255)||(1360382-1360502)
chr7 (56-204)||(43363693-43363839)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (1-255)||(34490899-34491153)
chr3 (1-255)||(6095827-6096081)
chr3 (1-255)||(47303938-47304191)
chr3 (1-255)||(49199698-49199953)
chr3 (12-255)||(54593402-54593644)
chr3 (1-255)||(30235811-30236065)
chr3 (12-255)||(46860168-46860412)
chr3 (1-241)||(43403975-43404215)
chr3 (1-253)||(55302195-55302447)
chr3 (1-255)||(4569637-4569891)
chr3 (1-241)||(43402032-43402272)
chr3 (12-255)||(36018548-36018791)
chr3 (1-255)||(40913024-40913279)
chr3 (9-255)||(41819752-41819995)
chr3 (1-185)||(28074303-28074486)
chr3 (10-253)||(5434108-5434351)
chr3 (11-245)||(1683184-1683417)
chr3 (10-242)||(34795565-34795795)
chr3 (10-175)||(26323821-26323985)
chr3 (10-245)||(35138944-35139186)
chr3 (10-145)||(39127255-39127389)
chr3 (11-178)||(36796103-36796274)
chr3 (56-111)||(31340448-31340503)
chr3 (18-130)||(41509960-41510072)
chr3 (189-253)||(26323306-26323369)
chr3 (102-244)||(20937444-20937585)
chr3 (25-96)||(50432937-50433006)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-255)||(1631960-1632214)
chr2 (1-255)||(42288338-42288591)
chr2 (1-255)||(45726616-45726869)
chr2 (1-255)||(35447112-35447366)
chr2 (1-255)||(17450277-17450530)
chr2 (10-253)||(24397752-24397991)
chr2 (10-255)||(33647864-33648108)
chr2 (1-173)||(7450987-7451158)
chr2 (12-180)||(42261913-42262080)
chr2 (10-195)||(30218322-30218506)
chr2 (11-121)||(40935542-40935651)
chr2 (59-120)||(24197643-24197703)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (1-256)||(8665093-8665348)
chr4 (1-255)||(54882706-54882960)
chr4 (1-253)||(26363951-26364203)
chr4 (1-255)||(27417189-27417433)
chr4 (1-255)||(50262926-50263180)
chr4 (1-255)||(50674074-50674328)
chr4 (1-255)||(12073079-12073332)
chr4 (1-255)||(55085593-55085848)
chr4 (1-255)||(6655642-6655896)
chr4 (9-255)||(35662136-35662380)
chr4 (12-255)||(41964114-41964354)
chr4 (1-207)||(40630670-40630876)
chr4 (1-253)||(46703187-46703437)
chr4 (12-255)||(379076-379318)
chr4 (40-256)||(8647863-8648079)
chr4 (10-255)||(33989558-33989801)
chr4 (1-157)||(2209394-2209550)
chr4 (1-207)||(46569822-46570028)
chr4 (10-253)||(33089594-33089825)
chr4 (1-99)||(8653286-8653384)
chr4 (3-109)||(10071959-10072065)
chr4 (1-106)||(10071571-10071676)
chr4 (1-243)||(35370578-35370820)
chr4 (10-255)||(22882981-22883225)
chr4 (10-255)||(22934645-22934889)
chr4 (11-157)||(38811405-38811550)
chr4 (56-253)||(12119281-12119475)
chr4 (14-247)||(3785790-3786021)
chr4 (17-243)||(34112314-34112539)
chr4 (10-253)||(26699676-26699920)
chr4 (10-245)||(35369679-35369912)
chr4 (18-255)||(41961110-41961350)
chr4 (177-255)||(2209575-2209653)
chr4 (17-99)||(47514885-47514967)
chr4 (41-184)||(25723516-25723658)
chr4 (9-70)||(32091265-32091326)
chr4 (18-102)||(6719289-6719373)
chr4 (10-81)||(22629290-22629361)
chr4 (223-255)||(40632353-40632385)
chr4 (56-207)||(6200140-6200291)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (8-255)||(37167990-37168237)
chr1 (1-255)||(11348384-11348638)
chr1 (1-255)||(29135934-29136187)
chr1 (1-255)||(7482460-7482713)
chr1 (1-255)||(42298203-42298457)
chr1 (1-255)||(34603262-34603515)
chr1 (8-255)||(13547317-13547564)
chr1 (8-255)||(13549228-13549475)
chr1 (16-255)||(37033301-37033540)
chr1 (1-255)||(34602568-34602821)
chr1 (7-255)||(37879139-37879387)
chr1 (1-255)||(47114858-47115111)
chr1 (1-255)||(193298-193551)
chr1 (1-255)||(47255568-47255816)
chr1 (12-255)||(28242086-28242328)
chr1 (1-255)||(19754177-19754434)
chr1 (1-255)||(19752372-19752625)
chr1 (10-255)||(41135516-41135759)
chr1 (90-255)||(31925934-31926099)
chr1 (9-204)||(6808141-6808336)
chr1 (15-204)||(9109680-9109869)
chr1 (19-255)||(22079039-22079260)
chr1 (9-81)||(31928210-31928282)
chr1 (10-207)||(16216771-16216966)
chr1 (101-174)||(4535783-4535857)
chr1 (73-245)||(12318720-12318890)
chr1 (26-102)||(3331255-3331331)
chr1 (18-131)||(28318110-28318225)
chr1 (18-144)||(6068321-6068447)
chr1 (54-147)||(38747052-38747144)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-255)||(11383672-11383926)
chr8 (1-255)||(42435219-42435473)
chr8 (1-255)||(40221431-40221685)
chr8 (12-255)||(40328476-40328719)
chr8 (1-255)||(44353481-44353732)
chr8 (8-171)||(22976227-22976389)
chr8 (1-255)||(4283232-4283464)
chr8 (10-247)||(40585420-40585656)
chr8 (10-182)||(2999821-2999993)
chr8 (10-178)||(40535548-40535713)
chr8 (17-176)||(3846126-3846283)
chr8 (11-178)||(9633842-9634007)
chr8 (17-163)||(11136843-11136989)
chr8 (11-81)||(20686459-20686528)
chr8 (160-255)||(18655246-18655340)
chr8 (25-102)||(10020150-10020227)
chr8 (86-175)||(3817641-3817729)
chr8 (54-102)||(10101540-10101588)
chr8 (59-129)||(28461305-28461375)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (1-255)||(3808937-3809191)
chr6 (13-255)||(603308-603550)
chr6 (1-255)||(5043314-5043567)
chr6 (1-255)||(21593352-21593604)
chr6 (1-255)||(17762673-17762929)
chr6 (12-255)||(2973167-2973410)
chr6 (1-255)||(26830352-26830606)
chr6 (2-245)||(22425065-22425308)
chr6 (12-179)||(26800468-26800634)
chr6 (22-204)||(17757789-17757973)
chr6 (10-207)||(25072881-25073076)
chr6 (153-255)||(5741019-5741120)
chr6 (212-255)||(25073464-25073507)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-255)||(11244-11498)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-255)||(80511-80765)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (6-245)||(18239-18478)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (12-180)||(490748-490915)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (10-207)||(1682-1878)


Alignment Details
Target: scaffold0466 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 7014 - 7268
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  7014 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 7113  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  7114 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 7213  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7214 gatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 7268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 40146947 - 40147201
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  40146947 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 40147046  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  40147047 tggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 40147146  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147147 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 40147201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 27015218 - 27015472
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||     
T  27015218 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 27015317  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27015318 gggttggtgccttttggggaagaatcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaa 27015417  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015418 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 27015472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 5057734 - 5057987
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  5057734 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggatcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaaccaaaagagggg-cttttgggaaaa 5057832  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  5057833 aggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 5057932  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5057933 gatccttagtaaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 5057987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 213154 - 213405
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgg-agaaccaaaaaagggggctcttgggaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  213154 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 213253  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  213254 agggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaga 213353  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  213354 agatccttagtgaaatcaaaggctaag----ggttctcttttgggggttagattct 213405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 38746691 - 38746945
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  38746691 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaagaaaa 38746790  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  38746791 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacgtgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 38746890  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38746891 gatccttattgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 38746945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 28278001 - 28278256
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggg-gctcttgggaaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28278001 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaa 28278100  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  28278101 agggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagactattgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagaga 28278200  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||  || |  ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28278201 agattgttagtgaaatcaaatgctaagggttggctctcttttaggggttagattct 28278256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27638096 - 27637845
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  27638096 ttttaaggttttagatactaaaggttgagaatctttgggtgaggttcaaag-ttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaa 27637998  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaa--aaag 198  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||    
T  27637997 gggttggtgcattttggg-aagattcatggggttaggaaacacatgagtgaagagtcttttatgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagag 27637899  T
Q  199 aagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagat 252  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27637898 aagatccttagtgaaatcaaagactaaaagtttgttctcttttgggggttagat 27637845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 316462 - 316700
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||    
T  316462 ttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagggggggctcttgggaga-gggttggtgc 316560  T
Q  111 cttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttg 209  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||  | ||||||| |||| |||||  |    
T  316561 cttttggggagagattcataaggttgggaaacacatcaaaagagagtc-tttgtgagcaactt-ggtgaatcttgggagaccaaaagagaaaatcctagg 316658  T
Q  210 caaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  316659 --aaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagatt 316700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33906491 - 33906305
Alignment:
Q  20 aaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggg 119  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33906491 aaaggttgagggtctttgagtgaggttcgaagcctcaaaatgtgaatcttgtagaaccaaaaaagggggctcttgggaga-gggttggtgccttttgggg 33906393  T
Q  120 a-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| |  |||||| | || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  33906392 agagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagac-ttagtgagcaacttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctt 33906305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 35615867 - 35616060
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||    
T  35615867 tttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaagggg-tgatg 35615965  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatc 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |  | |||||| ||||| | |||||| ||||||| |||  |||||||||  |||||||    
T  35615966 ccttttggggagagattcatggagttgagaaacacataaaagaagagtc-tttgtaatcaactttggtgagtcttgggaaaccaaaagcgaagatc 35616060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Original strand, 4160330 - 4160571
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |||    
T  4160330 tttagatactaaagtttgagggt-tttgggtgatgttcaaagtttaaagaagtgaatcctggagaactaaaagagggggctcttgggagaggg-taagtg 4160427  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||||     
T  4160428 tcttttggggagagattcatagggttgggaa-cacgtaagtggagagtcatttgtgagcaactagggtgaatcttgggaaaccaaaagagaagatcctta 4160526  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattc 254  Q
    |  || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160527 ggtaatt-aaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattc 4160571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16642349 - 16642208
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16642349 tttagatactaaaggttgatggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagaagtgaatcttgaagaacc--aaaagagggctcttgggaaa-gggttggtg 16642253  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggag 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16642252 ccttttggggacagattcatggggttaggaaacacatgagtggag 16642208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10055175 - 10055032
Alignment:
Q  14 gatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcctt 113  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  10055175 gatactaaagattgaaggtttttgggtgagattcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaa-ggtttggtgcctt 10055077  T
Q  114 ttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtc 157  Q
     |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10055076 atggggagagattcacggggttgggaaacacatgagtagagagtc 10055032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 30802649 - 30802782
Alignment:
Q  22 aggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga- 120  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  30802649 aggttgagggtctttaggtgaggttcaaagcttcatgatgtta-tcttagagaaccaaaagaggaggctcttgggaaagggtttg-tgccttttggggag 30802746  T
Q  121 agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30802747 agattcatggggttagaaaacacatgagtggagagt 30802782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 30792937 - 30793080
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||  |||||||||    
T  30792937 ttagatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaagcttcaagatgt-tatcttggagaaccaaaatatgtggct-ttgggaaa-aggttggtgc 30793033  T
Q  111 cttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagt 156  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30793034 cttttggggagatattcatggggttgggaaacacatgagtagagagt 30793080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14689880 - 14689649
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||    
T  14689880 tttagatagtgaaggttaagggtctttgagtgatgttcaaagtttcaagatgtgaattttggagaaccaaaagaaggggttcttgtgaaa-gggttggtg 14689782  T
Q  110 ccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttg 209  Q
    |||||||| | |||||| || |  ||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | | ||| |||  | ||||||| | ||||||||| |    
T  14689781 ccttttggag-agattcgtgagaatgggaaacacataaaaggagagt-atttgtgagcaacttagataagtcttgggacaccaaaagaaaagatccttag 14689684  T
Q  210 caaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14689683 -aaaatcaaaggctaggggttggttctcttttgggg 14689649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21206076 - 21205883
Alignment:
Q  59 atgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtc 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||| |||||  ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21206076 atgtgaatcttagagaaccaaaagatggggttctttggaaaggg-ttggtgtctttttcggagaggttcatagggttgggaaacacatgagtgaggagtc 21205978  T
Q  158 ttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt-tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
     ||||| || || |||||||| ||||   |||| ||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21205977 atttgtcagaaatttgggtgaattttaggaaactaaaagtgaagaaccttatg--aaatcaaagactaaggattggttctcttttgagggttagatt 21205883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16641263 - 16641169
Alignment:
Q  160 ttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16641263 ttgtgaacaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatacttaa-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggggattagattct 16641169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 2389968 - 2390222
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||     
T  2389968 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggaaaaccaaaagagggggctattgcgaaaa 2390067  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2390068 gggttggtggcttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggatagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 2390167  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390168 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 2390222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 6431657 - 6431911
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  6431657 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaa 6431756  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6431757 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 6431856  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6431857 gatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgagggttagattct 6431911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34311187 - 34310944
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34311187 tagatactaaaggttgagggtccttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcc 34311088  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  34311087 ttttggggaaggttcatggggatggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtg 34310988  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310987 aaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattct 34310944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4512871 - 4512618
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4512871 ttttagggttttagattctaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaag 4512772  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4512771 gg-ttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 4512673  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4512672 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgggggttatattct 4512618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 29608427 - 29608676
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  29608427 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 29608526  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  29608527 gggttggtgccttttgg-----attcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaa 29608621  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608622 gattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 29608676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6360394 - 6360140
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  6360394 ttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttgggtgaggttaaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaa 6360295  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||  ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  6360294 ggaatggtgccttttgaagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaa 6360195  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6360194 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 6360140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48599806 - 48599562
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||||| |||||||||||| ||||     
T  48599806 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaa----------ccaaaagagggggctcttgtgaaaa 48599717  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  48599716 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaaaacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 48599617  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48599616 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttatattct 48599562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 3258693 - 3258934
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3258693 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaacaaaaagatggggctcttgggaaaagggttggtgcc 3258792  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  3258793 ttttggggaagattcatggggatgggaaacatatgagtggagagtcttttattagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-g 3258891  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3258892 aaatcaaa-cctaagggttggttctcatttgggggttagattct 3258934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2361445 - 2361200
Alignment:
Q  9 ttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  2361445 ttttagatactaaagattgagggtctttgggtgagattcaatccttcaagatgtgaatcttgaagaatcaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggt 2361346  T
Q  109 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||     
T  2361345 gccttttggggatgattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagagaagatcctta 2361246  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2361245 gtgaaatcaaaggctaagggttggttctctttt-gaggttagattct 2361200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 22269672 - 22269913
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22269672 tagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagctacaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaagag-ttggtgcc 22269769  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  22269770 ttttggggaagattcatggggaggggaaacacatgagtggagagtctattgagagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtg 22269869  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22269870 aaatcataggctatgggttggttctcttttgggggttagattct 22269913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4509179 - 4508934
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4509179 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtga--------gaaccaaaagagggagctcttgggaaag 4509088  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||    
T  4509087 gg-ttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagataa 4508989  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  4508988 gatccttagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttatgggttagattct 4508934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4511021 - 4510776
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4511021 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtga--------gaaccaaaagagggagctcttgggaaag 4510930  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4510929 gg-ttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaactttggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 4510831  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  4510830 gatccttagtgaaatcaaaggctaacgattggttctcttttatgggttagattct 4510776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22328872 - 22328636
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  22328872 tttagatactaaaggttgaggatctttggtggaggttaaaagcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagagttggtg 22328773  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt- 207  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||| |||| |||| ||||||     
T  22328772 ccttttggggagagattcatagggttgggaaaaacatgagtagagagtcatttgtgagcaacttgggtgaatcttgggaaactaaaagagaatatcctta 22328673  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttggggg 246  Q
    ||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22328672 tg--taatcaaaagctaagggttggttctcttttggggg 22328636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32358318 - 32358189
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  32358318 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 32358219  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatgg 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32358218 gggttggtgccttttggggaaaattcatgg 32358189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8359708 - 8359553
Alignment:
Q  92 ttgggaaaggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaacc 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  8359708 ttgggaaaggg-ttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaacc 8359610  T
Q  192 aaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggtt 248  Q
    |||| |||| |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  8359609 aaaagagaaaatccttagtgaaatcaaaggctaagagttggttattttttgggggtt 8359553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 5116330 - 5116526
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||    
T  5116330 tttaaatactaaaggttgagggtctttaggtgatgttcaaaacttcaagatgtgaatctttgagaaccaaaagagggggctcttgggaga-gggtcggtg 5116428  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcct 206  Q
    |||||||| || |||||||| || |||| |||||| | |   ||| ||| |||||||  ||||| ||||||| |||   |||||||| ||||||||||    
T  5116429 ccttttggagagagattcattggattggtaaacacttcaaatgagggtcatttgtgataaacttaggtgagtcttgggtaaccaaaagagaagatcct 5116526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22552897 - 22552782
Alignment:
Q  23 ggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttggg-gaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||    
T  22552897 ggttgagggtctttgggtgagatttaaagggtcaaaatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgg--aaacggttggtgccttttgggaaaa 22552800  T
Q  122 gattcatggggttggaaa 139  Q
    |||||||||  |||||||    
T  22552799 gattcatggctttggaaa 22552782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 30814451 - 30814505
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttc 55  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814451 ttttagggttttagatacttaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttc 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 37545379 - 37545307
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgaggg-tctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaa 82  Q
    ||||| |||||| |||||| | ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37545379 ttagagactaaaagttgagagatctttggataagattcaaaggtttaagatgtgaatcttggagaaccaaaaa 37545307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1360502 - 1360382
Alignment:
Q  133 ttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttgg 232  Q
    ||||||||||||| |  |||||||  |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||  ||||  |||||||||  || || ||||    
T  1360502 ttggaaaacacatcaaaggagagt--tttgcgagcaacttgagtgagtcttggaaaaccaaaagagaatatt-tttgggaaatcaaaggatatggattgg 1360406  T
Q  233 ttctcttttg-ggggttagattct 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  1360405 ttctcttttggggggttagattct 1360382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43363839 - 43363693
Alignment:
Q  56 aagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggaga 154  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| |   |||||| ||||||||| | |||||||  ||||||  |||||||||||  ||||    
T  43363839 aagatgtgtatcttggagaactaaaagagggagctcttgggaca-ttgttggttccttttgggaagagattca-agggttgagaaacacatgagatgaga 43363742  T
Q  155 gtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatc 204  Q
    |||  |||||||||| |||||||| | |||  | ||||||| ||||||||    
T  43363741 gtc-cttgtgagcaatttgggtgaatcttgagagaccaaaagagaagatc 43363693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 34490899 - 34491153
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  34490899 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 34490998  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  34490999 gggttggtgccttttggagaagattcatggagttgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 34491098  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491099 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 34491153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 6096081 - 6095827
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  6096081 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttttgaaaa 6095982  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6095981 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 6095882  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095881 gatccttagtgaaatcaaatgctaaaggttggttctcttttgggggttagattct 6095827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 47303938 - 47304191
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  47303938 ttttatggttttagatactaaatgttgaaggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 47304037  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47304038 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagt-ttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaa 47304136  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
     |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47304137 tatccttagtgaaatcaaaaactaagggttggttctcttttgggggttagattct 47304191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49199953 - 49199698
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     
T  49199953 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaa 49199854  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggg-tgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  49199853 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacatatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggttgagtcttgtgaaaccaaaagaga 49199754  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199753 agatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattct 49199698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 54593402 - 54593644
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  54593402 tagatactaaaggttgagggtccttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtacc 54593501  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  54593502 ttttggggaagattcatggggatggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaatagaagatccttagtg 54593601  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54593602 aaatcaaaggctaagggtt-gttctcttttgggggttagattct 54593644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 30235811 - 30236065
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  30235811 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 30235910  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  30235911 gggttggtgccttttggggaatattcatggggttggaaaacacaagagtggagagtcatttgtgagcaagttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 30236010  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30236011 gatccttagtgaaatcgaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattct 30236065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 46860168 - 46860412
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46860168 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcc 46860267  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  46860268 ttttggggaagattcatagggatgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttag-g 46860366  T
Q  212 aaatcaaagacta--agggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46860367 aaatcaaagactaagagggttggttctcttttgggggttagattct 46860412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43404215 - 43403975
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  43404215 ttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 43404116  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  43404115 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaa 43404016  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctctttt 241  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43404015 gatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt 43403975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55302447 - 55302195
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  55302447 ttttagggttttagatactaaaagttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaa 55302348  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  55302347 gggttggtgccttttgggaaaaattcatgaggttggaaaacacatgagtggagattcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 55302248  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  55302247 gatccttagtgaaatcaaaggctaggggttggttctcttttgtaggttagatt 55302195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 4569637 - 4569891
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  4569637 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtaaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaaaa 4569736  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||     
T  4569737 gggggtgtgcctattggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagat 4569836  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4569837 gatctttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggtggttagattct 4569891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43402272 - 43402032
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  43402272 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgagaaaa 43402173  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  43402172 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagaatcatttgtgaacaacttgggtaagtcttgtgaaaccaaaagagaa 43402073  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctctttt 241  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43402072 gatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctctttt 43402032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 36018548 - 36018791
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  36018548 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgggaaaagggttggtgcc 36018647  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  36018648 ttttggggaagatccatggggatgggaaacacatgaatggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtg 36018747  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36018748 aaatcaaaggctatggattggttctcttttggggtttagattct 36018791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 40913024 - 40913279
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  40913024 ttttagggttttagatactaaaggtttagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 40913123  T
Q  101 gggttggtgcc-ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  40913124 gggttggtgcctttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaaattgggtgagtcttgtgaaagcaaaagaga 40913223  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40913224 agatccttagtgaaattaaaggttaagggttggttctcttttgggggttagattct 40913279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41819995 - 41819752
Alignment:
Q  9 ttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41819995 ttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggt 41819896  T
Q  109 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||| ||||    
T  41819895 gcctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagactcatttgtgagcaacttgagtgagtcttatgaaaccaaaagagaagat-cttt 41819798  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
       ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41819797 atgaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttagcggttagattct 41819752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 28074303 - 28074486
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28074303 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa- 28074401  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgt 185  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  28074402 tagttggtgcgttttggggaagattcatggggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagaaacttaggtgagtcttgt 28074486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5434351 - 5434108
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5434351 tttagataccaaaagttaagggtctttgagggaggtttaaagcttcaagatgtaaatcttatagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagtg 5434252  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt- 207  Q
      |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||     
T  5434251 ttttttagggagagattcatggggttaggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaagttgggtgagtcttgggaaaccaaaagagaagatcctta 5434152  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    ||   ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5434151 tg--taatcaaagactaaagattgattctcttttgggggttagatt 5434108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 1683184 - 1683417
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaa-gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || | || |||||||| ||||||    
T  1683184 ttagaaactaaaggttgagggtctttgggtgagattcaaatgtttcaa-atgtgaatcttggagaaccaaaagagaaggtttttcggaaaggg-ttggtg 1683281  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||     
T  1683282 cattttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgagtggataatcatttatgagcaactttggtgagtcttgtgagaccaaaagagaagatcctta 1683381  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1683382 g-aaaatcaaaggctaagggttggttatcttttgggg 1683417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 34795565 - 34795795
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| | || ||  ||    
T  34795565 tttagatactaaaggttgatggtcgttgggtgatgttcaaagcttcaagatctgaatcttggagaaccagaagagggggttctagggaga-ggtttcatg 34795663  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||     
T  34795664 ccttttgaggagagattcatggggttgggatacacatcaaaggagagt-ttttgtaagaaacttgggtgagtcttgggagaccaaaagagaagatcctta 34795762  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttg 242  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34795763 g-aaaatcaaaggctaagggatggttctcttttg 34795795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26323985 - 26323821
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  26323985 tttagatactaaaggttgagggtcattgggtgaagttcaaagcttcaagatgtaaatcttgaagaatcaaaagagagggctattgggaaa-gggttggtg 26323887  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggg 175  Q
    | ||||  | | |||||||||||||||  |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  26323886 cattttcagcagagattcatggggttgagaaacacatcaaaggagagtc-tttgtgagcaacttggg 26323821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35139186 - 35138944
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgt-------gaatcttggagaaccaaaa-aagggggctcttgggaaagg 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||       ||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||| |    
T  35139186 tttagatactaaacgttgagggtctttagatgaggttcaaaactttaagatgtaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaatgggttcttcggaaa-g 35139088  T
Q  102 ggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| || |   ||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||  | ||||||| ||||    
T  35139087 ggttgatgccttttgaggagagattcatgaggttggaaaacaaatcaaatgagagtc-tttatgagcaacttgaatgagtcttgggagaccaaaatagaa 35138989  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
    ||||||| | |||   |||  |||||||||  |||||||||||||    
T  35138988 gatccttaggaaataaaaaagctaagggttaattctcttttgggg 35138944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 39127255 - 39127389
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||  | |||||||    
T  39127255 tttacatactaaaggtttggggcctttgg-tgaggttcaaagcttcaagatatgaatcttagagaactaaaataggggactctt-ggaagagagttggtg 39127352  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacat 145  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  39127353 cctttttgggagagattcatgaggttgggaaacacat 39127389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 36796103 - 36796274
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaa----tcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttg 106  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    | ||| |||||||||| ||||| |||||  ||||  ||| |    
T  36796103 ttagaaactaaaggttgaaggtctttagatgaggttcaaagcttcaagatgtaaacctcttttgaagaaccaaaagaggggactctt-tgaaaaaggtcg 36796201  T
Q  107 gtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtga 178  Q
    ||   ||||||||| ||||||| ||||| || | ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  36796202 gttgattttggggagagattcacggggtcgggagacacaagagtggagagtcattggttagcaacttgggtga 36796274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31340503 - 31340448
Alignment:
Q  56 aagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31340503 aagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaatggttggtgcc 31340448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 41509960 - 41510072
Alignment:
Q  18 ctaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgg 117  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || ||||| |||||  |||||||| |    
T  41509960 ctaaaggttaagggtctttagatgagattcaaatggtcaagatgtgaatattggaaaaccaaaaaagagagcttttaggaaa-gggttaatgccttttag 41510058  T
Q  118 gga-agattcatgg 130  Q
    ||| ||||||||||    
T  41510059 ggagagattcatgg 41510072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26323369 - 26323306
Alignment:
Q  189 accaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26323369 accaaaaaagaatatccttaggaaa-tcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagatt 26323306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 244
Target Start/End: Original strand, 20937444 - 20937585
Alignment:
Q  102 ggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |   | |||||||| ||||  ||||||||||| | |||  | ||||||| ||||    
T  20937444 ggttggtgccttttgaggagagattcatgtggttgaaaaacacatcaaaagggagtcttt-gtgacaaacttgggtgattcttgggagaccaaaagagaa 20937542  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttggg 244  Q
    ||| ||| | ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  20937543 gattcttaggaaa-tcaaaggataaaggttggttctcttttggg 20937585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 50433006 - 50432937
Alignment:
Q  25 ttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttggg 96  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  50433006 ttgagggtctttgagtgagattcaaagggtcaagaggtgaatcttg--gaaccaaaagagggggctattggg 50432937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1632214 - 1631960
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1632214 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggggaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 1632115  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  1632114 gggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 1632015  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1632014 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 1631960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42288591 - 42288338
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  42288591 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 42288492  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  42288491 gggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 42288393  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42288392 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttcgggtttagattct 42288338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 45726616 - 45726869
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45726616 ttttagggttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaag 45726715  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  45726716 gg-ttggtgccttttggggaagattcatggggtttggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcatgtgaaaccaaaagagaa 45726814  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726815 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 45726869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35447366 - 35447112
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttg-gagaaccaaaaaagggggctcttgggaaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  35447366 ttttagggttttagatactaaaggttgagagtatttgtgtgaggttcaaagcttcaagatgtgagtcttgagagaaccaaaagagggg-ctcttgtgaaa 35447268  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  35447267 agggttggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagaga 35447168  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35447167 agatacttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 35447112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 17450277 - 17450530
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17450277 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa- 17450375  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgga-gagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| | | |||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  17450376 gggttggtgccctttgtgaaagattcatggggatgggaaacacatgagcgaaggagtcaattgtgagaaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaga 17450475  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||| || |  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  17450476 agatcattag-gaaatcaaaggctaagggttgattctctattgggggttggattct 17450530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Original strand, 24397752 - 24397991
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24397752 tttagatactaaaggttgacggtctttgtgtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtg 24397851  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||     
T  24397852 ccttttagggagagactcatcgggctggtaaacacatgagtggagagtcatttgtgaccaatttgggttagtcttgtgaaaccaaaagagaatatcctta 24397951  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  24397952 g-aaagtcaaag-ctaagggttggttc---tttgggggttagatt 24397991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Original strand, 33647864 - 33648108
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33647864 tttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaatcaaaagaggaggctcttgggaaaagggttggtg 33647963  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  33647964 ccttttgaggagagattcacgaggttggaaaacatatgagtagagagtcatttgttagctacttaggcgagtcttataaaaccaaaagagaagatcctta 33648063  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |  |||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  33648064 gggaaatcaaag--caagggttaattatcttttgggggttagattct 33648108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 7450987 - 7451158
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  7450987 ttttagggttttagatactaaaggttg-gcgtctttgggtgaggttcaaagcttcaggatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctttggtaaa 7451085  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttg 173  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7451086 gggttgatgacttttggagaagatttatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttg 7451158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42262080 - 42261913
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  42262080 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttggaga-gggttggtgcc 42261982  T
Q  112 ttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagt 180  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  42261981 tttaggtgagagattcatgggattgggaaacacatcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagt 42261913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30218506 - 30218322
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||| | | ||| |||    
T  30218506 tttagatactatatgttgagggtctttgggtgaggttcaaaacatcaaaatgtgaatcttggacaaccaaaaatgagggcttatgggaga-gagttagtg 30218408  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaa 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |  ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||    
T  30218407 ccttttggggagagattcatggggttgggaaacacaccaaaggagaatc-tttgtgagcaacttgagtgagtcttgcgaaaccaaaa 30218322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 40935651 - 40935542
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  40935651 ttagaaactaaaggttgagggcctttgggagagattcaaagtgtccaaatgtgaatctaggagaaccaaaagatgaggctcttgggaaa-gggttggtgc 40935553  T
Q  111 cttttggggaa 121  Q
    || ||||||||    
T  40935552 ctattggggaa 40935542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 120
Target Start/End: Original strand, 24197643 - 24197703
Alignment:
Q  59 atgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24197643 atgtgaatcttggggaaccaaaagaggggactcttgggaga-gggttggtgccttttgggga 24197703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 8665093 - 8665348
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8665093 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 8665192  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  8665193 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 8665292  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattctg 256  Q
    ||||||| |  |||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8665293 gatccttagtgaaatcaaaggttatgtgttggttttcttttgggggttagattctg 8665348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 54882706 - 54882960
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  54882706 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaa 54882805  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||    
T  54882806 gggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagaaacttgggtgagtctcgtgaaaccaaaagagaa 54882905  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54882906 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 54882960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 26363951 - 26364203
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26363951 ttttagggttttagatactaaaggttgagggcctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 26364050  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  26364051 gggttggggccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 26364150  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    ||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26364151 gatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttggtggttagatt 26364203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27417433 - 27417189
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27417433 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaaggggctcttgggaaag 27417334  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27417333 gggttggtgtcttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttt----------ttgggtgagtcttgtaaaaccaaaaaagaa 27417244  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27417243 gatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 27417189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50263180 - 50262926
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  50263180 ttttagggttttagacactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggaaaaa 50263081  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  50263080 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacctcggtgactcttgtgaaaccaaaagagaa 50262981  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    || |||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262980 gacccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattct 50262926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50674328 - 50674074
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||     
T  50674328 ttttagggttttaaatactaaatgttaagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctctaatgaaaa 50674229  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  50674228 gggttggtgccttatgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 50674129  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50674128 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 50674074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 12073079 - 12073332
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  12073079 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggg-ctcttgggaaaa 12073177  T
Q  101 -gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  12073178 agggttggtgccttttggg-aagattcatggggttggaaaacacatgagtgaagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttatgaaaccaaaagaga 12073276  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073277 agatccttagtgaaatcaaatgctaagggttggttctcttttgggggttagattct 12073332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55085848 - 55085593
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagctt-caagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  55085848 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttaaaagctttcaagatgtaaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaa 55085749  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  55085748 agggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgtgtgagtcttgtgaaaccaaaagaga 55085649  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  55085648 agatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgattctcctttgggggttagattct 55085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 6655642 - 6655896
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  6655642 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaactttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaa 6655741  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6655742 gggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 6655841  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6655842 gatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttggggttagattct 6655896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 35662136 - 35662380
Alignment:
Q  9 ttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35662136 ttttagatactaaaggttgagagtctttgggtgaggttcaaagcttcaatatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttaggaaaagggttggt 35662235  T
Q  109 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  35662236 gccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgaatggagagttctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatcctta 35662335  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35662336 g-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggtgttagattct 35662380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 41964114 - 41964354
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  41964114 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttagt--c 41964211  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  41964212 ttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtagagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtg 41964311  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41964312 aaatcaaaggctaagggttggttctctttt-ggggttagattct 41964354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 40630670 - 40630876
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||     
T  40630670 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagcttttgtgaaaa 40630769  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  40630770 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 40630869  T
Q  201 gatcctt 207  Q
    |||||||    
T  40630870 gatcctt 40630876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 46703187 - 46703437
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  46703187 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttcgagaatcaaaagagggggctcttgggaaaa 46703286  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  46703287 gggttggtgccttttggggaagattcatggggatgggaaa-acatgaatggagagtcttttgtcagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 46703385  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
     |||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46703386 aatccttag-gaaatcaaaggctaaaagttggttctcttttgggggttagatt 46703437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 379076 - 379318
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  379076 tagatactaaaggttgagggactttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggtcggtgcc 379175  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |      
T  379176 ttttggggaagattcatgagaatgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttag-g 379274  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  379275 aaatcaaaggctaagggttggttctcttttgtgggttagattct 379318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 8647863 - 8648079
Alignment:
Q  40 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8647863 tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaa 8647962  T
Q  140 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctctt 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||   || | ||||||||||||    
T  8647963 acacaggagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaatgttatgtgttggttctctt 8648062  T
Q  240 ttgggggttagattctg 256  Q
    |||||||||||||||||    
T  8648063 ttgggggttagattctg 8648079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Original strand, 33989558 - 33989801
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  33989558 tttagatactaaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaatagggggctcttgggaga-aggttggtg 33989656  T
Q  110 ccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttg 209  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |    
T  33989657 ccttttgggagagattcatgggattgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttttgaaaccaaaagagaagatccttag 33989756  T
Q  210 caaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
       |||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  33989757 -gtaatcaaaggctaaggatttgttctcttttggaggttagattct 33989801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 2209394 - 2209550
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||     
T  2209394 ttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaacgaggggactcttgggaaaa 2209493  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2209494 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtc 2209550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46570028 - 46569822
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  46570028 ttttagggttttagatactaaatgttgaaggtctttaggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 46569929  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | || | ||||||||| ||||    
T  46569928 ggattggtgccttttgggaaagattcatggggttgggaaacaaatgagtggaaagtcttttgtgaacaacttaggtgaatcttatgaaaccaaaagagaa 46569829  T
Q  201 gatcctt 207  Q
    | |||||    
T  46569828 ggtcctt 46569822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Original strand, 33089594 - 33089825
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  33089594 tttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagtttgaagatgtgaatcttggagaatcaaaagagggggctcttgggaga-gggttggtg 33089692  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
     ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           | ||||||| |||||||||||     
T  33089693 tcttttggagagagattcatggggtcgaaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttggg-----------agaccaaaagagaagatcctta 33089781  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33089782 g-aaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttggaggttagatt 33089825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 8653286 - 8653384
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8653286 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaa 8653384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 109
Target Start/End: Original strand, 10071959 - 10072065
Alignment:
Q  3 ttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||    
T  10071959 ttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaaagg 10072058  T
Q  103 gttggtg 109  Q
    |||||||    
T  10072059 gttggtg 10072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 10071571 - 10071676
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  10071571 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 10071670  T
Q  101 gggttg 106  Q
    ||||||    
T  10071671 gggttg 10071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35370820 - 35370578
Alignment:
Q  1 ttttaaggt-tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaaaagggggctcttgggaa 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||     
T  35370820 ttttaaggtatttagatactaaaggttgagggtctttgggagaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttgggag 35370721  T
Q  99 aggggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaa 197  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||  ||| |||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||| |    | ||||||| |    
T  35370720 a-gggttggtcccttttcgaaagagattcatgaggttgataaaaacatcaaaggagagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggataccaaaata 35370623  T
Q  198 gaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgg 243  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35370622 gaagat-ctttgggaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgg 35370578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22883225 - 22882981
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |     
T  22883225 tttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgggaga-gggctgata 22883127  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||   | ||||||| |||||||||||     
T  22883126 ccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatcaaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatcctta 22883028  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctctttt-gggggttagattct 255  Q
    | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22883027 g-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggggttagattct 22882981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22934889 - 22934645
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || |     
T  22934889 tttagatactaaaggttgagactatttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgggaga-gggctgata 22934791  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||| |   ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||   | ||||||| |||||||||||     
T  22934790 ccttttggagagagactcatagggttaggaaacacatcaaatgagagtc-tttgtgagcaatttgggcgagtcttaggagaccaaaagagaagatcctta 22934692  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctctttt-gggggttagattct 255  Q
    | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22934691 g-aaaatcaaaggataatggttggttctcttttggggggttagattct 22934645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38811550 - 38811405
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgc 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  38811550 ttagatactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaagctttaagatgtgaatcttggagaacccaaaga-ggggctcttgggaaa-gggttggtgt 38811453  T
Q  111 cttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtc 157  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||    
T  38811452 cttttgcggagagattcatgaggttaggaaacacataagtggagagtc 38811405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 253
Target Start/End: Original strand, 12119281 - 12119475
Alignment:
Q  56 aagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagag 155  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||     
T  12119281 aagatatgaatcttggagaattaaaaaagggaactcttgggaaaggg-ttggttcccttttgggaagattcatggggttgcgaaacacattagtggtgaa 12119379  T
Q  156 tcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||   ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119380 tcatttgtgagcaatttgggtgtgtcttgtgaaaccaaaagagaagatcc-ttaagaaatcgaag-ttaagggttggttctcttttgggggttagatt 12119475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 3785790 - 3786021
Alignment:
Q  14 gatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcctt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3785790 gatactaaaggttgagagtctttaggcgagattcaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-ggaaaagggttggtgcctt 3785888  T
Q  114 ttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaa 212  Q
    ||| ||| ||| | ||||||| |   ||||| | |  |||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||  | ||||||| |||| |||||| |  |    
T  3785889 ttgaggagagaattatggggtcgaggaacacttcaaaggagagtc-tttgtgagcaaattgtgcgagtcttgggagaccaaaagagaatatccttag-ga 3785986  T
Q  213 aatcaaagactaagggttggttctcttttgggggt 247  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3785987 aatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggt 3786021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 34112314 - 34112539
Alignment:
Q  17 actaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||   || |  ||||||||||||| |||| ||| | | ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  34112314 actaaagattgagggtctttgtgtgagattcaaaatgtccaattgtgaatcttggataacctaaagacgaggctcttagaaaaggg-ttggtgccttttg 34112412  T
Q  117 ggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaat 215  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||| |||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  34112413 gggagaggttcacggggttggaaaacacatgagtggagagtcatctgtgagcaacttggatgaatcttggaaaaacaaaactgaagatccttag-gaaat 34112511  T
Q  216 caaagactaagggttggttctcttttgg 243  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34112512 caaaggctaaagtttggttctcttttgg 34112539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26699920 - 26699676
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaa-aaagggggctcttgggaaaggggttggt 108  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  26699920 tttagatactaaaggttgaagatctttggttgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttagagagccaaatgaagggggatcttggaaaaagggttggt 26699821  T
Q  109 gccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    |||||||  | | ||||||||||||| || | | ||||||||||||| || || |||| |||||  | ||||| ||  ||||| |||| ||| ||| |||    
T  26699820 gccttttcagaagagattcatggggtcgggagatacatgagtggagattcattagtgaacaactcagatgagtcttagaaaactaaaagagatgat-ctt 26699722  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagatt 253  Q
    |    ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26699721 tatgtaatcaaaggttaaaggttggttctcttttaggggttagatt 26699676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35369912 - 35369679
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacc-aaaaaagggggctcttgggaaaggggttggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  35369912 tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagatttaagatgtgaatcttggagaacctaaaagagggggttcttgggaga-gggttggt 35369814  T
Q  109 gccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
     |||||| |  | ||||||||| ||||   |||||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||||| |    | | ||||| |||||||| ||    
T  35369813 cccttttcgaaagagattcatgaggtttagaaacacatcaaaagatagtc-tttgtaagcaacttgggtgagtctatggatagcaaaatagaagatcttt 35369715  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
     |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35369714 gg--gaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggg 35369679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Original strand, 41961110 - 41961350
Alignment:
Q  18 ctaaaggttgagggtctttgga-tgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttg 116  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||  || | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |  ||| ||||| |||||    
T  41961110 ctaaagggtgagggtctttggggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgtagaaccgaaaaagggggctctagggaga-aggtcggtgctttttg 41961208  T
Q  117 ggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagc-----aacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgc 210  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||| | |||||||     ||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||| |     
T  41961209 gggagagattcat-gggttgggaaacacattaaaggagagtc-tatgtgagcaacgtaacttgggtgagtcttgggagaccaaaaaagaatatccttag- 41961305  T
Q  211 aaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41961306 gaaatcaaaagctaagggttggttctcttttgagggttagattct 41961350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 255
Target Start/End: Original strand, 2209575 - 2209653
Alignment:
Q  177 gagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209575 gagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctatgggttggttctcttttgggggttagattct 2209653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 47514967 - 47514885
Alignment:
Q  17 actaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaa 99  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  47514967 actaaaggttgaaggtcttcgggtgaagttcaaagcttcaagatatgaatcttggtgaaccaaaagagtggactcttgggaaa 47514885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25723658 - 25723516
Alignment:
Q  41 gaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |  ||||  |||||||||| || || ||| ||||||||| ||    
T  25723658 gaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctctt-ggataatggttaatgccttttggagagagcttcgtggggttgggaa 25723560  T
Q  140 acacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttg 184  Q
    |||||| |   ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  25723559 acacatcaaaagagagtc-tttgtgaacaacttaagtgagttttg 25723516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 70
Target Start/End: Original strand, 32091265 - 32091326
Alignment:
Q  9 ttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttg 70  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32091265 ttttggatactaaatgttgagggtctttgagtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttg 32091326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Original strand, 6719289 - 6719373
Alignment:
Q  18 ctaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggg 102  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||||    
T  6719289 ctaaaggttgaaggttttagggtgagattcaaaggttcaagatgtgaatcttggaaaactaaaagagtggattcttgggaaaggg 6719373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22629361 - 22629290
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 81  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22629361 tttagaaactaaaggttcagtgtctctgggtgagatttaaaagttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 22629290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 255
Target Start/End: Original strand, 40632353 - 40632385
Alignment:
Q  223 taagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632353 taagggttggttctcttttgggggttagattct 40632385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6200291 - 6200140
Alignment:
Q  56 aagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggaga 154  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||||| || | | ||| ||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||  ||||    
T  6200291 aagatgtgtatcttggagaactaaaagatggagctcttgggacagagttgggttccttttggggagagatatgtggggttgagaaacacatgagatgaga 6200192  T
Q  155 gtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    |||  || ||||||| |||| ||| | |||  | ||||||| |||||||||||    
T  6200191 gtc-cttatgagcaatttggatgaatcttgagataccaaaagagaagatcctt 6200140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Original strand, 37167990 - 37168237
Alignment:
Q  8 gttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37167990 gttttagatactaaaggttgagggtttttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttgg 37168089  T
Q  108 tgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||    
T  37168090 tgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaactaaaagagaagatcctt 37168189  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
     |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37168190 agtgaaatcaaaggctaaaggttgattctcttttgggggttagattct 37168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 11348384 - 11348638
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  11348384 ttttagggttttagatactaagggttgagggtctttgggtgaggttcaaagtttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 11348483  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  11348484 ggtctggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 11348583  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348584 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 11348638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 29135934 - 29136187
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  29135934 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgagtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggactcttgggaaaa 29136033  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  29136034 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaa-acatgagtggagagttttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 29136132  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29136133 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttagttctcttttgggggttagattct 29136187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7482713 - 7482460
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggg-ctcttgggaaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7482713 ttttagggttttagatactaacggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgggaaa 7482614  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||    
T  7482613 agggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagaga 7482514  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7482513 agatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggggttagattct 7482460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42298457 - 42298203
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  42298457 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 42298358  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  42298357 gggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgcgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 42298258  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||  |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298257 gatcctaagtgaaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattct 42298203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 34603262 - 34603515
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  34603262 ttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttgggaaaa 34603361  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  34603362 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 34603461  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34603462 gatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattct 34603515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13547564 - 13547317
Alignment:
Q  8 gttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||    
T  13547564 gttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcgg 13547465  T
Q  108 tgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||    
T  13547464 tgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatactt 13547365  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547364 agtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 13547317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13549475 - 13549228
Alignment:
Q  8 gttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||    
T  13549475 gttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaagagggagctcttgtgaaaagggtcgg 13549376  T
Q  108 tgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||    
T  13549375 tgccttttgaggaaaattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgaatcttgtgaaaccaaaagagaagatactt 13549276  T
Q  208 tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549275 agtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 13549228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37033540 - 37033301
Alignment:
Q  16 tactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcctttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37033540 tactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcctttt 37033441  T
Q  116 ggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaat 215  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  37033440 gaggaagattcatgaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtgaaat 37033341  T
Q  216 caaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37033340 caaaggctatgggttggttctctttttggggttagattct 37033301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34602821 - 34602568
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||     
T  34602821 ttttagggttttagatattaaaggttgaaggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggagctcttggtaaaa 34602722  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  34602721 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtgaaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 34602622  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34602621 gatccttag-gaaatcaaaggctaagggttggttctcttttggaggttagattct 34602568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37879387 - 37879139
Alignment:
Q  7 ggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttg 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||    
T  37879387 ggttttagatactaaatgttgaggatctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaaaggttg 37879288  T
Q  107 gtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcct 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  37879287 gtgccttttggggaaaattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatcct 37879188  T
Q  207 ttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    | |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37879187 tagtgaaatcaaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattct 37879139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 47114858 - 47115111
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  47114858 ttttaaggctttagatattaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagctgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaca 47114957  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  47114958 gggttggtacctttt-gggaagattcatggggttgggaaacacatgaatggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 47115056  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47115057 gatccttaatgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 47115111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 193298 - 193551
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  193298 ttttagggttttagatattaaaggttgagggtctttcggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaa 193397  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  193398 aggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgtgtgaagagtcttttgtgagcaacttggatgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 193496  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193497 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 193551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 47255816 - 47255568
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  47255816 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttgggaaaa 47255717  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
        ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  47255716 ----tggtgccttttggggaagattcatggg-ttgggaaacacatgattggagagtcttttgtgagcaacttag-tgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 47255623  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47255622 gatccttagtgaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 47255568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 28242086 - 28242328
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28242086 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaaaatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaagggttggtgcc 28242185  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |      
T  28242186 tttt-gggaagattcataaggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaatatccttagtg 28242284  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28242285 aaatcaaaggctatgggttggttctcttttaggggttagattct 28242328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 19754177 - 19754434
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||     
T  19754177 ttttagggttctagatactaaaggttaagggtctttgggtgaggttcaaagcaccatgatttgaatcttggaaaaccaagagagggggctcttgtgaaaa 19754276  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19754277 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 19754376  T
Q  201 gatcctt---tgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
     ||||||    |  |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754377 aatccttataagtgaaatcaaaggataatggttggttctcttttgggggttagattct 19754434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 19752372 - 19752625
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||     
T  19752372 ttttagggttttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttctaagcgtcataatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttatgaaaa 19752471  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19752472 gg-ttggtgccttttggggaagattcattgagttgggaaacacatgagtggagagtattttgtgagcaacttagatgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 19752570  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19752571 gatccttagtgaaatcaaaggctaatgattggttctcttttgggggttagattct 19752625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Original strand, 41135516 - 41135759
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  | | |||||| | |||||||||    
T  41135516 tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaaccttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagaggaagattttgggaga-gggttggtg 41135614  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| |||    
T  41135615 ccttttagggagagattcatggggttgggaaacacatcaaaggagagtc-tttgtgagaaacttgggtgagtcttaggaaaccaaaagagaagatcattt 41135713  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41135714 g-gaaattaaaggctaaggattggttctcttttgggggttagattct 41135759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31926099 - 31925934
Alignment:
Q  90 tcttgggaaaggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaa 189  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  31926099 tcttgtgaaaagggttggtgccttttggggaagattcatgggtttgggaaacacgtgagtggagaatcttttgtgagcaacttgggtgagacttgtgaaa 31926000  T
Q  190 ccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925999 ccaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattct 31925934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 6808141 - 6808336
Alignment:
Q  9 ttttagatactaaaggttgaggg-tctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |  |  || |    
T  6808141 ttttagatactaaaggttgaggggtctttaggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagattgggctcttgg--agagattttg 6808238  T
Q  108 tgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatc 204  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  6808239 tgtcttttgggaagagattcatggggttggaaaacacatgaatgaagagtcatttgtgagcaactagggtgagtaatggaaaaccaaaagagaagatc 6808336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9109869 - 9109680
Alignment:
Q  15 atactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttt 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || ||||    
T  9109869 atactaaaggttgagggtatttgggtgaggttcaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggactcatgggaga-gggttgatgtcttt 9109771  T
Q  115 tgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatc 204  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | |||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||||    
T  9109770 tggggagagattcatgaggttgggagacacatcaaatgagagtcttttgtgagcaatttggatgagtcttgggaaatcaaaatagaagatc 9109680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 22079039 - 22079260
Alignment:
Q  19 taaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttggg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||  | ||||||||| | ||||||    
T  22079039 taaagtttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttaaagaaccaaaagagggggcaattgggtga-gggttggtgtcgtttggg 22079137  T
Q  119 gaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt-tgcaaaatca 217  Q
    ||           ||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| | ||||| ||| ||  ||||||    
T  22079138 ga-----------gttgggaaacacatcaagggagagtc-tttgtgagcaacttaggtgagtcttggcaaaccaaaatataagatgcttatg--aaatca 22079223  T
Q  218 aagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22079224 aaggctaaggatt-gttctcttttgggggttagattct 22079260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 31928282 - 31928210
Alignment:
Q  9 ttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 81  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31928282 ttttagatactaaaggttgagagtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttagaaaaccaaaa 31928210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16216966 - 16216771
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||    
T  16216966 tttagaaactaaaggttaagggtctttgggtgatattcaaaggttcaagatgtatatcttgaagaaccaaaagagggggctctt-cgaaaagggttggtg 16216868  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    | ||||||  | | |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| |||   |||| |||||||||||    
T  16216867 cattttggatagaaattcat-gtgttggcaaacacatgagaggagagtc-attgtgagcaacttgagtgaattttgaaaacttaaaagagaagatcctt 16216771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4535857 - 4535783
Alignment:
Q  101 gggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgg 174  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4535857 gggttggtgtcttttgggaatagattcatggggttgaaaaacacatgagtggatagtcgtttgtgagcaacttgg 4535783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12318890 - 12318720
Alignment:
Q  73 gaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttggggaaga-ttcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaact 171  Q
    ||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| || |||  |||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  12318890 gaaccaaatgagagggctcttgggagaggg-ttggtgccttttggggagaagttcataggattgagaaacacatcaaaggagagt-ttttatgagcaact 12318793  T
Q  172 tgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
    ||||||||| |||  | ||||||| |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12318792 tgggtgagtcttgggagaccaaaatagaaaatcttttggaaa-tcaaaggctaagggttggttctctttggggg 12318720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Original strand, 3331255 - 3331331
Alignment:
Q  26 tgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggg 102  Q
    ||||||||||| | |||| || |||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3331255 tgagggtctttaggtgagatttaaatgatcaagatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaggg 3331331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28318225 - 28318110
Alignment:
Q  18 ctaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaa-gcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaag-ggggctcttgggaaaggggttggtgcctttt 115  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  28318225 ctaaaagttgaggatctttggatgagtttcaaaggggtcaagatgtgaattttggataaccaaaagagaggggttcttgggaaa-gggttagtgcatttt 28318127  T
Q  116 gggga-agattcatggg 131  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28318126 ggggagagattcatggg 28318110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 6068321 - 6068447
Alignment:
Q  18 ctaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   | |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  6068321 ctaaaagttgagggtctttggatgagattcaaatgatgaagacgtgaatctaagggaaccaaaagagggggctcttaggaaa-aggttggtgtcttttgg 6068419  T
Q  118 gga-agattcatggggttggaaaacaca 144  Q
    | | ||||||||  |||||| |||||||    
T  6068420 gaagagattcataaggttgggaaacaca 6068447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38747144 - 38747052
Alignment:
Q  54 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatga 147  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38747144 tcaagatatgaatcttagacaaccaaaac-gggggctcttgaaaaaggg-ttggtgccttttggagagaggttcatagggttggaaaacacatga 38747052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 11383672 - 11383926
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     
T  11383672 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctattgtgaaaa 11383771  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  11383772 gggttggtgccttttgaggaagattcatggggttgggaaatacataagtggaaagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 11383871  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11383872 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 11383926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 42435473 - 42435219
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42435473 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgggaaaa 42435374  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  42435373 aggttggtgacttttggggaagattcatggggttgggaaacatatgaatggagagtcttttgtgagcaacttgagtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 42435274  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42435273 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgagggttagattct 42435219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 40221431 - 40221685
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221431 ttttagggtttttgatactaaaggtggaaggtctttggatgaggtttagaacttcaagatgtgaatcttcgagaaccaaaatagggggctcttgggaaag 40221530  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40221531 gggttagtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttaggtgagtcttgtaaaaccaaaagagaa 40221630  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221631 gatccttagtgaaatcaaaggctaaaggttggttctcttttgggggttagattct 40221685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Original strand, 40328476 - 40328719
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40328476 tagatactaaagatttagggtctttgggtgaggttcaaagcttcatgatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggaaaagggttggtgcc 40328575  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |      
T  40328576 ttttagggaagattcatggggatgggaaacacatgagtgtagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatctttagtg 40328675  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328676 aaatcaaaggctatgagttggttctcttttgggggttagattct 40328719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 44353481 - 44353732
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||      
T  44353481 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggtttaaaacttcaaga---gaatcttggagaactaaaagagggggctcttgtgaaga 44353577  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||    
T  44353578 gggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatcggtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagaaaa 44353677  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353678 gattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 44353732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 171
Target Start/End: Original strand, 22976227 - 22976389
Alignment:
Q  8 gttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  22976227 gttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggaggctcttggaaaaagggttgg 22976326  T
Q  108 tgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaact 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22976327 tgccttttggggaagattcatggggtt-gaaaacacatgagtgaagagtctattgtgagcaact 22976389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 4283232 - 4283464
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||               
T  4283232 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcttggagaaccaaaagagggggc----------- 4283320  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
               ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4283321 -----------ttttgggaaagattcatggggttgggaaacacatgagtggaaagtcttttgtgagaaacttggttgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 4283409  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283410 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 4283464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Original strand, 40585420 - 40585656
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |  |||||| ||    
T  40585420 tttagatactaaaggttaagagtctttggttgaggttcaaagcttcaagatgtgaatatttgagaatcaaaagagtgggctcttttggagagggttgatg 40585519  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatccttt 208  Q
     ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||     
T  40585520 tcttttggtgagagattcatggggtttgaaaacacatcaaaggagagtc-tttgtgagcaatttgggtgagtattggtagaccaaaagagaagatcctta 40585618  T
Q  209 gcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggt 247  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40585619 g-gaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggt 40585656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2999993 - 2999821
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||    
T  2999993 tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgatgttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggttcttgggata-tggttggtg 2999895  T
Q  110 ccttttgggg-aagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttt 182  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  2999894 tcttttggggaaagattcatggggatgagaaacacatgagtagagagtcaattgtgagcaacttgggcgagttt 2999821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 40535548 - 40535713
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  40535548 tttagatactaaagattgatggtctttgg--gtggttcaaagtttcaagttgtggatcttttagaaccaaaagagggggttcttgagaaa-gggttgatg 40535644  T
Q  110 ccttttggggaaga-ttcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtga 178  Q
    ||||||||  || | |||||| | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  40535645 ccttttggataaaagttcatgtgattggaaaacacatgagagaagagtc-attgtgagcaacttaggtga 40535713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3846283 - 3846126
Alignment:
Q  17 actaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttg 116  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||| ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||| |  | |||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  3846283 actaaaggttgagggttcttgagtgagattcaaaggttcataatgtgaatcttgaagaaccaaaaga-agagctctt-ggaaaagagttggtgtcttttg 3846186  T
Q  117 ggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggt 176  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||    
T  3846185 gggagagattcatggggttgggaaacacatgagagaagattc-tttgtgagcaaattgggt 3846126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9634007 - 9633842
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgc 110  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||| | || ||||| | || |||||||  |||||  ||||| |    
T  9634007 ttagaaactaaaggtcgaacgtctttgggtgagattcaaagtgtccaaatgtgaatcttgaataatcaaaagatggcgctcttgaaaaagg--ttggtac 9633910  T
Q  111 cttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtga 178  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9633909 cttttgggagagattaatggggttggtaaacacataagatgagagtcatttgtgagcaacttgggtga 9633842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Original strand, 11136843 - 11136989
Alignment:
Q  17 actaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttg 116  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||   || | || ||||| ||||||||| |||| || |||||||||| |||  ||| | |||||||||    
T  11136843 actaaaggttgggggtctttgggtgagattcaaattgtccaaatatgaattttggagaactaaaagagagggctcttgg-aaattggtcgatgccttttg 11136941  T
Q  117 ggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgt 163  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11136942 gggagaggttcattgggtaggaaaacacatgagtggagagtcatttgt 11136989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20686528 - 20686459
Alignment:
Q  11 ttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaa 81  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20686528 ttagatactaaatgttgaggatctttgg-tgaagttcaaagcttcaagatgtgaatcttggataaccaaaa 20686459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Original strand, 18655246 - 18655340
Alignment:
Q  160 ttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  18655246 ttgtgagcaacttcggtgagtcttgtgaaatcaaaagagaagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttgatactctttt-ggggttagattct 18655340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 102
Target Start/End: Original strand, 10020150 - 10020227
Alignment:
Q  25 ttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggg 102  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10020150 ttgagggtctttaggtgagattcaaatgatcaatatgtgaatcttagagaaccaaaagagggggctcttgggaaaggg 10020227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3817729 - 3817641
Alignment:
Q  86 gggctcttgggaaaggggttggtgccttttggggaa-gattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttggg 175  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||| || ||||||||||| |||||    
T  3817729 gggctcttggaaaaggg-ttggtgccttttggagaaagattcatggggttggaaaatacataagagaagattc-tttgtgagcaaattggg 3817641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10101588 - 10101540
Alignment:
Q  54 tcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggg 102  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10101588 tcaaaatgtgaaccttggagaaccaaaagaggaggctcttgggaaaggg 10101540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 129
Target Start/End: Original strand, 28461305 - 28461375
Alignment:
Q  59 atgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga-agattcatg 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28461305 atgtgaatcttggagaaccaaaagaggaagctcttaggaaa-tggttggttccttttggggatagattcatg 28461375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3809191 - 3808937
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggg-ctcttgggaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  3809191 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggctcttgtgaaa 3809092  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3809091 agggttggttccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttgtgagcaacttgggtgagtcttgtaaaaccaaaagaga 3808992  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3808991 aaatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttct-ttttgggggttagattct 3808937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 603550 - 603308
Alignment:
Q  13 agatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcct 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  603550 agatagtaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgaggaaagggttggtgcct 603451  T
Q  113 tttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaa 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  |    
T  603450 tttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagtgtcctttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtga 603351  T
Q  213 aatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  603350 aatcaaaggctaatggttggttctcttttgggggttagattct 603308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 5043314 - 5043567
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  5043314 ttttagggttttagatactaaagattgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgagaatcttggagaaccaaaagagagggctcttgggaaaa 5043413  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  5043414 gggttggtgccttttggg-aagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaatttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 5043512  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5043513 gatccttagtggaatcaaaggctaagagttggttctcttttgggggttagattct 5043567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 21593352 - 21593604
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  21593352 ttttagggttttagatactaaatgttgagggtctttgggtgaggttcaaagatttaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttggggaaa 21593451  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  21593452 gggttggtgccttttggagaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcatttttgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 21593551  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593552 gatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggggttagattct 21593604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 17762673 - 17762929
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  17762673 ttttagggttttagatactaaaggttgaggatctttgggtgaagttcaaggcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaa 17762772  T
Q  101 gggttggtgccttttgggga--agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaag 198  Q
    || ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||    
T  17762773 ggtttggtgccttttgggggttagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgggagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagag 17762872  T
Q  199 aagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17762873 aagatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 17762929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2973410 - 2973167
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||     
T  2973410 tagatactaaaggttgaaggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttgtgaaaagggttggtgct 2973311  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgca 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |      
T  2973310 tttttgggaagattcatggggttgggaaacacatgaatgcagagtcatttgtgaacaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaagatccttagtg 2973211  T
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2973210 aaatcaaaggctaagggttggttctcttttagggattagattct 2973167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26830606 - 26830352
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||     
T  26830606 ttttagggttttagataataaaggctgagggtctttgagtaaggtttaaaacttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggagtctcttgggaaaa 26830507  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  26830506 aggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacagatgagcgcagagtcatttgtgagcaacttgggcgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 26830407  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830406 gattcttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctcttttgggggttagattct 26830352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22425308 - 22425065
Alignment:
Q  2 tttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaaggggg--ctcttgggaaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  22425308 tttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgtggttcagagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagaggggggcctcttgggata 22425209  T
Q  100 ggggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaaga 199  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  22425208 agggttggtgcattttggggaagattcatggggttgtgaaacacatgggtgaagagtcatttaagagcaacttcggttagtcttgtgaaaccaaaagaga 22425109  T
Q  200 agatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
    | |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22425108 atatccttag-gaaatcaaag-ctaagggttggttctcttttgggg 22425065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 26800468 - 26800634
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26800468 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtggatcatggataaccaaaagagggggctcttgggaaaaaggttggtgcc 26800567  T
Q  112 ttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgag 179  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26800568 ttttggggaagattcat-gggatgggaaacacatgagtggagagtctattgagagcaacttgggtgag 26800634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Original strand, 17757789 - 17757973
Alignment:
Q  22 aggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgccttttgggga- 120  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||      
T  17757789 aggttgatggtctttgggtgagattcaaagcttgaagatgtgaatgttggagaaccaaaatagggggctcttgtgaaaagggttggtgcattttgggggt 17757888  T
Q  121 -agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatc 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  17757889 tagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgtgaaacaaaaagagaagatc 17757973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 25072881 - 25073076
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| |||||| || |||    
T  25072881 tttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatctttgagaacc-caaaggggggctcttggaaaagggatt-gtg 25072978  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttt-tgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
    ||| ||||| | |||||||| ||||| | |||||||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| |  || |||  ||||||||| |||||||||||    
T  25072979 cctcttgggaagagattcatagggtttggaaacacatcaaaggagagtctttatgtga--aacttggataggtcttgggaaaccaaaagagaagatcctt 25073076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5741120 - 5741019
Alignment:
Q  153 gagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagat 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||| ||||  |||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  5741120 gagtcttttgtgagcaatttgggtgaatcttgagaaacaaaaagtgaagatccttagtaaa-tcaaaggctaagggttggttacttttggggggttagat 5741022  T
Q  253 tct 255  Q
    |||    
T  5741021 tct 5741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 255
Target Start/End: Original strand, 25073464 - 25073507
Alignment:
Q  212 aaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25073464 aaattaaaggctaagggttgattctcttttgggggttagattct 25073507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 11244 - 11498
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||     
T  11244 ttttagggttttagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaagatggggctcttggggaaa 11343  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  11344 gggttggtgccttttggagaagattcatggggttgggaaacacatgagtggagagtcatttctgagcaacttgggtgagtcttgtgaaaccaaaagagaa 11443  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    |||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11444 gatcattagtaaaatcaaaggctaaaggttgtttctctttttggggttagattct 11498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 80765 - 80511
Alignment:
Q  1 ttttaaggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||     
T  80765 ttttagggttttagatactagaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatttgaatcttggagaaccaaaagagggggctcttatgaaaa 80666  T
Q  101 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || |    
T  80665 gggttggtgccttttggggaagattcatggggttgggaaacacatgagcggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagtcttgggaaactaaaagagta 80566  T
Q  201 gatcctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggggttagattct 255  Q
    ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  80565 gatccttagtgaaatcaaaggctaagggttggttctattttgggggttagattct 80511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18478 - 18239
Alignment:
Q  6 aggttttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggtt 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  18478 aggttttagatactaaaggttgcgggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaacaaaaagagggggctcttgtgaaaagggtt 18379  T
Q  106 ggtgcctttt-ggggaagattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18378 ggtgccttttgggggaagattcatgaggtt-gaaaacacatgagtggagagttatttgtgagcaacttgagtgagtcttgtaaaaccaaaagagaagatc 18280  T
Q  205 ctttgcaaaatcaaagactaagggttggttctcttttgggg 245  Q
    ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18279 cttagtgaaatcaaagactaagagttggttctcttttgggg 18239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 490915 - 490748
Alignment:
Q  12 tagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  490915 tagatactaaaggttgagggtctttgggtgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctctttggaga-gggttggtgcc 490817  T
Q  112 ttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagt 180  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  490816 tttaggtgagagattcatgggattgggaaacacatcaaaggagagt-ttttatgagcaacttgggcgagt 490748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1878 - 1682
Alignment:
Q  10 tttagatactaaaggttgagggtctttggatgaggttcaaagcttcaagatgtgaatcttggagaaccaaaaaagggggctcttgggaaaggggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||||    
T  1878 tttagatactaaaggttgaaggtctttgggtgagctccaaagcttcaagatgtgaatcttgaagaaccaaaagaggggactcttgggcga-ggcttggtg 1780  T
Q  110 ccttttgggga-agattcatggggttggaaaacacatgagtggagagtcttttgtgagcaacttgggtgagttttgtaaaaccaaaaaagaagatcctt 207  Q
     |||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||| |   |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  | | ||||| |||||||||||    
T  1779 tcttttgtggagagattcatgtagttgagaaacacatcatatgagagtc-attgtgagcaacttgggcgagtcttgggagatcaaaagagaagatcctt 1682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University