View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10140A_low_441 (Length: 223)

Name: NF10140A_low_441
Description: NF10140A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10140A_low_441
NF10140A_low_441
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (20-210)||(5216-5406)
scaffold0079 (107-194)||(5377-5464)
scaffold0079 (131-210)||(5364-5443)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (20-210)||(21676050-21676240)
chr7 (20-194)||(28719355-28719529)
chr7 (67-194)||(45148443-45148570)
chr7 (20-194)||(4483628-4483802)
chr7 (23-210)||(16382432-16382619)
chr7 (20-210)||(39292876-39293065)
chr7 (28-170)||(8564726-8564868)
chr7 (66-194)||(46472865-46472992)
chr7 (23-210)||(44306318-44306506)
chr7 (61-210)||(16369574-16369723)
chr7 (110-194)||(16369660-16369744)
chr7 (54-124)||(21539365-21539435)
chr7 (111-194)||(16382411-16382494)
chr7 (111-194)||(44306444-44306527)
chr7 (148-210)||(28719376-28719438)
chr7 (23-128)||(13617699-13617804)
chr7 (111-194)||(39293003-39293086)
chr7 (131-193)||(21676235-21676297)
chr7 (111-210)||(21676178-21676277)
chr7 (111-192)||(28719320-28719401)
chr7 (148-194)||(8564809-8564855)
chr7 (148-210)||(45148464-45148526)
chr7 (135-193)||(9641790-9641850)
chr7 (32-96)||(15979209-15979273)
chr7 (110-158)||(16369697-16369745)
chr7 (91-124)||(15979303-15979336)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (20-208)||(14342859-14343046)
chr5 (20-194)||(20455189-20455363)
chr5 (22-194)||(21108409-21108581)
chr5 (20-194)||(11964850-11965024)
chr5 (20-128)||(20833202-20833309)
chr5 (148-210)||(20455280-20455342)
chr5 (20-106)||(24226678-24226764)
chr5 (23-128)||(23414099-23414204)
chr5 (28-109)||(33627605-33627686)
chr5 (146-210)||(21108430-21108494)
chr5 (138-199)||(11764773-11764833)
chr5 (148-209)||(11964872-11964933)
chr5 (131-166)||(11764802-11764837)
chr5 (148-210)||(14342950-14343012)
chr5 (111-192)||(20455317-20455397)
chr5 (139-173)||(14343051-14343085)
chr5 (111-192)||(11964816-11964896)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (20-210)||(25756873-25757063)
chr8 (20-190)||(25294873-25295043)
chr8 (49-194)||(11543414-11543559)
chr8 (20-194)||(45560310-45560484)
chr8 (49-194)||(22312569-22312714)
chr8 (29-210)||(25608941-25609111)
chr8 (32-193)||(3845250-3845409)
chr8 (23-210)||(20177079-20177267)
chr8 (23-210)||(20221806-20221994)
chr8 (131-210)||(19332802-19332881)
chr8 (111-210)||(19332819-19332918)
chr8 (131-194)||(19332876-19332939)
chr8 (111-194)||(20177205-20177288)
chr8 (111-194)||(20221932-20222015)
chr8 (131-194)||(24238445-24238508)
chr8 (131-194)||(25608920-25608983)
chr8 (111-193)||(16000904-16000986)
chr8 (141-194)||(16000940-16000993)
chr8 (111-190)||(25756856-25756935)
chr8 (148-210)||(11543435-11543497)
chr8 (152-210)||(24238466-24238524)
chr8 (148-210)||(25294890-25294952)
chr8 (20-120)||(7469137-7469238)
chr8 (148-210)||(22312590-22312652)
chr8 (148-210)||(45560401-45560463)
chr8 (111-192)||(11543379-11543460)
chr8 (67-104)||(19332756-19332793)
chr8 (153-210)||(19332787-19332844)
chr8 (111-194)||(22312532-22312615)
chr8 (66-117)||(22498526-22498577)
chr8 (144-194)||(17265756-17265806)
chr8 (69-126)||(18042772-18042830)
chr8 (107-155)||(11543379-11543427)
[»] scaffold0317 (3 HSPs)
scaffold0317 (20-208)||(14943-15131)
scaffold0317 (111-194)||(15071-15154)
scaffold0317 (148-210)||(15034-15096)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (28-210)||(1323-1505)
scaffold1204 (131-194)||(1463-1526)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (20-194)||(11401475-11401649)
chr3 (28-210)||(17759543-17759729)
chr3 (28-210)||(19060863-19061049)
chr3 (20-173)||(8603542-8603695)
chr3 (20-191)||(5229206-5229376)
chr3 (20-194)||(38376904-38377078)
chr3 (27-120)||(25105174-25105267)
chr3 (131-191)||(17759687-17759747)
chr3 (131-191)||(19061007-19061067)
chr3 (136-210)||(38376983-38377057)
chr3 (138-199)||(11516772-11516833)
chr3 (136-199)||(17392274-17392337)
chr3 (148-194)||(5229297-5229343)
chr3 (148-210)||(11401496-11401558)
chr3 (20-120)||(43428742-43428843)
chr3 (75-191)||(11516746-11516864)
chr3 (145-194)||(14181293-14181342)
chr3 (20-120)||(18968979-18969080)
chr3 (141-194)||(40040403-40040456)
chr3 (135-193)||(17392241-17392301)
chr3 (138-194)||(37917651-37917707)
chr3 (115-192)||(38377036-38377113)
chr3 (145-193)||(31413599-31413647)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (20-210)||(22331603-22331792)
chr2 (20-194)||(18534727-18534901)
chr2 (20-194)||(24561963-24562137)
chr2 (33-210)||(6093725-6093894)
chr2 (20-106)||(43641704-43641790)
chr2 (23-194)||(20272259-20272430)
chr2 (122-192)||(6093706-6093776)
chr2 (20-208)||(24840690-24840873)
chr2 (106-194)||(22331582-22331670)
chr2 (138-194)||(29113144-29113200)
chr2 (89-152)||(45618691-45618754)
chr2 (20-106)||(19434670-19434756)
chr2 (148-210)||(24562054-24562116)
chr2 (148-210)||(18534748-18534810)
chr2 (111-192)||(24562091-24562172)
chr2 (20-89)||(45618405-45618474)
chr2 (156-210)||(24840725-24840779)
chr2 (148-189)||(45618713-45618754)
chr2 (77-157)||(29113144-29113224)
chr2 (91-123)||(45619298-45619330)
[»] scaffold0090 (7 HSPs)
scaffold0090 (20-191)||(5736-5907)
scaffold0090 (20-175)||(1356-1511)
scaffold0090 (148-210)||(1447-1509)
scaffold0090 (148-210)||(5827-5889)
scaffold0090 (112-183)||(35993-36063)
scaffold0090 (138-194)||(35982-36038)
scaffold0090 (131-190)||(36048-36102)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (71-210)||(11374005-11374144)
chr6 (67-194)||(29161586-29161713)
chr6 (20-194)||(23220601-23220774)
chr6 (53-194)||(16135183-16135324)
chr6 (84-173)||(25650019-25650108)
chr6 (20-154)||(17084450-17084584)
chr6 (106-194)||(22594749-22594837)
chr6 (111-208)||(29161667-29161764)
chr6 (132-194)||(21930797-21930859)
chr6 (144-210)||(22594750-22594816)
chr6 (131-194)||(29161761-29161824)
chr6 (111-194)||(11374082-11374165)
chr6 (131-210)||(29161724-29161803)
chr6 (148-210)||(16135204-16135266)
chr6 (148-210)||(23220622-23220684)
chr6 (133-190)||(4172874-4172931)
chr6 (133-190)||(4228483-4228540)
chr6 (111-192)||(23220566-23220647)
chr6 (148-210)||(29161630-29161692)
chr6 (111-192)||(21930762-21930843)
chr6 (159-194)||(18104732-18104767)
chr6 (20-79)||(31162105-31162164)
chr6 (107-153)||(4172885-4172931)
chr6 (107-153)||(4228494-4228540)
chr6 (148-210)||(25650019-25650081)
chr6 (169-210)||(21930818-21930859)
chr6 (20-120)||(22463317-22463418)
chr6 (135-193)||(22594642-22594702)
chr6 (109-157)||(26505689-26505737)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (29-210)||(9695-9877)
scaffold0183 (114-194)||(9674-9754)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (20-194)||(5371791-5371964)
chr4 (20-208)||(12134844-12135029)
chr4 (20-194)||(19558232-19558406)
chr4 (20-194)||(54364664-54364838)
chr4 (28-194)||(17376660-17376823)
chr4 (53-194)||(14570156-14570297)
chr4 (136-210)||(54364743-54364817)
chr4 (138-210)||(14570177-14570249)
chr4 (148-210)||(5371881-5371943)
chr4 (20-104)||(12733052-12733136)
chr4 (141-194)||(12134999-12135052)
chr4 (23-128)||(49070703-49070808)
chr4 (34-155)||(19082289-19082410)
chr4 (20-120)||(38763665-38763766)
chr4 (111-192)||(5371918-5371998)
chr4 (135-193)||(13595395-13595455)
chr4 (111-192)||(14570122-14570202)
chr4 (136-192)||(19082354-19082410)
chr4 (20-79)||(17213063-17213122)
chr4 (20-104)||(16226366-16226449)
chr4 (20-128)||(24237765-24237873)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (24-194)||(33396200-33396371)
chr1 (69-194)||(77184-77309)
chr1 (20-210)||(20821876-20822062)
chr1 (111-194)||(20821855-20821938)
chr1 (148-210)||(77226-77288)
chr1 (111-192)||(20821820-20821901)
chr1 (20-120)||(46144659-46144760)
chr1 (49-155)||(21224122-21224229)
chr1 (20-120)||(40437479-40437579)
chr1 (22-97)||(49998526-49998602)
[»] scaffold0231 (3 HSPs)
scaffold0231 (36-209)||(14075-14248)
scaffold0231 (136-210)||(14138-14212)
scaffold0231 (131-194)||(14207-14270)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (49-210)||(21208-21369)
scaffold0174 (111-209)||(21307-21405)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (20-187)||(11488-11656)
scaffold0017 (148-194)||(11518-11564)
[»] scaffold0009 (6 HSPs)
scaffold0009 (131-208)||(255643-255720)
scaffold0009 (113-210)||(255551-255648)
scaffold0009 (131-210)||(255606-255685)
scaffold0009 (131-193)||(98348-98412)
scaffold0009 (111-171)||(255660-255720)
scaffold0009 (144-194)||(98324-98374)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (53-194)||(247079-247220)
scaffold0005 (138-210)||(247127-247199)
scaffold0005 (111-192)||(247174-247254)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (49-119)||(12214-12284)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (20-110)||(4839-4929)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (112-194)||(8429-8511)
scaffold0013 (149-205)||(8429-8485)
scaffold0013 (20-110)||(8322-8412)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (141-194)||(75912-75965)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (20-103)||(2197-2280)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-128)||(44793-44900)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (20-96)||(34645-34720)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (20-115)||(755-850)


Alignment Details
Target: scaffold0079 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 5216 - 5406
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5216 atcataatgtgttgtattttctccattaattgaattgtgagaaatggtatgaagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgtatatatgt 5315  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5316 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgtggattgattgtgatattgttgttgaatgcatatatgttgattggttgtgatatt 5406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Original strand, 5377 - 5464
Alignment:
Q  107 aatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5377 aatgcatatatgttgattggttgtgatattgttggtgaataaatatatgtcaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 5464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 5364 - 5443
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||    
T  5364 gatattgttgttgaatgcatatatgttgattggttgtgatattgttggtgaataaatatatgtcaattgattgtgatatt 5443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 21676050 - 21676240
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21676050 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 21676149  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21676150 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgcaatattgttggtgaatgcatatatgtttgttggttgtgatatt 21676240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28719529 - 28719355
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28719529 atcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattttgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatagagttgatgttgattaatgcatatatgt 28719430  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28719429 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 28719355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45148570 - 45148443
Alignment:
Q  67 tatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattg 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  45148570 tatggagttgttgaactataagatataattgatgttgaatattgcatatatgttaattgatgaggatattgctggtgaatacatatatgttgattggttg 45148471  T
Q  167 tgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45148470 tgatattgttggtgaatacatatatgtt 45148443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4483802 - 4483628
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||  |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4483802 atcataatatgttgtattttcccctttatttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 4483703  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4483702 tgattgattgtgatattgttgttgaatacatatatgttaatggattgtaatattgtcggtgaatgcatatatgtt 4483628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16382619 - 16382432
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  16382619 ataaggtgttgtattttctcctttacttggattatgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattacatatatgttga 16382520  T
Q  123 ttgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |  ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  16382519 tatattgtgatattgttggtgaatacatatatgtttattgattgtgatattgttggtggatacatatatgttaattgagtgtgatatt 16382432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 39292876 - 39293065
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||     
T  39292876 atcataatgtgttgtattctctcctttacgtgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaaccatatgatctagtt-atgttgattaatgcatgtatgc 39292974  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  39292975 taattgatggtgatattgttggtaaatacatatatgttgattgattgtgatatttttgatgaataaatatatgttgattgattgtgatatt 39293065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 8564726 - 8564868
Alignment:
Q  28 gtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgat 127  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8564726 gtgttgtatgttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttaattgat 8564825  T
Q  128 gaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat 170  Q
       |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  8564826 tgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat 8564868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46472992 - 46472865
Alignment:
Q  66 gtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgatt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  46472992 gtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatattttaattgatggtgatattgtt-gaaaatacatatatgttgattgatt 46472894  T
Q  166 gtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
     ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  46472893 atgatattattggtgaatagatatatgtt 46472865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 44306318 - 44306506
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaa-ttgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtta 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||  ||| |||||||   ||| ||||||||||     
T  44306318 ataaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgatgaagtcgatgttggtgaatacatatatgttg 44306417  T
Q  122 attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||| ||    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  44306418 attaattgttatattattggtggatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttgattgattgtgatatt 44306506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 16369574 - 16369723
Alignment:
Q  61 aaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgat 160  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  16369574 aaatggtaggaagttgttgaattatatgacttagttgatgttggtgaacgcatatatattaattgatggttatattgttggtgaaggcatatatgttaat 16369673  T
Q  161 tgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  16369674 tgatggtgatattgttggtgaacgcatatatgttaattgatggtgatatt 16369723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 16369660 - 16369744
Alignment:
Q  110 gcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16369660 gcatatatgttaattgatggtgatattgttggtgaacgcatatatgttaattgatggtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 16369744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 21539365 - 21539435
Alignment:
Q  54 ttgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaatt 124  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21539365 ttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatacatgttaatt 21539435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16382494 - 16382411
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16382494 catatatgtttattgattgtgatattgttggtggatacatatatgttaattgagtgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 16382411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 44306444 - 44306527
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  44306444 catatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttgattgattgtgatattattgatgaatacatatatgtt 44306527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28719438 - 28719376
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  28719438 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 28719376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13617804 - 13617699
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  13617804 ataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatatatatcaa 13617705  T
Q  123 ttgatg 128  Q
    ||||||    
T  13617704 ttgatg 13617699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 39293003 - 39293086
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39293003 catatatgttgattgattgtgatatttttgatgaataaatatatgttgattgattgtgatattattggtgaatacatatatgtt 39293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 21676235 - 21676297
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21676235 gatattgttggtggatacatatatgtcaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgt 21676297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 21676178 - 21676277
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||    
T  21676178 catatatgttgattgattgcaatattgttggtgaatgcatatatgtttgttggttgtgatattgttggtggatacatatatgtcaattgattgtgatatt 21676277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28719401 - 28719320
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28719401 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattgcatatatg 28719320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Original strand, 8564809 - 8564855
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8564809 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 8564855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45148526 - 45148464
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  45148526 catatatgttaattgatgaggatattgctggtgaatacatatatgttgattggttgtgatatt 45148464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9641850 - 9641790
Alignment:
Q  135 ttgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat--attgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  9641850 ttgttggtgaatatatatatgttgaatgattgtggtgaattgttggtgagtgcatatatgt 9641790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 15979209 - 15979273
Alignment:
Q  32 tgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagtt 96  Q
    |||||||| | | ||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15979209 tgtattttctactttacttggattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 15979273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Original strand, 16369697 - 16369745
Alignment:
Q  110 gcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttg 158  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16369697 gcatatatgttaattgatggtgatattgtcggtgaatgcatatatgttg 16369745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 124
Target Start/End: Original strand, 15979303 - 15979336
Alignment:
Q  91 atagttgatgttgaataatgcatatatgttaatt 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15979303 atagttgatgttgagtaatgcatatatgttaatt 15979336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 14342859 - 14343046
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14342859 atcataatgtgttgtattttctccattaattgaattgtgagaaatggtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 14342958  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||    
T  14342959 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaacgcgtatacgttgatt-gttgtgata 14343046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 20455189 - 20455363
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20455189 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgaatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 20455288  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455289 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 20455363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21108581 - 21108409
Alignment:
Q  22 cataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtta 121  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  21108581 cataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattacatatatgttg 21108482  T
Q  122 attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21108481 attgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgagtgtgatattgtcggtgaatacatatatgtt 21108409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11965024 - 11964850
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11965024 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactaaataatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 11964925  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | |||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11964924 tgattgagtgtgatattgtcggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatcgtcggtgaatgcatatatgtt 11964850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 20833202 - 20833309
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||| || |||||||| ||  ||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20833202 atcataagatgatgtattttctct-ttacttgtattgtgagaaataatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 20833300  T
Q  120 taattgatg 128  Q
    ||| |||||    
T  20833301 taagtgatg 20833309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 20455280 - 20455342
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20455280 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 20455342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 24226678 - 24226764
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaat 106  Q
    ||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24226678 atcataatgtgttttactttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttgatgttgaat 24226764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23414204 - 23414099
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  23414204 ataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatatatatcaa 23414105  T
Q  123 ttgatg 128  Q
    ||||||    
T  23414104 ttgatg 23414099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Original strand, 33627605 - 33627686
Alignment:
Q  28 gtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataat 109  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33627605 gtgttgtattttctcctttacttgtattatgaaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagttgattaat 33627686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21108494 - 21108430
Alignment:
Q  146 tacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  21108494 tacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgagtgtgatatt 21108430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Original strand, 11764773 - 11764833
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattg 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11764773 ttggtgaatacatatatattgat-gattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgattg 11764833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11964933 - 11964872
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatat 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  11964933 catatatgttgattgagtgtgatattgtcggtgaatacatatatgttaattgattgtgatat 11964872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 166
Target Start/End: Original strand, 11764802 - 11764837
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11764802 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattg 11764837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 14342950 - 14343012
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14342950 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 14343012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 20455317 - 20455397
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| | ||||||||    
T  20455317 catatatgttaattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat-gtgttggtgatttcatatatg 20455397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 14343051 - 14343085
Alignment:
Q  139 tggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 173  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14343051 tggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 14343085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11964896 - 11964816
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   ||||| || ||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  11964896 catatatgttaattgattgtgatatcgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat-gtgttggtgattgcatatatg 11964816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25757063 - 25756873
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25757063 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 25756964  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  25756963 taattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatttttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 25756873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25295043 - 25294873
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25295043 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 25294944  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatata 190  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25294943 taattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatttttggtgaattcatata 25294873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11543559 - 11543414
Alignment:
Q  49 ttgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatac 148  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||    
T  11543559 ttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttggttgattgttatattgttggtgaatac 11543460  T
Q  149 atatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11543459 atatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 11543414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 45560310 - 45560484
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45560310 atcataaagtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 45560409  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |  |||||   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45560410 tgtttgattgtgatattgtttgtgaatacatatattttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatttgtt 45560484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22312714 - 22312569
Alignment:
Q  49 ttgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatac 148  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||    
T  22312714 ttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttggttgattgtgatattgttggtgaatac 22312615  T
Q  149 atatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22312614 atatatgtcaattgattgtaatattgtcggtgaatgcatatatgtt 22312569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25609111 - 25608941
Alignment:
Q  29 tgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatg 128  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||       
T  25609111 tgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgtggattaatacatatatgttgattg--- 25609015  T
Q  129 aggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  25609014 --------gttggtgaatacatatatgttgattggttgtgatattgttggtgaatacatatgtgttgattggttgtgatatt 25608941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 3845250 - 3845409
Alignment:
Q  32 tgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgagg 131  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||  |    
T  3845250 tgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgataatgattagtgcatatatgttaagtgatggtg 3845349  T
Q  132 atattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3845350 atattg--ggtgaatgcatatatgtcaattgatgttgatattgttggtgaatgcatatatgt 3845409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 20177079 - 20177267
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaa-ttgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtta 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||  ||| |||||||   ||| ||||||||||     
T  20177079 ataaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgatgaagtcgatgttggtgaatacatatatgttg 20177178  T
Q  122 attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||| ||    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20177179 attaattgttatattattggtggatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttgattgattgtgatatt 20177267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 20221806 - 20221994
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaa-ttgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtta 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||  ||| |||||||   ||| ||||||||||     
T  20221806 ataaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgatgaagtcgatgttggtgaatacatatatgttg 20221905  T
Q  122 attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||| ||    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20221906 attaattgttatattattggtggatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttgattgattgtgatatt 20221994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 19332802 - 19332881
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19332802 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgagatattgttggtaaatacatatatgttgattggttgtgatatt 19332881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Original strand, 19332819 - 19332918
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  19332819 catatatgttgattgattgagatattgttggtaaatacatatatgttgattggttgtgatattgtgggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 19332918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 19332876 - 19332939
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19332876 gatattgtgggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 19332939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 20177205 - 20177288
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  20177205 catatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttgattgattgtgatattattgatgaatacatatatgtt 20177288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 20221932 - 20222015
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  20221932 catatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttgattgattgtgatattattgatgaatacatatatgtt 20222015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24238508 - 24238445
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24238508 gatattgttggtgaatacatataagttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 24238445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25608983 - 25608920
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25608983 gatattgttggtgaatacatatgtgttgattggttgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 25608920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16000986 - 16000904
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  16000986 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgagtgattgagatgttgttggtgattgcatatatgt 16000904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16000993 - 16000940
Alignment:
Q  141 gtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16000993 gtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgtt 16000940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25756935 - 25756856
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatata 190  Q
    |||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25756935 catatatgttgattgattgtgatatttttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgccggtgaatgcatata 25756856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11543497 - 11543435
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11543497 catatatgttggttgattgttatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 11543435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24238524 - 24238466
Alignment:
Q  152 tatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  24238524 tatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatataagttaattgattgtgatatt 24238466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25294952 - 25294890
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  25294952 catatatgttaattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 25294890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7469238 - 7469137
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||    
T  7469238 atcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagctgattaatgaatacatg 7469139  T
Q  119 tt 120  Q
    ||    
T  7469138 tt 7469137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22312652 - 22312590
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |||||    
T  22312652 catatatgttggttgattgtgatattgttggtgaatacatatatgtcaattgattgtaatatt 22312590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 45560401 - 45560463
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  45560401 catatatgttgtttgattgtgatattgtttgtgaatacatatattttaattgattgtgatatt 45560463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11543460 - 11543379
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  11543460 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattacatatatg 11543379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 104
Target Start/End: Original strand, 19332756 - 19332793
Alignment:
Q  67 tatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19332756 tatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttga 19332793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 210
Target Start/End: Original strand, 19332787 - 19332844
Alignment:
Q  153 atgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  19332787 atgttgattggttgtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgagatatt 19332844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22312615 - 22312532
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||| |||||||    ||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22312615 catatatgtcaattgattgtaatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattgcatatatgtt 22312532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 117
Target Start/End: Original strand, 22498526 - 22498577
Alignment:
Q  66 gtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatat 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22498526 gtatggagtggttgaactatattatatagttgatgttgattaatgtatatat 22498577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17265806 - 17265756
Alignment:
Q  144 aatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17265806 aatatatatatgttaattgagtgtgatattttcggtgaatgcatatatgtt 17265756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 126
Target Start/End: Original strand, 18042772 - 18042830
Alignment:
Q  69 tggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaa-taatgcatatatgttaattga 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  18042772 tggagtggttgaactatattatatagttgatgttgaattaatgtatatatatcaattga 18042830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11543427 - 11543379
Alignment:
Q  107 aatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatg 155  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  11543427 aatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattacatatatg 11543379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 14943 - 15131
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14943 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatgt 15042  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgata 208  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  15043 taattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgata 15131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 15071 - 15154
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  15071 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgataatttcggtgaatgtgtatatgtt 15154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 15034 - 15096
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  15034 catatatgttaattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 15096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 1323 - 1505
Alignment:
Q  28 gtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgat 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1323 gtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattgcatatatgttaattgat 1422  T
Q  128 gaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  1423 gagaatattgttggtgaatacatatatgttgattggttgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 1463 - 1526
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1463 gatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattatcggtgaatgcgtatatgtt 1526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11401649 - 11401475
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11401649 atcataatgtgctgtgttttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgataaagttgatgttgattaatgcatatatgt 11401550  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11401549 taattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 11401475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 17759543 - 17759729
Alignment:
Q  28 gtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatg----ttgaataatgcatatatgttaat 123  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||    
T  17759543 gtgttgtattttctcttttaattggattgtgagaaagtatatggagttgttaaattatatgatatagttgatgcatgttgaatattgcatatatgttaat 17759642  T
Q  124 tgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17759643 tgatgaggatcttgttggtgaatacatatatgttgattggttgtgatattgttggtgaatacatatatgttcattgattgtgatatt 17759729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 19060863 - 19061049
Alignment:
Q  28 gtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatg----ttgaataatgcatatatgttaat 123  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||    
T  19060863 gtgttgtattttctcttttaattggattgtgagaaagtatatggagttgttaaattatatgatatagttgatgcatgttgaatattgcatatatgttaat 19060962  T
Q  124 tgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  19060963 tgatgaggatcttgttggtgaatacatatatgttgattggttgtgatattgttggtgaatacatatatgttcattgattgtgatatt 19061049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8603695 - 8603542
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8603695 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatgtgt 8603596  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 173  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  8603595 taattgataaggatattgttggtgaatacatatatatcaattgattgtgatatt 8603542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 5229206 - 5229376
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5229206 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatgt 5229305  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatat 191  Q
    | ||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  5229306 tgattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat-gtgttggtgattgcatatat 5229376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 38376904 - 38377078
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||| ||| ||||  ||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||   |||   |||||||    
T  38376904 atcataaggtgttatattttctcctttacttggattttgagaaataatatgatgttgttgaatcatatgataaagtcgatgttggtgaatatgtatatgt 38377003  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38377004 tgattgattatgatattgttggtgaatacatgtatgttaattgattgtgatattgtcagtgaatgcatatatgtt 38377078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 120
Target Start/End: Original strand, 25105174 - 25105267
Alignment:
Q  27 ggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgtt 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  25105174 ggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgggaaattgtatggagttgttgaactaaatgatatagttgaagttgattaatgaatacatgtt 25105267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 191
Target Start/End: Original strand, 17759687 - 17759747
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17759687 gatattgttggtgaatacatatatgttcattgattgtgatattgtcggagaatgcatatat 17759747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 191
Target Start/End: Original strand, 19061007 - 19061067
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19061007 gatattgttggtgaatacatatatgttcattgattgtgatattgtcggagaatgcatatat 19061067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 210
Target Start/End: Original strand, 38376983 - 38377057
Alignment:
Q  136 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  38376983 tgttggtgaatatgtatatgttgattgattatgatattgttggtgaatacatgtatgttaattgattgtgatatt 38377057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Original strand, 11516772 - 11516833
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11516772 ttggtgaatacatatatgttgattgattgagatgttgttggtgaatacatatatgttaattg 11516833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17392337 - 17392274
Alignment:
Q  136 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattg 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17392337 tgttagtgaatacatatatgttgatttattgtgatgttgttggtgaatacatatatgttaattg 17392274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Original strand, 5229297 - 5229343
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5229297 catatatgttgattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 5229343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11401558 - 11401496
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  11401558 catatatgttaattgatggtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 11401496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 43428742 - 43428843
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 118  Q
    |||||||||| |||||||||  || |||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||    
T  43428742 atcataaggtattgtattttcctctattacttgtattatgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtggaagttgattaatgaatacatg 43428841  T
Q  119 tt 120  Q
    ||    
T  43428842 tt 43428843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Original strand, 11516746 - 11516864
Alignment:
Q  75 tgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattg-attgtg-atat 172  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| |||   ||| |||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  11516746 tgttgaactatgtgaaaaagttgatattggtgaatacatatatgttgattgattgagatgttgttggtgaatacatatatgttaattgaattgtgaatgt 11516845  T
Q  173 tgttggtgaatgcatatat 191  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11516846 tgttggtgattgcatatat 11516864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 14181293 - 14181342
Alignment:
Q  145 atacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14181293 atacatatatgttaattgattgtgataatgtcggtgaatgcatatatgtt 14181342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18969080 - 18968979
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||| || | | |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||    
T  18969080 atcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgaatggagctgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatg 18968981  T
Q  119 tt 120  Q
    ||    
T  18968980 tt 18968979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Original strand, 40040403 - 40040456
Alignment:
Q  141 gtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40040403 gtgaataaatatatgctaattgattgtgataatgtcggtgaatgcatatatgtt 40040456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17392301 - 17392241
Alignment:
Q  135 ttgttggtgaatacatatatgttgattg-attgtg-atattgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  17392301 ttgttggtgaatacatatatgttaattgaattgtgaatgttgttggtgattgcatatatgt 17392241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 37917651 - 37917707
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37917651 ttggtgaataaatatatgctaattgattctgataatgtcggtgaatgcatatatgtt 37917707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 38377036 - 38377113
Alignment:
Q  115 tatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  38377036 tatgttaattgattgtgatattgtcagtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttgatgattgcatatatg 38377113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Original strand, 31413599 - 31413647
Alignment:
Q  145 atacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  31413599 atacatatatattgattaattatgatgttgttggtgagtgcatatatgt 31413647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22331792 - 22331603
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22331792 atcataatgtgttgtatcttctcctttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatatat 22331693  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  22331692 taattgatggtgatattgttggt-aatacatatatgttgattgattgtaatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 22331603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18534901 - 18534727
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18534901 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 18534802  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18534801 tgattgattgtgatattcttgatgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 18534727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 24561963 - 24562137
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24561963 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttgattaatgcatatatgt 24562062  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24562063 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattttgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 24562137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6093894 - 6093725
Alignment:
Q  33 gtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgagga 132  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6093894 gtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttattgttgaatattgcatatatgttaattgatgagga 6093795  T
Q  133 tattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||   |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  6093794 tattgttggtgaatacat--------attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgctgattgattgtgatatt 6093725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43641790 - 43641704
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaat 106  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43641790 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttgatgttgaat 43641704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20272430 - 20272259
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaa 122  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||  ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||   ||| ||||||||||||    
T  20272430 ataatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatgatgttattgaattatatgataaagtcgatgttggtgaatacatatatgttaa 20272331  T
Q  123 ttgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||   |||||||| ||||||| |||||||| | | || | ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20272330 ttgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgctaagtgttggtgattttgttggtgattgcatatatgtt 20272259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6093776 - 6093706
Alignment:
Q  122 attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6093776 attgatgaggatattgttggtgaatacatatatgctgattgattgtgatattgtcgacgaatgcatatatg 6093706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24840873 - 24840690
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||   |||| ||||        
T  24840873 atcataatgtgttgtattttctcc-tcacttgaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttggtgaatgtatat---- 24840779  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgata 208  Q
    | ||||||   ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  24840778 tgattgattgtgatatggtttgtgaatgcatatatgttgattgattgagatattgttggtgaaaacatatatgttaattgattgtgata 24840690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22331670 - 22331582
Alignment:
Q  106 taatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||| |||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  22331670 taatacatatatgttgattgattgtaatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattattgatgaatacatatgtgtt 22331582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29113200 - 29113144
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29113200 ttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 29113144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Original strand, 45618691 - 45618754
Alignment:
Q  89 atatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatat 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  45618691 atatagttgatgttgattaatgcatatatgttaattgatggtgatattgttggtgaatgcatat 45618754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Original strand, 19434670 - 19434756
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaat 106  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19434670 atcataatgtattgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtaaggagtttttgaactatatgatgtagttgatgttgaat 19434756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 24562054 - 24562116
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  24562054 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattttgatatt 24562116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18534810 - 18534748
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  18534810 catatatgttgattgattgtgatattcttgatgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 18534748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 24562091 - 24562172
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24562091 catatatgttaattgattttgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattgcatatatg 24562172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 45618474 - 45618405
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatga 89  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45618474 atcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatga 45618405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24840779 - 24840725
Alignment:
Q  156 ttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  24840779 ttgattgattgtgatatggtttgtgaatgcatatatgttgattgattgagatatt 24840725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 45618713 - 45618754
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatat 189  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45618713 catatatgttaattgatggtgatattgttggtgaatgcatat 45618754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29113224 - 29113144
Alignment:
Q  77 ttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgtt 157  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||   ||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29113224 ttgaattatatgatgaagttgatattggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 29113144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Original strand, 45619298 - 45619330
Alignment:
Q  91 atagttgatgttgaataatgcatatatgttaat 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45619298 atagttgatgttgagtaatgcatatatgttaat 45619330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 7)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 5736 - 5907
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5736 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgacgttgattaatgcatatatgt 5835  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatat 191  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5836 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgctaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatat 5907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 175
Target Start/End: Original strand, 1356 - 1511
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1356 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgacgttgattaatgcatatatgt 1455  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgt 175  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1456 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgctaattgattgtgatattgt 1511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 1447 - 1509
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  1447 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgctaattgattgtgatatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 5827 - 5889
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||    
T  5827 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgctaattgattgtgatatt 5889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 183
Target Start/End: Original strand, 35993 - 36063
Alignment:
Q  112 atatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaat 183  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35993 atatatgttgattgattgagatattgttagtgaatacatatatgttga-tgattgtgatattgttggtgaat 36063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 35982 - 36038
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35982 ttggtgaaaatatatatgttgattgattgagatattgttagtgaatacatatatgtt 36038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 36048 - 36102
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatata 190  Q
    |||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36048 gatattgttggtgaata-----atgttcattgattgtgatattgttggtgaatacatata 36102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 210
Target Start/End: Original strand, 11374005 - 11374144
Alignment:
Q  71 gagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11374005 gagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat 11374104  T
Q  171 attgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||| | ||||||||    
T  11374105 attgttggtgaatatgtatatgttaattgatggtgatatt 11374144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Original strand, 29161586 - 29161713
Alignment:
Q  67 tatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29161586 tatggagttgtcgaactatatgatatagttgatgttgaatattgcatatatgttaattgatgatgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattg 29161685  T
Q  167 tgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29161686 tgatattgttggtgaatacatatatgtt 29161713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23220774 - 23220601
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23220774 atcataatgtgtttcattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatg-agttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 23220676  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23220675 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattatgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 23220601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16135324 - 16135183
Alignment:
Q  53 attgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatat 152  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  16135324 attgtgagaaattgtatggagttattgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgactgtgatattgttggtgaatacatat 16135225  T
Q  153 atgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16135224 atgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 16135183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25650108 - 25650019
Alignment:
Q  84 atatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25650108 atatgatgtagttgatgttgaatagtgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgcgatatt 25650019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 154
Target Start/End: Original strand, 17084450 - 17084584
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17084450 atcataatgtgttgtattttctcatttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatatgt 17084549  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatat 154  Q
    | ||||||   |||| | |||||||||| ||||||    
T  17084550 tgattgattgtgatactattggtgaatatatatat 17084584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Original strand, 22594749 - 22594837
Alignment:
Q  106 taatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22594749 taatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattattggtgaatacatatatgtt 22594837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 208
Target Start/End: Original strand, 29161667 - 29161764
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgata 208  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  29161667 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgatggattgagatattgtcggtgaatatatatatgttgattggttgtgata 29161764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21930859 - 21930797
Alignment:
Q  132 atattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21930859 atattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 21930797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Original strand, 22594750 - 22594816
Alignment:
Q  144 aatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  22594750 aatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 22594816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 29161761 - 29161824
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29161761 gatactgttggtgaatacatatatgttgattgattgggatattgtcggtgaatgcatatatgtt 29161824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 11374082 - 11374165
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11374082 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatatgtatatgttaattgatggtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 11374165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 29161724 - 29161803
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29161724 gatattgtcggtgaatatatatatgttgattggttgtgatactgttggtgaatacatatatgttgattgattgggatatt 29161803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16135266 - 16135204
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  16135266 catatatgttgattgactgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 16135204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23220684 - 23220622
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  23220684 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattatgatatt 23220622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 4172874 - 4172931
Alignment:
Q  133 tattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4172874 tattgttggtgaatgcatatatgttaaatgatggtgatattgttggtgaatgcatata 4172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 4228483 - 4228540
Alignment:
Q  133 tattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4228483 tattgttggtgaatgcatatatgttaaatgatggtgatattgttggtgaatgcatata 4228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23220647 - 23220566
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23220647 catatatgttaattgattatgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttgatgattgcatatatg 23220566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 29161630 - 29161692
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  29161630 catatatgttaattgatgatgatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 29161692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21930843 - 21930762
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21930843 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaactgatggcgattttgttggtgattgcatatatg 21930762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 194
Target Start/End: Original strand, 18104732 - 18104767
Alignment:
Q  159 attgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18104732 attgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 18104767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 31162105 - 31162164
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttg 79  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  31162105 atcataaggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgtatgaagttgttg 31162164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Original strand, 4172885 - 4172931
Alignment:
Q  107 aatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatata 153  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  4172885 aatgcatatatgttaaatgatggtgatattgttggtgaatgcatata 4172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Original strand, 4228494 - 4228540
Alignment:
Q  107 aatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatata 153  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  4228494 aatgcatatatgttaaatgatggtgatattgttggtgaatgcatata 4228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25650081 - 25650019
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  25650081 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgcgatatt 25650019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21930859 - 21930818
Alignment:
Q  169 atattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21930859 atattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 21930818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 22463317 - 22463418
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||| |||| ||  | || | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||    
T  22463317 atcataaggtgttgtattttcctcctttacttggattgtgagaaattgtgcgaaggttttgaactataggatatagttgaagttgattaatgaatacatg 22463416  T
Q  119 tt 120  Q
    ||    
T  22463417 tt 22463418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Original strand, 22594642 - 22594702
Alignment:
Q  135 ttgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat--attgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  22594642 ttgttggtgaatatatatatgttgaatgattatggtgaattgttggtgagtgcatatatgt 22594702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26505737 - 26505689
Alignment:
Q  109 tgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgtt 157  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  26505737 tgcatatatgttaattaatggtgatattgttggtgaatccacatatgtt 26505689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9877 - 9695
Alignment:
Q  29 tgttgtattttttccattaattgaattgtga-aaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgat 127  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9877 tgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgataattgat 9778  T
Q  128 gaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  9777 ggtgatattgttggtgaatatagatatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttaattgattgtcatatt 9695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9754 - 9674
Alignment:
Q  114 atatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9754 atatgttgattgattgtgatattgttggtcaatacatatatgttaattgattgtcatattgtcggtgagtgcatatatgtt 9674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 5371791 - 5371964
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||   |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5371791 atcataatgtgttgtattttctcctttgcctgaattgtgagaaactgtatggagttgttga-ctatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 5371889  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5371890 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 5371964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 12134844 - 12135029
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12134844 atcataaagtgttgtattttctcttttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatctatgt 12134943  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgata 208  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||   || |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  12134944 taattgatgaagatattattggtgaatacatatatgttgattggttatgata---tttgtgaatacatatatgttaattgattgtgata 12135029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19558406 - 19558232
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  19558406 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatcgagttgttgaaccatatgatatagttgatgttgattaatacatatctgt 19558307  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||| |||||||    
T  19558306 tgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaatggattgttatattgtcgatgaatgcagatatgtt 19558232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 194
Target Start/End: Original strand, 54364664 - 54364838
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||   ||| |||||||||    
T  54364664 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttggtgaatacatatatgt 54364763  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    | ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54364764 tgatttattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 54364838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 17376660 - 17376823
Alignment:
Q  28 gtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgat 127  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  17376660 gtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggggttgttaaattatatgatttagttgatgttggttaatgcatatatgttgattgat 17376759  T
Q  128 gaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
       |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17376760 tgtgatattgttggtgaatacatata---tgattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 17376823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14570297 - 14570156
Alignment:
Q  53 attgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatat 152  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||| | ||||||  ||||||| |||   ||| |||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  14570297 attgtgagaaatagtatgatgttgttgaattttatgatgaagttgatattggtgaatacatatatgttgattgatagtgatatggttggtgaatacatat 14570198  T
Q  153 atgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14570197 atgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 14570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 210
Target Start/End: Original strand, 54364743 - 54364817
Alignment:
Q  136 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  54364743 tgttggtgaatacatatatgttgatttattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 54364817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14570249 - 14570177
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14570249 ttggtgaatacatatatgttgattgatagtgatatggttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 14570177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 5371881 - 5371943
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  5371881 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 5371943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12733136 - 12733052
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12733136 atcataaggtgttgtattttctcctttacttgtattgtgagaaatggtgcgaagttgttgaactataggatatagttgaagttga 12733052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Original strand, 12134999 - 12135052
Alignment:
Q  141 gtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12134999 gtgaatacatatatgttaattgattgtgataatgtcggtgaatgcatatatgtt 12135052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 49070808 - 49070703
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaa 122  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||| |||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| | ||    
T  49070808 ataaggtgttgtattctctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatgtatatcaa 49070709  T
Q  123 ttgatg 128  Q
    ||||||    
T  49070708 ttgatg 49070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Original strand, 19082289 - 19082410
Alignment:
Q  34 tattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggat 133  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | |||| | ||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||   |||| |||||| ||||||||||  |||    
T  19082289 tattttctcctttacttgaattgtaagaaattgcatgaagttattgaattatatgatgtagtcgatgttggtgaatgtatatatattaattgatggtgat 19082388  T
Q  134 attgttggtgaatacatatatg 155  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  19082389 attgttggtgaatgtatatatg 19082410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38763766 - 38763665
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 118  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||    
T  38763766 atcattaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatg 38763667  T
Q  119 tt 120  Q
    ||    
T  38763666 tt 38763665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 5371918 - 5371998
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| | ||||||||    
T  5371918 catatatgttaattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat-gtgttggtgatttcatatatg 5371998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 193
Target Start/End: Original strand, 13595395 - 13595455
Alignment:
Q  135 ttgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat--attgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  13595395 ttgttggtgaatatatatatgttgaatgattgtggtgaattgttggtgagtgcatatatgt 13595455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14570202 - 14570122
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  14570202 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat-ttgtcggtgagtgcatatatg 14570122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 19082354 - 19082410
Alignment:
Q  136 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19082354 tgttggtgaatgtatatatattaattgatggtgatattgttggtgaatgtatatatg 19082410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 17213063 - 17213122
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttg 79  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  17213063 atcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttg 17213122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Original strand, 16226366 - 16226449
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttga 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16226366 atcataatgtgttgtattttctcg-ttacttggattgtgaggaattgtatggagttgttggattatatgatatgattgatgttga 16226449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24237873 - 24237765
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||| | | ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24237873 atcataaggttttgtattttctcctttacttggattataagaacgtgtatggagttgttgagatataatatatagttgatgttgattaatgtatgtatat 24237774  T
Q  120 taattgatg 128  Q
     ||||||||    
T  24237773 caattgatg 24237765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33396371 - 33396200
Alignment:
Q  24 taaggtgttgtattttttccattaattg-aattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33396371 taaggtgttgtattttctcatttacttggaattgtgagaaataatatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatgttgcatatatgttaa 33396272  T
Q  123 ttgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33396271 ttgattaggatattgtcggtgaatacatatatgttgaatgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 33396200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 194
Target Start/End: Original strand, 77184 - 77309
Alignment:
Q  69 tggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtg 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  77184 tggagttgttaaactatatgatatagttgatggtgattaatgcatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacacatatgttaattgattgtg 77283  T
Q  169 atattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  77284 atattgtgggtgaatgcatatatgtt 77309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20822062 - 20821876
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |     || ||||||||    
T  20822062 atcataatgtgaagtattttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgttgaattatatgataaagttgatgtagg----tgaatatatgt 20821967  T
Q  120 taattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    | ||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  20821966 tgattgattgtgatatggttggtgagtacatatatgttgattgattatgataatgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 20821876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20821938 - 20821855
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20821938 catatatgttgattgattatgataatgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 20821855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 77226 - 77288
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  77226 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacacatatgttaattgattgtgatatt 77288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20821901 - 20821820
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20821901 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattgcatatatg 20821820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 46144760 - 46144659
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||| ||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||    
T  46144760 atcataaggtgttgtatgttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatg 46144661  T
Q  119 tt 120  Q
    ||    
T  46144660 tt 46144659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21224229 - 21224122
Alignment:
Q  49 ttgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactata-tgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaata 147  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  | || |||| |||||| |||||| || | |||||| | |||||||||  |||||||||||||| |     
T  21224229 ttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgagatgtaatgatgtagttgttgttgattattacatataagctaattgatggtgatattgttggtgagtg 21224130  T
Q  148 catatatg 155  Q
    ||||||||    
T  21224129 catatatg 21224122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Original strand, 40437479 - 40437579
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||| ||| ||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  40437479 atcataaggtattgtatttcctcctttacttggattgtgagaaattgtgcgaagttgttgaactataggatataattgaagttgattaatgaatacatgt 40437578  T
Q  120 t 120  Q
    |    
T  40437579 t 40437579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Original strand, 49998526 - 49998602
Alignment:
Q  22 cataaggtgttgtattttt-tccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttg 97  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49998526 cataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatgtagttgttgaactatatgatatagttg 49998602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 14075 - 14248
Alignment:
Q  36 ttttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatat 135  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||   |||||    
T  14075 ttttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgttgaattatatgatatagttgatgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatat 14174  T
Q  136 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatat 209  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  14175 ggttggtgaatacatatatgttgatcgattgtgatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatat 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 210
Target Start/End: Original strand, 14138 - 14212
Alignment:
Q  136 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  14138 tgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatggttggtgaatacatatatgttgatcgattgtgatatt 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Original strand, 14207 - 14270
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  14207 gatattgttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatattcggtgcatgcatatatgtt 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 210
Target Start/End: Original strand, 21208 - 21369
Alignment:
Q  49 ttgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatac 148  Q
    ||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||   ||||||||| || |||||    
T  21208 ttgaattgtgagaaatagtatgatgttgtggaattatatgataaagtcgatgttgatgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttagtaaatac 21307  T
Q  149 atatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||| ||||||    
T  21308 atatatgttgattgattgtgatattgttgatgagtacatatatgttgattgattgcgatatt 21369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 209
Target Start/End: Original strand, 21307 - 21405
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatat 209  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||    
T  21307 catatatgttgattgattgtgatattgttgatgagtacatatatgttgattgattgcgatattgttggtgagtacatatatgttgattgattgtaatat 21405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11656 - 11488
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttga-tgttgaataatgcatatatg 118  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11656 atcataaggtgttttattttctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgttgagttatattatatagttgaatgttgattaatgcatatatg 11557  T
Q  119 ttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcat 187  Q
    || | |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||||    
T  11556 ttgactgatggtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgattttgttggtgattgcat 11488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11518
Alignment:
Q  148 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11564 catatatgttgactgatggtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 11518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 208
Target Start/End: Original strand, 255643 - 255720
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgata 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  255643 gatatttttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatcttaattggttgtgata 255720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Original strand, 255551 - 255648
Alignment:
Q  113 tatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||    
T  255551 tatatgttgattgattttgatattgttggtgaatacatatatgtggattgattgtgatattgttagtaaataaatatatgtggattgattgtgatatt 255648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Original strand, 255606 - 255685
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  255606 gatattgttagtaaataaatatatgtggattgattgtgatatttttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatatt 255685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Original strand, 98348 - 98412
Alignment:
Q  131 gatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgat--attgttggtgaatgcatatatgt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| | |||||||||    
T  98348 gatattgttggtgaatatatatatgttgaatgattgtggtgaattgttggtgagttcatatatgt 98412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 171
Target Start/End: Original strand, 255660 - 255720
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgata 171  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  255660 catatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatacatatatcttaattggttgtgata 255720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 98324 - 98374
Alignment:
Q  144 aatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  98324 aatacatatatattgattaattatgatattgttggtgaatatatatatgtt 98374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 194
Target Start/End: Original strand, 247079 - 247220
Alignment:
Q  53 attgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatat 152  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||| | ||||||  ||||||| |||   ||| |||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  247079 attgtgagaaatagtatgatgttgttgaattttatgatgaagttgatattggtgaatacatatatgttgattgatagtgatatggttggtgaatacatat 247178  T
Q  153 atgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  247179 atgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 247220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 210
Target Start/End: Original strand, 247127 - 247199
Alignment:
Q  138 ttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtgatatt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  247127 ttggtgaatacatatatgttgattgatagtgatatggttggtgaatacatatatgttaattgattgtgatatt 247199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 247174 - 247254
Alignment:
Q  111 catatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatg 192  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  247174 catatatgttaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgttaagtgatggtgat-ttgtcggtgagtgcatatatg 247254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 12214 - 12284
Alignment:
Q  49 ttgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatgt 119  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12214 ttgaattgtgagaaattgtatggaattgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgt 12284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4929 - 4839
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4929 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgttgagctatattatatagttgatattgattaatg 4839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Original strand, 8429 - 8511
Alignment:
Q  112 atatatgttaattgatgaggatattgttggtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  8429 atatatgtttattgattgtgatattgttgatggatacatatatgttaattgattgtggcattgtcggtgaatgcatatatgtt 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 205
Target Start/End: Original strand, 8429 - 8485
Alignment:
Q  149 atatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtttattggttgtg 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||    
T  8429 atatatgtttattgattgtgatattgttgatggatacatatatgttaattgattgtg 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 8322 - 8412
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttg-atgttgaataatg 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  ||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  8322 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgtt-agctatattatatagttgaatgttgattaatg 8412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 75965 - 75912
Alignment:
Q  141 gtgaatacatatatgttgattgattgtgatattgttggtgaatgcatatatgtt 194  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  75965 gtgaatacatatgtgctaattgattgtgatattgtcggtgaatgcatatatgtt 75912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 2197 - 2280
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttg 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  2197 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttg 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Original strand, 44793 - 44900
Alignment:
Q  23 ataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatat--agttgatgttgaataatgcatatatgtt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||  || ||| | ||||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||| |     
T  44793 ataaggtgttgtattttctcctctacttggaatgtgagaaagtgtatagagttgttgagctatattatatatagttgatgttgattaatgtatatatatc 44892  T
Q  121 aattgatg 128  Q
    ||||||||    
T  44893 aattgatg 44900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Original strand, 34645 - 34720
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagtt 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34645 atcataaggtgttgtattttctcc-ttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagtt 34720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 850 - 755
Alignment:
Q  20 atcataaggtgttgtattttttccattaattgaattgtgaaaaatggtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatat 115  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||    |||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  850 atcataatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtacatgatgttgttgaacgataggatatagtttatgttgattaatgcatat 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University