View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145A_low_117 (Length: 363)

Name: NF10145A_low_117
Description: NF10145A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145A_low_117
NF10145A_low_117
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (21-363)||(579-921)
chr7 (21-363)||(16949644-16949985)
chr7 (21-363)||(12456437-12456779)
chr7 (21-363)||(14285548-14285890)
chr7 (21-363)||(14434426-14434768)
chr7 (21-363)||(15101775-15102117)
chr7 (23-363)||(13666272-13666612)
chr7 (21-363)||(13022092-13022434)
chr7 (69-363)||(14130608-14130902)
chr7 (21-363)||(19147946-19148288)
chr7 (21-363)||(20747345-20747687)
chr7 (23-363)||(12457375-12457715)
chr7 (21-363)||(15341166-15341508)
chr7 (21-363)||(19613410-19613752)
chr7 (21-363)||(49153036-49153378)
chr7 (21-363)||(11305435-11305777)
chr7 (21-363)||(11387600-11387942)
chr7 (21-363)||(14263416-14263758)
chr7 (26-363)||(13967845-13968182)
chr7 (23-363)||(26117779-26118119)
chr7 (21-363)||(16071467-16071808)
chr7 (67-363)||(8211346-8211642)
chr7 (21-363)||(12205972-12206314)
chr7 (21-363)||(18053125-18053467)
chr7 (21-363)||(23505042-23505384)
chr7 (61-351)||(15625298-15625588)
chr7 (61-363)||(11771475-11771777)
chr7 (125-351)||(21662707-21662933)
chr7 (61-291)||(15204425-15204655)
chr7 (62-327)||(15153892-15154157)
chr7 (61-351)||(321271-321561)
chr7 (29-358)||(10871734-10872063)
chr7 (29-358)||(44790553-44790882)
chr7 (254-363)||(6414246-6414355)
chr7 (29-358)||(18178481-18178810)
chr7 (29-358)||(8708344-8708673)
chr7 (62-358)||(9596796-9597092)
chr7 (29-358)||(8199367-8199696)
chr7 (61-358)||(13686803-13687100)
chr7 (61-358)||(18550992-18551289)
chr7 (61-261)||(14040531-14040731)
chr7 (61-261)||(14350561-14350761)
chr7 (29-351)||(12688247-12688568)
chr7 (29-327)||(11236415-11236713)
chr7 (29-358)||(11552304-11552633)
chr7 (61-261)||(15160291-15160491)
chr7 (29-358)||(23202815-23203144)
chr7 (29-358)||(23508942-23509271)
chr7 (62-358)||(16553-16847)
chr7 (61-350)||(14333144-14333432)
chr7 (29-171)||(14955484-14955622)
chr7 (119-184)||(13354063-13354128)
chr7 (119-261)||(13455583-13455725)
chr7 (126-184)||(23642359-23642417)
chr7 (119-184)||(27107066-27107131)
chr7 (119-171)||(14212600-14212652)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (21-363)||(24098860-24099202)
chr1 (21-363)||(20939320-20939662)
chr1 (23-363)||(19855065-19855405)
chr1 (23-363)||(20295172-20295512)
chr1 (23-363)||(19662396-19662740)
chr1 (21-363)||(37677840-37678182)
chr1 (27-363)||(31539260-31539596)
chr1 (23-354)||(21951678-21952009)
chr1 (107-363)||(20835231-20835487)
chr1 (21-363)||(20856017-20856360)
chr1 (61-357)||(50619541-50619837)
chr1 (62-363)||(20139590-20139891)
chr1 (61-274)||(16373378-16373591)
chr1 (119-351)||(21749713-21749945)
chr1 (29-358)||(41352927-41353256)
chr1 (26-126)||(23197508-23197608)
chr1 (61-353)||(19760170-19760455)
chr1 (29-261)||(19107230-19107462)
chr1 (62-351)||(20250574-20250862)
chr1 (61-358)||(21837715-21838012)
chr1 (62-351)||(22361542-22361831)
chr1 (61-273)||(22109872-22110084)
chr1 (61-273)||(22113721-22113933)
chr1 (61-358)||(16349896-16350193)
chr1 (248-361)||(22432600-22432713)
chr1 (29-358)||(51332758-51333087)
chr1 (61-261)||(33390326-33390526)
chr1 (29-358)||(21831068-21831397)
chr1 (62-358)||(17044313-17044609)
chr1 (119-358)||(16078011-16078250)
chr1 (119-184)||(20830747-20830812)
chr1 (23-72)||(20835159-20835208)
chr1 (119-204)||(21025092-21025177)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (21-363)||(31416102-31416444)
chr8 (21-350)||(1267062-1267391)
chr8 (23-363)||(23655738-23656078)
chr8 (21-363)||(20009548-20009889)
chr8 (23-363)||(16270854-16271194)
chr8 (21-363)||(19852222-19852564)
chr8 (21-363)||(19858258-19858600)
chr8 (21-363)||(21841228-21841570)
chr8 (23-363)||(12305569-12305909)
chr8 (21-363)||(6604469-6604811)
chr8 (21-363)||(6679922-6680264)
chr8 (26-363)||(14565953-14566290)
chr8 (21-363)||(803301-803643)
chr8 (21-363)||(20388910-20389252)
chr8 (21-363)||(20975279-20975621)
chr8 (21-355)||(22051682-22052016)
chr8 (21-363)||(22371751-22372093)
chr8 (23-363)||(27355359-27355698)
chr8 (23-363)||(29303056-29303396)
chr8 (21-363)||(31570470-31570812)
chr8 (61-362)||(20395800-20396094)
chr8 (64-363)||(23949730-23950029)
chr8 (21-186)||(20985175-20985340)
chr8 (61-327)||(22248085-22248351)
chr8 (62-345)||(21921405-21921688)
chr8 (61-301)||(22377122-22377362)
chr8 (61-301)||(22383297-22383537)
chr8 (29-358)||(19483700-19484029)
chr8 (61-363)||(19978778-19979080)
chr8 (62-351)||(21043268-21043557)
chr8 (61-261)||(22988109-22988309)
chr8 (206-357)||(22061246-22061397)
chr8 (61-358)||(17673691-17673988)
chr8 (29-358)||(18857393-18857722)
chr8 (62-327)||(21393534-21393799)
chr8 (62-327)||(21788028-21788293)
chr8 (119-315)||(23650900-23651096)
chr8 (62-327)||(21251788-21252056)
chr8 (61-358)||(19113506-19113803)
chr8 (119-358)||(22132767-22133006)
chr8 (61-363)||(21166206-21166508)
chr8 (62-358)||(30312813-30313109)
chr8 (119-358)||(22040675-22040914)
chr8 (119-358)||(32600960-32601199)
chr8 (29-261)||(22128594-22128826)
chr8 (97-184)||(25283346-25283433)
chr8 (119-184)||(22316181-22316246)
chr8 (87-166)||(22623558-22623637)
chr8 (97-184)||(25283120-25283207)
chr8 (97-170)||(23156716-23156789)
chr8 (119-363)||(15534191-15534438)
chr8 (61-116)||(23886082-23886137)
chr8 (232-358)||(16407885-16408011)
chr8 (289-327)||(22366561-22366599)
chr8 (146-315)||(12274442-12274611)
chr8 (62-163)||(16407714-16407815)
chr8 (119-184)||(16876821-16876886)
chr8 (119-184)||(21196228-21196293)
chr8 (119-168)||(21850063-21850112)
chr8 (123-171)||(22119904-22119952)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (21-363)||(13089-13431)
scaffold0034 (23-363)||(4143-4483)
scaffold0034 (21-363)||(68146-68488)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (21-363)||(20170-20512)
scaffold0104 (21-363)||(22990-23332)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (21-363)||(24619662-24620004)
chr5 (21-363)||(24715893-24716235)
chr5 (21-363)||(24748921-24749263)
chr5 (21-363)||(23079456-23079798)
chr5 (23-363)||(22235289-22235629)
chr5 (23-363)||(25848734-25849074)
chr5 (21-363)||(21890126-21890468)
chr5 (23-363)||(20342941-20343281)
chr5 (21-363)||(24797764-24798106)
chr5 (23-363)||(22503338-22503678)
chr5 (21-312)||(21496783-21497074)
chr5 (21-363)||(14886358-14886700)
chr5 (21-363)||(37542748-37543090)
chr5 (21-363)||(17268701-17269043)
chr5 (21-363)||(21831128-21831470)
chr5 (21-309)||(21680145-21680433)
chr5 (61-360)||(21563380-21563679)
chr5 (61-363)||(20822112-20822414)
chr5 (61-363)||(22462611-22462913)
chr5 (21-363)||(28894309-28894651)
chr5 (21-363)||(28915780-28916122)
chr5 (21-363)||(28923135-28923477)
chr5 (21-363)||(20774418-20774760)
chr5 (59-351)||(20467502-20467794)
chr5 (61-351)||(26738134-26738424)
chr5 (87-351)||(21407827-21408091)
chr5 (61-358)||(27611036-27611333)
chr5 (61-351)||(23471918-23472208)
chr5 (61-358)||(19770642-19770939)
chr5 (61-358)||(22349105-22349402)
chr5 (62-351)||(25423878-25424166)
chr5 (119-363)||(23440887-23441131)
chr5 (29-358)||(16357184-16357513)
chr5 (29-358)||(27519089-27519418)
chr5 (29-358)||(34567176-34567505)
chr5 (29-358)||(41771524-41771853)
chr5 (61-358)||(14999146-14999443)
chr5 (61-350)||(21338704-21338993)
chr5 (29-358)||(29475448-29475777)
chr5 (62-358)||(22135350-22135646)
chr5 (119-363)||(23574414-23574658)
chr5 (29-358)||(22332262-22332591)
chr5 (29-358)||(40709462-40709791)
chr5 (61-358)||(27684807-27685104)
chr5 (61-363)||(20800125-20800427)
chr5 (61-358)||(27667897-27668194)
chr5 (62-358)||(18776452-18776748)
chr5 (119-358)||(37290961-37291200)
chr5 (313-363)||(22381858-22381908)
chr5 (61-172)||(23517394-23517505)
chr5 (119-184)||(23504280-23504345)
chr5 (119-184)||(24582048-24582113)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-363)||(249389-249731)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (21-363)||(41693-42035)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (21-363)||(56088-56430)
scaffold0076 (21-363)||(32865-33207)
scaffold0076 (119-184)||(41213-41278)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (21-363)||(10468179-10468521)
chr6 (21-363)||(25768800-25769142)
chr6 (29-363)||(14380805-14381139)
chr6 (21-321)||(19435653-19435953)
chr6 (21-363)||(5296536-5296878)
chr6 (21-363)||(8762263-8762605)
chr6 (21-363)||(18795299-18795641)
chr6 (21-363)||(21472210-21472552)
chr6 (23-363)||(19454029-19454369)
chr6 (23-363)||(24365021-24365361)
chr6 (21-363)||(34644916-34645258)
chr6 (21-354)||(19879916-19880249)
chr6 (61-363)||(21563502-21563804)
chr6 (61-363)||(21569361-21569663)
chr6 (21-363)||(28282143-28282485)
chr6 (24-315)||(19488605-19488896)
chr6 (61-357)||(15459951-15460247)
chr6 (191-363)||(22796132-22796304)
chr6 (29-154)||(14379255-14379380)
chr6 (60-363)||(5838588-5838891)
chr6 (180-363)||(27560106-27560289)
chr6 (61-303)||(18966662-18966904)
chr6 (62-344)||(25609232-25609514)
chr6 (61-358)||(15896708-15897005)
chr6 (61-351)||(18197095-18197388)
chr6 (62-351)||(22761826-22762115)
chr6 (27-315)||(22078026-22078314)
chr6 (119-363)||(22434478-22434722)
chr6 (119-363)||(22442876-22443120)
chr6 (61-363)||(19865296-19865598)
chr6 (61-327)||(23079114-23079380)
chr6 (62-327)||(27566351-27566616)
chr6 (29-358)||(16626055-16626384)
chr6 (62-351)||(20636672-20636961)
chr6 (29-358)||(2874141-2874470)
chr6 (29-358)||(25113166-25113495)
chr6 (65-261)||(27330807-27331003)
chr6 (65-261)||(27391547-27391743)
chr6 (89-280)||(18436297-18436492)
chr6 (61-358)||(1542454-1542751)
chr6 (61-358)||(27188050-27188347)
chr6 (61-358)||(27260893-27261190)
chr6 (61-358)||(28262567-28262864)
chr6 (61-358)||(28341316-28341613)
chr6 (61-358)||(29591290-29591587)
chr6 (119-351)||(16962873-16963105)
chr6 (62-327)||(18407313-18407578)
chr6 (61-358)||(24312538-24312835)
chr6 (287-363)||(17416095-17416171)
chr6 (104-351)||(16927053-16927300)
chr6 (232-358)||(28291913-28292039)
chr6 (97-189)||(16098833-16098925)
chr6 (119-184)||(18837336-18837401)
chr6 (119-170)||(18572453-18572504)
chr6 (119-168)||(14624785-14624834)
chr6 (119-184)||(15077794-15077859)
chr6 (119-184)||(16381801-16381866)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (21-363)||(19651777-19652119)
chr2 (21-363)||(23277152-23277494)
chr2 (21-363)||(1064127-1064469)
chr2 (21-359)||(23294315-23294653)
chr2 (21-363)||(20828635-20828977)
chr2 (21-363)||(20833361-20833703)
chr2 (21-363)||(27364804-27365146)
chr2 (21-363)||(31831034-31831376)
chr2 (21-363)||(24948965-24949308)
chr2 (68-363)||(11357646-11357941)
chr2 (21-363)||(27788117-27788459)
chr2 (21-363)||(12574729-12575071)
chr2 (21-363)||(23111111-23111454)
chr2 (21-363)||(27209897-27210239)
chr2 (87-351)||(45529899-45530163)
chr2 (140-362)||(21125003-21125225)
chr2 (191-363)||(24642118-24642290)
chr2 (87-351)||(30210708-30210971)
chr2 (61-351)||(24819451-24819741)
chr2 (29-358)||(24876482-24876811)
chr2 (29-358)||(16925741-16926070)
chr2 (29-358)||(16999381-16999710)
chr2 (61-358)||(24710415-24710712)
chr2 (29-358)||(27371650-27371979)
chr2 (61-357)||(21325031-21325327)
chr2 (62-345)||(21890484-21890767)
chr2 (61-358)||(21144806-21145103)
chr2 (29-358)||(9610517-9610846)
chr2 (29-358)||(10869231-10869560)
chr2 (62-261)||(23066869-23067068)
chr2 (29-358)||(16923270-16923599)
chr2 (29-358)||(16982533-16982862)
chr2 (29-358)||(17064098-17064427)
chr2 (29-358)||(17067756-17068085)
chr2 (29-358)||(27218397-27218726)
chr2 (61-355)||(44385334-44385628)
chr2 (62-351)||(23107496-23107785)
chr2 (61-261)||(41608150-41608350)
chr2 (61-358)||(24262751-24263048)
chr2 (119-358)||(22324679-22324918)
chr2 (61-363)||(24675865-24676167)
chr2 (119-358)||(24707305-24707544)
chr2 (61-363)||(22756230-22756532)
chr2 (21-91)||(23099743-23099813)
chr2 (119-184)||(12640056-12640121)
chr2 (119-184)||(22276833-22276898)
chr2 (289-330)||(24831180-24831221)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (21-363)||(43559-43901)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (21-363)||(14574297-14574639)
chr3 (21-363)||(16827616-16827958)
chr3 (23-363)||(10384342-10384682)
chr3 (23-363)||(18133761-18134101)
chr3 (23-363)||(11303188-11303528)
chr3 (23-363)||(16337927-16338267)
chr3 (23-363)||(17493004-17493344)
chr3 (21-363)||(28754692-28755034)
chr3 (21-363)||(47124318-47124660)
chr3 (21-363)||(16380341-16380683)
chr3 (21-363)||(16835923-16836265)
chr3 (23-363)||(11960584-11960924)
chr3 (21-363)||(14087047-14087389)
chr3 (23-363)||(16329075-16329416)
chr3 (69-363)||(12360003-12360297)
chr3 (21-363)||(13971533-13971875)
chr3 (21-315)||(31694599-31694893)
chr3 (21-311)||(31939329-31939619)
chr3 (21-363)||(4678812-4679154)
chr3 (21-363)||(41177896-41178238)
chr3 (24-363)||(13942398-13942737)
chr3 (21-353)||(44777631-44777963)
chr3 (21-363)||(8758495-8758837)
chr3 (21-363)||(15228023-15228365)
chr3 (21-225)||(13319915-13320119)
chr3 (61-357)||(10419498-10419794)
chr3 (61-327)||(15248547-15248813)
chr3 (21-144)||(13299935-13300058)
chr3 (21-144)||(13310593-13310716)
chr3 (29-358)||(5424362-5424691)
chr3 (87-327)||(15015246-15015486)
chr3 (61-351)||(15209267-15209557)
chr3 (119-351)||(9523095-9523327)
chr3 (62-350)||(17490227-17490515)
chr3 (27-358)||(10906579-10906910)
chr3 (61-358)||(6601105-6601402)
chr3 (29-358)||(15339638-15339967)
chr3 (29-358)||(15588824-15589153)
chr3 (62-327)||(16491646-16491911)
chr3 (29-358)||(20061486-20061815)
chr3 (61-358)||(15347709-15348006)
chr3 (29-358)||(16636142-16636471)
chr3 (29-358)||(26791831-26792160)
chr3 (29-358)||(43163466-43163795)
chr3 (61-358)||(53384482-53384779)
chr3 (29-363)||(13253054-13253388)
chr3 (29-358)||(10005969-10006298)
chr3 (29-358)||(15724366-15724695)
chr3 (21-126)||(15234128-15234233)
chr3 (29-358)||(16411714-16412043)
chr3 (119-363)||(14876020-14876264)
chr3 (29-327)||(48425847-48426145)
chr3 (62-363)||(12498612-12498913)
chr3 (61-358)||(16756049-16756346)
chr3 (119-358)||(16806448-16806687)
chr3 (61-351)||(16371789-16372078)
chr3 (266-363)||(13322310-13322407)
chr3 (62-327)||(16692564-16692829)
chr3 (119-358)||(14126116-14126355)
chr3 (27-204)||(15401947-15402124)
chr3 (61-185)||(14580406-14580530)
chr3 (97-261)||(6711909-6712073)
chr3 (104-261)||(15062210-15062367)
chr3 (119-327)||(8273921-8274129)
chr3 (308-363)||(15952668-15952723)
chr3 (119-168)||(12792710-12792759)
chr3 (119-184)||(13966862-13966927)
chr3 (119-168)||(15610672-15610721)
chr3 (119-184)||(16257697-16257762)
chr3 (119-184)||(16742225-16742290)
chr3 (119-184)||(30138359-30138424)
chr3 (119-184)||(30147910-30147975)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (21-363)||(27300-27642)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (21-363)||(32507-32849)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (23-363)||(28001-28341)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (23-363)||(149346-149686)
scaffold0011 (21-363)||(194892-195234)
scaffold0011 (61-363)||(25761-26063)
scaffold0011 (119-165)||(180898-180944)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (23-363)||(46589-46929)
scaffold0010 (21-363)||(41521-41863)
scaffold0010 (61-309)||(2751-2992)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (21-363)||(22564-22906)
scaffold0261 (21-363)||(14385-14727)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (21-363)||(1160-1502)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (21-363)||(19896-20238)
scaffold0058 (126-184)||(75513-75571)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (21-363)||(33223668-33224010)
chr4 (21-363)||(15002549-15002891)
chr4 (21-363)||(3263979-3264321)
chr4 (21-363)||(15246669-15247011)
chr4 (23-363)||(11206418-11206758)
chr4 (23-363)||(20891727-20892067)
chr4 (21-363)||(27901131-27901473)
chr4 (23-363)||(44661053-44661393)
chr4 (21-363)||(29452722-29453064)
chr4 (21-361)||(1648462-1648802)
chr4 (21-363)||(15078380-15078722)
chr4 (21-363)||(15319896-15320237)
chr4 (21-363)||(8706663-8707005)
chr4 (21-363)||(15414211-15414553)
chr4 (23-246)||(15358307-15358530)
chr4 (29-239)||(16148580-16148790)
chr4 (29-239)||(16152726-16152936)
chr4 (61-309)||(14850331-14850579)
chr4 (61-261)||(14160317-14160517)
chr4 (62-339)||(7091201-7091478)
chr4 (29-358)||(19777726-19778055)
chr4 (29-358)||(12477350-12477679)
chr4 (61-358)||(14302943-14303240)
chr4 (29-358)||(29038337-29038666)
chr4 (29-358)||(8052556-8052885)
chr4 (29-358)||(8387162-8387491)
chr4 (61-358)||(14681317-14681614)
chr4 (29-358)||(23956497-23956826)
chr4 (61-358)||(27712086-27712383)
chr4 (287-363)||(15358541-15358617)
chr4 (29-358)||(40473790-40474119)
chr4 (119-358)||(18226469-18226708)
chr4 (61-351)||(1639390-1639680)
chr4 (65-363)||(15146854-15147152)
chr4 (61-170)||(14695051-14695160)
chr4 (61-358)||(18297955-18298252)
chr4 (104-358)||(12524426-12524680)
chr4 (119-170)||(16354468-16354519)
chr4 (119-186)||(15292441-15292508)
chr4 (98-156)||(18549321-18549379)
chr4 (97-170)||(12342126-12342199)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (23-363)||(2364-2704)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (23-363)||(3527-3867)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (21-363)||(5526-5868)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-363)||(51051-51393)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (21-363)||(32186-32529)
scaffold0106 (176-327)||(14851-15002)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (21-363)||(100-442)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (21-363)||(5206-5548)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (23-361)||(15903-16241)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (21-363)||(51368-51710)
scaffold0067 (21-363)||(60402-60744)
scaffold0067 (21-363)||(66790-67132)
scaffold0067 (61-150)||(26389-26478)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (21-360)||(2543-2882)
scaffold0222 (21-363)||(7836-8178)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (21-359)||(3571-3909)
scaffold0403 (62-327)||(7184-7449)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (21-363)||(45293-45635)
scaffold0114 (21-280)||(20759-21018)
scaffold0114 (203-363)||(44281-44441)
scaffold0114 (62-327)||(19570-19835)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (21-363)||(4640-4982)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (38-363)||(100754-101082)
scaffold0020 (61-363)||(180975-181277)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (23-363)||(27037-27377)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (23-327)||(20631-20935)
scaffold0077 (119-184)||(27552-27617)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (21-363)||(5989-6331)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (21-363)||(6426-6768)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-363)||(10569-10911)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (21-363)||(48222-48564)
scaffold0053 (21-363)||(57035-57377)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (47-363)||(25079-25395)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (21-363)||(20759-21101)
scaffold0298 (23-341)||(11247-11565)
scaffold0298 (23-341)||(15017-15335)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (21-363)||(645-987)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (21-363)||(11974-12315)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (21-363)||(19625-19967)
scaffold0090 (21-363)||(23787-24129)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-363)||(28833-29175)
scaffold0026 (62-327)||(29757-30022)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (21-363)||(261084-261426)
scaffold0005 (61-363)||(278058-278360)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (21-363)||(323480-323822)
scaffold0004 (21-363)||(202656-202998)
scaffold0004 (245-363)||(118344-118462)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (21-342)||(7333-7654)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-363)||(24260-24601)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (21-363)||(81020-81362)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (21-363)||(49702-50044)
scaffold0028 (61-358)||(9255-9552)
scaffold0028 (61-183)||(844-966)
scaffold0028 (61-358)||(43935-44232)
scaffold0028 (61-261)||(15814-16014)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (21-363)||(337-679)
scaffold0139 (23-183)||(28173-28333)
scaffold0139 (23-183)||(34426-34586)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (101-363)||(40514-40776)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (21-294)||(3021-3294)
scaffold0751 (217-360)||(2573-2716)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (23-341)||(12996-13316)
scaffold0124 (119-184)||(7094-7159)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (21-363)||(250-591)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (21-363)||(13487-13829)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (23-363)||(10647-10987)
scaffold0235 (23-363)||(20861-21201)
scaffold0235 (119-184)||(26761-26826)
[»] scaffold0232 (2 HSPs)
scaffold0232 (21-297)||(874-1150)
scaffold0232 (293-363)||(2337-2407)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (21-363)||(18124-18467)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (21-363)||(5524-5865)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (61-363)||(640-942)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (21-363)||(659-1001)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (21-363)||(9996-10338)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (107-363)||(6510-6767)
scaffold0149 (107-363)||(10941-11198)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (22-363)||(113335-113676)
scaffold0029 (61-357)||(95230-95526)
scaffold0029 (29-358)||(109007-109336)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (21-261)||(2518-2758)
scaffold0476 (173-261)||(10195-10283)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (21-307)||(4608-4894)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (23-363)||(48396-48737)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (61-309)||(34018-34266)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (21-357)||(47906-48222)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (21-351)||(39947-40277)
scaffold0064 (158-351)||(28093-28286)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (21-363)||(421-764)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (119-363)||(6322-6566)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (135-363)||(17839-18067)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (21-206)||(89633-89818)
scaffold0001 (21-206)||(90311-90496)
scaffold0001 (122-327)||(390489-390694)
scaffold0001 (270-363)||(114961-115054)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (61-363)||(1684-1986)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (61-351)||(116133-116423)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (61-363)||(3916-4218)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (125-363)||(6960-7198)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (61-327)||(218645-218911)
scaffold0012 (61-351)||(229831-230121)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (191-363)||(882-1054)
scaffold0120 (23-169)||(742-887)
scaffold0120 (62-351)||(12846-13135)
scaffold0120 (62-327)||(6835-7097)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (120-363)||(25006-25249)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (21-186)||(2673-2838)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (23-363)||(9746-10086)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (61-363)||(17457-17759)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (61-363)||(15653-15955)
scaffold0040 (61-351)||(112716-113005)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (21-182)||(11690-11851)
scaffold0518 (218-358)||(11550-11690)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (61-353)||(14307-14599)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (61-363)||(4820-5121)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (61-303)||(17205-17447)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (61-350)||(4820-5109)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (61-351)||(3685-3975)
scaffold0023 (87-327)||(59567-59807)
scaffold0023 (62-363)||(28601-28902)
scaffold0023 (62-261)||(130985-131184)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (23-139)||(1-117)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (87-327)||(85773-86012)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (61-351)||(7119-7409)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (61-303)||(4707-4949)
scaffold0270 (61-303)||(11837-12079)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (61-363)||(39048-39350)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (61-351)||(11425-11715)
scaffold0018 (61-351)||(17617-17907)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (62-327)||(6861-7126)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (61-327)||(1295-1561)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (62-327)||(1488-1753)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (21-138)||(2042-2159)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (62-315)||(520-773)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (62-351)||(3162-3451)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (29-358)||(8147-8476)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (62-327)||(19231-19496)
scaffold0324 (62-195)||(14440-14573)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (61-351)||(31981-32271)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (62-351)||(7560-7849)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (27-327)||(50244-50544)
scaffold0081 (61-363)||(19378-19680)
scaffold0081 (61-363)||(34802-35104)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (21-116)||(1-96)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (61-327)||(6826-7092)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (61-351)||(8315-8605)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (74-261)||(6099-6286)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (61-242)||(26172-26353)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (21-122)||(6873-6974)
scaffold0117 (125-184)||(716-775)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (62-358)||(13249-13545)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (119-351)||(32859-33091)
scaffold0109 (62-351)||(9384-9673)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (119-358)||(22648-22887)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (119-261)||(2345-2487)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (119-261)||(16533-16675)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (61-186)||(18443-18568)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (61-261)||(102111-102311)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (61-327)||(1705-1971)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (61-171)||(10244-10354)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (29-358)||(7720-8049)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (62-363)||(3043-3344)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (119-355)||(1198-1434)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (21-141)||(27931-28051)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (119-350)||(2054-2285)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (119-358)||(8571-8810)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (61-327)||(3006-3272)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (61-363)||(63259-63561)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (62-351)||(3634-3923)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (140-327)||(1-188)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (119-204)||(19353-19438)
scaffold0017 (119-261)||(56895-57037)
scaffold0017 (119-261)||(196764-196906)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (25-96)||(1-72)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (61-356)||(51-346)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (60-363)||(79721-80024)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (61-204)||(162-305)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (97-184)||(8220-8307)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (119-170)||(25943-25994)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (97-184)||(32677-32764)
scaffold0021 (97-184)||(72144-72231)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (62-144)||(39132-39214)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (305-363)||(49548-49606)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (17-66)||(3456-3505)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (119-260)||(341-482)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (119-184)||(3230-3295)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (119-184)||(19002-19067)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (17-66)||(30469-30518)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (119-204)||(4639-4724)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (149-327)||(15739-15910)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (97-184)||(10249-10336)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (119-170)||(15045-15096)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (61-171)||(8365-8475)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (289-327)||(461-499)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (119-184)||(3497-3562)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (119-184)||(3161-3226)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (119-184)||(9147-9212)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (119-184)||(24349-24414)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (119-184)||(13863-13928)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (119-184)||(15611-15676)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 579 - 921
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  579 tcaaggttgatgatcagggtgttatgaggttcagaagaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 678  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  679 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 778  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  779 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaagtgggacaatatttcta 878  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 16949644 - 16949985
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16949644 tcaaggttgatgatcagggtgttttgagatttagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 16949743  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16949744 tagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccacgatttga-gaaactgttttggtggtccggtttcaagcgtgatgttgctcattttgtgtat 16949842  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16949843 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttaacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatttcta 16949942  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16949943 tggatttcgtgacgagtctaccgagcactccgagagggcatga 16949985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12456779 - 12456437
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12456779 tcaaggttgatgatcagggtgttctaaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 12456680  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  12456679 tagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagctcattttgtgtat 12456580  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12456579 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttcta 12456480  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12456479 tggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatga 12456437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 14285548 - 14285890
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14285548 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagagggaggatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 14285647  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14285648 tagcttgagtattcatcctggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcattttgtatac 14285747  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14285748 gcatacttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 14285847  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14285848 tggattttgtaacaagtttaccaaacactccgagaggacatga 14285890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14434768 - 14434426
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14434768 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 14434669  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  14434668 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatat 14434569  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14434568 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttcta 14434469  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14434468 tggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatga 14434426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 15101775 - 15102117
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15101775 tcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 15101874  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || | ||||| |||    
T  15101875 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtttcttagtttgtctat 15101974  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15101975 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttcta 15102074  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15102075 tggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagacggcatga 15102117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13666612 - 13666272
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13666612 aaggttgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagta 13666513  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  13666512 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgc 13666413  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13666412 atgtttgacttgtcagaagtcgaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgatggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 13666313  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13666312 gattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 13666272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13022434 - 13022092
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  13022434 tcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagag 13022335  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13022334 taggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgttttgaagtgtgatgttgctcagtttgtttat 13022235  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  13022234 gcttgtttgacttgtcagaagtctaatgttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 13022135  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  13022134 tggatttcgtgacgagttaaccaaacactccgagggggcatga 13022092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 69 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14130902 - 14130608
Alignment:
Q  69 ttcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaa 168  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14130902 ttcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaa 14130803  T
Q  169 gaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgca 268  Q
     || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  14130802 aaagctgttttggtggtccgttttgaagcgtgatgtcgctcattttgtatatgcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgca 14130703  T
Q  269 gggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14130702 gggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggacatga 14130608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19148288 - 19147946
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  19148288 tcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaa 19148189  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19148188 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 19148089  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  19148088 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaagtgggatagcatttcca 19147989  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  19147988 tggattttgtgacgagtttaccgaatactcctagagggtatga 19147946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20747687 - 20747345
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  20747687 tcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacataaa 20747588  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20747587 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 20747488  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  20747487 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccagaatggaagtgggatagcatttcca 20747388  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  20747387 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggtatga 20747345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12457715 - 12457375
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||  ||| ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  12457715 aaggttgatgaccaaggtgtgctgaggtttagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 12457616  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  12457615 ggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaagtgagatgttgctcagtttgtttatgc 12457516  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12457515 ttgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 12457416  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12457415 gatttcgtgacgagtttacggaacactccgagagggcatga 12457375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15341508 - 15341166
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15341508 tcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaattcacaagag 15341409  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  15341408 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcagtttgtgtat 15341309  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15341308 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 15341209  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||  || | |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15341208 tggattttatgacgagtttaccaaacaccccgagaggacatga 15341166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19613752 - 19613410
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||| | | |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19613752 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 19613653  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19613652 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 19613553  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19613552 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 19613453  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19613452 tggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatga 19613410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 49153378 - 49153036
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  49153378 tcaaagttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 49153279  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||    
T  49153278 taggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaaaagatgttgctcagtttgtttat 49153179  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49153178 gcctgtttgatttgtcagaaatccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 49153079  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49153078 tggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 49153036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 11305435 - 11305777
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  11305435 tcaaagttgatgatcaaggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 11305534  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  11305535 tagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccgatttgaaaagggatgttgctcagtttgtttat 11305634  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11305635 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 11305734  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11305735 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 11305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 11387600 - 11387942
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  11387600 tcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagccacaggag 11387699  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11387700 taacttaagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtttat 11387799  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  11387800 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcta 11387899  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     ||||||  || | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11387900 cggattttatgacgagtttaccgaatactccgatagggcatga 11387942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 14263416 - 14263758
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  14263416 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacagaaa 14263515  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14263516 tagcctaagtattcatccaggaactacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 14263615  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  14263616 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcgtggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 14263715  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    || |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14263716 tgaattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatga 14263758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Original strand, 13967845 - 13968182
Alignment:
Q  26 gttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagct 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||||| | || || |||||||||||||| |    
T  13967845 gttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcttgacagtgatgatttgaagaatttgattctcgaggagagtcacaagagtaggt 13967944  T
Q  126 tgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtg 225  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13967945 tgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctg 13968044  T
Q  226 cttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggat 325  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13968045 tttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactggaagtgggacagtatctctatggat 13968144  T
Q  326 ttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    || ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13968145 tttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 13968182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 26117779 - 26118119
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  26117779 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtaaagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 26117878  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  26117879 ggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagttcgtttatgc 26117978  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26117979 ctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatg 26118078  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26118079 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 26118119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 16071467 - 16071808
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |  ||    
T  16071467 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgatgattt-aaaaagttgattttagaggaaagccatagaag 16071565  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16071566 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatataccatgatttgaagaaattattttggtggtctaggttgaaacgtgatgttggtcagtttgtttat 16071665  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |    
T  16071666 gcatgtttgactcgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgctagagtggaagtgggacaacatttcca 16071765  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  16071766 tggattttgtgacgagtttatcgaacactcaaagagggcatga 16071808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 8211346 - 8211642
Alignment:
Q  67 tattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttg 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  8211346 tattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgattta 8211445  T
Q  167 aagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccg 266  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8211446 aagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctg 8211545  T
Q  267 cagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8211546 catggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgagacagtatctctatggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatga 8211642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 12205972 - 12206314
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  12205972 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttgattttagaagaaagtcacagaag 12206071  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  12206072 tagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtttcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgcacagtttgtatat 12206171  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || || || |    
T  12206172 gcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgttccagaatggaaatgggatagcatatcca 12206271  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||| || ||  |||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  12206272 tggactttgtaacaagtttaccaaatactctgagagggcatga 12206314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 18053125 - 18053467
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  18053125 tcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcttagaggaaagtcataagag 18053224  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18053225 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 18053324  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  18053325 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 18053424  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  18053425 tggattttgtgacgaatttaccaaacactccgaggggacatga 18053467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 23505042 - 23505384
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  23505042 tcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 23505141  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  23505142 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 23505241  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  23505242 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacgccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 23505341  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  23505342 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 23505384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15625588 - 15625298
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15625588 aatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 15625489  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || |||||  || |||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  15625488 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtaatgtggcacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtagagcatcaga 15625389  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || |||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||| | ||| || |||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  15625388 aacctgctgggttgatgacacctttaggcgtgccagagtggaaatgggatactatatccatggattttgtgacgagtttaccgaatactcc 15625298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 11771475 - 11771777
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  11771475 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 11771574  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||||||| |||    
T  11771575 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcattaga 11771674  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  11771675 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaa 11771774  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  11771775 tga 11771777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 125 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21662933 - 21662707
Alignment:
Q  125 ttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgt 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  21662933 ttgagtattcatccgggagctacaaaaatatatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgt 21662834  T
Q  225 gcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatgga 324  Q
    | || | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  |||||||||||| | |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  21662833 gtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgttgggttgttgacacctttagatgttccagagtggacgtgggatagtatatccatgga 21662734  T
Q  325 tttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  21662733 ttttgtgacgagtttgccgaatactcc 21662707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15204655 - 15204425
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| | || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||    
T  15204655 aatttgtattcctgacgatgaagagataaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccggaagctacgaagatgtatcat 15204556  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  | ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15204555 gatttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 15204456  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgt 291  Q
    | || || |||||| ||  ||| ||||||||    
T  15204455 aacctgctgggttgatggtatccttagatgt 15204425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 15153892 - 15154157
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  15153892 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtatccatccgggagctatgaagatgtatcatg 15153991  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || |||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15153992 atctgaagaatttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 15154091  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
      | || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  15154092 atctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 15154157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 321271 - 321561
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  321271 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtgatagaagtagcttgagtatccatccaggagctacgaagatgtatcat 321370  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || || || || ||||| || |  ||||| |||   || || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  321371 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattaaaacgcgatgtggcacggtttgtatatttttgtttaatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcaga 321470  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||  || ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  321471 aacctgctggtatgatgacatctttagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 321561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10872063 - 10871734
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  10872063 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 10871964  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||| | || ||    
T  10871963 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgttt 10871864  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  10871863 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 10871764  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  10871763 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 10871734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 44790553 - 44790882
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  44790553 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 44790652  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  44790653 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgtattcctgttt 44790752  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  44790753 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 44790852  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  44790853 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 44790882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6414355 - 6414246
Alignment:
Q  254 catcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccga 353  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  6414355 catcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagtatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccga 6414256  T
Q  354 gagggcatga 363  Q
    ||||||||||    
T  6414255 gagggcatga 6414246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18178810 - 18178481
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||| ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  18178810 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttga 18178711  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  18178710 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgctt 18178611  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | || ||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  18178610 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatctgccagaatggaaatgggatagtatatctatggatttt 18178511  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  18178510 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 18178481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8708673 - 8708344
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  8708673 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 8708574  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||| | || ||    
T  8708573 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtttattcctgttt 8708474  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  8708473 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 8708374  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  8708373 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8708344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9597092 - 9596796
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  9597092 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacg 9596993  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  9596992 atttaaagaagattttatggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcattagaa 9596893  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  9596892 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggactttgtgacaagtttgccgaatactcctagaggg 9596796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8199696 - 8199367
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  8199696 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 8199597  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  8199596 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 8199497  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  8199496 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 8199397  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  8199396 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8199367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13687100 - 13686803
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  13687100 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 13687001  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13687000 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcaga 13686901  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  13686900 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 13686803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 18550992 - 18551289
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| | ||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  18550992 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 18551091  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
     |||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18551092 aatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 18551191  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18551192 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 18551289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14040731 - 14040531
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||| | | ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  14040731 aatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 14040632  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  14040631 gatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattaga 14040532  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  14040531 a 14040531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14350761 - 14350561
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||| | | ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  14350761 aatttgtattccagacgctgatgagatgaagaaaatgaatcttgaagagagtcatagaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 14350662  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  14350661 gatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgatcattaga 14350562  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  14350561 a 14350561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12688568 - 12688247
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||  |||| ||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12688568 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattctagaca-tgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 12688470  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||| |  | ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  12688469 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggcctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 12688370  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  12688369 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggagtgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 12688270  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||    
T  12688269 gtgacgagtttgccgaatactcc 12688247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Original strand, 11236415 - 11236713
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11236415 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 11236514  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  11236515 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcttgttt 11236614  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
       ||||||||| || || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  11236615 agtttgtcagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattt 11236713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 11552304 - 11552633
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||||||  ||||||| ||| | || ||| ||||| | || || ||||||| |||||||||||    
T  11552304 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccatacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacaggagtagcttga 11552403  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||  | || |||||| | || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  11552404 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgattgaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 11552503  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  11552504 agtttgtcataagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggatttt 11552603  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  11552604 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 11552633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Original strand, 15160291 - 15160491
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||  ||||| | ||||| ||||| | |||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  15160291 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtatatttagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 15160390  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15160391 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcaga 15160490  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  15160491 a 15160491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 23202815 - 23203144
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||| || ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  23202815 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23202914  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || | |||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  23202915 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 23203014  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       ||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  23203015 agtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 23203114  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23203115 gtgacgagtttgccgaatactacgagaggg 23203144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 23508942 - 23509271
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||| || ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  23508942 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatatgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23509041  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || | |||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  23509042 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgttt 23509141  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       ||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  23509142 agtttgtcagaaatcgaaagtcaaacatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 23509241  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  23509242 gtgacgagtttgccgaatactacgagaggg 23509271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Original strand, 16553 - 16847
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || |    
T  16553 atttgtattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacga--atgtatcacg 16650  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16651 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 16750  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     || || ||  |  ||  ||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16751 acctgctggtataatggtatctttagatgggccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagaggg 16847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14333432 - 14333144
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || | |||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  14333432 aatttgtatcccaggcaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 14333333  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || | |||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  14333332 gatttaaagaagat-ttcttgtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 14333234  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactc 350  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  14333233 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 14333144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14955622 - 14955484
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  14955622 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 14955523  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaa 171  Q
    ||||||||    |||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  14955522 gtattcat----gagctacgaagatgtatcatgatttaaagaa 14955484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13354128 - 13354063
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  13354128 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtgg 13354063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13455725 - 13455583
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||   |||| |||||| | ||  |||||   ||  ||||| | |||||||    
T  13455725 agtagtttgagtattcatccaggagcgacgaagatgtattaggatttgaagaggttgttatggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 13455626  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13455625 atgcttgcttggtttgtcagaagtcgaaggttgaacatcagaa 13455583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23642417 - 23642359
Alignment:
Q  126 tgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  23642417 tgagtattcatccaggagcgacaaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 23642359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 27107066 - 27107131
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  27107066 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 27107131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14212652 - 14212600
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaa 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  14212652 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaa 14212600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 24098860 - 24099202
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24098860 tcaaggttgacgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 24098959  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24098960 tagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgctcattttgtttat 24099059  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24099060 gcttgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggacagtatttcta 24099159  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24099160 tggattttgtgacaagtttaccgaacactacgagagggcatga 24099202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 20939320 - 20939662
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20939320 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcagaagaagaatttgcattcctgatgatgatgatttaaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagag 20939419  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  20939420 tagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 20939519  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  20939520 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggattttatttcta 20939619  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20939620 tggattttgtgacgagtttaccgaacgctccgagagggcatga 20939662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19855405 - 19855065
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19855405 aaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagaata 19855306  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||| |||| |||||    
T  19855305 gcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagacgctgttttggtggtctgggttgaaacgggatattgctcaaattgtgtatgc 19855206  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  19855205 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttggatgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatg 19855106  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19855105 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 19855065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20295512 - 20295172
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  20295512 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagta 20295413  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  20295412 ggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 20295313  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  20295312 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggactggaagtgggacattatctctatg 20295213  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295212 gattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 20295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 19662396 - 19662740
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19662396 aaggttgatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagta 19662495  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19662496 gcttaagtattcgtccggaagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaatttgtgtatgc 19662595  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgt----gccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| | || |||||    |||||||||||||||| | || ||||     
T  19662596 atgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagagttgttgacaccgttggatgtgccggccggagtggaagtggtatagcatttt 19662695  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662696 tatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 19662740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37678182 - 37677840
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  37678182 tcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 37678083  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| | |||||||||    
T  37678082 tagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgcttagtttgtttat 37677983  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37677982 gcctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctcta 37677883  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37677882 tggattttgtaactagtttaccgaacactccgagagggcatga 37677840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Original strand, 31539260 - 31539596
Alignment:
Q  27 ttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 126  Q
    ||||||||||||||||  |||||| || | | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||    
T  31539260 ttgatgatcagggtgtgctgaggttcacaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctggaggagagtcacaagagtaggtt 31539359  T
Q  127 gagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgc 226  Q
    ||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  31539360 gagtattcacccaggggctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgt 31539459  T
Q  227 ttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatt 326  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31539460 ttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggatt 31539559  T
Q  327 tcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    | ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31539560 ttgtgacgagtttgccgaacactccgagggggcatga 31539596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21952009 - 21951678
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| | |||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21952009 aaggtggatgatcagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctaacaatgatgatttgaagaagttgatccttgaagagagtcacaagagta 21951910  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  21951909 ggttgagtattcacccgggggctacaaatatgtttcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgc 21951810  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21951809 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 21951710  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgag 354  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  21951709 gattttgtgacgagtttgccgaacactccgag 21951678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 107 - 363
Target Start/End: Original strand, 20835231 - 20835487
Alignment:
Q  107 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20835231 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 20835330  T
Q  207 ctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtg 306  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  20835331 ctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagatgtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtg 20835430  T
Q  307 ggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20835431 ggatagcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatga 20835487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 20856017 - 20856360
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20856017 tcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagattaagaggcagaatttgtattcctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagag 20856116  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgg-cttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  || |||   ||||| ||||  ||||| ||    
T  20856117 caacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctggttttaaagaaggatgtcgctcggtttgtgta 20856216  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||| | || || || || |||||||| ||||| |  ||||||    
T  20856217 tgcgtgtttcacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtggaaatgggatatcatttct 20856316  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20856317 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatga 20856360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 357
Target Start/End: Original strand, 50619541 - 50619837
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  50619541 aatttgtattccatacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 50619640  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  50619641 gatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcaga 50619740  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
    | || || ||| |  ||  ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  50619741 aacctgctgggattatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagg 50619837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20139891 - 20139590
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  20139891 atttgtattccagactatgaagaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 20139792  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  20139791 atttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtctattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaa 20139692  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcat 361  Q
     || || ||  || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| |||||| ||    
T  20139691 acctgctggtatgatggtatcattagatgtgctagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagagggaat 20139592  T
Q  362 ga 363  Q
    ||    
T  20139591 ga 20139590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16373591 - 16373378
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  16373591 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctgcgaagatgtatcat 16373492  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| ||| | ||||||| || | ||||||| || |||||||||||||    
T  16373491 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgacgtgacacaatttgtgtattcttgcttgatttttaagaagtcgaaagttgagcatcaga 16373392  T
Q  261 atcccgcagggttg 274  Q
    | || |||||||||    
T  16373391 aacctgcagggttg 16373378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21749945 - 21749713
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  21749945 agtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 21749846  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||  || ||   ||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  21749845 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctctagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 21749746  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  21749745 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 21749713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 41352927 - 41353256
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || |||  ||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  41352927 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 41353026  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  41353027 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 41353126  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  41353127 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 41353226  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  41353227 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 41353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 23197508 - 23197608
Alignment:
Q  26 gttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagct 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23197508 gttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtgacaagagtagct 23197607  T
Q  126 t 126  Q
    |    
T  23197608 t 23197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 353
Target Start/End: Original strand, 19760170 - 19760455
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||    
T  19760170 aatttgtattcctgacgacgatgagatgagaaagatgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtatccatccaggagctataaagatgtatcat 19760269  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| ||||||       || |||||||||||||    
T  19760270 gatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcaga 19760362  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccga 353  Q
    |  | |  |||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||    
T  19760363 aatctgttgggttgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgagtactccga 19760455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19107462 - 19107230
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| || |||| |||||||||||    
T  19107462 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagccacaggagtagcttga 19107363  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||  || |||||||| ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  19107362 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaagcgagatgtggcacagtttgtgtattcatgttt 19107263  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
       |||||||||||| || || |||||||||||    
T  19107262 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaa 19107230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20250862 - 20250574
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  20250862 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatg 20250763  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||  ||  |||| ||||||||||| || ||||| ||| | |  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20250762 atctaaagaagttgttttggtggt-tggactgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 20250664  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  20250663 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatacatggattttgtgacgagttttccgaatactcc 20250574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21838012 - 21837715
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  21838012 aatttgtatcccagacaatgaagagattaataagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 21837913  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  21837912 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 21837813  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  21837812 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcccagaggg 21837715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Original strand, 22361542 - 22361831
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  || | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  22361542 atttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagaaacttgagtattcatccgggagctacgaagatctatcatg 22361641  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || ||||| || || |||||  | ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22361642 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcatagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 22361741  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  22361742 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 22361831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22110084 - 22109872
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  22110084 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccac 22109985  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| ||| | || |||| |||| ||||||  || ||||||||||| |    
T  22109984 gatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatcaaa 22109885  T
Q  261 atcccgcagggtt 273  Q
    | || ||||||||    
T  22109884 aacctgcagggtt 22109872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22113933 - 22113721
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  22113933 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcacccgggagctacgaagatgtaccac 22113834  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| ||| | || |||| |||| ||||||  || ||||||||||| |    
T  22113833 gatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgttagaagttgaaagttgagcatcaaa 22113734  T
Q  261 atcccgcagggtt 273  Q
    | || ||||||||    
T  22113733 aacctgcagggtt 22113721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 16349896 - 16350193
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  16349896 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 16349995  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16349996 gatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 16350095  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  16350096 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagaggg 16350193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 361
Target Start/End: Original strand, 22432600 - 22432713
Alignment:
Q  248 gttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaaca 347  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  22432600 gttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccaaaca 22432699  T
Q  348 ctccgagagggcat 361  Q
    ||||||||||||||    
T  22432700 ctccgagagggcat 22432713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 51332758 - 51333087
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  51332758 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 51332857  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  51332858 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 51332957  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  51332958 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 51333057  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  51333058 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 51333087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Original strand, 33390326 - 33390526
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  33390326 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccat 33390425  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   ||| |||||||| || |||||||||||||    
T  33390426 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgccagaagtcgaaagttgagcatcaga 33390525  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  33390526 a 33390526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21831397 - 21831068
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| |  |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  21831397 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 21831298  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  21831297 gtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 21831198  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  21831197 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 21831098  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  21831097 gtgacgagttttccaaatactcctagaggg 21831068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Original strand, 17044313 - 17044609
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |    
T  17044313 atttgtattcccgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacg 17044412  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| |  ||||| ||  | ||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17044413 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacaagatgtggcaaagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaa 17044512  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||| |||||||    
T  17044513 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcagagaggg 17044609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 16078011 - 16078250
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || | |||||| || |||||  ||||||| || || ||||| |    
T  16078011 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgt 16078110  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  16078111 attcctgtttagtctgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 16078210  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16078211 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 16078250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 20830747 - 20830812
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  20830747 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 20830812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Original strand, 20835159 - 20835208
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcc 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  20835159 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcc 20835208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21025177 - 21025092
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || |||||    
T  21025177 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgt 21025092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 31416102 - 31416444
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31416102 tcaaggttgatgatcagggcgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 31416201  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31416202 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtttat 31416301  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31416302 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttcta 31416401  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416402 tggattttgtgacgagtttaccgagcactccgagagggcatga 31416444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1267391 - 1267062
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1267391 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 1267292  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1267291 tagcttgagtattcatccaggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcccattttgtgtat 1267192  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  1267191 gcatgtttgactttccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttcta 1267092  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactc 350  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  1267091 tggatttcgtgacgagtttaccaaacactc 1267062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23656078 - 23655738
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  23656078 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaggtcacaagagta 23655979  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23655978 gcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgttgctcagtttgtttatgc 23655879  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  23655878 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttattaacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacaacatttccatg 23655779  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23655778 gattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 23655738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 20009548 - 20009889
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20009548 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcttgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 20009647  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20009648 tagcttaagtattcatccaggagctacaaatatgtatcatgatttgaagaaattattttggtggtcc-gtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 20009746  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  20009747 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 20009846  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  20009847 tggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggaatga 20009889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 16270854 - 16271194
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  16270854 aaggttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 16270953  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  16270954 ggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 16271053  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16271054 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 16271153  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16271154 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 16271194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19852564 - 19852222
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19852564 tcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 19852465  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  19852464 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgctcagtttttttat 19852365  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  19852364 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtggaagtgggacagcatttcca 19852265  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852264 tggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatga 19852222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19858600 - 19858258
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19858600 tcaaggatgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 19858501  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  19858500 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgctcagtttttttat 19858401  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  19858400 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttcgatgtgccagagtggaagtgggacagcatttcca 19858301  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| | | | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858300 tggattttgagacgagtttgccgaatactccaagagggcatga 19858258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21841570 - 21841228
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21841570 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 21841471  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  21841470 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctatgtttgtttat 21841371  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  21841370 gcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 21841271  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21841270 tggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagagggcatga 21841228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12305909 - 12305569
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||    
T  12305909 aaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagatgaagagtatgcattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattcttgaagagagtcataagagta 12305810  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12305809 ggttgagtattcacccgggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaattgtgatgttgctcagtttttttatgc 12305710  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || || | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12305709 ttgttttatttgtcagaagtctaaggttgatcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 12305610  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12305609 gatttcgtgacgaccttaccgaacactccgagagggtatga 12305569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6604811 - 6604469
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||  | | | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  6604811 tcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 6604712  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  6604711 taggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 6604612  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6604611 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 6604512  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6604511 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 6604469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6680264 - 6679922
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||  | | | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  6680264 tcaaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaggggtagagtctgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 6680165  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  6680164 taggttgagtattcacccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 6680065  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6680064 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcatgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 6679965  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6679964 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 6679922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14566290 - 14565953
Alignment:
Q  26 gttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagct 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| ||||| |    
T  14566290 gttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaaaagtaggt 14566191  T
Q  126 tgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtg 225  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14566190 tgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctg 14566091  T
Q  226 cttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggat 325  Q
     || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14566090 tttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatggat 14565991  T
Q  326 ttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14565990 tttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 14565953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 803301 - 803643
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||    
T  803301 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattctagaggagagtcacaagag 803400  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||| | || ||||||    
T  803401 taggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgttgctaagttcgtttat 803500  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  803501 gcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 803600  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  803601 cggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 803643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20389252 - 20388910
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  20389252 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacatacg 20389153  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20389152 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttagtggtccggattgaagcgtgatgttgtacagtttgtatat 20389053  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || || |    
T  20389052 gcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaaatgggatagcatatcca 20388953  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20388952 tggattgtgtgacaagtttaccgaatactccgagagggcatga 20388910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 20975279 - 20975621
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20975279 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 20975378  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  20975379 tagcttgagtattcatacgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaggaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtatat 20975478  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20975479 gcatgtttgacttgctagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggatagcatttcta 20975578  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  20975579 tggattttgtgacgaatttaccacatactccgagagggcatga 20975621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22052016 - 22051682
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22052016 tcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 22051917  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||    
T  22051916 taggttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttatgtat 22051817  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22051816 gcatgtttgacttgctagaagtctaacattgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 22051717  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgaga 355  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22051716 tggattttgtgacaagtttactaaacactccgaga 22051682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22372093 - 22371751
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||| ||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  22372093 tcaaggttgatgatctgtgtgtgttgaggttcagaggaagaatattcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattatagaagaaagtcacagaag 22371994  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  22371993 tagcttaagtattcacctgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccagattgaaacatgatgttgctcagtttgtttat 22371894  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  22371893 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcctgagtggaagtgggacaacatttcca 22371794  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22371793 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatga 22371751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27355698 - 27355359
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||   ||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  27355698 aaggttgatgatcagggtgtactgagattcagagggagagtttgtattcctgacagcgatgagttgaagg-gttgattcttgaagatagtcacaagagta 27355600  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  27355599 gattgagtatacacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 27355500  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27355499 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggtttttgacaccgttagatgtactggagtggaagtgggacagtatctctatg 27355400  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27355399 gattttgtgacgaatttaccgaacactccgagagggcatga 27355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 29303056 - 29303396
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||    
T  29303056 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagatgaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaaattgattcttgtagagagtcacaagagta 29303155  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29303156 ggttgagcattcacccgggggctacaaagatgtatcatgatttgaaggaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgctcagtttgtgtatgc 29303255  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||  ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29303256 atgtttgactttccagaagtctaaagtggaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatg 29303355  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| | | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  29303356 gatttcgtgacgaatttaccaaacacttcgagagggcatga 29303396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 31570470 - 31570812
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  31570470 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 31570569  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  31570570 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 31570669  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  31570670 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 31570769  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  31570770 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 31570812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 362
Target Start/End: Original strand, 20395800 - 20396094
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20395800 aatttatattcccgacaatgatgagataaagaagatgattcttgaagaaagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 20395899  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||| | || |||| ||||||       || |||||||||||||    
T  20395900 gatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtttattcatgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcaga 20395992  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20395993 aacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagagggca 20396092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23950029 - 23949730
Alignment:
Q  64 ttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgat 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  23950029 ttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagacgattcttgaagagagtcacataagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgat 23949930  T
Q  164 ttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatc 263  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || |||||  ||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  23949929 ttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaaagtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagtcgagcatcagaaac 23949830  T
Q  264 ccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
      || |||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  23949829 ttgctgggttgatgatatctttagatgtgccaaagtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccaagagggaatga 23949730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 20985175 - 20985340
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  20985175 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctaaaaatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaag 20985274  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    || ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20985275 tatcttaagtattcacccgagagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtc 20985340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Original strand, 22248085 - 22248351
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  22248085 aatttgtattcctgacattgacgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgtgtattcatccgggagctacgaggatgtatcat 22248184  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  22248185 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcaga 22248284  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || ||||||||| | ||| | |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  22248285 aacctgcagggttgataacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattt 22248351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 345
Target Start/End: Original strand, 21921405 - 21921688
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| | || ||  ||||| | ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21921405 atttgtattcaagacgatgatgagataaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacg 21921504  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21921505 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcaaaggttgagcatcagaa 21921604  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaa 345  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || |||||||| ||| | ||||| |||||    
T  21921605 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggataatatatccatggattttgtgacgagtttgccgaa 21921688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 301
Target Start/End: Original strand, 22377122 - 22377362
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22377122 aatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 22377221  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  ||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||| || || |  |||||||||||||    
T  22377222 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcaga 22377321  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtgg 301  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| || ||||||    
T  22377322 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgg 22377362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 301
Target Start/End: Original strand, 22383297 - 22383537
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22383297 aatttgtattcctaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 22383396  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  ||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||| || || |  |||||||||||||    
T  22383397 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcataaatcaatagttgagcatcaga 22383496  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtgg 301  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| || ||||||    
T  22383497 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtgg 22383537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 19483700 - 19484029
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || |||  ||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  19483700 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 19483799  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  19483800 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 19483899  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  19483900 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 19483999  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19484000 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 19484029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19979080 - 19978778
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  19979080 aatttgtattcttgacaatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 19978981  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || || || |||||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19978980 gatctaaagaagatattctggtggtctggattaaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 19978881  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  19978880 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgatgagtttgccgaatactcctagagggaa 19978781  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  19978780 tga 19978778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21043557 - 21043268
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |  |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  21043557 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcatg 21043458  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | || ||||| |||||||| ||| | || |||  ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21043457 atttaaagaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 21043358  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  ||  |   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  21043357 acctgctggtatgacggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 21043268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22988309 - 22988109
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||    
T  22988309 aatttctattccttacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcat 22988210  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||| | || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  22988209 gatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatatggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 22988110  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  22988109 a 22988109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Original strand, 22061246 - 22061397
Alignment:
Q  206 gctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagt 305  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |    
T  22061246 gctcagtttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgaacatcagaagcctgcagggttattgacaccgttggatgtaccggagtggaaat 22061345  T
Q  306 gggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
    |||| || |||||||||||||| |||   |||||||| |||||| |||||||    
T  22061346 gggatagcatttctatggattttgtgatgagtttaccaaacactacgagagg 22061397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 17673691 - 17673988
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17673691 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccat 17673790  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  17673791 gattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 17673890  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  17673891 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 17673988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18857722 - 18857393
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || |||  ||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  18857722 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaaggatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttga 18857623  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||  | || ||    
T  18857622 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtactcctgttt 18857523  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||| ||||| || ||||||||| |||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  18857522 agtttgtcaaaagtcgaaagttgagcattagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 18857423  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18857422 gtgacaagtttgccgaatactcctagaggg 18857393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 21393534 - 21393799
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  |  ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||    
T  21393534 atttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatg 21393633  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21393634 atctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgccagaagtcgaaggttgagcatcagaa 21393733  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||  |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  21393734 acctgctggtatgatggtatggttagatgtgccatagtggaaatgggatagtatatccatggattt 21393799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 21788028 - 21788293
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  |  ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||    
T  21788028 atttgtattcctgacgatgatgagatgaaggaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccaggagctacgaagatgtgtcatg 21788127  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21788128 atctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgccagaagtcgaaggttgagcatcagaa 21788227  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||  |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  21788228 acctgctggtatgatggtatggttagatgtgccatagtggaaatgggatagtatatccatggattt 21788293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23651096 - 23650900
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  23651096 agtatcttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 23650997  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
    || | || | || |||||||||||| || |||||||||||||| |  || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23650996 attcttgttggatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtat 23650900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21252056 - 21251788
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaa---agatgtacc 158  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || ||||  |||| | ||||||||||||||||||| || |   ||||||| |    
T  21252056 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccacagaagtaacctgagtattcatccgggagctacgacgaagatgtatc 21251957  T
Q  159 atgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 258  Q
    ||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||| | || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21251956 atgatctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttacacagtttgtatattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatca 21251857  T
Q  259 gaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || ||||||||    
T  21251856 gaaacctgctggtgtgatggtatcgttagatgtgccagattggaaatgggatcgtatatccatggattt 21251788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19113803 - 19113506
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  19113803 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 19113704  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  19113703 gatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 19113604  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  19113603 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagaggg 19113506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 22132767 - 22133006
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||      
T  22132767 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtga 22132866  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  22132867 attcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 22132966  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| |||   ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22132967 catggattttgtgatgagttttccgaatactcctagaggg 22133006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 21166206 - 21166508
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  21166206 aatttgtattcccaacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 21166305  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || ||||||||  | ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  || ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21166306 gatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttatcagaagtcgaagattgaacatcaga 21166405  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    |  |||| ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  21166406 aatccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 21166505  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  21166506 tga 21166508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Original strand, 30312813 - 30313109
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  30312813 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacg 30312912  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30312913 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaagagatgtggcacagtttgtctattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 30313012  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||| | || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  30313013 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgtcagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 30313109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22040914 - 22040675
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  22040914 agtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 22040815  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||  | || ||  || ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  22040814 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaatctgctggtatgatggtatctttagatgtgccggaatggaaatgggatagtatatc 22040715  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  22040714 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22040675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32601199 - 32600960
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| | || ||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |    
T  32601199 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatataaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgt 32601100  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||    
T  32601099 attcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgagatagtatatc 32601000  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  32600999 catggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 32600960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 261
Target Start/End: Original strand, 22128594 - 22128826
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||  | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||| ||||    
T  22128594 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagatattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagtttga 22128693  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  22128694 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22128793  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
       ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22128794 agtttgtcagaaatcaaaagttgagcatcagaa 22128826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25283433 - 25283346
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||  || |||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  25283433 gattttggaagaaggtcacaagagtagtttaagtattcatctaggagtgacgaagatgtatcaggatttgaagaaattgttttggtgg 25283346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22316246 - 22316181
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  22316246 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagagattgttttggtgg 22316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 22623558 - 22623637
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttg 166  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22623558 tgaaaaagatgattctggaaaaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttg 22623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25283207 - 25283120
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  25283207 gattttggaagaaggtcacaggagtagtttaagtattcatctaggagcgacgaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtgg 25283120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Original strand, 23156716 - 23156789
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaaga 170  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  23156716 gattttggacgaaggtcataagagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaaga 23156789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15534438 - 15534191
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgattt-gaagaaa--ctgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||   | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  |||| |    
T  15534438 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttagaaaaaaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcataattcg 15534339  T
Q  216 tttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
    | ||| | || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  |||  |||||||||| || ||||| || || |||||    
T  15534338 tgtattcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctctagatgtgccagaatggaaatgcgatagtat 15534239  T
Q  316 ttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  15534238 atccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 15534191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 23886137 - 23886082
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcaca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||    
T  23886137 aatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcaca 23886082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 358
Target Start/End: Original strand, 16407885 - 16408011
Alignment:
Q  232 ttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtg 331  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||  || ||  ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  16407885 ttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagacgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtg 16407984  T
Q  332 ccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16407985 acgagtttgccgaatactcctagaggg 16408011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 327
Target Start/End: Original strand, 22366561 - 22366599
Alignment:
Q  289 tgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22366561 tgtgccggagtggaagtgggatagtatttcgatggattt 22366599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 315
Target Start/End: Original strand, 12274442 - 12274611
Alignment:
Q  146 acaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtcta 245  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| |    
T  12274442 acaaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcga 12274541  T
Q  246 aggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  12274542 aagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtat 12274611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 16407714 - 16407815
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  16407714 atttgcattcctgacgatgaagagatgaataaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaagatgtatcatg 16407813  T
Q  162 at 163  Q
    ||    
T  16407814 at 16407815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 16876821 - 16876886
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  16876821 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 16876886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 21196228 - 21196293
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  21196228 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagatgttgttttggtgg 21196293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Original strand, 21850063 - 21850112
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21850063 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaa 21850112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 171
Target Start/End: Original strand, 22119904 - 22119952
Alignment:
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaa 171  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  22119904 gcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaa 22119952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 13089 - 13431
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13089 tcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 13188  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13189 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtat 13288  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13289 gcatgtttgacttgtcacaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttagatgtgccggagtggaagtgggacaatatttcta 13388  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13389 tggattttgtaacaagtttaccgaacactccgagagggcatga 13431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 4143 - 4483
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4143 aaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagaggaaagtcacaagagta 4242  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4243 gcttaagtattcattcgggagctacaaagatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgtatgc 4342  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4343 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 4442  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4443 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 4483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 68488 - 68146
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  68488 tcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagag 68389  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||    
T  68388 taacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgtttttgtggtctggtttgaagagggatgtcgctcagtttgtgtat 68289  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| | || ||||| | ||||||||| |||||||  |||||||    
T  68288 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctacagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaaatgggacaacatttcta 68189  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  68188 tggactttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatga 68146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20512 - 20170
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20512 tcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagag 20413  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20412 tagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgtat 20313  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20312 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 20213  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20212 tggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatga 20170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23332 - 22990
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23332 tcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcataggaagaatttgtattcctgagaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagag 23233  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23232 tagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaatctgttttggtggtccggtttaaagcgtgatgttgctcagtttgtgtat 23133  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23132 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 23033  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23032 tggatttcgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatga 22990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 24619662 - 24620004
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24619662 tcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 24619761  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  24619762 tagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 24619861  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24619862 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacattatttcta 24619961  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24619962 tggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatga 24620004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 24715893 - 24716235
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24715893 tcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 24715992  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  24715993 tagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 24716092  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24716093 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacattatttcta 24716192  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24716193 tggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatga 24716235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 24748921 - 24749263
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24748921 tcaaggttgatgttcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 24749020  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  24749021 tagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 24749120  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24749121 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcccgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaaatgggacattatttcta 24749220  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24749221 tggatttcgtgacgagtttagcaaacactccgagagggcatga 24749263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 23079456 - 23079798
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  23079456 tcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaaaag 23079555  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||    
T  23079556 tagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgcgacgtagctcagtttgtgtat 23079655  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23079656 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtcggacaatatttcta 23079755  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23079756 tggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 23079798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 22235289 - 22235629
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22235289 aaggtcgatgatcaggatgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcatgataatgaagagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagta 22235388  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  22235389 gcttaagtattcatctgggagctacaaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgc 22235488  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22235489 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttctatg 22235588  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22235589 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 22235629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25849074 - 25848734
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||    
T  25849074 aaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgatgatagtcataagagta 25848975  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  25848974 ggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 25848875  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25848874 ctgtttgaattgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 25848775  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25848774 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagagcatga 25848734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 21890126 - 21890468
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    
T  21890126 tcaaggttggtgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgagtttggaagaaagccacaaaag 21890225  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  21890226 tagctttagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttat 21890325  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  21890326 gcatgttcgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 21890425  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||  || |||||||||||||||||    
T  21890426 tggattttgtgacgagtttacaaaatactccgagagggcatga 21890468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20343281 - 20342941
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  20343281 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 20343182  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  20343181 ggttgagtattcacccgggggctacaaaaatataccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 20343082  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20343081 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggacgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 20342982  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20342981 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 20342941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 24797764 - 24798106
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  24797764 tcaaagttgatgatcaaggtgttttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 24797863  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  24797864 taggttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 24797963  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  24797964 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcca 24798063  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24798064 tggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatga 24798106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22503678 - 22503338
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||    
T  22503678 aaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtatgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagta 22503579  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  22503578 ggttgagtattcagcccggggctactaaaatgtaccatgatttgaagaaactattttagtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 22503479  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| || | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503478 ttgcttaatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtatcggagtggaagtgggacagtatttctatg 22503379  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22503378 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgaaagggcatga 22503338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21497074 - 21496783
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21497074 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataaggatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 21496975  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21496974 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacctgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 21496875  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacag 312  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21496874 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgagacag 21496783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 14886358 - 14886700
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  14886358 tcaaagttgatgatcagggggtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 14886457  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  14886458 taggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 14886557  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  14886558 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcca 14886657  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14886658 tggattttgtaacgagtttaccgaacacttcgaaaggacatga 14886700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 37542748 - 37543090
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | |||||||||||||||| || |||||||| || |||||| | || || |||||||||||    
T  37542748 tcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaacgaagagttgaagaaattgattcttgaggagagtcacaagag 37542847  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  37542848 taggttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtatgaaaagggatgttgctcagtttgtttat 37542947  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  37542948 gcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccagagtggaagtgggacattatctcta 37543047  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543048 tggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 37543090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 17268701 - 17269043
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  17268701 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcacaagag 17268800  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  17268801 tagcttgagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgtcgctcattttgtgtat 17268900  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  17268901 gcatgtttaacttgccagaagtctaaggttgaccatcagaaacctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttcta 17269000  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17269001 tggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatga 17269043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 21831128 - 21831470
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | || | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21831128 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattctgaggcagaatttgtatccctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaag 21831227  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  21831228 tagtttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaagcgtgatgttgcacagtttgtatat 21831327  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||| || || || || || |  |    
T  21831328 gcatgtttgatttgtcaaaaatctaaagttgaacatcagaagcctactgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtgaaaatgagatagcatatgca 21831427  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21831428 tggattttgtaacaagattaccgaatactccgagagggcatga 21831470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 309
Target Start/End: Original strand, 21680145 - 21680433
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||| | | |||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21680145 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 21680244  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21680245 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 21680344  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtggga 309  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21680345 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatggga 21680433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 61 - 360
Target Start/End: Original strand, 21563380 - 21563679
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  21563380 aatttgtattccttataattatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcat 21563479  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  21563480 gacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgccataaatctaaagttgaacatcaga 21563579  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | |  |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21563580 aacttgttgggttgttgacaccattggatgtgccggagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacaagtttaccgaatactccaagagggca 21563679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20822414 - 20822112
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| |||    
T  20822414 aatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcat 20822315  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| || |  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20822314 gacttgaagaagttgttttggtggtccggattgaagaaggatgtcgcacggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcaga 20822215  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
      || || || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  20822214 ggcctgcgggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacctaatactccgagaggaca 20822115  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  20822114 tga 20822112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22462913 - 22462611
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  22462913 aatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttggaagaaagtcataagagcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcat 22462814  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || |||||||| |||||||||||||| || ||||||   | ||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22462813 gacttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagaaggctgtcgctcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 22462714  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
      || ||||| ||||||||| | || || || || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22462713 ggcctgcaggtttgttgacaccgttggaggtaccagagtggaaatgggatatcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggca 22462614  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  22462613 tga 22462611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 28894309 - 28894651
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28894309 tcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagag 28894408  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| |||    
T  28894409 caacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtat 28894508  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28894509 gcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 28894608  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28894609 tggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatga 28894651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 28915780 - 28916122
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28915780 tcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagag 28915879  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| |||    
T  28915880 caacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtat 28915979  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28915980 gcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 28916079  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28916080 tggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatga 28916122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 28923135 - 28923477
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28923135 tcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaactgaagaagttgattttagaagaaggtcataagag 28923234  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| |||    
T  28923235 caacttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtat 28923334  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28923335 gcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 28923434  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  28923435 tggattttgtgacaagtttgcctaatactccgagaggacatga 28923477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20774760 - 20774418
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20774760 tcaaggttgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtatccctgacaatgaggaattgaagaagttgattttagaagaaggtcataagag 20774661  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     | |||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| |||    
T  20774660 caacttgagtattcacctgggagctacaaaaatgtatcaagacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtat 20774561  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20774560 gcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 20774461  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20774460 tggattttgtgtcaagtttacctaatacttcgagaggacatga 20774418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 351
Target Start/End: Original strand, 20467502 - 20467794
Alignment:
Q  59 aaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtacc 158  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20467502 aaaatttgtattcctgatgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtaacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatc 20467601  T
Q  159 atgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatca 258  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||| | ||||| || ||||||||| |    
T  20467602 atgatttgaagaagttggtttggtggtcggggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtttgatttgttaaaagtcaaaagttgagcatta 20467701  T
Q  259 gaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||| || || |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  20467702 gaaacctgctgggttgatgacatctttagaagtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 20467794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 26738134 - 26738424
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||    
T  26738134 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaaaatgtatcat 26738233  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26738234 gatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 26738333  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||| || ||  ||| |||||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  26738334 aacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgtgatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 26738424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21408091 - 21407827
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  21408091 tgaaaaagatgattctagaacaaagtcacagaagtaatttgagtattcatgcaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaatttattttggtggtc 21407992  T
Q  187 cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta 286  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| || ||||| || |  || ||||||||| | |||    
T  21407991 cgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcaaaagttgaacaccagaaacctgttggtttgttgacaccttta 21407892  T
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||| | || |||||||||||||| | ||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  21407891 gatattccagagtggaagtgggataatatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcc 21407827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27611333 - 27611036
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  27611333 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 27611234  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  27611233 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 27611134  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27611133 aacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27611036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23472208 - 23471918
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| | | | |  |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  23472208 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatttatagaagtagcttaagtattcatccgggagctagaacgatgtatcat 23472109  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  | || || ||| | || ||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  23472108 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgttatgtggcatagttggtatattcctgtttgatatgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 23472009  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || ||||||||| | ||| | |||||| | ||  ||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  23472008 aacctgcagggttgataacacctttagatataccatagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 23471918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19770939 - 19770642
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  19770939 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 19770840  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  19770839 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 19770740  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  19770739 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccaaatactccgagaggg 19770642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22349402 - 22349105
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  22349402 aatttgtattctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacgggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 22349303  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  22349302 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 22349203  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22349202 aacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 22349105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25424166 - 25423878
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  25424166 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaa-ttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 25424068  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25424067 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 25423968  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  25423967 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgtcagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 25423878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23441131 - 23440887
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| |    
T  23441131 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtagcacaatttgtgt 23441032  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  23441031 attcttgtttagtttgtcataagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 23440932  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  23440931 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcctagagggaatga 23440887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16357513 - 16357184
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16357513 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16357414  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16357413 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16357314  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  16357313 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 16357214  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16357213 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16357184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27519418 - 27519089
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  27519418 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 27519319  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  27519318 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27519219  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  27519218 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 27519119  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27519118 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27519089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34567505 - 34567176
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  34567505 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 34567406  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  34567405 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 34567306  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  34567305 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 34567206  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  34567205 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 34567176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41771853 - 41771524
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  41771853 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 41771754  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  41771753 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 41771654  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  41771653 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 41771554  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  41771553 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 41771524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 14999146 - 14999443
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  14999146 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 14999245  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14999246 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtctaaagttgagcatcaga 14999345  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  14999346 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 14999443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Original strand, 21338704 - 21338993
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  21338704 aatttgtattctagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcat 21338803  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| || ||||| |||||||| || || || || ||| | || || | |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21338804 gatttgaagaagttgttttcgtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcttgtttaatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcaga 21338903  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactc 350  Q
    | ||  | ||| || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  21338904 aacctacggggatgatggtatctttagatgtgccagattggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactc 21338993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 29475448 - 29475777
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29475448 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 29475547  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | |  |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  29475548 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagatttcctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcatgttt 29475647  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  29475648 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 29475747  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  29475748 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 29475777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22135646 - 22135350
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22135646 atttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattctagaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 22135547  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| || | ||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22135546 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgaggtgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaaa 22135447  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     ||  | ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22135446 acctactggagtgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 22135350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23574658 - 23574414
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  23574658 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 23574559  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  23574558 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 23574459  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  23574458 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 23574414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 22332262 - 22332591
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  22332262 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 22332361  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  22332362 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaataagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 22332461  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       ||| ||||| || || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  22332462 agtttgccagaaatcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccggaatggaagtgggatagtatatccatggatttt 22332561  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  22332562 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22332591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40709791 - 40709462
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  40709791 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 40709692  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  40709691 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 40709592  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  40709591 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 40709492  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  40709491 gtgacgagtttgcctaatactcctagaggg 40709462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 27684807 - 27685104
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  27684807 aatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 27684906  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27684907 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtctaaaattgagcatcaga 27685006  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  27685007 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 27685104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20800427 - 20800125
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  20800427 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacctgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 20800328  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||| ||| ||| || | ||| |||    
T  20800327 gatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaggtcgaagattaaacattaga 20800228  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |  |||||||||| ||||| |||||| |    
T  20800227 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgcgtttaccgaatactcctagagggaa 20800128  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  20800127 tga 20800125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 27667897 - 27668194
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||    
T  27667897 aatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcat 27667996  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  27667997 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 27668096  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | ||||| |||||  | ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  27668097 aacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccaaaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 27668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18776748 - 18776452
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  18776748 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacg 18776649  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||  || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18776648 atttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 18776549  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     || || ||  || ||  ||| |||||||||||| | ||||  || || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18776548 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccgaaatggatatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 18776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 37290961 - 37291200
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  | ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  37290961 agtagcttgagtattcatccgggagccacgaagatgtatcatgatttgaagaagattttctggtggtctagtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 37291060  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||    ||||||||||  || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  37291061 attcctgtttagtctgtcagaagtagaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 37291160  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||||    
T  37291161 catggattttgtgacgagtttgccaaacactcctagaggg 37291200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22381908 - 22381858
Alignment:
Q  313 tatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22381908 tatttctatggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 22381858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23517505 - 23517394
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||    
T  23517505 aatttgtattcctaaagatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctatgaagatgtatcat 23517406  T
Q  161 gatttgaagaaa 172  Q
    ||| ||||||||    
T  23517405 gatctgaagaaa 23517394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23504345 - 23504280
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  23504345 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 23504280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24582113 - 24582048
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  24582113 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 24582048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 249731 - 249389
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  249731 tcaaggttgatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagag 249632  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  249631 tagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcattttgtatat 249532  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  249531 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtcgaagtgggacagtatttcta 249432  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  249431 tggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 249389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42035 - 41693
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42035 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtccagaggaagaatttgtattcctaataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 41936  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  41935 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 41836  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41835 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatatgccggagtggaagtgggatagcatttcta 41736  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41735 tggatttcgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatga 41693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 56088 - 56430
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56088 tcaaggtggatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 56187  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  56188 tagcttgagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgaagttgctcagtttgtgtat 56287  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  56288 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttcta 56387  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  56388 tggatttggagccaagtttaccaaacacttcgagagggtatga 56430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 32865 - 33207
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||| | | |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32865 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 32964  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32965 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 33064  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33065 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 33164  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  33165 tggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatga 33207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41278 - 41213
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  41278 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 41213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 10468179 - 10468521
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10468179 tcaaagttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagag 10468278  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10468279 taggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcatgatgttgctcagtttgtttat 10468378  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10468379 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 10468478  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10468479 tagatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 10468521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25769142 - 25768800
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  25769142 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaag 25769043  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25769042 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgattttaagaaattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtttat 25768943  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25768942 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacagtatttcca 25768843  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  25768842 tggattttgtgacgagtttaccgaatacttcgaggggacatga 25768800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 363
Target Start/End: Original strand, 14380805 - 14381139
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14380805 gatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttga 14380904  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  14380905 gtgttcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgtatgcatgttt 14381004  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  14381005 gacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgagatagcatttctatggatttt 14381104  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14381105 gtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 14381139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19435953 - 19435653
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19435953 tcaaggtggatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaataaagtcacaagag 19435854  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  19435853 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcagtttatgtat 19435754  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435753 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttcta 19435654  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  19435653 t 19435653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 5296536 - 5296878
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5296536 tcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagttacaagag 5296635  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  5296636 tagcttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 5296735  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5296736 gcatgcttgacttatcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 5296835  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5296836 tggattttgtgactagtttaccaaacactccgagagggcatga 5296878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 8762263 - 8762605
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8762263 tcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaataaagtcacaaaag 8762362  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  8762363 tagcttgagtattcacccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 8762462  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||   |||| ||    
T  8762463 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacgacatttata 8762562  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8762563 tggattttgtgacgagtttaccgaacactcagagagggcatga 8762605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18795641 - 18795299
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| |||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18795641 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggtagaatttgtattccggacaatgatgagttgaaaaagttgatcttggaagaaagtcacaagag 18795542  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18795541 tagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 18795442  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||    
T  18795441 gcgtgtttgacttgccagaagtctaaggtcgagcatcagaagcctgcagggttgttgataccattagatgttccagagtggaagtgggacaacatttcta 18795342  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  18795341 tggattttgtgacaattttaccaaacactccgaggggacatga 18795299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21472552 - 21472210
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21472552 tcaaggttgatgatcagggcgtgttgaggttcagaggaataatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 21472453  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  21472452 cagcttaagtattcacccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 21472353  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  21472352 gcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcca 21472253  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    || |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21472252 tgaattttgcgacgagtttaccgaatactccaagagggcatga 21472210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19454369 - 19454029
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  19454369 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgacgagttgaaaaaattgattttcgaggaaagtcacaagagta 19454270  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19454269 acttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtaacatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttgtgtatgc 19454170  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  19454169 atgtttgacttgttagaagtctaaggttgaacatcagaagtctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaattgggatatcatttctatg 19454070  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454069 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 19454029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24365361 - 24365021
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  24365361 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaatagta 24365262  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||    
T  24365261 ggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagttcgtttatgc 24365162  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24365161 ctgtttgatctgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatatctatg 24365062  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24365061 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 24365021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 34644916 - 34645258
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | | |||||| |||||||| || |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  34644916 tcaaggttgatgaacacggtgtgttgagattcagaggcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaagattgattttggaagaaagtcacaagag 34645015  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34645016 tagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtaccacgacttgaaaaagctgttttggtgggttggtttgaagcgtgatgttgctcagtttgtatat 34645115  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34645116 gcgtgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 34645215  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34645216 tggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatga 34645258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19880249 - 19879916
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19880249 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctaacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagccacaagag 19880150  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19880149 tagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttagtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 19880050  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  19880049 gcctgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttcta 19879950  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgag 354  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  19879949 tggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgag 19879916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 21563502 - 21563804
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || ||||||||||| || |||||||| |||    
T  21563502 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccgggagctacgaagatgtatcat 21563601  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21563602 gacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcaga 21563701  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21563702 agcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggaca 21563801  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  21563802 tga 21563804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 21569361 - 21569663
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||| || || ||||||||||| || |||||||| |||    
T  21569361 aatttgtattcctgataatgatgagttgaaacagttaattttagaggaaagccacaggagtaacttaagcatccatccgggagctacgaagatgtatcat 21569460  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21569461 gacttgaagagattgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtatgcatatttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcaga 21569560  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21569561 agcttgcagggttgttgacatcgttggatgtgccggagtggaaatgggataacatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgagaggaca 21569660  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  21569661 tga 21569663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 28282143 - 28282485
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  28282143 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 28282242  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  28282243 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 28282342  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  28282343 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 28282442  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  28282443 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 28282485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 315
Target Start/End: Original strand, 19488605 - 19488896
Alignment:
Q  24 aggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtag 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | | || | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19488605 aggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaattcgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaagtag 19488704  T
Q  124 cttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcg 223  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||     
T  19488705 cttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgca 19488804  T
Q  224 tgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
    || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19488805 tgtttgatttgtcagaaatctaaagttgatcattagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaaatgggatagtat 19488896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15460247 - 15459951
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||    
T  15460247 aatttgtattcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcat 15460148  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| || |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15460147 gacttgaagaagttgttttggtggtctggattgaagaaggatgtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatcaga 15460048  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
    | || ||||| ||||||||| | || ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||    
T  15460047 agcctgcaggattgttgacaccgttggatataccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagg 15459951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Original strand, 22796132 - 22796304
Alignment:
Q  191 ttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatg 290  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  22796132 ttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatg 22796231  T
Q  291 tgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||  ||||||||||| |||  || |  |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22796232 tgccaaagtggaagtggaacaacatatacatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 22796304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 154
Target Start/End: Original strand, 14379255 - 14379380
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14379255 gatgatcagggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcgtgacaatgatgagttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttga 14379354  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatg 154  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  14379355 gtgttcatccgggagctacaaagatg 14379380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 363
Target Start/End: Original strand, 5838588 - 5838891
Alignment:
Q  60 aaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtacca 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  ||||| | || || ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  5838588 aaatttgtatccctgacaatgaagagatgaagaaaatgattctcgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatca 5838687  T
Q  160 tgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 259  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5838688 tgatttgaagaagttattttggtggtttggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcag 5838787  T
Q  260 aatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggc 359  Q
    || || || ||  || ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||     
T  5838788 aaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccggaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgactagtttgccgaatactcctagaggga 5838887  T
Q  360 atga 363  Q
    ||||    
T  5838888 atga 5838891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 363
Target Start/End: Original strand, 27560106 - 27560289
Alignment:
Q  180 ggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgac 279  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27560106 ggtggtctgggttgaagagagatgttgctcattttgtgtatgcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaggattgttgac 27560205  T
Q  280 atcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
      |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27560206 gccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaggggacatga 27560289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 18966662 - 18966904
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18966662 aatttgtattcctgacaatgatgagatgaggaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 18966761  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||  | |||||  |||||||  | |||||||| ||| | || |||| |||||||||||| || | ||||||||| |    
T  18966762 gatttgaaaaatttgttttgctggtctaggttgaatagtgatgtgccacaatttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaaggtgagcatcata 18966861  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaa 303  Q
    | || |  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  18966862 aacctggtgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaa 18966904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 344
Target Start/End: Original strand, 25609232 - 25609514
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25609232 atttgtattccagacgatgaagagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatg 25609331  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25609332 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgtgatgttgcaccgtttgtgtattcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaagttgagcatcagaa 25609431  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccga 344  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||| ||||    
T  25609432 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagattggaaatgggatagtatatccatggatttcgtgacgagtttgccga 25609514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15897005 - 15896708
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |  |||| |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  15897005 aattcgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttaaagagagtcacacaagtatcttgagtatccatccaggagctacaaagatgtatcat 15896906  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||||||||   | ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | ||  | | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15896905 gatttgaagaggttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcatgtctaatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 15896806  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || |||||| ||  |||  ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  15896805 aacctgctgggttgatggtatctatagatgtaccaaagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactccgaaaggg 15896708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 18197095 - 18197388
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  18197095 aatttgtattccagacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctaccaagatgtatcat 18197194  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccgg---cttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatc 257  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||    ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  18197195 gatttgaaaaatttgttttggtggtcgggattattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgattttctagaagtcaaaggttgagcatc 18197294  T
Q  258 agaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    |||| || ||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||| ||||| || || |  |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  18197295 agaaacctgcagggttgatgacacctttagatataccagagtggaaatgggatagcatatgcatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 18197388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Original strand, 22761826 - 22762115
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22761826 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 22761925  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22761926 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttatgtattcttgtttgatttttcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 22762025  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  22762026 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 22762115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Original strand, 22078026 - 22078314
Alignment:
Q  27 ttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 126  Q
    |||||||||| ||| | |||||||   || ||| |||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  22078026 ttgatgatcaaggtatgttgaggtttcgaggaagaatttgtactctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 22078125  T
Q  127 gagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgc 226  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | ||     
T  22078126 gagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaaattattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgt 22078225  T
Q  227 ttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22078226 ttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaagtgggatagtat 22078314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22434722 - 22434478
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  22434722 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 22434623  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||  || ||  ||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22434622 attcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtatcgttagacgtggcagagtggaaatgggatagtatatc 22434523  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  22434522 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 22434478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22443120 - 22442876
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  22443120 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtttcatgatctgaagaaaatattttggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgt 22443021  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||  || ||  ||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22443020 attcctgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctactggtatgatggtatcgttagacgtggcagagtggaaatgggatagtatatc 22442921  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  22442920 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 22442876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19865598 - 19865296
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  19865598 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 19865499  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
     || |||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19865498 tatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 19865399  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  19865398 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 19865299  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  19865298 tga 19865296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23079380 - 23079114
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  23079380 aatttctattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcat 23079281  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  23079280 gatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtagcataatttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 23079181  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || |  ||| || ||  ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23079180 aacctgttgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgagatagtatatccatggattt 23079114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 27566351 - 27566616
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27566351 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatg 27566450  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  27566451 atttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 27566550  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27566551 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaagtgggatagtatatccatggattt 27566616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 16626055 - 16626384
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16626055 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16626154  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16626155 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16626254  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  16626255 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16626354  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| |||| |||||||    
T  16626355 gtgacgagtttgccgaatactctgagaggg 16626384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Original strand, 20636672 - 20636961
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  20636672 atttttattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 20636771  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20636772 atctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 20636871  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  20636872 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 20636961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 2874141 - 2874470
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||  ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  2874141 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatggagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 2874240  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  2874241 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 2874340  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||    | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  2874341 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtgcctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 2874440  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  2874441 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 2874470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25113495 - 25113166
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  25113495 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 25113396  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  25113395 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 25113296  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||  || ||  | | |||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  25113295 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtaccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttc 25113196  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25113195 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 25113166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 27330807 - 27331003
Alignment:
Q  65 tgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatt 164  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||     
T  27330807 tgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatc 27330906  T
Q  165 tgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    | |||||  | ||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27330907 taaagaagttattttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 27331003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 27391547 - 27391743
Alignment:
Q  65 tgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatt 164  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||     
T  27391547 tgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctgcgaagatgtaacatgatc 27391646  T
Q  165 tgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    | |||||  | ||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27391647 taaagaagttattttggtggtctgggttgaaacgcaatgtggcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 27391743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18436492 - 18436297
Alignment:
Q  89 aaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc-- 186  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||      
T  18436492 aaaaagttgattctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtctg 18436393  T
Q  187 --cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgaca 280  Q
       || |||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || | |||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||  |||||||||||    
T  18436392 ggtgggttgaagtgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgttagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgcttggttgttgaca 18436297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 1542454 - 1542751
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  1542454 aatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcac 1542553  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  1542554 gatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 1542653  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1542654 aacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcccagaggg 1542751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27188347 - 27188050
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  27188347 aatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcat 27188248  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  27188247 gatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 27188148  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||  ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||||||    
T  27188147 aacccgttgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatacacctagaggg 27188050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 27260893 - 27261190
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  27260893 aatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcat 27260992  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  27260993 gatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggctcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 27261092  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||  ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||||||    
T  27261093 aacccgttgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatacacctagaggg 27261190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 28262567 - 28262864
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| | || ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  28262567 aatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 28262666  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28262667 gatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcaga 28262766  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28262767 aacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 28262864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 28341316 - 28341613
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| | || ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  28341316 aatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 28341415  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28341416 gatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaaggagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcaga 28341515  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28341516 aacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 28341613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 29591290 - 29591587
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  29591290 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 29591389  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  29591390 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 29591489  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  29591490 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgcctaatactcctagaggg 29591587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 351
Target Start/End: Original strand, 16962873 - 16963105
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||  | ||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |    
T  16962873 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaatatattttggtggtctggattgaagcgcgatgtggcacagtttgtgt 16962972  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    |  | || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||    
T  16962973 actcttgtttgatttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatcgaaatgggatagtatatc 16963072  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  16963073 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 16963105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 18407313 - 18407578
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  18407313 atttgtattccagatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatg 18407412  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||| | ||| || ||||| || |||||||| || ||| | ||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18407413 atctaaagaagttgttttgctagtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttttgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 18407512  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  18407513 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 18407578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 24312538 - 24312835
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  24312538 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 24312637  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || | |||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24312638 gatttaaagaagattttctagtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 24312737  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  24312738 aacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 24312835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17416171 - 17416095
Alignment:
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17416171 gatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagaggacatga 17416095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 351
Target Start/End: Original strand, 16927053 - 16927300
Alignment:
Q  104 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatg 203  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||| | |||||    ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  16927053 gaagagagtcacagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcacgatctaaagaagagattttggtggtctggattgaagcgcgatg 16927152  T
Q  204 ttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaa 303  Q
    | || || ||||| ||  | |  |||| |||| ||||||| ||  ||||||||||||| || || ||  || ||   || ||||||||||| ||||||||    
T  16927153 tggcacagtttgtgtactcttatttgatttgttagaagtcgaaaattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaa 16927252  T
Q  304 gtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  16927253 atgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 16927300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 358
Target Start/End: Original strand, 28291913 - 28292039
Alignment:
Q  232 ttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtg 331  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  28291913 ttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtg 28292012  T
Q  332 ccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  28292013 acgagtttgccgaatactccgagaggg 28292039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16098925 - 16098833
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccgg 189  Q
    |||||| || ||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16098925 gattttggacgaaggtcataggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaagttgttttggtggcccgg 16098833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 18837336 - 18837401
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| | |||||||||||    
T  18837336 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttaaagagattgttttggtgg 18837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18572504 - 18572453
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaaga 170  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18572504 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaga 18572453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Original strand, 14624785 - 14624834
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14624785 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaa 14624834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 15077794 - 15077859
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  15077794 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 15077859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 16381801 - 16381866
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  16381801 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 16381866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 19651777 - 19652119
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19651777 tcaaggtggatgatcggggtgtattgagattcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 19651876  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19651877 tagcttgaatattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgatttggtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcattttgtgtat 19651976  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19651977 gcatgtttgacttgtcagaagtctaacgttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 19652076  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19652077 tggatttagtgacaagtataccgaacactccgagagggcatga 19652119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23277494 - 23277152
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23277494 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 23277395  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||    
T  23277394 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcatgacgtcgctcaatttgtatat 23277295  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23277294 gcgtgcttgagttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccggaatggaagtgggatagcatttcta 23277195  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23277194 tggattttgtgacgattttaccgaacactccaagagggcatga 23277152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1064469 - 1064127
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  1064469 tcaaagttgatgatcagggtgtactgaggttcagaggtagagtttgtattcctaacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 1064370  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  1064369 tagtttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttat 1064270  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1064269 gcctgtttggtttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 1064170  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064169 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 1064127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23294653 - 23294315
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23294653 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgataatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagag 23294554  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| |||    
T  23294553 tagcttgaatattcatccgggagcaacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagtgtgacgtcgctcattttgtgtat 23294454  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  23294453 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtgaaagtgggatagcatttcta 23294354  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggc 359  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  23294353 tggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggc 23294315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20828977 - 20828635
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  20828977 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 20828878  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  20828877 taggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgttgctcagtttgtttat 20828778  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20828777 gcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 20828678  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20828677 tggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatga 20828635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20833703 - 20833361
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  20833703 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 20833604  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  20833603 taggttgagtattcacccaggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttaaaaagggatgttgctcagtttgtttat 20833504  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20833503 gcctgtttgatttgttagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 20833404  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20833403 tggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagggggcatga 20833361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 27364804 - 27365146
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||| | | |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27364804 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcctgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 27364903  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27364904 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 27365003  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27365004 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaaatgggatagtatttcta 27365103  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27365104 tggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatga 27365146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31831376 - 31831034
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||    
T  31831376 tcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaggagttaaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 31831277  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  31831276 taggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtatgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 31831177  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  31831176 gcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcca 31831077  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31831076 tggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 31831034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24949308 - 24948965
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggt-gttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaga 119  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  |||| | |||| ||| |||||| |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24949308 tcaaggttgatgatcatggttgtgatgagattcagaggaagaatttgcattcctcatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaga 24949209  T
Q  120 gtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24949208 gtagcttaagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgttgctcattttgtgta 24949109  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  24949108 tgcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgatatcgttggatgtgccggagttgaaatgggataggatttct 24949009  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24949008 atggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 24948965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Original strand, 11357646 - 11357941
Alignment:
Q  68 attcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttga 167  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  11357646 attcctgacattgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagtagtttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtatcatgacttga 11357745  T
Q  168 agaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgc 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  11357746 agaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttatgcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgc 11357845  T
Q  268 agggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357846 agggttgttggcaccgttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 11357941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27788459 - 27788117
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  27788459 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 27788360  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  27788359 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 27788260  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  27788259 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 27788160  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27788159 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 27788117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12575071 - 12574729
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || | |||| | | | ||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  12575071 tcaaggttgatgatcagggtgtgcttagattcagaggtagagtttgtatccctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 12574972  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  12574971 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaagagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 12574872  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  12574871 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 12574772  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  12574771 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 12574729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23111454 - 23111111
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | | || | | |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  23111454 tcaaggttgatgatcagggtatgttgagattctgaggcagaattttcattcttgacagtgatgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacataag 23111355  T
Q  121 tagcttga-gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||    
T  23111354 tagctttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggatttaagtgtgatgttgcacagtttgtata 23111255  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    ||| |  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||     
T  23111254 tgcatatttgacttgccagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggataacatatcc 23111155  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  23111154 atggattttgtaacaagtttacccaatactccaagagggcatga 23111111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 27209897 - 27210239
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||| |  ||| | ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27209897 tcaagattgatgagcaaggtgtgttgagatttagaggcaaaatctgtattcctgacaataaagaattgaagaagttgatattagaagaaagtcataagag 27209996  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| |||    
T  27209997 caacttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcgttttgtgtat 27210096  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  27210097 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttata 27210196  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| |||  ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27210197 tggattttgtgataagtttacctaatactccgagggggcatga 27210239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45530163 - 45529899
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45530163 tgaaaaagatgattctagaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtc 45530064  T
Q  187 cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta 286  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||| | |||    
T  45530063 cgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacaccttta 45529964  T
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  45529963 gatgttctagagtggaagtgggatagtatgtccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 45529899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 140 - 362
Target Start/End: Original strand, 21125003 - 21125225
Alignment:
Q  140 ggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcaga 239  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  21125003 ggagctacagagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatcttgctcaatttgtttatgcatgtttggcttgtcaga 21125102  T
Q  240 agtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagttt 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| | |||||    
T  21125103 agtctaaggttgagcatcacaagtctacagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagttt 21125202  T
Q  340 accgaacactccgagagggcatg 362  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  21125203 accgaatactccgagaggacatg 21125225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24642290 - 24642118
Alignment:
Q  191 ttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatg 290  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | || ||||    
T  24642290 ttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttggcaccgttggatg 24642191  T
Q  291 tgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642190 tgccggagtggaagtgggatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 24642118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Original strand, 30210708 - 30210971
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  30210708 tgaaaaagatgattctagaagaaagtcacaaaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttg-tttggtggtc 30210806  T
Q  187 cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta 286  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||   |||    
T  30210807 cgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacacattta 30210906  T
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||| | || |||||||  ||||| ||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  30210907 gatattccagagtggatatgggatagtatatccatagattttgtgtcgagtttgccgaatactcc 30210971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 24819451 - 24819741
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| | |  |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  24819451 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 24819550  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
     |||||||||   |||||||||||||  | |||||  || |||| || |||||||| ||| | || |||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24819551 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 24819650  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  24819651 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 24819741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 24876482 - 24876811
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  24876482 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 24876581  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||  || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  24876582 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtttggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 24876681  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  24876682 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttc 24876781  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24876782 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 24876811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16926070 - 16925741
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16926070 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16925971  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16925970 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgtattcctgttt 16925871  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||||||     
T  16925870 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtataacgatggatttt 16925771  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16925770 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16925741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16999710 - 16999381
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16999710 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16999611  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16999610 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtagcacagtttgtgtattcctgttt 16999511  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||  | ||||||||     
T  16999510 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtataacgatggatttt 16999411  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16999410 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16999381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24710712 - 24710415
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  24710712 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 24710613  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24710612 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 24710513  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  24710512 aacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 24710415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27371979 - 27371650
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  27371979 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 27371880  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  27371879 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27371780  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  27371779 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 27371680  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27371679 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27371650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 357
Target Start/End: Original strand, 21325031 - 21325327
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  21325031 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcac 21325130  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21325131 gatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaattcgtatattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 21325230  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||    
T  21325231 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatttcgtgacgagttttccgaatactcctagagg 21325327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 345
Target Start/End: Original strand, 21890484 - 21890767
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||  ||| | |||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |    
T  21890484 atttgtattctagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtaccacg 21890583  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  21890584 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaagcgcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgaacattagaa 21890683  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaa 345  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| |||||    
T  21890684 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaaagggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaa 21890767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 21144806 - 21145103
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  21144806 aatttgtattccagacaatgaggagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 21144905  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  21144906 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 21145005  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21145006 aacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttcgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 21145103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9610846 - 9610517
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  9610846 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 9610747  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  9610746 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 9610647  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  9610646 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 9610547  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  9610546 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 9610517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10869560 - 10869231
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| | |||||||||||    
T  10869560 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttga 10869461  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  10869460 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 10869361  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  10869360 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 10869261  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10869260 gtgacgagtttgccgagtactccgagaggg 10869231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23067068 - 23066869
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  23067068 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacg 23066969  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || ||||| || ||| |||| || ||||| |||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23066968 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgatattgcacagtttgtgtattattgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 23066869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16923599 - 16923270
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16923599 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16923500  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16923499 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16923400  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  16923399 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16923300  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  16923299 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 16923270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16982862 - 16982533
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16982862 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16982763  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16982762 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16982663  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  16982662 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16982563  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  16982562 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 16982533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17064427 - 17064098
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  17064427 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 17064328  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  17064327 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 17064228  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  17064227 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 17064128  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  17064127 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 17064098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17068085 - 17067756
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  17068085 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 17067986  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  17067985 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 17067886  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  17067885 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 17067786  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  17067785 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 17067756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27218726 - 27218397
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  27218726 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 27218627  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || || || || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  27218626 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttaaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 27218527  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  27218526 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttacacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 27218427  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27218426 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27218397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 355
Target Start/End: Original strand, 44385334 - 44385628
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  44385334 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 44385433  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||| | ||| | || ||   |||||||||||| || || | ||||||||    
T  44385434 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttatgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgggcatcaga 44385533  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgaga 355  Q
    | ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  44385534 aacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaga 44385628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Original strand, 23107496 - 23107785
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||   ||||| || || |  |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  23107496 atttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcctgaagagagccatagaagtaacttgagtattaatccgggagctacgaagatgtatcatg 23107595  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  | || ||| |||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  23107596 atctaaagaagatattctggcggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 23107695  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  23107696 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactcc 23107785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Original strand, 41608150 - 41608350
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  41608150 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 41608249  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||| | || ||   |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  41608250 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgaacatcaga 41608349  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  41608350 a 41608350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24263048 - 24262751
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | |||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  24263048 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagggtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 24262949  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24262948 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 24262849  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  24262848 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 24262751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 22324679 - 22324918
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  22324679 agtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 22324778  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  22324779 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 22324878  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  22324879 catggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 22324918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24676167 - 24675865
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  24676167 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 24676068  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||  ||||| ||| |||||||| |||    
T  24676067 gatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtctaaagtcgaagattgagcattaga 24675968  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | |  || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||| | || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  24675967 aacttgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatggaatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 24675868  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  24675867 tga 24675865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 24707305 - 24707544
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||| |||||  | || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |    
T  24707305 agtagcttgagtattcacccgggatctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtccggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgt 24707404  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||| |||| ||| |||| || || ||   | ||  ||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||    
T  24707405 attcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacattagaaacctgctggtacgatggtatctttagatgtgccataatggaaatgggatagtatatc 24707504  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24707505 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 24707544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 22756230 - 22756532
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  | ||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  22756230 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcat 22756329  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || ||||||||  | ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  22756330 gatctaaagaagatattctggtggtctagattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtaagaagtcgaagattgaacatcaga 22756429  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || ||  |  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| | | | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  22756430 aacctgctagtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgcgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 22756529  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  22756530 tga 22756532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 23099743 - 23099813
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaa 91  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23099743 tcaaggttgatgaacaaggcgtgttgaggttcagaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaa 23099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 12640056 - 12640121
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  12640056 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 12640121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22276898 - 22276833
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  22276898 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 22276833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Original strand, 24831180 - 24831221
Alignment:
Q  289 tgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgt 330  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24831180 tgtgccagagtggaagtgggatagcatttctatggatttcgt 24831221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43901 - 43559
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  43901 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttaattctagaagagagtcacaagag 43802  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||| |||    
T  43801 tagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtacaatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacttgacgtagctcagtttgtgtat 43702  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43701 gcatgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttcta 43602  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43601 tggatttcgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 43559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14574639 - 14574297
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14574639 tcaaggttgatgatcatggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacaagag 14574540  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  14574539 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgagatgttgctcggtttgtttat 14574440  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  14574439 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacatcgttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttcca 14574340  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14574339 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 14574297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 16827616 - 16827958
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  16827616 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaaaaatttgtattcatgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaacccacaaaag 16827715  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16827716 tagcttaagtattcatcagggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 16827815  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  16827816 gcatgtttgacttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 16827915  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16827916 tggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatga 16827958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10384682 - 10384342
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  10384682 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 10384583  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  10384582 ggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 10384483  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10384482 ctgtttgatttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 10384383  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10384382 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 10384342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 18133761 - 18134101
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18133761 aaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaattagtattcctgataatgacgagttgaaaaagttaattttggaagaaagtcacaagagta 18133860  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18133861 gcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgc 18133960  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  18133961 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacattagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttcaatg 18134060  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18134061 gattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 18134101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 11303188 - 11303528
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  11303188 aaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttcaaaaggttgagtttagaggaaaggcacaagagta 11303287  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  11303288 gcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggtggtccgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgtgtatgc 11303387  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11303388 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgtagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttctatg 11303487  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303488 gattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 11303528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 16337927 - 16338267
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||    
T  16337927 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcataagagta 16338026  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16338027 ggttgagtattcacctgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgctcagtttgtttatgc 16338126  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16338127 ttgtttgacttgttagaagtctaaagttgagcatcagaagcctgcagggttgttcacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatctctatg 16338226  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16338227 gatttcgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatga 16338267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17493344 - 17493004
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17493344 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagta 17493245  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||| | ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  17493244 gcttaagtattcattctggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcaatttttgtatgc 17493145  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||||    
T  17493144 atgtttgacttgtcagaaatctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccagagttgaagtgggatagcatttctatg 17493045  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17493044 gattttgtgacgagtttaccgaacactccaagagggcatga 17493004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28755034 - 28754692
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  28755034 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 28754935  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  28754934 taggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttat 28754835  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28754834 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 28754735  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28754734 tggattttgtaacgagtttaccgaacaccccgagagggcatga 28754692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47124660 - 47124318
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | | | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  47124660 tcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggtagagtttgcattcctgacaatgaggagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 47124561  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  47124560 taggttgagtattcacccaggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagtttgtttat 47124461  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47124460 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 47124361  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  47124360 tggattttgtgacaagtttaccgaacactccgaggaggcatga 47124318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 16380341 - 16380683
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16380341 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 16380440  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||  | ||||| ||||| ||||| |||    
T  16380441 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtacgggttgaattgagatgtcgctcattttgtgtat 16380540  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  | || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  16380541 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttcta 16380640  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  16380641 tggatttcgtgacaagcttaccaaacactccgagaggacatga 16380683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 16835923 - 16836265
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||| || || || | |||| | | ||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16835923 tcaaagttgatgatcagggagtattaagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaatcaaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 16836022  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  16836023 tagcttgagtattcatcccggagctacgaagatgtatcatgagttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtat 16836122  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16836123 gcgtgcttcacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgggatagcatttcta 16836222  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16836223 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccaagaggacatga 16836265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 11960584 - 11960924
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||    
T  11960584 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagattttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacgatagta 11960683  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  11960684 gtttgagtattcacccaggggctataaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgagatgttgctcagtttgtttatgc 11960783  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11960784 atgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgagacagtatttctatg 11960883  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11960884 gattttgtgacgagttttccaaacactccgagaggacatga 11960924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14087389 - 14087047
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||| | | |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14087389 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattccagacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 14087290  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14087289 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 14087190  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14087189 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 14087090  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  14087089 tggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatga 14087047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 16329075 - 16329416
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  16329075 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 16329174  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  16329175 ggttgagtattcacccggggtctacaaagatgtaccatgatctgaagaaattattttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 16329274  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta-gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctat 321  Q
     ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16329275 ttgcttgatttgtcaaaagtccaaggttgagcatcaaaagcttgcaaggttgttgacaccgttaggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctat 16329374  T
Q  322 ggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16329375 ggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagagggcatga 16329416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 363
Target Start/End: Original strand, 12360003 - 12360297
Alignment:
Q  69 ttcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaa 168  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  12360003 ttcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaa 12360102  T
Q  169 gaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgca 268  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||  || |||| || |||    
T  12360103 gaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctcaggttgaatattagaagcctgca 12360202  T
Q  269 gggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360203 gggttgttgacacagttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 12360297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 13971533 - 13971875
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||| | | |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13971533 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagaggcagaatttgcattcccgacaacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 13971632  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13971633 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaaaaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 13971732  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13971733 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatataccggagtggaaatgggatagtatttcta 13971832  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13971833 tggattttgtgacaagtttacctaatactccgagaggacatga 13971875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Original strand, 31694599 - 31694893
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31694599 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 31694698  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  31694699 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaagaagttgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgtat 31694798  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31694799 gcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttaaatgtgccggagtggaagtgggacagtat 31694893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31939619 - 31939329
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  31939619 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgacgaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaggg 31939520  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  31939519 tagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtattatgatctgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtcgctcattttgtgtat 31939420  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggaca 311  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31939419 gcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagccttcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggaca 31939329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4679154 - 4678812
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  4679154 tcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 4679055  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  4679054 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 4678955  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  4678954 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 4678855  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4678854 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 4678812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41178238 - 41177896
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  41178238 tcaaggttgatgaacagggtgtgttgagaatcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttgatcctagaggaaagtcataagag 41178139  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  41178138 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 41178039  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  41178038 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 41177939  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  41177938 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 41177896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13942737 - 13942398
Alignment:
Q  24 aggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtag 123  Q
    |||||||||||||||||||  | || | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||    
T  13942737 aggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagagtag 13942638  T
Q  124 cttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcg 223  Q
    ||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||     
T  13942637 cttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcatttcgtgtatgca 13942538  T
Q  224 tgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatgg 323  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  13942537 tgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaaacctgcaggattgttgacatcattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgg 13942438  T
Q  324 atttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  13942437 attttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 13942398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 44777963 - 44777631
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  44777963 tcaaggttgatgatcagggtgtgctaagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 44777864  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  44777863 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 44777764  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  44777763 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcccgcaggattgttgacaccattggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttcta 44777664  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccga 353  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  44777663 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccga 44777631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 8758495 - 8758837
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||    
T  8758495 tcaaggttgatgaacagggtgtgttgagattcagaggtagaatttgtattcctgataatgaagaaatgaaaaagttaatcctagaggaaagtcataagag 8758594  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8758595 tagcttaagcattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaagcgagatgttgctcattttgtgtat 8758694  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  8758695 gcatgtttaacttgtcagaagtctaaagttgaacaccagaaacctgcaggattgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 8758794  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  8758795 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgaggggacatga 8758837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15228365 - 15228023
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  15228365 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaag 15228266  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  15228265 tagcttaagtattcatccgggagctataaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatat 15228166  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  |  ||||||||||||  |||||| || || ||  |||| ||||| || || || |    
T  15228165 gcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcttgttgggttgttgacactattagaagtaccagaaaggaaatgggatagcatatcca 15228066  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15228065 tggactttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggcatga 15228023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 13319915 - 13320119
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13319915 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 13320014  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  13320015 tagattgagtattcacccgggagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtat 13320114  T
Q  221 gcgtg 225  Q
    |||||    
T  13320115 gcgtg 13320119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 357
Target Start/End: Original strand, 10419498 - 10419794
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||    
T  10419498 aatttgtgttcccgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagagtaatttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcat 10419597  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||||  |||||||||||||  | ||||||   ||||| || |  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10419598 gacttgaagaagttgttttggtggtctagattgaagaaggatgtcgcgcggtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcaga 10419697  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
    | || || || ||||||||| | || ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||    
T  10419698 agcctgcgggattgttgacaccgttggatataccggagtggaaatgggatagcatttctatggattttgtgacaagtttacccaataccccgagagg 10419794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15248813 - 15248547
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  15248813 aatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 15248714  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  15248713 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaaa 15248614  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || || ||| || ||  ||| |||||||| |  |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  15248613 aacctgctgggatgatggtatctttagatgtactagagtggaaatgggacagcatatccatggattt 15248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 13299935 - 13300058
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13299935 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 13300034  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagc 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  13300035 tagcttgagtattcacccgggagc 13300058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 13310593 - 13310716
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13310593 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgatgatgatggtttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 13310692  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagc 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  13310693 tagcttgagtattcacccgggagc 13310716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 5424362 - 5424691
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  5424362 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 5424461  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  5424462 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 5424561  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  5424562 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 5424661  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5424662 gtgacaagtttgccgaatactccgagaggg 5424691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 15015246 - 15015486
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||     
T  15015246 tgaagaagatgattatggaagaaattcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattttggtggtt 15015345  T
Q  187 cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta 286  Q
    | | |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| || ||||| || |  ||| |||||||||| |||    
T  15015346 caggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgtatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacaccagaaacctgttgggatgttgacatcttta 15015445  T
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  15015446 gatattcccgagtggaagtgggatagtatatccatggattt 15015486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15209557 - 15209267
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15209557 aatttgttttcttgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggtgctacgaagatgtatcat 15209458  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15209457 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaaattgagcatcaga 15209358  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||| || ||  ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  15209357 aacctgctgggatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 15209267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9523327 - 9523095
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||| | |||||  |||||||||||||  |  | || ||||||||||| || ||||| |    
T  9523327 agtaacttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttgttttggtggtctagactcaaacgtgatgttgcacagtttgtgt 9523228  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  9523227 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatgataccattagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 9523128  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  9523127 catggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 9523095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17490515 - 17490227
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  17490515 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 17490416  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17490415 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcttagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 17490316  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactc 350  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  17490315 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgagatagcatatccatggattttgtgtcgagtttgccgaatactc 17490227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10906910 - 10906579
Alignment:
Q  27 ttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  10906910 ttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 10906811  T
Q  127 gagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgc 226  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||     
T  10906810 gagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgt 10906711  T
Q  227 ttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatt 326  Q
    ||   |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10906710 ttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatt 10906611  T
Q  327 tcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  10906610 ttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 10906579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6601402 - 6601105
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  6601402 aatttgcattcccgacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 6601303  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | |||||||||||  | ||||| |  ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6601302 gatctaaagaagattttttggtggtctagtttgaaacaagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaggtcgagcatcaga 6601203  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6601202 aacccgctgggatgatggtacctttggatgtgccggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacaagttttccgaatactccgagaggg 6601105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15339967 - 15339638
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  15339967 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 15339868  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  15339867 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15339768  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  15339767 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacccgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 15339668  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15339667 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 15339638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 15588824 - 15589153
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  15588824 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 15588923  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  15588924 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15589023  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  15589024 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 15589123  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  15589124 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 15589153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 16491646 - 16491911
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | |||||    || || |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  16491646 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagtaccataaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 16491745  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||||||||||||| | ||| | || || ||||| || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16491746 atctaaagaatttgttttggtggtccagattgtaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 16491845  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||    
T  16491846 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggataatatatccatggattt 16491911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 20061486 - 20061815
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | || || ||||| |  ||||||||||    
T  20061486 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttga 20061585  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  20061586 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 20061685  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  20061686 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 20061785  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20061786 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 20061815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 15347709 - 15348006
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15347709 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattctcgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccat 15347808  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  15347809 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 15347908  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15347909 aacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 15348006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16636471 - 16636142
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16636471 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16636372  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16636371 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16636272  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  16636271 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 16636172  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16636171 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16636142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 26791831 - 26792160
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  26791831 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 26791930  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  26791931 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 26792030  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  26792031 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 26792130  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  26792131 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 26792160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43163795 - 43163466
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  43163795 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 43163696  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  43163695 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 43163596  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  43163595 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 43163496  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  43163495 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 43163466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 53384482 - 53384779
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| | || ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  53384482 aatttgtattccagacgacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 53384581  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | |||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  53384582 gatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgcttagtttgtcagaagtcaaaggtcgagcatcaga 53384681  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  53384682 aacccgctgggatgatggtacctttggatgtgtcggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 53384779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13253388 - 13253054
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  13253388 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 13253289  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  13253288 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 13253189  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  13253188 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 13253089  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  13253088 gtgacgagtttgccgaatactcctagagggaatga 13253054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10006298 - 10005969
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || ||| |||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  10006298 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 10006199  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  10006198 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 10006099  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| | ||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  10006098 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgcgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 10005999  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  10005998 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 10005969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 15724366 - 15724695
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||| ||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  15724366 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatctgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 15724465  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  15724466 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 15724565  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  15724566 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 15724665  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  15724666 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 15724695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15234233 - 15234128
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | ||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  15234233 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgagtaagaatttctattcctgataatgatgagttgaaaacgttgattttagaagaaagtcacagaag 15234134  T
Q  121 tagctt 126  Q
    ||||||    
T  15234133 tagctt 15234128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 16411714 - 16412043
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16411714 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagaggttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 16411813  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  16411814 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 16411913  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||  || ||  | | |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  16411914 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccaaaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 16412013  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  16412014 gtgacgagttttccaaatactcctagaggg 16412043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Original strand, 14876020 - 14876264
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  14876020 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaaattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 14876119  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   || ||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  14876120 attcctgtttagtttatcagaagttgaagattgaacatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 14876219  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||||| ||| | ||||| | ||| ||||| |||||| ||||    
T  14876220 catggattttgtgacgagtttgcagaatactcctagagggaatga 14876264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 48426145 - 48425847
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  48426145 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 48426046  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||  | || ||    
T  48426045 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtaatcctgttt 48425946  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  48425945 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattt 48425847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12498913 - 12498612
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | || || ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  12498913 atttgcattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaggagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatg 12498814  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  | || |||||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  12498813 atctaaagaagattttctggtggtctggattgaaatgcgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattaaacatcagaa 12498714  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcat 361  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  12498713 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatctatggattttgtgacgagttttccgaatactcctagagggaat 12498614  T
Q  362 ga 363  Q
    ||    
T  12498613 ga 12498612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 16756049 - 16756346
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  16756049 aatttgcattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 16756148  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | || ||  | || ||| |||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  16756149 gatctaaaaaagattttctgggggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcaggagtcgaaggtcgagcatcaga 16756248  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16756249 aacccgctgggatgatggtacctttggatgtgctggaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 16756346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 16806448 - 16806687
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  16806448 agtagcttgagtattcatctaggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 16806547  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  16806548 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 16806647  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16806648 catggactttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 16806687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16372078 - 16371789
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  || | ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  16372078 aatttgtattcctgatgataaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 16371979  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  16371978 gatctaaagaagatattctggtggtctgg-ttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 16371880  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  16371879 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 16371789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 363
Target Start/End: Original strand, 13322310 - 13322407
Alignment:
Q  266 gcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13322310 gcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacagcatctctatggattttgtgacgagtttacctaatactccgagaggacatga 13322407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16692829 - 16692564
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||||||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |    
T  16692829 atttgcattcctgacgatgcagagatgaaaaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgagagctacgaagatgtatcagg 16692730  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    | || |||||  | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16692729 acttaaagaagattttctggtggtctggtttgaagcgagatgtggcgcagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 16692630  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||| |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  16692629 acctgctggtatgatggtatctttagatatgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattt 16692564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 14126116 - 14126355
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| ||||||||  | || ||||| |    
T  14126116 agtagcttgagcattcaaccgggagctacgaagatgtatcaagatttaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgtgatgtgacacagtttgtgt 14126215  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || |  | ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  14126216 attcccgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaattgggatagtatatc 14126315  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14126316 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 14126355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 15401947 - 15402124
Alignment:
Q  27 ttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |  | ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  15401947 ttgatgatcaaggtgtgttgagattccaaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 15402046  T
Q  127 gagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgt 204  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || |||||    
T  15402047 gagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaatattttctggtggtctggtttgaaacgagatgt 15402124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Original strand, 14580406 - 14580530
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| | || ||| ||||| | || || |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||    
T  14580406 aatttgtattccagacgatgaagagattaagaagatgattcttgaggagagtcacagaagtagcttgagtattcacccaggagctacgaaaatgtatcat 14580505  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggt 185  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  14580506 gatttgaagaagttgttttggtggt 14580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 6711909 - 6712073
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaag 196  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||   ||||||||||| | ||  |||||    
T  6711909 gattttggaagaaggtcacaggagtagtctgagtattcatccaagaacaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaag 6712008  T
Q  197 cgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
       ||  | ||  ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6712009 aaggagatcgcggaatttgtttatgcttgtttggtttgtcagaagtctaagattgaacatcagaa 6712073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15062367 - 15062210
Alignment:
Q  104 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatg 203  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| | |||||    
T  15062367 gaagagagtcataggagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacttgatg 15062268  T
Q  204 ttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    | ||  | ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  15062267 tggcatagtttgtgtattcttgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 15062210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 327
Target Start/End: Original strand, 8273921 - 8274129
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   ||||||||||| | ||  |||||   ||  ||||| | |||||||    
T  8273921 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtggcctggaatgaagaaggagattgctgagtttgttt 8274020  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | ||||||  ||||||||| || ||| |||| |||||||  ||  | || ||| ||  | ||||   |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  8274021 attcttgcttggtttgtcagaaatcaaagattgaacatcagagaccgtcgggtttgatgcaaccattctttgtgccagagtggaagtgggatagcatttc 8274120  T
Q  319 tatggattt 327  Q
    |||||||||    
T  8274121 tatggattt 8274129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 363
Target Start/End: Original strand, 15952668 - 15952723
Alignment:
Q  308 gacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952668 gacagcatttccatggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 15952723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12792759 - 12792710
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12792759 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaa 12792710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 13966862 - 13966927
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  13966862 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 13966927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15610721 - 15610672
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15610721 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaa 15610672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16257762 - 16257697
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  16257762 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtgg 16257697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 16742225 - 16742290
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  16742225 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtgg 16742290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30138424 - 30138359
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  30138424 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 30138359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30147975 - 30147910
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  30147975 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 30147910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27642 - 27300
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  27642 tcaatgttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaag 27543  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27542 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 27443  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  27442 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacactgttagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttcca 27343  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27342 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatga 27300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 32507 - 32849
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32507 tcaaggtagatgatcagggtgtaatgaggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcacaagag 32606  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  32607 tagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccgtgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 32706  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32707 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatttcta 32806  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32807 tggatttcgtgacaagtttaccaaacactccgagagggcatga 32849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28341 - 28001
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  28341 aaggttgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagta 28242  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28241 gcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcacgacttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtgtatgc 28142  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  28141 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcacggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 28042  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28041 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagaggacatga 28001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 149686 - 149346
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  149686 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaaaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagagta 149587  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  149586 gcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctatgc 149487  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  149486 atgtttgacttgtcagaagtctaatgttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgctggagtgtaattgggacagcatttctatg 149387  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  149386 gattttgtgacgagtttactgaacactccgagagggcatga 149346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 194892 - 195234
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  194892 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 194991  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  194992 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcacgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 195091  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  195092 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagttggatagcatttcta 195191  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  195192 tggattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatga 195234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 25761 - 26063
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  25761 aatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcac 25860  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  ||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  25861 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacacgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 25960  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | |  ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| ||| | || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  25961 aacttgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatggcatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaaagggaa 26060  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  26061 tga 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 180944 - 180898
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgattt 165  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  180944 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcatgattt 180898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 46589 - 46929
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46589 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatctgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaagaaagtcacaagagta 46688  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  46689 gcttgagtattcatccaggagctacaaaaatgaatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgc 46788  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  46789 atgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgaagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttctatg 46888  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46889 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 46929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 41521 - 41863
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  41521 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 41620  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  41621 taggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 41720  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41721 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 41820  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41821 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 41863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2992 - 2751
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  2992 aatttgtattcctaatgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcat 2893  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||| ||||||       || |||||||||||||    
T  2892 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca-------aaagttgagcatcaga 2800  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtggga 309  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| || || ||||| |||||    
T  2799 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagaatggaaatggga 2751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 22564 - 22906
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  22564 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaac 22663  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  22664 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctat 22763  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22764 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgctgggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttcta 22863  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22864 tggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatga 22906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 14385 - 14727
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  14385 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaac 14484  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || | ||||| |||    
T  14485 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttactaagtttgtctat 14584  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14585 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttcta 14684  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14685 tggattttgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatga 14727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 1160 - 1502
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  1160 tcaaggttgatgatcaaggagtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgagttgaaaatgttgattttagaagaaagtcacagaag 1259  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1260 tagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 1359  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  1360 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggatagcatttcca 1459  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1460 tggattttatgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20238 - 19896
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20238 tcaaagttgatgatcagggtgtattgagattcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagagagtcacaagag 20139  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  20138 tagcttgagtattcatcctggagctactaatttgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtat 20039  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20038 gcatgtttgacttgtcagaagtcaaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttcta 19939  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19938 tggattttgtgacaagtttaccaaacactccgaaagggcatga 19896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 75571 - 75513
Alignment:
Q  126 tgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  75571 tgagtatccctccaggagcgacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtgg 75513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33224010 - 33223668
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  33224010 tcaaggttgatgatcagggtgttctgtggttcagaggaagaatttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattctagaagagagtcataagag 33223911  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  33223910 taggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccagtttgaaacgagatgttgctcagtttgtgtat 33223811  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33223810 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggaatggaagtgggacagtatctcta 33223711  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33223710 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 33223668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 15002549 - 15002891
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  15002549 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattctagaagaaagtcacaaaag 15002648  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  15002649 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcattttgtctat 15002748  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| |    
T  15002749 gcatgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagtgttgttgacaccgttagatgtgccagagcggaagtgggagatcatttcca 15002848  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15002849 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 15002891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 3263979 - 3264321
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  3263979 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 3264078  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  3264079 taggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 3264178  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3264179 gcctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 3264278  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264279 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 3264321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15247011 - 15246669
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  15247011 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcaggggaagaatttgtattcctgataatgacgagttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagag 15246912  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| |   |||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  15246911 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgagctgaaacgtgatgttgctcagtttgtctat 15246812  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15246811 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagcatttcta 15246712  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15246711 tggattttgtaacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 15246669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 11206418 - 11206758
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  11206418 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagggtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaatagta 11206517  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  11206518 ggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 11206617  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11206618 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 11206717  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206718 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 11206758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20892067 - 20891727
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||  || | |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  20892067 aaggttgatgatcagggtttcctgaggttcagagaaagagtttgtatttctgacaacgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagagta 20891968  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  20891967 ggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatctgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgc 20891868  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20891867 ttgcttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 20891768  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20891767 gatttcgtgacgagtctaccgaacactccgagagggcatga 20891727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27901473 - 27901131
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27901473 tcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagag 27901374  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| |||    
T  27901373 taacttgagtattcatccggaagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatgtcgctcagtttgtgtat 27901274  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27901273 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggacagcatttcta 27901174  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27901173 tggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatga 27901131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 44661053 - 44661393
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  44661053 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 44661152  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||  |||||||    
T  44661153 ggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagggatgttgctcagttcttttatgc 44661252  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44661253 ctgtttgatctgtcagaagtccaaggctgagcatcagaagcctgcggggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggatagtatctctatg 44661352  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44661353 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 44661393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 29452722 - 29453064
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||    
T  29452722 tcaaagttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagag 29452821  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||| | || ||||||    
T  29452822 taggttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtctggtttgaaaagagatgttgctaagttcgtttat 29452921  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29452922 gcctgtttggtttgtcagaagtccaaggtggagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctcta 29453021  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29453022 tggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagggggcatga 29453064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 1648462 - 1648802
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  1648462 tcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagattcagaagcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaggttaattctagaggaaagtcacaagag 1648561  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | ||||| || || ||||| |||    
T  1648562 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtaccatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagagggatgtcgcacagtttgtgtat 1648661  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| | || ||| | | ||||||||| |||||||| |||||||    
T  1648662 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatatactggagtggaaatgggacagcatttcta 1648761  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcat 361  Q
    ||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||    
T  1648762 tggattttgtaacgagtttacctaatactccgagagggcat 1648802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15078722 - 15078380
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||| |||| ||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||    
T  15078722 tcaaggtcgatgagcagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcatagaag 15078623  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15078622 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggttcggattgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 15078523  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  15078522 gcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttaatgacaccattagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 15078423  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15078422 tggattttgtgacgagtttatcgaatactccgagagggcatga 15078380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15320237 - 15319896
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  15320237 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttacattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttaaaagaaagtcacagaag 15320138  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| |||    
T  15320137 tagcttaagtattcatccaggacctacaaagatgtatcacgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcatagtttgtatat 15320038  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||  || || |    
T  15320037 gcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttga-aatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcgagagtggaagtgggacaacatctcca 15319939  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15319938 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 15319896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8707005 - 8706663
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8707005 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaag 8706906  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    || ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  8706905 taacttaagtattcatccgagagctacaaagatgtatcatgacttaaagaaattgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatat 8706806  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || || || |    
T  8706805 gcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaaatgagatagcatatcca 8706706  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8706705 tggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggcatga 8706663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 15414211 - 15414553
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | | || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  15414211 tcaaggttcatgatcagggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcctcataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacagaag 15414310  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||    
T  15414311 tagtttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggttttaaacgtgatgttgcacagtttgtatat 15414410  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |    
T  15414411 gcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgctgaaaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatcca 15414510  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||| || ||  ||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  15414511 tggactttgtaacaagtttactgaatacttcgagagggcatga 15414553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 15358307 - 15358530
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15358307 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagtaaagtcacaagagta 15358406  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  15358407 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaaactattttggtggtctggtttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgc 15358506  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaa 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  15358507 gtgtttgacttgtcagaagtctaa 15358530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16148790 - 16148580
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||| |    
T  16148790 gatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggaggaaagtcacaagagcagcttaa 16148691  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16148690 gtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtatgcgtgttt 16148591  T
Q  229 gacttgtcaga 239  Q
    |||||||||||    
T  16148590 gacttgtcaga 16148580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16152936 - 16152726
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||| |    
T  16152936 gatgatcagggtgtgttgaggttcataggaagaatttgtattcctgacaatgaagggttgaaaaagttgactctggaggaaagtcacaagagcagcttaa 16152837  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  16152836 gtatccatccgggagctacgaaaatgtatcacgatttgaagaagttgttttggtggtccggcttgaagcgtgacgtcgctcagtttgtgtatgcgtgttt 16152737  T
Q  229 gacttgtcaga 239  Q
    |||||||||||    
T  16152736 gacttgtcaga 16152726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 309
Target Start/End: Original strand, 14850331 - 14850579
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  14850331 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagattcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcat 14850430  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  14850431 gatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 14850530  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtggga 309  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| |||||    
T  14850531 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatggga 14850579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14160517 - 14160317
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  14160517 aatttgtattccagacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatcggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 14160418  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  14160417 gatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 14160318  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  14160317 a 14160317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7091478 - 7091201
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |  |||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  7091478 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattattgaagagagccatagaagtaacttaagtatttatccgggagctacgaagatgtatcatg 7091379  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | ||||   ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  7091378 atctaaagaggttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttatcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 7091279  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagttt 339  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  7091278 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagttt 7091201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 19777726 - 19778055
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  19777726 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 19777825  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  19777826 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgattttaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 19777925  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  19777926 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 19778025  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19778026 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 19778055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12477679 - 12477350
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  12477679 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 12477580  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  12477579 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 12477480  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  12477479 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 12477380  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12477379 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 12477350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 14302943 - 14303240
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  14302943 aatttgtatcccagacaataaagagtttaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 14303042  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  14303043 gatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 14303142  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  14303143 aacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 14303240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 29038337 - 29038666
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  29038337 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 29038436  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  29038437 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 29038536  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  29038537 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 29038636  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  29038637 gtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 29038666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 8052556 - 8052885
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| | ||| |  ||||||||||    
T  8052556 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagattcatagaagtagcttga 8052655  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  8052656 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 8052755  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  8052756 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 8052855  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8052856 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 8052885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8387491 - 8387162
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  8387491 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 8387392  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  8387391 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 8387292  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  8387291 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 8387192  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  8387191 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 8387162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14681614 - 14681317
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  14681614 aatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 14681515  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||| | || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  14681514 gatttaaagaagattttctggtggcctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 14681415  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || |||||  |||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14681414 aacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaaagggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 14681317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23956826 - 23956497
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| |  |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  23956826 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatccaggacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 23956727  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  23956726 gtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 23956627  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  23956626 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggatttt 23956527  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  23956526 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 23956497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27712383 - 27712086
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  27712383 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 27712284  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || |||||||||||||    
T  27712283 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 27712184  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||  |  || || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27712183 aacctactaggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgagaggg 27712086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 363
Target Start/End: Original strand, 15358541 - 15358617
Alignment:
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358541 gatgtgccggagtggaaatgggacagtatttctatggattttctgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 15358617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40474119 - 40473790
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  40474119 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 40474020  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  40474019 gtattcacccgggagctatgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 40473920  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  40473919 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 40473820  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  40473819 gtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 40473790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Original strand, 18226469 - 18226708
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||  |||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  18226469 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacaatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 18226568  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  18226569 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 18226668  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18226669 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 18226708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 1639390 - 1639680
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | ||  || ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||    
T  1639390 aatttgtatttcagacaatgaagagattaaggagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgagagctacgaagatgtatcat 1639489  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||  | ||||| ||| | || |||  |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  1639490 gatttgaaaaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgttgcatattttgtgtattcttgtttggtttgtcaaaagtcgaaagtcgagcatcaga 1639589  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||  || ||  | | |||||| | || |||||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  1639590 aacctgctggaatgatggtacctttagatataccagagtggaagtgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 1639680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Original strand, 15146854 - 15147152
Alignment:
Q  65 tgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatt 164  Q
    |||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||     
T  15146854 tgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatc 15146953  T
Q  165 tgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcc 264  Q
    |||||||  | || |||| ||| || |||||  | ||||| || || ||||| ||| | |  |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||    
T  15146954 tgaagaagatattctggtcgtctggattgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctatttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaaacc 15147053  T
Q  265 cgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     ||  |  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  15147054 tgctagtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctagagggaatga 15147152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14695160 - 14695051
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  14695160 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatataagtagcttgagtactcatccgggagctacgaagatgtatcat 14695061  T
Q  161 gatttgaaga 170  Q
    ||| ||||||    
T  14695060 gatctgaaga 14695051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18298252 - 18297955
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  18298252 aatttgtatcccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcac 18298153  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   ||||| |||||| || || ||||||||||    
T  18298152 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcggaagtcgaaagtcgagcatcaga 18298053  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | ||||| ||| || ||  | | ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  18298052 aacccgctgggatgatggtacctttagacgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatgaattttgtgacgagtttgccaaatactcctagaggg 18297955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12524680 - 12524426
Alignment:
Q  104 gaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatg 203  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||    
T  12524680 gaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccggaagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatg 12524581  T
Q  204 ttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaa 303  Q
    | || |  ||||| ||| | || |||  |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||   | ||  | | ||||||||||| || |||||    
T  12524580 tggcacggtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggaaagatggtacctttagatgtgccagaatggaa 12524481  T
Q  304 gtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12524480 atgggatagtatatcgatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 12524426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Original strand, 16354468 - 16354519
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaaga 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  16354468 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaga 16354519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Original strand, 15292441 - 15292508
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||||    
T  15292441 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaaaaggttgttttggtggtc 15292508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 156
Target Start/End: Original strand, 18549321 - 18549379
Alignment:
Q  98 attttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgta 156  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  18549321 attttagaggaaggtcacaagagtagcttaagtatacacccgggagccactaagatgta 18549379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Original strand, 12342126 - 12342199
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaaga 170  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  12342126 gattttggaagaaggtcacatgagtagtctaagtattcatccaggagtgacaaagatgtatcaggatttgaaga 12342199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2704 - 2364
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2704 aaggttgatgattagggtgtgttaaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaaattgattttagaggaaagtcacaagagta 2605  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  2604 gcttaattattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctggtttgaaaagtgatgttgctcagtttgtgtatgc 2505  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2504 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgttgggtttttgacaccgtttgatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 2405  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2404 gattttgtgacaagtttaccgaacactccgagagggcatga 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3867 - 3527
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3867 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagta 3768  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  3767 gcttaagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttagtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgc 3668  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3667 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagactgcagggttgttgacaccgttggatgtggcggaatggaagtgggacagcatttctatg 3568  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3567 gattttgtgacgagtttaccgaacactctgagagggcatga 3527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5868 - 5526
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5868 tcaaggttgatgatcagggtatgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaagag 5769  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  5768 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctat 5669  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |    
T  5668 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagactggaagtgggacaacatttcca 5569  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  5568 tggattttgtgacgagtttaccgaataatacgagagggcatga 5526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 51051 - 51393
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  51051 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 51150  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51151 taacttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgatttgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 51250  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  51251 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgggacagcatttcca 51350  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51351 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagaaggcatga 51393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32529 - 32186
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  32529 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattctggaggaaagtcacaagag 32430  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgtttt-ggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  32429 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaaactgtttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtcta 32330  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  32329 tgcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaatcctgtagggctgttgacaccgttggatgtgcaggagtggaagtgggacaacatttct 32230  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32229 atggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 32186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15002 - 14851
Alignment:
Q  176 ttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgt 275  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||  ||     
T  15002 ttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtatgcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatga 14903  T
Q  276 tgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  14902 tggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 14851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 100
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | | ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  442 tcaaggttgatgaccagggtgtattgagattcagaggtagaatttatattcctgaaaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 343  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||    
T  342 tagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaacatgacgttgctcagtttgtgtat 243  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  242 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 143  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  142 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5548 - 5206
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||  ||    
T  5548 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagtcgattttggaagaaatacacagaag 5449  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5448 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 5349  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  || || |    
T  5348 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccatagtggaagtgggacaacatctcca 5249  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5248 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 5206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 15903 - 16241
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  15903 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggtagagtttgtattcctgataatgaagagttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 16002  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||     
T  16003 ggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttatgg 16102  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16103 ctgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtaccggagtggaagtgggacagtatctctatg 16202  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcat 361  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16203 gattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcat 16241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 51368 - 51710
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51368 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 51467  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||    
T  51468 tagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatat 51567  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  51568 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 51667  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51668 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 51710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 60402 - 60744
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60402 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 60501  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||    
T  60502 tagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatat 60601  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  60602 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 60701  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  60702 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 60744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 66790 - 67132
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66790 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagagatagaatttgtattcctgacaatgacgaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 66889  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||  ||||| |||    
T  66890 tagcttgagtattcatccgcgagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgacgtcgctcgttttgtatat 66989  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  66990 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 67089  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67090 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 67132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26478 - 26389
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaa 150  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26478 aatttgtattcctgataacgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagctacaaa 26389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 360
Target Start/End: Original strand, 2543 - 2882
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2543 tcaaggtcgatgatcagggtgtgttaaggttcagaggaaggatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 2642  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||    
T  2643 tagcttgagtattcatccaggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcatttcgtgtat 2742  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2743 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacataagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggatagtatttcta 2842  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    || |||| ||| | ||| || | |||||||| ||||||||    
T  2843 tgaattttgtgacgagtatagcaaacactccaagagggca 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8178 - 7836
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8178 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggtttagaggaagaattttcattcctgatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggagagtcacaagag 8079  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  8078 tagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaataagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 7979  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  7978 gcatgtttgacttatcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctc 7879  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7878 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 7836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3909 - 3571
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3909 tcaaggttgatgttcagggtgtgttgaggttcagagggagaatttgcattccagataatgatgagttgaaaaagtttattctggaagaaagtcacaagag 3810  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  3809 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtctat 3710  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  3709 gcatgtttgacttgtcagaagactaaggttgagcatcagaagcctgtagggttgttgacaccgttagatgtgccggagtggaagtgggacaacatttcca 3610  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggc 359  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  3609 tggattttgtgacgagtttaccgaacactcccagagggc 3571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7449 - 7184
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |  || |  |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  7449 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagatccatagaagtaacttgagtattcatctgggagctacgaagatgtatcatg 7350  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | ||||   |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7349 atctaaagaggttgttttggtggtccgaattgaaacgtgacgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcaaaa 7250  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  7249 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 7184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 45635 - 45293
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45635 tcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagatgtagaatttgtaatcttgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 45536  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  45535 tagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccatgatttgaagaagctgtttcggtggtccggtttgaaacgcgacgttgctcagtttttgtat 45436  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  45435 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 45336  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45335 tggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 45293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21018 - 20759
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018 tcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattccttacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 20919  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  20918 tagcatgagtattcatccgggacctacaaaaatgtatcatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgtagctcaatttatttat 20819  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgaca 280  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||    
T  20818 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaaacctgcaaggttgttgaca 20759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44441 - 44281
Alignment:
Q  203 gttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtgga 302  Q
    |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  44441 gttgctcagtttttgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaatttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtgga 44342  T
Q  303 agtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44341 aatgggatagcatttctatggattttgtaacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 44281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 19570 - 19835
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |   ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  19570 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagatgtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 19669  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || || || ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19670 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagttcgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcatcagaa 19769  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  19770 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 19835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 4640 - 4982
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4640 tcaaggttgatgattagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcataagag 4739  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  4740 tagcttgagtattcatccggaagctacgaaaatgtaccatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 4839  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||  |||||||||| ||||| |  |||||||    
T  4840 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgggataacatttcta 4939  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4940 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 38 - 363
Target Start/End: Original strand, 100754 - 101082
Alignment:
Q  38 ggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtatt---c 134  Q
    ||||| ||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |    
T  100754 ggtgtgttgagattcagaggaagaatttgtattcctaacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattattc 100853  T
Q  135 atccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttg 234  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  100854 atctgggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgatttgaagcgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgatttg 100953  T
Q  235 tcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgcca 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  100954 tcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaagtgggacaatatttctatggattttgtgacg 101053  T
Q  335 agtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  101054 agtttgccaaacactccaagagggcatga 101082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 181277 - 180975
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  181277 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 181178  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| | || |||||||    
T  181177 gatctgaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagatcgaacatcaga 181078  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  181077 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 180978  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  180977 tga 180975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27377 - 27037
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || | ||| | |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  27377 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcaaaggaagagtttgtattcctgatcatgatgatttgaagaagttgattcttgaggagagtcacaagagta 27278  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||||||||||    
T  27277 ggttgagtattcacccgggggctacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagatatgttgctcattttgtttatgc 27178  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27177 ttgtttgatttgtcagaagtccaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgtttgatgtaccgtagtggaagtgggacagtatctctatg 27078  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27077 gatttcgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 27037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 327
Target Start/End: Original strand, 20631 - 20935
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20631 aaggttgatgatcatggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttgattttagaaaaaagtcacaagagta 20730  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20731 gcttaagtattcatccgggagctacaaagatctatcttgatttgaagaagcttttttggtggtctgggttgaagcgtgatgttgctcagtttgtctatgc 20830  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20831 gtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaaatgggacagcatttctatg 20930  T
Q  323 gattt 327  Q
    |||||    
T  20931 gattt 20935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 27552 - 27617
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  27552 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 27617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6331 - 5989
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | ||||   | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6331 tcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagagatagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 6232  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  6231 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctattttggtggtccagtttgaagcgagatgtcgctcattttgtgtat 6132  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  6131 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 6032  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6031 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatga 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 6426 - 6768
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6426 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagatttagaggaagaatttgcattcctgatgatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 6525  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  6526 tagcttgagtattcatccgggagctacgaaagtgcatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 6625  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6626 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgctggatgtaccggagtggaagtgggatagcatttcta 6725  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6726 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 6768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10911 - 10569
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  10911 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaaggatttgcattcttgataatgatgatttgaaaaagttgattctagaagaaagtcacagaag 10812  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10811 tagcctaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaactgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 10712  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| || ||||  |    
T  10711 gcatgtttgacttgttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaagtgggatagcattttca 10612  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10611 tggattttgtgacgagtttaccgaatagtccgagagggcatga 10569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 48222 - 48564
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||    
T  48222 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccataggag 48321  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||  | ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  48322 tagcttaagtattcatctaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaacctgatgttgctcagtttgtttat 48421  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  48422 gcatgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatatgccagagtggaagtgggacaacatttcca 48521  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48522 ttgattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 48564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 57035 - 57377
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||| |||||| ||||||||  ||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  57035 tcaaggttgatgatcagggagtattgaggttcaggggaagaatttgcattcctgatgatgacagtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 57134  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  57135 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttaaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtat 57234  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  57235 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 57334  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  57335 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggacatga 57377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 363
Target Start/End: Original strand, 25079 - 25395
Alignment:
Q  47 aggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaa 146  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25079 aggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgggagcta 25178  T
Q  147 caaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaa 246  Q
    | || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25179 cgaaaatgtatcctgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtatgcgtgtttgacttgtcagaagtctaa 25278  T
Q  247 ggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaac 346  Q
    |||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  25279 ggttgaacatcagaagtctgcagggtttttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggaaaacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaac 25378  T
Q  347 actccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||||||||    
T  25379 actccgagagggcatga 25395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21101 - 20759
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| || || | |||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21101 tcaaggttaatgatcagggtatattgaagttcacaggaaggatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagag 21002  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||    
T  21001 tagcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctattttggttgtctgggttgaaacgtgatgttgctcagttggtgtat 20902  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20901 gcgtgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctacagggttgatgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggacaacatttcta 20802  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801 tggattttatgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 20759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11247 - 11565
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || | ||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  11247 aaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagta 11346  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11347 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgc 11446  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11447 atgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 11546  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttac 341  Q
    ||||| ||| | |||||||    
T  11547 gattttgtgacgagtttac 11565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 15017 - 15335
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | || | ||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15017 aaggttgatgatcaaggtgtgttgagattcaaaggaagaatttgcattcctgataatgatgatgtgaaaaagttgattttggaggaaagccacaagagta 15116  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15117 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcattttgtgtatgc 15216  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15217 atgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 15316  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttac 341  Q
    ||||| ||| | |||||||    
T  15317 gattttgtgacgagtttac 15335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 645
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||    
T  987 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataacaatgatttgaaaaagttgattttggtagaaagccacagaag 888  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  887 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtttgggttgaaacgtgatgttgctcagttcgtttat 788  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||  ||||| |    
T  787 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatttgccaaagtggaagtgggacaacatttcca 688  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  687 tggattttgtgacgagtttaccgaatactctgagagggcatga 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 11974 - 12315
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11974 tcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagatgaaagtcacaagag 12073  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |||    
T  12074 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggttcggtttgaattgtgatgtcgctcattttgtgtat 12173  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  | || ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  12174 gcatgcttgacttgccagaagtctaaggttgagcattagaagcctgcagggttgttgac-ccgttggatgtaccagagtggaaatgggatagcatttcta 12272  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  12273 tggatttcgtgacgattttaccaaacactccgagaggacatga 12315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19967 - 19625
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19967 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 19868  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  19867 tagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgtat 19768  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  19767 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatggaagtgggacaacatttcta 19668  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  19667 tggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatga 19625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24129 - 23787
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24129 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgcattcctgacaatgatgagatgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagag 24030  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  24029 tagcttgagtattcattcgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtccggtttgaagggggatgttgcttaatttgtgtat 23930  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  23929 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggtcgaacatcagaagcctgcagggttgttgacacctttagatgtgccagaatggaagtgggacaacatttcta 23830  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||    
T  23829 tggattttgtgacgagtttacccaatactccgagagggcatga 23787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29175 - 28833
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  29175 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaattttcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttggaagaaagccacagaag 29076  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  29075 tagcttaagtattcatccaggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgcttagtttgtttat 28976  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  28975 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagaattagaagcctgcagggttgttaacactgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 28876  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28875 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccaagagggcatga 28833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30022 - 29757
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  30022 atttgtattccaaacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacg 29923  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | ||||   |||||| || ||| || ||||| || ||||||||  | ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29922 atctaaagaggttgtttttgtcgtctggattgaaacgcgatgttgcagagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgaccatcagaa 29823  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     ||  | ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  29822 acctactggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 29757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 261426 - 261084
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||| | | ||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  261426 tcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtgttcttgacaatgaagaattgaaaaagttaattttagaagaaggtcacaagag 261327  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  261326 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgctcagtttgtgtat 261227  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  261226 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 261127  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  261126 tggattttgtgacgagtttaccaaacactctgagaggacatga 261084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 278058 - 278360
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  278058 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaggttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 278157  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  278158 gatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcatgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 278257  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || |   || ||  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  278258 aacctgctgatatgatggtatcattagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 278357  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  278358 tga 278360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 323822 - 323480
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  323822 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattttggaggaaagtcacaagag 323723  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||     
T  323722 tagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcactcattttgtgtac 323623  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  323622 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaaaagcttgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggataacatttcta 323523  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  323522 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 323480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 202656 - 202998
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | |  | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  202656 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgcggtagaatttgtattcctgataatgatgagttaaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 202755  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  || || ||| ||||||| || ||||| |||    
T  202756 tagcttaagtattcatcagggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccgcattcaaacgtaatgttgcacagtttgtatat 202855  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    |  || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || || |    
T  202856 gaatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacatcgttagatgtgccggagtggaaataggatagcatatcca 202955  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  202956 tggattttgtaacaagtttaccgaatactccgagagggcatga 202998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 118462 - 118344
Alignment:
Q  245 aaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccga 344  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| | |||||||| |    
T  118462 aaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggattttatttctatggattttgtgacgagtttaccta 118363  T
Q  345 acactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||||||||||    
T  118362 acactccgagagggcatga 118344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 342
Target Start/End: Original strand, 7333 - 7654
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  7333 tcaaggtttatgatcagggtgttctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagttgattcttgaagagagtcacaagag 7432  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  7433 taggttgagtattcacccgagggctacaaagatgtatcatgatttgaagaaactgttttggtggtccggtttgaaaagagatgttgctcagtttgtttat 7532  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||    
T  7533 gcttgcttgagttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtactggagtggaaatgggatagcatttcta 7632  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttacc 342  Q
    ||||||| ||| | ||||||||    
T  7633 tggattttgtgacgagtttacc 7654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 24260 - 24601
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24260 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgagattccgaggcagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaaaag 24359  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  24360 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtataatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatat 24459  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |    
T  24460 gcttgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccgttagatgtgccgaagtggaaatgggatagta-ttcca 24558  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24559 tggattttgtaacaagtttaccgaatactccaagagggcatga 24601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 81020 - 81362
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  81020 tcaaggttgatgatcagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattcttgaagagagtcacaagag 81119  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||    
T  81120 tagtttgagtattcacccgggggctacaaaaatgtaccatgatttgaagaaactgttttggcggtccggtttgaaatgtgacgttgctcagtttgtgtat 81219  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  81220 gcatgtttgacttgtgagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 81319  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  81320 tggattttgtgacgagtttaccaaacactacgagagggcatga 81362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 49702 - 50044
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||| || |||||| | |||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49702 tcaaagttgatgaacaaggtgtgttgaagttcagatgcagaatttgcattcctgataacgatgagatgaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagag 49801  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49802 cagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgatttgaaaaagctgttttggtggcctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 49901  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  49902 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttcta 50001  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  50002 tggattttgtgacaagtttacataatactccgagaggacatga 50044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9552 - 9255
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  9552 aatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 9453  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||  |   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  9452 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtctagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 9353  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  9352 aacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 9255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 183
Target Start/End: Original strand, 844 - 966
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| | || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  844 aatttgtattctagacgatgaagagataaagaagatgattctggaagagagtcacaaaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcat 943  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtg 183  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  944 gatttgaagaagttgttttggtg 966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44232 - 43935
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||     
T  44232 aatttgtattacagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcactcgggagctacgaagatgtatcac 44133  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  44132 gatttgaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 44033  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    | || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  44032 aacctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggattttgtgacgagtttgccgaatactcccagaggg 43935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16014 - 15814
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  16014 aatttgtattccagacaataaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 15915  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||  |   |||||||||||| || || ||||||||||    
T  15914 gatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgactagtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcaga 15815  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  15814 a 15814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 337 - 679
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  337 tcaaggttgacgattagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttgaaaaagttgattttcgaagaaagtcacagaag 436  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| |||||||||   ||||| |||||||||||  ||||  |||||| | ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  437 tagcttaagtattcatttaggagctacaaagatgtattatgacctgaagagattgttttggtggtctgggttgaaacatgatgttgctcagtttgtttat 536  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  537 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtgaaagtgggatagcatttcca 636  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  637 tggattttgtgacgagtttactgaatactccgagagggcatga 679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28333 - 28173
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28333 aaggttgattttcagggtgtgttgaggttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagta 28234  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 183  Q
    |||| |||||||||| |||| | || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  28233 gcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 28173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34586 - 34426
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34586 aaggttgattttcagggtgtgttgaggttcggaggaagaatttgtatttctaataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagta 34487  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtg 183  Q
    |||| |||||||||| |||| | || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  34486 gcttaagtattcatctgggatctacgaaaatgtatcatgatttcaagaagctgttttggtg 34426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40776 - 40514
Alignment:
Q  101 ttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||    
T  40776 ttagaagaaagtcacaagagtagcttaagtattcatccgagagctacaaagatgtaccatgatttgaagaaatttttttggtggtctgggttgaaacgtg 40677  T
Q  201 atgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtg 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  40676 atgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaaaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtg 40577  T
Q  301 gaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40576 gaagtgggacaacatttccatggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 40514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3294 - 3021
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  3294 tcaaggttgatggtgagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagatgattctggaagaatgtcacaaaag 3195  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3194 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtttat 3095  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgcc 294  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3094 gcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgcc 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 217 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2716 - 2573
Alignment:
Q  217 ttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatt 316  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||  |||    
T  2716 ttatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtagaagtgggacaacatt 2617  T
Q  317 tctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2616 tccatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggca 2573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 12996
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13316 aaggtggatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttcaaaaggttaattttagaggaaagtcacaagagta 13217  T
Q  123 gcttgagtattcatccggga-gcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggt-ggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||| ||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13216 gcttaagtattcatccgggaagctacgaaaatgtatcatgatttaaagaagctgttttggttggtccggtttgaagcgtgatgtcgctcaatttgtgtat 13117  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13116 gcatgtttgacttgtctgaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttcta 13017  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttac 341  Q
    ||||||| ||| | |||||||    
T  13016 tggattttgtgacgagtttac 12996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 7094 - 7159
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  7094 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 7159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 250 - 591
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| || ||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  250 tcaaggttgatgatcaaggtgtgttgaggttcagaggaagaacttgcattcttgatagtgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcatagaag 349  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||    
T  350 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattattttggtggtccggtttgaaacgtgacgttgcacagtttgtatat 449  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |    
T  450 gcatgtttgatttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcatgca-ggttgttgacaccgttagatgtacctgagtggaagtgggatagcatttcca 548  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  549 tggattttgtgacaagtttgccgaatactccgagagggcatga 591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 13487 - 13829
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| | |||| ||| |||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  13487 tcaaggttgatgaaaagggtgtgttgagattcagaggaagaatttgcattcttgatgatgatgatttgaaaaagttaattctagaggaaagtcacaagag 13586  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  13587 tagcttaagtattcatctaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtat 13686  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  13687 gcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcaaggttgttgacaccgttggatgtaccagagtggaagtgggatagcatttcta 13786  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13787 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 13829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10987
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | | |||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10647 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagta 10746  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  10747 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgtatgc 10846  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10847 atgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 10946  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10947 gattttgtgacgagtctacctaacactccgagagggcatga 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 20861 - 21201
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||| | | |||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20861 aaggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagagggagaatttgcattcctaatgatgatggtttgaaaaagttaattttagaggaaagtcacaagagta 20960  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || || |||||    
T  20961 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtccagtttgaagcgtgacgtcgctcatttcgtgtatgc 21060  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21061 atgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcagggttgttgacaccgttggatgtgccggagtggaagtgggatagcatttctatg 21160  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21161 gattttgtgacgagtctacctaacactccgagagggcatga 21201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26826 - 26761
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  26826 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcatgatttgaagaggttgttttggtgg 26761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 297
Target Start/End: Original strand, 874 - 1150
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  874 tcaaagttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgatagtgatgagttggaaaagttgattctagaagaaagtcacaagag 973  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  974 tagctagagtattcacccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcagtttgtgtat 1073  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccgga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1074 gcgtgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcttgcagggttgttgacaccgttagatgtgccgga 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 363
Target Start/End: Original strand, 2337 - 2407
Alignment:
Q  293 ccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2337 ccggagtggaagtgggacggcatttctatggattttgtgacgagtttacctaacactccgagagggcatga 2407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18467 - 18124
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  18467 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcatgatagtgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtaacaaaag 18368  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactg-ttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||  || |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18367 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatcatttgaagaaattgtttttgatggtttgggttgaaatgtgatgttgctcagtttgttta 18268  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||     
T  18267 tgcatgtttgacttgtcagaagtttaaggttgagcatcagaagccttcagggttgttgactccgttagatgtgccagagtggaagtgggacatcatttcc 18168  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18167 atggattttgtgacgagtttaccgaatactccgtgagagcatga 18124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 5524 - 5865
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5524 tcaaagttgatgattagggagtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 5623  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  5624 tagcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaa-aagctattttggtggtccagtttgaaacgtgacgtagctcagtttgtgtat 5722  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || ||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5723 gcatgtttgtcttgttagaagtctaaagttgaatatcagaagcctacagggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttcta 5822  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5823 tggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagagggcatga 5865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 942 - 640
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||    
T  942 aatttgcattcctgatgatgttggtttgaaaaagttagttttagaggaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcat 843  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  842 gatttgaagaagctattttggtggtccggtttgaagcgtgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcaga 743  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || |||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  742 agcctgcagggttgttgtcaccgttggatgtgccgaagtggaagtgggataacatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacacttcgagagggca 643  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  642 tga 640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1001 - 659
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1001 tcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgattttagaagaaagtcataagag 902  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| ||||| |||    
T  901 caacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcagtttgtgtat 802  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  | || ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  801 gcgtgtttgacttgtcagaagtataaggttgagcatcagaggcctgcaggattgttgacgccgttggatgtaccggagtggaaatgggacaacatttcta 702  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  701 tggattttgtgacaagtttacctaatactccaagagggcatga 659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 9996 - 10338
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| | | || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9996 tcaaggttgatgatctgggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatttctgataatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacagaag 10095  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  10096 tagcttaagtattcatcagggagctaaaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacagtttgtatat 10195  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |    
T  10196 gcatgtttgacttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgctgggttgttgacaccattagatgtgccagaatggaaatgggatagcatatcca 10295  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||| || ||  |||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  10296 tggactttgtaacaagtttaccaaatacctcgagagggcatga 10338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 107 - 363
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6767
Alignment:
Q  107 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttg 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6510 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 6609  T
Q  207 ctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtg 306  Q
    |||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6610 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 6709  T
Q  307 ggacagtatttctatgga-tttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6710 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 6767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 107 - 363
Target Start/End: Original strand, 10941 - 11198
Alignment:
Q  107 gaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttg 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10941 gaaagtcacaaaagtagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttg 11040  T
Q  207 ctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtg 306  Q
    |||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11041 ctcaatttttcaatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcaccagaagcctgcaaggttgttgacaccattagatgtgccggagtggaagtg 11140  T
Q  307 ggacagtatttctatgga-tttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11141 ggacagcatttccatggatttttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 11198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 113676 - 113335
Alignment:
Q  22 caaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagt 121  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| | | || | | ||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  113676 caaggttgatgaacacggtgtgttgagattcggaggcagaatttgtattcttgacaacgatgagatgaaaaggctgattttggaagaaagtcacaagaat 113577  T
Q  122 agcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatg 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  113576 agcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcacgacttgaagaagctattttggtggtctagtttgaagcgtgatgttgcttagtttgtgtatg 113477  T
Q  222 cgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctat 321  Q
    | || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  113476 catgtttaacttgccagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctat 113377  T
Q  322 ggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  113376 ggatttcgtgacgagtctaccaaacactccgagaggacatga 113335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 357
Target Start/End: Original strand, 95230 - 95526
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || || ||||| |||    
T  95230 aatttgtgttcccgacaatgaagaattaaagaagttaattttagaagaaagtcataagagcaatttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcat 95329  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  95330 gacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgtatgcatgtttgacttgccagaagtctaaagttgaacatcaga 95429  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
      |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||    
T  95430 ggcccgcaggtttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagtatttctatggatttcgtgacaagtttacccaataccccgagagg 95526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Original strand, 109007 - 109336
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||| |||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  109007 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttatattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 109106  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  109107 gtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 109206  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||    | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||     
T  109207 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacccgctgggatgatggtgcctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcgatggaattt 109306  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  109307 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 109336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Original strand, 2518 - 2758
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2518 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtatccctgacaatgatgggttgaaaaagttgattttggaagaaagtcacaagag 2617  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2618 tagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagctgttttcgtggtccggtttgaagcgtgatgttgctcaatttgtgtat 2717  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || || |||||||| ||||||||| || | || ||||||||    
T  2718 gcatgtttgacttgccagaagtcttagctcgaacatcagaa 2758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10283 - 10195
Alignment:
Q  173 ctgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  10283 ctgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacattttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagcctcagaa 10195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4894 - 4608
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  4894 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctaataatgatgatttgataaagttgattttagaagaaagccacagaag 4795  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||| ||| |||||    
T  4794 tagcttaagtattcatccgggagctaaaaagatgattcatgacttgaagaaattgttttggtggtcttggttgaaacgtgatattgctcagtttttttat 4695  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgg 307  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  4694 gcgtgtttgacttgtcaaaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttagatgtgccagagtggaagtgg 4608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 48396 - 48737
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48396 aaggttgatgatcagggtgtattgagattcagaggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgattttagaggaaagtcataagagta 48495  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||   | |     
T  48496 gcttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtaccacgatttgaaaaagctgttttggtggtccggtttgaaacgtgacgtagctcagtttgaaaaagt 48595  T
Q  223 gtg-cttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctat 321  Q
     ||     | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48596 ttgaaaaaagttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaagcctgcatggttgttgacaccgttggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctat 48695  T
Q  322 ggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48696 ggatttagtgacaagtttaccaaacactccgagagggcatga 48737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34266 - 34018
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  34266 aatttgcattcctgacaacgatgagataaaaaggttgattttggaagaaagtcacaagagcagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcac 34167  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34166 gatttgaaaaagcttttttggtggtctggtttgaagcgtgatgttgctcaatttttttatgcatgtttgacttgccagaagtctaaggttgaacatcaga 34067  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtggga 309  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  34066 atcctgcagggttgttgacaccattggatgtaccggagtggaaatggga 34018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48222 - 47906
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  48222 tcaaggttgatgatgaaggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatgatgagttgaaaaagttgattctggaagaaagtcacaaaag 48123  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||                    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48122 tagcttaagtattcatccgggagctaca--------------------gaaattgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgttgctcaatttgtttat 48043  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  48042 gcatgttagacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaagcctacagggttgttgaccccgttagatgtgccagagtggaagtgggacaacatttcca 47943  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagg 357  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  47942 tggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagg 47906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 351
Target Start/End: Original strand, 39947 - 40277
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| |   || ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||    
T  39947 tcaaggttgatgatcaaggcgtgttgagatttcgaggaagaatttgtattccttataatgatgaattgaaaaagttgattttagaagatattcacagaag 40046  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttat 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  40047 tagcttaagtattcatccgggagctacaaagatttatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatat 40146  T
Q  221 gcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttcta 320  Q
    || || |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |    
T  40147 gcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatcagaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatcca 40246  T
Q  321 tggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  40247 tggattttgtaacaagtttaccgaatactcc 40277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 351
Target Start/End: Original strand, 28093 - 28286
Alignment:
Q  158 catgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatc 257  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28093 catgacttgaagaaattgttttggtggtccggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtatatgcatgtttgatttgtcagaaatctaaagttgaacatc 28192  T
Q  258 agaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    |||| |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  28193 agaaacttgctgggttgttgacaccattagatgtgccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtaacaagtttaccgaatactcc 28286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 421 - 764
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgatttt-agaagaaagtcacaaga 119  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||| | | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  421 tcaaggttgatgaacaaggtgtgttgagatttagaggcagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaagaagttgatttttagaagaaagtcataaga 520  T
Q  120 gtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| ||    
T  521 gcaacttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagctgttttagtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtgta 620  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||| | || || || || |||||||| ||||| |  ||||||    
T  621 tgcgtgtttgacttatcggaagtctaaggttgaacatcagaggcctgcaggtttgttgacaccgttggaagtaccagagtggaaatgggataacatttct 720  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  721 atggattttgtgacaagtttacctaatactccgagagggcatga 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 119 - 363
Target Start/End: Original strand, 6322 - 6566
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |    
T  6322 agtagcttaagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatgacttgaagaaattgttttggtggtccggtttgaaacgtgatgttgcacaatttctat 6421  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    | || || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || ||||| ||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||| || ||    
T  6422 aggcatgtttgacttgtcagaagtctaagattgaacatgagaagcctgcaggattgttgacaccgttagattttccagagtggaagtgggacagcatctc 6521  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
     |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6522 catggattttgtgacgagtttaccgaatactccgagagggcatga 6566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 135 - 363
Target Start/End: Original strand, 17839 - 18067
Alignment:
Q  135 atccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttg 234  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  17839 atccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagatgttgttttggtggtctgggttaaaacgtgatgttgctcagtttgtttatgcatgtttgacttg 17938  T
Q  235 tcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgcca 334  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |     
T  17939 ttagaagtctaaggttgagcatcagaagcctgcaggattgttgacaccgttagatgtggcagagtgaaagtgggacagcatttccatggatttcgtaacg 18038  T
Q  335 agtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18039 agtttaccgaacactccgagagggcatga 18067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 89633 - 89818
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89633 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 89732  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttg 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  89733 tagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgttg 89818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 90311 - 90496
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90311 tcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgacaatgatgatttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 90410  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttg 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  90411 tagctaaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgttg 90496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 327
Target Start/End: Original strand, 390489 - 390694
Alignment:
Q  122 agcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||     
T  390489 agcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtagcacagtttgtgtatt 390588  T
Q  222 cgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctat 321  Q
    | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||  |  || ||  ||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  390589 cttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctagaatgatggtatctttagatatgccagagtggaaatgggatagtatatccat 390688  T
Q  322 ggattt 327  Q
    ||||||    
T  390689 ggattt 390694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 115054 - 114961
Alignment:
Q  270 ggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  115054 ggttgttgacaccgttggatgtgctggagtggaagtggaatagcatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 114961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1986 - 1684
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  1986 aatttgtattcttgacaatgatgagataaagaagatgattctcgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctataaagatgtatcat 1887  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||  | || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  1886 gatttgaagaagctgttttggtggtctaggttgaaacgtgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 1787  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || |||||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  1786 aacctgctgggttgttgacaccgttagatgtgctagaatggaaatgggatagtatatacatggattttgtgacgagtttgccgaatactccaagaggaca 1687  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  1686 tga 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 116133 - 116423
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  116133 aatttgtattcctgacaatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 116232  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| || ||||||||| || |||||||||||||    
T  116233 gatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcgcagtttgtgtattcatgtttgatttctcagaagtcaaaagttgagcatcaga 116332  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || ||  ||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  116333 aacctgctaggttgatgacacctttagaagtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 116423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4218 - 3916
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | || ||| ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||  |||| | || |||||||| ||     
T  4218 aatttgtattcatgacgatgatgagattaagaagatgattttggaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatttgggatctaccaagatgtatcac 4119  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| ||||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  4118 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttatttattcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 4019  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || |||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | |||||  |||||||||||| |||| |    
T  4018 aacctgcagggctgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttttcgaacactccgaaagggaa 3919  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  3918 tga 3916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 6960
Alignment:
Q  125 ttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgt 224  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| |    
T  7198 ttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtctggtttgaagaaggatgtcgctcggtttgtatatgcat 7099  T
Q  225 gcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatgga 324  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||   ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  7098 gtttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaggcctgcaggaaagttgacaccattggatgtaccggagtggaaatgggatagcatttctatgga 6999  T
Q  325 tttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  6998 ttttgtgacaagtttacctaatactccgagggggcatga 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Original strand, 218645 - 218911
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  218645 aatttgtattcctgataatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 218744  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||  || | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  218745 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgaattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 218844  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  218845 aacctgcagggttgatgacaccattagatataccagagtggaaatgggatagcatatccatggattt 218911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 230121 - 229831
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  230121 aatttatattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 230022  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  || |||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  230021 gatttgaaaaagttggtttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttggtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcaga 229922  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  229921 aacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaattgtgatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 229831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Original strand, 882 - 1054
Alignment:
Q  191 ttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatg 290  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||    
T  882 ttgaagcatgacgtcgctcattttgtgtatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaggttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatg 981  T
Q  291 tgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  982 tgccggagtggaagtgggacctaatttctatggattttgtgacgagtttaccgaacactccgagagggcatga 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 169
Target Start/End: Original strand, 742 - 887
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  742 aaggttgatgatcaaggtgtattgaggttcagaggaagaatttgtattcctgataatga-gagttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaaaagta 840  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaag 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  841 gcttaagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcatgatttgaag 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13135 - 12846
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  13135 atttgtattccagacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcaccctggagctacgaagatgtatcatg 13036  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||| ||| ||  |||| || |||||||| || || || ||| | || || | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13035 atctaaagaagttgttttggttgtctggactgaaacgagatgttgcacagttcgtgtattcttgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 12936  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  12935 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 12846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7097 - 6835
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  7097 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccaggagctacgaagatgtaccacg 6998  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||    ||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  6997 atctaaag---ttgttttggtggtctggattgaaacgcgatgttgcacagtttgtgtatacttgtttgatttgtcagaaatcgaaggttgagtatcagaa 6901  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6900 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattt 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 363
Target Start/End: Original strand, 25006 - 25249
Alignment:
Q  120 gtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttta 219  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  25006 gtagcttgagtattcattagggagctacaaagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgta 25105  T
Q  220 tgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttct 319  Q
    | | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||     
T  25106 ttcatgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcagaaacctgttgggttgttgacaccgttagatgtgccgtagtggaaatgggatagtgtatcc 25205  T
Q  320 atggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25206 atggattttgtcacgagtttgccgaatactccaagagggcatga 25249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 2673 - 2838
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||  || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2673 tcaaggttgatgatgagggtgtgttgaggttcggagaaagaatttgcattcctgataatgatgagttgaaaaatttgattttagaggaaagtcacaagag 2772  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2773 tagcttaagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcatgacttgaagaagttgttttggtggtc 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10086 - 9746
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| | | || ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||    
T  10086 aaggtcgatgaccaaggtgtgttgagattctgaggaagaatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagta 9987  T
Q  123 gcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgc 222  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||  | ||||| ||| |    
T  9986 gcttgagcattcatccaggagctacgaagatgtatcatgatttgaaaaagttgttttggtggtctggactgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattc 9887  T
Q  223 gtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatg 322  Q
     || |||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||    
T  9886 ttgtttgatttgtcagaagtcaaaggttgagcatcaaaaacctgcagggttgatgacaccgttagatgtgccagagtggaaataggatagtatatccatg 9787  T
Q  323 gatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||    
T  9786 gattttgtgacgagttttccgaatactacgaaagggaatga 9746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17759 - 17457
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  17759 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttaagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 17660  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||  | |||||  | ||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  17659 gatctgaagaagttgttttggtggtctaggttgaaatgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 17560  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |||| |    
T  17559 aacctgcagggttgatgacacctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaacactccgaaagggaa 17460  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  17459 tga 17457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15955 - 15653
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||  ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  15955 aatttgtattcctgacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatccgggagctactaagatgtatcat 15856  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || || || || ||||| |||   || |||| |||||||||||| || ||| |||||||||    
T  15855 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgagacgtggcacagtttgtgtattactgtttgatttgtcagaagtcaaaagttcagcatcaga 15756  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || ||||||||| ||||| | |||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| |||||||| |    
T  15755 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtaccatagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactacgagagggaa 15656  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  15655 tga 15653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 112716 - 113005
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  112716 aatttgtattccagacgatgaggagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 112815  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| | || || | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  112816 gatctgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcttgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 112915  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||| || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  112916 aacctgctgggatgatggtatctttagatgtgccaga-tggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 113005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11851 - 11690
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || | | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11851 tcaaggttgatgatcagggtgtattgagattcataggtagaatttgtattcctgacaatgaagaattgaaaaagttgatcttagaagaaagtcataagag 11752  T
Q  121 tagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggt 182  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  11751 tagcttaagtattcatccaggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttgttttggt 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11690 - 11550
Alignment:
Q  218 tatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtattt 317  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || |||||  |||||||||| ||||| |  ||||    
T  11690 tatgcatgtttgacttgtcagaagtctaaagttgaacatcagaagcctgcagggttgttgacaccgttggatgtatcggagtggaaatgggataacattt 11591  T
Q  318 ctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  11590 ctatggattttgtgacgagtttaccaaacactccgagaggg 11550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 353
Target Start/End: Original strand, 14307 - 14599
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||    
T  14307 aatttgtattcctgactatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtattcatcagggagctacgaagatgtatcat 14406  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||  | || ||||| ||| | || |||| |||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  14407 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgacacagtttgtgtattcatgtttgatttgttagaagtcaaaagttgagtatcaga 14506  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccga 353  Q
    | || |  |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||    
T  14507 aacctgttgggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggaatttgtgacgagtttgccgaatactccga 14599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 4820 - 5121
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||| |||   ||  |||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  4820 aatttgtattcctgataatacagaaatgaaaaagatgattctggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcac 4919  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  4920 gatttgaagaagttattttggtggtccgggttaaagcgagatgttgcacaatttgtgtatgcatgtttaatttgtcagaagtcgaaggttgaacatcaca 5019  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    |  |  | |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||  ||||| ||    
T  5020 aaacttctgggttgttgacacctttagatattccagagtggaagtgggatagtatatc-atggattttgtgacgagtttgccgaatactcaaagaggaca 5118  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  5119 tga 5121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 17205 - 17447
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  17205 aatttgtattcttgaagatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcacaaaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 17304  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  17305 gatttgaagaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaaa 17404  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaa 303  Q
    | || |  |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  17405 aacctgttgggttgatgctatctttagatgtgccagagtggaa 17447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5109 - 4820
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  5109 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcataaaagtagcttgagtaatcatccgggagctacgaagatgtatcat 5010  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||| || |||||  ||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  5009 gatttaaagaagttgttttggtggtctgggttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagttgagcatcaga 4910  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactc 350  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||| |||| |  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  4909 aacctgcaggtttgatgacacctttatatgttctagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagttttccgaatactc 4820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 3685 - 3975
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||    
T  3685 aatttgtattcctgacggtgatgagatgaaaaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggagctacgaaaatgtatcat 3784  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||| | || || | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3785 gatctgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 3884  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || |  ||| || ||  ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  3885 aacctgttgggatgatggtatctttagatgttccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 59807 - 59567
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||  | |||||||||||    
T  59807 tgaagaagatgattatggaagaaagtcacagaagtaatttgagtattcatccgggagctacaaaaatgtatcaagattttaagaagttattttggtggtc 59708  T
Q  187 cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta 286  Q
    ||| ||||||||  |||| || |||||||  |||||||| || | |||||||||||  || | ||| || ||||| ||  | |||||||||||| | |||    
T  59707 cgggttgaagcgacatgtggcacaatttgggtatgcgtgtttaatttgtcagaagttaaaagatgaacaccagaaacctactgggttgttgacaccttta 59608  T
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||| | |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  59607 gatattcgagagtggaagtgggatagtatatccatggattt 59567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 363
Target Start/End: Original strand, 28601 - 28902
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    |||||||||||| || |||  |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  28601 atttgtattccttacgatgtagagttgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatg 28700  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    ||   |||||  | || | || ||| |  ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  28701 atccaaagaagattttatagttgtctgtattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcagaa 28800  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcat 361  Q
     ||||| ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  28801 acccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaat 28900  T
Q  362 ga 363  Q
    ||    
T  28901 ga 28902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 131184 - 130985
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |  || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  131184 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagcaacttgagtattcatccgggagctacgaagaggtatcatg 131085  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  ||||||||||||| || ||||| || || |||||  | ||||| ||| | || |||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  131084 atctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcaaagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgatggttaagcatcagaa 130985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 117 - 1
Alignment:
Q  23 aaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagta 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  117 aaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagaggaaagtcacaagagta 18  T
Q  123 gcttgagtattcatccg 139  Q
    |||| ||||||||||||    
T  17 gcttaagtattcatccg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 85773 - 86012
Alignment:
Q  87 tgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  || |  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  85773 tgaaaaagatgattttggaagaaagtcacataagcaatttgagtatttatccgggagctacaaaaatgtatcatgatttgaagaagttattt-ggtggtc 85871  T
Q  187 cggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcatta 286  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || | |||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||| | |||    
T  85872 cgggttgaagcgagatgtggcacaatttgtgcatgcgtgtttaatttgtcagaagtcgaaagttgaacatcagaaacctgctgggttgttgacaccttta 85971  T
Q  287 gatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  85972 gatgttccaaagtggaagtgggataatatatccatggattt 86012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 7119 - 7409
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||||| || |||||||  |||| ||| ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  7119 aatttgtattccttacgatgatgaaatgaagaagatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 7218  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  |||||||||||||  | ||||| |||||||| ||  | ||||| ||| | || |||  |||||||||||| || || ||||||||||    
T  7219 gatctaaagaagatgttttggtggtctcggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtatattcatgtttggtttgtcagaagtcaaaagtggagcatcaga 7318  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || |  |||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  7319 aacctgttgggttgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacaagtttgccgaatactcc 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4949 - 4707
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4949 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 4850  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||  | ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  4849 gatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcaga 4750  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaa 303  Q
    | ||   ||||||| ||||| | ||| |||| || ||||||||    
T  4749 aacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaa 4707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12079 - 11837
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12079 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcat 11980  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||  | ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  11979 gatttgaagaagttgttttggtcgtctgggttgaaacgtgatgtggcatagtttgtgtattcctgtttgatttgtcagaagtcaaaagtggagcatcaga 11880  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaa 303  Q
    | ||   ||||||| ||||| | ||| |||| || ||||||||    
T  11879 aacctatagggttgatgacacctttatatgtaccagagtggaa 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 39048 - 39350
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| | ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  39048 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagactcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacaaagatgtatcat 39147  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||| | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  39148 gatctgaagaaaattttatggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacaatttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 39247  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | ||||| || ||| ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| | ||| ||||| |||||| |    
T  39248 aacccgctggtttgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgctgaatactcctagagggaa 39347  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  39348 tga 39350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 11425 - 11715
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| | |  |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  11425 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 11524  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
     |||||||||   |||||||||||||  | |||||  || |||| || |||||||| ||| | || |||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  11525 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 11624  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  11625 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 11715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 17617 - 17907
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| | |  |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||    
T  17617 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaagatgactcttaaagagagtcacagaagtagcttgagtatccatccgggagctagaaagatgtatcat 17716  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
     |||||||||   |||||||||||||  | |||||  || |||| || |||||||| ||| | || |||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  17717 tatttgaagaggttgttttggtggtctaggttgaaaagtaatgtggcacaatttgtgtattcctgtttgctttgtcaaaagtcaaaagttgagcatcaga 17816  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  17817 aacctgcagggttgatgacacctttagatgtgccagagtggaaatgggatagaatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 17907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7126 - 6861
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  7126 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 7027  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | || ||  |||||||||||||||| |||||  | || ||||| || ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7026 atctaaaaaagttgttttggtggtccggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgcttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 6927  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6926 acctgctggtatgatggtatcgttagatgtgcctgagtggaaatgggatagtatatccatggattt 6861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Original strand, 1295 - 1561
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||    
T  1295 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgatatttgaagagagtcataggagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatatatcat 1394  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||| ||  |||||||||| || || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  1395 gatctgaaaaagttgttttggtgatctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 1494  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||| || ||||||||    
T  1495 aacctgcgggaatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggataatatatccatggattt 1561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1753 - 1488
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1753 atttgtattctagacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcattgaagtagtttgagtattcatccgggagctacgaagatgcaccatg 1654  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||||||||   ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1653 atttgaagatgttgttttgatggtctggattgaagcgtgatgttgcacggtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 1554  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || ||  || ||  ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  1553 acctgctggtatgatggtatatttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 2042 - 2159
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2042 tcaaggttaatgatcagggtgtgttgaggttccgaggaagaatttgtattcctgataatgatgatttgaaaaagttgattttagagaaaagtcacaagag 2141  T
Q  121 tagcttgagtattcatcc 138  Q
    |||||| |||||||||||    
T  2142 tagcttaagtattcatcc 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 520
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    |||| |||||| ||| | |||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  773 atttctattccagacgacgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgattattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 674  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  673 atttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacacgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgatttgtcagaagtcgaaggttgagcatcagaa 574  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtat 315  Q
     ||||| ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  573 acccgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtat 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3451 - 3162
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  3451 atttgtattccagacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtaccacg 3352  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  3351 atctaaagaagttgttctggtggtctggattgaaacgtgatgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcagaaattgaaggttgagcatcagaa 3252  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  3251 acctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 3162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8476 - 8147
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  8476 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtattccagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcacaggagtagcttga 8377  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | ||  |    
T  8376 gtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtct 8277  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  8276 agtttgtcagaagtcgaaagtcgagcatcagaaacctgccggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatcaatggatttt 8177  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8176 gtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 8147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 327
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19496
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  19231 atttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 19330  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||| || |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19331 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacggtttgtgtatgcttgtttgatttgccagaagtcgaagattgagcatcagaa 19430  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
     || || |   |||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  19431 acctgctgatatgttggtatcgttagatgttccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 19496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Original strand, 14440 - 14573
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14440 atttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 14539  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaa 195  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14540 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaa 14573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 31981 - 32271
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  31981 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatcat 32080  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | |  || | |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  32081 gatgtgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtgtattcctatttaatttgtgagaagtcgaaagttgagcatcaga 32180  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||  || ||  ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  32181 aacctgctggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 32271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Original strand, 7560 - 7849
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  7560 atttgtattcccgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagccatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatg 7659  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | || |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  7660 atctaaagaagttgttttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgttagaagtcgaaggttgaacatcagaa 7759  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     || || ||  || ||  |||||||||||||||  | ||||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  7760 acctgctggtatgatggtatcattagatgtgccaaaatggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 7849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50544 - 50244
Alignment:
Q  27 ttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagctt 126  Q
    |||||||||| ||||| |||||||   || | | |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||    
T  50544 ttgatgatcaaggtgtattgaggtttcgaggtagaatttgtattccagaagatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagctt 50445  T
Q  127 gagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgc 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||  ||| | ||     
T  50444 gagtattcatccgggagctacgaagatgtaccatgatctaaagaagttattttgctggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgcgtattcttgt 50345  T
Q  227 ttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatt 326  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  50344 ttgatttgccagaagtcgaaagttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggatt 50245  T
Q  327 t 327  Q
    |    
T  50244 t 50244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19680 - 19378
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||| | |||||||| |||| ||| || |||||||| |||    
T  19680 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatcat 19581  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||| | || ||||||||  | ||||| ||  ||||  | || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19580 gatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 19481  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  19480 aacctgctggtatgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 19381  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  19380 tga 19378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35104 - 34802
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||| | |||||||| |||| ||| || |||||||| |||    
T  35104 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcctaagtattcacccggcagctacgaagatgtatcat 35005  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||| | || ||||||||  | ||||| ||  ||||  | || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  35004 gatctgaagaaaatattctggtggtctagattgaaacgcaatgtgacacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgaagattgaacatcaga 34905  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  34904 aacctgctggtatgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 34805  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  34804 tga 34802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 1
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcaca 116  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96 tcaaggttgatgatcagggggtgttgaggttcagaggaagaatttgcattcctgataacgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcaca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6826
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||    
T  7092 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctatgaagatgtatcat 6993  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | ||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| ||| | || |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  6992 gatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttgtttgatttgtcataagtcgaaggttgaacatcaga 6893  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6892 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 8315 - 8605
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| | ||||| | ||| |  ||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||    
T  8315 aatttgtattcatgacgatgatgagatgaagaagatgattcttgaagagaatcatagaagtggcttaagtatccatccgggagctacgcagatgtatcat 8414  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || || ||| | || |||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  8415 gatttgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagttcgtgtattcatgtttgatttgttagaagtcgaaagttgagcatcaga 8514  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
    | || || ||  || ||  ||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  8515 aacctgcgggaatgatggtatctttagatgtaccagagtggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6286 - 6099
Alignment:
Q  74 gacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaac 173  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||||||| ||| | |||||      
T  6286 gacaatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagaaagtcatagaagtagcttgagtatccatctgggagctatgaagatgtaccacgatctaaagaagt 6187  T
Q  174 tgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||||| ||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6186 tgttttagtggtctagattgaaacgcgatgttgcacaatttgtgtattcttgtttgacttgttagaagtcgaaggttgagcatcagaa 6099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 242
Target Start/End: Original strand, 26172 - 26353
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  26172 aatttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaaatagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcat 26271  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagt 242  Q
    |||||||| ||  | ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  26272 gatttgaaaaagttattttggtggtctgggttgaaacgtgatgtggcacagtttgtatattcttgtttgatttgtcagaagt 26353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Original strand, 6873 - 6974
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6873 tcaaggttgatgaacacggtgtgttgaggttcagaggcagaatttgtgttcctgacaatgatgagatgaaaaggctgattttagaagaaagtcacaagag 6972  T
Q  121 ta 122  Q
    ||    
T  6973 ta 6974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 184
Target Start/End: Original strand, 716 - 775
Alignment:
Q  125 ttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  716 ttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13545 - 13249
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  13545 atttgcattcctgacgatgcagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacg 13446  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || |||||  ||||||| || || ||||| ||| | || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13445 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaatgtgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttagtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 13346  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13345 acctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 13249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 351
Target Start/End: Original strand, 32859 - 33091
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  32859 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgt 32958  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || |||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  32959 attcctgtttggtttgtcagaggtcaaagattgagcatcagaaacccgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 33058  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  33059 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 33091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9673 - 9384
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| || |    
T  9673 atttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacg 9574  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9573 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaa 9474  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     ||||| ||   | ||  ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  9473 acccgctggtaagatggtatctttagatgtgccagaacggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 9384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22887 - 22648
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |    
T  22887 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaaaattttttggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtat 22788  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  |||  |||||||| | || ||||| ||||| ||||| ||    
T  22787 attcctgtttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctctagatgtgtctgaatggaaatgggatagtatatc 22688  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22687 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagaggg 22648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2487 - 2345
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| |    
T  2487 agtagcttaagtattgatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaagaaactattttggtggtctggattaaaacgggatgtggcacagtttgtgt 2388  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | || |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2387 attcttgtttgatttgtcaaaagtcgaaggttgagcatcagaa 2345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16675 - 16533
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | || ||  | ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  16675 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaaaaagttattttggtggtctggattgaaacgtgatgtggcacagtttgtgt 16576  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | || |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16575 attcttgtttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaa 16533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 186
Target Start/End: Original strand, 18443 - 18568
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||    
T  18443 aatttgtattcctgacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcat 18542  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtc 186  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  18543 gatttgaagaagttgttttggtggtc 18568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 102311 - 102111
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  102311 aatttgtattcctgacgatgaggagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtatccatccgggagctacgaaaatgtatcat 102212  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||  | || ||||| ||| | |  |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  102211 gatctgaaaaagttgttttggtggtctgggttgaaacatgatgtgtcacagtttgtgtattcctatttgatttgtcagaagtcgaaagttgagcatcaga 102112  T
Q  261 a 261  Q
    |    
T  102111 a 102111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1705
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| |||| ||| ||||| |  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||    
T  1971 aatttgtattctagacgatgaggagatgaagaagatgattctcaaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatccgggagctacgaaaatgtatcat 1872  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||||||| ||  | |||||||| ||  | ||||| |||||||| || |||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||| |||| |    
T  1871 gatttgaaaaagttattttggtgatctaggttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgtattctggtttgatttgtcagaagtcgaaagttgaggatcaaa 1772  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | ||  | ||  || ||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1771 aacctactggaatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaagtgggatagtatatccatggattt 1705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Original strand, 10244 - 10354
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||| ||  ||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10244 aatttgtattcctgacgacgatgacatgaagaaaatgattcttgaagagagtcacagaagtagcttgagtatacatccgggagctacaaagatgtatcat 10343  T
Q  161 gatttgaagaa 171  Q
    |||||||||||    
T  10344 gatttgaagaa 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8049 - 7720
Alignment:
Q  29 gatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| | | || ||| ||||||||| |  |||||||| ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||    
T  8049 gatgatcaaggtgtgttgagattccgaggaagaatttgtatcctagacaatgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttga 7950  T
Q  129 gtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgctt 228  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || ||    
T  7949 gtattcacccgggagctacgaagatttatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgttt 7850  T
Q  229 gacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttc 328  Q
       |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||  || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  7849 agtttgtcagaagtcgaaagttgagcatcagaagcctgctggaatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggatttt 7750  T
Q  329 gtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
    ||| | ||||| || || ||||| ||||||    
T  7749 gtgacgagttttccaaatactcctagaggg 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 363
Target Start/End: Original strand, 3043 - 3344
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  3043 atttgtattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaaaatgtatcatg 3142  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || |||||||| | || |||||||| || | ||| || ||||| || || ||||| | | | || |||  |||||||||||| |||  ||| | ||||||    
T  3143 atctgaagaaaattttctggtggtctggatcgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtgttcttgtttggtttgtcagaagtcgaagactgaacgtcagaa 3242  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcat 361  Q
     ||||| ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||    
T  3243 acccgctggtatgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgagatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaat 3342  T
Q  362 ga 363  Q
    ||    
T  3343 ga 3344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1434 - 1198
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||| | |    
T  1434 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcatagtttatgt 1335  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || ||   |||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||| || ||  | | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  1334 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaagtcgggcatcagaaacccgctgggatgatggtacctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 1235  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgaga 355  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  1234 gatggattttgtgacgagtttgccgaatactccgaga 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28051 - 27931
Alignment:
Q  21 tcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagag 120  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||| | |||| ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  28051 tcaagattgatgattagggtgtactgagattcagaggaagagtttgtattcctgacaacgatgaattgaggaagttgattcttgaagagagtcacaagag 27952  T
Q  121 tagcttgagtattcatccggg 141  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  27951 tagattgagtattcacccggg 27931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2285 - 2054
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||| || |||||  | || ||||| || ||||| |    
T  2285 agtaacttgagtattcatccgggagctccgaagatgtagcatgatctaaagaagttgttttggtggtctggattgaaatgcgacgttgcacagtttgtgt 2186  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | || || | |||||||||||| |||| ||||| |||||| || || ||  || ||   || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  2185 attcttgttttatttgtcagaagtcgaaggatgagcgtcagaaacctgctggtatgatggtgtctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatc 2086  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactc 350  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  2085 catggattttgtgacgagtttgccgaatactc 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8810 - 8571
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |    
T  8810 agtagcttgagtatccatccgggagctacgaagatgtatgacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcaaagtttgtgt 8711  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttc 318  Q
    || | |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  8710 attcctgcttagtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatc 8611  T
Q  319 tatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagaggg 358  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||| |||| |||||||    
T  8610 catggattttgtgacgagtttgccgaatactcagagaggg 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3272 - 3006
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||    
T  3272 aatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacctgggagctacgaagatgtatcat 3173  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| | | |||| |||||||    
T  3172 gatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcgacgattgaacatcaga 3073  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  3072 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatccatggattt 3006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 363
Target Start/End: Original strand, 63259 - 63561
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||     
T  63259 aatttgaattcctgacgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcac 63358  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || | |  |||||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  63359 gatctaaagaagatattctggtggtctggattgaaacgcgatgtggcgcagtttgtgtattcctgttaggtttgtcagaagtcgaagattgaacataaga 63458  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggca 360  Q
    | || || ||  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  63459 aacctgctggtatgatggtatctttagatgtgccagagtggaaatgggatagtatatgcatggattttgtgacgagtttgccgaatactcctagagggaa 63558  T
Q  361 tga 363  Q
    |||    
T  63559 tga 63561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Original strand, 3634 - 3923
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatg 161  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| || |    
T  3634 atttgcattcctgacgatgtagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcatctgggtgctacgaagatgtatcacg 3733  T
Q  162 atttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    |||| |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | || |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3734 atttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgtggcacagtttgtgtattcctgtttggtttgtcagaagtcaaagattgagcatcagaa 3833  T
Q  262 tcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactcc 351  Q
     ||||| ||   | ||  ||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  3834 acccgctggtaagatggtatctttagatgtgccagaacggaaatgggatagtatatccatggattttgtgacgagtttgccgaatactcc 3923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 327
Target Start/End: Original strand, 1 - 188
Alignment:
Q  140 ggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcaga 239  Q
    ||||| || |||||||| |||||| | |||||  | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||| | |  |||| ||||||||    
T  1 ggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagttattttggtggtccggattgaaacgcgacgttgcacagtttgtgtattcttatttgatttgtcaga 100  T
Q  240 agtctaaggttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    | || ||||||||||||||||| || || ||  || ||  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  101 aatcgaaggttgagcatcagaaacctgctggtatgatggtatcattagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccatggattt 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 19353 - 19438
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  | || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  19353 agtagcttgagtattcatccgggagctacaaagatgtatcatggtttaaagaagatcttctggtggtctggattgaaacgtgatgt 19438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 57037 - 56895
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||  | || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  57037 agtagcttgagtatccacccgggagctacgaagatgtatcacgatttaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgtgatgtggcacaatttgtgt 56938  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | || ||   |||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  56937 attcctgtttagtttgtcagaagtcgaaaattgagcatcagaa 56895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Original strand, 196764 - 196906
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |    
T  196764 agtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagattttatggtggtctggattgaaacgagatgtggcatagtttgtgt 196863  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcagaa 261  Q
    || | || |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  196864 attcttgtttggtttgtcagaagtcgaagattgagcatcagaa 196906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 1
Alignment:
Q  25 ggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagtt 96  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  72 ggttgatgatcagggtgtgctgaggttcagaggaagagtttgtattcctgacaatgatgatttgaagaagtt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 356
Target Start/End: Original strand, 51 - 346
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||  | ||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||    
T  51 aatttgtattcctgacgatgaagagatgaagaaaataattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtttcat 150  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    ||| |||||||| | || | |||||| || ||||| || ||| | || |||||| | ||| | || ||   ||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  151 gatctgaagaaaattttctagtggtctggtttgaaacgcgatatggcacaatttttgtattcctgtttagtttgtcagaaatcgaagattgaacatcaca 250  T
Q  261 atcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagag 356  Q
    | || ||  |  || ||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| ||||| ||||    
T  251 aacctgctagtatgatggtatccttagatgtgccagagtggaaatgggacagtatatccatggagtttgtgacgagtttgccgaatactcctagag 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 363
Target Start/End: Original strand, 79721 - 80024
Alignment:
Q  60 aaatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtacca 159  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  79721 aaatttgtattcctgatgatgaagagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcaaccgggagctacgaagatgtatca 79820  T
Q  160 tgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcag 259  Q
    |||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || || ||||| |||  ||| ||   |||||| ||||| ||| | || ||||||    
T  79821 tgatctaaagaagattttctggtggtctggattgaaacgagatgtggcacagtttgtgtatttgtgtttattttgtcataagtcgaagatcgaacatcag 79920  T
Q  260 aatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggc 359  Q
    || || || ||  || ||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||| ||| | |||||  |||| ||||| ||||||     
T  79921 aaacctgctggtatgatggtatcgttagatgtgccagaatggaaatgggatagtatatccacggattttgtgacgagtttgtcgaatactcctagaggga 80020  T
Q  360 atga 363  Q
    ||||    
T  80021 atga 80024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 204
Target Start/End: Original strand, 162 - 305
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| | || ||| ||||| | ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  162 aatttgtattccagacaacgaagagattaagaagatgattcttgaagagagtcatagaagtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcat 261  T
Q  161 gatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgt 204  Q
    ||| | |||||  | || |||||||| || ||||| || |||||    
T  262 gatctaaagaagattttctggtggtctggtttgaaacgagatgt 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8307 - 8220
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    |||||| || ||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  8307 gattttggacgaaggtcaaaggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggctgttttggtgg 8220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25994 - 25943
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaaga 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  25994 agtagcttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcatgatctgaaga 25943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Original strand, 32677 - 32764
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  32677 gattttagacgaaggtcataaaagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 72231 - 72144
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  72231 gattttggacgaaggtcacaggagtagtctgagtattcatccaggagcaaataagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 72144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 39132 - 39214
Alignment:
Q  62 atttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagc 144  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39132 atttgtattccagacgatgatgagatgaagaaaatgattcttgaagagagtcataggagtaacttgagtattcatccgggagc 39214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 49606 - 49548
Alignment:
Q  305 tgggacagtatttctatggatttcgtgccaagtttaccgaacactccgagagggcatga 363  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49606 tgggatagcatttctatggattttgtggcgagtttaccaaacactccgagagggcatga 49548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 3456 - 3505
Alignment:
Q  17 gacatcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttg 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  3456 gacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 3505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 482 - 341
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgttt 218  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| || |||||||| || ||||||||||   ||||||||||| | ||  |||||  |||| ||||| | |||||||    
T  482 agtagtttgagtattcatctaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtggcctggaatgaagaatgatattgctgagtttgttt 383  T
Q  219 atgcgtgcttgacttgtcagaagtctaaggttgagcatcaga 260  Q
    |||| || |||  ||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  382 atgcttgtttggtttgtcagaaatcgaagattgaacatcaga 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3295
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  3230 agtagtttgagtattcatccaggagcaacgaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 3295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19067 - 19002
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  19067 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 19002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 30469 - 30518
Alignment:
Q  17 gacatcaaggttgatgatcagggtgttttgaggtccagatgaaaaatttg 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  30469 gacatcaaggttgatgatcagggtgtgttgaggttcagaggaagaatttg 30518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4724
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| | |||||  | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  4639 agtagcttgagtattcacccgggagctacgaagatgtatcatgatctaaagaagatattttggtggtctggattgaaacgcgatgt 4724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 327
Target Start/End: Original strand, 15739 - 15910
Alignment:
Q  149 aagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtggtccggcttgaagcgtgatgttgctcaatttgtttatgcgtgcttgacttgtcagaagtctaagg 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| ||| | || |||| ||||||       || |    
T  15739 aagatgtatcatgatttgaagaagttgttttggtggtctggattgaaacatgatgtggcacagtttgtgtattcctgtttgatttgtca-------aaag 15831  T
Q  249 ttgagcatcagaatcccgcagggttgttgacatcattagatgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    ||||||||||||| || |||| | || ||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  15832 ttgagcatcagaaacctgcagcgatgatgacacctttagatgtaccagagtggaaatgggatagcatatccatggattt 15910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10336 - 10249
Alignment:
Q  97 gattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    |||||| || ||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  10336 gattttggacgaaggtcataggagtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 10249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15096 - 15045
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaaga 170  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  15096 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtaccaggatttgaaga 15045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8475 - 8365
Alignment:
Q  61 aatttgtattcctgacaatgatgagttgaaaaagttgattttagaagaaagtcacaagagtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccat 160  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| | |  ||| ||||| | ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||     
T  8475 aatttgtattccagacaatggagagattacgaagatgattcttgaagagagtcatagaagtaacttgagtattcatccgggagctacgaagatgtatcac 8376  T
Q  161 gatttgaagaa 171  Q
    ||||| |||||    
T  8375 gatttaaagaa 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 461
Alignment:
Q  289 tgtgccggagtggaagtgggacagtatttctatggattt 327  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  499 tgtgccagagtggaagtgggatagtatttctatggattt 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3562 - 3497
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  3562 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 3497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 3161 - 3226
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  3161 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 9147 - 9212
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||   |||||||||||    
T  9147 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtattaggatttgaagaggttgttttggtgg 9212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24414 - 24349
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |   |||||||||||    
T  24414 agtagtttgagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaaaaggttgttttggtgg 24349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13863
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  13928 agtagtttgagtattcatccaggagcgactaagatgtatcaagatttgaagaggttgttttggtgg 13863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15676 - 15611
Alignment:
Q  119 agtagcttgagtattcatccgggagcaacaaagatgtaccatgatttgaagaaactgttttggtgg 184  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||    
T  15676 agtagtttaagtattcatccaggagcaactaagatgtatcaggatttgaagaggttgttttggtgg 15611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University