View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145A_low_12 (Length: 473)

Name: NF10145A_low_12
Description: NF10145A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145A_low_12
NF10145A_low_12
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (71-433)||(20774166-20774528)
chr5 (68-433)||(22462356-22462721)
chr5 (71-433)||(28894541-28894903)
chr5 (71-433)||(28916012-28916374)
chr5 (71-433)||(28923367-28923729)
chr5 (71-433)||(20821860-20822222)
chr5 (71-433)||(22235519-22235881)
chr5 (74-432)||(21890359-21890717)
chr5 (71-432)||(17268934-17269294)
chr5 (71-414)||(21563591-21563934)
chr5 (71-432)||(24716126-24716487)
chr5 (71-432)||(24619895-24620256)
chr5 (71-432)||(22503086-22503447)
chr5 (71-432)||(25848482-25848843)
chr5 (71-432)||(24749154-24749515)
chr5 (71-432)||(14886591-14886952)
chr5 (73-433)||(21831360-21831720)
chr5 (71-433)||(20342689-20343051)
chr5 (68-432)||(24797997-24798361)
chr5 (71-433)||(23079688-23080050)
chr5 (71-372)||(22381606-22381907)
chr5 (71-387)||(19770385-19770701)
chr5 (71-387)||(27668135-27668451)
chr5 (76-390)||(25423619-25423933)
chr5 (71-432)||(23471654-23472015)
chr5 (71-387)||(14999384-14999700)
chr5 (71-387)||(34566919-34567235)
chr5 (71-387)||(37291141-37291457)
chr5 (68-390)||(20467739-20468060)
chr5 (71-387)||(16356927-16357243)
chr5 (71-399)||(22332520-22332848)
chr5 (71-387)||(22348848-22349164)
chr5 (71-387)||(27610779-27611095)
chr5 (71-387)||(27685045-27685361)
chr5 (71-387)||(40709205-40709521)
chr5 (71-272)||(21339046-21339247)
chr5 (195-432)||(37542981-37543218)
chr5 (71-387)||(41771267-41771583)
chr5 (71-387)||(27518832-27519148)
chr5 (71-387)||(29475718-29476034)
chr5 (71-387)||(22135093-22135409)
chr5 (71-399)||(23574167-23574490)
chr5 (71-297)||(21497772-21497997)
chr5 (75-266)||(21496569-21496760)
chr5 (159-399)||(26738360-26738600)
chr5 (74-272)||(18776198-18776396)
chr5 (71-219)||(23516966-23517114)
chr5 (151-417)||(21407643-21407909)
chr5 (71-200)||(20799185-20799314)
chr5 (71-183)||(23440650-23440762)
chr5 (374-433)||(21680377-21680436)
chr5 (71-200)||(37545328-37545457)
chr5 (71-138)||(922-989)
chr5 (335-399)||(23440899-23440963)
chr5 (71-126)||(26738611-26738666)
chr5 (197-399)||(20799999-20800201)
chr5 (336-387)||(21338942-21338993)
chr5 (335-390)||(23517215-23517270)
chr5 (356-390)||(21936830-21936864)
chr5 (356-390)||(24581902-24581936)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (68-433)||(654-1019)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (68-433)||(20856250-20856615)
chr1 (71-433)||(20835377-20835739)
chr1 (71-433)||(22432605-22432967)
chr1 (71-433)||(19662626-19662992)
chr1 (71-433)||(20939552-20939914)
chr1 (71-432)||(19854821-19855174)
chr1 (71-432)||(31539487-31539848)
chr1 (71-432)||(24099093-24099454)
chr1 (71-432)||(37677588-37677949)
chr1 (71-432)||(20294920-20295281)
chr1 (71-399)||(21749449-21749777)
chr1 (67-399)||(50619767-50620099)
chr1 (71-387)||(16350134-16350450)
chr1 (71-399)||(22361767-22362095)
chr1 (71-387)||(51333028-51333344)
chr1 (71-387)||(21837458-21837774)
chr1 (71-387)||(33390564-33390880)
chr1 (71-387)||(21830811-21831127)
chr1 (71-387)||(17044550-17044866)
chr1 (71-297)||(16369805-16370031)
chr1 (71-219)||(19106875-19107023)
chr1 (134-390)||(20139401-20139657)
chr1 (67-399)||(19760389-19760721)
chr1 (332-432)||(21951678-21951778)
chr1 (140-399)||(20250379-20250638)
chr1 (71-183)||(16078391-16078503)
chr1 (71-183)||(41354208-41354320)
chr1 (71-144)||(41308333-41308406)
chr1 (356-390)||(20830924-20830958)
chr1 (335-387)||(16078191-16078243)
chr1 (335-387)||(20937686-20937738)
chr1 (335-387)||(41353197-41353249)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (68-433)||(95422-95787)
scaffold0029 (75-433)||(113087-113445)
scaffold0029 (71-387)||(109277-109593)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (71-432)||(27900879-27901240)
chr4 (71-432)||(15002782-15003143)
chr4 (71-432)||(15246417-15246778)
chr4 (71-432)||(1648695-1649056)
chr4 (73-433)||(15078130-15078490)
chr4 (71-433)||(8706411-8706773)
chr4 (71-403)||(15358537-15358869)
chr4 (71-431)||(15319644-15320004)
chr4 (71-432)||(3264212-3264573)
chr4 (71-433)||(33223416-33223778)
chr4 (71-432)||(11206649-11207010)
chr4 (71-432)||(29452955-29453316)
chr4 (67-433)||(14691391-14691757)
chr4 (71-432)||(20891475-20891836)
chr4 (73-432)||(44661284-44661643)
chr4 (71-433)||(15414443-15414805)
chr4 (67-432)||(14850524-14850889)
chr4 (74-387)||(16251648-16251961)
chr4 (71-387)||(8052826-8053142)
chr4 (71-387)||(8386905-8387221)
chr4 (71-387)||(12477093-12477409)
chr4 (71-387)||(14681060-14681376)
chr4 (71-387)||(27711829-27712145)
chr4 (71-387)||(29038607-29038923)
chr4 (67-395)||(1639620-1639948)
chr4 (71-399)||(7090925-7091253)
chr4 (71-387)||(12524169-12524485)
chr4 (71-399)||(15147076-15147403)
chr4 (71-387)||(40473533-40473849)
chr4 (71-387)||(18297698-18298014)
chr4 (71-387)||(19777996-19778312)
chr4 (71-387)||(23956240-23956556)
chr4 (71-387)||(14303181-14303497)
chr4 (71-404)||(16354631-16354964)
chr4 (74-387)||(18226649-18226962)
chr4 (78-395)||(14159970-14160287)
chr4 (140-216)||(18549694-18549770)
chr4 (356-390)||(15292618-15292652)
chr4 (73-111)||(16146409-16146447)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (74-432)||(67897-68255)
scaffold0034 (71-433)||(4373-4735)
scaffold0034 (71-432)||(13322-13683)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (71-433)||(15459693-15460055)
chr6 (71-433)||(34645148-34645510)
chr6 (71-433)||(21563694-21564056)
chr6 (71-433)||(21569553-21569915)
chr6 (71-432)||(25768548-25768909)
chr6 (71-433)||(19453777-19454139)
chr6 (75-433)||(21471962-21472320)
chr6 (71-432)||(8762496-8762857)
chr6 (71-433)||(14381029-14381391)
chr6 (71-432)||(5296769-5297130)
chr6 (73-410)||(17415845-17416182)
chr6 (71-433)||(27560179-27560541)
chr6 (71-432)||(22796195-22796556)
chr6 (71-432)||(18795047-18795408)
chr6 (71-423)||(28282385-28282737)
chr6 (74-433)||(19879658-19880017)
chr6 (71-433)||(10468411-10468773)
chr6 (71-432)||(24364769-24365130)
chr6 (71-387)||(1542692-1543008)
chr6 (71-399)||(18407538-18407866)
chr6 (71-387)||(24312776-24313092)
chr6 (71-404)||(5838810-5839143)
chr6 (67-399)||(15896447-15896779)
chr6 (71-399)||(19865044-19865372)
chr6 (71-402)||(28262790-28263121)
chr6 (71-402)||(28341539-28341870)
chr6 (71-387)||(16626325-16626641)
chr6 (71-387)||(29591528-29591844)
chr6 (134-387)||(20636909-20637162)
chr6 (71-387)||(2874411-2874727)
chr6 (71-399)||(22762051-22762379)
chr6 (75-402)||(28291965-28292292)
chr6 (78-399)||(27391769-27392090)
chr6 (71-399)||(25112909-25113237)
chr6 (78-399)||(27331029-27331350)
chr6 (71-399)||(22078286-22078614)
chr6 (68-387)||(25609469-25609788)
chr6 (71-399)||(16927236-16927564)
chr6 (71-399)||(23078826-23079154)
chr6 (71-387)||(27187793-27188109)
chr6 (71-387)||(27261131-27261447)
chr6 (71-390)||(22434226-22434545)
chr6 (74-339)||(11280161-11280426)
chr6 (68-207)||(17032737-17032876)
chr6 (134-432)||(18197291-18197589)
chr6 (71-154)||(1641129-1641212)
chr6 (71-214)||(16963148-16963291)
chr6 (365-433)||(19435653-19435721)
chr6 (158-390)||(22442711-22442943)
chr6 (71-218)||(27559765-27559912)
chr6 (134-219)||(21836973-21837058)
chr6 (356-390)||(1648419-1648453)
chr6 (167-297)||(18966984-18967114)
chr6 (359-390)||(23996893-23996924)
chr6 (356-390)||(16381978-16382012)
chr6 (374-424)||(19488843-19488893)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (71-432)||(6708-7069)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (71-433)||(10419690-10420052)
chr3 (71-432)||(13322298-13322659)
chr3 (71-433)||(14086795-14087157)
chr3 (71-433)||(13971765-13972127)
chr3 (71-433)||(17492752-17493114)
chr3 (71-433)||(18133991-18134353)
chr3 (71-424)||(12360196-12360549)
chr3 (71-432)||(16827849-16828209)
chr3 (71-432)||(16836156-16836517)
chr3 (71-433)||(13942146-13942508)
chr3 (74-432)||(14574054-14574406)
chr3 (71-423)||(8758737-8759089)
chr3 (71-423)||(41177644-41177996)
chr3 (71-432)||(11303419-11303780)
chr3 (71-432)||(28754440-28754801)
chr3 (71-432)||(47124066-47124427)
chr3 (71-423)||(4678560-4678912)
chr3 (71-433)||(44777369-44777731)
chr3 (71-375)||(15952671-15952975)
chr3 (71-432)||(10384091-10384451)
chr3 (71-424)||(16380582-16380935)
chr3 (71-432)||(16338158-16338519)
chr3 (71-386)||(15227771-15228086)
chr3 (71-432)||(9522831-9523192)
chr3 (71-414)||(16329324-16329668)
chr3 (71-404)||(12498360-12498693)
chr3 (71-404)||(16491866-16492199)
chr3 (71-387)||(10005712-10006028)
chr3 (71-399)||(17489962-17490290)
chr3 (71-402)||(6600848-6601179)
chr3 (284-433)||(11960814-11960963)
chr3 (71-387)||(5424632-5424948)
chr3 (71-387)||(10906322-10906638)
chr3 (71-387)||(13252802-13253118)
chr3 (71-387)||(16635885-16636201)
chr3 (71-387)||(43163209-43163525)
chr3 (71-402)||(53384705-53385036)
chr3 (71-387)||(48425559-48425875)
chr3 (72-219)||(14126464-14126611)
chr3 (71-387)||(15347947-15348263)
chr3 (71-387)||(20061756-20062072)
chr3 (68-399)||(16371522-16371853)
chr3 (71-253)||(12850104-12850286)
chr3 (74-387)||(16411984-16412297)
chr3 (68-399)||(14876188-14876520)
chr3 (71-387)||(15589094-15589410)
chr3 (74-402)||(16756272-16756600)
chr3 (68-366)||(15061865-15062163)
chr3 (73-387)||(15339383-15339697)
chr3 (74-387)||(26792101-26792414)
chr3 (71-387)||(15402212-15402528)
chr3 (71-387)||(16806628-16806944)
chr3 (74-399)||(15209006-15209331)
chr3 (74-387)||(15724636-15724949)
chr3 (71-297)||(16692272-16692502)
chr3 (75-399)||(15248263-15248587)
chr3 (71-219)||(11564551-11564699)
chr3 (83-272)||(15015573-15015762)
chr3 (68-126)||(11960986-11961044)
chr3 (32-68)||(14685174-14685210)
chr3 (377-433)||(31694831-31694887)
chr3 (377-433)||(31939331-31939387)
chr3 (71-110)||(26008961-26009000)
chr3 (356-390)||(8274098-8274132)
chr3 (356-390)||(13967039-13967073)
chr3 (356-390)||(30138213-30138247)
chr3 (356-390)||(30147764-30147798)
chr3 (356-433)||(16742359-16742436)
chr3 (32-68)||(10790579-10790615)
chr3 (80-244)||(18748796-18748960)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (132-432)||(468-768)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (71-433)||(20975511-20975873)
chr8 (71-432)||(1266797-1267158)
chr8 (71-424)||(21840976-21841329)
chr8 (71-432)||(31416335-31416696)
chr8 (74-432)||(23655489-23655847)
chr8 (73-433)||(22061293-22061653)
chr8 (71-433)||(20388658-20389020)
chr8 (71-433)||(22371499-22371861)
chr8 (71-432)||(19851970-19852331)
chr8 (71-432)||(19858006-19858367)
chr8 (71-432)||(803534-803895)
chr8 (71-432)||(6679670-6680031)
chr8 (71-423)||(31570712-31571064)
chr8 (71-432)||(16271085-16271446)
chr8 (71-432)||(22051422-22051783)
chr8 (71-432)||(6604217-6604578)
chr8 (71-432)||(27355107-27355468)
chr8 (71-433)||(29303286-29303648)
chr8 (68-432)||(14565698-14566062)
chr8 (71-432)||(12305317-12305678)
chr8 (67-432)||(20395986-20396351)
chr8 (67-432)||(22377315-22377680)
chr8 (67-432)||(22383490-22383855)
chr8 (69-389)||(23949476-23949796)
chr8 (71-387)||(19113249-19113565)
chr8 (71-390)||(16407949-16408267)
chr8 (71-389)||(21393769-21394087)
chr8 (71-389)||(21788263-21788581)
chr8 (71-404)||(21251500-21251833)
chr8 (71-387)||(32600703-32601019)
chr8 (71-432)||(20009780-20010122)
chr8 (73-399)||(21921630-21921955)
chr8 (71-387)||(17673929-17674245)
chr8 (71-387)||(18857136-18857452)
chr8 (71-399)||(21166432-21166759)
chr8 (75-399)||(22040422-22040746)
chr8 (75-387)||(30313050-30313362)
chr8 (71-399)||(23650600-23650928)
chr8 (71-399)||(19978526-19978854)
chr8 (71-219)||(22046932-22047080)
chr8 (75-216)||(15533943-15534084)
chr8 (74-387)||(22164098-22164411)
chr8 (75-387)||(22120080-22120392)
chr8 (71-387)||(22132947-22133263)
chr8 (68-390)||(22987757-22988074)
chr8 (71-178)||(20017865-20017972)
chr8 (71-183)||(19484980-19485092)
chr8 (353-432)||(22248278-22248357)
chr8 (140-216)||(19863684-19863760)
chr8 (140-216)||(19868321-19868397)
chr8 (356-389)||(21850241-21850274)
chr8 (335-399)||(21043268-21043332)
chr8 (101-216)||(22129017-22129132)
chr8 (356-390)||(16876998-16877032)
chr8 (36-68)||(1733390-1733422)
chr8 (335-387)||(19483970-19484022)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (71-433)||(33097-33459)
scaffold0076 (233-433)||(56320-56520)
scaffold0076 (356-390)||(41067-41101)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (71-433)||(49934-50296)
scaffold0028 (71-387)||(43678-43994)
scaffold0028 (71-387)||(8998-9314)
scaffold0028 (71-219)||(15460-15608)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (71-433)||(6658-7020)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (71-433)||(51600-51962)
scaffold0067 (71-433)||(60634-60996)
scaffold0067 (71-433)||(67022-67384)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (71-433)||(118092-118454)
scaffold0004 (71-421)||(323228-323578)
scaffold0004 (71-433)||(202888-203250)
scaffold0004 (71-272)||(386343-386544)
scaffold0004 (68-297)||(112542-112771)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (71-433)||(27365036-27365398)
chr2 (71-433)||(19652009-19652371)
chr2 (71-432)||(24641866-24642227)
chr2 (224-432)||(27210130-27210338)
chr2 (71-433)||(23276900-23277262)
chr2 (71-433)||(24948713-24949075)
chr2 (71-423)||(12574477-12574829)
chr2 (71-432)||(1063875-1064236)
chr2 (71-432)||(20828383-20828744)
chr2 (71-432)||(20833109-20833470)
chr2 (71-419)||(21125130-21125476)
chr2 (71-423)||(27787865-27788217)
chr2 (71-432)||(31830782-31831143)
chr2 (71-303)||(23294082-23294314)
chr2 (119-433)||(23110907-23111221)
chr2 (71-432)||(11357832-11358193)
chr2 (71-399)||(24675613-24675941)
chr2 (74-387)||(27371396-27371709)
chr2 (71-387)||(9610260-9610576)
chr2 (71-399)||(21325257-21325585)
chr2 (71-387)||(27218140-27218456)
chr2 (71-387)||(16923013-16923329)
chr2 (71-387)||(16982276-16982592)
chr2 (71-387)||(17063841-17064157)
chr2 (71-387)||(17067499-17067815)
chr2 (71-387)||(22324859-22325175)
chr2 (71-387)||(24707485-24707801)
chr2 (134-399)||(23107721-23107986)
chr2 (74-387)||(24262497-24262810)
chr2 (71-387)||(10868974-10869290)
chr2 (71-387)||(16925484-16925800)
chr2 (71-387)||(16999124-16999440)
chr2 (71-399)||(22756456-22756784)
chr2 (71-297)||(23064201-23064427)
chr2 (74-387)||(21145044-21145357)
chr2 (71-384)||(41608391-41608704)
chr2 (71-387)||(24876752-24877068)
chr2 (327-433)||(23294315-23294421)
chr2 (71-219)||(24710157-24710305)
chr2 (71-219)||(44385740-44385888)
chr2 (73-219)||(20442684-20442830)
chr2 (71-219)||(23189131-23189279)
chr2 (80-433)||(45529644-45529997)
chr2 (71-270)||(30211037-30211236)
chr2 (211-432)||(24819644-24819865)
chr2 (67-200)||(24825472-24825605)
chr2 (233-399)||(21890709-21890875)
chr2 (356-387)||(22276687-22276718)
chr2 (328-387)||(24710415-24710474)
chr2 (332-387)||(44385572-44385627)
chr2 (356-389)||(12640234-12640267)
chr2 (92-245)||(25128792-25128945)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (73-433)||(14285780-14286140)
chr7 (74-433)||(13666023-13666382)
chr7 (71-433)||(6413994-6414356)
chr7 (71-432)||(13021840-13022201)
chr7 (71-432)||(19147694-19148055)
chr7 (71-432)||(20747093-20747454)
chr7 (71-432)||(15102008-15102369)
chr7 (68-432)||(11305668-11306032)
chr7 (71-423)||(18053367-18053719)
chr7 (71-433)||(14130356-14130718)
chr7 (71-433)||(23505274-23505636)
chr7 (71-433)||(14434174-14434536)
chr7 (71-432)||(14263649-14264010)
chr7 (71-432)||(49152784-49153145)
chr7 (74-432)||(16071699-16072057)
chr7 (203-433)||(19613290-19613520)
chr7 (71-432)||(16949876-16950237)
chr7 (71-433)||(11387832-11388194)
chr7 (68-433)||(15340911-15341276)
chr7 (71-433)||(12206204-12206566)
chr7 (67-390)||(15625030-15625353)
chr7 (71-432)||(8211533-8211894)
chr7 (69-432)||(812-1175)
chr7 (71-432)||(12456185-12456546)
chr7 (71-432)||(13968073-13968434)
chr7 (69-423)||(11771677-11772031)
chr7 (71-432)||(26118010-26118371)
chr7 (71-387)||(12687983-12688299)
chr7 (248-433)||(12457300-12457485)
chr7 (71-387)||(9596539-9596855)
chr7 (71-387)||(18551230-18551546)
chr7 (71-387)||(8199110-8199426)
chr7 (71-387)||(44790823-44791139)
chr7 (71-398)||(14040178-14040504)
chr7 (71-398)||(14350208-14350534)
chr7 (71-387)||(11236685-11237001)
chr7 (71-387)||(8708087-8708403)
chr7 (71-387)||(10871477-10871793)
chr7 (71-387)||(11552574-11552890)
chr7 (71-387)||(13686546-13686862)
chr7 (71-387)||(14332879-14333195)
chr7 (71-387)||(15160529-15160845)
chr7 (67-399)||(15154117-15154449)
chr7 (71-387)||(18178224-18178540)
chr7 (75-387)||(16788-17100)
chr7 (80-414)||(21662452-21662786)
chr7 (71-244)||(14955102-14955275)
chr7 (104-387)||(23203085-23203368)
chr7 (104-387)||(23509212-23509495)
chr7 (258-390)||(321506-321638)
chr7 (80-244)||(4440419-4440583)
chr7 (71-129)||(23199451-23199509)
chr7 (356-390)||(27107243-27107277)
chr7 (71-107)||(12457262-12457298)
chr7 (32-64)||(14325743-14325775)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (71-433)||(19644-20006)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (71-432)||(27749-28110)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (71-433)||(41443-41803)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (71-433)||(21091-21453)
scaffold0235 (147-433)||(10877-11163)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (71-432)||(20507-20868)
scaffold0298 (71-349)||(12865-13143)
scaffold0298 (71-349)||(16635-16913)
scaffold0298 (345-433)||(11477-11565)
scaffold0298 (345-433)||(15247-15335)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (71-424)||(40262-40615)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (78-433)||(25285-25640)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (71-433)||(48627-48989)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (71-433)||(46819-47181)
scaffold0010 (71-432)||(41754-42115)
scaffold0010 (71-432)||(2445-2806)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (71-432)||(10317-10678)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (71-432)||(27048-27409)
scaffold0192 (71-249)||(26666-26844)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (73-432)||(17958-18317)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (73-432)||(3277-3636)
scaffold0035 (140-216)||(12833-12909)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (78-433)||(195124-195479)
scaffold0011 (68-432)||(149091-149455)
scaffold0011 (69-421)||(25965-26317)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (71-433)||(4872-5234)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (164-432)||(5830-6098)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (71-431)||(5757-6117)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (74-433)||(100972-101331)
scaffold0020 (73-399)||(180725-181051)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (71-433)||(944-1306)
scaffold0120 (71-387)||(6547-6863)
scaffold0120 (335-387)||(12846-12898)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (71-414)||(114704-115052)
scaffold0001 (71-272)||(90513-90714)
scaffold0001 (67-390)||(390663-390986)
scaffold0001 (132-272)||(89835-89975)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (71-429)||(6660-7019)
scaffold0149 (71-429)||(11091-11450)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (71-433)||(44029-44391)
scaffold0114 (71-433)||(45041-45403)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (74-432)||(47651-48009)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (71-433)||(6456-6818)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (147-432)||(2188-2473)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (71-432)||(51284-51645)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (92-433)||(81252-81593)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (68-424)||(12215-12570)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (173-433)||(13719-13979)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (71-433)||(11293-11655)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (214-432)||(57268-57486)
scaffold0053 (68-432)||(48455-48819)
scaffold0053 (71-129)||(57541-57599)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (71-432)||(1393-1754)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (71-432)||(4954-5315)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (71-432)||(393-754)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (71-432)||(5274-5635)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (71-432)||(570-931)
scaffold0139 (71-198)||(28043-28170)
scaffold0139 (71-198)||(34296-34423)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (68-433)||(260829-261194)
scaffold0005 (71-387)||(278296-278612)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (147-433)||(7660-7946)
scaffold0222 (71-433)||(2775-3137)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (71-413)||(31934-32276)
scaffold0106 (71-404)||(14563-14896)
scaffold0106 (71-219)||(17965-18113)
scaffold0106 (151-387)||(18321-18557)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (75-414)||(28207-28546)
scaffold0064 (75-414)||(40198-40537)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (71-432)||(2318-2679)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (71-432)||(3315-3676)
scaffold0403 (71-404)||(6896-7229)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (71-394)||(2336-2657)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (74-432)||(249140-249498)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (71-424)||(43307-43660)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (73-433)||(19375-19735)
scaffold0090 (73-433)||(23537-23897)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (71-349)||(11412-11690)
scaffold0124 (71-252)||(5-186)
scaffold0124 (345-433)||(12996-13084)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (211-433)||(528-750)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (71-433)||(24492-24853)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (71-432)||(16134-16495)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (224-433)||(5-210)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (183-432)||(14618-14867)
scaffold0261 (183-432)||(22797-23046)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (71-432)||(17883-18233)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (71-433)||(32739-33101)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (71-432)||(26785-27146)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (212-384)||(49437-49609)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (134-433)||(12081-12380)
scaffold0483 (71-154)||(9782-9865)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (67-432)||(1428-1793)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (71-399)||(19126-19454)
scaffold0081 (71-272)||(50017-50218)
scaffold0081 (134-399)||(34613-34878)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (67-414)||(25158-25505)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (73-432)||(218838-219197)
scaffold0012 (67-399)||(229563-229895)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (71-432)||(4555-4916)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (72-404)||(19451-19783)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (71-399)||(32207-32534)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (71-404)||(6573-6906)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (67-432)||(3660-4025)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (71-390)||(1991-2310)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (71-410)||(15859-16198)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (249-432)||(20096-20279)
scaffold0104 (249-432)||(22916-23099)
scaffold0104 (71-252)||(1052-1233)
scaffold0104 (152-252)||(12582-12682)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (69-386)||(3872-4189)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (69-386)||(9118-9435)
scaffold0109 (69-387)||(33039-33357)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (67-423)||(9490-9846)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (71-387)||(160-476)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (71-399)||(14884-15212)
scaffold0044 (71-387)||(1144-1460)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (208-424)||(28718-28934)
scaffold0026 (71-213)||(37726-37868)
scaffold0026 (181-399)||(29578-29797)
[»] scaffold0600 (2 HSPs)
scaffold0600 (71-245)||(4399-4573)
scaffold0600 (352-433)||(4581-4662)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (134-399)||(39465-39730)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (71-399)||(277-605)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (71-399)||(63485-63813)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (71-410)||(14522-14861)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (75-399)||(3911-4232)
scaffold0023 (71-248)||(130672-130849)
scaffold0023 (71-270)||(28963-29161)
scaffold0023 (80-206)||(59287-59413)
scaffold0023 (335-399)||(28826-28890)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (71-432)||(15401-15762)
scaffold0040 (74-387)||(112953-113266)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (71-399)||(3268-3596)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (71-271)||(13011-13211)
scaffold0293 (335-387)||(13256-13308)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (71-399)||(220-548)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (71-387)||(7921-8237)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (71-399)||(4553-4881)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (71-387)||(7463-7779)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (71-399)||(16179-16507)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (71-297)||(18761-18987)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (71-404)||(25498-25831)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (281-433)||(482-633)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (71-247)||(622-798)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (87-399)||(2914-3226)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (344-432)||(7566-7654)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (71-387)||(7890-8206)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (71-387)||(22391-22707)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (147-399)||(8541-8793)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (75-387)||(65933-66245)
scaffold0042 (71-399)||(39274-39601)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (71-245)||(68199-68373)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (101-398)||(4425-4722)
scaffold0270 (101-398)||(11555-11852)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (71-387)||(938-1254)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (68-399)||(1197-1528)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (67-390)||(116368-116691)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (71-390)||(196941-197260)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (71-399)||(6538-6866)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (71-387)||(8314-8630)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (71-390)||(5745-6064)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (71-272)||(80075-80276)
scaffold0022 (67-99)||(126953-126985)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (211-399)||(7345-7533)
scaffold0379 (67-183)||(12647-12763)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (356-432)||(20862-20938)
scaffold0077 (356-390)||(27729-27763)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (71-218)||(844-991)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (227-433)||(10228-10434)
scaffold0130 (71-165)||(10428-10522)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (71-387)||(7797-8110)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (80-414)||(5031-5364)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (71-297)||(9867-10093)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (74-198)||(4953-5077)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (147-399)||(24098-24350)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (73-399)||(1791-2117)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (71-210)||(1523-1662)
scaffold0413 (335-399)||(1681-1745)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (333-432)||(17467-17566)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (374-433)||(34015-34074)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (211-432)||(11618-11839)
scaffold0018 (211-432)||(17810-18031)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (150-433)||(85938-86213)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (356-397)||(880-921)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (235-306)||(17524-17595)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (158-245)||(71830-71917)
scaffold0021 (92-245)||(33021-33174)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (356-390)||(3338-3372)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (356-390)||(3967-4001)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (356-390)||(24203-24237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (356-406)||(3391-3441)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (356-390)||(44347-44381)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (80-245)||(182-347)
[»] scaffold1701 (1 HSPs)
scaffold1701 (32-64)||(28-60)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (71-111)||(195-235)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 20774166 - 20774528
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774166 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttg 20774265  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774266 ggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 20774365  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774366 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcgaagtattaggtaaacttgacacaaaatccatagaa 20774465  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20774466 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 20774528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 22462356 - 22462721
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22462356 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 22462455  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462456 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaactccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 22462555  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462556 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 22462655  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462656 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28894903 - 28894541
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28894903 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28894804  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894803 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28894704  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894703 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28894604  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28894603 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28894541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28916374 - 28916012
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28916374 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28916275  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916274 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28916175  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28916174 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28916075  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28916074 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28916012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 28923729 - 28923367
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28923729 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28923630  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923629 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28923530  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28923529 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28923430  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28923429 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 28923367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 20821860 - 20822222
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20821860 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcg 20821959  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20821960 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataacttatattaat 20822059  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20822060 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 20822159  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20822160 atactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcctctgatgt 20822222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22235881 - 22235519
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  22235881 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttg 22235782  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  22235781 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactaagctaccgaataactaatattaat 22235682  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22235681 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaaccaatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22235582  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22235581 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatgt 22235519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21890717 - 21890359
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  21890717 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 21890618  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||     
T  21890617 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgg 21890518  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21890517 aataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattttgtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 21890418  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21890417 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatg 21890359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17269294 - 17268934
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||   | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  17269294 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 17269196  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17269195 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 17269096  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17269095 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 17268996  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  17268995 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggtttctgatg 17268934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21563934 - 21563591
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21563934 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21563835  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  21563834 gatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaat 21563735  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21563734 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcgtgccctcttggagtattcggtaaacttgtcacaaaatccatggat 21563635  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21563634 atgctatcccatttccactccggcacatccaatggtgtcaacaa 21563591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24716487 - 24716126
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24716487 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24716388  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24716387 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24716288  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24716287 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24716188  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24716187 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24716126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24620256 - 24619895
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24620256 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24620157  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24620156 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24620057  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24620056 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24619957  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24619956 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24619895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 22503086 - 22503447
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  22503086 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 22503185  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22503186 gatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 22503285  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503286 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctttcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22503385  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  22503386 atactgtcccacttccactccgatacatccaacggtgacaacaaccctgcaggcttctgatg 22503447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 25848482 - 25848843
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  25848482 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 25848581  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25848582 gatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctactggataactgatattgat 25848681  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |  |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  25848682 aggaataaagtgtgccgacttcatcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgctctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 25848781  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25848782 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25848843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24749515 - 24749154
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24749515 tccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24749416  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24749415 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24749316  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24749315 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24749216  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24749215 ataatgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcgggcttctgatg 24749154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14886952 - 14886591
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  14886952 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 14886853  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14886852 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 14886753  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  14886752 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 14886653  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14886652 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14886591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831360
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |     
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |  |||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || |    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattg 21831521  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||    
T  21831520 gaataaagtgcgccgacttcgacaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaatcttgttacaaaatccatgcatat 21831421  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  21831420 gctatctcattttcactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagtaggcttctgatgt 21831360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 20342689 - 20343051
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20342689 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20342788  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20342789 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 20342888  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20342889 aggaatgaagtgtgccgacttcctcaaccggtcgacaacgacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20342988  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20342989 atactgtcccacttccactccggtacgtccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24798361 - 24797997
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 24798162  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||||     
T  24798161 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatg 24798062  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24798061 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24797997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23080050 - 23079688
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  23080050 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 23079951  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      || ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23079950 aatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 23079851  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
       |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23079850 atgaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 23079751  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23079750 atattgtccgacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23079688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 372
Target Start/End: Original strand, 22381606 - 22381907
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22381606 tccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22381705  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22381706 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaacataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22381805  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22381806 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctatcaaccagaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 22381905  T
Q  371 at 372  Q
    ||    
T  22381906 at 22381907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 19770385 - 19770701
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19770385 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19770484  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19770485 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19770584  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  19770585 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 19770684  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  19770685 atactatcccatttcca 19770701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27668451 - 27668135
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27668451 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27668352  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27668351 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27668252  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27668251 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27668152  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27668151 atactatcccatttcca 27668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 390
Target Start/End: Original strand, 25423619 - 25423933
Alignment:
Q  76 ctgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25423619 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatct 25423718  T
Q  176 ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaa 275  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||| ||    
T  25423719 ctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaatcggaa 25423818  T
Q  276 tgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgct 375  Q
      || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  25423819 gaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatact 25423918  T
Q  376 atcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||    
T  25423919 atcccatttccactc 25423933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 23471654 - 23472015
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaatattgcgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaat 23471853  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23471854 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacacaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23471953  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  23471954 atgctatcccatttccactatggtatatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 23472015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14999700 - 14999384
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14999700 tccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14999601  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14999600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 14999501  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14999500 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14999401  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  14999400 atactatcccatttcca 14999384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 34566919 - 34567235
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  34566919 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 34567018  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  34567019 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 34567118  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  34567119 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 34567218  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  34567219 atactatcccatttcca 34567235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37291457 - 37291141
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  37291457 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 37291358  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  37291357 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 37291258  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  37291257 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 37291158  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  37291157 atactatcccatttcca 37291141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20468060 - 20467739
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20468060 ctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 20467961  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20467960 tcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgtcaactgagatacaggacaactgatatt 20467861  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20467860 aatcggaatgaa-tgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatg 20467762  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  20467761 gatatactatcccatttccactc 20467739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 16356927 - 16357243
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16356927 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16357026  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16357027 gatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16357126  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16357127 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16357226  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16357227 atactatcccatttcca 16357243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22332848 - 22332520
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22332848 tccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22332749  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22332748 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22332649  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22332648 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22332549  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22332548 atactatcccacttccattccggcacatc 22332520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 22348848 - 22349164
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22348848 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22348947  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22348948 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22349047  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||  || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22349048 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataaccctaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22349147  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  22349148 atactatcccatttcca 22349164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 27610779 - 27611095
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27610779 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27610878  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27610879 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27610978  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27610979 aggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27611078  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27611079 atactatcccatttcca 27611095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27685361 - 27685045
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27685361 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27685262  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27685261 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27685162  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27685161 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27685062  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27685061 atactatcccatttcca 27685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 40709205 - 40709521
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40709205 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40709304  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  40709305 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 40709404  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  40709405 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40709504  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  40709505 atactatcccatttcca 40709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21339247 - 21339046
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  21339247 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 21339148  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21339147 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 21339048  T
Q  271 cg 272  Q
    ||    
T  21339047 cg 21339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37543218 - 37542981
Alignment:
Q  195 acggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgt 294  Q
    ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  37543218 acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgactttgt 37543119  T
Q  295 caacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggt 394  Q
    ||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||    
T  37543118 caaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccactctggt 37543019  T
Q  395 acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37543018 acatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37542981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 41771267 - 41771583
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41771267 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41771366  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||    
T  41771367 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatactaat 41771466  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41771467 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41771566  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  41771567 atactatcccatttcca 41771583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 27518832 - 27519148
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27518832 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27518931  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27518932 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27519031  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27519032 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27519131  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27519132 atactatcccatttcca 27519148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29476034 - 29475718
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||| |  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29476034 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29475935  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | || ||| || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  29475934 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttaatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 29475835  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29475834 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29475735  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  29475734 atactatcccatttcca 29475718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 22135093 - 22135409
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22135093 tccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22135192  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  22135193 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 22135292  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22135293 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22135392  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  22135393 atactatcccatttcca 22135409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 23574167 - 23574490
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  23574167 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 23574266  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  23574267 gatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctgccaactgggcaaccggaaaactaatattaat 23574366  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||     || || |  |||||  | |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23574367 cggtagaaaatgagccgacttcgtca-----tcaacaatcacccaatttgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23574461  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23574462 atactatcccatttccactctggcacatc 23574490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21497997 - 21497772
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||| || |||||||||  |||||||| ||||    
T  21497997 tccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttg 21497898  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21497897 gatctctatctgacacaatgctcga-agaacaccatgcaacttcacaatatcatgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21497799  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  21497798 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 21497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 266
Target Start/End: Original strand, 21496569 - 21496760
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21496569 actgaccatctatttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 21496668  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21496669 tctatccgacacaatacttgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatatccgccaactgagctaccggaaaactaatat 21496760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26738600 - 26738360
Alignment:
Q  159 aagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggata 258  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||  || ||| |    
T  26738600 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaattgagaaacaggaaa 26738501  T
Q  259 actgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcaca 358  Q
    | ||||||||||   || ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||    
T  26738500 attgatattaattagaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcaca 26738401  T
Q  359 aaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26738400 aaatccatggatatgctatcacatttccactctggtacatc 26738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 272
Target Start/End: Original strand, 18776198 - 18776396
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18776198 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggat 18776297  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||    
T  18776298 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgatttaaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatattaatcg 18776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 23516966 - 23517114
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||    
T  23516966 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttg 23517065  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  23517066 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaat 23517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 417
Target Start/End: Original strand, 21407643 - 21407909
Alignment:
Q  151 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 250  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| |    
T  21407643 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagat 21407742  T
Q  251 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 350  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |   | || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| || ||||    
T  21407743 acaggaaaactgatgttaatcggaataaaatgggccgacttcgttagtgtatccacaattacccaaatcgcataatgtccttttggagtattcggaaaac 21407842  T
Q  351 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacc 417  Q
    | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| || | ||| || ||||||||||||||    
T  21407843 tcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaaacc 21407909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Original strand, 20799185 - 20799314
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  20799185 tccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 20799284  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 200  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20799285 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Original strand, 23440650 - 23440762
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  23440650 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 23440749  T
Q  171 ggtctctatctga 183  Q
    | |||||||||||    
T  23440750 gatctctatctga 23440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21680436 - 21680377
Alignment:
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21680436 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 21680377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37545457 - 37545328
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||| || |||| || || ||||| ||||| |    
T  37545457 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcg 37545358  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 200  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||    
T  37545357 gatctctatccgacacaatgctagacggaa 37545328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 922
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttg 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||    
T  989 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttg 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 23440899 - 23440963
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23440899 ggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26738666 - 26738611
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  26738666 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacc 26738611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 399
Target Start/End: Original strand, 20799999 - 20800201
Alignment:
Q  197 ggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtca 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| | || ||||||||||  |  || || |||||||| ||||    
T  20799999 ggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaacctaatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtca 20800098  T
Q  297 acctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtac 396  Q
    | || || |  | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  20800099 atctatcaataataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggtaaacgcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcac 20800198  T
Q  397 atc 399  Q
    |||    
T  20800199 atc 20800201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21338993 - 21338942
Alignment:
Q  336 gagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21338993 gagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttcca 21338942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 390
Target Start/End: Original strand, 23517215 - 23517270
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23517215 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 23517270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21936864 - 21936830
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21936864 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 21936830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 24581902 - 24581936
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24581902 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24581936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 654
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  1019 ctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaact 920  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  919 ttgggtctctatttgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgctaactgagctactggataactgatatt 820  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  819 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 720  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  719 gaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20856615 - 20856250
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20856615 ctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 20856516  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856515 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 20856416  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856415 aatcagaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 20856316  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856315 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 20856250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20835739 - 20835377
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||| | ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20835739 tccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 20835640  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20835639 gatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 20835540  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20835539 cggaataaaatgcgtcgactttgtcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20835440  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20835439 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22432967 - 22432605
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || ||  |||| ||||| |    
T  22432967 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcg 22432868  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22432867 gatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattttctgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22432768  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432767 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22432668  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22432667 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22432605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19662992 - 19662626
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19662992 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19662893  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19662892 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19662793  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||    
T  19662792 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccacatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataaaa 19662693  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggt----acatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||| ||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19662692 atgctataccacttccactccggccggcacatccaacggtgtcaacaactctgcaggcttctgatgt 19662626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20939914 - 20939552
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20939914 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20939815  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20939814 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcattatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccgaataattgatattaat 20939715  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20939714 cgaaataaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagcgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20939615  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20939614 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20939552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 19854821 - 19855174
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  19854821 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 19854920  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19854921 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcaccatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 19855020  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19855021 cggaataaagtgcgccgactt--------tgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19855112  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19855113 atgctatcccacttccactctggcacatccaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 19855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31539848 - 31539487
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31539848 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31539749  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31539748 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 31539649  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||     
T  31539648 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagag 31539549  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31539548 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31539487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24099454 - 24099093
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24099454 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24099355  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24099354 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattgat 24099255  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24099254 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatagcatcatgccctctcgtagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 24099155  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24099154 atactgtcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24099093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 37677588 - 37677949
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  37677588 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 37677687  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37677688 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 37677787  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  37677788 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactagttacaaaatccatagag 37677887  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37677888 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 37677949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 20294920 - 20295281
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||| |||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20294920 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20295019  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  20295020 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgagtaactgatattaat 20295119  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || | |||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  20295120 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaataacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 20295219  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20295220 ataatgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20295281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 21749449 - 21749777
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21749449 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21749548  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21749549 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21749648  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  21749649 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 21749748  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21749749 atactatcccatttccactctggcacatc 21749777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 50620099 - 50619767
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  50620099 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 50620000  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    ||| || ||||| ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  50619999 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatttcacaatatcacaaatataaatctctgccaactgagaaacaagaaaactgatat 50619900  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    ||||||  ||||| || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  50619899 taatcgggatgaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 50619800  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50619799 ggatatactatcccatttccactctggtacatc 50619767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16350450 - 16350134
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16350450 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16350351  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  16350350 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 16350251  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16350250 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16350151  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16350150 atactatcccatttcca 16350134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22362095 - 22361767
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |  ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22362095 tccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22361996  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |   || ||| |||| ||||||||    
T  22361995 ggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctccgccaactaataaacaggaaaactaatattaat 22361896  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22361895 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22361796  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22361795 atactatcccatttccactctggcacatc 22361767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 51333344 - 51333028
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51333344 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 51333245  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  51333244 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 51333145  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  51333144 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 51333045  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  51333044 atactatcccatttcca 51333028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 21837458 - 21837774
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21837458 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21837557  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  21837558 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 21837657  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21837658 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctgggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21837757  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  21837758 atactatcccatttcca 21837774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33390880 - 33390564
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  33390880 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 33390781  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  33390780 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 33390681  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  33390680 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 33390581  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  33390580 atactatcccatttcca 33390564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 21830811 - 21831127
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21830811 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21830910  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  21830911 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 21831010  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21831011 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 21831110  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  21831111 atactatcccatttcca 21831127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17044866 - 17044550
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  17044866 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 17044767  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||    
T  17044766 gatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacaggaaaactaatattaat 17044667  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17044666 cggtagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17044567  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  17044566 atactatcccatttcca 17044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Original strand, 16369805 - 16370031
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  | || ||  | ||||| ||||   |||||||||| |||||||| || |    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagctataggaaaactgatattaat 16370004  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  16370005 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 16370031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 19106875 - 19107023
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  19106875 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattg 19106974  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19106975 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19107023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 390
Target Start/End: Original strand, 20139401 - 20139657
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  20139401 tcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcccaaatgtaaa 20139500  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    | || |||||| |||  || ||  |||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  20139501 tttctgccaaccgagaaacagggaaactaatattaatcggaagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgtgtcattccctct 20139600  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20139601 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 20139657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 19760721 - 19760389
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| || ||||||    
T  19760721 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaac 19760622  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    || || | |||||| || || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||     ||||| |||||||| |||| || |||  || |||||||||    
T  19760621 ctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcagatgtaaatctccgctaactaagatacatgaaaactgatat 19760522  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| || |  ||||  ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19760521 taatcgaaattaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatagcgtcatttcctttcggagtactcggcaaacttgtcacaaaatccat 19760422  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19760421 ggatatactatctcatttccactctggcacatc 19760389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 332 - 432
Target Start/End: Original strand, 21951678 - 21951778
Alignment:
Q  332 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 431  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21951678 ctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 21951777  T
Q  432 g 432  Q
    |    
T  21951778 g 21951778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 399
Target Start/End: Original strand, 20250379 - 20250638
Alignment:
Q  140 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccg 239  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||   |||| || ||||| |    
T  20250379 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgccaattcacaatatcacgaatataaatctctg 20250478  T
Q  240 ccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 339  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||    
T  20250479 ccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtaattccctttaggagt 20250578  T
Q  340 attaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||    
T  20250579 attcggaaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccactctggcacatc 20250638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16078503 - 16078391
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16078503 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16078404  T
Q  171 ggtctctatctga 183  Q
    | |||||||||||    
T  16078403 gatctctatctga 16078391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41354320 - 41354208
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41354320 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41354221  T
Q  171 ggtctctatctga 183  Q
    | |||||||||||    
T  41354220 gatctctatctga 41354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 41308333 - 41308406
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaact 144  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||    
T  41308333 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20830958 - 20830924
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20830958 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 20830924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16078243 - 16078191
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16078243 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 16078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Original strand, 20937686 - 20937738
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20937686 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20937738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 41353249 - 41353197
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41353249 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 41353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 95787 - 95422
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95787 ctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaacc 95688  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  95687 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctggatgtagatttccgccaactgagctactgggtaacttatatt 95588  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  95587 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacgaaatccata 95488  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  95487 gaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgt 95422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 113087 - 113445
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |  ||    
T  113087 actgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatc 113186  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| |||||||| || || | | |||||||||| || | |    
T  113187 tctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatgtcccgaatataaatctctgccaactgcgccaccgtaaaactgatatttattgga 113286  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  113287 ataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatattgaatcatgtcctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatac 113386  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  113387 tatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 109593 - 109277
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  109593 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 109494  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  109493 gttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 109394  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  109393 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatcgat 109294  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  109293 atactatcccatttcca 109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 27900879 - 27901240
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  27900879 tccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccg 27900978  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27900979 ggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaat 27901078  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901079 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27901178  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27901179 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 27901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15003143 - 15002782
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  15003143 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 15003044  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||    
T  15003043 ggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaaccgagctaccggataactaacattgat 15002944  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  15002943 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 15002844  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  15002843 atgatctcccacttccgctctggcacatctaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatg 15002782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 15246417 - 15246778
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15246417 tccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15246516  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  15246517 aatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattgtgaatataaatctctgccaactgagctattggataactaatattgat 15246616  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  15246617 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 15246716  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15246717 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15246778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1649056 - 1648695
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  || ||||||| ||||| ||||| |    
T  1649056 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcg 1648957  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1648956 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaatatgatgaatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatattaat 1648857  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1648856 aggaatgaaatgtgccgacttagtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtattaggtaaactcgttacaaaatccatagaa 1648757  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1648756 atgctgtcccatttccactccagtatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatg 1648695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Original strand, 15078130 - 15078490
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15078130 cgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgga 15078229  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  15078230 tctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactaagctaccggaaaactaatattgatcg 15078329  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15078330 gaataaaatgcgccgacttcatcaacctttcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaatccatggaaat 15078429  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    | | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  15078430 gttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcattaaccctgcaggcttctgatgt 15078490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 8706411 - 8706773
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8706411 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8706510  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  8706511 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgat 8706610  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8706611 tggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 8706710  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  8706711 atgctatctcatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 8706773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15358869 - 15358537
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||| |    
T  15358869 tccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcg 15358770  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358769 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 15358670  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15358669 tggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcagaaaatccatagaa 15358570  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaac 403  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15358569 atactgtcccatttccactccggcacatccaac 15358537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 431
Target Start/End: Original strand, 15319644 - 15320004
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  15319644 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 15319743  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  15319744 gatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatttccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 15319843  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  || || ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  15319844 cgggataaaatgccccgagttcgtcaacctatcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 15319943  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 431  Q
    ||| | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15319944 atgttgtcccacttccactctcgcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgat 15320004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3264573 - 3264212
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  3264573 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 3264474  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3264473 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 3264374  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  3264373 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 3264274  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3264273 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 3264212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 33223416 - 33223778
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  33223416 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 33223515  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  33223516 gatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 33223615  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  33223616 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 33223715  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33223716 atactgtcccacttccattccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 33223778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11207010 - 11206649
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  || | || || ||||| |||||      
T  11207010 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctca 11206911  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11206910 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtatatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 11206811  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11206810 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaatcggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11206711  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11206710 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11206649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29453316 - 29452955
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  29453316 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 29453217  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29453216 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatgttaat 29453117  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  29453116 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 29453017  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29453016 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 29452955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 433
Target Start/End: Original strand, 14691391 - 14691757
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14691391 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14691490  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14691491 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatat 14691590  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14691591 tactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 14691690  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  14691691 ggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 14691757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 20891475 - 20891836
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20891475 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20891574  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20891575 gatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 20891674  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  20891675 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacgaaatccatagag 20891774  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20891775 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20891836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44661643 - 44661284
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||     
T  44661643 cgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 44661544  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |    
T  44661543 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattgatag 44661444  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44661443 gaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagat 44661344  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44661343 actatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 44661284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15414805 - 15414443
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15414805 tccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15414706  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||  || || | | |||| ||||||||    
T  15414705 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactatgccaccgaaaaactaatattaat 15414606  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| || |||||||| || || || || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15414605 cggaataaagtgtgctgacttcgttaatctatcaacaaccagccatatggcatcatgccctctcgaagtattcagtaaacttgttacaaagtccatggat 15414506  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| ||| || |||||| ||||||||    
T  15414505 atgctatcccatttccactctggcacatctaatggtttcagcaacccagcaggcttctgatgt 15414443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14850889 - 14850524
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14850889 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14850790  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||  || ||| |||| ||||    
T  14850789 ctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaattcccgccaactgagaaacaggaaaactcatat 14850690  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  || ||||||| || |||||  ||||||||| |||    
T  14850689 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttctgagtattcggaaaactcatcacaaaatacat 14850590  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  14850589 ggatatgttatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 14850524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16251961 - 16251648
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16251961 gactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16251862  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  16251861 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 16251762  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16251761 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgaatata 16251662  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  16251661 ctatcccatttcca 16251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8053142 - 8052826
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8053142 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8053043  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| || ||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8053042 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaactgggcaacagggaaactaatattaat 8052943  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || ||||||||||||||||| || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8052942 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8052843  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8052842 atactatcccatttcca 8052826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 8386905 - 8387221
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8386905 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8387004  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8387005 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8387104  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8387105 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8387204  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8387205 atactatcccatttcca 8387221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 12477093 - 12477409
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12477093 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12477192  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  12477193 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 12477292  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12477293 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12477392  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  12477393 atactatcccatttcca 12477409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 14681060 - 14681376
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14681060 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14681159  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  14681160 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 14681259  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14681260 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14681359  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||| ||||||    
T  14681360 atactatcccttttcca 14681376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 27711829 - 27712145
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27711829 tccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27711928  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27711929 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27712028  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27712029 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27712128  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27712129 atactatcccatttcca 27712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29038923 - 29038607
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29038923 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29038824  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29038823 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29038724  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29038723 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 29038624  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  29038623 atactatcccatttcca 29038607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1639948 - 1639620
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  1639948 tctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 1639849  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 265  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1639848 cttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcggatataaatctctgtcaactgagctacgggaaaactgata 1639750  T
Q  266 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 365  Q
    ||||||| ||  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1639749 ttaatcggaagaaaatgagccgtcttcgtcaatctatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatcca 1639650  T
Q  366 tagaaatgctatcccatttccactccggta 395  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1639649 tggatatgctatcccacttccactctggta 1639620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 7090925 - 7091253
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||  |||    
T  7090925 tccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttg 7091024  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 269  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||    
T  7091025 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcgaatatagatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaa 7091123  T
Q  270 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 369  Q
    ||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||  ||||  |||| |||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  7091124 tcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccctaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaacttgtcacaaaatccatgga 7091223  T
Q  370 aatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7091224 tatactatcccatttccactctggcacatc 7091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 12524169 - 12524485
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  12524169 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 12524268  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12524269 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12524368  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12524369 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12524468  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  12524469 atactatcccatttcca 12524485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15147403 - 15147076
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  15147403 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 15147304  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  15147303 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctaccaactaggcaataggaaaactgatattaat 15147204  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  15147203 cg-tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 15147105  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15147104 atactatcccatttccactctggcacatc 15147076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 40473533 - 40473849
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40473533 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40473632  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||  |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  40473633 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctttgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 40473732  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  40473733 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40473832  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  40473833 atactatcccatttcca 40473849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 18297698 - 18298014
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18297698 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttg 18297797  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18297798 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18297897  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||     
T  18297898 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaattcatggat 18297997  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  18297998 atactatcccatttcca 18298014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19778312 - 19777996
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19778312 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19778213  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19778212 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19778113  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19778112 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19778013  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  19778012 atactatcccatttcca 19777996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 23956240 - 23956556
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23956240 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23956339  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  23956340 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 23956439  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23956440 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 23956539  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  23956540 atactatcccatttcca 23956556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 14303497 - 14303181
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14303497 tccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14303398  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14303397 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 14303298  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14303297 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14303198  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  14303197 atactatcccatttcca 14303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16354964 - 16354631
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16354964 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16354865  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16354864 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16354765  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16354764 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16354665  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16354664 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 16354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18226962 - 18226649
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18226962 gactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggat 18226863  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||     
T  18226862 ctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcgg 18226763  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18226762 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 18226663  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  18226662 ctatcccatttcca 18226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 395
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160287
Alignment:
Q  78 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 177  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  178 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 277  Q
     ||| | || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || || ||||||||||  || ||| |||| |||||||| | || |    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatttctgccaactgagacacaggaaaactaatattaattggaagg 14160169  T
Q  278 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 377  Q
    || || |||||||| ||||  || |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  14160170 aaatgagccgacttagtcagtctatagacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctat 14160269  T
Q  378 cccatttccactccggta 395  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14160270 cccatttccactctggta 14160287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18549770 - 18549694
Alignment:
Q  140 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18549770 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15292652 - 15292618
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15292652 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 15292618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 111
Target Start/End: Original strand, 16146409 - 16146447
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 111  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16146409 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaa 16146447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68255
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcgg 68096  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68097 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaagtccatagaaatg 68196  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  68197 ttgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcctctgatg 68255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4373
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  4735 tccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcg 4636  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4635 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaatattatgaatataaatctccgccaactgagccaccggataactaatattaat 4536  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4535 cggaataaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4436  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  4435 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttttgatgt 4373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13322
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  13683 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctct 13584  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13583 gattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgactataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13484  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13483 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttgttacaaaatccatagaa 13384  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  13383 atattgtcccacttccactccggcacatctaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 15459693 - 15460055
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15459693 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 15459792  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15459793 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctctgccagctgagctactggataacttatattaat 15459892  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15459893 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 15459992  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15459993 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 15460055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 34645510 - 34645148
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34645510 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttg 34645411  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| ||    
T  34645410 gatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctctgccaattgcgccaccggaaaactgatatttat 34645311  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34645310 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 34645211  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34645210 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 34645148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21564056 - 21563694
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21564056 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21563957  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21563956 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctacctgataactgatattgat 21563857  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21563856 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21563757  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21563756 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21563694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21569915 - 21569553
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21569915 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21569816  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21569815 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctaccagataactgatattgat 21569716  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21569715 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21569616  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  21569615 atgttatcccatttccactccggcacatccaacgatgtcaacaaccctgcaagcttctgatgt 21569553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 25768548 - 25768909
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  25768548 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcg 25768647  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  25768648 gatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattataaatgtaaatctccgccaactgagctactggaaaactaatattgat 25768747  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || | |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  25768748 cgaaataaaatgcgccgacttcgtcaacgtatcgacgacaacccaaatggcatcatgtcccctcgaagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 25768847  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25768848 atactgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 25768909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 19453777 - 19454139
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19453777 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19453876  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19453877 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19453976  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453977 cggaataaagtgcgctgactttgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19454076  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19454077 atgatatcccaattccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacttctgatgt 19454139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 21471962 - 21472320
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21471962 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatc 21472061  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||      
T  21472062 tctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaataatatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggg 21472161  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |    
T  21472162 ataaaatgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcgcaaaattcatggagatac 21472261  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21472262 tgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 21472320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8762857 - 8762496
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  8762857 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 8762758  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  8762757 gatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaatatcatgaatatagatctccgccaactgagctaccggataattgatatcaat 8762658  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8762657 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctctgagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatataa 8762558  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8762557 atgtcgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 8762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14381391 - 14381029
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14381391 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14381292  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  14381291 gatctctattcgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctcccccaactgagctaccaggtaactaatattaat 14381192  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381191 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 14381092  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381091 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcctctgatgt 14381029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5297130 - 5296769
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  5297130 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 5297031  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  5297030 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctacccgataattgatgttaat 5296931  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5296930 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactagtcacaaaatccatagaa 5296831  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5296830 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5296769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 410
Target Start/End: Original strand, 17415845 - 17416182
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  17415845 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgga 17415944  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17415945 tccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 17416044  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17416045 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgactactacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaat 17416144  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17416145 gttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtca 17416182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27560541 - 27560179
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27560541 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27560442  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  27560441 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 27560342  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27560341 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27560242  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27560241 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 27560179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22796556 - 22796195
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  22796556 tccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 22796457  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  22796456 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactaataatgat 22796357  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |     
T  22796356 cggaataaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatgtat 22796257  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | | ||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22796256 atgttgttccacttccactttggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 18795047 - 18795408
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| ||||   |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  18795047 tccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcg 18795146  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |   | || || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  18795147 gatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaatgtcacggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactgatatttat 18795246  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18795247 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaaattgtcacaaaatccatagaa 18795346  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18795347 atgttgtcccacttccactctggaacatctaatggtatcaacaaccctgcaggcttctgatg 18795408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 28282737 - 28282385
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  28282737 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 28282638  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  28282637 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 28282538  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28282537 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28282438  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28282437 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 28282385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Original strand, 19879658 - 19880017
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  19879658 gactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 19879757  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |   || || |||||||||||||| || |  ||| |||||||||| ||||     
T  19879758 ctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccagatataaatctccgccaactgcgccatcggaaaactgatatttatcgg 19879857  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19879858 aataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatattgaatcatatcccctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatg 19879957  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19879958 ctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19880017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10468773 - 10468411
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || || || ||||| |    
T  10468773 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcg 10468674  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10468673 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatattatggacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 10468574  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  10468573 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaattgcttcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatctatagag 10468474  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10468473 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 10468411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 24364769 - 24365130
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24364769 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24364868  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| ||    
T  24364869 gatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctgccggataattgatattgat 24364968  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  24364969 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagat 24365068  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24365069 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 24365130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1543008 - 1542692
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1543008 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1542909  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1542908 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 1542809  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||  | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1542808 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatatttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 1542709  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  1542708 atactatcccatttcca 1542692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18407866 - 18407538
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18407866 tccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttg 18407767  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  18407766 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaacagagaaacaggaaaactgatattaat 18407667  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18407666 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 18407567  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  18407566 atactatcccatttccactctggcacatc 18407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24313092 - 24312776
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24313092 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24312993  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  24312992 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactgatattaat 24312893  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24312892 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24312793  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  24312792 atactatcccatttcca 24312776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5839143 - 5838810
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  |||||||||  || ||| |||| ||||| ||    
T  5839043 gatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgatataaatctctaccaactgagaaacaggaaaactaatatttat 5838944  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||||||||| || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  5838943 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactagtcacaaaatccatggat 5838844  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5838843 atactatcccatttccattccggcacatctaacg 5838810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 399
Target Start/End: Original strand, 15896447 - 15896779
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||    
T  15896447 tctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatac 15896546  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15896547 ctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatat 15896646  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||     ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15896647 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaataacgccattccctttcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccat 15896746  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15896747 ggatatactatcccatttccactttggtacatc 15896779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 19865044 - 19865372
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19865044 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19865143  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  19865144 gatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacacgaaaactgatattaat 19865243  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19865244 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19865343  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19865344 atactatcccatttccactctggcacatc 19865372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28263121 - 28262790
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28263121 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28263022  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28263021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28262922  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28262921 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28262822  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28262821 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28262790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28341870 - 28341539
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28341870 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28341771  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28341770 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28341671  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28341670 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28341571  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28341570 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28341539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16626641 - 16626325
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16626641 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16626542  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16626541 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 16626442  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16626441 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16626342  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16626341 atactatcccatttcca 16626325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 29591844 - 29591528
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29591844 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29591745  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29591744 gatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29591645  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  29591644 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29591545  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  29591544 atactatcccatttcca 29591528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20637162 - 20636909
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  20637162 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataga 20637063  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  20637062 tctctgccaactgagaaacaggataactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 20636963  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20636962 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20636909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 2874727 - 2874411
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2874727 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2874628  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||  |||| ||||||||    
T  2874627 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacagggaaactaatattaat 2874528  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  2874527 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 2874428  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  2874427 atactatcccatttcca 2874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22762379 - 22762051
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22762379 tccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22762280  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  22762279 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 22762180  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22762179 cataagaaaatgagccgacttagtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22762080  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22762079 atactatcccatttccactctggcacatc 22762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 28292292 - 28291965
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28292292 actgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 28292193  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |      
T  28292192 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggt 28292093  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  28292092 aggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatac 28291993  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28291992 tatcccatttccattccggcacatccaa 28291965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27392090 - 27391769
Alignment:
Q  78 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27392090 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27391991  T
Q  178 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 277  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27391990 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27391891  T
Q  278 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 377  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27391890 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatttggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27391791  T
Q  378 cccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27391790 cccatttctactctggcacatc 27391769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 25112909 - 25113237
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25112909 tccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25113008  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  25113009 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 25113108  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  25113109 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 25113208  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  25113209 atactatcccatttccattctggtacatc 25113237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27331350 - 27331029
Alignment:
Q  78 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27331350 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27331251  T
Q  178 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 277  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27331250 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27331151  T
Q  278 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 377  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27331150 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatagggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27331051  T
Q  378 cccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27331050 cccatttctactctggcacatc 27331029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22078614 - 22078286
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || || ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22078614 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22078515  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||||||| | ||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  22078514 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatatctcgaatatagatctctgtcaactgagaaacaggaaaactgatattaac 22078415  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || ||||||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||  ||     
T  22078414 cggaagaaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccacggat 22078315  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22078314 atactatcccacttccactctggcacatc 22078286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25609788 - 25609469
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  25609788 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 25609689  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    |||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||  || ||||| ||||| ||||  || ||| |||||||| |    
T  25609688 ttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcacgatctctttaacataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactgatact 25609589  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||     
T  25609588 aatcgccagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtaatcggcaaactcgtcacgaaatccatg 25609489  T
Q  368 gaaatgctatcccatttcca 387  Q
    || || ||||||||||||||    
T  25609488 gatatactatcccatttcca 25609469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16927564 - 16927236
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16927564 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16927465  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| |  | ||| || | ||| |||||||  || || ||| ||||||| |||||    
T  16927464 ggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctctttaatataaacctctgccaactatgcaacaggaaaactgatgttaat 16927365  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16927364 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16927265  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16927264 atactatcccatttccactctggcacatc 16927236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 23078826 - 23079154
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||    |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  23078826 tccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttg 23078925  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  23078926 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatctcgaatataaatttccgccaactgagacacatgaaaactgatattaat 23079025  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| | |  | ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||     
T  23079026 cggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattcactttaggagtattctaaaaactcgtcacaaaatccatggat 23079125  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23079126 atactatctcatttccactctggtacatc 23079154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 27187793 - 27188109
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27187793 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27187892  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27187893 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27187992  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27187993 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27188092  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27188093 atactatcccatttcca 27188109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 27261447 - 27261131
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27261447 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27261348  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27261347 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27261248  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27261247 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27261148  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27261147 atactatcccatttcca 27261131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 390
Target Start/End: Original strand, 22434226 - 22434545
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||    
T  22434226 tccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttg 22434325  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22434326 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22434425  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22434426 cagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22434525  T
Q  371 atgctatcccatttccactc 390  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22434526 atactatcccatttccactc 22434545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11280426 - 11280161
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  11280426 gactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 11280327  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | | || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||| ||||     
T  11280326 ctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcccggatataaatctctgccaactgtgccaccggaaaactgatatttatcgg 11280227  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 339  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |  || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11280226 aataaagtgcgccaacttcgtcaatccatcgactacaaccaatattgaatcatgtcccctcggagt 11280161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 207
Target Start/End: Original strand, 17032737 - 17032876
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  17032737 ctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 17032836  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatg 207  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  17032837 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18197589 - 18197291
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |    
T  18197589 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaa 18197490  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    |||| || ||||||| |||   | ||||||| ||||||| |||||| ||  | |||||||||||  | || || |  ||||| || |  || | |||  |    
T  18197489 tctctgctaactgagatacaaaaaaactgatgttaatcggaatgaaatgatctgacttcgtcaatttatccacaatcacccaaatagcgtcgttcccttt 18197390  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  18197389 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatgctatcccatttccactctggtatatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 18197291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Original strand, 1641129 - 1641212
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  1641129 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16963291 - 16963148
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16963291 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16963192  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttc 214  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16963191 ggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttc 16963148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 365 - 433
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19435721
Alignment:
Q  365 atagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19435721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 390
Target Start/End: Original strand, 22442711 - 22442943
Alignment:
Q  158 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggat 257  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || |||     
T  22442711 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaa 22442810  T
Q  258 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 357  Q
    ||||||||||||||   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  22442811 aactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcac 22442910  T
Q  358 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22442911 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 22442943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27559912 - 27559765
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27559912 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27559813  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 218  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  27559812 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21837058 - 21836973
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21837058 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21836973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1648453 - 1648419
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648453 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 1648419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18967114 - 18966984
Alignment:
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  |||||  ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |    
T  18967114 cttggatctctatctgacataatgatcgacaaaacaccatgtaccttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaagaaaactgatgt 18967015  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  18967014 taatcggaatgaaatgagccgacgtcgtcaa 18966984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 390
Target Start/End: Original strand, 23996893 - 23996924
Alignment:
Q  359 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996893 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 23996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16382012 - 16381978
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382012 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19488893 - 19488843
Alignment:
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  19488893 ctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggc 19488843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 6708 - 7069
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  6708 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttg 6807  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808 ggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6907  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6908 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatggaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 7007  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  7008 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaactttcctgcaggcctctgatg 7069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10420052 - 10419690
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420052 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 10419953  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419952 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctccgccagctgagctactggataacttatattaat 10419853  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10419852 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 10419753  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10419752 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcttctgatgt 10419690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13322659 - 13322298
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||      
T  13322659 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctca 13322560  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13322559 gatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctaccggataactgatattaat 13322460  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13322459 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13322360  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  13322359 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcagacctccgatg 13322298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 14086795 - 14087157
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14086795 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14086894  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  14086895 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 14086994  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086995 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14087094  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  14087095 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 14087157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13972127 - 13971765
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  13972127 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 13972028  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  13972027 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 13971928  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971927 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 13971828  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13971827 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13971765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 17492752 - 17493114
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  17492752 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 17492851  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| || || | || | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17492852 gatctctatccgaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataattgatattaat 17492951  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| || || || | ||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17492952 tggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcgacaataacccatatggcatcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 17493051  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17493052 atgctatcccacttcaactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 17493114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18134353 - 18133991
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||    || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  18134353 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 18134254  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18134253 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtaaccttacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 18134154  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18134153 cggaataaagtgcgccgaattcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccattgaa 18134054  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  18134053 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctaatgt 18133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12360549 - 12360196
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  12360549 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcg 12360450  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  12360449 gatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctatcggatatttgatattaat 12360350  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12360349 cggaataaagtgcgccaactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12360250  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12360249 atgttatcccacttccactccggcacatccaactgtgtcaacaaccctgcaggc 12360196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16828209 - 16827849
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  16828209 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtgaacctcg 16828110  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16828109 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 16828010  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16828009 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcca-cacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 16827911  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16827910 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16827849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16836517 - 16836156
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  16836517 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcg 16836418  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16836417 gatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaacattatgaatgtaaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16836318  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16836317 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctcttggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 16836218  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16836217 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16836156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 13942146 - 13942508
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13942146 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13942245  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13942246 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 13942345  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13942346 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 13942445  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  13942446 atgctatcccatttccactccggtacatccaatgatgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 13942508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 14574054 - 14574406
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||    |    
T  14574054 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaat 14574153  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||         
T  14574154 ctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactg--atta----g 14574247  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14574248 aataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 14574347  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14574348 ctatcccacttccactctggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14574406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 8759089 - 8758737
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  8759089 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 8758990  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  8758989 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 8758890  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8758889 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 8758790  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8758789 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 8758737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Original strand, 41177644 - 41177996
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  41177644 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 41177743  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  41177744 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 41177843  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41177844 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 41177943  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41177944 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 41177996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11303780 - 11303419
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || || |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  11303780 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 11303681  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  11303680 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccagataactaatattgat 11303581  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  11303580 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacgacgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 11303481  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  11303480 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctacaagcttctgatg 11303419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 28754440 - 28754801
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  28754440 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 28754539  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28754540 gatctctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 28754639  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  28754640 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggggtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 28754739  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28754740 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 28754801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 47124066 - 47124427
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  47124066 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 47124165  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47124166 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 47124265  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  47124266 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgcctcctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagag 47124365  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47124366 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 47124427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Original strand, 4678560 - 4678912
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  4678560 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 4678659  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| || | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4678660 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 4678759  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4678760 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4678859  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4678860 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 4678912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 44777369 - 44777731
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  44777369 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 44777468  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||||| | | || || || || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  44777469 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaacactatgtatataaatttcagccaactgagctaccggataattgatgttgat 44777568  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44777569 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccttcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 44777668  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  44777669 atgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcgggcttctgatgt 44777731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 71 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15952975 - 15952671
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15952975 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15952876  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15952875 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataagcaatattgat 15952776  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  15952775 cggaataaagtgtgccgacttcgtcagcctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaa 15952676  T
Q  371 atgct 375  Q
    |||||    
T  15952675 atgct 15952671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 10384091 - 10384451
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||| | |||| || || ||||| ||||| |    
T  10384091 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcg 10384190  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10384191 gatctctatccgacacaatacta-acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 10384289  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  10384290 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 10384389  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10384390 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10384451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16380935 - 16380582
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||| | |    
T  16380935 tccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcg 16380836  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16380835 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16380736  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || |||||||| | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16380735 aggaataaaatgtgccgactttgacaatctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaagcttgtcacgaaatccatagaa 16380636  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16380635 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggc 16380582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16338519 - 16338158
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16338519 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcg 16338420  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16338419 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16338320  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  16338319 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 16338220  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16338219 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtgaacaaccctgcaggcttctgatg 16338158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 386
Target Start/End: Original strand, 15227771 - 15228086
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15227771 tccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15227870  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    |||||| ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||    
T  15227871 gatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaatatcacaaatgtaaatctctgccaactgtgccaccagaaaactaatattaat 15227970  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15227971 cggaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaacaactacccatatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaagtccatggat 15228070  T
Q  371 atgctatcccatttcc 386  Q
    ||||||||||||||||    
T  15228071 atgctatcccatttcc 15228086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 9522831 - 9523192
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9522831 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9522930  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  9522931 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactaagaaataggaaaactgatattaat 9523030  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  9523031 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgggtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 9523130  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| || ||| ||| || ||| |||||  |||||||    
T  9523131 atactatcccatttccactctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatg 9523192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16329668 - 16329324
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16329668 tccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcg 16329569  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16329568 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattgat 16329469  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  16329468 aggaatgaagtgtgctgacttcgtcaaccggttgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagag 16329369  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatcc-aacggtgtcaacaa 414  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16329368 atactgtcccacttccactccggtacatcctaacggtgtcaacaa 16329324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Original strand, 12498360 - 12498693
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12498360 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12498459  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12498460 gatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12498559  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  12498560 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatagat 12498659  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12498660 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 12498693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16492199 - 16491866
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  16492199 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttg 16492100  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  16492099 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 16492000  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||  || ||| | |||||||||||||| ||     
T  16491999 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatgcggaaaaatcgtcacaaaatccatggat 16491900  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16491899 atattatcccatttccactctggcacatctaacg 16491866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 10005712 - 10006028
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10005712 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10005811  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10005812 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10005911  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10005912 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10006011  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  10006012 atactatcccatttcca 10006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 17489962 - 17490290
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17489962 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17490061  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  17490062 gatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatatagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 17490161  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| || |  |||| |||  |  ||||||| || ||||| | |||||||||||| ||     
T  17490162 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgacacaaaatccatggat 17490261  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17490262 atgctatctcatttccactctggcacatc 17490290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 402
Target Start/End: Original strand, 6600848 - 6601179
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6600848 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6600947  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6600948 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6601047  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  6601048 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccatcgat 6601147  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6601148 atactatcccatttccattccggcacatccaa 6601179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 284 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11960963 - 11960814
Alignment:
Q  284 gccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatt 383  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  11960963 gccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggaaaactcgtcacaaaatccatagaaatactgtctcatt 11960864  T
Q  384 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11960863 tccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgt 11960814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5424948 - 5424632
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5424948 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5424849  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  5424848 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 5424749  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  5424748 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatcgat 5424649  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  5424648 atactatcccatttcca 5424632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 10906322 - 10906638
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10906322 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10906421  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10906422 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10906521  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10906522 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10906621  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  10906622 atactatcccatttcca 10906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 13252802 - 13253118
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13252802 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13252901  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  13252902 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 13253001  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13253002 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 13253101  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  13253102 atactatcccatttcca 13253118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 16635885 - 16636201
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16635885 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16635984  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16635985 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16636084  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16636085 aggcaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16636184  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16636185 atactatcccatttcca 16636201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 43163209 - 43163525
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43163209 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43163308  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43163309 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43163408  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43163409 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 43163508  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  43163509 atactatcccatttcca 43163525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 53385036 - 53384705
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  53385036 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 53384937  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatat-tctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 269  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||    
T  53384936 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctctg-atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaa 53384838  T
Q  270 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 369  Q
    | |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  53384837 taggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcga 53384738  T
Q  370 aatgctatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
     || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53384737 tatactatcccatttccattccgacacatccaa 53384705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 48425559 - 48425875
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48425559 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 48425658  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  48425659 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 48425758  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  48425759 aggtaggaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 48425858  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  48425859 atactatcccatttcca 48425875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14126611 - 14126464
Alignment:
Q  72 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 171  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  14126611 ccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14126512  T
Q  172 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14126511 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15348263 - 15347947
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15348263 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15348164  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15348163 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15348064  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15348063 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15347964  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  15347963 atactatcccatttcca 15347947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20062072 - 20061756
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20062072 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20061973  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  20061972 gatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 20061873  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  20061872 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 20061773  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  20061772 atactatcccatttcca 20061756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 399
Target Start/End: Original strand, 16371522 - 16371853
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  16371522 ctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16371621  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || | |||||| || ||  || |||| |||||    
T  16371622 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctggcaactgggcaacatgaaaactaatatt 16371721  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  16371722 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 16371821  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16371822 gatatactatcccatttccactctggcacatc 16371853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12850286 - 12850104
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  12850286 tccgactgaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 12850187  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctact 253  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12850186 gatctctatccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctact 12850104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16412297 - 16411984
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| || || || |||||  ||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16412297 gactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16412198  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  16412197 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 16412098  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16412097 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 16411998  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  16411997 ctatcccatttcca 16411984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 14876520 - 14876188
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14876520 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 14876421  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataact-gatat 266  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| ||| |||| || || ||| ||||  ||||    
T  14876420 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgcctactgggcaacaggaaaactaaatat 14876321  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    ||||||  |  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14876320 taatcggtagaaaatgagccggcttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcattccctctaggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccat 14876221  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  14876220 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 14876188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15589410 - 15589094
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15589410 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15589311  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15589310 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15589211  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15589210 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 15589111  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  15589110 atactatcccatttcca 15589094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16756600 - 16756272
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16756600 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16756501  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |     
T  16756500 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatagg 16756401  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16756400 tagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 16756301  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16756300 ctatcccatttccattccagcacatccaa 16756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 366
Target Start/End: Original strand, 15061865 - 15062163
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |    
T  15061865 ctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatc 15061964  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || ||||| || || || ||| |||| |||||    
T  15061965 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctgccaattgggcaacaggaaaactaatatt 15062064  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15062065 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 15062163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 387
Target Start/End: Original strand, 15339383 - 15339697
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  15339383 cgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 15339482  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || |   |||| ||||||||||    
T  15339483 tctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagtgaaactaatattaatcg 15339582  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15339583 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 15339682  T
Q  373 gctatcccatttcca 387  Q
     ||||||||||||||    
T  15339683 actatcccatttcca 15339697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26792414 - 26792101
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  26792414 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 26792315  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| |||||||| |     
T  26792314 ctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaaatgggcaacggggaaactaatattaattgg 26792215  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     || || || ||| |||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  26792214 tataaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 26792115  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  26792114 ctatcccatttcca 26792101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15402528 - 15402212
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15402528 tccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15402429  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  || | ||||||||    
T  15402428 gatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaagtaatattaat 15402329  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||     
T  15402328 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcatactcgtcacaaaatccatggat 15402229  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  15402228 atactatcccatttcca 15402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 16806944 - 16806628
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  16806944 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 16806845  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16806844 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16806745  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||| | || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  16806744 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacctaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatggat 16806645  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16806644 atactatcccatttcca 16806628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 399
Target Start/End: Original strand, 15209006 - 15209331
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |  || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||| ||    |    
T  15209006 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatat 15209105  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||     
T  15209106 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataacgtggatataaatttctgccaactaagacacaggaaaactgatattaatcgg 15209205  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| || || || |  | ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  15209206 aatgaaataagccgactttgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 15209305  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15209306 ctatcccatttccactctggtacatc 15209331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15724949 - 15724636
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  15724949 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggat 15724850  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||||     
T  15724849 ctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaataataatcgg 15724750  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  15724749 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 15724650  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  15724649 ctatcccatttcca 15724636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Original strand, 16692272 - 16692502
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatct----tgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||    || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  16692272 tccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 16692371  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  16692372 cttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatat 16692471  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    ||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  16692472 taatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaa 16692502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 399
Target Start/End: Original strand, 15248263 - 15248587
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    ||    
T  15248263 actgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatc 15248362  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    ||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   | || || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  15248363 tctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcgga 15248462  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  15248463 atgaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatacggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 15248562  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  15248563 tgtcccatttccactctagtacatc 15248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11564699 - 11564551
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11564699 tccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttg 11564600  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11564599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 11564551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15015762 - 15015573
Alignment:
Q  83 tccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctg 182  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15015762 tccgactgcggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctg 15015663  T
Q  183 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    | || |||||||||||||| ||||| | | ||| ||| |   |||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15015662 atacaatactcgacggaacaccatgtagcctcaaaatctcacgaatataaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcg 15015573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11961044 - 11960986
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11961044 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacc 11960986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14685210 - 14685174
Alignment:
Q  32 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685210 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 14685174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 31694887 - 31694831
Alignment:
Q  377 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31694887 tcccacttccactccggcacatttaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 31694831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 433
Target Start/End: Original strand, 31939331 - 31939387
Alignment:
Q  377 tcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31939331 tcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgaaggcttctgatgt 31939387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26009000 - 26008961
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactca 110  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26009000 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 26008961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8274132 - 8274098
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8274132 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 8274098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13967073 - 13967039
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13967073 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 13967039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 30138213 - 30138247
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30138213 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 30147764 - 30147798
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30147764 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30147798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16742436 - 16742359
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  16742436 acaaaatccatagaaatgctattccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacctgacggtctctgatgt 16742359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Original strand, 10790579 - 10790615
Alignment:
Q  32 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 68  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10790579 ttgatagctgtacacaccataggggcttccagcggtc 10790615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Original strand, 18748796 - 18748960
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || ||   ||    
T  18748796 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgat 18748895  T
Q  180 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 244  Q
    ||||||| ||||| || ||||   |||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  18748896 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 18748960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 132 - 432
Target Start/End: Original strand, 468 - 768
Alignment:
Q  132 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 231  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  468 catcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgta 567  T
Q  232 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgcccc 331  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  568 aatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgatttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccct 667  T
Q  332 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 431  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  668 cttggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggcctctgat 767  T
Q  432 g 432  Q
    |    
T  768 g 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20975873 - 20975511
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20975873 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 20975774  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20975773 gatctccatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactgatattaat 20975674  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20975673 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtatgtggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 20975574  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  20975573 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacactgcaggcttctgatgt 20975511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 1266797 - 1267158
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  1266797 tccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcg 1266896  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1266897 gatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgtgctacaggataactgatattaat 1266996  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1266997 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctaagagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 1267096  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1267097 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1267158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 424
Target Start/End: Original strand, 21840976 - 21841329
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21840976 tccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21841075  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21841076 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgctaactgagctactggaaaactaatattgat 21841175  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  21841176 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaccaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 21841275  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21841276 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 21841329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31416696 - 31416335
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31416696 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 31416597  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31416596 gatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 31416497  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416496 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31416397  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31416396 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31416335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 23655489 - 23655847
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  23655489 gactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggat 23655588  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  23655589 ctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactaagctaccggataactaatattaatcaa 23655688  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23655689 aatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaaatg 23655788  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  23655789 ttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgttaataaccctgcaggcttctgatg 23655847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22061653 - 22061293
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || | |||  |||| || || ||||| ||||||||     
T  22061653 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttgga 22061554  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |    
T  22061553 tccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggatacttgatgttaatag 22061454  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22061453 gaatgaagtgcgccgactttctcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctcgtagtgtttggtaaactcatcacaaaatccatagaaat 22061354  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  22061353 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaataaccctgcaggcttctgatgt 22061293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 20388658 - 20389020
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20388658 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20388757  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  20388758 gatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatgcaactttacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccactggaaaactaatattgat 20388857  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  20388858 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgtcacacaatccatggat 20388957  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  20388958 atgctatcccatttccactccggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 20389020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 22371499 - 22371861
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  22371499 tccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 22371598  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22371599 gatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgtcaaatgagctaccggaaaactaatattgat 22371698  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  22371699 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 22371798  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22371799 atgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 22371861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 19851970 - 19852331
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19851970 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19852069  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19852070 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19852169  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19852170 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19852269  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19852270 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19852331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 19858006 - 19858367
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19858006 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19858105  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19858106 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19858205  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19858206 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19858305  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  19858306 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 19858367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 803895 - 803534
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  803895 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 803796  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  803795 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactatgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 803696  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||     
T  803695 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccgtagag 803596  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  803595 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 803534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 6679670 - 6680031
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6679670 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6679769  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6679770 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 6679869  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6679870 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6679969  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6679970 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6680031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 31571064 - 31570712
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  31571064 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 31570965  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| | |||||| || || ||    
T  31570964 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatgttgat 31570865  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31570864 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31570765  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31570764 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 31570712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16271446 - 16271085
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16271446 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcg 16271347  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16271346 gatccctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacattgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16271247  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16271246 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16271147  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  16271146 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatg 16271085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 22051422 - 22051783
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22051422 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22051521  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22051522 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 22051621  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| ||  |||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22051622 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcacccacaacccaaatagaatcatgtcttctcggagtgtttagtaaacttgtcacaaaatccatagaa 22051721  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  22051722 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 22051783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 6604217 - 6604578
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6604217 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6604316  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6604317 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 6604416  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6604417 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6604516  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6604517 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatg 6604578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 27355107 - 27355468
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27355107 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27355206  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  27355207 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactatgaatgtaaatctctgccaactgttctaccggataactgatattgat 27355306  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||     
T  27355307 gggaatgaagtgtgtcgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaattcgtcacaaaatccatagag 27355406  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  27355407 atactgtcccacttccactccagtacatctaacggtgtcaaaaaccctgcaggcttctgatg 27355468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29303648 - 29303286
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  29303648 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 29303549  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || | ||  || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29303548 gatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctctgccaattgtgctaccgaataactgatattaat 29303449  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||||||     
T  29303448 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgaagtgtttggtaaattcgtcacgaaatccatagag 29303349  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29303348 atactatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 29303286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 68 - 432
Target Start/End: Original strand, 14565698 - 14566062
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 14565897  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14565898 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 14565997  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14565998 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 14566062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 12305317 - 12305678
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    || ||||||||  |||| ||  | ||||| ||||| |    
T  12305317 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcg 12305416  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12305417 gatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 12305516  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||| || || |  |||| ||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||     
T  12305517 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaactcaaatagtgtcataccctctcggagtgttcggtaaggtcgtcacgaaatccatagag 12305616  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  12305617 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 12305678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20396351 - 20395986
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||  || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  20396351 tctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 20396252  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  20396251 cttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaatctggcgaatgtaaatctccgccaactgagatagaggaaaactgatat 20396152  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    ||| || |||||| || || |||||||| || || || || |  ||||| || |   ||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20396151 taaccggaatgaaatgagctgacttcgttaatctatccacaatcacccaaatagcggcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 20396052  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  20396051 ggatatactatcccattttcactctggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 20395986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22377680 - 22377315
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22377481  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22377480 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22377381  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22377380 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22383855 - 22383490
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22383656  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22383655 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22383556  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     || ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  22383555 ggatatgctatcccattcccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 22383490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 389
Target Start/End: Original strand, 23949476 - 23949796
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || | ||| | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  23949476 tttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacct 23949575  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
     || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  23949576 cggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacagtatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgtta 23949675  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23949676 atcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattccctcttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatgg 23949775  T
Q  369 aaatgctatcccatttccact 389  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  23949776 atatattatcccatttccact 23949796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 19113249 - 19113565
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19113249 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19113348  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  19113349 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 19113448  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  19113449 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 19113548  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  19113549 atactatcccatttcca 19113565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16408267 - 16407949
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  16408267 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttg 16408168  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||    
T  16408167 ggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttc-caatctccttaatataaatctctgccaactgggccacaggaaaactaatatttat 16408069  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || |  | |||||| || |  | || ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16408068 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaattataacccaaattgcgtaattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16407969  T
Q  371 atgctatcccatttccactc 390  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16407968 atactatcccatttccactc 16407949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21394087 - 21393769
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21394087 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21393988  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21393987 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21393888  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21393887 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21393788  T
Q  371 atgctatcccatttccact 389  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21393787 atactatcccatttccact 21393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21788581 - 21788263
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21788581 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21788482  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21788481 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21788382  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21788381 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21788282  T
Q  371 atgctatcccatttccact 389  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21788281 atactatcccatttccact 21788263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Original strand, 21251500 - 21251833
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21251500 tccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21251599  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  21251600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacaaatgtaaatctccgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 21251699  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21251700 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21251799  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || | |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  21251800 atacgatcccatttccaatctggcacatctaacg 21251833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 32600703 - 32601019
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  32600703 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 32600802  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  32600803 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 32600902  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32600903 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32601002  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||| ||||||||    
T  32601003 atactatctcatttcca 32601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20010122 - 20009780
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  20010122 tccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctga 20010023  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |                
T  20010022 aatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgggctaccggaaa------------ 20009935  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
           || |||| ||| ||||||||||  || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  20009934 -------aaatgcgtcgaattcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcattccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 20009842  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20009841 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20009780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21921955 - 21921630
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  21921955 cgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 21921856  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21921855 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcttccaattgagaaacaggaaaactgatattaatcg 21921756  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||   | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  21921755 gaagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccgtttaggagt-ttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 21921657  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
      |||||||||||||||| || |||||    
T  21921656 attatcccatttccactctggcacatc 21921630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17674245 - 17673929
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17674245 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17674146  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17674145 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17674046  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17674045 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17673946  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  17673945 atactatcccatttcca 17673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 18857136 - 18857452
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18857136 tccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18857235  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  18857236 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 18857335  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  18857336 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 18857435  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  18857436 atactatcccatttcca 18857452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21166759 - 21166432
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21166759 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21166660  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||| || ||||| || ||||  || || ||| |||||||||||||    
T  21166659 gatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttaatataaatctctgctaactaggcaacaggaaaactgatattaat 21166561  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21166560 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21166461  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||||    
T  21166460 atattatcccacttccactctggcacatc 21166432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 399
Target Start/End: Original strand, 22040422 - 22040746
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  22040422 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatc 22040521  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||| ||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  22040522 tctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccagctgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 22040621  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22040622 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22040721  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22040722 tatcccatttccattccggcacatc 22040746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30313362 - 30313050
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30313362 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 30313263  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || |||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  30313262 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctccaccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 30313163  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  30313162 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 30313063  T
Q  375 tatcccatttcca 387  Q
    |||||||||||||    
T  30313062 tatcccatttcca 30313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 23650600 - 23650928
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23650600 tccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23650699  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | ||||||||    
T  23650700 gatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaaatgagaaacaagaaaaataatattaat 23650799  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||  || || ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||   ||     
T  23650800 cagaagaaaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatcctgggat 23650899  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23650900 atactatcccatttccactctggcacatc 23650928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 19978526 - 19978854
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19978526 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19978625  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19978626 gatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19978725  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || ||    ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  19978726 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacagtcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccatggat 19978825  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19978826 atactatcccatttccactctggcacatc 19978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 22046932 - 22047080
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22046932 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22047031  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  22047032 gatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 22047080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Original strand, 15533943 - 15534084
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15533943 actgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 15534042  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 216  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  15534043 tctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcac 15534084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22164411 - 22164098
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22164411 gactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 22164312  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  22164311 ctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 22164212  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  22164211 taggaattgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 22164112  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  22164111 ctatcccatttcca 22164098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22120392 - 22120080
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22120392 actgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatc 22120293  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||||      
T  22120292 tctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaatcggt 22120193  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    |  || || |||||||| ||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22120192 agaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22120093  T
Q  375 tatcccatttcca 387  Q
    | |||||||||||    
T  22120092 tgtcccatttcca 22120080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22133263 - 22132947
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22133263 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22133164  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || |||||   |||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22133163 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctttcaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22133064  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  22133063 cggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcatcacaaaatccatggat 22132964  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  22132963 atactatcccatttcca 22132947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 390
Target Start/End: Original strand, 22987757 - 22988074
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  ||||||||||     |||| |    
T  22987757 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatc 22987851  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | |  ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  22987852 tcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatatt 22987951  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    |||||  || || ||  ||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  22987952 aatcggtataaaatgatccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 22988051  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    || ||| ||||||||||| ||||    
T  22988052 gatatgttatcccatttctactc 22988074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20017972 - 20017865
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20017972 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20017873  T
Q  171 ggtctcta 178  Q
    | ||||||    
T  20017872 gatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19485092 - 19484980
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19485092 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19484993  T
Q  171 ggtctctatctga 183  Q
    | |||||||||||    
T  19484992 gatctctatctga 19484980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22248357 - 22248278
Alignment:
Q  353 gtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||  |||||||    
T  22248357 gtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatg 22248278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 19863684 - 19863760
Alignment:
Q  140 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863684 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19863760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 19868321 - 19868397
Alignment:
Q  140 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19868321 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21850274 - 21850241
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850274 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 21850241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 21043268 - 21043332
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21043268 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 21043332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129017
Alignment:
Q  101 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 200  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  201 ccccatgcaacttcac 216  Q
      ||||||||| ||||    
T  22129032 taccatgcaacctcac 22129017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16877032 - 16876998
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16877032 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16876998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 1733390 - 1733422
Alignment:
Q  36 tagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733390 tagctgtacacaccatatgggcttccagcggtc 1733422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19484022 - 19483970
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19484022 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 19483970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33459 - 33097
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33459 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 33360  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  33359 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 33260  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 33160  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33159 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgt 33097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 56520 - 56320
Alignment:
Q  233 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 332  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  56520 atctccgccaactgtgctaccggataactaatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcataccctc 56421  T
Q  333 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  56420 tcgaagtgtttggtaaacttggctccaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 56321  T
Q  433 t 433  Q
    |    
T  56320 t 56320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 41067 - 41101
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41067 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 41101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 50296 - 49934
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  50296 tccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 50197  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  50196 gatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 50097  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50096 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattatgtaaacttgtcacaaaatccatagaa 49997  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49996 atactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 49934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 43678 - 43994
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43678 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43777  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43778 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43877  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43878 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 43977  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  43978 atactatcccatttcca 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9314
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8998 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9097  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  9098 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 9197  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9198 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 9297  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  9298 atactatcccatttcca 9314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15608
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15460 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15559  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15560 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6658
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | || ||||| ||||| ||||| |    
T  7020 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcg 6921  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6920 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtagatttccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6821  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6820 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6721  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6720 atgctatcccacttccactccggtacatccagcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 51962 - 51600
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  51962 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 51863  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51862 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 51763  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51762 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 51663  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51662 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 51600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 60996 - 60634
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  60996 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 60897  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  60896 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 60797  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  60796 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 60697  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  60696 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 60634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 67384 - 67022
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  67384 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 67285  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  67284 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 67185  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  67184 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 67085  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  67084 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 67022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 118092 - 118454
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  118092 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 118191  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  118192 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 118291  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118292 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 118391  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  118392 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 118454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 71 - 421
Target Start/End: Original strand, 323228 - 323578
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  323228 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 323327  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  323328 gatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 323427  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  323428 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 323527  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 421  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  323528 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgca 323578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 203250 - 202888
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  203250 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttg 203151  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  203150 gatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatttctgccaactgagccactggaaaactaatattgat 203051  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  203050 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 202951  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  202950 atgctatcctatttccactccggcacatctaacgatgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 202888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 272
Target Start/End: Original strand, 386343 - 386544
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  386343 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 386442  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  386443 gatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaattctccgctaactgagctaccggaaaactaatattgat 386542  T
Q  271 cg 272  Q
    ||    
T  386543 cg 386544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 297
Target Start/End: Original strand, 112542 - 112771
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  112542 cttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 112641  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    |  | ||||||||||| || || || | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  112642 tcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgtggatgtaaatatccgccaactgagatataggaaaactgatatt 112741  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  112742 aatcggaatgaaatgagcccacttcgtcaa 112771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 27365398 - 27365036
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27365398 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27365299  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  27365298 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 27365199  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365198 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27365099  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27365098 atactatcccatttccactccggtatatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 27365036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652009
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  19652371 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 19652272  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19652271 gatccttatccgacacaatactcgacggtactccatataacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 19652172  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19652171 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtctacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtatacttgtcactaaatccatagaa 19652072  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19652071 atactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 19652009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 24641866 - 24642227
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  24641866 tccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 24641965  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24641966 gacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgaatatgaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24642065  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24642066 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24642165  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  24642166 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 24642227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 224 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27210338 - 27210130
Alignment:
Q  224 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27210338 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27210239  T
Q  324 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27210238 catgccccctcggagtattaggtaaacttatcacaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcagg 27210139  T
Q  424 cctctgatg 432  Q
    |||||||||    
T  27210138 cctctgatg 27210130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 23276900 - 23277262
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23276900 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 23276999  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23277000 aatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 23277099  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23277100 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctcttggagtgttcggtaaaatcgtcacaaaatccatagaa 23277199  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23277200 atgctatcccacttccattccggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23277262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 24948713 - 24949075
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||  ||||||| |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  24948713 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 24948812  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24948813 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24948912  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24948913 cggaataaagtgcgccaacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24949012  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24949013 atcctatcccatttcaactccggcacatccaacgatatcaacaaccctgcaggcttctgatgt 24949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Original strand, 12574477 - 12574829
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12574477 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 12574576  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  12574577 gatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 12574676  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574677 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccactacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12574776  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12574777 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 12574829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 1063875 - 1064236
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  1063875 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 1063974  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  1063975 gatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattgat 1064074  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  1064075 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 1064174  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1064175 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1064236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 20828383 - 20828744
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20828383 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20828482  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20828483 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20828582  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20828583 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20828682  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20828683 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20828744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 20833109 - 20833470
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20833109 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20833208  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20833209 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20833308  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20833309 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20833408  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20833409 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20833470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21125476 - 21125130
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21125476 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21125377  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  21125376 gatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcacgat--tatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 21125279  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || | | |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21125278 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaaaacaacccaaatggcaccatgtcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 21125179  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctg 419  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21125178 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctg 21125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Original strand, 27787865 - 27788217
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27787865 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27787964  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  27787965 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 27788064  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27788065 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacgacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 27788164  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27788165 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 27788217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 31830782 - 31831143
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31830782 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31830881  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31830882 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 31830981  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  31830982 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 31831081  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31831082 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 31831143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 303
Target Start/End: Original strand, 23294082 - 23294314
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23294082 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 23294181  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23294182 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgattttaat 23294281  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 303  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23294282 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 23294314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 433
Target Start/End: Original strand, 23110907 - 23111221
Alignment:
Q  119 tttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 218  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23110907 tttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacacaatgcaacttcacaa 23111006  T
Q  219 tattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatat 318  Q
    |||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  || || |||||  |||||||||| || || || || ||||| ||    
T  23111007 tatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgggataaaatgcgctaacttcgtcaatctatcgacaactacccaaat 23111106  T
Q  319 cgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacct 418  Q
     | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  23111107 agcatcatgccctcttggagtattgggtaaacttgttacaaaatccatggatatgttatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccca 23111206  T
Q  419 gcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||| ||||||||    
T  23111207 gcaggcttctgatgt 23111221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11358193 - 11357832
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11358193 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 11358094  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  || || | | |  |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  11358093 gatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagttttaccacactgcgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattaat 11357994  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11357993 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11357894  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  11357893 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatg 11357832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 24675613 - 24675941
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  24675613 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 24675712  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||    
T  24675713 gatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaat 24675812  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24675813 cggtagaaaatgggccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24675912  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24675913 atgctattccatttccactctggcacatc 24675941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Original strand, 27371396 - 27371709
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27371396 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 27371495  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| |     
T  27371496 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaatagg 27371595  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  27371596 tagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 27371695  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  27371696 ctatcccatttcca 27371709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 9610260 - 9610576
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9610260 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9610359  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  9610360 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 9610459  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9610460 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 9610559  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  9610560 atactatcccatttcca 9610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21325585 - 21325257
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21325585 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21325486  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  21325485 gatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 21325386  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||   ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  21325385 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatctcgtcatatcctctaggagtattcggaaaactcgtcacgaaatccatggat 21325286  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21325285 atactatcccatttccactctggcacatc 21325257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 27218140 - 27218456
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27218140 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27218239  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27218240 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27218339  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27218340 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27218439  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  27218440 atactatcccatttcca 27218456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 16923013 - 16923329
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16923013 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16923112  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16923113 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16923212  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16923213 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16923312  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16923313 atactatcccatttcca 16923329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 16982276 - 16982592
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16982276 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16982375  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16982376 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16982475  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16982476 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16982575  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16982576 atactatcccatttcca 16982592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 17063841 - 17064157
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17063841 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17063940  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17063941 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17064040  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17064041 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17064140  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  17064141 atactatcccatttcca 17064157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 17067499 - 17067815
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17067499 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17067598  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17067599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17067698  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17067699 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17067798  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  17067799 atactatcccatttcca 17067815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22325175 - 22324859
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22325175 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22325076  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  22325075 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 22324976  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22324975 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22324876  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  22324875 atactatcccatttcca 22324859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24707801 - 24707485
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  24707801 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 24707702  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  24707701 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 24707602  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24707601 cgctagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24707502  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  24707501 atactatcccatttcca 24707485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23107986 - 23107721
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  23107986 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaga 23107887  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  |    
T  23107886 tctcggccaactgaggaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttccttt 23107787  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23107786 aggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23107721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Original strand, 24262497 - 24262810
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  24262497 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 24262596  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  24262597 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 24262696  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  24262697 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 24262796  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  24262797 ctatcccatttcca 24262810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 10868974 - 10869290
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10868974 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10869073  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10869074 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10869173  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| ||||  ||   ||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10869174 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaatcgcgtcgctccctctcggagtactcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10869273  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  10869274 atactatcccatttcca 10869290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 16925484 - 16925800
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16925484 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16925583  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16925584 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16925683  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16925684 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16925783  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16925784 atactatcccatttcca 16925800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 16999124 - 16999440
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16999124 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16999223  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16999224 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16999323  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16999324 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16999423  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  16999424 atactatcccatttcca 16999440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22756784 - 22756456
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||    
T  22756784 tccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttg 22756685  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22756684 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22756585  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || |  |  |||||  |||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||     
T  22756584 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaaaaatcacccaagtcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcgcaaaatccatggat 22756485  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22756484 atactatcccatttccactctggcacatc 22756456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Original strand, 23064201 - 23064427
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23064201 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttg 23064300  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  23064301 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 23064400  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  23064401 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 23064427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21145357 - 21145044
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21145357 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 21145258  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| || || |||||||  || || ||  |||| ||||| ||||     
T  21145257 ctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatttctgccaacttggcaacagggaaactaatattgatcgg 21145158  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  21145157 tagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatata 21145058  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  21145057 ctatcccatttcca 21145044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41608704 - 41608391
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41608704 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41608605  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  41608604 gatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 41608505  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41608504 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41608405  T
Q  371 atgctatcccattt 384  Q
    || |||||||||||    
T  41608404 atactatcccattt 41608391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 24877068 - 24876752
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  24877068 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaaatcttg 24876969  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  24876968 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 24876869  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  | ||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  24876868 cggtaggaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 24876769  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  24876768 atactatcccatttcca 24876752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 327 - 433
Target Start/End: Original strand, 23294315 - 23294421
Alignment:
Q  327 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 426  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  23294315 gccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggctt 23294414  T
Q  427 ctgatgt 433  Q
    |||||||    
T  23294415 ctgatgt 23294421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 24710157 - 24710305
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24710157 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24710256  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  24710257 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24710305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44385888 - 44385740
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44385888 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44385789  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44385788 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442684
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaat 20442684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 23189131 - 23189279
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23189131 tccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23189230  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  23189231 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 433
Target Start/End: Original strand, 45529644 - 45529997
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 179  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  45529644 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 45529743  T
Q  180 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 279  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||   ||||||||  || ||| ||||||| |||||   ||| ||    
T  45529744 ctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaatctctcggatataaatctctatcaactgagacacaggaaaactgatgttaattagaataaa 45529843  T
Q  280 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 379  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  45529844 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggacatactatcc 45529943  T
Q  380 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || ||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  45529944 cacttccactctagaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 45529997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30211236 - 30211037
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  30211236 tccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 30211137  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  30211136 gatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 30211037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24819865 - 24819644
Alignment:
Q  211 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 310  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  24819865 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 24819766  T
Q  311 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  24819765 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 24819666  T
Q  411 acaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  24819665 tcaaccctgcaggtttctgatg 24819644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24825605 - 24825472
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  24825605 tctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 24825506  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 200  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24825505 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21890875 - 21890709
Alignment:
Q  233 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 332  Q
    ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||      
T  21890875 atctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctt 21890776  T
Q  333 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    | ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  21890775 taggattattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccttttccactctggcacatc 21890709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 356 - 387
Target Start/End: Original strand, 22276687 - 22276718
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276687 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 22276718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 387
Target Start/End: Original strand, 24710415 - 24710474
Alignment:
Q  328 ccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24710415 ccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 24710474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 44385627 - 44385572
Alignment:
Q  332 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44385627 ctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 44385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12640267 - 12640234
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12640267 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccact 12640234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 245
Target Start/End: Original strand, 25128792 - 25128945
Alignment:
Q  92 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||  ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  25128792 ggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 25128891  T
Q  192 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 245  Q
    | || ||||  ||||||||| | ||||| |  | |||||||||| | |||||||    
T  25128892 tagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatcccagccaact 25128945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14286140 - 14285780
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  ||| |||||| || || ||||| ||     
T  14286140 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcgga 14286041  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14286040 tctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtagatctccgctaactgtgctaccggataactgatgttaatcg 14285941  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14285940 gaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgttacaaaatccatagaaat 14285841  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14285840 actgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14285780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Original strand, 13666023 - 13666382
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  13666023 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggat 13666122  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  13666123 ccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactgagctaccggataactgatattgatcgg 13666222  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13666223 aataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatg 13666322  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13666323 ctatcccacttccactccggcacatccatcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13666382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 6413994 - 6414356
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  6413994 tccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 6414093  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6414094 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctctgctaactgagctatcggataactgatattgat 6414193  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6414194 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6414293  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6414294 atactatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 6414356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 13021840 - 13022201
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  13021840 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcg 13021939  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13021940 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13022039  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  13022040 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccccctcggagtgtttggttaactcgtcacgaaatccatagaa 13022139  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13022140 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13022201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 19147694 - 19148055
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  19147694 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 19147793  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19147794 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 19147893  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19147894 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctctaggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 19147993  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19147994 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 19148055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 20747093 - 20747454
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  20747093 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 20747192  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  20747193 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 20747292  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  20747293 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 20747392  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20747393 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20747454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15102369 - 15102008
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15102369 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15102270  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102269 gatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 15102170  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15102169 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccgtctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 15102070  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15102069 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 15102008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11306032 - 11305668
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatatt 11305833  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11305832 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 11305733  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11305732 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 11305668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18053719 - 18053367
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  18053719 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 18053620  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  18053619 gatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 18053520  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18053519 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 18053420  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18053419 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcagg 18053367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 14130356 - 14130718
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14130356 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14130455  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14130456 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14130555  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14130556 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14130655  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14130656 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14130718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23505636 - 23505274
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  23505636 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 23505537  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23505536 gatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 23505437  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23505436 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 23505337  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23505336 atgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggtttctgatgt 23505274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 14434174 - 14434536
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14434174 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14434273  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14434274 gatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14434373  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14434374 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14434473  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14434474 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 14434536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14264010 - 14263649
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  14264010 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 14263911  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14263910 gatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 14263811  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||    
T  14263810 cggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaacaacgcaaatggcatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaattcatggaa 14263711  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  14263710 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccacgcaggcttctgatg 14263649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 49152784 - 49153145
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  49152784 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 49152883  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49152884 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 49152983  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  49152984 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 49153083  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  49153084 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 49153145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16072057 - 16071699
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| || |    
T  16072057 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggat 16071958  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  16071957 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 16071858  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||  |||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16071857 aagaaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctttgagtgttcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatg 16071758  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     | ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16071757 ttgtcccacttccactctagcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16071699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 203 - 433
Target Start/End: Original strand, 19613290 - 19613520
Alignment:
Q  203 ccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgt 302  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || | | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  19613290 ccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccgaaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctat 19613389  T
Q  303 ctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaa 402  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613390 caaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaa 19613489  T
Q  403 cggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19613490 tggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19613520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16950237 - 16949876
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16950237 tccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 16950138  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16950137 aatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 16950038  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  16950037 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtagactcgtcacgaaatccatagaa 16949938  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  16949937 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgttaacaaccctgcaggcttctgatg 16949876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11388194 - 11387832
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11388194 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 11388095  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  11388094 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatggcacggatgtaaatctccgccagctgaggtaccggaaaactgatatttat 11387995  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||| || | |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  11387994 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccacaaaaacccaaatagcatcatgccctatcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccgtagaa 11387895  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11387894 atgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11387832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 15340911 - 15341276
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  15340911 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacc 15341010  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15341011 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgtt 15341110  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
     || | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||||||||||    
T  15341111 gataggaataaagtgtgccaactttgtcaacctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggggtgtttggtaaactcgtcataaaatccata 15341210  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15341211 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15341276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12206566 - 12206204
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  12206566 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttg 12206467  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  12206466 gatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgtgccactggaaaactaatattaat 12206367  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| || |||||| |||| || || || || | ||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  12206366 tggaataaagtgtgctgacttcttcaatctatcaacaaccatccatatgacatcatgccctctcagagtatttggtaaacttgttacaaagtccatggat 12206267  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  12206266 atgctatcccatttccattctggaacatctaatggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 12206204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 390
Target Start/End: Original strand, 15625030 - 15625353
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  15625030 tctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 15625129  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15625130 cttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtagatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 15625229  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || || |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15625230 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagagtcattcccttttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccat 15625329  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactc 390  Q
     || ||  ||||||||||||||||    
T  15625330 ggatatagtatcccatttccactc 15625353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8211894 - 8211533
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  8211894 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 8211795  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  8211794 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaattgcgctaccggataactgatattgat 8211695  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||     
T  8211694 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagag 8211595  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  8211594 atactgtctcacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 8211533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 812
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
    ||  || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  1075 tgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccagataactgatattg 976  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  975 atcggaatgaaatgtgctgacttcgtcaacctgtcgacaatgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttggcacgaaatccatag 876  T
Q  369 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  875 aaatattgtcccacttccactccggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 12456185 - 12456546
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || || |||||  ||||||||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12456185 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 12456284  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||||  | | ||  || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12456285 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctataaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattgat 12456384  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12456385 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12456484  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  12456485 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 12456546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13968434 - 13968073
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13968434 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13968335  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13968334 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataacttatattaat 13968235  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  13968234 aggaataaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13968135  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13968134 atactgtcccacttccagtccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 13968073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 69 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 11772031 - 11771677
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11772031 tttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaacct 11771932  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||     
T  11771931 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgagacacaagaaaactgatattt 11771832  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  11771831 atcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 11771732  T
Q  369 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  11771731 atatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcagg 11771677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26118371 - 26118010
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||||   |||| || || ||||| ||||| |    
T  26118371 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcg 26118272  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  26118271 gatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcactacactgtgaatataaatttctgctaactgcgctaccggataattgatattgat 26118172  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  26118171 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 26118072  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26118071 atactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatg 26118010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 12687983 - 12688299
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12687983 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12688082  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  12688083 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 12688182  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12688183 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12688282  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  12688283 atactatcccatttcca 12688299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 433
Target Start/End: Original strand, 12457300 - 12457485
Alignment:
Q  248 gctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggta 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  12457300 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtctacaacaacctaaatagcatcatgccctctcggagtgttccgta 12457399  T
Q  348 aacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12457400 aactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 12457485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 9596539 - 9596855
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9596539 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9596638  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  9596639 gatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 9596738  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  9596739 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaagtccatggat 9596838  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  9596839 atactatcccatttcca 9596855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18551546 - 18551230
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18551546 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18551447  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  18551446 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 18551347  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  18551346 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 18551247  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  18551246 atactatcccatttcca 18551230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 8199110 - 8199426
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8199110 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8199209  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8199210 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8199309  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8199310 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8199409  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8199410 atactatcccatttcca 8199426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 44791139 - 44790823
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44791139 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44791040  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  44791039 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 44790940  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  44790939 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 44790840  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  44790839 atactatcccatttcca 44790823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 398
Target Start/End: Original strand, 14040178 - 14040504
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14040178 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14040277  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14040278 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14040377  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14040378 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14040476  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacat 398  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14040477 atactatcccatttccactctggtacat 14040504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 398
Target Start/End: Original strand, 14350208 - 14350534
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14350208 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14350307  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14350308 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14350407  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14350408 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14350506  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacat 398  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14350507 atactatcccatttccactctggtacat 14350534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11237001 - 11236685
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  11237001 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 11236902  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  11236901 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 11236802  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  11236801 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattttgcaaactcgtcacaaaatccatggat 11236702  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  11236701 atactatcccatttcca 11236685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 8708087 - 8708403
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8708087 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8708186  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  8708187 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 8708286  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8708287 aggtagaaaatgagttgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8708386  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8708387 atactatcccatttcca 8708403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 10871477 - 10871793
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10871477 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10871576  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10871577 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10871676  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10871677 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10871776  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  10871777 atactatcccatttcca 10871793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11552890 - 11552574
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11552890 tccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttg 11552791  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  11552790 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 11552691  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  11552690 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccattgat 11552591  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  11552590 atactatcccatttcca 11552574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 13686546 - 13686862
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13686546 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13686645  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  ||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  13686646 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctaccaactgggcaacggggaaactaatattaat 13686745  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13686746 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 13686845  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  13686846 atactatcccatttcca 13686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 14332879 - 14333195
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14332879 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14332978  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  14332979 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgataaaaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 14333078  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14333079 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14333178  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  14333179 atactatcccatttcca 14333195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 15160845 - 15160529
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15160845 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15160746  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15160745 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 15160646  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||     
T  15160645 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcaaaaaatccatggat 15160546  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  15160545 atactatcccatttcca 15160529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15154449 - 15154117
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | |  || |||||| |||||||||| ||||| ||     
T  15154449 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaat 15154350  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||    
T  15154349 cttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaattgatat 15154250  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||| |||| |||  | |||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  15154249 taatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgagtcattccctttaggagtattcggcaaactcgttaaaaaatccat 15154150  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15154149 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 15154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 18178224 - 18178540
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  18178224 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 18178323  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18178324 gatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18178423  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  18178424 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatagat 18178523  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  18178524 atactatcccatttcca 18178540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17100 - 16788
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17100 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 17001  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  17000 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 16901  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    |  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  16900 agaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacgatgacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatac 16801  T
Q  375 tatcccatttcca 387  Q
    |||||||||||||    
T  16800 tatcccatttcca 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 414
Target Start/End: Original strand, 21662452 - 21662786
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 179  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| | || |  |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  21662452 ccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 21662551  T
Q  180 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 279  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   | || || ||||   ||||||||| ||| ||| || |||| ||||||| ||| ||    
T  21662552 ctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatctcacggatataaatcttttccaactgagatacaggaaaattgatgttaatcggaataaa 21662651  T
Q  280 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 379  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21662652 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcc 21662751  T
Q  380 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
    ||  ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  21662752 cacgtccactctggaacatctaaaggtgtcaacaa 21662786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 244
Target Start/End: Original strand, 14955102 - 14955275
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | | ||| |||||| |  |||  || |||||||| ||||    
T  14955102 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttg 14955201  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 244  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  14955202 gatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgtaaatctccgccaac 14955275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203085
Alignment:
Q  104 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 203  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  204 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 303  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23203169  T
Q  304 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23203168 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23203085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509212
Alignment:
Q  104 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 203  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  204 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 303  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23509296  T
Q  304 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23509295 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23509212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 321638 - 321506
Alignment:
Q  258 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 357  Q
    |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||    
T  321638 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 321539  T
Q  358 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  321538 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 321506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 244
Target Start/End: Original strand, 4440419 - 4440583
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||    
T  4440419 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 4440518  T
Q  180 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 244  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  4440519 ctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 4440583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23199509 - 23199451
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  23199509 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaa 23199451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27107277 - 27107243
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27107277 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27107243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 107
Target Start/End: Original strand, 12457262 - 12457298
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaac 107  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12457262 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14325775 - 14325743
Alignment:
Q  32 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14325775 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 14325743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 19644 - 20006
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  19644 tccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 19743  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19744 gatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaatgttctgaatataaatctccgccaactgagctacgagataactgatattaat 19843  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctttcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 19943  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19944 atgctatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 20006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 27749 - 28110
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  27749 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 27848  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27849 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaacggataactgatattaat 27948  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27949 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28048  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  28049 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccgtgcaggcttctgatg 28110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 41443 - 41803
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  41443 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaac--aacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccg 41540  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41541 gatctctattcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 41640  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41641 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 41740  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41741 atgctatcccacttccactccggcatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 41803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21453 - 21091
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21453 tccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 21354  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21353 gatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 21254  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21253 cgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaa 21154  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21153 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 21091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 147 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11163 - 10877
Alignment:
Q  147 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  11163 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactg 11064  T
Q  247 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11063 agctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggt 10964  T
Q  347 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10963 agactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgt 10877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 20507 - 20868
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20507 tccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20606  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20607 gatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccacaaactgagctaccgggtaactgatattaat 20706  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20707 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccaaatggaatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcataaaatccatagaa 20806  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  20807 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatg 20868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13143 - 12865
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  13143 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 13044  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13043 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 12944  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  12943 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16913 - 16635
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  16913 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 16814  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16813 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 16714  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  16713 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 11565 - 11477
Alignment:
Q  345 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11565 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 15247
Alignment:
Q  345 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15335 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 15247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 71 - 424
Target Start/End: Original strand, 40262 - 40615
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  40262 tccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 40361  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40362 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 40461  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  40462 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 40561  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40562 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggc 40615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25285
Alignment:
Q  78 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 177  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  25640 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctct 25541  T
Q  178 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 277  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||     
T  25540 atccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcataaaattatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgataataattggaata 25441  T
Q  278 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 377  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25440 aagtgcgctgacttcgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgtttt 25341  T
Q  378 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  25340 cccacttccactccggcacatccaacggtgtcaaaaaccctgcagacttctgatgt 25285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 48989 - 48627
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  48989 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 48890  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  48889 gattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccagataactgatgttaat 48790  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48789 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcactaaatccatagaa 48690  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  48689 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatgt 48627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 47181 - 46819
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||| |||||||    
T  47181 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttg 47082  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  47081 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactaagctatcggataattgatattaat 46982  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46981 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctgttgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 46882  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  46881 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatgt 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42115 - 41754
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  42115 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 42016  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42015 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 41916  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  41915 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 41816  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41815 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 41754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2806
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| | |||  |||||||||| || |||||||| |    
T  2445 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcg 2544  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||   |||| || || | |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  2545 gatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttcataatatcgcgaatataaattttcgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 2644  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||| || |||||||||||||| || || || |  | ||| || |   ||| |||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||     
T  2645 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcagccaaattgcgccattccctttaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccacggat 2744  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  2745 atgctatcccatttccattctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 2806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10678
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  10317 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 10416  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  10417 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctcctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 10516  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  10517 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggactattcggtaaactcgtcacaaaatccatgaaa 10616  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10617 atgctatcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 10678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 27048 - 27409
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  27048 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 27147  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  27148 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 27247  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27248 cggaataaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 27347  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27348 atgctatcccacttccactctggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Original strand, 26666 - 26844
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  26666 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 26765  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 249  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26766 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagc 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 73 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18317 - 17958
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||     
T  18317 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgga 18218  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18217 tctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctactggataactaatattgatcg 18118  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||    
T  18117 gaataaagtgtgccgactttgtcaacttgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacgaaatccatggaaat 18018  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18017 gctgtcccactttcactctgccacatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatg 17958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 73 - 432
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3636
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| | |||  |||||||||| ||||| |||||  |     
T  3277 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcaga 3376  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3377 tcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 3476  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3477 gaataaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 3576  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  3577 gctgtcccacttccattccgccacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12909 - 12833
Alignment:
Q  140 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 216  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12909 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacgaaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 78 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 195479 - 195124
Alignment:
Q  78 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 177  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  195479 gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 195380  T
Q  178 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 277  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  195379 atccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaacctctgctaactgagctaccggataaatgatattaatcggaata 195280  T
Q  278 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195279 aagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctat 195180  T
Q  378 cccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  195179 ccaacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgatgt 195124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 432
Target Start/End: Original strand, 149091 - 149455
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  149091 ctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacc 149190  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||| ||| || | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  149191 tcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcaaaatgttatcaatataaatctcctccaactgagctaccggataactgatatt 149290  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  149291 aatcggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatggaatcatgccctctcggagtgttcagtaaactcgtcacaaaatccata 149390  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  149391 gaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 149455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26317 - 25965
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
     || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgggatacaggaaaactgatatta 26118  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    |||| ||| || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  26117 atcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 26018  T
Q  369 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgca 421  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  26017 atatgctatgccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgca 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5234 - 4872
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||      
T  5234 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 5135  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5134 aatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5035  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5034 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaatccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4935  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4934 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 164 - 432
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6098
Alignment:
Q  164 aaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactga 263  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5830 aaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctacaggataactaa 5929  T
Q  264 tattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatc 363  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5930 tgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatc 6029  T
Q  364 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6030 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcttctgatg 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 5757
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  6117 tccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctca 6018  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6017 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatcttagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5918  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5917 aggaatgaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 5818  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgat 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  5817 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgat 5757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 74 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 101331 - 100972
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  101331 gactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 101232  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||     
T  101231 ccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccagaaaactaatatttatcgg 101132  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  101131 gataaaatgtgccgacttcgtcaacctatctaccacgacccaaatggcatcatgccctcttggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatagaaata 101032  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  101031 ttgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 100972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 399
Target Start/End: Original strand, 180725 - 181051
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  180725 cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttgga 180824  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||||||||    
T  180825 tctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaagaggaaaactgatattaatcg 180924  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  180925 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 181024  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  181025 actatcccatttccactctggcacatc 181051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 944
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  1306 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 1207  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1206 gatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttataaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 1107  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1106 cggaatatagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 1007  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1006 attaggtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 6547 - 6863
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6547 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttg 6646  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  6647 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 6746  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  6747 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccatatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgttacaaaatccatggat 6846  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  6847 atactatcccatttcca 6863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Original strand, 12846 - 12898
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12846 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 12898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 414
Target Start/End: Original strand, 114704 - 115052
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  114704 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 114803  T
Q  171 ggtct-----ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 265  Q
    | ||      |||||  |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  114804 gatcggatccctatccaacacaatactcgacggtacaccatgcagctttacaatattatgactgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgata 114903  T
Q  266 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 365  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  114904 ttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatcca 115003  T
Q  366 tagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  115004 tagaaatgctattccacttccactccagcacatccaacggtgtcaacaa 115052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 90714 - 90513
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  90614 gatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctactagataactaatattgat 90515  T
Q  271 cg 272  Q
    ||    
T  90514 cg 90513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 390986 - 390663
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  390986 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 390887  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||    
T  390886 cttggatctttatctgatacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctcagccaactgagaaataggaaaactgatat 390787  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| ||| || || | | |||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  390786 taatcggaataaaatgagtcaacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcatcccctttaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccat 390687  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactc 390  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  390686 ggatatactatcccatttccactc 390663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 89975 - 89835
Alignment:
Q  132 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 231  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  89975 catcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatata 89876  T
Q  232 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  89875 aatctctgccaactgagctactagataactaatattgatcg 89835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6660
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  7019 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 6920  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  6919 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 6820  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 369  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  6819 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 6720  T
Q  370 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 429  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6719 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 6660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 71 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11091
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  11450 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 11351  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  11350 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 11251  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 369  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11250 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 11151  T
Q  370 aatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctg 429  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  11150 aatgctgtcccacttccactccggcacatctaatggtgtcaacaaccttgcaggcttctg 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 44029 - 44391
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  44029 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 44128  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  44129 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 44228  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  44229 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 44328  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44329 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 44391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 45041 - 45403
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  45041 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 45140  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  45141 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 45240  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  45241 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 45340  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45341 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 45403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 47651 - 48009
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  47651 gactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggt 47750  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  47751 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcccccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 47850  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || | |||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47851 aataaagtgtgccgacttagtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcagggcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 47950  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  47951 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggggtcaacaaccctgtaggcttctgatg 48009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6456
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  6818 tccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 6719  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  6718 gatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 6619  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  6618 cgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 6519  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||| ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  6518 atgctgtcccacttccactctggaaaatctaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctcatgt 6456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 147 - 432
Target Start/End: Original strand, 2188 - 2473
Alignment:
Q  147 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 246  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2188 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaatattatgaatgtagatctccgccaactg 2287  T
Q  247 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||    
T  2288 agctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggt 2387  T
Q  347 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  2388 aaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggtgtcaaaaacccaacaggcttctgatg 2473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51284
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||      
T  51645 tccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctca 51546  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  51545 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 51446  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  51445 cggaataaagtgtgacgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccttctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 51346  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51345 atgctgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 51284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 92 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81252
Alignment:
Q  92 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 191  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || || ||  |||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  192 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgactt 291  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttcaaaatattatgaatataaatctaagtcaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactt 81394  T
Q  292 cgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 391  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81393 tgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 81294  T
Q  392 ggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  81293 ggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 81252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12570 - 12215
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| || || ||||    
T  12570 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacc 12471  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  12470 tcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataattgatgtt 12371  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
     ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| |||||||||    
T  12370 gataccaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaaatcgtcacgaaatccata 12271  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12270 gaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacgg-gtcaacaaccctgcaggc 12215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 173 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13979 - 13719
Alignment:
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13979 tctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatgttaatcg 13880  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13879 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 13780  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13779 gctatcccacttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatgt 13719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11655
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11293 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcg 11392  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11393 gatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 11492  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11493 aggaatgaagtgtaccgactttgtcaacctatcgaccacaaaccatatagaatcaaaccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 11592  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11593 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 11655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 214 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 57486 - 57268
Alignment:
Q  214 cacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacc 313  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57486 cacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacc 57387  T
Q  314 catatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 413  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57386 caaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 57287  T
Q  414 aacctgcaggcctctgatg 432  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  57286 accctgcaggcttctgatg 57268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 68 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48819 - 48455
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  48819 ctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacc 48720  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  48719 tcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatatt 48620  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  48619 gatcggaagaaagtttgccgacttcgtcaacctatcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatcaatg 48520  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||| | ||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48519 gaaatgttgtcccacttccactctggcatatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 48455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 57599 - 57541
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  57599 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaa 57541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1754 - 1393
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  1754 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcg 1655  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||    
T  1654 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttaaaaatatgatgaatataaatctccgccaactaagctaccggaaaactaatattgat 1555  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1554 cggaataaaatgtgcctacttcgtcaacctatcgacagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccatggaa 1455  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1454 atgctatcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 4954 - 5315
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |   |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  4954 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 5053  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||    
T  5054 aatctctatccgacacgatgctcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgat 5153  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  5154 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 5253  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5254 atgttgtcccacttccactatggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 393 - 754
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  393 tccgactgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 492  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  493 gatctctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 592  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || | | |||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  593 cggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatcgacaaaatcccaaatggcatcatgccctctcagagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 692  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||  || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  693 atgttgtcccacttccactttggcaaatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 5274 - 5635
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  5274 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 5373  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
      |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5374 aatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgctaactgagctaccggataactgatattaat 5473  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5474 aggaatgaagtgtgccaacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtattattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 5573  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5574 atgttgtcccacttccagtctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 5635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 931 - 570
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  931 tccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 832  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  || |||| ||||| ||    
T  831 gatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttcataatattatgaatataaatctcagccaattgagctaccagaaaactaatattgat 732  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  731 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcagtaaactcgtcacaaaatccatggaa 632  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  631 atgctatcccactttcactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 198
Target Start/End: Original strand, 28043 - 28170
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  28043 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 28142  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacgg 198  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28143 gatctctatctgacacaatacttgacgg 28170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 198
Target Start/End: Original strand, 34296 - 34423
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  34296 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 34395  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacgg 198  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34396 gatctctatctgacacaatacttgacgg 34423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 260829 - 261194
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  260829 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacc 260928  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  260929 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaattgagctatcggataactgatgtt 261028  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
     || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  261029 gataggaataaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcagagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccata 261128  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  261129 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 261194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 278612 - 278296
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  278612 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttg 278513  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| ||| || | || || ||| |||||||||||||    
T  278512 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgcctacagggcgacaggaaaactgatattaat 278413  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||     || || |||||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  278412 cggtggaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 278313  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  278312 atactatcccatttcca 278296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 433
Target Start/End: Original strand, 7660 - 7946
Alignment:
Q  147 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 246  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  7660 tccagaatctagaagtgaacatcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccacgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactg 7759  T
Q  247 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 346  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||    
T  7760 agctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggt 7859  T
Q  347 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7860 aaactcgtcacaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 7946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2775
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  3137 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 3038  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||  || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  3037 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcactatgttatgaacataaatctccgccaactatgctaccagataactgatattaat 2938  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | ||| ||||| || ||||| || | || ||| |||||||||| |||||||    
T  2937 aggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgataacaacctatatagcatcgtgccctcttggagtgtttgctatactcgtcacaaaattcatagaa 2838  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  2837 atactatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttcttatgt 2775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 413
Target Start/End: Original strand, 31934 - 32276
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  31934 tccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 32033  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  32034 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaattgagctaccggataactgatattgat 32133  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||| || ||||||| || ||||| || |  |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32134 tggaataaagagcaccgactttgttaacctatcaaaaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 32233  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaaca 413  Q
    ||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32234 atgttgtcccacttccactcctgcacatccaacggtgtcaaca 32276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14896
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14563 tccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14662  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  14663 gatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 14762  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||     
T  14763 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattaggcaaactcttcacaaaatccatggat 14862  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14863 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 14896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 219
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18113
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  17965 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 18064  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 219  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  18065 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaat 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18321
Alignment:
Q  151 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 250  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||      
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagaa 18458  T
Q  251 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 350  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||   ||| |||  | |||||||| | |||||    
T  18457 acaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcggcattccctttaggagtattcgttaaac 18358  T
Q  351 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  18357 tcgtcacaaaatacatggatatactatcccatttcca 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28207
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28546 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 28447  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  28446 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 28347  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28346 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 28247  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  28246 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 28207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 40537 - 40198
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40537 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 40438  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  40437 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 40338  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  40337 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 40238  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  40237 tatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaa 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2679
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| |    
T  2318 tccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcg 2417  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  2418 gatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaccggataactattattgat 2517  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2518 cggaataaagtgtgttgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcgtgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 2617  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2618 atgttgtcccacttctactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 2679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 3315 - 3676
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  3315 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 3414  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  3415 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgtaacttcttaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactaatattgat 3514  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3515 cggaataaagtgcgcggactttgtcaacctatcgacaaccacccaaatggcatcacgccctctgggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 3614  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  3615 atgttgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctacaggcttctgatg 3676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Original strand, 6896 - 7229
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6896 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6995  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6996 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 7095  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  7096 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattagacaaactcgtcacaaaatccatggat 7195  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  7196 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2657 - 2336
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2657 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 2558  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2557 gatctctatccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgactataaatctccgcc--ctgagctaccggataattgatattaat 2460  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2459 tggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 2360  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggt 394  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2359 atgccgtcccacttccactccggt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249498
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || |||||||| || |    
T  249140 gactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggat 249239  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  249240 ccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattaattgg 249339  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  249340 aatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaata 249439  T
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  249440 ctgtcccacttcgactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggcttctgatg 249498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 424
Target Start/End: Original strand, 43307 - 43660
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  43307 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 43406  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || || | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43407 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccagataactgatattaat 43506  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43507 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 43606  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggc 424  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43607 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccatgcaggc 43660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Original strand, 19375 - 19735
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  19375 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 19474  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  19475 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 19574  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19575 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 19674  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19675 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 19735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 433
Target Start/End: Original strand, 23537 - 23897
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  23537 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 23636  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  23637 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 23736  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23737 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 23836  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    | | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23837 gttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 349
Target Start/End: Original strand, 11412 - 11690
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  11412 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 11511  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11512 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 11611  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  11612 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 186 - 5
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  186 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 87  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 252  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  86 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 433
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13084
Alignment:
Q  345 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12996 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 13084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 211 - 433
Target Start/End: Original strand, 528 - 750
Alignment:
Q  211 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 310  Q
    |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  528 cttcacaatattatcgatataaatctccgccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccaca 627  T
Q  311 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  628 acccatatagtatcatgccctctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggtgaca 727  T
Q  411 acaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  728 acaaccctgcaggcttctgatgt 750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24853 - 24492
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24853 tccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24754  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||| || ||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||| ||    
T  24753 gatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttcacgaatataaatctccgccaaatgagccaccataaaactaatattgat 24654  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  24653 tggaataaattgcgtcgacttcgtcaatctatctacaaccacccaaatggtatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccat-gga 24555  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  24554 atactatcccatttccacttcggcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggcttctgatgt 24492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16495 - 16134
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16495 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 16396  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||| ||    
T  16395 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactacgctaccggataattgatattgat 16296  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  | |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16295 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgttatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16196  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16195 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 16134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 224 - 433
Target Start/End: Original strand, 5 - 210
Alignment:
Q  224 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 323  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5 tgaatataaatctcagccaactgagc----ggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 100  T
Q  324 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  101 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctacagg 200  T
Q  424 cctctgatgt 433  Q
    | ||||||||    
T  201 cttctgatgt 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14618
Alignment:
Q  183 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 282  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  14867 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 14768  T
Q  283 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 382  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  14767 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 14668  T
Q  383 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  14667 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcagtcttctgatg 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22797
Alignment:
Q  183 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 282  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  23046 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 22947  T
Q  283 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 382  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22946 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 22847  T
Q  383 ttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||    
T  22846 ttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccagcagtcttctgatg 22797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 17883 - 18233
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  17883 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaatctcg 17982  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17983 gatctctatcccacacaatactcgatagaactccatgcaactttacaatattatgaatataaacctccgccgactgagctactggataactaatattgat 18082  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||           |||||||| || | ||||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18083 cggaataaagtgtgccgacttcgtca-----------acaacccaaatggcatcatgctctcacggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 18171  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  18172 atgatgtcccacttccactctggcacatctaacggagtcaacaaccctgaaggcttctgatg 18233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 71 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33101 - 32739
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  33101 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 33002  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| |||   ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  33001 gatccctatccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccgggtaactgacattaat 32902  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| |   ||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32901 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgatagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 32802  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32801 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 32739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 26785 - 27146
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  26785 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 26884  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  26885 gatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 26984  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  26985 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaacagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 27084  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27085 atactgtcccacttccactacggtacatcaaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 27146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 212 - 384
Target Start/End: Original strand, 49437 - 49609
Alignment:
Q  212 ttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaa 311  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49437 ttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggttaactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaa 49536  T
Q  312 cccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccattt 384  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49537 cccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgccacaaaatccatagaaatgctatcccattt 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 433
Target Start/End: Original strand, 12081 - 12380
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |    
T  12081 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaa 12180  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  12181 tctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 12280  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  12281 cgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgt 12380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9865 - 9782
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 154  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  9865 tccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 432
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1793
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1428 tcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 1527  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  1528 cttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaatctcgtgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgt 1627  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1628 taatcagaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgtcctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 1727  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
      | || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  1728 gtatatactatcccatttccattctagcacatctaacggtgtcaacaacccagcaggtttctgatg 1793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19454
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19126 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19225  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19226 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19325  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19326 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19425  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19426 atactatctcatttccactctggcacatc 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 272
Target Start/End: Original strand, 50017 - 50218
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  50017 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 50116  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  50117 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcaagaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 50216  T
Q  271 cg 272  Q
    ||    
T  50217 cg 50218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 399
Target Start/End: Original strand, 34613 - 34878
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |    
T  34613 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaa 34712  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  34713 tctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctct 34812  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  34813 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 34878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25505 - 25158
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  25505 tctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 25406  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||||| |||  || ||||||| |    
T  25405 catggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacgaatgtaaatctctgccaactgagatacaagaaaactgatgt 25306  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25305 taattggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtgacaaaatccat 25206  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
     || |  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  25205 ggatacactatcccatttccactacggcacatctaacggtgtcaacaa 25158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 219197 - 218838
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  219197 cgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttgga 219098  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  219097 tctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcg 218998  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  || || |||||||||||||| || ||    
T  218997 gaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaagctcgtcacaaaatccatggatat 218898  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  218897 gctatcccatttccactctggtatatctaatggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 218838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 399
Target Start/End: Original strand, 229563 - 229895
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||| |||  |||||||     
T  229563 tctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaat 229662  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  229663 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatat 229762  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  229763 taatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 229862  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     || || ||||| || |||||||| || |||||    
T  229863 ggatatactatcacaattccactctggcacatc 229895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4916
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  4555 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 4654  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4655 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcataatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 4754  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  4755 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttatgagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 4854  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||  || ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4855 atgctatcccatttccactctagaacatataaaggtgtcatcaaacctgcaggtttctgatg 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19783 - 19451
Alignment:
Q  72 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  19783 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttgg 19684  T
Q  172 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatc 271  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||    
T  19683 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatc 19584  T
Q  272 gaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaa 371  Q
    | ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||| |  | ||| |||||||||||||| || |    
T  19583 ggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatttgtcatactcgtcacaaaatccatggata 19484  T
Q  372 tgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19483 tactatcccatttccactctggaacatctaacg 19451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 32534 - 32207
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  32534 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 32435  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  32434 gatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 32336  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32335 cggaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32236  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32235 atgctatcccatttccactctggtacatc 32207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Original strand, 6573 - 6906
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6573 tccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6672  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6673 gatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcagaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 6772  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || |  |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  6773 cggaagaaaataagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 6872  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6873 atactatcccatttccactcaggcacatctaacg 6906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 432
Target Start/End: Original strand, 3660 - 4025
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  3660 tctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 3759  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3760 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 3859  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| |||||| || ||||||||   ||| || ||||| |  ||| | ||||  |||| |||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  3860 taatcggaatgaaatgagccgacttgtgcaatctatctacaatcacctaaatcgcgtcattccctttcggagtgttcgaaaaactcgtcacaaaatccat 3959  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||  ||||||||  |||||||    
T  3960 ggatatactatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtcatcagccctgcaggtttctgatg 4025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 390
Target Start/End: Original strand, 1991 - 2310
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1991 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2090  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  2091 ggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaag 2190  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||     
T  2191 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaactcgttacaaaatccatggat 2290  T
Q  371 atgctatcccatttccactc 390  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2291 atgctatcccatttccactc 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16198 - 15859
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  16198 tccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 16099  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  16098 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaacttagacataggaaaactgatattaat 15999  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  15998 cggaataaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15899  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15898 atgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtca 15859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Original strand, 20096 - 20279
Alignment:
Q  249 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  20096 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 20195  T
Q  349 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20196 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Original strand, 22916 - 23099
Alignment:
Q  249 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  22916 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 23015  T
Q  349 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23016 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 23099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 252
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1233
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||  ||||| ||||| |||||      
T  1052 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctca 1151  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 252  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  1152 gatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatcaatataaatctccgccaactgtgctac 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12682
Alignment:
Q  152 aatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagcta 251  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgcta 12681  T
Q  252 c 252  Q
    |    
T  12682 c 12682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3872
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  4189 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 4090  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  4089 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 3990  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  3989 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 3890  T
Q  369 aaatgctatcccatttcc 386  Q
    | || |||||||||||||    
T  3889 atatactatcccatttcc 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 386
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9435
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  9118 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 9217  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  9218 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 9317  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  9318 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 9417  T
Q  369 aaatgctatcccatttcc 386  Q
    | || |||||||||||||    
T  9418 atatactatcccatttcc 9435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 33357 - 33039
Alignment:
Q  69 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 168  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  169 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 268  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaagaaaactaatatta 33158  T
Q  269 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 368  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  33157 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 33058  T
Q  369 aaatgctatcccatttcca 387  Q
    | || ||||||||||||||    
T  33057 atatactatcccatttcca 33039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 423
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9846
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  9490 tctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 9589  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  9590 cttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtaaatttcctccaactgagacacaggaaaactgatat 9689  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    |||||| |||||| || || || ||||| || || || || |  ||||| |||  ||||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9690 taatcggaatgaaatgagctgatttcgttaatctatcaacaattacccaaatcacatcattccctttcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccat 9789  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcagg 423  Q
     || || |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  9790 ggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggtgtcatcaaccctgcagg 9846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 160
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  476 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 377  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||  |||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||    
T  376 gatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaataggaaaactaatattaat 277  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  276 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 177  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  176 atactatcccatttcca 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 14884 - 15212
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14884 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14983  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||| ||||||||    
T  14984 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactaatattaat 15083  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  | ||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15084 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattagccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15183  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  15184 atactatcccatttccattctggtacatc 15212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1460
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1144 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1243  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1244 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1343  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || | |||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  1344 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgttccctctagaagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 1443  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  1444 atactatcccatttcca 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 208 - 424
Target Start/End: Original strand, 28718 - 28934
Alignment:
Q  208 caacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctacc 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  ||     
T  28718 caacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatagaca 28817  T
Q  308 acaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtg 407  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||| ||| |||    
T  28818 acaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacagtg 28917  T
Q  408 tcaacaaacctgcaggc 424  Q
    | ||||| |||||||||    
T  28918 ttaacaaccctgcaggc 28934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 213
Target Start/End: Original strand, 37726 - 37868
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  37726 tccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 37825  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaactt 213  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  37826 gatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccatacaactt 37868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 399
Target Start/End: Original strand, 29578 - 29797
Alignment:
Q  181 tgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaag 280  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  ||     
T  29578 tgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaa 29677  T
Q  281 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccatagaaatgctatcc 379  Q
    || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  29678 tgagccgacttcgtcaatctttcaacaatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtatcatgcaaactcgtcacaaaaatccatggatatactatcc 29777  T
Q  380 catttccactccggtacatc 399  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  29778 catttccactctggcacatc 29797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Original strand, 4399 - 4573
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  4399 tccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 4498  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 245  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4499 gatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaact 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 433
Target Start/End: Original strand, 4581 - 4662
Alignment:
Q  352 tgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4581 tgtcacaaaatccatggatatgctataccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgt 4662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39465
Alignment:
Q  134 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaa 39631  T
Q  234 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 333  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  39630 tctctgccaactgagaaacaggaaaactgatactaatcgaaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 39531  T
Q  334 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  39530 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 277
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  605 tccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 506  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  505 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 406  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || |  ||||| ||||  |||| | | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  405 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattctctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaactccatggat 306  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || || |||||||||||||| || |||||    
T  305 atactgtcccatttccactctggcacatc 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 63813 - 63485
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||   | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||| | ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  63713 gatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctttatataaatctctgccaactgagcaacaggaaaactgatattaat 63614  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||| ||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |     
T  63613 cggtagaaaatgagccgacgtcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcat 63514  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  63513 atactatcccatttccactctggcacatc 63485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14861 - 14522
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  14861 tccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcg 14762  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14761 gatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctctgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 14662  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || |||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||||| || |  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14661 cggaatgaaatgagccgacttcgttaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattcccattcggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatggat 14562  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  14561 atactatctcatttccactctggcacatctaaaggtgtca 14522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4232 - 3911
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4232 actgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatc 4133  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  4132 tctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcgcgaatgtaaatctccgccaactaagacacgggaaaactgatattaatcgga 4033  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    || || |  || ||||||||||| || |   | |||| ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4032 ataaactaagctgacttcgtcaatctat---caacaatccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 3936  T
Q  375 tatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  3935 tatcccatttccactctggaacatc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 248
Target Start/End: Original strand, 130672 - 130849
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  130672 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 130771  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgag 248  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  130772 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgag 130849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29161 - 28963
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  29161 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatcttg 29063  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  29062 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgctaactgggcaacaggaaaactgatattaat 28963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 59287 - 59413
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 179  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  59287 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 59386  T
Q  180 ctgacactatactcgacggaaccccat 206  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  59387 ctgatacaatacttgacggaacaccat 59413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28890 - 28826
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  28890 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 432
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15762
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  15401 tccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 15500  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||   | || || |||||||| |||||||  || ||| |||  || |||||    
T  15501 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaatatcacggatataaatctccgcgaactgagacacaggagaaccaatgttaat 15600  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||| || || ||||||||| |||| |  || || |  ||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15601 cggaataaaatgagccgacttcatcaatccatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 15700  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  15701 atgctatcccatttccactatggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 15762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 113266 - 112953
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  113266 gactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggat 113167  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 273  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || || ||  |||||||||  || ||| |||| |||||||| |     
T  113166 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctggaatataaatttcttccaactgagaaacaggaaaactaatattaattgg 113067  T
Q  274 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 373  Q
    || ||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  113066 aaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 112967  T
Q  374 ctatcccatttcca 387  Q
    ||||||||||||||    
T  112966 ctatcccatttcca 112953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3268
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  3596 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttg 3497  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  ||  || |||||||||||||    
T  3496 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttaatatatatctctgccaactgggtaacaagaaaactgatattaat 3397  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||   |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  3396 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcccgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 3297  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3296 atactatctcatttccactctggcacatc 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Original strand, 13011 - 13211
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13011 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13110  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  13111 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 13210  T
Q  271 c 271  Q
    |    
T  13211 c 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 387
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13308
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 387  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13256 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 220 - 548
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  220 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 319  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||| || ||||| ||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  320 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataccacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaagactgatattaat 419  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |      
T  420 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaattcatgggt 519  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  520 atactatcccatttccactctggcacatc 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 7921 - 8237
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7921 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8020  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||  || || ||||| || ||| | || ||  || |||| ||||||||    
T  8021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaacagggcaacaagaaaactaatattaat 8120  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||||||| ||||||| || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  8121 cggtagaaaatgagccgacttcatcaacctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccattgat 8220  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8221 atactatcccatttcca 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4881 - 4553
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  4881 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 4782  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  || ||  |||| ||||||||    
T  4781 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggaaacagggaaactaatattaat 4682  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||     
T  4681 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggat 4582  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  4581 atactatcccatttccactctggcacatc 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 7463 - 7779
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7463 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7562  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  7563 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 7662  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7663 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 7762  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  7763 atactatcccatttcca 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 16179 - 16507
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  16179 tccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttg 16278  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| |||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16279 gatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 16378  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  16379 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcatcattcccattaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatcgatggat 16478  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16479 atactatcgcatttccactctggcacatc 16507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18987 - 18761
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||  ||  | ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||      
T  18987 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctca 18888  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  18887 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagatacaagaaaactgatattaat 18788  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  18787 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 18761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Original strand, 25498 - 25831
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25498 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25597  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  25598 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 25697  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  25698 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 25797  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 404  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  25798 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 25831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 281 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 482
Alignment:
Q  281 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatccc 380  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  633 tgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaaccctaatggtgtcatgccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggaaatgctatccc 534  T
Q  381 atttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  533 acttccactcaggtacatctaacggtgtcaac-aacctgcatgcttctgatgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 622 - 798
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  622 tccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 721  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactga 247  Q
    | ||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  722 gatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactga 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 399
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3226
Alignment:
Q  87 tctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacac 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  187 tatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgcc 286  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | |||||||||| ||  || || |||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaagaaaattaatattaatcggaagaaaatgagcc 3113  T
Q  287 gacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcc 386  Q
    || |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3114 gaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcc 3213  T
Q  387 actccggtacatc 399  Q
    |||| || |||||    
T  3214 actctggcacatc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 344 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7566
Alignment:
Q  344 ggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7654 ggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 7566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 7890 - 8206
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7890 tccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7989  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  7990 gacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8089  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8090 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 8189  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8190 atactatcccatttcca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 22391 - 22707
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22391 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22490  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22491 gatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22590  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || |  || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22591 cggtagaaaataagcagacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgtcccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22690  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  22691 atactatcccatttcca 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8793 - 8541
Alignment:
Q  147 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 246  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||||    
T  8793 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctaccaactg 8694  T
Q  247 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 346  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | |||||||| ||     
T  8693 agaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggc 8594  T
Q  347 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8593 aaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatc 8541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 387
Target Start/End: Original strand, 65933 - 66245
Alignment:
Q  75 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  65933 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 66032  T
Q  175 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 274  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| ||||  |||||||||      
T  66033 cctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactattattaatcggt 66132  T
Q  275 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 374  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | |||   |||  | |||||||| || || || |||||||||||||| || || |    
T  66133 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgctccctttaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatac 66232  T
Q  375 tatcccatttcca 387  Q
    |||||||||||||    
T  66233 tatcccatttcca 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 39601 - 39274
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  39601 tccgactgac-atctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttg 39503  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| | || ||| || |||||  | ||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  39502 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaactttgcaatctccttaatataaatctctactaactgggcaataggaaaactgatattaat 39403  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  39402 tggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccatggat 39303  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  39302 atactatcccatttccactctggcacatc 39274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 68373 - 68199
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  68373 tccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctcaactttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 68274  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 245  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  68273 gatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaact 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 398
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4722
Alignment:
Q  101 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 200  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  201 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 300  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  4525 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 4624  T
Q  301 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 398  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4625 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 398
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11852
Alignment:
Q  101 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 200  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  201 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 300  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  11655 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 11754  T
Q  301 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 398  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11755 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 938 - 1254
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  938 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1037  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1038 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1137  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || |  ||||| || |  ||   ||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1138 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctccatctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 1237  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  1238 atactatcccatttcca 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 399
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1528
Alignment:
Q  68 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 167  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  1197 ctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 1296  T
Q  168 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 267  Q
    || | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || | | |||||||| |    
T  1297 ttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttgacgaatatatatctctgccaactgagacacagaaaaactgatact 1396  T
Q  268 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 367  Q
    ||||| ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||     
T  1397 aatcggaagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctttaggagtattcggcaaagtcgtcacaaaatccatg 1496  T
Q  368 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  1497 gatatactatcccatttccactctggcacatc 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 116691 - 116368
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  116691 tcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 116592  T
Q  167 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 266  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||  ||  || || | |    
T  116591 ctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgggatagaggtaaattgttgt 116492  T
Q  267 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 366  Q
    ||||   |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  116491 taatatgaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctctccacaatcacccaaatagcgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 116392  T
Q  367 agaaatgctatcccatttccactc 390  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  116391 ggatatactatcccatttccactc 116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 197260 - 196941
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  197260 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 197161  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  197160 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 197061  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  197060 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggctaactcgtcacaaaatccatggat 196961  T
Q  371 atgctatcccatttccactc 390  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  196960 atattatcccatttcgactc 196941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Original strand, 6538 - 6866
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6538 tccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttg 6637  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||  || || || |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6638 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctaaaaataaatatctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6737  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  6738 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctataggagtaatcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 6837  T
Q  371 atgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  6838 atactatcccatttccactctggcacatc 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Original strand, 8314 - 8630
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  8314 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttg 8413  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||| |||||||   ||  || || ||||| |||||||| || |  ||| |||| ||||||||    
T  8414 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatcaccttgatataaatctctgccaactgggcaataggaaaactaatattaat 8513  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |   |||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8514 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattgcccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8613  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||||||||||||    
T  8614 atactatcccatttcca 8630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 390
Target Start/End: Original strand, 5745 - 6064
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5745 tccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5844  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  5845 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattacgaatataaatctatgccaacttagaaacaggaaaactgatattaat 5944  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    || ||  || ||  ||||||||||||| ||  | |  |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  5945 cggaagaaaatgaaccgacttcgtcaatctacccataatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgggt 6044  T
Q  371 atgctatcccatttccactc 390  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6045 atactatcccatttccactc 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 80276 - 80075
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  80276 tccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttg 80177  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  80176 gatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 80077  T
Q  271 cg 272  Q
    ||    
T  80076 cg 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 126985 - 126953
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgata 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126985 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 126953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7533 - 7345
Alignment:
Q  211 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 310  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || || |      
T  7533 cttcacaatatcgcgaatgtaaatctccgccaactgagacacgggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaacctatcaacaatc 7434  T
Q  311 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7433 acccaaatagcgtcattccctttgggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12763 - 12647
Alignment:
Q  67 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 166  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  12763 tctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 12664  T
Q  167 cttgggtctctatctga 183  Q
    ||  | |||||||||||    
T  12663 ctcagatctctatctga 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 356 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20862
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20938 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatg 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27763 - 27729
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27763 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 844
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  991 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 892  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 218  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  891 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10228
Alignment:
Q  227 atgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcat 326  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||   ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| | | |||||    
T  10434 atgtaaatctctgccaattgtgccaccggaaaactaatattaattagaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaaccaccacccatgtggcatcat 10335  T
Q  327 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcct 426  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || |||||| |    
T  10334 gccctctcgaggtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttccattctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaggctt 10235  T
Q  427 ctgatgt 433  Q
    |||||||    
T  10234 ctgatgt 10228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10522 - 10428
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaa 165  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  10522 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaa 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7797
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||   |||  |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8110 tccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaa-cttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8012  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  8011 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactga--aacaggaaaactaatattaat 7914  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 370  Q
    |  ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7913 cagaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtctttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 7814  T
Q  371 atgctatcccatttcca 387  Q
    || ||||| ||||||||    
T  7813 atactatctcatttcca 7797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 5364 - 5031
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 179  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||  || ||||||||| | || || ||||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5364 ccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 5265  T
Q  180 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 279  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |    ||| || |||||||||| ||||| |||  || |||| || ||||||  ||| ||    
T  5264 ctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacaaatataaatctccgccacctgagatacaagaaaactaatgttaatcagaataaa 5165  T
Q  280 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 379  Q
     || ||||| |||||||  || || |  |  ||||| |||| |||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5164 atgagccgaattcgtcagtctatccataattacccaaatcgcatcatgtcctctttgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat-gatatactatcc 5066  T
Q  380 catttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa 414  Q
    || |||||||| || | ||| || |||||||||||    
T  5065 cacttccactctggaatatctaaaggtgtcaacaa 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 297
Target Start/End: Original strand, 9867 - 10093
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9867 tccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9966  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 270  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  9967 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctcccaactcagaaacaggaaaactgatattaat 10066  T
Q  271 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 297  Q
    || ||  || || | ||||||||||||    
T  10067 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaa 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 4953
Alignment:
Q  74 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  5077 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggat 4978  T
Q  174 ctctatctgacactatactcgacgg 198  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  4977 ctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 399
Target Start/End: Original strand, 24098 - 24350
Alignment:
Q  147 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 246  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |||| |||||||||    
T  24098 tccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatcttcgccaactg 24197  T
Q  247 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 346  Q
     || || ||| |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | |||||| |      
T  24198 ggcaacaggaaaactgatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctatagaagtattcgac 24297  T
Q  347 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  24298 aaactcatcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 24350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 399
Target Start/End: Original strand, 1791 - 2117
Alignment:
Q  73 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 172  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||     
T  1791 cgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttgga 1890  T
Q  173 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 272  Q
    ||| ||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  |  ||| |||| |||||||||     
T  1891 tctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaataggaaaactaatattaatct 1990  T
Q  273 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 372  Q
     ||  || || ||||||| ||||||  || | || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  1991 gaagaaaatgagccgactacgtcaatatgccaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 2090  T
Q  373 gctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  2091 actatcccatttccactctggcacatc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 210
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1662
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 170  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||      
T  1523 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaa 1622  T
Q  171 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaa 210  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1623 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1745
Alignment:
Q  335 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 399  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  1681 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctggcacatc 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 333 - 432
Target Start/End: Original strand, 17467 - 17566
Alignment:
Q  333 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  17467 tcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatg 17566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 433
Target Start/End: Original strand, 34015 - 34074
Alignment:
Q  374 ctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  34015 ctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggattctgatgt 34074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11839 - 11618
Alignment:
Q  211 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 310  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  11839 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 11740  T
Q  311 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  11739 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 11640  T
Q  411 acaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  11639 tcaaccctgcaggtttctgatg 11618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18031 - 17810
Alignment:
Q  211 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 310  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  18031 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 17932  T
Q  311 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtca 410  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  17931 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatctaaaggtgtca 17832  T
Q  411 acaaacctgcaggcctctgatg 432  Q
     ||| ||||||||  |||||||    
T  17831 tcaaccctgcaggtttctgatg 17810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 86213 - 85938
Alignment:
Q  150 aaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||  ||||        |||| || ||||||||||||||||     
T  86213 aaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgtaatctcac--------gaatataaatctccgccaactgaga 86122  T
Q  250 tactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 349  Q
    ||  ||| || |||| ||||| | ||| || || ||||||||| |||  || || || |  ||||| |||| || ||| ||  | |||||||| ||  ||    
T  86121 tagaggaaaattgatgttaattggaataaaatgggccgacttcatcagtctatccacaattacccaaatcgcattatgtccttttggagtattcggacaa 86022  T
Q  350 cttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgt 433  Q
    || |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||    
T  86021 ctcgtcacaaaatccatggatatattatcccacttccactttggaacatctaaaggtgtcaacaacccagcaggtttctgatgt 85938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 880
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtaca 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  921 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtaca 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17595 - 17524
Alignment:
Q  235 ctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctac 306  Q
    ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  17595 ctccgccaactaagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctac 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 245
Target Start/End: Original strand, 71830 - 71917
Alignment:
Q  158 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 245  Q
    |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  71830 gaagtaaaccttagatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 71917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33021
Alignment:
Q  92 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 191  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  192 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 245  Q
    | || ||||  ||||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  33074 tagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 33021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3372 - 3338
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3372 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4001
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3967 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24237
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3391
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  3441 acaaagtccatagaaatgctatcccacttccactccggcacaaacaacggt 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 390
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44381
Alignment:
Q  356 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44347 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 44381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Original strand, 182 - 347
Alignment:
Q  80 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatctt-gaagtaaaccttgggtctcta 178  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||   | |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || | |    
T  182 ccatcggtctggcgatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactt-tccaaaaacttagaactaaacctcggatcccga 280  T
Q  179 tctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 245  Q
    |||||||| | ||| || ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  281 tctgacacaagactagaaggaataccatgcaacctcacaatatgctcaatgtagatctcagccaact 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1701 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1701
Description:

Target: scaffold1701; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Original strand, 28 - 60
Alignment:
Q  32 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 64  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 111
Target Start/End: Original strand, 195 - 235
Alignment:
Q  71 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 111  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  195 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaa 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University