View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145A_low_135 (Length: 350)

Name: NF10145A_low_135
Description: NF10145A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145A_low_135
NF10145A_low_135
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (12-350)||(35855804-35856142)
chr4 (12-350)||(38517993-38518331)
chr4 (12-350)||(49786812-49787150)
chr4 (12-350)||(49710070-49710407)
chr4 (12-350)||(1860574-1860912)
chr4 (121-350)||(55559131-55559360)
chr4 (12-162)||(13337320-13337470)
chr4 (288-347)||(787780-787839)
chr4 (12-74)||(618208-618270)
chr4 (286-347)||(31921373-31921434)
chr4 (295-323)||(787932-787960)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (12-350)||(6310978-6311317)
chr1 (12-350)||(37390136-37390467)
chr1 (12-350)||(16041922-16042260)
chr1 (12-342)||(2329074-2329401)
chr1 (12-350)||(2453101-2453437)
chr1 (13-342)||(36207120-36207449)
chr1 (12-344)||(18148591-18148923)
chr1 (70-350)||(48238519-48238799)
chr1 (12-350)||(48775319-48775657)
chr1 (121-350)||(52500566-52500795)
chr1 (12-127)||(48233498-48233613)
chr1 (288-350)||(25074115-25074177)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (12-350)||(7036617-7036955)
chr7 (12-350)||(12781132-12781471)
chr7 (12-343)||(12785962-12786293)
chr7 (12-350)||(9001129-9001467)
chr7 (12-350)||(21070046-21070384)
chr7 (12-350)||(5828539-5828877)
chr7 (12-259)||(22843792-22844039)
chr7 (121-350)||(42231981-42232210)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (12-350)||(8428558-8428896)
chr5 (12-350)||(37372833-37373171)
chr5 (15-350)||(27880981-27881316)
chr5 (12-350)||(39883080-39883418)
chr5 (12-350)||(25542777-25543115)
chr5 (12-342)||(14192796-14193126)
chr5 (12-350)||(3689874-3690212)
chr5 (12-350)||(3876575-3876913)
chr5 (12-259)||(17871621-17871868)
chr5 (121-350)||(10024960-10025189)
chr5 (121-350)||(30346637-30346866)
chr5 (121-350)||(24629954-24630183)
chr5 (80-350)||(37261212-37261482)
chr5 (227-350)||(6089107-6089230)
chr5 (288-350)||(4051703-4051765)
chr5 (288-347)||(15032841-15032900)
chr5 (288-350)||(2261274-2261336)
chr5 (288-350)||(30314094-30314156)
chr5 (295-323)||(15032720-15032748)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (12-350)||(41920157-41920495)
chr2 (12-343)||(28666156-28666487)
chr2 (12-343)||(37824990-37825321)
chr2 (12-350)||(21395267-21395605)
chr2 (12-350)||(24269054-24269392)
chr2 (12-350)||(27192386-27192724)
chr2 (12-350)||(27842200-27842538)
chr2 (12-350)||(27509271-27509609)
chr2 (12-350)||(17683813-17684151)
chr2 (67-342)||(35609590-35609865)
chr2 (12-260)||(24245812-24246060)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (12-350)||(29640012-29640351)
chr6 (12-350)||(31510183-31510521)
chr6 (12-350)||(2202163-2202501)
chr6 (12-350)||(15333540-15333878)
chr6 (12-350)||(18344022-18344360)
chr6 (12-350)||(10187441-10187779)
chr6 (113-350)||(12517285-12517522)
chr6 (12-259)||(30881315-30881562)
chr6 (288-350)||(12519504-12519566)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (12-347)||(32671-33006)
chr3 (12-350)||(10110497-10110835)
chr3 (20-347)||(50410072-50410399)
chr3 (12-350)||(10000304-10000642)
chr3 (12-350)||(13529936-13530274)
chr3 (12-349)||(10968766-10969102)
chr3 (17-350)||(10237453-10237785)
chr3 (12-350)||(11368543-11368883)
chr3 (12-319)||(52917994-52918300)
chr3 (12-350)||(11362155-11362494)
chr3 (73-350)||(46912968-46913245)
chr3 (101-341)||(47692875-47693115)
chr3 (80-342)||(10038545-10038807)
chr3 (286-347)||(41763620-41763681)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (12-350)||(25218549-25218887)
chr8 (12-348)||(7821737-7822073)
chr8 (12-350)||(30307074-30307412)
chr8 (12-350)||(25209031-25209354)
chr8 (34-350)||(31978533-31978849)
chr8 (12-350)||(21113728-21114066)
chr8 (288-350)||(14714162-14714224)
chr8 (286-347)||(33861638-33861699)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (12-343)||(48920-49251)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (12-350)||(321320-321658)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (12-350)||(31830-32167)
scaffold0073 (34-350)||(19354-19670)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (12-350)||(556-894)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (12-350)||(5244-5581)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (12-350)||(18903-19241)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (12-350)||(186454-186789)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (12-342)||(905-1235)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (12-350)||(17860-18191)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (12-350)||(182708-183046)
scaffold0003 (12-350)||(165427-165766)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (49-342)||(16589-16882)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (121-350)||(28727-28956)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (157-350)||(31-224)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (196-323)||(1572-1699)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (288-350)||(97083-97145)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (15-66)||(39937-39988)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (289-350)||(126126-126187)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35856142 - 35855804
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35856142 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 35856043  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35856042 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 35855943  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35855942 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 35855843  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35855842 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 35855804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38518331 - 38517993
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38518331 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttg 38518232  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38518231 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 38518132  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38518131 gaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccaaaatttcttaatggtattaagagc 38518032  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38518031 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 38517993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 49786812 - 49787150
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49786812 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 49786911  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49786912 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 49787011  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49787012 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttaacaccagaatttcttaatggtattaagagc 49787111  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49787112 tctggaattccaaatcacagattgaaactaaaggtggga 49787150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49710407 - 49710070
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49710407 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatcc-ttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 49710309  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49710308 gtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 49710209  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49710208 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccggaatttcttaatggtattaagagc 49710109  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49710108 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 49710070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1860912 - 1860574
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  1860912 atgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 1860813  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||    
T  1860812 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggtgaaga 1860713  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  1860712 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagc 1860613  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1860612 tatggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 1860574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 55559131 - 55559360
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  55559131 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 55559230  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  55559231 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaatt 55559330  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  55559331 tcaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 55559360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13337470 - 13337320
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  13337470 atgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgtttatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 13337371  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgatt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13337370 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgatt 13337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 787839 - 787780
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  787839 gaatttcttaatggtattaagagctatggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtg 787780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 618208 - 618270
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcactt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  618208 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttcatgtcactt 618270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31921434 - 31921373
Alignment:
Q  286 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  31921434 cagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtg 31921373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 787960 - 787932
Alignment:
Q  295 ttaatggtattaagagctctggaattcca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  787960 ttaatggtattaagagctctggaattcca 787932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 6310978 - 6311317
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6310978 atgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 6311077  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6311078 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 6311177  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctattttt-agatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311178 gaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagag 6311277  T
Q  311 ctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311278 ctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 6311317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 37390136 - 37390467
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37390136 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 37390235  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37390236 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 37390335  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37390336 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgt-------gagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 37390428  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37390429 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 37390467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16042260 - 16041922
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16042260 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtgtatcccaatctgaatgataaccttg 16042161  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16042160 gtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaaga 16042061  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16042060 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagc 16041961  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16041960 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 16041922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2329401 - 2329074
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2329401 atgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagac---gtgtatcccgatttgaatgataaccttg 2329305  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  2329304 gtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 2329205  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  2329204 gaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagagagtggttcacaacggaatttctaaatggtattaagagc 2329105  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2329104 tatggaattccaaatcaccggttgaaactaa 2329074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 2453101 - 2453437
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  2453101 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaatgataaccttg 2453200  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  2453201 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgctttattgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaattccaggtgaaga 2453300  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  2453301 gaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaaacga--gattcacaatggaatttcttaatggtattaagagc 2453398  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  2453399 tctggaattccaaatcaccgattgaaactaacggtggga 2453437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36207449 - 36207120
Alignment:
Q  13 tgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttgg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  36207449 tgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttgg 36207350  T
Q  113 tgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagag 212  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  36207349 tgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 36207250  T
Q  213 aaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagct 312  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36207249 aaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagtgagttgttcacaacggaatttcttaatggtattaagagct 36207150  T
Q  313 ctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
    ||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  36207149 ctgaaactccaaatcaccggttgaaactaa 36207120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18148923 - 18148591
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||    
T  18148923 atgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataaccttg 18148824  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  18148823 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 18148724  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  18148723 gaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattcttatgtccaaagcaagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagc 18148624  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaag 344  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18148623 tctggaattctaaatcaccggttgaaactaaag 18148591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 70 - 350
Target Start/End: Original strand, 48238519 - 48238799
Alignment:
Q  70 cacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttga 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48238519 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 48238618  T
Q  170 gcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaa 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||||| ||    
T  48238619 gcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtccaa 48238718  T
Q  270 agcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| || |||||||    
T  48238719 agcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagctctgaaattccaattcaccggttgaaaccaagggtggga 48238799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 48775319 - 48775657
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| |||    
T  48775319 atgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaattctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataacattg 48775418  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  48775419 gtgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggtgaaga 48775518  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| | |||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48775519 gaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtctgatgtccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 48775618  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||| | |||||||    
T  48775619 tatggaattccaaatcaccagttgaaactgagggtggga 48775657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52500795 - 52500566
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52500795 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 52500696  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  52500695 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaatt 52500596  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52500595 ccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 52500566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 48233613 - 48233498
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48233613 atgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaatccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 48233514  T
Q  112 gtgaccaactattttt 127  Q
    | ||||  ||||||||    
T  48233513 gcgaccctctattttt 48233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 25074115 - 25074177
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25074115 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 25074177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7036955 - 7036617
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7036955 atgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 7036856  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7036855 gtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 7036756  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7036755 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 7036656  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7036655 tttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 7036617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 12781132 - 12781471
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12781132 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 12781231  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12781232 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 12781331  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctattttt-agatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781332 gaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagag 12781431  T
Q  311 ctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12781432 ctatggaattccaaatcacaggttgaaactaatggtggga 12781471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 12785962 - 12786293
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12785962 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 12786061  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12786062 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaaga 12786161  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12786162 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 12786261  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12786262 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaa 12786293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 9001129 - 9001467
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  9001129 atgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatccgttgatgtctcttatagactttgtttatcccgatctgattgataaccttg 9001228  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9001229 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaaga 9001328  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9001329 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccggaatttcttaatggtattaagagc 9001428  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9001429 tctgaaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 9001467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 21070046 - 21070384
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21070046 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 21070145  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  21070146 gtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcctggtgaaga 21070245  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21070246 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaatttagatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 21070345  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  21070346 tctgaaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 21070384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 5828539 - 5828877
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  5828539 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatcttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 5828638  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  5828639 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgactcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 5828738  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  5828739 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacattgtaatttcttaatggtattaagagc 5828838  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  5828839 tctggaattccaaatcaccggttgaaactagaggtggga 5828877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22844039 - 22843792
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||||||    
T  22844039 atgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttg 22843940  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  22843939 gtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 22843840  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattc 259  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  22843839 gaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42232210 - 42231981
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42232210 tatttttccaagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 42232111  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42232110 tttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagctctggaatt 42232011  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42232010 ccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 42231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 8428558 - 8428896
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8428558 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 8428657  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8428658 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 8428757  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428758 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 8428857  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8428858 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 8428896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37373171 - 37372833
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37373171 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 37373072  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37373071 gtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaaccaatttatgatgtcactgattccaggtgaaga 37372972  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37372971 gaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 37372872  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37372871 tttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 37372833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27881316 - 27880981
Alignment:
Q  15 aaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtg 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27881316 aaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtg 27881217  T
Q  115 accaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27881216 accaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaa 27881117  T
Q  215 agagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctct 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27881116 agagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacactggaatttcttaatggtattaagagctct 27881017  T
Q  315 ggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27881016 ggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 27880981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39883418 - 39883080
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39883418 atgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 39883319  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39883318 gtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaagtgaaga 39883219  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39883218 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattatgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagc 39883119  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  39883118 tctggaattccaaatcacatgttgaaattaaaggtggga 39883080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 25542777 - 25543115
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25542777 atgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 25542876  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  25542877 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 25542976  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  25542977 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacaacgaaattccttaatggtattaagagc 25543076  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25543077 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 25543115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Original strand, 14192796 - 14193126
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14192796 atgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 14192895  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  14192896 gtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 14192995  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14192996 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacgacggaatttcgtaatggtattaagagc 14193095  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14193096 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaa 14193126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3690212 - 3689874
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  3690212 atgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattg 3690113  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||    
T  3690112 gtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggaga 3690013  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3690012 gaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 3689913  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  3689912 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtggga 3689874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 3876575 - 3876913
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  3876575 atgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattg 3876674  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||    
T  3876675 gggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggaga 3876774  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3876775 gaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgatctctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 3876874  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  3876875 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtggga 3876913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Original strand, 17871621 - 17871868
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||||||    
T  17871621 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttg 17871720  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17871721 gtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 17871820  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattc 259  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  17871821 gaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10025189 - 10024960
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10025189 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagta 10025090  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10025089 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggtatt 10024990  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10024989 ccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 10024960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 30346637 - 30346866
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30346637 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 30346736  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30346737 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctctggaatt 30346836  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30346837 ccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 30346866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 24629954 - 24630183
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24629954 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 24630053  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24630054 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaaatgagcggttcacaacggaattccttaatggtattaagagctttggaatt 24630153  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24630154 ccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 24630183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37261482 - 37261212
Alignment:
Q  80 ctttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaac 179  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||   ||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  37261482 ctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 37261383  T
Q  180 gaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggt 279  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  37261382 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgaatggt 37261283  T
Q  280 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  37261282 tcacaaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 37261212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6089230 - 6089107
Alignment:
Q  227 ctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaat 326  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || || || | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6089230 ctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttaatatccaaggtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctgggatttcaaat 6089131  T
Q  327 cataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||   ||||||||||| |||||||    
T  6089130 cactagttgaaactaagggtggga 6089107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4051765 - 4051703
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  4051765 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 4051703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 15032841 - 15032900
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15032841 gaatttcttaatggtattaagagctctagaattccaaatcatcggttgaaactaagggtg 15032900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 2261274 - 2261336
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2261274 gaatttcttaatggtattaagagctttggcattccaaatcacaggttgaaactaagggtggga 2261336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30314156 - 30314094
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||    
T  30314156 gaatttcttcatggtattaagacctctggaattccaaatcaccgattgaaactaagggtggga 30314094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 323
Target Start/End: Original strand, 15032720 - 15032748
Alignment:
Q  295 ttaatggtattaagagctctggaattcca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032720 ttaatggtattaagagctctggaattcca 15032748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 41920157 - 41920495
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41920157 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 41920256  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41920257 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 41920356  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41920357 taaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 41920456  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41920457 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 41920495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 28666156 - 28666487
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28666156 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 28666255  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  28666256 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaaga 28666355  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28666356 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 28666455  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28666456 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaa 28666487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 37824990 - 37825321
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37824990 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctaaatgataaccttg 37825089  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37825090 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaaga 37825189  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37825190 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 37825289  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37825290 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaa 37825321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21395605 - 21395267
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21395605 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatgataaccttg 21395506  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395505 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 21395406  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21395405 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacgccggaatttcttaatggtattaagagc 21395306  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21395305 tctggaattccaaatcacaggttgaagctaaaggtggga 21395267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 24269054 - 24269392
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  24269054 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 24269153  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  24269154 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 24269253  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24269254 gaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagc 24269353  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24269354 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 24269392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27192724 - 27192386
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27192724 atgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 27192625  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27192624 gtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaaga 27192525  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27192524 gaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagc 27192425  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  27192424 tctgaaattccaaatcaccggttgaaaccaagggtggga 27192386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27842538 - 27842200
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27842538 atgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 27842439  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  27842438 gtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaaga 27842339  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27842338 gaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagc 27842239  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  27842238 tctgaaattccaaatcaccggttgaaaccaagggtggga 27842200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27509609 - 27509271
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27509609 atgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaattcgttgatatcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 27509510  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  27509509 gtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 27509410  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27509409 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctaatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 27509310  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  27509309 tctggaatttcaaatcaccggttgaaaataagggtggga 27509271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 17683813 - 17684151
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17683813 atgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 17683912  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17683913 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 17684012  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17684013 gaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 17684112  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  17684113 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 17684151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 67 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35609865 - 35609590
Alignment:
Q  67 tgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagt 166  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35609865 tgtcacttatagactttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagt 35609766  T
Q  167 tgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtc 266  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  35609765 tgagtatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtc 35609666  T
Q  267 taaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35609665 caaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcactggttgaaactaa 35609590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24246060 - 24245812
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24246060 atgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatgtcacttatagaccttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 24245961  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  24245960 gtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 24245861  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 260  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24245860 gaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 29640012 - 29640351
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29640012 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataaccttg 29640111  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29640112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 29640211  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacacc-agaatttcttaatggtattaagag 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29640212 gaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccaagaatttcttaatggtattaagag 29640311  T
Q  311 ctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29640312 ctctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 29640351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 31510183 - 31510521
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  31510183 atgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatcaaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataaccttg 31510282  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31510283 gtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 31510382  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31510383 gaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 31510482  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31510483 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 31510521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 2202163 - 2202501
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2202163 atgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 2202262  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  2202263 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtagaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 2202362  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  2202363 gaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaactgaattccttaatggtatttagagc 2202462  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  2202463 tctggaattccaaatcactggttgaaactaagggtggga 2202501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15333878 - 15333540
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15333878 atgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtcactaatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 15333779  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15333778 gtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 15333679  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  15333678 gaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagaggttcatatcgaaatttcttaatggtattaagagc 15333579  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15333578 tctggaattccaaatcacaggttaaaactaaaggtggga 15333540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 18344360 - 18344022
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18344360 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 18344261  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  18344260 gtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaaga 18344161  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18344160 gaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtatttcacaatagaatttcttaatggtattaagagc 18344061  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||  ||||||||||||   |||||||| || |||||||    
T  18344060 tctaaaattccaaatcaccagttgaaaccaagggtggga 18344022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10187779 - 10187441
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10187779 atgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 10187680  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10187679 gtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 10187580  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10187579 gaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 10187480  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  10187479 tcttgaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 10187441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12517522 - 12517285
Alignment:
Q  113 tgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagag 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12517522 tgaccagctatttttccaagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagag 12517423  T
Q  213 aaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagct 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12517422 aaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagct 12517323  T
Q  313 ctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12517322 ttggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 12517285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30881562 - 30881315
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||||||    
T  30881562 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttg 30881463  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  30881462 gtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 30881363  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattc 259  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  30881362 gaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12519566 - 12519504
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  12519566 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 12519504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33006 - 32671
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33006 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatggactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 32907  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32906 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaaga 32807  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32806 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccataatttcttaatggtattaagagc 32707  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32706 tctggaaatccaaatcacaggttgaaactaaaggtg 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10110835 - 10110497
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  10110835 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 10110736  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10110735 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 10110636  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  10110635 gaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccttaatgatattaagagc 10110536  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10110535 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 10110497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 50410399 - 50410072
Alignment:
Q  20 agaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaa 119  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  50410399 agaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccca 50410300  T
Q  120 ctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagt 219  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50410299 ctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacaaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagt 50410200  T
Q  220 atttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaat 319  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50410199 atttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaatgagagtggttcacagcggaatttctaaatggtattaagagctctggaat 50410100  T
Q  320 tccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    ||||||||   |||||||||||| ||||    
T  50410099 tccaaatcgctggttgaaactaagggtg 50410072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10000642 - 10000304
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  10000642 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatctgttgatatcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 10000543  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10000542 gtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 10000443  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||    
T  10000442 gaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccctaatgatattaagagc 10000343  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10000342 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 10000304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13530274 - 13529936
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13530274 atgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 13530175  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  13530174 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttcattcagttgagcattttaacgaatatatgatgtcactgagtccaggtgaaga 13530075  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  || | |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  13530074 gaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaattttggtgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttagtggtattaagagc 13529975  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  13529974 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 13529936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 349
Target Start/End: Original strand, 10968766 - 10969102
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||     
T  10968766 atgaaggtagaaatttctga-gatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgccacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaacttc 10968864  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10968865 gtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtttagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 10968964  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10968965 gaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 10969064  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggg 349  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  10969065 tctagaatttcaaatcaccggttgaaactaatggtggg 10969102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10237785 - 10237453
Alignment:
Q  17 ggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgac 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  10237785 ggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgac 10237686  T
Q  117 caactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaag 216  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  10237685 ccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaag 10237586  T
Q  217 agtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctgg 316  Q
    |||| |||| || ||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10237585 agta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtccaaatcaagtggttcacaacggaattccttaatgatattaagagctctgg 10237487  T
Q  317 aattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10237486 aattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 10237453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11368883 - 11368543
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  11368883 atgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcactcatagactttgtatatcccgatttgaatgataacattg 11368784  T
Q  112 gtgaccaactattttt-ccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaag 210  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11368783 gtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaag 11368684  T
Q  211 agaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtg-aaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaaga 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11368683 agaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagtctgatgtccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaaga 11368584  T
Q  310 gctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  11368583 gctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 11368543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 52918300 - 52917994
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | || |  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  52918300 atgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagacttcgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 52918202  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  52918201 gtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 52918102  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  52918101 gaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtactaagagc 52918002  T
Q  312 tctggaat 319  Q
    ||||||||    
T  52918001 tctggaat 52917994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11362494 - 11362155
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || |||||  | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||    
T  11362494 atgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattg 11362395  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  11362394 gtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaaga 11362295  T
Q  212 gaaaga-gtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagag 310  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11362294 gaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagag 11362195  T
Q  311 ctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  11362194 ctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtggga 11362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46913245 - 46912968
Alignment:
Q  73 ttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagca 172  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46913245 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagca 46913146  T
Q  173 tgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagc 272  Q
    ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| | ||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  46913145 tgttaacgaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtccaaagc 46913046  T
Q  273 gagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  46913045 gagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctatggaattcaaaatcaccggttgaaactaagggtggga 46912968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 101 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47693115 - 47692875
Alignment:
Q  101 tgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgatt 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||    
T  47693115 tgataaccttggtgacccacaattttcccaagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaatt 47693016  T
Q  201 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  47693015 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtccagagcgagtggttcacaacgaaatttcttaatg 47692916  T
Q  301 gtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaacta 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47692915 gtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaacta 47692875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 80 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10038807 - 10038545
Alignment:
Q  80 ctttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaac 179  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||     
T  10038807 ctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgagcatattaat 10038708  T
Q  180 gaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggt 279  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  10038707 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgcccaaagcgaatggt 10038608  T
Q  280 tcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10038607 tcacaaaggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccggttgaaactaa 10038545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 41763620 - 41763681
Alignment:
Q  286 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  41763620 cagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtg 41763681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 25218549 - 25218887
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25218549 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 25218648  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25218649 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 25218748  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25218749 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccggaatttcttaatggtattaagagc 25218848  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25218849 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 25218887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7822073 - 7821737
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7822073 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgataaccttg 7821974  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7821973 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcaggtgaaga 7821874  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7821873 gaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaattgtattaagagc 7821774  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtgg 348  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7821773 tctggaattccaaatcacatgttgaaactaaaggtgg 7821737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30307412 - 30307074
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30307412 atgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataaccttg 30307313  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30307312 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 30307213  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307212 gaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 30307113  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30307112 tctgcaattccaaatcacaagttgaaactaaaggtggga 30307074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 25209031 - 25209354
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||    
T  25209031 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt---------------aatgataaccttg 25209115  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25209116 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaga 25209215  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25209216 gaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtccaaagctagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 25209315  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25209316 tctggtattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 25209354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Original strand, 31978533 - 31978849
Alignment:
Q  34 atttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaaga 133  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31978533 atttgctgatatcgggcacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 31978632  T
Q  134 aaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31978633 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 31978732  T
Q  234 tctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggt 333  Q
    ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31978733 tctgtttgtagatcgggggaaaattcagatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggt 31978832  T
Q  334 tgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  31978833 tgaaactaaaggtggga 31978849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 21113728 - 21114066
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  21113728 atgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttg 21113827  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  21113828 gtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 21113927  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  21113928 gaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtccaaagtgagtggttcacaacgaaattccttaatggtattaagagc 21114027  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21114028 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 21114066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14714224 - 14714162
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14714224 gaatttcttaatggtattaagagctctggcattccaaatcacaggttgaaactaagggtggga 14714162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 33861638 - 33861699
Alignment:
Q  286 cagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtg 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  33861638 cagaattttttaatggtattaagagctctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtg 33861699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 12 - 343
Target Start/End: Original strand, 48920 - 49251
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48920 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 49019  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  49020 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaaga 49119  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49120 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 49219  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49220 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaa 49251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 321320 - 321658
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  321320 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatccgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaatgataaccttg 321419  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  321420 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatttcaggtgaaga 321519  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  321520 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcagaatttcttaatggtattcagagc 321619  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  321620 tctggaattccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 321658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32167 - 31830
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32167 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttg 32068  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32067 gtgaccagctatttttccaagaaagggga-tacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgttgctgattccaggtgaaga 31969  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  31968 gaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagatc 31869  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31868 tttggaatcccaaatcacaggttgaaactaaaggtggga 31830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 19354
Alignment:
Q  34 atttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaaga 133  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 19571  T
Q  134 aaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19570 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 19471  T
Q  234 tctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggt 333  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19470 tctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcacaggt 19371  T
Q  334 tgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  19370 tgaaactaaaggtggga 19354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 556 - 894
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  556 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttg 655  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  656 gtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaatgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaa 755  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  756 gaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacatcggaatttcttaatggtattaagagc 855  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  856 tatggaattccaaatcacaggttgaagctaaaagtggga 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 5244 - 5581
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  5244 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctattgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttg 5343  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  5344 gtgacccgctatttt-ccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatttcaggtgaaga 5442  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5443 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaattccttaatggtattaagagc 5542  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  5543 tctggaattccaaatcaccggttgatactaaaggtggga 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19241 - 18903
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  19241 atgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttg 19142  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  19141 gtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 19042  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  19041 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtgcaaagcgagtggttcacaacggaattccttaatggtattaagagc 18942  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18941 tctggaattccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 18903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 186789 - 186454
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  186789 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 186690  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  186689 gtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 186590  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  186589 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaattctgatgtccaaagcgagtggttctcaacggaattccttaatggtattaagagc 186491  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  186490 tctgg--ttccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 186454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1235 - 905
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1235 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 1136  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||    
T  1135 gtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagtgaaga 1036  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1035 gaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatgaccagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 936  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  935 tctggaattccaaatcaccggttgaagctaa 905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Original strand, 17860 - 18191
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17860 atgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 17959  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||| |  ||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  17960 gtgatccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgatttagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 18052  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18053 gaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattatgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagc 18152  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  18153 tctagaattccaaatcaccggttgaaactaagggtggga 18191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 183046 - 182708
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||    
T  183046 atgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttgaatgatatcattg 182947  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||    
T  182946 gtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtgaaga 182847  T
Q  212 gaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  182846 gaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatctgatggctagagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagc 182747  T
Q  312 tctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  182746 tctggaatttcaaatcaccggttgaaactaatggtggga 182708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 165766 - 165427
Alignment:
Q  12 atgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttg 111  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || |||||  | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||    
T  165766 atgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattg 165667  T
Q  112 gtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaaga 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  165666 gtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaaga 165567  T
Q  212 gaaaga-gtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagag 310  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  165566 gaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtctagagcgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagag 165467  T
Q  311 ctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  165466 ctctggaattccaaatcaccggttgaaactaatggtggga 165427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16882 - 16589
Alignment:
Q  49 acacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtctcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgc 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16882 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgc 16783  T
Q  149 accaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcg 248  Q
    ||||||| || ||| ||| ||| ||||||||| || |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  ||||    
T  16782 accaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttttcaatcg 16683  T
Q  249 ggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaa 342  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16682 agcgaaaattctgatgtccaaagcgagtggttcacaacagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatgaccggttgaaactaa 16589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 28727 - 28956
Alignment:
Q  121 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgtttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  28727 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagta 28826  T
Q  221 tttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||| | | | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28827 tttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtccaaagtgagtggttcacaacggaatttcttaatggtattaagagctctggaatt 28926  T
Q  321 ccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28927 ccaaatcaccggttgaaactaaaggtggga 28956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 157 - 350
Target Start/End: Original strand, 31 - 224
Alignment:
Q  157 ttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| | | | | |||||||||||||    
T  31 ttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgggtgaaaa 130  T
Q  257 ttctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  131 ttctgatttccaaaacgagtggttcacaatggaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcaccagttgaaactaagggtggga 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1699 - 1572
Alignment:
Q  196 tgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtctaaagcgagtggttcacaccagaatttct 295  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1699 tgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtccaaagcgagtggttcacaacggaatttct 1600  T
Q  296 taatggtattaagagctctggaattcca 323  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1599 taatggtattaagagcactagaattcca 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 97083 - 97145
Alignment:
Q  288 gaatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  97083 gaatttcttaatggtattaagagctccagcattccaaatcacaggttgaaattaagggtggga 97145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 39988 - 39937
Alignment:
Q  15 aaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaataaatccgttga 66  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  39988 aaggtagaaattcttgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 126187 - 126126
Alignment:
Q  289 aatttcttaatggtattaagagctctggaattccaaatcataggttgaaactaaaggtggga 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  126187 aattttttaatggtattaagagctctgacgttccaaatcacaggttgaaaataagggtggga 126126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University