View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145A_low_239 (Length: 293)

Name: NF10145A_low_239
Description: NF10145A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145A_low_239
NF10145A_low_239
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (11-293)||(27285831-27286113)
chr6 (9-258)||(24868198-24868447)
chr6 (9-258)||(28164973-28165222)
chr6 (9-260)||(27625176-27625427)
chr6 (9-258)||(27183411-27183660)
chr6 (9-258)||(27265579-27265828)
chr6 (9-258)||(27357575-27357824)
chr6 (9-257)||(13294416-13294664)
chr6 (11-258)||(26774094-26774341)
chr6 (9-258)||(16754303-16754552)
chr6 (9-258)||(26922859-26923108)
chr6 (9-260)||(24301222-24301473)
chr6 (9-258)||(14140859-14141108)
chr6 (9-258)||(22930349-22930598)
chr6 (9-258)||(23852794-23853043)
chr6 (9-258)||(27023619-27023868)
chr6 (10-258)||(27061988-27062236)
chr6 (10-276)||(8901169-8901435)
chr6 (11-264)||(17087910-17088163)
chr6 (10-258)||(29554039-29554287)
chr6 (11-260)||(16939494-16939743)
chr6 (10-258)||(4541240-4541488)
chr6 (10-258)||(4762245-4762493)
chr6 (10-258)||(27489615-27489863)
chr6 (11-258)||(4719602-4719849)
chr6 (11-258)||(16678622-16678869)
chr6 (14-260)||(15408003-15408249)
chr6 (14-260)||(15419790-15420036)
chr6 (11-261)||(34459973-34460223)
chr6 (10-258)||(13519660-13519908)
chr6 (10-258)||(26790298-26790546)
chr6 (10-258)||(29577496-29577744)
chr6 (10-257)||(28211937-28212184)
chr6 (11-258)||(29505898-29506145)
chr6 (10-258)||(33371897-33372145)
chr6 (11-258)||(4529767-4530014)
chr6 (11-258)||(30553483-30553730)
chr6 (10-260)||(27012211-27012461)
chr6 (10-260)||(27198665-27198915)
chr6 (10-258)||(3700565-3700813)
chr6 (10-258)||(4777362-4777610)
chr6 (11-257)||(26111879-26112125)
chr6 (11-258)||(20173029-20173276)
chr6 (11-258)||(22162715-22162962)
chr6 (10-260)||(27250319-27250570)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (11-293)||(31031803-31032085)
chr3 (9-260)||(22383143-22383394)
chr3 (9-258)||(15736659-15736908)
chr3 (11-258)||(11105926-11106173)
chr3 (9-260)||(29144321-29144572)
chr3 (9-258)||(4688101-4688350)
chr3 (9-258)||(35885212-35885461)
chr3 (10-258)||(6538308-6538556)
chr3 (10-258)||(29660536-29660784)
chr3 (9-260)||(8285035-8285286)
chr3 (10-260)||(8001004-8001254)
chr3 (10-260)||(10647517-10647767)
chr3 (9-258)||(4726076-4726325)
chr3 (9-258)||(18055708-18055957)
chr3 (9-258)||(19698936-19699185)
chr3 (10-258)||(5715519-5715767)
chr3 (10-258)||(5726429-5726677)
chr3 (10-258)||(5765691-5765939)
chr3 (11-258)||(28343623-28343870)
chr3 (9-258)||(4792200-4792449)
chr3 (9-258)||(21679149-21679398)
chr3 (9-258)||(32443597-32443846)
chr3 (10-258)||(20572409-20572657)
chr3 (11-258)||(5591924-5592171)
chr3 (10-260)||(51786467-51786717)
chr3 (9-258)||(5471434-5471683)
chr3 (9-258)||(15888270-15888519)
chr3 (9-258)||(18335076-18335325)
chr3 (9-258)||(20070486-20070735)
chr3 (10-258)||(4421361-4421609)
chr3 (10-258)||(7077652-7077900)
chr3 (10-258)||(18287919-18288167)
chr3 (10-258)||(18303220-18303468)
chr3 (10-254)||(48470377-48470621)
chr3 (13-256)||(28111523-28111766)
chr3 (10-258)||(5018160-5018408)
chr3 (10-258)||(6206350-6206598)
chr3 (10-258)||(17980515-17980763)
chr3 (10-258)||(18229642-18229890)
chr3 (10-258)||(47027899-47028147)
chr3 (11-258)||(32295074-32295321)
chr3 (11-292)||(16620057-16620338)
chr3 (9-258)||(24332609-24332858)
chr3 (10-258)||(4342242-4342490)
chr3 (10-258)||(10400590-10400838)
chr3 (10-258)||(17972427-17972675)
chr3 (10-260)||(22866414-22866664)
chr3 (10-260)||(22881473-22881723)
chr3 (11-258)||(28025727-28025974)
chr3 (9-258)||(4628231-4628480)
chr3 (10-258)||(31960021-31960269)
chr3 (11-258)||(5604881-5605128)
chr3 (10-257)||(18247188-18247435)
chr3 (9-213)||(5656625-5656829)
chr3 (9-114)||(8216224-8216329)
chr3 (208-258)||(5654531-5654581)
chr3 (213-258)||(8216181-8216226)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (9-258)||(31778-32027)
scaffold0143 (9-258)||(8445-8694)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (9-258)||(27429952-27430201)
chr2 (10-260)||(11630696-11630946)
chr2 (9-258)||(20842397-20842646)
chr2 (9-260)||(39894551-39894802)
chr2 (11-260)||(12591290-12591539)
chr2 (9-258)||(19412012-19412261)
chr2 (9-258)||(27780718-27780967)
chr2 (9-258)||(27820475-27820724)
chr2 (9-258)||(28886763-28887012)
chr2 (10-258)||(256165-256413)
chr2 (10-258)||(3786977-3787225)
chr2 (9-293)||(21698682-21698966)
chr2 (10-258)||(34295638-34295886)
chr2 (11-258)||(34159328-34159575)
chr2 (9-258)||(23124080-23124329)
chr2 (11-260)||(27808185-27808434)
chr2 (10-258)||(40237992-40238240)
chr2 (11-258)||(37681408-37681655)
chr2 (11-258)||(37696673-37696920)
chr2 (14-260)||(12660018-12660264)
chr2 (10-260)||(12712113-12712363)
chr2 (11-257)||(16165965-16166211)
chr2 (11-293)||(21672688-21672970)
chr2 (10-260)||(31880768-31881018)
chr2 (11-258)||(9345499-9345746)
chr2 (11-258)||(34270433-34270680)
chr2 (11-258)||(37947375-37947622)
chr2 (9-258)||(27121008-27121257)
chr2 (9-258)||(31889002-31889251)
chr2 (14-254)||(37382165-37382405)
chr2 (11-258)||(13932060-13932307)
chr2 (11-258)||(34866168-34866415)
chr2 (11-258)||(32054287-32054534)
chr2 (11-258)||(37929853-37930100)
chr2 (11-258)||(16824851-16825098)
chr2 (11-258)||(16896382-16896629)
chr2 (11-258)||(19451936-19452183)
chr2 (10-258)||(22923660-22923908)
chr2 (11-258)||(39047332-39047579)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (9-258)||(16203556-16203805)
chr1 (9-293)||(20335938-20336222)
chr1 (9-258)||(21893270-21893519)
chr1 (10-258)||(10949564-10949812)
chr1 (9-258)||(28154223-28154472)
chr1 (11-258)||(10967152-10967399)
chr1 (9-258)||(3645629-3645879)
chr1 (10-260)||(28589565-28589815)
chr1 (10-258)||(41788833-41789081)
chr1 (10-258)||(51642705-51642953)
chr1 (9-258)||(20465463-20465712)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (9-293)||(25204735-25205019)
chr5 (9-293)||(25268890-25269174)
chr5 (9-261)||(29886616-29886868)
chr5 (11-258)||(3794033-3794280)
chr5 (11-293)||(22892920-22893202)
chr5 (10-258)||(41679197-41679445)
chr5 (9-258)||(6878797-6879046)
chr5 (9-258)||(18370953-18371202)
chr5 (9-258)||(30939127-30939376)
chr5 (10-258)||(9321968-9322216)
chr5 (10-258)||(13438103-13438351)
chr5 (10-258)||(30172961-30173209)
chr5 (9-258)||(13182212-13182461)
chr5 (9-258)||(26484886-26485135)
chr5 (14-258)||(23630462-23630705)
chr5 (9-257)||(24587867-24588115)
chr5 (10-258)||(24728461-24728709)
chr5 (14-258)||(28955209-28955453)
chr5 (11-258)||(8660896-8661143)
chr5 (9-260)||(18123835-18124086)
chr5 (9-258)||(11553847-11554096)
chr5 (9-258)||(22994536-22994785)
chr5 (9-258)||(33781977-33782226)
chr5 (10-258)||(9546129-9546377)
chr5 (10-258)||(15654178-15654426)
chr5 (11-258)||(43082747-43082994)
chr5 (10-260)||(13320250-13320500)
chr5 (9-258)||(30033920-30034169)
chr5 (10-258)||(11328129-11328377)
chr5 (10-258)||(18496145-18496393)
chr5 (11-258)||(28653735-28653982)
chr5 (11-258)||(40468971-40469218)
chr5 (9-258)||(33297020-33297269)
chr5 (10-258)||(12136667-12136915)
chr5 (10-258)||(33879620-33879868)
chr5 (9-256)||(23896369-23896616)
chr5 (10-260)||(31821827-31822077)
chr5 (10-260)||(34621008-34621258)
chr5 (10-258)||(2515554-2515802)
chr5 (10-258)||(15754272-15754520)
chr5 (11-258)||(30156523-30156770)
chr5 (10-258)||(37759475-37759723)
chr5 (11-258)||(5642280-5642527)
chr5 (11-258)||(33520872-33521119)
chr5 (10-260)||(31435954-31436204)
chr5 (10-258)||(37666906-37667154)
chr5 (11-258)||(32591695-32591942)
chr5 (10-257)||(37354063-37354310)
chr5 (87-260)||(24974396-24974569)
chr5 (73-256)||(37766474-37766657)
chr5 (10-78)||(37747749-37747817)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (9-260)||(19912645-19912896)
chr8 (9-258)||(16287437-16287685)
chr8 (9-258)||(22137394-22137643)
chr8 (9-258)||(19692582-19692831)
chr8 (9-258)||(2132743-2132992)
chr8 (9-258)||(18795188-18795437)
chr8 (9-258)||(19656824-19657073)
chr8 (9-258)||(27604388-27604637)
chr8 (9-258)||(33246854-33247103)
chr8 (9-258)||(18713968-18714217)
chr8 (9-258)||(44565468-44565717)
chr8 (11-258)||(9359109-9359356)
chr8 (11-293)||(19203847-19204129)
chr8 (11-258)||(28357437-28357684)
chr8 (12-258)||(21343657-21343903)
chr8 (11-293)||(22076410-22076692)
chr8 (10-258)||(33263218-33263466)
chr8 (9-260)||(14562106-14562357)
chr8 (10-258)||(15772058-15772306)
chr8 (10-257)||(12088207-12088454)
chr8 (9-260)||(19678929-19679180)
chr8 (9-260)||(31485354-31485605)
chr8 (10-258)||(29833809-29834057)
chr8 (10-258)||(31359012-31359260)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (9-260)||(16513837-16514088)
chr7 (10-258)||(2105571-2105819)
chr7 (9-282)||(16045773-16046046)
chr7 (9-258)||(11420186-11420435)
chr7 (9-258)||(16445413-16445662)
chr7 (9-258)||(26533280-26533529)
chr7 (10-258)||(4140654-4140902)
chr7 (10-258)||(24587942-24588190)
chr7 (11-258)||(26511105-26511352)
chr7 (11-258)||(39208548-39208795)
chr7 (9-258)||(2159056-2159305)
chr7 (9-258)||(4203871-4204120)
chr7 (9-258)||(45735789-45736038)
chr7 (9-258)||(2777736-2777985)
chr7 (9-258)||(3449788-3450037)
chr7 (9-258)||(5162865-5163114)
chr7 (9-258)||(10912276-10912525)
chr7 (11-258)||(26517274-26517521)
chr7 (11-258)||(26665323-26665570)
chr7 (11-258)||(26680515-26680762)
chr7 (10-260)||(11445367-11445617)
chr7 (9-258)||(26270493-26270742)
chr7 (10-258)||(31128389-31128637)
chr7 (10-260)||(45391700-45391950)
chr7 (10-258)||(5142748-5142996)
chr7 (10-258)||(26315256-26315504)
chr7 (10-258)||(26439739-26439987)
chr7 (14-258)||(31086034-31086278)
chr7 (38-258)||(5132478-5132698)
chr7 (10-258)||(31559798-31560046)
chr7 (11-258)||(10846102-10846349)
chr7 (10-258)||(16746925-16747173)
chr7 (9-42)||(5152782-5152815)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (9-258)||(10521-10770)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-258)||(17067-17315)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (9-260)||(34184482-34184733)
chr4 (11-293)||(15232279-15232561)
chr4 (9-258)||(14669511-14669760)
chr4 (9-258)||(20333943-20334192)
chr4 (10-258)||(40101160-40101408)
chr4 (11-258)||(33669324-33669571)
chr4 (9-258)||(24587883-24588132)
chr4 (9-258)||(36340039-36340288)
chr4 (14-258)||(17017544-17017788)
chr4 (10-258)||(18312701-18312949)
chr4 (11-258)||(54837889-54838136)
chr4 (9-258)||(30758258-30758507)
chr4 (10-258)||(6574356-6574604)
chr4 (10-258)||(18796137-18796385)
chr4 (10-258)||(24117160-24117408)
chr4 (11-258)||(39855135-39855382)
chr4 (11-260)||(5699031-5699280)
chr4 (10-258)||(5010373-5010621)
chr4 (10-258)||(14755015-14755263)
chr4 (11-258)||(14103041-14103288)
chr4 (11-277)||(15381757-15382023)
chr4 (9-258)||(1904752-1905001)
chr4 (9-258)||(27158839-27159088)
chr4 (11-258)||(21974199-21974446)
chr4 (11-258)||(31122036-31122283)
chr4 (11-258)||(15278151-15278398)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-258)||(14056-14303)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (9-260)||(4550-4801)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (10-260)||(10451-10701)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (10-258)||(21714-21962)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (10-260)||(141-391)
scaffold0322 (11-258)||(10530-10777)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (10-257)||(12435-12682)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-293)||(23566-23848)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-258)||(10507-10755)
[»] scaffold0159 (4 HSPs)
scaffold0159 (10-260)||(4702-4952)
scaffold0159 (11-260)||(24056-24305)
scaffold0159 (88-258)||(11774-11944)
scaffold0159 (182-258)||(9712-9788)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (9-159)||(11112-11262)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (102-260)||(42294-42454)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (9-87)||(26421-26499)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Original strand, 27285831 - 27286113
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27285831 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 27285930  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27285931 gtacatcatgcattaacttctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatccccatctaaaaggaa 27286030  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  27286031 tttactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctggtgggtacttacggcttagcaagaactgcttga 27286113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24868447 - 24868198
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24868447 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 24868348  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24868347 atgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 24868248  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24868247 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 24868198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28165222 - 28164973
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28165222 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 28165123  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28165122 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 28165023  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28165022 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28164973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 27625176 - 27625427
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27625176 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27625275  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27625276 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacagg 27625375  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27625376 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 27625427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27183660 - 27183411
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27183660 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27183561  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27183560 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27183461  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27183460 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27183411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 27265579 - 27265828
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27265579 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27265678  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27265679 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27265778  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27265779 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27265828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 27357575 - 27357824
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27357575 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 27357674  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27357675 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27357774  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27357775 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27357824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 257
Target Start/End: Original strand, 13294416 - 13294664
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13294416 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 13294515  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13294516 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 13294615  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13294616 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcac 13294664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 26774094 - 26774341
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26774094 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 26774193  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26774194 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 26774293  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  26774294 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 26774341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16754552 - 16754303
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16754552 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 16754453  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16754452 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 16754353  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16754352 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16754303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26923108 - 26922859
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26923108 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 26923009  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26923008 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 26922909  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  26922908 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26922859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 24301222 - 24301473
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24301222 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacagcttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 24301321  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24301322 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacatg 24301421  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24301422 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 24301473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 14140859 - 14141108
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14140859 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccaaaggtaccgtc 14140958  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14140959 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 14141058  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14141059 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 14141108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 22930349 - 22930598
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22930349 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 22930448  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22930449 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 22930548  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22930549 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 22930598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 23852794 - 23853043
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23852794 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 23852893  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23852894 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 23852993  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23852994 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 23853043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27023868 - 27023619
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27023868 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27023769  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27023768 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagg 27023669  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27023668 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27023619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27062236 - 27061988
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27062236 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 27062137  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27062136 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatttaacagga 27062037  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  27062036 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27061988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 276
Target Start/End: Original strand, 8901169 - 8901435
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8901169 ctggtagcaatcatgttccatggccatccagtagtaacttgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 8901268  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8901269 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 8901368  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggct 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || |||| ||||||    
T  8901369 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcctgcttggaagcacccgacggatattcacggct 8901435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 17087910 - 17088163
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17087910 tggtagcaatcatgctccatggacatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 17088009  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17088010 gtacgtcatgcattaattgttctgcctcgtgctcatcaacacattttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatccccatctaacaagaa 17088109  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgg 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17088110 cctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacccgatgg 17088163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29554287 - 29554039
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29554287 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacccgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtca 29554188  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29554187 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 29554088  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29554087 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29554039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 16939494 - 16939743
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16939494 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 16939593  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16939594 gtacatcgtgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 16939693  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16939694 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 16939743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 4541240 - 4541488
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4541240 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4541339  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4541340 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 4541439  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4541440 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4541488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4762493 - 4762245
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4762493 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4762394  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4762393 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaaccataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 4762294  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4762293 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4762245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27489863 - 27489615
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27489863 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 27489764  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27489763 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 27489664  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27489663 atctaccggccaatcttctcaaagtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27489615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 4719602 - 4719849
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4719602 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 4719701  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4719702 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 4719801  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4719802 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4719849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16678869 - 16678622
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16678869 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 16678770  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16678769 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtataggatatctccatctaacaggaa 16678670  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16678669 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 16678622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 15408003 - 15408249
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15408003 tagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgta 15408102  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15408103 catcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacaccttaataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacatgaatct 15408202  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15408203 actggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgattggaagcacctg 15408249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Original strand, 15419790 - 15420036
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15419790 tagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgta 15419889  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15419890 catcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacaccttaataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacatgaatct 15419989  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15419990 actggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgattggaagcacctg 15420036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 34459973 - 34460223
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34459973 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaagctaccgtcat 34460072  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34460073 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatttaacaggaa 34460172  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctga 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34460173 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctga 34460223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 13519660 - 13519908
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13519660 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 13519759  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13519760 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacagga 13519859  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13519860 atctactgaccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 13519908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26790546 - 26790298
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26790546 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 26790447  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790446 tgtatatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctcaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 26790347  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  26790346 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26790298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29577744 - 29577496
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29577744 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 29577645  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  29577644 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaa 29577545  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29577544 atctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 29577496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28212184 - 28211937
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28212184 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 28212085  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28212084 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 28211985  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28211984 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 28211937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29506145 - 29505898
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29506145 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 29506046  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29506045 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttatcaacaccatgtcatagttcctcttgtaaagaatatctccatctaacaggaa 29505946  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29505945 tctactggccaatcttcttagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29505898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 33371897 - 33372145
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33371897 ctggtagcagtcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcg 33371996  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33371997 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtatagaatatctccatctaacagga 33372096  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33372097 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33372145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4530014 - 4529767
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4530014 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 4529915  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4529914 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaagaa 4529815  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4529814 tctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4529767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 30553483 - 30553730
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30553483 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 30553582  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30553583 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 30553682  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30553683 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30553730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27012461 - 27012211
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27012461 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 27012362  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27012361 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctcaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 27012262  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27012261 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 27012211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27198915 - 27198665
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27198915 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 27198816  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27198815 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 27198716  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27198715 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 27198665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3700813 - 3700565
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3700813 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 3700714  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3700713 tgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcgacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 3700614  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||    
T  3700613 atctaccggccaatcttctcagagtcttcttatcttgtttggaagcacc 3700565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4777610 - 4777362
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4777610 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4777511  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4777510 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 4777411  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4777410 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4777362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Original strand, 26111879 - 26112125
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26111879 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 26111978  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26111979 gtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaa 26112078  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26112079 tctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 26112125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20173276 - 20173029
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  20173276 tggtagcaatcatgctccatggtcatccaatagtaacctgctcgtaacaactttcgtgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcgt 20173177  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20173176 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagttcctcttgtatagaatatctccatctaacaggaa 20173077  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20173076 tctaccggctaatcttctcaaggtcttcttgtctctgttggaagcacc 20173029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 22162715 - 22162962
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  22162715 tggtagcaatcatgctccatggtcatccaatagtaacctgctcgtaacaactttcgtgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcgt 22162814  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22162815 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagttcctcttgtatagaatatctccatctaacaggaa 22162914  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22162915 tctaccggctaatcttctcaaggtcttcttgtctctgttggaagcacc 22162962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 27250319 - 27250570
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250319 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 27250418  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtt-tcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27250419 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttccctcttgtacaaaatatctccatctaacagg 27250518  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27250519 aatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 27250570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Original strand, 31031803 - 31032085
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31031803 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 31031902  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31031903 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 31032002  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||| |||| |||| || |||||||    
T  31032003 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagctcccggtggatacttacagcttagcaagaactgcttga 31032085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 22383143 - 22383394
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383143 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaatttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 22383242  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22383243 atgtacatcatgcattaactgttctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 22383342  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22383343 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 22383394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 15736659 - 15736908
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15736659 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 15736758  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15736759 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 15736858  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  15736859 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 15736908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 11105926 - 11106173
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11105926 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 11106025  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11106026 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 11106125  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  11106126 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11106173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 29144321 - 29144572
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29144321 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 29144420  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29144421 atgtacatcatgcattaattgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 29144520  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  29144521 aatctactggccaatctcctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 29144572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4688350 - 4688101
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4688350 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 4688251  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4688250 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccgtctaacagg 4688151  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4688150 aatctactggtcaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 4688101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35885461 - 35885212
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35885461 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 35885362  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35885361 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 35885262  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  35885261 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 35885212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 6538308 - 6538556
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6538308 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 6538407  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6538408 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 6538507  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6538508 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 6538556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 29660536 - 29660784
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29660536 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 29660635  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29660636 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 29660735  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  29660736 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29660784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 8285035 - 8285286
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8285035 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaacgtc 8285134  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8285135 atgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcataatttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 8285234  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8285235 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacctg 8285286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8001254 - 8001004
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8001254 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 8001155  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8001154 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 8001055  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8001054 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 8001004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10647767 - 10647517
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10647767 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 10647668  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647667 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 10647568  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10647567 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 10647517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4726325 - 4726076
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4726325 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctcctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 4726226  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4726225 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 4726126  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4726125 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4726076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18055957 - 18055708
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18055957 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 18055858  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18055857 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 18055758  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18055757 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18055708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19699185 - 19698936
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19699185 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 19699086  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || |    
T  19699085 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaataccatgttgtagtttctcttgtacaaaatgtctccatctagcaag 19698986  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698985 aatttactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 19698936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5715767 - 5715519
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5715767 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 5715668  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5715667 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 5715568  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5715567 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5715519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5726677 - 5726429
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5726677 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 5726578  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5726577 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 5726478  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5726477 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5726429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 5765691 - 5765939
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5765691 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 5765790  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765791 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 5765890  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5765891 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5765939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28343870 - 28343623
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28343870 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 28343771  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28343770 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 28343671  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28343670 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 28343623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 4792200 - 4792449
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4792200 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcttgtaacaatttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 4792299  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4792300 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 4792399  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4792400 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 4792449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21679398 - 21679149
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21679398 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 21679299  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21679298 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 21679199  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21679198 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 21679149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32443846 - 32443597
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32443846 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 32443747  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32443746 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 32443647  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32443646 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 32443597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 20572409 - 20572657
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20572409 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 20572508  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20572509 tgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 20572608  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20572609 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 20572657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 5591924 - 5592171
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5591924 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 5592023  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5592024 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 5592123  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5592124 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5592171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51786717 - 51786467
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51786717 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 51786618  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51786617 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacagga 51786518  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  51786517 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 51786467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5471683 - 5471434
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5471683 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 5471584  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5471583 atgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 5471484  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5471483 aatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5471434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 15888270 - 15888519
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15888270 gctgatagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 15888369  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15888370 atgtacatcatacattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaatactatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 15888469  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15888470 aatctactggccaatctgctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 15888519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18335325 - 18335076
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18335325 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaagataccgtc 18335226  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18335225 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacagg 18335126  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18335125 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18335076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20070735 - 20070486
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20070735 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccttgtagcatgggtcccgaaggtaccatc 20070636  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20070635 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcgacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 20070536  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20070535 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 20070486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4421609 - 4421361
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4421609 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccaatagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4421510  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4421509 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 4421410  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4421409 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4421361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7077900 - 7077652
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7077900 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 7077801  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7077800 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacagaa 7077701  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7077700 atctactagccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 7077652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 18287919 - 18288167
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18287919 ctggtagcaatcatgctccatggccatccaatagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18288018  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18288019 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 18288118  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18288119 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18288167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 18303220 - 18303468
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18303220 ctggtagcaatcatgctccatggccatccaatagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18303319  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303320 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 18303419  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18303420 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18303468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48470621 - 48470377
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48470621 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtgccgtca 48470522  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48470521 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 48470422  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaag 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  48470421 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaag 48470377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Original strand, 28111523 - 28111766
Alignment:
Q  13 gtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgt 112  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28111523 gtagcaatcatgttccatggccatccaatagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgt 28111622  T
Q  113 acgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatc 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28111623 acatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatc 28111722  T
Q  213 tactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagca 256  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28111723 tgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagca 28111766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5018408 - 5018160
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5018408 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcg 5018309  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5018308 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 5018209  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5018208 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5018160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6206598 - 6206350
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6206598 ctggtagcaatcatactccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 6206499  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6206498 tgtacatcatgcattaactactccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 6206399  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6206398 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 6206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 17980515 - 17980763
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17980515 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 17980614  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17980615 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttatcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 17980714  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17980715 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 17980763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18229890 - 18229642
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18229890 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18229791  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18229790 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttatcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 18229691  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18229690 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18229642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47028147 - 47027899
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47028147 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 47028048  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47028047 tgtacatcatgcactaactgttccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 47027948  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  47027947 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 47027899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32295321 - 32295074
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32295321 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 32295222  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32295221 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 32295122  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32295121 tctactggccaatcttcttagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 32295074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 292
Target Start/End: Original strand, 16620057 - 16620338
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16620057 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 16620156  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  16620157 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaacaagaa 16620256  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttg 292  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| |||| || ||||||    
T  16620257 cctaccagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacccggtggatactcacggcttagcaagaactgcttg 16620338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24332858 - 24332609
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24332858 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 24332759  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24332758 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 24332659  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24332658 aatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 24332609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 4342242 - 4342490
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4342242 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4342341  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4342342 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 4342441  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4342442 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4342490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10400838 - 10400590
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  10400838 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccatca 10400739  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10400738 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacagga 10400639  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10400638 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10400590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 17972427 - 17972675
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17972427 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 17972526  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  17972527 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaa 17972626  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  17972627 atctgctggccaatcttctcggggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 17972675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 22866414 - 22866664
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22866414 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 22866513  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22866514 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctctatctaacagga 22866613  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22866614 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 22866664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 22881473 - 22881723
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22881473 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 22881572  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22881573 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctctatctaacagga 22881672  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22881673 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 22881723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28025974 - 28025727
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28025974 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 28025875  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28025874 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatccccatctaacaggaa 28025775  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28025774 tctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28025727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4628480 - 4628231
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4628480 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 4628381  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4628380 atgtacatcatgcattaattgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 4628281  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |  |||||||||||    
T  4628280 aatctaccggccaatcttctcagggtcttcctatcctgtttggaagcacc 4628231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 31960021 - 31960269
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31960021 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31960120  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960121 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 31960220  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31960221 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31960269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 5604881 - 5605128
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5604881 tggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 5604980  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5604981 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 5605080  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5605081 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5605128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18247435 - 18247188
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18247435 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18247336  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18247335 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 18247236  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18247235 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 18247188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5656829 - 5656625
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5656829 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacagcttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 5656730  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| || |    
T  5656729 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaatatcatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtttccatctagcaag 5656630  T
Q  209 aatct 213  Q
    |||||    
T  5656629 aatct 5656625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 8216329 - 8216224
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8216329 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 8216230  T
Q  109 atgtac 114  Q
    ||||||    
T  8216229 atgtac 8216224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5654581 - 5654531
Alignment:
Q  208 gaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5654581 gaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 5654531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8216226 - 8216181
Alignment:
Q  213 tactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  8216226 tactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 8216181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32027 - 31778
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32027 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatc 31928  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31927 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 31828  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31827 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 31778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8694 - 8445
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8694 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 8595  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  8594 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatg 8495  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8494 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 8445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 27429952 - 27430201
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27429952 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27430051  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27430052 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27430151  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27430152 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatctttgttggaagcacc 27430201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 11630696 - 11630946
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11630696 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 11630795  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11630796 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 11630895  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  11630896 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 11630946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20842646 - 20842397
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20842646 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtgacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 20842547  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842546 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcagcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 20842447  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20842446 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttgaaagcacc 20842397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39894802 - 39894551
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39894802 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 39894703  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39894702 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 39894603  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39894602 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 39894551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12591539 - 12591290
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12591539 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 12591440  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591439 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 12591340  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12591339 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 12591290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 19412012 - 19412261
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19412012 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 19412111  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19412112 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 19412211  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19412212 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 19412261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27780967 - 27780718
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27780967 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 27780868  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27780867 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27780768  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27780767 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27780718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27820724 - 27820475
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27820724 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 27820625  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27820624 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27820525  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27820524 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27820475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28887012 - 28886763
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28887012 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 28886913  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28886912 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaaccataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 28886813  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28886812 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 28886763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 256165 - 256413
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  256165 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 256264  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  256265 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 256364  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  256365 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 256413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3787225 - 3786977
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3787225 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaataacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 3787126  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3787125 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 3787026  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3787025 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 3786977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Original strand, 21698682 - 21698966
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21698682 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacccgctcgtaacaacttccttgacatagtatgctctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 21698781  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  21698782 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtctccatctaacaga 21698881  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || | ||||||| |||| || |||||||    
T  21698882 aatctactggccaatctcctcagggtcttcttgtctttgttggaagcatccggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 21698966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34295886 - 34295638
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34295886 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 34295787  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34295786 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 34295687  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34295686 ctctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 34295638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34159575 - 34159328
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34159575 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 34159476  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159475 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 34159376  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  34159375 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 34159328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 23124080 - 23124329
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23124080 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 23124179  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23124180 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 23124279  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  23124280 aatctactggccaatcttctcagggttttcttatcttgtttggaagcacc 23124329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27808434 - 27808185
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27808434 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 27808335  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27808334 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 27808235  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  27808234 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 27808185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40238240 - 40237992
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40238240 ctggtagcaatcatgttccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 40238141  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40238140 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 40238041  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40238040 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 40237992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 37681408 - 37681655
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37681408 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 37681507  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681508 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 37681607  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37681608 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37681655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 37696673 - 37696920
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37696673 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 37696772  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37696773 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 37696872  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37696873 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37696920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12660264 - 12660018
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12660264 tagcaatcatgctccatggccatctagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgta 12660165  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12660164 catcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 12660065  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12660064 actggccaatctcctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 12660018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 12712113 - 12712363
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12712113 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaataacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 12712212  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712213 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 12712312  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12712313 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 12712363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16166211 - 16165965
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16166211 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 16166112  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16166111 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 16166012  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  16166011 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcac 16165965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Original strand, 21672688 - 21672970
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21672688 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 21672787  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21672788 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatacctccatctaacaggaa 21672887  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  || |||| ||||||  |||| || |||||||    
T  21672888 tctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctggcggatattcacggctcagcaagaactgcttga 21672970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31881018 - 31880768
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31881018 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31880919  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31880918 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacagga 31880819  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  31880818 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 31880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 9345499 - 9345746
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9345499 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtagcaacttccttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 9345598  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345599 ggacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttccttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 9345698  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9345699 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 9345746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 34270433 - 34270680
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34270433 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 34270532  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34270533 gtacatcatgcattaactgctcaacttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtgtctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 34270632  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34270633 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 34270680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 37947375 - 37947622
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37947375 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 37947474  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37947475 gtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 37947574  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37947575 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27121257 - 27121008
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27121257 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaaccggctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 27121158  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27121157 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 27121058  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27121057 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27121008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 31889002 - 31889251
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31889002 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttctttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 31889101  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31889102 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcattaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 31889201  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  31889202 aatctactggctaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 31889251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37382405 - 37382165
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37382405 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgta 37382306  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37382305 catcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 37382206  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaag 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  37382205 actggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaag 37382165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 13932060 - 13932307
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13932060 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 13932159  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13932160 gtatatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 13932259  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13932260 tctgctggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 13932307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34866415 - 34866168
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34866415 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 34866316  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34866315 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatattcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagttccttttgtatagaatatctccatctaacaggaa 34866216  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34866215 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 34866168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32054534 - 32054287
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32054534 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 32054435  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32054434 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaa 32054335  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  32054334 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 32054287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37930100 - 37929853
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37930100 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 37930001  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37930000 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaa 37929901  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  37929900 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37929853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 16824851 - 16825098
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16824851 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 16824950  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16824951 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 16825050  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16825051 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16825098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16896629 - 16896382
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16896629 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 16896530  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16896529 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 16896430  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16896429 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16896382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 19451936 - 19452183
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19451936 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 19452035  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |||    
T  19452036 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaa 19452135  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452136 cctactagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 19452183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 22923660 - 22923908
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22923660 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 22923759  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22923760 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 22923859  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22923860 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 22923908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 39047332 - 39047579
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39047332 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 39047431  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39047432 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaa 39047531  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  39047532 tctactggccaaccttctcaaggttttcttgtcttgtttggaagcacc 39047579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 16203556 - 16203805
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16203556 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacccgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 16203655  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16203656 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 16203755  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16203756 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatctttgttggaagcacc 16203805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Original strand, 20335938 - 20336222
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20335938 gctggtagcaatcgtgctccatggtcatccaatagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtacgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 20336037  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20336038 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcattttcatcaacacatcttagcaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 20336137  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||| || |||||||    
T  20336138 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtctctgttggaagcacccggtggatacttacggcttagcaagaactgcttga 20336222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 21893270 - 21893519
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21893270 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 21893369  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893370 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 21893469  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21893470 aatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 21893519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10949812 - 10949564
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10949812 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 10949713  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10949712 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 10949613  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10949612 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10949564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28154472 - 28154223
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28154472 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 28154373  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28154372 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 28154273  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28154272 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28154223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10967399 - 10967152
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10967399 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 10967300  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10967299 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 10967200  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10967199 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 10967152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3645879 - 3645629
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccg-aaggtaccgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3645879 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccggaaggtaccgt 3645780  T
Q  108 catgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacag 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3645779 catgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacag 3645680  T
Q  208 gaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  3645679 gaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 3645629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28589815 - 28589565
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28589815 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 28589716  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28589715 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 28589616  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28589615 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 28589565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 41788833 - 41789081
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41788833 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 41788932  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41788933 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcgtcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 41789032  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  41789033 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 41789081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51642953 - 51642705
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  51642953 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatca 51642854  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642853 tgtacatcctgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 51642754  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  51642753 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 51642705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20465712 - 20465463
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20465712 gctggtagcaatcatgctccatggttatccagtagtaacctgcccgtaacaacttctttgacatagtatgccttgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 20465613  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20465612 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtctccatctaacagg 20465513  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20465512 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtccctgttggaagcacc 20465463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25205019 - 25204735
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25205019 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 25204920  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25204919 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctagcagg 25204820  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| || |||||||    
T  25204819 aatttactagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacccggtggatacttacgacttagcaagaactgcttga 25204735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25269174 - 25268890
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25269174 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 25269075  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25269074 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctagcagg 25268975  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||| |||| || |||||||    
T  25268974 aatttactagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacccggtggatacttacgacttagcaagaactgcttga 25268890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 29886616 - 29886868
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29886616 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 29886715  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29886716 atgtacgtcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaaaagg 29886815  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctga 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29886816 aatctactggccaatcttcttagggtcttcttgtcttggttggaagcacctga 29886868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3794280 - 3794033
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3794280 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 3794181  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3794180 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 3794081  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  3794080 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 3794033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22893202 - 22892920
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22893202 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 22893103  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22893102 gtacgtcatgcattaactactccgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaacatctccagctaacaggaa 22893003  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| || |||||||    
T  22893002 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtccctgttggaagcacctggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 22892920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41679445 - 41679197
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41679445 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 41679346  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41679345 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 41679246  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41679245 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 41679197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6879046 - 6878797
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6879046 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 6878947  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6878946 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatctctccatctaacagg 6878847  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6878846 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 6878797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 18370953 - 18371202
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18370953 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 18371052  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18371053 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 18371152  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18371153 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30939376 - 30939127
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30939376 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 30939277  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30939276 atgcacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 30939177  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30939176 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30939127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9322216 - 9321968
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9322216 ctggtagcaatcatgttccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 9322117  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322116 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 9322017  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9322016 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 9321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 13438103 - 13438351
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13438103 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 13438202  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13438203 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaacatctccatctaacagga 13438302  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  13438303 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 13438351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30173209 - 30172961
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30173209 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 30173110  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30173109 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 30173010  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  30173009 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 30172961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 13182212 - 13182461
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13182212 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 13182311  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13182312 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 13182411  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13182412 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 13182461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26485135 - 26484886
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26485135 gctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 26485036  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  26485035 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacaga 26484936  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26484935 aatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26484886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23630705 - 23630462
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23630705 tagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgta 23630606  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23630605 catcatgcattaactgctctgcttc-tgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 23630507  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23630506 actggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 23630462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24588115 - 24587867
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24588115 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacagcttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 24588016  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24588015 atgtacatcatgcatcaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaaaagg 24587916  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24587915 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcac 24587867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24728709 - 24728461
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24728709 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 24728610  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24728609 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 24728510  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24728509 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 24728461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 28955209 - 28955453
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28955209 tagcaatcatgctccatggccatccaatagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgta 28955308  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28955309 catcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 28955408  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28955409 actggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 28955453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 8660896 - 8661143
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8660896 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 8660995  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8660996 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 8661095  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  8661096 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 8661143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 18123835 - 18124086
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18123835 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 18123934  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18123935 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatcttcatctaacagg 18124034  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  18124035 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 18124086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11554096 - 11553847
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11554096 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgatatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 11553997  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11553996 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 11553897  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11553896 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 11553847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 22994536 - 22994785
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22994536 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatggtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 22994635  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22994636 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 22994735  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22994736 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 22994785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33782226 - 33781977
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33782226 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 33782127  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33782126 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacagg 33782027  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33782026 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33781977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 9546129 - 9546377
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9546129 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 9546228  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9546229 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 9546328  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9546329 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 9546377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15654178 - 15654426
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15654178 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacccgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 15654277  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15654278 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 15654377  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15654378 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 15654426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43082994 - 43082747
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43082994 tggtagcaatcctgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 43082895  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082894 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcacagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 43082795  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  43082794 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 43082747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 13320250 - 13320500
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13320250 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 13320349  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320350 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 13320449  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13320450 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 13320500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30034169 - 30033920
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30034169 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 30034070  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30034069 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacagg 30033970  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  30033969 aatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 30033920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11328377 - 11328129
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11328377 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 11328278  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11328277 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacagga 11328178  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  11328177 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11328129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 18496145 - 18496393
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18496145 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18496244  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18496245 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 18496344  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18496345 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18496393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28653982 - 28653735
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28653982 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcat 28653883  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653882 gtacatcatgcattaactgctcagcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 28653783  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28653782 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 28653735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 40468971 - 40469218
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40468971 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaatctgctcgtagcaacttccttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 40469070  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469071 ggacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttccttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 40469170  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40469171 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 40469218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33297269 - 33297020
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33297269 gctggtagcaatcatgctccatggctatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatggtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 33297170  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  33297169 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 33297070  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33297069 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33297020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12136915 - 12136667
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12136915 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 12136816  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12136815 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaa 12136716  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12136715 atctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 12136667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33879868 - 33879620
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33879868 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 33879769  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33879768 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacagga 33879669  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33879668 atctactgaccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33879620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23896616 - 23896369
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  23896616 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacgtccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtactgtt 23896517  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||| || |    
T  23896516 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtttccatctagcaag 23896417  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagca 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896416 aatttactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagca 23896369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 31821827 - 31822077
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31821827 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtagcagctttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31821926  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31821927 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 31822026  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  31822027 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacctg 31822077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34621258 - 34621008
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34621258 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 34621159  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34621158 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 34621059  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34621058 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 34621008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2515802 - 2515554
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2515802 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtca 2515703  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2515702 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagaa 2515603  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2515602 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 2515554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 15754272 - 15754520
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15754272 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtagcaactttcttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 15754371  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15754372 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccgtctaacagga 15754471  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15754472 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 15754520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30156770 - 30156523
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30156770 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 30156671  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30156670 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaa 30156571  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30156570 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30156523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 37759723 - 37759475
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37759723 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 37759624  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759623 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 37759524  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  37759523 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttgtaagcacc 37759475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5642527 - 5642280
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5642527 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 5642428  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5642427 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatattcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtatagaatatctccatctaacaggaa 5642328  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  5642327 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaggcacc 5642280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33521119 - 33520872
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33521119 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 33521020  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33521019 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 33520920  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33520919 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 33520872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31436204 - 31435954
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31436204 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31436105  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31436104 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctcaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 31436005  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31436004 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 31435954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 37666906 - 37667154
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37666906 ctggtagcaatcatgctccttagtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttacttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 37667005  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37667006 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacagga 37667105  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  37667106 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 37667154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 32591695 - 32591942
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32591695 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 32591794  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32591795 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaa 32591894  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  32591895 tctactggccaatcttctcaaggttttcttgtcttgtttggaagcacc 32591942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Original strand, 37354063 - 37354310
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37354063 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 37354162  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37354163 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 37354262  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37354263 atctaccggccaattttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 37354310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24974569 - 24974396
Alignment:
Q  87 catgggttccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgta 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24974569 catgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgta 24974470  T
Q  187 cagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24974469 cagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 24974396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Original strand, 37766474 - 37766657
Alignment:
Q  73 agtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcg 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37766474 agtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtca 37766573  T
Q  173 tagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagca 256  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  37766574 tagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagca 37766657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 37747749 - 37747817
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatg 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37747749 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatg 37747817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 19912645 - 19912896
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19912645 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 19912744  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19912745 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 19912844  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19912845 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacctg 19912896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16287685 - 16287437
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16287685 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 16287586  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16287585 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 16287486  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16287485 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtc-ttgttggaagcacc 16287437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22137643 - 22137394
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22137643 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 22137544  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22137543 atgtatatcatgcattaactgctccgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 22137444  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137443 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 22137394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19692831 - 19692582
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19692831 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 19692732  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19692731 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 19692632  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19692631 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 19692582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 2132743 - 2132992
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2132743 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaataacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 2132842  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2132843 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 2132942  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2132943 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2132992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18795437 - 18795188
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18795437 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 18795338  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18795337 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 18795238  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18795237 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18795188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 19656824 - 19657073
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19656824 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaataacttccttgacatagtatgccctatagcatgggtcccgaaggtaccgtc 19656923  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656924 atgtacatcatgcattaactgcttcgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 19657023  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657024 aatctactggccaatcttcttagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 19657073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 27604388 - 27604637
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27604388 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccttgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27604487  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604488 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 27604587  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27604588 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27604637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33247103 - 33246854
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33247103 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacagcttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 33247004  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33247003 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 33246904  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  33246903 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 33246854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18714217 - 18713968
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18714217 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccaaaggtaccgtc 18714118  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18714117 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatg 18714018  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18714017 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18713968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44565717 - 44565468
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44565717 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 44565618  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44565617 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 44565518  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  44565517 aatctactggccaatattctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 44565468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9359356 - 9359109
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9359356 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 9359257  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9359256 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 9359157  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  9359156 tttactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaaacacc 9359109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Original strand, 19203847 - 19204129
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19203847 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 19203946  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19203947 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 19204046  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||  || ||||  |||||| |||| || |||||||    
T  19204047 tctaccggccaatctcctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 19204129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 28357437 - 28357684
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28357437 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcat 28357536  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357537 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 28357636  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28357637 tctgccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28357684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Original strand, 21343657 - 21343903
Alignment:
Q  12 ggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatg 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21343657 ggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatg 21343756  T
Q  112 tacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaat 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343757 tacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaaaaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaat 21343856  T
Q  212 ctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21343857 ctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 21343903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Original strand, 22076410 - 22076692
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22076410 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaaccggctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 22076509  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  22076510 gtacgtcatgcattaattgctctgcctcatgctcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaacaagaa 22076609  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| |||| || |||||||    
T  22076610 cctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacccggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 22076692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33263466 - 33263218
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33263466 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 33263367  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33263366 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaacatctccatctaacagga 33263267  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33263266 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33263218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14562357 - 14562106
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  14562357 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacagcttccttgacatagtatgtcctgtagcaggggtcccgaaggtactgtc 14562258  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14562257 atgtacatcaggcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatg 14562158  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14562157 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaggcacctg 14562106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15772306 - 15772058
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15772306 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 15772207  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15772206 tgtacatcatgcattaactactctgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctagcagga 15772107  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15772106 atctattggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 15772058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Original strand, 12088207 - 12088454
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12088207 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 12088306  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12088307 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 12088406  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12088407 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 12088454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19679180 - 19678929
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19679180 gctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 19679081  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19679080 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 19678981  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19678980 aatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 19678929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 31485354 - 31485605
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31485354 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaacttcctcgacatagtatgccctatagcatgggtcccgaaggtaccgtc 31485453  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31485454 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 31485553  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  31485554 aatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 31485605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29834057 - 29833809
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29834057 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcagctttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 29833958  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29833957 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 29833858  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  29833857 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 29833809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31359260 - 31359012
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31359260 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31359161  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359160 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 31359061  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  31359060 atctaccggccaatcttctcagggttttcttatcttgtttggaagcacc 31359012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 16513837 - 16514088
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16513837 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 16513936  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16513937 atgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 16514036  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16514037 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 16514088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 2105571 - 2105819
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2105571 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 2105670  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2105671 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 2105770  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2105771 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16046046 - 16045773
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16046046 gctggtagcaatcatgctctatggtcatccagtagtaacccgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 16045947  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16045946 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccctctagcagg 16045847  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaa 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||    
T  16045846 aatttactggccaatcttctcagggttttcttgtctttgttggaagcacccggtggatacttacggcttagcaa 16045773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 11420186 - 11420435
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11420186 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 11420285  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11420286 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 11420385  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  11420386 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11420435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 16445413 - 16445662
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16445413 gctggtagcaatcatgctccatggtcatctagtagtaacctgctcgtaacaacttccatgacatagtatgccctgtagcatggctcccgaaggtaccgtc 16445512  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16445513 atgtacgtcatgcattaactgctccgcttcgtgttcaccaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacataatatctccatctaacagg 16445612  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16445613 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagcacc 16445662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 26533280 - 26533529
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26533280 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtc 26533379  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26533380 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 26533479  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26533480 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26533529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 4140654 - 4140902
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4140654 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4140753  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4140754 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 4140853  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4140854 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4140902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 24587942 - 24588190
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24587942 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 24588041  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588042 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 24588141  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  24588142 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 24588190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 26511105 - 26511352
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26511105 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 26511204  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26511205 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 26511304  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26511305 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26511352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 39208548 - 39208795
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39208548 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 39208647  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39208648 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 39208747  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  39208748 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 39208795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2159305 - 2159056
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2159305 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacttgctcgtaacaatttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 2159206  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2159205 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 2159106  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2159105 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2159056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4204120 - 4203871
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4204120 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 4204021  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4204020 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 4203921  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4203920 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 4203871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45736038 - 45735789
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45736038 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 45735939  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45735938 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaatactatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 45735839  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45735838 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 45735789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2777985 - 2777736
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2777985 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtc 2777886  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2777885 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtagagaatatctccatctaacagg 2777786  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2777785 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2777736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3450037 - 3449788
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3450037 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 3449938  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3449937 atgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagg 3449838  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3449837 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 3449788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5163114 - 5162865
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5163114 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcctgaaggtaccgtc 5163015  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5163014 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 5162915  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  5162914 aatctactggtcaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5162865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 10912276 - 10912525
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10912276 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 10912375  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10912376 atgtacatcatgcatcaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 10912475  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10912476 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 10912525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26517521 - 26517274
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26517521 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 26517422  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26517421 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatttctccatctaacaggaa 26517322  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  26517321 tctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26517274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 26665323 - 26665570
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26665323 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 26665422  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665423 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 26665522  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26665523 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26665570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 26680515 - 26680762
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26680515 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtaataacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 26680614  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680615 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 26680714  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26680715 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26680762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11445617 - 11445367
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11445617 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 11445518  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11445517 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 11445418  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11445417 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 11445367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 26270493 - 26270742
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26270493 gctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 26270592  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26270593 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaga 26270692  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26270693 aatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26270742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31128637 - 31128389
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31128637 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacatgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31128538  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128537 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 31128438  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31128437 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31128389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45391950 - 45391700
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45391950 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 45391851  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45391850 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 45391751  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  45391750 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 45391700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 5142748 - 5142996
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5142748 ctggtagcaatcgtgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 5142847  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5142848 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacagga 5142947  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  5142948 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcctgtttggaagcacc 5142996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 26315256 - 26315504
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26315256 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 26315355  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26315356 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaa 26315455  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26315456 atctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26315504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26439987 - 26439739
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26439987 ctggtagcaatcgtgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 26439888  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26439887 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatattcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 26439788  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26439787 atctaccggccaatctcctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26439739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Original strand, 31086034 - 31086278
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31086034 tagcaatcatgctccatgcccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgta 31086133  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  31086134 catcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaaccggaacct 31086233  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31086234 actggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31086278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5132698 - 5132478
Alignment:
Q  38 cagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5132698 cagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgctt 5132599  T
Q  138 caggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtctt 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5132598 catgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacataatatctccatctaacaagaatctactggccaatcttctcagggtctt 5132499  T
Q  238 cttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||| ||||  |||||||||||    
T  5132498 cttatcttgtttggaagcacc 5132478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 31559798 - 31560046
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31559798 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 31559897  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31559898 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacagga 31559997  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  31559998 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 31560046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10846349 - 10846102
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10846349 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 10846250  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |||    
T  10846249 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaatacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaa 10846150  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10846149 cctactagccaatcttcttagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 10846102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 16746925 - 16747173
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16746925 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 16747024  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16747025 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaataataccatgtcatagttcctcttatacagaatatctccgtctaacagga 16747124  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16747125 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16747173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 5152815 - 5152782
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagta 42  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5152815 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagta 5152782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10770 - 10521
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10770 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccaaaggtaccgtc 10671  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10670 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 10571  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10570 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 17067
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17315 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 17216  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17215 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 17116  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17115 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 17067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Original strand, 34184482 - 34184733
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34184482 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 34184581  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34184582 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcacgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 34184681  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34184682 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 34184733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15232561 - 15232279
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15232561 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctactcgtaacaacttccttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 15232462  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15232461 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaa 15232362  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| |||| || |||||||    
T  15232361 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacccggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 15232279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14669760 - 14669511
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14669760 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 14669661  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14669660 atgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 14669561  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14669560 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 14669511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 20333943 - 20334192
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20333943 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 20334042  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20334043 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 20334142  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20334143 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 20334192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 40101160 - 40101408
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40101160 ctggtagcaatcatgctccatggccatccaatagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 40101259  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40101260 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 40101359  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40101360 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 40101408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 33669324 - 33669571
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33669324 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 33669423  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33669424 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 33669523  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33669524 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 33669571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 24587883 - 24588132
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24587883 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 24587982  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24587983 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagg 24588082  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  24588083 aatctactggccaatcttctcagggccttcttatcttgtttggaagcacc 24588132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 36340039 - 36340288
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36340039 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 36340138  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  36340139 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacagg 36340238  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  36340239 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 36340288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17017788 - 17017544
Alignment:
Q  14 tagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgta 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17017788 tagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgta 17017689  T
Q  114 cgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 213  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017688 catcatgcattaactactctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatct 17017589  T
Q  214 actggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  17017588 actggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 17017544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 18312701 - 18312949
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18312701 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18312800  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312801 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 18312900  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18312901 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18312949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54838136 - 54837889
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54838136 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 54838037  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54838036 gtacatcatgcattaactgttctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaa 54837937  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  54837936 tctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 54837889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30758507 - 30758258
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30758507 gctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatc 30758408  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  30758407 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaaccgg 30758308  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  30758307 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30758258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6574604 - 6574356
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6574604 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 6574505  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574504 tgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 6574405  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6574404 atctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 6574356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 18796137 - 18796385
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18796137 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtatcctgctcgtaacaacttcctcgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 18796236  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796237 tgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcgtagttccttttgtacagaatatctccatctaacagga 18796336  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18796337 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18796385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24117408 - 24117160
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24117408 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 24117309  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24117308 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacagga 24117209  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||    
T  24117208 atctactggccaatcttctcaaagtcctcttgtcttgtttggaagcacc 24117160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39855382 - 39855135
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39855382 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtggcatgggtcccgaaggtaccgtcat 39855283  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39855282 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 39855183  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39855182 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 39855135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5699280 - 5699031
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5699280 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 5699181  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5699180 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 5699081  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  5699080 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 5699031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5010621 - 5010373
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5010621 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtggcatgggtcccgaaggtaccgtca 5010522  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5010521 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctatcagga 5010422  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  5010421 atctgctggccaatcttctcagagtcttcttgtcttgtttggaagcacc 5010373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 14755015 - 14755263
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14755015 ctggtagcaatcatgctccatggccatccaatagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 14755114  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14755115 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 14755214  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14755215 atctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 14755263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14103288 - 14103041
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14103288 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcat 14103189  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103188 gtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 14103089  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  14103088 tctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 14103041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 15381757 - 15382023
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15381757 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaaccggctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcacgaaggtaccgtcat 15381856  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||    
T  15381857 gtacgtcatgcattaattgctctgcctcatgctcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaaaaagaa 15381956  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggctt 277  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  15381957 cctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacctggtggatactcacggctt 15382023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1905001 - 1904752
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1905001 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgtaacaacttccttcacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 1904902  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |    
T  1904901 atgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgctcatcaacacatcttaacaataccatgttgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataag 1904802  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1904801 aacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 1904752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Original strand, 27158839 - 27159088
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27158839 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 27158938  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27158939 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacagg 27159038  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27159039 aatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27159088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21974446 - 21974199
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21974446 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 21974347  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21974346 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 21974247  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21974246 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 21974199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 31122036 - 31122283
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31122036 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 31122135  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31122136 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttagcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 31122235  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31122236 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31122283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 15278151 - 15278398
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  15278151 tggtagcaatcatgctccacggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcctgaaggtaccgtcat 15278250  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |||    
T  15278251 gtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgttgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaa 15278350  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15278351 cctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 15278398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14303 - 14056
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14303 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgctcgtaacaacttctttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 14204  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14203 gtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 14104  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14103 tctgctggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 14056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4801 - 4550
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4801 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaccctgcccgtaacagcttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 4702  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagg 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  4701 atgtacatcatgcatcaactgctccgctttatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatg 4602  T
Q  209 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4601 aatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 4550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 10451 - 10701
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10451 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 10550  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10551 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 10650  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  10651 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacctg 10701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 258
Target Start/End: Original strand, 21714 - 21962
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21714 ctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 21813  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21814 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 21913  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  21914 atctaccggtcaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 21962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 391 - 141
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  391 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 292  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  291 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 192  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  191 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctg 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10777 - 10530
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  10777 tggtagcaatcatgctccatggtcctccagtagtaacctgctcgtaacaactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaagtaccgtcgt 10678  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  10677 gtacgtcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttatacagaatatctccatctaacaagaa 10578  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10577 cctactagccaatcttctcagagtcttcttgtcttagttggaagcacc 10530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12682 - 12435
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12682 ctggtagcaatcatgctccatagtcatccagtagtaacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 12583  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12582 tgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagga 12483  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcac 257  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12482 atctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 12435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23848 - 23566
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23848 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaaccggctcgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaagtaccgtcat 23749  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  23748 gtacgtcatgcattaattgctctgcctcatgctcatcaacacatcttaacaataccatgttgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaacaagaa 23649  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctgatgggtatttacggcttcgcaaaaattgcttga 293  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| |||| || |||||||    
T  23648 cctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacccggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 23566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10755 - 10507
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10755 tggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 10656  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatctt-aacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaaataataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 10556  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  10555 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 10507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 4702 - 4952
Alignment:
Q  10 ctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4702 ctggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtca 4801  T
Q  110 tgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacagga 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4802 tgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacagga 4901  T
Q  210 atctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  4902 atctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacctg 4952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24305 - 24056
Alignment:
Q  11 tggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcat 110  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24305 tggtagcaatcatgctccatagccatccagtaataacctgcccgtagcaactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcat 24206  T
Q  111 gtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaa 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24205 gtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaa 24106  T
Q  211 tctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  24105 tctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacctg 24056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Original strand, 11774 - 11944
Alignment:
Q  88 atgggttccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaacaataccatgtcgtagtttcttttgtac 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  11774 atgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtac 11873  T
Q  188 agaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11874 agaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 11944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 258
Target Start/End: Original strand, 9712 - 9788
Alignment:
Q  182 ttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9712 ttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 9788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 11112 - 11262
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11112 gctggtagcaatcatgctccatggccatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtc 11211  T
Q  109 atgtacgtcatgcattaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaa 159  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11212 atgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaa 11262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Original strand, 42294 - 42454
Alignment:
Q  102 taccgtcatgtacgtcatgca-ttaactgctctgcttcaggttcatcaacacatcttaa-caataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctcca 199  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42294 taccgtcatgtacatcatgcaattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaaacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctcca 42393  T
Q  200 tctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacctg 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42394 tctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 42454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Original strand, 26421 - 26499
Alignment:
Q  9 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgctcgcaacaacttccttgacatagtatgccctgtagc 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26421 gctggtagcaatcatgctccatggtcatccagtagtaacctgcccgtaacaacttccttgacatagtatgccctgtagc 26499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University