View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145A_low_674 (Length: 222)

Name: NF10145A_low_674
Description: NF10145A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145A_low_674
NF10145A_low_674
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (1-222)||(27187720-27187941)
chr6 (1-222)||(27261299-27261520)
chr6 (1-210)||(2874591-2874800)
chr6 (1-222)||(25112836-25113057)
chr6 (1-222)||(1542860-1543081)
chr6 (1-210)||(17032667-17032876)
chr6 (1-222)||(24312944-24313165)
chr6 (1-222)||(16626493-16626714)
chr6 (1-210)||(28262985-28263194)
chr6 (1-222)||(28292148-28292369)
chr6 (1-210)||(28341734-28341943)
chr6 (1-222)||(29591696-29591917)
chr6 (1-222)||(5838995-5839216)
chr6 (1-222)||(19864971-19865192)
chr6 (1-219)||(25609640-25609858)
chr6 (1-222)||(18407718-18407939)
chr6 (1-222)||(27331209-27331430)
chr6 (1-222)||(27391949-27392170)
chr6 (1-210)||(22078478-22078687)
chr6 (1-219)||(22434153-22434371)
chr6 (1-222)||(16927416-16927637)
chr6 (1-222)||(22762231-22762452)
chr6 (1-222)||(23078753-23078974)
chr6 (1-210)||(16963155-16963364)
chr6 (6-222)||(15896383-15896599)
chr6 (1-222)||(25768475-25768696)
chr6 (2-222)||(19879583-19879803)
chr6 (2-157)||(1641057-1641212)
chr6 (5-222)||(34645362-34645579)
chr6 (2-222)||(14381243-14381463)
chr6 (2-222)||(17415771-17415991)
chr6 (2-222)||(19453705-19453925)
chr6 (2-222)||(21563908-21564128)
chr6 (3-222)||(21569767-21569986)
chr6 (1-222)||(21471885-21472106)
chr6 (2-222)||(5296982-5297201)
chr6 (2-222)||(22796408-22796628)
chr6 (2-219)||(24364697-24364914)
chr6 (116-222)||(21836973-21837079)
chr6 (69-222)||(8762709-8762862)
chr6 (2-222)||(11280281-11280501)
chr6 (131-222)||(20637077-20637168)
chr6 (2-221)||(27559765-27559984)
chr6 (2-221)||(27560394-27560613)
chr6 (2-221)||(28282590-28282809)
chr6 (116-222)||(18197504-18197610)
chr6 (2-222)||(18794975-18795195)
chr6 (1-219)||(15459620-15459838)
chr6 (2-222)||(10468625-10468845)
chr6 (160-219)||(22442710-22442769)
chr6 (20-210)||(16382161-16382351)
chr6 (40-210)||(23996571-23996741)
chr6 (20-210)||(18837696-18837886)
chr6 (107-192)||(23027522-23027607)
chr6 (83-210)||(16098416-16098543)
chr6 (89-210)||(21927577-21927698)
chr6 (90-210)||(1648602-1648722)
chr6 (20-168)||(14625068-14625216)
chr6 (68-210)||(25742876-25743018)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-222)||(10868901-10869122)
chr2 (1-222)||(9610187-9610408)
chr2 (1-222)||(16999051-16999272)
chr2 (1-222)||(16982203-16982424)
chr2 (1-222)||(17063768-17063989)
chr2 (1-222)||(17067426-17067647)
chr2 (1-222)||(44385740-44385961)
chr2 (1-222)||(23189058-23189279)
chr2 (1-222)||(24710084-24710305)
chr2 (1-222)||(27218067-27218288)
chr2 (1-222)||(27371320-27371541)
chr2 (1-222)||(41608556-41608777)
chr2 (1-222)||(24262421-24262642)
chr2 (1-222)||(22325027-22325248)
chr2 (1-222)||(21325437-21325658)
chr2 (1-222)||(24675540-24675761)
chr2 (1-210)||(24707665-24707874)
chr2 (1-222)||(22756636-22756857)
chr2 (1-222)||(30211088-30211309)
chr2 (1-219)||(23064128-23064346)
chr2 (5-222)||(21145212-21145418)
chr2 (1-222)||(45529562-45529783)
chr2 (69-222)||(16925479-16925632)
chr2 (71-222)||(16923010-16923161)
chr2 (76-222)||(20442684-20442830)
chr2 (1-203)||(24825472-24825674)
chr2 (64-222)||(24876920-24877078)
chr2 (2-222)||(27365250-27365470)
chr2 (2-222)||(23294010-23294230)
chr2 (2-222)||(19652223-19652443)
chr2 (41-219)||(21125331-21125509)
chr2 (2-219)||(20828311-20828528)
chr2 (2-219)||(20833037-20833254)
chr2 (1-222)||(23276827-23277048)
chr2 (2-222)||(24948641-24948861)
chr2 (2-219)||(31830710-31830927)
chr2 (2-221)||(12574405-12574624)
chr2 (2-221)||(27787793-27788012)
chr2 (2-210)||(11358057-11358265)
chr2 (2-219)||(1063803-1064020)
chr2 (134-222)||(23107901-23107989)
chr2 (107-222)||(23110892-23111007)
chr2 (68-222)||(24641860-24642014)
chr2 (1-68)||(16925311-16925378)
chr2 (1-69)||(24878319-24878387)
chr2 (2-111)||(23087502-23087611)
chr2 (61-210)||(25128758-25128907)
chr2 (20-210)||(24569851-24570041)
chr2 (20-210)||(22276349-22276538)
chr2 (79-155)||(23817291-23817367)
chr2 (68-210)||(22761752-22761894)
chr2 (40-210)||(24831370-24831540)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-222)||(15589262-15589483)
chr3 (1-222)||(20061924-20062145)
chr3 (1-222)||(16635812-16636033)
chr3 (1-222)||(43163136-43163357)
chr3 (1-222)||(53384888-53385109)
chr3 (1-222)||(10005639-10005860)
chr3 (1-222)||(10906249-10906470)
chr3 (1-222)||(16756455-16756676)
chr3 (1-222)||(48425486-48425707)
chr3 (1-222)||(12498287-12498508)
chr3 (1-210)||(14876381-14876590)
chr3 (1-210)||(15348127-15348336)
chr3 (1-212)||(16806806-16807017)
chr3 (1-222)||(16371452-16371673)
chr3 (1-222)||(13252729-13252950)
chr3 (1-210)||(5424812-5425021)
chr3 (1-222)||(14126464-14126685)
chr3 (1-222)||(15061795-15062016)
chr3 (1-210)||(15724816-15725025)
chr3 (1-222)||(11564551-11564772)
chr3 (1-222)||(15402380-15402601)
chr3 (1-222)||(16412152-16412373)
chr3 (1-222)||(26792269-26792490)
chr3 (1-222)||(15339308-15339529)
chr3 (1-210)||(16692199-16692412)
chr3 (1-222)||(9522758-9522979)
chr3 (1-222)||(6600786-6600996)
chr3 (1-222)||(17489889-17490110)
chr3 (1-222)||(16492051-16492272)
chr3 (1-222)||(15248186-15248407)
chr3 (1-222)||(15208930-15209151)
chr3 (2-222)||(15227699-15227919)
chr3 (1-214)||(15015634-15015835)
chr3 (2-222)||(13971979-13972199)
chr3 (2-222)||(14086723-14086943)
chr3 (2-222)||(15952827-15953047)
chr3 (1-222)||(14573978-14574199)
chr3 (2-222)||(11303632-11303852)
chr3 (1-222)||(12850138-12850359)
chr3 (2-219)||(28754368-28754585)
chr3 (2-222)||(13322511-13322731)
chr3 (2-222)||(17492680-17492900)
chr3 (2-221)||(16836370-16836589)
chr3 (2-221)||(44777297-44777516)
chr3 (2-219)||(13942074-13942291)
chr3 (2-221)||(8758942-8759161)
chr3 (2-221)||(41177572-41177791)
chr3 (2-219)||(47123994-47124211)
chr3 (2-222)||(12360401-12360621)
chr3 (68-222)||(16828061-16828215)
chr3 (2-219)||(10384019-10384235)
chr3 (6-221)||(16380788-16381003)
chr3 (2-216)||(4678488-4678702)
chr3 (1-219)||(10419907-10420125)
chr3 (2-212)||(18134215-18134425)
chr3 (2-222)||(16329520-16329738)
chr3 (2-222)||(16338371-16338591)
chr3 (2-123)||(11960992-11961113)
chr3 (1-114)||(13001958-13002070)
chr3 (2-126)||(26008948-26009072)
chr3 (20-209)||(15576818-15577007)
chr3 (20-210)||(8274281-8274471)
chr3 (61-210)||(16742585-16742734)
chr3 (20-203)||(18748733-18748916)
chr3 (61-210)||(6152733-6152882)
chr3 (40-210)||(13967222-13967392)
chr3 (83-177)||(17193224-17193318)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-222)||(8199037-8199258)
chr7 (1-222)||(10871404-10871625)
chr7 (1-222)||(44790991-44791212)
chr7 (1-222)||(9596466-9596687)
chr7 (1-210)||(11236865-11237074)
chr7 (2-222)||(16956-17176)
chr7 (1-222)||(13686473-13686694)
chr7 (1-222)||(15160697-15160918)
chr7 (1-222)||(18178151-18178372)
chr7 (1-222)||(18551398-18551619)
chr7 (1-222)||(8708014-8708235)
chr7 (1-222)||(12687910-12688131)
chr7 (1-222)||(14332806-14333027)
chr7 (1-222)||(11552742-11552963)
chr7 (1-210)||(14955029-14955238)
chr7 (1-222)||(15154297-15154518)
chr7 (1-222)||(14040105-14040326)
chr7 (1-222)||(14350135-14350356)
chr7 (1-222)||(15624961-15625182)
chr7 (1-222)||(11771881-11772102)
chr7 (1-222)||(21662370-21662591)
chr7 (2-222)||(12206418-12206638)
chr7 (2-222)||(15102221-15102441)
chr7 (2-219)||(8211749-8211966)
chr7 (2-222)||(16071912-16072132)
chr7 (107-222)||(23203253-23203368)
chr7 (107-222)||(23509380-23509495)
chr7 (1-222)||(14263862-14264083)
chr7 (6-222)||(13021772-13021988)
chr7 (2-219)||(11305884-11306101)
chr7 (2-222)||(6413922-6414142)
chr7 (2-222)||(11388046-11388266)
chr7 (2-222)||(14285994-14286214)
chr7 (2-221)||(18053572-18053791)
chr7 (2-219)||(49152712-49152929)
chr7 (2-222)||(1025-1245)
chr7 (2-222)||(13665948-13666168)
chr7 (2-221)||(14130284-14130503)
chr7 (20-222)||(16950089-16950291)
chr7 (2-221)||(14434102-14434321)
chr7 (2-219)||(23505491-23505708)
chr7 (2-222)||(12456113-12456333)
chr7 (1-111)||(23516520-23516630)
chr7 (2-222)||(19147622-19147842)
chr7 (2-222)||(20747021-20747241)
chr7 (2-219)||(13968289-13968506)
chr7 (1-102)||(15204288-15204389)
chr7 (2-221)||(15340842-15341061)
chr7 (2-219)||(26118226-26118443)
chr7 (2-165)||(23199418-23199581)
chr7 (20-210)||(4440356-4440546)
chr7 (21-210)||(21674185-21674374)
chr7 (40-210)||(14936795-14936965)
chr7 (40-210)||(15364388-15364558)
chr7 (1-66)||(35964646-35964711)
chr7 (2-110)||(12457190-12457298)
chr7 (20-210)||(7824328-7824518)
chr7 (20-210)||(27107426-27107616)
chr7 (89-210)||(17924148-17924269)
chr7 (95-203)||(23641951-23642059)
chr7 (40-168)||(45147003-45147131)
chr7 (62-184)||(15171642-15171764)
chr7 (139-218)||(40790-40869)
chr7 (128-186)||(17144936-17144994)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (1-222)||(34566846-34567067)
chr5 (1-222)||(16356854-16357075)
chr5 (1-222)||(37291309-37291530)
chr5 (1-222)||(19770312-19770533)
chr5 (1-210)||(22332712-22332921)
chr5 (1-222)||(27518759-27518980)
chr5 (1-222)||(27685213-27685434)
chr5 (1-222)||(27668303-27668524)
chr5 (1-210)||(40709132-40709341)
chr5 (1-210)||(22135020-22135229)
chr5 (1-210)||(29475898-29476107)
chr5 (1-212)||(18776122-18776333)
chr5 (1-222)||(14999552-14999773)
chr5 (1-222)||(27610706-27610927)
chr5 (1-222)||(41771194-41771415)
chr5 (1-222)||(22348775-22348996)
chr5 (1-210)||(23516893-23517102)
chr5 (1-222)||(23574094-23574315)
chr5 (1-203)||(20799112-20799314)
chr5 (1-222)||(21339099-21339320)
chr5 (1-190)||(23440577-23440766)
chr5 (1-219)||(25423541-25423759)
chr5 (1-222)||(21497850-21498070)
chr5 (1-222)||(20467909-20468130)
chr5 (1-222)||(23471581-23471802)
chr5 (1-222)||(21563786-21564007)
chr5 (2-222)||(22235733-22235953)
chr5 (1-222)||(26738540-26738739)
chr5 (2-219)||(14886807-14887024)
chr5 (2-219)||(24716342-24716559)
chr5 (2-219)||(22503014-22503231)
chr5 (2-219)||(24620111-24620328)
chr5 (6-222)||(21890572-21890788)
chr5 (2-219)||(24749370-24749587)
chr5 (76-222)||(21831574-21831720)
chr5 (2-222)||(22381534-22381754)
chr5 (2-219)||(25848410-25848627)
chr5 (2-219)||(20342617-20342834)
chr5 (1-222)||(20821787-20822008)
chr5 (1-222)||(28916226-28916447)
chr5 (1-222)||(28923581-28923802)
chr5 (2-195)||(37545336-37545529)
chr5 (2-186)||(22462287-22462471)
chr5 (2-222)||(23079902-23080122)
chr5 (1-222)||(21496492-21496713)
chr5 (2-219)||(24798213-24798430)
chr5 (2-144)||(919-1061)
chr5 (108-222)||(21407597-21407711)
chr5 (1-210)||(20774094-20774302)
chr5 (1-112)||(21405174-21405285)
chr5 (1-92)||(21984248-21984339)
chr5 (1-222)||(28894755-28894976)
chr5 (2-221)||(17269148-17269366)
chr5 (62-210)||(25244175-25244323)
chr5 (62-210)||(25308327-25308475)
chr5 (20-210)||(21937013-21937203)
chr5 (40-210)||(27011457-27011627)
chr5 (1-56)||(21831722-21831777)
chr5 (40-210)||(24581584-24581753)
chr5 (62-123)||(16065604-16065665)
chr5 (61-177)||(23503837-23503952)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (1-222)||(8386832-8387053)
chr4 (1-222)||(29038775-29038996)
chr4 (1-222)||(12477020-12477241)
chr4 (1-210)||(14303361-14303570)
chr4 (1-222)||(12524096-12524317)
chr4 (1-222)||(18297625-18297846)
chr4 (1-222)||(27711756-27711977)
chr4 (1-222)||(8052994-8053215)
chr4 (1-222)||(14680987-14681208)
chr4 (1-222)||(19778164-19778385)
chr4 (1-222)||(40473460-40473681)
chr4 (1-222)||(16251816-16252037)
chr4 (1-222)||(16354816-16355037)
chr4 (1-222)||(15147255-15147476)
chr4 (12-222)||(23956178-23956388)
chr4 (1-222)||(18226817-18227038)
chr4 (1-222)||(8706338-8706559)
chr4 (1-222)||(1639796-1640017)
chr4 (1-222)||(7090852-7091073)
chr4 (1-222)||(14850737-14850958)
chr4 (32-222)||(14691353-14691543)
chr4 (1-222)||(15414657-15414878)
chr4 (1-124)||(14266368-14266491)
chr4 (1-222)||(15078055-15078276)
chr4 (2-222)||(1648908-1649128)
chr4 (2-222)||(15246345-15246565)
chr4 (2-219)||(3264428-3264645)
chr4 (2-219)||(29453171-29453388)
chr4 (2-222)||(15002995-15003215)
chr4 (81-222)||(14159970-14160111)
chr4 (71-222)||(15319641-15319792)
chr4 (2-219)||(11206865-11207082)
chr4 (69-222)||(33223411-33223564)
chr4 (2-222)||(15358721-15358941)
chr4 (2-222)||(27900807-27901027)
chr4 (3-219)||(44661500-44661716)
chr4 (2-222)||(20891403-20891623)
chr4 (2-126)||(16146333-16146459)
chr4 (20-210)||(14997755-14997945)
chr4 (40-168)||(13248104-13248232)
chr4 (79-219)||(18549694-18549834)
chr4 (68-210)||(9291322-9291464)
chr4 (83-122)||(15423974-15424013)
chr4 (20-168)||(12342548-12342696)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-222)||(865-1086)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-222)||(14811-15032)
scaffold0044 (1-210)||(1071-1280)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-222)||(109445-109666)
scaffold0029 (1-222)||(95636-95857)
scaffold0029 (2-222)||(113011-113231)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-222)||(16350302-16350523)
chr1 (1-222)||(19106802-19107023)
chr1 (1-222)||(51333196-51333417)
chr1 (1-222)||(21837385-21837606)
chr1 (1-222)||(33390732-33390953)
chr1 (1-222)||(17044718-17044939)
chr1 (1-210)||(21830738-21830947)
chr1 (1-222)||(21749376-21749597)
chr1 (1-200)||(16078377-16078576)
chr1 (1-192)||(41354202-41354393)
chr1 (1-222)||(16369732-16369953)
chr1 (1-210)||(50619959-50620168)
chr1 (2-222)||(22361947-22362167)
chr1 (1-222)||(19760569-19760790)
chr1 (2-222)||(24099306-24099526)
chr1 (2-219)||(19854749-19854966)
chr1 (2-219)||(37677516-37677733)
chr1 (2-218)||(20939770-20939986)
chr1 (2-222)||(22432819-22433039)
chr1 (68-222)||(19662844-19662998)
chr1 (2-219)||(31539703-31539920)
chr1 (97-222)||(20139361-20139486)
chr1 (2-210)||(20856476-20856684)
chr1 (2-152)||(41308261-41308411)
chr1 (2-222)||(20835591-20835811)
chr1 (1-104)||(20137213-20137316)
chr1 (2-219)||(20294848-20295065)
chr1 (140-210)||(20250376-20250446)
chr1 (1-94)||(20250285-20250378)
chr1 (20-210)||(20831107-20831297)
chr1 (61-210)||(22135272-22135421)
chr1 (185-222)||(41353365-41353402)
chr1 (68-210)||(20914712-20914854)
chr1 (68-177)||(20184683-20184792)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-222)||(17892-18113)
scaffold0106 (1-222)||(14490-14711)
scaffold0106 (2-222)||(31862-32082)
scaffold0106 (154-222)||(18489-18557)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-222)||(19113176-19113397)
chr8 (1-222)||(30313218-30313439)
chr8 (1-222)||(17674097-17674318)
chr8 (1-210)||(18857063-18857272)
chr8 (1-210)||(22133127-22133336)
chr8 (1-212)||(15533866-15534077)
chr8 (1-210)||(16408131-16408340)
chr8 (1-222)||(32600630-32600851)
chr8 (1-210)||(21166624-21166832)
chr8 (1-222)||(22046859-22047080)
chr8 (1-210)||(22120260-22120469)
chr8 (1-222)||(21921809-21922030)
chr8 (1-222)||(22040345-22040566)
chr8 (1-210)||(22164278-22164486)
chr8 (1-192)||(19484974-19485165)
chr8 (1-222)||(19978453-19978674)
chr8 (1-181)||(20017865-20018045)
chr8 (1-222)||(21251427-21251648)
chr8 (1-222)||(23650527-23650748)
chr8 (1-222)||(22377528-22377749)
chr8 (1-222)||(22383703-22383924)
chr8 (1-222)||(21393939-21394160)
chr8 (1-222)||(21788433-21788654)
chr8 (1-210)||(20388585-20388794)
chr8 (1-220)||(23949405-23949624)
chr8 (1-222)||(22987687-22987903)
chr8 (1-222)||(20396199-20396420)
chr8 (2-222)||(31416548-31416768)
chr8 (2-222)||(20975725-20975945)
chr8 (2-219)||(14565629-14565846)
chr8 (2-219)||(16271301-16271518)
chr8 (2-222)||(1266725-1266945)
chr8 (2-221)||(22051350-22051569)
chr8 (2-219)||(803750-803967)
chr8 (2-219)||(12305245-12305462)
chr8 (1-210)||(19851897-19852106)
chr8 (1-210)||(19857933-19858142)
chr8 (2-219)||(27355035-27355252)
chr8 (2-222)||(23655414-23655634)
chr8 (2-219)||(6604145-6604362)
chr8 (2-219)||(6679598-6679815)
chr8 (2-222)||(22061507-22061727)
chr8 (2-222)||(22371427-22371647)
chr8 (1-222)||(21840903-21841124)
chr8 (5-222)||(29303500-29303717)
chr8 (1-222)||(20009974-20010195)
chr8 (2-221)||(31570917-31571136)
chr8 (104-210)||(22129026-22129132)
chr8 (20-210)||(21850423-21850613)
chr8 (20-210)||(16877181-16877371)
chr8 (61-210)||(23900822-23900971)
chr8 (31-210)||(23157098-23157277)
chr8 (20-210)||(21196588-21196778)
chr8 (68-210)||(22315744-22315886)
chr8 (185-222)||(19484138-19484175)
chr8 (98-219)||(19863639-19863760)
chr8 (98-219)||(19868276-19868397)
chr8 (40-210)||(22982959-22983128)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-210)||(4051-4260)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (5-222)||(12942-13159)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-210)||(9047-9256)
scaffold0109 (1-210)||(33219-33428)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-222)||(8241-8462)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-222)||(43605-43826)
scaffold0028 (1-222)||(15398-15608)
scaffold0028 (1-222)||(8936-9146)
scaffold0028 (2-222)||(50148-50368)
scaffold0028 (68-203)||(106226-106361)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (1-222)||(4733-4954)
scaffold0761 (20-210)||(32-222)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-210)||(7390-7599)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-222)||(7848-8069)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-222)||(457-678)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (1-222)||(6823-7044)
scaffold0403 (2-217)||(3243-3458)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-222)||(22318-22539)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-222)||(278464-278685)
scaffold0005 (2-221)||(260760-260979)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-212)||(65856-66067)
scaffold0042 (1-210)||(39466-39674)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-222)||(63665-63886)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-222)||(197112-197333)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-222)||(6465-6686)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-222)||(19636-19857)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-222)||(147-368)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (1-210)||(3460-3669)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-222)||(16106-16327)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-222)||(6474-6695)
scaffold0120 (2-222)||(1158-1378)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-222)||(130599-130820)
scaffold0023 (1-222)||(4088-4309)
scaffold0023 (1-222)||(59205-59426)
scaffold0023 (72-222)||(29014-29163)
scaffold0023 (1-36)||(134693-134728)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-222)||(390834-391055)
scaffold0001 (1-222)||(90566-90787)
scaffold0001 (2-165)||(114632-114795)
scaffold0001 (137-222)||(89888-89973)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-222)||(5672-5893)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (12-222)||(49955-50165)
scaffold0081 (69-222)||(19121-19274)
scaffold0081 (128-222)||(34604-34698)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-210)||(6500-6709)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-222)||(7828-8038)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (40-222)||(25464-25646)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-222)||(1127-1348)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-222)||(113121-113342)
scaffold0040 (1-222)||(15328-15549)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-222)||(203102-203323)
scaffold0004 (1-222)||(112472-112693)
scaffold0004 (2-222)||(118020-118240)
scaffold0004 (1-222)||(386270-386491)
scaffold0004 (2-222)||(323156-323376)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-222)||(219051-219272)
scaffold0012 (1-222)||(229494-229715)
scaffold0012 (62-186)||(32667-32791)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-218)||(2372-2589)
scaffold0010 (2-219)||(41970-42187)
scaffold0010 (2-222)||(47033-47253)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-222)||(7963-8183)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-222)||(9421-9642)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (13-222)||(9806-10015)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-222)||(16050-16271)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-222)||(26167-26388)
scaffold0011 (2-222)||(195338-195557)
scaffold0011 (2-218)||(149022-149238)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (31-222)||(80128-80319)
scaffold0022 (1-144)||(126911-127054)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-222)||(14713-14934)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-218)||(4482-4699)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-210)||(24717-24926)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-222)||(328-549)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-222)||(25353-25574)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-222)||(116539-116760)
scaffold0037 (20-147)||(98485-98612)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (4-222)||(5225-5443)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-210)||(1450-1659)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-222)||(18839-19060)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-222)||(1359-1580)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-222)||(32387-32607)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (2-222)||(6871-7091)
scaffold0149 (2-222)||(11302-11522)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-222)||(3591-3812)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-222)||(180668-180871)
scaffold0020 (2-222)||(101186-101406)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (1-222)||(1716-1937)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-222)||(40189-40410)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-222)||(28402-28623)
scaffold0064 (1-222)||(40393-40614)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (2-222)||(2509-2729)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (2-222)||(27677-27897)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-222)||(33311-33531)
scaffold0076 (20-210)||(40728-40918)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (71-222)||(1988-2139)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (90-222)||(2914-3046)
scaffold0894 (1-99)||(1590-1688)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (2-222)||(20435-20655)
scaffold0298 (2-222)||(12995-13215)
scaffold0298 (2-222)||(16765-16985)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (2-222)||(43235-43455)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (2-222)||(249065-249285)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-200)||(12633-12832)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (1-222)||(4326-4547)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-222)||(320-541)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (2-222)||(11221-11441)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-222)||(10244-10465)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-222)||(51497-51718)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (2-222)||(6670-6890)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (2-222)||(47576-47796)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (2-222)||(48841-49061)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (2-222)||(19572-19792)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (68-221)||(844-997)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-222)||(6872-7093)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (1-222)||(18171-18392)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (2-171)||(10425-10594)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (2-222)||(41371-41589)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (2-219)||(16350-16567)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (2-222)||(2246-2466)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (2-222)||(5202-5422)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (2-222)||(6636-6856)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (2-222)||(5086-5306)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (2-222)||(51814-52033)
scaffold0067 (2-222)||(60848-61067)
scaffold0067 (2-222)||(67236-67455)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (2-222)||(13535-13755)
scaffold0034 (2-222)||(4587-4807)
scaffold0034 (77-222)||(67897-68042)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (2-209)||(4945-5152)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (1-222)||(26975-27196)
scaffold0192 (20-222)||(26612-26814)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (1-218)||(787-1004)
scaffold0139 (2-192)||(27971-28161)
scaffold0139 (68-192)||(34290-34414)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-102)||(46679-46780)
scaffold0007 (1-212)||(86154-86359)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (2-210)||(1618-1826)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (2-222)||(43957-44177)
scaffold0114 (2-222)||(44969-45189)
scaffold0114 (2-165)||(20574-20737)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (26-221)||(12420-12615)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (68-222)||(38-192)
scaffold0124 (2-222)||(11340-11560)
scaffold0124 (20-210)||(7456-7646)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (1-146)||(122-267)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (2-219)||(2992-3209)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-222)||(48668-48888)
scaffold0053 (2-162)||(57511-57671)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (2-222)||(21305-21525)
scaffold0235 (40-168)||(26296-26424)
scaffold0235 (149-222)||(11091-11164)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-209)||(37653-37861)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (2-222)||(5969-6191)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (116-222)||(12060-12166)
scaffold0483 (2-157)||(9782-9937)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (4-222)||(4884-5102)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-222)||(549-770)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (2-222)||(980-1200)
scaffold0104 (155-222)||(12582-12649)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (2-210)||(19301-19509)
scaffold0090 (2-210)||(23463-23671)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (2-222)||(3203-3423)
scaffold0035 (98-219)||(12833-12954)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (104-222)||(4425-4543)
scaffold0270 (104-222)||(11555-11673)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (2-222)||(5665-5885)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (2-210)||(25511-25719)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (20-222)||(68225-68427)
scaffold0066 (20-210)||(46624-46814)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (2-222)||(26713-26933)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (68-183)||(17877-17992)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (137-222)||(39645-39730)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (2-210)||(880-1088)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (6-222)||(32953-33169)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (149-222)||(8721-8794)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (95-218)||(81470-81593)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (2-184)||(341-523)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (149-222)||(24097-24170)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (20-210)||(3521-3711)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (61-203)||(11167-11309)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (20-210)||(23864-24054)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (2-113)||(13994-14105)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (68-210)||(5693-5835)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (20-210)||(9507-9697)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (40-210)||(18541-18711)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (61-210)||(7679-7828)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (95-210)||(33059-33174)
scaffold0021 (116-210)||(24529-24623)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (40-210)||(13398-13568)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (83-210)||(700-827)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (31-210)||(3565-3744)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (20-210)||(3629-3818)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (68-210)||(24398-24540)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (83-210)||(14670-14798)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (31-210)||(44019-44198)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (31-210)||(27912-28091)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (149-222)||(2187-2260)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (137-222)||(470-555)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (107-203)||(19-115)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (40-168)||(1112-1240)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 27187720 - 27187941
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27187720 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 27187819  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187820 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 27187919  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  27187920 gaacaccatgcagcttcacaat 27187941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27261520 - 27261299
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27261520 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 27261421  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261420 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 27261321  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  27261320 gaacaccatgcagcttcacaat 27261299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2874800 - 2874591
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874800 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 2874701  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2874700 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 2874601  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  2874600 gaacaccatg 2874591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 25112836 - 25113057
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25112836 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 25112935  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112936 taggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 25113035  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  25113036 gaacaccatgcaacttcacaat 25113057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1543081 - 1542860
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1543081 atgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 1542982  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1542981 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 1542882  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  1542881 gaacaccatgcaacttcacaat 1542860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 17032667 - 17032876
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17032667 atgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatga 17032766  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032767 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 17032866  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  17032867 gaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24313165 - 24312944
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24313165 atgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 24313066  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24313065 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 24312966  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  24312965 gaacaccatgcaacttcacaat 24312944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16626714 - 16626493
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626714 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 16626615  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16626614 tacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 16626515  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16626514 gaacaccatgcaacttcacaat 16626493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28263194 - 28262985
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28263194 atgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatga 28263095  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263094 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 28262995  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  28262994 gaacaccatg 28262985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28292369 - 28292148
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28292369 atgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatga 28292270  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292269 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 28292170  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  28292169 gaacaccatgcagcttcacaat 28292148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28341943 - 28341734
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28341943 atgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatga 28341844  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341843 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 28341744  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  28341743 gaacaccatg 28341734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29591917 - 29591696
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29591917 atgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 29591818  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29591817 tacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 29591718  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  29591717 ggacaccatgcaacttcacaat 29591696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5839216 - 5838995
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839216 atgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 5839117  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5839116 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaag 5839017  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  5839016 gaacaccatgcaacttcacaat 5838995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19864971 - 19865192
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19864971 atgactagcccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatga 19865070  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19865071 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtag 19865170  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19865171 gaacaccatgaaacttcacaat 19865192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25609858 - 25609640
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25609858 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatga 25609759  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25609758 taagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaag 25609659  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  25609658 gaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18407939 - 18407718
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18407939 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatga 18407840  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18407839 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaag 18407740  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  18407739 gaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27331430 - 27331209
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27331430 atgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatga 27331331  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27331330 tacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaa 27331231  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27331230 gaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27392170 - 27391949
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27392170 atgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatga 27392071  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27392070 tacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaa 27391971  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27391970 gaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22078687 - 22078478
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22078687 atgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaatcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatga 22078588  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22078587 tacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaag 22078488  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  22078487 gaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22434153 - 22434371
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22434153 atgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctccgactaatcatctgtctgcggatga 22434252  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434253 tacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 22434352  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  22434353 gaacaccatgcaacttcac 22434371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16927637 - 16927416
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927637 atgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 16927538  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  16927537 tacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaag 16927438  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||| | |||||||||    
T  16927437 gaataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22762452 - 22762231
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  22762452 atgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatga 22762353  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22762352 tacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 22762253  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  22762252 gaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23078753 - 23078974
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23078753 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacga 23078852  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  | || |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078853 tacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 23078952  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  23078953 gaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16963364 - 16963155
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963364 atgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaattctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 16963265  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  16963264 tacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaag 16963165  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  16963164 gaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  6 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  106 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 205  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  206 ccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 25768475 - 25768696
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| |  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25768475 atgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagcaaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatga 25768574  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  25768575 taagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatg 25768674  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  25768675 gaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 19879583 - 19879803
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19879583 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgat 19879682  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19879683 aagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 19879782  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  19879783 aacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Original strand, 1641057 - 1641212
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1641057 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 1641156  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 157  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641157 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34645579 - 34645362
Alignment:
Q  5 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 104  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34645579 ctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataag 34645480  T
Q  105 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 204  Q
    | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34645479 ctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatctgatacaatactcgacggaac 34645380  T
Q  205 accatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||| | |||||||||    
T  34645379 accatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14381463 - 14381243
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14381463 tgactgtcccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 14381364  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  14381363 aagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacgg 14381264  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || |||||||||||||||||    
T  14381263 tactccatgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 17415771 - 17415991
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415771 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgat 17415870  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  17415871 aagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 17415970  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  17415971 tacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 19453705 - 19453925
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453705 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 19453804  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  19453805 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacgg 19453904  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19453905 tacaccatgtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21564128 - 21563908
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564128 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 21564029  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |    
T  21564028 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccg 21563929  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  21563928 tacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  3 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 102  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  103 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 202  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  203 acaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21471885 - 21472106
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  || |||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21471885 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtcctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatga 21471984  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  21471985 taagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatg 21472084  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  21472085 gaactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5297201 - 5296982
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5297201 tgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 5297103  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  5297102 aagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 5297003  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5297002 aactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22796628 - 22796408
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  22796628 tgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgat 22796529  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  22796528 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 22796429  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  22796428 aactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 24364697 - 24364914
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24364697 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 24364796  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  24364797 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacgg 24364896  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  24364897 aacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836973
Alignment:
Q  116 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  216 tcacaat 222  Q
    |||||||    
T  21836979 tcacaat 21836973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  69 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  169 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11280501 - 11280281
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11280501 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggt 11280402  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  11280401 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgt 11280302  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    || |||||| | |||||||||    
T  11280301 aataccatgcaacttcacaat 11280281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  131 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27559984 - 27559765
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27559984 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27559885  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27559884 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 27559785  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27559784 aactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27560613 - 27560394
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27560613 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27560514  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27560513 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 27560414  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27560413 aactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28282809 - 28282590
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28282809 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 28282710  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  28282709 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 28282610  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  28282609 aactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  116 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  216 tcacaat 222  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 18794975 - 18795195
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  18794975 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgattgaccatccgtatgaggatgat 18795074  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  18795075 aagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatctgacacagtactcgacgg 18795174  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  18795175 aacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15459620 - 15459838
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15459620 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 15459719  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  15459720 taagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacg 15459819  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  15459820 gaacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10468845 - 10468625
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10468845 tgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 10468746  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  10468745 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 10468646  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  10468645 tacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 219
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442769
Alignment:
Q  160 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 22442769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16382351 - 16382161
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  16382351 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 16382252  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382251 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 23996571 - 23996741
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  23996571 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 23996670  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996671 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18837886 - 18837696
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  18837886 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactca 18837787  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837786 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  107 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 192  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 16098416 - 16098543
Alignment:
Q  83 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 182  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  16098416 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 16098515  T
Q  183 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098516 ctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 210
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  89 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 188  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  189 caatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  90 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 189  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  190 aatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25743018 - 25742876
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  25743018 gtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaa 25742919  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742918 acctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10868901 - 10869122
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10868901 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 10869000  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869001 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 10869100  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  10869101 gaacaccatgcagcttcacaat 10869122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9610187 - 9610408
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9610187 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 9610286  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610287 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 9610386  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  9610387 gaacaccatgcaacttcacaat 9610408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16999051 - 16999272
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16999051 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 16999150  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999151 tatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16999250  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16999251 gaacaccatgcaacttcacaat 16999272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16982203 - 16982424
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16982203 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 16982302  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982303 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16982402  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16982403 gaacaccatgcaacttcacaat 16982424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17063768 - 17063989
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17063768 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 17063867  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063868 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 17063967  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  17063968 gaacaccatgcaacttcacaat 17063989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17067426 - 17067647
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17067426 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 17067525  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067526 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 17067625  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  17067626 gaacaccatgcaacttcacaat 17067647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44385961 - 44385740
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44385961 atgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatga 44385862  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385861 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 44385762  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  44385761 gaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23189058 - 23189279
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23189058 atgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaatcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatga 23189157  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189158 taagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 23189257  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  23189258 gaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24710084 - 24710305
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24710084 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 24710183  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24710184 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaag 24710283  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  24710284 gaacaccatgcaacttcacaat 24710305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 27218067 - 27218288
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27218067 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatga 27218166  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218167 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 27218266  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27218267 gaacaccatgcaacttcacaat 27218288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 27371320 - 27371541
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27371320 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatga 27371419  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27371420 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 27371519  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27371520 gaacaccatgcaacttcacaat 27371541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41608777 - 41608556
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41608777 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatga 41608678  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41608677 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaag 41608578  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  41608577 gaacaccatgcaacttcacaat 41608556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24262421 - 24262642
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  24262421 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatga 24262520  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24262521 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 24262620  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  24262621 gaacaccatgcaacttcacaat 24262642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22325248 - 22325027
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22325248 atgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 22325149  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22325148 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 22325049  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  22325048 gaacaccatgcaacttcacaat 22325027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21325658 - 21325437
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325658 atgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 21325559  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  21325558 tacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgaca 21325459  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21325458 gaacaccatgcaacttcacaat 21325437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 24675540 - 24675761
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675540 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaatcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 24675639  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24675640 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaa 24675739  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  24675740 gaacaccatgcaacttcacaat 24675761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24707874 - 24707665
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707874 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaatcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 24707775  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707774 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 24707675  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  24707674 gaacaccatg 24707665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22756857 - 22756636
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  22756857 atgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatga 22756758  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756757 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 22756658  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  22756657 gaacaccatgcaacttcacaat 22756636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30211309 - 30211088
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30211309 atgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatga 30211210  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  30211209 tacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatg 30211110  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30211109 gaacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23064128 - 23064346
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064128 atgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 23064227  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23064228 taagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaag 23064327  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  23064328 gaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21145418 - 21145212
Alignment:
Q  5 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  21145418 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat-----------cctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacg 21145330  T
Q  105 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21145329 ccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaac 21145230  T
Q  205 accatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||| | |||||||||    
T  21145229 accatgcaacttcacaat 21145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 45529562 - 45529783
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  45529562 atgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatga 45529661  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  45529662 tacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatg 45529761  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  45529762 caacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925632
Alignment:
Q  69 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  169 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16925632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923161
Alignment:
Q  71 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  171 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16923161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442684
Alignment:
Q  76 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  176 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaat 20442684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24825674 - 24825472
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24825674 atgactatcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatga 24825575  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825574 tacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 24825475  T
Q  201 gaa 203  Q
    |||    
T  24825474 gaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876920
Alignment:
Q  64 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  164 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24876920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27365470 - 27365250
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27365470 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27365371  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27365370 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 27365271  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  27365270 aacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 23294010 - 23294230
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23294010 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaaccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 23294109  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  23294110 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 23294209  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  23294210 tacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19652443 - 19652223
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19652443 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 19652344  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||| ||    
T  19652343 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatccgacacaatactcgacgg 19652244  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || |||| || |||||||||    
T  19652243 tactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  41 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 140  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  141 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 20828311 - 20828528
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20828311 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20828410  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20828411 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 20828510  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  20828511 aacaccatgaagtttcac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 20833037 - 20833254
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20833037 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20833136  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20833137 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 20833236  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  20833237 aacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23276827 - 23277048
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23276827 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatga 23276926  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  23276927 taagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacg 23277026  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  23277027 gtacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 24948641 - 24948861
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24948641 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 24948740  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  24948741 aagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacgg 24948840  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  24948841 tacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 31830710 - 31830927
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31830710 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 31830809  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  31830810 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 31830909  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  31830910 aacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 12574405 - 12574624
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12574405 tgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 12574504  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12574505 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaagg 12574604  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  12574605 aactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 27787793 - 27788012
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27787793 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 27787892  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  27787893 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 27787992  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  27787993 aactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11358265 - 11358057
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11358265 tgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 11358166  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  11358165 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacgg 11358066  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    |||||||||    
T  11358065 aacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 1063803 - 1064020
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1063803 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 1063902  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  1063903 aagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacgg 1064002  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  1064003 aacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  134 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  107 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 206  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  207 catgtagcttcacaat 222  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16925311 - 16925378
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925311 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24878387 - 24878319
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24878387 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 111
Target Start/End: Original strand, 23087502 - 23087611
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23087502 tgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgat 23087601  T
Q  102 atgccgaact 111  Q
    | || |||||    
T  23087602 aagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 25128758 - 25128907
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| ||||||||   ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||    
T  25128758 ctgaatagtcctctctatctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaactta 25128857  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128858 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24570041 - 24569851
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  24570041 ccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccatcggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctca 24569942  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569941 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 22276349 - 22276538
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  22276349 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatcagtctggggatggtaagcagaactcaatctca 22276448  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22276449 acttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gacacaatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23817367 - 23817291
Alignment:
Q  79 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 155  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817367 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22761894 - 22761752
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  22761894 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 22761795  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761794 acctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24831540 - 24831370
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   ||    
T  24831540 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagct 24831441  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831440 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15589483 - 15589262
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15589483 atgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 15589384  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589383 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 15589284  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  15589283 gaacaccatgcagcttcacaat 15589262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20062145 - 20061924
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20062145 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 20062046  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20062045 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaag 20061946  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  20061945 gaacaccatgcagcttcacaat 20061924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16635812 - 16636033
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16635812 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 16635911  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635912 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16636011  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16636012 gaacaccatgcaacttcacaat 16636033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 43163136 - 43163357
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43163136 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 43163235  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163236 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 43163335  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  43163336 gaacaccatgcaacttcacaat 43163357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 53385109 - 53384888
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  53385109 atgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatga 53385010  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385009 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 53384910  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  53384909 gaacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10005639 - 10005860
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10005639 atgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 10005738  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005739 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 10005838  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  10005839 gaacaccatgcaacttcacaat 10005860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10906249 - 10906470
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10906249 atgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 10906348  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906349 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 10906448  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  10906449 gaacaccatgcaacttcacaat 10906470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16756676 - 16756455
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16756676 atgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatga 16756577  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756576 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16756477  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  16756476 gaacaccatgcagcttcacaat 16756455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 48425486 - 48425707
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48425486 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 48425585  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425586 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 48425685  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  48425686 gaacaccatgcaacttcacaat 48425707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12498287 - 12498508
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12498287 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 12498386  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12498387 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaag 12498486  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  12498487 gaacaccatgcaacttcacaat 12498508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14876590 - 14876381
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14876590 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatga 14876491  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876490 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 14876391  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  14876390 gaacaccatg 14876381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15348336 - 15348127
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15348336 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 15348237  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15348236 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 15348137  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  15348136 gaacaccatg 15348127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16807017 - 16806806
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807017 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 16806918  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16806917 taagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16806818  T
Q  201 gaacaccatgta 212  Q
    ||||||||||||    
T  16806817 gaacaccatgta 16806806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16371452 - 16371673
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16371452 atgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatga 16371551  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371552 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16371651  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  16371652 gaacaccatgcagcttcacaat 16371673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13252729 - 13252950
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13252729 atgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 13252828  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13252829 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 13252928  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  13252929 gaacaccatgcaacttcacaat 13252950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5425021 - 5424812
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5425021 atgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 5424922  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5424921 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 5424822  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  5424821 gaacaccatg 5424812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14126685 - 14126464
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14126685 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatga 14126586  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14126585 taagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 14126486  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14126485 gaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15061795 - 15062016
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15061795 atgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcgtatga 15061894  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061895 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 15061994  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  15061995 gaacaccatgcagcttcacaat 15062016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15725025 - 15724816
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15725025 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatga 15724926  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  15724925 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaag 15724826  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  15724825 gaacaccatg 15724816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11564772 - 11564551
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11564772 atgactatcccaagttcctcctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatga 11564673  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564672 tacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 11564573  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  11564572 gaacaccatgtaacttcacaat 11564551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15402601 - 15402380
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  15402601 atgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatga 15402502  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15402501 tacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagg 15402402  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15402401 gaacaccatgcaacttcacaat 15402380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16412373 - 16412152
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||    
T  16412373 atgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttga 16412274  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16412273 tactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 16412174  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16412173 gaacaccatgcaacttcacaat 16412152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26792490 - 26792269
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26792490 atgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatga 26792391  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26792390 tacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaag 26792291  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  26792290 gaacaccatgcaacttcacaat 26792269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15339308 - 15339529
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  15339308 atgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatga 15339407  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15339408 tacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagg 15339507  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15339508 gaacaccatgcaacttcacaat 15339529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16692199 - 16692412
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16692199 atgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatga 16692298  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcct----cttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 196  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16692299 taagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctc 16692398  T
Q  197 gaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||||||||||    
T  16692399 gaaggaacaccatg 16692412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9522758 - 9522979
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522758 atgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 9522857  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9522858 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 9522957  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  9522958 gaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6600786 - 6600996
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6600786 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 6600874  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600875 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 6600974  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  6600975 gaacaccatgcagcttcacaat 6600996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17489889 - 17490110
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489889 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacagatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 17489988  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17489989 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaag 17490088  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  17490089 gaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16492272 - 16492051
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16492272 atgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 16492173  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16492172 tacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 16492073  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16492072 gaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15248186 - 15248407
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15248186 atgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaaatcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatga 15248285  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  15248286 tacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaag 15248385  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15248386 gaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15208930 - 15209151
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15208930 atgactatcccaagttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatga 15209029  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  15209030 tacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaag 15209129  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15209130 gaacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 15227699 - 15227919
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15227699 tgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgat 15227798  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | || |||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15227799 aagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatgg 15227898  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| |||||| ||||    
T  15227899 aacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15015835 - 15015634
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||            |||||||    
T  15015835 atgactatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccgactg------------cggatga 15015748  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15015747 tatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacg 15015648  T
Q  201 gaacaccatgtagc 214  Q
    ||||||||||||||    
T  15015647 gaacaccatgtagc 15015634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13972199 - 13971979
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13972199 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgat 13972100  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13972099 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 13972000  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  13971999 aacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 14086723 - 14086943
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14086723 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 14086822  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14086823 aagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 14086922  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  14086923 aacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15953047 - 15952827
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15953047 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgat 15952948  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15952947 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 15952848  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  15952847 aactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14573978 - 14574199
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14573978 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatga 14574077  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14574078 taagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacg 14574177  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||| ||||||| |||||||||    
T  14574178 aaactccatgtaacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11303852 - 11303632
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11303852 tgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 11303753  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  11303752 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 11303653  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11303652 tacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12850359 - 12850138
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12850359 atgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctacggatta 12850260  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||||| || |    
T  12850259 taagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgcttgatg 12850160  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  12850159 ggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 28754368 - 28754585
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28754368 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 28754467  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  28754468 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatctgacacaatactagacgg 28754567  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28754568 aacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13322731 - 13322511
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13322731 tgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaatcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13322632  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  13322631 aagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacgg 13322532  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13322531 tacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 17492680 - 17492900
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17492680 tgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 17492779  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||  | | | ||    
T  17492780 aagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgaaacaacacacaacgg 17492879  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  17492880 aacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16836589 - 16836370
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16836589 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 16836490  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  16836489 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatccgatgcaatactcgacgg 16836390  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  16836389 aactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 44777297 - 44777516
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44777297 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 44777396  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  44777397 aagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 44777496  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44777497 aacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 13942074 - 13942291
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13942074 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13942173  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  13942174 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 13942273  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13942274 aactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8759161 - 8758942
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8759161 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 8759062  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  8759061 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 8758962  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  8758961 aactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 41177572 - 41177791
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41177572 tgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 41177671  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  41177672 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 41177771  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  41177772 aactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 47123994 - 47124211
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47123994 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 47124093  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  47124094 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 47124193  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  47124194 aacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12360621 - 12360401
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360621 tgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaatcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 12360522  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | ||    
T  12360521 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacgg 12360422  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  12360421 tacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 10384019 - 10384235
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10384019 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 10384118  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  10384119 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacgg 10384217  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  10384218 aacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16381003 - 16380788
Alignment:
Q  6 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 105  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  16381003 tatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagc 16380904  T
Q  106 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||| || ||||||||     
T  16380903 cgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgacacaatacttgaaggaact 16380804  T
Q  206 ccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  16380803 ccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 4678488 - 4678702
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4678488 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 4678587  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4678588 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 4678687  T
Q  202 aacaccatgtagctt 216  Q
    ||| |||||||||||    
T  4678688 aactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10420125 - 10419907
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10420125 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 10420026  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  10420025 taagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacg 10419926  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  10419925 gaacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18134425 - 18134215
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18134425 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgat 18134326  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  18134325 aagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 18134226  T
Q  202 aacaccatgta 212  Q
     ||||||||||    
T  18134225 tacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16329738 - 16329520
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  16329738 tgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgat 16329641  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  16329640 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 16329541  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16329540 tacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11961113 - 11960992
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11961113 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgat 11961014  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaactt 123  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  11961013 aagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 13001958 - 13002070
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  13001958 atgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactctcatcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtga 13002056  T
Q  101 tatgccgaactcaa 114  Q
    || |||||||||||    
T  13002057 taagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26009072 - 26008948
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26009072 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 26008973  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcga 126  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008972 aagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 15576818 - 15577007
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  15576818 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 15576917  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 209  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576918 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8274471 - 8274281
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  8274471 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 8274372  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274371 acttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16742734 - 16742585
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  16742734 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 16742635  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742634 gaagtaaacctgggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 18748733 - 18748916
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  18748733 ccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 18748832  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| || |||||||    
T  18748833 atttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 177
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  83 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 177  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 8199037 - 8199258
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8199037 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 8199136  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199137 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 8199236  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  8199237 gaacaccatgcaacttcacaat 8199258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10871404 - 10871625
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10871404 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 10871503  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871504 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 10871603  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||| |||||||||||    
T  10871604 gaataccatgcagcttcacaat 10871625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44791212 - 44790991
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44791212 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 44791113  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791112 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 44791013  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  44791012 gaacaccatgcaacttcacaat 44790991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9596466 - 9596687
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596466 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 9596565  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596566 taagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 9596665  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||||| | |||||||    
T  9596666 ggacaccatgtaacctcacaat 9596687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11237074 - 11236865
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237074 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 11236975  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11236974 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 11236875  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  11236874 gaacaccatg 11236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17176 - 16956
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17176 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgat 17077  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17076 aagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 16977  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  16976 aacaccatgtagcctcacaat 16956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 13686473 - 13686694
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13686473 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 13686572  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13686573 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 13686672  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  13686673 gaacaccatgcaacttcacaat 13686694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15160918 - 15160697
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15160918 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 15160819  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15160818 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 15160719  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15160718 gaacaccatgcaacttcacaat 15160697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18178151 - 18178372
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18178151 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacagatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 18178250  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18178251 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaag 18178350  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18178351 gaacaccatgtagcttcacaat 18178372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18551619 - 18551398
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18551619 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 18551520  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18551519 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 18551420  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  18551419 gaacaccatgcaacttcacaat 18551398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 8708014 - 8708235
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8708014 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 8708113  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8708114 tacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 8708213  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  8708214 gaacaccatgcaacttcacaat 8708235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12687910 - 12688131
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12687910 atgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 12688009  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12688010 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaag 12688109  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||| | |||||||||    
T  12688110 gaataccatgcaacttcacaat 12688131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14332806 - 14333027
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14332806 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 14332905  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14332906 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 14333005  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14333006 gaacaccatgcaacttcacaat 14333027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11552963 - 11552742
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  11552963 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatga 11552864  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552863 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 11552764  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  11552763 gaacaccatgcaacttcacaat 11552742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 14955029 - 14955238
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14955029 atgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 14955128  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14955129 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaag 14955228  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||| ||||||    
T  14955229 gaataccatg 14955238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15154518 - 15154297
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15154518 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 15154419  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15154418 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaag 15154319  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  15154318 gaacaccatgtaacttcacaat 15154297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14040105 - 14040326
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14040105 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 14040204  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040205 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 14040304  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14040305 gaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14350135 - 14350356
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14350135 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 14350234  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14350235 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 14350334  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14350335 gaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15624961 - 15625182
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15624961 atgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgaccatctgtttgcggatga 15625060  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  15625061 tacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcg 15625160  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15625161 gaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11772102 - 11771881
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11772102 atgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatga 11772003  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11772002 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaag 11771903  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  11771902 gaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21662370 - 21662591
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  21662370 atgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatga 21662469  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |    
T  21662470 tacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatg 21662569  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  21662570 gaacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12206638 - 12206418
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12206638 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 12206539  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||    
T  12206538 aagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacgg 12206439  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  12206438 aacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15102441 - 15102221
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15102441 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 15102342  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| ||    
T  15102341 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatgg 15102242  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  15102241 taaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8211966 - 8211749
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8211966 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 8211867  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  8211866 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacgg 8211767  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  8211766 aacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16072132 - 16071912
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16072132 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgat 16072033  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16072032 aagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 16071933  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  16071932 aactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203253
Alignment:
Q  107 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  207 catgtagcttcacaat 222  Q
    |||| |||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaat 23203253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509380
Alignment:
Q  107 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  207 catgtagcttcacaat 222  Q
    |||| |||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaat 23509380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14264083 - 14263862
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14264083 atgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatcctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatga 14263984  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| |    
T  14263983 taagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatg 14263884  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14263883 gaacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 13021772 - 13021988
Alignment:
Q  6 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  13021772 tatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagc 13021871  T
Q  106 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 205  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||    
T  13021872 cgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtaca 13021971  T
Q  206 ccatgtagcttcacaat 222  Q
    || || |||||||||||    
T  13021972 ccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11306101 - 11305884
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11306101 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgat 11306002  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  11306001 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 11305902  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  11305901 aacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 6413922 - 6414142
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6413922 tgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgat 6414021  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  6414022 aagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacgg 6414121  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  6414122 tacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11388266 - 11388046
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11388266 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 11388167  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  11388166 aagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 11388067  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  11388066 aacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14286214 - 14285994
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14286214 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgat 14286115  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14286114 aagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 14286015  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  14286014 tacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18053791 - 18053572
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18053791 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 18053692  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18053691 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaagg 18053592  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  18053591 aactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 49152712 - 49152929
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  49152712 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 49152811  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  49152812 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 49152911  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  49152912 aacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1245 - 1025
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1245 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgat 1146  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  1145 aagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacgg 1046  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || |||||||||||||||||    
T  1045 tactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 13665948 - 13666168
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13665948 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgat 13666047  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |     
T  13666048 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacga 13666147  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13666148 tacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 14130284 - 14130503
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14130284 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 14130383  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  14130384 aagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaagg 14130483  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  14130484 aactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16950291 - 16950089
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  16950291 ccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctca 16950192  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||||||    
T  16950191 acttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcac 16950092  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  16950091 aat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 14434102 - 14434321
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14434102 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 14434201  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  14434202 aagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaagg 14434301  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  14434302 aactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23505708 - 23505491
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23505708 tgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 23505609  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  23505608 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaagg 23505509  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  23505508 aactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 12456113 - 12456333
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12456113 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgat 12456212  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  12456213 aagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 12456312  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  12456313 tacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23516630 - 23516520
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23516630 atgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatgctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatga 23516531  T
Q  101 tatgccgaact 111  Q
    || ||||||||    
T  23516530 tacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 19147622 - 19147842
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19147622 tgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 19147721  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19147722 aagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatgg 19147821  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  19147822 aactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 20747021 - 20747241
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20747021 tgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 20747120  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20747121 aagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatgg 20747220  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  20747221 aactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13968506 - 13968289
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13968506 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 13968407  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  13968406 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 13968307  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
     |||||||| ||||||||    
T  13968306 tacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 15204288 - 15204389
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15204288 atgactattccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatga 15204387  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  15204388 ta 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 15340842 - 15341061
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15340842 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgat 15340941  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  15340942 aagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaagg 15341041  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  15341042 aactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26118443 - 26118226
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26118443 tgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 26118344  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||    
T  26118343 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccgg 26118244  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  26118243 aacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23199581 - 23199418
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23199581 tgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 23199482  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 165  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23199481 aagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 4440356 - 4440546
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  4440356 ccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 4440455  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440456 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21674374 - 21674185
Alignment:
Q  21 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 120  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||    
T  21674374 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaa 21674275  T
Q  121 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674274 cttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 14936795 - 14936965
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  14936795 tctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagct 14936894  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  14936895 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 15364388 - 15364558
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  15364388 tctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagct 15364487  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  15364488 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 35964711 - 35964646
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964711 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 110
Target Start/End: Original strand, 12457190 - 12457298
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| ||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12457190 tgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 12457289  T
Q  102 atgccgaac 110  Q
    | |||||||    
T  12457290 aagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 7824328 - 7824518
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  7824328 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 7824427  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824428 acttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27107616 - 27107426
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  27107616 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 27107517  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107516 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 210
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  89 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 188  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  189 caatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 203
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  95 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 194  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  195 tcgaaggaa 203  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 45147003 - 45147131
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  ||    
T  45147003 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagct 45147102  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147103 tgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  62 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  162 aagtaaatcttggatctctatct 184  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40869 - 40790
Alignment:
Q  139 ttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 218  Q
    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40869 ttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  128 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 186  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 34566846 - 34567067
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34566846 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 34566945  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566946 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 34567045  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  34567046 gaacaccatgcaacttcacaat 34567067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16356854 - 16357075
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16356854 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 16356953  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16356954 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaag 16357053  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16357054 gaacaccatgcaacttcacaat 16357075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37291530 - 37291309
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291530 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 37291431  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37291430 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 37291331  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  37291330 gaacaccatgcaacttcacaat 37291309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19770312 - 19770533
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19770312 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 19770411  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19770412 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 19770511  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19770512 gaacaccatgcaacttcacaat 19770533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22332921 - 22332712
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332921 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatga 22332822  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22332821 tatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 22332722  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  22332721 gaacaccatg 22332712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 27518759 - 27518980
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27518759 atgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 27518858  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518859 tacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 27518958  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27518959 gaacaccatgcaacttcacaat 27518980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27685434 - 27685213
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27685434 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 27685335  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27685334 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 27685235  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27685234 gaacaccatgcaacttcacaat 27685213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27668524 - 27668303
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27668524 atgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 27668425  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27668424 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 27668325  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27668324 gaacaccatgcaacttcacaat 27668303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 40709132 - 40709341
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40709132 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 40709231  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40709232 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 40709331  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  40709332 gaacaccatg 40709341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22135020 - 22135229
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22135020 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaattctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatga 22135119  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22135120 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 22135219  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  22135220 gaacaccatg 22135229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29476107 - 29475898
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476107 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 29476008  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29476007 tacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 29475908  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  29475907 gaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18776122 - 18776333
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18776122 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatga 18776221  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776222 taagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 18776321  T
Q  201 gaacaccatgta 212  Q
    ||||||||||||    
T  18776322 gaacaccatgta 18776333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14999773 - 14999552
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  14999773 atgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatga 14999674  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14999673 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 14999574  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14999573 gaacaccatgcaacttcacaat 14999552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 27610706 - 27610927
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27610706 atgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 27610805  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27610806 tacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 27610905  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27610906 gaacaccatgcaacttcacaat 27610927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 41771194 - 41771415
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41771194 atgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 41771293  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41771294 tacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 41771393  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  41771394 gaacaccatgcaacttcacaat 41771415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22348775 - 22348996
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22348775 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaatcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 22348874  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22348875 taagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaag 22348974  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  22348975 gaacaccatgcaacttcacaat 22348996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23516893 - 23517102
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516893 atgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 23516992  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516993 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 23517092  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  23517093 gaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23574094 - 23574315
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574094 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 23574193  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  23574194 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaag 23574293  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  23574294 gaacaccatgcaacttcacaat 23574315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20799112 - 20799314
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20799112 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataa 20799211  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799212 taagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 20799311  T
Q  201 gaa 203  Q
    |||    
T  20799312 gaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21339320 - 21339099
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21339320 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 21339221  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339220 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 21339121  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21339120 gaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 23440577 - 23440766
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440577 atgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatga 23440676  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 190  Q
    ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440677 tacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 25423541 - 25423759
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25423541 atgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatga 25423640  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25423641 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaag 25423740  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  25423741 gaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21498070 - 21497850
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  21498070 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatctgcggatga 21497971  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21497970 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaa- 21497872  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21497871 gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20468130 - 20467909
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| |    
T  20468130 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaagtcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataa 20468031  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||      
T  20468030 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaca 20467931  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20467930 gaacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23471581 - 23471802
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23471581 atgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatga 23471680  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23471681 tacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaag 23471780  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  23471781 gaaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21564007 - 21563786
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21564007 atgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatga 21563908  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21563907 taagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatg 21563808  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  21563807 gaacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22235953 - 22235733
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22235953 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 22235854  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  22235853 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacgg 22235754  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  22235753 tacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26738739 - 26738540
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738739 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatga 26738640  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||                      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738639 tatgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcc----------------------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 26738562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14887024 - 14886807
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14887024 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 14886925  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14886924 aagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacgg 14886825  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14886824 aacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24716559 - 24716342
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24716559 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgct 24716460  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24716459 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacgg 24716360  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24716359 aacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 22503014 - 22503231
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22503014 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 22503113  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  22503114 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatgg 22503213  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  22503214 aacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24620328 - 24620111
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24620328 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgct 24620229  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24620228 aagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacgg 24620129  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24620128 aacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21890788 - 21890572
Alignment:
Q  6 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 105  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21890788 tatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagc 21890689  T
Q  106 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 205  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||     
T  21890688 cgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaact 21890589  T
Q  206 ccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||| | |||||||||    
T  21890588 ccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24749587 - 24749370
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  24749587 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgct 24749488  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24749487 aagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacgg 24749388  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24749387 aacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831574
Alignment:
Q  76 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 175  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  176 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 22381534 - 22381754
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22381534 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgat 22381633  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22381634 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 22381733  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  22381734 aactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 25848410 - 25848627
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25848410 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaaatcttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 25848509  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| | ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  25848510 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacgg 25848609  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  25848610 aacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 20342617 - 20342834
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20342617 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20342716  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  20342717 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 20342816  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
     |||||||| ||||||||    
T  20342817 tacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 20821787 - 20822008
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20821787 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 20821886  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |    
T  20821887 taagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatctgacactatactcgacg 20821986  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  20821987 gaacaccatgcaacttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28916447 - 28916226
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28916447 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 28916348  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  28916347 taagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacg 28916248  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||  ||||| | |||||||||    
T  28916247 gaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28923802 - 28923581
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28923802 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 28923703  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  28923702 taagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacg 28923603  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||  ||||| | |||||||||    
T  28923602 gaatcccatgcaacttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37545529 - 37545336
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37545529 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 37545430  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 195  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545429 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 22462287 - 22462471
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462287 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 22462386  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 186  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462387 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23080122 - 23079902
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23080122 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgat 23080023  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23080022 aagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacgg 23079923  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  23079922 tacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21496492 - 21496713
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  21496492 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatctatttgcgaatga 21496591  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || |    
T  21496592 taagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgatg 21496691  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  21496692 gaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24798430 - 24798213
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  24798430 tgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgat 24798331  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||    
T  24798330 aagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacgg 24798231  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24798230 aacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1061 - 919
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061 tgactatcctaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 962  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 144  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  961 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  108 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 207  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  208 atgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20774094 - 20774302
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20774094 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggat-gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 20774192  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| |    
T  20774193 taagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtctgacactatactcgacg 20774292  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    |||| |||||    
T  20774293 gaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 21405174 - 21405285
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  21405174 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatga 21405273  T
Q  101 tatgccgaactc 112  Q
    || |||||||||    
T  21405274 tacgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21984339 - 21984248
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984339 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28894976 - 28894755
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28894976 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatga 28894877  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||||||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  28894876 taagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacg 28894777  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||  ||||| | |||||||||    
T  28894776 gaatcccatgcaacttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17269366 - 17269148
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17269366 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 17269267  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  17269266 aagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 17269168  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17269167 aactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  62 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 161  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  162 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  62 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 161  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  162 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21937203 - 21937013
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  21937203 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 21937104  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937103 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 27011457 - 27011627
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  27011457 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaact 27011556  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011557 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21831777 - 21831722
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcta 56  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21831777 atgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctcta 21831722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 24581584 - 24581753
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  24581584 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 24581682  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581683 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  62 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 123  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 177
Target Start/End: Original strand, 23503837 - 23503952
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  23503837 ctgaatagtcctctccgtctgcctatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag-ttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 23503935  T
Q  161 gaagtaaatcttggatc 177  Q
    |||||||| || |||||    
T  23503936 gaagtaaacctcggatc 23503952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 8386832 - 8387053
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8386832 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 8386931  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386932 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 8387031  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  8387032 gaacaccatgcaacttcacaat 8387053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29038996 - 29038775
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29038996 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 29038897  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038896 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 29038797  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  29038796 gaacaccatgcaacttcacaat 29038775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12477020 - 12477241
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12477020 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 12477119  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477120 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 12477219  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  12477220 gaacaccatgcaacttcacaat 12477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14303570 - 14303361
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14303570 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatga 14303471  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303470 tatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 14303371  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  14303370 gaacaccatg 14303361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 12524096 - 12524317
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12524096 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 12524195  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524196 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 12524295  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  12524296 gaacaccatgcaacttcacaat 12524317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 18297625 - 18297846
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18297625 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 18297724  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297725 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 18297824  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  18297825 gaacaccatgcaacttcacaat 18297846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 27711756 - 27711977
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27711756 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatga 27711855  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27711856 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 27711955  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  27711956 gaacaccatgcaacttcacaat 27711977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8053215 - 8052994
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8053215 atgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 8053116  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8053115 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 8053016  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  8053015 gaacaccatgcaacttcacaat 8052994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14680987 - 14681208
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14680987 atgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 14681086  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14681087 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaag 14681186  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||| | |||||||||    
T  14681187 gaataccatgcaacttcacaat 14681208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19778385 - 19778164
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19778385 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 19778286  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19778285 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 19778186  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19778185 gaacaccatgcaacttcacaat 19778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 40473460 - 40473681
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  40473460 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 40473559  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40473560 tacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 40473659  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  40473660 gaacaccatgcaacttcacaat 40473681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16252037 - 16251816
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16252037 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatga 16251938  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251937 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16251838  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  16251837 gaacaccatgtaacctcacaat 16251816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16355037 - 16354816
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16355037 atgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatga 16354938  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16354937 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaag 16354838  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16354837 gaacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15147476 - 15147255
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147476 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 15147377  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15147376 tacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 15147277  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15147276 gaacaccatgcaacttcacaat 15147255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 23956178 - 23956388
Alignment:
Q  12 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23956178 aagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaact 23956277  T
Q  112 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 211  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23956278 taatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgc 23956377  T
Q  212 agcttcacaat 222  Q
    | |||||||||    
T  23956378 aacttcacaat 23956388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18227038 - 18226817
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18227038 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatga 18226939  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18226938 taagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaag 18226839  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||||| | |||||||    
T  18226838 gcacaccatgtaacctcacaat 18226817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 8706338 - 8706559
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8706338 atgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 8706437  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8706438 taagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacg 8706537  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  8706538 gaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1640017 - 1639796
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1640017 atgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatga 1639918  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1639917 tacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaag 1639818  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  1639817 gaacaccatgcaacttcacaat 1639796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7090852 - 7091073
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7090852 atgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaatcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatga 7090951  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7090952 tatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaag 7091051  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  7091052 gaacaccatgcaacttcacaat 7091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14850958 - 14850737
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14850958 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatga 14850859  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14850858 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaag 14850759  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  14850758 gaacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  32 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 131  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  132 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15414878 - 15414657
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  15414878 atgactatcccaaactccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatga 15414779  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || |    
T  15414778 taagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacg 15414679  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  15414678 gaacaccatgcagcttcacaat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14266491 - 14266368
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14266491 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatga 14266392  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttc 124  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  14266391 tacgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15078055 - 15078276
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  15078055 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctcttcgactgaccatttgtttgcggatga 15078154  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  15078155 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcggatctctatccgacacaatactcgatg 15078254  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  15078255 gaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1649128 - 1648908
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1649128 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 1649029  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  1649028 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 1648929  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  1648928 tacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 15246345 - 15246565
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15246345 tgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctggggatgat 15246444  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| |     
T  15246445 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgatacaatactcgacga 15246544  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  15246545 aactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3264645 - 3264428
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3264645 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 3264546  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  3264545 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 3264446  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  3264445 aacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29453388 - 29453171
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29453388 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 29453289  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  29453288 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 29453189  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  29453188 aacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15003215 - 15002995
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15003215 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 15003116  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||    
T  15003115 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacgg 15003016  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  15003015 aactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 222
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  81 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 180  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  181 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  71 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  171 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11207082 - 11206865
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11207082 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 11206983  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  11206982 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacgg 11206883  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  11206882 aacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 33223411 - 33223564
Alignment:
Q  69 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  33223411 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaa 33223510  T
Q  169 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223511 cctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15358941 - 15358721
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15358941 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctctctgaggatgat 15358842  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15358841 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 15358742  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  15358741 tacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 27900807 - 27901027
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27900807 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 27900906  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||    
T  27900907 aagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacgg 27901006  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  27901007 aacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44661716 - 44661500
Alignment:
Q  3 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 102  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  44661716 gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgata 44661617  T
Q  103 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 202  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  44661616 agccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgga 44661517  T
Q  203 acaccatgtagcttcac 219  Q
    |||||||| || |||||    
T  44661516 acaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 20891403 - 20891623
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20891403 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 20891502  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || ||    
T  20891503 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacgg 20891602  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| || | |||||||||    
T  20891603 tacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 16146333 - 16146459
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc--aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||  |  |||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16146333 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagtaaatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatg 16146432  T
Q  100 atatgccgaactcaatctcaacttcga 126  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146433 ataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 14997755 - 14997945
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14997755 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14997854  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997855 actttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 13248104 - 13248232
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  13248104 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 13248203  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    |||||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  13248204 tgcaaactctcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  79 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 178  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  179 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 9291322 - 9291464
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  9291322 gtcctctccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 9291421  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291422 acctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  83 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 122  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12342696 - 12342548
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || |    
T  12342696 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaacctta 12342597  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  12342596 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 865 - 1086
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  865 atgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatga 964  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  965 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 1064  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  1065 gaacaccatgcaacttcacaat 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14811 - 15032
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14811 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 14910  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14911 taagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 15010  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||||| | |||||||    
T  15011 gaaccccatgtaacctcacaat 15032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1071 - 1280
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1071 atgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 1170  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1171 tacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 1270  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  1271 gaacaccatg 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 109666 - 109445
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  109666 atgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 109567  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  109566 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaag 109467  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  109466 gaacaccatgcagcttcacaat 109445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 95857 - 95636
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  95857 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccgactgaccatcagtctgcggatga 95758  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  95757 taagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacg 95658  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  95657 gaacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 113011 - 113231
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| ||| ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  113011 tgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacagatcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgat 113110  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  113111 aagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacgg 113210  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  113211 aacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16350523 - 16350302
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16350523 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 16350424  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16350423 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 16350324  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16350323 gaacaccatgcaacttcacaat 16350302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19106802 - 19107023
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19106802 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 19106901  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106902 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaag 19107001  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19107002 gaacaccatgcaacttcacaat 19107023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51333417 - 51333196
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51333417 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 51333318  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333317 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 51333218  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  51333217 gaacaccatgcaacttcacaat 51333196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21837385 - 21837606
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21837385 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 21837484  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21837485 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 21837584  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21837585 gaacaccatgcaacttcacaat 21837606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33390953 - 33390732
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33390953 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 33390854  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33390853 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 33390754  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  33390753 gaacaccatgcaacttcacaat 33390732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17044939 - 17044718
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17044939 atgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatga 17044840  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17044839 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaag 17044740  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  17044739 gaacaccatgtaacctcacaat 17044718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 21830738 - 21830947
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830738 atgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 21830837  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21830838 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 21830937  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  21830938 gaacaccatg 21830947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21749376 - 21749597
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749376 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 21749475  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749476 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 21749575  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21749576 gaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16078576 - 16078377
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16078576 atgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatga 16078477  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078476 taagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 16078377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41354393 - 41354202
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41354393 atgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatga 41354294  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 192  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354293 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16369732 - 16369953
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369732 atgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatga 16369831  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369832 tacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 16369931  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16369932 gaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50620168 - 50619959
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  50620168 atgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 50620069  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620068 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 50619969  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  50619968 gaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19760790 - 19760569
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || || | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19760790 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 19760691  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |    
T  19760690 tacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatg 19760591  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19760590 gaacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24099526 - 24099306
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24099526 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 24099427  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  24099426 aagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 24099327  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  24099326 tacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 19854749 - 19854966
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19854749 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaatcctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 19854848  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  19854849 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 19854948  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
     |||||||||||||||||    
T  19854949 tacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 37677516 - 37677733
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37677516 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 37677615  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  37677616 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 37677715  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  37677716 aacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20939986 - 20939770
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20939986 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 20939887  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  20939886 aagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 20939787  T
Q  202 aacaccatgtagcttca 218  Q
     ||||||||||||||||    
T  20939786 tacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22433039 - 22432819
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22433039 tgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 22432940  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22432939 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 22432840  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||  |||| |||||||||||    
T  22432839 aacttcatgcagcttcacaat 22432819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19662998 - 19662844
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  19662998 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 19662899  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19662898 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 19662844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31539920 - 31539703
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31539920 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 31539821  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  31539820 aagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 31539721  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  31539720 aacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  97 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 196  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  197 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20856684 - 20856476
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20856684 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgat 20856585  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  20856584 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacgg 20856485  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    |||||||||    
T  20856484 aacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 152
Target Start/End: Original strand, 41308261 - 41308411
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41308261 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 41308360  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 152  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  41308361 aagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20835811 - 20835591
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20835811 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattgaccgtctgtctgaggatgat 20835712  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20835711 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaattctcgacgg 20835612  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  20835611 tacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 20137213 - 20137316
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20137213 atgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatga 20137312  T
Q  101 tatg 104  Q
    ||||    
T  20137313 tatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 20294848 - 20295065
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20294848 tgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 20294947  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | ||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20294948 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 20295047  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
     |||||||| ||||||||    
T  20295048 tacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 210
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20250285 - 20250378
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 94  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250285 atgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20831297 - 20831107
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  20831297 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 20831198  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831197 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353365
Alignment:
Q  185 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 41353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 20914712 - 20914854
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||    
T  20914712 gtcctctcagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaa 20914811  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914812 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 68 - 177
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  168 atcttggatc 177  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 17892 - 18113
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17892 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 17991  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 18091  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  18092 gaacaccgtgtaacctcacaat 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14490 - 14711
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  14490 atgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctga 14589  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14590 tacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaat 14689  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  14690 gaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 31862 - 32082
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31862 tgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgat 31961  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  31962 aagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 32061  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  32062 aactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  154 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19113176 - 19113397
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19113176 atgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 19113275  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19113276 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 19113375  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19113376 gaacaccatgcaacttcacaat 19113397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30313439 - 30313218
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  30313439 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatga 30313340  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313339 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 30313240  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  30313239 gaacaccatgtaacctcacaat 30313218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17674318 - 17674097
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17674318 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 17674219  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17674218 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 17674119  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  17674118 gaacaccatgcaacttcacaat 17674097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18857063 - 18857272
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18857063 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcgggtga 18857162  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18857163 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 18857262  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  18857263 gaacaccatg 18857272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22133336 - 22133127
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133336 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 22133237  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22133236 tacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaag 22133137  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  22133136 gaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15533866 - 15534077
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15533866 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatga 15533965  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15533966 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaag 15534065  T
Q  201 gaacaccatgta 212  Q
    ||||||||||||    
T  15534066 gaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16408340 - 16408131
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408340 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 16408241  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16408240 taagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaag 16408141  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  16408140 gaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 32600630 - 32600851
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32600630 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 32600729  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600730 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 32600829  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  32600830 gaacaccatgtaacctcacaat 32600851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21166832 - 21166624
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166832 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 21166733  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21166732 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaag 21166634  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  21166633 gaacaccatg 21166624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22046859 - 22047080
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046859 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 22046958  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22046959 taagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaag 22047058  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  22047059 gaacaccatgtaacctcacaat 22047080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22120469 - 22120260
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22120469 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatga 22120370  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22120369 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 22120270  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||| ||||||    
T  22120269 gaataccatg 22120260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21922030 - 21921809
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21922030 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatga 21921931  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21921930 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 21921831  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21921830 gaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22040345 - 22040566
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22040345 atgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatga 22040444  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22040445 taagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaag 22040544  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  22040545 gaacaccatgtaacctcacaat 22040566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22164486 - 22164278
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22164486 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatga 22164388  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
     | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22164387 cacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaag 22164288  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  22164287 gaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19485165 - 19484974
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19485165 atgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatga 19485066  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 192  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485065 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 19978453 - 19978674
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978453 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 19978552  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19978553 tacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaag 19978652  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19978653 gaacaccatgcaacttcacaat 19978674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20018045 - 20017865
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20018045 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 20017946  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 181  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017945 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21251427 - 21251648
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21251427 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatga 21251526  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21251527 tacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 21251626  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21251627 gaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 23650527 - 23650748
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23650527 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatga 23650626  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23650627 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaag 23650726  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  23650727 gaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22377749 - 22377528
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22377749 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 22377650  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377649 tacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 22377550  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22377549 gaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22383924 - 22383703
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22383924 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 22383825  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383824 tacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 22383725  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22383724 gaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21394160 - 21393939
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21394160 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 21394061  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21394060 tacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 21393961  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21393960 gaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21788654 - 21788433
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21788654 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 21788555  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21788554 tacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 21788455  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  21788454 gaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20388585 - 20388794
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20388585 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaaatcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatctgtttgcggatga 20388684  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  20388685 taagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattatcgacg 20388784  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  20388785 gaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23949405 - 23949624
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23949405 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatga 23949504  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23949505 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacg 23949604  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23949605 gaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22987687 - 22987903
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22987687 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatga 22987786  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||||     ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  22987787 taagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaag 22987881  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  22987882 gaacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20396420 - 20396199
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20396420 atgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatga 20396321  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       
T  20396320 tacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggca 20396221  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  20396220 ggacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31416768 - 31416548
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31416768 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 31416669  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  31416668 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 31416569  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || |||||||||||||||||    
T  31416568 tactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20975945 - 20975725
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20975945 tgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 20975846  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  20975845 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatctgacacaatactcgacgg 20975746  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  20975745 tacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 14565629 - 14565846
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  14565629 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgat 14565728  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||    
T  14565729 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacgg 14565828  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14565829 aacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16271518 - 16271301
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16271518 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16271419  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16271418 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgacgg 16271319  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16271318 aacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 1266725 - 1266945
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  1266725 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgat 1266824  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  1266825 aagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacgg 1266924  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| ||||| |||||    
T  1266925 tacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 22051350 - 22051569
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22051350 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 22051449  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  22051450 aagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 22051549  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  22051550 aactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 803967 - 803750
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  803967 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 803868  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  803867 aagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 803768  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  803767 aacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 12305245 - 12305462
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12305245 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 12305344  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12305345 aagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacgg 12305444  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  12305445 aacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 19851897 - 19852106
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19851897 atgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatga 19851996  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  19851997 taagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatg 19852096  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  19852097 gaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 19857933 - 19858142
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19857933 atgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatga 19858032  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  19858033 taagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatg 19858132  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  19858133 gaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 23655414 - 23655634
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23655414 tgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgat 23655513  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  23655514 aacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 23655613  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  23655614 tacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 6604145 - 6604362
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6604145 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 6604244  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  6604245 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 6604344  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  6604345 aacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 6679598 - 6679815
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6679598 tgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 6679697  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  6679698 aagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 6679797  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  6679798 aacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22061727 - 22061507
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22061727 tgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaatactccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgat 22061628  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  22061627 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacgg 22061528  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  22061527 aactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 22371427 - 22371647
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22371427 tgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattat 22371526  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  22371527 aagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatgg 22371626  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||  ||||| | |||||||||    
T  22371627 aagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 21840903 - 21841124
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  21840903 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatga 21841002  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |  ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21841003 tgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatg 21841102  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  21841103 gaactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29303717 - 29303500
Alignment:
Q  5 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 104  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29303717 ctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcatccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataag 29303618  T
Q  105 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 204  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  29303617 ccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaac 29303518  T
Q  205 accatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||||||||||||    
T  29303517 cccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20010195 - 20009974
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20010195 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatga 20010096  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| |    
T  20010095 taagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatg 20009996  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  20009995 gaacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31571136 - 31570917
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31571136 tgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 31571037  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  31571036 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 31570937  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  31570936 aactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129026
Alignment:
Q  104 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  204 caccatg 210  Q
     ||||||    
T  22129032 taccatg 22129026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21850613 - 21850423
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  21850613 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 21850514  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850513 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16877371 - 16877181
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16877371 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctta 16877272  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877271 acttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23157277 - 23157098
Alignment:
Q  31 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || |||||| | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  |||    
T  23157277 aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgtcggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttccc 23157178  T
Q  131 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157177 aaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21196778 - 21196588
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  21196778 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctctatgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctca 21196679  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196678 acttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcggattccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 22315744 - 22315886
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  22315744 gtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaa 22315843  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315844 acctcggatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484138
Alignment:
Q  185 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 19484138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863760
Alignment:
Q  98 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 197  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  198 aaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcac 19863760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868397
Alignment:
Q  98 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 197  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  198 aaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcac 19868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 22982959 - 22983128
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  22982959 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 22983058  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983059 tgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4260 - 4051
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4260 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatga 4161  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4160 tatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaag 4061  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  4060 gaacaccatg 4051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13159
Alignment:
Q  5 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12942 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataag 13041  T
Q  105 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042 ccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 13141  T
Q  205 accatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13142 accatgtaacttcacaat 13159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9256
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9047 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatga 9146  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9147 tatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaag 9246  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  9247 gaacaccatg 9256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33428 - 33219
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33428 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatga 33329  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33328 tatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaag 33229  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  33228 gaacaccatg 33219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 8241 - 8462
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8241 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 8340  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8341 taagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 8440  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||| | |||||||    
T  8441 gaataccatgtaacctcacaat 8462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 43605 - 43826
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43605 atgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 43704  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43705 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaag 43804  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  43805 gaacaccatgcaacttcacaat 43826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15398 - 15608
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15398 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 15486  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15487 tacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaag 15586  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  15587 gaacaccatgcaacttcacaat 15608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 8936 - 9146
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8936 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat-----------cctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatga 9024  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9025 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaag 9124  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  9125 gaacaccatgcaacttcacaat 9146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50368 - 50148
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  50368 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactgaccatccgtctgaggatgat 50269  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  50268 aagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatttgatacaatactcgacgg 50169  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  50168 aacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 106361 - 106226
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||    
T  106361 gtcctcttcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaa 106262  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106261 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4733
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4954 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 4855  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4854 tacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 4755  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  4754 gaacaccatgcaacttcacaat 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 32
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  222 ccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 123  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  122 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 7390 - 7599
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7390 atgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 7489  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7490 tacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 7589  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  7590 gaacaccatg 7599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7848 - 8069
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7848 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgtggatga 7947  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7948 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 8047  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  8048 gaacaccatacaacttcacaat 8069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 678 - 457
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  678 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaatcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatga 579  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  578 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 479  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  478 gaacaccatgcaacttcacaat 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6823 - 7044
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 6922  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6923 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 7022  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  7023 gaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 3243 - 3458
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3243 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 3342  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  3343 aagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacgg 3442  T
Q  202 aacaccatgtagcttc 217  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3443 aacaccatgtaacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 22318 - 22539
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22318 atgattatcccaagttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatga 22417  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22418 taagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 22517  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||| | |||||||    
T  22518 aaacaccatgtaacctcacaat 22539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 278685 - 278464
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278685 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 278586  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278585 tacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 278486  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  278485 gaacaccatgcaacttcacaat 278464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 260760 - 260979
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  260760 tgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgat 260859  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  260860 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaagg 260959  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  260960 aactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 65856 - 66067
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  65856 atgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatga 65955  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  65956 taagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaag 66055  T
Q  201 gaacaccatgta 212  Q
    ||||||||||||    
T  66056 gaacaccatgta 66067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39674 - 39466
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39674 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgac-atctgtctgtggatga 39576  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39575 tacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 39476  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  39475 gaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 63886 - 63665
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63886 atgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 63787  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  63786 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaag 63687  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  63686 gaacaccatgcaacttcacaat 63665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 197333 - 197112
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  197333 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatga 197234  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  197233 tacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaag 197134  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||  | |||||||||    
T  197133 gaacgccatacaacttcacaat 197112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6465 - 6686
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6465 atgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatga 6564  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6565 tacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 6664  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  6665 gaacaccatgcaacttcacaat 6686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19857 - 19636
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19857 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactgaccatctgtctgcggatga 19758  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19757 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 19658  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  19657 gaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 147 - 368
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 246  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 346  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  347 gaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3669 - 3460
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3669 atgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatga 3570  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3569 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaag 3470  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  3469 gaacaccatg 3460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16106 - 16327
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16106 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatga 16205  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  16206 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaag 16305  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  16306 gaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 6474 - 6695
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6474 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 6573  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6574 tacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaag 6673  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  6674 gaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1158
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1378 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 1279  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| ||    
T  1278 aagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacgg 1179  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  1178 tacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 130599 - 130820
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130599 atgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 130698  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  130699 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 130798  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  130799 gaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4309 - 4088
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4309 atgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatga 4210  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4209 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaag 4110  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  4109 gaacaccatgtaacttcacaat 4088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 59205 - 59426
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  59205 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatga 59304  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  59305 tacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatacttgacg 59404  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| ||| || |||||    
T  59405 gaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29014
Alignment:
Q  72 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  172 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 29014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 134693 - 134728
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 36  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  134693 atgactatcccaagttcatccttgctcaagaacaca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 391055 - 390834
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  391055 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 390956  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  390955 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatacaatgctcgatg 390856  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  390855 gaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 90787 - 90566
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90787 atgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 90688  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  90687 taagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacg 90588  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  90587 gaaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 114632 - 114795
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  114632 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgat 114731  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 165  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114732 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  137 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 5672 - 5893
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||    
T  5672 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatga 5771  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5772 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 5871  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  5872 gaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 49955 - 50165
Alignment:
Q  12 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49955 aagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaact 50054  T
Q  112 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 211  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  50055 caacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgc 50154  T
Q  212 agcttcacaat 222  Q
    | |||||||||    
T  50155 aacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 69 - 222
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19274
Alignment:
Q  69 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  169 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 222
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34698
Alignment:
Q  128 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 34698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6709
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6500 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatga 6599  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6600 tatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaag 6699  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  6700 gaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 7828 - 8038
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  7828 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatga 7916  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7917 tacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaag 8016  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  8017 gaacaccatgcaacttcacaat 8038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 222
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1348
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  1127 atgactatcccaagttccttcttgctcaagtacgcaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatga 1226  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1227 tacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaag 1326  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  1327 gaacaccatgtaacttcacaat 1348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 113342 - 113121
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  113342 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctgtctgcggatga 113243  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
     | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113242 cacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 113143  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  113142 gaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 15328 - 15549
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15328 atgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaagtccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatga 15427  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15428 tatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 15527  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  15528 gaacaccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 203323 - 203102
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  203323 atgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 203224  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  203223 taagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacg 203124  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  203123 gaacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 112472 - 112693
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  112472 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatga 112571  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  112572 tacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcg 112671  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  112672 gaacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 118020 - 118240
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  118020 tgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 118119  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  118120 aagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgg 118219  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  118220 tacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 386270 - 386491
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  386270 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatga 386369  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  386370 taagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacg 386469  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  386470 gaaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 323156 - 323376
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323156 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 323255  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  323256 aagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacgg 323355  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  323356 tacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 219272 - 219051
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  219272 atgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatga 219173  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  219172 taccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaag 219073  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  219072 gaacaccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 229494 - 229715
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  229494 atgaatatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatga 229593  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229594 tacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 229693  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  229694 gaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32791 - 32667
Alignment:
Q  62 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 161  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||    
T  32791 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 32692  T
Q  162 aagtaaatcttggatctctatctga 186  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||    
T  32691 aagtaaacctcggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2372 - 2589
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2372 atgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatga 2471  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2472 tacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcggatctctatctgatacattgctcgaag 2571  T
Q  201 gaacaccatgtagcttca 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2572 gaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42187 - 41970
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42187 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 42088  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  42087 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 41988  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| || |||||    
T  41987 aacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47253 - 47033
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47253 tgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 47154  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  47153 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacgg 47054  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  47053 tacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8183 - 7963
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  8183 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatttttctttggatga 8084  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8083 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacg 7985  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  7984 gaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 9421 - 9642
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9421 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatga 9520  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9521 tatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaat 9620  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9621 gaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 9806 - 10015
Alignment:
Q  13 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  9806 agttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactc 9905  T
Q  113 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 212  Q
    || |||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9906 aacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 10005  T
Q  213 gcttcacaat 222  Q
     |||||||||    
T  10006 acttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16271 - 16050
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16271 atgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatga 16172  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16171 tacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 16072  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  16071 gaacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26388 - 26167
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |   ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26388 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatga 26289  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26288 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 26189  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  26188 gaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 195557 - 195338
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||||||  |  || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  195557 tgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gaccatctgtctgaggatggt 195459  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  195458 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 195359  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  195358 tacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 149022 - 149238
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  149022 tgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgat 149121  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  149122 aagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacgg 149221  T
Q  202 aacaccatgtagcttca 218  Q
     ||||||||||||||||    
T  149222 tacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  31 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  131 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 127054 - 126911
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  127054 atgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatga 126955  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 144  Q
    || |  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  126954 tacgttgaactcaacctcaacttagaacataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14934 - 14713
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14934 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtga 14835  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |    
T  14834 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacg 14735  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14734 gaacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4482 - 4699
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4482 atgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaagtccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatga 4581  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4582 tacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 4681  T
Q  201 gaacaccatgtagcttca 218  Q
    |||||||||||| |||||    
T  4682 gaacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24926 - 24717
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24926 atgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatga 24827  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  24826 taagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacg 24727  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  24726 gaacaccatg 24717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 549 - 328
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  549 atgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 450  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  |||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  449 tacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaag 350  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||| | |||||||||    
T  349 gaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25574 - 25353
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  25574 atgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatga 25475  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  25474 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacg 25375  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25374 gaacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 116760 - 116539
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  116760 atgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatga 116661  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  116660 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacg 116561  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  116560 aaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 98485 - 98612
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  98485 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 98584  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaact 147  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98585 acttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5225
Alignment:
Q  4 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||     
T  5443 actatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaatcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatac 5344  T
Q  104 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    | ||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5343 gtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaa 5244  T
Q  204 caccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5243 caccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1450 - 1659
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450 atgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaatcttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatga 1549  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1550 tacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaag 1649  T
Q  201 gaacaccatg 210  Q
    ||||||||||    
T  1650 gaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19060 - 18839
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19060 atgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatga 18961  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18960 tacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaag 18861  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18860 gaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1359 - 1580
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1359 atgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatga 1458  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||  ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  1459 tacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatg 1558  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1559 gaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32607 - 32387
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32607 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 32508  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||     
T  32507 tacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaa 32409  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  32408 gaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11522 - 11302
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11522 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 11423  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  11422 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 11323  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  11322 aactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 3591 - 3812
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3591 atgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaagtctttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatga 3690  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3691 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaag 3790  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  3791 gaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 180668 - 180871
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||| |||||    
T  180668 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacccaaactctcaacaaatcctctagcgac------------------tgaccatctgtctgctgatga 180749  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  180750 tacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaag 180849  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  180850 gaacaccatgcaacttcacaat 180871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 101406 - 101186
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  101406 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgat 101307  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  101306 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatgg 101207  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  101206 aactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 1716 - 1937
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  1716 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatga 1815  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  1816 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaag 1915  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  1916 gaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 40189 - 40410
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40189 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatga 40288  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  40289 taagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacg 40388  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  40389 gaactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28623 - 28402
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28623 atgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatga 28524  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  28523 taagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacg 28424  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  28423 gaacaccatgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40614 - 40393
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40614 atgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatga 40515  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  40514 taagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacg 40415  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  40414 gaacaccatgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2729 - 2509
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2729 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 2630  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  2629 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgatacaatactcgacgg 2530  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  2529 tacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 27677 - 27897
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27677 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 27776  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27777 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27876  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  27877 tacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33531 - 33311
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33531 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 33432  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33431 aagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacgg 33332  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  33331 aacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 40728 - 40918
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  40728 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 40827  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40828 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 222
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  71 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  171 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 222
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  90 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  190 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 1590 - 1688
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1590 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 20435 - 20655
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20435 tgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgat 20534  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20535 aaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacgg 20634  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  20635 aactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13215 - 12995
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13215 tgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13116  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  13115 aagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 13016  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13015 tacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16985 - 16765
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16985 tgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgat 16886  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  16885 aagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 16786  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16785 tacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 43235 - 43455
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43235 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 43334  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  43335 aagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacgg 43434  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  43435 tacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 249065 - 249285
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  249065 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgat 249164  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  249165 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacgg 249264  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || |||||||||||||||||    
T  249265 tactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12832 - 12633
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | |||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12832 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatga 12733  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12732 tacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 4326 - 4547
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4326 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatga 4425  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| |    
T  4426 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatg 4525  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  4526 gaacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 320 - 541
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  320 atgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgtggatga 419  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  420 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatg 519  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | ||| |||| | |||||||||    
T  520 gtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 11221 - 11441
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11221 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 11320  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  11321 aagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaagg 11420  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  11421 aactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 10244 - 10465
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10244 atgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatga 10343  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  10344 taagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatg 10443  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  10444 gaactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51497
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  51718 atgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatga 51619  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| |    
T  51618 taagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatg 51519  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  51518 gaacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6890 - 6670
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6890 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgat 6791  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||    
T  6790 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatgg 6691  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6690 aaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 47576 - 47796
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47576 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgat 47675  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  47676 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatgg 47775  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||| | |||||||||    
T  47776 aactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49061 - 48841
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49061 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgat 48962  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  48961 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaagg 48862  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  48861 aactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 19572 - 19792
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19572 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcat 19671  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  19672 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacgg 19771  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  19772 aactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7093 - 6872
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatga 6994  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || |    
T  6993 taagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacg 6894  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  6893 gtacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18392 - 18171
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | | | | |||||||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18392 atgactatcccaagctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaatcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatga 18293  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| |    
T  18292 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacg 18193  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||| | |||||||||    
T  18192 gaactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10594 - 10425
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10594 tgactattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 10495  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 171  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10494 aagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 41371 - 41589
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41371 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 41470  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||||| ||    
T  41471 aagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctctattcgacacaatactcgacgg 41568  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  41569 tacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16567 - 16350
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16567 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16468  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16467 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 16368  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16367 aacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 2246 - 2466
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2246 tgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattaaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgat 2345  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||    
T  2346 atgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatgg 2445  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||  ||||||| |||||||||    
T  2446 aagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5202 - 5422
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5202 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatcctctaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgat 5301  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  5302 aagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatgg 5401  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||| | |||||||||    
T  5402 tacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 6636 - 6856
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6636 tgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6735  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||    
T  6736 aagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggg 6835  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     | |||||| | |||||||||    
T  6836 gataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5306 - 5086
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5306 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 5207  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||| || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |    
T  5206 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaag 5107  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5106 aactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52033 - 51814
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52033 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 51935  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  51934 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 51835  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  51834 aactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 61067 - 60848
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  61067 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 60969  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  60968 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 60869  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  60868 aactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 67455 - 67236
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  67455 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 67357  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  67356 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 67257  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  67256 aactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13755 - 13535
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13755 tgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgat 13656  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| ||    
T  13655 aagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacgg 13556  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13555 tacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4807 - 4587
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4807 tgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggacgat 4708  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| ||    
T  4707 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacgg 4608  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  4607 tacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  77 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  177 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5152 - 4945
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5152 tgactatcccaagctccaacttgctcaagaacacacactctcagtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgat 5053  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  5052 aagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T
Q  202 aacaccat 209  Q
     |||||||    
T  4952 tacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 26975 - 27196
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26975 atgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatga 27074  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  27075 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatg 27174  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  27175 gtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Original strand, 26612 - 26814
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  26612 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctca 26711  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||||||    
T  26712 actttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcac 26811  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  26812 aat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1004 - 787
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1004 atgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacga 905  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  904 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatg 805  T
Q  201 gaacaccatgtagcttca 218  Q
     ||||||||||| |||||    
T  804 aaacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 27971 - 28161
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27971 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 28070  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 192  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28071 aagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 192
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaat 192  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 46679 - 46780
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46679 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatga 46778  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  46779 ta 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 86359 - 86154
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||    
T  86359 atgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatga 86260  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    ||     | |||    |||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  86259 ta----cacctc--cgtcaacttataacccaacgcctcctgcaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacg 86166  T
Q  201 gaacaccatgta 212  Q
    ||||||||||||    
T  86165 gaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1826 - 1618
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1826 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 1727  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    |||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  1726 atgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatgg 1627  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    ||| |||||    
T  1626 aactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 43957 - 44177
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43957 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgat 44056  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  44057 aagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 44156  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  44157 aactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 44969 - 45189
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  44969 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgat 45068  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  45069 aagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 45168  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  45169 aactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 20574 - 20737
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||    
T  20574 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgat 20673  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 165  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20674 aagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactcttccagaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12615 - 12420
Alignment:
Q  26 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 125  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12615 tcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 12516  T
Q  126 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 221  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12515 aacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 38
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  192 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 93  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  92 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 11340 - 11560
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11340 tgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgat 11439  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  11440 aagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgg 11539  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11540 tacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7646 - 7456
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  7646 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 7547  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7546 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 122 - 267
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  122 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgactaaccatctgtctgcggatga 221  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 146  Q
    || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  222 tacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3209 - 2992
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || || || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3209 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatcgtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgat 3110  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  3109 aagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 3010  T
Q  202 aacaccatgtagcttcac 219  Q
     |||||||||||||||||    
T  3009 tacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48888 - 48668
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  48888 atgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa-tcctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatga 48790  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| |    
T  48789 taagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacg 48690  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  48689 gaaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 57671 - 57511
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  57671 tgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgat 57572  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 162  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |||||    
T  57571 aagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactcttccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21525 - 21305
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  21525 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgat 21426  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |    
T  21425 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacag 21326  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  21325 cacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Original strand, 26296 - 26424
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  ||    
T  26296 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagct 26395  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26396 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  149 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 37653 - 37861
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37653 atgactatctcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatga 37752  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  37753 taggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatg 37852  T
Q  201 gaacaccat 209  Q
    |||| ||||    
T  37853 gaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6191 - 5969
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6191 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctatctgaggatg 6092  T
Q  100 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 199  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||||    
T  6091 ataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgaa 5992  T
Q  200 ggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  5991 ggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  116 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 215  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  216 tcacaat 222  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9937 - 9782
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9937 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 9838  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 157  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  9837 aagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  4 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 103  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  104 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  204 caccatgtagcttcacaat 222  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 549 - 770
Alignment:
Q  1 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  549 atgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcctctccgtctgaccatctgtctgaggatga 648  T
Q  101 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 200  Q
    || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||||| |    
T  649 taagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccaccacaatactcgatg 748  T
Q  201 gaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    | |||||||| | |||||||||    
T  749 gtacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 980 - 1200
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  980 tgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgat 1079  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  1080 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacgg 1179  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     || |||||||||||||||||    
T  1180 taccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  155 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 19301 - 19509
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19301 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgat 19400  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19401 aagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacgg 19500  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    |||||||||    
T  19501 aacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 23463 - 23671
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  23463 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgat 23562  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  23563 aagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacgg 23662  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    |||||||||    
T  23663 aacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 3203 - 3423
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3203 tgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgat 3302  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  3303 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacgg 3402  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  3403 aacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  98 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 197  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  198 aaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  104 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  204 caccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  104 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  204 caccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5665 - 5885
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  5665 tgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaaccatctttctgacgatgat 5764  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  5765 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaagctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacacaatactagaagg 5864  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  5865 aactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25719 - 25511
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25719 tgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgat 25620  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  25619 aagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 25520  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    |||||||||    
T  25519 aacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 219  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  220 aat 222  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 46624 - 46814
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  |||||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  46624 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctca 46723  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46724 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 26713 - 26933
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26713 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 26812  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |     
T  26813 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacga 26912  T
Q  202 aacaccatgtagcttcacaat 222  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  26913 tacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  168 atcttggatctctatc 183  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  137 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1088 - 880
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1088 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgat 989  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 201  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| ||    
T  988 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacgg 889  T
Q  202 aacaccatg 210  Q
    ||| |||||    
T  888 aaccccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33169 - 32953
Alignment:
Q  6 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 105  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  33169 tatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagt 33070  T
Q  106 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 205  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||   ||| ||||| || |||    
T  33069 cgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacgaaatactcgacggtaca 32970  T
Q  206 ccatgtagcttcacaat 222  Q
    || || |||||||||||    
T  32969 ccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  149 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  95 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 194  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  195 tcgaaggaacaccatgtagcttca 218  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 341 - 523
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  341 tgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttactaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgat 440  T
Q  102 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 184  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  441 aagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24170
Alignment:
Q  149 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3521
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  3711 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 3612  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3611 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 23864 - 24054
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  23864 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 23963  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23964 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13994
Alignment:
Q  2 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14105 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaatcctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgat 14006  T
Q  102 atgccgaactca 113  Q
    | || |||||||    
T  14005 aagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 210
Target Start/End: Original strand, 7679 - 7828
Alignment:
Q  61 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 160  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  7679 ctgaatagtcctctcggtctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacata 7778  T
Q  161 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7779 gaagtaaacctcggatccggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  95 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 194  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  195 tcgaaggaacaccatg 210  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 210
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  116 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 210
Target Start/End: Original strand, 13398 - 13568
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||    
T  13398 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagct 13497  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13498 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  83 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 182  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  183 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  31 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 130  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  131 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 210
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3818
Alignment:
Q  20 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 119  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||    
T  3629 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctctctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtca 3727  T
Q  120 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3728 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 210
Target Start/End: Original strand, 24398 - 24540
Alignment:
Q  68 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 167  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| |    
T  24398 gtcctctccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtga 24497  T
Q  168 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24498 accttggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 210
Target Start/End: Original strand, 14670 - 14798
Alignment:
Q  83 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa-gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 181  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |    
T  14670 ccatctgtcttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccga 14769  T
Q  182 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    ||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  14770 tctaacacaatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Original strand, 44019 - 44198
Alignment:
Q  31 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 130  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||    
T  44019 aacacaagctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc 44118  T
Q  131 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44119 aaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28091 - 27912
Alignment:
Q  31 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 130  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  |||    
T  28091 aacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttccc 27992  T
Q  131 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 210  Q
    |||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27991 aaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  149 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  137 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 222  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Original strand, 19 - 115
Alignment:
Q  107 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 203  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  19 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 1112
Alignment:
Q  40 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 139  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  1240 tctcaacaaatcctccaaactctgaatcgtcctctctgtctgctcatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaagcagct 1141  T
Q  140 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 168  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  1140 ttcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University