View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145A_low_73 (Length: 395)

Name: NF10145A_low_73
Description: NF10145A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145A_low_73
NF10145A_low_73
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (18-395)||(38763494-38763872)
chr4 (43-390)||(12732864-12733217)
chr4 (185-373)||(18275551-18275739)
chr4 (61-364)||(42707498-42707800)
chr4 (22-263)||(18240841-18241084)
chr4 (278-368)||(19823802-19823892)
chr4 (235-358)||(7187229-7187353)
chr4 (277-366)||(10105523-10105612)
chr4 (277-366)||(31114518-31114607)
chr4 (277-366)||(15676248-15676337)
chr4 (70-215)||(49070721-49070865)
chr4 (72-203)||(12134792-12134922)
chr4 (64-196)||(54364604-54364735)
chr4 (64-241)||(5371731-5371906)
chr4 (104-214)||(19558317-19558426)
chr4 (242-319)||(24237655-24237733)
chr4 (242-339)||(54364894-54364992)
chr4 (242-321)||(17213168-17213247)
chr4 (64-241)||(17376592-17376768)
chr4 (64-184)||(17213003-17213122)
chr4 (258-346)||(10115705-10115795)
chr4 (242-316)||(19558102-19558177)
chr4 (68-215)||(24237783-24237929)
chr4 (245-313)||(50223487-50223555)
chr4 (245-339)||(5372022-5372116)
chr4 (239-353)||(18420207-18420320)
chr4 (245-316)||(41257679-41257750)
chr4 (242-319)||(49070594-49070672)
chr4 (325-354)||(14617896-14617925)
chr4 (109-197)||(16226351-16226437)
chr4 (258-306)||(11923440-11923488)
chr4 (69-144)||(50221091-50221167)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (22-395)||(14939493-14939865)
chr7 (22-395)||(15367086-15367458)
chr7 (185-395)||(48354054-48354264)
chr7 (36-395)||(33558409-33558769)
chr7 (183-390)||(34242379-34242586)
chr7 (185-395)||(16921193-16921402)
chr7 (22-384)||(31499930-31500300)
chr7 (185-395)||(9609956-9610165)
chr7 (185-395)||(9837528-9837737)
chr7 (36-395)||(4437564-4437928)
chr7 (197-395)||(4444965-4445169)
chr7 (240-368)||(17225239-17225367)
chr7 (224-368)||(16918313-16918458)
chr7 (242-354)||(16382286-16382399)
chr7 (242-354)||(45148318-45148431)
chr7 (104-241)||(4483686-4483822)
chr7 (242-354)||(15979398-15979510)
chr7 (109-203)||(21676035-21676128)
chr7 (71-241)||(28719413-28719582)
chr7 (242-337)||(21539497-21539592)
chr7 (64-201)||(15979137-15979273)
chr7 (110-241)||(8564704-8564834)
chr7 (72-203)||(16382544-16382674)
chr7 (64-201)||(39292816-39292952)
chr7 (242-319)||(8564899-8564977)
chr7 (273-339)||(19066362-19066428)
chr7 (68-224)||(13617708-13617863)
chr7 (109-222)||(21539315-21539428)
chr7 (242-316)||(4483498-4483573)
chr7 (242-316)||(21676354-21676429)
chr7 (242-316)||(28719224-28719299)
chr7 (276-354)||(3193397-3193475)
chr7 (245-316)||(9322388-9322459)
chr7 (166-215)||(46472948-46472997)
chr7 (69-144)||(9322191-9322267)
chr7 (64-175)||(3193220-3193330)
chr7 (245-316)||(20584208-20584279)
chr7 (325-354)||(8325230-8325259)
chr7 (271-307)||(17910748-17910784)
chr7 (64-195)||(44306255-44306386)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (22-383)||(38636769-38637129)
chr8 (43-390)||(7468965-7469319)
chr8 (22-366)||(24553679-24554024)
chr8 (185-395)||(15932039-15932246)
chr8 (61-366)||(24266748-24267054)
chr8 (198-358)||(29296650-29296810)
chr8 (185-395)||(26010157-26010358)
chr8 (240-395)||(17283970-17284124)
chr8 (69-241)||(45560255-45560426)
chr8 (242-354)||(17265631-17265744)
chr8 (242-354)||(19332951-19333064)
chr8 (68-215)||(25294953-25295099)
chr8 (68-215)||(25756973-25757119)
chr8 (273-358)||(23227377-23227462)
chr8 (80-211)||(25609123-25609254)
chr8 (242-339)||(24238291-24238389)
chr8 (242-322)||(25608794-25608875)
chr8 (109-203)||(3845223-3845316)
chr8 (242-339)||(45560539-45560636)
chr8 (51-215)||(11543498-11543660)
chr8 (36-224)||(22498392-22498579)
chr8 (133-214)||(25609031-25609111)
chr8 (242-339)||(18042882-18042979)
chr8 (68-144)||(18042668-18042745)
chr8 (109-241)||(22312627-22312757)
chr8 (245-338)||(33171010-33171102)
chr8 (242-316)||(11543283-11543358)
chr8 (242-316)||(22312438-22312513)
chr8 (38-142)||(17500983-17501087)
chr8 (245-316)||(22498625-22498697)
chr8 (19-140)||(22886824-22886947)
chr8 (245-316)||(33612386-33612457)
chr8 (325-354)||(18033091-18033120)
chr8 (110-203)||(19332695-19332787)
chr8 (80-144)||(33171223-33171288)
chr8 (64-195)||(20177016-20177147)
chr8 (64-195)||(20221743-20221874)
chr8 (245-313)||(37654972-37655040)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (18-366)||(49998422-49998767)
chr1 (110-395)||(46144482-46144774)
chr1 (36-366)||(40437391-40437720)
chr1 (179-390)||(52399338-52399549)
chr1 (247-395)||(17607650-17607797)
chr1 (240-395)||(17022269-17022423)
chr1 (36-183)||(52400233-52400380)
chr1 (241-354)||(33396074-33396188)
chr1 (68-203)||(33396296-33396431)
chr1 (242-316)||(20821724-20821799)
chr1 (72-144)||(77102-77174)
chr1 (245-316)||(41212991-41213062)
chr1 (43-144)||(20193061-20193163)
chr1 (31-144)||(21194100-21194214)
chr1 (177-241)||(77187-77251)
chr1 (252-316)||(5769545-5769609)
chr1 (69-144)||(8539109-8539185)
chr1 (69-144)||(8604348-8604424)
chr1 (245-313)||(37235287-37235355)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (19-358)||(18968845-18969186)
chr3 (36-366)||(43428655-43428985)
chr3 (36-395)||(21167840-21168200)
chr3 (69-395)||(17319728-17320060)
chr3 (132-366)||(25105175-25105409)
chr3 (185-395)||(34558581-34558790)
chr3 (61-395)||(4146823-4147162)
chr3 (61-358)||(6229780-6230075)
chr3 (183-358)||(4163450-4163626)
chr3 (132-395)||(14816912-14817181)
chr3 (240-395)||(17203376-17203530)
chr3 (251-395)||(12020661-12020804)
chr3 (224-363)||(15549259-15549399)
chr3 (240-354)||(8603428-8603542)
chr3 (242-354)||(17759761-17759873)
chr3 (242-354)||(19061081-19061193)
chr3 (64-203)||(8603617-8603755)
chr3 (104-241)||(5229186-5229322)
chr3 (242-361)||(17392074-17392195)
chr3 (239-353)||(27050475-27050588)
chr3 (109-215)||(11401559-11401664)
chr3 (242-339)||(5229398-5229495)
chr3 (43-144)||(14181125-14181227)
chr3 (245-317)||(17385633-17385704)
chr3 (245-319)||(38377137-38377212)
chr3 (245-316)||(41660382-41660453)
chr3 (24-98)||(14816804-14816878)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (21-395)||(6446-6818)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (36-385)||(26560912-26561261)
chr5 (36-395)||(5622553-5622913)
chr5 (132-390)||(24082827-24083091)
chr5 (61-395)||(6455386-6455726)
chr5 (132-350)||(33627605-33627823)
chr5 (19-395)||(29912765-29913147)
chr5 (249-363)||(21224040-21224154)
chr5 (240-354)||(14343085-14343199)
chr5 (245-346)||(21108292-21108394)
chr5 (277-366)||(18532161-18532250)
chr5 (68-229)||(11964920-11965080)
chr5 (277-366)||(22055125-22055214)
chr5 (109-241)||(20455174-20455305)
chr5 (64-203)||(14342799-14342937)
chr5 (72-203)||(21108505-21108635)
chr5 (60-203)||(24226614-24226756)
chr5 (242-316)||(11964720-11964795)
chr5 (80-203)||(20833158-20833279)
chr5 (68-224)||(23414108-23414263)
chr5 (243-337)||(20455419-20455513)
chr5 (240-306)||(24851787-24851853)
chr5 (245-313)||(24226793-24226861)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (36-358)||(32350832-32351155)
chr6 (51-320)||(22463244-22463514)
chr6 (240-389)||(25649870-25650019)
chr6 (77-358)||(18630776-18631056)
chr6 (208-381)||(29604288-29604462)
chr6 (224-368)||(22363499-22363644)
chr6 (240-363)||(21621868-21621991)
chr6 (245-368)||(25918416-25918539)
chr6 (243-354)||(11374178-11374290)
chr6 (242-354)||(31162210-31162322)
chr6 (242-354)||(29161836-29161949)
chr6 (109-236)||(17084435-17084561)
chr6 (281-366)||(15006013-15006098)
chr6 (242-354)||(16375120-16375232)
chr6 (242-354)||(5485657-5485768)
chr6 (43-203)||(29161459-29161617)
chr6 (112-241)||(23220659-23220786)
chr6 (274-354)||(17857741-17857821)
chr6 (149-229)||(16135253-16135333)
chr6 (243-354)||(4173002-4173112)
chr6 (242-316)||(16135053-16135128)
chr6 (245-339)||(34965658-34965751)
chr6 (107-184)||(31162088-31162164)
chr6 (176-260)||(33539663-33539750)
chr6 (243-354)||(4228611-4228721)
chr6 (245-312)||(19852973-19853040)
chr6 (242-316)||(21930666-21930741)
chr6 (111-184)||(16375278-16375350)
chr6 (64-144)||(26505802-26505881)
chr6 (265-307)||(15482225-15482267)
chr6 (273-339)||(18104827-18104892)
chr6 (36-144)||(34965875-34965985)
chr6 (19-94)||(11373847-11373924)
chr6 (265-302)||(23090078-23090115)
chr6 (239-291)||(22544688-22544739)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (185-395)||(98430-98639)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (185-395)||(29809-30018)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (185-395)||(68205-68414)
scaffold0009 (242-354)||(255745-255857)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (36-390)||(25132899-25133255)
chr2 (61-395)||(24881314-24881654)
chr2 (256-368)||(40641631-40641743)
chr2 (242-354)||(6093580-6093692)
chr2 (22-201)||(6093831-6094010)
chr2 (36-241)||(18534785-18534990)
chr2 (208-321)||(9782201-9782314)
chr2 (273-358)||(19665390-19665475)
chr2 (277-366)||(24342740-24342829)
chr2 (109-225)||(22331692-22331807)
chr2 (66-241)||(24561905-24562079)
chr2 (64-203)||(43641712-43641850)
chr2 (224-395)||(9782217-9782399)
chr2 (242-354)||(20272130-20272243)
chr2 (109-194)||(45618405-45618489)
chr2 (242-338)||(45619359-45619455)
chr2 (242-339)||(24562193-24562291)
chr2 (64-203)||(19434610-19434748)
chr2 (242-316)||(18534598-18534672)
chr2 (242-306)||(39668570-39668633)
chr2 (245-339)||(24276632-24276725)
chr2 (245-313)||(43641597-43641665)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (185-390)||(1344-1549)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (197-384)||(198640-198826)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (185-375)||(12170-12360)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (176-395)||(1293-1519)
scaffold0174 (242-354)||(21405-21516)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (61-366)||(3107-3413)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (56-342)||(2099-2385)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (247-395)||(52009-52156)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (61-358)||(23185-23480)
scaffold0021 (238-358)||(19095-19215)
scaffold0021 (238-358)||(28671-28791)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (224-368)||(467-612)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (224-390)||(5438-5604)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (176-331)||(1056-1210)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (242-354)||(11349-11462)
scaffold0017 (64-204)||(11577-11716)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (104-241)||(1336-1472)
scaffold0090 (104-241)||(5716-5852)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (242-354)||(10678-10791)
scaffold0013 (64-204)||(8262-8400)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (68-203)||(4851-4985)
scaffold0057 (242-319)||(4711-4789)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (277-390)||(50278-50390)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (274-358)||(105965-106049)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (109-215)||(14928-15033)
scaffold0317 (242-354)||(15213-15325)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (244-339)||(9532-9628)
scaffold0183 (109-215)||(9795-9901)
[»] scaffold1204 (2 HSPs)
scaffold1204 (242-354)||(1538-1651)
scaffold1204 (109-203)||(1300-1393)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (246-340)||(326-420)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (242-340)||(12464-12562)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (109-203)||(5201-5294)
scaffold0079 (242-301)||(5520-5580)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (245-316)||(44935-45007)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (242-319)||(2299-2376)
scaffold0601 (64-196)||(2138-2268)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (245-339)||(130634-130727)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (150-215)||(12210-12275)
scaffold0468 (242-354)||(12323-12434)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (36-201)||(34555-34720)
scaffold0049 (245-316)||(34787-34858)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (104-215)||(760-870)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (245-316)||(85189-85260)
scaffold0004 (245-339)||(26305-26398)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (245-316)||(457-528)
scaffold0786 (245-316)||(5512-5583)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (245-316)||(4045-4116)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (72-203)||(14006-14137)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (301-358)||(6543-6599)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (325-354)||(199452-199481)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 18 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 38763872 - 38763494
Alignment:
Q  18 atcaaaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38763872 atcaaaaatgattctttgagccaaataccttataatattttgagattagtttgatacgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttaaatatg 38763773  T
Q  118 atatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 217  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763772 atatttatcattaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 38763673  T
Q  218 tacatattgattaa-ttgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38763672 tacatgttgatgaatttgtgatatttggtgatgactcttaattgaataatggcatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 38763573  T
Q  317 agttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38763572 agttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctttgct 38763494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12733217 - 12732864
Alignment:
Q  43 taccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattt 142  Q
    |||||| ||||||||   || ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  12733217 taccttgtaatctttcgtgaatagctttatatgatcaaatgaagatatgtgaataattgttacgtgttgaacatgatgtttatcataaggtgttgtattt 12733118  T
Q  143 tccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt 242  Q
    ||  |||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  12733117 tct-cctttacttgtattgtgagaaatggtgcgaagttgttgaactataggatatagttgaagttgattgatgaatacatgttgattaattgtgacattt 12733019  T
Q  243 gg-tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12733018 tgatgatgactcttaattgaataatgacatgacgattgtgtggacgcaaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgt 12732919  T
Q  342 acttttacattgtgttgttgtat------gttgagtagtttgcattattgggtct 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12732918 acttttacattgtgttggtgtatgtattcgttgagtagtttgcattattgagtct 12732864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18275739 - 18275551
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18275739 aactatgtgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 18275640  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtag 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18275639 atgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgtcgtatgttgagtag 18275551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42707800 - 42707498
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | || ||| || |||| |||||||  | |||||| ||||| ||  |||||||| ||     
T  42707800 gattagttgtatatgattgaatgaagatatttgagtaaatggtaagtattggatttgatgtttatcacaaggtgttgcatttttcat-tttacttggata 42707702  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattg 260  Q
     ||| || ||||   | |||| |||||||| | |||||||| |||| ||||| || ||| || ||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  42707701 atgataaattgtgcaaggttgatgaactatgtaatatagttaaagttgattattggatatatgttgatgaattatgatatttggtgatgactcttgattg 42707602  T
Q  261 aataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgtt 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42707601 aataatgacatgctgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaattgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggt 42707502  T
Q  361 gtat 364  Q
    ||||    
T  42707501 gtat 42707498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 18240841 - 18241084
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttga-gccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||      
T  18240841 aaaatgattctttgaagccaattaccttataatcctttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgttgaacgtgaag 18240940  T
Q  121 tttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 220  Q
    |||||||  | |||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18240941 tttatcacaaggtgttgtattttcctcttttacttggatggtgataagttgtgtaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatac 18241040  T
Q  221 atattgattaattgtggta-tttggtgatgactcttaattgaat 263  Q
    || ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18241041 atgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaat 18241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 368
Target Start/End: Original strand, 19823802 - 19823892
Alignment:
Q  278 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttg 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19823802 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgtggttggagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagttg 19823892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 358
Target Start/End: Original strand, 7187229 - 7187353
Alignment:
Q  235 tggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaatt 333  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  7187229 tggtatttgataatgactcttatttgaattatgacttaattgactgtgtggatgtaaatacttgatagtgcaattgttggtggagttgagcaatgtaact 7187328  T
Q  334 ggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7187329 ggaggtgtacttttacattgtgttg 7187353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 10105523 - 10105612
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10105523 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 10105612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31114607 - 31114518
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31114607 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 31114518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 15676248 - 15676337
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15676248 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttaaattgtgttggtgtatgt 15676337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 49070865 - 49070721
Alignment:
Q  70 tatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagt 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| || | |||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||      
T  49070865 tatatgattaaatgaagatatgtgagtgattgttaggtgttgaatatgatatttatgataaggtgttgtattct-ctcctttacttggattgtgagaaag 49070767  T
Q  170 tgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
    | |||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  49070766 tatatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatg 49070721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Original strand, 12134792 - 12134922
Alignment:
Q  72 tatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttg 171  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||  |     
T  12134792 tatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggttttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtatttt-ctcttttacttggattgtgagaaagta 12134890  T
Q  172 tatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12134891 tatggagttgttgaactatatgatatagttga 12134922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Original strand, 54364604 - 54364735
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  54364604 tagtttgatatgattatacgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtg 54364702  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgata 196  Q
    | || | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  54364703 agaaatagtatgatgttgttgaattatatgata 54364735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Original strand, 5371731 - 5371906
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| |  ||   |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||| | || ||||||    
T  5371731 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgttttctatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttgcctgaattgtg 5371829  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    | ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  5371830 agaaactgtatggagttgttga-ctatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 5371906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19558426 - 19558317
Alignment:
Q  104 atgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19558426 atgtgttggatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattgtatcgagttgttgaaccatatgatatagttga 19558328  T
Q  204 agtggattaat 214  Q
     || |||||||    
T  19558327 tgttgattaat 19558317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24237733 - 24237655
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24237733 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgagtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 24237655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Original strand, 54364894 - 54364992
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  54364894 tggtaatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatgtaaacacttgataattcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 54364992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 321
Target Start/End: Original strand, 17213168 - 17213247
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttg 321  Q
    |||||||||||  | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17213168 tggtgatgacttcttattgaattgtgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcacttgttgttgaagttg 17213247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Original strand, 17376592 - 17376768
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||   | || ||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17376592 tagtttgatatgattgtatgaagatatgtgaatgctttctaagtgttgaatatgatgtttatcatagtgtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 17376690  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    | || || ||||  |||||| || |||||||| ||||||| || | |||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  17376691 agaaattatatggggttgttaaattatatgatttagttgatgttggttaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 17376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 184
Target Start/End: Original strand, 17213003 - 17213122
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || ||||| | ||||  | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17213003 tagtttgatatgattatatgaaaatgtgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtg 17213101  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttg 184  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  17213102 agaaattgtatgaagttgttg 17213122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 346
Target Start/End: Original strand, 10115705 - 10115795
Alignment:
Q  258 ttgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt--tgagcaatgtaattggaggtgtacttt 346  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  10115705 ttgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaaaacttgataatgcaaatgatgttgaatttatgaagaatgtaattggaggtgtacttt 10115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19558177 - 19558102
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19558177 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 19558102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 24237929 - 24237783
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | ||| | | || |||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||| ||| | | ||    
T  24237929 tttatatgattaaatgaagatatgttaatgatttttaggtgttgaatatgatatttatcataaggttttgtatttt-ctcctttacttggattataagaa 24237831  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
      |||||| |||||||||  ||||  |||||||||| || ||||||||    
T  24237830 cgtgtatggagttgttgagatataatatatagttgatgttgattaatg 24237783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 50223487 - 50223555
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgt 313  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50223487 tgatgactctttattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttaataatgcaattgttgt 50223555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Original strand, 5372022 - 5372116
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  5372022 tgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtcattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 5372116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 353
Target Start/End: Original strand, 18420207 - 18420320
Alignment:
Q  239 atttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt-tgagcaatgtaattggag 337  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||   | ||||||| | |||  |||||||||||||    
T  18420207 atttgatgatgactcttg-ttgaattaagacttgttgattgtgtggatgtaaaa-cttgataatgcataaggtgttgaattatgaagaatgtaattggag 18420304  T
Q  338 gtgtacttttacattg 353  Q
    ||||||||||||||||    
T  18420305 gtgtacttttacattg 18420320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 41257679 - 41257750
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  41257679 tgatgactcttatttgaattatgacttgattgttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 41257750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49070672 - 49070594
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||| || |||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49070672 tggttatgactcttaattgatctatgacttgattgattatgtggacgttaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 49070594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14617925 - 14617896
Alignment:
Q  325 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14617925 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 14617896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Original strand, 16226351 - 16226437
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatat 197  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||   | ||||||| |||||||  | ||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  16226351 ttgaatatgaaatttatcataatgtgttgtattttc--tcgttacttggattgtgaggaattgtatggagttgttggattatatgatat 16226437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 11923440 - 11923488
Alignment:
Q  258 ttgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaa 306  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  11923440 ttgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaagtacttgataatgcaa 11923488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Original strand, 50221091 - 50221167
Alignment:
Q  69 ttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| | || || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  50221091 ttatatgactaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgtttaatatgatatttatcataaggtgttgcattttc 50221167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14939865 - 14939493
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatat 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14939865 aaaatgatcctttgagccaaataccttataatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatat 14939766  T
Q  122 ttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaataca 221  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  14939765 ttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttatatgaagttgttgaactaaatgatatagttgaagtgtatcaatgaatacg 14939666  T
Q  222 tattgattaattgtggtat-ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagtt 320  Q
    | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14939665 tgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 14939566  T
Q  321 gagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14939565 gagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgt-atgtt-tatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 14939493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15367458 - 15367086
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatat 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15367458 aaaatgatcctttgagccaaataccttataatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatat 15367359  T
Q  122 ttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaataca 221  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  15367358 ttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttatatgaagttgttgaactaaatgatatagttgaagtgtatcaatgaatacg 15367259  T
Q  222 tattgattaattgtggtat-ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagtt 320  Q
    | ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15367258 tgttgataaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagtt 15367159  T
Q  321 gagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15367158 gagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgt-atgtt-tatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 15367086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48354264 - 48354054
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48354264 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 48354165  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48354164 atgtaaatgcttgataatgcagttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 48354065  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
    |||||| ||||    
T  48354064 gggtctttgct 48354054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 33558769 - 33558409
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaag-tg 134  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | || |||||| |||  ||||||| |||| ||    
T  33558769 agccaattaccttataatccattgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtagatggtaggtgttgaatgtgaggtttatca-caagatg 33558671  T
Q  135 ttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattg 234  Q
    ||||||||||| | |||||||| |  |||| ||  |||   || | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33558670 ttgtattttcctcttttacttggagggtgacaaaatgtgcaaaatggttgaactatataatatagttgaagttgattaatgaatacttgttgttgaattg 33558571  T
Q  235 tggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaatt 333  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33558570 tgatattttggtgatgactcttaattgaataacgacatattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaatt 33558471  T
Q  334 ggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33558470 ggaggtgtacttttacattgtgttcgtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 33558409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 390
Target Start/End: Original strand, 34242379 - 34242586
Alignment:
Q  183 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgt 282  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34242379 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttatttgaataatgacatgttaattgtgt 34242478  T
Q  283 ggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcatta 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34242479 ggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacatttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcatta 34242578  T
Q  383 ttgggtct 390  Q
    ||||||||    
T  34242579 ttgggtct 34242586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Original strand, 16921193 - 16921402
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16921193 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgatagtgtgg 16921292  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16921293 atgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagta-attgcattatt 16921391  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  16921392 tggtctttgct 16921402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31500300 - 31499930
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttgag-ccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgata 120  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||| | || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | || ||  || |||      
T  31500300 aaaatgattctttaaggccaattaccttacattcctttgtgattagttttatatgtttgaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgttagatgtgacg 31500201  T
Q  121 tttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 220  Q
    |||||||  | |||||||||||||  | |||||||| || |||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31500200 tttatcacaaggtgttgtattttct-cttttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatac 31500102  T
Q  221 atattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31500101 atgctgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaatattgacatgttgattgtgtggaggtaaatacttgataatacaattgttgttgaagt 31500002  T
Q  320 tgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg-------tatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||    
T  31500001 tgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtattgtatatgttgagtagtttgcattatt 31499930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9610165 - 9609956
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9610165 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtgg 9610066  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9610065 atgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 9609967  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  9609966 tggtctttgct 9609956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9837737 - 9837528
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9837737 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactctaaattgaataatgacatgttggttgtgtgg 9837638  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9837637 atgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattgtatgtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 9837539  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  9837538 tggtctttgct 9837528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4437928 - 4437564
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||| || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||  | || ||| || |||  || |||   ||||||    
T  4437928 agccaattatcttataatctttagtgactagttttatatgattgaatggagttatatgagtaaatggaaagtgttggatgtgacgtt-atcccaaagtgt 4437830  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgt 235  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||| || ||||   | ||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  4437829 tgtattttcctcctttacttggatggtgataaattgtgcaaggtgaatgaattatagaatatagttgaagttgattactgaatacatgttgatgaattgt 4437730  T
Q  236 ggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattg 334  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4437729 gatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattg 4437630  T
Q  335 gaggtgtacttttacattgtgttgttg-----tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  4437629 gaggtgtacttttacattgtgttgatgttgtatatgttgagttgtttgcattattgagtctgtgct 4437564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 4445169 - 4444965
Alignment:
Q  197 tagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgct 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4445169 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcataattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatact 4445070  T
Q  296 taataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg-----tatgttgagtagtttgcattattgggtct 390  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4445069 tgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgatgttgtatatgttgagttgtttgcattattgagtct 4444970  T
Q  391 ctgct 395  Q
     ||||    
T  4444969 gtgct 4444965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 240 - 368
Target Start/End: Original strand, 17225239 - 17225367
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17225239 tttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggt 17225338  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttgtatgttg 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17225339 gtacttttacattgtgttgttgtaagttg 17225367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 224 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16918458 - 16918313
Alignment:
Q  224 ttgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttga 322  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16918458 ttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacattttgtttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgt 16918359  T
Q  323 gcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttg 368  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16918358 aaaatgtaattggaggtgtaattttacattgtgttgttgtaagttg 16918313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16382399 - 16382286
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16382399 tggtgatgactcttaattgaattatgacttaattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 16382300  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  16382299 tacttttacattgt 16382286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 45148431 - 45148318
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  45148431 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttgaagttggtcgatgtaaatggaggtg 45148332  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  45148331 tacttttacattgt 45148318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4483822 - 4483686
Alignment:
Q  104 atgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483822 atgtgttgaatatgatgtttatcataatatgttgtattttcc-cctttatttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 4483724  T
Q  204 agtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
     || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  4483723 tgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 4483686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 15979398 - 15979510
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  15979398 tggtgatgactcttacttaaatcgtgacttgttgattgtggggacgtaaatagttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtga 15979497  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
     || |||||||||    
T  15979498 tctcttacattgt 15979510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 21676035 - 21676128
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21676035 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 21676128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28719582 - 28719413
Alignment:
Q  71 atatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagtt 170  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |  ||   |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  | |||||||| ||| ||| || ||    
T  28719582 atatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cttttacttgaattttgagaaatt 28719484  T
Q  171 gtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  28719483 gtatggagttgttgaactatatgatagagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 28719413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 337
Target Start/End: Original strand, 21539497 - 21539592
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 337  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21539497 tggtgatgactcttatttaaattgtgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgatcaatgtaaatggag 21539592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 201
Target Start/End: Original strand, 15979137 - 15979273
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| ||| | ||| | | || |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  15979137 tagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttttaggtgttgaatattatgtttatcctaatgtgatgtattttctac-tttacttggattgtg 15979235  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15979236 agaaattgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 15979273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Original strand, 8564704 - 8564834
Alignment:
Q  110 tgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgga 209  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8564704 tgaatatgatgtttatcattgtgtgttgtatgttct-cctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttga 8564802  T
Q  210 ttaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    |||||| ||| || || ||| |||||| ||||    
T  8564803 ttaatgcatatatgttaattgattgtgatatt 8564834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16382674 - 16382544
Alignment:
Q  72 tatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttg 171  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||  |     
T  16382674 tatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttct-cctttacttggattatgagaaagta 16382576  T
Q  172 tatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16382575 tatggagttgttgaactatatgatatagttga 16382544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 201
Target Start/End: Original strand, 39292816 - 39292952
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||   | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  39292816 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattctct-cctttacgtgtattgtg 39292914  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 201  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  39292915 agaaattgtatggagttgttgaaccatatgatctagtt 39292952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Original strand, 8564899 - 8564977
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8564899 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtttggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 8564977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19066428 - 19066362
Alignment:
Q  273 ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  19066428 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgttcaatataaatggaggt 19066362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13617863 - 13617708
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| | ||  |||||||||| ||||| || | |||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||    
T  13617863 tttatttgattaaattaagatatttgaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggaatgtgagaa 13617765  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatat 224  Q
      |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  13617764 agtgtatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatatatat 13617708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 222
Target Start/End: Original strand, 21539315 - 21539428
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatattt-atcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt-gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagt 206  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||  |  ||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21539315 ttgaatatgatattttatcatgatgtgatgtattttctcc--ttacttggatttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgt 21539412  T
Q  207 ggattaatgaatacat 222  Q
     |||||||| ||||||    
T  21539413 tgattaatgcatacat 21539428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4483573 - 4483498
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4483573 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 4483498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Original strand, 21676354 - 21676429
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21676354 tggtgatgactctaaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 21676429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28719299 - 28719224
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  28719299 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttga 28719224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 3193397 - 3193475
Alignment:
Q  276 attgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||  || |||||||||    
T  3193397 attgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgttcaatatagttggaggtgatctcttacattgt 3193475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 9322388 - 9322459
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9322388 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtatggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 9322459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 46472997 - 46472948
Alignment:
Q  166 aagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  46472997 aagttgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatg 46472948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Original strand, 9322191 - 9322267
Alignment:
Q  69 ttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  9322191 ttatatgactaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttc 9322267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 175
Target Start/End: Original strand, 3193220 - 3193330
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  3193220 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtattgaatatgatgtttatcataatttgtcgtatttt-ctcctttacttgaattgtg 3193318  T
Q  164 aaaagttgtatg 175  Q
    | || |||||||    
T  3193319 agaacttgtatg 3193330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 20584208 - 20584279
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20584208 tgatgactcttaatgaaatcatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20584279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 354
Target Start/End: Original strand, 8325230 - 8325259
Alignment:
Q  325 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8325230 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 8325259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17910784 - 17910748
Alignment:
Q  271 tgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17910784 tgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaat 17910748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 44306255 - 44306386
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttg-tattgt 162  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||   |||| |||||| |||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  44306255 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtatttt-ctcctttacttgaaattgt 44306353  T
Q  163 gaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgat 195  Q
    || || |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  44306354 gagaaataatatgatgttgttgaattatatgat 44306386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 38636769 - 38637129
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38636769 aaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtattgaatatgatat 38636868  T
Q  122 ttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaataca 221  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38636869 ttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttatattatgagaagttatatgaagttgttgaactatatgatatagttggagtggattaatgaataca 38636968  T
Q  222 tattgattaattgtggtat-ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagtt 320  Q
    | ||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38636969 tgttgatgaattatgatatgttgatgatgactcttaattgaataatgacatattgattgtgtggatgtaaatgattgataatgcaattgttgttgaagtt 38637068  T
Q  321 gagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattat 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38637069 gaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgt-atgtt-tatgttgagtagtttgcattat 38637129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7469319 - 7468965
Alignment:
Q  43 taccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattt 142  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  7469319 taccttataatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgcgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattt 7469220  T
Q  143 tccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggta-tt 241  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||    
T  7469219 tcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagctgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattt 7469120  T
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  7469119 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgggcgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaactggaggtgt 7469020  T
Q  342 acttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtct 390  Q
    ||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7469019 acttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtct 7468965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 366
Target Start/End: Original strand, 24553679 - 24554024
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttga-gccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgata 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||  | || |||||| | |      
T  24553679 aaaatgattctttgaagccaattaccttataatcctttgtgattagttt-atatgactaaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgttgaatgtaacg 24553777  T
Q  121 tttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatac 220  Q
    |||||||  | ||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||   ||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24553778 tttatcacaaggtgttgtattttcctgctttacttggatggtgataagttgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatac 24553877  T
Q  221 atattgattaattgtggtatttg-gtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    || ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24553878 atgttgatgaattgtgatattttcgagatgactcttaattgaataatgacatgttgcttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattattgttgaagt 24553977  T
Q  320 tgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24553978 tgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 24554024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15932246 - 15932039
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    |||||| |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932246 aactatgtgatgtagatgaagt--attaatgaatgcatattgatgaattgtgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 15932149  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15932148 atgtaaatgcttgataatgcaaatgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 15932050  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  15932049 tggtctttgct 15932039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24267054 - 24266748
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||  |  || |||  |||||||  | |||||||||||||    |||||||| |      
T  24267054 gattagttttatatgtttgaatggagatatgtgagtaaatggtaagtgatagatgtgacgtttatcacaaggtgttgtattttctctttttacttggaag 24266955  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaatt 259  Q
    || | |||||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24266954 gttataagttgtgcaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaatt 24266855  T
Q  260 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24266854 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgg 24266755  T
Q  360 tgtatgt 366  Q
    |||||||    
T  24266754 tgtatgt 24266748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 198 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29296810 - 29296650
Alignment:
Q  198 agttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctta 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29296810 agttgaagttgattaatgaatacatgttgatgtactatgatatttggtgatgactcttaaataaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttg 29296711  T
Q  298 ataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29296710 ataatgcaattgttgttggagttgaacaatataattggaggtgtacttttacattgtgttg 29296650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26010358 - 26010157
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26010358 aactatgtgatgtagttgaagttaattaatgaatacaagttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 26010259  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    |||        | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26010258 atg--------tgataatgcaattgttgttgaagttaggcaatttaattggaggtgtaattttacattgtattgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 26010168  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  26010167 tggtctttgct 26010157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17284124 - 17283970
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17284124 tttggtggtgactcttaattgaattatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgtttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggt 17284025  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| | || |||||||||| ||||| ||||    
T  17284024 gtacttttacattatgttgttgtgagttgtggag-ttgcattatttggtctttgct 17283970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Original strand, 45560255 - 45560426
Alignment:
Q  69 ttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaag 168  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||   ||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  45560255 ttatatgattatatgaagatatgtgaacgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttct-cctttacttggattgtgagaag 45560353  T
Q  169 ttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||| || |||||| ||||    
T  45560354 ttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgtttgattgtgatatt 45560426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17265744 - 17265631
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17265744 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 17265645  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  17265644 tacttttacattgt 17265631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 19332951 - 19333064
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  19332951 tggtgatgactctttattgaattataacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttaaagttgatcaatgtaaatggaggtg 19333050  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  19333051 tacttttacattgt 19333064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25295099 - 25294953
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||| | | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||    
T  25295099 tttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgacttgtgagaa 25295001  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25295000 attgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatg 25294953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25757119 - 25756973
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||| | | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||    
T  25757119 tttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgacttgtgagaa 25757021  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25757020 attgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatg 25756973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 273 - 358
Target Start/End: Original strand, 23227377 - 23227462
Alignment:
Q  273 ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23227377 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaatttttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttg 23227462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25609254 - 25609123
Alignment:
Q  80 aatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagt 179  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |||||||||| ||  | | |||||||  |||||    
T  25609254 aatgaagatatgtgggtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggcgttgtattttcctcctttacttggatgataataagttgtgcgaagt 25609155  T
Q  180 tgttgaactatatgatatagttgaagtggatt 211  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  25609154 tgttgaaccataggatatagttgaagttgatt 25609123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24238389 - 24238291
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  24238389 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatataaatggaggt 24238291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25608875 - 25608794
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttga 322  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25608875 tggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttga 25608794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 3845223 - 3845316
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3845223 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttct-cctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 3845316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Original strand, 45560539 - 45560636
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  45560539 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 45560636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11543660 - 11543498
Alignment:
Q  51 aatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctt 150  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||  | || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||  |  |    
T  11543660 aatcttttgaggatagtttgttatgattaaatgaaggtatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctcc--t 11543563  T
Q  151 tacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
     ||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11543562 cacttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatg 11543498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 224
Target Start/End: Original strand, 22498392 - 22498579
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtg 134  Q
    |||||| |||||||||| |||||   || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  | || ||||||||||| |||||||  | |||    
T  22498392 agccaattaccttataaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcacaaggtg 22498491  T
Q  135 ttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatat 224  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | | ||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  22498492 ttgtatttt-ctcctatacttggaatatgagaag-tgtatggagtggttgaactatattatatagttgatgttgattaatgtatatatat 22498579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25609111 - 25609031
Alignment:
Q  133 tgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaat 214  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25609111 tgttgtattttct-cctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgtggattaat 25609031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Original strand, 18042882 - 18042979
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  18042882 tggtgatggctcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 18042979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 144
Target Start/End: Original strand, 18042668 - 18042745
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18042668 tttatatgattaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttc 18042745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22312757 - 22312627
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||  |  | ||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22312757 ttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctcc--tcacttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttg 22312660  T
Q  209 attaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    ||||||| ||| || ||| || |||||| ||||    
T  22312659 attaatgcatatatgttggttgattgtgatatt 22312627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33171102 - 33171010
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagg 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  33171102 tgatgactcttaattgaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggagg 33171010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11543358 - 11543283
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  11543358 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatacaattgttgttga 11543283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22312513 - 22312438
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22312513 tggtgatgactcttaatttatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 22312438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17501087 - 17500983
Alignment:
Q  38 ccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttg 137  Q
    |||| ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  17501087 ccaattaccttataatcttttgtggatagctttatatgattaaatgaaattatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttg 17500988  T
Q  138 tattt 142  Q
    |||||    
T  17500987 tattt 17500983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 22498625 - 22498697
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||||||    
T  22498625 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacgtgattatgcaattgttgttga 22498697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22886947 - 22886824
Alignment:
Q  19 tcaaaaatgattctttga-gccaaataccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatat 116  Q
    ||||||||| |||||| | ||| | |||||||||| ||||||  || ||| ||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||| | || ||||||||    
T  22886947 tcaaaaatggttctttaaagccgagtaccttataaatcttttgtgaatagctttatatgactaaatgaagctatgtgaatgattgttaagtgttgaatat 22886848  T
Q  117 gatatttatcatcaagtgttgtat 140  Q
    ||| |||||||| | |||||||||    
T  22886847 gatgtttatcataaggtgttgtat 22886824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 33612386 - 33612457
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  || |  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33612386 tgatgactcttatttgaattatgatttgattgttgtgtggacgtgaatacttaataatgcaattgttgttga 33612457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18033120 - 18033091
Alignment:
Q  325 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18033120 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 18033091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Original strand, 19332695 - 19332787
Alignment:
Q  110 tgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  ||||||||  | |||||||| |||||||  |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19332695 tgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttcttc-tttacttggattgtgaggaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 19332787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33171288 - 33171223
Alignment:
Q  80 aatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  33171288 aatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttc 33171223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 20177016 - 20177147
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttg-tattgt 162  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||   |||| |||||| |||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  20177016 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtatttt-ctcctttacttgaaattgt 20177114  T
Q  163 gaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgat 195  Q
    || || |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20177115 gagaaataatatgatgttgttgaattatatgat 20177147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 195
Target Start/End: Original strand, 20221743 - 20221874
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttg-tattgt 162  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| | |||   |||| |||||| |||| ||||| || | |||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  20221743 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttattataaggtgttgtatttt-ctcctttacttgaaattgt 20221841  T
Q  163 gaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgat 195  Q
    || || |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20221842 gagaaataatatgatgttgttgaattatatgat 20221874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 37654972 - 37655040
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgt 313  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37654972 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37655040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 366
Target Start/End: Original strand, 49998422 - 49998767
Alignment:
Q  18 atcaaaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  49998422 atcaaaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttgtggttagt----tatgattggatgaagatatgtgagtaattgtgaggccttgaatatg 49998517  T
Q  118 atatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 217  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49998518 atatttaacataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatgtagttgttgaactatatgatatagttggagtggattaatgaa 49998617  T
Q  218 tacatattgattaattgtggtat-ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49998618 tacatgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 49998717  T
Q  317 agttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  49998718 agttgaacaatgtaattggaggtgtagttttatattgtgttggtgtatgt 49998767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 110 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 46144774 - 46144482
Alignment:
Q  110 tgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgga 209  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46144774 tgaatatgatatttatcataaggtgttgtatgttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtgga 46144675  T
Q  210 ttaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaatt 308  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  46144674 ttaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgtaatt 46144575  T
Q  309 gttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46144574 gttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 46144482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 40437391 - 40437720
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||| |||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| | || |    
T  40437391 agccaattaccctataatcttttgtgaataactttatatgattaaatgaagttatgtgagtaattgttaggtgttgaacatgatgtttatcataaggtat 40437490  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgt 235  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40437491 tgtattt-cctcctttacttggattgtgagaaattgtgcgaagttgttgaactataggatataattgaagttgattaatgaatacatgttgattaattgt 40437589  T
Q  236 ggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattg 334  Q
    |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40437590 gacattttggtgatgactcttaattggataatgacatgatgattgtgtggacataaatacttaataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatg 40437689  T
Q  335 gaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40437690 gaggtgtac-tttacattgtgttgatgtatgt 40437720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 179 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 52399549 - 52399338
Alignment:
Q  179 ttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||||        ||||||||    
T  52399549 ttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatgttgatgaattatgatattttggtgttgactcttaattgat-------atgttgat 52399457  T
Q  278 tgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagt 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      ||||||||||    
T  52399456 tgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgctgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttagtgtatgtatatgttgagt 52399357  T
Q  372 agtttgcattattgggtct 390  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  52399356 agtttgcattattgagtct 52399338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17607797 - 17607650
Alignment:
Q  247 atgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttt 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17607797 atgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaggttgagcaatgtaattggaagtgtacttt 17607698  T
Q  347 tacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  17607697 tacattgtgttgtcgtatgttgcgtag-ttgcattatttggtctttgct 17607650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17022423 - 17022269
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  17022423 tttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggagat 17022324  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||| ||||    
T  17022323 gtacttttacattgtgttgttgtaagttgtggag-ttgcattatttggtctttgct 17022269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52400380 - 52400233
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  52400380 agccaaataccttataatcttttgtgattagttttatatgattgagtgaagatatgtgactaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgt 52400281  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgtt 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  52400280 tgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 52400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33396188 - 33396074
Alignment:
Q  241 ttggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33396188 ttggtgatgattcttaattgaattatgacttgattgattttgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggt 33396089  T
Q  340 gtacttttacattgt 354  Q
    |||||||||||||||    
T  33396088 gtacttttacattgt 33396074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33396431 - 33396296
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgta-ttgtgaaa 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||  | || ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||  | |||||||| | |||||| |    
T  33396431 tttatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcgtaaggtgttgtattttct-catttacttggaattgtgaga 33396333  T
Q  167 agttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33396332 aataatatgatgttgttgaactatatgatatagttga 33396296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20821799 - 20821724
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20821799 tggtgatgactctcaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 20821724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Original strand, 77102 - 77174
Alignment:
Q  72 tatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  77102 tatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaagtgttgtattttc 77174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 41212991 - 41213062
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41212991 tgatgactcctaattgaagtatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41213062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20193163 - 20193061
Alignment:
Q  43 taccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtatt 141  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |   | ||||| | |  ||||||||||| |||||||| | |||||| |||    
T  20193163 taccttataaatcttttatgattagctttatatgattaaatgaagatatttagatgattgttaagcgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgcatt 20193064  T
Q  142 ttc 144  Q
    |||    
T  20193063 ttc 20193061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21194214 - 21194100
Alignment:
Q  31 ctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatc 129  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||   || ||| ||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||  || | ||| ||||||||||||||||     
T  21194214 ctttaagccaattatcttatgatctttcgtgactagctttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgatatatgttggatatgatatttatcata 21194115  T
Q  130 aagtgttgtattttc 144  Q
    |||||||||||||||    
T  21194114 aagtgttgtattttc 21194100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 241
Target Start/End: Original strand, 77187 - 77251
Alignment:
Q  177 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  77187 agttgttaaactatatgatatagttgatggtgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 77251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 316
Target Start/End: Original strand, 5769545 - 5769609
Alignment:
Q  252 tcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  5769545 tcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttga 5769609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Original strand, 8539109 - 8539185
Alignment:
Q  69 ttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| || | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8539109 ttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttc 8539185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 144
Target Start/End: Original strand, 8604348 - 8604424
Alignment:
Q  69 ttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| | |||||| || | ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8604348 ttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttc 8604424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 37235287 - 37235355
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgt 313  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37235287 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 37235355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18969186 - 18968845
Alignment:
Q  19 tcaaaaatgattctttga-gccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatg 117  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18969186 tcaaaaacgattctttaaagccaaatacgttataatcttttgtgattagttgtatagggttgaatgtggttatgtgagtaattgtgaagtattgaatatg 18969087  T
Q  118 atatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 217  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969086 atatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgaatggagctgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaa 18968987  T
Q  218 tacatattgattaattgtggta-tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||| ||||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18968986 tacatgttgatgaattatgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtcgatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttga 18968887  T
Q  317 agttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18968886 agttgaacaatgtaattgaatgtgtacttttacattgtgttg 18968845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 366
Target Start/End: Original strand, 43428655 - 43428985
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| | || |    
T  43428655 agccaattactttataatcttttgtgaattgttttatatgatttaatgaagatatgtgagtaat-gtggggtcttgaatatgatgtttatcataaggtat 43428753  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgt 235  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43428754 tgtattttcctctattacttgtattatgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtggaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgt 43428853  T
Q  236 ggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattg 334  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43428854 gatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatggaattgttgttgaagttgatcaatgtaattg 43428953  T
Q  335 gaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43428954 gaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 43428985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 395
Target Start/End: Original strand, 21167840 - 21168200
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaag-tg 134  Q
    |||||| | ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||  ||||||| |||| ||    
T  21167840 agccaattgccttataatccattgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatca-caagatg 21167938  T
Q  135 ttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattg 234  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||| || ||||   ||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  21167939 ttgtattttcctcttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattg 21168038  T
Q  235 tggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaatt 333  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21168039 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaatt 21168138  T
Q  334 ggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21168139 ggagatgtacttttacattgtgttggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 21168200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 69 - 395
Target Start/End: Original strand, 17319728 - 17320060
Alignment:
Q  69 ttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaag 168  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||| || || || | ||     
T  17319728 ttatctgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatttgatgtttatcagaaggtgttgtattttcctcctttacgtggatggtcataaa 17319827  T
Q  169 ttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggatt-aatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataat 266  Q
    ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17319828 ttgtgcgaagtttttgaactataggatatagttgaagttgatttaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataat 17319927  T
Q  267 gacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg----- 361  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||         
T  17319928 gacattttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac--ttacattgtgttggtgtatgt 17320025  T
Q  362 -tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17320026 atatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 17320060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 366
Target Start/End: Original strand, 25105175 - 25105409
Alignment:
Q  132 gtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaa 231  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  25105175 gtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgggaaattgtatggagttgttgaactaaatgatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaa 25105273  T
Q  232 ttgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgta 330  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  25105274 ttgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagatgatcagtgta 25105373  T
Q  331 attggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25105374 aatggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 25105409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34558790 - 34558581
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||| || || |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34558790 aactatatgatgcagttgaagttgtctaatgaatacatgttaatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgagtgtgtgg 34558691  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34558690 atgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaaatggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 34558592  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  34558591 tggtctttgct 34558581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 61 - 395
Target Start/End: Original strand, 4146823 - 4147162
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||  |  |||  |||||||    |||||||||||||||  |||||||| ||     
T  4146823 gattagttgtatatgtttgaatgaagatatgtgagtaatggtaa-gtgttagaggtgacgtttatcacacggtgttgtattttccat-tttacttggatg 4146920  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaatt 259  Q
    |||| |  |||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4146921 gtgatatattgtgtaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaatt 4147020  T
Q  260 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg- 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4147021 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatacaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgttcttttacattgtgttgg 4147120  T
Q  359 -----ttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
          | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4147121 catatgtatatgtcgagtagtttgcattattgggtctttgct 4147162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 6229780 - 6230075
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| || || | ||  |  ||||||||| ||  | |||||||||||||||  |||||||| ||     
T  6229780 gattagttgtatatgtttgaatgtagatatgtgagtaatggtaat-tgttagaggtgatatttaacacaaggtgttgtattttccat-tttacttggatg 6229877  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattg 260  Q
    |||| || ||||   |||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6229878 gtgataaattgtgcaaagttgatgaattatagaatatagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatatttggtgatgactcttaattg 6229977  T
Q  261 aataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6229978 aataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttttataatgcaattgttgttgaagttgaacgatgtaattggaggtgtacttttatattgtgttg 6230075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 183 - 358
Target Start/End: Original strand, 4163450 - 4163626
Alignment:
Q  183 tgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttgg-tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtg 281  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4163450 tgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgatattttgatgatgactcttaattgaataatgacatgttgattggg 4163549  T
Q  282 tggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4163550 tggatgtaaatgctttataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 4163626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 132 - 395
Target Start/End: Original strand, 14816912 - 14817181
Alignment:
Q  132 gtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaa 231  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| || |||| || |||| | |||||| |||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||    
T  14816912 gtgttgtatttttcat-tttacttggatggtgataaattgtgtaaagttgatgaactatagaacatagttgaagttgatttatgaatatatgttgatgaa 14817010  T
Q  232 ttgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgta 330  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||    
T  14817011 ttgtgatattttggtgatgactcttaaatgaataatgacatgttgatcgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgccgttgaagttgaacaatata 14817110  T
Q  331 attggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14817111 attggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 14817181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 240 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17203530 - 17203376
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17203530 tttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggt 17203431  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  17203430 gtacttttacattgtgttgttgtaagttgaggag-ttgcattatttggtctttgct 17203376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12020804 - 12020661
Alignment:
Q  251 ctcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttaca 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12020804 ctcttaaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgctcgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtacttttaca 12020705  T
Q  351 ttgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||| ||||    
T  12020704 ttgtgttgttgtaagttgtggag-ttgcattatttggtctttgct 12020661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15549399 - 15549259
Alignment:
Q  224 ttgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttga 322  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15549399 ttgatgaattgtgatattttggtggtgatacttaattgaataatgacatgttggttgtgttgatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttggagttgt 15549300  T
Q  323 gcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15549299 acaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgta 15549259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8603542 - 8603428
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  8603542 tttggtgatgactcttaattgaataatgtcatgttgattgcgtggacgtaaatacttgataatgcaatcgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggt 8603443  T
Q  340 gtacttttacattgt 354  Q
    |||||||||||||||    
T  8603442 gtacttttacattgt 8603428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 17759761 - 17759873
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17759761 tggtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 17759859  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  17759860 tacttttacattgt 17759873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 19061081 - 19061193
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19061081 tggtgatgactcttaattgaattttgacttgattgattgtgtg-acgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 19061179  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  19061180 tacttttacattgt 19061193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8603755 - 8603617
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  8603755 tagtttgatatgattatgtgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttct-cctttacttggattgtg 8603657  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8603656 agaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttga 8603617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 5229186 - 5229322
Alignment:
Q  104 atgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5229186 atgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaacaatatgatatagttga 5229284  T
Q  204 agtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
     || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  5229285 tgtcgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 5229322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17392195 - 17392074
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatg--cttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  17392195 tggtgatgactcttatttgaattgtgactttttgattgtgtggacgtaaatatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaaatggaagt 17392096  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttg 361  Q
    |  || ||||||||||||||||    
T  17392095 gatctcttacattgtgttgttg 17392074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27050588 - 27050475
Alignment:
Q  239 atttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagg 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||| ||   |||||||| ||||||    
T  27050588 atttggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattggtggtgaa-ttactcaatgtaaatggagg 27050490  T
Q  339 tgtacttttacattg 353  Q
     ||||||||||||||    
T  27050489 ggtacttttacattg 27050475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11401664 - 11401559
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  11401664 ttgaatatgatgtttatcataatgtgctgtgttttct-cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgataaagttgatgttg 11401566  T
Q  209 attaatg 215  Q
    |||||||    
T  11401565 attaatg 11401559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Original strand, 5229398 - 5229495
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  5229398 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 5229495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 144
Target Start/End: Original strand, 14181125 - 14181227
Alignment:
Q  43 taccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtatt 141  Q
    |||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  14181125 taccttataaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatt 14181224  T
Q  142 ttc 144  Q
    |||    
T  14181225 ttc 14181227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17385704 - 17385633
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaa 317  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  17385704 tgatgactctta-ttgaattatgacttgttgattgtatggatgtaaatacttgataatgcaaatgttggtgaa 17385633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 319
Target Start/End: Original strand, 38377137 - 38377212
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||| |||||    
T  38377137 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgaaattattgtcgaagt 38377212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41660453 - 41660382
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41660453 tgatgactcttaatagaattatgacctgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 41660382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 98
Target Start/End: Original strand, 14816804 - 14816878
Alignment:
Q  24 aatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaa 98  Q
    ||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14816804 aatgattcttaaggccaattactttacaatcctttgtgattagttgtatatgtttgaatgaagatatgtgagtaa 14816878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6446
Alignment:
Q  21 aaaaatgattctttga-gccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgat 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6818 aaaaatgattctttaaagccaaataccttataatcttttgtcaatagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgat 6719  T
Q  120 atttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaata 219  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||          |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  6718 atttatcataaggtgttgtattttcctcttttacttgtattatgaaaagttgt----------tgaactatatgatatacttggagtggattaatatata 6629  T
Q  220 catattgattaattgtggtat-ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaag 318  Q
    ||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6628 catgttgatgaattatgatatgttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtatggatgtaaattcttgataatgcaattgttgttgaag 6529  T
Q  319 ttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6528 ttgagaaatgtaattggaggtgtacttttacactgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 6446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 385
Target Start/End: Original strand, 26560912 - 26561261
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||  |||||||  | ||||    
T  26560912 agccaattaccttataatccattgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatcacaaggtgt 26561011  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgt 235  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||| || ||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26561012 tgtattttcctcttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtggttgaactataa-atatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgt 26561110  T
Q  236 ggtat-ttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattg 334  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26561111 gatatgttggtgatgactcttaattgaataacgacatgttgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattg 26561210  T
Q  335 gaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26561211 gaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgttgagtagtttgcattattg 26561261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 395
Target Start/End: Original strand, 5622553 - 5622913
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaag-tg 134  Q
    |||||| | ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||  ||||||| |||| ||    
T  5622553 agccaattgccttataatccattgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaggtgttgaatgtgaggtttatca-caagatg 5622651  T
Q  135 ttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattg 234  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||| || ||||   ||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  5622652 ttgtattttcctcttttacttggatggtgacaaattgtgcaaagtgattgaactatagaatatagttgaagttgatttatgaatacatgttgatgaattg 5622751  T
Q  235 tggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaatt 333  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5622752 tgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaatt 5622851  T
Q  334 ggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5622852 ggagatgtacttttacattgtgttggtgtatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 5622913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24083091 - 24082827
Alignment:
Q  132 gtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaa 231  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||| || || ||||| ||    
T  24083091 gtgttgtattttccat-tttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttaattaatgattatatgttgatgaa 24082993  T
Q  232 ttgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgta 330  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24082992 ttgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgta 24082893  T
Q  331 attggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtct 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24082892 attggaggtgtacttttacattgtgttgatgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgggtct 24082827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6455726 - 6455386
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  | |||||  || |||  | ||||   | |||||||||||||  |||||||||  ||     
T  6455726 gattagttttatatgtttgaatgaagatatatgagtaaatggtaagtcttagatgtgacgtatatcccaaggtgttgtattttct-cctttactttgatg 6455628  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaatt 259  Q
    |||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6455627 gtgataaattgtacaaagttgatgaactataaaatataattgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaatt 6455528  T
Q  260 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||     
T  6455527 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggatgtgtactcttacattgcgttgg 6455428  T
Q  360 tg------tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6455427 tgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 6455386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 132 - 350
Target Start/End: Original strand, 33627605 - 33627823
Alignment:
Q  132 gtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaa 231  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  33627605 gtgttgtattttct-cctttacttgtattatgaaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagttgattaataaatacatgttgatgaa 33627703  T
Q  232 ttgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgta 330  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33627704 ttgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgactgtgtggacgtaaatactggataatgcaattgtggttgaagttgatcaatgta 33627803  T
Q  331 attggaggtgtacttttaca 350  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  33627804 aatggaggtgtacttttaca 33627823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29913147 - 29912765
Alignment:
Q  19 tcaaaaatgattctttgagccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatga 118  Q
    |||||||||||||||| || | |||  |||| | || |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | || ||  |  |||    
T  29913147 tcaaaaatgattctttaaggccaattgcttacattcctttgtgattagttgtatatgtttgaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgtttgaggtga 29913048  T
Q  119 tatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaat 218  Q
      |||||||  | |||||||||||||||  |||||||| ||  ||| || || |   |||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  29913047 cgtttatcagaaggtgttgtattttccat-tttacttggatgttgataaattatgcaaagttcatgaactataaaatatagttgaagttgattaatgaat 29912949  T
Q  219 acatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaa 317  Q
    | || ||||| ||||||| ||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29912948 atatgttgatgaattgtgatattttggggacgactcttaatggaatgatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaa 29912849  T
Q  318 gttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29912848 gttgaacaatgtaattgtaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtctttgct 29912765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 363
Target Start/End: Original strand, 21224040 - 21224154
Alignment:
Q  249 gactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtactttta 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21224040 gactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtactttta 21224139  T
Q  349 cattgtgttgttgta 363  Q
    |||||||||||||||    
T  21224140 cattgtgttgttgta 21224154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 240 - 354
Target Start/End: Original strand, 14343085 - 14343199
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  14343085 tttggtgataactcttaattgaataatgacatgttgattgtgttgacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagat 14343184  T
Q  340 gtacttttacattgt 354  Q
    |||||||||||||||    
T  14343185 gtacttttacattgt 14343199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21108394 - 21108292
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtac 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21108394 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgtac 21108295  T
Q  344 ttt 346  Q
    |||    
T  21108294 ttt 21108292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 18532161 - 18532250
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18532161 ttgtgtggacgtaattacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 18532250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11965080 - 11964920
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |  ||   |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  11965080 tttatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaa 11964982  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgatt 229  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||| ||| || ||||||    
T  11964981 attgtatgaagttgttgaactaaataatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgatt 11964920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 22055125 - 22055214
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22055125 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggatgtgtacttttacattgtgttgatgtatgt 22055214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 20455174 - 20455305
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  20455174 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaactgaatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttg 20455272  T
Q  209 attaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  20455273 attaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 20455305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Original strand, 14342799 - 14342937
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | || ||| ||| ||||||    
T  14342799 tagtttgatgtgattaaatgaagatatgtgggtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtatttt-ctccattaattgaattgtg 14342897  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | || | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14342898 agaaatggtatggagttgttgaacaatatgatatagttga 14342937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21108635 - 21108505
Alignment:
Q  72 tatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttg 171  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||  |     
T  21108635 tatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttaccataaggtgttgtattttct-cctttacttggattgtgagaaagta 21108537  T
Q  172 tatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21108536 tatggagttgttgaactatatgatatagttga 21108505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 203
Target Start/End: Original strand, 24226614 - 24226756
Alignment:
Q  60 agattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtat 159  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |  ||   |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||  |||||||||| ||    
T  24226614 agattagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttttactttct-cctttacttgaat 24226712  T
Q  160 tgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24226713 tgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttga 24226756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11964795 - 11964720
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11964795 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 11964720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 20833158 - 20833279
Alignment:
Q  80 aatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagt 179  Q
    ||||||||| |||||  |||||| |  | ||| |||||||||||||||| |  || |||||||||   ||||||||||||||||| || |  |||| |||    
T  20833158 aatgaagatgtgtgatgaattgttaaatgttggatatgatatttatcataagatgatgtattttct--ctttacttgtattgtgagaaataatatggagt 20833255  T
Q  180 tgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20833256 tgttgaactatatgatatagttga 20833279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23414263 - 23414108
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| | ||  |||||||||| ||||| || | |||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||    
T  23414263 tttatttgattaaattaagatatttgaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggaatgtgagaa 23414165  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatat 224  Q
      |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  23414164 agtgtatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatatatat 23414108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 337
Target Start/End: Original strand, 20455419 - 20455513
Alignment:
Q  243 ggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 337  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  20455419 ggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgccattgttgttg-aggtgatcaatataattggag 20455513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 306
Target Start/End: Original strand, 24851787 - 24851853
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaa 306  Q
    ||||||||||||||||   |  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24851787 tttggtgatgactcttttgttgattatgacttgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaa 24851853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 24226793 - 24226861
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgt 313  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24226793 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 24226861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32351155 - 32350832
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||| |||  |||||||  | ||||    
T  32351155 agccaattaccttataatccattgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgttgaatgtgaggtttatcacaaggtgt 32351056  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgt 235  Q
    |||||||||| | ||||| || || |||| || ||||   |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32351055 tgtattttcctcttttacgtggatggtgacaaattgtgcaaagtggttgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgt 32350956  T
Q  236 ggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattg 334  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32350955 gatattttggagatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggacgtaaatacttggtaatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattg 32350856  T
Q  335 gaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32350855 gaggtgtacttttacattgtgttg 32350832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Original strand, 22463244 - 22463514
Alignment:
Q  51 aatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctt 150  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  22463244 aatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcctt 22463343  T
Q  151 tacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggta-tttggtgatg 249  Q
    |||||| ||||||| || ||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22463344 tacttggattgtgagaaattgtgcgaaggttttgaactataggatatagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatg 22463443  T
Q  250 actcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagtt 320  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22463444 actcttatttgaataacaacatgttgattgtgtggacgtagatacttgataatgcaattgttgttgaagtt 22463514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 240 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25650019 - 25649870
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25650019 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattcgaggt 25649920  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtc 389  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25649919 gtaattttacattgtgttcttgtatgttgagtagtttgcattattgggtc 25649870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 77 - 358
Target Start/End: Original strand, 18630776 - 18631056
Alignment:
Q  77 ttgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatga 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | || ||| || |||| |||||||  | |||||||||||| ||  |||||||| || |||| || ||||   |    
T  18630776 ttgaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgttggatgtgatgtttatcacaaggtgttgtattttacat-tttacttggatggtgataaattgtgcaa 18630874  T
Q  177 agttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttga 276  Q
    ||||| ||||||||   |||||| | |||| |||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18630875 agttgatgaactatggaatatagctaaagttgattaatgaatatatgttgatgaattatgatatttggtgatgattcttaattgaataatgacatattga 18630974  T
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18630975 ttgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttg 18631056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 208 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29604462 - 29604288
Alignment:
Q  208 gattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaa 306  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  29604462 gattaatgaatatatgttgatgaattatgatattttggtggtgactcttaattaaataatgacatgttgattgtgtggatgcaaatatttgataatgcaa 29604363  T
Q  307 ttgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcatt 381  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  29604362 ttgttgttgaagttgtacactgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtatatgttgagtagttttcatt 29604288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 224 - 368
Target Start/End: Original strand, 22363499 - 22363644
Alignment:
Q  224 ttgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttga 322  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||     
T  22363499 ttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataattcaattttggttgaagttgt 22363598  T
Q  323 gcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttg 368  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22363599 acaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttgtaagttg 22363644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21621991 - 21621868
Alignment:
Q  240 tttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21621991 tttggtgatgactattaattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgctcgatagtgcaattgttgttgaagttgtgaaatgtaattggaggt 21621892  T
Q  340 gtacttttacattgtgttgttgta 363  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21621891 ttacttttacattgtgttgttgta 21621868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25918539 - 25918416
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtact 344  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25918539 tgataactcttaattgtataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatacttaataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtctact 25918440  T
Q  345 tttacattgtgttgttgtatgttg 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  25918439 tttacattgtgttgttgtaagttg 25918416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 354
Target Start/End: Original strand, 11374178 - 11374290
Alignment:
Q  243 ggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11374178 ggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggatataaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtgt 11374277  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
    |||||||||||||    
T  11374278 acttttacattgt 11374290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 31162210 - 31162322
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31162210 tggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtggaagtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtga 31162309  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
     || |||||||||    
T  31162310 tctcttacattgt 31162322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 29161836 - 29161949
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29161836 tggtgatgactcttaatttaattatgactttattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttgaagttgatcattgtaaatggaggtg 29161935  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  29161936 tacttttacattgt 29161949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 236
Target Start/End: Original strand, 17084435 - 17084561
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  17084435 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-catttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttg 17084533  T
Q  209 attaatgaatacatattgattaattgtg 236  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  17084534 attaatgcatatatgttgattgattgtg 17084561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Original strand, 15006013 - 15006098
Alignment:
Q  281 gtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15006013 gtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttgaagttgatcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattggtgtatgt 15006098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16375232 - 16375120
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||     
T  16375232 tggtgatgactcttatttgaattatgacttgttgattatgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgctcaatgtaaatgaaggtga 16375133  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
     || |||||||||    
T  16375132 tctcttacattgt 16375120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 5485657 - 5485768
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||  | | |||||||| |||| ||||    
T  5485657 tggtgatgtctcttatttgaattatgacttgttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggatgtgt 5485755  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
    |||||||||||||    
T  5485756 acttttacattgt 5485768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 203
Target Start/End: Original strand, 29161459 - 29161617
Alignment:
Q  43 taccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattt 142  Q
    ||||||||||||||||   | ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| | |||  ||||||    
T  29161459 taccttataatcttttgtaaatagctttatgtgactaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattt 29161558  T
Q  143 tccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | | |||||||||| | ||||||||  | |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29161559 t-ctcctttacttgga-tgtgaaaaagtatatggagttgtcgaactatatgatatagttga 29161617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23220786 - 23220659
Alignment:
Q  112 aatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggatt 211  Q
    |||||||| |||||||| | |||||  ||||||  |||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23220786 aatatgatgtttatcataatgtgtttcattttct-cctttacttgaattgtgagaaattatatga-gttgttgaactatatgatatagttgatgttgatt 23220689  T
Q  212 aatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    |||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  23220688 aatgcatatatgttgattgattgtgatatt 23220659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 354
Target Start/End: Original strand, 17857741 - 17857821
Alignment:
Q  274 tgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  17857741 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgttcaatgtagttggaggtgatctcttacattgt 17857821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16135333 - 16135253
Alignment:
Q  149 tttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgatt 229  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||||    
T  16135333 tttacttggattgtgagaaattgtatggagttattgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgatt 16135253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 354
Target Start/End: Original strand, 4173002 - 4173112
Alignment:
Q  243 ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgta 342  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||   || |||||    
T  4173002 ggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtatgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaaatgatgtgta 4173100  T
Q  343 cttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||    
T  4173101 cttttacattgt 4173112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16135128 - 16135053
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16135128 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatatttgataatgcaattgttgttga 16135053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34965751 - 34965658
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  34965751 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtgaacgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 34965658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Original strand, 31162088 - 31162164
Alignment:
Q  107 tcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttg 184  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  31162088 tcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttgaattgtgagaaactgtatgaagttgttg 31162164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 260
Target Start/End: Original strand, 33539663 - 33539750
Alignment:
Q  176 aagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaat--gaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattg 260  Q
    |||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33539663 aagttgatgaactatagaatatagatgaagttgattaatatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattg 33539750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 354
Target Start/End: Original strand, 4228611 - 4228721
Alignment:
Q  243 ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgta 342  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||   || |||||    
T  4228611 ggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgtacgtaaatagttgataatgcaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaaatgatgtgta 4228709  T
Q  343 cttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||    
T  4228710 cttttacattgt 4228721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19853040 - 19852973
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttg 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  19853040 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttg 19852973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21930741 - 21930666
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  21930741 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaataattgataatgtaattgttgttga 21930666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16375350 - 16375278
Alignment:
Q  111 gaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttg 184  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  16375350 gaatatgatgtttatcatagtgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttg 16375278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26505881 - 26505802
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttc 144  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  26505881 tagtttgatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatca-aatgtgttgtattttc 26505802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 307
Target Start/End: Original strand, 15482225 - 15482267
Alignment:
Q  265 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaat 307  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15482225 atgacttgttgattatgtggatgtaaatgctttataatgcaat 15482267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 339
Target Start/End: Original strand, 18104827 - 18104892
Alignment:
Q  273 ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||||||    
T  18104827 ttgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtttttg-aggtgatcaatataattggaggt 18104892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34965985 - 34965875
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagt 133  Q
    |||||| |||||||||| |||||   || ||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |  | |||||||||||||||||||| | ||    
T  34965985 agccaattaccttataaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtaaatgaattgttagatgttgaatatgatatttatcataaggt 34965886  T
Q  134 gttgtattttc 144  Q
    ||| |||||||    
T  34965885 gttttattttc 34965875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 11373847 - 11373924
Alignment:
Q  19 tcaaaaatgattctttga-gccaaataccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtga 94  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11373847 tcaaaaatggttctttaaagccaattaccttataaatctttcgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtga 11373924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 302
Target Start/End: Original strand, 23090078 - 23090115
Alignment:
Q  265 atgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataat 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23090078 atgacttgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataat 23090115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22544739 - 22544688
Alignment:
Q  239 atttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaa 291  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22544739 atttgatgatgactcttg-ttgaattatgacttgttgattgtgtggatgtaaa 22544688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Original strand, 98430 - 98639
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98430 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacgtgttgatgaattatgatctttggtgacgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 98529  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  98530 atgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaagtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 98628  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  98629 tggtctttgct 98639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 30018 - 29809
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30018 aactatatgatgtagttgaatttgattaatgaatacatgttgatgaattatgacctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 29919  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29918 atgtaaatgcttggtaatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagta-tttgcattatt 29820  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  29819 tggtctttgct 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 68414 - 68205
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  68414 aactacatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgattaatgacatgttgattgtgtgg 68315  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  68314 acgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttaagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtag-ttgcattatt 68216  T
Q  385 gggtctctgct 395  Q
     ||||| ||||    
T  68215 tggtctttgct 68205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 255745 - 255857
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||     
T  255745 tggtgttgactattatttgaattgtgacttgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttcttcaatgtagttggaggtga 255844  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
     || |||||||||    
T  255845 tctcttacattgt 255857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25133255 - 25132899
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgt 135  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |||||| |||| |||||||  | ||||    
T  25133255 agccaattaccttataatccattgtgaatagctttatatgattgaatgaagatgtgtgagtaaatgttaagtgttgaatgtgatgtttatcacaaggtgt 25133156  T
Q  136 tgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgt 235  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||| ||||| |   |||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  25133155 tgtattttcctcctttacttggatggtgataagttatgaaaagtggttgaacaatagaatatagttgaagttgattaatgaatacctgatgatgaattgt 25133056  T
Q  236 ggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattg 334  Q
    | ||||| ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25133055 gatattttggtgatgactct-----gaataatgacatgttggttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaattg 25132961  T
Q  335 gaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttgagtagtttgcattattgggtct 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25132960 gaggtgtacttttacattgtgttggtgcatgtatatgttgagtagtttgcattattgagtct 25132899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24881654 - 24881314
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | || ||  |  |||  |||||||  | |||||||||||||||  |||||||| ||     
T  24881654 gattagttgtatatgtttgaatgaagatatgtgagtaaatggtaagtgttagaggtgacgtttatcacaaggtgttgtattttccat-tttacttggata 24881556  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaatt 259  Q
     ||| || |||| | | |||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | |    
T  24881555 ttgataaattgtgtaaggttgatgaactatagaacatagttgaagttgattaatgattatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttgaat 24881456  T
Q  260 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg- 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24881455 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgatgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgg 24881356  T
Q  359 -----ttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24881355 tgcatgtgtatgttgagtagttggcattattgggtctttgct 24881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 368
Target Start/End: Original strand, 40641631 - 40641743
Alignment:
Q  256 aattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtg 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  40641631 aattgaataatgacatgttggttgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattgaaggtgtacttttacactttg 40641730  T
Q  356 ttgttgtatgttg 368  Q
    |||||||| ||||    
T  40641731 ttgttgtaagttg 40641743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6093692 - 6093580
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6093692 tggtgatg-ctcttaattgaattatgacttgattgattgtgtgggtgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggaggtg 6093594  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  6093593 tacttttacattgt 6093580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6094010 - 6093831
Alignment:
Q  22 aaaatgattctttga-gccaaataccttataatcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgata 120  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  6094010 aaaatgattctttaaagccaattaccttataatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaggtgttgaatatgatg 6093911  T
Q  121 tttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 201  Q
    |||||||| | | |  ||||||| | |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6093910 tttatcataatgcgaagtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagtt 6093831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18534990 - 18534785
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtg 134  Q
    |||||| |||||||||| |||||   || ||| |||||||||||  |||||||||||||| |  ||   |||| |||||||||||  ||||||| | |||    
T  18534990 agccaattaccttataaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgttttacatgtgttgaatatgatgattatcataatgtg 18534891  T
Q  135 ttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattg 234  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||| ||||    
T  18534890 ttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatgttgattgattg 18534792  T
Q  235 tggtatt 241  Q
    || ||||    
T  18534791 tgatatt 18534785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Original strand, 9782201 - 9782314
Alignment:
Q  208 gattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaat 307  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9782201 gattaatgaatgtgtgttgatgaattgtgataattggtggtgactcttcaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgcaat 9782300  T
Q  308 tgttgttgaagttg 321  Q
    ||||||||||||||    
T  9782301 tgttgttgaagttg 9782314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 273 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19665475 - 19665390
Alignment:
Q  273 ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19665475 ttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttagagttgagcaatgtaactagaggtgtacttttacattgtgttg 19665390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 24342740 - 24342829
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgt 366  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24342740 ttgtgtggacgtaattacttgataatgcaattgttgttggagttgtgcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttggtgtatgt 24342829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22331807 - 22331692
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  22331807 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtatcttct-cctttacttgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttg 22331709  T
Q  209 attaatgaatacatatt 225  Q
    ||||||| ||| |||||    
T  22331708 attaatgcatatatatt 22331692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Original strand, 24561905 - 24562079
Alignment:
Q  66 gttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaa 165  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||| |  | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  24561905 gtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgttagatgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgag 24562003  T
Q  166 aagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
    || | |||||| ||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  24562004 aaatagtatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 24562079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43641850 - 43641712
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| |  ||   |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  43641850 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtg 43641752  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43641751 agaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttga 43641712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 395
Target Start/End: Original strand, 9782217 - 9782399
Alignment:
Q  224 ttgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgag 323  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  9782217 ttgatgaattgtgataattggtggtgactcttcaatgaataatgacatgttggttgtgtggatgtgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgta 9782316  T
Q  324 caatgtaat------------tggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    || |||  |            |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||| ||||    
T  9782317 cattgtgttagacgcattgtgtggatgtgtacttttacattgtgttgttgtaagttgtgaag-ttgcattatttggtctttgct 9782399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20272243 - 20272130
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||  |||||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20272243 tggtgatgactcttatttgaattatgacttgattgattgagtggacataaatatttgataatgaaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatgaaggtg 20272144  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  20272143 tacttttacattgt 20272130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45618489 - 45618405
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatga 194  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  | |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45618489 ttgaatatgatttttatcataatgtgttgtattttct-cttttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatga 45618405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 338
Target Start/End: Original strand, 45619359 - 45619455
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggagg 338  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  45619359 tggtgatgactcatatttgaattgtgacttgttgattgtgtagacgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttaatcaatgtaaatggagg 45619455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 339
Target Start/End: Original strand, 24562193 - 24562291
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  24562193 tggtgatgacttttgattgatttatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaaggtgatcaatataaatggaggt 24562291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Original strand, 19434610 - 19434748
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| |  ||   || | ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  19434610 tagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatatgttgaatatgatgtttatcataatgtattgtattttct-cctttacttgaattgtg 19434708  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | || ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||    
T  19434709 agaaattgtaaggagtttttgaactatatgatgtagttga 19434748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18534672 - 18534598
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18534672 tggtgatgactcttaattgatttatgacttgattgattgtgtggacgt-aatacttgataatgcaattgttgttga 18534598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Original strand, 39668570 - 39668633
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaa 306  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39668570 tggtgatgactctttgtt-aattatgacctgttgattgtatggatgtaaatgcttgataatgcaa 39668633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24276725 - 24276632
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |  |||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  24276725 tgatgactcttaattgaattatgacttaattgttgtctggtcgtaaatacttgataatgcaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 24276632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43641665 - 43641597
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgt 313  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43641665 tgatgactcttatttgaattatgacttgaatgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgt 43641597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 390
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1549
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtg 283  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1344 aactatatgatgtagttgaagttgattattgaatatatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtgtg 1443  T
Q  284 gatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattat 383  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1444 gatgtaaatgcatgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatttaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttaagtag-ttgcattat 1542  T
Q  384 tgggtct 390  Q
    | |||||    
T  1543 ttggtct 1549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 384
Target Start/End: Original strand, 198640 - 198826
Alignment:
Q  197 tagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgctt 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  198640 tagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgttt 198739  T
Q  297 aataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattatt 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  198740 gataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttacattgtattgttgaatgttgagtag-ttgcattatt 198826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12360 - 12170
Alignment:
Q  185 aactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 284  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12360 aactatatgatgtagttgaagttgattaatgaatacatgttgatgaattatgatctttagtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtgg 12261  T
Q  285 atgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtt 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12260 atgtaaatgcttgataatgcaattgttgttatagttgagcaatgcaattggaggtgtactttgacattgtgttgttatatgttgagtagtt 12170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1519 - 1293
Alignment:
Q  176 aagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgtt 274  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1519 aagttgatgaactatagaatatagttgaagttgactaatgaatacatgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaattgaataatgacttctt 1420  T
Q  275 gattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttg------tatgttg 368  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||      |||||||    
T  1419 gattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaattggaggtgtacttttgcattgtgttggtgtatgtatatgttg 1320  T
Q  369 agtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1319 agtagtttgcattattgagtctttgct 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 21405 - 21516
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||  | ||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||| ||||  | | |||||||| ||||| |||    
T  21405 tggtgatgattcttatttgaattgtgatttattgattgtgtggacgtaaatacttgataataaaattgttggtgaa-ctaatcaatgtaaatggagatgt 21503  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
    | |||||||||||    
T  21504 aattttacattgt 21516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 366
Target Start/End: Original strand, 3107 - 3413
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | || ||| || |||  |||||||  | |||||||||||||| | |||||||  ||     
T  3107 gattagttttatatgtttgattgaagatatgtgagtaaatgataagtgttggatgtgacgtttatcacaaggtgttgtattttcctcttttacttagatg 3206  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaatt 259  Q
    |||| || ||||   |||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3207 gtgataaattgtgcaaagtcgataaactatagaatatagttgaagttgattaatcaatacgtgttgatgaattgtgatattttggtgatgactcttaatt 3306  T
Q  260 gaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgt 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3307 gaataatgacatgatgattgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttgaagttgaacaatgtaattgaaggtgtacttttacattgtgttgg 3406  T
Q  360 tgtatgt 366  Q
    |||||||    
T  3407 tgtatgt 3413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 342
Target Start/End: Original strand, 2099 - 2385
Alignment:
Q  56 tttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttactt 155  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  | || ||| || |||  |||||||  | |||||||||||||||  |||||||    
T  2099 tttatgattagttttatatgtttgaacgaagatatgtgagtaaatgataagtgttggatgtgacgtttatcacaaggtgttgtattttccat-tttactt 2197  T
Q  156 gtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggta-tttggtgatgactct 254  Q
    | |  |||| || ||||   |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  2198 ggaaggtgataaattgtgcaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgattaatgaatatatgttgatgaattgtgataattttgtgatgactct 2297  T
Q  255 taattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgta 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2298 taattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgaacaatgtaactggaggtgta 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 52156 - 52009
Alignment:
Q  247 atgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttt 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52156 atgactcttaagtgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtttacttt 52057  T
Q  347 tacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtctctgct 395  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  52056 tacattgtgtagttgtacgttgagtag-ttgcattatttggtctttgct 52009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 23185 - 23480
Alignment:
Q  61 gattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtatt 160  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |   | || ||| || |||| |||||||  | |||||||||||||||  |||||||| |      
T  23185 gattagttcgatatgtttgaatgaagatatgtgagtaaatagtaagtgttggatgtgatgtttatcacaaggtgttgtattttccat-tttacttggaag 23283  T
Q  161 gtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttggtgatgactcttaattg 260  Q
    | || || ||||   |||||| ||||||||   |||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || | || |||||| ||||||||||||||||    
T  23284 gagataaattgtgcaaagttgatgaactatggaatatagttaaagttgattaatgaatatatgttgatgaagtatgatatttg-tgatgactcttaattg 23382  T
Q  261 aataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23383 aataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggaggtgtacttttagattgtgttg 23480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 238 - 358
Target Start/End: Original strand, 19095 - 19215
Alignment:
Q  238 tatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  19095 tatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggat 19194  T
Q  338 gtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19195 gtgtacttttacattgtgttg 19215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 238 - 358
Target Start/End: Original strand, 28671 - 28791
Alignment:
Q  238 tatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggag 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  28671 tatttggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaattgttgttggagttgaacaatgtaactggat 28770  T
Q  338 gtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28771 gtgtacttttacattgtgttg 28791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 224 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 612 - 467
Alignment:
Q  224 ttgattaattgtggtatttggtga-tgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttga 322  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  612 ttgatgaatggtgatatttggtgaatgactcttaattgaataatgacatgttggttgtatggatgtaaatgtttaataatgcaattgttgttggagtttt 513  T
Q  323 gcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttg 368  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  512 acaaagtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtaagttg 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5604 - 5438
Alignment:
Q  224 ttgattaattgtggtattt-ggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttga 322  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5604 ttgatgaattgtgatattttggtggtgactcttaattgaataatgacacgatggttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgt 5505  T
Q  323 gcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagtttgcattattgggtct 390  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||    
T  5504 acaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgtaagttgtggag-ttgcattatttggtct 5438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 331
Target Start/End: Original strand, 1056 - 1210
Alignment:
Q  176 aagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatttgg-tgatgactcttaattgaataatgacatgtt 274  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1056 aagtggttgaactatagagtatagttgaagttgattaatgaatacatgatgatgaattgtgatattttgatgatgact--taattgaataatgacatgtt 1153  T
Q  275 gattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaa 331  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1154 gattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaa 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11349
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  11462 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggaggtg 11363  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  11362 tacttttacattgt 11349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11716 - 11577
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||| | | ||| |   || ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  11716 tagtttgatatgattatatgaagatatgtcaattatttttgggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttttattttct-cctttacttggattgtg 11618  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaa 204  Q
    | ||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  11617 agaaagtgtatgaagttgttgagttatattatatagttgaa 11577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1472
Alignment:
Q  104 atgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1336 atgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 1434  T
Q  204 agtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
     || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  1435 cgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 1472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 5716 - 5852
Alignment:
Q  104 atgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5716 atgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttga 5814  T
Q  204 agtggattaatgaatacatattgattaattgtggtatt 241  Q
     || |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||    
T  5815 cgttgattaatgcatatatgttgattgattgtgatatt 5852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 10678 - 10791
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  10678 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgatgatgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaaaggagatg 10777  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  10778 tacttttacattgt 10791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 204
Target Start/End: Original strand, 8262 - 8400
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||||||| | ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  8262 tagtttgatatgattacatgaatatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtg 8360  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaa 204  Q
    | ||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  8361 agaaagtgtatgaagttgtt-agctatattatatagttgaa 8400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4985 - 4851
Alignment:
Q  68 tttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaa 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||    
T  4985 tttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaa 4887  T
Q  168 gttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4886 agtgtatgaagttgttgagctatattatatagttga 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4789 - 4711
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4789 tggttatgactcttaattgatctatgacttgattgattgtgtggacataaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 50390 - 50278
Alignment:
Q  277 ttgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttgttgtatgttgagtagttt 376  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | || ||    
T  50390 ttgtgtggatatgaatgcttgataatgcaattgttgttgaagttgtacaatgtaattggaggtgtattgttacattgtgttgttgtaagttgtggag-tt 50292  T
Q  377 gcattattgggtct 390  Q
    |||||||| |||||    
T  50291 gcattatttggtct 50278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 358
Target Start/End: Original strand, 105965 - 106049
Alignment:
Q  274 tgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  105965 tgattgtgtggatgtaaatacttgataatgcaaatgttgttggagttgaataatgtaactggaggtgtacttttacattgtgttg 106049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Original strand, 14928 - 15033
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtgg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14928 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttct-cctttacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgtcg 15026  T
Q  209 attaatg 215  Q
    |||||||    
T  15027 attaatg 15033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 15213 - 15325
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttg-attgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |  | |||||||| ||||||||    
T  15213 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgatggattgtgtggaagtaaatactttataattcaattgttggtgaacta-atcaatgtaaatggaggtg 15311  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  15312 tacttttacattgt 15325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9628 - 9532
Alignment:
Q  244 gtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  9628 gtgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttgaagtcgatcaatataaatggaggt 9532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9901 - 9795
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtga-aaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtg 207  Q
    ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9901 ttgaatatgatgtttaccataatatgttgtattttct-cttttacttgaattgtgagaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgtt 9803  T
Q  208 gattaatg 215  Q
    ||||||||    
T  9802 gattaatg 9795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 1538 - 1651
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||| || |||||| |||||| |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  1538 tggtgatgactcctagttgaattttgacttgattgattatgtggacgtaattacttgatattgcaattgttgttgaagttgatcaatgtaaatggatgtg 1637  T
Q  341 tacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||    
T  1638 tacttttacattgt 1651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1393
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    ||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1300 ttgaatacgatgtttatcatggtgtgttgtattttct-cctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttga 1393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 420 - 326
Alignment:
Q  246 gatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| || ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  420 gatgactcttatttgaattgtgacttgatgattatgtggacgtaaatactttataatgcaattgttgttgaagttgattaatgtaaatggaggtg 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12562 - 12464
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  12562 tggtgatgactcttatttgaattgtgacttgttgattgtgtgcacgtaaatacttgataatgcaattgattttgaagatgatcaatgtaaatggaggtg 12464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 5201 - 5294
Alignment:
Q  109 ttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  || ||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5201 ttgaataagatgtttatcataatgtgttgtattttct-ccattaattgaattgtgagaaatggtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 301
Target Start/End: Original strand, 5520 - 5580
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataa 301  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  5520 tggtgaagactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtaaatacttgataa 5580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 44935 - 45007
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44935 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgattgtgtggacgtgaatacttgataatgcaattgttgttga 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 242 - 319
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2376
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatg-ttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2299 tggtgatgactcttaattgaattatgacttgattaattgtgtgga-ctaaatacttgataatgcaattgttgttgaagt 2376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Original strand, 2138 - 2268
Alignment:
Q  64 tagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtg 163  Q
    |||||| |||||| |  |||||||||||||| | ||||| | || |||||||||||  ||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  2138 tagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgat-gttatcataaggtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtg 2235  T
Q  164 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgata 196  Q
    | || |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  2236 agaaataatatgatgttgttgaattatatgata 2268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 130727 - 130634
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||    
T  130727 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgtggttg-aggtgatcaatataattggaggt 130634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 215
Target Start/End: Original strand, 12210 - 12275
Alignment:
Q  150 ttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggattaatg 215  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12210 ttacttgaattgtgagaaattgtatggaattgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatg 12275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 12323 - 12434
Alignment:
Q  242 tggtgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgt 341  Q
    ||||||||||| | | ||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||| |||  ||||||| |||||||||     
T  12323 tggtgatgactatcatttgaattgtgacttgatgtttgtgtggatgtgaatacttgataatgcaattgttgaggaa-ttgttcaatgtagttggaggtga 12421  T
Q  342 acttttacattgt 354  Q
     || |||||||||    
T  12422 tctcttacattgt 12434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 34555 - 34720
Alignment:
Q  36 agccaaataccttataa-tcttttaagattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagt-aattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagt 133  Q
    |||||| |||||||||| |||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||  || | |||||| | || ||||||||||  |||||||| | ||    
T  34555 agccaattaccttataaatctttcgtgattagctttatatgattaaatgaagatatacgaatgaattgttaggtgttgaatatgaagtttatcataaggt 34654  T
Q  134 gttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 201  Q
    |||||||||||   | ||||||| | ||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  34655 gttgtattttc--tccttacttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagtt 34720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 34787 - 34858
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  34787 tgatgactcttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgtaattgttgttga 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 870 - 760
Alignment:
Q  104 atgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |  |||| |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  870 atgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtatttt-ctcctttacttggattgtgagaaagtacatgatgttgttgaacgataggatatagttta 772  T
Q  204 agtggattaatg 215  Q
     || ||||||||    
T  771 tgttgattaatg 760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 85260 - 85189
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||||||||| || || || |  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  85260 tgatgactcttaattgaattataacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatgcaattgttgttga 85189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26398 - 26305
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggt 339  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  26398 tgatgacttttaattgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttgataatccaattgttgttg-aggtgatcaatataattggaggt 26305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 528 - 457
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  528 tgatgactcttaaatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttcataatgcaaatgttgttga 457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5583 - 5512
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  5583 tgatgactcttaaatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttcataatgcaaatgttgttga 5512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4116 - 4045
Alignment:
Q  245 tgatgactcttaattgaataatgacatgttgattgtgtggatgtaaatgcttaataatgcaattgttgttga 316  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  4116 tgatgactcttaaatgaattatgacttgattgttgtgtggacgtaaatacttcataatgcaaatgttgttga 4045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 203
Target Start/End: Original strand, 14006 - 14137
Alignment:
Q  72 tatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgatgtcttgaatatgatatttatcatcaagtgttgtattttccacctttacttgtattgtgaaaagttg 171  Q
    |||||||  |||||||||||||  | ||||  | || ||||||||||| |||||||| |  ||  ||||||| | |||||| ||| ||||||| || | |    
T  14006 tatgattatatgaagatatgtggatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatttgaagtatttttctcctttatttggattgtgagaaatag 14105  T
Q  172 tatgaagttgttgaactatatgatatagttga 203  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14106 tgtgatgttgttgaattatatgatatagttga 14137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 358
Target Start/End: Original strand, 6543 - 6599
Alignment:
Q  301 atgcaattgttgttgaagttgagcaatgtaattggaggtgtacttttacattgtgttg 358  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6543 atgcaattgttgtgga-gttgtacaatgtaactggaagtgtacttttacattgtgttg 6599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 354
Target Start/End: Original strand, 199452 - 199481
Alignment:
Q  325 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  199452 aatgtaattggaggtgtacttttacattgt 199481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University