View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10145_low_1 (Length: 463)

Name: NF10145_low_1
Description: NF10145
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10145_low_1
NF10145_low_1
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-440)||(54331285-54331724)
chr4 (1-441)||(14829153-14829593)
chr4 (1-441)||(34056205-34056645)
chr4 (1-439)||(5271917-5272355)
chr4 (1-441)||(19831039-19831479)
chr4 (1-441)||(37701239-37701681)
chr4 (1-441)||(2776484-2776925)
chr4 (1-441)||(22115693-22116133)
chr4 (1-441)||(33502643-33503079)
chr4 (1-424)||(55998354-55998777)
chr4 (1-441)||(17699384-17699824)
chr4 (1-441)||(28973269-28973710)
chr4 (1-441)||(53342616-53343058)
chr4 (1-441)||(7643434-7643874)
chr4 (1-441)||(23479117-23479548)
chr4 (1-441)||(13628259-13628703)
chr4 (38-441)||(21353291-21353693)
chr4 (9-441)||(17740247-17740681)
chr4 (1-441)||(40622354-40622799)
chr4 (1-441)||(8531023-8531466)
chr4 (1-348)||(38008561-38008909)
chr4 (1-441)||(36857294-36857716)
chr4 (1-439)||(41983875-41984314)
chr4 (1-438)||(47557068-47557504)
chr4 (120-440)||(28134826-28135146)
chr4 (113-441)||(35495298-35495625)
chr4 (1-278)||(36514982-36515259)
chr4 (1-160)||(7847513-7847672)
chr4 (223-364)||(7842621-7842762)
chr4 (340-441)||(38008051-38008152)
chr4 (337-426)||(39742724-39742813)
chr4 (354-441)||(3839360-3839447)
chr4 (354-441)||(26870284-26870371)
chr4 (1-75)||(39742636-39742710)
chr4 (1-61)||(35495243-35495303)
chr4 (66-304)||(56541134-56541372)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (1-441)||(35087465-35087905)
chr3 (1-441)||(50770874-50771314)
chr3 (1-441)||(31368642-31369084)
chr3 (1-441)||(6103753-6104194)
chr3 (1-441)||(16341842-16342283)
chr3 (1-441)||(32755703-32756141)
chr3 (9-426)||(48976886-48977303)
chr3 (1-441)||(49113253-49113692)
chr3 (17-441)||(52853087-52853511)
chr3 (1-441)||(55294408-55294846)
chr3 (1-426)||(54512985-54513409)
chr3 (1-364)||(50741638-50742000)
chr3 (1-441)||(52462558-52463000)
chr3 (1-441)||(11597587-11598030)
chr3 (1-427)||(21699214-21699622)
chr3 (1-441)||(48520667-48521089)
chr3 (192-441)||(51248536-51248785)
chr3 (1-228)||(8242891-8243118)
chr3 (1-293)||(54934151-54934433)
chr3 (1-230)||(40824297-40824526)
chr3 (3-248)||(18741857-18742103)
chr3 (1-135)||(51248797-51248931)
chr3 (1-105)||(23194712-23194816)
chr3 (66-346)||(23936793-23937072)
chr3 (354-441)||(16496077-16496164)
chr3 (363-441)||(40827024-40827102)
chr3 (363-441)||(50741539-50741617)
chr3 (354-441)||(54792945-54793032)
chr3 (365-441)||(11383299-11383375)
chr3 (1-53)||(50802827-50802879)
chr3 (1-53)||(50872998-50873050)
chr3 (2-40)||(2843551-2843589)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-441)||(1072898-1073338)
chr6 (1-441)||(18598620-18599061)
chr6 (1-441)||(34856127-34856564)
chr6 (1-441)||(14887573-14888013)
chr6 (1-441)||(2521337-2521777)
chr6 (1-441)||(17939694-17940132)
chr6 (1-441)||(18311963-18312402)
chr6 (1-441)||(35041265-35041700)
chr6 (1-441)||(30044380-30044820)
chr6 (1-441)||(21799714-21800153)
chr6 (1-441)||(4424657-4425097)
chr6 (1-441)||(22373478-22373916)
chr6 (9-440)||(34321266-34321699)
chr6 (1-395)||(7222528-7222923)
chr6 (1-441)||(33321088-33321527)
chr6 (8-376)||(15275883-15276241)
chr6 (69-364)||(14831766-14832061)
chr6 (1-119)||(11933117-11933235)
chr6 (1-119)||(33814485-33814603)
chr6 (246-441)||(25540245-25540440)
chr6 (1-95)||(25540450-25540544)
chr6 (350-441)||(14831657-14831748)
chr6 (1-37)||(14832059-14832095)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (1-441)||(26821843-26822283)
chr2 (1-441)||(16723978-16724418)
chr2 (1-441)||(33907451-33907894)
chr2 (1-441)||(26827723-26828162)
chr2 (1-439)||(42885601-42886037)
chr2 (1-441)||(30570177-30570619)
chr2 (1-440)||(11706837-11707277)
chr2 (1-441)||(21097922-21098352)
chr2 (9-441)||(18092357-18092791)
chr2 (1-441)||(33663425-33663863)
chr2 (1-439)||(45204648-45205085)
chr2 (1-364)||(36632679-36633042)
chr2 (11-441)||(1514624-1515059)
chr2 (1-287)||(19126313-19126598)
chr2 (1-364)||(45399097-45399450)
chr2 (1-344)||(35285920-35286249)
chr2 (75-426)||(4811785-4812136)
chr2 (229-441)||(30572285-30572499)
chr2 (1-157)||(11448238-11448394)
chr2 (1-171)||(19167487-19167657)
chr2 (1-148)||(27364465-27364612)
chr2 (1-97)||(5252901-5252997)
chr2 (350-438)||(35286318-35286406)
chr2 (350-441)||(36633064-36633155)
chr2 (354-441)||(17092000-17092087)
chr2 (354-441)||(17025815-17025902)
chr2 (354-437)||(17037496-17037579)
chr2 (364-438)||(28379995-28380069)
chr2 (364-426)||(45398980-45399042)
chr2 (385-441)||(19167654-19167710)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (1-441)||(18814415-18814855)
chr1 (1-441)||(34687783-34688223)
chr1 (1-441)||(31619885-31620325)
chr1 (1-441)||(34692311-34692751)
chr1 (1-441)||(41962543-41962984)
chr1 (1-441)||(41829665-41830104)
chr1 (1-441)||(44406556-44406996)
chr1 (1-389)||(52521232-52521620)
chr1 (1-364)||(38844822-38845185)
chr1 (1-441)||(50561237-50561685)
chr1 (1-441)||(52310030-52310470)
chr1 (1-438)||(17671655-17672086)
chr1 (1-439)||(48340527-48340951)
chr1 (56-441)||(47135591-47135982)
chr1 (1-364)||(36682322-36682675)
chr1 (1-364)||(45005053-45005406)
chr1 (8-285)||(10694445-10694722)
chr1 (115-441)||(51965460-51965787)
chr1 (1-336)||(12245509-12245831)
chr1 (77-327)||(16031287-16031527)
chr1 (7-207)||(17709424-17709624)
chr1 (245-335)||(17709621-17709711)
chr1 (354-441)||(13662373-13662460)
chr1 (350-441)||(38845211-38845302)
chr1 (354-439)||(12714675-12714760)
chr1 (350-438)||(16031567-16031655)
chr1 (350-438)||(45004931-45005019)
chr1 (354-441)||(28565683-28565770)
chr1 (354-441)||(28631508-28631595)
chr1 (368-438)||(36681442-36681512)
chr1 (379-441)||(24294725-24294787)
chr1 (380-440)||(39760143-39760203)
chr1 (377-438)||(12245831-12245892)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-441)||(25987-26427)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-441)||(10116-10556)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (1-441)||(7285831-7286271)
chr5 (1-441)||(33610765-33611205)
chr5 (1-441)||(2195319-2195759)
chr5 (1-441)||(3028908-3029349)
chr5 (1-441)||(26320702-26321140)
chr5 (1-441)||(3150229-3150669)
chr5 (1-441)||(38934616-38935056)
chr5 (1-426)||(1851585-1852010)
chr5 (1-441)||(21030262-21030703)
chr5 (1-441)||(27066027-27066466)
chr5 (1-440)||(30689464-30689907)
chr5 (1-441)||(4882426-4882866)
chr5 (2-425)||(3396762-3397188)
chr5 (1-439)||(10511990-10512427)
chr5 (1-441)||(17996719-17997162)
chr5 (1-441)||(34374009-34374445)
chr5 (1-441)||(35539549-35539984)
chr5 (1-441)||(20758100-20758539)
chr5 (1-364)||(20995522-20995884)
chr5 (1-438)||(33706399-33706841)
chr5 (1-441)||(19448157-19448589)
chr5 (1-439)||(20350078-20350529)
chr5 (1-364)||(41781083-41781436)
chr5 (1-364)||(33930055-33930408)
chr5 (1-108)||(12420222-12420329)
chr5 (350-441)||(41780982-41781073)
chr5 (350-438)||(33929951-33930039)
chr5 (350-441)||(20995918-20996009)
chr5 (354-441)||(3210178-3210265)
chr5 (354-441)||(9702406-9702493)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (1-441)||(14078445-14078885)
chr8 (1-427)||(27273179-27273604)
chr8 (1-441)||(33423874-33424314)
chr8 (1-441)||(6477108-6477548)
chr8 (1-441)||(38962101-38962541)
chr8 (1-441)||(38992445-38992885)
chr8 (1-441)||(44599634-44600073)
chr8 (1-441)||(23522275-23522712)
chr8 (1-441)||(38993615-38994056)
chr8 (1-441)||(42810548-42810992)
chr8 (1-368)||(9761273-9761640)
chr8 (1-441)||(41628823-41629261)
chr8 (1-441)||(44382415-44382856)
chr8 (1-441)||(19395177-19395618)
chr8 (1-440)||(3751044-3751486)
chr8 (1-441)||(45293186-45293632)
chr8 (1-441)||(19248040-19248487)
chr8 (1-441)||(19321224-19321671)
chr8 (126-441)||(30826387-30826702)
chr8 (9-364)||(41977508-41977863)
chr8 (78-441)||(41156571-41156935)
chr8 (1-285)||(36597650-36597934)
chr8 (1-364)||(22946415-22946764)
chr8 (1-182)||(22332342-22332523)
chr8 (198-364)||(22332887-22333053)
chr8 (9-153)||(5835816-5835960)
chr8 (116-297)||(12760493-12760672)
chr8 (1-99)||(42785443-42785541)
chr8 (1-98)||(41533474-41533571)
chr8 (350-441)||(22333085-22333176)
chr8 (350-441)||(41977391-41977482)
chr8 (354-441)||(12250167-12250254)
chr8 (1-68)||(30826699-30826766)
chr8 (354-441)||(39444953-39445040)
chr8 (363-441)||(12760407-12760485)
chr8 (350-438)||(22946778-22946866)
chr8 (354-441)||(29433971-29434058)
chr8 (354-438)||(23626312-23626396)
chr8 (342-395)||(36597929-36597982)
chr8 (350-398)||(16668790-16668838)
chr8 (354-441)||(39204563-39204650)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (1-441)||(11500051-11500491)
chr7 (1-441)||(14309045-14309486)
chr7 (1-441)||(8925541-8925974)
chr7 (1-441)||(17469924-17470363)
chr7 (1-441)||(17582851-17583290)
chr7 (1-441)||(23766070-23766510)
chr7 (1-441)||(5962888-5963329)
chr7 (1-441)||(33638305-33638747)
chr7 (1-441)||(42687744-42688186)
chr7 (1-441)||(17482523-17482980)
chr7 (1-441)||(17570234-17570691)
chr7 (1-439)||(27734680-27735118)
chr7 (1-441)||(23299354-23299794)
chr7 (1-364)||(17478181-17478545)
chr7 (1-364)||(17574669-17575033)
chr7 (1-364)||(19521420-19521781)
chr7 (1-439)||(47174647-47175094)
chr7 (14-364)||(33031129-33031479)
chr7 (1-426)||(42826988-42827403)
chr7 (1-364)||(42918130-42918495)
chr7 (191-441)||(9149554-9149805)
chr7 (211-441)||(41262184-41262411)
chr7 (1-178)||(41262010-41262182)
chr7 (1-142)||(9149815-9149956)
chr7 (350-441)||(17478080-17478171)
chr7 (350-441)||(17575043-17575134)
chr7 (350-441)||(19521317-19521408)
chr7 (354-441)||(4481371-4481458)
chr7 (354-441)||(42244840-42244927)
chr7 (354-441)||(42996640-42996727)
chr7 (350-441)||(33030988-33031079)
chr7 (354-441)||(38434534-38434621)
chr7 (350-426)||(42918030-42918106)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (44-441)||(606-1003)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (1-441)||(3047-3486)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (1-441)||(48863-49302)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-441)||(12556-12998)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (1-384)||(190-575)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-356)||(176734-177087)
scaffold0010 (1-364)||(120170-120533)
scaffold0010 (350-398)||(120102-120150)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (1-335)||(660-993)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-344)||(101005-101338)
scaffold0016 (363-438)||(100790-100865)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (196-441)||(10430-10677)
scaffold0079 (1-71)||(10362-10432)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-260)||(11041-11299)
scaffold0032 (1-260)||(4592-4850)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-124)||(14965-15088)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (337-441)||(26673-26777)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (350-441)||(29974-30064)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (354-441)||(52948-53035)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (354-441)||(152135-152222)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 54331285 - 54331724
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331285 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 54331384  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  54331385 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 54331484  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331485 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 54331584  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331585 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 54331684  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattag 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54331685 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattag 54331724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 14829153 - 14829593
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829153 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 14829252  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14829253 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttatcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 14829352  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829353 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 14829452  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14829453 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 14829552  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829553 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 14829593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 34056205 - 34056645
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34056205 taatcttgtctaggattatagttaaggtgatttgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 34056304  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  34056305 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttttcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttataacttgct 34056404  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34056405 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgatcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgtttcttttagaaatgtcattgatatct 34056504  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34056505 cattttagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 34056604  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34056605 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 34056645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 5271917 - 5272355
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5271917 taatttagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 5272016  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  5272017 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 5272116  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5272117 ctctttgctgttatcaagcgacatttatacattttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 5272216  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5272217 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttat 5272316  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5272317 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagatta 5272355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 19831039 - 19831479
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831039 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatatttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 19831138  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||        ||||||||||    
T  19831139 tggcttctctatatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 19831238  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19831239 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgctttccgtattctttttagaaatgtcattgatatct 19831338  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19831339 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttac 19831438  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  19831439 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 19831479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 37701239 - 37701681
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37701239 taatctagtttaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtacggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcatatttttagg 37701338  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||||    
T  37701339 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggtaaaatttgaacaattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 37701438  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701439 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 37701538  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaac--atttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37701539 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgcacatttctaaaacatatttaccaaagcattataaagattt 37701638  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  37701639 attgtaggaaaagaacatgtttaattttgttcaagagattagg 37701681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2776925 - 2776484
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776925 taatctagtctgggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 2776826  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcct-aagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||        |||||||||    
T  2776825 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttcacgacaaaatttgaaccattggccgccttaagtattttttgtaacttgc 2776726  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2776725 tctctttgccgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcaatgagtgtgattgttttccgtattccttttagaaatgtcattgatatc 2776626  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2776625 tcatttgagaagtgctaggtacaaaataaattgcagtgtcaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagattta 2776526  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  2776525 ctgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 2776484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 22115693 - 22116133
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115693 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaacattaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 22115792  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  22115793 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttcacgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 22115892  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22115893 ctctttgtcgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgttgatgagtgtgattgtttcccgtattccttttagaaatgtcattgatatct 22115992  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22115993 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgtcaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatttac 22116092  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22116093 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 22116133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 33502643 - 33503079
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33502643 taatctagtctaggattagaattaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcatattattagg 33502742  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||         |||||||||    
T  33502743 tg-cttctctagatcaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaac-attagccgcctaagtattttc--taacttgct 33502838  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33502839 ctctttgccgttatcaagcgacacttatacattttttgagcttctttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttaaaaatgtcattgatatct 33502938  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33502939 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcattgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 33503038  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33503039 tgtataaaaacaacatgttttattttgttcaagagattagg 33503079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 55998354 - 55998777
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998354 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttcaacgtgtgggtcatcaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 55998453  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  55998454 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 55998553  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998554 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtaatttttttccctgttccttttagaaatgtcattgatatct 55998653  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55998654 catttgagaagtgctaggtaaaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttac 55998753  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatt 424  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  55998754 tgtaggaaaagtgcatgttttatt 55998777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17699824 - 17699384
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17699824 taatctagtctaggattagagttaatgtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttagaaacgacttgaagatgcatatttttagg 17699725  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||        ||| ||||||    
T  17699724 tggcttctctagattaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgtttttggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtagcttgct 17699625  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17699624 ctcttttccgttatcaaacgacacttacaccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagatatgtcattgatatct 17699525  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699524 catttgagaagtgctaggtataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatacttacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 17699425  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||| ||||| | ||||||||||||   |||||||||||||    
T  17699424 cgtaagaaaagagcatgttttatttcgttcaagagattagg 17699384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28973710 - 28973269
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28973710 taatttagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaga 28973611  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  28973610 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 28973512  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28973511 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttatcgatgagtgtgattgttttctgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 28973412  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatat--atatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28973411 catttgaaaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtattaattagaagttatatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 28973312  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      |||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  28973311 gttgtatgaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 28973269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 53343058 - 53342616
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53343058 taatctagtttaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgaattgaacgtgcatatttttagg 53342959  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||        ||||||||||    
T  53342958 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctatctctaacatatgttctcagcaatatttgaaccatggaccgcctaagtattttttgtaacttgct 53342859  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53342858 ctatttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttcccatgttccttttagaaatgtcattgatatct 53342759  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatat--atatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53342758 tatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 53342659  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    | |||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  53342658 aatgtaggaaaagagcatattttattttgttcaagagattagg 53342616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 7643434 - 7643874
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7643434 taatctagtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatattattagg 7643533  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaa-ttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||        |||||||||    
T  7643534 cggcttctctagatcaaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaatttgaaccattgggcgcctaagtattttt-gtaacttgc 7643632  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7643633 tctctttgccgttatcaagcgacacttatactttttttgagcttgtttgtcgatgagtgggattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 7643732  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7643733 ttatttgagaagttctaggtacaaaacaaattgcagtattaattagaagttgcatatatgtacatttctaaaacatttacctaagcattataaagatttg 7643832  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  7643833 ttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 7643874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23479548 - 23479117
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23479548 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttggaaatgacttgaacgtgcatgtttttagg 23479449  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  23479448 cggcttctctagataaaaaattaacttatcacatacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 23479349  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23479348 ctctttgccgttatcaagcgacgcttatatcttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 23479249  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||           
T  23479248 cattttagaagtgctaggtacaaaataaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttataaaacatttaccaaagcattgtaaa------- 23479156  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23479155 --taggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 23479117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 13628703 - 13628259
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatat-ttttag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13628703 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctattgaaagtacgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatattttag 13628604  T
Q  100 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn--gtaactt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||          |||||||    
T  13628603 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattagccgcaaaagtattttttttgtaactt 13628504  T
Q  198 gctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgata 297  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13628503 gctctcttttccattatcaagcgacagttataccttttttgagcttgtttttcgatgagtgtgattgttttccattttccttttagaaatctcattgata 13628404  T
Q  298 tctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13628403 tctcatttgagaagtgctaggtataaaaaaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 13628304  T
Q  398 tactgtag-gaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||  |||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  13628303 tactgtagaaaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 13628259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 38 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21353693 - 21353291
Alignment:
Q  38 aaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacc 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21353693 aaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacccacc 21353594  T
Q  138 tctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttatacctttttt 237  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21353593 tctaacatatgttcacgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgctctctttgtcgttatcaagtgaaacttatacctttttt 21353494  T
Q  238 gagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21353493 gagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttc-gtattccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaataaattgcagtg 21353395  T
Q  338 ttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagat 437  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||    
T  21353394 tcaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatttaccgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaatagat 21353295  T
Q  438 tagg 441  Q
    ||||    
T  21353294 tagg 21353291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17740681 - 17740247
Alignment:
Q  9 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740681 tctaggattagagttaaggtggtctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 17740582  T
Q  109 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgc 208  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||        ||||||||||||||||||    
T  17740581 ctagatcaaaa-ttagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagtttaatcattgaccgcctaagtattttttgtaacttgctctctttgc 17740483  T
Q  209 cgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttt-ccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttga 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17740482 cgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattttttttccctgttccttttagaaatgtccttgatatctcatttgg 17740383  T
Q  308 gaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagt--tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtag 405  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17740382 aaagtgctaggtacaaaacaaattgcagcgttaattagatgttctatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtag 17740283  T
Q  406 gaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  17740282 gaaaagaacatattctattttgttcaagagattagg 17740247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40622799 - 40622354
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40622799 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttaaaaatgcggatcatgaagaccaaatctttatttgagaacgacttgaacgtgcatatttttagg 40622700  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  40622699 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 40622600  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40622599 ctatttgccattatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccctgttccttttagaaatgtccttgatatct 40622500  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat----gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 396  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40622499 catttgggacgtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatataagtacatttctaagacatttaccaaagcattataaagat 40622400  T
Q  397 ttactgtaggaaaataacatg-ttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  40622399 ttgctgtaggaaaagaacatgtttttattttgttcaagagattagg 40622354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8531466 - 8531023
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8531466 taatcttgtctatgattagagttaaggtgatctattgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 8531367  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||        |||||||| |    
T  8531366 tggcttctctagataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaagtttaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgtt 8531267  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttatacctttttt-gagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8531266 ctctttgtcgttatcaagcgacacttatacctttttttgagtttgtttgtcgatgaatgtgattttttcccctgttccttttagaaatgtccttgatatc 8531167  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 397  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8531166 tcatttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatt 8531067  T
Q  398 tactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  8531066 tgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 8531023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38008909 - 38008561
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38008909 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggagcgacttgaacgtgcatatttttagg 38008810  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  38008809 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 38008710  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttatacc-ttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38008709 ctctttactgttatcaagcgacacttatacctttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttaaaaatgtcattgatatc 38008610  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaag 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38008609 tcatttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaag 38008561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 36857716 - 36857294
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36857716 taatctactctaaaattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgcatcatgaacaccaaatctttatttgaaaacgacttgaacctgcatatttttagg 36857617  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||                  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||        ||||||||||    
T  36857616 tggcttctctagataaaaaa------------------ctaatatatgttctcggtaaaatttgaacgattggccacctaagtattttttgtaacttgct 36857535  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36857534 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgatggttttccgtgttcctcttagaaatatcattgatatct 36857435  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36857434 catttgagaagtgctagatacaaaacaaattgcagtgttaattagattttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 36857335  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36857334 tgtaggaaaatagcatgttttattttgctcaagagattagg 36857294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 41983875 - 41984314
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41983875 taatctagtttaggattagagttaaggtgatctgttgaaagagcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 41983974  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |         |||||||||    
T  41983975 tggcttctctagattaaaa-ttagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctatgtatttttcataacttgct 41984073  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41984074 ctctttcccattatcaagcgacacttatacattttttgagcttgtttgctaatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 41984173  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41984174 catttgggaagtgttaggtgcaaaacaaattgcagtgctaattagatgttatatatataattacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 41984273  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
     ||||| ||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||    
T  41984274 gctgtacgaaaagagcatgttctatcttgttcaagagatta 41984314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 47557068 - 47557504
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  47557068 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaattgcgaatcatgaacaccaaatctttatttgtg---gacttgaacgtgcatatttttagg 47557164  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||        ||||||||||    
T  47557165 tggcttctctacataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgcatcattgaccgcctaagtattttttgtaacttgct 47557264  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47557265 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgaatgtgatttttttccatgttccttttagaaatgtccttgatatct 47557364  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  47557365 catttgggaagtgcaaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaatatttaccaaagcattatgaagattt 47557464  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
      ||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||    
T  47557465 gttgtgggaaaagaatatgttctattttgttcaagagatt 47557504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 120 - 440
Target Start/End: Original strand, 28134826 - 28135146
Alignment:
Q  120 attaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||     
T  28134826 attaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaattcgaaccattggtcgcctaattattttttgtaacttgctctctttgccgttatcaagc 28134925  T
Q  220 gacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggt 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28134926 gacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtcttccttttagatatgtcattgatatctcatttgagaattgctaggt 28135025  T
Q  320 acaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgtt 419  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28135026 ataaaacaaattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttactgtaggaaaagagcatgtt 28135125  T
Q  420 ttatttttctcaagagattag 440  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  28135126 ttattttgttcaagagattag 28135146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 113 - 441
Target Start/End: Original strand, 35495298 - 35495625
Alignment:
Q  113 atcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgtt 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||        ||||| || |||||||| ||||    
T  35495298 atcaaaaattaacttatcacatacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacatgttctctttgtcgtt 35495397  T
Q  213 atcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagt 312  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35495398 atcaagcgacacttattccttttttgagcttatttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcattttagaagt 35495497  T
Q  313 gctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaata 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35495498 gcta-gtacaaaacaaattgcagtgttaatcagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaacgcattataaagatttaccgtaggaaaaga 35495596  T
Q  413 acatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35495597 acatgttttattttgttcaagagattagg 35495625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 36514982 - 36515259
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36514982 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatctgttaaaagtgtgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaatgatttgaacgtgcatatttttagg 36515081  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  36515082 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttcacgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 36515181  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttcct 278  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36515182 ctctttgctgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttcccgtattcct 36515259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7847672 - 7847513
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7847672 taatctagtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaatgtgcatatttttagg 7847573  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7847572 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaa 7847513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 223 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7842762 - 7842621
Alignment:
Q  223 acttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtaca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7842762 acttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattattttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatctcatttggaaagtgctaggtaca 7842663  T
Q  323 aaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7842662 aaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 7842621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 340 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38008152 - 38008051
Alignment:
Q  340 aattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  38008152 aattagaagttatatatatgtacatttttaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagatta 38008053  T
Q  440 gg 441  Q
    ||    
T  38008052 gg 38008051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 426
Target Start/End: Original strand, 39742724 - 39742813
Alignment:
Q  337 gttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  39742724 gttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttaccgtaggaaaagagcatgttttatttt 39742813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 3839360 - 3839447
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3839360 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaaaatttgctataggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 3839447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 26870284 - 26870371
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26870284 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 26870371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 39742636 - 39742710
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaa 75  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39742636 taatctagtctatgattagagttaaggtgatatgttgaaagtgtgtatcatgaacatcaaatctttattaggaaa 39742710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 35495243 - 35495303
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaa 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35495243 taatctagtgtaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacatcaaa 35495303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 56541372 - 56541134
Alignment:
Q  66 tatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaa 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |  || |||| ||| ||||  ||| |||||| |||||||  |  |||| ||||||| || |    
T  56541372 tatttgggaacaacttgaacgtgcatgtttttaggtggttgttcaagattaaagattagtttaccacctatctctaacgcacattcttggcaaaagttga 56541273  T
Q  166 accattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgt 265  Q
    |||||||| | ||||||         | | ||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||  |||||| ||| |  || |||||||| || ||    
T  56541272 accattggtcacctaagtatttttcatgatttgctctctctgcagtaatcaagcaacacttatacctcgtttgagtttggtcatcaatgagtgtcatcgt 56541173  T
Q  266 tttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatt 304  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||| ||||||| |||||    
T  56541172 tttccgttttccctttagaaccgtccttgatatatcatt 56541134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 35087465 - 35087905
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087465 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 35087564  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  35087565 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 35087664  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087665 ctctttgccgttttcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 35087764  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087765 catttgagaagtgataggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 35087864  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087865 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 35087905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 50770874 - 50771314
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50770874 taatctagtctacgattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagt 50770973  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  50770974 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 50771073  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50771074 ctctttgccattatcaaatgacacttataccttttttaagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 50771173  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  50771174 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgt 50771273  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50771274 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 50771314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 31368642 - 31369084
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31368642 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 31368741  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaa-ttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||        |||||||||    
T  31368742 tggcttctctagataaaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaactattgaccgcctaagtattttttgtaacttgc 31368841  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31368842 tctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcaatgagtatgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 31368941  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31368942 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagattta 31369041  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatg-ttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31369042 ctgtaggaaaataacatgtttttatttttctcaagagattagg 31369084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 6103753 - 6104194
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6103753 taatctagtctaggattaaagttaaggtggtatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaagaacttgaacgtgcatatttttagg 6103852  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacc-tacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||    
T  6103853 tggcttctctagataaaaaattaacttatcaccctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgc 6103952  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6103953 tctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgttagtgatatc 6104052  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6104053 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattggagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagattta 6104152  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104153 ctataggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 6104194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16342283 - 16341842
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16342283 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgagaacgatttgaacgtgcatatttttagg 16342184  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| | |    
T  16342183 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggtt 16342085  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat-- 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16342084 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatat 16341985  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16341984 ctcatttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttacaaaagcattataaagattt 16341885  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  16341884 gctgtaggaaaatagcatgttttattttgttcaagagattagg 16341842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32756141 - 32755703
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32756141 taatctagtataggattagaattaaagtgatatgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttatg 32756042  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  32756041 tggcttctctagatcaaaaattagattatcacctacctctaacatatgttctcggtaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 32755942  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32755941 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgaatgtgattgttttccgtattccttttaaaaatgtcgttgatatct 32755842  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755841 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttat--atatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 32755744  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  32755743 tgtaggaaaatagcatgttttattttattcaagagattagg 32755703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 48977303 - 48976886
Alignment:
Q  9 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48977303 tctaggattatagttaaggtgatctgttgaaagtacggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 48977204  T
Q  109 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||    
T  48977203 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgctctctttgc 48977104  T
Q  209 cgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgag 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48977103 cgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttatttgtcgattggtgtgattgttttccgagttcattttagaaatgtcattgatatctcatttgag 48977004  T
Q  309 aagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaa 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48977003 aagtgctaggtataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttataaaacatttaccaaagcattataaaaatttactgtaggaa 48976904  T
Q  409 aataacatgttttatttt 426  Q
    || | |||||||||||||    
T  48976903 aagagcatgttttatttt 48976886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49113692 - 49113253
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113692 taatctagtctaggattagagttaaggtgatttgttgcaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 49113593  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||        ||||||||||    
T  49113592 tgacttctctatatcaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 49113493  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113492 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgacgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 49113393  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  49113392 catttgagaagtgctaggtataaaataaattgcactgttaattagaagttatatatatgtacattcctaaaatatttacc-aagcattataaagatttac 49113294  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49113293 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 49113253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 52853087 - 52853511
Alignment:
Q  17 tagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52853087 tagagttaaggtaatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttagaaacgacttgaacgtgcatatttttagatgacttctctagatca 52853186  T
Q  117 aaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  52853187 aaaattaatttatcacctacttctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgatcgcctaactattttttgtaacttgctctctttgccgttatca 52853286  T
Q  217 agtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgcta 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  52853287 agcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattaatatctcatttgagaagtgtta 52853386  T
Q  317 ggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  52853387 ggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaacttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttaccgtaggaaaatattat 52853486  T
Q  417 gttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  52853487 gttttattttgttcaagagattagg 52853511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 55294408 - 55294846
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55294408 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 55294507  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  55294508 tggcttctttagataaaaaattagct-atcacctacctctaacatatattctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 55294606  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55294607 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgaattttttccctgttccttttagaaatgtccttgatatct 55294706  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  55294707 catttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagca-tataaagatttgt 55294805  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  55294806 tgtaggaaaagaacatgttttattttgttcaagagattagg 55294846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 54513409 - 54512985
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  54513409 taatctagtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacacgaaatctttaattgagaacgacttgaacgtgcatatttttagg 54513310  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||        ||||||||||    
T  54513309 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgatc-attggccgcctaagtattttttgtaacttgct 54513211  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54513210 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 54513111  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  54513110 catttgggaagtgttaggtacaaaacaaattgcaattttaattagatgttatatatacgtacatttctaaaacatttaccaaagtattataaagatttga 54513011  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||    
T  54513010 tgtaggaaaagagcatgttttttttt 54512985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 50742000 - 50741638
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50742000 taatctagtctaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaaaaacttgaacgtgcatatttttagg 50741901  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  50741900 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtattttttgtaacttgct 50741801  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50741800 ctctttgtcgttatcaagcgacactcatacc-tttttgagtttgtttgtggatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 50741702  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50741701 catttgataagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatatat 50741638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 52462558 - 52463000
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52462558 taatccagtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtacggatcatgaacacataatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatattttaagg 52462657  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  52462658 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 52462757  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52462758 ctctttgccgttatcaagcgacagttataccttttttgagcttgtttgctgacgattgtgattgttttccatgttccttttagaaatgtccttgatatct 52462857  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52462858 aatttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgctaattggatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 52462957  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      |||||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  52462958 gttgtaggaaaagagcatgttctatgttgttcaagagattagg 52463000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 11597587 - 11598030
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11597587 taatcttgtctaagattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaatgtgcatatttttagg 11597686  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||        ||||||||||    
T  11597687 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaatcattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 11597786  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttatac--cttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 298  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11597787 ctcattgccgttatcaagcgaaacttatacatattttttgagtttgtttttcgatgagtgtgatt-ttttccctgttccttttagaaatgtccttgatat 11597885  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 396  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11597886 ctcatttgggaagttctaggtacaaaacaaattgcactgttaattagatattatatatataagtacattactaaaacatttaccaaagcattataaagat 11597985  T
Q  397 ttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  11597986 ttgctgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 11598030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 21699214 - 21699622
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21699214 taatctagtctaagattagagttaaggtgatatgctgaaagtgcggattatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatacttttagg 21699313  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||         |||||||       
T  21699314 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggctgcctaaatattttttgtaactt--- 21699410  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
                |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21699411 ------------atcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcaatgcgtgtgattgttttccgtgttccttttagaaaagtcattgatatct 21699498  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21699499 catttgagaagtgctaggtataaaacaa---gcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttac 21699595  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttattttt 427  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||    
T  21699596 tataggaaaagagcatgttttattttt 21699622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 48520667 - 48521089
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48520667 taatcttgtcttggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacaacttgaacgtgcatatttttagg 48520766  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||        ||||||||||    
T  48520767 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcttaagtatttttcgtaacttgct 48520866  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||                       
T  48520867 ctctttgccgttattaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccctgttcctttt------------------- 48520947  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat-gta-tatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
     | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520948 -acttgggaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatagtacaatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 48521046  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      |||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  48521047 gttgtaggaaaagaacatcttctattttgttcaagagattagg 48521089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 192 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 51248785 - 51248536
Alignment:
Q  192 taacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtca 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51248785 taacttgctctctttgccgttatcaagcgacatttatacatttttagagcttatttgtcgatgaatgtgattgttttccgtattccttttagaaatgtca 51248686  T
Q  292 ttgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattata 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248685 ttgatatctcatttgagaagtgctaggtataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattata 51248586  T
Q  392 aagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  51248585 aagattcactgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaaaagattagg 51248536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8243118 - 8242891
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8243118 taatctagtctaggattggagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgtatatttttagg 8243019  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8243018 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttggtaacttgct 8242919  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttat 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8242918 ctctttgacgttatcaagcgacacttat 8242891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 54934433 - 54934151
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  54934433 taatctagtatatgattagaattaaggtaatatgttgaaagtgcatatcatgaacaccaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 54934334  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||        ||||||||||    
T  54934333 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcatctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattggtcgcctaagtatttttcgtaacttgct 54934234  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcatt 293  Q
    ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54934233 ctctttgc----------tgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgatttttttctgtgttccttttagaaatgtcatt 54934151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40824297 - 40824526
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40824297 taatcttgtctgagattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcataaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 40824396  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  40824397 tggcttctctagattaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 40824496  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttatac 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40824497 ctctttgccgttatcaagcgacacttatac 40824526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 18741857 - 18742103
Alignment:
Q  3 atctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18741857 atctagtctaagattagagttaaggtgatctgttaaaagtgcggatcatgaacaccaaaccttcatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagatg 18741956  T
Q  103 gcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||        | | | |  |||    
T  18741957 gcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgaaccattgtct 18742056  T
Q  203 ctttgccgttatcaagtgacacttatacc-ttttttgagcttgtttg 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18742057 ctttgccgttatcaagcgacacttatacctttttttgagcttgtttg 18742103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 51248931 - 51248797
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51248931 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcttatttttagg 51248832  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcaccta 135  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51248831 tgacttctctagatcaaaaattaacttatcgccta 51248797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23194816 - 23194712
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23194816 taatctaatctaggattagagataaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatatttatttgggaacgacttgatcgtacatatttttagg 23194717  T
Q  101 tggct 105  Q
    |||||    
T  23194716 tggct 23194712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23937072 - 23936793
Alignment:
Q  66 tatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaa 165  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||| |||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||| |    
T  23937072 tatttgggaacaacttgaacgtgcatgtttttaggtggcttttccagatcaaagattagtttaccaccgaccactaacacatg-tctcggaaaaatttga 23936974  T
Q  166 accattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgt 265  Q
    |||||||||| ||||||         | |||||||||||  || || |||||| ||||||||||| |  |||||| ||| |  ||||||| ||| |  ||    
T  23936973 accattggccacctaagtacttttcatgacttgctctctccgcggtaatcaagcgacacttatacttcctttgagtttggtcatcgatgactgtcaccgt 23936874  T
Q  266 tttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattaga 346  Q
    ||| ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  23936873 ttttcgctttccttttagaaccgtccttgatatctcattggggaaatgctaagtaggaaacaaattgcaatgttaattaga 23936793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16496164 - 16496077
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||    
T  16496164 tatatgtacatttttaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaggaaaatagcatgttctatttggttcaagagattagg 16496077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 441
Target Start/End: Original strand, 40827024 - 40827102
Alignment:
Q  363 atttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  40827024 atttctaaaacatttaccaaagcattataaacatttgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 40827102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 363 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 50741617 - 50741539
Alignment:
Q  363 atttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50741617 atttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 50741539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 54792945 - 54793032
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||    
T  54792945 tatatgtacatttcgaaagcatttatcaaagcattataaagatttaccgtaggaaaagaacatgttctatttggttcaagagattagg 54793032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11383375 - 11383299
Alignment:
Q  365 ttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  11383375 ttctaaaatatttaccaaagcattataaagctttgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 11383299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 50802827 - 50802879
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatga 53  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50802827 taatctaatctaagattagagttaaggtgatttgttgaaagtacggatcatga 50802879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 50873050 - 50872998
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatga 53  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50873050 taatctaatctaagattagagttaaggtgatttgttgaaagtacggatcatga 50872998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Original strand, 2843551 - 2843589
Alignment:
Q  2 aatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaa 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2843551 aatctagtctaggattagagttaaggtgatctgctgaaa 2843589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 1072898 - 1073338
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072898 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 1072997  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  1072998 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 1073097  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073098 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 1073197  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1073198 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 1073297  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073298 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 1073338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 18598620 - 18599061
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598620 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 18598719  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaa-ttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||    
T  18598720 tggcttctctagataaaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgc 18598819  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598820 tctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 18598919  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598920 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 18599019  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18599020 ctgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 18599061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34856564 - 34856127
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34856564 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 34856465  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  34856464 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtattttttgtaacttgct 34856365  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34856364 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 34856265  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34856264 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 34856165  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  34856164 tgtaggaaaatagcatgttttattt---tcaagagattagg 34856127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 14887573 - 14888013
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887573 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgaggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 14887672  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14887673 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 14887772  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887773 ctctttgacgatataaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgaatgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 14887872  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14887873 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 14887972  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887973 tgcaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 14888013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2521777 - 2521337
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2521777 taatctagtctaggattaaagttaaggtgacatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattttaagg 2521678  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  2521677 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 2521578  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2521577 ctctttgtcgttatcaagcgacacttacatcttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgtttcttttagaaatgtcattgatatct 2521478  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2521477 cattttagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgcacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 2521378  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521377 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 2521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17940132 - 17939694
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17940132 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17940033  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn-gtaacttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||         |||||||||    
T  17940032 tggcttctctagatcaaaacttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattgaccgcataagtatttttttgtaacttgc 17939933  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939932 tctctttgtcgttatcaag-gacactcataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 17939834  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17939833 tcatttgataagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagaagttatatata--tacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttg 17939736  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17939735 ttgtaggaaaatagcatgttttattttgttcaagagattagg 17939694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18312402 - 18311963
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18312402 taatctagtctacgattaga-ttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcatatttttagg 18312304  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||        |||||||| |    
T  18312303 tggcttctctagatcaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttatcgacaaaatttgaaccattgactgcctaagtattttttgtaacttgat 18312204  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18312203 ctctttgccgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttcccgtgttccttttagaaatatcattgttatct 18312104  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18312103 catttgagaagtgctaggtacaaaataaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataatgatttac 18312004  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  18312003 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaaaagattagg 18311963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 35041700 - 35041265
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35041700 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgatttgaacgtgcatatttttagg 35041601  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  35041600 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacccacctctaacatatgttcacgacaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 35041501  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35041500 ctctttgccgttatcaagtgaaacttatacattttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttt-ccgtattccttttagaaatgtcattgatatct 35041402  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35041401 catttgagaagtgcaaggtacaaaacaaattgcagtgtcaattagaagttatatatatgtacattt----aacaattaccaaagcattataaagatttat 35041306  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  35041305 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 35041265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30044820 - 30044380
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattttta-g 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  30044820 taatctagtctagaattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttccg 30044721  T
Q  100 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||  |    
T  30044720 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaa-tttaaaccattggccgcctaagtattttttataactgac 30044622  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30044621 tctctttgtcgttatcaaacgacacttataccttttttgagcttgtttatcaatgagtgtgattgttttctgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 30044522  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30044521 tcatttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgcactgttaattagaagttatatatatgaacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttg 30044422  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30044421 ctgtatgaaaaaaacatgttttattttgttcaagagattagg 30044380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21800153 - 21799714
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21800153 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaac--caaatctttatttgaaaacgacttgaacgtgcatatttttatg 21800056  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn-gtaacttgc 199  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  21800055 tgacttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaatacatgttttcgtcaaaatttaaaccattggccgcctaagtatttttttgtaacttgc 21799956  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21799955 tcactttgccgttatcaagcgacacttatagcttttttgagcttgtttgtcg-tgagtgtgattattttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 21799857  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaat-tgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21799856 tcatttgagaagtgctaggtacaaaaaaaaactgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagattt 21799757  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21799756 accgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 21799714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4425097 - 4424657
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4425097 taatctagtctacaattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttctagg 4424998  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||        ||||||||||    
T  4424997 tgccttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctcttacatatgttctcagcaaaatttgtaccattggtcgcctaagtattttttgtaacttgct 4424898  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4424897 ttctttgtcgttatcaagcgacacttataccttgtttgagcttgtttgtcgatgagtgtaattgttttccgtgttccttttaaaaatgtcattgatatct 4424798  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  4424797 catttgagaagtgttaggtataaaacatattgcagtgtgaattagaagttatatatatgcacatttctaaaacatttatcaaagcgttataaagatttat 4424698  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  4424697 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 4424657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 22373478 - 22373916
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  22373478 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatctgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttgggaatgacctgaacgtgcatatttttagg 22373577  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  22373578 tggcttctctaaatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatat-ttctcgacaaaatttgaaccattggccgcttaagtattttt-gtaacttgct 22373675  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22373676 ctctttgtcgttatcaagcgacacttatacctttattgagcttgtttgttgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 22373775  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  22373776 catttgagaagtactaggtacaaaataaattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaaaatttgt 22373875  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  22373876 tgtaggaaaagagcatgatttatgttgttcaagagattagg 22373916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 34321699 - 34321266
Alignment:
Q  9 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321699 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 34321600  T
Q  109 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgc 208  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  34321599 ctagatgaaaaattagtttttcacctacctctaacatatgttctcagcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgctctctttgc 34321500  T
Q  209 cgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgag 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34321499 cgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttctgtgttctttttagaaatgtccttgatatctcatttggg 34321400  T
Q  309 aagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatat--atgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtagg 406  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34321399 aagtgttaggtacaaaacaaattgcaatgttaattaaatattatatatacaagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaag 34321300  T
Q  407 aaaataacatgttttatttttctcaagagattag 440  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  34321299 aaaagaacatgttctattttgttcaagagattag 34321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7222923 - 7222528
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattttt-ag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7222923 taatctagtctaggattagagttaaagtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaatgtgcatattttttag 7222824  T
Q  100 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||    
T  7222823 gtggcttctctagatcaaaaattaatttatcacttacctataacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtattttttgtaacttgc 7222724  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||| ||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7222723 tctttttgctgtaatcaagcgacgcttatatcttttttgaacttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 7222624  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaaga 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7222623 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttcttaaacatttaccaaagcattataaaga 7222528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 33321088 - 33321527
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33321088 taatcttgtctaggattaaagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 33321187  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||         ||||||||||    
T  33321188 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaaatatttttcgtaacttgct 33321287  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33321288 ctttttgccgttatcaagcgacatttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatt-ttttccctgttcctattagaaatgtcattgatatct 33321386  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagt--tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  33321387 catttgggaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttctatatataagtacatttctaaaaca--taccaaaacattataaagattt 33321484  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  33321485 gctgtaggaaaagaacatgttcaattttgttcaagagattagg 33321527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15276241 - 15275883
Alignment:
Q  8 gtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276241 gtctaggattagagttaaggtgatgtgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttagttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttc 15276142  T
Q  108 tctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  15276141 tctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgctctctttg 15276042  T
Q  208 ccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttga 307  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||    
T  15276041 ctgttatcaagcgacacttatactttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtca------------ttga 15275954  T
Q  308 gaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagt--tatatatatgtatatttctaaaacatt 376  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15275953 gaagtgctagatacaaaacgaattgcagtgttaattagaagttatatatatatgtacatttctaaaacatt 15275883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 69 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14832061 - 14831766
Alignment:
Q  69 ttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaacc 168  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||    
T  14832061 ttgggaacgacttgaacgcgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttcttgacaaaagttgaacc 14831962  T
Q  169 attggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttt 268  Q
    |||| |||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  14831961 attgaccgcctaagtatttttcgtaactttctctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttttttgtcgatgagtgtgattttttt 14831862  T
Q  269 ccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14831861 ccctgttccttttagaaatgtccttgatatctcatttgggaagtgctaggtaaaaaacaaattgctgtgttaattagatgttatatatatatatat 14831766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 11933117 - 11933235
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11933117 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 11933216  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11933217 tggcttctctagatcaaaa 11933235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 33814603 - 33814485
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33814603 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 33814504  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaa 119  Q
    || ||||||||||||||||    
T  33814503 tgtcttctctagatcaaaa 33814485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 246 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25540440 - 25540245
Alignment:
Q  246 ttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattag 345  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25540440 ttgtcgatgagtgtgattttttcccctcttccttttagaaatgtccttgatatctcacttgggaagtgctagatacaaaacaaattgcagtgttaattag 25540341  T
Q  346 aagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  25540340 atgttatatataagtacatttctaaaacagttacctaatcattataaagatttgtcgtaggaaaagaacatgttctattttattcaagagattagg 25540245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25540544 - 25540450
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattt 95  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25540544 taatcttgtctaggattagaattaaggtgatctgttgaaagtgtagatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatattt 25540450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14831748 - 14831657
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  14831748 tatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagaattataaagatttgttgtaggaaaataacatgttctattttgttcaagagattagg 14831657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 14832095 - 14832059
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttg 37  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14832095 taatcttgtctaggattagagttaagatgatctgttg 14832059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26822283 - 26821843
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26822283 taatctagtctacgattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagt 26822184  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  26822183 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 26822084  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822083 ctctttgccattatcaaatgacacttataccttttttaagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 26821984  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821983 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 26821884  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821883 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 26821843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 16723978 - 16724418
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16723978 taatctagtctaggattaatgttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatttttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 16724077  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||        ||||||||||    
T  16724078 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctatctctaacacatgttctcgtcaaaatttgaatcattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 16724177  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724178 ctctttgccgttatcaagcgacacttatacattttttgagcttgttagtcgatgagtgtgattattttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 16724277  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16724278 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaggattgtaaggatttac 16724377  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724378 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 16724418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33907894 - 33907451
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33907894 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 33907795  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||         ||||| |||    
T  33907794 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaatcattggccgcctaagtattttttataactggct 33907696  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907695 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 33907596  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatat----atatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 396  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907595 catttgaaaagttctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 33907496  T
Q  397 ttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||  |||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||    
T  33907495 ttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgtttaagagattagg 33907451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26828162 - 26827723
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  26828162 taatttagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 26828063  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  26828062 tggcttctctagatcaaaaataaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 26827964  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26827963 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgcgtgtcgatgggtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgttattgatatct 26827864  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26827863 catttgaaaagtgttaggtacaaaacaaattgcaatgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttgc 26827764  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  26827763 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 26827723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 42886037 - 42885601
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42886037 taatctaatctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtgaatcattaacaccaaatctttatttagaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 42885938  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||        ||||||||||    
T  42885937 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcatctacctctaacatatgttatcggcaaaatttgaatcattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 42885838  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885837 ctctttgctgttatcaagcgacacttataccttttttaagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttatgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 42885738  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42885737 catttgagaagtgctaggtataaaacaaattgcagtgttaatcagaagttat--atatttacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 42885640  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  42885639 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagatta 42885601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 30570177 - 30570619
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  30570177 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcacgaacaccaaatctttatttggaaacgacatgaacgtgcatatttttatg 30570276  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||||    
T  30570277 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacatacctataacatatgttatcggcaaaatttgaactattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 30570376  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30570377 ctctttatcgttatcaagcaacacttaaaccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 30570476  T
Q  301 catttgagaagtgctaggta-caaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30570477 catttgagaagtgctaggtataaaaaaaaattgcagtgtaaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccgaagcattataaagattta 30570576  T
Q  400 ctgtag-gaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||  |||| | ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30570577 ctgtagaaaaaagagcatgtattattttgttcaagagattagg 30570619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11707277 - 11706837
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11707277 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccgaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatatttagg 11707178  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnng-taacttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||          |||||  |    
T  11707177 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtatttttttataactgac 11707079  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttatacctttttt-gagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11707078 tctctttgccgttatcaaacgacacttatacctttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatttcattgatat 11706979  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11706978 ctcatttgaaaagtgataggtacaaaacaaattacagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagattt 11706879  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattag 440  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  11706878 gctgtatgaaaagagcatgttttattttgttcaagagattag 11706837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21098352 - 21097922
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098352 taatctagtctaggattaaagttaatgtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttagaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 21098253  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||| |       
T  21098252 tggcttctctagataaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacatat- 21098154  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
             ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21098153 ---------gttatcaaacgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttctgtgtttcttttagaaatgtcattgatatct 21098063  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  21098062 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattaaaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaatatttat 21097963  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21097962 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 21097922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 441
Target Start/End: Original strand, 18092357 - 18092791
Alignment:
Q  9 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18092357 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtggatcatgaacactaaatatttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 18092456  T
Q  109 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgc 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        |||||||| |||||||||    
T  18092457 ctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgttctctttgc 18092556  T
Q  209 cgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgag 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18092557 cgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttctcttttccttttagaaatgtctttgatatctcatttggg 18092656  T
Q  309 aagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtagg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  18092657 aagtgctaggtacaaaacaaattgctgtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaatcattataaagatttgttgtagg 18092756  T
Q  407 aaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18092757 aaaagaacatgttttattttgttcaagagattagg 18092791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 33663425 - 33663863
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33663425 taatctagtctaggattagagttaaggtgattcgttgaaagtgcggattatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcatatttttagg 33663524  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcct-aagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||        |||||||||    
T  33663525 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacatacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattggccaccttaagtattttttgtaacttgc 33663624  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||| |||| |||||||||| |   || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33663625 tctttttgtcgttatcaagcg---ctcataccttttttaagcttgtttgtcgatgattgtgattgttttccatgttccttttaaaaatgtcattgatatc 33663721  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33663722 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattacaatgttaattaaaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttg 33663821  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  33663822 ctgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 33663863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 45204648 - 45205085
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45204648 taatccagtctaggattagagataaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgatcgtgcatatttttagg 45204747  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||||    
T  45204748 tggcttctctagatcaaaaattaacttgccacctccctctaacatat-ttctcggcaaaatttgaactattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 45204846  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45204847 ctttttgtccttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtctttgatatat 45204946  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      
T  45204947 catttgggaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatgtacatttctaaaacatttatcaaagcatcataaagatttgt 45205046  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||    
T  45205047 tgtaggaaaagagcttgttttattttgttcaagagatta 45205085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 36632679 - 36633042
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632679 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgaggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 36632778  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  36632779 tggcttctctagatcaaaaattagcttgtcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaag-tattttcgtaacttgct 36632877  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttatacc-ttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36632878 atctttgtcgttatcaagcgacacttatacctttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcatcgatatc 36632977  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36632978 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 36633042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 441
Target Start/End: Original strand, 1514624 - 1515059
Alignment:
Q  11 taggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctct 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1514624 taggattaaagttaaggtgatctgttgaaagtccggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctct 1514723  T
Q  111 agatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccg 210  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||         |||||||||||||||||||    
T  1514724 agataaaaaattagcttatcacctacctttaacatatgttctcgacaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcataacttgctctctttgccg 1514823  T
Q  211 ttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaa 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1514824 ttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtagatgagtgtgatatttttccccgttccttttagaaatgtccttgatatctcatttgggaa 1514923  T
Q  311 gtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagt----tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgta-g 405  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  1514924 gtaataggtacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttaaatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttgctgtagg 1515023  T
Q  406 gaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  1515024 gaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 1515059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 19126313 - 19126598
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19126313 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcgtgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcata-ttttagg 19126411  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  19126412 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 19126511  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaat 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19126512 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaat 19126598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45399450 - 45399097
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  45399450 taatctagtataggattagaattaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacacaaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttggg 45399351  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |        ||||||| ||    
T  45399350 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaatatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccacctacgtatttttcgtaacttact 45399251  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45399250 ctctttgcc----------gacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtctttgatatct 45399161  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  45399160 catttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttttatatatatatat 45399097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 35285920 - 35286249
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  35285920 taatctagtatatgattagaattaaggtgatatgttgaacgtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttggg 35286019  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  35286020 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacct----catatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgct 35286115  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35286116 ctctttgcc----------gacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 35286205  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaatta 344  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35286206 catttggaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaatta 35286249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 75 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4812136 - 4811785
Alignment:
Q  75 acgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4812136 acgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctaggtcaaaaattagcttataacctacctctaacaaatgttctcagcaaaagttaaaccattgac 4812037  T
Q  175 cgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgt 274  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812036 cgcctaagtaattttcgtaacttgctctctttgccg----------acacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgt 4811947  T
Q  275 tccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtat----------at 364  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||          ||    
T  4811946 tccttttagaaatgtccttgatatctcatttggaaagtggtaggtacaaaacaaattgcggtgttaattagatgttatatatatatatatatatatacat 4811847  T
Q  365 ttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||    
T  4811846 ttctacaacatttaccaaagcgttataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttctatttt 4811785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 229 - 441
Target Start/End: Original strand, 30572285 - 30572499
Alignment:
Q  229 accttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggta-caaaaca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  30572285 accttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtataaaaaaa 30572384  T
Q  328 aattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtag-gaaaataacatgttttatttt 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||    
T  30572385 aattgcagtgtaaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccgaagcattataaagatttactgtagaaaaaagagcatgtattatttt 30572484  T
Q  427 tctcaagagattagg 441  Q
      |||||||||||||    
T  30572485 gttcaagagattagg 30572499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11448394 - 11448238
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11448394 taatctagtctagggttagagttaaggtgatctgttgaaagtggggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 11448295  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggca 157  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448294 tggcttttctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggca 11448238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 19167487 - 19167657
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  19167487 taatctagcctagaattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggataatgaacaccaaatctttatttgaaaacgacttgaacatgtatatttttagg 19167586  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccatt 171  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19167587 tggtttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaatttgaaccatt 19167657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 27364465 - 27364612
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27364465 taatctagtataggattagaattaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 27364564  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27364565 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatg 27364612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5252997 - 5252901
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattttt 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5252997 taatctagtctaggatcagagttaaggtgatctcttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattttt 5252901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Original strand, 35286318 - 35286406
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  35286318 tatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctggaggaaaagagcatgttctattttattcaagagatt 35286406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 36633064 - 36633155
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  36633064 tatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtagataaagagcatgttctattttattcaagagattagg 36633155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17092087 - 17092000
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  17092087 tatatgtacatttctagaacatttaccaaagcattataaagctttgatgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 17092000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17025902 - 17025815
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||| ||||||  ||||||||| |||    
T  17025902 tatatgtacatttctagaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtgggaaaagagcatgttctattttgttcaagagatnagg 17025815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 354 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 17037579 - 17037496
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagat 437  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||| ||||||  |||||||||    
T  17037579 tatatgtacatttctagaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtgggaaaagagcatgttctattttgttcaagagat 17037496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 438
Target Start/End: Original strand, 28379995 - 28380069
Alignment:
Q  364 tttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  28379995 tttctaaaatatttaccaaagcattataaagatttgctgtagtaaaagagcatgttctattttgttcaagagatt 28380069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 45399042 - 45398980
Alignment:
Q  364 tttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||    
T  45399042 tttctaaaatatttaccaaagcattataaagatttgctgtagtaaaagagcatgttctatttt 45398980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Original strand, 19167654 - 19167710
Alignment:
Q  385 cattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  19167654 cattataaagatctaatgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 19167710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 18814855 - 18814415
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814855 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 18814756  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  18814755 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 18814656  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814655 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 18814556  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18814555 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 18814456  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814455 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 18814415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34688223 - 34687783
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34688223 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 34688124  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  34688123 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 34688024  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34688023 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 34687924  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34687923 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 34687824  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687823 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 34687783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31620325 - 31619885
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31620325 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 31620226  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  31620225 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttatcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 31620126  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31620125 ctctttgccgctatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgaatgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 31620026  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31620025 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 31619926  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31619925 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 31619885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34692751 - 34692311
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34692751 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggattatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtacatatttttagg 34692652  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||||    
T  34692651 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaactattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 34692552  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692551 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgttgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 34692452  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692451 catttaagaagtgctaggtacaaaacaaattgcattgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 34692352  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34692351 tgtaggaaaatagcatattttatttttctcaagagattagg 34692311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 41962543 - 41962984
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41962543 taatctagtctaggattaaagtaaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 41962642  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  41962643 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattgaccgcctaagtattttttgtaacttgct 41962742  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41962743 ctctttgccgttatcaagcgacgcttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccatgttccttttagaaatgtcattgatatct 41962842  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41962843 cattttagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcatcgtaaagatttac 41962942  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctc-aagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41962943 tgtaggaaaataacatgtttcatttttctctaagagattagg 41962984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 41829665 - 41830104
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41829665 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 41829764  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  41829765 tggcttctctagat-aaaaattaacttattacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttttaacttgct 41829863  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41829864 ctctttgccgttatcaagcgacacttatatcttttttgagcttgtttgtcgatgaatgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 41829963  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41829964 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 41830063  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41830064 cgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaatagattagg 41830104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44406996 - 44406556
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44406996 taatatagtctatgattagagttaaggtgattagttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 44406897  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  44406896 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 44406797  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44406796 ctctttgccgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttcccgtgttccttttagaaatgacattgatatct 44406697  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44406696 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcattgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatctac 44406597  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  44406596 tgtaggaaaagatcatgttttattttgttcaagagattagg 44406556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Original strand, 52521232 - 52521620
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52521232 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggattgtgaacaccaaatctttatttgaaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 52521331  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||        ||||||||||    
T  52521332 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctgcctctaacatatcttctcagcaaaatttgaaacattggctgcctaagtattttttgtaacttgct 52521431  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52521432 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtaattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 52521531  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcatta 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52521532 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcatta 52521620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 38844822 - 38845185
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38844822 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgaaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 38844921  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  38844922 tggcttctctagatcaaaaattaaattatcacctacctcaaacatatgttctcggaaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 38845021  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38845022 ctctgtgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgatcgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 38845121  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38845122 catttgagaagtgctaggtataaaacaaattgcattgttaattagaagttatatatatatatat 38845185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 50561685 - 50561237
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50561685 taatcttgtttaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 50561586  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||        ||||||| ||    
T  50561585 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttact 50561486  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50561485 ctctttgcagttatcaagcgacacttatacc-tttttgag-ttttttgtcgatgagtgtgatttttttccctattccttttagaaatgtccttgatatct 50561388  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat----------gtatatttctaaaacatttaccaaagcattat 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50561387 catttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatatataagtacatttctaaaatatttaccaaagcattat 50561288  T
Q  391 aaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  50561287 aaagatttgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 50561237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 52310470 - 52310030
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  52310470 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgctgaaagtgcgaatcatgaacaccaa-tctttatttgggaacgacttgaacatgcatatttttagg 52310372  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||        ||||||||||    
T  52310371 tggcttctctggatcaaaaattagcctatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaacaattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 52310272  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  52310271 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgattttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccctattccttttagaaatgtccttgatatct 52310172  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52310171 catttgggaagtgctaggtac-aaacaaactgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagattt 52310073  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      ||||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  52310072 gttgtagaaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 52310030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 17672086 - 17671655
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17672086 taatctactataggattagaattaaggtgatctgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttttttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 17671987  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||         |||||||||    
T  17671986 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagaatttttcttaacttgct 17671887  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671886 ctctttgccg----------acacttataccttttttgagcttgtttgtcgataagtgtgattgttttctgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 17671797  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatata----tgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 396  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671796 catttggaaagtgttaggtacaaaacaaattgttgtgttaattagatgttatatatatatgtgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 17671697  T
Q  397 ttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    || ||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  17671696 ttgctgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagatt 17671655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 48340951 - 48340527
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48340951 taatctagtctaagattagagataaggtgatatgttcaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgatcgtgcatatttttagg 48340852  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||              || ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  48340851 tggcttctctagatcaaaaattaacttgccacctacctctaacatat--------------ttgaaccattggccgcctaagtattttttttaacttgct 48340766  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  48340765 ctctttgtcgttatcaagcgacatttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttaaaaatgtctttgatatat 48340666  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||      
T  48340665 catttaggaagtgctaggtacaaaacatattgcagggttaattagatgttatatatatgtacatttctaaaacatttatcaaagcatcataaagatttgt 48340566  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  ||| |||||||    
T  48340565 tgtaggaaaagagcttgttttattttgttcaggagatta 48340527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 56 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47135982 - 47135591
Alignment:
Q  56 accaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgg 155  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47135982 accaaatttttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcgg 47135883  T
Q  156 caaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatga 255  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47135882 caaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgctatctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatga 47135783  T
Q  256 gtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatata 355  Q
    || ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  47135782 gtttgatttttttccctattccttttagaaatgtccttgatatctcatttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgttgtgttaattagatgttatata 47135683  T
Q  356 tat------gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||      ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  47135682 tatatataagtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 47135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36682675 - 36682322
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36682675 taatctagtataggattagaattaaagtaatatgttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatatttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 36682576  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  36682575 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgct 36682476  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36682475 ctctttgcc----------gacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagcaatgtccttgatatct 36682386  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36682385 catttggaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 36682322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45005406 - 45005053
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45005406 taatctagtataggattagaattaaagtaatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatatttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 45005307  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  45005306 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgct 45005207  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45005206 ctctttgcc----------gacacttatacattttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagcaatgtccttgatatct 45005117  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45005116 catttggaaagtgctaggtacaaaacaaattgcggtgttaattagatgttatatatatatatat 45005053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Original strand, 10694445 - 10694722
Alignment:
Q  8 gtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10694445 gtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacttgcatatttttaggtggcttc 10694544  T
Q  108 tctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttg 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        |||||||||||||||||    
T  10694545 tctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgctctctttg 10694644  T
Q  208 ccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaa 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  10694645 ccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgcttgtcgatgagtgtgattgttttgcaccttccttttagaa 10694722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 441
Target Start/End: Original strand, 51965460 - 51965787
Alignment:
Q  115 caaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttat 214  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  51965460 caaaaattagcttctcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaatcattgaccgcgtaagtatttttcgtaacttgctctctttgccgttat 51965559  T
Q  215 caagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgc 314  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51965560 caagcgacacttatacctttcttgagtttgtttgttgatgagtgtgatt-ttttccatgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgggaagtgc 51965658  T
Q  315 taggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaata 412  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |    
T  51965659 tacgtacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttatatatataagtacatttttaaaacatttaccaaagcattataaagatctgttgtagcaaaaga 51965758  T
Q  413 acatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  51965759 acatgttctattttgttcaagagattagg 51965787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 12245509 - 12245831
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12245509 taatctagtatatgattagaattaaggtgatatgttgaacgtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 12245608  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaag-nnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  12245609 tggcttctttaggtaaaaaattagcttatcacctacct----catatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtattttttcgtaacttgc 12245704  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12245705 tctctttgcc----------gacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtccttgatatc 12245794  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagt 336  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245795 tcatttggaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagt 12245831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 327
Target Start/End: Original strand, 16031287 - 16031527
Alignment:
Q  77 gacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccg 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16031287 gacttgaatgtgcatatttttaggtggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaatcattggccg 16031386  T
Q  177 cctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttc 276  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16031387 cctaagtatttttcgtaacttgctctctttgccg----------acacttatacctttttcgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttaccgtgttc 16031476  T
Q  277 cttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaaca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16031477 cttttagaaatgtccttgatatctaatttggaaagtgctaggtacaaaaca 16031527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Original strand, 17709424 - 17709624
Alignment:
Q  7 agtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggctt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17709424 agtctaggattagagttaaggtgatctgttcaaagtgtggatcatgaacacaatatctttatttgggaacggcttgaacgtgcatatttttatgtgcctt 17709523  T
Q  107 ctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctcttt 206  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  17709524 ctatagatcaaaaattagcttattacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaagcattggccgcctaagtattttccgtaacttgctctcttt 17709623  T
Q  207 g 207  Q
    |    
T  17709624 g 17709624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Original strand, 17709621 - 17709711
Alignment:
Q  245 tttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcag 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  17709621 tttgtcgatgagtgtgattgtttttcatgttccttttagaaatgtctttgatatctcatttgggaagtgctgggaacaaaacaagttgcag 17709711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 13662373 - 13662460
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||    
T  13662373 tatatgtacatttttaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaggaaaatagcatgttctatttggttcaagagattagg 13662460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 38845211 - 38845302
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  38845211 tatatatatatacatttttaaaatatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagatattagg 38845302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12714760 - 12714675
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||    
T  12714760 tatatgtacatttataaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaggaaaagaacatgttctatttggttcaagagatta 12714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Original strand, 16031567 - 16031655
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  16031567 tatatatatatacatttctaaaacatttaccaaaacattatagagatttgctgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagatt 16031655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45005019 - 45004931
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  45005019 tatatatatatatatttctaaaacatttatcaaagcattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagatt 45004931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 28565683 - 28565770
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||   |||||||||||||    
T  28565683 tatatgtacatttttaaaacatttaccaaatcattataaagatttgctgtaggaaaagagcatgttctatttggttcaagagattagg 28565770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 28631595 - 28631508
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| || ||||||  |||||||||||||    
T  28631595 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtgggaaaagagcatattctattttgttcaagagattagg 28631508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36681512 - 36681442
Alignment:
Q  368 taaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  36681512 taaaacatttatcaaagcattataaagatttgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagatt 36681442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24294787 - 24294725
Alignment:
Q  379 ccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  24294787 ccaaagcattataaagatttgctgtagaaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 24294725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 440
Target Start/End: Original strand, 39760143 - 39760203
Alignment:
Q  380 caaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattag 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  39760143 caaagcattataaagatttgctgtagaaaaagagcatgttctattttgttcaagagattag 39760203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Original strand, 12245831 - 12245892
Alignment:
Q  377 taccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  12245831 taccaaagcattataaagatttgttggaggaaaagagcatgttctattttattcaagagatt 12245892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 25987 - 26427
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25987 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 26086  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  26087 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttatcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 26186  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26187 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 26286  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26287 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 26386  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26387 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 26427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 10556 - 10116
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10556 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 10457  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  10456 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttatcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 10357  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10356 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 10257  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10256 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 10157  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10156 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 10116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7286271 - 7285831
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7286271 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaactctttatttggaaacgacttgaacatgcatatttttagg 7286172  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  7286171 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcgaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 7286072  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7286071 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 7285972  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7285971 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgctaattagaagttatatatatgtacatttctaaaatatttaccaaagcattataaagatttac 7285872  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285871 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 7285831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 33610765 - 33611205
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33610765 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggattatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttcaacgtgcatatttttatg 33610864  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  33610865 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 33610964  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33610965 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtatgattgttttccgtgtttcttttagaaatgtcattcatatct 33611064  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611065 catttgagaaatgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 33611164  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33611165 tgtaggaaaatagcatattttatttttctcaagaaattagg 33611205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 2195759 - 2195319
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195759 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 2195660  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  2195659 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctataacatatgttcttggcaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 2195560  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195559 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccatgttccttttagaaatgtcattgatatct 2195460  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2195459 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgataatttgaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 2195360  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195359 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 2195319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3029349 - 3028908
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3029349 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacgtgaacgtgcatatttttagg 3029250  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn-gtaacttgc 199  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  3029249 tggcttctcttgataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtatttttttgtaacttgc 3029150  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3029149 tctttttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgacgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 3029050  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3029049 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagctatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 3028950  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  3028949 ctgtaggaaaagagcatgtattattttgttcaagagattagg 3028908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 26320702 - 26321140
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320702 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaac--caaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 26320799  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  26320800 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttctcgtcaaaatttgaaccattgtccgcctaagtattttttgtaacttgct 26320899  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320900 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatcagtgtgattattttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 26320999  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26321000 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattaaaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 26321099  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26321100 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 26321140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 3150229 - 3150669
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3150229 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttgaaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 3150328  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||        ||||||||||    
T  3150329 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctttaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattggctgcctaagtattttttgtaacttgct 3150428  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3150429 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgtttcttttagaaatgtcattgatatct 3150528  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3150529 catttgagaagtgctaggtataaaacaaattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttatcaaagcattataaagatttac 3150628  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||    
T  3150629 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaggagattagg 3150669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38935056 - 38934616
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38935056 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaaa 38934957  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        || |||||||    
T  38934956 tggcttctctacatcaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttctcgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtgacttgct 38934857  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934856 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 38934757  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  38934756 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaattgcaatgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaatacttac 38934657  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    | |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38934656 tataggaaaatagcatgttttattttgctcaatagattagg 38934616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 1851585 - 1852010
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851585 taatgtagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaaatgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 1851684  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  1851685 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaaaatatgttctcgacaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 1851784  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851785 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 1851884  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1851885 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattccaatgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattatagagatttac 1851984  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  1851985 tgtaggaaaagagcatgttttatttt 1852010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21030703 - 21030262
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030703 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 21030604  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||| |    
T  21030603 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgtt 21030504  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttatacctttttt-gagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030503 ctctttgtcgttatcaagcgacacttatacctttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 21030404  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030403 tcatttgagaagtgctaggtataaaaaaaattgcagtgttaattagaagttatatctatgcacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 21030304  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  21030303 ctgtaggaaaagagcatgttctattttgatcaaaagattagg 21030262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27066466 - 27066027
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066466 taatctagtataggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 27066367  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  27066366 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaatttgatccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 27066267  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066266 ctctttgctgttatcaagcgacatttataccttttt-gagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccatgttccttttagaaatgtcattgatatct 27066168  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27066167 catttgagaagtgctaggtataaaacaaactgcagtgttaattagaacttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttat 27066068  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27066067 tgtaggaaaagaacatgttttattttgttcaagagattagg 27066027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30689907 - 30689464
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689907 taatctagtctagaattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 30689808  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaa--ttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttg 198  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||        ||||||||    
T  30689807 tggcttctctagataaaaaaaattaacttatcacctacctctaacatacgttctcggcaaaatttgaaccattggtcgcctaagtattttttgtaacttg 30689708  T
Q  199 ctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 298  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30689707 ctctctctgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttctgtgttccttttaaaaatgtcattgatat 30689608  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatat--atatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30689607 ctcatttgacaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatgcacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagat 30689508  T
Q  397 ttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattag 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689507 ttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattag 30689464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 4882866 - 4882426
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4882866 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtggatcatgaacatcaaatcgttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 4882767  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||        ||||||||||    
T  4882766 tggcttctctagatcaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaacttgaaccattggccgccgaagtatttttagtaacttgct 4882667  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4882666 ctctttgtcgttatcacgcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 4882567  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4882566 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaactgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagatttac 4882467  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  4882466 tgtaggaaaagagtatgttttattttgttcaagagattagg 4882426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 425
Target Start/End: Original strand, 3396762 - 3397188
Alignment:
Q  2 aatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggt 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3396762 aatctagtttaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacatcaaatctttatttggaaacgccttgaacgtgcatatttttaggt 3396861  T
Q  102 ggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn---gtaacttg 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||           ||||||||    
T  3396862 ggcttctctagatcaaaaattaacttatcacatacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattggccgcctaagtatttttttttgtaacttg 3396961  T
Q  199 ctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3396962 ctctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgaattttttccgtgttccttttagaaatatcattgatat 3397061  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397062 ctcatttgagaagtgttagatataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 3397161  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttattt 425  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  3397162 attgtaggaaaatagcatgttttattt 3397188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 10511990 - 10512427
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10511990 taatctagtctaggattagagttaaggtaatctgttgaaagtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaacgacttaaacgtgcatatttttagg 10512089  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||| ||||||    
T  10512090 tggcttctctaaatcaaaaattaacttatcacctacctttaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgta-cttgct 10512188  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10512189 atctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgcgattgttttccgtgttccttttagaactatcattgatatct 10512288  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10512289 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttataaaacatttaccaaagcattataaagatttgt 10512388  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||    
T  10512389 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaaaagatta 10512427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17997162 - 17996719
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997162 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17997063  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaa---ctt 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||        ||||   |||    
T  17997062 tggcttctctaaatcaaaaattaacttattaacctcctctaacatatgttcttgacaaaatttgaaccattggcagcctaagtattttttgtaataactt 17996963  T
Q  198 gctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgata 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17996962 gctctctttgccgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattatttcccgtgttccttttagaaatatcattgata 17996863  T
Q  298 tctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  17996862 tctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattaaatagatt 17996763  T
Q  398 tactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  17996762 tactgtaggaaaagagcatgctttattttgttcaagagattagg 17996719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 34374009 - 34374445
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34374009 taatctagtctagaattagagttaaggtgatctgttgaaagtacggatcatgaacaccaaatctttatttgtgaacgatttgaacgtgcatatttttagg 34374108  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  34374109 tggtttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 34374207  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34374208 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatg----tgattgttttccgtcttccttttagaaatgtcattgatatct 34374303  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaag-cattataaagattta 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  34374304 catttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagccattataaagatttg 34374403  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  34374404 atgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 34374445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 35539549 - 35539984
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35539549 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 35539648  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  35539649 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcgg-aaaatttgaaccattggccgcctaagtattttta-taactggct 35539746  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||      ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35539747 ctctttgcc------aagcgacatttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 35539840  T
Q  301 catttgagaagtgctag---gtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 397  Q
    ||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35539841 catttgaaaagtgttagtaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 35539940  T
Q  398 tactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |  |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35539941 tgttgtaagaaaagaacatgttttattttgttcaagagattagg 35539984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20758539 - 20758100
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20758539 taatctagtttaggattatagttaagatgatctgttgaaaatgcgaatcatgaacaccaaatctttacttggaaacgacttgaacatgcatatttttagg 20758440  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||        ||||  ||||    
T  20758439 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacatacctttgacatatgttcacgacaaaatttgaacaattggctgcctaagtattttttgtaatctgct 20758340  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20758339 ctctttgccgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtatgattgttt-ccgtattccttttagaaatgtcattgatatct 20758241  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20758240 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgtcaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatttac 20758141  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  20758140 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 20758100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 20995522 - 20995884
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995522 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgaagatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 20995621  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  20995622 tggcttctctagatcaaaaaatagcttatcacttacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaag-tattttcgtaacttgct 20995720  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995721 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 20995820  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20995821 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 20995884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 438
Target Start/End: Original strand, 33706399 - 33706841
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33706399 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaattgcgaatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 33706498  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||        ||||||||||    
T  33706499 tggcttctctagataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaatcattgaccgcctaagtattttttgtaacttgct 33706598  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttt-ccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33706599 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattttttttccctgttccttttagaaatgtccttgatatc 33706698  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat----gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaaga 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33706699 tcatttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatataagtacatttctaaaaattttaccaaagcattataaaga 33706798  T
Q  396 tttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    |||  ||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  33706799 tttgttgtgggaaaagaacatgttctattttgttcaagagatt 33706841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19448589 - 19448157
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19448589 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgctgaaagtgcagatcataaacaccaaatttttatttggaagcgacttgaacgtgcatatttttagg 19448490  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaa-catatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||         |||||||||    
T  19448489 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaaacatatgttcttggcaaaatttgaatcattggccgcctaaatattttttgtaacttgc 19448390  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    || |||         |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19448389 tccctt---------caagcgacacttatacctattttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 19448299  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  19448298 ttatttgataagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttacatatatgtacatttctaaaacatttatcaaaatattataaaaattta 19448199  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||    
T  19448198 ctgtaggaaaagagcatgttttattttgtttaagagattagg 19448157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20350529 - 20350078
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20350529 taatctagtgtaggattagagttaaagtgatttgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 20350430  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaa-ttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||        ||||||||     
T  20350429 tggcttctttagataaaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttttcggcaaaatttgaaccgttgaccgcctaagtattttttgtaacttga 20350330  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350329 tcgctttgtcgttatcaagcgacactcataccttttttgagcttgtttgtgcttgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 20350230  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtat------------atttctaaaacatttaccaaagcat 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||            |||||||||| ||||||||||||||    
T  20350229 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatatatatatatatacatttctaaaatatttaccaaagcat 20350130  T
Q  388 tataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||    
T  20350129 tataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagatta 20350078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41781436 - 41781083
Alignment:
Q  1 taatctagtctagg-attagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttag 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41781436 taatctagtctagggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacacaaagtctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttag 41781337  T
Q  100 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||         ||||||||    
T  41781336 gtggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcataacttgc 41781237  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||          |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41781236 tctctttgcc----------gacacttatacctttttt-agcttgttagtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatc 41781148  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41781147 tcatttgaaaagtgataggtacaaaacaaattgcagtgttagttagatgttatatatatatatat 41781083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33930408 - 33930055
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  33930408 taatctagtatatgattaaaattaaggtgatatgttgaacgtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatatttttagg 33930309  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  33930308 cggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaaaatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 33930209  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33930208 ctctttgcc----------gacacttatacattttttgagcttgtttgtcgatgagcgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 33930119  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33930118 catttggaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 33930055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 12420222 - 12420329
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  12420222 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtggatcatgaacaccgaatctttatttgggaacgatttaaacgtgcatatttttagg 12420321  T
Q  101 tggcttct 108  Q
    ||||||||    
T  12420322 tggcttct 12420329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41781073 - 41780982
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  41781073 tatatatatatatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 41780982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33930039 - 33929951
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  33930039 tatatatatatatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctggaggaaaagaacatggtctattttattcaagagatt 33929951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 20995918 - 20996009
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  20995918 tatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtagaaaaagagcatgttctattttattcaagagattagg 20996009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 3210178 - 3210265
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  3210178 tatatgtatatttcaaaaacatttaccaaagcattatgaagatttgatgtaggaaaagagcacgttctattttgttcaagagattagg 3210265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9702493 - 9702406
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| || ||||||  |||||||||||||    
T  9702493 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtgggaaaagagcatattctattttgttcaagagattagg 9702406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 14078445 - 14078885
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14078445 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtacatatttttagg 14078544  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  14078545 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacacatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 14078644  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078645 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 14078744  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14078745 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 14078844  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078845 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 14078885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27273604 - 27273179
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27273604 taatctagtctagaattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgaattgaacgtgcatatttttatg 27273505  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  27273504 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcga-aaaatttaaaccattggccgcctaagttttttttgtaacttgct 27273406  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273405 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgattagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 27273306  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273305 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 27273206  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttattttt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27273205 tgtaggaaaataacatgttttattttt 27273179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 33423874 - 33424314
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33423874 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacatgcatatttttagg 33423973  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||| |||||    
T  33423974 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggctgcctaagtattttttgtaatttgct 33424073  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424074 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 33424173  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  33424174 catttgagaagtgctagctacaaaacaaattgcggtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttat 33424273  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424274 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 33424314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 6477108 - 6477548
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477108 taatctaatctaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttgtttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 6477207  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||| || ||    
T  6477208 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaaattact 6477307  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477308 ctctttgccgttatcaagcgacacttgtaccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 6477407  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6477408 catttgagaagtgttaggtataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttat 6477507  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6477508 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 6477548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38962541 - 38962101
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38962541 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaatgacttgaacgtgcatatttttagg 38962442  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  38962441 tgacttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctttaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 38962342  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38962341 ctctttgtcgttatcaaacgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgattagtgtgattgttttccgtgttccttttataaatgtcattgatatct 38962242  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38962241 catttgagaagtgataggtacaaaaaaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaatcattataaagatttac 38962142  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  38962141 tgcaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 38962101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38992885 - 38992445
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38992885 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaatgacttgaacgtgcatatttttagg 38992786  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  38992785 tgacttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctttaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 38992686  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38992685 ctctttgtcgttatcaaacgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgattagtgtgattgttttccgtgttccttttataaatgtcattgatatct 38992586  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38992585 catttgagaagtgataggtacaaaaaaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaatcattataaagatttac 38992486  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    || ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  38992485 tgcaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 38992445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 44600073 - 44599634
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44600073 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 44599974  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  44599973 tggtttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 44599875  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44599874 ctttttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtcttccttttaaaaatgtcattgatatct 44599775  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44599774 catttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttga 44599675  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  44599674 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 44599634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 23522275 - 23522712
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  23522275 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaacaccaattctttatttggaaac---ttgaacgtgcatatttttagg 23522371  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||        ||||||||||    
T  23522372 tggcttctctagattaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgtcaaaatttgaaccattttccgcctaagtattttttgtaacttgct 23522471  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23522472 ctctttgccgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgttgatgagtgtgattgtttcccgtattccttttagaaatgtcattgatatct 23522571  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23522572 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgtcaattaaaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatttac 23522671  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23522672 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 23522712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38994056 - 38993615
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38994056 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 38993957  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  38993956 tggtttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 38993858  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaa-tgtcattgatatc 299  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38993857 ctttttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtcttccttttaaaaaatgtcattgatatc 38993758  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaa-caaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38993757 tcatttgaaaagtgctaggtacaaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 38993658  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  38993657 gatgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 38993615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 42810548 - 42810992
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42810548 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatatttatttggaaacgacttgaatgtgcatatttttagg 42810647  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  42810648 tggcttctctagattaaaaattaacttatcacctaaccctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 42810747  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42810748 ctctttttcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccatgttccttttagaaatgtcattgatatct 42810847  T
Q  301 catttgagaagtgc--tagg--tacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 396  Q
    ||||||||||||||  ||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42810848 catttgagaagtgctataggtataaaaaaaaaattgcactgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagat 42810947  T
Q  397 ttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||    
T  42810948 ttaatgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagggattagg 42810992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9761640 - 9761273
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9761640 taatctagtctacgattagagttaaggtgatctattgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 9761541  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  9761540 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 9761441  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9761440 ctctttgtctttatcaagcgacacttatactttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttaaaaatgtcattgatatct 9761341  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9761340 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttct 9761273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41629261 - 41628823
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |    
T  41629261 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacattagatctttatttggaaacgacttgaacatccatacttttatg 41629162  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttct-cggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||        |||||||||    
T  41629161 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatattcttcggcaaagtttgaaccattggccgcctaagtatttt--gtaacttgc 41629064  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41629063 tctctttgccattatcaagcga-acttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagcgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 41628965  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41628964 tcatttgagaagtgataggtacaaaacaaatttcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagattta 41628865  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  41628864 ctgttgaaaaacaacatgttttattttgttcaatagattagg 41628823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 44382415 - 44382856
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44382415 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttagtaacgacttgaacgtgcatatttttagg 44382514  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |        ||||||||||    
T  44382515 tggcttctatagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttcttggcaaaagttgaaccattgaccgcctaggtatttttcgtaacttgct 44382614  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382615 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttatttgtcgatgagtgtgatttttttcc-tgttccttttagaaatgtcattgatatct 44382713  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382714 catttgggaagtgataggtacaaaataaattgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 44382813  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  44382814 gttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 44382856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 19395177 - 19395618
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19395177 taatcgagtcaaggattagagttaaggtgattggttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 19395276  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||         ||||||| ||    
T  19395277 tggcttctctagatcaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttctcggcgaaatttgaaccattggccgcctaaatattttttgtaactttct 19395376  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19395377 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtggatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 19395476  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagt--tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19395477 cattggagaagtgctaggtataaaacaaattacaatgttaattagaagttatatatatatgtacatttataaaacatttagcaaagcattataaagattt 19395576  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||| |  ||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  19395577 act-tttgaaaagagcatgttttattttattcaagaggttagg 19395618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3751486 - 3751044
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  3751486 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgaattaaacgtgcatatttttagg 3751387  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  3751386 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 3751287  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtc-gatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3751286 ccctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtccgatgagtgtgatt-ttttccctattccttttagaaatgtccttgatatc 3751188  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatt 397  Q
    ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3751187 tcatttagaaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatattatatatataagtatatttctaaaacatttaccagagcattataaagatt 3751088  T
Q  398 tactgtagg-aaaataacatgttttatttttctcaagagattag 440  Q
    | ||| ||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3751087 tgctgaaggaaaaaaaacatgttctattttgttcaagagattag 3751044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 45293186 - 45293632
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagag-ttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttag 99  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45293186 taatcttgtctaggattagagattaaggtgatctattgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgagaacgacttgaacgtgcatatttttag 45293285  T
Q  100 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||        |||||||||    
T  45293286 gtggcttctctagatcaaaaatgagcttttcacctacctctaacatatgctctcagcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgc 45293385  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45293386 tctctttgccgttatcaagcgacctttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtatgattgttttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatc 45293485  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat----gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaaga 395  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45293486 tcatttgggatgtgctaggtacaaaac-aattgcagtgttagttagatgttatatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaaga 45293584  T
Q  396 tttactgtaggaaaataacatgtt--ttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||  | |||||||  ||||||||   | ||||| |||||||||||||    
T  45293585 tttgttataggaaaggaacatgttcaatttttttttcaagagattagg 45293632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19248487 - 19248040
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19248487 taatctcgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 19248388  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaag-nnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||         |||| ||||    
T  19248387 tggtttctcttgatcaaaaattagtttctcacctacctctaacatatgttctcagcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttttgtaaattgc 19248288  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19248287 tctctttgctgttatcaagcgacccttatacctttttttagcttgtttgtcgatgagtatgattgttttctgtgttccttttagaaatgtccttgatatc 19248188  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat------gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaa 393  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||     
T  19248187 tcatttgggaagtgctagggacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttatatatatatataagtacattttcaaaatatttaccaaaacattataac 19248088  T
Q  394 gatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  19248087 gatttgctgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 19248040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19321671 - 19321224
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19321671 taatctcgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 19321572  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaag-nnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||         |||| ||||    
T  19321571 tggtttctcttgatcaaaaattagtttctcacctacctctaacatatgttctcagcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttttgtaaattgc 19321472  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19321471 tctctttgctgttatcaagcgacccttatacctttttttagcttgtttgtcgatgagtatgattgttttctgtgttccttttagaaatgtccttgatatc 19321372  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat------gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaa 393  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||     
T  19321371 tcatttgggaagtgctagggacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttatatatatatataagtacattttcaaaatatttaccaaaacattataac 19321272  T
Q  394 gatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  19321271 gatttgctgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 19321224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 126 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 30826702 - 30826387
Alignment:
Q  126 ttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacact 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30826702 ttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattggccgcctaagtattttttgtaacttgctctctttgccgttatcaagcgacact 30826603  T
Q  226 tataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30826602 tataccttttttgagcttgtttgccgatgagtgtgattgttttccgtgttcctattagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgataggtacaaaa 30826503  T
Q  326 caaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttattt 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30826502 caaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaatatttatcaaagcattgtaaagatttactgtaggaaaatagcatgttttattt 30826403  T
Q  426 ttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||||||||    
T  30826402 ttctcaagagattagg 30826387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41977863 - 41977508
Alignment:
Q  9 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41977863 tctaggattagagttaaggtggtctgttgaaaatgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaatgacttgtacgtgcatatttttaggtggcttct 41977764  T
Q  109 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgc 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||    
T  41977763 ctagataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcagcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgctctctttgc 41977664  T
Q  209 cgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgag 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  41977663 cgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccatgttccttttagaaatgtacttgatatctcatttggg 41977564  T
Q  309 aagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41977563 aagtgttatgtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 41977508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 78 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41156935 - 41156571
Alignment:
Q  78 acttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  41156935 acttgaacgtgcatatttttaggtggtttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaatcattgaccgc 41156836  T
Q  178 ctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttcc 277  Q
    |||||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41156835 ctaagtatttttcgtaacttgctctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttctgagtttgtttgtcgatgagtgtgatt-ttttccctgttcc 41156737  T
Q  278 ttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacat 375  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  41156736 ttttagaaacgtccttgatatctcatttgggaaatgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacat 41156637  T
Q  376 ttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  41156636 ttaccaaagcattataaagatttgttgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 41156571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 36597650 - 36597934
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36597650 taatctagtatgggattagagttaaggtgctctgttgaaagtgcggatcatgaacactcaatctttatttggaaacgccttgaacgtgcatatttttagg 36597749  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||        |||||||||     
T  36597750 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacttacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgcccgcctaagtattttttgtaacttgcc 36597849  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaa 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36597850 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaa 36597934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 22946415 - 22946764
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  22946415 taatctagtatatgattagaattaaggtgatatgttgaacgtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaatgacttgaacgtgcatattttttgg 22946514  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  22946515 tggcttctctaagtcaaaaattagcttatcacctacct----catatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgct 22946610  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22946611 ctctttgcc----------gacacttataccttttttgagcttgtttgtcggtgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtctttgatatct 22946700  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22946701 catttgtaaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaattagatgttttatatatatatat 22946764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 22332342 - 22332523
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332342 taatctagtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 22332441  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22332442 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacatacctctaacatatgttctcgacaaaatttaaaccattgtctgcctaag 22332523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 198 - 364
Target Start/End: Original strand, 22332887 - 22333053
Alignment:
Q  198 gctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgata 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22332887 gctctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgaatgtgattgttttctgtgttccttttagaaatgtcattgata 22332986  T
Q  298 tctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22332987 tctcatttgagaagtgctagatataaaacaaatttcagtgttaattagaagttatatatatatatat 22333053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5835960 - 5835816
Alignment:
Q  9 tctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5835960 tctatgattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttagaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttct 5835861  T
Q  109 ctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctc 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5835860 ctagatcaaaaattaatttatcacctacctctaacatatgttctc 5835816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12760672 - 12760493
Alignment:
Q  116 aaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatc 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  12760672 aaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgacc-cctaagtatttttcgtaacttgctctctttgccgttatc 12760574  T
Q  216 aagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgata 297  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12760573 aagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatt-ttttccctgttccttttcgaaatgtccttgata 12760493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 42785541 - 42785443
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttag 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42785541 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatctattgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttag 42785443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 41533474 - 41533571
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatattttta 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41533474 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatatttatttgggaactacttgaacgtgcatattttta 41533571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 22333085 - 22333176
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22333085 tatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 22333176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41977482 - 41977391
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  41977482 tatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtagaaaaataacatgttctattttgttcaagagattagg 41977391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 12250167 - 12250254
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  12250167 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 12250254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 30826766 - 30826699
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttat 68  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826766 taatctagtataggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttat 30826699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39445040 - 39444953
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  39445040 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 39444953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12760485 - 12760407
Alignment:
Q  363 atttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12760485 atttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttgttgtaggaaaagaacatgttttattttgttcaagagattagg 12760407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Original strand, 22946778 - 22946866
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  22946778 tatatatatatacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctggaggaaaagagcatgttctattttattcaagagatt 22946866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29434058 - 29433971
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  29434058 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaaaatttgttgtaagaaaatagcatgttctattttgttcaagagattagg 29433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 354 - 438
Target Start/End: Original strand, 23626312 - 23626396
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  23626312 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtgggaaaagagcatgttctattttgttcaagagatt 23626396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Original strand, 36597929 - 36597982
Alignment:
Q  342 ttagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaaga 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36597929 ttagaagttatatatatgtacatttcttaatcatttaccaaagcattataaaga 36597982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Original strand, 16668790 - 16668838
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16668790 tatatatatatacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 16668838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39204650 - 39204563
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| | || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  39204650 tatacgtacatttctaaaacatttaccaaaacattatgaagatttgatgtaggaaaagagcacgttctattttgttcaagagattagg 39204563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 11500491 - 11500051
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11500491 taatctagtctaggattagagttaagttgatctattgaaaatgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgatttgaacgtgcatatttttagg 11500392  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||        || |||||||    
T  11500391 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacttacctctaacataagttctcggcaaaatttgaaccattagccgcctaagtattttttgttacttgct 11500292  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500291 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 11500192  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500191 catttgagaagtgctagatacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 11500092  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  11500091 tgtaggaaaagagcatattttattttgttcaagagattagg 11500051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14309486 - 14309045
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14309486 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacactaaatctttatttggaaaggaattgaacgtgcatatttttagg 14309387  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaa-ttaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||        |||||||||    
T  14309386 tggcttctctacataaaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgactgcctaagtattttttgtaacttgc 14309287  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309286 tctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 14309187  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14309186 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattgtaaagattta 14309087  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309086 ccgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 14309045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 8925541 - 8925974
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8925541 taatctagtctaggattaaagttaaggtgatatgttgaaagtgtggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 8925640  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  8925641 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 8925740  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8925741 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgaact------tcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 8925834  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8925835 catttgagaaatgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttat 8925934  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8925935 tgtaggaaaatagcatgtttta-ttttgtcaagagattagg 8925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17470363 - 17469924
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17470363 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaagaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17470264  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  17470263 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcatccacctctaacatatgttcacgataaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 17470164  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17470163 ctctttgtcgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttt-ccgtattccttttagaaatgtcattgatatct 17470065  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17470064 catttgagaagtgctaggtacaaaaaaaattgcagtgtcaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatttac 17469965  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17469964 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 17469924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 17582851 - 17583290
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17582851 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcgaatcatgaagaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17582950  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  17582951 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcatccacctctaacatatgttcacgataaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 17583050  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17583051 ctctttgtcgttatcaagtgaaacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttt-ccgtattccttttagaaatgtcattgatatct 17583149  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17583150 catttgagaagtgctaggtacaaaaaaaattgcagtgtcaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacaattaccaaagcattataaagatttac 17583249  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17583250 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 17583290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 23766070 - 23766510
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766070 taatctagtctaggattaatgttaaagtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 23766169  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||        ||||||||||    
T  23766170 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacatctaacacatgttctcgtcaaaatttgaaccattggccacctaagtattttttgtaacttgct 23766269  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23766270 ctctttgccgttatcaagcgacaattatacattttttgagcttgttagtcgatgagtgtgattattttccgtgttccttttcaaaatgtcattgatatct 23766369  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23766370 catttgagaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattgtaaagatttac 23766469  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766470 tgtaggaaaatagcatgttttatttttctcaagagattagg 23766510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5963329 - 5962888
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaag-tgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5963329 taatctagtataggattagagttaaggtgatatgttgaaaggtgcggatcatgaacactaaatctttatttggaaacaacttgaacgtgcatatttttag 5963230  T
Q  100 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||    
T  5963229 gtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgc 5963130  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5963129 tctctttgtcgttatcaagcgactcttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccgtgttccctttagaaatgtcattgatatc 5963030  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 399  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963029 tcatttgagaattgctaggtataaaacaaattgcagtgttaattacaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattta 5962930  T
Q  400 ctgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
       |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  5962929 aaataggaaaaaaaaatgttttattttgttcaagagattagg 5962888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 33638305 - 33638747
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638305 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatttttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 33638404  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  33638405 tggcttctctagataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 33638504  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638505 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccctgttccttttagaaatgtcattgatatct 33638604  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638605 catttgggaagttctaggtacaaaacaaattgaagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 33638704  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     |||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  33638705 gctgtgggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 33638747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42688186 - 42687744
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42688186 taatctagtttaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgtaaacgacttgaacgtgcttatttttagg 42688087  T
Q  101 tg--gcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttg 198  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||    
T  42688086 tgtggcttctctagattaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcgacaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttg 42687987  T
Q  199 ctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 298  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42687986 ctctctttgtcattatcaagcgacactcatacctttttagagcttatttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 42687887  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42687886 ctcatttgagaagtgctatttataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaatattt 42687787  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||  ||||||  || |||||||||  |||||||||||||    
T  42687786 actgtattaaaatattattttttattttgttcaagagattagg 42687744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17482980 - 17482523
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17482980 taatctagtctaggattagagttatggtgttttgttgaaagtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17482881  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn-gtaacttgc 199  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||         |||||||||    
T  17482880 tagcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtatttttttgtaacttgc 17482781  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17482780 tctctttgtcgttatcaagcgacactcataccttttttgagcttgtttgtggatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 17482681  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtat----------------atttctaaaacatttaccaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                |||||||||||||||||||||    
T  17482680 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatatatatatatatatatacatttctaaaacatttaccaaa 17482581  T
Q  384 gcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17482580 gcattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 17482523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 17570234 - 17570691
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17570234 taatctagtctaggattagagttatggtgttttgttgaaagtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17570333  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn-gtaacttgc 199  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||         |||||||||    
T  17570334 tagcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtatttttttgtaacttgc 17570433  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17570434 tctctttgtcgttatcaagcgacactcataccttttttgagcttgtttgtggatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 17570533  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtat----------------atttctaaaacatttaccaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                |||||||||||||||||||||    
T  17570534 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatatatatatatatatatacatttctaaaacatttaccaaa 17570633  T
Q  384 gcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17570634 gcattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 17570691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 27734680 - 27735118
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27734680 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaacgatttgaacatgcatatttttagg 27734779  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||        ||||||||||    
T  27734780 tggcttctctagatcaaaaattagct-atcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccgttgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 27734878  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27734879 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgaattttttccctgttccttttagaaatgtccttgatatct 27734978  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27734979 catttggaaagtgctaggtacaaaacaaattgcattgttaatcagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagca-tataaagattt 27735077  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
      |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  27735078 gttgtaggaaaagaacatgttttattttgttcaagagatta 27735118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 23299354 - 23299794
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23299354 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaatgacttgaacatgcatatttttagg 23299453  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||        ||||||| ||    
T  23299454 tggcttctctagatcaaaa-ttagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgccaaagtatttttcgtaactttct 23299552  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23299553 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtatgttgatgagtgtgatt-ttttccctgttccttttagaaatgtccttgatatct 23299651  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23299652 catttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaatttgatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaatattt 23299751  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23299752 cctgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 23299794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17478545 - 17478181
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17478545 taatctagtctaggattagagttatggtgttttgttgaaagtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17478446  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnn-gtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||         |||||||||    
T  17478445 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtatttttttgtaacttgc 17478346  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478345 tctctttgtcgttatcaagcgacactcataccttttttgagcttgtttgtggatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 17478246  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17478245 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcactgttaattagaagttatatatatatatat 17478181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 17574669 - 17575033
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17574669 taatctagtctaggattagagttatggtgttttgttgaaagtgcggatcatgaataccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 17574768  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaag-nnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||         |||||||||    
T  17574769 tggcttctctagataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccattgaccgcctaagtatttttttgtaacttgc 17574868  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 299  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574869 tctctttgtcgttatcaagcgacactcataccttttttgagcttgtttgtggatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatc 17574968  T
Q  300 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17574969 tcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcactgttaattagaagttatatatatatatat 17575033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19521781 - 19521420
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521781 taatctagtctagaattagagttaaggtgatccgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatttttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 19521682  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||||||    
T  19521681 tggcttatctagatcaaaaattaacttatcac-tacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaaccat-ggccgcctaagtattttttgtaacttgct 19521584  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19521583 ctctttgcgattatcaaacgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgaatgtgattgttttccgtgttccttttaaaaatgtcattgatatct 19521484  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19521483 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatatatat 19521420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47175094 - 47174647
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  47175094 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgat-gtgcataattttagg 47174996  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||         |||||||||    
T  47174995 tggcttctctagatcaaaaattagtttatcacctacctctaacatatgttctctgcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcttaacttgct 47174896  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  47174895 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttctgagcttgtttctcgatgagtgtgattgttttccgtgttccatttagaaatgtccttgatatct 47174796  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatata----------tgtatatttctaaaacatttaccaaagcattat 390  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47174795 catttgggaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatgtgtgtgtgtacatttctaaaacatttaccaaagcattat 47174696  T
Q  391 aaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatta 439  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||||| ||||||  |||||||||||    
T  47174695 aaagacttactgtagaaaaagagaatgttctattttgttcaagagatta 47174647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33031479 - 33031129
Alignment:
Q  14 gattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctaga 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33031479 gattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttatctaaa 33031380  T
Q  114 tcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgtta 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||        ||||||||||||||||| |||||    
T  33031379 taaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttgaatcattgaccgcctaagttttttttgtaacttgctctctttgtcgtta 33031280  T
Q  214 tcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtg 313  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031279 tcaagcgacacttatactttttttgagcatgtttgtcgttgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtg 33031180  T
Q  314 ctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33031179 ctaggtacaaaacaaattgcactgttaattagaagttatatatatatatat 33031129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 42826988 - 42827403
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||    
T  42826988 taatctagtataggattagaattaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaagtctttatttgagaatgatttgaacgtgcatatttttagg 42827087  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||||||| |    
T  42827088 tggcttctctaggtaaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttatcggcaaaagttaaaccgttggccgcctaagtatttttcgtaacttgtt 42827187  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42827188 ctctttgccg----------acacttataccttttttgagcttgtttatcgacgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 42827277  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  42827278 catttggaaagtgataggtacaaaacaaattgcagtgttaattagacgttatatatatatacatttctaaaacatttaccaaagcattataaaaatttgt 42827377  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||    
T  42827378 tgtaggaaaagagcatgttctatttt 42827403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42918495 - 42918130
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42918495 taatcttgtctaggattagagttaaggtggtctgttgaaagtgcacatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 42918396  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaag-nnnnnnnngtaacttgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||          ||||||||    
T  42918395 tggcttctctagatcaaaaattagcttttcacctacctctaacatatgttctcagcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtattttttcataacttgc 42918296  T
Q  200 tctctttgccgttatcaagtgacacttatacc-ttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatat 298  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42918295 tccctttgccgttatcaagcgacccttatacctttttttgagcttgtttgtcgatgagtatgattgtttttcatgttccttttagaaatgtccttgatat 42918196  T
Q  299 ctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42918195 ctcatttgggatgtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatatatatat 42918130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9149805 - 9149554
Alignment:
Q  191 gtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtc 290  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9149805 gtaacttgctctctttatcgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatt-ttttccctgttccttttagaaatgtc 9149707  T
Q  291 attgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcatt 388  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9149706 cttgatatctcatttgggaagtgctaggtacaacacaaatttcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcatt 9149607  T
Q  389 ataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  9149606 ataaagatttgttataggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 9149554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 211 - 441
Target Start/End: Original strand, 41262184 - 41262411
Alignment:
Q  211 ttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaa 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41262184 ttatcaagagacacttataccttttttgcgcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtctttcttt---aaatgtcattgatatctcatttgagaa 41262280  T
Q  311 gtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaa 410  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41262281 gtgctaggtataaaacacattgtagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaatatttaccaaaacattataaagatttaccgtaggaaaa 41262380  T
Q  411 taacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  41262381 gaacatattttattttgttcaagatattagg 41262411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 41262010 - 41262182
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41262010 taatctagtctaggattagagttaaagtgatctgttgaaagtgtggatcataaacatcaaatctttatttagaaacgacttgaacatgcatatttttagg 41262109  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcc 178  Q
    ||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  41262110 tggctt-----gataaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgtactaggcaaaatttgaaccattggccgcc 41262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 9149956 - 9149815
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9149956 taatcttgtctaggattagaattaaggtggtatgttgaaagtgcagatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttagg 9149857  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaa 142  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9149856 tggcttctctagataaaaaattagcttatcacctacctctaa 9149815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17478171 - 17478080
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17478171 tatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 17478080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 17575043 - 17575134
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17575043 tatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 17575134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19521408 - 19521317
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  19521408 tatatatatatatatttataaaacatttcccaaagcattataaagatttactataggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 19521317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 4481371 - 4481458
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  4481371 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgttgttggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 4481458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 42244840 - 42244927
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  42244840 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaaaatttattgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 42244927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42996727 - 42996640
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  42996727 tatatttacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 42996640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 33031079 - 33030988
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  33031079 tatatatatgtacatttctaaaacatttatcaaaacattataaagatttgttgtaggaaaagagcatgatttatgttgttcaagagattagg 33030988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 38434534 - 38434621
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  38434534 tatatgtacatttctataacatttaccaaagcattataaagatttgatgtgggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 38434621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 42918106 - 42918030
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttt 426  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  42918106 tatatataagtacattactaaaagatttaccaaagcattataaagatttgttgtagtaaaagaacatgttctatttt 42918030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1003 - 606
Alignment:
Q  44 cggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaac 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1003 cggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttaggtggcttctctagataaaaaattaacttatcgcctacttctaac 904  T
Q  144 atatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagctt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  903 atatgttctcggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgctctctttgccgttatcaagcgacacttatacattttttgagctt 804  T
Q  244 gtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaatt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  803 gtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaatt 704  T
Q  344 agaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  703 agaagttatatatatgtacatttctaaaacatttatcaaagcattgtaaagatttaccgtaggaaaataacatgttttaattttctcaagagattagg 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3486
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  3047 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttattttggaacgctttgaacgtgcatatttttagg 3146  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||         ||||| |||    
T  3147 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcatctacctctaacatctgttctcggcaaa-tttgaactattggccgcctaagtattttttataactggct 3245  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3246 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttttcgataagtgtgattgttttccgtgttccttttaaaaatgtcattgatatct 3345  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3346 catttgaaaagtgctaggtataaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgt 3445  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  3446 tgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagagattagg 3486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 48863 - 49302
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  48863 taatctagtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgacttgaacgtgcatatttttcgg 48962  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  48963 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaa-tttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 49061  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49062 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttatcaatgagtgtgattgttttctgtgttccttttagaaatatcattgatatct 49161  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttac 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  49162 catttgaaaagtgttaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaacatttaccaaagtattataaaggtttgc 49261  T
Q  401 tgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  49262 tgtatgaaaaaagcatgttttattttgttcaagagattagg 49302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Original strand, 12556 - 12998
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12556 taatcttgtctaggattagagttaatgtgatatgttgaaagtgcgggtcatgaacaccaaatctttatttgagaacgacttgaacgtgcatatttttagg 12655  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  12656 tggcttctctatattaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 12755  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12756 ctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccatgttccttttacaaatgtctttgatatct 12855  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatat--atgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12856 catttgggaagtgctgggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatacaagtacatttctaaaacatttaccaaaacattataaagattt 12955  T
Q  399 actgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  12956 gctgtaggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 12998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 575 - 190
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  575 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatatgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaaagacttgaacgtacatatttttagg 476  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||        ||||||||||    
T  475 tggcttctctagataaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggtaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttcgtaacttgct 376  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  375 ctctttgccgttatcaagcgagacctataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattattttccctgttccttttagaaatgtccttgatatct 276  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaag 384  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  275 catttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaag 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 177087 - 176734
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  177087 taatttagtctaagattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 176988  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||         ||||| |||    
T  176987 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatctgttctcggc-aaatttgaaccattggccgcctaagtattttttataactggct 176889  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  176888 ctctttgtcgttatcaagcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgggtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgttattgatat-t 176790  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatat 356  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176789 catttaaaaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatat 176734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 120533 - 120170
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  120533 taatctagtataggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcagatcatgaacactaaatctttatttgggaacgatttgaacgtgcatatttttagg 120434  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||          ||||||||    
T  120433 tggattctctagatcaaaaattagcttatcacatacctctaacatatgttctctgcaaaagttgaaccattgaccgcctaagtatttttctcaacttgct 120334  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  120333 ctctttgtcgttatcatgcgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttctgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 120234  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatatgtatat 364  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  120233 catttgggaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattacaagttatatatatatatat 120170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 120150 - 120102
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  120150 tatatatatatatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagattt 120102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 660 - 993
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  660 taatctagtctagcattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgt-catatttttaag 758  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  759 tggctactctagatcaaaaattaacttatcacttacctctaacatatgttcttggcaaaatttgaaccattggccgcctaagtattttttgtaacttgct 858  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  859 ctctttgccgttatcaaacgacacttatacctttttttagcttgtttgtcgatgagtgtgattgtttttcgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 958  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcag 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  959 catttgagaagtgctaggtataaaacaaattgcag 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 101338 - 101005
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  101338 taatctagtataggattagaattaaggtgatcggttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgggaatgacttgaacatgcatatttttagg 101239  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||        ||||||||||    
T  101238 tggcttctctaggtcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaagttgaaccattggccgcctaagtatttttcgtaacttgct 101139  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattgatatct 300  Q
    |||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  101138 ctctttgcc----------gacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtccttgatatct 101049  T
Q  301 catttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaatta 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  101048 catttgaaaagtgctaggtacaaaacaaattgtagtgttaatta 101005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 100865 - 100790
Alignment:
Q  363 atttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagatt 438  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  100865 atttttaaaacatttaccaaaacattataaagatttgctgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagatt 100790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 196 - 441
Target Start/End: Original strand, 10430 - 10677
Alignment:
Q  196 ttgctctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtgattgttttccgtgttccttttagaaatgtcattga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10430 ttgctctctttgccgttatcaagcgacacttataccttttttgagtttgtttgtcgatgagtgtgatttttttccctgttccttttagaaatgtccttga 10529  T
Q  296 tatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagaagttatatatat--gtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10530 tatctcatttgagaagtgctaggtacaaaacaaattgcagtgttaattagatgttatatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaa 10629  T
Q  394 gatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||  | |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  10630 gatttgttataggaaaagaacatgttctattttgttcaagagattagg 10677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 10362 - 10432
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttg 71  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10362 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttg 10432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 11041 - 11299
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11041 taatcttgtctaggattagagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggtaacgacttgaacgtgcgtatttttagg 11140  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||         ||||||||||    
T  11141 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcgggaaaagtttaaccattgaccacctaattatttttcgtaacttgct 11240  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtg 260  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11241 ctctttgccgttatgaagcgacacttataccttttttgagtttg-ttgtcgatgagtgtg 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 4592 - 4850
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4592 taatcttgtctaggattatagttaaggtgatttgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggtaacgacttgaacgtgcgtatttttagg 4691  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaacttatcacctacctctaacatatgttctcggcaaaatttaaaccattggccgcctaagnnnnnnnngtaacttgct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||         ||||||||||    
T  4692 tggcttctctagatcaaaaattagcttatcacctacctctaacatatgttctcgggaaaagtttaaccattgaccacctaattatttttcgtaacttgct 4791  T
Q  201 ctctttgccgttatcaagtgacacttataccttttttgagcttgtttgtcgatgagtgtg 260  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4792 ctctttgccgttatgaagcgacacttataccttttttgagtttg-ttgtcgatgagtgtg 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 14965 - 15088
Alignment:
Q  1 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttggaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14965 taatctagtctaggattagagttaaggtgatctgttgaaagtgcggatcatgaacaccaaatctttatttgaaaacgacttgaacgtgcatatttttagg 15064  T
Q  101 tggcttctctagatcaaaaattaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15065 tggcttctctagatcaaaaattaa 15088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 337 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26777 - 26673
Alignment:
Q  337 gttaattagaagttatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagaga 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||    
T  26777 gttaattagaagttatatatatgtacatttctaaaatatttagcaaagcattataaagatttaccgtaggaaaagagcatgttttattttgttcaagaga 26678  T
Q  437 ttagg 441  Q
    |||||    
T  26677 ttagg 26673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 441
Target Start/End: Original strand, 29974 - 30064
Alignment:
Q  350 tatatatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  29974 tatatataagtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttcctgtaggaaaaaaacatgttctatttgt-tcaagagattagg 30064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 52948 - 53035
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  52948 tatatgtacatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttgatgtaggaaaagagcatgttctattttgttcaagagattagg 53035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 441
Target Start/End: Original strand, 152135 - 152222
Alignment:
Q  354 tatatgtatatttctaaaacatttaccaaagcattataaagatttactgtaggaaaataacatgttttatttttctcaagagattagg 441  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||||    
T  152135 tatatgtacatttttaaaacatttaccaaagcattataaagatttgctgtaggaaaatagcatgttctatttggttcaagagattagg 152222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University