View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10148_low_1 (Length: 749)

Name: NF10148_low_1
Description: NF10148
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10148_low_1
NF10148_low_1
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (18-739)||(4635745-4636466)
chr7 (81-739)||(4629797-4630455)
chr7 (81-739)||(4665823-4666481)
chr7 (84-739)||(4642592-4643247)
chr7 (47-739)||(4652408-4653100)
chr7 (83-739)||(4671528-4672184)
chr7 (81-735)||(4660693-4661350)
chr7 (24-726)||(4784348-4785050)
chr7 (41-726)||(4816794-4817479)
chr7 (19-739)||(4697698-4698418)
chr7 (69-735)||(4862781-4863447)
chr7 (24-582)||(4846534-4847092)
chr7 (494-739)||(4713049-4713294)
chr7 (24-354)||(4712579-4712909)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (81-739)||(18926309-18926967)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 678; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 678; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4636466 - 4635745
Alignment:
Q  18 ctattaaaatgaaagaaagtttgtggaaaacaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4636466 ctattaaaatgatagaaagtttatggaaaacaaagaatgaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcagagatcagagc 4636367  T
Q  118 agccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4636366 agccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtacaaaggtttcattgatggatccacacccgttgcgataaaa 4636267  T
Q  218 cgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636266 cgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaatgagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggat 4636167  T
Q  318 attgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636166 attgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcagcacggtactctctgcgagtatctttatggttctaataaccaacccctaccatg 4636067  T
Q  418 gaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcacc 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636066 gaagcagaggcttgaaattcttttgggtgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcacc 4635967  T
Q  518 aacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattg 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4635966 aacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattg 4635867  T
Q  618 ttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggt 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4635866 ttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatcagacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggt 4635767  T
Q  718 gttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4635766 gttgtgtgctaggccacctttg 4635745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 81 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4630455 - 4629797
Alignment:
Q  81 atttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataa 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||   ||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  4630455 atttgtgtcgctactttacaatcgcggagatcaaagcagccacaaacaactttgacaatgatttcatcatcggatttggagggtttgggaacgtgtacaa 4630356  T
Q  181 aggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcc 280  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4630355 aggttgtgtcgatggatccacacctgttgcgataaaacgcctcaaatcaggctctcaacaaggtgccaacgagttcatgaacgaaatcgagttgctctcc 4630256  T
Q  281 cagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4630255 cagcttcgccacattcacttggtgtcccttgtaggatattgcaatgacaacacagagatgattctggtttatgagttcatgcagcacggtactctctgcg 4630156  T
Q  381 ggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggt 480  Q
     |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4630155 agtatctgtatggttccaataatcagcccctaccatggaagcagaggcttgagatcctattgggtgcagcgagagggctgaattatcttcattctgaggt 4630056  T
Q  481 taaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtggga 580  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4630055 gaagcacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatactgttggatgagaaatgggtagctaaggtttctgatttcgggttatccaaggtggga 4629956  T
Q  581 ccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaat 680  Q
    || ||||| ||| |||||||||| |||||||| || || ||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4629955 cctacaggaataacgactacccatgtcagcacgatggtgaaggggagccttggatatttggatcccgaatactatatgctccaaaggctaactctaaaat 4629856  T
Q  681 ctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4629855 ctgacgtgtactcgtttggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctagaccacctttg 4629797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 81 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4666481 - 4665823
Alignment:
Q  81 atttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataa 180  Q
    |||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||   ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  4666481 atttgtgccggtcctttacaattgcagagatcagagcagccacaaacaactttgacgatgatttcatcatcggagttggagggtttggcaacgtgtacaa 4666382  T
Q  181 aggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcc 280  Q
    |||||   |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  4666381 aggttgtgtcgatggatccacacttgttgccataaaacgcctcaaatcaggctctcaacaaggtgccaacgagttcatgaacgaaatcgaattgctctct 4666282  T
Q  281 cagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4666281 cagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaatgacgacacagagatgattctggtttatgagttcatgcagcacggtactctttgcg 4666182  T
Q  381 ggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggt 480  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4666181 agtatctttatggttctaataaccagcccctatcatggaagcagaggcttgagattcttttgggtgcagcgagagggctgaattatcttcatactgaggt 4666082  T
Q  481 taaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtggga 580  Q
     ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  4666081 gaaacagaagataatacaccgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggatgaaaaatggatggcaaaggtttccgactttgggttatccaaggtggga 4665982  T
Q  581 ccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaat 680  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4665981 ccgacagggatatcaactacccatgtcagcacgatggtgaaggggagcctcggatatttggatcccgaatattatatgctccaaaggctaactctaaaat 4665882  T
Q  681 ctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4665881 ctgatgtgtactcgttcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctagaccacctttg 4665823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4643247 - 4642592
Alignment:
Q  84 tgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaagg 183  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||     || ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  4643247 tgtgccgctcctttacaatcgcagagatcaaagcagctacaaacaacttcgatgatgcttttatcatcggagttggagggtttggcaacgtgtacaaagg 4643148  T
Q  184 tttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccag 283  Q
    ||   | |||||||||||||  |||||| | || |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4643147 ttgtgttgatggatccacacttgttgcggttaagcgcctcaaatcgggctctcaacaaggtgccaacgagttcatgaatgaaatcgagttgctctcccag 4643048  T
Q  284 cttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggt 383  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||    
T  4643047 cttcgccacattcacttggtgtccctcgtgggatattgcaacgatgacacagagatgattttggtttatgagttcatgcagcacggtactctttgtgagt 4642948  T
Q  384 atctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaa 483  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4642947 atctttatggttctaataacgagccactaccttggaggcagaggcttgaaattctattaggtgccgcaagagggctgaattatcttcatgctgaggtgaa 4642848  T
Q  484 aaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccg 583  Q
      |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||     
T  4642847 gcacaaaataatacatcgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggatgaaaaatggatagctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtgggacct 4642748  T
Q  584 acaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctg 683  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4642747 acagggatatcgactacccacatcagcacaatggtgaaaggaagccttgggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggctaactctaaaatcag 4642648  T
Q  684 acgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4642647 atgtgtactcgttcggtgtggtacttcttgaagtgttgtgtgctaggccacctttg 4642592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4653100 - 4652408
Alignment:
Q  47 acaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaaca 146  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||| ||| |  ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    ||    
T  4653100 acaaagaacaaagggtcgtcatctttgccaccacatttgtgtcgctccttcacaatcgcagagatcaaagcagccacaaataacttcgatgatgttttca 4653001  T
Q  147 ttatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgc 246  Q
    | ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  4653000 tcatcggtgttggaggatttggcaacgtgtacaaaggttgcatcgatggatccatgcctgttgcgataaaacgcctcaaatctggctctcaacaaggtgc 4652901  T
Q  247 aaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctg 346  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| |||||| ||    
T  4652900 caacgagttcatgaatgagatcgagttactctcccagcttcgccacattcacttggtatccctcgtgggatattgcaatgatgacacagaaatgattttg 4652801  T
Q  347 gtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatg 446  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |     
T  4652800 gtttatgagttcatgcaacacggtactctgtgtgagtatctttatggttctaataaccagcccttaccgtggaagaagaggcttgagattctattgggtt 4652701  T
Q  447 cagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagc 546  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4652700 ccgcgagagggctgaattatcttcatgcagaggtgaaacacaagataatacaccgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggatgagaaatgggtggc 4652601  T
Q  547 taaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcct 646  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| || ||||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||     
T  4652600 taaggtttctgattttggattatcgaaagtgggaccgacaaggatgtctacaacccatgttagcacgatggtgaagggtagcctagggtatttggatcca 4652501  T
Q  647 gagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    || || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4652500 gaatattatatgctccaaaggctaactctaaaatctgatgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctagaccacctttg 4652408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4672184 - 4671528
Alignment:
Q  83 ttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaag 182  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||     || ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||    
T  4672184 ttgtgccgttcctttacaatcgcagagatcaaagcagccacaaacaacttcgatgatgcttctatcatcggagttggagggtttggaaacctgtacaaag 4672085  T
Q  183 gtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctccca 282  Q
    |||   |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4672084 gttgtgtcgatggatccacacttgttgccataaaacggctcaaatcgggctctcagcaaggtgccaacgagttcatgaacgaaatcgagttactctctca 4671985  T
Q  283 gcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcggg 382  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  | ||| |||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| |    
T  4671984 acttcgccacattcacttggtatccctcgttggatattgcgacgatgacacatagatgattttggtttacgagtttatgcagcacggtactctttgcgag 4671885  T
Q  383 tatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggtta 482  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  4671884 tatctttatggttctaataacgagccactaccttggaggcagaggcttgagattctattgggtgctgcgagagggctaaattatcttcatgctgaggtga 4671785  T
Q  483 aaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggacc 582  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  4671784 agcacaaaataatacatcgtgacgtgaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtgggacc 4671685  T
Q  583 gacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatct 682  Q
     || || ||| | |||||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||     
T  4671684 cacggggataacaactacccacgtcagcacaatggtgaaaggaagccttgggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggctaactctaaaatca 4671585  T
Q  683 gacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4671584 gatgtgtactcattcggtgtggtacttcttgaagtgttgtgtgctaggccacctttg 4671528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 81 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 4661350 - 4660693
Alignment:
Q  81 atttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||    
T  4661350 atttgtgccgctactttacaattgcagagatcagagcagccacaaaaaactttgatgatgatttcatcattggagttggagggtttggcaacgtgtacaa 4661251  T
Q  181 aggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcc 280  Q
    |||||   | |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4661250 aggttgtgttgatggatcaacacttgttgcgattaaacgcctcaaatcgggctctcaacaaggtgtcaacgagttcatgaacgaaatcgagttgctctcc 4661151  T
Q  281 cagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcg 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4661150 cagcttcgccacattcatttggtgtccctcatgggatattgtaatgacaacacatagatgattctggtttatgaattcatgcagcgcggtactctctgcg 4661051  T
Q  381 ggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggt 480  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| || || |||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  4661050 agcatctttatggttctaataaccagcccctaccttggaggcaaaggcttgagatcctattgggttcagcaagagggttgcattatcttcatgctgaggt 4660951  T
Q  481 taaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtggga 580  Q
     ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  4660950 gaaacacaaaataatacaccgcgacgtaaagagcaccaacatattgttggatcacaaatgggtagctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtggga 4660851  T
Q  581 ccgacaggtatatcgactac---ccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactctta 677  Q
    |||||||| |||||||||||    |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||  | ||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  4660850 ccgacagggatatcgactactcatcacgtcagcacaatggtgaaggggagccttgggtatttggatccccaatactatatgctccaaaggttaactctaa 4660751  T
Q  678 aatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacc 735  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4660750 aatctgaagtgtactcgttcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacc 4660693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 726
Target Start/End: Original strand, 4784348 - 4785050
Alignment:
Q  24 aaatgaaagaaagtttgtggaaaacaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccac 123  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||    
T  4784348 aaatggaagaaagttcatggaagacaaagaaacaaggttcctcaagtttaccatcccatttgtgccgctattttacaatagcggaaataaaagcagctac 4784447  T
Q  124 aaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctc 223  Q
    ||| |||||||| |||      || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  || ||||||   ||||| |||||||||||||| ||     
T  4784448 aaacaacttcgaagatatttttatcatcggggttggagggttcggcaatgtgtacaaaggttatattgatggagttacaccagttgcgataaaacgtctt 4784547  T
Q  224 aggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgca 323  Q
    |   | || |||||||||||||  || |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||||    
T  4784548 aaaccaggttctcaacaaggtgtgaacgagttcttgaatgagattgagttgctctctcagcttcgtcatattcacttggtttcacttattggatattgca 4784647  T
Q  324 acgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagca 423  Q
    | ||      |||||||||||| || ||||| |||||||  |  || | ||| || |  ||||||||||| ||  ||||| |||| ||  | ||||||||    
T  4784648 atgaaggtgtagagatgattctcgtttatgacttcatgcaacgtggcagtctatgtgaatatctttatggatcagataacaaacctcttacctggaagca 4784747  T
Q  424 gaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacata 523  Q
    ||||||||| ||||| || | ||| ||  | ||| || ||||||| ||| | |  |  ||  |||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  4784748 gaggcttgagattctattaggtgccgcgcgggggttgcattatctgcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgacgtgaagagtacaaacata 4784847  T
Q  524 ttgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagg 623  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| || || || |    
T  4784848 ttgttggatgaaaaatgggtggctaaggtttctgattttgggttatcaaaagtgggacctacagggatgtcgatgacccatgtcagcactatggtgaaag 4784947  T
Q  624 gaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtg 723  Q
    | ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||   |||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4784948 gtagtctcgggtatttggatccagaatactacatgcgacaaaggttgactctaaagtctgatgtgtactctttcggtgttgtgcttcttgaggtgttgtg 4785047  T
Q  724 tgc 726  Q
    |||    
T  4785048 tgc 4785050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 726
Target Start/End: Original strand, 4816794 - 4817479
Alignment:
Q  41 tggaaaacaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatg 140  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||| |||||||| |||     
T  4816794 tggaagacaaagaaacaaggttcctcaagtttaccatcccatttgtgccgctattttacaatagcggaaataaaagcagctacaaacaacttcgaagata 4816893  T
Q  141 aaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaaca 240  Q
         || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||  || ||||||   ||||| |||||||||||||| || |   | || ||||||||    
T  4816894 tttttatcatcggggttggagggttcggcaatgtgtacaaaggttatattgatggagttacaccagttgcgataaaacgtcttaaacctggttctcaaca 4816993  T
Q  241 aggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatg 340  Q
    |||||  || |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||||||| ||      |||||||    
T  4816994 aggtgttaacgagttcttgaatgagattgagttgctctctcagcttcgtcatattcacttggtttcacttattggatattgcaatgaaggtgtagagatg 4817093  T
Q  341 attctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttt 440  Q
    ||||| || ||||| |||||||  |  || | ||| || |  ||||||||||| ||  ||||| |||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |    
T  4817094 attctcgtttatgacttcatgcaacgtggcagtctatgtgaatatctttatggatcagataacaaacctcttacctggaagcagaggcttgagattctat 4817193  T
Q  441 tggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatg 540  Q
    | | ||| ||  | ||| || ||||| | ||| | |  |  ||  |||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  4817194 taggtgccgcgcgggggttgcattatttgcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtacaaacatattgttggatgaaaaatg 4817293  T
Q  541 gatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtattta 640  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| || || || || ||  | ||||||||     
T  4817294 ggtggctaaggtttctgattttgggttatcaaaagtgggacctacagggatgtcgatgacccatgtcagcactatggtgaaaggtagtctcgggtatttg 4817393  T
Q  641 gatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgc 726  Q
    ||||| || ||||| |||   |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4817394 gatccagaatactacatgcgacaaagattgactctaaagtctgatgtgtactctttcggtgttgtgcttcttgaggtgttgtgtgc 4817479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 739
Target Start/End: Original strand, 4697698 - 4698418
Alignment:
Q  19 tattaaaatgaaagaaagtttgtggaaaacaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagca 118  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  4697698 tattgaaatggaagaaagttcatggaggacaagaaaagaaggttcgtcaactttaccatcccatttgtgccgctattttacaatagcggagataagagcc 4697797  T
Q  119 gccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaac 218  Q
    || ||||| |||||||| |||      || || || ||||| |||||||| || ||||  ||||||| |||||||| |   ||||| || || |||||||    
T  4697798 gctacaaacaacttcgaagatatttttatcattggagttggagggtttggtaacgtgttcaaaggttacatcgatgaaggtacacctgtagcaataaaac 4697897  T
Q  219 gcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggata 318  Q
    |  | |   |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||  | |||||    
T  4697898 gtttgaaaccgggttctcaacaaggtgtaaacgagttcatgaatgaaatcgagttgctctctcaacttcgtcacattcacttggtttctctcattggata 4697997  T
Q  319 ttgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatgg 418  Q
    |||||||||     ||||||||||||| || || || ||||||   |  || |||||  | |  ||||| ||||||||  ||||| |||| ||  | |||    
T  4697998 ttgcaacgaaggtgcagagatgattctcgtttacgacttcatggaacgtggcactcttcgtgaatatctctatggttcggataacgaacctcttacttgg 4698097  T
Q  419 aagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcacca 518  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||  ||||| ||||| ||  ||||||||||| | |  |  ||  |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  4698098 aagaagagactcgagattctattgggggcagcaagaggcctacattatcttcatgcaggtgcgaagcacaatatcatacaccgtgatgtgaagagtacca 4698197  T
Q  519 acatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgt 618  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |  ||    
T  4698198 acatattgttagatgataaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggaccaacaggaatgtcgatgacccacgtcagcactaaggt 4698297  T
Q  619 taagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtg 718  Q
     ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||  |    |||||| | || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  4698298 gaagggtagtctcgggtatttagatcccgaatactaccttcgtcaaaggttgaccctaaagtccgacgtgtactcttttggtgttgtgcttcttgaggta 4698397  T
Q  719 ttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    |||||||| || |||||||||    
T  4698398 ttgtgtgcgagaccacctttg 4698418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 4863447 - 4862781
Alignment:
Q  69 ctttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgg 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||     ||| || || ||||| ||||| ||    
T  4863447 ctttaccatcccatttgtgccgctattttacaataacagagataagagctgctacaaacaactttgacgatattttcatcattggagttggagggttcgg 4863348  T
Q  169 gaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatc 268  Q
     || ||||| |||||||  || ||||||  || ||| |||||||||||||| || |   | || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  4863347 caacgtgtacaaaggttatattgatggagacatacctgttgcgataaaacgtcttaaaccaggttctcaacaaggtataaatgagttcatgaatgagatc 4863248  T
Q  269 gagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacag-agatgattctggtctatgagttcatgcggcac 367  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  | |||||||||||||| | |  || |||||||||| || ||||| |||||||  |      
T  4863247 gaattactctctcagcttcgtcatattcacttggtttctctcattggatattgcaacga-aggtgaggagatgattctcgtttatgacttcatgcaacgt 4863149  T
Q  368 ggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatc 467  Q
    || |||||| | |  ||||||||||||||  ||||  |||| ||  | |||||| |||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||| |  ||||||    
T  4863148 ggcactctccgtgaatatctttatggttcggataatgaacctcttacttggaagaagagacttgagattctgttgggggcagcaagggggttacattatc 4863049  T
Q  468 ttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggtt 567  Q
    ||||| |||  || ||  |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  4863048 ttcatgctggtgtaaagcacaatatcatacaccgtgacgtgaagagtaccaacatattgttggatgaaaaatgggtggctaaggtgtctgatttcgggtt 4862949  T
Q  568 atcaaaggtgggaccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaagg 667  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || |  || |||||||||||  | || ||||| ||  | || ||||||||||| || |||||  |    ||||||    
T  4862948 atcaaaagtgggaccaacaggaatgtctatcactcacgtcagcaccgtggtgaagggtagtcttggatatttagatccagaatactaccttcgtcaaagg 4862849  T
Q  668 cttactcttaaatctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacc 735  Q
     | ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  4862848 ttgactctaaaatccgacgtgtattctttcggtgttgtccttcttgaggtgttgtgtgcgagaccacc 4862781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 582
Target Start/End: Original strand, 4846534 - 4847092
Alignment:
Q  24 aaatgaaagaaagtttgtggaaaacaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccac 123  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||    
T  4846534 aaatggaagaaagttcatggaagacaaacaaagaaggttcctcaactttaccgtcccatttgtgccgctattttacaatagcggagataagagaagctac 4846633  T
Q  124 aaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctc 223  Q
    ||| |||||||| |||      || || || | ||| ||||| || || ||||| ||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||||||| |      
T  4846634 aaacaacttcgaagatatttttatcattggagctggagggttcggcaacgtgtacaaaggttacatcaatggactcacacctgttgcgataaaacgtcgt 4846733  T
Q  224 aggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgca 323  Q
    |   |||| |||| | |||||  ||| || |||||||| || |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  4846734 aaaccgggttctcgataaggtctaaatgaattcatgaatgaaatcgagatgctctctcagcttcgtcatattcacttggtttccctcattggatattgca 4846833  T
Q  324 acgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcgggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagca 423  Q
    ||||  |  ||||||||||||| || ||||| |||||||  |  ||||||||| | |   |||| ||||||||  ||||  |||| ||    ||||| ||    
T  4846834 acgaagatgcagagatgattctagtttatgacttcatgcaacgtggtactctcagtgaacatctctatggttcggataatgaacctcttaggtggaatca 4846933  T
Q  424 gaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggttaaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacata 523  Q
     || || || ||||| || | |||||| || ||| ||||||||||||||   |  |  ||  |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  4846934 aagactcgagattctattaggtgcagcaagggggttgaattatcttcatgaaggtgcgaagcacaatatcatacatcgtgacgttaagagtacaaacata 4847033  T
Q  524 ttgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggacc 582  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4847034 ttgttggatgaaaaatgggtggctaaggtttctgatttcgggttatcaaaagtgggacc 4847092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 494 - 739
Target Start/End: Original strand, 4713049 - 4713294
Alignment:
Q  494 atacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtgggaccgacaggtatat 593  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4713049 atacaccgtgacgttaagagtacaaatatattgttggatgaaaaatgggtggctaaggtttctgatttcggtttatcaaaagtgggaccaacagggatat 4713148  T
Q  594 cgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaatctgacgtgtactc 693  Q
    | |  || || |||||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||| |||| |||  |     | | | | |||||||| ||||||||||||||    
T  4713149 caatgactcatgtcagcactatggtgaagggtagtataggatatttggatccagagtgctacctacgaaacaagttgactcttaagtctgacgtgtactc 4713248  T
Q  694 attcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4713249 attcggagttgtgcttcttgaggtgttgtgtgcgagaccacctttg 4713294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 354
Target Start/End: Original strand, 4712579 - 4712909
Alignment:
Q  24 aaatgaaagaaagtttgtggaaaacaaagaaagaaggttcgtcaactttaccatcctatttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccac 123  Q
    ||||||||||||||   ||||| | ||| || |||||||| |||| |||||||||| ||||||| || |  ||||| || | ||| || ||||| || ||    
T  4712579 aaatgaaagaaagtcattggaagataaataatgaaggttcatcaattttaccatcccatttgtgtcgatgttttactatagtggaaataagagccgctac 4712678  T
Q  124 aaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataaaggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctc 223  Q
    ||| |||||||| |||      || ||||| ||||| || || || || ||||| ||||||| ||| ||||||  || ||| |||||||||||||| |      
T  4712679 aaacaacttcgaagatatttttatcatcggggttggaggattcggcaacgtgtacaaaggttacattgatggactcatacctgttgcgataaaacgtcgt 4712778  T
Q  224 aggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcccagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgca 323  Q
    |  | ||| |||| |||||||  ||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||  | ||||||||||    
T  4712779 aaattgggttctcgacaaggtctaaatgaattcatgaatgaaatcgagttgctctctcagcttcgtcatattcacttagtttccctcattggatattgca 4712878  T
Q  324 acgacaagacagagatgattctggtctatga 354  Q
    | ||  |  ||||||||||||| || |||||    
T  4712879 atgaagatgcagagatgattcttgtttatga 4712909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 81 - 739
Target Start/End: Original strand, 18926309 - 18926967
Alignment:
Q  81 atttgtgccgctactttacaatcgcggagatcagagcagccacaaaaaacttcgatgatgaaaacattatcggtgttggggggtttgggaatgtgtataa 180  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  18926309 atttgtgccgctactttacaattgcagagataaaagcagccacaaataactttgatgatgatttaatcatcggagttggagggtttggcaacgtgtataa 18926408  T
Q  181 aggtttcatcgatggatccacacccgttgcgataaaacgcctcaggtcgggctctcaacaaggtgcaaaggagttcatgaacgagatcgagttgctctcc 280  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18926409 aggtttcatcgataaatccacacccgttgcaataaaacgtctcaaaccaggctctcaacaaggggccaacgagttcatgaatgagatcgagttgctctct 18926508  T
Q  281 cagcttcgccacattcacttggtatcccttgtgggatattgcaacgacaagacagagatgattctggtctatgagttcatgcggcacggtactctctgcg 380  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||| || || || ||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||  |  |||||||| || |    
T  18926509 caacttcgccacattcatctggtatccctcgtcgggtactgcaacggcaacaaagagatgattctgatttatgagttcatgcaacgtggtactctttgtg 18926608  T
Q  381 ggtatctttatggttctaataaccaacccctaccatggaagcagaggcttgaaattcttttggatgcagctagagggctgaattatcttcatactgaggt 480  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18926609 agtatctatatggttccaataaccaacccctactttggaagcaaaggcttgagattgtattgggtgccgcaagagggctgaattatcttcatgctgaggt 18926708  T
Q  481 taaaaacaagataatacatcgtgacgtaaagagcaccaacatattgttggatgagaaatggatagctaaggtttctgattttgggttatcaaaggtggga 580  Q
     ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  18926709 gaaacacaagataatacatcgtgatgtgaaaagcaccaacatattattggatgagaaatgggtggctaaggtttccgacttcgggttatccaaggtggga 18926808  T
Q  581 ccgacaggtatatcgactacccacgtcagcacaattgttaagggaagcttggggtatttagatcctgagtactatatgttccaaaggcttactcttaaat 680  Q
    || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  18926809 ccaacggggatatcaactacccatgtcagcacaatggtgaaggggagtcttgggtatttagatcctgagtactatatgctccaaaggcttaccctaaaat 18926908  T
Q  681 ctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtgttgtgtgctaggccacctttg 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18926909 ctgacgtgtactcattcggtgtggtgcttcttgaggtattgtgtgcaaggccacctttg 18926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University