View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10151A_low_120 (Length: 276)

Name: NF10151A_low_120
Description: NF10151A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10151A_low_120
NF10151A_low_120
[»] chr3 (109 HSPs)
chr3 (1-276)||(12020106-12020381)
chr3 (1-276)||(17202821-17203096)
chr3 (1-269)||(34558057-34558325)
chr3 (1-272)||(15548695-15548964)
chr3 (92-272)||(17137567-17137744)
chr3 (92-267)||(39654035-39654208)
chr3 (92-267)||(14061065-14061237)
chr3 (92-267)||(15515798-15515970)
chr3 (118-267)||(25769407-25769552)
chr3 (118-267)||(11199395-11199541)
chr3 (99-274)||(15874374-15874544)
chr3 (92-274)||(11884040-11884217)
chr3 (90-237)||(11330793-11330938)
chr3 (100-276)||(12490635-12490815)
chr3 (118-267)||(14287197-14287343)
chr3 (92-272)||(55443704-55443877)
chr3 (118-267)||(14523258-14523402)
chr3 (119-272)||(18008951-18009101)
chr3 (125-265)||(6230496-6230636)
chr3 (93-265)||(12563354-12563522)
chr3 (94-222)||(35121838-35121963)
chr3 (95-224)||(41659842-41659971)
chr3 (118-267)||(47786715-47786859)
chr3 (125-265)||(33371204-33371344)
chr3 (134-267)||(40937817-40937948)
chr3 (125-265)||(14819683-14819823)
chr3 (115-272)||(38813233-38813395)
chr3 (115-259)||(12950767-12950917)
chr3 (92-223)||(11062976-11063100)
chr3 (118-267)||(14296606-14296750)
chr3 (118-267)||(14302233-14302377)
chr3 (118-223)||(6148703-6148806)
chr3 (94-272)||(48419828-48420008)
chr3 (117-213)||(30204622-30204717)
chr3 (123-223)||(53900448-53900545)
chr3 (118-223)||(17536903-17537007)
chr3 (126-265)||(4147531-4147670)
chr3 (125-259)||(17320412-17320547)
chr3 (125-259)||(43429372-43429507)
chr3 (115-209)||(8602532-8602626)
chr3 (118-267)||(50113971-50114116)
chr3 (125-265)||(4164083-4164222)
chr3 (123-201)||(2045532-2045609)
chr3 (118-265)||(15988724-15988873)
chr3 (118-267)||(22146125-22146270)
chr3 (101-201)||(17098851-17098948)
chr3 (118-201)||(19230256-19230338)
chr3 (123-201)||(19262892-19262969)
chr3 (100-201)||(13815794-13815892)
chr3 (101-201)||(10736762-10736859)
chr3 (125-224)||(18968313-18968411)
chr3 (115-194)||(37918737-37918816)
chr3 (123-201)||(2048261-2048338)
chr3 (125-187)||(11636782-11636844)
chr3 (123-201)||(45581039-45581116)
chr3 (115-258)||(5230434-5230579)
chr3 (101-198)||(12351674-12351767)
chr3 (101-197)||(319451-319543)
chr3 (118-223)||(7851594-7851703)
chr3 (105-201)||(8629995-8630089)
chr3 (115-190)||(10902729-10902804)
chr3 (118-201)||(19572673-19572755)
chr3 (125-224)||(21168552-21168651)
chr3 (118-223)||(17936366-17936475)
chr3 (115-210)||(17391232-17391327)
chr3 (118-201)||(23082062-23082144)
chr3 (118-201)||(23490707-23490788)
chr3 (118-201)||(25056973-25057055)
chr3 (133-223)||(17958297-17958386)
chr3 (158-224)||(31416123-31416189)
chr3 (136-201)||(14846519-14846584)
chr3 (118-201)||(1469509-1469591)
chr3 (118-201)||(8270260-8270342)
chr3 (118-201)||(8277371-8277453)
chr3 (118-201)||(8306180-8306262)
chr3 (118-201)||(12266353-12266435)
chr3 (115-190)||(14182230-14182305)
chr3 (134-201)||(15940337-15940404)
chr3 (118-201)||(16746028-16746110)
chr3 (115-190)||(25106175-25106250)
chr3 (118-201)||(30151552-30151634)
chr3 (118-201)||(41268457-41268539)
chr3 (118-201)||(53768876-53768958)
chr3 (117-190)||(14968093-14968167)
chr3 (133-223)||(23888054-23888143)
chr3 (123-201)||(44227642-44227719)
chr3 (136-201)||(2451439-2451504)
chr3 (136-209)||(15470333-15470406)
chr3 (136-201)||(15574221-15574286)
chr3 (136-201)||(15613240-15613305)
chr3 (101-223)||(16818954-16819078)
chr3 (101-223)||(18908590-18908714)
chr3 (118-267)||(19944676-19944825)
chr3 (101-223)||(22272945-22273069)
chr3 (118-210)||(11517291-11517382)
chr3 (115-190)||(40041404-40041480)
chr3 (115-211)||(15551724-15551826)
chr3 (118-201)||(55314597-55314679)
chr3 (133-223)||(14283515-14283604)
chr3 (163-201)||(15861110-15861148)
chr3 (115-161)||(31414473-31414519)
chr3 (104-157)||(11381064-11381115)
chr3 (162-223)||(12796634-12796694)
chr3 (136-201)||(16935846-16935911)
chr3 (133-214)||(25607242-25607323)
chr3 (133-209)||(12903747-12903823)
chr3 (175-223)||(14695701-14695748)
chr3 (169-201)||(38527807-38527839)
chr3 (100-160)||(51963065-51963124)
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (1-276)||(16915833-16916108)
chr7 (17-269)||(48345777-48346029)
chr7 (8-274)||(9609428-9609694)
chr7 (8-274)||(9837000-9837266)
chr7 (27-276)||(17229848-17230097)
chr7 (92-276)||(13388169-13388354)
chr7 (1-173)||(16917835-16918007)
chr7 (106-276)||(5617639-5617809)
chr7 (92-267)||(49049679-49049850)
chr7 (92-266)||(15628878-15629048)
chr7 (92-274)||(13375870-13376047)
chr7 (92-265)||(9058429-9058600)
chr7 (1-175)||(16921657-16921837)
chr7 (118-267)||(12249923-12250069)
chr7 (92-236)||(15914227-15914368)
chr7 (115-265)||(4482466-4482616)
chr7 (93-263)||(16572010-16572175)
chr7 (93-263)||(16593487-16593652)
chr7 (125-269)||(14938900-14939043)
chr7 (125-269)||(15366493-15366636)
chr7 (118-276)||(10862754-10862911)
chr7 (125-274)||(34242981-34243130)
chr7 (125-268)||(28388632-28388775)
chr7 (95-213)||(9322873-9322991)
chr7 (92-223)||(11285259-11285393)
chr7 (118-223)||(12753089-12753192)
chr7 (149-269)||(31499431-31499551)
chr7 (101-267)||(15824336-15824495)
chr7 (168-274)||(16929845-16929951)
chr7 (168-274)||(16935228-16935334)
chr7 (100-222)||(45455545-45455664)
chr7 (125-256)||(20587480-20587611)
chr7 (101-222)||(141788-141904)
chr7 (101-214)||(44863368-44863478)
chr7 (144-224)||(18920958-18921038)
chr7 (118-201)||(11582820-11582902)
chr7 (118-267)||(26072111-26072255)
chr7 (118-267)||(26095898-26096042)
chr7 (115-265)||(39293974-39294126)
chr7 (118-201)||(13039094-13039176)
chr7 (101-199)||(3893321-3893416)
chr7 (136-201)||(3054920-3054985)
chr7 (118-200)||(113148-113229)
chr7 (123-201)||(122708-122785)
chr7 (123-201)||(1938614-1938691)
chr7 (125-255)||(4444481-4444610)
chr7 (123-201)||(32496436-32496513)
chr7 (118-199)||(16209915-16209995)
chr7 (125-265)||(4437070-4437209)
chr7 (115-190)||(13460601-13460676)
chr7 (92-223)||(13868036-13868169)
chr7 (134-231)||(15687794-15687890)
chr7 (94-223)||(18305789-18305920)
chr7 (118-201)||(2435808-2435890)
chr7 (111-190)||(3193864-3193942)
chr7 (133-223)||(47482788-47482877)
chr7 (134-223)||(18255701-18255789)
chr7 (162-265)||(21677395-21677499)
chr7 (101-165)||(47287950-47288011)
chr7 (118-201)||(11514343-11514425)
chr7 (115-182)||(13452467-13452534)
chr7 (118-201)||(13756798-13756880)
chr7 (118-201)||(13912975-13913057)
chr7 (118-201)||(15443419-15443501)
chr7 (118-201)||(15518719-15518801)
chr7 (118-201)||(27103407-27103489)
chr7 (118-201)||(27110755-27110837)
chr7 (118-201)||(27174836-27174918)
chr7 (118-201)||(38785499-38785581)
chr7 (123-201)||(10987831-10987908)
chr7 (117-268)||(15980350-15980504)
chr7 (125-265)||(9641241-9641379)
chr7 (44-101)||(14939074-14939130)
chr7 (44-101)||(15366667-15366723)
chr7 (118-199)||(30263984-30264064)
chr7 (118-223)||(16416420-16416529)
chr7 (49-101)||(34242897-34242949)
chr7 (162-201)||(12545830-12545869)
chr7 (118-201)||(18981844-18981926)
chr7 (118-201)||(26011053-26011135)
chr7 (162-223)||(369055-369115)
chr7 (162-223)||(2192827-2192887)
chr7 (136-201)||(7821144-7821209)
chr7 (136-201)||(7828455-7828520)
chr7 (133-214)||(15762439-15762520)
chr7 (150-190)||(16370226-16370266)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (30-274)||(98936-99180)
scaffold0031 (125-267)||(30188-30327)
scaffold0031 (94-267)||(68468-68636)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (1-264)||(22363950-22364213)
chr6 (2-253)||(21621312-21621557)
chr6 (92-276)||(18383477-18383661)
chr6 (8-267)||(25917855-25918109)
chr6 (1-274)||(25649437-25649719)
chr6 (92-267)||(7829719-7829891)
chr6 (1-258)||(33539940-33540204)
chr6 (101-264)||(16889621-16889782)
chr6 (92-265)||(12310810-12310983)
chr6 (92-224)||(940932-941063)
chr6 (92-264)||(25369250-25369419)
chr6 (90-267)||(17790961-17791137)
chr6 (92-265)||(22846315-22846488)
chr6 (95-256)||(19852469-19852630)
chr6 (134-222)||(22866325-22866413)
chr6 (125-224)||(17085394-17085492)
chr6 (169-276)||(21927128-21927235)
chr6 (100-267)||(33322915-33323076)
chr6 (149-267)||(15080708-15080824)
chr6 (133-224)||(14150811-14150901)
chr6 (115-265)||(29162738-29162889)
chr6 (125-268)||(31469377-31469520)
chr6 (126-265)||(22467942-22468082)
chr6 (100-214)||(16104775-16104886)
chr6 (125-265)||(22595495-22595636)
chr6 (118-223)||(25646766-25646869)
chr6 (123-265)||(34965130-34965275)
chr6 (125-224)||(6092758-6092856)
chr6 (118-201)||(23151644-23151726)
chr6 (95-201)||(25746119-25746222)
chr6 (118-265)||(21929637-21929786)
chr6 (118-199)||(32896222-32896302)
chr6 (125-201)||(17787684-17787759)
chr6 (134-214)||(31626664-31626744)
chr6 (125-224)||(15006487-15006586)
chr6 (101-267)||(18775382-18775541)
chr6 (101-222)||(22428392-22428508)
chr6 (115-265)||(16131457-16131609)
chr6 (101-201)||(18740583-18740680)
chr6 (93-201)||(19985053-19985158)
chr6 (123-201)||(13016687-13016763)
chr6 (101-222)||(18128258-18128375)
chr6 (101-222)||(18422033-18422150)
chr6 (180-267)||(21411301-21411387)
chr6 (112-210)||(17375550-17375647)
chr6 (115-190)||(4174547-4174623)
chr6 (115-190)||(4230176-4230252)
chr6 (101-201)||(25173456-25173553)
chr6 (115-190)||(17858216-17858291)
chr6 (133-223)||(16301969-16302058)
chr6 (136-201)||(15860981-15861046)
chr6 (118-201)||(1651847-1651929)
chr6 (118-201)||(10487103-10487185)
chr6 (118-201)||(16229804-16229886)
chr6 (118-201)||(16378142-16378224)
chr6 (118-201)||(16385466-16385548)
chr6 (118-201)||(16645737-16645819)
chr6 (118-201)||(16651103-16651185)
chr6 (134-201)||(17344139-17344206)
chr6 (118-201)||(18088647-18088729)
chr6 (136-201)||(1659571-1659636)
chr6 (101-223)||(18578745-18578869)
chr6 (136-201)||(27655960-27656025)
chr6 (118-223)||(16235679-16235788)
chr6 (125-213)||(29603806-29603893)
chr6 (93-157)||(35017602-35017663)
chr6 (101-267)||(18843865-18844029)
chr6 (144-190)||(23219240-23219286)
chr6 (136-223)||(33316603-33316695)
chr6 (133-214)||(1553855-1553936)
chr6 (162-223)||(14628590-14628650)
chr6 (162-223)||(18005079-18005139)
chr6 (171-223)||(13623156-13623207)
chr6 (101-157)||(35011281-35011334)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-264)||(1834-2097)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (17-276)||(40642065-40642324)
chr2 (1-267)||(19812787-19813050)
chr2 (96-276)||(25303757-25303937)
chr2 (110-276)||(9782726-9782892)
chr2 (92-272)||(5078-5254)
chr2 (92-272)||(720550-720726)
chr2 (92-267)||(7319591-7319762)
chr2 (118-267)||(22581838-22581983)
chr2 (99-272)||(24296381-24296558)
chr2 (145-274)||(32738651-32738780)
chr2 (101-272)||(23823315-23823482)
chr2 (101-272)||(23825259-23825426)
chr2 (118-267)||(32082-32227)
chr2 (118-222)||(28972189-28972292)
chr2 (95-265)||(24272245-24272415)
chr2 (94-267)||(4450129-4450295)
chr2 (60-269)||(30994757-30994973)
chr2 (125-259)||(24868741-24868875)
chr2 (100-224)||(22137635-22137755)
chr2 (101-264)||(25600053-25600208)
chr2 (125-222)||(36892615-36892710)
chr2 (92-264)||(24089230-24089406)
chr2 (115-246)||(19435758-19435895)
chr2 (92-253)||(22654228-22654383)
chr2 (1-81)||(9782659-9782739)
chr2 (94-201)||(25877840-25877944)
chr2 (139-201)||(23806484-23806546)
chr2 (101-201)||(9654757-9654854)
chr2 (114-272)||(19657642-19657809)
chr2 (102-201)||(19655200-19655297)
chr2 (146-267)||(269305-269422)
chr2 (123-209)||(460762-460847)
chr2 (136-209)||(22861726-22861798)
chr2 (136-201)||(43644891-43644956)
chr2 (118-201)||(8886387-8886470)
chr2 (115-210)||(6092696-6092790)
chr2 (118-201)||(6877659-6877741)
chr2 (115-190)||(25593422-25593497)
chr2 (162-265)||(43640543-43640646)
chr2 (177-267)||(24573318-24573406)
chr2 (115-269)||(29111955-29112112)
chr2 (118-190)||(18533607-18533679)
chr2 (133-201)||(23779795-23779863)
chr2 (90-161)||(19670960-19671029)
chr2 (118-264)||(22691890-22692030)
chr2 (118-264)||(22696537-22696677)
chr2 (147-201)||(23837282-23837336)
chr2 (136-201)||(25210831-25210896)
chr2 (101-201)||(8941650-8941747)
chr2 (118-201)||(5890154-5890236)
chr2 (118-201)||(11233108-11233190)
chr2 (118-201)||(14908295-14908377)
chr2 (118-201)||(17398453-17398535)
chr2 (118-201)||(22514955-22515037)
chr2 (118-201)||(23772754-23772836)
chr2 (118-201)||(23818397-23818479)
chr2 (118-201)||(24687526-24687608)
chr2 (118-201)||(24828459-24828541)
chr2 (118-201)||(24832911-24832993)
chr2 (118-201)||(28777557-28777639)
chr2 (123-201)||(22273102-22273179)
chr2 (123-201)||(22282335-22282412)
chr2 (133-223)||(28032939-28033028)
chr2 (101-223)||(3801271-3801395)
chr2 (101-223)||(19888885-19889009)
chr2 (118-201)||(20013340-20013422)
chr2 (115-210)||(23614411-23614505)
chr2 (105-223)||(15631549-15631663)
chr2 (125-167)||(20271199-20271241)
chr2 (125-210)||(25132459-25132544)
chr2 (136-222)||(12638184-12638275)
chr2 (133-209)||(17202800-17202876)
chr2 (175-223)||(21140050-21140097)
chr2 (175-223)||(21276577-21276624)
chr2 (133-201)||(22254531-22254598)
chr2 (117-201)||(22692510-22692593)
chr2 (117-201)||(22697157-22697240)
chr2 (119-167)||(24839656-24839704)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-276)||(17021738-17022013)
chr1 (1-265)||(17607119-17607381)
chr1 (94-276)||(20956843-20957023)
chr1 (92-276)||(37235764-37235948)
chr1 (92-267)||(22837215-22837388)
chr1 (94-267)||(22837420-22837591)
chr1 (99-272)||(36358136-36358306)
chr1 (98-267)||(27672980-27673146)
chr1 (92-267)||(51658211-51658383)
chr1 (115-268)||(5472221-5472373)
chr1 (92-265)||(21193356-21193528)
chr1 (92-272)||(19601381-19601556)
chr1 (99-231)||(38035420-38035550)
chr1 (95-213)||(40555614-40555732)
chr1 (94-267)||(35524308-35524473)
chr1 (125-259)||(49999186-49999320)
chr1 (118-223)||(9786295-9786397)
chr1 (125-222)||(18164411-18164509)
chr1 (118-267)||(22408142-22408286)
chr1 (125-265)||(40438123-40438265)
chr1 (118-267)||(27331084-27331227)
chr1 (118-222)||(5676515-5676617)
chr1 (95-213)||(41213476-41213593)
chr1 (101-201)||(35053079-35053176)
chr1 (125-257)||(52397863-52397995)
chr1 (125-224)||(5770043-5770141)
chr1 (123-201)||(37846351-37846428)
chr1 (125-213)||(21042031-21042118)
chr1 (60-224)||(29217329-29217501)
chr1 (118-201)||(18505585-18505666)
chr1 (118-201)||(44036771-44036853)
chr1 (136-201)||(20443944-20444009)
chr1 (136-201)||(20529684-20529749)
chr1 (133-201)||(20895681-20895749)
chr1 (93-201)||(21857691-21857796)
chr1 (1-224)||(46144004-46144230)
chr1 (157-214)||(22148259-22148316)
chr1 (118-214)||(21716357-21716450)
chr1 (115-175)||(33395150-33395210)
chr1 (123-201)||(20929685-20929761)
chr1 (115-210)||(78340-78435)
chr1 (115-190)||(20191999-20192074)
chr1 (118-201)||(35935480-35935562)
chr1 (101-267)||(22080061-22080225)
chr1 (115-265)||(20820625-20820777)
chr1 (136-201)||(41392668-41392733)
chr1 (101-201)||(17146758-17146855)
chr1 (115-187)||(25093113-25093185)
chr1 (118-201)||(5074167-5074249)
chr1 (118-201)||(17003041-17003123)
chr1 (118-201)||(20827088-20827170)
chr1 (118-201)||(22034063-22034145)
chr1 (118-199)||(7642448-7642528)
chr1 (101-223)||(20252253-20252377)
chr1 (118-201)||(18602910-18602992)
chr1 (162-201)||(41217475-41217514)
chr1 (136-201)||(22226201-22226266)
chr1 (60-101)||(49999114-49999155)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (1-276)||(17283417-17283690)
chr8 (30-269)||(15931514-15931753)
chr8 (1-274)||(26009616-26009890)
chr8 (92-276)||(21192537-21192719)
chr8 (92-257)||(23835427-23835592)
chr8 (92-276)||(21199964-21200145)
chr8 (92-267)||(22737789-22737960)
chr8 (92-265)||(38531757-38531927)
chr8 (92-257)||(37655450-37655615)
chr8 (92-265)||(29296071-29296243)
chr8 (118-265)||(17731367-17731511)
chr8 (1-269)||(5851690-5851963)
chr8 (92-267)||(21695773-21695943)
chr8 (118-267)||(20655923-20656068)
chr8 (140-272)||(18769992-18770123)
chr8 (118-222)||(21679351-21679453)
chr8 (95-258)||(33170456-33170620)
chr8 (92-227)||(39448602-39448734)
chr8 (92-267)||(31196403-31196576)
chr8 (125-265)||(24554410-24554550)
chr8 (115-267)||(25293721-25293878)
chr8 (115-267)||(25755710-25755867)
chr8 (102-224)||(23229114-23229234)
chr8 (118-267)||(25120621-25120765)
chr8 (95-213)||(23118655-23118773)
chr8 (125-258)||(23154447-23154578)
chr8 (125-224)||(18263250-18263349)
chr8 (93-211)||(28543079-28543194)
chr8 (118-223)||(41243865-41243968)
chr8 (125-265)||(20707986-20708126)
chr8 (125-268)||(21233866-21234009)
chr8 (101-223)||(645935-646059)
chr8 (128-265)||(24266190-24266327)
chr8 (136-201)||(29758497-29758562)
chr8 (125-213)||(17500092-17500180)
chr8 (125-201)||(20479831-20479906)
chr8 (101-201)||(43375458-43375555)
chr8 (125-224)||(7468532-7468631)
chr8 (134-201)||(22323409-22323476)
chr8 (101-223)||(831670-831794)
chr8 (123-201)||(24387578-24387655)
chr8 (118-264)||(41509102-41509249)
chr8 (115-210)||(11600303-11600398)
chr8 (125-187)||(22499138-22499200)
chr8 (92-222)||(37605202-37605327)
chr8 (162-223)||(269862-269922)
chr8 (123-190)||(16204164-16204230)
chr8 (118-265)||(24906125-24906275)
chr8 (153-266)||(33612875-33612988)
chr8 (115-190)||(24237290-24237365)
chr8 (118-201)||(24547401-24547483)
chr8 (112-190)||(22884036-22884114)
chr8 (125-201)||(16416475-16416550)
chr8 (118-267)||(23508938-23509088)
chr8 (118-201)||(273059-273141)
chr8 (118-201)||(642708-642790)
chr8 (118-201)||(828514-828596)
chr8 (118-201)||(5236413-5236495)
chr8 (125-196)||(19995065-19995135)
chr8 (118-201)||(21846348-21846430)
chr8 (118-201)||(21853753-21853835)
chr8 (118-201)||(22090301-22090383)
chr8 (118-201)||(24663103-24663185)
chr8 (118-201)||(43683872-43683954)
chr8 (101-267)||(13664708-13664872)
chr8 (101-267)||(13723983-13724147)
chr8 (92-146)||(18768646-18768698)
chr8 (133-223)||(21496175-21496264)
chr8 (115-157)||(22319923-22319965)
chr8 (133-223)||(22884683-22884772)
chr8 (101-223)||(3433683-3433807)
chr8 (149-210)||(11542225-11542286)
chr8 (136-201)||(16874800-16874865)
chr8 (94-223)||(24719471-24719603)
chr8 (1-101)||(24266361-24266461)
chr8 (118-223)||(28835891-28836000)
chr8 (118-201)||(16676182-16676264)
chr8 (169-258)||(19333914-19334005)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-269)||(21228095-21228363)
chr5 (92-276)||(13793321-13793505)
chr5 (92-276)||(37189920-37190103)
chr5 (92-272)||(21615197-21615376)
chr5 (92-272)||(7726787-7726964)
chr5 (118-267)||(11338782-11338926)
chr5 (94-274)||(28888075-28888259)
chr5 (94-222)||(24185095-24185220)
chr5 (115-274)||(5453127-5453291)
chr5 (118-267)||(23453059-23453204)
chr5 (118-267)||(23460303-23460448)
chr5 (118-267)||(23464564-23464709)
chr5 (94-272)||(23492098-23492279)
chr5 (115-258)||(19872119-19872263)
chr5 (125-258)||(26561623-26561756)
chr5 (125-265)||(3420668-3420808)
chr5 (99-272)||(32967970-32968141)
chr5 (115-274)||(3671609-3671773)
chr5 (125-265)||(24082310-24082450)
chr5 (162-276)||(430962-431076)
chr5 (118-223)||(21392349-21392452)
chr5 (125-265)||(23236244-23236384)
chr5 (117-267)||(20710647-20710792)
chr5 (118-201)||(24470493-24470575)
chr5 (125-267)||(28257658-28257794)
chr5 (100-201)||(4863489-4863588)
chr5 (144-265)||(6454901-6455022)
chr5 (118-267)||(19403689-19403833)
chr5 (92-161)||(19860529-19860598)
chr5 (110-201)||(27185672-27185761)
chr5 (169-274)||(24227823-24227928)
chr5 (118-201)||(21661573-21661654)
chr5 (125-224)||(5623265-5623364)
chr5 (115-190)||(16837583-16837658)
chr5 (118-201)||(20614832-20614914)
chr5 (162-223)||(11579833-11579893)
chr5 (101-267)||(18780200-18780365)
chr5 (118-201)||(16534329-16534411)
chr5 (118-201)||(21934136-21934218)
chr5 (118-201)||(21940306-21940388)
chr5 (118-201)||(22368654-22368736)
chr5 (118-201)||(25902302-25902384)
chr5 (125-264)||(29912244-29912383)
chr5 (118-201)||(35580474-35580556)
chr5 (118-201)||(37011140-37011222)
chr5 (118-201)||(37051204-37051286)
chr5 (101-267)||(25211947-25212111)
chr5 (101-267)||(25276099-25276263)
chr5 (101-223)||(10218-10342)
chr5 (136-201)||(4201961-4202026)
chr5 (101-223)||(10780270-10780394)
chr5 (95-160)||(25003141-25003205)
chr5 (101-267)||(35793310-35793475)
chr5 (118-223)||(1221806-1221915)
chr5 (118-223)||(9732762-9732871)
chr5 (118-223)||(11340510-11340619)
chr5 (118-201)||(7423820-7423902)
chr5 (123-201)||(21235388-21235465)
chr5 (162-223)||(17473921-17473981)
chr5 (162-223)||(17907726-17907786)
chr5 (136-201)||(21075482-21075547)
chr5 (136-201)||(27008231-27008296)
chr5 (162-223)||(29192886-29192946)
chr5 (133-201)||(32949334-32949403)
chr5 (101-223)||(34937482-34937606)
chr5 (133-201)||(7527378-7527446)
chr5 (175-223)||(22885276-22885323)
chr5 (118-210)||(33628099-33628191)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-274)||(51497-51770)
scaffold0025 (133-214)||(7956-8037)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-274)||(11622-11894)
scaffold0107 (118-201)||(29569-29651)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-274)||(29289-29562)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (92-276)||(33660-33844)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (96-273)||(12246050-12246226)
chr4 (92-273)||(41167725-41167903)
chr4 (94-272)||(34197982-34198157)
chr4 (92-276)||(43283248-43283436)
chr4 (23-264)||(19824214-19824451)
chr4 (93-265)||(41258155-41258326)
chr4 (100-272)||(27959239-27959407)
chr4 (92-259)||(42706906-42707072)
chr4 (118-267)||(15853120-15853267)
chr4 (119-272)||(37958879-37959030)
chr4 (125-269)||(7966437-7966581)
chr4 (92-267)||(14867571-14867741)
chr4 (92-264)||(30236367-30236532)
chr4 (125-269)||(38762966-38763110)
chr4 (125-269)||(5407338-5407482)
chr4 (95-213)||(50223971-50224089)
chr4 (118-272)||(15116127-15116286)
chr4 (118-267)||(18496314-18496460)
chr4 (94-267)||(21961398-21961564)
chr4 (100-209)||(12901595-12901701)
chr4 (1-269)||(18275001-18275273)
chr4 (125-265)||(7187768-7187907)
chr4 (92-267)||(20813846-20814014)
chr4 (118-201)||(44054106-44054188)
chr4 (95-265)||(10239246-10239416)
chr4 (118-267)||(12838172-12838316)
chr4 (134-267)||(13752154-13752282)
chr4 (95-213)||(47470146-47470266)
chr4 (169-267)||(13814727-13814824)
chr4 (118-201)||(53909730-53909812)
chr4 (136-201)||(109686-109751)
chr4 (92-214)||(45460850-45460973)
chr4 (123-201)||(54120180-54120257)
chr4 (101-201)||(8874311-8874408)
chr4 (115-265)||(12136123-12136275)
chr4 (118-223)||(34393296-34393405)
chr4 (118-201)||(13244544-13244626)
chr4 (118-201)||(16366604-16366686)
chr4 (101-223)||(33738395-33738512)
chr4 (115-259)||(41919072-41919217)
chr4 (101-201)||(53706793-53706888)
chr4 (125-256)||(13448877-13449007)
chr4 (125-259)||(19557535-19557669)
chr4 (115-207)||(54365910-54366002)
chr4 (92-163)||(13811514-13811582)
chr4 (133-223)||(14503384-14503473)
chr4 (124-190)||(17378030-17378096)
chr4 (133-226)||(33240566-33240659)
chr4 (133-214)||(23272043-23272123)
chr4 (133-201)||(8043246-8043314)
chr4 (133-201)||(9793554-9793622)
chr4 (118-223)||(18166785-18166894)
chr4 (117-201)||(24237149-24237233)
chr4 (118-201)||(15296054-15296136)
chr4 (123-223)||(55378749-55378853)
chr4 (123-201)||(26337702-26337779)
chr4 (118-199)||(10486890-10486970)
chr4 (125-265)||(13595866-13596004)
chr4 (101-223)||(15274628-15274752)
chr4 (113-190)||(19623870-19623947)
chr4 (101-223)||(26678090-26678214)
chr4 (125-182)||(44345015-44345070)
chr4 (118-223)||(8372518-8372627)
chr4 (60-182)||(12732453-12732581)
chr4 (175-223)||(15211426-15211473)
chr4 (125-213)||(17213708-17213796)
chr4 (118-223)||(18246089-18246198)
chr4 (118-201)||(14950236-14950317)
chr4 (118-201)||(15288887-15288969)
chr4 (123-201)||(47355447-47355524)
chr4 (101-201)||(5684772-5684870)
chr4 (162-223)||(7134533-7134593)
chr4 (1-102)||(7187638-7187739)
chr4 (149-226)||(15676831-15676907)
chr4 (125-223)||(16520712-16520814)
chr4 (175-223)||(9293623-9293670)
chr4 (175-223)||(10642285-10642332)
chr4 (175-223)||(37474642-37474689)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (92-272)||(106710-106887)
scaffold0022 (92-267)||(107782-107954)
scaffold0022 (95-266)||(130075-130244)
scaffold0022 (94-222)||(114108-114233)
scaffold0022 (136-201)||(59310-59375)
scaffold0022 (136-201)||(7023-7088)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (90-267)||(24233-24408)
scaffold0138 (145-265)||(18825-18945)
scaffold0138 (162-223)||(26362-26422)
scaffold0138 (93-209)||(15228-15341)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (99-267)||(9555-9723)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (92-267)||(7173-7343)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (92-264)||(5210-5379)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (89-267)||(12457-12630)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (92-267)||(77889-78062)
scaffold0028 (139-258)||(70157-70275)
scaffold0028 (94-267)||(90976-91148)
scaffold0028 (92-142)||(64273-64322)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (92-223)||(25417-25548)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (125-274)||(1434-1583)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (118-267)||(1527-1672)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (92-264)||(3351-3518)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (92-267)||(9750-9920)
scaffold0021 (92-259)||(19620-19786)
scaffold0021 (92-259)||(29196-29362)
scaffold0021 (118-201)||(138653-138735)
scaffold0021 (101-223)||(76505-76624)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (102-265)||(106430-106592)
scaffold0032 (101-201)||(53869-53966)
scaffold0032 (157-267)||(101669-101779)
scaffold0032 (133-201)||(29346-29414)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (94-264)||(2469-2634)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (112-265)||(25751-25904)
scaffold0004 (112-224)||(84648-84760)
scaffold0004 (134-223)||(331016-331110)
scaffold0004 (135-201)||(197976-198042)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-265)||(199081-199349)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (125-269)||(104147-104291)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (125-268)||(3545-3688)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (118-264)||(5979-6122)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (118-267)||(144862-145007)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (125-265)||(5924-6064)
scaffold0357 (60-98)||(6097-6135)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (125-268)||(780-922)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (92-227)||(7445-7577)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (92-222)||(2890-3017)
scaffold0409 (92-222)||(11145-11272)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (118-211)||(14134-14226)
scaffold0396 (136-201)||(15664-15729)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (118-267)||(92128-92272)
scaffold0023 (118-201)||(11121-11203)
scaffold0023 (118-267)||(86129-86279)
scaffold0023 (123-199)||(34552-34627)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (118-267)||(31652-31796)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (118-223)||(2824-2927)
[»] scaffold0253 (3 HSPs)
scaffold0253 (92-267)||(3931-4112)
scaffold0253 (1-96)||(9716-9811)
scaffold0253 (1-96)||(19141-19236)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (92-267)||(5719-5889)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (92-267)||(6858-7025)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (196-276)||(50873-50953)
[»] scaffold0786 (1 HSPs)
scaffold0786 (100-211)||(4992-5100)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (92-267)||(6766-6935)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (125-268)||(36090-36233)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (92-223)||(26790-26917)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (101-223)||(13705-13823)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (100-190)||(78643-78732)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (101-222)||(59783-59900)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (100-224)||(3513-3633)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (118-222)||(8304-8407)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (93-201)||(37565-37670)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (125-264)||(772-911)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (123-222)||(66577-66673)
scaffold0037 (123-223)||(26645-26743)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (118-267)||(4705-4849)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (125-201)||(1294-1369)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (90-190)||(4276-4374)
scaffold0327 (125-265)||(6727-6867)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (118-201)||(21305-21387)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (118-201)||(249374-249456)
scaffold0012 (133-223)||(35670-35759)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (147-265)||(31508-31625)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (118-200)||(37699-37780)
scaffold0102 (162-223)||(45841-45901)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (125-265)||(25807-25946)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (101-189)||(20810-20895)
scaffold0008 (101-267)||(28326-28485)
scaffold0008 (136-201)||(130083-130148)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (117-213)||(99375-99471)
scaffold0003 (136-201)||(217632-217697)
scaffold0003 (118-223)||(5132-5241)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (94-201)||(7245-7349)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (118-201)||(19469-19551)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (115-190)||(22965-23040)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (92-214)||(13890-14008)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (133-223)||(7035-7123)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (125-213)||(20368-20457)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (94-222)||(3996-4120)
scaffold0342 (118-223)||(2638-2747)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (101-201)||(12427-12523)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (92-209)||(56130-56250)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (115-190)||(11590-11665)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (162-274)||(7016-7132)
scaffold0090 (115-190)||(37018-37093)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (118-201)||(72297-72379)
scaffold0011 (118-201)||(76678-76760)
scaffold0011 (118-201)||(256807-256889)
scaffold0011 (125-201)||(125285-125360)
scaffold0011 (118-210)||(192698-192788)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (136-201)||(111-176)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (136-201)||(1403-1468)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (134-267)||(7316-7450)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (118-199)||(4366-4445)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (101-223)||(648-772)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (136-201)||(40917-40982)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (92-148)||(8784-8840)
scaffold0292 (92-267)||(17606-17779)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (93-201)||(7072-7176)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (95-175)||(55721-55801)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (94-223)||(30561-30692)
scaffold0049 (118-201)||(44362-44444)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (134-201)||(4009-4076)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (115-190)||(13216-13291)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (125-224)||(1815-1913)
[»] scaffold0407 (4 HSPs)
scaffold0407 (110-201)||(92-181)
scaffold0407 (110-201)||(6556-6645)
scaffold0407 (169-264)||(4178-4271)
scaffold0407 (169-264)||(10644-10737)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (110-201)||(17465-17553)
scaffold0195 (92-161)||(8495-8561)
scaffold0195 (92-161)||(13884-13950)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (134-201)||(236350-236417)
scaffold0009 (118-267)||(270199-270349)
scaffold0009 (115-211)||(256625-256720)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (94-264)||(2929-3097)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (133-223)||(3652-3741)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (112-194)||(4210-4292)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (136-201)||(36333-36398)
scaffold0078 (101-201)||(39414-39511)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (118-211)||(27872-27970)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (118-223)||(77509-77618)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (95-210)||(45410-45525)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (126-224)||(2874-2972)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (133-223)||(52314-52403)
scaffold0066 (133-223)||(44145-44234)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (101-211)||(2397-2510)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (101-211)||(5261-5374)
scaffold0383 (162-223)||(239-299)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (136-209)||(28034-28107)
scaffold0225 (136-209)||(14513-14586)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (136-201)||(17098-17163)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (162-223)||(94178-94238)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (157-274)||(141148-141265)
scaffold0001 (168-223)||(78250-78304)
scaffold0001 (118-167)||(75707-75755)
scaffold0001 (162-223)||(166982-167042)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (118-210)||(1228-1318)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (133-209)||(7963-8039)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (101-201)||(33333-33430)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (118-201)||(15806-15888)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (118-201)||(20866-20948)
scaffold0141 (118-201)||(25121-25203)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (118-201)||(25476-25558)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (118-201)||(37507-37589)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (134-201)||(106215-106282)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (133-223)||(16155-16244)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (118-201)||(30970-31058)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (133-223)||(75420-75509)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (162-223)||(5313-5373)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (162-223)||(10151-10211)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (136-201)||(3450-3515)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (162-223)||(24604-24664)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (175-267)||(21386-21474)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (133-201)||(11920-11988)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (137-201)||(4056-4120)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (133-201)||(42019-42087)
scaffold0017 (115-157)||(10572-10614)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (118-201)||(25123-25205)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (123-201)||(12495-12572)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (133-223)||(67547-67636)
[»] scaffold0725 (1 HSPs)
scaffold0725 (153-190)||(7328-7365)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (136-201)||(9800-9865)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (162-223)||(28493-28553)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (118-167)||(72146-72194)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (175-223)||(4873-4920)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (175-223)||(7310-7357)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (175-223)||(49713-49760)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 109)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12020381 - 12020106
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12020381 tgataaatgtgcttggtgaatacttgattgtattattttgaaatgttatgtaaatgtacatattgagttgactgtttatgctaagtacttggaattgaat 12020282  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12020281 tattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 12020182  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  12020181 atgattagttgctctggtgagttgattgatgcttggtcggatatcgggagctatctccgatatcagttttgtaggg 12020106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17203096 - 17202821
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17203096 tgataaatgtgcttggtgaatacttgattgtattattctgaaatgttatgaaaatgtacatactgaattgaatgtttatgctaagtacttggaattgaat 17202997  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17202996 tattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgtccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 17202897  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17202896 aggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggtcggatatcgggagctatctcaggtatcggtttcgtaggg 17202821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34558325 - 34558057
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34558325 tgataagtgtacttggtgaatacttggttgtattattttgaaatgttatgtaaatatacatattgaattaactgtttatgttaagtacttggaattgatt 34558226  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34558225 tattcatgttaaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcccacctttctgtatggatgggtagacgttgtgc 34558126  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34558125 atgattagttgcttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcagttt 34558057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15548964 - 15548695
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |    
T  15548964 tgataaatgtgcttggtgaatacttgattgtattatcttggaatgttatgtaaatgcacatattgaattaactgtttatgttaagtacttaaacttgaat 15548865  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15548864 tattcatgtataactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 15548767  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15548766 atgattagttgctctggtgagttgactgatgcttggttggatatcgggagctatttccggtatcggtttagt 15548695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17137744 - 17137567
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  17137744 gaattgaattattcatggttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtag 17137647  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17137646 acgttgtgcaggattagttgctctagtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 17137567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39654208 - 39654035
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39654208 gaattgaattattcatgcttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 39654111  T
Q  192 acgttgtgcatgattag-ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  39654110 acgttgtgcatgattagtttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatgaggagctatctccggtatcggt 39654035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 14061065 - 14061237
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  14061065 gaattgaattattcatgcttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgactacctgtctgtatggatgggtag 14061162  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14061163 acgttgtgcaagattagttgctctagtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 14061237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15515970 - 15515798
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  15515970 gaattgatttattcatgtttaactgct-atgtggattatgat-gatgtaatacttaccgt-agtggttttgcccgcctacctgtctgtatggatgggtag 15515874  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15515873 acgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggt 15515798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25769552 - 25769407
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||    
T  25769552 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttaccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctccgg 25769456  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25769455 tgagttgattgttgtttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 25769407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 11199395 - 11199541
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11199395 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgcatgattagttgctcttg 11199493  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11199494 tgagttctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 11199541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15874544 - 15874374
Alignment:
Q  99 tttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgt 198  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15874544 tttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttaccccaa-tggttt-gaccgccaacctgtctgtatggatgggtagacgctgt 15874449  T
Q  199 gcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15874448 gcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttgg-tggatatcgggagctacctccggtatcggtttagtag 15874374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 274
Target Start/End: Original strand, 11884040 - 11884217
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11884040 gaattgatttattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgatc-atataatacttacccctagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 11884135  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  11884136 acgctgtgcaggattagtagctccggtgagttgattgatgcttgg-tggatatcgggaactatctccggtatcggtttggtag 11884217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Original strand, 11330793 - 11330938
Alignment:
Q  90 tggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggt 189  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11330793 tggaattactttattcatgtataactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatagttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 11330890  T
Q  190 aaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggt 237  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11330891 agacgctgtgcaggattagttgctctactgagttgattgttgtttggt 11330938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Original strand, 12490635 - 12490815
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||| | ||||||| |||||||||||||| ||    
T  12490635 ttattcgtgcttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccacctacctgtttgtatggatgggtagac 12490732  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  12490733 gttgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctacctccgatatcggtgtagtaggg 12490815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14287343 - 14287197
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  14287343 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctttatggatgggtagactttgtgcaggattagttgctctgg 14287245  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14287244 tgagttctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctcctgtatcggt 14287197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 55443704 - 55443877
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55443704 gaattgaatcattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaa 55443800  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||| |||||| |||||| ||||||   ||| ||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55443801 acgctgtgcaggattag-tgctctagtgagt---ttggtggcttggtggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 55443877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 14523258 - 14523402
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||    
T  14523258 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgct-tgg 14523355  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14523356 tgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 14523402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Original strand, 18008951 - 18009101
Alignment:
Q  119 tatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggt 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||    
T  18008951 tatgtggattatgat-gatgtaatacttacctt-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccagt 18009048  T
Q  219 gagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  18009049 gagttggttgatgcttgg-tggataccgggagctatctccggtattggtttagt 18009101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 6230496 - 6230636
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  6230496 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 6230595  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  6230596 cttgctggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 6230636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 265
Target Start/End: Original strand, 12563354 - 12563522
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12563354 aattgaattattcatgtt-aagtgtt-atgtgaattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 12563450  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    || |||||| |||||||||||||| | ||| ||||  || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12563451 cgctgtgcaggattagttgctctgatcagtcgatttttgcttgg-tggatatcaggagctatctccggtatcg 12563522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35121963 - 35121838
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35121963 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtattacttaccccaagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 35121867  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35121866 gttgtgcatgagtagttgctctggtgagt 35121838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41659971 - 41659842
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41659971 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 41659872  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
      ||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  41659871 aagtgcaggattaatcgctttggtgagttg 41659842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 47786715 - 47786859
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  47786715 ttatttggattatgat-gatgtaatactaacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc-gg 47786812  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47786813 tgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcaggagctatctccggtatcggt 47786859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 33371204 - 33371344
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33371204 gattatgattgatgtaaagcttaccaccagtggttttgaccgcctaccggtctgtatggatgagtagacgtcgtgtatgattagttgctctggtgagttg 33371303  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     | | || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  33371304 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 33371344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40937948 - 40937817
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||   ||| || |    
T  40937948 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgtaggattagttgctctggtgagtcttttg-tgct 40937850  T
Q  234 tggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40937849 t-gttggatatcgggagctttctccgatatcggt 40937817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 14819683 - 14819823
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  14819683 gattatgattgatgtaaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 14819782  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  14819783 cttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 14819823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 272
Target Start/End: Original strand, 38813233 - 38813395
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt------gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |      ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  38813233 tgtttatgttgattatgattgatgtaatacttacccctagtggatctatgatggactgcctacctgtctgtatgtatgggtagacgttgtgcaaaattag 38813332  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  38813333 ttgctccggtgagttggttgatgcttgg-tggataccgggagctatctccggtatcagtttagt 38813395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12950917 - 12950767
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  12950917 tgtttatgttgattatgattgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatagatgggtaaacgttgtgcaggattaa 12950818  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    ||||| |||| ||||| ||| || ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  12950817 ttgctttggtcagttgcttggtggttgcttggatagcaagagctatctccg 12950767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Original strand, 11062976 - 11063100
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||     
T  11062976 gaattgaattattcatgtt-aattgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccg----tctgtctgtatggatgggtag 11063068  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11063069 acgttgtgcaggattagctgctctggtgagtt 11063100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14296750 - 14296606
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  14296750 ttatttggattatgat-gatgtaacacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgctc-gg 14296653  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  || ||| |||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  14296652 tgagtt--tttatgcttgg-tggatatcggaagctttctccagtatcggt 14296606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14302377 - 14302233
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  14302377 ttatttggattatgat-gatgtaacacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgctc-gg 14302280  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  || ||| |||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  14302279 tgagtt--tttatgcttgg-tggatatcggaagctttctccagtatcggt 14302233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 6148703 - 6148806
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||    
T  6148703 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgctc-gg 6148800  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  6148801 tgagtt 6148806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48420008 - 48419828
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||    
T  48420008 attgttttatttatgtctaactgttt-tgtggattatgat-gatgtaatacttaccccaa-tggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgg 48419912  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  48419911 gtagacgttgtgcatgattaattgctctggtgagttggttgatgcttgg-tggataccggaagctatctccagtataggtttagt 48419828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30204717 - 30204622
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  30204717 tttatttggattatgat-gatgtaatacttactcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgct 30204622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 53900448 - 53900545
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  53900448 tggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc-ggtgagt 53900544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 17536903 - 17537007
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccc-cagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  17536903 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttaccccccagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgct-tg 17537000  T
Q  217 gtgagtt 223  Q
    |||||||    
T  17537001 gtgagtt 17537007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 4147531 - 4147670
Alignment:
Q  126 attatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttga 225  Q
    |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  4147531 attatgattcttgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttgc 4147630  T
Q  226 ttgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||| || ||| || |||| || |||||||||||| |||||    
T  4147631 ttggtggttgcttagatagcgggagctatctccgttatcg 4147670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Original strand, 17320412 - 17320547
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg-ctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  | || | ||||    
T  17320412 gattatgattgatgtaaagcttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgtttttgataagtt 17320511  T
Q  224 gattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    | |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  17320512 gcttgatgattgcttggatattgggagctatctccg 17320547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Original strand, 43429372 - 43429507
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgc-tctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||| | |||||||||    
T  43429372 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatagatgggtagacgaagtacaggattagttgcttttggtgagtt 43429471  T
Q  224 gattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    | ||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  43429472 gcttggtgattgcttggatatcgggagatatctccg 43429507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8602626 - 8602532
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  8602626 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagt 8602532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 50113971 - 50114116
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||    
T  50113971 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgactgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tgg 50114068  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||   ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  50114069 tgagtcttttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 50114116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 4164083 - 4164222
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4164083 gattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaaggttagttgctttggtgagttg 4164181  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| |||||||  | || ||||||||| |||||    
T  4164182 cttggtggttgcttggatagtgggaactatctccgttatcg 4164222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2045609 - 2045532
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2045609 tggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 2045532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15988873 - 15988724
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgctct- 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| |||||| ||||| |     
T  15988873 ttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctttc 15988774  T
Q  216 ggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||||||||  ||| || ||| |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  15988773 ggtgagtttcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcg 15988724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 22146125 - 22146270
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||| |||    
T  22146125 ttatttggattatgat-gatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaaaagtagttgct-tgg 22146222  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||   ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22146223 tgagtcttttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 22146270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17098948 - 17098851
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17098948 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttttccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 17098852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19230338 - 19230256
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19230338 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 19230256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 19262892 - 19262969
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19262892 tggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 19262969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13815892 - 13815794
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13815892 ttattcatgtt-aactgtt-attttgattatgat-gatgtaatacttacccccagaagttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 13815796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10736859 - 10736762
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10736859 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccacctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 10736763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18968411 - 18968313
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18968411 gattatgattgatgtgaatcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggat-gatagacgacgtgcatgattagttgctttggtgagttg 18968313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 37918737 - 37918816
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  37918737 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggtttcgaccgcctaccagtttgtatgaatgggtaaacg 37918816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2048338 - 2048261
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2048338 tggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaacctcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 2048261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11636844 - 11636782
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11636844 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgg 11636782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45581116 - 45581039
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45581116 tggattatgata-atgtaatatttacccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 45581039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 258
Target Start/End: Original strand, 5230434 - 5230579
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc- 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||   ||||| |||||| ||||     
T  5230434 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttacccgtagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggaagggtagacaaagtgcaggattagtttgct 5230533  T
Q  213 tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
    | |||||||| | |||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  5230534 tttggtgagtggcttgatgattgcttggataacgggagctatctcc 5230579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 198
Target Start/End: Original strand, 12351674 - 12351767
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgt 198  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12351674 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 12351767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Original strand, 319451 - 319543
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttg 197  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  319451 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttg 319543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7851703 - 7851594
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  7851703 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcattattagttg 7851605  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  7851604 ct-tggtgagtt 7851594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8630089 - 8629995
Alignment:
Q  105 catgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8630089 catgattaactgtt-atttggattatgat-gatgtaatatttacccccagcggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgtagtgca 8629995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10902804 - 10902729
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10902804 tgtttatgttgattatgattgatatgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 10902729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 19572673 - 19572755
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19572673 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttatccgtctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 19572755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 21168552 - 21168651
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  21168552 gattatgattgatgtaaagcttacacctaatggttctgaccacctacttgtcagtatggatgggtaaacgaagtgcatgattagtttctttggtgagttg 21168651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17936475 - 17936366
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtt------ttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      | |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17936475 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 17936377  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    ||| ||||||||    
T  17936376 ctc-ggtgagtt 17936366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17391327 - 17391232
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||| |||||    
T  17391327 tgttaatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgagtagtt 17391232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 23082062 - 23082144
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  23082062 ttatctggattatgata-atgtaatacttaccctcagtggttttaaccgcatacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 23082144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23490788 - 23490707
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23490788 ttatttggattatgata-atgtaatacttaccct-agtggttttaaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgca 23490707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25057055 - 25056973
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  25057055 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 25056973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 17958297 - 17958386
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||    
T  17958297 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatgcatgaatagtagct-tggtgagtt 17958386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 31416123 - 31416189
Alignment:
Q  158 ttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31416123 ttttgactgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagttg 31416189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 14846519 - 14846584
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  14846519 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 14846584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 1469509 - 1469591
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  1469509 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 1469591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 8270260 - 8270342
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  8270260 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 8270342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 8277371 - 8277453
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  8277371 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 8277453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 8306180 - 8306262
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  8306180 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 8306262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 12266353 - 12266435
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  12266353 ttatctggattatgata-atgtaatacttacacccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 12266435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 14182230 - 14182305
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  14182230 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccaatggttttgaccgcctatctgtttgtatgaatgggta 14182305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 15940337 - 15940404
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15940337 tgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15940404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16746028 - 16746110
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16746028 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16746110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 25106175 - 25106250
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  25106175 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtttgtgtgaatgggta 25106250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30151634 - 30151552
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  30151634 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 30151552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41268539 - 41268457
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  41268539 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 41268457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53768958 - 53768876
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  53768958 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 53768876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14968167 - 14968093
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggt-tttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  14968167 tttatgttgattatgattgatgtgaaactaacccccagtggtctttgaccgtctacctgtttgtatgaatgggta 14968093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 23888054 - 23888143
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||  |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  23888054 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtggacgttgtgcaagaatagtagct-tggtgagtt 23888143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44227719 - 44227642
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  44227719 tggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 44227642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 2451439 - 2451504
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  2451439 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 2451504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Original strand, 15470333 - 15470406
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||    
T  15470333 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctatttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcgtgagtagt 15470406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15574286 - 15574221
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15574286 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15574221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15613305 - 15613240
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15613305 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15613240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16819078 - 16818954
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  16819078 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 16818982  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16818981 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 16818954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18908714 - 18908590
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  18908714 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 18908618  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18908617 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 18908590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19944825 - 19944676
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  19944825 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggatatgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagatg 19944727  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || |||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  19944726 ct-tggtgagtt--ttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 19944676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22273069 - 22272945
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  22273069 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 22272973  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  22272972 ttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 22272945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Original strand, 11517291 - 11517382
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  || ||||| | || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||| |||||    
T  11517291 ttatgttgattatgattgatgtgaagctaaccccaa-tgattttgaccgcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgagtagtt 11517382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 40041404 - 40041480
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccc-cagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||    
T  40041404 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccccccagtggttttgagcgcctacttgtttgtatgaatgggta 40041480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Original strand, 15551724 - 15551826
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  15551724 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttaccccctgtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgtatgattag 15551823  T
Q  209 ttg 211  Q
    |||    
T  15551824 ttg 15551826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55314679 - 55314597
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  55314679 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgca 55314597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14283604 - 14283515
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  14283604 ttgatgtaatactcacccatagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagct-tggtgagtt 14283515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Original strand, 15861110 - 15861148
Alignment:
Q  163 accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15861110 accgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 15861148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Original strand, 31414473 - 31414519
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  31414473 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggtttt 31414519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11381115 - 11381064
Alignment:
Q  104 tcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg 157  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11381115 tcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacctccagtgg 11381064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12796694 - 12796634
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  12796694 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 12796634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 16935846 - 16935911
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16935846 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccacctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16935911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 25607242 - 25607323
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||| |||| || |||||||||    
T  25607242 ttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctc 25607323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 12903747 - 12903823
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||| || || ||| || |||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  12903747 ttgaagtaatactcactcccagtggttttaacagcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggattagt 12903823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14695748 - 14695701
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  14695748 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 14695701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38527839 - 38527807
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38527839 tacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 38527807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Original strand, 51963065 - 51963124
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttt 160  Q
    ||||||||| |||| || |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51963065 ttattcatgcttaattgattaattggattatg-ttgatgtaatactcacccccagtggttt 51963124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16916108 - 16915833
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16916108 tgataaatgtgcttggggaatacttgattgtattattttgaaatgttatgtaaatgtacatactgaattgactgtttatgctaagtacttggaattgaat 16916009  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16916008 tattgataattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 16915909  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16915908 aggattagttgctccggtgagttaattgatgtttggtcggatatcgggagttatctccggtatcgctttagtaggg 16915833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48346029 - 48345777
Alignment:
Q  17 tgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactg 116  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48346029 tgaatacttggtcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaattg 48345930  T
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctg 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  48345929 tttacgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatgattttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttg 48345830  T
Q  217 gtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48345829 gtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggttt 48345777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9609694 - 9609428
Alignment:
Q  8 tgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcat 107  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609694 tgtgctaggtgaatacttgatcgtattattatgggatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcat 9609595  T
Q  108 gtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgatta 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9609594 gtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggatta 9609495  T
Q  208 gttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||| ||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9609494 gttacttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcgattttgtag 9609428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9837266 - 9837000
Alignment:
Q  8 tgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcat 107  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9837266 tgtgctaggtgaatacttgatcgtattattatgggatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcat 9837167  T
Q  108 gtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgatta 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9837166 gtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggatta 9837067  T
Q  208 gttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||| ||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9837066 gttacttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcgattttgtag 9837000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 276
Target Start/End: Original strand, 17229848 - 17230097
Alignment:
Q  27 attgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtgga 126  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  17229848 attgtattatcttggaatgttatgtaaatgcacatactaagtgaactatttatgttaagtacttagaattgatttgttcatgcttaactgcttatgtgga 17229947  T
Q  127 ttatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17229948 ttatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgagtagacgctgtgcaggattagttgctccggtgagttgat 17230047  T
Q  227 tgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17230048 taatgcttggttggatatcgggagctatcaccggtatcgattttgtaggg 17230097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13388354 - 13388169
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt-gaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13388354 gaattggtttattcatgtctaactgttcatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 13388255  T
Q  191 aacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13388254 gacgttgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttagtcggatatcgggagctatctccagtatcgatttagtaggg 13388169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16918007 - 16917835
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16918007 tgataaatgtgcttggggaatacttgattgtattattttgaaatgttatgtaaatgtacatactgaattgactgtttatgctaagtacttggaattgaat 16917908  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacct 173  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16917907 tattgataattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacct 16917835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5617809 - 5617639
Alignment:
Q  106 atgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5617809 atgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgat 5617710  T
Q  206 tagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
     |||||||   |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5617709 gagttgcttcagtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctcaggtatcggtttcgtaggg 5617639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 49049679 - 49049850
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  49049679 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 49049775  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  49049776 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatcttcggtatcggt 49049850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15629048 - 15628878
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15629048 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 15628952  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcgg 266  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15628951 acgatgtgtaggattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccagtatcgg 15628878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13376047 - 13375870
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13376047 gaattgttttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtattacttaccct-agtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 13375952  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13375951 acgctgtgcaggattagttgctccggtgagttgattggtgcttgg-tggatatcgagagctatctccggtatcagtttagtag 13375870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Original strand, 9058429 - 9058600
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  9058429 gaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttaccct-agtg-ttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 9058526  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | | | || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  9058527 acgttgtgcaggattagttgctttggtgagtggctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 9058600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 16921657 - 16921837
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16921657 tgataagtgtgcttggtgaatgcttgatcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtgcttggaattgatt 16921756  T
Q  101 t--attcat----gtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgt 175  Q
    |  ||||||    | | || | | | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16921757 ttaattcatataagctcaaatctatttttggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacatacctgt 16921837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 12249923 - 12250069
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  12249923 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctccgg 12250021  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12250022 tgagttctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 12250069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 236
Target Start/End: Original strand, 15914227 - 15914368
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15914227 gaattgttttattgatgtctaactgtt-atgtggattataat-gatgtaatacttacccccagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 15914323  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttgg 236  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15914324 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttgg 15914368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4482616 - 4482466
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  4482616 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtgatttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctt 4482517  T
Q  215 tggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  4482516 tggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 4482466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Original strand, 16572010 - 16572175
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  16572010 aattgaattattcatgtt-aattgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtaga 16572106  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtat 263  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16572107 cgttgtgaaggattagttgatctggtgagtcctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtat 16572175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16593652 - 16593487
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  16593652 aattgaattattcatgtt-aattgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtaga 16593556  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtat 263  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16593555 cgttgtgaaggattagttgatctggtgagtcctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtat 16593487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14939043 - 14938900
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  14939043 gattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgtaggattagttgcttcggtgagttg 14938945  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
     ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14938944 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggttt 14938900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15366636 - 15366493
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  15366636 gattatgattgatgtaaagcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgtaggattagttgcttcggtgagttg 15366538  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
     ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15366537 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggttt 15366493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 276
Target Start/End: Original strand, 10862754 - 10862911
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||     
T  10862754 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggtttcgactgcctacctgtctgtatggattggtagacgttgtgcaggattagttgctttga 10862852  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||  | || |||||||||| ||| | ||||||    
T  10862853 tgagttgcttgatgcatggtcggatatcggaaactttctccggtattggtgttgtaggg 10862911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Original strand, 34242981 - 34243130
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||   ||||||||    
T  34242981 gattatgattgatgtaatgtttaccccgagtggttttgactgcctacctgtttgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgcttcagtgagttg 34243080  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||    
T  34243081 tttgatgcttggttggatatcgggagctatccccagtatcggtttcgtag 34243130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28388775 - 28388632
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28388775 gattatgattgatgtaaagcttacccccaggggttttgaccgcctacctgtttatatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagttg 28388676  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
       | || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  28388675 cccggtgattgcttggataacgggagctatctccgttatcggtt 28388632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 9322873 - 9322991
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||    
T  9322873 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacttgtctgtatcgatgggtagacg 9322972  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgct 213  Q
      ||||| |||||||||||    
T  9322973 aagtgcaggattagttgct 9322991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11285393 - 11285259
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt------gaccgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||      |||||| |||||||||||||||||    
T  11285393 gaattgaattattcatgtttaactgtt-atgtggattatcat-gatgtaatacttacccccagtggatttgtgatggaccgcctacctgtctgtatggat 11285296  T
Q  186 gggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11285295 gagtagacgttgtgcatgattagttgct-tggtgagtt 11285259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12753192 - 12753089
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  12753192 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagttgctc-gg 12753095  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  12753094 tgagtt 12753089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31499551 - 31499431
Alignment:
Q  149 ccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgag 248  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||| |||||||||| |    
T  31499551 ccccagtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgcttcggtgagttgcttggtgcttgtttggatatcggg 31499452  T
Q  249 agctatctccggtatcggttt 269  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  31499451 agctatcgccgatatcggttt 31499431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 15824336 - 15824495
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15824336 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtga 15824432  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | |||||||||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15824433 aggattagttgctc-ggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 15824495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 274
Target Start/End: Original strand, 16929845 - 16929951
Alignment:
Q  168 atacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16929845 atacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttcttcggtgagttaattgatgcttggtcggaaatcgggagctatctccggtatcggt 16929944  T
Q  268 ttagtag 274  Q
    || ||||    
T  16929945 ttcgtag 16929951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 274
Target Start/End: Original strand, 16935228 - 16935334
Alignment:
Q  168 atacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16935228 atacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttcttcggtgagttaattgatgcttggtcggaaatcgggagctatctccggtatcggt 16935327  T
Q  268 ttagtag 274  Q
    || ||||    
T  16935328 ttcgtag 16935334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 222
Target Start/End: Original strand, 45455545 - 45455664
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  45455545 ttattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgta 45455641  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||  | |||||||||||||||||    
T  45455642 cagaagtagttgctctggtgagt 45455664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Original strand, 20587480 - 20587611
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||   |||| ||||||||| |  |||||||||    
T  20587480 gattttgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacatgcaggattagttgattcggtgagttg 20587579  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatct 256  Q
     ||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  20587580 tttggtgcttgcttggatatcgggagctatct 20587611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 141904 - 141788
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  141904 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 141809  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagt 222  Q
    | |  |||||||| ||||||||    
T  141808 agggatagttgct-tggtgagt 141788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44863478 - 44863368
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44863478 tattcatgtt-aactgtt-atttggattataat-gatgtaatacttacccccagtggttttgacagcatacctgtctgtgtggatgggtagacgttgtgc 44863382  T
Q  201 atgattagttgctc 214  Q
    | |  |||||||||    
T  44863381 agggatagttgctc 44863368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 18920958 - 18921038
Alignment:
Q  144 cttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18920958 cttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 18921038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 11582820 - 11582902
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11582820 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 11582902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 26072111 - 26072255
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  26072111 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccacagtcgttttaatcgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-gg 26072208  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  26072209 tgagtt--ttaatgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 26072255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 26095898 - 26096042
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  26095898 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccacagtcgttttaatcgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-gg 26095995  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  26095996 tgagtt--ttaatgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 26096042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Original strand, 39293974 - 39294126
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt--gc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| | |||  ||||||||||||||        
T  39293974 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttagccccagtggttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggcagacgaagtgcatgattagtttgat 39294073  T
Q  213 tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | |||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  39294074 tttggtgagttgcttgatgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 39294126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 13039094 - 13039176
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13039094 ttatttggattatg-ttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgttgtgca 13039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3893416 - 3893321
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3893416 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgtctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtg 3893321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3054985 - 3054920
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3054985 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgca 3054920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Original strand, 113148 - 113229
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  113148 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgtctacctatctatatggatgggtagacgttgtgc 113229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 122785 - 122708
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  122785 tggattatgata-atgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtgca 122708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 1938614 - 1938691
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1938614 tggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgca 1938691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4444610 - 4444481
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||| |||  ||||| |||||||||||  |||||||||    
T  4444610 gattttgattgatgtaaatcttacccctagtggttttgatcgcctacatgtgtgtatagatgggtagacgacgtgcaggattagttgcttcggtgagttg 4444511  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatc 255  Q
     ||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  4444510 cttggtgctt-gttggatatcgggagctatc 4444481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 32496436 - 32496513
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32496436 tggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatggatagacgttgtgca 32496513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16209995 - 16209915
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16209995 ttatttggattatgata-atgtaatacttatccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgctgtg 16209915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4437209 - 4437070
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||   ||| | |||||||||||   ||||||||    
T  4437209 gattttgattgatgtaaatcttacccctagtgattttgatcgcctacctatctgtatggatgggtagacaacgtgtaggattagttgcttcagtgagttg 4437110  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  4437109 cttgatgctt-gtttgatatcaggagctatctccggtatcg 4437070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13460676 - 13460601
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13460676 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 13460601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Original strand, 13868036 - 13868169
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      |  || |||||||||||||||||    
T  13868036 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggatctgtgatggattgcctacctgtctgtatggat 13868132  T
Q  186 gggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  13868133 gggtagacgttttgcaggattagttgct-tggtgagtt 13868169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15687890 - 15687794
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatg 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15687890 tgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctc-ggtgagttgatcgatg 15687794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 18305789 - 18305920
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      || || ||||||||||||||||||     
T  18305789 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggatctgtgatggactgcctacctgtctgtatggatga 18305885  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18305886 gtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 18305920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 2435890 - 2435808
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  2435890 ttatctggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 2435808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 190
Target Start/End: Original strand, 3193864 - 3193942
Alignment:
Q  111 taactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3193864 taactgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccc-agtagttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 3193942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 47482788 - 47482877
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  47482788 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaactgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgcaggagtagtagct-tggtgagtt 47482877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Original strand, 18255701 - 18255789
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  18255701 tgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagct-tggtgagtt 18255789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Original strand, 21677395 - 21677499
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgc-tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccgg 260  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||   |||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||||||||||     
T  21677395 gaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagactgcgtgcatgattagttgcttttggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgt 21677494  T
Q  261 tatcg 265  Q
    |||||    
T  21677495 tatcg 21677499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47288011 - 47287950
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgacc 165  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47288011 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgacc 47287950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11514425 - 11514343
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  11514425 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 11514343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13452534 - 13452467
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13452534 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttatccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatg 13452467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13756880 - 13756798
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  13756880 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 13756798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 13912975 - 13913057
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  13912975 ttatttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 13913057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 15443419 - 15443501
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15443419 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15443501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 15518719 - 15518801
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15518719 ttatctggattatgata-atgtaatacttacccccggtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15518801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 27103407 - 27103489
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  27103407 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 27103489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 27110755 - 27110837
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  27110755 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 27110837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27174918 - 27174836
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  27174918 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 27174836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 38785499 - 38785581
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  38785499 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 38785581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10987908 - 10987831
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  10987908 tggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 10987831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 268
Target Start/End: Original strand, 15980350 - 15980504
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgctct 215  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||| ||||| || | |||||| ||||| |    
T  15980350 tttatgttgataatgattgatgtgaagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctctttgtaaaaatgggtagacgttttgtaggattagattgcttt 15980449  T
Q  216 -ggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagct-atctccggtatcggtt 268  Q
     ||||||||| ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  15980450 cggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctaatctccgttatcggtt 15980504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9641379 - 9641241
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc-tctggtgagt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||  ||| | |||||| |||| | ||||||||    
T  9641379 gattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctac----ctgtatggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgcttttggtgagt 9641284  T
Q  223 tgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    || ||| || ||| |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  9641283 tgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcg 9641241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14939130 - 14939074
Alignment:
Q  44 tgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgattt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  14939130 tgttatgtaaatgtacatattgaattaactg-ttatgtgaagtaattggaattgattt 14939074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15366723 - 15366667
Alignment:
Q  44 tgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgattt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  15366723 tgttatgtaaatgtacatattgaattaactg-ttatgtgaagtaattggaattgattt 15366667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Original strand, 30263984 - 30264064
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||    
T  30263984 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 30264064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16416529 - 16416420
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  16416529 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatg 16416431  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  16416430 ct-tggtgagtt 16416420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 101
Target Start/End: Original strand, 34242897 - 34242949
Alignment:
Q  49 tgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgattt 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  34242897 tgtaaatgtacatattgaatcaactatttatgttaagtgcttggaattgattt 34242949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Original strand, 12545830 - 12545869
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12545830 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 12545869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 18981844 - 18981926
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  18981844 ttatctggattatgata-atgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 18981926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 26011053 - 26011135
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  26011053 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctgcttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 26011135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 369115 - 369055
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  369115 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 369055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 2192827 - 2192887
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  2192827 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 2192887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7821209 - 7821144
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  7821209 atgtaatgcttatccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 7821144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7828520 - 7828455
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  7828520 atgtaatgcttatccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 7828455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 15762439 - 15762520
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||||    
T  15762439 ttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcttacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagctc 15762520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 190
Target Start/End: Original strand, 16370226 - 16370266
Alignment:
Q  150 cccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16370226 cccagtgggtttgaccgcctacctgtttgtatggatgggta 16370266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Original strand, 98936 - 99180
Alignment:
Q  30 gtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggatta 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  98936 gtattattttgaaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtgtatgttaagtacttggaattgatttattcatgttttactttttatgtggatta 99035  T
Q  130 tgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattga 229  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  99036 tgattgatgtaatgtttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttga 99135  T
Q  230 tgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  99136 tgtttggttggatatcgggagctatatccggtatcggtttcgtag 99180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30327 - 30188
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30327 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttc 30229  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
     ||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30228 tttg-tgcttgg-gggatatcgggagctatctccggtatcggt 30188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 68636 - 68468
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||    
T  68636 attgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gacataatacttacccccagtggttttgactgcctacctgtctatatggatgggtagac 68540  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  68539 gttgtgcaggattagttgctctggtgagtcttttg-tgcttgg-tggataccgggagctttctccggtatcggt 68468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 22363950 - 22364213
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22363950 tgataaatgtgcctgatgaatacttgattttattattttgaaatgttatgtaaatgtacatactgaattgactgtttatgctaagtacttggaattgaat 22364049  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| |    
T  22364050 tattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccctgtggttttgaccgcctacctatctgtgtggaagggtatacgttgtac 22364149  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22364150 aagattagttgctctggtgagttgattgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatc 22364213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21621557 - 21621312
Alignment:
Q  2 gataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgattt 101  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||    
T  21621557 gataaatgtgcttggtgaatatttgattgtatcattttgaaatgttatgta------catattgaattgactgtttatgttaagtgtttagaattgattt 21621464  T
Q  102 attcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21621463 attcatgcttaactacttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgca 21621364  T
Q  202 tgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagcta 253  Q
     |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21621363 ggattagttcccccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagcta 21621312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Original strand, 18383477 - 18383661
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18383477 gaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaacccgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 18383576  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383577 acgctgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggtcggataacgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 18383661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25918109 - 25917855
Alignment:
Q  8 tgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcat 107  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  25918109 tgtgcctgatgaatatttgattgtattattttgaaatgt-atgagaatgaacataatgaattaattgtttatgttaagtacttgaaattaatgcattcat 25918011  T
Q  108 gtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgatta 207  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  25918010 gcttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggagta 25917913  T
Q  208 gttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||| |  |||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  25917912 gttgtttcggtgag-tgattgatgcttgg-tggatagcgggagctacctccggtatcggt 25917855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25649719 - 25649437
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25649719 tgataagtgtgcttggtgaatacttgatcgtaatattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatgtaaagtgcttggaattgatt 25649620  T
Q  101 t--attc----atgtttaactgt---ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
       ||||    ||| | || | |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  25649619 ccaattcctatatgctcaaatctctgttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtttggatgggtag 25649520  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    |||||||||| | |||||| ||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  25649519 acgttgtgcagggttagtttcttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatatctggtattggtttcgtag 25649437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 7829719 - 7829891
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  7829719 gaattgatttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctaatggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtag 7829816  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7829817 acgctgtgcaggattagttgctctggtgaattgattgttgcttgg-tggatatcggaagctatctccggtatcggt 7829891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 33539940 - 33540204
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33539940 tgataagtgtgcttggttaatacttgatcgtaatattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatgttaagtgcttggaattgatt 33540039  T
Q  101 t--attcatgttt------aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |  |||||| | |      | || ||| | | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33540040 ttaattcatatatgctcagatctattt-tattgattatgattgatgtaaagcttacgcccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 33540138  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||| | | || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  33540139 cgttgtgcaagattagttgatttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctcc 33540204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Original strand, 16889621 - 16889782
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  16889621 tattcatgtataactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgaatgggtagacgttgtgc 16889718  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    | |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16889719 aggattagtttctcttgtgagttggttgatgcttgggtggatatcgggagctatctccgatatc 16889782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Original strand, 12310810 - 12310983
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  12310810 gaattgacttattcatgtctaaatgtttatgtggattatgattgatgtaaaacttaccctcagtggttttgaccgcctacctgtcggtatggatgggtag 12310909  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| | | |  ||| |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  12310910 acgttgtgcaggattagtttctttggtgagttgctcggtagttgcttggatagtgggagctatctccgctatcg 12310983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 224
Target Start/End: Original strand, 940932 - 941063
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  940932 gaattgaattattcatgcctaactgct-atgtggattatgaatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 941030  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  941031 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 941063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Original strand, 25369250 - 25369419
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||     
T  25369250 gaattgaattattcatgtttaactgtt-atgtcgattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatctaaatggatgggtag 25369347  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25369348 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagtcctttgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatc 25369419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 267
Target Start/End: Original strand, 17790961 - 17791137
Alignment:
Q  90 tggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt-gaccgcatacctgtctgtatggatggg 188  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  17790961 tggaattgttttattcatgtataactgtt-atatggattatgat-gatgtaacgcttaaccccagtggtttttgaccgcctccctgtctgtacggatggg 17791058  T
Q  189 taaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17791059 tagacactgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttgggtggatattgggagctatatccggtatcggt 17791137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22846488 - 22846315
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  22846488 gaattgatttatttatgtctaaatgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttatcccaagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtag 22846389  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||| | | || ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  22846388 acgttgtgcaggtttagttgcgttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcggtagctatctccgttatcg 22846315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19852630 - 19852469
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  19852630 ttgattcattcatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 19852531  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatct 256  Q
       |||| |||||||||||  ||||||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||    
T  19852530 acatgcaagattagttgcttgggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatct 19852469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22866413 - 22866325
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22866413 tgatgtaatacttacccctagtggttttgacctcctacctgtctgtatgggtgggtagacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 22866325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 17085394 - 17085492
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17085394 gattatgtttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc-ggtgagttg 17085492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 276
Target Start/End: Original strand, 21927128 - 21927235
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||   | | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21927128 tacctgtctgtatggatgggtaggtgctatgcaggattagttgctccggtgaattgattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtt 21927227  T
Q  269 tagtaggg 276  Q
    ||||||||    
T  21927228 tagtaggg 21927235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33323076 - 33322915
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33323076 ttattcatgtt-aactgttg-tgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtaaacgctgtg 33322981  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
     | ||||||||||||| |||||||  |||  | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33322980 taggattagttgctctagtgagtt-cttgtggcttgg-tggatattgggagctatctccggtatcggt 33322915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 267
Target Start/End: Original strand, 15080708 - 15080824
Alignment:
Q  149 ccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgag 248  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||| |    
T  15080708 ccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctggtgagtt-attcttgcttgg-tggatatcggg 15080805  T
Q  249 agctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15080806 agctatctccggtatcggt 15080824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14150901 - 14150811
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14150901 ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagttg 14150811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Original strand, 29162738 - 29162889
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgc-t 213  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||| || ||||||| |    
T  29162738 tgtttatgttgattaggactgatgtaaagcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtggacgaagtgcaggactagttgctt 29162837  T
Q  214 ctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     |||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29162838 ttggtgagttgcttggtgattgcttggatatcgggagctatctccgttatcg 29162889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Original strand, 31469377 - 31469520
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||  ||||| | ||||||||| |||||||||     
T  31469377 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtagttttgaccgcctacctgtctctatggatgagtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagtta 31469476  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
     ||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  31469477 cttggtgtttgcttggatagcgggagctatctccgttatcggtt 31469520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 22467942 - 22468082
Alignment:
Q  126 attatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg-ctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22467942 attatgattgatgtaaagcttaccctcagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgattttggtgagttg 22468041  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  22468042 cttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcg 22468082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16104886 - 16104775
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16104886 ttattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 16104790  T
Q  200 catgattagttgctc 214  Q
    || | ||||||||||    
T  16104789 cagggttagttgctc 16104775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 22595495 - 22595636
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgc-tctggtgagtt 223  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| | || ||||||    
T  22595495 gattatgtttgatgtcaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgcttttgatgagtt 22595594  T
Q  224 gattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  22595595 gcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 22595636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 25646766 - 25646869
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||    
T  25646766 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgcaggattagatgct-tgg 25646863  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  25646864 tgagtt 25646869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34965275 - 34965130
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttaccccc-agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc-tctggtg 219  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| | |||||    
T  34965275 tggattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgacgtgcaagattagtttgcttttggtg 34965176  T
Q  220 agttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  34965175 agttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 34965130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6092856 - 6092758
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6092856 gattatgtatgatgtaatgcttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgcaggattacttgctc-ggtgagttg 6092758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23151726 - 23151644
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23151726 ttatttggattatgat-gatgtaatacatacccccagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtaaacgttgtgca 23151644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 201
Target Start/End: Original strand, 25746119 - 25746222
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  25746119 ttgaattattcatgtt-aactgtt-attttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacg 25746215  T
Q  195 ttgtgca 201  Q
    |||||||    
T  25746216 ttgtgca 25746222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21929786 - 21929637
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgctct- 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||   ||||||||||| ||||| |     
T  21929786 ttatgttgattatgattgatgtaaaccttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaaatgcatgattagtttgctttc 21929687  T
Q  216 ggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  21929686 ggtgagttgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcg 21929637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32896302 - 32896222
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32896302 ttatttggattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 32896222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17787759 - 17787684
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17787759 gattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 17787684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31626744 - 31626664
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  31626744 tgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgtttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc 31626664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 15006487 - 15006586
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15006487 gattatgattgatgtaaagcttacccccagaggttttgaccgcctacatgtctgtacggatgagtagacgaagtgcatgattagttgcttttgtgagttg 15006586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18775541 - 18775382
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18775541 tattcatgtt-aactgtt-atttggattataat-gatgtaatacttaccct-agtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgc 18775446  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | || |||||||| ||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18775445 aggagtagttgct-tggtgagtattttg-tgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggt 18775382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22428508 - 22428392
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22428508 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgc 22428413  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagt 222  Q
    | |  |||||||| ||||||||    
T  22428412 agggatagttgct-tggtgagt 22428392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16131609 - 16131457
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc- 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| |||||| ||||     
T  16131609 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttatccccagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgct 16131510  T
Q  213 tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | |||||||||| ||| || ||| ||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  16131509 tttggtgagttgcttggtgattgtttggataacaggagctatctccgttatcg 16131457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18740680 - 18740583
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18740680 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttatctccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 18740584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 19985053 - 19985158
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  19985053 aattgaattattcatgat-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacccgtctgtatggatgggtaga 19985149  T
Q  193 cgttgtgca 201  Q
    |||| ||||    
T  19985150 cgttttgca 19985158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 13016687 - 13016763
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13016687 tggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttaaccgtttacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 13016763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18128375 - 18128258
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18128375 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccaaagtggttttaaccgcctacatgtatgtatggatgggtagacgttgtgc 18128279  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagt 222  Q
    | |  |||||||| ||||||||    
T  18128278 agggatagttgct-tggtgagt 18128258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18422150 - 18422033
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18422150 tattcatgtt-aactgtt-atttgaattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgactacctgtctgtatggatgggtagacattgtgc 18422054  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagt 222  Q
    | |  |||||||| ||||||||    
T  18422053 agggatagttgct-tggtgagt 18422033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 267
Target Start/End: Original strand, 21411301 - 21411387
Alignment:
Q  180 atggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  21411301 atggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctgatgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggaactatctccagtatcggt 21411387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 210
Target Start/End: Original strand, 17375550 - 17375647
Alignment:
Q  112 aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  17375550 aactatttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtt 17375647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 4174547 - 4174623
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggt-tttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4174547 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggta 4174623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 4230176 - 4230252
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggt-tttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4230176 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagtggtctttgaccgcctacctgtttgtatggatgggta 4230252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25173553 - 25173456
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||    
T  25173553 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgc 25173457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 17858216 - 17858291
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  17858216 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggta 17858291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 16301969 - 16302058
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  16301969 ttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcatgactagtagct-tggtgagtt 16302058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15861046 - 15860981
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15861046 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15860981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 1651847 - 1651929
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  1651847 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 1651929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10487185 - 10487103
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  10487185 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 10487103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16229886 - 16229804
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16229886 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16229804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16378142 - 16378224
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16378142 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16378224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16385466 - 16385548
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16385466 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16385548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16645737 - 16645819
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16645737 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16645819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16651103 - 16651185
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16651103 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16651185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 17344139 - 17344206
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  17344139 tgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 17344206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 18088647 - 18088729
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  18088647 ttatttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 18088729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 1659571 - 1659636
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || || ||| ||||||||||    
T  1659571 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtacgggtgagtagacgttgtgca 1659636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18578869 - 18578745
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||  | ||| |||||||||||||||| |||    
T  18578869 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgatc-atgtaatacttacccccagtggatctgtgatgaaccgactgcctatctgtatggatgggtagacg 18578773  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18578772 ttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 18578745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 27655960 - 27656025
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  27655960 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 27656025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16235788 - 16235679
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16235788 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 16235690  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  16235689 ct-tggtgagtt 16235679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29603893 - 29603806
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||    
T  29603893 gattatgattgatgtaaagtttaccgc-agtggttttgactgcctacatgtctgtatggacgggtagacgacgtgcatgtttagttgct 29603806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 35017602 - 35017663
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg 157  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35017602 aattgatatattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtgg 35017663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 18843865 - 18844029
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | | | |||||||||||||||| |||    
T  18843865 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacg 18843961  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||  |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  18843962 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagt--attg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 18844029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23219286 - 23219240
Alignment:
Q  144 cttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23219286 cttacccccagcggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 23219240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 223
Target Start/End: Original strand, 33316603 - 33316695
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  33316603 atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 33316695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1553936 - 1553855
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||||    
T  1553936 ttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcttacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagctc 1553855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 14628590 - 14628650
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  14628590 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 14628650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 18005079 - 18005139
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18005079 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 18005139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 223
Target Start/End: Original strand, 13623156 - 13623207
Alignment:
Q  171 cctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  13623156 cctgcctgtatggatgggtacacgttgtgcatgtttagatgct-tggtgagtt 13623207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 157
Target Start/End: Original strand, 35011281 - 35011334
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg 157  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35011281 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtgg 35011334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 1834 - 2097
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1834 tgataagtgtgcttggtggatacttgatcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttgaaattgatt 1933  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1934 tattcatgtctaattgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgtctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 2033  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    | |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2034 aggattagttgcttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatc 2097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 40642065 - 40642324
Alignment:
Q  17 tgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactg 116  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  40642065 tgaatacttgattgtattatcttggaatgttaagtaaatgcacatattgaattaattgtgtatgttaagtacttagaattgatttattcatgattaactg 40642164  T
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctg 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40642165 cttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttttccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctccg 40642264  T
Q  217 gtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40642265 gtgagttgattgatgcttggtcggatatcgggagttatctccggtatcggtttcgtaggg 40642324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 19812787 - 19813050
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  19812787 tgataaatgtgcttggtgaatacttgattgtattattttgttatgttatgtaaatatagatattgaattaactgtttatgttaagtacttgaaattgatg 19812886  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    || ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  19812887 tactcatgcttaactgtt-atatggattatgat-gatgtaatatttacccc-agtggttttgactgcctagctgtctgtatggatggatagacgttgtgc 19812983  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19812984 aggattagttgcttcggtgagttgattgatgcttgattggatatcgggagctatctccggtatcggt 19813050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 25303937 - 25303757
Alignment:
Q  96 tgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgt 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |     
T  25303937 tgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgatttatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcttacctgtcaatatggatgggtagatgc 25303838  T
Q  196 tgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25303837 tgtgcaggattagttgctctggtgagtcgattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtaggg 25303757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 9782726 - 9782892
Alignment:
Q  110 ttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  9782726 ttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccactggttttgaccgcctgcctgtctgtatggataggtagacgttgtacctgattagt 9782825  T
Q  210 tgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9782826 tgctccggtgagttaattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcagtttcgtaggg 9782892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 5078 - 5254
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  5078 gaattgttttattcatgtctaactgct-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc-tacctgcctgtatggatgggtag 5174  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5175 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttcg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 720726 - 720550
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||     
T  720726 gaattgatttattcacgtttaactgtt-atatggattatgag-gatgtaatacttacccccagtggttt-gacctcctacctgtctgtatggatgggtag 720630  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  720629 acgctgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 720550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7319762 - 7319591
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  7319762 gaattgaattattcatgtt-aattgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttaccctcagtgattttgaccgcctacctatctgtatggatgggtag 7319666  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7319665 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcggaagctatctccggtatcggt 7319591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 22581838 - 22581983
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  22581838 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctgg 22581936  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22581937 tgagttcttt--tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 22581983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 24296381 - 24296558
Alignment:
Q  99 tttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatggg-------taa 191  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||     
T  24296381 tttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttag 24296478  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24296479 acgttgtgcaggattagttgctctagtgagttgtttgatgcttgg-tggatattgggagctatctccggtatcggtttagt 24296558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32738780 - 32738651
Alignment:
Q  145 ttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32738780 ttaccccctgtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgcttcggtgagttgcttgatgtttggtcggatat 32738681  T
Q  245 cgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32738680 cgggagctatctccggtatcggtttcgtag 32738651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 272
Target Start/End: Original strand, 23823315 - 23823482
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23823315 tattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgac-gcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 23823411  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    | ||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  23823412 aggattaattgctctggtgagttatttgatgcttgg-tggatatcgggagctatctctagtatcagtttagt 23823482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 101 - 272
Target Start/End: Original strand, 23825259 - 23825426
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23825259 tattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgac-gcctacttgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 23825355  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    | ||||| |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  23825356 aggattaattgctctggtgagttatttgatgcttgg-tggatatcgggagctatctctagtatcagtttagt 23825426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 32082 - 32227
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32082 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctgg 32179  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| ||  || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32180 tgagttg-tttttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 32227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28972292 - 28972189
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28972292 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtgattttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctgg 28972194  T
Q  218 tgagt 222  Q
    |||||    
T  28972193 tgagt 28972189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24272415 - 24272245
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| |||    
T  24272415 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctaatggttttgactgcctacttgtctgtattgatgggtagacg 24272316  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| || | |||||||||| |||||    
T  24272315 aagtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggtgctatctccgttatcg 24272245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Original strand, 4450129 - 4450295
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  4450129 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 4450225  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  || ||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4450226 gttgtgcaggattagttgctc-ggtga-atgtttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccggtatcggt 4450295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 269
Target Start/End: Original strand, 30994757 - 30994973
Alignment:
Q  60 atattgaattaattgtttatgttaagtacttggaa------ttgatttattcatgtttaactgt-ttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccc 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||| ||| ||||| || | | || | | |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  30994757 atattgaattaactgtttatgttaagtacttggaacttgatttgattcatttatgttcaaatttattttattgattatgattgatgtaaagcttagcccc 30994856  T
Q  153 agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagct 252  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||||||  ||||| ||| ||| || ||| |||||||||| ||| |    
T  30994857 agtggttttgaccgcctacctgactgtatggatggatagacgaagtgcaggattagttgcttcggtgaattgcttggtgcttgcttggatatcgggagtt 30994956  T
Q  253 atctccggtatcggttt 269  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30994957 atctccgatatcggttt 30994973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24868875 - 24868741
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  24868875 gattatgattgatgtaaagcttacctctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattaattgctttggtgagttg 24868776  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
     | |  | ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  24868775 ctcggcggttgcttggatagcgggagctatctccg 24868741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 224
Target Start/End: Original strand, 22137635 - 22137755
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22137635 ttattcatgtttatctgtt-atgtggattatgat-gatgtaatgctaacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 22137731  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    || ||||||||| | ||||||||||    
T  22137732 caagattagttg-tttggtgagttg 22137755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25600208 - 25600053
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25600208 tattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttggccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgc 25600113  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    | |||||||||||| ||||||||  ||| || |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25600112 aggattagttgctc-ggtgagtt-cttg-tgcttgg-tggatattgggagctatctccggtatc 25600053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Original strand, 36892615 - 36892710
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  36892615 gattatgat-gatgtaatacttacccgcagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatggatagttgct-tggtgagt 36892710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Original strand, 24089230 - 24089406
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||      ||||| ||| ||| |||||||||    
T  24089230 gaattgatttattcatgtttaactgtt-atacggattatgat-gatgtaatatttacccgcagtggatctgtgatggaccgcctacatgtatgtatggat 24089327  T
Q  186 gggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24089328 gggtagatgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgcttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatc 24089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 19435758 - 19435895
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt------gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |      |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19435758 tgtttttgttgattatgatttatgtaatacttacccccaatggatctatgatggaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgttgtgcaggattag 19435857  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcg 246  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  19435858 ttgctttggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcg 19435895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22654383 - 22654228
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  22654383 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttaatcgcctacatgtatgtatggatgggtag 22654288  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagcta 253  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  22654287 acgctgtgcatgactagttactctagtgagtt-cttgttgcttgg-tggatatcgagagcta 22654228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 9782659 - 9782739
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgt 81  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9782659 tgatagatgtgcttggtgaatacttgattgtattattttgaaatgttatgtaaatgtacgtattgaattaactgtttatgt 9782739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Original strand, 25877840 - 25877944
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25877840 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatatttacccccaatggtttttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 25877936  T
Q  194 gttgtgca 201  Q
    ||||||||    
T  25877937 gttgtgca 25877944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Original strand, 23806484 - 23806546
Alignment:
Q  139 taatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23806484 taatacttacccccagtggttttaaccgcatacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 23806546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 9654757 - 9654854
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9654757 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 9654853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19657809 - 19657642
Alignment:
Q  114 ctgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtt------ttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgatta 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |      | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | | |||    
T  19657809 ctgtttatgtggattatgat-gatgtaatgcttacccccagtggatctgtgatggaccgcatgcctgtctgtatggataggtagacgttgtgtaggttta 19657711  T
Q  208 gttgctctggtgagt------tgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||||||| |||||||      || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657710 gttgctc-ggtgagttgttcgtggttgatgcttgg-tggataccgagagctatctccggtatcggtttagt 19657642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19655297 - 19655200
Alignment:
Q  102 attcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19655297 attcatgttaaactgtt-atgtagattatgat-gatgtaatgcttacccccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgca 19655200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 269422 - 269305
Alignment:
Q  146 tacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatc 245  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||    
T  269422 tacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtacaggattaattgctc-ggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatc 269327  T
Q  246 gagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  269326 gggagctttctccggtatcggt 269305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 460847 - 460762
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  460847 tggattatgata-atgtaatacttacccccagttgttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgagtagt 460762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22861798 - 22861726
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22861798 atgtaatacttacccc-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgagtagt 22861726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 43644891 - 43644956
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43644891 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 43644956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8886470 - 8886387
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttga-ccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8886470 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 8886387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6092790 - 6092696
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  6092790 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccc-attggttttgaccgcctatctgtctatatggatgggtagacgaagtgcatgattagtt 6092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6877741 - 6877659
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6877741 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagaggtgttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 6877659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25593497 - 25593422
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  25593497 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 25593422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43640646 - 43640543
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggt 261  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | || ||| ||||||| || ||||||||| || |    
T  43640646 gaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcgggagctatcttcgct 43640547  T
Q  262 atcg 265  Q
    ||||    
T  43640546 atcg 43640543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 267
Target Start/End: Original strand, 24573318 - 24573406
Alignment:
Q  177 tgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24573318 tgtatggatgggtagacgctctgcaggattagttgctctggtgagtt-cttgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 24573406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29112112 - 29111955
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgct 213  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||||||||| |||||    
T  29112112 tgtttatgttgattgtgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgacagcctgcctgtttgtatgaatgcgtagacgaagtgcatgattagtttgct 29112013  T
Q  214 ct-ggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagct-atctccggtatcggttt 269  Q
     | ||||||||| ||| || ||| ||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||    
T  29112012 ttcggtgagttgcttggtgattgtttggatagctggagctaatctccgttatcggttt 29111955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18533679 - 18533607
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  18533679 ttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 18533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Original strand, 23779795 - 23779863
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23779795 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgca 23779863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 161
Target Start/End: Original strand, 19670960 - 19671029
Alignment:
Q  90 tggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt 161  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19670960 tggaatcgttttattcatgtttaactg-ttatgtggattatga-tgatgtaatgcttacccccagtgatttt 19671029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Original strand, 22691890 - 22692030
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |||||| | |||    
T  22691890 ttatgtggactatgat-gatgtaatatttaccccaa-tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgcgtagacgctgtgcaggaatagttg-tttgg 22691986  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||||||   | ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22691987 tgagtt--cttatgcttgg-tggatatcaggagctatctccggtatc 22692030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Original strand, 22696537 - 22696677
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |||||| | |||    
T  22696537 ttatgtggactatgat-gatgtaatatttaccccaa-tggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgcgtagacgctgtgcaggaatagttg-tttgg 22696633  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||||||   | ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22696634 tgagtt--cttatgcttgg-tggatatcaggagctatctccggtatc 22696677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 23837282 - 23837336
Alignment:
Q  147 acccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23837282 acccccagtggttttaaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 23837336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25210896 - 25210831
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  25210896 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 25210831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8941747 - 8941650
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||    
T  8941747 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgc 8941651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 5890154 - 5890236
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  5890154 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 5890236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 11233108 - 11233190
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  11233108 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 11233190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 14908295 - 14908377
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  14908295 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 14908377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 17398453 - 17398535
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  17398453 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtaagtagacgttgtgca 17398535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 22514955 - 22515037
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22514955 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22515037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23772836 - 23772754
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  23772836 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 23772754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23818479 - 23818397
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  23818479 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 23818397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 24687526 - 24687608
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  24687526 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 24687608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 24828459 - 24828541
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  24828459 ttatctggattatgata-atgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 24828541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 24832911 - 24832993
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  24832911 ttatctggattatgata-atgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 24832993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 28777557 - 28777639
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  28777557 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 28777639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22273179 - 22273102
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22273179 tggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22273102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22282412 - 22282335
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22282412 tggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22282335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 28032939 - 28033028
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| | |||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  28032939 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagaagttgtgcaagactagtagct-tggtgagtt 28033028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 3801271 - 3801395
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  3801271 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 3801367  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3801368 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 3801395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 19888885 - 19889009
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  19888885 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 19888981  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  19888982 ttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 19889009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20013422 - 20013340
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  20013422 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggggagtagacgttgtgca 20013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 23614411 - 23614505
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  23614411 tgtttatgttgattatgattgacgtgaatcttaccct-agttgttttgaccgcctacctttttgtatgaatgggtagacgaagtgcatgattagtt 23614505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15631663 - 15631549
Alignment:
Q  105 catgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatga 204  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | || || ||||| || ||| |||||||||| ||    
T  15631663 catgattaactgtt-atttgaattatgat-gatgtaatacttacccccagtgg-tttgtccgcctgcttgcctatatgggtgagtagacgttgtgcagga 15631567  T
Q  205 ttagttgctctggtgagtt 223  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  15631566 gtagttgctc-ggtgagtt 15631549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20271241 - 20271199
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc 167  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20271241 gattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgc 20271199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25132544 - 25132459
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt-gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||    
T  25132544 gattatcattgatgtaaagcttacccc-agtggtttttgatcgcctacctgtctgtatggaagggtagacgaagtgcaggattagtt 25132459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 222
Target Start/End: Original strand, 12638184 - 12638275
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12638184 atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagt 12638275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17202876 - 17202800
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||  || ||| ||||||||||||| ||||    
T  17202876 ttgatgtaatactcactcccagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgagtgagtagacgttgtgcatgactagt 17202800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21140097 - 21140050
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21140097 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 21140050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 21276577 - 21276624
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21276577 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 21276624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22254598 - 22254531
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22254598 ttgatgtaatactcacccc-agtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22254531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22692593 - 22692510
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |  |||||||| || ||| ||| ||||||    
T  22692593 tttatttggattatgata-atgtaatacttacccccattggttttaaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgctgtgca 22692510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22697240 - 22697157
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |  |||||||| || ||| ||| ||||||    
T  22697240 tttatttggattatgata-atgtaatacttacccccattggttttaaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgctgtgca 22697157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24839704 - 24839656
Alignment:
Q  119 tatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  24839704 tatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccaatggtttcgaccgc 24839656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17022013 - 17021738
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17022013 tgataaatatgcttggtgaatacttgattgtattatcttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatgttaagtacttagaattaatt 17021914  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17021913 tattcatgcttaactgcttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtctgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgc 17021814  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17021813 aggattagttgctccgatgagttgactgatgtttggtcagatatcgggagctatctccggtatcggtttcgtaggg 17021738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17607381 - 17607119
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| ||| |||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17607381 tgataagtgtacttggtgaatatttggttgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgaat 17607282  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  17607281 tattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgctta-cccaagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtga 17607183  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | |||||| ||||  ||| ||||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17607182 aggattag-tgcttcggtaagttgcttgatgcttgatcggatatcgggagctatctccggtatcg 17607119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 20956843 - 20957023
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  20956843 attgatttattcatgtttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatggttagac 20956940  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20956941 gttgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtaggg 20957023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Original strand, 37235764 - 37235948
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37235764 gaattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 37235863  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37235864 acattgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggtcggatattgggagctatctccgatatcggtttcgtaggg 37235948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 22837215 - 22837388
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22837215 gaattgatttattcatgtttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 22837312  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22837313 actttgtgcaagattagttgcttcggtgagtttcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggt 22837388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Original strand, 22837420 - 22837591
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22837420 attgatttattcatgtttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 22837517  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
     ||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22837518 tttgtgcaagattagttgcttcggtgagtttcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggt 22837591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 36358136 - 36358306
Alignment:
Q  99 tttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgt 198  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36358136 tttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtcgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 36358233  T
Q  199 gcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36358234 gcatgattagttgctctagtgagttatttgatgtttgg-tggatatcgggagctatctccgatatcggtttagt 36358306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27673146 - 27672980
Alignment:
Q  98 atttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttg 197  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  27673146 atttattcatgtttaactgtc-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagatgttg 27673050  T
Q  198 tgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27673049 tgcaagatcagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatattgggagctatctccggtatcggt 27672980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 51658211 - 51658383
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg-ttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51658211 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtgggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggta 51658307  T
Q  191 aacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51658308 gacgctgtgcatgattagttgctccggtgagttgattgttgcttgg-tagatatcgggagctatctccgatatcggt 51658383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 268
Target Start/End: Original strand, 5472221 - 5472373
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||     
T  5472221 tgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggatagacgaagtgcgtgattagttgctt 5472319  T
Q  215 tggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5472320 tggtgagttgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggtt 5472373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21193528 - 21193356
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||     
T  21193528 gaattgatttattcatctctaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctatctg-atggatgggtag 21193430  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | || ||| |||| || || |||||||||||| |||||    
T  21193429 acgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttgggtagcgggagctatctccgctatcg 21193356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19601556 - 19601381
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19601556 gaattgtttcattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttatccccaatggttt-gaccgc-tacctgtctgtatggatgggtag 19601461  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19601460 acgctgtgcatgattaattgctccggtgagttgattgatgcttgg-tagatatctggagctatctccggtatcggtttagt 19601381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 38035420 - 38035550
Alignment:
Q  99 tttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgt 198  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  38035420 tttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgattgcctacctgtctgtatggttgggtagatgttgt 38035517  T
Q  199 gcatgattagttgctctggtgagttgattgatg 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38035518 gcatgattagttgctctgttgagttgtttgatg 38035550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40555732 - 40555614
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  40555732 ttgattcattcatgtcaaattgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 40555633  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgct 213  Q
      ||| |||||||||||||    
T  40555632 aagtgtatgattagttgct 40555614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Original strand, 35524308 - 35524473
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35524308 attgaattattcatgtt-aactgttctt-tggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 35524403  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35524404 gttgtgcaagattagttgctc-ggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccggtatcggt 35524473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Original strand, 49999186 - 49999320
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||| | ||||||||||    
T  49999186 gattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagacgaagttcagggttagttgatttggtgagttg 49999285  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
     ||| || ||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  49999286 cttggtggttgcttggatagctggagctatctccg 49999320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 9786295 - 9786397
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||    
T  9786295 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaaggttagttgct-tgg 9786391  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  9786392 tgagtt 9786397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18164509 - 18164411
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttaccccc-agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  18164509 gattatgattgatgtaaaacttaccccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcatgattagttgcttcggtgagt 18164411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 22408142 - 22408286
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  22408142 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-gg 22408239  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22408240 tgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 22408286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 40438123 - 40438265
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc-tctggtgagt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  40438123 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtccgtatggatgggtagacggagtgcatgattagtttgcttttggtgagt 40438222  T
Q  223 tgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    || ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  40438223 tgcttggtgattgtttggatagcgggagctatctccgttatcg 40438265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 27331084 - 27331227
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||    
T  27331084 ttatttggattatgat-gatgtaatactaacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgcaggattagttgct-tgg 27331180  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27331181 tgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcaggagctatctccggtatcggt 27331227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Original strand, 5676515 - 5676617
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||| |||    
T  5676515 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagactttgtgcagggatagttgct-tgg 5676612  T
Q  218 tgagt 222  Q
    |||||    
T  5676613 tgagt 5676617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 41213476 - 41213593
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41213476 ttgattcatttatgtcaaactgtttatctggattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggtttggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 41213574  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgct 213  Q
      ||||| |||||||||||    
T  41213575 aagtgcaggattagttgct 41213593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35053176 - 35053079
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35053176 tattcatgtt-aactgtt-atttgaattatgat-gatgtaatacctacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 35053080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52397995 - 52397863
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||   ||||   ||||||| | ||||||||||    
T  52397995 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgccgacctgtctgtatggatgggtagacgaaatgcagagttagttgttttggtgagttg 52397896  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctc 257  Q
     ||| || ||| ||||||| || ||||||||||    
T  52397895 cttggtggttgcttggatagcgggagctatctc 52397863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 5770043 - 5770141
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5770043 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 5770141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 37846351 - 37846428
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37846351 tggattatgata-atgtaatacttacccccaatggttttaaccgcatacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 37846428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21042118 - 21042031
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  21042118 gattatgtttgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtaaacgaagtgcaggattagttgct 21042031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29217501 - 29217329
Alignment:
Q  60 atattgaattaattgtttatgttaagtacttggaa-ttgattt-attcatgttt-----aactgtttatgtggattatgattgatgtaatactta-cccc 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |     ||||  || | | |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  29217501 atattgaattaactgtttatgttaagtactcggaatttgatttaattcatatatactcaaacttattttattgattatgattgatgtaaagcttaccccc 29217402  T
Q  152 cagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  29217401 cagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 29217329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18505666 - 18505585
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18505666 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 18505585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 44036771 - 44036853
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44036771 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccacagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 44036853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20444009 - 20443944
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20444009 atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 20443944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20529749 - 20529684
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20529749 atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 20529684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Original strand, 20895681 - 20895749
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20895681 ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtcggtatggatgggtagacgttgtgca 20895749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21857796 - 21857691
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| |    
T  21857796 aattgaattattcatgat-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggaagggtaga 21857700  T
Q  193 cgttgtgca 201  Q
    |||||||||    
T  21857699 cgttgtgca 21857691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 46144230 - 46144004
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||| ||  ||||| | | |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46144230 tgataagtgtgcttgatgagtatttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaattgtttatgtgaagtactcggaattgatt 46144131  T
Q  101 t--attcatgttt-----aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    |  |||||| | |     || |  || | | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||    
T  46144130 ttaattcatatatgctcaaatttattttattgattatgattgatgtgaagcttacccccagtggttttgaccgcctac----ctgtatggatgggtagac 46144035  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  46144034 gaggtgcagggttagttgctttggtgagttg 46144004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 22148259 - 22148316
Alignment:
Q  157 gttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22148259 gttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc 22148316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21716450 - 21716357
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21716450 ttatttggattatgat-gatgtaaaacttaccca-agtggttttgaccgcctaca-gtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc 21716357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33395210 - 33395150
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgt 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33395210 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgt 33395150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20929761 - 20929685
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20929761 tggattatgata-atgtaatacttaccca-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 20929685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 78340 - 78435
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||| |||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||    
T  78340 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagtttatccctagtgttttcggccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgactagtt 78435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20192074 - 20191999
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20192074 tgtttatgttgatcatgattgatgtgaagcttacccccagtggtttcgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 20191999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 35935480 - 35935562
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  35935480 ttatctggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 35935562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22080225 - 22080061
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||      ||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  22080225 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacgcccagtggatctgtgatggaccgcctacctttctgtatggatgggtagacg 22080129  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22080128 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt--ttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 22080061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20820777 - 20820625
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt--gc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  |||  |||||  |||||||        
T  20820777 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggttttgaccgcctacctgtttgtataaatgggttgacgaagtgcagaattagtttgtt 20820678  T
Q  213 tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | |||||||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20820677 tttggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 20820625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41392733 - 41392668
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  41392733 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 41392668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17146855 - 17146758
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||    
T  17146855 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgc 17146759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25093185 - 25093113
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  25093185 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgccaacctgtttgtatgaatgg 25093113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 5074167 - 5074249
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  5074167 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 5074249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17003123 - 17003041
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  17003123 ttatctggattatg-ttaatgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 17003041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 20827088 - 20827170
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  20827088 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 20827170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22034145 - 22034063
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22034145 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22034063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Original strand, 7642448 - 7642528
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||    
T  7642448 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 7642528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20252377 - 20252253
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  20252377 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtagatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 20252281  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  20252280 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 20252253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 18602910 - 18602992
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  18602910 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgca 18602992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41217514 - 41217475
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41217514 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 41217475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22226266 - 22226201
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||| ||||||    
T  22226266 atgtaatacttactcccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgca 22226201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 60 - 101
Target Start/End: Original strand, 49999114 - 49999155
Alignment:
Q  60 atattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgattt 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  49999114 atattgaattaactgtttatgtgaagtactcggaattgattt 49999155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17283690 - 17283417
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17283690 tgataaatgtgcttggtggatacttggttgtattattttgaaatgctatgtaaatgcacacattgaattaattgtttatgctaagtacttggaattgaat 17283591  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  17283590 tattcatgattaactgtt-atgtggattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacactgtgc 17283493  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17283492 tggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggttttgtaggg 17283417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 30 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15931753 - 15931514
Alignment:
Q  30 gtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggatta 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15931753 gtattatcttggaatgttatgtaaatgtacttattgaattaactgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggatta 15931654  T
Q  130 tgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattga 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15931653 tgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctatatggatcagtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgcttga 15931554  T
Q  230 tgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15931553 tgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggttt 15931514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26009890 - 26009616
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26009890 tgataagtgtacttggtgaatacttggtcgtattattttggaatgttatgtaaaggtacatattgaattaactatttatgttaagtgcttggaattgatt 26009791  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatactta-cccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26009790 tattcatgtttaactatttatttagattatgattgatgtaatgcttagcccctagtggttttgactgcctacctgtctctatggatgggtaaacgttgtg 26009691  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26009690 caggattagttgctttggtgagttgcttgatgattggtcggatatcgggagctatctctggtatcagtttcgtag 26009616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Original strand, 21192537 - 21192719
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  21192537 gaattgttttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtag 21192634  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  21192635 acgttgtgcatgattagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctacctctggtatcagtttagtaggg 21192719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23835592 - 23835427
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  23835592 gaattggtttattcatgtctaactatttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgatcgcctacctatctgtatggatgggtag 23835493  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctc 257  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23835492 acgctgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctatctc 23835427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Original strand, 21199964 - 21200145
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21199964 gaattgttttatccatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttatcct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 21200060  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21200061 acgatgtgcaagattagttgctccggtgagttaattgatggttggttggatatcgggagctacctccagtatcggtttagtaggg 21200145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 22737789 - 22737960
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  22737789 gaattgaactattcatgtttaactgtt-atgtagattatgat-gatgtaatacttacccctagtgattttgaccgcctacctgtctgtatgg-tgggtag 22737885  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22737886 acgttgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 22737960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38531927 - 38531757
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  38531927 gaattgaattattcatgtttaactgtt-atatgaattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtag 38531830  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38531829 acgatgtgcatgattagttgctctggtgagttgtttgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccgatatcg 38531757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Original strand, 37655450 - 37655615
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  37655450 gaattgatttattcatgtctaactgtctatgtgggttatgattgatgtaatgcttacccccaatggttttgaccgccaacctgtctgtatggatgggtag 37655549  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctc 257  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | | || ||| ||||||| || ||||||||||    
T  37655550 acgttgtgcagtattagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggataacgggagctatctc 37655615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29296243 - 29296071
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  29296243 gaattgaattattcatgtccaactgtttatgtggagcattattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtag 29296144  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  29296143 acgttgtgcaagattagttgct-tggtgagttgctcgatggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 29296071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Original strand, 17731367 - 17731511
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  17731367 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgactacctatctgtatggatgtgtagacgctgtgcaggattagttgctctgg 17731465  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17731466 tgagtt-cttgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcg 17731511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5851963 - 5851690
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5851963 tgataagtgtgcttggtgaatacttgaccgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattggattatccgtttatgttaagtgcttgtaattgatt 5851864  T
Q  101 tat-tcatgttt------aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||  |||| | |      | |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  5851863 taactcatatatgctcaaatctgttt-tattgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgactgcctacctgtctgtatggatgggtagat 5851766  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
    |  ||||| |  ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5851765 gacgtgcagggatagttgcttcggtgagttacttgatgcttggtggaatatcgggagctatcttcggtatcggttt 5851690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21695943 - 21695773
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  21695943 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtag 21695847  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||  || || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  21695846 acgctgtgcaggattagttgttcttgtgagttg-tttttgctt-gttggatatcgcgagctatcttcggtgtcggt 21695773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 20655923 - 20656068
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  20655923 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc-gg 20656020  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||   ||| || |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  20656021 tgagtcttttg-tgcttgg-tggatatcaggagctttctccggtatcggt 20656068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Original strand, 18769992 - 18770123
Alignment:
Q  140 aatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||| ||    
T  18769992 aatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgtgtagacgctgtgtatgatgagttgctccggtgagttgattgttgcttgg-tg 18770090  T
Q  240 gatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  18770091 gatattgggagctatcttcggtatcggtttagt 18770123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21679453 - 21679351
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21679453 ttatatggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttt-gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctgg 21679356  T
Q  218 tgagt 222  Q
    |||||    
T  21679355 tgagt 21679351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33170620 - 33170456
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  33170620 ttgattcatttatgtcgaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacgccaagtggttttgaccgcctacttgtctgtatggatgggtagacg 33170521  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgc-tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
      ||||| ||||| |||| | |||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  33170520 aagtgcaggattaattgcttttggtgagttgcttggtgattgcttggatatcgggagctatctcc 33170456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 227
Target Start/End: Original strand, 39448602 - 39448734
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||     
T  39448602 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttaccctcaatggttttgatcgcctacctgtttgtatggataggtag 39448698  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgatt 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  39448699 acgttgtgcaggattagttgcgctggtgagttgatt 39448734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 31196403 - 31196576
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgacc-gcatacctgtctgtatggat-gggt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    | ||   ||| ||||||||| ||||    
T  31196403 gaattgaattattcatgtttaac-gtttatgtggattatgat-gatgtaatacttaccctcagtggatctgtgatggatt--tgtttgtatggattgggt 31196498  T
Q  190 aaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31196499 agacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttggttgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggt 31196576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 24554410 - 24554550
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24554410 gattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttaaccgcttacctttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 24554509  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  24554510 cttggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 24554550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25293878 - 25293721
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  25293878 tgtttatgttgattatgattgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatg-atgggtagacgttgtgcaggattag 25293780  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||  ||||||||| || ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25293779 ttgcttcggtgagttgctttatgcttggtcgaatatcgggagctatctccagtatcggt 25293721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25755867 - 25755710
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  25755867 tgtttatgttgattatgattgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatg-atgggtagacgttgtgcaggattag 25755769  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||  ||||||||| || ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25755768 ttgcttcggtgagttgctttatgcttggtcgaatatcgggagctatctccagtatcggt 25755710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 23229114 - 23229234
Alignment:
Q  102 attcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  23229114 attcatgttaaact-tttatgtggattatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtgtgtatggatgggtagacgctgtgca 23229211  T
Q  202 tgattagttgctctggtgagttg 224  Q
     ||||||||||||  ||||||||    
T  23229212 ggattagttgctccagtgagttg 23229234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25120765 - 25120621
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  25120765 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaaccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-gg 25120668  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  25120667 tgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 25120621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 23118655 - 23118773
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| |||    
T  23118655 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaaagttacccccagtggttttgaccgcctacttgtccgtatggatgagtagacg 23118754  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgct 213  Q
      ||||| |||||||||||    
T  23118755 aagtgcaggattagttgct 23118773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 258
Target Start/End: Original strand, 23154447 - 23154578
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23154447 gattatgtttgatgtaatgcttatccctagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagttg 23154545  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
     ||| || ||| |||||||  | |||||||||||    
T  23154546 cttg-tggttgcttggatagtgggagctatctcc 23154578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 18263250 - 18263349
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18263250 gattatgattgatgtatagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 18263349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28543194 - 28543079
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  28543194 aattgaattattcatgtt-aattgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtaga 28543098  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttg 211  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  28543097 cgttgtgcaggatttgttg 28543079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41243968 - 41243865
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  41243968 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaacccaagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-gg 41243871  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  41243870 tgagtt 41243865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20708126 - 20707986
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||||| || ||||||||||    
T  20708126 gattatgattgatgtagagcttactcccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagaattagtttctttggtgagttg 20708027  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| ||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  20708026 cttggtgattgtttggatagcgggagctctctccgttatcg 20707986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Original strand, 21233866 - 21234009
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtct-gtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21233866 gattacgattgatgtaaaacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttttgtatggatgggtagatgaagtgcatgattagttgctttggtgagtt 21233964  T
Q  224 gattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
    | |   || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  21233965 gctcagtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggtt 21234009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 645935 - 646059
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  645935 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 646031  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  646032 ttgtgcatgattagttgct-tggtgagtt 646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 128 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24266327 - 24266190
Alignment:
Q  128 tatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgatt 227  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  ||||| | |||| |||| | |||||||| ||    
T  24266327 tatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatggatagacgaagtgcagggttagatgctttcgtgagttgctt 24266228  T
Q  228 gatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | || ||| || |||| || |||||||||||| |||||    
T  24266227 ggtggttgctttgatagcgggagctatctccgttatcg 24266190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29758562 - 29758497
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29758562 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 29758497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17500180 - 17500092
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  17500180 gattatgtttgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgct 17500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20479906 - 20479831
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20479906 gattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 20479831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 43375458 - 43375555
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43375458 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatggatagacgttgtgc 43375554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7468631 - 7468532
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7468631 gattatgattgatgtaaagcttacctcccatggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaagattagttgctttggtgagttg 7468532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 22323409 - 22323476
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323409 tgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 22323476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 831670 - 831794
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  831670 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccncagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 831766  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  831767 ttgtgcatgattagttgct-tggtgagtt 831794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 24387578 - 24387655
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24387578 tggattatgata-atgtaataattacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 24387655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Original strand, 41509102 - 41509249
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41509102 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccctcagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttg 41509200  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    || |||||||||  ||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41509201 ct-tggtgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgggagctacctccggtatc 41509249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11600398 - 11600303
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||| |||||    
T  11600398 tgtttatgtggattgtgattgatgtgaagcttactcccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggtagacggagtgcatgagtagtt 11600303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 187
Target Start/End: Original strand, 22499138 - 22499200
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22499138 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgg 22499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37605327 - 37605202
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  37605327 gaattgaaatattcatgtt-aactgtt-atttagattatgat-gatgtaataattacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctatatggatgggtag 37605232  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  37605231 acgttgtgcagggatagttgct-tggtgagt 37605202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 269922 - 269862
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  269922 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct-tggtgagtt 269862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 190
Target Start/End: Original strand, 16204164 - 16204230
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16204164 tggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacatgtctgtatggatgggta 16204230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24906275 - 24906125
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg-ttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc-tc 214  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| |||||| |||| |     
T  24906275 ttatttggattctgattgatgtaaatcttacccccagtggtttttgatcgcctacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggattagtttgcatt 24906176  T
Q  215 tggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |||||||||| |||  | ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  24906175 tggtgagttgcttggggattgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 24906125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 266
Target Start/End: Original strand, 33612875 - 33612988
Alignment:
Q  153 agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagct 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||| |||| |||| ||||| | |||| ||| ||||||| || ||| |    
T  33612875 agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggacagacgttgtacagaattagctgctttggttagttgctcgatggttgcttggatagcgggagtt 33612974  T
Q  253 atctccggtatcgg 266  Q
    ||||||| ||||||    
T  33612975 atctccgctatcgg 33612988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24237365 - 24237290
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  24237365 tgtttatgttgattatgattgatgtgaatcttacccccaatggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggta 24237290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24547483 - 24547401
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  24547483 ttatctggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 24547401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22884114 - 22884036
Alignment:
Q  112 aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  22884114 aactgtttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccctagtggttttgactgcctacctgtttgtatgaatgggta 22884036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16416550 - 16416475
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16416550 gattatgat-gatgtaatacttacccccagaggttttagctgtctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgca 16416475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23509088 - 23508938
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23509088 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 23508990  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || |||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23508989 ct-tggtgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggt 23508938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 273059 - 273141
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  273059 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 273141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 642790 - 642708
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  642790 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 642708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 828596 - 828514
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  828596 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 828514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5236495 - 5236413
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  5236495 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 5236413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Original strand, 19995065 - 19995135
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgtt 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19995065 gattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggatgtaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgtt 19995135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 21846348 - 21846430
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  21846348 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 21846430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 21853753 - 21853835
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  21853753 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttcaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 21853835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 22090301 - 22090383
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22090301 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22090383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 24663103 - 24663185
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  24663103 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 24663185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43683954 - 43683872
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  43683954 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 43683872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 13664708 - 13664872
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  13664708 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacg 13664804  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13664805 ttgtgcaggtttagatgct-tggtgagt--attg-tgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggt 13664872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 13723983 - 13724147
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  13723983 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacg 13724079  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13724080 ttgtgcaggtttagatgct-tggtgagt--attg-tgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggt 13724147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 146
Target Start/End: Original strand, 18768646 - 18768698
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatactt 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18768646 gaattgatttattcatgcttaactg-ttatgtggattatga-tgatgtaatactt 18768698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 21496175 - 21496264
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||| ||| || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  21496175 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtttgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagct-tggtgagtt 21496264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22319965 - 22319923
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22319965 tgtttatgttgattatgattgatgtaaaacttacccccagtgg 22319923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22884772 - 22884683
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  22884772 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtaagggtgagtagacgttgtgcaggactagtagct-tggtgagtt 22884683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 3433683 - 3433807
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  3433683 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 3433779  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  3433780 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 3433807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11542286 - 11542225
Alignment:
Q  149 ccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  11542286 ccccagtggtttcgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacaaagtgcatgattagtt 11542225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 16874800 - 16874865
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16874800 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16874865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Original strand, 24719471 - 24719603
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccc-cagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatg 186  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||      ||||| | ||| ||||||||||||    
T  24719471 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctcagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatg 24719567  T
Q  187 ggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  24719568 ggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 24719603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24266461 - 24266361
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||| ||  ||||| | | |||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24266461 tgataagtgtgcttggtgagtacttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgtgaagtactcggaattgatt 24266362  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  24266361 t 24266361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28836000 - 28835891
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  28836000 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatg 28835902  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  28835901 ct-tggtgagtt 28835891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16676182 - 16676264
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16676182 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtagttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16676264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 258
Target Start/End: Original strand, 19333914 - 19334005
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgctct-ggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  19333914 tacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtttgctttcggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctcc 19334005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21228095 - 21228363
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21228095 tgataaatgtgcttggtgaatatttgattgtattattttgaaatgttatgtaaatgtacatattgaattaaccgtttatgttaagtactaggaattgatt 21228194  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||| || |||||     
T  21228195 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttgtcaaccaacctgtctgtatggatgggtagacattgtgt 21228294  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
    | ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21228295 aggattagtagctccaatgagtttattgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggttt 21228363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13793505 - 13793321
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13793505 gaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatggataa 13793406  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13793405 acgctgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttggttggatatcggaagctatctccggtatccgtttagtaggg 13793321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Original strand, 37189920 - 37190103
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37189920 gaattgttttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 37190018  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37190019 acgttgtgcaggattagttgttccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtaggg 37190103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21615376 - 21615197
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  21615376 gaattgatttgttcatgtctaactgtttatgttgattatgattgatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtag 21615278  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21615277 acgctgtgcaggattagttactccggtgagttgattgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 21615197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7726964 - 7726787
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  7726964 gaattgaattattcatgcttagctgtt-atctggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatagatgggtag 7726867  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  7726866 acgatgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctctggtatcagtttagt 7726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 11338782 - 11338926
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  11338782 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc-gg 11338879  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11338880 tgagtt-cttg-tgtttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 11338926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28888259 - 28888075
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccc-agtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatg 186  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||||||||||||||||||||||    
T  28888259 attgttttattcacgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttaccccccagtggatctgtgatggaccgcatacctgtctgtatggatg 28888162  T
Q  187 ggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28888161 ggtagacgttgtgcaggattagttgcttcagtgagttgattgatgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtag 28888075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 24185095 - 24185220
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24185095 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtagac 24185191  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  24185192 gttgtgcaggagtagttgctctggtgagt 24185220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 274
Target Start/End: Original strand, 5453127 - 5453291
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||      ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5453127 tgtttatgttgattatgattgatgtaatacttaccccaaatggatctgtgatgaaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaagattag 5453226  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5453227 ttgctccggtgagttgattgatgctt-gatggatatcaggagctatctccggtatcggtttagtag 5453291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23453204 - 23453059
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||    
T  23453204 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttcctttgg 23453106  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23453105 tgagttcttt--tgcttgg-tggatatcgtgagctatctctggtatcggt 23453059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23460448 - 23460303
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||    
T  23460448 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttcctttgg 23460350  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23460349 tgagttcttt--tgcttgg-tggatatcgtgagctatctctggtatcggt 23460303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23464709 - 23464564
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||    
T  23464709 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttcctttgg 23464611  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23464610 tgagttcttt--tgcttgg-tggatatcgtgagctatctctggtatcggt 23464564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23492279 - 23492098
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| ||||||||||||||| |||    
T  23492279 attgttttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggctgg 23492182  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23492181 gtagacgttgtgcaggattagttgctctagtgagttggttgatgcttgg-tggataccgggagctatctcctgtatcggtttagt 23492098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19872263 - 19872119
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgc-t 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |    
T  19872263 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagttgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctt 19872164  T
Q  214 ctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
     |||||||||| ||| || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  19872163 ttggtgagttgcttggtgattgcttggatagcgggagctatctcc 19872119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 258
Target Start/End: Original strand, 26561623 - 26561756
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26561623 gattatgattgatgtaaagcttaccctcagtggatttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattaattgctttggtgagttg 26561722  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctcc 258  Q
     ||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  26561723 cttggtgattggttggatagcgggagctatctcc 26561756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 3420668 - 3420808
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3420668 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 3420767  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  3420768 tttggtgattgcttggatagcggaagctatctccgttatcg 3420808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 272
Target Start/End: Original strand, 32967970 - 32968141
Alignment:
Q  99 tttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc--atacctgtctgtatggatgggtaaacgtt 196  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32967970 tttattcatgtttaactgct-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccactgtggttt-gaccgcctatacctgtctgtatggatgggtagacgtt 32968066  T
Q  197 gtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| || | |||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  32968067 gtgcaagattagttgctccagtgagttggttgatgctt-gatggataccaggagctatctccgatatcggtgtagt 32968141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3671773 - 3671609
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag 208  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  3671773 tgtttatgttaattatgattgatataatacttacccctagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacaatgtgcaagattag 3671674  T
Q  209 ttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3671673 ttgctccgatgagttgattgatgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcgatttagtag 3671609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24082450 - 24082310
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | |  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24082450 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgactgcctacctatctgtatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 24082351  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  24082350 cttgatggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 24082310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 431076 - 430962
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggt 261  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  431076 gaccgcctacttgtctatatggataggtagacgttgtgcatgattagttgatctggtgagttggttgatgcttggttggatatcgggagctatctctggt 430977  T
Q  262 atcggtttagtaggg 276  Q
    |||||| || |||||    
T  430976 atcggtgtactaggg 430962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21392452 - 21392349
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  21392452 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-gg 21392355  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  21392354 tgagtt 21392349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 23236244 - 23236384
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23236244 gattatgattgatgtaaagcttacccccaatggttttagccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgctttggtgagttg 23236343  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| || |||| || |||||||||||| |||||    
T  23236344 cttggtgattgcttagatagcgggagctatctccgttatcg 23236384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20710792 - 20710647
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctg 216  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||    
T  20710792 tttatatggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatggatagttgct-tg 20710696  T
Q  217 gtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||   ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20710695 gtgagtcttttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 20710647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24470575 - 24470493
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24470575 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 24470493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28257794 - 28257658
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||     
T  28257794 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggatagttgct-tggtgagtt- 28257698  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
     ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28257697 -ttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 28257658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4863588 - 4863489
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||| |||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4863588 ttattcatgattaactgttgttttg-attatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 4863491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6455022 - 6454901
Alignment:
Q  144 cttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggata 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  6455022 cttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacggagtgcagggttagttgctttggtgagttgcttggtggttgcttggata 6454923  T
Q  244 tcgagagctatctccggtatcg 265  Q
      | |||||||||||| |||||    
T  6454922 gtgggagctatctccgttatcg 6454901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19403833 - 19403689
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  19403833 ttatatggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgc-tacctgtttgtatggatgagtagacgttgtgcaggattagttgctctag 19403737  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||   ||| || |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  19403736 tgagtcttttg-tgcttgg-tggatatcaggagctttctccggtatcggt 19403689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19860598 - 19860529
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt 161  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19860598 gaattgatttgttcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccggtggtttt 19860529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Original strand, 27185672 - 27185761
Alignment:
Q  110 ttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27185672 ttaactgttaat-tggattatg-ttgatgtaatacttacccccagtgattttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 27185761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Original strand, 24227823 - 24227928
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  24227823 tacctgtctgtatagatgggtagacgttgtgcaggattagttgattcggtgagttgcttgatgtttgctcggatatcgggagctatcttcggtatcgatt 24227922  T
Q  269 tagtag 274  Q
    | ||||    
T  24227923 tcgtag 24227928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 21661573 - 21661654
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21661573 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 21661654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 5623265 - 5623364
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5623265 gattatgattgatgtaaagcttacacctaatggttctgaccacctacttgtcagtatggatgggtaaacgaagtgcatgattagtttctttggtgagttg 5623364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 16837583 - 16837658
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16837583 tgtttatgttgattataattgatgtaaagtttactcccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggta 16837658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20614914 - 20614832
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  20614914 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacctgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 20614832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11579893 - 11579833
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11579893 gaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 11579833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 18780200 - 18780365
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  18780200 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 18780296  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18780297 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggt 18780365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16534411 - 16534329
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  16534411 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 16534329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 21934136 - 21934218
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  21934136 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 21934218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 21940306 - 21940388
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  21940306 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 21940388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 22368654 - 22368736
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  22368654 ttatttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 22368736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 25902302 - 25902384
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  25902302 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 25902384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29912383 - 29912244
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| |||  || || | ||||| ||| | ||||||||    
T  29912383 gattatgattgatgtaaagcttacccctagtggtttggaccatctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtacagggttagtcgcttttgtgagttg 29912284  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
     ||| || ||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||||    
T  29912283 cttggtggttgcttggatagcggaagccatctccgttatc 29912244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35580556 - 35580474
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  35580556 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 35580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 37011140 - 37011222
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  37011140 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 37011222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37051286 - 37051204
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37051286 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttatctgtatgggtgagtagacgttgtgca 37051204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 25211947 - 25212111
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  25211947 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 25212043  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  25212044 ttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt--ttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 25212111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 25276099 - 25276263
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  25276099 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 25276195  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  25276196 ttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt--ttg-tgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 25276263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10342 - 10218
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  10342 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 10246  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  10245 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 4201961 - 4202026
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  4201961 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 4202026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 10780270 - 10780394
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  10780270 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 10780366  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  10780367 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 10780394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25003205 - 25003141
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttt 160  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  25003205 ttgaattattcatgcttaattgattatgtggattatg-ttgatgtaatgctcacccccagtggttt 25003141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Original strand, 35793310 - 35793475
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | | | |||||||||||||||| |||    
T  35793310 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacg 35793406  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35793407 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgagagctttctccgatatcggt 35793475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 1221806 - 1221915
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  1221806 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatg 1221904  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  1221905 ct-tggtgagtt 1221915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 9732762 - 9732871
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  9732762 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 9732860  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  9732861 ct-tggtgagtt 9732871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11340619 - 11340510
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  11340619 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 11340521  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  11340520 ct-tggtgagtt 11340510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7423902 - 7423820
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  7423902 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccacctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 7423820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 21235388 - 21235465
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  21235388 tggattatgata-atgtaatgcttaccaccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 21235465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 17473921 - 17473981
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  17473921 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 17473981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17907786 - 17907726
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  17907786 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtagct-tggtgagtt 17907726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 21075482 - 21075547
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  21075482 atgtaatgtttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 21075547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27008296 - 27008231
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  27008296 atgtaatgcttacccccagtgattttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 27008231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 29192886 - 29192946
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  29192886 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 29192946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32949403 - 32949334
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtgg-ttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  32949403 ttgatgtaatactcacccccagtggtttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 32949334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34937606 - 34937482
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtt------ttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      | |||||| | | | |||||||||||||||| |||    
T  34937606 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctgcatatctgtatggatgggtagacg 34937510  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  34937509 ttgtgcaggactagtagct-tggtgagtt 34937482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7527446 - 7527378
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  7527446 ttgatgtaatactcacccccagtggttctaaccgcctacttgcctgtatgggggagtagacgttgtgca 7527378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 22885276 - 22885323
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  22885276 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 22885323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Original strand, 33628099 - 33628191
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||  ||||| | |||||  ||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  33628099 ttatttggattatgattgatgtaaagcttatcttcagtggttttgaccgtctacctatttgtataaatgggtagacgaagtgcaggattagtt 33628191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51770 - 51497
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  51770 tgataaatgtacttggtgaatacttggtcgcattattttagaatgtcatgtaaatgtacatattgaattgactgtttatgctaagtacttggaattgaat 51671  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51670 tattcatgattaactgtttatgtgaattatgattgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatgaatgggtagacgttgtgc 51571  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51570 aggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggtttcgtag 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8037 - 7956
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||| |||| || |||||||||    
T  8037 ttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctc 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11894 - 11622
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  11894 tgataagtgtacttggtgaatacttggtcgtattattttagaatgttatgtaaatgtacatattgaattaactatttatgttaagtacttggaattcatt 11795  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11794 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgat-taatgcttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgc 11696  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    | |||||||||||   |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11695 aggattagttgcttctgtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcggttttgtag 11622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29651 - 29569
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  29651 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 29569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29562 - 29289
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||| | | ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29562 tgataagtgtacttggtgaatacttgttcgcattattttggaacgttatgtaaatgtacatattgaattaactgtttatgctaagtacttggaattgaat 29463  T
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  29462 tattcatgattaactgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgttgtgt 29363  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29362 aggattagttgcttcgttgagttgattgatgcttggtcggatatcaggagctatctccggtattggttttgtag 29289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33844 - 33660
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||     
T  33844 gaattggtttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgactgcctacatgtctgtatggattggtag 33745  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33744 acgttgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagtaggg 33660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 273
Target Start/End: Original strand, 12246050 - 12246226
Alignment:
Q  96 tgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgt 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||      
T  12246050 tgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccctcggtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac-c 12246148  T
Q  196 tgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagta 273  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12246149 tgtgcaggattagttgctctagtgagtcgattgatgcttggttggatatcgagagctatatccggtatcggtttagta 12246226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 273
Target Start/End: Original strand, 41167725 - 41167903
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  41167725 gaattgttttattcatgtctaactgtt-atgtggattgtgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 41167821  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagta 273  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41167822 acgttgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgtttggttggatatcgggagctatctccggtatcggtttagta 41167903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 272
Target Start/End: Original strand, 34197982 - 34198157
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34197982 attgttttattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccgcagtagttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 34198079  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  34198080 gttgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttgg-tggataccaggagctatctccgctatcggtttagt 34198157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 276
Target Start/End: Original strand, 43283248 - 43283436
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||      ||||| |||||||||||||||||    
T  43283248 gaattgaattattcatgtctaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtagatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggat 43283345  T
Q  186 gggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  43283346 gggtagacgttgtgcaagattagttgctctggtgagttgattgatgattggttggatatcgggagctacctctgatatcggtttagtaggg 43283436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 19824214 - 19824451
Alignment:
Q  23 cttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatttattcatgtttaactgtttatg 122  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| | ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  19824214 cttgattgcattattttgagatgttatgtaaatgtacgtattgaattaaccgtttatatcaagtatttgaaattgatttattcacgcttaactg-ttatg 19824312  T
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||| |  ||||||     
T  19824313 tggattatga-tgatgtaatacttatctccaatggttttgatcgcctacctgtctgtatggatgggtagaagctgtgcaggagtagttgtttcggtgag- 19824410  T
Q  223 tgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19824411 tgattgatgcttgg-tggatatcgggagctacctccggtatc 19824451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 265
Target Start/End: Original strand, 41258155 - 41258326
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41258155 aattgatttattcatgtctaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtaaa 41258253  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||  | | || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  41258254 cgttgtgcaggattagttactttggtgagtttctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 41258326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27959407 - 27959239
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27959407 ttattcatgcttaactgtt-atgtggattatggt-gatgtaatacttacccaaa-tggttttgactgcctacctgtctgtatggatgagtagacgttgtg 27959311  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27959310 caagattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 27959239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42707072 - 42706906
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||     
T  42707072 gaattgaattattcatgcttaattgtttatgtggattatgattgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgactatctgtctgtatggatgggtag 42706973  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||| | |  | ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42706972 acgttgtgcaggagtagttgct-tggtgagttgctcggcggttgcttggatagcgggagctatctccg 42706906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 15853120 - 15853267
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  |    
T  15853120 ttatgtggattatgat-gatataatacttacccccagtggttttgaccacatacatgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggatcagttgctccag 15853218  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15853219 tgagttattttatgcttgg-tggatatcgagagctatctccggtatcggt 15853267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Original strand, 37958879 - 37959030
Alignment:
Q  119 tatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggt 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |||    
T  37958879 tatgtggattatgat-gatgtaatacttacctccggtggttttgaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgctgttcaggattagttgctccggt 37958977  T
Q  219 gagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37958978 gagttggttgatgcttgg-tggataccgggagctatctccggtatcggtttagt 37959030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Original strand, 7966437 - 7966581
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |   ||||||||    
T  7966437 gattatgattgatgtaatgattacctccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggagtagttgattcagtgagttg 7966536  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
     ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7966537 cttgatgcctggtcggatatcgggagctatctccggtatcggttt 7966581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14867741 - 14867571
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||     
T  14867741 gaattgaattatttatgtttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttt-gaccgtctacctgtctgtatggatgggtag 14867645  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||   |||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14867644 acgttgtgcaggattagttgcttcggtgagt--gttgatgcttgatcggatatcgtaagctatctccggtatcggt 14867571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Original strand, 30236367 - 30236532
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  30236367 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 30236463  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30236464 acgctgtgcatgattagttgct-tggtgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatc 30236532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38763110 - 38762966
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  38763110 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcagggttagttgcttcggtgagttg 38763011  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
     ||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38763010 cttggtgcttggtcgaatatcgggagctatctccggtatcggttt 38762966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5407482 - 5407338
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| | || |||||||    
T  5407482 gattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctatctgtctgtatggatgagtagacgacgtgcatgattagttgttttgatgagttg 5407383  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
     ||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5407382 cttggtgcttgcttggatatcaggagctatctccggtatcggttt 5407338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 50223971 - 50224089
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  50223971 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 50224070  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgct 213  Q
      ||||| |||||||||||    
T  50224071 aagtgcacgattagttgct 50224089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 15116127 - 15116286
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      || || | | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  15116127 ttatgttgattatgattgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggactgcctgcatgtctgtatggatgtgtagacgttgtgcaggattagttg 15116226  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15116227 ctccggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatatccggtatcggtttagt 15116286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 18496314 - 18496460
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |    
T  18496314 ttatatggattatgat-gatgtgatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcagtattagttgctctag 18496412  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18496413 tgagtt-cttgttgcttag-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 18496460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Original strand, 21961398 - 21961564
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21961398 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaataattaaccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagac 21961494  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21961495 gttgtgcaggattagttgctc-ggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggaactttctccggtatcggt 21961564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 12901595 - 12901701
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901595 ttattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtg 12901691  T
Q  200 catgattagt 209  Q
    || |||||||    
T  12901692 caggattagt 12901701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18275273 - 18275001
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18275273 tgataagtgtgcttggtgaatagttgatcgtattattttggaatgttatgtaaatgtacatattcgattaaccgtttatgttaagtgcttggaattgatt 18275174  T
Q  101 t-attcatgttt------aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    | | |||| | |      | |||||| | |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||    
T  18275173 taactcatatatgctcaaatctgttt-tatttattatgattgatgtaat--gtacccccagtggttttgaccgcttaccagtctgtatgtatgggtagac 18275077  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
       ||||| |  || |||||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  18275076 aacgtgcagggatatttgcttcggttagttgcttgatgcttggtcggatatcaggagctatctctggtatcggttt 18275001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 7187768 - 7187907
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  7187768 gattatgtttgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgattgggtgagttg 7187867  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
      || || ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  7187868 -ctggtgattgcttggatagcggcagctatctccgttatcg 7187907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Original strand, 20813846 - 20814014
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  20813846 gaattgaattattcatgtt-aactatt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 20813942  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20813943 acgttgtacaggattaattgctc-ggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 20814014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44054188 - 44054106
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44054188 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 44054106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 265
Target Start/End: Original strand, 10239246 - 10239416
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  10239246 ttgattcatttatgtctaactatttatgtggattatgattgttgtaaagcttacccctagtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagacg 10239345  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
      ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || ||| || ||||  | ||| |||||||| |||||    
T  10239346 aagtgcaagattagtcgctttggtgagttgcttggtgattgcttagatagagggagttatctccgttatcg 10239416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 12838172 - 12838316
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||    
T  12838172 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaacggcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaaggttagttgctc-gg 12838269  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  12838270 tgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 12838316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Original strand, 13752154 - 13752282
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||| || |    
T  13752154 tgatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-ggtgagtt--ttg-tgct 13752249  T
Q  234 tggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  13752250 tgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 13752282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Original strand, 47470146 - 47470266
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccc--agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |    
T  47470146 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttacccccctagtggttttgaccacctacttgtctgtatggatgggtaga 47470245  T
Q  193 cgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  47470246 cgaagtgcatgattagttgct 47470266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 267
Target Start/End: Original strand, 13814727 - 13814824
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13814727 tacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctctgatgagttgtttgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtgtcggt 13814824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 53909730 - 53909812
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53909730 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgca 53909812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 109751 - 109686
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  109751 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 109686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 214
Target Start/End: Original strand, 45460850 - 45460973
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatac----ctgtctgtatggatgg 187  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||| |    
T  45460850 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattattat-gatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtctgtatggatag 45460946  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45460947 gtagacgttgtgcaggattagttgctc 45460973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Original strand, 54120180 - 54120257
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54120180 tggattatg-ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgtctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 54120257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 8874311 - 8874408
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8874311 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatatttactcccattggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 8874407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 265
Target Start/End: Original strand, 12136123 - 12136275
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc- 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |   ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||     
T  12136123 tgtttatgttgattatgattgatgtgaaggttaccaccaatggtttcgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagtttgct 12136222  T
Q  213 tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  12136223 tttggtgagttgcttggtgattgcttggatagcggaagctatctccgttatcg 12136275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34393405 - 34393296
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt------gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34393405 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacctccagtggatctatgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttg 34393307  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  34393306 ct-tggtgagtt 34393296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13244626 - 13244544
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13244626 ttatttggattatg-ttgatgtaatacttacccccaatggttttaaccacctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtgca 13244544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 16366604 - 16366686
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16366604 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttatccgcctgcctgtctgtatggacgggtagacgttgtgca 16366686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33738512 - 33738395
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33738512 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatact-acccacagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtgc 33738417  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    | | |||||||||| ||||||||    
T  33738416 agggttagttgctc-ggtgagtt 33738395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 259
Target Start/End: Original strand, 41919072 - 41919217
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgatt-agttgc- 212  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| | ||||     
T  41919072 tgtttatgttgattttgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgaagtgcaggattaatttgct 41919170  T
Q  213 tctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    | ||||||||||  || || ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  41919171 tttggtgagttgtctggtgattgcttggatagcgggagctatctccg 41919217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 53706793 - 53706888
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53706793 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccc--agtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgttgtgc 53706887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Original strand, 13448877 - 13449007
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  | || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  13448877 gattatgattgatgtaaagcttaccct-attgattttgaccgcctacctgcctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 13448975  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatct 256  Q
     | | || ||| ||||||| || |||||||||    
T  13448976 ctcggtgattgcttggatagcgggagctatct 13449007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19557669 - 19557535
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg-ctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| |||||||||  | || ||||||    
T  19557669 gattatgtttgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtcagtatggat-ggtagacgaagtgcaggattagttgtttttgatgagtt 19557571  T
Q  224 gattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    | ||| || ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  19557570 gcttggtgattccttggatagcgagagctatctccg 19557535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 207
Target Start/End: Original strand, 54365910 - 54366002
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgatta 207  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||| |||||    
T  54365910 tgtttatgttgattatgaatgatgtgaagcttaccccaagtggttttgacagcatacctgtttgtatgaatgggtagacgaagtgcaggatta 54366002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 163
Target Start/End: Original strand, 13811514 - 13811582
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttga 163  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13811514 gaattgaattattcatgtt-aattgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttga 13811582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 14503384 - 14503473
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  14503384 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggaatagtagct-tggtgagtt 14503473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Original strand, 17378030 - 17378096
Alignment:
Q  124 ggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  17378030 ggattatgattgatgtgaaacttacccccagtagttttgaccgcctacctgtttgtatcaatgggta 17378096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33240659 - 33240566
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtat-ggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgat 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || || ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33240659 ttgatgtaatgctcacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggttgagtagacgttatgcatgagtagttgctc-ggtgagttgat 33240566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 214
Target Start/End: Original strand, 23272043 - 23272123
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  23272043 ttgatgtaatactcacccc-agtggttttgaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcagggttagttgctc 23272123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8043314 - 8043246
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  8043314 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 8043246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9793622 - 9793554
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9793622 ttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgttgtgca 9793554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18166894 - 18166785
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18166894 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatttgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 18166796  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  18166795 ct-tggtgagtt 18166785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24237233 - 24237149
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||    
T  24237233 tttatgttgattatgattgatgtgaagctaacccccagttgttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgagtagacgtggtgca 24237149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 15296054 - 15296136
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15296054 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15296136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 55378749 - 55378853
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctg 216  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  55378749 tggattatgttt-atgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagatgct-tg 55378846  T
Q  217 gtgagtt 223  Q
    |||||||    
T  55378847 gtgagtt 55378853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26337779 - 26337702
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  26337779 tggattatgata-atgtaatgcttacccctagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtgagtagacgttgtgca 26337702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10486970 - 10486890
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||    
T  10486970 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 10486890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 13595866 - 13596004
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattag-ttgc-tctggtgagt 222  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| |||  ||| | |||||| |||| | ||||||||    
T  13595866 gattatgattgatgtaaagcttatccctagtggttttgaccgcctac----ctgtatggatgggtagacgaagtgtaggattagtttgcttttggtgagt 13595961  T
Q  223 tgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    || ||| || ||| |||||||  | |||||||||||| |||||    
T  13595962 tgcttggtgattgcttggatagtgggagctatctccgttatcg 13596004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 15274628 - 15274752
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  15274628 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 15274724  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  15274725 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 15274752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Original strand, 19623870 - 19623947
Alignment:
Q  113 actgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |  || ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  19623870 actgtttatgttgattatgatttatgtgaagctaacccctagtggttttgaccacctacctgtttgtatgaatgggta 19623947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26678214 - 26678090
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  26678214 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacg 26678118  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  26678117 ttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 26678090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44345070 - 44345015
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatg 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44345070 gattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatg 44345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8372627 - 8372518
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8372627 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 8372529  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  8372528 ct-tggtgagtt 8372518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12732581 - 12732453
Alignment:
Q  60 atattgaattaattgtttatgttaagtacttggaa-ttgattta-ttcatgt---tt--aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |   ||  || | || |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  12732581 atattgaattaaatgcttatgttaagtacttggaacttgatttaattcatttacattcaaattattcatgtcgattatgattgatgtgaaactta-cccc 12732483  T
Q  153 agtggttttgaccgcatacctgtctgtatg 182  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  12732482 agtgattttgaccgcctacctgtttgtatg 12732453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15211473 - 15211426
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15211473 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 15211426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 17213708 - 17213796
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||   ||||| |||||||||||    
T  17213708 gattatgattgatgtgaagctaatccccagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatggatagacagagtgcaggattagttgct 17213796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18246198 - 18246089
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18246198 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 18246100  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  18246099 ct-tggtgagtt 18246089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14950317 - 14950236
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  14950317 ttatctggattatgata-atgtaatgcttaccccca-tggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtaaacgttgtgca 14950236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 15288887 - 15288969
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| | || ||| ||||||||||    
T  15288887 ttatttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtattggtgagtagacgttgtgca 15288969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47355524 - 47355447
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  47355524 tggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggtttaaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 47355447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 5684772 - 5684870
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttt-tgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  || |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5684772 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atataatgcttacccctagtggtttctaaccgcctacttgtctgtatggatgagtagacgttgtg 5684868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 7134533 - 7134593
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  7134533 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 7134593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 7187638 - 7187739
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||||| ||  ||||| | | |||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  7187638 tgataagtgtgattggtgaatacttgatcgtgctatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaattgtctatgtgaagtacctgaaattgatt 7187737  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  7187738 ta 7187739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 226
Target Start/End: Original strand, 15676831 - 15676907
Alignment:
Q  149 ccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgat 226  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||| |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  15676831 ccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttatgcaggagtagttgctc-ggtgagttgat 15676907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16520814 - 16520712
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggt 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      || | || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16520814 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgttatgaactgtatgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgct-tggt 16520717  T
Q  219 gagtt 223  Q
    |||||    
T  16520716 gagtt 16520712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9293670 - 9293623
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  9293670 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 9293623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10642332 - 10642285
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  10642332 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaagtttagttgct-tggtgagtt 10642285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37474689 - 37474642
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  37474689 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 37474642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 272
Target Start/End: Original strand, 106710 - 106887
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  106710 gaattgctttattcatgtataactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccaatgattttgaccgcctacctgtctgcatggatgggtag 106807  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagt 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106808 acgttgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggtttagt 106887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 107954 - 107782
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||     
T  107954 gaattgatctattcatgtttaactgat-atgcggattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtattaatgggtag 107857  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  107856 acgtggtgcatgattagttgctctggtgagttgattgttgcttgg-tggatatcgggagctatctccgttatcggt 107782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 130244 - 130075
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  130244 ttgattcatttatgtcaaactgtttataaggattatgattgatgtaaagcttaccc--agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacg 130147  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcgg 266  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  130146 acgtgcaggattaattgctttggtgagttgcttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcgg 130075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 114108 - 114233
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||    
T  114108 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttgaattatgat-gatgtaatacatacccccagtggttttgaccgcctacctatttgtatggatgggtagac 114204  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||    
T  114205 gatgtgcaggagtagttgctctggtgagt 114233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 59310 - 59375
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||| ||||||    
T  59310 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgca 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7088
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| || ||| ||| ||||||    
T  7023 atgtaatacttacccccagtggttttaaccacctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgca 7088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 90 - 267
Target Start/End: Original strand, 24233 - 24408
Alignment:
Q  90 tggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggt 189  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24233 tggaattgttttattcatgtataactgtt-atgtggattatgat-gatgtagtgctcacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 24330  T
Q  190 aaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24331 agacgctgtgcaggattagttgctctggtgagttgattgatgcttgggtggatatcggaagctatctccagtatcggt 24408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18945 - 18825
Alignment:
Q  145 ttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| || ||||||| | | || ||| |||||||     
T  18945 ttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttgatgagttgctcggtggttgcttggatag 18846  T
Q  245 cgagagctatctccggtatcg 265  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  18845 tgggagctatctccgttatcg 18825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26422 - 26362
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26422 gaccgcctgcctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct-tggtgagtt 26362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Original strand, 15228 - 15341
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||||  |||||||| || | ||||||| |    
T  15228 aattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacctccaatgattttaaccgccgacctgtctatacgaatgggtaga 15324  T
Q  193 cgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||| ||||    
T  15325 cgttgtgcatgagtagt 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9723 - 9555
Alignment:
Q  99 tttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgt 198  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9723 tttactcatgtttaaatgtatatgtggattatg-ttgatgtaatgcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgt 9625  T
Q  199 gcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttg-gttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9624 gcaggattagttgcttcggtgaattgattgatgcttgatttggatatcgggagctatctccggtatcggt 9555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 7173
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7343 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 7247  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7246 acgttgtgcaggattagttgctctggtgagttctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 7173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Original strand, 5210 - 5379
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  5210 gaattgttttattcatgcctaactgtt-atgtggaatatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 5307  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5308 acgctgtgcaggattagttgttccggtgagttgattgatgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatc 5379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 267
Target Start/End: Original strand, 12457 - 12630
Alignment:
Q  89 ttggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatggg 188  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12457 ttggaattgtttcattcatgtttaactgtt-atgtg-attatgat-gatgtaatgcttacccccactggttttgaccgcctacatgtctgtatggatggg 12553  T
Q  189 taaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12554 tagacgttgtgcaggattagttgctccggtgagt--attgatgcttgggtggatatcgggagctatctccggtatcggt 12630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 78062 - 77889
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||     
T  78062 gaattgttttattcatgcctaactgct-atgtggattatgat-gatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtattgatgagtag 77965  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  77964 acgttgtgcagcattagttgctctggtgagttggttgatgcttgggtggatatcgggagctatctccggtatcggt 77889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 258
Target Start/End: Original strand, 70157 - 70275
Alignment:
Q  139 taatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggtt 238  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  || ||| ||    
T  70157 taatgcttacccccattggttttgaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagtcgct-tggtgagttgcttcgtggttgctt 70255  T
Q  239 ggatatcgagagctatctcc 258  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  70256 ggatagcgggagctatctcc 70275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Original strand, 90976 - 91148
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||    
T  90976 attgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgg 91072  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||  || |||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  91073 gtagacgttgtgcagaattagttgct-tggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatggggagctatctccggtaccggt 91148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 142
Target Start/End: Original strand, 64273 - 64322
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaat 142  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  64273 gaattaattttttcatgttaaactgtttatgtggattatga-tgatgtaat 64322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Original strand, 25417 - 25548
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||     
T  25417 gaattgatttattcatgtctaactgtttaagtggattatgattgatgtaatgcttacccccaattgttttgaccgcctacctatctgtatggatgcgtag 25516  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25517 acgttgtgcatgattagttgctttggtgagtt 25548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 125 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1583 - 1434
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  |||||||||    
T  1583 gattatgattgatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaagtagttgcttcggtgagttg 1484  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtag 274  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1483 cttgatgcttggtcggatatcgggagctatctccggtatcagtttcgtag 1434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1672 - 1527
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1672 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agttgttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcatgattagttgctctgg 1575  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1574 tgagttgattg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctctggtatcggt 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Original strand, 3351 - 3518
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||     
T  3351 gaattgaattattcatgtt-aactatt-atgtggattatgat-gatgtgatacttacccccagtgattttgacggcctacctgt-tgtatggatgggtag 3446  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3447 acattgtacatgattagttgctctggtgagttgattgttgtttgg-tggatatcgggagctatctccggtatc 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9920 - 9750
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  9920 gaattgaattattcatgtt-aactatt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttggccgcctacctgtctgtatggatgggtag 9824  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9823 acgttgtgcaggattagttgctctggtgagtcctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Original strand, 19620 - 19786
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  19620 gaattgaattattcatgccta-ctatttatatggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtag 19718  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||||||| | | || ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  19719 acattgtgcagaagtagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccg 19786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 259
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29362
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| |||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  29196 gaattgaattattcatgccta-ctatttatatggattatgattgatgtaaagcttacccctagtggttttgaccgcctagctgtctgtatggatgggtag 29294  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccg 259  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||||||| | | || ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  29295 acattgtgcagaagtagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccg 29362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 138653 - 138735
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  138653 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgca 138735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 76624 - 76505
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttaccccca-gtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  76624 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctaagtggttttaaccgcgtacctatctgtatggatgggtagacgatgtg 76528  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    || | |||||||||| ||||||||    
T  76527 cagggttagttgctc-ggtgagtt 76505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 265
Target Start/End: Original strand, 106430 - 106592
Alignment:
Q  102 attcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |    
T  106430 attcatgtttaactgtttatgtggattataat-gatgtaatgcttacccccagtagttttgaccgcctacctgtctgtattgatgggtagacgctgtgta 106528  T
Q  202 tgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||||||||||| |||||||||| | | || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  106529 ggattagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgctatcg 106592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 53966 - 53869
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53966 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 53870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Original strand, 101669 - 101779
Alignment:
Q  157 gttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatct 256  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||| || || || | ||||||||| |||||||||    
T  101669 gttttgaccgcttacttgtcggtatggatgggtaaacgttgtgcaggagtagtttctcgagtgagttgactggtgctttggtggatatcgggagctatct 101768  T
Q  257 ccggtatcggt 267  Q
    | |||||||||    
T  101769 ctggtatcggt 101779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Original strand, 29346 - 29414
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  29346 ttgatgtaatactcacccccattggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 29414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 264
Target Start/End: Original strand, 2469 - 2634
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||    
T  2469 attgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaacagcctacctgactgtatggatgggtagac 2565  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2566 gttgtgcatgattagttgctctggtgagtt-ctttatgcttgg-tggatatcgggagctatctccagtatc 2634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25904 - 25751
Alignment:
Q  112 aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  25904 aactgtttatgtggattatgattgatataaatcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaggtgcaggattagttg 25805  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    || |||||||||| ||| || ||  ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  25804 ctttggtgagttgcttggtgattccttggatagcgggagctatctccgttatcg 25751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 84760 - 84648
Alignment:
Q  112 aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  84760 aactgtttatgtggattatgattgatgtaaagcttaccctaagtggttttgaccgcctacccgtctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttg 84661  T
Q  212 ctctggtgagttg 224  Q
    || ||||||||||    
T  84660 ctttggtgagttg 84648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Original strand, 331016 - 331110
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||      || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  331016 tgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctc-ggtgagtt 331110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Original strand, 197976 - 198042
Alignment:
Q  135 gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||||| || ||| ||||||||||    
T  197976 gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttacctgtatgggtgagtagacgttgtgca 198042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 199081 - 199349
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattgatt 100  Q
    |||||| ||| |||| ||| | |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  199081 tgataagtgtacttggtgactacttgatcgtattatttggaa-tgttatgtaaatgtacatattggattaaccgtttatgttaagtgcttggaattgatt 199179  T
Q  101 tat-tcatgttt------aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||  |||| | |      | |||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    
T  199180 taactcatatatgctcaaatctgttt-tattgattatgattgatgtaatgcttacccc-agtggttttgacatcctacctgtctgtatggatgggtagac 199277  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
    |  ||||| |  ||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  199278 gacgtgcagggatagttgcttcggtgagttgcttgatgcttggtcggatatcgagagctatctccagtatcg 199349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 104291 - 104147
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||  |||||||||    
T  104291 gattatgattgatgtaaagcttacttccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgaaggattagttgcttcggtgagttg 104192  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggttt 269  Q
     ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  104191 cttggtgcttgcttggatatcgggagctatctccggtatcggttt 104147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3688
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3545 gattatgattgatgtaaaacttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagaattagttgctttggtgagttg 3644  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
     | | || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  3645 ctcggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggtt 3688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6122 - 5979
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  6122 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctaactgtctgtatggatggttagacgctgtgtagaattagttgctctgg 6024  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6023 tgagttgattg-tgcttgg-tggatatcaggagctatctctggtatc 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 145007 - 144862
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  145007 ttatgtggattatgata-atgtaatacttacccc-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggattagttgctctgg 144910  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||   ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  144909 tgagtcctttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 144862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6064 - 5924
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  6064 gattatgattgatgtaaatcttacccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagttgctttggtgagttg 5965  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||  ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  5964 cttggtggtttcttggatagcgggagctatctccgttatcg 5924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 6135 - 6097
Alignment:
Q  60 atattgaattaattgtttatgttaagtacttggaattga 98  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6135 atattgaattaactgtttatgtgaagtacttggaattga 6097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 922 - 780
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||   |||||||     
T  922 gattatgattaatgtaatgcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgacgtgcaaggttagttgcttcagtgagttt 824  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  823 cttgatgcttggtcggatatcgagagctatctccgatatcggtt 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 227
Target Start/End: Original strand, 7445 - 7577
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||     
T  7445 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttaccctcaatggttttgatcgcctacctgtttgtatggataggtag 7541  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgatt 227  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7542 acgttgtgcaggattagttgcgctggtgagttgatt 7577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 2890 - 3017
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2890 gaattgtttcattcatgtttaactgtt-atgtg-attatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtag 2986  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  2987 acgttgtgcaggaatagttgctccggtgagt 3017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 11145 - 11272
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11145 gaattgtttcattcatgtttaactgtt-atgtg-attatgat-gatgtaatgcttacccctagtggttttgaccgcttacctgtctgtatggatgggtag 11241  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  11242 acgttgtgcaggaatagttgctccggtgagt 11272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 211
Target Start/End: Original strand, 14134 - 14226
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14134 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttg 14226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15729 - 15664
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15729 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 92272 - 92128
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||    
T  92272 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgct-tgg 92175  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||  ||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  92174 tgagtt-cttg-tgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 92128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 11121 - 11203
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  11121 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 11203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 86129 - 86279
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  86129 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttg 86227  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || |||||||||   | ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  86228 ct-tggtgagtt--cttatgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 86279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34627 - 34552
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||    
T  34627 tggattatgata-atgtaatgcttacccccagttgttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtg 34552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31796 - 31652
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31796 ttatgtgggttatgat-gatgtaatgcttaccgcccgtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgctc-gg 31699  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||   | ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31698 tgagtt--cttatgcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 31652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2927 - 2824
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||    
T  2927 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtttct-tgg 2830  T
Q  218 tgagtt 223  Q
    ||||||    
T  2829 tgagtt 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3931
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtt------ttgaccgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |      | |||||| ||||| ||| |||||||    
T  4112 gaattgatttattcatgtttaactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggatcagtgatggaccgcctacctttctttatggat 4016  T
Q  186 gg----gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||    ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4015 ggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctctggtaagttgattgttgcttgg-cggatatcgggagctatctccggtatcggt 3931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9811 - 9716
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaatt 96  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||| ||  ||||| | | |||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9811 tgataagtgtgcttggtgagtgcttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtacttggaatt 9716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19236 - 19141
Alignment:
Q  1 tgataaatgtgcttgatgaatgcttgattgtattattttgaaatgttatgtaactgtacatattgaattaattgtttatgttaagtacttggaatt 96  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||| ||  ||||| | | |||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19236 tgataagtgtgcttggtgagtgcttgatcgtgatatttgggattgttatgtgaatgtgtatattgaattaactgtttatgttaagtacttggaatt 19141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5719
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  5889 gaattgaaatattcatgtt-aactgtt-atttggattataat-gatgtaatacttatccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggtag 5793  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggt-tggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||  || ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5792 acgttgtgcaggattagttgctc-ggtgagtt--tttgtgcttggtgtggatatcgggagctttctccgatatcggt 5719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7025 - 6858
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  7025 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gacgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 6930  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| ||| || | ||||||||| |||||||||  | |  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6929 acgctgtacaggtttagttgct-tggtgagttcttgg--gcttgg-tggatatcgggagctatctccggtatcggt 6858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50953 - 50873
Alignment:
Q  196 tgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtttagtaggg 276  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50953 tgtgcaggattagttgctccggtgagttgattgatgcttggttggatatcgagagctatctccagtatcggtttagtaggg 50873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5100 - 4992
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5100 ttattcatgtttatctgtt-atgtggattatgat-gatgtaatgctaacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgta 5004  T
Q  200 catgattagttg 211  Q
    ||||||||||||    
T  5003 catgattagttg 4992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6935 - 6766
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6935 gaattgacttattcatgtt-aactgtt-atatggattatgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 6840  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||| |||||| |  |||||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  6839 acgatgtgcaggggtagttgtttcggtgag-tgattgatgcttgg-tggatatcgggagctacctccgatatcggt 6766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36233 - 36090
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36233 gattatgattgatgtaaagcttactctcagtggttttgaccgcctacatttctgtatggatgggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 36134  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggtt 268  Q
     | | || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  36133 ctcggtgattgcttggatagcgggagctatctccgttatcggtt 36090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26917 - 26790
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26917 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggactatg-ttgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtag 26821  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  26820 acgttgtgcagggttagttgctc-ggtgagtt 26790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 13705 - 13823
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13705 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtacacgttgtgc 13801  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    | | |||||||||| ||||||||    
T  13802 agggttagttgctc-ggtgagtt 13823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 78643 - 78732
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  78643 ttattcatgtctaactgtttatatggattatgattgatgtaatactta-ccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtacggatcggta 78732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 59900 - 59783
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  59900 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 59804  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagt 222  Q
    | |  |||||||| ||||||||    
T  59803 agggatagttgct-tggtgagt 59783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3633 - 3513
Alignment:
Q  100 ttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3633 ttattcatgtttatctgtt-atgtggattatgat-gatgtaatgctaactcc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgta 3537  T
Q  200 catgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  3536 catgattagttg-tttggtgagttg 3513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8407 - 8304
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |||||||| |||    
T  8407 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccaatggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgagtagacgctgtgcaggagtagttgctatgg 8309  T
Q  218 tgagt 222  Q
    |||||    
T  8308 tgagt 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37670 - 37565
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37670 aattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtaaa 37574  T
Q  193 cgttgtgca 201  Q
    |||||||||    
T  37573 cgttgtgca 37565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 911 - 772
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  911 gattatgattgatgtaaagcttacacccagtggttttgaccgcctacctgtctttgtggatgggtagatgaggtgcagggttagttgctttggtgagttg 812  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
     ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  811 cttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatc 772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 66577 - 66673
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  66577 tggattatgat-gatgtaatacttaccct-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcatgattagttgct-tggtgagt 66673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 26645 - 26743
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  26645 tggattatgat-gatgtaatacttaccctgagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgctc-ggtgagt 26742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Original strand, 4705 - 4849
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctgg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||    
T  4705 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctgtctatatggatgggtagacgctgtgcaggaatagttgct-tgg 4802  T
Q  218 tgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||||   | ||| |||| ||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  4803 tgagtt--cttatgcttgg-tggatattgggagctatctctggtatcggt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1369
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1294 gattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 1369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4276
Alignment:
Q  90 tggaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggt 189  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4374 tggaattgttttattcatgtataactgtt-atgtggattatgat-gatgtaaagctcagccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 6727 - 6867
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||| |||| || ||| |||    
T  6727 gattatgattgatgtaaagtttacccccagtggttttgaccacctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcagggttagctgctttgatgatttg 6826  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     | | || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  6827 ctcggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 6867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21387 - 21305
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21387 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgactgtatggatgggtagacgttgtgca 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 249374 - 249456
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  249374 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 249456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 35670 - 35759
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| | || ||| |||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  35670 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtataggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagctc-ggtgagtt 35759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 265
Target Start/End: Original strand, 31508 - 31625
Alignment:
Q  147 acccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcg 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||||||| | | || ||| ||||||| ||    
T  31508 acccccagtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggagtagttgct-tggtgagttgctcggtggttgcttggatagcg 31606  T
Q  247 agagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| |||||||| |||||    
T  31607 ggagatatctccgctatcg 31625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37780 - 37699
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37780 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgc 37699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45901
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45841 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 45901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Original strand, 25807 - 25946
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||  |||||   ||||||| | ||||||||||    
T  25807 gattatgattgatgtaaagcttacccc-agtggttttgaccgcctacctgttggtatggatgggtagacgaagtgcagagttagttgttttggtgagttg 25905  T
Q  225 attgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcg 265  Q
     ||| || ||| ||||||| || |||||||||||| |||||    
T  25906 cttggtggttgcttggatagcgggagctatctccgttatcg 25946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20895 - 20810
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggt 189  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20895 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtgcttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggt 20810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28485 - 28326
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  28485 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttgactgcctaactgtctgtatggattggtagacgttttgc 28389  T
Q  201 atgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | | |||||||||| ||||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28388 agggttagttgctc-ggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 28326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 130083 - 130148
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  130083 atgtaatacttaccccaagtggttttaaccgcctacttgcttgtatgggtgagtagacgttgtgca 130148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 99471 - 99375
Alignment:
Q  117 tttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  99471 tttatgtggattatgattgatgtaaagcttaatcccagtggttttgaccgcctacctgcctgtatgcatgggtagacgaagtgcaggattagttgct 99375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 217632 - 217697
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  217632 atgtaatacttaccccccgtggttttaaccgcctatctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 217697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5241 - 5132
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  5241 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatg 5143  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  5142 ct-tggtgagtt 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Original strand, 7245 - 7349
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||    
T  7245 attgaattattcatgtt-aact-tttattttgattatgat-gatgtaatacttacccccggtggttttaactgcctacctgtctgtatggatgggtagac 7341  T
Q  194 gttgtgca 201  Q
    ||||||||    
T  7342 gttgtgca 7349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 19469 - 19551
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19469 ttatttggattatgata-atgtaatactaacccccagtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 19551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 22965 - 23040
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  22965 tgtttatgttgattatgattgatgtaaagcttacccccagtggttttgaccgcctacatgtctgtatgaatgggta 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14008 - 13890
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||     
T  14008 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatg-ttgatgtaatacttaccca-agtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtag 13913  T
Q  192 acgttgtgcatgattagttgctc 214  Q
    |||||||||| | || |||||||    
T  13912 acgttgtgcagggttggttgctc 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 7035 - 7123
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7035 ttgatgtaatgcttaccct-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatagatgggtagacgttgtccatgattagttgctc-ggtgagtt 7123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20457 - 20368
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttaccccc-agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgct 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20457 gattatgattgatgtaaagcttaccccccagtggattttaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgaagtgcatgattagttgct 20368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4120 - 3996
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  4120 attgaattattcatgtt-aactgtt-attttgattatgat-gatgtaataattacccc-agtggttttgaccacctacctgtctatatggatgggtagac 4025  T
Q  194 gttgtgcatgattagttgctctggtgagt 222  Q
    |||||| |  | |||||||||||||||||    
T  4024 gttgtgtagcagtagttgctctggtgagt 3996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 2638 - 2747
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  2638 ttatttggattatgata-atgtaatacttacccccagtggatctgttatggaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagtag 2736  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  2737 ct-tggtgagtt 2747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12523 - 12427
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  12523 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggttttgaccgcctacctgtctctatggatgggtagacattgtgc 12428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 56250 - 56130
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||    
T  56250 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggat 56154  T
Q  186 gggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  56153 gggtagacgttgtgcatgattagt 56130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11665 - 11590
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  11665 tgtttatgttgattatgattgatgtaaaactaacccctagtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaatgggta 11590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Original strand, 7016 - 7132
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt----gattgatgtttggttggatatcgagagctatctc 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    | | | || ||||| |||||||  |||||||||     
T  7016 gaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgctttggtgagttgctcggtggttgcttggtcggatatcaggagctatcta 7115  T
Q  258 cggtatcggtttagtag 274  Q
    |||||||||||| ||||    
T  7116 cggtatcggtttcgtag 7132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 37018 - 37093
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||| |||||||    
T  37018 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccccagtagttttgaccgcctgcctatttgtatgaatgggta 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 72297 - 72379
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  72297 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagttgttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgca 72379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 76678 - 76760
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  76678 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagttgttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgca 76760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 256807 - 256889
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  256807 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccctagtggttttaaccacctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgca 256889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Original strand, 125285 - 125360
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  125285 gattatgat-gatgtattacttacacccaatggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 125360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 192788 - 192698
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  192788 ttatttggattatg-ttgatgtaatacttaccct-agtggttttaactgcctacctgtctgtgtggataggtagacgttgtgcaggagtagtt 192698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 111 - 176
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  111 atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggatgggtagacgttgtgca 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1468 - 1403
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1468 atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggatgggtagacgttgtgca 1403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7450 - 7316
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||    
T  7450 tgatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt-ctt 7353  T
Q  228 gatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    | || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7352 g-tgcttggt--gatatcgggagctttctccggtatcggt 7316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4366
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtg 199  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4445 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaaccc-agtggttttgaccgcctacctgtctgtatggatgggtagatgttgtg 4366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 223
Target Start/End: Original strand, 648 - 772
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  648 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctatctgtatggatgggtagacg 744  T
Q  195 ttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  745 ttgtgcaagattagttgct-tggtgagtt 772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 40982 - 40917
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40982 atgtaatacttatccccagtggttttaaccgcctacctatctgtatggatgggtagacgttgtgca 40917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 148
Target Start/End: Original strand, 8784 - 8840
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttac 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  8784 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgttgattatgattaatgtaatgcttac 8840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17779 - 17606
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggat 185  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||      ||||| ||||| |||||||||||    
T  17779 gaattgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattttgat-gatgtaatacttacccccattggatctgtgatggaccgcctacctctctgtatggat 17683  T
Q  186 gggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||  ||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17682 gggtagacgttgtgcaggattagatg-tttggtgagtt--ttg-tgcttgg-tggatatcgggagctacctccggtatcggt 17606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 7072 - 7176
Alignment:
Q  93 aattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaa 192  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7072 aattgaattattcatgat-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatacttacccc-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtaga 7167  T
Q  193 cgttgtgca 201  Q
    || ||||||    
T  7168 cgctgtgca 7176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 55801 - 55721
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgt 175  Q
    |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  55801 ttgattcatttatgtcaaactgtttatgtggattatgattgatgtgaagcttacccctagtggttttgaccgcctacctgt 55721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30692 - 30561
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtt------ttgaccgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      | |||||| | ||||||||||||||| |    
T  30692 attgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctgcctgtctgtatggattg 30596  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30595 gtagacgttatgcaggattagttgct-tggtgagtt 30561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44444 - 44362
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  44444 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccctcagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 44362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Original strand, 4009 - 4076
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4009 tgatgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacctctctgtatggttgggtagacgttgtgca 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 13216 - 13291
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13216 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccatagtggttttgaccgcctacctgtctgtatgaatgggta 13291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 224
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1913
Alignment:
Q  125 gattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1815 gattatgattgatgtaaagtttacccc-agaggttttgaccgcctacctatctgtatggataggtagacgaagtgcaggattagttgctttggtgagttg 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Original strand, 92 - 181
Alignment:
Q  110 ttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  92 ttaactgttaat-tggattatg-ttgatgtaatacttacccccagtggtcttaaccccctacctgtctatatggatgggtagatgttgtgca 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Original strand, 6556 - 6645
Alignment:
Q  110 ttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  6556 ttaactgttaat-tggattatg-ttgatgtaatacttacccccagtggtcttaaccccctacctgtctatatggatgggtagatgttgtgca 6645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4271 - 4178
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4271 tacctgtctgtatgaatgggtagaagttgtgcaggattagttgctctgttgagttctttg-tgcttgg-tggatatcggaagctatctccggtatc 4178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10737 - 10644
Alignment:
Q  169 tacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10737 tacctgtctgtatgaatgggtagaagttgtgcaggattagttgctctgttgagttctttg-tgcttgg-tggatatcggaagctatctccggtatc 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17553 - 17465
Alignment:
Q  110 ttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17553 ttaactgttaat-tggattatg-ttgatgtagtacttaccct-agtggttttaaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 17465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 8495 - 8561
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt 161  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8495 gaattgaattattcatgtt-aattgtt-attttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggtttt 8561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 13884 - 13950
Alignment:
Q  92 gaattgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt 161  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13884 gaattgaattattcatgtt-aattgtt-attttgattatgat-gatgtaatacttacccccagtggtttt 13950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 236417 - 236350
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  236417 tgatgtaatacttatccctagtggttttgaccgcctacctgtatgtatggatgggtagacgctgtgca 236350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 270349 - 270199
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||      ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  270349 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcttgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatg 270251  T
Q  212 ctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    || |||||||||  ||  || |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  270250 ct-tggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgggagctttctccgatatcggt 270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Original strand, 256625 - 256720
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||  ||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  256625 tgtttatgttgattatgattgatgtgaagcttacccctagtgg-tttgaccgcctacctgtttggattaatgggtagacggcgtgcatgagtagttg 256720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3097 - 2929
Alignment:
Q  94 attgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgg 187  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| | |||| ||||||||||||    
T  3097 attgaattattcatgtt-aactgtt-atgtggattatgat-gatgtaatacttacccc-agtggatctgtgatggaccgcctgcctgcctgtatggatgg 3002  T
Q  188 gtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatc 264  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||  || |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3001 gtagacgttatgcaggattagttgct-tggtgagtt--tttgtgcttgg-tggatatcgagagctacctccggtatc 2929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3741 - 3652
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  3741 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgtctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggactagtagct-tggtgagtt 3652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4292 - 4210
Alignment:
Q  112 aactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  4292 aactgtttatgatgattatgattgatgtaaagctaacccccagtggttctgactgcctacctgtttgtatgaatgggtaaacg 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36398 - 36333
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36398 atgtaatacttacccctagtggttttaaccacctacctgtctgtatggatgggtagacattgtgca 36333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 39414 - 39511
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||    
T  39414 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgc 39510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27970 - 27872
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggtttt------gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27970 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtggatctatgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagaattagttg 27872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 77618 - 77509
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||      ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  77618 ttatttggattatgat-gatataatacttacccccagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagtcgttgtgcaggattagttg 77520  T
Q  212 ctctggtgagtt 223  Q
    || |||||||||    
T  77519 ct-tggtgagtt 77509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Original strand, 45410 - 45525
Alignment:
Q  95 ttgatttattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||| ||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| |||    
T  45410 ttgattcatttatgtcaaactatttatgttgattatgattgatgtgaagcttacctccggtggttttgaccgcctacctgtttgtatgaataggtagacg 45509  T
Q  195 ttgtgcatgattagtt 210  Q
      |||||||| |||||    
T  45510 gagtgcatgagtagtt 45525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Original strand, 2874 - 2972
Alignment:
Q  126 attatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttg 224  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |  ||||| | ||||||||| || |||||||    
T  2874 attatgattgatgtaaagcttacccctagtgattttgaccgcctacctgtatggatggatgggtagatgaagtgcagggttagttgctttgatgagttg 2972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52403 - 52314
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  52403 ttgatgtaatactcaccctcagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgggtagacgttgtgcaggagtagtagct-tggtgagtt 52314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44234 - 44145
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||| || |||||||| || ||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  44234 ttgatgtaatactcacccccagtggttttttctgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgcaggagtagtagct-tggtgagtt 44145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2510 - 2397
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  2510 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccgagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatgggtgggtagacg 2414  T
Q  195 ttgtgcatgattagttg 211  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2413 ttgtgcaggattagttg 2397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5374 - 5261
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacg 194  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  5374 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgat-gatgtaatacttaccccgagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatgggtgggtagacg 5278  T
Q  195 ttgtgcatgattagttg 211  Q
    ||||||| |||||||||    
T  5277 ttgtgcaggattagttg 5261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 299 - 239
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  299 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28107 - 28034
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| | |||||||| |||||||    
T  28107 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagatgttgtgcaggattagt 28034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14586 - 14513
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || || ||||| || ||| ||| ||||||||| ||||    
T  14586 atgtaatacttacccctagtggttttaaccgcctacttgcctatatgggtgagtagacgctgtgcatgagtagt 14513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 17098 - 17163
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  17098 atgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 94238 - 94178
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  94238 gaccgcctacctgtttgtatggatgggtagacgttgtgcaagattagttgct-tggtgagtt 94178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 274
Target Start/End: Original strand, 141148 - 141265
Alignment:
Q  157 gttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatct 256  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||  ||||||||| | | || ||| |||||||  | |||||||||    
T  141148 gttttgaccacctacctgtttgtatggatgggcagacgaagtgcaggattagttgcttaggtgagttgctcggtgattgcttggatagggggagctatct 141247  T
Q  257 ccggtatcggtttagtag 274  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  141248 ccgttatcggtttcgtag 141265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Original strand, 78250 - 78304
Alignment:
Q  168 atacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  78250 atacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgcagggttagttgct-tggtgagtt 78304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 75707 - 75755
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc 167  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75707 ttatttggattatgat-gatgtaatacttacccccagtgattttgaccgc 75755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 166982 - 167042
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  166982 gaccgcatgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagtagct-tggtgagtt 167042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1228
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagtt 210  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||    
T  1318 ttatttggattatg-ttgatgtaatactta-ccctagtggttttaaccgcctacttgtctgtgtggattggtagacgttgtgcaggagtagtt 1228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8039
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagt 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| | |||||||| |||||||    
T  7963 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagatgttgtgcaggattagt 8039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33430 - 33333
Alignment:
Q  101 tattcatgtttaactgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgc 200  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||    
T  33430 tattcatgtt-aactgtt-atttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgc 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 15806 - 15888
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15806 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 15888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20948 - 20866
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  20948 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 20866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25203 - 25121
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  25203 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25558 - 25476
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  25558 ttatttggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatggatgagtagacgctgtgca 25476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37589 - 37507
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  37589 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 37507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 106282 - 106215
Alignment:
Q  134 tgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  106282 tgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 106215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16244 - 16155
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| | |||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  16244 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagatgttgtgcaggaatagtagct-tggtgagtt 16155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31058 - 30970
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttg------accgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||      ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31058 ttatttggattatgat-gatgtaatacttaccccaagtggatctgtgatggaccgcctacctgtctgtatggatgggtagacgttgtgca 30970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 75509 - 75420
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  75509 ttgatgtaatactcaccccgagtggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgcatgactagtagct-tggtgagtt 75420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5373 - 5313
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5373 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 10151 - 10211
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10151 gaccgcctacctatttgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgct-tggtgagtt 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3515
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  3450 atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 3515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 24604 - 24664
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  24604 gaccgcctacatgtctgtatggatgggtagacgttgttcaggattagttgct-tggtgagtt 24664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 267
Target Start/End: Original strand, 21386 - 21474
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagttgattgatgtttggttggatatcgagagctatctccggtatcggt 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||   | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21386 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagttgat-tggtgagtt--cttatgcttgg-tggatatcgggagctacctccggtatcggt 21474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Original strand, 11920 - 11988
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  11920 ttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 11988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4120 - 4056
Alignment:
Q  137 tgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||||| || ||| ||||||||||    
T  4120 tgtaatacttacccccagtggttttaaccgcctactttcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 4056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42087 - 42019
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  42087 ttgatgtaatactcacccccagtggttttaaccgcctacttgcatgtatgggtgagtagacgttgtgca 42019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10614 - 10572
Alignment:
Q  115 tgtttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtgg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10614 tgtttatgttgattatgattgatgtgaaacttacccccagtgg 10572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 201
Target Start/End: Original strand, 25123 - 25205
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||||| || ||| ||||||||||    
T  25123 ttatctggattatgata-atgtaatgcttacccccagtggttttaaccgcctactagcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 25205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12572 - 12495
Alignment:
Q  123 tggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| || || ||| || |||||||| || ||| ||||||||||    
T  12572 tggattatgata-atgtaatacttacccctagtggttttaacagcctacttgcctgtatgggtgagtagacgttgtgca 12495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 223
Target Start/End: Original strand, 67547 - 67636
Alignment:
Q  133 ttgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||| || |||  ||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  67547 ttgatgtaatactcacccctagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtaggcgttgtgcaggactagtagct-tggtgagtt 67636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0725 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0725
Description:

Target: scaffold0725; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7365 - 7328
Alignment:
Q  153 agtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggta 190  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7365 agtggttttgaccgcctacatgtctgtatggatgggta 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 9800 - 9865
Alignment:
Q  136 atgtaatacttacccccagtggttttgaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgca 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||| ||| ||||||    
T  9800 atgtagtacttacccccagtggttttaaccgcctacttgcctgtatgggtgagtagacgctgtgca 9865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28553 - 28493
Alignment:
Q  162 gaccgcatacctgtctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  28553 gaccgcctgcctatctgtatggatgggtagacgttgtgcaggattagatgct-tggtgagtt 28493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Original strand, 72146 - 72194
Alignment:
Q  118 ttatgtggattatgattgatgtaatacttacccccagtggttttgaccgc 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  72146 ttatgtggattatgat-gatgtaatacttactcacagcggttttgaccgc 72194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 4873 - 4920
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  4873 tctgtatggatgggtagacgttgtggaggattagttgct-tggtgagtt 4920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 7310 - 7357
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  7310 tctgtatggatgggtagacgttgtgcaggtttagttgct-tggtgagtt 7357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 49713 - 49760
Alignment:
Q  175 tctgtatggatgggtaaacgttgtgcatgattagttgctctggtgagtt 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  49713 tctgtatggatgggtagacgttgtggaggattagttgct-tggtgagtt 49760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University