View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10151A_low_43 (Length: 381)

Name: NF10151A_low_43
Description: NF10151A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10151A_low_43
NF10151A_low_43
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (6-232)||(44241352-44241579)
chr1 (10-232)||(29001730-29001953)
chr1 (6-232)||(31072313-31072540)
chr1 (11-232)||(9869105-9869327)
chr1 (10-234)||(4599527-4599753)
chr1 (10-232)||(1174604-1174828)
chr1 (10-232)||(6238654-6238877)
chr1 (10-232)||(39053338-39053561)
chr1 (10-232)||(39059710-39059933)
chr1 (10-232)||(42091895-42092118)
chr1 (10-232)||(45015780-45016003)
chr1 (10-232)||(26621468-26621692)
chr1 (10-232)||(41305514-41305738)
chr1 (10-232)||(44916329-44916560)
chr1 (10-232)||(41297515-41297739)
chr1 (15-232)||(11913262-11913479)
chr1 (10-201)||(27240161-27240354)
chr1 (10-232)||(43686626-43686851)
chr1 (10-232)||(32797735-32797945)
chr1 (6-232)||(1115982-1116211)
chr1 (10-232)||(41299188-41299412)
chr1 (10-143)||(23764521-23764655)
chr1 (10-168)||(5445028-5445186)
chr1 (10-227)||(28413678-28413897)
chr1 (153-232)||(23762336-23762415)
chr1 (6-227)||(39806052-39806274)
chr1 (10-210)||(38672788-38672991)
chr1 (10-227)||(2824824-2825042)
chr1 (97-223)||(47646755-47646883)
chr1 (10-226)||(23251342-23251568)
chr1 (120-227)||(5357752-5357861)
chr1 (120-227)||(45620149-45620258)
chr1 (184-228)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (6-232)||(2640-2867)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (6-232)||(37026043-37026270)
chr7 (10-232)||(26601911-26602134)
chr7 (10-232)||(15914637-15914860)
chr7 (10-232)||(39432907-39433129)
chr7 (10-232)||(15949158-15949381)
chr7 (10-232)||(3924093-3924316)
chr7 (10-232)||(36875544-36875767)
chr7 (10-232)||(5049912-5050135)
chr7 (10-232)||(14287714-14287937)
chr7 (11-232)||(14298900-14299122)
chr7 (10-232)||(6795437-6795660)
chr7 (10-232)||(23612388-23612611)
chr7 (10-232)||(9642916-9643141)
chr7 (6-229)||(45433580-45433805)
chr7 (10-232)||(1948633-1948857)
chr7 (10-232)||(6020864-6021088)
chr7 (10-232)||(8185392-8185616)
chr7 (10-232)||(8192952-8193176)
chr7 (10-232)||(48353480-48353704)
chr7 (10-232)||(2446645-2446868)
chr7 (28-232)||(21642535-21642740)
chr7 (10-232)||(19089806-19090030)
chr7 (10-232)||(48347096-48347320)
chr7 (6-232)||(33850643-33850870)
chr7 (10-232)||(5056307-5056531)
chr7 (10-232)||(1378946-1379169)
chr7 (10-232)||(8142446-8142669)
chr7 (230-375)||(42422112-42422257)
chr7 (10-227)||(10831130-10831349)
chr7 (10-227)||(11024922-11025141)
chr7 (158-232)||(13774130-13774204)
chr7 (10-227)||(21901193-21901413)
chr7 (8-61)||(1942042-1942095)
chr7 (166-227)||(27954243-27954303)
chr7 (184-227)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (10-232)||(13671817-13672040)
chr6 (13-232)||(27670096-27670316)
chr6 (10-232)||(31547894-31548117)
chr6 (10-232)||(32328493-32328716)
chr6 (10-232)||(1428423-1428646)
chr6 (10-232)||(34711557-34711780)
chr6 (10-232)||(9864760-9864984)
chr6 (10-232)||(4186684-4186907)
chr6 (10-232)||(11058150-11058373)
chr6 (13-232)||(21262574-21262795)
chr6 (10-232)||(4020235-4020459)
chr6 (10-232)||(4026661-4026885)
chr6 (10-232)||(34655249-34655473)
chr6 (10-232)||(34648798-34649022)
chr6 (10-232)||(4738323-4738547)
chr6 (20-232)||(7069702-7069916)
chr6 (6-165)||(29906885-29907045)
chr6 (6-165)||(30117335-30117495)
chr6 (10-137)||(7062578-7062707)
chr6 (89-232)||(1167480-1167630)
chr6 (34-227)||(10081567-10081762)
chr6 (170-232)||(7062516-7062578)
chr6 (91-227)||(9846601-9846738)
chr6 (195-232)||(29907044-29907081)
chr6 (195-232)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (6-232)||(4973558-4973785)
chr5 (10-232)||(22359963-22360186)
chr5 (10-232)||(22313829-22314052)
chr5 (11-232)||(5876218-5876440)
chr5 (10-232)||(34357288-34357511)
chr5 (10-232)||(34359079-34359302)
chr5 (10-232)||(2957857-2958081)
chr5 (10-232)||(2966326-2966550)
chr5 (10-232)||(29980458-29980681)
chr5 (10-232)||(30041244-30041467)
chr5 (10-232)||(40958617-40958840)
chr5 (10-232)||(25894649-25894873)
chr5 (6-232)||(2438796-2439022)
chr5 (10-230)||(42150817-42151039)
chr5 (10-232)||(12505765-12505996)
chr5 (10-232)||(29414669-29414892)
chr5 (10-227)||(33794091-33794309)
chr5 (10-227)||(9843348-9843566)
chr5 (10-227)||(2156125-2156341)
chr5 (121-223)||(19853484-19853588)
chr5 (120-227)||(12918955-12919064)
chr5 (120-227)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (10-232)||(21341882-21342105)
chr2 (13-232)||(2021448-2021668)
chr2 (10-232)||(21331994-21332217)
chr2 (10-232)||(42931372-42931595)
chr2 (10-232)||(16856487-16856709)
chr2 (10-232)||(12950795-12951018)
chr2 (10-232)||(16817330-16817552)
chr2 (10-232)||(36782184-36782408)
chr2 (10-232)||(34834812-34835035)
chr2 (10-232)||(34841256-34841479)
chr2 (10-232)||(29484925-29485149)
chr2 (10-232)||(45011981-45012205)
chr2 (8-232)||(2164025-2164250)
chr2 (10-232)||(15852548-15852772)
chr2 (10-232)||(43267857-43268081)
chr2 (10-232)||(2157611-2157834)
chr2 (10-232)||(13901957-13902180)
chr2 (10-232)||(21067958-21068181)
chr2 (83-232)||(45700644-45700793)
chr2 (6-227)||(41455601-41455823)
chr2 (68-232)||(11909950-11910116)
chr2 (68-227)||(17784443-17784604)
chr2 (85-223)||(13162892-13163032)
chr2 (68-227)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (6-232)||(16405337-16405568)
chr4 (10-232)||(55462772-55462995)
chr4 (10-232)||(16838359-16838581)
chr4 (10-232)||(27590304-27590527)
chr4 (8-232)||(41372983-41373209)
chr4 (10-231)||(37368315-37368538)
chr4 (10-232)||(13594105-13594330)
chr4 (10-232)||(7780406-7780629)
chr4 (10-232)||(8103880-8104104)
chr4 (10-232)||(30238259-30238482)
chr4 (10-232)||(17456853-17457077)
chr4 (6-232)||(30211536-30211755)
chr4 (15-232)||(36754791-36755017)
chr4 (85-232)||(5660549-5660696)
chr4 (6-209)||(13003809-13004014)
chr4 (10-227)||(2947844-2948062)
chr4 (10-106)||(48914898-48914996)
chr4 (10-42)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (10-232)||(12768743-12768966)
chr8 (10-232)||(11358193-11358417)
chr8 (10-232)||(7311348-7311571)
chr8 (10-232)||(8013320-8013543)
chr8 (10-232)||(36005482-36005705)
chr8 (8-232)||(36075964-36076189)
chr8 (10-232)||(36425730-36425954)
chr8 (10-232)||(6464576-6464799)
chr8 (16-232)||(15012393-15012610)
chr8 (10-232)||(36021799-36022023)
chr8 (10-232)||(41242116-41242339)
chr8 (10-232)||(1238212-1238436)
chr8 (10-232)||(16710668-16710892)
chr8 (89-232)||(26250591-26250734)
chr8 (9-232)||(31017397-31017608)
chr8 (40-232)||(45068416-45068609)
chr8 (10-227)||(7933931-7934150)
chr8 (10-63)||(14393733-14393786)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (6-232)||(49686-49912)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (10-232)||(4311486-4311709)
chr3 (6-232)||(10941304-10941531)
chr3 (10-232)||(32746369-32746592)
chr3 (10-232)||(6036265-6036488)
chr3 (10-232)||(24179072-24179296)
chr3 (8-232)||(9570548-9570775)
chr3 (10-232)||(27501967-27502191)
chr3 (8-232)||(9577050-9577277)
chr3 (10-232)||(13014985-13015208)
chr3 (10-232)||(43995068-43995300)
chr3 (10-232)||(25893229-25893458)
chr3 (10-232)||(43931581-43931799)
chr3 (8-232)||(23068461-23068686)
chr3 (10-136)||(41353860-41353987)
chr3 (85-222)||(20651135-20651272)
chr3 (10-160)||(41354142-41354293)
chr3 (8-227)||(4590791-4591012)
chr3 (9-76)||(3577095-3577162)
chr3 (6-227)||(20952759-20952990)
chr3 (120-227)||(4644354-4644463)
chr3 (170-227)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (6-232)||(15166-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (10-232)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (10-232)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (10-232)||(8881-9105)
scaffold0510 (10-232)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (91-232)||(12014-12155)
scaffold0513 (10-74)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (10-116)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (6-209)||(24268-24473)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 44241352 - 44241579
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44241352 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggc 44241451  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241452 gtgaaacttgttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 44241551  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44241552 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 29001730 - 29001953
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29001730 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaa 29001829  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29001830 aacttgttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29001929  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||    
T  29001930 aacactattcatgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 31072313 - 31072540
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31072313 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggc 31072412  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31072413 atgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccct 31072512  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31072513 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 9869105 - 9869327
Alignment:
Q  11 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9869105 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggtgtgaa 9869204  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9869205 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 9869304  T
Q  210 acaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  9869305 acatctttcgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 4599527 - 4599753
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  4599527 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 4599626  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4599627 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4599726  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaatact 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599727 caacaccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 1174604 - 1174828
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1174604 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 1174703  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1174704 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1174803  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1174804 caacaccattcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 6238654 - 6238877
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6238654 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6238753  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238754 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6238853  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238854 aacaccattcgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39053561 - 39053338
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39053561 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39053462  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39053461 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39053362  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39053361 aacactattcgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39059933 - 39059710
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39059933 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39059834  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39059833 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39059734  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39059733 aacactattcgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 42091895 - 42092118
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  42091895 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 42091994  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42091995 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42092094  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42092095 aacaccattcgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 45015780 - 45016003
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  45015780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 45015879  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45015880 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 45015979  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015980 aacaccattcgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 26621468 - 26621692
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  26621468 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 26621567  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26621568 aaacttgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 26621667  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621668 caacaccattcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41305738 - 41305514
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41305738 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41305639  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41305638 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 41305539  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  41305538 caacaccattcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 44916329 - 44916560
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  44916329 gaccattcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaata 44916428  T
Q  101 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916429 aggcgtgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtat 44916528  T
Q  201 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44916529 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 41297515 - 41297739
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  41297515 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41297614  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41297615 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 41297714  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41297715 caacaccattcgtgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913262
Alignment:
Q  15 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  112 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  212 accattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27240354 - 27240161
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  27240354 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtg 27240255  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240254 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 43686626 - 43686851
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  43686626 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 43686725  T
Q  107 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43686726 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcg 43686825  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43686826 acaacaccattcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 32797735 - 32797945
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||    
T  32797735 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaa 32797821  T
Q  110 a-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32797822 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32797921  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32797922 aacacaattcgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1116211 - 1115982
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggc 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||     
T  1116211 cacataccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggt 1116113  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1116112 gtgaaacttcttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccct 1116013  T
Q  205 caacaac---accattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  1116012 cgacaacactaccatttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41299412 - 41299188
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41299412 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41299313  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41299312 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 41299213  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  41299212 caacaccattcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23764655 - 23764521
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23764655 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 23764556  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtc 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23764555 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5445186 - 5445028
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5445186 gaccgttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtga 5445088  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445087 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28413897 - 28413678
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  28413897 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 28413799  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||    
T  28413798 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctca 28413699  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  28413698 acaagattattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762336
Alignment:
Q  153 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Original strand, 39806052 - 39806274
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| |||||||||    
T  39806052 cacaaaccgtttgacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggc 39806150  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 202  Q
    || |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    ||||||||||||||||     
T  39806151 gt-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcg 39806249  T
Q  203 ctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||||||| |  |||||||||||||    
T  39806250 ctcaacaagattattcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38672991 - 38672788
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  38672991 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 38672893  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 205  Q
    |||    || | |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  38672892 aaaaacattggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 38672793  T
Q  206 aacaa 210  Q
    |||||    
T  38672792 aacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2825042 - 2824824
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  2825042 gaccattcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aa 2824944  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| ||  |||| ||| |||||||| |||     ||||||||||||||| |||||    
T  2824943 aaacgttggaattagagttccttgattatgcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttacccatattatcacgtatcgctcaa 2824844  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||| |  |||| ||||||||    
T  2824843 caagattattcatgtccaaa 2824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646883
Alignment:
Q  97 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 194  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  195 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaacatcattcatgtc 47646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Original strand, 23251342 - 23251568
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||     |||  ||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  23251342 gaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaaagagtagttgtttgtttgtttgtaactaagttaactaattcgcaagaataaaagttgagagtaata 23251441  T
Q  101 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttctttgatattatcacgt 198  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  23251442 aggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgt 23251540  T
Q  199 atccctcaacaacaccattcgtgtccaa 226  Q
    ||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23251541 atcgctcaacaagattattcgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  120 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  218 cgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45620149
Alignment:
Q  120 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 217  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  |||    
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  218 cgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||    
T  45620158 cgtgtccaaa 45620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Original strand, 9316137 - 9316181
Alignment:
Q  184 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 228  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9316137 ttgatattatcacatattgctcaacaacatcattcgtgtccaaac 9316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 2640 - 2867
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2640 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggc 2739  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2740 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccct 2839  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  2840 cgacaacaccattcgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 37026043 - 37026270
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  37026043 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggc 37026142  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37026143 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccct 37026242  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37026243 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 26601911 - 26602134
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26601911 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 26602010  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602011 aacttgttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 26602110  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  26602111 aacactattcgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 15914637 - 15914860
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15914637 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15914736  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15914737 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15914836  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15914837 aacactattcgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 39432907 - 39433129
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39432907 gaccgttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaa 39433006  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39433007 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 39433106  T
Q  210 acaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  39433107 acgccattcgtgtccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 15949158 - 15949381
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15949158 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15949257  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15949258 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15949357  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15949358 aacactattcgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3924316 - 3924093
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  3924316 gaccgttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 3924217  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3924216 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3924117  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3924116 aacaccattcgtgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 36875544 - 36875767
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36875544 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36875643  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36875644 aacttgttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36875743  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875744 aacaccattcgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5050135 - 5049912
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5050135 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5050036  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5050035 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5049936  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5049935 aacaccattcgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 14287714 - 14287937
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14287714 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 14287813  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14287814 atcttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 14287913  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287914 aacaccattcgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 14298900 - 14299122
Alignment:
Q  11 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14298900 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaa 14298999  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299000 acttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 14299099  T
Q  210 acaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14299100 acaccattcgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 6795437 - 6795660
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6795437 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6795536  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795537 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6795636  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795637 aacaccattcgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 23612388 - 23612611
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  23612388 gaccgttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 23612487  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23612488 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 23612587  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  23612588 aacactattcgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9643141 - 9642916
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  9643141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 9643042  T
Q  107 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9643041 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 9642942  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9642941 acaacaccattcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Original strand, 45433580 - 45433805
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| |||||||||    
T  45433580 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggc 45433679  T
Q  105 gtgaaa-cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccc 203  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45433680 gtaaaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccc 45433779  T
Q  204 tcaacaacaccattcgtgtccaaaca 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  45433780 tcgacaacaccattcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1948857 - 1948633
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948857 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtg 1948758  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1948757 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcga 1948658  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1948657 caacactattcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6021088 - 6020864
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6021088 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 6020989  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6020988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 6020889  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  6020888 caacactattcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8185616 - 8185392
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8185616 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8185517  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8185516 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8185417  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8185416 caacactattcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8193176 - 8192952
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8193176 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8193077  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8192977  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8192976 caacactattcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48353704 - 48353480
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  48353704 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 48353605  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353604 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48353505  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48353504 caacactattcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 2446645 - 2446868
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2446645 gaccattcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 2446744  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446745 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2446844  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2446845 aacaccattcgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  28 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  127 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 226  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  227 acaata 232  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 19089806 - 19090030
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  19089806 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 19089905  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089906 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 19090005  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  19090006 caacactattcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 48347320 - 48347096
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  48347320 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatg 48347221  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48347220 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48347121  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48347120 caacactattcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33850870 - 33850643
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggc 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||    
T  33850870 cacataccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggc 33850771  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33850770 gttaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccct 33850671  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33850670 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5056531 - 5056307
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  5056531 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 5056432  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5056431 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 5056332  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5056331 caacaccattcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 1378946 - 1379169
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  1378946 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 1379045  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1379046 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 1379145  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1379146 aacaccattcgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8142669 - 8142446
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  8142669 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 8142570  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8142569 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 8142470  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142469 aacaccattcgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422257
Alignment:
Q  230 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  330 ccgatgttggactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctc 375  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctc 42422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10831349 - 10831130
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  10831349 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 10831251  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  10831250 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 10831151  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  10831150 acaagattattcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11025141 - 11024922
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  11025141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 11025043  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  11025042 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 11024943  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||| |  |||| ||||||||    
T  11024942 acaagattattcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  158 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21901413 - 21901193
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  21901413 gaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt- 21901315  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 205  Q
    |||   ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  21901314 aaaaacgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 21901215  T
Q  206 aacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  21901214 aacaagattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 1942042 - 1942095
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942042 cagaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 227
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  166 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  184 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13672040 - 13671817
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13672040 gaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtga 13671941  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13671940 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13671841  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13671840 aacactattagtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Original strand, 27670096 - 27670316
Alignment:
Q  13 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27670096 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaac 27670195  T
Q  112 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670196 ttgttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 27670295  T
Q  212 accattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  27670296 atcattcgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 31547894 - 31548117
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31547894 gaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 31547993  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31547994 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 31548093  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  31548094 aacactattcgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32328716 - 32328493
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32328716 gaccgttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32328617  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328616 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32328517  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32328516 aacaccattcgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1428646 - 1428423
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1428646 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 1428547  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1428546 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 1428447  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428446 aacaccattcgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34711780 - 34711557
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34711780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34711681  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34711680 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34711581  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711580 aacaccattcgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9864984 - 9864760
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9864984 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 9864885  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864884 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 9864785  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  9864784 caatactattcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 4186684 - 4186907
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||      
T  4186684 gaccgttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtag 4186783  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4186784 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgac 4186883  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4186884 aacaccattcgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11058373 - 11058150
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  11058373 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 11058274  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11058273 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 11058174  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058173 aacaccattcgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21262795 - 21262574
Alignment:
Q  13 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21262795 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa 21262696  T
Q  111 cttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262695 cttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaa 21262596  T
Q  211 caccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262595 caccattcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4020459 - 4020235
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4020459 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4020360  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4020359 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4020260  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4020259 caacactattcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4026885 - 4026661
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4026885 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4026786  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026785 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4026686  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4026685 caacactattcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 34655249 - 34655473
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34655249 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34655348  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34655349 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34655448  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34655449 caacactattcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 34648798 - 34649022
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34648798 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34648897  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34648898 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34648997  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34648998 caacactattcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4738547 - 4738323
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4738547 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4738448  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4738447 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 4738348  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4738347 caacactattcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  20 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 117  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  118 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  218 cgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Original strand, 29906885 - 29907045
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29906885 cacagaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggc 29906984  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906985 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30117495 - 30117335
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30117495 cacagaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggc 30117396  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117395 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7062707 - 7062578
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7062707 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 7062608  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatca 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062607 aaacttgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167480
Alignment:
Q  89 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------t 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       |    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttat 1167531  T
Q  182 ctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  1167530 tttttatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaataata 1167480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  34 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagtt-gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  133 gatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  170 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Original strand, 9846601 - 9846738
Alignment:
Q  91 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgat 188  Q
    |||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || || |||| | ||  |||||||||| |||  | |||    
T  9846601 gagattaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatacggattctagcattttatcgat 9846699  T
Q  189 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9846700 attatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaa 9846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907081
Alignment:
Q  195 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 29907081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117299
Alignment:
Q  195 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30117299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 4973558 - 4973785
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  4973558 cacaaaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggg 4973657  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4973658 gtgaaacttgttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccct 4973757  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||    
T  4973758 cgacaacatcattcgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 22359963 - 22360186
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22359963 gaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22360062  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22360063 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22360162  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22360163 aacactattcgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 22313829 - 22314052
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22313829 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22313928  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22313929 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22314028  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22314029 aacactattcgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 5876218 - 5876440
Alignment:
Q  11 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5876218 accgttcaacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaa 5876317  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5876318 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgaca 5876417  T
Q  210 acaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  5876418 acactattcgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34357511 - 34357288
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34357511 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34357412  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357411 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34357312  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357311 aacaccattcgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34359302 - 34359079
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34359302 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34359203  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359202 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34359103  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359102 aacaccattcgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 2957857 - 2958081
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2957857 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2957956  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2957957 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2958056  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2958057 caacactattcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 2966326 - 2966550
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2966326 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2966425  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2966426 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2966525  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2966526 caacactattcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 29980458 - 29980681
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  29980458 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 29980557  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29980558 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29980657  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980658 aacaccattcgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30041467 - 30041244
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  30041467 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 30041368  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30041367 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 30041268  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041267 aacaccattcgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40958840 - 40958617
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  40958840 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 40958741  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40958740 cacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgac 40958641  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40958640 aacactattcgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25894873 - 25894649
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25894873 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25894774  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894773 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 25894674  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  25894673 caacactattcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 2438796 - 2439022
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  2438796 cacagaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggc 2438895  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2438896 gtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccct 2438994  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  2438995 cgacaacatcatttgtgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 42150817 - 42151039
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  42150817 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 42150916  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42150917 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 42151016  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaa 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  42151017 caacactattcgtgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12505996 - 12505765
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaata 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12505996 gacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaata 12505897  T
Q  101 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505896 aggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtat 12505797  T
Q  201 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12505796 ccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29414892 - 29414669
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |    
T  29414892 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaa 29414793  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29414792 aacttattaggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29414693  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||    
T  29414692 aacatcattcatgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 33794091 - 33794309
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  33794091 gaccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 33794188  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    ||  |||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  33794189 aaaatgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctca 33794288  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||| |  |||||| ||||||    
T  33794289 acaagattattcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 9843348 - 9843566
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9843348 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 9843446  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  9843447 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 9843546  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  9843547 caagattattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2156341 - 2156125
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  2156341 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaa 2156245  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  2156244 aaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctca 2156146  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  2156145 acaagattattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853484
Alignment:
Q  121 ttagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  219 gtgtc 223  Q
     ||||    
T  19853488 atgtc 19853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12919064 - 12918955
Alignment:
Q  120 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 217  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||| | ||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12919064 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacctaataaccacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactatt 12918965  T
Q  218 cgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||    
T  12918964 cgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  120 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  218 cgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21342105 - 21341882
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21342105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21342006  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342005 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21341906  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21341905 aacaccattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2021668 - 2021448
Alignment:
Q  13 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  2021668 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaac 2021569  T
Q  112 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2021568 ttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 2021469  T
Q  212 accattcgtgtccaaacaata 232  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2021468 actattcgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21332217 - 21331994
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21332217 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21332118  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21332117 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21332018  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21332017 aacaccattcatgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42931595 - 42931372
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42931595 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 42931496  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42931495 aacttgttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42931396  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  42931395 aacactattcgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16856709 - 16856487
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16856709 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16856611  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16856610 nacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16856511  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16856510 aacaccattcgtgtccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 12950795 - 12951018
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12950795 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 12950894  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12950895 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 12950994  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950995 aacaccattcgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16817552 - 16817330
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16817552 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16817454  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16817453 cacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16817354  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16817353 aacaccattcgtgtccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36782408 - 36782184
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36782408 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36782309  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36782308 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36782209  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36782208 caacaccattcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34835035 - 34834812
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34835035 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34834936  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834935 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34834836  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34834835 aacaccattcgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34841479 - 34841256
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34841479 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34841380  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841379 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34841280  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841279 aacaccattcgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 29484925 - 29485149
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  29484925 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 29485024  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29485025 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 29485124  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  29485125 caacactattcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 45011981 - 45012205
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  45011981 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 45012080  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45012081 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 45012180  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  45012181 caacactattcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 2164025 - 2164250
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  2164025 cagaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgt 2164124  T
Q  107 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2164125 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 2164224  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2164225 acaacaccattcgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 15852548 - 15852772
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15852548 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 15852647  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852648 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 15852747  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  15852748 caacactattcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 43267857 - 43268081
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  43267857 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 43267956  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43267957 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 43268056  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43268057 caacaccattcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 2157611 - 2157834
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  2157611 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 2157710  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157711 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2157810  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157811 aacaccattcgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13902180 - 13901957
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  13902180 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 13902081  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13902080 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 13901981  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13901980 aacaccattcgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21068181 - 21067958
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || |||    
T  21068181 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtg 21068082  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068081 aaactt-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 21067983  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21067982 caacaccattcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  83 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  183 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Original strand, 41455601 - 41455823
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||    
T  41455601 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcg 41455700  T
Q  106 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccc 203  Q
    | |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| |    
T  41455701 t-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcac 41455799  T
Q  204 tcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||||| |  |||||||||||||    
T  41455800 tcaacaagattattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909950
Alignment:
Q  68 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatac 165  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  166 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  || |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaataata 11909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  68 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 164  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  ||    
T  17784604 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacata 17784506  T
Q  165 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
     ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17784505 tatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163032
Alignment:
Q  85 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 182  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  183 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 223  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtc 13163032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17789096
Alignment:
Q  68 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 164  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  ||    
T  17789257 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacata 17789159  T
Q  165 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
     |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17789158 tatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 16405337 - 16405568
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16405337 cacagaccgttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggc 16405436  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacgtat 200  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||    
T  16405437 gtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtat 16405536  T
Q  201 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405537 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 55462995 - 55462772
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55462995 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 55462896  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55462895 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 55462796  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  55462795 aacactattcgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16838581 - 16838359
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  16838581 gaccgttagacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 16838483  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16838482 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgac 16838383  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16838382 aacaccattcgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 27590304 - 27590527
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27590304 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 27590403  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27590404 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 27590503  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  27590504 aacactattcgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 41372983 - 41373209
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcg 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  41372983 cagaccgttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcg 41373082  T
Q  106 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41373083 taaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 41373182  T
Q  206 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
     |||||| |||||||||||||||||||    
T  41373183 gacaacatcattcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37368538 - 37368315
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37368538 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 37368439  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37368438 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 37368339  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaat 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  37368338 caacactattcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 13594105 - 13594330
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  13594105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 13594204  T
Q  107 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594205 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 13594304  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594305 acaacaccattcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 7780406 - 7780629
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  7780406 gaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgta 7780504  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7780505 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 7780604  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  7780605 caacatcattcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 8103880 - 8104104
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8103880 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8103979  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103980 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8104079  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8104080 caacactattcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 30238259 - 30238482
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  30238259 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 30238358  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  30238359 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgac 30238458  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  30238459 aacactattcgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 17456853 - 17457077
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||    
T  17456853 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtg 17456952  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17456953 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 17457052  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  17457053 caacactattcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30211755 - 30211536
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30211755 cacagaccgttcgacaccaaatat--------gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggc 30211664  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30211663 atgaaacttgttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccct 30211564  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30211563 cgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754791
Alignment:
Q  15 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  106 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 205  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  206 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  85 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  185 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13004014 - 13003809
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||    
T  13004014 cacagactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggc 13003915  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 202  Q
    || |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||     
T  13003914 gt-aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatca 13003816  T
Q  203 ctcaaca 209  Q
    |||||||    
T  13003815 ctcaaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 2947844 - 2948062
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2947844 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 2947942  T
Q  110 acttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  2947943 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 2948042  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  2948043 caagattattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 48914898 - 48914996
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914898 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 5660775 - 5660743
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaa 42  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5660775 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaa 5660743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 12768743 - 12768966
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768743 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtga 12768842  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12768843 aacttgttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgac 12768942  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  12768943 aagaccattcgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11358417 - 11358193
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  11358417 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 11358318  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11358317 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 11358218  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11358217 caacactattcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 7311348 - 7311571
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  7311348 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 7311447  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311448 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 7311547  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311548 aacaccattcgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8013543 - 8013320
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8013543 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 8013444  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013443 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 8013344  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013343 aacaccattcgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36005705 - 36005482
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36005705 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36005606  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36005605 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36005506  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005505 aacaccattcgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 36075964 - 36076189
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  36075964 cagaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 36076063  T
Q  107 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36076064 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 36076163  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36076164 acaacaccattcgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36425954 - 36425730
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  36425954 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 36425855  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36425854 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36425755  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36425754 caacactattcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6464799 - 6464576
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6464799 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6464700  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6464699 aactcgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6464600  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464599 aacaccattcgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012610
Alignment:
Q  16 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  115 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  215 attcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36022023 - 36021799
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36022023 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36021924  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36021923 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36021824  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36021823 caacaccattcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41242339 - 41242116
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  41242339 gaccgtttgacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 41242240  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41242239 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 41242140  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41242139 aacaccattcgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 1238212 - 1238436
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  ||||     
T  1238212 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgta 1238311  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238312 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1238411  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1238412 caacactattcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16710892 - 16710668
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| |     
T  16710892 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcata 16710793  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710792 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 16710693  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16710692 caacaccattcgtgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250591
Alignment:
Q  89 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  189 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Original strand, 31017397 - 31017608
Alignment:
Q  9 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || |||||||||||||    
T  31017397 agaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataaggcgtga 31017482  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31017483 aactagttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccctcg 31017582  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31017583 acaacaccattcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  40 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  139 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7934150 - 7933931
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  7934150 gaccgttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaa 7934051  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    ||    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  7934050 aaaca-ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 7933952  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  7933951 acaagattattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Original strand, 14393733 - 14393786
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393733 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 49686 - 49912
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  49686 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggc 49784  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49785 gtaaaacttgttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 49884  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49885 cgacaacactattcgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4311709 - 4311486
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4311709 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 4311610  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4311609 aacttgttaggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 4311510  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  4311509 aacactattcgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10941531 - 10941304
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10941531 cacagaccgtttgacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggc 10941432  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10941431 gtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccct 10941332  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10941331 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 32746369 - 32746592
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32746369 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32746468  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32746469 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32746568  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32746569 aacactattcgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 6036265 - 6036488
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6036265 gaccgtttgacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 6036364  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6036365 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6036464  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  6036465 aacactattcgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 24179072 - 24179296
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24179072 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 24179171  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24179172 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 24179271  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  24179272 caacactattcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9570775 - 9570548
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  9570775 cagaccgttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggc 9570676  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570675 gtaaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 9570576  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9570575 caacaataccattcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27501967
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27502191 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 27502092  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502091 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 27501992  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27501991 caacactattcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9577277 - 9577050
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  9577277 cagaccgttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggc 9577178  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9577177 gtaaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 9577078  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9577077 caacaataccattcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 13014985 - 13015208
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |    
T  13014985 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaa 13015084  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015085 aacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13015184  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13015185 aacactattcgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 43995068 - 43995300
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaata 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  43995068 gaccattcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaata 43995167  T
Q  101 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgta 199  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43995168 aggcgtgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgta 43995267  T
Q  200 tccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43995268 tccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 25893229 - 25893458
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25893229 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25893328  T
Q  108 aaacttgttagtattagagtt-----ccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 202  Q
    ||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893329 aaacttgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 25893428  T
Q  203 ctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25893429 ctcaacaatactattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 43931581 - 43931799
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43931581 gaccgtccgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtga 43931680  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  43931681 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcg 43931773  T
Q  207 acaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  43931774 acaacaccattcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Original strand, 23068461 - 23068686
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| |||    
T  23068461 cagaccgttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggc 23068560  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068561 g-gaaacttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccct 23068658  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23068659 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 41353860 - 41353987
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41353860 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaa 41353959  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatc 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41353960 aacttgttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20651272 - 20651135
Alignment:
Q  85 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20651272 aaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctt 20651173  T
Q  185 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651172 tgatattatcacgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41354293 - 41354142
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41354293 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 41354195  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354194 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Original strand, 4590791 - 4591012
Alignment:
Q  8 cagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| |||||    
T  4590791 cagaccgttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgt 4590890  T
Q  107 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
     |||   ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||    
T  4590891 -aaaaacgttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgct 4590989  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  4590990 caacaagattattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3577162 - 3577095
Alignment:
Q  9 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 76  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577162 agaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20952990 - 20952759
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacga-taatttgttgtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgat-aaagttgagatt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||     |||  ||||||| ||||||  || |||||||||| |    
T  20952990 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagagtaattgtttgtttctttgcaactaagttaactaatttgcaagaataaaagttgagagt 20952891  T
Q  97 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatc 194  Q
    |||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    |||||||||    
T  20952890 aataaggcgt-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgctttaccgatattatc 20952792  T
Q  195 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||||| |||||||| |  |||| ||||||||    
T  20952791 acgtatcgctcaacaagattattcatgtccaaa 20952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4644463 - 4644354
Alignment:
Q  120 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 217  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  4644463 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactatt 4644364  T
Q  218 cgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||    
T  4644363 cgtgtccaaa 4644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 2785865 - 2785922
Alignment:
Q  170 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785865 attctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 15166 - 15393
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15166 cacagacctttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggc 15265  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15266 gtgaaacttgttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccct 15365  T
Q  205 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||    
T  15366 cgacaacaccgttcgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5005
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5228 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5129  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5029  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5028 aacaccattcgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3486 - 3264
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  3486 gaccattcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 3388  T
Q  109 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3387 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3288  T
Q  209 aacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  3287 aacatcattcgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9105 - 8881
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  9105 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 9006  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9005 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 8906  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8905 caacaccattcgtgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2560
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  2784 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 2685  T
Q  108 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2684 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2585  T
Q  208 caacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  2584 caacaccattcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 91 - 232
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12155
Alignment:
Q  91 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 190  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  191 tatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12014
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11949 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 99913 - 100020
Alignment:
Q  10 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  99913 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtga 100012  T
Q  109 aacttgtt 116  Q
    ||||||||    
T  100013 aacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24473 - 24268
Alignment:
Q  6 cacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||    
T  24473 cacagactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggc 24374  T
Q  105 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 202  Q
    || |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||     
T  24373 gt-aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatca 24275  T
Q  203 ctcaaca 209  Q
    |||||||    
T  24274 ctcaaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University