View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10153_low_22 (Length: 285)

Name: NF10153_low_22
Description: NF10153
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10153_low_22
NF10153_low_22
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (58-278)||(34766027-34766247)
chr6 (52-278)||(24692480-24692706)
chr6 (58-278)||(8562474-8562694)
chr6 (58-264)||(22222654-22222860)
chr6 (58-264)||(22248489-22248695)
chr6 (73-264)||(1597842-1598033)
chr6 (58-252)||(19363764-19363958)
chr6 (60-264)||(9034101-9034303)
chr6 (75-264)||(26019599-26019787)
chr6 (60-264)||(18170558-18170760)
chr6 (76-264)||(27786697-27786883)
chr6 (60-264)||(3286531-3286733)
chr6 (60-264)||(12455738-12455940)
chr6 (60-264)||(14792287-14792489)
chr6 (60-264)||(16898631-16898833)
chr6 (60-264)||(18160746-18160948)
chr6 (60-264)||(20912967-20913169)
chr6 (60-264)||(24921172-24921374)
chr6 (60-264)||(24930208-24930410)
chr6 (60-264)||(31358246-31358448)
chr6 (60-264)||(31367976-31368178)
chr6 (63-264)||(18705502-18705702)
chr6 (63-264)||(18711437-18711637)
chr6 (76-264)||(29541130-29541317)
chr6 (60-264)||(16909284-16909486)
chr6 (73-264)||(30657067-30657257)
chr6 (74-264)||(26169099-26169288)
chr6 (62-264)||(15504119-15504321)
chr6 (82-264)||(16322006-16322187)
chr6 (82-264)||(16334154-16334335)
chr6 (60-203)||(18335659-18335801)
chr6 (73-175)||(12989046-12989148)
chr6 (64-264)||(790202-790401)
chr6 (76-264)||(18202231-18202418)
chr6 (76-237)||(17826562-17826723)
chr6 (76-237)||(20968552-20968713)
chr6 (72-176)||(7753910-7754014)
chr6 (63-170)||(6314664-6314771)
chr6 (58-233)||(28093343-28093512)
chr6 (200-278)||(18333385-18333463)
chr6 (84-184)||(9760731-9760830)
chr6 (76-175)||(25537672-25537769)
chr6 (76-175)||(26045068-26045165)
chr6 (121-176)||(13154944-13155000)
chr6 (121-176)||(13159800-13159856)
chr6 (82-137)||(17556354-17556410)
chr6 (205-264)||(7754043-7754101)
chr6 (76-137)||(4892740-4892801)
chr6 (76-175)||(26140732-26140829)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (58-278)||(518862-519082)
chr4 (58-278)||(521368-521588)
chr4 (52-270)||(17420467-17420686)
chr4 (58-270)||(26459097-26459309)
chr4 (72-264)||(8841867-8842059)
chr4 (58-264)||(13792207-13792412)
chr4 (60-264)||(16250131-16250333)
chr4 (58-264)||(13401959-13402165)
chr4 (60-264)||(16397933-16398136)
chr4 (73-264)||(17827185-17827375)
chr4 (73-264)||(17836576-17836766)
chr4 (58-264)||(6405000-6405205)
chr4 (60-264)||(16059054-16059258)
chr4 (73-264)||(2830670-2830860)
chr4 (73-264)||(16630217-16630407)
chr4 (76-264)||(10422467-10422654)
chr4 (76-264)||(17162273-17162461)
chr4 (60-264)||(17984046-17984248)
chr4 (60-264)||(18104596-18104798)
chr4 (60-264)||(40922528-40922730)
chr4 (58-264)||(41526984-41527187)
chr4 (75-264)||(4837189-4837378)
chr4 (76-264)||(5292101-5292288)
chr4 (76-264)||(5301760-5301947)
chr4 (76-264)||(15670764-15670951)
chr4 (76-264)||(17144413-17144601)
chr4 (76-264)||(21846970-21847157)
chr4 (76-264)||(21856562-21856749)
chr4 (76-264)||(21902833-21903020)
chr4 (76-264)||(21912425-21912612)
chr4 (76-264)||(27679766-27679953)
chr4 (76-264)||(27689421-27689608)
chr4 (60-264)||(6692903-6693105)
chr4 (60-264)||(6703309-6703511)
chr4 (73-264)||(44889703-44889893)
chr4 (76-264)||(3486640-3486827)
chr4 (76-264)||(3495963-3496150)
chr4 (74-176)||(53945300-53945402)
chr4 (60-264)||(14599831-14600034)
chr4 (74-264)||(16210162-16210350)
chr4 (60-264)||(30652356-30652554)
chr4 (60-264)||(7845914-7846117)
chr4 (76-264)||(16253920-16254107)
chr4 (60-153)||(7843034-7843127)
chr4 (60-168)||(16081454-16081562)
chr4 (82-137)||(14932672-14932728)
chr4 (82-137)||(14941877-14941933)
chr4 (76-184)||(18585698-18585806)
chr4 (82-137)||(30626053-30626109)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (58-278)||(24872397-24872617)
chr3 (58-264)||(49386553-49386759)
chr3 (73-264)||(2488062-2488253)
chr3 (82-264)||(25433793-25433975)
chr3 (72-264)||(13118630-13118822)
chr3 (60-264)||(20492715-20492918)
chr3 (73-264)||(4781636-4781826)
chr3 (131-278)||(17734808-17734955)
chr3 (131-278)||(19036077-19036224)
chr3 (63-260)||(20293734-20293930)
chr3 (60-264)||(10507846-10508049)
chr3 (60-264)||(1684429-1684631)
chr3 (60-264)||(5654804-5655006)
chr3 (60-264)||(8973531-8973733)
chr3 (60-264)||(8984086-8984288)
chr3 (60-264)||(9537820-9538022)
chr3 (60-264)||(9548146-9548348)
chr3 (60-264)||(16334594-16334796)
chr3 (73-264)||(19827420-19827610)
chr3 (76-264)||(4372224-4372411)
chr3 (76-264)||(4381965-4382152)
chr3 (149-270)||(24794115-24794236)
chr3 (72-264)||(14801614-14801808)
chr3 (58-264)||(11459823-11460027)
chr3 (60-264)||(4023305-4023507)
chr3 (60-264)||(6422992-6423194)
chr3 (60-264)||(6433419-6433621)
chr3 (60-227)||(10507032-10507199)
chr3 (73-264)||(20743898-20744088)
chr3 (74-264)||(12386917-12387107)
chr3 (52-200)||(38817129-38817279)
chr3 (76-260)||(11181-11364)
chr3 (76-268)||(23503058-23503246)
chr3 (76-237)||(10002619-10002780)
chr3 (75-237)||(51977677-51977839)
chr3 (63-163)||(24773549-24773649)
chr3 (60-168)||(682987-683095)
chr3 (58-142)||(24814638-24814722)
chr3 (73-184)||(11043899-11044010)
chr3 (69-184)||(13430705-13430820)
chr3 (99-175)||(20649573-20649648)
chr3 (82-137)||(12899514-12899570)
chr3 (90-149)||(29708514-29708571)
chr3 (82-137)||(30684412-30684468)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (58-278)||(1973857-1974077)
chr1 (58-278)||(1988644-1988864)
chr1 (58-278)||(52948870-52949090)
chr1 (73-264)||(26192275-26192466)
chr1 (58-264)||(34823652-34823857)
chr1 (73-264)||(27066764-27066954)
chr1 (75-264)||(37013036-37013224)
chr1 (74-264)||(18096107-18096297)
chr1 (60-264)||(16155568-16155770)
chr1 (73-264)||(20315115-20315305)
chr1 (73-264)||(20327360-20327550)
chr1 (60-264)||(21459313-21459515)
chr1 (60-264)||(25020153-25020355)
chr1 (60-264)||(21793433-21793639)
chr1 (63-260)||(25038573-25038769)
chr1 (60-257)||(21820635-21820834)
chr1 (73-267)||(22957137-22957331)
chr1 (63-260)||(25043785-25043981)
chr1 (75-264)||(41543018-41543206)
chr1 (60-264)||(18384028-18384231)
chr1 (73-264)||(20316878-20317068)
chr1 (73-176)||(12420180-12420283)
chr1 (63-264)||(4951114-4951314)
chr1 (63-264)||(22961588-22961788)
chr1 (74-264)||(49336433-49336622)
chr1 (76-264)||(2117539-2117727)
chr1 (60-237)||(13965757-13965933)
chr1 (60-264)||(2369596-2369799)
chr1 (84-264)||(19747437-19747616)
chr1 (84-264)||(42034898-42035077)
chr1 (74-237)||(8540971-8541134)
chr1 (74-237)||(8606210-8606373)
chr1 (74-176)||(25822352-25822454)
chr1 (73-167)||(25868126-25868220)
chr1 (76-264)||(30548815-30549002)
chr1 (105-184)||(22892342-22892421)
chr1 (110-170)||(22892614-22892674)
chr1 (105-184)||(22892189-22892268)
chr1 (73-168)||(34000645-34000740)
chr1 (76-139)||(21904518-21904581)
chr1 (76-175)||(19867790-19867887)
chr1 (73-124)||(22959167-22959218)
[»] scaffold0313 (3 HSPs)
scaffold0313 (58-278)||(6439-6659)
scaffold0313 (58-278)||(10221-10441)
scaffold0313 (108-278)||(20596-20766)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (58-278)||(20948521-20948741)
chr5 (58-278)||(20958890-20959110)
chr5 (72-278)||(19547629-19547835)
chr5 (60-264)||(18208631-18208833)
chr5 (60-264)||(18217969-18218171)
chr5 (60-264)||(21682872-21683074)
chr5 (58-264)||(36317130-36317336)
chr5 (73-264)||(30942671-30942861)
chr5 (73-264)||(30952093-30952283)
chr5 (73-264)||(37646713-37646904)
chr5 (73-264)||(37537602-37537793)
chr5 (60-264)||(20897638-20897844)
chr5 (73-264)||(22172634-22172824)
chr5 (73-264)||(4037361-4037551)
chr5 (60-264)||(32071125-32071327)
chr5 (73-264)||(37818283-37818473)
chr5 (60-264)||(18390919-18391121)
chr5 (73-264)||(19887070-19887260)
chr5 (60-264)||(26191197-26191399)
chr5 (60-264)||(26201779-26201981)
chr5 (73-264)||(27273563-27273753)
chr5 (60-264)||(33940005-33940207)
chr5 (60-264)||(33950405-33950607)
chr5 (63-264)||(19781287-19781487)
chr5 (76-264)||(21754219-21754406)
chr5 (76-264)||(21763506-21763693)
chr5 (58-264)||(23376131-23376340)
chr5 (73-264)||(13571061-13571251)
chr5 (60-264)||(18361962-18362164)
chr5 (60-264)||(27412833-27413035)
chr5 (73-264)||(34129871-34130061)
chr5 (60-264)||(27578525-27578728)
chr5 (60-264)||(8764539-8764741)
chr5 (60-264)||(11410283-11410485)
chr5 (73-264)||(37298196-37298386)
chr5 (76-264)||(31917496-31917683)
chr5 (69-176)||(20904001-20904108)
chr5 (75-260)||(204850-205034)
chr5 (75-264)||(20807921-20808109)
chr5 (63-264)||(22245295-22245495)
chr5 (74-264)||(42089887-42090078)
chr5 (82-137)||(29958777-29958833)
chr5 (82-137)||(15321142-15321198)
chr5 (82-137)||(15330145-15330201)
chr5 (82-137)||(18708556-18708612)
chr5 (82-137)||(18717570-18717626)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (58-270)||(22907965-22908177)
chr2 (58-270)||(27159094-27159306)
chr2 (58-270)||(27169442-27169654)
chr2 (58-278)||(19342985-19343205)
chr2 (58-270)||(22902817-22903029)
chr2 (92-278)||(15474683-15474869)
chr2 (60-264)||(32935879-32936081)
chr2 (73-260)||(16901325-16901512)
chr2 (73-260)||(16994716-16994903)
chr2 (73-264)||(45191521-45191711)
chr2 (63-264)||(28451011-28451211)
chr2 (76-264)||(4459062-4459249)
chr2 (60-264)||(2997789-2997991)
chr2 (60-264)||(18651903-18652105)
chr2 (60-264)||(18664021-18664223)
chr2 (76-264)||(4468687-4468874)
chr2 (76-264)||(5345822-5346009)
chr2 (76-264)||(38929616-38929803)
chr2 (73-264)||(3604751-3604941)
chr2 (60-264)||(9501852-9502054)
chr2 (60-264)||(9513218-9513420)
chr2 (60-264)||(17489375-17489577)
chr2 (73-264)||(22678855-22679045)
chr2 (58-260)||(69263-69464)
chr2 (76-264)||(5335970-5336157)
chr2 (76-264)||(29424037-29424224)
chr2 (76-264)||(41026013-41026201)
chr2 (89-264)||(22671731-22671905)
chr2 (82-264)||(21109898-21110080)
chr2 (76-264)||(45015397-45015584)
chr2 (77-256)||(37862223-37862401)
chr2 (82-264)||(44637770-44637951)
chr2 (92-264)||(12571281-12571452)
chr2 (76-264)||(38956958-38957145)
chr2 (76-264)||(24695693-24695877)
chr2 (71-238)||(40408122-40408288)
chr2 (99-184)||(22146542-22146627)
chr2 (76-176)||(38461270-38461369)
chr2 (82-137)||(22635001-22635057)
chr2 (82-137)||(41896403-41896459)
chr2 (121-162)||(37488798-37488839)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (58-278)||(26361511-26361731)
chr8 (53-270)||(14438101-14438318)
chr8 (60-264)||(13675445-13675647)
chr8 (60-264)||(21986923-21987125)
chr8 (60-264)||(21996457-21996659)
chr8 (73-264)||(14893222-14893412)
chr8 (60-264)||(9324208-9324410)
chr8 (73-264)||(14880872-14881062)
chr8 (73-264)||(20530058-20530248)
chr8 (60-264)||(21202008-21202210)
chr8 (60-264)||(21212424-21212626)
chr8 (60-264)||(21334983-21335185)
chr8 (73-264)||(31990839-31991029)
chr8 (73-264)||(31998428-31998618)
chr8 (60-264)||(2689455-2689659)
chr8 (73-264)||(33773315-33773503)
chr8 (72-184)||(12840640-12840752)
chr8 (60-163)||(3988296-3988399)
chr8 (82-264)||(23014227-23014408)
chr8 (74-264)||(11429657-11429846)
chr8 (76-170)||(12900498-12900592)
chr8 (89-176)||(6760589-6760676)
chr8 (76-160)||(21461892-21461976)
chr8 (73-160)||(18537438-18537525)
chr8 (106-184)||(37817815-37817892)
chr8 (179-264)||(20852168-20852253)
chr8 (74-115)||(17269564-17269605)
chr8 (82-137)||(45489579-45489635)
chr8 (82-137)||(45498537-45498593)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (58-270)||(13284879-13285091)
chr7 (58-268)||(41028279-41028489)
chr7 (58-278)||(5614625-5614846)
chr7 (58-278)||(12826550-12826770)
chr7 (58-278)||(31825388-31825608)
chr7 (58-278)||(42596052-42596272)
chr7 (60-264)||(27989777-27989981)
chr7 (59-260)||(15987838-15988038)
chr7 (73-264)||(24539652-24539843)
chr7 (60-264)||(15374388-15374592)
chr7 (58-212)||(12088061-12088215)
chr7 (60-264)||(14946795-14946998)
chr7 (58-263)||(9007630-9007834)
chr7 (62-264)||(14247678-14247880)
chr7 (60-264)||(5380987-5381189)
chr7 (60-264)||(5390625-5390827)
chr7 (76-264)||(12770767-12770954)
chr7 (60-264)||(26304240-26304442)
chr7 (60-264)||(26362376-26362578)
chr7 (53-264)||(9534406-9534615)
chr7 (60-264)||(5927820-5928022)
chr7 (60-264)||(6535169-6535371)
chr7 (60-264)||(6545490-6545692)
chr7 (60-264)||(8501734-8501936)
chr7 (60-264)||(8512204-8512406)
chr7 (60-264)||(11625539-11625741)
chr7 (60-264)||(16131089-16131291)
chr7 (60-264)||(16141638-16141840)
chr7 (73-264)||(19800784-19800974)
chr7 (60-264)||(26307800-26308002)
chr7 (60-264)||(44897983-44898185)
chr7 (60-264)||(44908408-44908610)
chr7 (60-264)||(46497799-46498001)
chr7 (60-264)||(46508411-46508613)
chr7 (53-264)||(9544689-9544898)
chr7 (76-264)||(43984344-43984531)
chr7 (60-264)||(32099065-32099267)
chr7 (60-260)||(32109506-32109704)
chr7 (73-264)||(45554241-45554431)
chr7 (76-264)||(42621776-42621963)
chr7 (73-264)||(10416668-10416858)
chr7 (73-264)||(19586431-19586621)
chr7 (74-213)||(12574917-12575056)
chr7 (60-260)||(2991063-2991261)
chr7 (61-176)||(7018580-7018695)
chr7 (61-176)||(7033942-7034057)
chr7 (76-176)||(13130608-13130708)
chr7 (63-200)||(8340954-8341090)
chr7 (74-191)||(12516019-12516136)
chr7 (105-184)||(40703320-40703399)
chr7 (74-185)||(12492220-12492331)
chr7 (105-170)||(40703578-40703643)
chr7 (105-184)||(40703164-40703246)
chr7 (76-184)||(11605501-11605609)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (109-278)||(1-170)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (60-278)||(39749-39967)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (60-264)||(6189-6393)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (75-264)||(20250-20439)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (58-264)||(2484-2689)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (58-190)||(19725-19857)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (73-264)||(34-224)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (73-264)||(110962-111152)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (60-264)||(233170-233372)
scaffold0014 (76-264)||(147391-147578)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (58-264)||(1633-1839)
scaffold0591 (76-160)||(1-85)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (74-264)||(19455-19644)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (60-264)||(18544-18747)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (76-264)||(45-232)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (58-251)||(16142-16334)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (60-264)||(7024-7226)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (60-257)||(11975-12174)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (76-264)||(309217-309403)
scaffold0005 (60-264)||(217344-217547)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (76-264)||(55324-55510)
scaffold0018 (76-264)||(59273-59459)
scaffold0018 (76-264)||(60701-60887)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (75-267)||(196586-196780)
scaffold0015 (73-124)||(189977-190028)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (73-237)||(8847-9011)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (76-264)||(55041-55228)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (73-237)||(28207-28371)
scaffold0058 (73-176)||(49411-49514)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (76-264)||(73924-74111)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (74-237)||(8131-8295)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (73-176)||(395053-395156)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (76-264)||(92075-92262)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (72-264)||(954-1144)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (60-156)||(30836-30932)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (76-201)||(1154-1280)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (63-260)||(27959-28155)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (82-176)||(209-303)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (76-264)||(8795-8982)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (58-154)||(67012-67108)
scaffold0057 (147-265)||(66228-66346)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (76-175)||(2000-2097)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (82-137)||(4987-5043)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34766247 - 34766027
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766247 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 34766148  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34766147 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 34766048  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  34766047 agactttacacctttctgctc 34766027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 52 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24692706 - 24692480
Alignment:
Q  52 gagaagagaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagata 151  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24692706 gagaagagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagata 24692607  T
Q  152 acttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttac 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24692606 acttctcaaatcatgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtactctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttac 24692507  T
Q  252 ccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  24692506 ctacttagaatttacacctttctgctc 24692480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 8562474 - 8562694
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8562474 agaagaacacacagaaatttatattggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 8562573  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8562574 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttatacctttcttgctaagttacccactt 8562673  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  8562674 agactttacacctttctgctc 8562694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 22222654 - 22222860
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22222654 agaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctct 22222753  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||     
T  22222754 caaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgca-ctttcttgctaagttacccaca 22222852  T
Q  257 tagacttt 264  Q
    ||||||||    
T  22222853 tagacttt 22222860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 22248489 - 22248695
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22248489 agaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctct 22248588  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||     
T  22248589 caaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgca-ctttcttgctaagttacccaca 22248687  T
Q  257 tagacttt 264  Q
    ||||||||    
T  22248688 tagacttt 22248695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1598033 - 1597842
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1598033 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaaccctgcacctt 1597934  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| |||||||||  |||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  1597933 acaatccttgttcacatgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 1597842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19363958 - 19363764
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19363958 agaagaacacacataaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccacttctcacaatattgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctct 19363859  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacc 252  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  19363858 caaatcatgcaccttacaatcttgttcgcctgaacaatttcaacaaatgtattctcttagcctcagcagacttatacctttcttgctaagttacc 19363764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9034303 - 9034101
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9034303 aagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgagttagtccactccacacaatcttgtgggagtttccactatgatgtttgagataacctctca 9034204  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    |||||||||  |||||| |||||||  | ||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9034203 aatcctgcaatttacaatcttgttcgcccgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttag 9034106  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  9034105 acttt 9034101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 26019599 - 26019787
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26019599 tttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttac 26019698  T
Q  175 aa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || | ||||||| ||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  26019699 aatctttgttcacctgaacagttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 26019787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18170760 - 18170558
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18170760 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18170661  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18170660 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18170563  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18170562 acttt 18170558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 27786697 - 27786883
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| || |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  27786697 ttatagtgattcatccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatacttgagataacctctcaactcttgcaccttaca 27786796  T
Q  176 accttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |  ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  27786797 atattgttcacctgaacacttacaacgattgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt--ttgctaagttacccacttagacttt 27786883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3286733 - 3286531
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3286733 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 3286634  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  3286633 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 3286536  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  3286535 acttt 3286531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12455940 - 12455738
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12455940 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 12455841  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  12455840 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 12455743  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  12455742 acttt 12455738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14792489 - 14792287
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14792489 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggatagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 14792390  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  14792389 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 14792292  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  14792291 acttt 14792287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16898833 - 16898631
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16898833 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16898734  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16898733 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16898636  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16898635 acttt 16898631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18160948 - 18160746
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18160948 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18160849  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18160848 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18160751  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18160750 acttt 18160746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20913169 - 20912967
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20913169 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 20913070  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20913069 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 20912972  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  20912971 acttt 20912967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 24921172 - 24921374
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24921172 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 24921271  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  24921272 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttagccacttag 24921369  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  24921370 acttt 24921374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 24930208 - 24930410
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24930208 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 24930307  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  24930308 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttagccacttag 24930405  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  24930406 acttt 24930410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31358448 - 31358246
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31358448 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 31358349  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  31358348 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 31358251  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  31358250 acttt 31358246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31368178 - 31367976
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31368178 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 31368079  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  31368078 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 31367981  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  31367980 acttt 31367976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Original strand, 18705502 - 18705702
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18705502 aacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaat 18705601  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    | |||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  18705602 cttgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggattacacc-ttgttgctaagttaaccacttagac 18705699  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  18705700 ttt 18705702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Original strand, 18711437 - 18711637
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18711437 aacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaat 18711536  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    | |||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  18711537 cttgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggtttacacc-ttgttgctaagttaaccacttagac 18711634  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  18711635 ttt 18711637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29541317 - 29541130
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29541317 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 29541218  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29541217 atctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 29541130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16909486 - 16909284
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16909486 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16909387  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16909386 agtcctgcaccttacaatcttgtttacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16909289  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16909288 acttt 16909284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 30657067 - 30657257
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30657067 aatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 30657166  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||||||| |||||||||| |||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  30657167 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-cctgtattctctaagcctcagcacgcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 30657257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26169288 - 26169099
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26169288 atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtctccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctta 26169189  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| || |||||  ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  26169188 caatccgtgttctcctgaacacttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 26169099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15504321 - 15504119
Alignment:
Q  62 gaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaa 161  Q
    |||||| |||| |||||||  |||||||| ||| || | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15504321 gaacacacaaagatttatagaggttcacctaatatgggctagtccacttcccacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaccactcaaa 15504222  T
Q  162 tcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    || |||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  15504221 tcttgcaccttacaatctttgttcagctgaacaattacaacacatatattctctaagcctcagcaggcttccacc-ttcttgctaagttatccacttaga 15504123  T
Q  261 cttt 264  Q
    ||||    
T  15504122 cttt 15504119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16322187 - 16322006
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-cctt 180  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||    
T  16322187 tggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatcttt 16322088  T
Q  181 gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  16322087 gttcacctgaacaattacaatta-tgtattctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 16322006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16334335 - 16334154
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-cctt 180  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||    
T  16334335 tggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatcttt 16334236  T
Q  181 gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  16334235 gttcacctgaacaattacaatta-tgtattctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 16334154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18335801 - 18335659
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18335801 aagaacacacagaaatttatagaggttcaaccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttaagataatttctca 18335702  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaa 203  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  18335701 aatcctacaccttacaacctt-ttcacctgaacaattacaacaa 18335659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Original strand, 12989046 - 12989148
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12989046 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 12989145  T
Q  173 aca 175  Q
    |||    
T  12989146 aca 12989148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 264
Target Start/End: Original strand, 790202 - 790401
Alignment:
Q  64 acacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatc 163  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  790202 acacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaattttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatc 790301  T
Q  164 ctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagact 262  Q
    |||||||||||||  | || ||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| || | || | ||||||||| |||||||||||    
T  790302 ctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaac-ttgttgctaagttaaccacttagact 790399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18202418 - 18202231
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18202418 ttatagtggtttccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttaca 18202319  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | ||||| ||| |||||||||||||    
T  18202318 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattttctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaatttaaccacttagacttt 18202231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17826723 - 17826562
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17826723 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 17826624  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    | | ||||||| ||||| | ||| |||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17826623 atctttgttcacctgaacaattataac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 17826562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20968713 - 20968552
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20968713 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 20968614  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20968613 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 20968552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 176
Target Start/End: Original strand, 7753910 - 7754014
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |    
T  7753910 aaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgtgagtttcctctatgatgttttagataacctctcaaatcctgcactt 7754009  T
Q  172 tacaa 176  Q
    |||||    
T  7754010 tacaa 7754014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 170
Target Start/End: Original strand, 6314664 - 6314771
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6314664 aacacacaaaaatttatagtagttcacccaatgtgggataatctactcctcacaatcttgtgagaaattccattatgatgcttgagataccctctcaaat 6314763  T
Q  163 cctgcacc 170  Q
    ||||||||    
T  6314764 cctgcacc 6314771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28093512 - 28093343
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||  || | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    ||||    
T  28093512 agaagaagacacataaatttatagtggttcacctaacatgggctaatccactcctcacaatcttgtgagaattttcactgtgatgcttgaga----ttct 28093417  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttaca 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||   |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  28093416 caaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaactacaac--ctgtattctctaagtctcggcaggcttaca 28093343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18333463 - 18333385
Alignment:
Q  200 acaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18333463 acaactgtattatcttagcctcagcagacttacacctttcttgctaagttacccacttagactttacacctttctgctc 18333385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 9760731 - 9760830
Alignment:
Q  84 gttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgaga-ttttccactatgatgcttgagataac-ttctcaaatcctgcaccttacaaccttg 181  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  9760731 gttcatccaacgtgggctagtccactcctcacaat---gtgagagttttccactacgatgcttgagacaacattctcaactcctgcaccttacaactttg 9760827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25537769 - 25537672
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  25537769 ttatagtggttcatccaatgtgggttagttcactcctcccaat--tgtgagattttt-actatgatgcttgagacaaccttctgaactcatgcaccttac 25537673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26045165 - 26045068
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  26045165 ttatagtggttcacctaatgtgggttattccactcctcacaa--ctgtgagatgtt-cactatgatccttgagacaaccttctcaactcatgcaccttac 26045069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13155000 - 13154944
Alignment:
Q  121 tgtgagattttccactatgatgcttgagataac-ttctcaaatcctgcaccttacaa 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13155000 tgtgagatttttcactatgatgcttgagcaaacattctcaactcctgcaccttacaa 13154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13159856 - 13159800
Alignment:
Q  121 tgtgagattttccactatgatgcttgagataac-ttctcaaatcctgcaccttacaa 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13159856 tgtgagatttttcactatgatgcttgagcaaacattctcaactcctgcaccttacaa 13159800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 17556354 - 17556410
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17556354 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatgcttgtgagattttccacta 17556410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 264
Target Start/End: Original strand, 7754043 - 7754101
Alignment:
Q  205 tgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  7754043 tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 7754101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 4892801 - 4892740
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccacta 137  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  4892801 ttatcatgattcccccaatgtgagttagtccagccctcacaatactgtgagattatccacta 4892740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26140829 - 26140732
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  26140829 ttatagtggttcatctaatgtgggttattccactcctcacaa--ctgtgagatgtt-cactatgatccttgagacaaccttctcaactcatgcaccttac 26140733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 518862 - 519082
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  518862 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 518961  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  518962 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 519061  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  519062 agactttacacctttctgctc 519082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 521368 - 521588
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  521368 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 521467  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  521468 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 521567  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  521568 agactttacacctttctgctc 521588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 52 - 270
Target Start/End: Original strand, 17420467 - 17420686
Alignment:
Q  52 gagaagagaagaaca-cgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagat 150  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17420467 gagaagagaagaaaaacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagat 17420566  T
Q  151 aacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagtta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17420567 aacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagtta 17420666  T
Q  251 cccacttagactttacacct 270  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17420667 cccacttagactttacacct 17420686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26459309 - 26459097
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26459309 agaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccactatgatgtttgagataacttct 26459210  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26459209 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaacagtattctcttagcctcatcgggcttacacctttaatgctaagttacccactt 26459110  T
Q  258 agactttacacct 270  Q
    |||||||||||||    
T  26459109 agactttacacct 26459097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8842059 - 8841867
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  8842059 aaatttatagtggttcacccactatgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcactt 8841960  T
Q  172 tacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8841959 tacaatcttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 8841867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 13792207 - 13792412
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13792207 agaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctct 13792306  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  13792307 caaatcatgcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaaaaaatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttctttctaagttacccactt 13792405  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  13792406 agacttt 13792412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16250333 - 16250131
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16250333 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 16250234  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16250233 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16250136  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16250135 acttt 16250131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 13401959 - 13402165
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  13401959 agaagaacacacaaaaatttatagtggttcaccaaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactacgatgcttgagataacctct 13402058  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
    ||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  13402059 caaattccgcaccttacaatctttgttcaactgaacaattacaccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccact 13402157  T
Q  257 tagacttt 264  Q
    ||||||||    
T  13402158 tagacttt 13402165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16398136 - 16397933
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16398136 aagaacacacagaaatttatagtggttcatccaatgtggtttagtccactcctcacgatcttgtgagagttttcactatgatgtttgaggtaacctctca 16398037  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16398036 aatcctgcactttacaatcttgttcacctgaacaattacatcaattgtattctctaagcctcagcaggcttacaccttt-ttgctaagttacccacttag 16397938  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16397937 acttt 16397933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 17827185 - 17827375
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17827185 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 17827284  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17827285 acaatccttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 17827375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 17836576 - 17836766
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17836576 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 17836675  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17836676 acaatccttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 17836766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 6405000 - 6405205
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| |||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6405000 agaaaaacacacaaagatttatagtggttcaaacaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctct 6405099  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||  | |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  6405100 caaatatttcaccttacaatcttgttcacctgaaaaattacaacaattgtattctctaagcctcagcaatcttgcacc-ttcttgctaagttacccactt 6405198  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  6405199 agacttt 6405205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16059258 - 16059054
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16059258 aagaacacacaaagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgtttgagataacctctca 16059159  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||| | |||    
T  16059158 aatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttctttctaagttacctattta 16059060  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  16059059 gacttt 16059054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2830860 - 2830670
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2830860 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 2830761  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  2830760 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 2830670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16630407 - 16630217
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16630407 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 16630308  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  16630307 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 16630217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10422654 - 10422467
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10422654 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccattatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 10422555  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10422554 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 10422467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17162461 - 17162273
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17162461 ttatagtggttcacccaatgtgggatagtccactcctcataatcttctgagagtttccactatgatgcttgagataacctatcaaatcctgcaccttaca 17162362  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  17162361 atctttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgaacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 17162273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 17984046 - 17984248
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17984046 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 17984145  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  17984146 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 17984243  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  17984244 acttt 17984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 18104596 - 18104798
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18104596 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18104695  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18104696 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18104793  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18104794 acttt 18104798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40922730 - 40922528
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40922730 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 40922631  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  40922630 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 40922533  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  40922532 acttt 40922528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41527187 - 41526984
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  41527187 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtg-gttagtccacttctcacaatcttgagag--tttccactatgatgctaaagataacctct 41527091  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  41527090 caaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccact 41526992  T
Q  257 tagacttt 264  Q
    ||||||||    
T  41526991 tagacttt 41526984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 4837189 - 4837378
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4837189 tttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctattatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttac 4837288  T
Q  175 aa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||| || |  |||||||| |||||||||||||    
T  4837289 aatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcaacagcaggcttgcacc-ttgtttctaagttaaccacttagacttt 4837378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 5292101 - 5292288
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5292101 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 5292200  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5292201 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 5292288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 5301760 - 5301947
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5301760 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 5301859  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5301860 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 5301947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15670951 - 15670764
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15670951 ttatagtggttcaccctatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 15670852  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||| ||||| |||||||||||||    
T  15670851 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgcttagttaaccacttagacttt 15670764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17144601 - 17144413
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17144601 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactacgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttaca 17144502  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| || | |||||| || |||||||||||||    
T  17144501 atccttgttcaccggaacaattacaacaactgtattctctaaacctcagcaggcttgcacc-ttattgctaaggtaaccacttagacttt 17144413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21847157 - 21846970
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21847157 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 21847058  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21847057 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 21846970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21856749 - 21856562
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21856749 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 21856650  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21856649 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 21856562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21903020 - 21902833
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21903020 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 21902921  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21902920 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 21902833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21912612 - 21912425
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21912612 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 21912513  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21912512 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 21912425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 27679766 - 27679953
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27679766 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 27679865  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27679866 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 27679953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 27689421 - 27689608
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27689421 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 27689520  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27689521 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 27689608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6693105 - 6692903
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6693105 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 6693006  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6693005 agtcctgcaccttacaatcttgttctcctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 6692908  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6692907 acttt 6692903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6703511 - 6703309
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6703511 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 6703412  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6703411 agtcctgcaccttacaatcttgttctcctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 6703314  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6703313 acttt 6703309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44889893 - 44889703
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44889893 aatttatagtagttcccccaatgggtgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 44889794  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  44889793 acaatatgtgttcaactgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 44889703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 3486640 - 3486827
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  3486640 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 3486739  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3486740 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 3486827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 3495963 - 3496150
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  3495963 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 3496062  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3496063 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 3496150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Original strand, 53945300 - 53945402
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53945300 atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctta 53945399  T
Q  174 caa 176  Q
    |||    
T  53945400 caa 53945402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 14599831 - 14600034
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  14599831 aagaacacacaaatatttatagtggttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagtttcaactatgatacttgagataacctctta 14599930  T
Q  160 aatcctgcaccttacaacc-ttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | |||||||||| |||| || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  14599931 aatcctgcatcttacaacctttgttcacctgaacaattataacca-tgtattctctaagccacaactggcttgcacc-ttcttgctaagttacccactta 14600028  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  14600029 gacttt 14600034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 16210162 - 16210350
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16210162 atttatagtggttc-cccaatgtgggttagtccactcctctaaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgtacctta 16210260  T
Q  174 caacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| || |||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| ||||||| |||||    
T  16210261 caatctgtgttcacctgaacacttac-acctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-atgttgctaagttaaccacttatacttt 16210350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30652554 - 30652356
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30652554 aagaacactcaaagatttatagtggttcccccaatgttggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctca 30652455  T
Q  160 aatcc-tgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||| ||||      | | ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30652454 aatccttgca------atctttgttcacctgaacaattacgccaactgtattctctaagcatcagcaggcttgtacc-ttcttgctaagttacccactta 30652362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 7845914 - 7846117
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7845914 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttatgagagtttcccctatgatgcttgagataacctctca 7846013  T
Q  160 aatcctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    | |||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||    |||||| ||| |||||||||||| || |||| || | ||||||||| |||||||    
T  7846014 agtcctgcaccttacaatttatgttcacctgaatacttacaa-ttctgtattttctaagcctcagcaggattgcacc-ttgttgctaagttaaccactta 7846111  T
Q  259 gacttt 264  Q
     |||||    
T  7846112 aacttt 7846117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16254107 - 16253920
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  16254107 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaattttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctcaca 16254008  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| | |||||||||||    
T  16254007 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaactacttagacttt 16253920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Original strand, 7843034 - 7843127
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataac 153  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7843034 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataac 7843127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 16081454 - 16081562
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16081454 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16081553  T
Q  160 aatcctgca 168  Q
    | |||||||    
T  16081554 agtcctgca 16081562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14932728 - 14932672
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14932728 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatgcttgtgagattttccacta 14932672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14941933 - 14941877
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14941933 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatgcttgtgagattttccacta 14941877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 184
Target Start/End: Original strand, 18585698 - 18585806
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgag-attttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| | ||   |||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||| ||||||||| ||    
T  18585698 ttatagtggttcacccaatatgggctagtccactccttataa--ctgtgagaattttccactataatgcttgaaacaaccttctcaactcctgcaccgta 18585795  T
Q  174 caaccttgttc 184  Q
    |||| ||||||    
T  18585796 caactttgttc 18585806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 30626053 - 30626109
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30626053 tggttcccccaacgtgggttagtccagtcctcacaaaacttgtgagattttccacta 30626109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 24872397 - 24872617
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872397 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 24872496  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24872497 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 24872596  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  24872597 agactttacacctttctgctc 24872617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 49386553 - 49386759
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49386553 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgtttgagataacttct 49386652  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49386653 caaatcatgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaagcttacacctttcttgctaagttacccactt 49386752  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  49386753 agacttt 49386759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 2488062 - 2488253
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2488062 aatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcacctt 2488161  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  2488162 acaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 2488253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25433975 - 25433793
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-cctt 180  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25433975 tggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcctt 25433876  T
Q  181 gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||||| |||||    
T  25433875 gttcacctgaacaattacaacaattgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ctgttgctaagttacccacttaaacttt 25433793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 13118630 - 13118822
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13118630 aaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacgt 13118729  T
Q  172 tacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    | ||||||||| |||||||||||||    
T  13118730 tacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-cggttgctaagttaaccacttagacttt 13118822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20492918 - 20492715
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20492918 aagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagaaaacctctca 20492819  T
Q  160 aatcctgcaccttac-aaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| ||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||    
T  20492818 aatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaattacaac-cttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccactta 20492721  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  20492720 gacttt 20492715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 4781636 - 4781826
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4781636 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 4781735  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  4781736 acaatctttgttcacctgaacagttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 4781826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17734955 - 17734808
Alignment:
Q  131 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17734955 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcaccaggctt 17734856  T
Q  231 acacctttctggctaagttacccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17734855 acatatttcttgctaagttacccacttagactttacacctttctgctc 17734808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 131 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19036224 - 19036077
Alignment:
Q  131 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19036224 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaaccttgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcatcaggctt 19036125  T
Q  231 acacctttctggctaagttacccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19036124 acatttttcttgctaagttacccacttagactttacacctttctgctc 19036077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20293930 - 20293734
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20293930 aacacacagaaatttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 20293831  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||    
T  20293830 cctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttacacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 20293734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 10507846 - 10508049
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10507846 aagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgtttccactatgatgcttgagataacctctca 10507945  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||| ||||  | |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  10507946 aatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaac-cctgtattctctaagcctcaacaggtctgcacc-ttcttactaagttacccactta 10508043  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  10508044 gacttt 10508049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 1684429 - 1684631
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1684429 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 1684528  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  1684529 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcttgtattctctaagcctcggcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 1684626  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  1684627 acttt 1684631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 5654804 - 5655006
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5654804 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 5654903  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  5654904 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 5655001  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  5655002 acttt 5655006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8973733 - 8973531
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8973733 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 8973634  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8973633 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 8973536  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  8973535 acttt 8973531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8984288 - 8984086
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8984288 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 8984189  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8984188 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 8984091  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  8984090 acttt 8984086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9538022 - 9537820
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9538022 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 9537923  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  9537922 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 9537825  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  9537824 acttt 9537820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9548348 - 9548146
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9548348 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 9548249  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  9548248 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 9548151  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  9548150 acttt 9548146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 16334594 - 16334796
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16334594 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16334693  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16334694 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16334791  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16334792 acttt 16334796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 19827420 - 19827610
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19827420 aatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcacctt 19827519  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19827520 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 19827610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4372411 - 4372224
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  4372411 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 4372312  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||| ||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4372311 atcttcgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 4372224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4382152 - 4381965
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  4382152 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 4382053  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||| ||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4382052 atcttcgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 4381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24794236 - 24794115
Alignment:
Q  149 ataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24794236 ataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattatcttagcctcatcaggcttacacctttcttgctaagt 24794137  T
Q  249 tacccacttagactttacacct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24794136 tacccacttagactttacacct 24794115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 14801614 - 14801808
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14801614 aaattaatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacct 14801713  T
Q  172 tacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaat--tgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| || |||||| ||||| | |||||| |||  |||||| | | ||||||| ||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  14801714 tacaatctgtgttcacctgaacacttacaataattatgtattgtgtaagcctcaacaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 14801808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11460027 - 11459823
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  11460027 agaagaacacacaaag-tttatagtggttcacccattgtgggttagtccacttctcacaatcttatgagagttttcactatgatgtttgagataacctct 11459929  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    ||||||||||| | |||||  ||||||| || || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  11459928 caaatcctgcatcctacaatattgttcacctaaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccgctt 11459830  T
Q  258 agacttt 264  Q
    | |||||    
T  11459829 acacttt 11459823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 4023305 - 4023507
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4023305 aagaacacacagagatttatagtggttcagccaatgtgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttccactatgatatttgagataacctctca 4023403  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||    
T  4023404 aatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaataattacaac-cctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccactta 4023501  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  4023502 gacttt 4023507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6423194 - 6422992
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6423194 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 6423095  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||| | ||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6423094 agtcctgcagcttacaatcttgttcaccagaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttagccacttag 6422997  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6422996 acttt 6422992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6433621 - 6433419
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6433621 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtaggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 6433522  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6433521 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggattgcacc-ttcttgctaagttagccacttag 6433424  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6433423 acttt 6433419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 227
Target Start/End: Original strand, 10507032 - 10507199
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10507032 aagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgtttccactatgatgcttgagataacctctca 10507131  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcagg 227  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||| ||||    
T  10507132 aatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaac-cctgtattctctaagcctcaacagg 10507199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 20743898 - 20744088
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20743898 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 20743997  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||| ||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20743998 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctgtattttctaagcctcagcagtcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20744088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12387107 - 12386917
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  12387107 atttatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaaatcctacacctta 12387008  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||   ||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  12387007 caatttttgttcacctgaacagttacacaacctgtattctctaagccttagcagtcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 12386917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Original strand, 38817129 - 38817279
Alignment:
Q  52 gagaagagaa-gaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagat 150  Q
    |||||||||| |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38817129 gagaagagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccacttctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagat 38817228  T
Q  151 aacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||    
T  38817229 aacttctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaa 38817279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 260
Target Start/End: Original strand, 11181 - 11364
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11181 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 11280  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  11281 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 11364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 268
Target Start/End: Original strand, 23503058 - 23503246
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||  |||||||||||    
T  23503058 ttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttaagataccctatcaaattttgcaccttaca 23503157  T
Q  176 accttgttcatctgaatagttac-aacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagactttacac 268  Q
    | |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| | |||     ||||||||| ||||||||||||||    
T  23503158 atcttgttcatctgaacaattacaaacaactgtattctctaagcctcaacagacttacaaccttc-----aagttacccgcttagactttacac 23503246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Original strand, 10002619 - 10002780
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10002619 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtacttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 10002718  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10002719 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 10002780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 51977677 - 51977839
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51977677 tttatagtggttcccccaatgtgggttagttcactcctcacaatctagtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttac 51977776  T
Q  175 aacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||  | |||||| ||||| |  ||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51977777 aatttgtgttcacctgaacacctacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 51977839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24773649 - 24773549
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24773649 aacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaaat 24773550  T
Q  163 c 163  Q
    |    
T  24773549 c 24773549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 682987 - 683095
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  682987 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 683086  T
Q  160 aatcctgca 168  Q
    | |||||||    
T  683087 agtcctgca 683095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24814722 - 24814638
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatg 142  Q
    |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814722 agaagaacacacatgaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagattttccactatgatg 24814638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 11043899 - 11044010
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  11043899 aatttataatggttcacccaatatgggctaatccactcctcacaatcttatgagaattttcactataatgcttgagataacctctcaactcctgcaccat 11043998  T
Q  173 acaaccttgttc 184  Q
    | ||| ||||||    
T  11043999 ataactttgttc 11044010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 184
Target Start/End: Original strand, 13430705 - 13430820
Alignment:
Q  69 caaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgca 168  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||||||| | || || |||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| | | ||||||||||  |     
T  13430705 caaaaatttatagtggttaattcaatgtgggctaatctactcttcacaatcttgtgagaattttcaatctgatgcttgagacaccatctcaaatccaccg 13430804  T
Q  169 ccttacaaccttgttc 184  Q
     |||||||||||||||    
T  13430805 gcttacaaccttgttc 13430820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Original strand, 20649573 - 20649648
Alignment:
Q  99 gttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  20649573 gttagtgcactccttacaat--tgtgagagtttccactatgatgtttgagacaaccttctcaactcatgcaccttaca 20649648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 12899514 - 12899570
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12899514 tggttcacccatcgtgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 12899570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 149
Target Start/End: Original strand, 29708514 - 29708571
Alignment:
Q  90 ccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgaga 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29708514 ccaatgtgggttagtccactcctcacaa--ttatgagattttcctctataatgtttgaga 29708571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 30684468 - 30684412
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30684468 tggttcacccaacttgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 30684412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 1973857 - 1974077
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1973857 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 1973956  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1973957 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 1974056  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  1974057 agactttacacctttctgctc 1974077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 1988644 - 1988864
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988644 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 1988743  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1988744 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 1988843  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  1988844 agactttacacctttctgctc 1988864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 52948870 - 52949090
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52948870 agaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagttttgtgagattttccattatgatgcttgagataacttct 52948969  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52948970 caaattctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctcttagcctcagcagacttacacctttcttgctaagttacccactt 52949069  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  52949070 agactttacacctttctgctc 52949090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 26192275 - 26192466
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26192275 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 26192374  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  26192375 acaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ctgttgctaagttaaccacttagacttt 26192466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34823857 - 34823652
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||    
T  34823857 agaagaacacacaaaaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccatttctcacaatcttatgagagtttctactatgatgtttgagataaccgct 34823758  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  34823757 caaatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaatgacaacaactgtattctctaagcctcaacaggcttacacc-ttcttgctaagttatccactt 34823659  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  34823658 agacttt 34823652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27066954 - 27066764
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27066954 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 27066855  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  27066854 acaatctttgttcacctgaacaattacaatta-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 27066764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37013224 - 37013036
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37013224 tttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactacgatgttatagataacctctcaaatcctgcactttac 37013125  T
Q  175 aaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37013124 aatcttgttcacttgaacaattacatcaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgttaagttacccacttagacttt 37013036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 18096107 - 18096297
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18096107 atttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcacctta 18096206  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
     || | ||||||| ||||| | |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  18096207 gaatctttgttcacctgaacaattacacaacttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 18096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16155770 - 16155568
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16155770 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16155671  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16155670 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaatca-tgtattctctaagcctcagcaagcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16155573  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16155572 acttt 16155568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20315305 - 20315115
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20315305 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcacctt 20315206  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20315205 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20315115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 20327360 - 20327550
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20327360 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttcccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 20327459  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20327460 acaatctttgttcacctgaacaattacaatta-tgtattctctatgcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20327550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21459515 - 21459313
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21459515 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 21459416  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21459415 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21459318  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21459317 acttt 21459313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25020355 - 25020153
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25020355 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 25020256  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||    
T  25020255 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaacctcttag 25020158  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  25020157 acttt 25020153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21793639 - 21793433
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21793639 aagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtggtttagtccactcctcacaatcttgtgggagtttccactatgatgctttagataacctctca 21793540  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaa-tagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| |||||  | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||   |||||||| |||||    
T  21793539 aatcctacaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttattaagttacacactt 21793440  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  21793439 agacttt 21793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 260
Target Start/End: Original strand, 25038573 - 25038769
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25038573 aacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgtgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 25038672  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||| ||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  25038673 cctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 25038769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 257
Target Start/End: Original strand, 21820635 - 21820834
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21820635 aagaacacgcaaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacctctca 21820734  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaa-tagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||  | |||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  21820735 aatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacacaacctgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttacacactt 21820834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 73 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22957331 - 22957137
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22957331 aatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatggtatttgagataccttctcagatcctgcacttt 22957232  T
Q  173 acaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttac-acctttctggctaagttacccacttagactttaca 267  Q
    ||||   |||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22957231 acaaaaatgttaatctgaacatatac-acaattgtattctctaaacctcagcaggcttacaaccttcttggctaagttacccacttagactttaca 22957137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 260
Target Start/End: Original strand, 25043785 - 25043981
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25043785 aacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgtgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 25043884  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||   |||| |||||| |||||| |||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  25043885 cctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 25043981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 41543018 - 41543206
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41543018 tttataatggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacccctcaaatcctgcaccttac 41543117  T
Q  175 aacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || || ||||||  |||| | |||| || | |||||||||| |||||||| |||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  41543118 aatctatgttcacatgaacacttactacta-tgtattctctaagcctcagtaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 41543206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18384231 - 18384028
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18384231 aagaacacacacatatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctca 18384132  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  | || | |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  | | ||||||||| |||||||    
T  18384131 aatcctacaccttacaatctttgttcacataaacaattacaac-tttgtattctctaagcctgagcaggcttgcacc-atgttgctaagttaaccactta 18384034  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  18384033 gacttt 18384028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 20316878 - 20317068
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20316878 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttcccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 20316977  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| || || | ||||||    ||||||||||  |||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20316978 acaatctttgttcacctaaacaattacaa-ttctgtattctctatgcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20317068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12420283 - 12420180
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12420283 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 12420184  T
Q  173 acaa 176  Q
    ||||    
T  12420183 acaa 12420180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4951314 - 4951114
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4951314 aacacacataaatttatagtggttcccctaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 4951215  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    | |||||||||||| ||  ||||| ||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  4951214 catgcaccttacaatctgagttcacctgaacacttacaa-ttttgtattctctaagcctcagcagacttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagac 4951117  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  4951116 ttt 4951114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22961788 - 22961588
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22961788 aacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaat 22961689  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    |||||||||||||| || |||||| || || | |||| ||   | |||||||| ||||||||||||||| |||| |  | ||||||||| ||||||||||    
T  22961688 cctgcaccttacaatctgtgttcacctaaacacttaccac-tctatattctctaagcctcagcaggcttgcacc-tagttgctaagttaaccacttagac 22961591  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  22961590 ttt 22961588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 49336622 - 49336433
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  49336622 atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgtacctta 49336523  T
Q  174 caacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| || || ||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||  |||||||||||||    
T  49336522 caatctgtgctcacctgaacacttac-acctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-atgttgctaagttgaccacttagacttt 49336433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2117727 - 2117539
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagt-tagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  2117727 ttatagtggttcacccaatgtggggctagtccacttctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctttc 2117628  T
Q  175 aa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  2117627 aatccttgttcacctgaaaaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 2117539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13965933 - 13965757
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  13965933 aagaacacacaaagatttatagtggttcagccaatgtgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttccactatgataattgagataacctctca 13965835  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13965834 aatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaacca-tgtattctctaagcctcagcaggtttgcacctt 13965757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 2369596 - 2369799
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  2369596 aagaacacacagagatttatagtggttcacctaatgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacctctaa 2369695  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||  |||| | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  2369696 aatcatgcaccttacaatttttgttcacgtgaacaattacaa-atatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccactta 2369793  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  2369794 gacttt 2369799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 264
Target Start/End: Original strand, 19747437 - 19747616
Alignment:
Q  84 gttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgt 182  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  19747437 gttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcctgcactttacaatttgtgt 19747536  T
Q  183 tcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  19747537 tcacctgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaggttaaccacttagacttt 19747616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42035077 - 42034898
Alignment:
Q  84 gttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-ccttgt 182  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  42035077 gttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaagtcctgcaccttacaatctttgt 42034978  T
Q  183 tcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| | ||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42034977 tcaccagaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 42034898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8541134 - 8540971
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8541134 atttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaatcctgcacctta 8541035  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||| | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  8541034 caatctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcatcagcagacttgcacctt 8540971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8606373 - 8606210
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8606373 atttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaatcctgcacctta 8606274  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||| | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  8606273 caatctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcatcagcagacttgcacctt 8606210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 176
Target Start/End: Original strand, 25822352 - 25822454
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  25822352 atttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctctaatcttgcacctta 25822451  T
Q  174 caa 176  Q
    |||    
T  25822452 caa 25822454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25868220 - 25868126
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgc 167  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25868220 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtaagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgc 25868126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 30548815 - 30549002
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    
T  30548815 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtaagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacataaca 30548914  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  30548915 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctaagcagacttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 30549002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22892421 - 22892342
Alignment:
Q  105 ccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22892421 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccgaacaaccttgttc 22892342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22892674 - 22892614
Alignment:
Q  110 cctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacc 170  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22892674 cctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgcttgagataacttctcaattcctgcacc 22892614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22892268 - 22892189
Alignment:
Q  105 ccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  22892268 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccaccatgatgcttaagataacttctcaactctagcaccgaacaaccttgttc 22892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34000740 - 34000645
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgca 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||| ||| || |||||||    
T  34000740 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtctactcgtcacaatcttgtaagagtttccactatgttgtttgatataacatcttaattcctgca 34000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Original strand, 21904518 - 21904581
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatg 139  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21904518 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 21904581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Original strand, 19867790 - 19867887
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| | |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  19867790 ttatagtggttcacccaatatgggttagtccactcctcacaa--ctgtgagatttt-cactttaatgcttgagacaaccttctcaactcctgcaccttac 19867886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22959218 - 22959167
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtg 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22959218 aatttataatggttcatccaatatgggttagtccactcctcacaatcttgtg 22959167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6659 - 6439
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6659 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 6560  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6559 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 6460  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  6459 agactttatacctttctgctc 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10441 - 10221
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10441 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 10342  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10341 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 10242  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  10241 agactttatacctttctgctc 10221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 108 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20766 - 20596
Alignment:
Q  108 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||    
T  20766 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgt 20667  T
Q  208 attctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20666 attctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatacctttctgctc 20596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20948741 - 20948521
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20948741 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 20948642  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20948641 caaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 20948542  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  20948541 agactttacacctttctgctc 20948521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20959110 - 20958890
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20959110 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 20959011  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20959010 caaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 20958911  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  20958910 agactttacacctttctgctc 20958890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 72 - 278
Target Start/End: Original strand, 19547629 - 19547835
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19547629 aaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacactt 19547728  T
Q  172 tacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagactttacacctc 271  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19547729 tacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactatattctcttagtctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttacacctt 19547828  T
Q  272 tctgctc 278  Q
    |||||||    
T  19547829 tctgctc 19547835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 18208631 - 18208833
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18208631 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 18208730  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18208731 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18208828  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18208829 acttt 18208833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 18217969 - 18218171
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18217969 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 18218068  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18218069 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18218166  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18218167 acttt 18218171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21683074 - 21682872
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21683074 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 21682975  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21682974 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21682877  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21682876 acttt 21682872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36317336 - 36317130
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36317336 agaagaacacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctct 36317237  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  36317236 caaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcatc-ttcttgctaagttacccact 36317138  T
Q  257 tagacttt 264  Q
    ||||||||    
T  36317137 tagacttt 36317130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 30942671 - 30942861
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30942671 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 30942770  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30942771 acaatccttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 30942861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 30952093 - 30952283
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30952093 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 30952192  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30952193 acaatccttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 30952283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 37646713 - 37646904
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37646713 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttttgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 37646812  T
Q  173 aca-accttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||  ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  37646813 acattccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 37646904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 37537602 - 37537793
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37537602 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccattatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 37537701  T
Q  173 aca-accttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||  ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  37537702 acattccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcagacttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 37537793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20897844 - 20897638
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20897844 aagaacacacaaaaagttatactggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacctctca 20897745  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaa-tagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| |||||  | |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||    
T  20897744 aatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttactaagttacacactt 20897645  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  20897644 agacttt 20897638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 22172634 - 22172824
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22172634 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 22172733  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22172734 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 22172824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 4037361 - 4037551
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4037361 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 4037460  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  4037461 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 4037551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32071327 - 32071125
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32071327 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 32071228  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  32071227 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaatca-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 32071130  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  32071129 acttt 32071125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37818473 - 37818283
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37818473 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcacctt 37818374  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  37818373 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 37818283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18391121 - 18390919
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18391121 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18391022  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18391021 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18390924  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18390923 acttt 18390919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 19887070 - 19887260
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19887070 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcctctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 19887169  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19887170 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 19887260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 26191197 - 26191399
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26191197 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 26191296  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26191297 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 26191394  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  26191395 acttt 26191399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 26201779 - 26201981
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26201779 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 26201878  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26201879 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 26201976  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  26201977 acttt 26201981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 27273563 - 27273753
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27273563 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcataatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcacctt 27273662  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  27273663 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 27273753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33940207 - 33940005
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33940207 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 33940108  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  33940107 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 33940010  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  33940009 acttt 33940005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33950607 - 33950405
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33950607 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 33950508  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  33950507 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 33950410  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  33950409 acttt 33950405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19781487 - 19781287
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19781487 aacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 19781388  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||   |||| |||||| |||||| |||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  19781387 cctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagac 19781290  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  19781289 ttt 19781287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21754406 - 21754219
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21754406 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 21754307  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21754306 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 21754219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21763693 - 21763506
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  21763693 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 21763594  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21763593 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 21763506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 23376131 - 23376340
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23376131 agaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcccctatgatgcttgagataacctct 23376230  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttac----cc 253  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| | |||| || ||||||||||    ||    
T  23376231 caattcctgcaccttacaatcttgttcagctgaacaagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgctcctt-cttgctaagttacgtaccc 23376329  T
Q  254 acttagacttt 264  Q
    |||||||||||    
T  23376330 acttagacttt 23376340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 13571061 - 13571251
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13571061 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcacctt 13571160  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | || | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  13571161 ataatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 13571251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18362164 - 18361962
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18362164 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18362065  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18362064 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctaaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18361967  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18361966 acttt 18361962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27413035 - 27412833
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  27413035 aagaacacacaaagagttatagtggttcacctaatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctatca 27412936  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  27412935 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 27412838  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  27412837 acttt 27412833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 34129871 - 34130061
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34129871 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcgtcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 34129970  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||   ||||||| ||||| |  |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  34129971 acaatttttgttcacctgaacaactacaatta-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 34130061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 27578525 - 27578728
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  27578525 aagaacgcacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctta 27578624  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||| ||| |||| || |  |||||||| |||||||    
T  27578625 aatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaac-cctgtattctctaagcctcagcagacttgcacc-ttgttactaagttatccactta 27578722  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  27578723 gacttt 27578728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 8764539 - 8764741
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8764539 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatatgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 8764638  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||    
T  8764639 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaatcacttag 8764736  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  8764737 acttt 8764741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 11410283 - 11410485
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  11410283 aagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagatgacctctca 11410382  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11410383 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 11410480  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  11410481 acttt 11410485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 37298196 - 37298386
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  37298196 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaactctcaaatcatgcacctt 37298295  T
Q  173 ac-aaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || ||| ||||||| ||||| ||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | | ||||||| |||||||||||||    
T  37298296 acaaactttgttcacctgaacagttataa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttattgataagttaaccacttagacttt 37298386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31917683 - 31917496
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac- 174  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31917683 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccaatcctcacaatcttgtgagagttgccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 31917584  T
Q  175 aaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  31917583 aactttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 31917496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 20904001 - 20904108
Alignment:
Q  69 caaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgca 168  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20904001 caaaaagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatccttca 20904100  T
Q  169 ccttacaa 176  Q
    ||||||||    
T  20904101 ccttacaa 20904108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 260
Target Start/End: Original strand, 204850 - 205034
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| || || ||||||||||    
T  204850 tttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgttgcttgagataatctcttaattcttgcaccttac 204949  T
Q  175 aa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    || | ||||||  || || | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  204950 aatctttgttctccttaacatttacaa-ttttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 205034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20808109 - 20807921
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| ||||||  | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20808109 tttatagtggttcctcgaatgtgggttagtccactcctcacactcttgtgagagtttccaccatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttag 20808010  T
Q  175 aacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || || | |||| ||||| | ||||||    | |||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20808009 aatctgtattcacctgaacacttacaa-ttctatattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20807921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22245495 - 22245295
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22245495 aacacacacaaatttatagtggttcccccaatgcgggttagtcaattcctcacaatcttatgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 22245396  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    | ||||||||||||  | || ||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  22245395 catgcaccttacaatatgtgctcacctgaacacttac-acctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-atgttgctaagttaaccacttagac 22245298  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  22245297 ttt 22245295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 42089887 - 42090078
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtcca---ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacc 170  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  42089887 atttatagtggttcccccgatgtgggttagtccagcactcctcacaatcttgtgagagtttccact-tgatgcttgagataacctcttaaatcctgcact 42089985  T
Q  171 ttaca-accttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||||  | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  42089986 ttacagtctttgttcacctgaacacttacaatta-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 42090078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29958833 - 29958777
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29958833 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 29958777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 15321142 - 15321198
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15321142 tggttcacccaacttgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 15321198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 15330145 - 15330201
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15330145 tggttcacccaacttgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 15330201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18708612 - 18708556
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18708612 tggttcacccaacttgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 18708556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18717626 - 18717570
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18717626 tggttcacccaacttgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 18717570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 22907965 - 22908177
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22907965 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgcttgagataacttct 22908064  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22908065 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgattaattacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 22908164  T
Q  258 agactttacacct 270  Q
    |||||||||||||    
T  22908165 agactttacacct 22908177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 27159094 - 27159306
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27159094 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 27159193  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27159194 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 27159293  T
Q  258 agactttacacct 270  Q
    |||||||||||||    
T  27159294 agactttacacct 27159306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 27169442 - 27169654
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27169442 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 27169541  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27169542 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 27169641  T
Q  258 agactttacacct 270  Q
    |||||||||||||    
T  27169642 agactttacacct 27169654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19343205 - 19342985
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  19343205 agaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagatttttgactatgatgatttagataacttct 19343106  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19343105 caaatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 19343006  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  19343005 agactttacacctttctgctc 19342985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22903029 - 22902817
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903029 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 22902930  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  22902929 caaatcatacacattacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactatattctcttagcctcaacaggtttacacctttcttactaagttacctactt 22902830  T
Q  258 agactttacacct 270  Q
    |||||||||||||    
T  22902829 agactttacacct 22902817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 92 - 278
Target Start/End: Original strand, 15474683 - 15474869
Alignment:
Q  92 aatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaa 191  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  15474683 aatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaatcttgttcacctgaa 15474782  T
Q  192 tagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
     | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15474783 caattacaacaattgtattctctaagccttagcaggattacacttttcttgctaatttacccacttagactttacacctttctgctc 15474869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 32935879 - 32936081
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32935879 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccactatgatgcttgagataacctctca 32935978  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  32935979 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 32936076  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  32936077 acttt 32936081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Original strand, 16901325 - 16901512
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16901325 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatggttgagataacctctcaaatcctgcacttt 16901424  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  16901425 acaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 16901512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 260
Target Start/End: Original strand, 16994716 - 16994903
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16994716 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatggttgagataacctctcaaatcctgcacttt 16994815  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||    
T  16994816 acaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaga 16994903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45191711 - 45191521
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45191711 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 45191612  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  45191611 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 45191521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28451211 - 28451011
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28451211 aacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 28451112  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagac 261  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  28451111 cctgcaccttacaatctgtgttcacatgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagac 28451014  T
Q  262 ttt 264  Q
    |||    
T  28451013 ttt 28451011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4459249 - 4459062
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  4459249 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 4459150  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4459149 atctttgttcacctgaacaattacaatca-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 4459062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 2997789 - 2997991
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2997789 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 2997888  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  2997889 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 2997986  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  2997987 acttt 2997991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18652105 - 18651903
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18652105 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18652006  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18652005 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18651908  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18651907 acttt 18651903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18664223 - 18664021
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18664223 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18664124  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18664123 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 18664026  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  18664025 acttt 18664021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4468874 - 4468687
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  4468874 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 4468775  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4468774 atctttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 4468687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 5345822 - 5346009
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5345822 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 5345921  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||| ||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5345922 atcttcgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 5346009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 38929616 - 38929803
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38929616 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 38929715  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  38929716 atctttgttcacctgaacaattacaac-tttgtattctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 38929803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 3604751 - 3604941
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3604751 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcccgcacctt 3604850  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  |  ||||| ||||| | |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  3604851 acaatatgcgttcacctgaacacttacaac-tttgtattctctaagcctcagcaagcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 3604941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 9501852 - 9502054
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9501852 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 9501951  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||    
T  9501952 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaatcacttag 9502049  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  9502050 acttt 9502054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 9513218 - 9513420
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9513218 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 9513317  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||    
T  9513318 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaatcacttag 9513415  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  9513416 acttt 9513420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17489577 - 17489375
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17489577 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 17489478  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  17489477 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctatattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 17489380  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  17489379 acttt 17489375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 22678855 - 22679045
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22678855 aatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 22678954  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22678955 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 22679045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 260
Target Start/End: Original strand, 69263 - 69464
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || | ||||||| ||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  69263 agaagaacacacagagatttatagtggtttatccaatgttggctagtccactcctcacaatcttgtgagaatttcaactatgatgtttgagataacctct 69362  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| ||||||||| ||  || |||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  69363 caaatcatgcaccttaaaatattattcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttactaagttacccactt 69461  T
Q  258 aga 260  Q
    |||    
T  69462 aga 69464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 5335970 - 5336157
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5335970 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 5336069  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||| ||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5336070 atcttcgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 5336157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29424224 - 29424037
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  29424224 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcatgcaccttaca 29424125  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29424124 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtactctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 29424037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 41026013 - 41026201
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41026013 ttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcttcacaatcttgcgagagtttccatcatgatgcttgagacaacctctcaaatcctgcaccttaca 41026112  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| || || | ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41026113 atctttgttcacctaaacaattatatcaattgtattctctaagcctcatcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccacttagacttt 41026201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 264
Target Start/End: Original strand, 22671731 - 22671905
Alignment:
Q  89 cccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcatc 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  22671731 cccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacc 22671830  T
Q  188 tgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  22671831 tgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 22671905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21110080 - 21109898
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa-cctt 180  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||    
T  21110080 tggttcacccaatgtggactagtccactcctcgcaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatcttt 21109981  T
Q  181 gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| ||||| | ||||||||  | |||||||| || |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  21109980 gttcaactgaacaattacaacacatatattctctaagtctcagcaggcttgcacc-ttcttgttaagttacccacttagacttt 21109898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45015584 - 45015397
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45015584 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 45015485  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  45015484 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcttcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 45015397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Original strand, 37862223 - 37862401
Alignment:
Q  77 tataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa 176  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  37862223 tatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaa 37862322  T
Q  177 -ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
     | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  37862323 tcattgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttt-ttgctaagttaaccact 37862401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 44637770 - 44637951
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-t 180  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |    
T  44637770 tggttcccccaatgtgggttagcccactcctcacaatcttgtgagagtttccactttgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaccatctgt 44637869  T
Q  181 gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||| ||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  44637870 gatcacctgaacacttacaac-actgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 44637951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12571452 - 12571281
Alignment:
Q  92 aatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcatctga 190  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| || |    
T  12571452 aatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctatgttcacctaa 12571353  T
Q  191 atagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  12571352 acacttacaatta-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 12571281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 38956958 - 38957145
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38956958 ttatagtggttcatccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 38957057  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||| |||||    
T  38957058 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaaacttt 38957145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 24695693 - 24695877
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24695693 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactc---acaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 24695789  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  24695790 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 24695877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 238
Target Start/End: Original strand, 40408122 - 40408288
Alignment:
Q  71 aaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacc 170  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  40408122 aaaatttatagtggtttattcaatgtggtctagtccactcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgtttgagataacctctcaactcctgcacc 40408221  T
Q  171 ttacaaccttgtt-catctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacaccttt 238  Q
    ||||||| ||||| | |  ||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    
T  40408222 ttacaactttgttcccttggaataattacaaca--tgtattctctaagcttcagtaggcttacaacttt 40408288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22146627 - 22146542
Alignment:
Q  99 gttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttc 184  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || | |||||| ||||||    
T  22146627 gttaatccacttctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgcttgagataatctctcaactcctacatcgtacaacattgttc 22146542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38461369 - 38461270
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| ||||||| ||||||||   || ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  38461369 ttatattggttcatccaatgtggactaatccactcctcacaac--tgtgagagtttccactatgatgcttgagacaaccttctcaactcttgcaccttac 38461272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22635057 - 22635001
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22635057 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 22635001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41896459 - 41896403
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41896459 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatacttgtgagattttccacta 41896403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37488839 - 37488798
Alignment:
Q  121 tgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  37488839 tgtgagattttccaatatgatgcttgagagatcttctcaaat 37488798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 26361511 - 26361731
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26361511 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttaagataacttct 26361610  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26361611 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgagcaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 26361710  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  26361711 agactttacacctttctgctc 26361731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 53 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14438318 - 14438101
Alignment:
Q  53 agaagagaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa 152  Q
    |||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14438318 agaaaagaggaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgctttagatat 14438219  T
Q  153 cttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacc 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14438218 cttctcaaatccttcaccttacaaccttgttcacctgatcaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacc 14438119  T
Q  253 cacttagactttacacct 270  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14438118 cacttagactttacacct 14438101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13675647 - 13675445
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13675647 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 13675548  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  13675547 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 13675450  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  13675449 acttt 13675445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 21986923 - 21987125
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21986923 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 21987022  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21987023 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21987120  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21987121 acttt 21987125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 21996457 - 21996659
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21996457 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 21996556  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21996557 aatcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21996654  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21996655 acttt 21996659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 14893222 - 14893412
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14893222 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacacctt 14893321  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  14893322 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-tactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 14893412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 9324208 - 9324410
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9324208 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 9324307  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  9324308 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 9324405  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  9324406 acttt 9324410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 14880872 - 14881062
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14880872 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcacctt 14880971  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||| |||||    
T  14880972 acaatctttgttcacctgaacaattacaatta-tgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttaaacttt 14881062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 20530058 - 20530248
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20530058 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacctatcaaatcctgcacctt 20530157  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||  ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20530158 acaatctttgttctcctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcaacaggcttacacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20530248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 21202008 - 21202210
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21202008 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 21202107  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21202108 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21202205  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21202206 acttt 21202210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 21212424 - 21212626
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21212424 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 21212523  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21212524 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21212621  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21212622 acttt 21212626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21335185 - 21334983
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21335185 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 21335086  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21335085 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 21334988  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  21334987 acttt 21334983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 31990839 - 31991029
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31990839 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatctt 31990938  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| || |||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  31990939 acaatctctgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 31991029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 31998428 - 31998618
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31998428 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatctt 31998527  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | |||||||  |||| | ||||||    |||||||||| |||||| |||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  31998528 acaatctttgttcacatgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 31998618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 2689455 - 2689659
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2689455 aagaacacacaaagatttatagtggctcgcccaatgtgggctagtccacttctcacaatcttgtgaaagtttccactattatgcttgagataacctctca 2689554  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| | ||||||||  ||| |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  2689555 aatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaacacatgtattctctaatcctcagcatacttgcacc-ttcttgctcagttacccactta 2689653  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  2689654 gacttt 2689659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 33773315 - 33773503
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33773315 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 33773414  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| |||||||||   ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  33773415 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagc--tcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 33773503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 12840640 - 12840752
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  12840640 aaatttatagtggttcacccaatgtgggttaatccactcctcacaatcttgtgagaatttccattatgatgcttgagataccctctcaaatcctgtacct 12840739  T
Q  172 tacaaccttgttc 184  Q
    |||||||||||||    
T  12840740 tacaaccttgttc 12840752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3988399 - 3988296
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3988399 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 3988300  T
Q  160 aatc 163  Q
    ||||    
T  3988299 aatc 3988296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Original strand, 23014227 - 23014408
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-t 180  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  23014227 tggttcccccaacgtgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgt 23014326  T
Q  181 gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| ||||| | ||||||    |||||||| | ||||||| ||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  23014327 gttcacctgaacacttacaa-ttctgtattctttaagcctcaacaggcttgcaccttgct-gttaagttaaccacttagacttt 23014408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 11429657 - 11429846
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11429657 atttatagtggttcccccaaggtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaccactcaaatcctgcacctta 11429756  T
Q  174 caacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||  | || ||| ||||| |||| | |||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||  | | ||||||||  |||||||||||||    
T  11429757 caatttgtgctcacctgaacagttgc-acatctgtattctctaagcctcagcaagcttgcacc-atgttgctaagttgaccacttagacttt 11429846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Original strand, 12900498 - 12900592
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacc 170  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12900498 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcacc 12900592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6760676 - 6760589
Alignment:
Q  89 cccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  6760676 cccaatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcatgcactttacaa 6760589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21461976 - 21461892
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21461976 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaa 21461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18537525 - 18537438
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaa 160  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18537525 aatttatagtggttcatccaatgtgggttaatccactcctcacaatcttgtgagaatttccactataatgcttgaaataacctctcaa 18537438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37817892 - 37817815
Alignment:
Q  106 cactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttc 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||    
T  37817892 cactcctcacaatcttctgagattttc-actatgatgcttgagataactttttaactcctgcatcgtacaaccttgttc 37817815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20852253 - 20852168
Alignment:
Q  179 ttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20852253 ttgttcacctgaaaaattacaacacctatattctccaagcctcagcaggcttacacttttcttgctaagttacccacttagacttt 20852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17269605 - 17269564
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17269605 atttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 17269564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 45489579 - 45489635
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45489579 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatgcttgtgagattttccacta 45489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 45498537 - 45498593
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45498537 tggttcacccaacgtgggttagtccagtccccacaatgcttgtgagattttccacta 45498593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 13284879 - 13285091
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284879 agaagaacacacagaaatttataatggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 13284978  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  13284979 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgatcagttacccactt 13285078  T
Q  258 agactttacacct 270  Q
    |||||||||||||    
T  13285079 agactttacacct 13285091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41028489 - 41028279
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41028489 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 41028390  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41028389 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaacagtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 41028290  T
Q  258 agactttacac 268  Q
    |||||||||||    
T  41028289 agactttacac 41028279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 5614625 - 5614846
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5614625 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 5614724  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5614725 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagtaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 5614824  T
Q  258 agac-tttacacctctctgctc 278  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  5614825 agacttttacacctttctgctc 5614846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Original strand, 12826550 - 12826770
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12826550 agaagaacacatagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 12826649  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12826650 caaatcttgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctcttagcctcagcaggattacacctttcttgctaagttacccactt 12826749  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  12826750 agactttacacctttctgctc 12826770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31825608 - 31825388
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31825608 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaattttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 31825509  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31825508 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaataactgtattctcttagccacagcaagcttacacctttcttgctaagttaaccactt 31825409  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  31825408 agactttacacctttctgctc 31825388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 58 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42596272 - 42596052
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42596272 agaagaacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtcagtctactcctcacagttttgtgagatttttcactatgatgcttgagataacttct 42596173  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42596172 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacgtgaacaattacaacaactgtattctcttagccttagtaggcttacacctttcttgctaagttacccactt 42596073  T
Q  258 agactttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  42596072 agactttacacctttctgctc 42596052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27989981 - 27989777
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27989981 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgcgttagtccactcctcacaatctcgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 27989882  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||    
T  27989881 aatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccactta 27989783  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  27989782 gacttt 27989777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 260
Target Start/End: Original strand, 15987838 - 15988038
Alignment:
Q  59 gaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctc 158  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15987838 gaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgagctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgtttgagataacctctc 15987937  T
Q  159 aaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  15987938 aaatcctgcaccttacaatgttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctaagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccactta 15988036  T
Q  259 ga 260  Q
    ||    
T  15988037 ga 15988038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 24539652 - 24539843
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24539652 aatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 24539751  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  24539752 acaatccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 24539843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15374592 - 15374388
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15374592 aagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 15374493  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | || | ||||||||| |||||||    
T  15374492 aatcctgcaccttacaatccttgttcacttgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgca-cattgttgctaagttaaccactta 15374394  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  15374393 gacttt 15374388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12088215 - 12088061
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12088215 agaagaacacacaaaaatttatagcggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccaataagatgcttgagataacttct 12088116  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12088115 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattct 12088061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14946998 - 14946795
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14946998 aagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 14946899  T
Q  160 aatcctgcaccttac-aaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| ||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||||||    
T  14946898 aatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaattacaac-cttgtattctctaagcctcagcaggcttgca-ctttgttgctaagttaaccactta 14946801  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  14946800 gacttt 14946795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9007834 - 9007630
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9007834 agaataacacacaaagatttatagtggttcatccaatgtgggccagtccactcctcacaatcttgagagagtttccactatgatgcttgagataacctct 9007735  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||    
T  9007734 caaatcatgcacatgacaaccttgttcagttgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgttaagttacccactt 9007636  T
Q  258 agactt 263  Q
    ||||||    
T  9007635 agactt 9007630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Original strand, 14247678 - 14247880
Alignment:
Q  62 gaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaa 161  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14247678 gaacacacaaatatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttttgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaa 14247777  T
Q  162 tcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  |||| | ||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  14247778 tcctgcaccttacaatctttgttcacttgaacaattacaacacctgaattctctaagcatcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagatacccacttaga 14247876  T
Q  261 cttt 264  Q
    ||||    
T  14247877 cttt 14247880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 5380987 - 5381189
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5380987 aagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 5381086  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  5381087 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 5381184  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  5381185 acttt 5381189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 5390625 - 5390827
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5390625 aagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 5390724  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  5390725 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 5390822  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  5390823 acttt 5390827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12770954 - 12770767
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12770954 ttatagtggttcacccgacatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttaca 12770855  T
Q  176 accttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12770854 accttgttcacctgaacagttacaacacctatattctctaagcctcaaca-acttacacttttcttgctaagttacccacttaaacttt 12770767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26304442 - 26304240
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26304442 aagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 26304343  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26304342 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 26304245  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  26304244 acttt 26304240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 26362376 - 26362578
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26362376 aagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 26362475  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26362476 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 26362573  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  26362574 acttt 26362578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 264
Target Start/End: Original strand, 9534406 - 9534615
Alignment:
Q  53 agaagagaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa 152  Q
    |||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9534406 agaagaaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataa 9534505  T
Q  153 cttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacc 252  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |    
T  9534506 cctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaac 9534603  T
Q  253 cacttagacttt 264  Q
    ||||||||||||    
T  9534604 cacttagacttt 9534615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5928022 - 5927820
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5928022 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 5927923  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  5927922 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 5927825  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  5927824 acttt 5927820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6535371 - 6535169
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6535371 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 6535272  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6535271 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 6535174  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6535173 acttt 6535169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6545692 - 6545490
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6545692 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 6545593  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  6545592 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 6545495  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6545494 acttt 6545490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8501936 - 8501734
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8501936 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 8501837  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8501836 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 8501739  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  8501738 acttt 8501734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8512406 - 8512204
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8512406 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 8512307  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  8512306 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 8512209  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  8512208 acttt 8512204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 11625539 - 11625741
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11625539 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 11625638  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  11625639 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 11625736  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  11625737 acttt 11625741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 16131089 - 16131291
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16131089 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16131188  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16131189 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16131286  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16131287 acttt 16131291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 16141638 - 16141840
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16141638 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 16141737  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16141738 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 16141835  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  16141836 acttt 16141840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19800974 - 19800784
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19800974 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatctt 19800875  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19800874 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 19800784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26308002 - 26307800
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26308002 aagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 26307903  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| || || | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  26307902 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctaaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 26307805  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  26307804 acttt 26307800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44898185 - 44897983
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44898185 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 44898086  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  44898085 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 44897988  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  44897987 acttt 44897983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44908610 - 44908408
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44908610 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 44908511  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  44908510 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 44908413  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  44908412 acttt 44908408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46498001 - 46497799
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46498001 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 46497902  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  46497901 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 46497804  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  46497803 acttt 46497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46508613 - 46508411
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46508613 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 46508514  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  46508513 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 46508416  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  46508415 acttt 46508411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 264
Target Start/End: Original strand, 9544689 - 9544898
Alignment:
Q  53 agaagagaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa 152  Q
    |||||| |||||||| || | | ||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9544689 agaagaaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataa 9544788  T
Q  153 cttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacc 252  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |    
T  9544789 cctctcaagtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaac 9544886  T
Q  253 cacttagacttt 264  Q
    ||||||||||||    
T  9544887 cacttagacttt 9544898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43984531 - 43984344
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  43984531 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccataca 43984432  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||| ||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43984431 atcttcgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 43984344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32099267 - 32099065
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  32099267 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaaaatgcttgagataacctctca 32099168  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  32099167 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 32099070  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  32099069 acttt 32099065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32109704 - 32109506
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32109704 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 32109605  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  32109604 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 32109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45554431 - 45554241
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45554431 aatttatagtggttcccccaatgtaggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 45554332  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||||||| || |||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  45554331 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctgtattctctaagtctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 45554241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42621963 - 42621776
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42621963 ttatagtggttcacccaacgtgtgctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 42621864  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||||||||| | | |||||   |||||||||| ||||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  42621863 atctttgttcatctgaacaataacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgca-ctttgttgctaagttaaccacttagacttt 42621776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10416858 - 10416668
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10416858 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcacctt 10416759  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   | |||||||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  10416758 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctatattctctaagcctcagcagtcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 10416668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19586621 - 19586431
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19586621 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacattcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcatgcacctt 19586522  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19586521 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 19586431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12575056 - 12574917
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12575056 atttataatggttcccccaatgtgggttactccactcctcacgatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcacttta 12574957  T
Q  174 caaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctc 213  Q
    ||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12574956 caatcttgttcacctgaacaattacatcaactgtattctc 12574917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 260
Target Start/End: Original strand, 2991063 - 2991261
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2991063 aagaacacactaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatattgtgagaatttccactatgattcttgagataacctctca 2991162  T
Q  160 aatcctgcaccttacaacc-ttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||  |||| | ||| ||||  |||||  ||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  2991163 aatcctacactttacaacctttgttcacttgaacaattataacacctgtat--tctaagcctcagcaggcttgca-cattcttgctaagttacccactta 2991259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 7018580 - 7018695
Alignment:
Q  61 agaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaa 160  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7018580 agaacacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataacctctcaa 7018679  T
Q  161 atcctgcaccttacaa 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  7018680 atcctgcaccttacaa 7018695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 7033942 - 7034057
Alignment:
Q  61 agaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaa 160  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7033942 agaacacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataacctctcaa 7034041  T
Q  161 atcctgcaccttacaa 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  7034042 atcctgcaccttacaa 7034057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13130708 - 13130608
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13130708 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 13130609  T
Q  176 a 176  Q
    |    
T  13130608 a 13130608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8341090 - 8340954
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8341090 aacacacaaatatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcc--acaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 8340993  T
Q  163 cctgcaccttacaacct-tgttcatctgaatagttacaa 200  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||    
T  8340992 cctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 8340954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12516136 - 12516019
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||    
T  12516136 atttatagtggttcccccaatgtgggttactccactcctcacgatcttgtgagagttcccactatgatgtttaagataacctctcaaatcccgcacttta 12516037  T
Q  174 caaccttgttcatctgaa 191  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  12516036 caatcttgttcacctgaa 12516019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40703399 - 40703320
Alignment:
Q  105 ccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  40703399 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccgaacaaccttgttc 40703320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12492331 - 12492220
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||    
T  12492331 atttatagtggttcctccaatgtgggttactccactcctcacgatcttgtgagagttcctactatgatgtttgagataacctttcaaattctgcacttta 12492232  T
Q  174 caaccttgttca 185  Q
    ||| ||||||||    
T  12492231 caatcttgttca 12492220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 40703643 - 40703578
Alignment:
Q  105 ccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacc 170  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40703643 ccacccctcacaatcctgtaagaatttccactatgatgcttgagataacttctcaattcctgcacc 40703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40703246 - 40703164
Alignment:
Q  105 ccactcctcacaatcttgtgagattttccactatga---tgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttc 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  40703246 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgttgcttgagataacctctcaactctagcaccgaacaaccttgttc 40703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 184
Target Start/End: Original strand, 11605501 - 11605609
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagatt-ttccactatgatgcttgagataactt-ctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||| ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||   ||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  11605501 ttatagtggttcatccaatgtggactagtccactcttcacaac--tgtgagagtgttccactctaatgcttgagacaactttctcaactcctgcacctta 11605598  T
Q  174 caaccttgttc 184  Q
    |||| ||||||    
T  11605599 caactttgttc 11605609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 109 - 278
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
Q  109 tcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgta 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  1 tcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacaactgta 100  T
Q  209 ttctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagactttacacctctctgctc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  101 ttctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatacctttctgctc 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Original strand, 39749 - 39967
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39749 aagaacacgcagaaacttatagtggttcacccaatgtgggttagtccccttctcacaatcttgtgagtttttccacgatgatgcttgagataacttctca 39848  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || | |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39849 aatcacgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaataactatattctctaagcctcaacatgcttacacctttcttgctaagttacccacttag 39948  T
Q  260 actttacacctctctgctc 278  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  39949 actttacacctttctgctc 39967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 6189 - 6393
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6189 aagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctca 6288  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6289 aatcctacaccttacaaccttgttcacctgaacaattacaacacctgtattctcaaaacctcagcaggcttacacttttcttgctaagttacccacttag 6388  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  6389 acttt 6393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 20250 - 20439
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20250 tttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttac 20349  T
Q  175 aa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  20350 aatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 20439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Original strand, 2484 - 2689
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2484 agaagaacacacaaagatttatagtggttcattcaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctct 2583  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  2584 caaatcctgcaccttacaatgttgttcaactgaacaattacatcaactgtattctctaagcctcagcaggattgcacc-ttcttgctaagtgacccactt 2682  T
Q  258 agacttt 264  Q
    |||||||    
T  2683 agacttt 2689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19857 - 19725
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857 agaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 19758  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctga 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19757 caaatcctgcaccttacaaccttgttcacctga 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 34 - 224
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcacctt 133  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  134 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagtcttt 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 110962 - 111152
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  110962 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagatttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccat 111061  T
Q  173 acaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    |||| | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  111062 acaatctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 111152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 233170 - 233372
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  233170 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 233269  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  233270 agtcctgcaccttacaatcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 233367  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  233368 acttt 233372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 147578 - 147391
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  147578 ttatagtggttcatccaatgtcggttagtccactcctcacaatcttctgagagttattactatgatgtttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 147479  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  147478 atctttgttcaactgaacaattacaatta-tgtattctctaagcctcagcatgcttgcaccttcct-gctaagttaactacttagacttt 147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1839 - 1633
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 agaagaacacacaaagatttatagtggttcactgaatgtgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacttct 1740  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccact 256  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||| | ||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |     
T  1739 caaatcctgcaccttgcaatctttgttcacttgaacaattacagcacatgtattctctaagcttcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttacccgcg 1641  T
Q  257 tagacttt 264  Q
    ||||||||    
T  1640 tagacttt 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 85 - 1
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19644 - 19455
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19644 atttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcctgagataacctctcaaatcctgcacctta 19545  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||| | ||||||| ||||| | ||||||  | |||||||||| |||||||| |||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19544 caatctttgttcacctgaacaattacaatta-tgtattctctaagcctcagtaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 19455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 18544 - 18747
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18544 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 18643  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  18644 agtcccgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaa-tcttgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccactta 18741  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  18742 gacttt 18747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 232 - 45
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  232 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 133  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  132 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 45  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16334 - 16142
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttct 157  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16334 agaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcccctatgatgcttgagataacctct 16235  T
Q  158 caaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttac 251  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| | || |||| ||||||||||    
T  16234 caattcctgcaccttacaatcttgttcagctgaacaagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgctcc-ttcttgctaagttac 16142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Original strand, 7024 - 7226
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7024 aagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctca 7123  T
Q  160 aatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttag 259  Q
    | ||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  7124 agtcctgcaccttacaatcttgttctcctgaacaattac-actcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttag 7221  T
Q  260 acttt 264  Q
    |||||    
T  7222 acttt 7226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12174 - 11975
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12174 aagaacacgcaaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacctctca 12075  T
Q  160 aatcctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaa-tagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactt 257  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||  | |||||  |  |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  12074 aatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacacaacctgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttacacactt 11975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 309217 - 309403
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  309217 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 309316  T
Q  176 accttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  309317 atcttgttcacctgaacaattacaa-tcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcacc-ttcttgctaagttaaccacttagacttt 309403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 217547 - 217344
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctca 159  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  217547 aagaacacacaaatatttatagtggttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagtttcaactatgatacttgagataacctctta 217448  T
Q  160 aatcctgcaccttacaacc-ttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccactta 258  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| | |||||||||| |||| || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  217447 aatcctgcatcttacaacctttgttcacctgaacaattataacca-tgtattctctaagccacaactggcttgcacc-ttcttgctaagttacccactta 217350  T
Q  259 gacttt 264  Q
    ||||||    
T  217349 gacttt 217344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 55510 - 55324
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55510 ttatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 55414  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||  ||||| ||||| | |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55413 atctacgttcacctgaacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttt 55324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 59459 - 59273
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  59459 ttatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 59363  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||  ||||| ||||| | |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  59362 atctacgttcacctgaacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttt 59273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 60887 - 60701
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  60887 ttatattggttcattcaatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 60791  T
Q  176 acctt-gttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | ||  ||||| ||||| | |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60790 atctacgttcacctgaacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttt 60701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 267
Target Start/End: Original strand, 196586 - 196780
Alignment:
Q  75 tttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||    
T  196586 tttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttacactatggtatttgagataccttctcagatccttcactttac 196685  T
Q  175 aaccttgttcatctgaatagttaca-acaattgtattctcttagcctcagcaggcttac-acctttctggctaagttacccacttagactttaca 267  Q
    ||   |||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  196686 aaaaatgttaatctgaacatatacacacaattgtattctctaagcctcggcaggcttgcaaccttcttggctaagttacccacttagactttaca 196780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 189977 - 190028
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtg 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  189977 aatttatagtggttcacccaatatgggttagtccactcctcgcaatcttgtg 190028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9011 - 8847
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9011 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcacctt 8912  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  8911 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctgtattctctaagcctcagcaagcttgcacctt 8847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 55041 - 55228
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  55041 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 55140  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  55141 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcagacttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 55228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 73 - 237
Target Start/End: Original strand, 28207 - 28371
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28207 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacagtcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 28306  T
Q  173 acaacct-tgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||||  | |||||| ||||| | |||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28307 acaatatgtgttcacctgaacacttacaac-tctgtattttctaagcctcagcaggcttgcacctt 28371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 49411 - 49514
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49411 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccacaccttacagtcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 49510  T
Q  173 acaa 176  Q
    ||||    
T  49511 acaa 49514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 73924 - 74111
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  73924 ttatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataatctctcaagtcctgaaccttaca 74023  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  74024 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacc-ttgttgctaagttaaccacttagacttt 74111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8295 - 8131
Alignment:
Q  74 atttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctta 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  8295 atttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttatgagagtttccattatgatgtttgagataacctctcaaatctggcacctta 8196  T
Q  174 caa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctt 237  Q
    ||| |||||||||  |||| | |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8195 caatccttgttcacttgaacaattacacaacatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 8131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 395053 - 395156
Alignment:
Q  73 aatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacctt 172  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  395053 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctggacctt 395152  T
Q  173 acaa 176  Q
    ||||    
T  395153 acaa 395156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Original strand, 92075 - 92262
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  92075 ttatagtggttcacccaacgtgagctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttaca 92174  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | ||||||    |||||||||| |||||||| |||||| |||| || | ||||||||| | |||||||||||    
T  92175 atctttgttcacctgaacaattacaa-ttctgtattctctaagcctcagtaggcttgcacc-ttgttgctaagttaactacttagacttt 92262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1144 - 954
Alignment:
Q  72 aaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcacct 171  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||  | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||    
T  1144 aaatttatagtggttcactcaacgtaggctaatccattcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataccctctcaactcctgcgcct 1045  T
Q  172 tacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||   |||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  1044 tacaatcttgttcacctgaacaattacaacaactatattctgtaagcctcaacaggcttagcactttcttgctaaat--cccacttagacttt 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 30836 - 30932
Alignment:
Q  60 aagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttc 156  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30836 aagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagatnacttc 30932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 201
Target Start/End: Original strand, 1154 - 1280
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  1154 ttatagtggttcacccaacgtgggatagtccactcctaacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctgaagtcctgcatcttaca 1253  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaac 201  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||    
T  1254 atctttgttcacctgaacaattacaac 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 260
Target Start/End: Original strand, 27959 - 28155
Alignment:
Q  63 aacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaat 162  Q
    ||||| |||| ||||||| || |||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  27959 aacacacaaagatttatagtgcttcatccaatttgggctagtccactcctcgcaatcttgtcagagtttccactatgatgcttgacataacccttcaaat 28058  T
Q  163 cctgcaccttacaa-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttaga 260  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||| || |||||||   |||||||| | |||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28059 cctgcatcttacaatctttgttcacctgagtaattacaac-cctgtattctttaagcctcagtaggctcgcacc-ttcttgctaagttacccacttaga 28155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 176
Target Start/End: Original strand, 209 - 303
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaa 176  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  209 tggttcacccaacgtgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcatcttacaa 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8982 - 8795
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttaca 175  Q
    ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8982 ttatagtggttcacccaacgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatggtgtttgagataacctctcaagtcctgcacctcaca 8883  T
Q  176 a-ccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaagttacccacttagacttt 264  Q
    | | ||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| |||||||| || ||| |||| || | ||||||||| | |||||||||||    
T  8882 atctttgttcacctgaacaattacaac-tctgtattctctaagcctcagaagacttgcacc-ttgttgctaagttaactacttagacttt 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 67108 - 67012
Alignment:
Q  58 agaagaacacgcaaaaatttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataact 154  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  67108 agaagaacacgcataaatatatagtggttcactcaatgtgggttagtacactcctcacaatcttgtgagaattttcactatgatgcttcagataact 67012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 66346 - 66228
Alignment:
Q  147 agataacttctcaaatcctgcaccttacaaccttgttcatctgaatagttacaacaattgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttctggctaa 246  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  | || | |||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| |  | | |||||    
T  66346 agataacctctcaaattctgcaccttacaatcttgttcacttaaacaattacaataattgtattctctaagactcatcaggcttacaaccattttgctaa 66247  T
Q  247 gttacccacttagacttta 265  Q
    |||||||||||||||||||    
T  66246 gttacccacttagacttta 66228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 175
Target Start/End: Original strand, 2000 - 2097
Alignment:
Q  76 ttataatggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataa-cttctcaaatcctgcaccttac 174  Q
    ||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||   |||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  2000 ttatagtggttcatctaatgtgggttattccactcctcacaa--ctgtgagatgtt-cactatgatccttgagacaaccttctcaactcatgcaccttac 2096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5043 - 4987
Alignment:
Q  82 tggttcacccaatgtgagttagtccactcctcacaat-cttgtgagattttccacta 137  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  5043 tggttcacccaatgtgggttaatccagtccccacaatacttatgagattttccacta 4987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University