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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF10164_low_5 (Length: 365)
Name: NF10164_low_5
Description: NF10164
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10164_low_5 |
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 360
Target Start/End: Original strand, 18535302 - 18535646
Alignment:
| Q |
17 |
acttataaagcattatgtgtatatacataagttaaaatatttattgtttattatttgagaatcatgatttatgaaataatgaa-taatttgtttcttaaa |
115 |
Q |
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| T |
18535302 |
acttataaagcattatgtgtatatacataagttaaaatatttattgtttattatttgagaatcatgatttatgaaataatgaagtaatttgtttctcaaa |
18535401 |
T |
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| Q |
116 |
acgtgttgaattgcgagagattgttctagatgatacaaatgaatagctttaggccttttgactttaaatatcatgtatgacttttaaccaccattatagc |
215 |
Q |
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| T |
18535402 |
acgtgttgaattgcgagagattgttctagatgatacaaatgaatagctttaggcctagtgactttaaatatcatgtatgacttttaaccacctttatagc |
18535501 |
T |
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| Q |
216 |
aaatacaggtttgtggtataaaaataaggattggactattctaattgtttttgagatatggattctagacttggttgataatttttataaatatttattt |
315 |
Q |
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| T |
18535502 |
aaatacaggtttgtggtataaaaataaggattggactattctaattgtttttgagatatggattctagacttggttgataatttttataaagatttattt |
18535601 |
T |
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| Q |
316 |
cttttattttggaaaagcattgattttagattctcctttgcttct |
360 |
Q |
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| T |
18535602 |
cttttattttggaaaagcattgattttagattctcttttgcttct |
18535646 |
T |
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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Original strand, 18538660 - 18538997
Alignment:
| Q |
17 |
acttataaagcattatgtgtatatacataagttaaaatatttattgtttattatttgagaatcatgatttatgaaataatgaa-taatttgtttcttaaa |
115 |
Q |
| |
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| T |
18538660 |
acttataaagcattatgtgtatatacataagttaaaatatttattgtttattatttgagaatcatgatttatgaaataatgaagtaatttgtttctcaaa |
18538759 |
T |
|
| Q |
116 |
acgtgttgaattgcgagagattgttctagatgatacaaatgaatagctttaggccttttgactttaaatatcatg---tatgacttttaaccaccattat |
212 |
Q |
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| T |
18538760 |
acgtgttgaattgcgagagattgttctagatgatacaaatgaatagctttaggcctagtgactttaaatatcatgcagtatgacttttaaccaccattat |
18538859 |
T |
|
| Q |
213 |
agcaaatacaggtttgtggtataaaaataaggattggactattctaattgtttttgagatatggattctagacttggttgataatttttataaatattta |
312 |
Q |
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| T |
18538860 |
agcaaatacaggtttctagtgtaaaaataaggattggactattctaattgtttttgagatatggattctagacttggttgtttatttttataaagattta |
18538959 |
T |
|
| Q |
313 |
tttcttttattttggaaaagcattgattttagattctc |
350 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18538960 |
tttcttttattttggaaaagcattgattttagattctc |
18538997 |
T |
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