View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10173_low_12 (Length: 277)
Name: NF10173_low_12
Description: NF10173
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10173_low_12 |
 | |
|
| [»] scaffold0129 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23717490 - 23717240
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717490 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
23717391 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717390 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
23717291 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717290 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
23717240 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32742469 - 32742219
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742469 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
32742370 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742369 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
32742270 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742269 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
32742219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 35216381 - 35216631
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216381 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
35216480 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216481 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
35216580 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216581 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
35216631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 38223137 - 38223387
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223137 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
38223236 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223237 |
taattttgcagaaggcaagagatacaacgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
38223336 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223337 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
38223387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9313812 - 9313562
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9313812 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcataggagaat |
9313713 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9313712 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcactg |
9313613 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9313612 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
9313562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 42988917 - 42989167
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42988917 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
42989016 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42989017 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaacttctgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
42989116 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42989117 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgagtctgttgatgt |
42989167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 3522637 - 3522887
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522637 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
3522736 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522737 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
3522836 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522837 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
3522887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10269458 - 10269208
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10269458 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
10269359 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10269358 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
10269259 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10269258 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
10269208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 335526 - 335776
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
335526 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
335625 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
335626 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
335725 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
335726 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgttgatgt |
335776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 14218938 - 14219188
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218938 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
14219037 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219038 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
14219137 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219138 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
14219188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30704355 - 30704105
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704355 |
gagatcaaaagacacaaaccaacaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
30704256 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704255 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacatgatggcttgggaaattcaagcaccg |
30704156 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704155 |
acatggcataaagtcatttcatcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
30704105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 14677105 - 14677355
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677105 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
14677204 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677205 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
14677304 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677305 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
14677355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 45106864 - 45107114
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45106864 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
45106963 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45106964 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
45107063 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45107064 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
45107114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1085843 - 1085593
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
1085843 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
1085744 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1085743 |
taattttgtagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
1085644 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1085643 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
1085593 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21395672 - 21395911
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395672 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
21395771 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395772 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
21395871 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtggg |
251 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395872 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtggg |
21395911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17195628 - 17195378
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17195628 |
gagatcaaaagacacaaacaagcaaaatatcctgatatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
17195529 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17195528 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctgtacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
17195429 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17195428 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
17195378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 10485419 - 10485669
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485419 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacgtggagaaggttgtttatgagtggtttttacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
10485518 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485519 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatgacttgggaaattcaagcaccg |
10485618 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485619 |
acatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
10485669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49550345 - 49550095
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49550345 |
gagatcaaaagacacaaaccaataaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
49550246 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
49550245 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
49550146 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
49550145 |
acatggcataaagtcatttcatccttttggcgagagtgggtctattgatgt |
49550095 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Original strand, 5926523 - 5926651
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5926523 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
5926622 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatg |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926623 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatg |
5926651 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27182599 - 27182471
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182599 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
27182500 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatg |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182499 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatg |
27182471 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44553551 - 44553301
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553551 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
44553452 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553451 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
44553352 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553351 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
44553301 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38518413 - 38518163
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518413 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
38518314 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518313 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
38518214 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518213 |
acatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
38518163 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 34945539 - 34945789
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945539 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaatgttgtttatgagtggtttctacaacatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
34945638 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945639 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgcaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
34945738 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945739 |
acatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
34945789 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27644649 - 27644504
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27644649 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatattacaggagaat |
27644550 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctca |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27644549 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctca |
27644504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Original strand, 20394852 - 20394982
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394852 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
20394951 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaa |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394952 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaa |
20394982 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16642075 - 16641825
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16642075 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
16641976 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16641975 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
16641876 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16641875 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
16641825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 41773878 - 41774128
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41773878 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
41773977 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41773978 |
taattttgtagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
41774077 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41774078 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
41774128 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 2026645 - 2026895
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2026645 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
2026744 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2026745 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
2026844 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2026845 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttgtcgagagtgggtctgttgatgt |
2026895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37039010 - 37038760
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37039010 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
37038911 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37038910 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
37038811 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37038810 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttgacgagagtgggtctgttgatgt |
37038760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 43488038 - 43488288
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43488038 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaagttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
43488137 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43488138 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
43488237 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43488238 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
43488288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 23415631 - 23415881
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23415631 |
gagatcaaaagacacaaaccagtaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatttcacaggagaat |
23415730 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23415731 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
23415830 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23415831 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
23415881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 3615254 - 3615504
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3615254 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacaacatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
3615353 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3615354 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttataccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
3615453 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3615454 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttgacgagagtgggtctgttgatgt |
3615504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 2272550 - 2272800
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2272550 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
2272649 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2272650 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
2272749 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2272750 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgttgatgt |
2272800 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 3534864 - 3535114
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3534864 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
3534963 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3534964 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
3535063 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3535064 |
acatggcataaagttatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
3535114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Original strand, 12532924 - 12533175
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaa-ccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaa |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12532924 |
gagatcaaaagacacaaaaccagcaaaatatcctgacaaggagaatgttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaa |
12533023 |
T |
|
| Q |
111 |
ttaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcacc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12533024 |
ttaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcacc |
12533123 |
T |
|
| Q |
211 |
gacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12533124 |
gacatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
12533175 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7356764 - 7356517
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7356764 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgttt--gagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
7356667 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7356666 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttggg-aattcaagcaccg |
7356568 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7356567 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtttgttgatgt |
7356517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0129 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:
Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39320 - 39070
Alignment:
| Q |
12 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39320 |
gagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaggagaat |
39221 |
T |
|
| Q |
112 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtactctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaagcaccg |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39220 |
taattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacatgatggcttgggaaattcaagcaccg |
39121 |
T |
|
| Q |
212 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39120 |
acatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctattgatgt |
39070 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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