View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10173_low_2 (Length: 673)

Name: NF10173_low_2
Description: NF10173
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10173_low_2
NF10173_low_2
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (384-658)||(30731206-30731480)
chr2 (1-264)||(30731961-30732225)
chr2 (1-263)||(30733943-30734205)
chr2 (17-223)||(32918074-32918281)
chr2 (267-407)||(30731536-30731676)
chr2 (17-224)||(43850042-43850250)
chr2 (1-228)||(9020836-9021064)
chr2 (1-228)||(9026775-9027003)
chr2 (103-218)||(2841010-2841125)
chr2 (1-249)||(8973280-8973529)
chr2 (1-220)||(9008018-9008238)
chr2 (70-215)||(19232359-19232504)
chr2 (144-228)||(9032042-9032126)
chr2 (136-249)||(9023415-9023528)
chr2 (103-228)||(9030387-9030512)
chr2 (150-228)||(8979311-8979389)
chr2 (110-210)||(10763878-10763978)
chr2 (105-249)||(8988423-8988568)
chr2 (103-249)||(9016461-9016611)
chr2 (104-226)||(8992139-8992262)
chr2 (150-224)||(8984686-8984760)
chr2 (110-215)||(6471709-6471813)
chr2 (106-189)||(17225659-17225743)
chr2 (103-213)||(35701893-35702003)
chr2 (103-186)||(17275862-17275945)
chr2 (80-162)||(8912989-8913074)
chr2 (1-57)||(8992294-8992349)
chr2 (179-214)||(39814115-39814150)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (384-658)||(14670344-14670617)
chr1 (1-264)||(14669599-14669863)
chr1 (1-264)||(14706041-14706305)
chr1 (10-263)||(14708532-14708786)
chr1 (9-264)||(14716244-14716500)
chr1 (1-264)||(14654231-14654494)
chr1 (1-264)||(14664022-14664285)
chr1 (1-264)||(14683703-14683967)
chr1 (23-256)||(14681560-14681794)
chr1 (23-256)||(14674442-14674676)
chr1 (17-256)||(14679820-14680060)
chr1 (5-264)||(14652478-14652738)
chr1 (5-264)||(14662269-14662529)
chr1 (460-658)||(14705389-14705584)
chr1 (267-407)||(14670148-14670288)
chr1 (1-224)||(38175420-38175644)
chr1 (9-249)||(28366097-28366338)
chr1 (122-264)||(14676585-14676727)
chr1 (1-264)||(14667007-14667264)
chr1 (80-249)||(33988038-33988208)
chr1 (461-658)||(14685700-14685883)
chr1 (100-214)||(11872471-11872585)
chr1 (267-388)||(14676148-14676263)
chr1 (267-388)||(14683266-14683381)
chr1 (139-211)||(37422175-37422247)
chr1 (145-221)||(28698549-28698625)
chr1 (104-163)||(14703134-14703193)
chr1 (318-385)||(14653974-14654040)
chr1 (318-385)||(14663765-14663831)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (9-262)||(10944297-10944550)
chr8 (16-250)||(41841058-41841292)
chr8 (17-217)||(40054312-40054513)
chr8 (103-250)||(44878950-44879097)
chr8 (103-250)||(44880824-44880971)
chr8 (19-215)||(37679757-37679953)
chr8 (17-217)||(37682057-37682258)
chr8 (117-225)||(42555090-42555198)
chr8 (105-200)||(44582870-44582965)
chr8 (144-250)||(42220880-42220985)
chr8 (174-224)||(42872514-42872564)
chr8 (144-228)||(42092010-42092093)
chr8 (111-163)||(44583111-44583162)
chr8 (103-157)||(42554655-42554709)
chr8 (1-66)||(42872408-42872471)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (16-230)||(11652298-11652512)
chr4 (10-251)||(49106428-49106670)
chr4 (70-251)||(50077158-50077340)
chr4 (10-226)||(3461042-3461258)
chr4 (2-251)||(49108524-49108774)
chr4 (105-216)||(26998735-26998846)
chr4 (111-216)||(26984668-26984773)
chr4 (105-216)||(48205832-48205943)
chr4 (103-189)||(21503706-21503792)
chr4 (112-215)||(41013548-41013651)
chr4 (110-210)||(26982549-26982646)
chr4 (117-251)||(49533638-49533765)
chr4 (108-181)||(35806165-35806238)
chr4 (110-153)||(54677590-54677633)
chr4 (110-160)||(34481105-34481155)
chr4 (157-210)||(6431957-6432010)
chr4 (176-212)||(34481155-34481191)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (1-224)||(7524961-7525185)
chr5 (103-228)||(1716444-1716570)
chr5 (14-217)||(3643640-3643843)
chr5 (105-213)||(4103249-4103357)
chr5 (80-184)||(5350672-5350777)
chr5 (108-215)||(16037861-16037966)
chr5 (146-210)||(19261152-19261216)
chr5 (103-163)||(13636366-13636426)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (61-251)||(10795840-10796031)
chr6 (2-251)||(10791543-10791793)
chr6 (20-217)||(30521242-30521440)
chr6 (20-163)||(13136608-13136752)
chr6 (105-215)||(8875691-8875803)
chr6 (103-174)||(11333273-11333344)
chr6 (18-91)||(10509478-10509551)
chr6 (111-210)||(21216032-21216131)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (103-217)||(27134511-27134625)
chr7 (103-211)||(8128149-8128256)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (169-215)||(15758562-15758608)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (106-163)||(5450-5507)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 384 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 30731480 - 30731206
Alignment:
Q  384 aaacatcctcttcaactcctgaacacaannnnnnngtcaatggcatcctatcatatacaacacaatttggagaaacactctgataatctcccgccaaact 483  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30731480 aaacatcctcttcaactcttgaacccaacccaaccgtcaatggcatcctatcatatacaacacaatttggagaaacactctgataatctcccgccaaact 30731381  T
Q  484 aaggaaactaaataacccacctaatgtcttagggatttcctacttctgcttcgactttagacaaattcactaatatcccatctctatcagtaatcacata 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30731380 aaggaaactaaataacccacctaatgtcttagggatttcctacttctgcttcgactttagacaaattcactaatatcccatctctatcagtaatcacata 30731281  T
Q  584 tctcaagaattgaaattcactaaaacatgttataaatatatttactcgaaaaacttttagaaaactatgctttgt 658  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30731280 tctcaataattgaaattcactaaaacatattataaatatatttactcgaaaaacttttagaaaactatgctttgt 30731206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30732225 - 30731961
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30732225 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcaccagaccaatgctatagtgcaacacattgacaacacacgagaagcctagtagcaagctaccaaagtggcc 30732126  T
Q  101 tcccccc-tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732125 tccccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatattagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 30732026  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732025 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 30731961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30734205 - 30733943
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||     
T  30734205 aaaaatttgaacttggattggtggggtgcgccaagccaatgcaatagtgcaacgcactggcgacactcgagaagcctagtagcaagctactaaaatggct 30734106  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30734105 tctccccctaaaaaaagtaatttaatatcatgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 30734006  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctca 263  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30734005 aggccgagaaaggtataagttacaacatgagatc-ctgctgcttttatatctgacatgttctca 30733943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32918281 - 32918074
Alignment:
Q  17 attggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaa 115  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||    
T  32918281 attggtgaggtgcgccaaactaatgctatagtgcaacgcattagcgacacaagagaagcagagtagcaagctactgcaatggcttctccccctcaaaaaa 32918182  T
Q  116 gtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32918181 gtaatttaatatcgtgtggaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 32918082  T
Q  216 gagttgaa 223  Q
    ||||||||    
T  32918081 gagttgaa 32918074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 267 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30731676 - 30731536
Alignment:
Q  267 actacacacagagatcagtcttgtcttggttcccaaaggtgatgtgatgagttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttat 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30731676 actacacacagagattagtcttgtcttggttcccaaaggtgatgtgatgagttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttat 30731577  T
Q  367 ttatggcataccatgtgaaacatcctcttcaactcctgaac 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30731576 ttatagcataccatgtgaaacatcctcttcaactcctgaac 30731536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43850250 - 43850042
Alignment:
Q  17 attggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||  || |||| |||||||||| ||| | |||||||  ||||| | | |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  43850250 attggttgggtgcgccaagcctatgcaatagtgcaacgcataggcgacacattagaagtccaatagcaagctattgaagtgacctctccccctcaaaaaa 43850151  T
Q  116 gtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    || |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43850150 gtgatttaatatcatgtgactcattgggccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 43850051  T
Q  216 gagttgaaa 224  Q
    |||||||||    
T  43850050 gagttgaaa 43850042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9021064 - 9020836
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |  |||||   ||||||| | ||||||| || | || |||||    
T  9021064 aaaaatttgaacttgaattggtggggtgcacca-acctatgcaatagtgcaacacataggtgacacttgagaagcccaatagcaagttattgaaatggcc 9020966  T
Q  101 tccc-ccctcaaaaaagtaatttaatatcgt-gtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020965 tctcaccctcaaaaaagtaatttaatactgtagtgacccattgggccacatctcagatattaaattgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 9020866  T
Q  199 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9020865 aaggccgagaaatgtatgaattgaaagatg 9020836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9027003 - 9026775
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||| | ||||||   |||| || | |||||||||| | || ||| |    
T  9027003 aaaaatttgaacttgaattggaggggtgtgccag-ccaatgcaatagtgcaaagcataggcgacacttgagaaacccaatagcaagctattgaaatggtc 9026905  T
Q  101 tccccc-ctcaaaaaagtaatttaatatcgt-gtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 198  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9026904 tctcccactcaaaaaagtaatttaatactgttgtgacccattgggccactaatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 9026805  T
Q  199 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9026804 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 9026775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Original strand, 2841010 - 2841125
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2841010 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgatccattgaaccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 2841109  T
Q  203 ccgagaaaggtatgag 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  2841110 ccgagaaaggtatgag 2841125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8973529 - 8973280
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||| |||   | ||||   |||| || |  ||||||||| | || ||| |    
T  8973529 aaaaatttgaacttgaattggtggggcgcgccagctca-tgcaatagtgcaacgcatatgcaacacttgagaaacccaacagcaagctattgaaatggtc 8973431  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgt-gtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 198  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8973430 tctcccccttaaaaaagtaatttaatattgttgtgacccattgggccactaatcagatattaaactaataagaacagatactacacttgatcttagccaa 8973331  T
Q  199 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||    
T  8973330 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgaactcgcttatgcttttatat 8973280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9008238 - 9008018
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||  ||| | ||||||   |||| || | || |||| || | || |||||    
T  9008238 aaaaaattgaactagaattggtggggtgtgccag-cgaatgcaatagtgcaaagcataggcgacacttgagaaacccaataacaagttattgaaatggcc 9008140  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtg-tgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008139 tctccccctcaaaaaagtaatttaatactgttatgacccattgggccactaatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 9008040  T
Q  199 aaggccgagaaaggtatgagtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9008039 aaggccgagaaaggtatgagtt 9008018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Original strand, 19232359 - 19232504
Alignment:
Q  70 agaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgata 168  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19232359 agaagcccaatagcaagctattgaagtggcttctccccctcaaaaaggtaatttaatattgtgtgacccaatgggtcacatatcag-tattaaactgata 19232457  T
Q  169 agaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19232458 agaacagatattacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 19232504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9032126 - 9032042
Alignment:
Q  144 ccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9032126 ccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttaaccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 9032042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9023528 - 9023415
Alignment:
Q  136 ccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgt 235  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  9023528 ccattgggccactaatcagatattaaactaataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagttggactcgc 9023429  T
Q  236 tgctgcttttatat 249  Q
    |  |||||||||||    
T  9023428 ttatgcttttatat 9023415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9030512 - 9030387
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9030512 ccccctcaaaaaagtaatttaatactgtgtgacccattgagccacttctcaaatattaaattgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 9030413  T
Q  203 ccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  9030412 ccaagaaaaatatgagttgaaagatg 9030387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8979389 - 8979311
Alignment:
Q  150 atcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8979389 atcaaatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 8979311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Original strand, 10763878 - 10763978
Alignment:
Q  110 aaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaa 209  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10763878 aaaaaagtaatttaatattgtatggaccattgatccacatatcagatattaaactgataagaacatatactacacttgatcttagtcaaaagaccgagaa 10763977  T
Q  210 a 210  Q
    |    
T  10763978 a 10763978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8988568 - 8988423
Alignment:
Q  105 ccctcaaaaaagtaatttaatatcgt-gtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   |||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8988568 ccctcaaaaaagtaatttaatattgttgagaaccattgagtcactgatcaaatattaaactgataagaacaaatactacacttgatcttcgccaaaaggc 8988469  T
Q  204 cgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatat 249  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||  |||| |  |||||||||||    
T  8988468 caagaatggtataagttgaaagatgaactcgcttatgcttttatat 8988423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9016611 - 9016461
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgt-gtgaaccattggtccacatatcagatattaaacc---gataagaacagatactacacttgatcttagccaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9016611 ccccctcaaaaaagtaatttaatactgttgtgacccattgggccactaatcagatattaaactactgataagaacagatactacatttgatcttagccaa 9016512  T
Q  199 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatat 249  Q
    |||| |||  |||||||||||| |||||||  |||| |  |||||||||||    
T  9016511 aaggtcgaataaggtatgagttaaaagatgaactcgcttatgcttttatat 9016461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8992262 - 8992139
Alignment:
Q  104 cccctcaaaaaagtaatttaatatcgt-gtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  8992262 cccctcaaaaaagtaatttaatattattgtgacccattgggccactaatcagatattgaactcataagaacatatactacacttgatcttagccaaaaga 8992163  T
Q  203 ccgagaaaggtatgagttgaaaga 226  Q
    | |||||||| ||||||| |||||    
T  8992162 ctgagaaaggcatgagttaaaaga 8992139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8984760 - 8984686
Alignment:
Q  150 atcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaa 224  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8984760 atcaaatattaaactaataagaacaaatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaa 8984686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Original strand, 6471709 - 6471813
Alignment:
Q  110 aaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaa 209  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  6471709 aaaaaagtaacttaatatcatgtgatccattagaccgtatatcagatattaaactaataagaacatatactacactt-atcttagccaaaaggtcgaaaa 6471807  T
Q  210 aggtat 215  Q
    ||||||    
T  6471808 aggtat 6471813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 17225659 - 17225743
Alignment:
Q  106 cctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgat-aagaacagatactacacttgat 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17225659 cctcaaaaaagtaatttaatatcgtatgattcattggaccagatatcagttattaaaccgataaaaaacagatactacacttgat 17225743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35702003 - 35701893
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  35702003 ccccctcaaaaaagtaaactaatatcgtgtgacttgttggcccacatatcaaatattaaactaataaaaacaaataccacacttgatcttagccaaaaag 35701904  T
Q  203 ccgagaaaggt 213  Q
      |||||||||    
T  35701903 ttgagaaaggt 35701893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17275945 - 17275862
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacactt 186  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  17275945 ccccctcaaaaatgtaattcaatatcgtgtgatccattggaccacatattaaagattgaactgataagaacgtatactacactt 17275862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8913074 - 8912989
Alignment:
Q  80 tagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatc--gtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaa 162  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||    
T  8913074 tagcaagctactgaaatggtctctccccctcaaaaaagtaatttaatatcatgtgtgattcattggaccacatattatatattaaa 8912989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 8992349 - 8992294
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacat 57  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  8992349 aaaaatttgaacttgaattggaggggtgcgccag-cccatgcaatagtgcaacacat 8992294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39814150 - 39814115
Alignment:
Q  179 ctacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggta 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39814150 ctacacttgatcatagccaaaaggccgagaaaggta 39814115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 384 - 658
Target Start/End: Original strand, 14670344 - 14670617
Alignment:
Q  384 aaacatcctcttcaactcctgaacacaannnnnnngtcaatggcatcctatcatatacaacacaatttggagaaacactctgataatctcccgccaaact 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14670344 aaacatcctcttcaactcctgaacacaacccccc-gtcaatggcatcctatcatatacaacacaatttggagaaacaatctgataatctcccgccaaact 14670442  T
Q  484 aaggaaactaaataacccacctaatgtcttagggatttcctacttctgcttcgactttagacaaattcactaatatcccatctctatcagtaatcacata 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670443 aaggaaactaaataacccacctaatgtcttagggatttcctacttctacttcgactttagacaaattcactaatatcccatctctatcagtaatcacata 14670542  T
Q  584 tctcaagaattgaaattcactaaaacatgttataaatatatttactcgaaaaacttttagaaaactatgctttgt 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670543 tctcaagaattgaaattcactaaaacatattataaatatatttactcgaaaaacttttagaaaactatgctttgt 14670617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 14669599 - 14669863
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  14669599 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcaccagaccaatgctatagtgcaacacattggcgacacacaagaggattagtagcaagctactaaagttgcc 14669698  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14669699 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 14669798  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14669799 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 14669863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14706305 - 14706041
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||    
T  14706305 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgttatagtgcaacacatagtcaacacacaagaggattagtagcaagctactaaagttgcc 14706206  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14706205 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 14706106  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14706105 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcggtgctgcttttatatcagaaacgttctcag 14706041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14708786 - 14708532
Alignment:
Q  10 aacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccct 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  14708786 aacttgaattggtggggtgcgccaggccaatgctgtagtgcaacacattgacgacacaagagaagcctaatagcaagctactaaagtgacctctccccct 14708687  T
Q  109 caaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708686 caaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgaga 14708587  T
Q  209 aaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctca 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  14708586 aaggtatgagttgaaagatgggctcactagtgcttttatatctgacattttctca 14708532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14716500 - 14716244
Alignment:
Q  9 aaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccc 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  14716500 aaacttgaattggtggggtgcaccaagccaatgctatagtgcaacacattggcgacacacgagaggattagtagcaagctactaaagttgcctctccccc 14716401  T
Q  108 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14716400 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatattagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgag 14716301  T
Q  208 aaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14716300 aaaggtatgagttgaaagatgaactcggtgctgcttttatatcagacatcttctcag 14716244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 14654231 - 14654494
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  14654231 aaaaatttaa-cttgaattggtggggtgagccaagccaatgctatagtgcaacatattggcgacacacgagaggactcgtagcaagctactgaagtggcc 14654329  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654330 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 14654429  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14654430 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatggacaagctgctgcttttatattagacattttctcag 14654494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 14664022 - 14664285
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  14664022 aaaaatttaa-cttgaattggtggggtgagccaagccaatgctatagtgcaacatattggcgacacacgagaggactcgtagcaagctactgaagtggcc 14664120  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664121 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 14664220  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14664221 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatggacaagctgctgcttttatattagacattttctcag 14664285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14683967 - 14683703
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| |||    
T  14683967 aaaaatttaactttggattggtggggtgcaccaagccaatgctatagtgcaacacattggtgacacacgagaggactagtagcaagctactaaagttgcc 14683868  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683867 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 14683768  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  14683767 aggccgagaaaggtatgagttgaaatatggactagctgccgcttttataacagacatcttctcag 14683703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14681794 - 14681560
Alignment:
Q  23 ggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatt 121  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  14681794 ggggtgtgccaaaccaatgctatagtgcaatacattgttgacacccgagaagcctagtagcaagctactaaaatggcttctccccctcaaaaaagtaatt 14681695  T
Q  122 taatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14681694 taatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtataagttg 14681595  T
Q  222 aaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacat 256  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14681594 aaaaatgggctaggtgctgcttttatatcagacat 14681560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14674676 - 14674442
Alignment:
Q  23 ggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatt 121  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  14674676 ggggtgtgccaaaccaatgctatagtgcaatacattgttgacacccgagaagcctagtagcaagctactaaaatggcttctccccctcaaaaaagtaatt 14674577  T
Q  122 taatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttg 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14674576 taatatcatgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttg 14674477  T
Q  222 aaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacat 256  Q
     ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  14674476 gaagattggctaggtgctgcttttatatcagacat 14674442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14680060 - 14679820
Alignment:
Q  17 attggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaa 115  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||    
T  14680060 attggtcgggtgcgccaagccaatgctgtagtgcaacgcattggcaacactcaagaagcctagtagcaagctactaatatggcttctccccctcaaaaaa 14679961  T
Q  116 gtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14679960 gtaatttaatatcatgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 14679861  T
Q  216 gagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacat 256  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  14679860 gagttggaagattggctaggtgctgcttttatatcagacat 14679820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14652738 - 14652478
Alignment:
Q  5 atttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-c 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||   |||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || |    
T  14652738 atttgaacttgaattggtggggtgcgccacgccaatgctatagtgcaacgcattggaaacactcgagaagcctagtagcaagctactaaaatggcttctc 14652639  T
Q  104 cccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652638 cccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtggaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggc 14652539  T
Q  204 cgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||| || || || || |  | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14652538 cgagaaaggtatgatttcaatgaaggaccagctgctgctcttatatcagacatcttctcag 14652478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14662529 - 14662269
Alignment:
Q  5 atttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-c 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||   |||| | |||||||||||||||||||||| || |||| || |    
T  14662529 atttgaacttgaattggtggggtgcgccacgccaatgctatagtgcaacgcattggaaacactcgagaagcctagtagcaagctactaaaatggcttctc 14662430  T
Q  104 cccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14662429 cccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtggaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggc 14662330  T
Q  204 cgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    |||||||||||||| || || || || |  | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14662329 cgagaaaggtatgatttcaatgaaggaccagctgctgctcttatatcagacatcttctcag 14662269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 460 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14705584 - 14705389
Alignment:
Q  460 actctgataatctcccgccaaactaaggaaactaaataacccacctaatgtcttagggatttcctacttctgcttcgactttagacaaattcactaatat 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14705584 actctgataatctcccgccaaactaaggaaa-tacat--cccacctaatgtcttagggatttcctacttctgcttccactttagacaaattcactaatat 14705488  T
Q  560 cccatctctatcagtaatcacatatctcaagaattgaaattcactaaaacatgttataaatatatttactcgaaaaacttttagaaaactatgctttgt 658  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14705487 cccatctctatcagtaatcacatacctcaagaattgaaattcactaaaacatattataaatagatttactcaaaaaacttttagaaaactatgctttgt 14705389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 267 - 407
Target Start/End: Original strand, 14670148 - 14670288
Alignment:
Q  267 actacacacagagatcagtcttgtcttggttcccaaaggtgatgtgatgagttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670148 actacacacagagatcagtcttgtcttggttcccaaaggtgatgtgatgagttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttat 14670247  T
Q  367 ttatggcataccatgtgaaacatcctcttcaactcctgaac 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670248 ttatagcataccatgtgaaacatcctcttcaactcctgaac 14670288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 38175420 - 38175644
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||   |||||||  | || || || ||||||||||| | ||||      
T  38175420 aaaaaattgaactagaattggtggggtgcgccaggcttatgtaatagtgcaacacataagcgacacatgataaacccagcagcaagctactgaggtggtt 38175519  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38175520 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccattggaacacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 38175619  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaa 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38175620 aggccgagaaaggtatgagttgaaa 38175644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 28366097 - 28366338
Alignment:
Q  9 aaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccc 107  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||  | |  |||||||||||||||||  | | | ||| |||||    
T  28366097 aaactttaattggtgggatgcgccag-ccaatgcaatagtgcaacgcataaacgacacatgaaagacctagtagcaagctactataatagtctctccccc 28366195  T
Q  108 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtc-cacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccga 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28366196 ttaaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccattggggtcacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccga 28366295  T
Q  207 gaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatat 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||    
T  28366296 gaaaggtatgagttgaaagaggggttcgcatctgcttttatat 28366338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14676727 - 14676585
Alignment:
Q  122 taatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14676727 taatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttg 14676628  T
Q  222 aaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    ||| |||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  14676627 aaatatggactagctgccgcttttataacagacatcttctcag 14676585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 14667007 - 14667264
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaag-tggc 99  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |       ||||| ||  ||||    
T  14667007 aaaaatttgagcttggattggtggggtgcgccaagccaatgctatagtgcaacacactggcaacactcgagaagccttg-------ctactaaaaatggc 14667099  T
Q  100 ctc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaa 198  Q
     || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667100 ttctccccctagaaaaagtaatttaatatcatgtgaaccattggtccacgtatcagatattaaactaataagaacagatactacacttgatcttagccaa 14667199  T
Q  199 aaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctcag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14667200 aaggccgagaaaggtatgagttacaacatgagatc-ctgctgcttttatatctgacatgttctcag 14667264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33988208 - 33988038
Alignment:
Q  80 tagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagata 178  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33988208 tagcaagctattgaaatggcctctcccccttaaaaaagtaatttaatatcgtgtgactcattgagccacatatcagatattaaactgataagaacagata 33988109  T
Q  179 ctacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||    
T  33988108 ctacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatggactcacttatgcttttatat 33988038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 461 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 14685883 - 14685700
Alignment:
Q  461 ctctgataatctcccgccaaactaaggaaactaaataacccacctaatgtcttagggatttcctacttctgcttcgactttagacaaattcactaatatc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            
T  14685883 ctctgataatctcccgccaaactaaggaaactaaataacccaacaaatgtcttagggatttcctacttctgctttgactttagacaaattca-------- 14685792  T
Q  561 ccatctctatcagtaatcacatatctcaagaattgaaattcactaaaacatgttataaatatatttactcgaaaaacttttagaaaactatgctttgt 658  Q
          | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||| |||||    
T  14685791 ------ccatcagtaatcacatgtcccaagaattgaaattcactaaaacatattataaatagatttacttgaattttttttagaaaactatggtttgt 14685700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 11872471 - 11872585
Alignment:
Q  100 ctcccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11872471 ctcccccttaaaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccattgaaccacatatcatatattaaactgataagaacagatagtacacttgatcttagtcaaa 11872570  T
Q  200 aggccgagaaaggta 214  Q
    |||||||||||||||    
T  11872571 aggccgagaaaggta 11872585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 267 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14676263 - 14676148
Alignment:
Q  267 actacacacagagatcagtcttgtcttggttcccaaaggtgatgtgatgagttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14676263 actacacacagagatcagtcttgtcttggttccaaaaggtgatg-----agttataactactataaaaccaaatacacaacactgacgttgcaaccttat 14676169  T
Q  367 ttatggcataccatgtgaaaca 388  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  14676168 ttat-gcataccatatgaaaca 14676148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 267 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14683381 - 14683266
Alignment:
Q  267 actacacacagagatcagtcttgtcttggttcccaaaggtgatgtgatgagttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttat 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14683381 actacacacagagatcagtcttgtcttggttccaaaaggtgatg-----agttataactactataaaaccaaatacacaacactgacgttgcaaccttat 14683287  T
Q  367 ttatggcataccatgtgaaaca 388  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  14683286 ttat-gcataccatatgaaaca 14683266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37422247 - 37422175
Alignment:
Q  139 ttggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaag 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37422247 ttggaccacatatcagatattaaactgataagaacatatgctacacttgatcttagccaaaaggccgagaaag 37422175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28698625 - 28698549
Alignment:
Q  145 cacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttg 221  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28698625 cacatatcaaatattaaattgataaaaatatatactacatttgatcttagccaaaagaccgagaaatgtatgagttg 28698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14703193 - 14703134
Alignment:
Q  104 cccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaac 163  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  14703193 cccctaaaaaatttaatttaatatcgtgtggactattggtccacatatcaaatattaaac 14703134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 385
Target Start/End: Original strand, 14653974 - 14654040
Alignment:
Q  318 ttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttatttatggcataccatgtgaa 385  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  14653974 ttataaccactataaaactaaataaacaacactgaagttgc-gacttatttatagcataccatatgaa 14654040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 385
Target Start/End: Original strand, 14663765 - 14663831
Alignment:
Q  318 ttataactactattaaaccaaatacacaacactgaagttgcaaacttatttatggcataccatgtgaa 385  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  14663765 ttataaccactataaaactaaataaacaacactgaagttgc-gacttatttatagcataccatatgaa 14663831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 10944297 - 10944550
Alignment:
Q  9 aaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctcccccc- 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||     
T  10944297 aaacttgaattggtggggtgcgccaaaccaatgctatagtgcaacgcaatagtgacactcaagaagcctagtagcaagctactaaaatggcttctcccca 10944396  T
Q  108 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10944397 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccatttgtccacatataagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggtcgag 10944496  T
Q  208 aaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatcagacatgttctc 262  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||  |  |||||||||||| |||||||||||    
T  10944497 aaaggtatgagttacaacatgagctc-ctattgcttttatatctgacatgttctc 10944550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Original strand, 41841058 - 41841292
Alignment:
Q  16 aattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctcccccc-tcaaaaa 114  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||| | |||||||||| |   ||||| || |||| |||||||    
T  41841058 aattgatggggtgcgccagccca-tgcaatagtgcaacacataggcgacactcgagaagcccaatagcaagctattggggtggcttctccccatcaaaaa 41841156  T
Q  115 agtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggta 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41841157 agtaatttaatatcgtgtgacccattggaccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggta 41841256  T
Q  215 tgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatc 250  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||||||||||    
T  41841257 tgagttgaaagatgggttggcttctgcttttatatc 41841292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40054513 - 40054312
Alignment:
Q  17 attggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaa 115  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||   ||||||  |||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  40054513 attggtggggtgcgccaagcttatgcaatagtgcaacacataagcgacacttaagaagcccaatagcaagctattgaagtggcctctccccctcaaaaaa 40054414  T
Q  116 gtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40054413 gtaatttaatatcgtatgacccattgggccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 40054314  T
Q  216 ga 217  Q
    ||    
T  40054313 ga 40054312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44879097 - 44878950
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44879097 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcatgtgacccattgagccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 44878998  T
Q  203 ccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatc 250  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||    
T  44878997 ccgagaaaggtatgagttgaatgttgggctcgcctctgcttttatatc 44878950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Original strand, 44880824 - 44880971
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44880824 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcatgtgacccattgagccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 44880923  T
Q  203 ccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatc 250  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||    
T  44880924 ccgagaaaggtatgagttgaatgttgggctcgcctctgcttttatatc 44880971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37679953 - 37679757
Alignment:
Q  19 tggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| | || ||| | |||||||||||    |||||||| ||||||||| |||      
T  37679953 tggtggggtgcgccagaccattgctatagtgcaacacaaaggcgacacaga-gaggcccaatagcaagctaccgtggtggcctctccccctcaataaata 37679855  T
Q  118 aatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679854 aatttaatatcaagtggaccattggcccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 37679757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37682258 - 37682057
Alignment:
Q  17 attggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctcccc-cctcaaaaaa 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |  || |||||   |||  |||| |||||||||| ||  |||| ||| |  ||| ||||||    
T  37682258 attggtggggcgcgccagaccaatgcaatagtgcaacgtaaagatgacacttgagagacctaatagcaagctattttggtggactctcatcctaaaaaaa 37682159  T
Q  116 gtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
      |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37682158 caaatttaatatcgtgtggaccattggcccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaatgtat 37682059  T
Q  216 ga 217  Q
    ||    
T  37682058 ga 37682057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 42555090 - 42555198
Alignment:
Q  117 taatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatg 216  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  42555090 taatttaatatcgtgtgattcattgaaccacatatcaaatattaaactgataaaaacagattctgcacttgatcttagccaaaagatcaagaaaggtatg 42555189  T
Q  217 agttgaaag 225  Q
    |||||||||    
T  42555190 agttgaaag 42555198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44582965 - 44582870
Alignment:
Q  105 ccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   | ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44582965 ccctcaaaaaagtaatttaatatcatagaatccattgagctacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaa 44582870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Original strand, 42220880 - 42220985
Alignment:
Q  144 ccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgctt 243  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |  |||||   ||||||    
T  42220880 ccacatatcagatattaaactaataagaa-agatactacacttgatcttagccaaaagaccgaaaaatgtatgagttgaaagctatgctcgcctctgctt 42220978  T
Q  244 ttatatc 250  Q
    |||||||    
T  42220979 ttatatc 42220985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 42872514 - 42872564
Alignment:
Q  174 agatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaa 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42872514 agatactacacttaatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaa 42872564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42092093 - 42092010
Alignment:
Q  144 ccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  42092093 ccacatatcagatattaaactgataagaacaaatattacacttaattttag-caaaaggcaaagaaaggtatgagtttaaagatg 42092010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44583162 - 44583111
Alignment:
Q  111 aaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  44583162 aaaaagtaatttaatatcgtgtgtaccatt-gttcacatatcagatattaaac 44583111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 157
Target Start/End: Original strand, 42554655 - 42554709
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagata 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||    
T  42554655 ccccctcaaaaaaataatttaatatcgtgtaattcattgacccacatatcagata 42554709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 42872408 - 42872471
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacac 66  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  42872408 aaaaaattaaactt-aattggtggggtgcgtcagccca-tgcaatagtgcaacacatagacgacac 42872471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 11652298 - 11652512
Alignment:
Q  16 aattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||||||||| |  |||||| || ||||||||||||    
T  11652298 aattggtggggtgcgccagccca-tgcaatagtgcaacacataggcgacactcaagaagcccaatagcaagctattggagtggcttctccccctcaaaaa 11652396  T
Q  115 agtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggta 214  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11652397 aataatttaatatcgtgtgacccattgggccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggta 11652496  T
Q  215 tgagttgaaagatggg 230  Q
    |||||| |||||||||    
T  11652497 tgagttaaaagatggg 11652512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 49106428 - 49106670
Alignment:
Q  10 aacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccct 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||   ||||||| |||||  | |||||||||||||| | ||| | || ||||||    
T  49106428 aactagaattggtggggtgcgcctagctcatgcaatagtgcaacacatgagcgacacataagaaatccagtagcaagctactaaggtgacttctccccct 49106527  T
Q  109 caaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49106528 caaaaaagtaatttaatatcgtgtgatccattggaccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgaga 49106627  T
Q  209 aaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatca 251  Q
    |||||||||||||||||   |||| | | ||||||||||||||    
T  49106628 aaggtatgagttgaaagggtggctggcttctgcttttatatca 49106670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 251
Target Start/End: Original strand, 50077158 - 50077340
Alignment:
Q  70 agaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgata 168  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  50077158 agaagcccaatagcaagctattgaagtggcttctccccctcaaaaaagtaatttaatatcatgtgaaccattggaacacatatcagatattaaactgata 50077257  T
Q  169 agaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  50077258 agaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagaagagctggcttctgcttttatatca 50077340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Original strand, 3461042 - 3461258
Alignment:
Q  10 aacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccct 108  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||| | |||| || | |||||||||| | || |||| || ||||||    
T  3461042 aacttgtattggtggggtgtgccag-cctatgcaatagtgcaacgcatagacgacactcgagaaacccaatagcaagctattgaaatggcttctccccct 3461140  T
Q  109 caaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgaga 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3461141 taaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccattgagtcacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgaga 3461240  T
Q  209 aaggtatgagttgaaaga 226  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  3461241 aaggtatgaattgaaaga 3461258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Original strand, 49108524 - 49108774
Alignment:
Q  2 aaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcct 101  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||   ||||||| |||||| | | ||||||||||||    || | |    
T  49108524 aaaaattaaactaggattggtggggtgcgcctagctcatgcaatagtgcaacacatgagcgacacataagaagtccaatagcaagctactgtgatgactt 49108623  T
Q  102 c-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49108624 ctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccattgagtcacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaa 49108723  T
Q  201 ggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| | | ||| ||||||||||    
T  49108724 ggccgagaaaggtatgagttgaaatataggctggcttctgattttatatca 49108774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Original strand, 26998735 - 26998846
Alignment:
Q  105 ccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggcc 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26998735 ccctaaaaaaagtaatttaatatcgtgtggaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggcc 26998834  T
Q  205 gagaaaggtatg 216  Q
    ||||||||||||    
T  26998835 gagaaaggtatg 26998846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Original strand, 26984668 - 26984773
Alignment:
Q  111 aaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26984668 aaaaagtaatttaatatcgtgtggaccattggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaa 26984767  T
Q  211 ggtatg 216  Q
    ||||||    
T  26984768 ggtatg 26984773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48205943 - 48205832
Alignment:
Q  105 ccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48205943 ccctcaaaaaagtaatttaatatcatgtaaaccaatggtccacatataagatattaaattaataagaacagatactacacttaatcttagctaaaaggcc 48205844  T
Q  205 gagaaaggtatg 216  Q
    ||||||||||||    
T  48205843 gagaaaggtatg 48205832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21503792 - 21503706
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21503792 ccccctcaaaaaaataatttaatatcgtgtgacctattgagccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgat 21503706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 215
Target Start/End: Original strand, 41013548 - 41013651
Alignment:
Q  112 aaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaag 211  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||     
T  41013548 aaaaataatttaataccatgtgaacccttggtccacatatcagatattaaacggataagaacatatattatacttaatcttaaccaaaaggccgagaaaa 41013647  T
Q  212 gtat 215  Q
    ||||    
T  41013648 gtat 41013651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26982646 - 26982549
Alignment:
Q  110 aaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaa 209  Q
    |||||| | |||||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26982646 aaaaaaatgatttaatatcatgtaaatcattgatccacatattagatactaaac---taataacagatgctacacttgatcttagccaagaggccgagaa 26982550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 251
Target Start/End: Original strand, 49533638 - 49533765
Alignment:
Q  117 taatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatg 216  Q
    |||||||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||     |||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49533638 taatttaatatcgtgtgacctattgagtaacatatcagatattaa-----taagaacagata-tgcacttgatcttagccaag-ggccgagaaaggtatg 49533730  T
Q  217 agttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatca 251  Q
     |||| || | ||||| | | ||| ||||||||||    
T  49533731 ggttggaataagggctggcttctggttttatatca 49533765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35806238 - 35806165
Alignment:
Q  108 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatacta 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| |   |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35806238 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgcgactcattagattacatatcatatattaaactgataagaacaaatacta 35806165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 54677633 - 54677590
Alignment:
Q  110 aaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  54677633 aaaaaagtaatttaatatcgtgtgatccattagaccacatatca 54677590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 160
Target Start/End: Original strand, 34481105 - 34481155
Alignment:
Q  110 aaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatatta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  34481105 aaaaaagtaatttaatatcttgtggatcattgattcacatatcagatatta 34481155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 6431957 - 6432010
Alignment:
Q  157 attaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaa 210  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  6431957 attaaactaataagaagagatactaaacctgatcttagccaataggccgagaaa 6432010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 212
Target Start/End: Original strand, 34481155 - 34481191
Alignment:
Q  176 atactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaagg 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34481155 atactacactcgatcttagccaaaaggctgagaaagg 34481191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7525185 - 7524961
Alignment:
Q  1 aaaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcc 100  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||   || |||| |||||||||| ||| |||||||||  |||| || || ||||||||||| | | ||||    
T  7525185 aaaaaattaaactaaaattggtggggtgcgcctagcccatgcaatagtgcaacgcatggacgacacatgagaaacccagcagcaagctactaaggcggcc 7525086  T
Q  101 tc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7525085 tctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgatccattggatcacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaa 7524986  T
Q  200 aggccgagaaaggtatgagttgaaa 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  7524985 aggccgagaaaggtatgacttgaaa 7524961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Original strand, 1716444 - 1716570
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccatt-ggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaag 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1716444 cccccttaaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccatttggaccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaag 1716543  T
Q  202 gccgagaaaggtatgagttgaaagatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1716544 gccgagaaaggtatgagttaaaagatg 1716570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3643843 - 3643640
Alignment:
Q  14 tgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   | |||| | |||| || | |||||||||| |    | |  || |||||| |||    
T  3643843 tgaattggtggggtgcgccag-ccaatgcaatagtgcaacacataagcaacactcgagaaacccaatagcaagctattgtgatagtttctcccccttaaa 3643745  T
Q  113 aaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaagg 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643744 aaagtaatttaatatcgtgtgacccaatgggccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaagg 3643645  T
Q  213 tatga 217  Q
    |||||    
T  3643644 tatga 3643640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4103357 - 4103249
Alignment:
Q  105 ccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggcc 204  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  4103357 ccctaaaaaaagcaatttaatatcgtgtggactattgggccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttaaccaaaatgct 4103258  T
Q  205 gagaaaggt 213  Q
    |||||||||    
T  4103257 gagaaaggt 4103249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5350777 - 5350672
Alignment:
Q  80 tagcaagctacttaagtggcctcc-cccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagata 178  Q
    |||||||||||||  |||| |||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  5350777 tagcaagctactttggtggactctacccctcaagaaataaatttaatatcgtgtggaccattgtcccacatatcagatattaaactgataacaatagata 5350678  T
Q  179 ctacac 184  Q
    ||||||    
T  5350677 ctacac 5350672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16037966 - 16037861
Alignment:
Q  108 tcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||| ||||| |||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16037966 tcaaaaaagtaatttaatatcgtttgacccattagaccac-tatcaaatattaagataataagaacaaatactacacttgatcttag-aaaacggccgag 16037869  T
Q  208 aaaggtat 215  Q
    ||| ||||    
T  16037868 aaaagtat 16037861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Original strand, 19261152 - 19261216
Alignment:
Q  146 acatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaa 210  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  19261152 acatatcagatatttaacggataagaacatatattacacttgatcttaatcaaaaggctgagaaa 19261216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13636426 - 13636366
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaac 163  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13636426 ccccctcaagaacttaatttaataccgtgtggaccgttgatccacatatcagatattaaac 13636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 251
Target Start/End: Original strand, 10795840 - 10796031
Alignment:
Q  61 cgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatatt 159  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  10795840 cgacacatgagaagcctaatagcaagctattgaagtggcttctccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgacccattgggtcacatatcagatatt 10795939  T
Q  160 aaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatca 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||    
T  10795940 aaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatgagttgaaagaagagctggcttctgcttttatatca 10796031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Original strand, 10791543 - 10791793
Alignment:
Q  2 aaaatttaaacttgaattggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcct 101  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||  |||| |||||||||| ||    |||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||| |    
T  10791543 aaaagttaaactagaattggtggggtgtacctaactcatgcaatagtgcaacgcacgagcgacacatgagaagcctaatagcaagctattgaagtggctt 10791642  T
Q  102 c-ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10791643 ctccccctcaaaaaagtaatttaatatcatgtgacccattggatcacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaa 10791742  T
Q  201 ggccgagaaaggtatgagttgaaagatgggctcgttgctgcttttatatca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | | | ||||||||||||||    
T  10791743 ggccgagaaaggtatgagttgaaagaagagttggcttctgcttttatatca 10791793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30521440 - 30521242
Alignment:
Q  20 ggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggcctc-ccccctcaaaaaagta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  ||||||||   |||  || | ||||||||||    ||||| ||| |||||||||||||  |    
T  30521440 ggtggggtgcgccaggccaatgcaatagtgcaaagcaaagacgacacttgagagacccaatagcaagctatagtagtggactctccccctcaaaaaataa 30521341  T
Q  119 atttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtatga 217  Q
    ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30521340 attgaatatcgtgtgaggcgatggtccacatatcagatattaaactgataagaacagatactacacttgatctcagccaaaaggtcgagaaaggtatga 30521242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13136752 - 13136608
Alignment:
Q  20 ggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctacttaagtggc-ctcccccctcaaaaaagta 118  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||  | |||| |  ||| ||||||||||||    
T  13136752 ggtggggtgcgccaaactaatgctatagtgcaacgcattagcgacacaagagaagcagagtagcaagctactgcaatggctcctccctctcaaaaaagta 13136653  T
Q  119 atttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaac 163  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136652 atttaatatcgtgtggaccattggtccacatatcagatattaaac 13136608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8875803 - 8875691
Alignment:
Q  105 ccctcaaaaaagta--atttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8875803 ccctcaaaaaagtataatttaatatcgtgtaatctattggaccacatatcagatattaaattgataagaacagatattacacttgatcttagccaaaagg 8875704  T
Q  203 ccgagaaaggtat 215  Q
    ||| |||| ||||    
T  8875703 ccgggaaatgtat 8875691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11333344 - 11333273
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaaca 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11333344 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgatccgttggaccacatatcagatattaaactgataagaaca 11333273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10509551 - 10509478
Alignment:
Q  18 ttggtggggtgcgccagaccaatgctatagtgcaacacattgacgacacacaagaagcctagtagcaagctact 91  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10509551 ttggtggggtgctccaagccaatgctatagtgcaacgcattagcgacacacaagaagccgagtagcaagctact 10509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21216131 - 21216032
Alignment:
Q  111 aaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaa 210  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||| || |||||    
T  21216131 aaaaagtaatttaatattttgtgattcattgagccacatataagatattaaactgataagaatagatgctatacatgatcttagtcaaaagaccaagaaa 21216032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27134625 - 27134511
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||    
T  27134625 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtttgactcattagaccacatatcagatattaaaccaataagaacagatactagatttgatcttagtgaaaagg 27134526  T
Q  203 ccgagaaaggtatga 217  Q
    |||| ||||||||||    
T  27134525 ccgaaaaaggtatga 27134511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8128256 - 8128149
Alignment:
Q  103 ccccctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaaccgataagaacagatactacacttgatcttagccaaaagg 202  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||     
T  8128256 ccccctcaagaaataaatttaatattgtgtga-ccattggcccacatatcatatattaaactaaaaagaacatatactacacttaatcttaaccaaaaga 8128158  T
Q  203 ccgagaaag 211  Q
     ||||||||    
T  8128157 acgagaaag 8128149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 15758562 - 15758608
Alignment:
Q  169 agaacagatactacacttgatcttagccaaaaggccgagaaaggtat 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15758562 agaacagatattacacttgatcttagccaaaaggctgagaaaggtat 15758608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5507 - 5450
Alignment:
Q  106 cctcaaaaaagtaatttaatatcgtgtgaaccattggtccacatatcagatattaaac 163  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5507 cctcaaaaaataaatttaatatcgtgtgaacaattggcccatatatcagatattaaac 5450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University