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Alignment Overview

Query: NF10182_low_1 (Length: 615)

Name: NF10182_low_1
Description: NF10182
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10182_low_1
NF10182_low_1
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (16-475)||(42877477-42877933)
chr8 (159-367)||(38696306-38696516)
chr8 (158-369)||(42878737-42878935)
chr8 (154-367)||(42098556-42098772)
chr8 (518-609)||(42877979-42878070)
chr8 (157-375)||(38696908-38697126)
chr8 (162-367)||(14840807-14841014)
chr8 (158-313)||(45437445-45437601)
chr8 (175-369)||(32798437-32798634)
chr8 (175-353)||(42872113-42872291)
chr8 (278-465)||(10669252-10669443)
chr8 (175-374)||(4810483-4810681)
chr8 (175-350)||(24192589-24192765)
chr8 (157-395)||(13116326-13116565)
chr8 (158-273)||(41743619-41743734)
chr8 (162-312)||(45394968-45395119)
chr8 (252-367)||(9854787-9854904)
chr8 (158-367)||(13117540-13117752)
chr8 (176-375)||(22551022-22551222)
chr8 (174-318)||(17702231-17702378)
chr8 (275-350)||(31845721-31845795)
chr8 (155-373)||(42100009-42100228)
chr8 (279-374)||(20180575-20180671)
chr8 (175-373)||(44076263-44076465)
chr8 (156-298)||(28418801-28418944)
chr8 (174-367)||(32695181-32695378)
chr8 (278-352)||(43202214-43202288)
chr8 (158-298)||(28420152-28420293)
chr8 (273-358)||(42362668-42362753)
chr8 (177-374)||(45281089-45281288)
chr8 (177-325)||(41629724-41629872)
chr8 (156-374)||(28734983-28735205)
chr8 (183-373)||(32693852-32694043)
chr8 (232-375)||(17455118-17455263)
chr8 (278-352)||(24305160-24305234)
chr8 (187-375)||(6397809-6397998)
chr8 (183-312)||(41742089-41742218)
chr8 (218-326)||(45279737-45279845)
chr8 (153-244)||(34504673-34504764)
chr8 (174-373)||(32797151-32797354)
chr8 (175-271)||(8570132-8570228)
chr8 (278-333)||(8571559-8571614)
chr8 (274-337)||(17701053-17701116)
chr8 (307-350)||(40437522-40437565)
chr8 (173-271)||(17338053-17338151)
chr8 (175-245)||(26696546-26696616)
chr8 (426-466)||(42837493-42837533)
chr8 (187-369)||(42870839-42871025)
chr8 (158-296)||(17339530-17339668)
chr8 (421-463)||(19914794-19914836)
chr8 (157-219)||(36756057-36756119)
chr8 (173-239)||(45396055-45396121)
chr8 (278-346)||(26697763-26697831)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (157-457)||(1010184-1010484)
chr5 (161-411)||(8521255-8521505)
chr5 (159-369)||(1009182-1009394)
chr5 (158-369)||(8523655-8523865)
chr5 (518-609)||(8522908-8522999)
chr5 (156-366)||(30910736-30910950)
chr5 (518-609)||(1010037-1010128)
chr5 (149-375)||(32757813-32758042)
chr5 (175-375)||(325086-325287)
chr5 (177-367)||(30859078-30859272)
chr5 (278-375)||(1102736-1102834)
chr5 (159-312)||(9169584-9169738)
chr5 (175-367)||(22047746-22047942)
chr5 (156-375)||(22308699-22308920)
chr5 (178-350)||(39603870-39604045)
chr5 (157-244)||(26047809-26047896)
chr5 (159-346)||(30912093-30912280)
chr5 (158-271)||(32759054-32759167)
chr5 (406-477)||(8522795-8522867)
chr5 (300-375)||(11262533-11262609)
chr5 (157-335)||(33173901-33174080)
chr5 (187-367)||(27705223-27705406)
chr5 (156-463)||(10735758-10736069)
chr5 (158-375)||(10977019-10977237)
chr5 (183-326)||(30857822-30857965)
chr5 (183-318)||(39605428-39605563)
chr5 (278-367)||(4127161-4127251)
chr5 (157-244)||(10978312-10978399)
chr5 (278-376)||(36898880-36898979)
chr5 (177-298)||(22049115-22049236)
chr5 (278-367)||(9220365-9220458)
chr5 (158-225)||(20538050-20538117)
chr5 (408-463)||(14210388-14210443)
chr5 (278-333)||(35081380-35081435)
chr5 (173-352)||(41144445-41144622)
chr5 (302-347)||(15548381-15548426)
chr5 (279-350)||(17420322-17420391)
chr5 (156-271)||(20539352-20539466)
chr5 (284-346)||(324163-324225)
chr5 (172-242)||(11846306-11846376)
chr5 (421-463)||(19524168-19524210)
chr5 (155-225)||(34899003-34899073)
chr5 (156-225)||(34894144-34894213)
chr5 (149-185)||(5382927-5382963)
chr5 (158-242)||(11796566-11796650)
chr5 (315-347)||(13520728-13520760)
chr5 (174-242)||(24503197-24503265)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (152-369)||(3455531-3455750)
chr3 (161-395)||(28909487-28909721)
chr3 (162-360)||(20288139-20288339)
chr3 (278-444)||(10338856-10339023)
chr3 (174-367)||(3208497-3208693)
chr3 (159-367)||(10732036-10732247)
chr3 (177-374)||(12107880-12108083)
chr3 (152-350)||(35370904-35371098)
chr3 (162-271)||(43174712-43174821)
chr3 (173-367)||(26886284-26886481)
chr3 (158-360)||(53614187-53614392)
chr3 (276-371)||(48083343-48083439)
chr3 (281-371)||(14745104-14745195)
chr3 (176-367)||(38242423-38242617)
chr3 (279-444)||(10301053-10301217)
chr3 (174-395)||(40244200-40244421)
chr3 (175-375)||(53624263-53624463)
chr3 (549-609)||(3454794-3454854)
chr3 (156-326)||(10730880-10731050)
chr3 (173-367)||(41264560-41264757)
chr3 (187-375)||(42684902-42685092)
chr3 (155-273)||(50809415-50809533)
chr3 (155-273)||(50866329-50866447)
chr3 (156-244)||(43173881-43173969)
chr3 (279-342)||(11224776-11224839)
chr3 (295-350)||(27841635-27841690)
chr3 (232-387)||(20314652-20314809)
chr3 (157-298)||(50810812-50810954)
chr3 (157-298)||(50864910-50865052)
chr3 (278-349)||(49379819-49379891)
chr3 (175-344)||(53420330-53420501)
chr3 (232-360)||(20336572-20336702)
chr3 (278-344)||(7270441-7270507)
chr3 (278-350)||(34819210-34819285)
chr3 (278-349)||(13621037-13621109)
chr3 (183-373)||(34818108-34818299)
chr3 (174-273)||(37735319-37735418)
chr3 (278-395)||(55423511-55423628)
chr3 (177-273)||(18458661-18458757)
chr3 (174-244)||(24403252-24403322)
chr3 (187-245)||(53194902-53194960)
chr3 (183-245)||(55328337-55328399)
chr3 (278-375)||(5123247-5123344)
chr3 (273-367)||(21074188-21074284)
chr3 (278-395)||(31282419-31282536)
chr3 (266-326)||(53622767-53622830)
chr3 (157-212)||(20336693-20336748)
chr3 (231-346)||(36175333-36175448)
chr3 (322-369)||(44602950-44602997)
chr3 (177-295)||(18197163-18197281)
chr3 (156-326)||(26887506-26887676)
chr3 (278-375)||(53194512-53194610)
chr3 (162-243)||(9338470-9338551)
chr3 (276-381)||(21515506-21515611)
chr3 (175-244)||(36176540-36176609)
chr3 (87-147)||(40839847-40839908)
chr3 (419-463)||(11220546-11220590)
chr3 (278-365)||(18442366-18442454)
chr3 (278-365)||(19487440-19487528)
chr3 (315-355)||(24487239-24487279)
chr3 (156-192)||(28909236-28909272)
chr3 (300-336)||(28909550-28909586)
chr3 (153-273)||(42686149-42686269)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (156-403)||(15746639-15746887)
chr1 (159-352)||(48096956-48097149)
chr1 (157-375)||(46318518-46318737)
chr1 (158-374)||(46467143-46467360)
chr1 (162-346)||(10722306-10722493)
chr1 (156-367)||(15232747-15232961)
chr1 (160-271)||(46468725-46468836)
chr1 (152-326)||(49802846-49803020)
chr1 (162-271)||(7161366-7161474)
chr1 (156-367)||(49801612-49801826)
chr1 (158-373)||(16963831-16964047)
chr1 (176-365)||(16965035-16965228)
chr1 (159-313)||(42244629-42244785)
chr1 (172-346)||(10711797-10711974)
chr1 (280-350)||(13147342-13147412)
chr1 (158-244)||(42245920-42246006)
chr1 (278-350)||(3617423-3617495)
chr1 (232-375)||(46110353-46110497)
chr1 (157-271)||(15743272-15743386)
chr1 (177-350)||(45584933-45585109)
chr1 (176-313)||(52628837-52628974)
chr1 (278-350)||(9226141-9226213)
chr1 (183-346)||(15072720-15072884)
chr1 (278-375)||(48527652-48527750)
chr1 (175-344)||(35943379-35943549)
chr1 (159-373)||(15233945-15234159)
chr1 (278-367)||(51445707-51445798)
chr1 (278-367)||(5612993-5613082)
chr1 (279-367)||(14478384-14478474)
chr1 (158-240)||(20064173-20064255)
chr1 (278-374)||(12665909-12666005)
chr1 (278-335)||(41873912-41873969)
chr1 (278-350)||(44999388-44999460)
chr1 (292-367)||(52078052-52078128)
chr1 (174-313)||(24499619-24499758)
chr1 (178-328)||(27814309-27814460)
chr1 (278-352)||(18821663-18821737)
chr1 (175-333)||(14470870-14471029)
chr1 (278-350)||(9482574-9482645)
chr1 (164-240)||(20069924-20070000)
chr1 (279-350)||(6049351-6049422)
chr1 (174-245)||(15071355-15071426)
chr1 (174-313)||(44276135-44276274)
chr1 (278-367)||(26286530-26286619)
chr1 (169-243)||(51042376-51042450)
chr1 (278-374)||(28050439-28050536)
chr1 (284-375)||(19466109-19466200)
chr1 (218-335)||(23091408-23091527)
chr1 (175-226)||(46111539-46111590)
chr1 (518-598)||(2471582-2471664)
chr1 (278-375)||(13894732-13894829)
chr1 (278-335)||(34350228-34350288)
chr1 (285-350)||(9485230-9485295)
chr1 (174-234)||(835258-835318)
chr1 (175-335)||(14477732-14477893)
chr1 (293-367)||(26802073-26802148)
chr1 (322-369)||(27556431-27556478)
chr1 (178-257)||(44278369-44278448)
chr1 (408-461)||(6048093-6048147)
chr1 (178-240)||(10376645-10376706)
chr1 (338-396)||(15743415-15743472)
chr1 (279-375)||(30535570-30535666)
chr1 (175-323)||(50444651-50444800)
chr1 (303-375)||(51300160-51300233)
chr1 (419-463)||(26055081-26055125)
chr1 (300-375)||(34351865-34351940)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (154-345)||(127426-127618)
scaffold0011 (156-271)||(128597-128712)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (159-352)||(40723225-40723419)
chr4 (158-375)||(13533162-13533379)
chr4 (159-375)||(53432060-53432278)
chr4 (164-335)||(53435694-53435866)
chr4 (160-352)||(34326729-34326919)
chr4 (174-335)||(52963582-52963743)
chr4 (156-271)||(40724850-40724963)
chr4 (175-367)||(52239891-52240086)
chr4 (162-350)||(28590830-28591020)
chr4 (175-375)||(6348169-6348370)
chr4 (156-367)||(7707583-7707798)
chr4 (278-367)||(56085465-56085555)
chr4 (174-350)||(2312406-2312585)
chr4 (175-367)||(27850845-27851034)
chr4 (157-371)||(33231385-33231601)
chr4 (152-274)||(38698031-38698153)
chr4 (175-350)||(44498474-44498651)
chr4 (159-350)||(26629789-26629980)
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Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
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Target Start/End: Original strand, 42877477 - 42877933
Alignment:
Q  16 aataattcgattagcaattaacgcaacacataaaatcataaccatcttcttcataaattataattttctt-gatttgtgatgattggttagaagagatgg 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  42877477 aataattcgattagcacttaacgcaactcataaaatcata----tcttcttcataaattataattttctttgatttgtgatgattggttagaagagatga 42877572  T
Q  115 taactttaatctaaaattttcaagtttttagttatttaaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  42877573 taactttaatctaaaattttcaagtttttagttatttaaaattaggcttaataggttatttggtctcttaattaatttcaagttttcattttggtctcat 42877672  T
Q  215 aactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42877673 aactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtcttcgtcagtcaaataaatcccgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacc 42877772  T
Q  315 ttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatc 414  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42877773 ttaagaatggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaagggccgttgtatc 42877872  T
Q  415 taacagtgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttcatcaacaccaaa 475  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42877873 taacagcgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttcatcaacaccaaa 42877933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 38696306 - 38696516
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38696306 ggcttaataggccatttggtcccctaattaattttaagttttcattttggtctcataactaataaaactcatgttttggtccctcaagtttgcctccgtc 38696405  T
Q  259 agtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttc 356  Q
     |||||||||||| |   |  |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||     
T  38696406 ggtcaaataaatcccttgctattaagtttaaccctaaatgtctatggtagaccaaccttaaaagtggtccaccatagatctaattaatttttataatttt 38696505  T
Q  357 aaccctttgat 367  Q
    |||||||||||    
T  38696506 aaccctttgat 38696516  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42878935 - 42878737
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||               ||||||||    
T  42878935 aggcttaataggtcatttggtcccctaattaatttcaagttttcattttggtcccataactaatgaaactcatgttt---------------gtctccgt 42878851  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaacccc---aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatt 354  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42878850 cagtcaaataaatcctgacagttaactttaaccccccaaaatgt-tatggtggaccaaccttaagtgtggtccaccatagatcctattaattatttaatc 42878752  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 367
Target Start/End: Original strand, 42098556 - 42098772
Alignment:
Q  154 aattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtct 253  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   |||||| |||| |||||||||||    
T  42098556 aattaggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaagtggcgttttgatcccccacgtttgtct 42098655  T
Q  254 ccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tt 349  Q
    ||||  | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||   |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42098656 ccgtttgccaaataaatc-cgactgttaattttaaccccaaatgatgtctttggtggaccaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattactt 42098754  T
Q  350 taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  42098755 taatttcaaccgtttgat 42098772  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 518 - 609
Target Start/End: Original strand, 42877979 - 42878070
Alignment:
Q  518 gattgattcttcttctccgaaacggcgacatttggatgatgatgtggtgcagaaggaagtttacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42877979 gattgattcttcttctccgaaacggcgacatttggatgatgatgtggtgcagaaggaagttgacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 42878070  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38697126 - 38696908
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  38697126 taggcttaatagctcatttggtccctcaattaatttccagttttcattttggtcccataactaataaaactcatgttttgatccttcacatttgcctccg 38697027  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaattt 355  Q
    || ||||||||||||      || |||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |  ||||||| || |||||    
T  38697026 tcggtcaaataaatcatttatgtcaactttaacctcaaatttctattgtggaccaacattataga-tagtccaccatagacctaattaatttttcaattt 38696928  T
Q  356 caaccctttgatctattttt 375  Q
     || |||||||||| |||||    
T  38696927 taatcctttgatcttttttt 38696908  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14841014 - 14840807
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  14841014 ttaataggttatttggtcttttgattaatttcaaattttcattttggtaccataactaataaaattcatgttttggtccctcatatttgtctccgtctat 14840915  T
Q  262 caaataaatctcgacg--gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaa 358  Q
    ||||||||||||  ||   |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||| |||| |||||||| ||    
T  14840914 caaataaatctc-tcgttcttaagtttaaccacaaatgtctatggtggaccaacattaaaagtgatccaccatagttcttattaaattttttaatttaaa 14840816  T
Q  359 ccctttgat 367  Q
    || ||||||    
T  14840815 ccgtttgat 14840807  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45437601 - 45437445
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  45437601 aggcttaataggtcatttgatcccctaattaatttcaagttttcattttgatcccataattaataaaactcatgttttggtccctcgtgtttgcctccgc 45437502  T
Q  258 cagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
     ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  45437501 tagtcaaataaatccctgactgttaagtttaaccccaaatatttatggcgggccaac 45437445  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32798634 - 32798437
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||| ||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||       
T  32798634 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttagtccctcaattttttctccgtttgtcaaataaatcctc 32798535  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    |||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  32798534 acggttaagtttaactcaaatgatgtctatggtggatcaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgatct 32798437  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42872291 - 42872113
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || ||  || |||||  ||||||||  | ||||| |||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||  |    
T  42872291 tggtcccttaaataattttaagttttcattttaatctcataatgaataaaacgtacgttttagtccttcactttttcctccgtttgtcaaataaatcctg 42872192  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaat 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42872191 acggttaactttaacctcaaatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtctaccatagatcctattaattttttaat 42872113  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10669443 - 10669252
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttttc 376  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||  ||||||     
T  10669443 gttaactttaacctcaaatgtctatggtgaaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaaatattttaatttaaaccgattgataaatttttt 10669344  T
Q  377 caaaaaaggacggttaga--tttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaa--ttttttcactttcttcatcttcttcat 465  Q
     |||| ||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||| ||| || ||| | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10669343 taaaagaggacggttagatttttcg-aggtccattgtatctaatagtaaatcatgaccaactaattttttttcccttttttcatcttcttcat 10669252  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Original strand, 4810483 - 4810681
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||  ||| |||||||  | |||||||||| ||    
T  4810483 tggtccctcaaatactttcaaatttttattttggtcccataattaataaaacgtatgttttggtccttcaaatttttctccgtttgccaaataaatcccg 4810582  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaaccctttgatcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||     
T  4810583 acggttaactttaaccccaaatgatgtctatggtgga-----attaagagtggtccaccatagatcctattaatatttttaatttaaactgtttgatctt 4810677  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24192765 - 24192589
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatg-ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc-t 272  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| ||||  |||  |||||| | ||||| |  || |    
T  24192765 tggtccctcaattaatttcgagttttcgttttggtcccataactcttaaaa-tcatcattttggtctctcaacttttactccgttaatcaaaaaggtcct 24192667  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24192666 tgactgttaactttaaccctaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 24192589  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 395
Target Start/End: Original strand, 13116326 - 13116565
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| |||| |||| |||  |||||    
T  13116326 taggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaagtggcgttttagtccttcacattttcctccg 13116425  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaattt 355  Q
    |  | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||| || | |||||||    
T  13116426 tttgccaaataaatcccgactgttaactttaactccaaatgtctataatagaccaatcttcagagtggtccatcgtagaccctattacttttgttaattt 13116525  T
Q  356 caaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
     |||| || ||||||||| ||  |||| |||| |||||||    
T  13116526 taaccattcgatctatttatcataaaagggaccgttagat 13116565  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41743734 - 41743619
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |  | | |||||||    
T  41743734 aggcttaataggtcatttggtcctttaattaattttaagttttcattttggtcccataagtaataaaacttatgttttggtcctttaattgtttctccgt 41743635  T
Q  258 cagtcaaataaatctc 273  Q
    | |||||| |||||||    
T  41743634 cggtcaaaaaaatctc 41743619  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 312
Target Start/End: Original strand, 45394968 - 45395119
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |  | | |||| |||  |    
T  45394968 ttaatagatcatttgatcccttaattaattttaagttttcattttgatcccataattaataaaactcatgttttggttacttaattgtctctctgtcgat 45395067  T
Q  262 caaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaa 312  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  45395068 caaataaatccctgacggttaactttaactccaaatatctatggtggaccaa 45395119  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9854904 - 9854787
Alignment:
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt- 349  Q
    |||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9854904 ctccgtcagtcaaaaaggtcctgaccgttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccaactttaagagtggtccaccatagatcctattaattcttc 9854805  T
Q  350 taatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  9854804 taatttaaaccatttgat 9854787  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13117752 - 13117540
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||| ||    
T  13117752 aggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccataattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctctgt 13117653  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatt 354  Q
      | |||||||||| ||||  | || |||||||| ||  || | ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  13117652 ttgccaaataaatcccgaccatcaagtttaacccaaatgatctatatagtggaccaactttaaaagtggtccatcatagatcctattaattattttaata 13117553  T
Q  355 tcaaccctttgat 367  Q
    |||||| ||||||    
T  13117552 tcaaccgtttgat 13117540  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 22551022 - 22551222
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaat-ctcg 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||| ||| ||||| |  | ||||||||| || |    
T  22551022 ggtccctcaaataatttcaagtttttattttggtcccacaattaataaaacgtatcttttggtccctcac-tttttctccatttgccaaataaatcctgg 22551120  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    |  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |||| |||| | |||||| |||| |||||||| |||    
T  22551121 attgttaagtttaaccccaaatctctatggtggacaaaccttaaaagtgatccaccataaaccttattaaattttgtaatttaaaccgtttgatctgttt 22551220  T
Q  374 tt 375  Q
    ||    
T  22551221 tt 22551222  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17702378 - 17702231
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtc--aaataaatc 271  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||| |  |||  ||| |||||    
T  17702378 ttggtcccttaattaatttccaattttcattttggtcccataactaataaaacctatgttttggtccctcaagttcatctccatttgtcaaaaagaaatc 17702279  T
Q  272 tc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaa 318  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  17702278 tctgaccgttaactttaacctcaaatgtctatggtggatgaaccttaa 17702231  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31845795 - 31845721
Alignment:
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31845795 acggttaactttaaccccaaatgtctatggtgaaccaac-ttaagagtggtccaccataggtcctattaattattt 31845721  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42100228 - 42100009
Alignment:
Q  155 attaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctc 254  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||| |   |||||| |||||||  |||  |||    
T  42100228 attaggcttattagatcgtttgatcccttatttaatttcatgttttcattttggtctcacaattaataaaaatggcgttttgatccctcatattttcctc 42100129  T
Q  255 cgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaat 353  Q
    |||  | ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| | |||||    
T  42100128 cgtttgccaaataattcccgactgttaactttaacttcaaatgtctttggtggaccaaccttaaaagtggtccatcgtagaccttattaattttgttaat 42100029  T
Q  354 ttcaaccctttgatctattt 373  Q
    || |||| || |||||||||    
T  42100028 tttaaccattcgatctattt 42100009  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20180671 - 20180575
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||    
T  20180671 ttaactttaaccctaaatgtctatagtggactaacattaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaattaaaaccgtttgatctttttt 20180575  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44076465 - 44076263
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||  || ||||||| |||||  |||  ||||||  | |||||||||| |     
T  44076465 tggtccctcaaataatttcaaatttttattttggtcccacaattaataaaacgtatcttttggtgcctcaatttttcctccgtttgccaaataaatccct 44076366  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaaccctttgatcta 370  Q
    || ||||| |||||||||||   |||| ||||||||| |||| |||| | || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  44076365 acagttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaacaacattaaaaatgatccaccataaatcttattaatttttttaatttaaaccatttgatcta 44076266  T
Q  371 ttt 373  Q
    |||    
T  44076265 ttt 44076263  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 298
Target Start/End: Original strand, 28418801 - 28418944
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||  ||||    
T  28418801 ttaggcttaatagatccattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaacacacgttttagtccctcactttttcctcc 28418900  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
    ||  | ||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  28418901 gtttgccaaataaatctcaaactgttaactttaactctaaatgt 28418944  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32695378 - 32695181
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||  | ||||  |||| ||||||||  ||| ||  | ||||| | ||      
T  32695378 ttggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtctcacaattaataaaacgtacgtttaagtccttcacgttttcctctgtttgccaaattagtcct 32695279  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  32695278 gaccgttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtgaaccaatcttaagattggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 32695181  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 352
Target Start/End: Original strand, 43202214 - 43202288
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43202214 gttaattttaaccccaaatatctatagtggatcaaccttaagagtggtccaccatagatcctattagttatttaa 43202288  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28420293 - 28420152
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||  ||||||    
T  28420293 aggcttaatagatccattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaacacacgttttagtccctcattttttcctccgt 28420194  T
Q  258 cagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
      ||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  28420193 ttgtcaaataaatctcaaactgttaactttaactctaaatgt 28420152  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42362753 - 42362668
Alignment:
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaa 358  Q
    |||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42362753 cgactgttaactttaattccagatgtctatggtggaccaacattaagagtggttcatcatagatcctattaattttttaatttcaa 42362668  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45281288 - 45281089
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||||| | || |||||||| | |||||||| ||| |||  |||  |||| |  | |||||||||| | ||    
T  45281288 gtccctcaaataatttcaagttttcattttggtccaacaattaataaaaat-atgttttgatccttcagattttcctccatttgccaaataaatcccaac 45281190  T
Q  277 ggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
     ||||||||||| || ||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| |||    
T  45281189 agttaactttaatccaaatgatgtctacggtggaccaaccttaagagtggtctaccataaatcctattaatatttttaatttaaaccgtttgatcttttt 45281090  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 325
Target Start/End: Original strand, 41629724 - 41629872
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||  || ||||| ||||||| ||||   |||||  | |||||||||| ||||    
T  41629724 gtcccctaaataatttcaagtttttattttggtctcacaattaataaaacgtatattttgatccctcaagttttcttccgtttgccaaataaatcccgac 41629823  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggt 325  Q
     |||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41629824 cgttaacttgaactccaaaagtctatggtgaaccaaccttaaaagtggt 41629872  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 374
Target Start/End: Original strand, 28734983 - 28735205
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtct-- 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |    ||||||      
T  28734983 ttaggcttaataggtcatttgatttcctaattaattttaagtgttcattttggttccataattaataaaactcatgttttggtctcacttaattgtcttc 28735082  T
Q  254 ccgtcagtcaaataaatct-cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt-a 351  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||| |||  || |||||  ||    |||||||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  28735083 ccgtcagtcaaataaatctgagactattaagtttaaccccaaatgtctatcatgaaccaaaattgtaggtggtccatcatagaccatattaattttttca 28735182  T
Q  352 atttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    |||| | ||||||||||| ||||    
T  28735183 attttatccctttgatctttttt 28735205  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 373
Target Start/End: Original strand, 32693852 - 32694043
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||  | | |||||||| |||  |||  ||||||  | |||||||||| | || |||||    
T  32693852 taattaattttaagttttcattttggtcccacaattaataaaacatacgctttggtccttcagattttcctccgtttgccaaataaatcccaacagttaa 32693951  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    |||||||   |||||| |||| |||||||||||||| ||||| | | |||||| | |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32693952 ctttaactttaaatgtatatgatggaccaaccttaaaagtggcctatcatagaccttattaattttattaattttaaccgtttgatctattt 32694043  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 375
Target Start/End: Original strand, 17455118 - 17455263
Alignment:
Q  232 ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccacc 330  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |     ||||||||||||  ||||| | |||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  17455118 ttttggtcccttatgtttgtctccttcattcaaataaatccttttatgttaactttaacttcaaatatctatgctagaccaatcttaaaagtggtccacc 17455217  T
Q  331 atagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17455218 atagatcttattaattattttaatttgaaccgttttatctattttt 17455263  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 352
Target Start/End: Original strand, 24305160 - 24305234
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||    
T  24305160 gttaactttaaccctaaatgtctatggtggaccaacattaagagtgatctatcttagatcctattaattttttaa 24305234  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 375
Target Start/End: Original strand, 6397809 - 6397998
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaacttt 286  Q
    ||||||||  |||| || ||||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||||  ||| |||||||  | ||||||||||  ||  ||||| |||    
T  6397809 taatttcatattttcattttggtcccacaattaataaaacttacattttagtccctcatttttttctccgtttgccaaataaatcatgaatgttaaattt 6397908  T
Q  287 aaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||| ||||||   ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  6397909 aactccaaataactatggtaaaccaacctttacagtggtccaccatagaccttattaatttttttaatttaaaccatttgatctgttttt 6397998  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 41742089 - 41742218
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||||||||||| || || ||   |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||  || |||||    
T  41742089 taattaatttcaagttttcattttagttttataattaataaaatttatgttttggtccctcacatttgttttcatcggtcaaataaatcttaaccgttaa 41742188  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaa 312  Q
    |||||||  ||| ||| | |||||||||||    
T  41742189 ctttaacatcaagtgtctgtggtggaccaa 41742218  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 326
Target Start/End: Original strand, 45279737 - 45279845
Alignment:
Q  218 taataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta 317  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||| | | |||  | |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||    
T  45279737 taataaaacgtacgttttggtccctcaagttttttttcgtttggcaaataaatcccgacggttaactttaactctaaatgtatatggtggaccagtctta 45279836  T
Q  318 agagtggtc 326  Q
    | |||||||    
T  45279837 aaagtggtc 45279845  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 34504764 - 34504673
Alignment:
Q  153 aaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||| ||| | ||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34504764 aaattaggtttatttggtccattggtctcctaattaattttcagtttttattttagtctcataactaataaaacacatgttttggtccctca 34504673  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 373
Target Start/End: Original strand, 32797151 - 32797354
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtca---aataaat 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||  |||||||| ||||  ||||||    ||   |||||||    
T  32797151 ttggtcccttaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcaggttttcctccgtttaccaaataataaat 32797250  T
Q  271 ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    | || | ||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||| || | |||| | |||||||| | ||||||| |||| || |||||    
T  32797251 cgcggccgttaagtttaactccaaatgtctatgatggatcaaccttaaaaatggttcatcgtagaccttattaattttgttaattttaaccattcgatct 32797350  T
Q  370 attt 373  Q
    ||||    
T  32797351 attt 32797354  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 8570132 - 8570228
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | || |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  8570132 tggtcccctaattaatttcacgttttcattttggtcctacaattaataaaacgtacgttttggtccctcacttttgtctctgtttgccaaataaatc 8570228  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8571614 - 8571559
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  8571614 gttaagtttaaccccaaatgtctatggtggaccaactttaaaaatggtccaccata 8571559  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 337
Target Start/End: Original strand, 17701053 - 17701116
Alignment:
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatc 337  Q
    |||||||||||||||| | |||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17701053 gacggttaactttaactctaaatttctatgatggatcaaccttacgagtggtccaccatagatc 17701116  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 307 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40437565 - 40437522
Alignment:
Q  307 gaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40437565 gaccaaccttaaaagtggtccaccgtagatcctattaattattt 40437522  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 17338053 - 17338151
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||    
T  17338053 tttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcacatttttctccgtttgccaaataaatc 17338151  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 245
Target Start/End: Original strand, 26696546 - 26696616
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcac 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  26696546 tggtcccctaattaatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacatacattttggtccctcac 26696616  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 42837533 - 42837493
Alignment:
Q  426 catcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttcatc 466  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42837533 catcaacaactatttttttcattttcttcatcttcttcatc 42837493  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 42870839 - 42871025
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaacttt 286  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||| |||||| || |||   || ||  | | ||| ||||  ||| ||||| |||    
T  42870839 taatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgttttagtcccttactttttcgtctgtttgccgaatgaatcctgactgttaagttt 42870938  T
Q  287 aaccccaaa---tgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    |||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  42870939 aaccccaaaagatgtctattgtggaccaatcttaagagtggtccaccgtagaccttattaaattttgtaatttaaaccgtttgatct 42871025  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17339668 - 17339530
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||| | || |||||||| |    |||| |||||||||||||  ||||||    
T  17339668 aggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatattttcattttggtccaacaattaataaaaatggcattttagtccctcacgttttcctccgt 17339569  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaat 296  Q
      | ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||    
T  17339568 ttgccaaataaatcctgactgttaagtttaactccaaat 17339530  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19914836 - 19914794
Alignment:
Q  421 tgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttc 463  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19914836 tgaaccaccaacacctaattttttctctttcttcatcttcttc 19914794  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Original strand, 36756057 - 36756119
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataacta 219  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  36756057 taggcttaatacatcatttggtcccttaacttatttttagtttttaatttggtcccataacta 36756119  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 45396121 - 45396055
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtc 239  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  45396121 tttggtccctcgattaattttcagttttcattttggtcccataactaaaaaaactcacgtttcggtc 45396055  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26697831 - 26697763
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    | |||||||||||| |||| |||||    
T  26697831 gttaagtttaaccccaaatgtttatggtggaccaacattatatatagtccaccatagaccctagtaatt 26697763  T

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Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 157 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1010484 - 1010184
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010484 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttattttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 1010385  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttc 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010384 tcagtcaaataaatcccgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccgccatagatcctattaattatttaatttc 1010285  T
Q  357 aaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcat 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010284 aaccctttgatctatttttccaaaaaaggacgattagatttcgaagggccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcat 1010185  T
Q  457 c 457  Q
    |    
T  1010184 c 1010184  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 161 - 411
Target Start/End: Original strand, 8521255 - 8521505
Alignment:
Q  161 cttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521255 cttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagttttcattttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcag 8521354  T
Q  261 tcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaacc 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521355 tcaaataaatcccgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagaatggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaacc 8521454  T
Q  361 ctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgt 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8521455 ctttgatctattttttcaaaaaaggacggttagatttcgaagggccgttgt 8521505  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 159 - 369
Target Start/End: Original strand, 1009182 - 1009394
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  1009182 ggcttaataggtcatttggttccctaattaatttcaagttttcattttggttccataactaataaaactcatgttttggttcttcatgtttgtctccatc 1009281  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaacccc---aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaattt 355  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1009282 agtcaaataaatcttgatagttaacttttaccccccaaaatgt-tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatct 1009380  T
Q  356 caaccctttgatct 369  Q
    ||| ||||||||||    
T  1009381 caatcctttgatct 1009394  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 158 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8523865 - 8523655
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  8523865 aggcttaataggtcatttggtcccctaattaatttcaagttttcattttggtcccataactaataaaactcatgttttgatccttcatgtttgtctccgt 8523766  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaacccc---aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatt 354  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||     
T  8523765 cagtcaaataaatcctgacagttaactttaaccccccaaaatgt-tatggtggaccaaccttcagagtggtccaccatag---gaattaattatttaatc 8523670  T
Q  355 tcaaccctttgatct 369  Q
    |||||||||||||||    
T  8523669 tcaaccctttgatct 8523655  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 518 - 609
Target Start/End: Original strand, 8522908 - 8522999
Alignment:
Q  518 gattgattcttcttctccgaaacggcgacatttggatgatgatgtggtgcagaaggaagtttacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522908 gattgattcttcttctccgaaacggcgacatttggatgatgatgtggtgcagaaggaagttgacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 8522999  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 366
Target Start/End: Original strand, 30910736 - 30910950
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  |||     
T  30910736 ttaggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctct 30910835  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-ttta 351  Q
    ||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30910836 gtttaccaaataaatctcgactgttaactttaacaccaaatgatgtctttggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttta 30910935  T
Q  352 atttcaaccctttga 366  Q
    ||||||||| |||||    
T  30910936 atttcaaccgtttga 30910950  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 518 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 1010128 - 1010037
Alignment:
Q  518 gattgattcttcttctccgaaacggcgacatttggatgatgatgtggtgcagaaggaagtttacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 609  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010128 gattgattcttcttctccaaaacggtgtcatttggatgatgatgtggtgcagaaggaagttgacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 1010037  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 375
Target Start/End: Original strand, 32757813 - 32758042
Alignment:
Q  149 tttaaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtt 248  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32757813 tttaaactaaggtttaataggtcatttggtccctcaaataatttccagttttcattttggtcccataaataataaaactcatgttttggtccctcaagtt 32757912  T
Q  249 tgtctccgtcagtcaaataaat-ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacct-taagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
       ||||| | ||||||||||| |  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||| | |||||||||||| | ||||||||    
T  32757913 cacctccgccggtcaaataaatccatgggtgttaactttaaccccaaatgtctatggtggaccaacatggtaga-tagtccaccatagaccttattaatt 32758011  T
Q  347 attt--aatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
     |||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  32758012 tttttcaattttaaccctttgatcttttttt 32758042  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 325287 - 325086
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||| ||    
T  325287 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcaagttttcctccgtttgccaaataaatcccg 325188  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    || |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||    
T  325187 actgttaactttaactctaaatgtctatggtggaccaaccttaatagtggtccatcgtagaccttattaattttgttaattttaaccgtttgatcttttt 325088  T
Q  374 tt 375  Q
    ||    
T  325087 tt 325086  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30859272 - 30859078
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||  ||||||||| |||  ||| ||  | ||||||| ||| |||    
T  30859272 gtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcacattttcctctgtttgccaaataagtcttgac 30859173  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
     ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  30859172 cgttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaccaatcttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 30859078  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 1102736 - 1102834
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  1102736 gttaactttaaccccaaatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtccaccatagatcttattaattattttaatttaaaccgtttgatcttttttt 1102834  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 312
Target Start/End: Original strand, 9169584 - 9169738
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactc-atgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | |  | | |||||||    
T  9169584 ggcttaataggtcatttggccccttaattaatttcaagttttcattttagtcccataattaataaaactctatgttttggtcttttaattgtctctccgt 9169683  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaa 312  Q
    | |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9169684 cggtcaaataaatccctgaagttaactttaaccccaaatgtctatagtggaccaa 9169738  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 22047746 - 22047942
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||  |||  ||||||  | ||||||||||  |    
T  22047746 tggtcccttaattaatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgttttggtccctcattttttcctccgtttgccaaataaatcctg 22047845  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
     | ||||| |||||| | ||   |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22047846 gctgttaagtttaactctaaatgatgtctatggtggatcaaccttaagagtggtccaccataaatcctatgaattattttaatttaaaccgtttgat 22047942  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22308920 - 22308699
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    ||||| ||||||||| |||  ||||    
T  22308920 ttaggcttattagatcgtttggtcccctaaataatttcatgttttcattttggtcccataattaataaaacaggcgttttagtccctcacattttgctcc 22308821  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaat 353  Q
    ||  | ||||||||||   |   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||    
T  22308820 gtttgccaaataaatccatggttgttaagtttaaccccaaatgtctatggtggacctaccttaagagtggtccaccatagacattattaaattttttaat 22308721  T
Q  354 ttcaaccctttgatctattttt 375  Q
     | |||| |||||||| |||||    
T  22308720 gtaaaccatttgatctgttttt 22308699  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Original strand, 39603870 - 39604045
Alignment:
Q  178 tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacg 277  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||||||  |||  ||||||  | ||||||||||  |||     
T  39603870 tccctcaaataatttcaagttttcattttgatcccacaattaataaaacgtacgttttggtccctcaaattttcctccgtttgccaaataaatcatgact 39603969  T
Q  278 gttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39603970 gttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtagaccaaccttaaaagtgatccaccatagatcctattaattattt 39604045  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 244
Target Start/End: Original strand, 26047809 - 26047896
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26047809 taggtttaataggtcatttggtcctctaattaatttcaaatttttattttggtctcataactaataaaactcatgttttagtccctca 26047896  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30912280 - 30912093
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| ||| |||||||     
T  30912280 ggcttattagatcgtttagtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaagtggcgttttagtccctcacctttttctccgtt 30912181  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
     | |||||||||| | |  |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||||    
T  30912180 tgccaaataaatcccaagtgttaactttaactccaaatatctatggtggaccaaccttaaaagtggtacatcatagaccttattaatt 30912093  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32759167 - 32759054
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||    
T  32759167 aggcttaataggtcatttggtccctcaaataattttcagttttcattttagttccataaataataaaactcatgttttggtccctcaagttcacctccgt 32759068  T
Q  258 cagtcaaataaatc 271  Q
    | ||||||||||||    
T  32759067 cggtcaaataaatc 32759054  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 477
Target Start/End: Original strand, 8522795 - 8522867
Alignment:
Q  406 cgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaa-ttttttcactttcttcatcttcttcatcaacaccaaacc 477  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522795 cgttgtatctaacaatgaaccatcaacaactaattttttttactttcttcatcttcttcatcaacaccaaacc 8522867  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 11262533 - 11262609
Alignment:
Q  300 tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  11262533 tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattataatttaaaccatttgatcttttttt 11262609  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33174080 - 33173901
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||| |  |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||| |    
T  33174080 taggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttgatcccacatttaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttcctctg 33173981  T
Q  257 tcagtcaaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    |  | |||||||||| | | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33173980 tttgccaaataaatccttggctgttaagtttaaccccaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtctaccataga 33173901  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27705406 - 27705223
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaacttt 286  Q
    |||||||||||||| || ||||||  | || |||||||||  | ||||||||||||||  |||  |||| |  | |||||||||   ||| |||||||||    
T  27705406 taatttcaagttttcattttggtcatacaattaataaaacgtacgttttggtccctcagattttcctccttttgccaaataaatacagacagttaacttt 27705307  T
Q  287 aaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaaccctttgat 367  Q
    || || ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  27705306 aatccaaatgatgtctatggtggaccaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaatatttttaatttaaaccgtttgat 27705223  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 463
Target Start/End: Original strand, 10735758 - 10736069
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||  |||||   | |||||||||||||  ||||  ||||    
T  10735758 ttaggcttaattggacttttggtcccctaagtaattacttgttttcattttggtcccataactcgtaaaatcaacgttttggtccctcttgttttgctcc 10735857  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcga-cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaat 353  Q
    || ||||||| |  || | | | |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10735858 gttagtcaaaaaggtccctaaccgttaactttaactccaaatatctatggtggaccaacgttaacagcagtccaccatagatcatattaattattttaat 10735957  T
Q  354 ttcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaatttttt---cacttt 450  Q
    || |||| | |||| || ||||  ||||||||||  || |||| || |||    || |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||   || |||    
T  10735958 ttaaaccgtctgat-taattttttaaaaaaggaccatttgattacgcaggtgtattttatctaatggtgcaccatcaacatctaattttttgcacatttt 10736056  T
Q  451 cttcatcttcttc 463  Q
    |||||||||||||    
T  10736057 cttcatcttcttc 10736069  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 375
Target Start/End: Original strand, 10977019 - 10977237
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||  |||   |||||    
T  10977019 aggcttaataggtcatttgatcccctaattaatttgcaattttcatcttggtcctataactaataaaacccacgtttcggtccctcaattttacgtccgt 10977118  T
Q  258 cagtcaaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttc 356  Q
    |||||||||   || |   | ||||| ||||||  ||||||| || | ||||||||| ||    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||     
T  10977119 cagtcaaattggtcatgttccgttaattttaacttcaaatgtctaagatggaccaacattgtatgtggtctaccatagaccatattaattttttaatttt 10977218  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    | || ||||||||||||||    
T  10977219 atccatttgatctattttt 10977237  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 326
Target Start/End: Original strand, 30857822 - 30857965
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||  |||  |||| |  |||||||||||||  || |||||    
T  30857822 taattaattttaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatgttttggtccttcagattttcctccttttgtcaaataaatcttaacagttaa 30857921  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    |||||||   |||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  30857922 ctttaactttaaatgtctatgatggaccaaccttaaaagtggtc 30857965  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39605563 - 39605428
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||  |||  ||||||  | ||||||||||  |||||||||    
T  39605563 taattaatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacatacgttttggtccctcagattttcctccgtttgccaaataaatcctgacggttaa 39605464  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaa 318  Q
    ||| |||   |||||| ||||||||||||| |||||    
T  39605463 cttcaactttaaatgtatatggtggaccaatcttaa 39605428  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4127251 - 4127161
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt-atttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  4127251 gttaactttaaccccaaatgtctatgatagatcaatcttaaaagtggtccaccatagatcctgttaattaatttaatttaaaccatttgat 4127161  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10978399 - 10978312
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||||    
T  10978399 taggcttaatagatcatttggtcccctaattaatttccaattttcattttggtcctataaataataaaacccacgtttcggtccctca 10978312  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36898979 - 36898880
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttttc 376  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  36898979 gttaactttaacctcaaatatttatggtggcccaaccttaaaagtagtccaccatagattctgttaattattttagtttaaaccctttgatttttttttc 36898880  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22049236 - 22049115
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||| ||  | |||||||||| |  |    
T  22049236 gtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccataattaataaaacgtacgttttggtccctcactttttcctctgtttggcaaataaatccctgc 22049137  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  22049136 tgttaagtttaaccccaaatgt 22049115  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9220458 - 9220365
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctt---aagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  9220458 gttaactttaacctcaaatgtctatggtggaccaacattaagaagagtggtcccccataaatcttattaattattttaatttaaaccgtttgat 9220365  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Original strand, 20538050 - 20538117
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  20538050 aggcttaataggttttttggtcccctaattaatttcaaattttcattttggtcccataattaataaaa 20538117  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 463
Target Start/End: Original strand, 14210388 - 14210443
Alignment:
Q  408 ttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttc 463  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  14210388 ttgtatctaacaatgaaccatctacaattaatttttttcctttcttcatcttcttc 14210443  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35081435 - 35081380
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35081435 gttaactttaacctcaaatgtctatagtggatcaaccttaagagttgtccaccata 35081380  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41144622 - 41144445
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||| || |||||||||||| |  |||||   | ||||||||||||    |||  |||||| ||||||| |  ||     
T  41144622 tttggtcccctaattaatttgttgttttcattttggtcccataaattctaaaatcaacgttttggtccctttgattttgctccgttagtcaaaaaggtcc 41144523  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41144522 tgacggttaactttaaccccaaatatatatgatggatcaaccttaa-attgatccaccatagat-ctattaattttttaa 41144445  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 347
Target Start/End: Original strand, 15548381 - 15548426
Alignment:
Q  302 tggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta 347  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  15548381 tggtggaccaaccttaagaatgatccaccataaatcctattaatta 15548426  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Original strand, 17420322 - 17420391
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  17420322 ttaactttaatcccaaatat-tatggtgaaccaaccttaagagtggt-tactatagattctattaattattt 17420391  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20539466 - 20539352
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||| |||  |||||    
T  20539466 ttaggcttaatagattttttggtcccctaattaattttaaattttcattttggtcccattattaat-aaagtcatgtttcggtcactcaagttcatctcc 20539368  T
Q  256 gtcagtcaaataaatc 271  Q
    ||  |||||| |||||    
T  20539367 gtatgtcaaaaaaatc 20539352  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Original strand, 324163 - 324225
Alignment:
Q  284 tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  324163 tttaactctaaatgtctatggtggaccaactttaatagtggtccatcatagaccttattaatt 324225  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11846376 - 11846306
Alignment:
Q  172 atttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccct 242  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  11846376 atttggtcccttaattaatttacaggtttcattttggtctcataactaataaaaattttgttttagtccct 11846306  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 463
Target Start/End: Original strand, 19524168 - 19524210
Alignment:
Q  421 tgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttc 463  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19524168 tgaaccaccaacatctaattttttccctttcttcatcttcttc 19524210  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34899073 - 34899003
Alignment:
Q  155 attaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  34899073 attaggcttattagatccattggtcccttaattaattttcatttttcattttggtcccataagtaataaaa 34899003  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 225
Target Start/End: Original strand, 34894144 - 34894213
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  34894144 ttaggcttattagatccattggtcccttaattaatttccatttttcattttggtcccgtaagtaataaaa 34894213  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 185
Target Start/End: Original strand, 5382927 - 5382963
Alignment:
Q  149 tttaaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5382927 tttaaaattaggcttaatacatcatttggtcccttaa 5382963  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 242
Target Start/End: Original strand, 11796566 - 11796650
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccct 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||   |||||  || |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  11796566 aggcttaattggacatttggtcccctaaataattatgagtttacattttggtcccataaattgtaaaactcatattttggtccct 11796650  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13520760 - 13520728
Alignment:
Q  315 ttaagagtggtccaccatagatcctattaatta 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13520760 ttaagagtggttcaccatagatcctattaatta 13520728  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 242
Target Start/End: Original strand, 24503197 - 24503265
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccct 242  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||    
T  24503197 ttggtcccttaattaattaccaattttcattttggtcccataagtaataaaacgtaccttttggtccct 24503265  T

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Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3455750 - 3455531
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3455750 aaaagtaggcttaataggtcatttggtccccgaattaatttcaagttttcattttggtctcataactaataaaactcatgttttggtccttcatgtttgt 3455651  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaacccc---aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat 348  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3455650 ctccgtcagtcaaataaatcctgacagttaactttaaccccccaaaatgt-tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcatattaattat 3455552  T
Q  349 ttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  3455551 ttaatctcaaccctttgatct 3455531  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28909721 - 28909487
Alignment:
Q  161 cttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcag 260  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28909721 cttaataggtcattcagtcctctaattaattttcagttttcattttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgttgg 28909622  T
Q  261 tcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaa 358  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||| | | ||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  28909621 tcaaataaatctctgac--ttaagtttaaccccaaatatctgtggtgaaccactcttaaggttggtccaccatagatcctattaatttttttaatttaaa 28909524  T
Q  359 ccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
    |   ||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  28909523 ctggttgatcttttttattaaaagaggacggttagat 28909487  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20288339 - 20288139
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||    
T  20288339 ttaataggccatttggtcccctaattaatttttagttttcattttgatcccataattaataaaactcatgtgttggtccctcaagtttgtctctgttagt 20288240  T
Q  262 caaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaa 358  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  20288239 caaataaatccctgactgttaagtttaactccaaatgtctatggtggaccaacattataga-tattccaccatagaccttattaatttatttaatttaaa 20288141  T
Q  359 cc 360  Q
    ||    
T  20288140 cc 20288139  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 444
Target Start/End: Original strand, 10338856 - 10339023
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttttc 376  Q
    ||||||||||||| || |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | |||||     
T  10338856 gttaactttaacctcagatgtctataatgaaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaattttaactgtttgatttttttttt 10338955  T
Q  377 caaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaatttttt 444  Q
      ||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  10338956 ttaaataggacggttagattttggaggtccattgtatctaatattgaatcatcaccaactaatttttt 10339023  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 367
Target Start/End: Original strand, 3208497 - 3208693
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||  ||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| |  |||  ||||||  ||||||||||||      
T  3208497 ttggtcctctaattaatttccatttttcattttggtcccataattaataaaacgtacgttttgatcccttattttttcctccgtttgtcaaataaatcct 3208596  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtg--tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
     || ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  3208597 taccgttaagtttaaccccaaatgatattatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataaatcctattaattattataatttaaaccgtttgat 3208693  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10732247 - 10732036
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||| |||||||   ||||| || |||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||||||     
T  10732247 ggcttattagatcgtttgatcccttatttaatttattgttttcattttggtcccataattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctccgtt 10732148  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaattt 355  Q
       |||||||||  |||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10732147 taccaaataaattccgacggttaagtttaacccaaatgatgtctatggtggaccaacctttagagcggtccaccatagatcctattaattattttaattt 10732048  T
Q  356 caaccctttgat 367  Q
    | ||| ||||||    
T  10732047 cgaccgtttgat 10732036  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12108083 - 12107880
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataa---atctc 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||   ||| |    
T  12108083 gtcccttaaataatttcaagttttcattttggtcccacaactaataaaacatatattttggtccctcactttttcctccgtttgccaaataataaatcac 12107984  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatcta 370  Q
    |   ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||| ||||||||     
T  12107983 gggtgttaaatttaaccccaaatgatatttatggtggaccaaccttaaaagtggtccaccatagaccctattttttttttaatataaaccgtttgatctt 12107884  T
Q  371 tttt 374  Q
    ||||    
T  12107883 tttt 12107880  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 350
Target Start/End: Original strand, 35370904 - 35371098
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||| || |||||||| |  |||||| |||| |||| |||      
T  35370904 aaaaataggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttgatcccacaattaataaaaatggtgttttagtccttcaccttttc 35371003  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt 349  Q
    ||| ||  ||||||||      ||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35371004 ctctgtttgtcaaata------gacggttaagtttagcccaaatgatgtttatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt 35371097  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43174821 - 43174712
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| |    
T  43174821 ttaatatgtcatttggtcccttatttaattttaagttttcattttgaccccataactaataaaactcatgttttggtccctcaaatctatctccgtcaat 43174722  T
Q  262 caaataaatc 271  Q
    ||||||||||    
T  43174721 caaataaatc 43174712  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Original strand, 26886284 - 26886481
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||  | || |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||     
T  26886284 tttggtcccttatttaatttcatattttcattttggtctaacaattaataaaaatggtgttttgatccctcacgtttgtctctgtttgccaaataaatc- 26886382  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||| ||||| || |||| ||||||   | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26886383 cgactgttaatttcaacctcaaatgatgtttacggtgaaccaaccttaagagtggtccaccataaatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 26886481  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 53614392 - 53614187
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||  |||  |    
T  53614392 aggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcttgtttttattttggtcccacaattaataaaactggcgttttagtccctcacattttcctctat 53614293  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaat---gtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaat 353  Q
      | ||||||||||  | || |||| |||||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53614292 ttgccaaataaatccaggcg-ttaagtttaaccccaaataatgtctatggtggatcatccttaagagtggtccaccatagatcctagtaattattttaat 53614194  T
Q  354 ttcaacc 360  Q
    |||||||    
T  53614193 ttcaacc 53614187  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 371
Target Start/End: Original strand, 48083343 - 48083439
Alignment:
Q  276 cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctat 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  48083343 cggttaactttaaccacaaatgtctatggtgcactaaccttaagagtggtctaccatagatcctattaattattttaatttaaaccattcgatctat 48083439  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 281 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14745195 - 14745104
Alignment:
Q  281 aactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctat 371  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  14745195 aactttaaccccaaatatctgtggtggaccaaccttaagagtggttcaccatagatcctattaattattttaatttaaactgtttgatctat 14745104  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 38242617 - 38242423
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga 275  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| ||| | || ||  | ||||||||||   |    
T  38242617 ggtccctcaaataatttcaagttttcattttgatcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcacttttttatctgtttgccaaataaatcctca 38242518  T
Q  276 cggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    | ||||| |||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38242517 cagttaagtttaactcaaatgatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataaattctattaattattttaatttaaaccgtttgat 38242423  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 444
Target Start/End: Original strand, 10301053 - 10301217
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttttcc 377  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | |||||      
T  10301053 ttaactttaacctcaaatatctatggtgaaccaaccttaagagtgatccaccatagatcctattaattattttaatttaaactgtttgat-ttttttttt 10301151  T
Q  378 aaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaatttttt 444  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||||| || |  ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||    
T  10301152 taaataggactgttagattttgaaggtccatcatatctaatagtg-atcatcaccaactaatttttt 10301217  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 395
Target Start/End: Original strand, 40244200 - 40244421
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||  |  |||||||||||||  |||  ||||||  | ||||| ||| |     
T  40244200 ttggtcccttaaataatttcaagttttcattttggtctcacaattaataaaacgtacattttggtccctcaaattttcctccgtttgccaaat-aatttt 40244298  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctatt 372  Q
    ||| ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| | |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  40244299 gacagttaactttaacttcaagtgtctatggtggaccaaacttaaaagtggtccatcgtagaccttattaattttgttaattttaactctttgatctatt 40244398  T
Q  373 tttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
    | ||  |||| |||| |||||||    
T  40244399 tatcataaaatggaccgttagat 40244421  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53624463 - 53624263
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||| || || || |||||||||  |  |||||||| ||||| ||| |||| ||  | ||||||||||  |    
T  53624463 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttgatctcacaattaataaaacgtacattttggtcactcacttttttctcggtttgccaaataaatccag 53624364  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||| |||||||| |||    
T  53624363 acggttaggtttaaccccaaatgtatatggtggaccaacattataga-tagtccaccatagaccttattaatttttcaattttaaccttttgatcttttt 53624265  T
Q  374 tt 375  Q
    ||    
T  53624264 tt 53624263  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 549 - 609
Target Start/End: Original strand, 3454794 - 3454854
Alignment:
Q  549 ttggatgatgatgtggtgcagaaggaagtttacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 609  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3454794 ttggatgataatgtggtgcagaaggaagttgacgaaagaggttaatgattcttcttctctc 3454854  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Original strand, 10730880 - 10731050
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| | | || |||| ||||||| | ||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||| |    ||||||||| |||| ||| |||||    
T  10730880 ttaggcttattggatcgtttgatcccttattcaatttcttgttttcattttggtcccataattaataaaaatggcattttggtccttcacttttttctcc 10730979  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    ||  | |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10730980 gtttgccaaataaatcccgactgttaactttaacttcaaatgtctatggtgaaccaaccttaaaagtggtc 10731050  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41264757 - 41264560
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| || |  |||||||| |   |||||| |||||||| ||| |||||||  | |||||||||||    
T  41264757 tttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtctcacatttaataaaaatggcgttttgatccctcacctttttctccgtttgccaaataaatct 41264658  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    | || ||||| |||||    ||  |||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  41264657 caaccgttaagtttaataaaaatgatgtttatggtggatcatctttaagagtggtacaccatagatcctattaattattttaatttcgaccgtttgat 41264560  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 375
Target Start/End: Original strand, 42684902 - 42685092
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc-tcgacggttaactt 285  Q
    |||||| ||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||  ||| |||  ||    |||||||||| | ||| ||||| ||    
T  42684902 taattttaagttttcattttggttccataatgaataaaactgacgttttagtccctcatttttttctatgtttaccaaataaatccttgactgttaagtt 42685001  T
Q  286 taaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  42685002 taaccccaaatgtctatggtgaaccaagcttaagagtggtccaccataaaccttattaaattttttaatttaaaccgtttgatctgttttt 42685092  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 273
Target Start/End: Original strand, 50809415 - 50809533
Alignment:
Q  155 attaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctc 254  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||    
T  50809415 attaggcttaatagatctattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaacacacgttttagtccctcactttttcctc 50809514  T
Q  255 cgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||  | ||||||||||||    
T  50809515 cgtttgccaaataaatctc 50809533  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50866447 - 50866329
Alignment:
Q  155 attaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctc 254  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||  |||    
T  50866447 attaggcttaatagatctattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaacacacgttttagtccctcactttttcctc 50866348  T
Q  255 cgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||  | ||||||||||||    
T  50866347 cgtttgccaaataaatctc 50866329  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 43173881 - 43173969
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43173881 ttaggcttaataggtcatttgatcccctaattaatttccaattttcattttgtccccataactaataaaattcatgttttggttcctca 43173969  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11224839 - 11224776
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt 342  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11224839 ttaactttaatcccaaatgttcatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcatatt 11224776  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27841690 - 27841635
Alignment:
Q  295 atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27841690 atgtttatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctaataattattt 27841635  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 20314809 - 20314652
Alignment:
Q  232 ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaa-tctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccac 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| ||| ||| | ||||||    
T  20314809 ttttggtccctcaagtttgtctctgttagtcaaataaattcatgactgttaagtttaactccaaatgtctatgttagaccaacattataga-tagtccac 20314711  T
Q  330 catagatcctattaa-ttatttaatttcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggac 387  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  20314710 catagaccttattaatttatttaatttaaaccatttgatttattttttcaaaagaggac 20314652  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50810954 - 50810812
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  50810954 taggcttaatagatccattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaacacacgttttagtccctcattttttcctccg 50810855  T
Q  257 tcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
    |  | ||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  50810854 tttgccaaataaatctcaaactgttaactttaactctaaatgt 50810812  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Original strand, 50864910 - 50865052
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |||||    
T  50864910 taggcttaatagatccattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaacacacgttttagtccctcattttttcctccg 50865009  T
Q  257 tcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
    |  | ||||||||||||  || |||||||||||| | ||||||    
T  50865010 tttgccaaataaatctcaaactgttaactttaactctaaatgt 50865052  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 349
Target Start/End: Original strand, 49379819 - 49379891
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt 349  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49379819 gttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccgactttaaaaatggtccaccatagatcctattaattatt 49379891  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 344
Target Start/End: Original strand, 53420330 - 53420501
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||| || ||||||| | || |||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| |     
T  53420330 tggtcccctaactaatttcatattttcattttggtcctacaattaataaaacgtacgttttggtccctcacttttttctccgtttatcaaataaatccct 53420429  T
Q  275 a--cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa 344  Q
    |  |  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||    
T  53420430 agtctattaagtttaaccacaaatgtctatggtggaccaactttaaaagtgatccaccatagaccttattaa 53420501  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20336702 - 20336572
Alignment:
Q  232 ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaa-tctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccac 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  20336702 ttttggtccctcaagtttgtctccgttagtcaaataaattcatgactgttaagtttaactccaaatgtctatgttggaccaacattataga-tagtccac 20336604  T
Q  330 catagatcctattaa-ttatttaatttcaacc 360  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  20336603 catagaccttattaatttatttaatttaaacc 20336572  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 344
Target Start/End: Original strand, 7270441 - 7270507
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7270441 gttaactttaacctcaaatgtctgtagtggaccaaccttaagagtggtctaccatagatcttattaa 7270507  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34819285 - 34819210
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||| ||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34819285 gttaagtttaaccccaaatgatgtctatagtggatcaaccttaagagtggtccaccatagatcctattacttattt 34819210  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 349
Target Start/End: Original strand, 13621037 - 13621109
Alignment:
Q  278 gttaactttaacc-ccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt 349  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621037 gttaactttaacctccaaatgtctatggtggaccgacttaaaaaatggtccaccatagatcctattaattatt 13621109  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 373
Target Start/End: Original strand, 34818108 - 34818299
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||  |||  |||| |  | |||||||||| | |  |||||    
T  34818108 taattaatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatgatttggtccctcagattttcctccatttgccaaataaatcccaatagttaa 34818207  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    |||||||   |||||| |||||| || ||||||||| | || || | |||||| | |||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  34818208 ctttaactttaaatgtctatggttgatcaaccttaaaaatgatctatcatagaccttattaattttgttaattttaaccgttcgatctattt 34818299  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Original strand, 37735319 - 37735418
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  37735319 ttggtcctttaaataattttaagttttcattttggtcccataattaataaaacgtatgttttagtccctcatttttttcttcgtttgtcaaataaatctc 37735418  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 395
Target Start/End: Original strand, 55423511 - 55423628
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttcc 377  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||     
T  55423511 gttaacttcaaccccaaatgtcttaggtggaccaaccttgtaggtggtccaccgtagaccttattaattttttaatttcatctttttgatctttttttca 55423610  T
Q  378 aaaaaaggacggttagat 395  Q
    ||||| | |||| |||||    
T  55423611 aaaaaggaacggctagat 55423628  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18458757 - 18458661
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||||    
T  18458757 gtcccctaaataatttcaagtttttattttggtcccacaattaataaaacttgcgttttagtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatctc 18458661  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 244
Target Start/End: Original strand, 24403252 - 24403322
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  24403252 ttggtccactaattaatttcaagttttcattatggtctcataattaataaaatttatgttttggtccctca 24403322  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 53194960 - 53194902
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcac 245  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  53194960 taatttcaagttttcattttggtcccataattaataaaacgtacgttttggtccctcac 53194902  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 55328399 - 55328337
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcac 245  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  55328399 taattaatttcaagttttcattttgatctcataattaataaaattcatgttttagtccctcac 55328337  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5123344 - 5123247
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||| ||    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5123344 gttaattttaacctcaaatgtttaagatggaccaacattgtatgtggtctaccatagaccttattaattttttaattttaaccatttgatctattttt 5123247  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21074284 - 21074188
Alignment:
Q  273 cgacggttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattattt-aatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  21074284 cgacggttaagtttaacccccaaatgtatatggtggaccaacattataga-tagtccaccatagaccttattaattttttcaattttaaccctttgat 21074188  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31282536 - 31282419
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttcc 377  Q
    |||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||     
T  31282536 gttaacttcaaccccaaatatcttaggtggaccaaccttgtaggtggtccaccgtagaccttattaattttttaatttcatctttttgatctttttttca 31282437  T
Q  378 aaaaaaggacggttagat 395  Q
    ||||| | |||| |||||    
T  31282436 aaaaaggaacggctagat 31282419  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 326
Target Start/End: Original strand, 53622767 - 53622830
Alignment:
Q  266 taaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  53622767 taaatcccaacggttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtc 53622830  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20336748 - 20336693
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtccc 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  20336748 taggcttactaggtcatttggtcccctaattaattttcagttttcattttggtccc 20336693  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 346
Target Start/End: Original strand, 36175333 - 36175448
Alignment:
Q  231 gttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccacc 330  Q
    |||||||| |||||  ||| |||||||  | ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||    | |||||||    
T  36175333 gttttggtgcctcatttttttctccgtttgccaaataaatccggactgttaagtttaaccccaaatgtctatgatggatcaacattatatatagtccacc 36175432  T
Q  331 atagatcctattaatt 346  Q
    ||| ||||||||||||    
T  36175433 atatatcctattaatt 36175448  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44602997 - 44602950
Alignment:
Q  322 tggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  44602997 tggtctaccatagatcctattaattttttaatttaaaccgtttgatct 44602950  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 18197163 - 18197281
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    |||||| || ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||  |||  ||||||  | ||||||||||  |||    
T  18197163 gtccctcaaataatttcaaattttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcattttttcctccgtttgccaaataaatccagac 18197262  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaa 295  Q
     |||||||||||| |||||    
T  18197263 cgttaactttaactccaaa 18197281  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26887676 - 26887506
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| || |||||||| |     ||| ||||||||  |||  |||     
T  26887676 ttaggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcatttttgtcccacaattaataaaaatggcaatttagtccctcatcttttcctct 26887577  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    ||    |||||||||   ||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26887576 gtttcccaaataaattctgacggttaactttaacttcaaatatctatggtgtaccaaccttaaaagtggtc 26887506  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53194610 - 53194512
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||||||   |||| | |||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  53194610 gttaactttaactttaaatatctatggtagacaaatcttaaaagtgatccaccatagattctattaattattttattttaaaccgtttgatcttttttt 53194512  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9338551 - 9338470
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctc 243  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||  | |||| || || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9338551 ttaataggtcatttagtcctctgattaattttcaattttaattttagtttcataattaataaaactcatgttttggtccctc 9338470  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21515611 - 21515506
Alignment:
Q  276 cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||  ||    ||||||||||||| | | |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||    
T  21515611 cggttaactttaactccaaatgtattaggtggatcaatattgtaggtggtccaccatataccttattaattttttaattccagccatttgatctattttt 21515512  T
Q  376 ccaaaa 381  Q
    | ||||    
T  21515511 caaaaa 21515506  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36176609 - 36176540
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||    
T  36176609 tggtcccctgattaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaatgtatgttttggtccctca 36176540  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 147
Target Start/End: Original strand, 40839847 - 40839908
Alignment:
Q  87 atttgtgatgattggttagaaga-gatggtaactttaatctaaaattttcaagtttttagtt 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40839847 atttgtgatgattgtttagaagaagatgatgaatttaatctaaatttttcatgtttttagtt 40839908  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11220590 - 11220546
Alignment:
Q  419 agtgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttc 463  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11220590 agtgaaccatcaccacataattttttccctttcttcatcttcttc 11220546  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 365
Target Start/End: Original strand, 18442366 - 18442454
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaaccctttg 365  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    | |||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||    
T  18442366 gttaagtttaaccccaaatgtctatggtggaccaacattatcgatagtccaccatagaccttattaacttcttcaattttaaccctttg 18442454  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 365
Target Start/End: Original strand, 19487440 - 19487528
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaaccctttg 365  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    | |||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||    
T  19487440 gttaagtttaaccccaaatgtctatggtggaccaacattatcgatagtccaccatagaccttattaacttcttcaattttaaccctttg 19487528  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24487279 - 24487239
Alignment:
Q  315 ttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaattt 355  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24487279 ttaagattggtcaaccatagatcctattaattttttaattt 24487239  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 192
Target Start/End: Original strand, 28909236 - 28909272
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaattt 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28909236 ttaggcttaaaaggtcatttggtccattaattaattt 28909272  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 336
Target Start/End: Original strand, 28909550 - 28909586
Alignment:
Q  300 tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28909550 tatggtggaccaaccttaagagtggttcaccacagat 28909586  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42686269 - 42686149
Alignment:
Q  153 aaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtc 252  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  | |||||||| ||| ||| | || |||||||||     |||| ||||||||| ||| ||    
T  42686269 aaattaggcttattagatcatttgatcccttaaataattctatgtttttattttgatcctacaattaataaaacaggcattttagtccctcacttttttc 42686170  T
Q  253 tccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    || ||  ||||||||||||||    
T  42686169 tctgtttgtcaaataaatctc 42686149  T

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Target: chr1 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 156 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15746887 - 15746639
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | | |||||    
T  15746887 ttaggcttaataggtcatttggtcccctaattaatttccaattttcattttggtcccataagtaataaaactcatgttttggtcccttaattgtatctcc 15746788  T
Q  256 gtcagtcaaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatt 354  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15746787 gtcagtcaaataaatcatccactgttaagtttaacttcaaatgtctatggtggaccaatcttaagagtggtccaccatagatcctattaatcttttaatt 15746688  T
Q  355 tcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaagg 403  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  15746687 ttaaccctttgatctatttttacaaaagaggacggttggattttgaagg 15746639  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 48097149 - 48096956
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  48097149 ggcttaataggtcatttagtcctctaattaatttccaatttttattttggtcccataactaataaaactcatgttttagtcccttaggtttgtctccgtc 48097050  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
     |||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48097049 ggtcaaataaatccctactgttaagtttaacctcaaatgtatatggtggaccaaccttaagagtggtctaccatagatcctattaattatttaa 48096956  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46318737 - 46318518
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  46318737 taggcttaataggtcatttggtcctttaattaatttcaagttttgatttttgtcccataactaataaaagtcatgttttggtccctcaattgtatctccg 46318638  T
Q  257 tcagtcaaataaat-ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatt 354  Q
    || ||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||| |||| ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46318637 tctgtcaaataaatccttggctgttaagtttaaccccaaatgtctatgatgga-ttacttttagagtggtccaccatagatcctattaaatattttaatt 46318539  T
Q  355 tcaaccctttgatctattttt 375  Q
    | || | |||||||| |||||    
T  46318538 taaatcgtttgatcttttttt 46318518  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 374
Target Start/End: Original strand, 46467143 - 46467360
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  46467143 aggcttaataggtcaattgatcctttaattaatttcaagttttcattttggtcccataactaataaaactcatgtttcggtccctcaggtttgcctccgt 46467242  T
Q  258 cagtcaaataaat--ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaattt 355  Q
      |||||||||||  |||| | ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||| | ||||||||    
T  46467243 ttgtcaaataaatccctcg-ctgttaagtttaaccataaatgtctatggtggaccaacattaaaagtgatccaccgtagatgttattaaatttttaattt 46467341  T
Q  356 caaccctttgatctatttt 374  Q
     |||| |||||| ||||||    
T  46467342 aaaccgtttgatatatttt 46467360  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10722493 - 10722306
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  10722493 ttaataagttatttggtctcctaattaatttcaagttttcattttcgtctcataactagtaaaactcatgttttggtctctcacgtttgtcttcgtcaat 10722394  T
Q  262 caaataaatctc---gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    ||||| || | |   | | ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  10722393 caaatgaagccccctggccgttaactttaacctcaaatatctatgatggaccaacctaaagagtggtccatcatagattctactaatt 10722306  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 15232747 - 15232961
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  |||     
T  15232747 ttaggcttattagatcatttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccataattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctct 15232846  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaa 352  Q
    ||  | ||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15232847 gtttgccaaataaatcatgaccgttaagtttaacccaaatgatgtatatagtggaccaactttaaaagtggtccatcatagatcctattaattattttaa 15232946  T
Q  353 tttcaaccctttgat 367  Q
    | |||||| ||||||    
T  15232947 tatcaaccgtttgat 15232961  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46468836 - 46468725
Alignment:
Q  160 gcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtca 259  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||      
T  46468836 gcttaataggtcatttggttctttaattaatttcaaatttttattttggtcccataactaataaaactcatgtttcggtccatcaagtttgcctctgttt 46468737  T
Q  260 gtcaaataaatc 271  Q
    ||||||||||||    
T  46468736 gtcaaataaatc 46468725  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 49803020 - 49802846
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| | | ||||| ||||||||  ||| |    
T  49803020 aaaattaggcttgttagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatgacgttttagtccctcatcttttt 49802921  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  49802920 ctccgtttgccaaataaatcccgacggttaacttcaactctaaatgtctatggtgtaccaaccttaaaagtggtc 49802846  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7161474 - 7161366
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  7161474 ttaataggtcatttgttcccttaattaatttcaaatttttattttgatctcataagtaataaaattcatgttttggtccctcaggtttgcctccgtc-gt 7161376  T
Q  262 caaataaatc 271  Q
    ||||||||||    
T  7161375 caaataaatc 7161366  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 49801612 - 49801826
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||| || ||||||||| || |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
T  49801612 ttaggcttattagatcatttggtcccttatttaattttatattttcattttggtcccacaattaataaaaatggtgttttgatccctcacgtttgtctct 49801711  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-ttta 351  Q
    ||  | |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||   | || |||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  49801712 gtttgccaaataaatc-cgactgttaattttaacctcaaatgatgtttacggtaaaccaaccttaaaagtggtccaccataaattctattaattatttta 49801810  T
Q  352 atttcaaccctttgat 367  Q
    |||| |||| ||||||    
T  49801811 atttaaaccgtttgat 49801826  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 373
Target Start/End: Original strand, 16963831 - 16964047
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  |||  ||||||    
T  16963831 aggcttattagatcgtttggtcttttaattaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggtgttttagtccctcatcttttcctccgt 16963930  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttc 356  Q
      | |||||||||   ||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| | |||||||     
T  16963931 ttgccaaataaatgctgactgttaactttaactctaaatgtttatgatggaccaaccttaaaagtggtccatcatagaccttattaattttgttaatttt 16964030  T
Q  357 aaccctttgatctattt 373  Q
    ||||||| |||||||||    
T  16964031 aacccttcgatctattt 16964047  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16965228 - 16965035
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga 275  Q
    ||||||||| ||||||||   |||| || ||||||||| || |||||||| | | ||||| |||||| || |||   |||||   ||||||||||  |||    
T  16965228 ggtcccttatttaatttcttattttcattttggtcccacaattaataaaaatgacgttttagtcccttacattttcttccgtttatcaaataaattccga 16965129  T
Q  276 cggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttg 365  Q
     |||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16965128 tggttaagtttaaccccaaatgatgtatatggtggaccaactttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttcaaccgtttg 16965035  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 313
Target Start/End: Original strand, 42244629 - 42244785
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||    
T  42244629 ggcttaataggtcatttggtcctttaattaatttcaaattttcattttgatcccataattaataaaactcatgttttggtcccttaagttgatctccgtc 42244728  T
Q  259 agtcaaataaa--tctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
     || ||| |||  || |  | ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  42244729 tgtaaaaaaaagttcacctctgttaagtttaacaacagatgtgtatggtggaccaac 42244785  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 346
Target Start/End: Original strand, 10711797 - 10711974
Alignment:
Q  172 atttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  10711797 atttggtctcctaattaatttgaagttttcattttcgtctcataactagtaaaactcatgttttgctctctcacgtttgtcttcgtcaatcaaatgaagc 10711896  T
Q  272 tc---gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
     |   ||| ||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  10711897 cccctgaccgttaactttaacctcaaatatctatgatagaccaacctaaagagtggtccatcataaattctactaatt 10711974  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 280 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13147412 - 13147342
Alignment:
Q  280 taactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13147412 taactttaatcccaaatgtctatggtggaccaaccttaatagtggtccaccatagatcctattaattattt 13147342  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 42246006 - 42245920
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42246006 aggcttaatagatcatttaatcccttaattaatttcaagtttttattttggttccataattaataaaactcatcttttggtccctca 42245920  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3617495 - 3617423
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3617495 gttaactttaacctcaaatgtctatggtgaaccaaccttaagagtggtccactatagatcctattaattattt 3617423  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 375
Target Start/End: Original strand, 46110353 - 46110497
Alignment:
Q  232 ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccacca 331  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||  |  |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  46110353 ttttggtcactcaagtttttctccgtttgctaaataaatctcgactgttaactttaactctaaatatctatggtggaccaaccttaagagtggtccatcg 46110452  T
Q  332 tagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| | |||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  46110453 tagaccttattaattttgttaattttaaccgtttgatcttttttt 46110497  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 15743272 - 15743386
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    | | |||||     
T  15743272 taggcttaataggttatttggtcctctaattaatttccaatttttattttggtctcataagtaataaaactcatgttttggtcccttgattgtatctcca 15743371  T
Q  257 tcagtcaaataaatc 271  Q
    |||||||||||||||    
T  15743372 tcagtcaaataaatc 15743386  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45585109 - 45584933
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||  |  ||||||||| |||| |||  ||||||  | ||||||||||  |||    
T  45585109 gtccctcaaataatttcaagttttcattttggtctcacaattaataaaacgtaccttttggtccttcactttttcctccgtttgccaaataaatcctgac 45585010  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
     ||||| ||||| ||||||||   | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45585009 cgttaagtttaaacccaaatgatgtctatggtggcccaactttaagagtgctccaccatagatcctattaattattt 45584933  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52628974 - 52628837
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||||||| |    
T  52628974 ggtcccttaaataatttcaagttttaattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcattttttcctccgtttgccaaataaatctcaa 52628875  T
Q  276 cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  52628874 ccgttaagtttaaccccaaatatgtaaggtggaccaac 52628837  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9226213 - 9226141
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9226213 gttaaatttaacctcaaatgtctatggtggatcaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattt 9226141  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15072884 - 15072720
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-gacggtta 281  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||| |  |||  ||||||  | ||||||||||   | | ||||    
T  15072884 taattaatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacattttggtcccttattttttcctccgtttgccaaataaatccatgtctgtta 15072785  T
Q  282 actttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15072784 actttaacctcaaatgtctatggtggaccaacctaaagagtggtccaccgtagactctattaatt 15072720  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 48527652 - 48527750
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |||||    
T  48527652 gttaactttaactccaaatgtctatggtcgaccaactttaagagtggtccaccatagatcttatcaattattttaatttaaactgtttgatcttttttt 48527750  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 35943549 - 35943379
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc- 273  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||| |||| |||  || |||  | |||||||||| |     
T  35943549 tggtctcttaaataatttcaaatttttattttggtcccacaattaataaaacgtacattttggtcc-tcactttttccttcgtttgccaaataaatcccc 35943451  T
Q  274 -gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa 344  Q
     | | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  35943450 tggctgttaagtttaaccctaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtgatccaccatagaccttattaa 35943379  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15234159 - 15233945
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||||||     
T  15234159 ggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctccgtt 15234060  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttca 357  Q
     | |||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||| || | ||||||| |    
T  15234059 tgccaaataaatcccgactgtt-actttaacttcaaatgtctataatagaccaatcttcagagtggtccatcgtagaccctattacttttgttaatttta 15233961  T
Q  358 accctttgatctattt 373  Q
    ||| || |||||||||    
T  15233960 accattcgatctattt 15233945  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 51445707 - 51445798
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  51445707 gttaactttaacccccaaatgtctatggtggatcaactttaaaaatggtccaccatagatcctattaattattctaatttaaaccgtttgat 51445798  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5613082 - 5612993
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  5613082 gttaactttaaccccaaatgtttatggtggatcacctttaa-agtgatccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 5612993  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 367
Target Start/End: Original strand, 14478384 - 14478474
Alignment:
Q  279 ttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14478384 ttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccgactttaaaaatggtccaccatagatcctattaattattctaatttaaaccgtttgat 14478474  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Original strand, 20064173 - 20064255
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20064173 aggcttaatagctcatttggtccctcaattaatttcccgttttcattttggtcccatatctaataaaacacacgttttggtcc 20064255  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Original strand, 12665909 - 12666005
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12665909 gttaactttaacctcaaatgtttatggtgaaccatc-ttaagagtggtccaccatagatcttattaattttgttaatttaaaccgtttgatctttttt 12666005  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41873969 - 41873912
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41873969 gttaagtttaaccacaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 41873912  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44999460 - 44999388
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44999460 gttaactttaaccttaaatgtctatggtggaccaatcgtaagagtggttcaccatagatcttattaattattt 44999388  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 52078128 - 52078052
Alignment:
Q  292 caaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  52078128 caaatgtctatggtgaaccaaccttaagagtgatacaccatagatcctattaattattttaattttaaccgtttgat 52078052  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24499758 - 24499619
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||    ||||||||||      
T  24499758 ttggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtctcacaattaataaaactcacgttttggtccctcactttttcctccgtttaccaaataaatccg 24499659  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
    | | || |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  24499658 gtctgtcaactttaaactcaaatgtctattgtggaccaac 24499619  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 27814309 - 27814460
Alignment:
Q  178 tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacg 277  Q
    ||||| || |||||||||||||| || || |||| |||| |||||||||  |  |||||||||||||  |||  ||| ||  | |||||||||| |||||    
T  27814309 tccctcaaataatttcaagttttcattttagtcctataattaataaaacgtaccttttggtccctcattttttcctctgtttgccaaataaatcccgacg 27814408  T
Q  278 gttaacttt-aaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtcca 328  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27814409 gttaacttttaactctaaatgtctatggtggaccaactttaaaagtggtcca 27814460  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18821737 - 18821663
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  18821737 gttatctttaacttcaaatgtctatggtggactaaccttaagagtggtctaccaaagatcctattaattttttaa 18821663  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 333
Target Start/End: Original strand, 14470870 - 14471029
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | | ||  ||||||||| |||  || |||  | |||||||||| |     
T  14470870 tggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacggttaagtccctcactttttccttcgtttgccaaataaatc-ct 14470968  T
Q  275 acggt--taactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
     ||||  ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14470969 tcggtgttaagtttaaccccaaacgtctatagtggaccaaccttaagagtggtccaccata 14471029  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 9482574 - 9482645
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9482574 gttaactttaaccc-aaatgtctacagtggaccaactttaagagtggttcaccatagatcttattaattattt 9482645  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20070000 - 20069924
Alignment:
Q  164 aataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc 240  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20070000 aatagctcatttggtccctcaattaatttcccgttttcattttggtctcatatctaataaaacacatgttttggtcc 20069924  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6049422 - 6049351
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6049422 ttaacttcaactccaaatgtctatggtggaccaatctaaatagtggtccaccgtagatcctgttaattattt 6049351  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Original strand, 15071355 - 15071426
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcac 245  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15071355 ttggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcacataattaataaaacgtatgttttggtccctcac 15071426  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 44276135 - 44276274
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||| || |||||| ||||| |||||||||  | |||||| ||| |||| ||| |||| ||  ||||| ||||||      
T  44276135 ttggttccctaattaatttccatttttcattttggtctcataattaataaaacgtacgttttgatccttcacttttttctctgtttgtcaattaaatcct 44276234  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44276235 gactgttaagtttaaccacaaatgcgtatggtggaccaac 44276274  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 26286530 - 26286619
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  26286530 gttaactttaaccccaaatgtttatggtggatc-acctttaaagtgatccaccatagactctattaattattttaatttaaaccgtttgat 26286619  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51042450 - 51042376
Alignment:
Q  169 gtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctc 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||    
T  51042450 gtcacttggtcccttaattaatttccaattttcattttggtcccacaattaataaaactcacgttttagtccctc 51042376  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Original strand, 28050439 - 28050536
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||||||||||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| || |||| |||||||| ||||    
T  28050439 gttaactttaacctcaaatgtcttaagtggaccaatcttaagagtgttccaccatagatcctattgattttcttaactttaaccgtttgatctttttt 28050536  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19466200 - 19466109
Alignment:
Q  284 tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  19466200 tttaacctcaaatgtctatggtggactaacattataga-tagtccaccatagaccttattaattttttaatttcagccatttgatctattttt 19466109  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 335
Target Start/End: Original strand, 23091408 - 23091527
Alignment:
Q  218 taataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga--cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacct 315  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||||| ||| |||||||  | |||||||||| | |  | ||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  23091408 taataaaacgtacgttttggtcactcacttttttctccgtttgccaaataaatccctagtctgttaagtttaatctcaaatgtctatggtggaccaactt 23091507  T
Q  316 taagagtggtccaccataga 335  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  23091508 taaaagtggtccaccataga 23091527  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46111590 - 46111539
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaac 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  46111590 tggtcccttaaataatttcaagtttttattttggtcccacaattaataaaac 46111539  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 2471664 - 2471582
Alignment:
Q  518 gattgattcttcttctccgaaacggcgacatttggatgatgat-gtggtgcagaagga-agtttacgaaagaggttaatgatt 598  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  2471664 gattgattcttcttgttctaaacggcgtcgtttggatgatgatggtggtgctgaaggagaggttacgaaagaggttaaagatt 2471582  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 13894732 - 13894829
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||||||| |  || | ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  13894732 gttaactttaacctcgcatatctatggtg-accaacctaaagagttgtctaccatagatcctgttaattattttaatttaaaccgtttgatcttttttt 13894829  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Original strand, 34350228 - 34350288
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34350228 gttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggatcaaccttaagagtggtccaccataga 34350288  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9485295 - 9485230
Alignment:
Q  285 ttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9485295 ttaaccctagatgtctatggtggatcaactttaagagtggttaaccataaatcctattaattattt 9485230  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Original strand, 835258 - 835318
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttt 234  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  835258 ttggtcccctaattaatttgcagttttcattttggtctcataactaataaaactcacgttt 835318  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14477893 - 14477732
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc--t 272  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||||  | ||||  ||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||  |    
T  14477893 tggtcccataaataattttaagttttcactttgatcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcacttttttctccgtttgccaaataaatcctt 14477794  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||| | |||| |||||| | |||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14477793 cgatg-ttaagtttaactctaaatgtctatggtagatcaatcttaagagttgtccaccataga 14477732  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 367
Target Start/End: Original strand, 26802073 - 26802148
Alignment:
Q  293 aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  26802073 aaatgtctaaggtgaaccaaccttaagagttgtccactatagatcatattaatcattttaatttaaaccgtttgat 26802148  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Original strand, 27556431 - 27556478
Alignment:
Q  322 tggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  27556431 tggtccaccatagatcctattaattttttaatttaaacagtttgatct 27556478  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44278448 - 44278369
Alignment:
Q  178 tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||  | ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  44278448 tcccctaattaatttcaagttttcattttggtcccacgattaataaaacgtacgttttggtccctcatttttttctccgt 44278369  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 408 - 461
Target Start/End: Original strand, 6048093 - 6048147
Alignment:
Q  408 ttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaa-ttttttcactttcttcatcttct 461  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  6048093 ttgtatctaatagtgaaccatcaacacctaatttttttccttttcttcatcttct 6048147  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10376706 - 10376645
Alignment:
Q  178 tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc 240  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10376706 tcccttaattcatttcaagttttcat-ttgatctcataattaataaaacttatgttttggtcc 10376645  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 396
Target Start/End: Original strand, 15743415 - 15743472
Alignment:
Q  338 ctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatt 396  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  15743415 ctattaatt-tttaattttaaccctttgatctattttttcaaaagagaacggttggatt 15743472  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30535666 - 30535570
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  30535666 ttaactttagcttcaaatgtctatggtggaccaacattataga-tagtccaccatagaccttatttattttttaattttaaccctctgatcttttttt 30535570  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50444800 - 50444651
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| || || |||||| || |||||||||  |  |||||||||||||  |||  |||||   | ||||||||||       
T  50444800 tggtccctcaaataatttcaaattttcattttagtcccacaattaataaaacgtacattttggtccctcattttttcctccgattgccaaataaatccaa 50444701  T
Q  275 acggttaactttaac-cccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtg 323  Q
    || |||||||||||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  50444700 accgttaactttaactccaaaacgtctatgttggaccaaccttaagagtg 50444651  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51300233 - 51300160
Alignment:
Q  303 ggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| | | ||||| |||| |||||| |||||||    
T  51300233 ggtggaccaacattaaaagtggtccaccatagaccttattaattttatgaattttaaccatttgatatattttt 51300160  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 419 - 463
Target Start/End: Original strand, 26055081 - 26055125
Alignment:
Q  419 agtgaaccatcaacaactaattttttcactttcttcatcttcttc 463  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26055081 agtgaaccatcaccacataattttttccctttcttcatcttcttc 26055125  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34351940 - 34351865
Alignment:
Q  300 tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| | | |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  34351940 tatggtggaccaac-ttaagagtggtccaccataaaccttattaatatttctaattttaaccctttggtcttttttt 34351865  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 345
Target Start/End: Original strand, 127426 - 127618
Alignment:
Q  154 aattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtct 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  127426 aattaggcttaataggtcatttggtcccctaattaatttcaagttttcgttttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcatgtttgcct 127525  T
Q  254 ccgtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat 345  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  127526 ccgtcggtcaaataaatccctgacagttaactttaacctcaaatgtctatggtgaaacaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat 127618  T

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Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 128712 - 128597
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  128712 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaattttaagttttcattttggtcctattactaataaaactcatgttttggtcccttaaatttgtctcc 128613  T
Q  256 gtcagtcaaataaatc 271  Q
    ||| |||||| |||||    
T  128612 gtcggtcaaaaaaatc 128597  T

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Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 352
Target Start/End: Original strand, 40723225 - 40723419
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaattt--caagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  40723225 ggcttaataggtcatttggtcccctaattaattttgcaa-ttttcattttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcccttaggtttatctccg 40723323  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
    || ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40723324 tcggtcaaataaatccatactgttaagtttaacctcaaatgtatatggtggaccaaccttaagagtggtctaccatagatcctattaattatttaa 40723419  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13533379 - 13533162
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13533379 aggcttaataggtcatttggtcctctaattaatttcaagttttcatcttagttccataactaaaaaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 13533280  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttc 356  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || |||||     
T  13533279 cggtcaaataaatccagactgttaaatttaacttcaaatgtctatggtggaccaacattataga-tagtccaccatagaccttattaatttttcaatttt 13533181  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  13533180 aaccatttgatcttttttt 13533162  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 159 - 375
Target Start/End: Original strand, 53432060 - 53432278
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||     
T  53432060 ggcttaataggtcgtttgatcccttaattaatttcaagttttcattttggtcccataagtaataaaacttatgttttggtccctcaagtttgccttcgtt 53432159  T
Q  259 agtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt-aatttc 356  Q
     |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | | |||||||| ||| |||||     
T  53432160 ggtcaaataaatccctgacggttaagtttaaccccaaatgtctatggtgaaccaactttaagagtggctcaccatacaccttattaattttttcaatttt 53432259  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  53432260 aaccgtttgatcttttttt 53432278  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53435866 - 53435694
Alignment:
Q  164 aataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtca 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  ||||    
T  53435866 aataggtcatttgatcccttaattaatttcaagttttcattttggtcccataagtaataaaactcatgttttggcccctcaagtttacctccgttggtca 53435767  T
Q  264 aataaat-ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53435766 aataaatccttgacggttaagtttaactttaaatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtccaccgtaga 53435694  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 352
Target Start/End: Original strand, 34326729 - 34326919
Alignment:
Q  160 gcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtca 259  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||     
T  34326729 gcttaataggtcatttggtcccctaattaatttttaattttcatcttaatcccataa-taataaaacttatgttttggtcccttaggtttgtctttgtcg 34326827  T
Q  260 gtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaa 352  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34326828 gtcaaataaatcccg-ctgttaaatttaatcccaaatatacatggtggaccaactttaagagtggtctactatagatcctattaattatttaa 34326919  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 52963582 - 52963743
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| || |||||| || || ||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  52963582 ttggtcctctaaataatttcaagttttcattttggtctcacaattaataaatcgtatgttttggtccctcaagtttttctccgtttgtcaaataaatctc 52963681  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  52963682 gactgttaactttaactccaaatgtctatggtggaccagccttaaaagtggtccatcataga 52963743  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40724963 - 40724850
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40724963 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttgcagtttttattttgatccca--actaataaaactcatgttttggtcccttaagtttgtctcc 40724866  T
Q  256 gtcagtcaaataaatc 271  Q
    || |||||||||||||    
T  40724865 gttagtcaaataaatc 40724850  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 52239891 - 52240086
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||||  | |||||||| | ||| |||| |||||||  | |||||||||  |     
T  52239891 tggtccctcaaataatttcaaatttttattttgatcccacaattaataaaacgtacgttttggttcttcaggtttttctccgtttgccaaataaattcca 52239990  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaaccctttgat 367  Q
    | ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  52239991 agggttaactttaacccaaatgatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatatttttaatttaaaccgtttgat 52240086  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 162 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28591020 - 28590830
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | ||||| |||  ||    
T  28591020 ttaataggttatttggtcccttaaataatttccagctttcattttggtcccataaataataaaactcatgttttggtcctttaattgtgtcttcgttggt 28590921  T
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg--tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||||| | | | ||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  28590920 caaataaattttgcccgttaaatttaaccctaaatgtctatatggtgaaccaactttaagagtgattcatcatagatcctattaattattt 28590830  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Original strand, 6348169 - 6348370
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  ||||||| |||||| |||  ||| ||  |||||||||||   |    
T  6348169 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggttcctcactttttcctctgtttgtcaaataaattctg 6348268  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| | | |||||| ||||||||||||| |||    
T  6348269 atggttaagtttaacctcaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccgtagaccttattaatatttctaattttaaccctttgatcttttt 6348368  T
Q  374 tt 375  Q
    ||    
T  6348369 tt 6348370  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 7707583 - 7707798
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||| ||| ||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| | | ||||| |||| |||| |||  |||     
T  7707583 ttaggtttattagatcttttagtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatgacgttttagtccatcacattttcctct 7707682  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-ttta 351  Q
    ||  | ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||   | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7707683 gtttgccaaataaatcctgacggttagctttaacaccaaatgatgtctttggtagaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttta 7707782  T
Q  352 atttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||| ||||||    
T  7707783 atttcaaccgtttgat 7707798  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 56085465 - 56085555
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  56085465 gttaactttaaccccaaatgtctatggtggactaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 56085555  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2312585 - 2312406
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  || || |||||| || |||||||||  | ||||  ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||      
T  2312585 ttggtcccttagataatttcaagtttccattttagtcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatcat 2312486  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2312485 gaccgttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaccaatcttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattt 2312406  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27851034 - 27850845
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||  |||  ||||||       ||||||| |     
T  27851034 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatattttggtccctcaatttttcctccgt-------ataaatccca 27850942  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    || ||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  27850941 acagttaagtttaacctcaaatgatgtctatggtggaccaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 27850845  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 157 - 371
Target Start/End: Original strand, 33231385 - 33231601
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| || |||||||| |  |||||| ||||||||  ||| || |||    
T  33231385 taggcttattagatcatttggtcccttatttaatttcatgttttcattttagtcccacaattaataaaaatggtgttttagtccctcatctttttcaccg 33231484  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacg-gttaactttaaccc-caaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatt 354  Q
    |  | |||||||||    ||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  33231485 tttgccaaataaattcatacttgttaagtttaaccctcaaatgtctatggtggacaaaccttagaagtggtccaccataaactctattaattttttaatt 33231584  T
Q  355 tcaaccctttgatctat 371  Q
    |||||| ||||||||||    
T  33231585 tcaaccatttgatctat 33231601  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38698153 - 38698031
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |  | |||    
T  38698153 aaaagtaggcttaataggtcatttggtcctttaaataatttccaattttcattttggtcccatatctaataaaagtcatgttttggtcctttaactgtgt 38698054  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||| |||||| ||||||||    
T  38698053 ctccgtctgtcaaaaaaatctcg 38698031  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Original strand, 44498474 - 44498651
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatg-ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaa-tc- 271  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||  |||  ||| || | ||||| ||| ||     
T  44498474 tggtccctcaattaatttcgagttttcgttttggtcccataactcttaaaa-tcatcattttggtccctcaacttttgctctgttattcaaaaaaagtca 44498572  T
Q  272 tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44498573 ttgacggttaactttaactttaaatgtctatggtggatcaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 44498651  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 26629789 - 26629980
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca-cgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||| || | ||||||||||||| ||| ||   ||||| || |||||||||||||| ||||||   |  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26629789 ggcttaattggacttttggtcccttaagtaaattgttgttttcattttggtcccataactcataaaatcaacattttggtccctcaacgtttg-ctccgt 26629887  T
Q  258 cagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
     | ||||| |  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26629888 taatcaaaaaggtccatgacggttaactttaaccccaaatgtttatggtgaaccaac-ttaagagtggtccaccataggtcctattaattattt 26629980  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 371
Target Start/End: Original strand, 4871611 - 4871706
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccc-caaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctat 371  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  4871611 gttaactttaaccctcaaatgtctatggtggaccaacctaaagagtggtccaccgtagatcctattaattattttaatttaaaccttttaatctat 4871706  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Original strand, 1794425 - 1794629
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||| || || || ||||||||   |  ||||| |||||||| |||  ||| ||  ||||||||||||       
T  1794425 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttgatctcacaattaataaaatataccttttgatccctcactttttcctctgtttgtcaaataaatccta 1794524  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaaccctttgatcta 370  Q
    |||||||| ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||||||| |    
T  1794525 acggttaagtttaatcccaaatgatgtatatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagaccttattaaattttttaatttaaaccgtttgatcaa 1794624  T
Q  371 ttttt 375  Q
    |||||    
T  1794625 ttttt 1794629  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 375
Target Start/End: Original strand, 13165494 - 13165711
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||||||| |   ||||| |||| |||  |||  ||||||     
T  13165494 ggcttattagatcgtttggtccattatttaatttcatgttttcattttggtccc-taattaataaaaatggcgttttcgtccttcatcttttcctccgtt 13165592  T
Q  259 agtcaaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttc 356  Q
     |||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||     
T  13165593 tgtcaaataaatccttgactgttaagtttaacttcaaatttctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagacttcattaattattttaattta 13165692  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  13165693 aaccgtttgatcttttttt 13165711  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 393739 - 393568
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-g 274  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||   || |||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| | |    
T  393739 ggtccctcaaataatttcaaattttcattttggtcccacaattaataaaaagtatcttttggtccctcacttttttctccgtttgccaaataaatcccgg 393640  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    || |||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||    
T  393639 actgttaactttaattctaaatgtttatagtggaccaaccttaaaagtggtccatcgtagaccttattaatt 393568  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 374
Target Start/End: Original strand, 7053177 - 7053392
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||  || ||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||  ||||| ||  ||    
T  7053177 aggcttaataggtcattttttcccctaattaattttcagtttacattttggttccataattaataaaacttatatttttgtccctctagtttg-ctttgt 7053275  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatg-gtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaattt 355  Q
     |||||||||||| |  || ||||| ||||| | | ||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7053276 tagtcaaataaatgt--actgttaagtttaatctcgaatgtctatttgtggaccaatcttaagagtgatccaccatagatcctattaatttttttaattt 7053373  T
Q  356 caaccctttgatctatttt 374  Q
     || | |||||||| ||||    
T  7053374 aaatcgtttgatctttttt 7053392  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26496430 - 26496217
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc-ctcacgtttgtctc 254  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||    ||||  || |||||||||||| |  |||||||||  ||||||||| || | ||||| |||    
T  26496430 ttaggcttaattggacatttggtcctctaactaattatgtgtttacattttggtcccataaattgtaaaactcacattttggtcctcttaggtttg-ctc 26496332  T
Q  255 cgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taa 352  Q
    ||||||||||| |  ||   || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26496331 cgtcagtcaaaaaggtcctaactgttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccgactttaaaaatggtccaccatagatcctattaattattctaa 26496232  T
Q  353 tttcaaccctttgat 367  Q
    ||| |||| ||||||    
T  26496231 tttaaaccgtttgat 26496217  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6349655 - 6349492
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |||   |||||    |||||| ||| ||    
T  6349655 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcaccttttcttccgtttaccaaatagatcccg 6349556  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6349555 aacgttaagtttaaccccaaatgatgtatatggtggatcaaccttaagagtggtccaccataga 6349492  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8682845 - 8682756
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac-cttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8682845 ttaagtttaacaccaaatgtctatggtggactaaatcttaagagtggtccatcatagatcatattaattttttaatttcaaccctttgat 8682756  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14524966 - 14524815
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagttttt-atcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcag 260  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||  |    
T  14524966 ttaataggtcacttggtcctttaattaatttcaagtttttcattttgatcccataattaataaaactcatgttttagtctcttacttttccctccgtttg 14524867  T
Q  261 tcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaa 312  Q
     |||| ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14524866 -caaaaaaatccctaactgttaagtttaaccccaaatgtctatgatggaccaa 14524815  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 374
Target Start/End: Original strand, 27847704 - 27847891
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaacttt 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||   || ||| ||||||| |  |||   |||||  | ||||||||||  ||||||||| |||    
T  27847704 taatttcaagtttttattttggtcccacaattaataaaatgtatttttcggtcccttaatttttcttccgtttgccaaataaatccagacggttaagttt 27847803  T
Q  287 aaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  27847804 aaccccaaatgtatatggtgggccaagattataga-tagtccaccatagaccttattaatttttcaattttaaccctttgatctttttt 27847891  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 36845524 - 36845600
Alignment:
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36845524 gacggtcaactttaaccctaaatgtttatgatagaccaacattaagagtggtccaccataggtcctattaattattt 36845600  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 346
Target Start/End: Original strand, 1829768 - 1829939
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga 275  Q
    ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  || |||| ||||||||| |||  || |||  |||||||||||  |||    
T  1829768 ggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatcttttagtccctcactttttcctacgtttgtcaaataaattccga 1829867  T
Q  276 cggttaac-tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    | |||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| | |||| | ||||||||    
T  1829868 ctgttaacttttaactctaaatgtctatcgtggaccaactttaaaagtggtccatcgtagaccttattaatt 1829939  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 375
Target Start/End: Original strand, 2162622 - 2162825
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaa-tct 272  Q
    |||||||  ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |  || ||| ||| ||     
T  2162622 ttggtcctctaattaattttcagttttcattttagtcccataactaataaaactcatattttggtccctcaagttcatctccttttgttaaaaaaattca 2162721  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt-aatttcaaccctttgatctat 371  Q
    || | ||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||    ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |    
T  2162722 cgtctgttaagtttaaccctaaatatgtaaggttgaccaacattttaggtggtccaccatagaccttattaattttttcaattttaacactttgatcttt 2162821  T
Q  372 tttt 375  Q
    ||||    
T  2162822 tttt 2162825  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 11968537 - 11968702
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaacttt 286  Q
    |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||  |  |||||||||||||  |||  ||||||  || ||||||||  || | || ||||||    
T  11968537 taatttcaagttttcattttggtctcacaattaataaaacatactttttggtccctcagattttgctccgtttgtaaaataaattccggctgtcaacttt 11968636  T
Q  287 aaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||| |  |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11968637 aactcagattatgtctatgatggaccaaccttaagagtggtccatcatagatcctattaattattt 11968702  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19750292 - 19750194
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||    
T  19750292 gttaactttaaccttaaatgtctatggtggacaaatcttaaaagttgtccaccatagatcctattaattattttaatttaaatcgtttgatcttttttt 19750194  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 19789514 - 19789612
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||    
T  19789514 gttaactttaaccttaaatgtctatggtggacaaatcttaaaagttgtccaccatagatcctattaattattttaatttaaatcgtttgatcttttttt 19789612  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Original strand, 23201858 - 23202055
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||| |    |||||||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||     
T  23201858 tttggtcccttatttaatttcatgtttttattttggtcccacatttaataaaaatggcattttggtccctcaccttttcctccgtttgccaaataaatcc 23201957  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    | || ||||| |||||    ||  |||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  23201958 caaccgttaagtttaataaaaatgatgtttatggtggatcatctttaagagtggtacaccataggtcctattaattattttaatttcgaccgtttgat 23202055  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 313
Target Start/End: Original strand, 1188859 - 1188996
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||||| |||     
T  1188859 gtccctcaaataatttcaagtttttattttggtcccacaattaataaaacgtacattttggtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatcccgaa 1188958  T
Q  277 ggttaac-tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
     |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1188959 cgttaacttttaaccctaaatgtctatggtgaaccaac 1188996  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 270
Target Start/End: Original strand, 28589777 - 28589890
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||||| | | |  | ||||||||    
T  28589777 taggtttaataggtcatttgatcccttaaataattttcagttttcattttggtcccataagtattaaaacttatgttttggtactttaattatgtctccg 28589876  T
Q  257 tcagtcaaataaat 270  Q
    || |||||||||||    
T  28589877 tcggtcaaataaat 28589890  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 50546901 - 50547118
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| || || || || |||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||  |||  | ||    
T  50546901 ttaggcgtattagatcatttggtcccttatttaatttcatgtcttcattttagtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcatcttttccacc 50547000  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacg-gttaactttaaccc-caaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaat 353  Q
    ||  | |||||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  50547001 gtttgccaaataaatccctacctgttaagtttaaccctcaaatgtctatggcggataaaccttagaagtggtccaccataaactctattaattttttaat 50547100  T
Q  354 ttcaaccctttgatctat 371  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  50547101 ttcaaccatttgatctat 50547118  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15450090 - 15450005
Alignment:
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtg---tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat 345  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15450090 caaataaatctt-acggttaagtttaactccaaatgttgtctatcgtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat 15450005  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 38695538 - 38695622
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38695538 ttaggcttaataggttatttggtcccttaaataattttcaattttcattttgatcccatatctaataaaaatcatgttttggtcc 38695622  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 326
Target Start/End: Original strand, 40792773 - 40792914
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||  ||| |||||||  | |||||||||| |||  |||||    
T  40792773 taattaattttaagttttcattttggtcccacaattaataaaacatacattttggtccctcagatttttctccgtttgccaaataaatcccga--gttaa 40792870  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    |||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40792871 ctttaactttaaatgtctatagtggaccaaccttaaaagtggtc 40792914  T

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Target: chr4; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 1519929 - 1520018
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Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  1519929 gttaactttaaccccaaatgtttatggtagatcacctttaa-agtgatccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 1520018  T

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Target: chr4; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 157 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10168903 - 10168745
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Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  |||||    
T  10168903 taggcttattagatcgtttggtccattatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctccg 10168804  T
Q  257 tcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
    |  | ||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10168803 tttgccaaataaatccatgacagttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccaac 10168745  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11438658 - 11438476
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-gacggttaactt 285  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||  |||| |  |  ||||||||||| |||  |||| ||    
T  11438658 taatttgaagtttttattttggtctcataattaataaaacactcgttttggtccctcactttttcctccatttgctaaataaatctctgacttttaagtt 11438559  T
Q  286 taaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |    ||||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  11438558 taaccccaaatgtctacggtggaccaacagtgtaggtggtccaccataaaccctattaatttctttaatttaaaccatttgat 11438476  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 52138794 - 52138701
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgt--atggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  52138794 gttaactttaacccctaaatgtctctatggtagaccaactttaagaatggtccaccatagatcctattaattattctaatttaaaccgtttgat 52138701  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 13531143 - 13531195
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcc 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  13531143 ggcttaataggtcatttggacccttaattaatttcaagttttcattttggtcc 13531195  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 335
Target Start/End: Original strand, 4714016 - 4714195
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||| |   |||||  ||||| || ||   |||| |    
T  4714016 aggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatatttttattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttaatcccttaccttatcctcctt 4714115  T
Q  258 ca-gtcaaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
       | |||||||||| |||||  |||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4714116 tttgccaaataaatcatcgactattaagtttaacttcaaatgtctatggtggatcaaccttaagagtggtccaccataga 4714195  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 56157493 - 56157426
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56157493 ttaactttaacctcaaatgtctcaagtggaccaatcttaagagtgttccaccatagatcctattaatt 56157426  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 468
Target Start/End: Original strand, 668384 - 668696
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||   |||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||   ||||||    
T  668384 ggcttaataagtcatttgatcctccaattaattttcagttttcattttggtctcataactaataaaactcacgttttggtcccccaattttacgtccgtc 668483  T
Q  259 agtcaaataaatctcga-cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttc 356  Q
    | ||||||   || |   | ||||| ||||||||||||| | || | |||| |||| ||  ||| ||||| | |||||| | |||||||| ||||| ||     
T  668484 attcaaattggtcccattccgttaattttaaccccaaatatttaagatggaacaacattgtaga-tggtctatcatagaccttattaattttttaaattt 668582  T
Q  357 aaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaatt--ttttcactttcttc 454  Q
    |||| || |||||||||||| ||| ||  |  ||| |||    |||| |  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  668583 aaccattagatctatttttcaaaacaaaaaacgttggatcaaaaaggtctattgtatcatacaatgaaccatcaacaactaattatttttccctttcttc 668682  T
Q  455 atcttcttcatcaa 468  Q
    ||||||||||||||    
T  668683 atcttcttcatcaa 668696  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Original strand, 34438527 - 34438616
Alignment:
Q  284 tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34438527 tttaacctcaaatgtctatggtggactaacattataga-tagtccaccatagaccttattaattttttaatttcaaccatttgatctattt 34438616  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 669755 - 669678
Alignment:
Q  167 aggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  | |||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  669755 aggtcatttggtcccccaattaattttcaattttcattttggtcccataattaataaaactcacattttggtccctca 669678  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 7708911 - 7708719
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagttttt--atcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtct 253  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| | || |||  || ||||| | | || |||||||| |   ||||| ||||||||| ||| |||    
T  7708911 ttaggcttattagatcgtttggtcccttatttaattttatgtgttttcattttggttctacaattaataaaagtggcgttttagtccctcacctttttct 7708812  T
Q  254 ccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    | ||  | |||||||||| | |  |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||||    
T  7708811 ctgtttgccaaataaatcccaagtgttaactttaactctaaatatctatggtggaccaaccttaaaagtggtacatcatagaccttattaatt 7708719  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28657116 - 28656999
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttcc 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    ||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||||     
T  28657116 gttaactttaaccccaaatgtcttaggtggaccaaccttgtaggtgatccaccgtagaccttattaattttttaatttcatctttttgatctttttttca 28657017  T
Q  378 aaaaaaggacggttagat 395  Q
    ||||| | |||| |||||    
T  28657016 aaaaaggaacggctagat 28656999  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 390230 - 390354
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||  | |  ||||||  | ||||||||||      
T  390230 ttggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatattttggtccctcatttcttcctccgtttgccaaataaatcct 390329  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  390330 gactgttaagtttaacctcaaatgt 390354  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 369
Target Start/End: Original strand, 36243637 - 36243729
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    ||||||||||||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||    
T  36243637 gttaactttaacctcaaatgtcttaagtggaccaatcttaagagtgttccaccatagattctattgaattttttaactttaaccgtttgatct 36243729  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49896560 - 49896492
Alignment:
Q  300 tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  49896560 tatggtggaccaacctaaagagtggtccactgtagatcctgttaattattttaatttaaaccgtttgat 49896492  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Original strand, 22069353 - 22069420
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat 345  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||    
T  22069353 gttaactttaacttcaaatgtctatggtggacgaaccttaaaagtggttcaccatagactctattaat 22069420  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23103962 - 23103915
Alignment:
Q  322 tggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  23103962 tggtccaccatagatcctattaattttttaatttaaaccgtttgatct 23103915  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 346
Target Start/End: Original strand, 42871109 - 42871280
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||| || ||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||  |    
T  42871109 tggtcccctgattaatttcaaattttcattttgatcccacaattaataaaacgtacgttttggtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatcctg 42871208  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    || ||||| |||||  |||||||| || |||||| |||| |||    | ||||||| |||| ||||||||||    
T  42871209 actgttaagtttaattccaaatgtctacggtggatcaacattatatatagtccaccgtagaccctattaatt 42871280  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 54865117 - 54865214
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||    
T  54865117 tttggtcccttatttaattttatgttttcattttggtcccataattaataaaa-ttgtgttttagtccctcacattttcctccgtttgtcaaataaatc 54865214  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 2310945 - 2311006
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||    
T  2310945 taattaatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgttttggtccctca 2311006  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4871467 - 4871322
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||| || ||||| | | || |||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  4871467 ttggtccccaaaataatttcatgttttcattttggttctacaattaataaaacgtatgtttaagtcccccacgtttttctccgtttgtcaaataaatccc 4871368  T
Q  274 -gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaa 318  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  4871367 tgaatgttaactttaatcccaaatgtttatcatggaccaactttaa 4871322  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42810303 - 42810118
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||  ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||         
T  42810303 gtcccttaaataatttcaacttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacttttaagtccctcacattttcctccgtttgccaaataaatccttgg 42810204  T
Q  277 ggttaactttaaccccaa-atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaacc 360  Q
     ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||    
T  42810203 tgttaagtttaacccccagatgtctatggtgaaccaatcttaagagtagtccaccatagaccttattaaattttttaatttaaacc 42810118  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 461
Target Start/End: Original strand, 49895214 - 49895271
Alignment:
Q  405 ccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaa-ttttttcactttcttcatcttct 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49895214 ccgttgtatctaatagtgaaccatcaacacctaatttttttccttttcttcatcttct 49895271  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 52241259 - 52241035
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||  | |||||| | |||||  |||  ||||||  | |||||||||      
T  52241259 tttgatcccttatttaatttcatgttttcattttgattccacaattaataaaacgtacgttttgattcctcatcttttcctccgtttgccaaataaattc 52241160  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctat 371  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||| | ||||| || | ||||||| | || || |||||||    
T  52241159 cgaccgttaactttaactccaaatatctatggt-gaccatccttaaaagtggtccatgatagaccttattagttttgttaattttatccattcgatctat 52241061  T
Q  372 ttttccaaaaaaggacggttagattt 397  Q
    || ||  |||| |||| |||||||||    
T  52241060 ttatcataaaagggacagttagattt 52241035  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 10167417 - 10167489
Alignment:
Q  153 aaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||||||    
T  10167417 aaattaggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtaccacaattaataaaa 10167489  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54485664 - 54485596
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaac 226  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  54485664 aggcttaatagatcacttagtcccctaaataatttcaagttttcattttgatcccataattaataaaac 54485596  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23204071 - 23203904
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||| |  |||||||| |   |||||||||| |||  ||| |||||||     
T  23204071 ggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatattttcattttggtcccacatttaataaaaatggcgttttggtccgtcatctttttctccgtt 23203972  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
     | ||| |||||| | |   ||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23203971 tgccaattaaatcccaagtattaactttaactctaaatatctatggtggatcaaccttaaaagtggtc 23203904  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Original strand, 44501531 - 44501630
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||  | ||||  ||||||||| ||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  44501531 ttggtccctcaaataatttcaagttttcattctggtcccataattaataaaacgtacgtttaagtccctcacttttttctctgtttgccaaataaatctc 44501630  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Original strand, 45535207 - 45535254
Alignment:
Q  322 tggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  45535207 tggtccaccatagatcctattaattttttaatttaaactgtttgatct 45535254  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Original strand, 49342737 - 49342788
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccac 329  Q
    ||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49342737 gttaagtttaaccccaaacgtctatagtggaccaaccttaaaagtggtccac 49342788  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3921234 - 3921172
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttg 236  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||| ||||||||| || ||||||    
T  3921234 ttggtcccttaattaattttcagttttcattttggtctcataaataataaaacccaagttttg 3921172  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 285
Target Start/End: Original strand, 4129019 - 4129117
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactt 285  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||   |  ||||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||| ||||||||    
T  4129019 taatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaatgtacattttggtcccttacttttttctccgtttgccaaataaatcccgaccgttaactt 4129117  T

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Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13166784 - 13166710
Alignment:
Q  262 caaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13166784 caaataaatccttgactgttaagtttaacttcaaatgtctatgatggaccaaccgtaagagtgatccaccataga 13166710  T

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Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 306
Target Start/End: Original strand, 37882848 - 37882981
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc--t 272  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||  |    
T  37882848 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttagtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcaccttttcctccgtttgccaaataaatcatt 37882947  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtg 306  Q
     ||| ||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  37882948 tgactgttaactttaatctcaaatatctatggtg 37882981  T

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Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1831365 - 1831296
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| || |||||||||  |  |||||||||||||    
T  1831365 tggtccctcaattaatttcaagttttcattttagtcccacaattaataaaacgtacattttggtccctca 1831296  T

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Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 54866748 - 54866612
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |||| || ||||| ||| || |||||||| |  |||||| |||||| ||||||  ||||||     
T  54866748 ggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatattttcattttggt-ccacaattaataaaaatggtgttttagtcccttacgttttcctccgtt 54866650  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaat 296  Q
     | ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||    
T  54866649 tgccaaataaatcatgactgttaagtttaactccaaat 54866612  T

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Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1190295 - 1190243
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaac 226  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  1190295 ttggtccctcaaataattttaagttttcattttggtcccataattaataaaac 1190243  T

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Target: scaffold2071 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 159 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 799 - 581
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  799 ggcttaataggtcatttggtcctctaattaatttccagttttcattttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcaagtttgtctctgtc 700  T
Q  259 agtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttc 356  Q
     |||||||||||| | ||  || || ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||     
T  699 ggtcaaataaatccctgattgtcaagtttaacctcaaatgtatataatggaccaaccttaagagtggtccaccatagaccttattaaattttttaattta 600  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  599 aaccgtttgatctgttttt 581  T

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Target: chr7 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9662355 - 9662138
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662355 aggcttaataggtcatttggtcctctaattaatttcaagttttcatcttagttccataactaaaaaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 9662256  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttc 356  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || |||||     
T  9662255 cggtcaaataaatccagactgttaaatttaacttcaaatgtctatggtggaccaacattataga-tagtccaccatagaccttattaatttttcaatttt 9662157  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  9662156 aaccatttgatcttttttt 9662138  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 367
Target Start/End: Original strand, 32254998 - 32255199
Alignment:
Q  170 tcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaa 269  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |  ||||| |||||||| |||  ||||||  | ||||||||    
T  32254998 tcatttggtccctcaaataatttcaaatttttattttggtcccataattaataaaacgtacattttgatccctcactttttcctccgtttgccaaataaa 32255097  T
Q  270 tctcgacggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttg 365  Q
    || |||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32255098 tcccgacggttaagtttaaccccaaatgatgtttatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttcaaccgtttg 32255197  T
Q  366 at 367  Q
    ||    
T  32255198 at 32255199  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 375
Target Start/End: Original strand, 25533186 - 25533403
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | | ||||||||    
T  25533186 ggcttaataagtcatttggtctcttaattaatttcaagttttcattttggtcccataactaataaaattcatgttttggtccttcaattgtatctccgtc 25533285  T
Q  259 agtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttca 357  Q
     |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||| | |||||||| |    
T  25533286 ggtcaaataaatctctgactgttaagtttaaccccaaatgcttatagtgaactaactttaagggtggtccactatagaccttattaaatctttaatttaa 25533385  T
Q  358 accctttgatctattttt 375  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  25533386 accgtttgatatattttt 25533403  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 350
Target Start/End: Original strand, 46201129 - 46201321
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  | ||| |||||    
T  46201129 aggcttaagaggtcatttggtctcataataattttca-gttttcattttggtcccataagtaataaaactcatgttttgatcctttaattgtgtttccgt 46201227  T
Q  258 cagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    | | ||||||||||   | | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46201228 cggccaaataaatccaagcctgttaagtttaaccccaaatgtctatggtgaaccaaccttaagagtggtccaccatagatcatattaattattt 46201321  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13564363 - 13564164
Alignment:
Q  153 aaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtc 252  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| || ||||||||||   ||||| ||||||||| |||  |    
T  13564363 aaataaggcttattagatcatttagtcccttatttaatttcttgttttcattttggtcccacaattaataaaactggcgttttagtccctcacattttcc 13564264  T
Q  253 tccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaat---gtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt 349  Q
    |||||  | |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13564263 tccgtttgccaaataaatcccgacg-ttaagtttaaccccaaataatgtctatggtggatcatccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt 13564165  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 242
Target Start/End: Original strand, 38539667 - 38539752
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccct 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38539667 taggcttaataggtcatttgatcccttaattaatttcaagttttcattttggtcccataaataataaaactcatgttttggtccct 38539752  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 360
Target Start/End: Original strand, 22335977 - 22336181
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||| ||     
T  22335977 ggcttattagatcttttggtcccttatttaatttcgtgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttcctcagtt 22336076  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg-tg-tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaattt 355  Q
     | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22336077 tgccaaataaatcccgaatgttaagtttaaccccaaatgatgctatggtggatcaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattttaattt 22336176  T
Q  356 caacc 360  Q
    |||||    
T  22336177 caacc 22336181  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 35295817 - 35296007
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttttc 376  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||     
T  35295817 gttaactttaaccccaaatatctgtggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgatctatatttt 35295916  T
Q  377 caaaaaaggacggttagatttcgaaggaccgttgtatctaacagtgaaccatcaacaactaatttt--ttcactttcttcatcttcttcat 465  Q
     |||  ||||| ||| ||||  ||||| || |||||||  |  ||||  |  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  35295917 aaaatgaggactgttggattatgaaggtccattgtatcgtatcgtgagtcgacaacaactgatttttcttccctttcttcatcttcttcat 35296007  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Original strand, 43441381 - 43441536
Alignment:
Q  196 gtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca-cgtttgtctccgtcagtcaaataaatc-tcgacggttaactttaacccca 293  Q
    ||||| || |||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  43441381 gttttcattttggtctcataactcataaaattaatattttggtccctcagcgtttg-ctccgttaatcaaaaagatccttgacggttaactttaacccta 43441479  T
Q  294 aatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43441480 aatgtctatggtgtaccaaccttaagagtggtccaccataagtcctattaattattt 43441536  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47060569 - 47060408
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||  || | |||||  | ||||||||||  ||| |||||    
T  47060569 taattaattttaagttttcattttggtcctataattaataaaacgtacgttttggtccctcacccttttttccgtttgccaaataaatccggactgttaa 47060470  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa 344  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  47060469 gtttaacaccaaatgtatatggtggaccaaccttaagaatagtccaccatagaccttattaa 47060408  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 367
Target Start/End: Original strand, 47454351 - 47454544
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||  |  ||||||||||||| |||| ||| |||  | |||||||||| ||    
T  47454351 tggtccctcaaataatttcaagctttcattttggtcccacaattaataaaacgtacattttggtccctcaagtttttcttcgtttgccaaataaatcccg 47454450  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||  ||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  47454451 actattaactttaactctaaatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtccatcgtagaccttattaattttattaattttaaccgtttgat 47454544  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 374
Target Start/End: Original strand, 40811422 - 40811536
Alignment:
Q  263 aaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaac 359  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||    
T  40811422 aaataaatcctgacggttaactttaacccaaatgatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagattctattaatatttttaatttaaac 40811521  T
Q  360 cctttgatctatttt 374  Q
    | |||||||| ||||    
T  40811522 cgtttgatctttttt 40811536  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 43460911 - 43460728
Alignment:
Q  189 atttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaa 288  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||| ||||||||| |||  |||| |  | ||||||||||   || ||||| |||||    
T  43460911 atttgaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacattttagtccctcactttttcctccatttgccaaataaatcctcacagttaagtttaa 43460812  T
Q  289 ccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    | | ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43460811 ctcaaattatgtctatggtggaccaactttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccctttgatct 43460728  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22538966 - 22538807
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||| || |||||||| | | ||||| ||||||||  |||  ||||||     
T  22538966 ggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttctttttggtcccacaattaataaaaatgacgttttagtccctcatcttttcctccgtt 22538867  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaa 318  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  22538866 tgccaaataaatctcgacggttaactttaactccaaatatctatggtgtaccaacattaa 22538807  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 40812743 - 40812544
Alignment:
Q  147 tatttaaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacg 246  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||  | |||||| |||||||      
T  40812743 tatttaaaattcggcttattagatcgtttgatcccttatttaatttcatgttttcattttggttccataattaataaaacgtacgttttgctccctcata 40812644  T
Q  247 tttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    |||  ||| ||  |||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||    |||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||    
T  40812643 ttttcctctgtttgtcaaatatatcccgactgtttactttaactccaaataaccatggtggaccaaccttaaaagtgatccatcgtagatcttattaatt 40812544  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35211 - 35105
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |  | ||||||||||    
T  35211 ggcttaataggtcatttggtcccttaaataatttccaattttcattttggtcccatatctaataaaagtcatgttttggtcctttaactgtgtctccgtc 35112  T
Q  259 agtcaaa 265  Q
     ||||||    
T  35111 tgtcaaa 35105  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 669386 - 669290
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  669386 gttaactttaacctcaaatgtctatggtggaccatc-ttaagagtggtccaccatagatcctattaattttgttaatttaaaccgtttgatctttttt 669290  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 366
Target Start/End: Original strand, 2414863 - 2414952
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttga 366  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||    
T  2414863 gttaactttaaccccaaatgtctataatggaccaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattttcttaatttaaaccgtttga 2414952  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 22537554 - 22537768
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||| |  |||| || ||||||||| || || ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||     
T  22537554 ttaggcttattagatcgtttgctcccttatttaattttatattttcattttggtcccacaattactaaaaatgacattttgatccctcacgtttgtctct 22537653  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-ttta 351  Q
    ||  | |||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||   | || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22537654 gtttgccaaataaatc-caactgttaattttaacctcaaatgatgtttacggtgaaccaaccttaatagtgatccaccatagatcctattaattatttta 22537752  T
Q  352 atttcaaccctttgat 367  Q
    |||| |||| ||||||    
T  22537753 atttaaaccgtttgat 22537768  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 27749 - 27833
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27749 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaaataatttccaattttcattttggttccatatctaataaaagtcatgttttggtcc 27833  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Original strand, 44372848 - 44372944
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||    
T  44372848 ttaactttaaccctaaatgtctatagtggactaacattaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaattaaaaccgtttgatctttttt 44372944  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Original strand, 44381704 - 44381800
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||    
T  44381704 ttaactttaaccctaaatgtctatagtggactaacattaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaattaaaaccgtttgatctttttt 44381800  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 373
Target Start/End: Original strand, 11501192 - 11501393
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |  |||||||| |    |||| ||||||||| |||  |||| |  | ||||||||||     
T  11501192 tttggtcctttaattaatttcatgttttcattttggtcccacagttaataaaaatagcattttagtccctcaccttttcctccatttgccaaataaatcc 11501291  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctat 371  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||   |||| | |||||||| | ||||||| |||| || |||||||    
T  11501292 cgactgttaactttaacttcaaatgtctatggtggaccaaccttaaaagtggttcattgtagaccttattaattttgttaattttaaccattcgatctat 11501391  T
Q  372 tt 373  Q
    ||    
T  11501392 tt 11501393  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32256497 - 32256344
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||   |  |||||||||||||| |||  |||| |  | |||||||||  |     
T  32256497 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccataattaataaaatgtaccttttggtccctcactttttcctccatttgccaaataaattcca 32256398  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtcca 328  Q
    || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32256397 accgttaactttaacttcaaatgtctatggtggaccaacattaaaagtggtcca 32256344  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 373
Target Start/End: Original strand, 43459471 - 43459668
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    ||||  |||||||| ||||  ||||||  | ||||||||||||| |    
T  43459471 gtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtgcgtttaagtccctcatgttttcctccgtttgccaaataaatctcggc 43459570  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
     ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| || | |||| | |||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  43459571 tgttaagtttaactccaaatgtctatggtggatcaaccttaaaaatggtacatcgtagaccttattaattttgttaattttaaccattcgatctattt 43459668  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 15992253 - 15992325
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  15992253 gttaactttaacctcaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtgatttaccaaagatcctattaattattt 15992325  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11502437 - 11502328
Alignment:
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttca 357  Q
    |||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11502437 caaataaatcccaacagttaagtttaacctcaaatgatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctagtaattattttaatttca 11502338  T
Q  358 accctttgat 367  Q
     || ||||||    
T  11502337 gccgtttgat 11502328  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 39981434 - 39981525
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  39981434 gttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccaactttaaaaatggtccaccatagatccaattaattattctaatttaaaccgtttgat 39981525  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40509836 - 40509675
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc--t 272  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||  || |||||| |||  ||||||    ||||||||||  |    
T  40509836 tggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgtttaagttcctcactttttcctccgtttaccaaataaatcatt 40509737  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||  | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40509736 cggtg-ttaagtttaaccccaaatgtctatagtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 40509675  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 41328336 - 41328427
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  41328336 gttaactttaacccccaaatgtctatggtggaacaactttaaaaatggtccaccatagatcctattaattattctaatttaaaccgtttgat 41328427  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 16755989 - 16756079
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16755989 gttaactttaacctcaaatgtctatggtgaaacaaccttaaaagttgtctaccatagatcctattaattattttaattttaaccatttgat 16756079  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 346
Target Start/End: Original strand, 47059122 - 47059295
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| | || ||||||||   | |||||| |||||||| |||  ||||||  | ||||||||||  |    
T  47059122 tggtcccctaattaattttaagttttcattttggtcctacaattaataaaatgtacgttttgatccctcactttttcctccgtttgccaaataaatcctg 47059221  T
Q  275 acggttaactttaaccc--caaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    || ||||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  47059222 accgttaagtttaaccctccaaaagtctatggtggagcaaccttaagagtagcccaccatagaccttattaatt 47059295  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22115162 - 22115105
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115162 gttaagtttaaccccaaatgtctatagtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 22115105  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33779184 - 33779036
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-ga 275  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | |||  ||||| |   | |||||||||  |     
T  33779184 gtcccctaaataatttcaagttttcattttggccccacaattaataaaactcacgttttagtccctcgctttttcctccgcc---ccaataaatctttgg 33779088  T
Q  276 cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtcc 327  Q
    | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33779087 ctgttaagtttaaccacaaatgtctatggtggaccaaccttaagagtggtcc 33779036  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 325
Target Start/End: Original strand, 13562818 - 13562986
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| ||| |||| |    
T  13562818 taggcttattagatcgtttagtcccttatttaatttcttgtttttattttggtcccacaagtaataaaaatggcgttttagtccctcacatttttctctg 13562917  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggt 325  Q
    |    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||    
T  13562918 tttaccaaataaatcccgattgttaactttaacttcaaatgtctataatggaccaaccttaaaagtggt 13562986  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 336
Target Start/End: Original strand, 40508392 - 40508554
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||| || |||||||||  | ||||  ||||||||| |||  |||||| || |||||||||| |     
T  40508392 tggtcccctaaataatttcaagttttcatttttgtcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcactttttcctccgttagccaaataaatc-ct 40508490  T
Q  275 acggt--taactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagat 336  Q
     ||||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40508491 tcggtgttaagtttaatcccaaatgtctatggtggatcaatcttaagagttgtccaccatagat 40508554  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 41079937 - 41079766
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||  | |||||||||||| |  |||  ||||||  |  ||||||||| |    
T  41079937 ttggtccctcaattaatttccattttttattttggtcccacaa-taataaaacgtacgttttggtcccttatcttttcctccgtttgctaaataaatccc 41079839  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
     || |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||| | ||||||||    
T  41079838 taccgttaactttaactccaaatatctatggtggaacaacattaaaagtggtccatcgtagaccttattaatt 41079766  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46202401 - 46202289
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  | |  | ||||||||||    
T  46202401 ggcttaataggtcgtttgatcccttaaataatttacagttttcattttgatcccataagtaataaaactcatgttctggtcatttaattgtgtctccgtc 46202302  T
Q  259 agtcaaataaatc 271  Q
     ||||||||||||    
T  46202301 ggtcaaataaatc 46202289  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Original strand, 30333298 - 30333395
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||    
T  30333298 ttggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatcttttggtccctcatttttttctccgtttgtcaaataaatc 30333395  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Original strand, 9660119 - 9660171
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcc 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9660119 ggcttaataggtcatttggacccttaattaatttcaagttttcattttggtcc 9660171  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Original strand, 32602946 - 32603045
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||||    
T  32602946 ttggtccttcaaataatttcaagtttttattttggtcccataattaataaaacgtacgttttagtccctcactttttactccgtttgccaaataaatctc 32603045  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45455474 - 45455352
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||  |  ||||| |||||||| ||| |||||||  | ||||||||||  |    
T  45455474 tggtcccttaattaatttcaaattttcattttggtcccacaattaataaaacgtacattttgatccctcacttttttctccgtttgccaaataaatcatg 45455375  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatg 297  Q
     | ||||| |||||||| |||||    
T  45455374 gctgttaagtttaaccctaaatg 45455352  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4300138 - 4299989
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacg-gttaactt 285  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||  ||||||||| |||  ||| ||  | |||||||||||    | ||||| ||    
T  4300138 taatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcactttttcctctgtttgccaaataaatctttcggtgttaagtt 4300039  T
Q  286 taaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4300038 taaccccaaacgtctatagtggatcaaccttaagagtggcccaccataga 4299989  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30334755 - 30334557
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||| || |||||||||  |  |||||||||||||    |  ||||||     
T  30334755 ggcttaatagatccattggtcccctaactaatttcaagttttcattttagtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctca----tccctccgtt 30334660  T
Q  259 agtcaaataaatctcga-cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttca 357  Q
     | |||||||||  | | | ||||| | |||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30334659 tgccaaataaattccaaaccgttaaatctaactctaaatgtctatggaggaccaactttaagaacagtccaccatagatcctattaattttttaatttaa 30334560  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 333
Target Start/End: Original strand, 41078859 - 41078930
Alignment:
Q  264 aataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  41078859 aataaatcccgacggttaactttaacccaaatgatgtatatggtggaccaatcttaaaaatggtccaccata 41078930  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6173552 - 6173400
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||  ||||||| |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||||| |     
T  6173552 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttgtacccataattaataaaacgtacattttggtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatc-ca 6173454  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtcca 328  Q
     |  ||||||||||| | |||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  6173453 tctattaactttaactctaaatatctatagtggaccaactttaaaagtggtcca 6173400  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 45454052 - 45454148
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||    
T  45454052 tggtcccctaattaatttcacgttttcattttggtctcataattaataaaacatacgttttagtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatc 45454148  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 44554764 - 44554698
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  44554764 ttaactttaactccaaatgtctatggtggaccaacatt-ataatggtccaccgtagatcttattaatt 44554698  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47456477 - 47456366
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||  |||   || ||  | |||||||||||||    
T  47456477 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtactttttggtccctcattttttcttctgtttgccaaataaatctcg 47456378  T
Q  275 acggttaacttt 286  Q
    || |||||||||    
T  47456377 actgttaacttt 47456366  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22337386 - 22337252
Alignment:
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaacc 360  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  || || |||| |||| | |||||||| | ||||||| |||     
T  22337386 caaataaatcctgaccgttaaatttaacttcaaatgtctatggtggaccaaccttaaatgtagtacaccgtagaccttattaattttgttaattttaaca 22337287  T
Q  361 ctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
     || ||||||||| ||  |||| |||| |||||||    
T  22337286 tttcgatctatttatcataaaagggaccgttagat 22337252  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40738957 - 40738891
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    |||||| ||| || ||||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40738957 ggcttattagatcgtttggtcccctaaacaatttcatgtttttattttggtcccataattaataaaa 40738891  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Original strand, 4298831 - 4298888
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  4298831 gttaagtttaaccctaaacgtgtatggtggatcaatcctaagagttgtccaccataga 4298888  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 266
Target Start/End: Original strand, 26135637 - 26135746
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||  |||||   | |||||||||||| ||   ||||||||    
T  26135637 taggcttaattggacttttggtcccctaactaatttgatgttttcattttggtcccataacttctaaaatcaacgttttggtcccttacaaatgtctccg 26135736  T
Q  257 tcagtcaaat 266  Q
    | ||||||||    
T  26135737 ttagtcaaat 26135746  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35484305 - 35484220
Alignment:
Q  284 tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||   ||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  35484305 tttaaccctaaatgtctaaggtgaaccaacattataggtggtccaccatagatcttaatagatttttaattttaaccctttgatct 35484220  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 48312202 - 48312235
Alignment:
Q  322 tggtccaccatagatcctattaattatttaattt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48312202 tggtccaccatagatcctattaattttttaattt 48312235  T

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Target: chr2 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 369
Target Start/End: Original strand, 35903506 - 35903717
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  35903506 ggcttaataggtcatttggtcctttaattaatttcaagttttcattttggtcccataactaataaaagtcatgttttggtccctcaattatatctccgtc 35903605  T
Q  259 agtcaaataaat-ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttc 356  Q
    |||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||| |||| | ||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  35903606 agtcaaataaatccttggctgttaagtttaaccccaaatgtctatgataga-ttacttttagagtggtccaccatagatcctattaaatattttaattta 35903704  T
Q  357 aaccctttgatct 369  Q
    |||| ||||||||    
T  35903705 aaccgtttgatct 35903717  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34513677 - 34513453
Alignment:
Q  153 aaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |    
T  34513677 aaattaggcttaataggtcatttggtcccctaattaattaccaattttcattttggttccataattaataaaactcatgtttaggtctctcgggtttgcc 34513578  T
Q  253 tccgtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttattt 350  Q
    ||||| |||||||||| || | |   |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||    
T  34513577 tccgttagtcaaataattccctggtcgttaagcttaaccccaaatgtatatggttgaccaaccttaagagtgatccaccatagaccttattaattttttt 34513478  T
Q  351 aatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||    
T  34513477 aatttaaaccgtttgatctgttttt 34513453  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 375
Target Start/End: Original strand, 34147131 - 34147353
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  34147131 ttaggcttaataggtcatttggtccctcaaataattttcagttttcattttggtcccataagtaataaaactcatgttttggtccctcaagttcacctcc 34147230  T
Q  256 gtcagtcaaataaat-ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacct-taagagtggtccaccatagatcctattaattattt--a 351  Q
    | ||||||||||||| |  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||| | |||||||||||| | |||||||| |||  |    
T  34147231 gccagtcaaataaatccatgggtgttaactttaaccccaaatgtctatggtggaccaacatggtaga-tagtccaccatagaccttattaatttttttca 34147329  T
Q  352 atttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  34147330 attttaaccctttgatcttttttt 34147353  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 333
Target Start/End: Original strand, 34512815 - 34512985
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||    
T  34512815 ttaataggttatttggtcccctaattaattaccagttttcattttggtcccataattaataaaactcatgttttgatccctcaaatttgcctccgttagt 34512914  T
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34512915 caaataaatcatgactgttaagtttaa-ccttaatgtatatggtggatcaaccataagagtggtccaccata 34512985  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Original strand, 29219381 - 29219595
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  |||||    
T  29219381 taggcttattagatcgtttggtcctttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttcctccg 29219480  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaa 352  Q
    |  | |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29219481 tttgccaaataaatcccaactgttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaccaatcttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattttaa 29219580  T
Q  353 tttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||| ||||||    
T  29219581 tttcaaccgtttgat 29219595  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Original strand, 29332680 - 29332894
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  |||||    
T  29332680 taggcttattagatcgtttggtcctttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttcctccg 29332779  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaa 352  Q
    |  | |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29332780 tttgccaaataaatcccaactgttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaccaatcttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattttaa 29332879  T
Q  353 tttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||| ||||||    
T  29332880 tttcaaccgtttgat 29332894  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 369
Target Start/End: Original strand, 34463970 - 34464178
Alignment:
Q  163 taataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtc 262  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||   |||| |||||||||  || ||||||||| ||| ||||| |||||| | ||    
T  34463970 taatatgtcatttggtcccctaattaattaccagttttcattttggtttgataattaataaaacaaatcttttggtccatcaggtttgcctccgttaatc 34464069  T
Q  263 aaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatta-attatttaatttcaacc 360  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||     
T  34464070 aaataaatctctgactgttaagtttaaccccaaatgtctatcgttgaccaaccttaagagtggtccaccatagaccttattagattttttaatttaaact 34464169  T
Q  361 ctttgatct 369  Q
     ||||||||    
T  34464170 gtttgatct 34464178  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18617127 - 18616912
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||||    
T  18617127 ttaggcttattagatcatttggtcctttatttaatttcatgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttcctcc 18617028  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-ttta 351  Q
    ||  | |||||||||| | ||  |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18617027 gtttgccaaataaatcccaactattaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggaccagtcttaaaagtggtccaccatagatcctattaattatttta 18616928  T
Q  352 atttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||| ||||||    
T  18616927 atttcaaccgtttgat 18616912  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Original strand, 43033099 - 43033271
Alignment:
Q  178 tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc-tcgac 276  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  | |||||||||| ||||     
T  43033099 tcccttaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatcctcgat 43033198  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    | |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43033199 g-ttaagtttaacctcaaatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtccaccataaaccctattaattattt 43033271  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2277574 - 2277369
Alignment:
Q  172 atttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaat- 270  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||   ||| ||| |||||||||||     
T  2277574 atttggtccctcaaataatttccagttttcattttggtcccataagtaataaaacttatgttttggtccctcaagttcacctcagtcggtcaaataaatc 2277475  T
Q  271 ctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacct-taagagtggtccaccatagatcctattaattattt-aatttcaaccctttgatc 368  Q
    |  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  2277474 catgggagttaactttaaccccaaatgtctatggtggaccaacatggtaga-tagtccaccatagaccttattaattttttcaattttaaccctttgatc 2277376  T
Q  369 tattttt 375  Q
    | |||||    
T  2277375 ttttttt 2277369  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 374
Target Start/End: Original strand, 11547672 - 11547875
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  |||  || |||  ||||||||||||      
T  11547672 ttggtcctttaaataatttcaagttttcattttggtctcataattaataaaacacatgttttaacccctcattttttccttcgtttgtcaaataaatcct 11547771  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatcta 370  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||| ||||||||     
T  11547772 gactgttaagtttaaccccaaatgatgtctatcatggaccaaccttaggagtggtccaccatagatcgtattaaatttataatttaaaccgtttgatctg 11547871  T
Q  371 tttt 374  Q
    ||||    
T  11547872 tttt 11547875  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42641962 - 42641760
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||| ||| | |||||  | ||||||||||       
T  42641962 tggtccctcaaataatttcaaatttttattttggtcccataattaataaaacgcaccttttggtcccccactttttt-tccgtttgccaaataaatcctc 42641864  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctat 371  Q
    ||  |||| || ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| |    
T  42641863 acaattaagttcaacccaaatgatgtctatggtgggccaaccttaagagtggtctaccatagatcctattaattattttaatttaaactgtttgatcttt 42641764  T
Q  372 tttt 375  Q
    ||||    
T  42641763 tttt 42641760  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11317470 - 11317293
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||  |||  ||||||  | ||||||||||       
T  11317470 tggtccctcaaataatttcaaattttcattttggtcccacaattaataaaacatatattttggtccctcaatttttcctccgtttggcaaataaatcctc 11317371  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    || ||||| |||||| | ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11317370 acagttaagtttaactcaaatgatgtctatggtagaccaaccttaagagtggtctaccatagatcctattaattattt 11317293  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Original strand, 33995948 - 33996057
Alignment:
Q  161 cttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||  ||||||| |    
T  33995948 cttaataggtcatttggtcccttaattaattttaagttttcatttttgt-ccataactaataaaactcatgttttagtcccttaattttccctccgtcgg 33996046  T
Q  261 tcaaataaatc 271  Q
    |||||||||||    
T  33996047 tcaaataaatc 33996057  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34148480 - 34148366
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  34148480 taggcttaataggtcatttggtccctcaaataattttcagttttcattttagttccataaataataaaactcatgttttggtccctcaagttcacctccg 34148381  T
Q  257 tcagtcaaataaatc 271  Q
    || ||||||||||||    
T  34148380 tcggtcaaataaatc 34148366  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35061434 - 35061351
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  35061434 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttgaagttttcattttggt-ccataactaataaaactcacgttttagtccct 35061351  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 271
Target Start/End: Original strand, 2276276 - 2276391
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  2276276 ttaggcttaataggtcatttggtccctcaaataattttcagttttcattttagtcctataagtaataaaactcatgttttggtccctcaagttcacctcc 2276375  T
Q  256 gtcagtcaaataaatc 271  Q
    ||  ||||||||||||    
T  2276376 gtaggtcaaataaatc 2276391  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 28562911 - 28562689
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||  |    
T  28562911 tggtccctcaaataatttcaaattttcattttggtcccataattaataaaacataccttttggtccctcactttttcctccgtttgtcaaataaatccag 28562812  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaatttcaaccctttgatctatt 372  Q
    || ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| | |||| |||| |  ||||| ||||||||||||| ||    
T  28562811 actgttaagtttaatcccaaatatatatggtggaccaacattataga-tagtccaccatagaccttattaaattttccaattttaaccctttgatctttt 28562713  T
Q  373 tttccaaaaaaggacggttagatt 396  Q
    |||   ||| ||||||||| ||||    
T  28562712 tttaagaaagaggacggttggatt 28562689  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43034573 - 43034400
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||  || || || |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||      
T  43034573 tggtccctcaaataatttcaagttttcattttaatctcacaattaataaaacgtaccttttggtccctcactttttcctccgtttgtcaaataaatcttc 43034474  T
Q  275 acggttaactttaacccc--aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
     | ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43034473 gctgttaagtttaacctctcaaatgtctatggtggatcaactttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 43034400  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32470675 - 32470478
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  | ||||  || ||||| ||||  ||||||  |||||||||||| || |    
T  32470675 gtcccctaaataatttcaagtttttattttggtcccacaattaataaaacgtacgtttaagttcctcatgttttcctccgtttgtcaaataaatcccggc 32470576  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
     ||||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||| | |||| | |||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  32470575 tgttaagtttaactccaaatgtctatggtggataaaccttaaaaatggtccatcgtagaccttattaattttgttaattttaaccattcgatctattt 32470478  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35904862 - 35904749
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||    
T  35904862 aggcttaataggtcatttagtcctttaaataatttctaattttcattttggccccataagtaataaaactcatgttttggtcctttaattctgtctccgt 35904763  T
Q  258 cagtcaaataaatc 271  Q
    |||||||| |||||    
T  35904762 cagtcaaaaaaatc 35904749  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 346
Target Start/End: Original strand, 37956961 - 37957134
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||| |||||     
T  37956961 tttggtcccttaattaatttcaaattttcattttggtcccataagtaataaaattcatgttttggtcccttaattgtctctccgtcggtcaaagaaatcc 37957060  T
Q  273 cgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
     ||   |||| ||||||||||||| | | | ||||| |||| |||   |||||||||||| || | ||||||||    
T  37957061 tgaatattaagtttaaccccaaatatctcttgtggatcaacattatatgtggtccaccattgaccttattaatt 37957134  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6030485 - 6030370
Alignment:
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaat-tatttaatttcaa 358  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  6030485 caaataaatctcaacagttaactttaacccaaatgatgtctacggtggaccaaccttaagagtgatctaccatagatcctattaatatttttaatttaaa 6030386  T
Q  359 ccctttgatctatttt 374  Q
    || |||||||| ||||    
T  6030385 ccgtttgatctttttt 6030370  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 346
Target Start/End: Original strand, 11315946 - 11316118
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  | ||||  |||||||| ||||  ||||||  | |||||||||| |    
T  11315946 ttggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcaggttttcctccgtttgccaaataaatccc 11316045  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatt 346  Q
    | | ||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||    
T  11316046 ggctgttaagtttaattccaaatgtctatggtggatcaaccttaaaaatggtccaccgtagaccttattaatt 11316118  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 7753640 - 7753442
Alignment:
Q  162 ttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagt 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |  | | ||  |||| ||    
T  7753640 ttaataggtcatttggtcccctaattaatttcaaattttcattttggt-ccataattaattaaactcatgtttttgtcccttaattgtctcctcgtcggt 7753542  T
Q  262 caaataaatc-tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaacc 360  Q
    | |||||||| | |   |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||    ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  7753541 ctaataaatctttgggtgttaactttaactccaaatgtatatggtggatcaacattgtaggtgatccaccatagaccgtattaattttttaatttaaacc 7753442  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 32469285 - 32469358
Alignment:
Q  295 atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32469285 atgtatatggtggaccaactttaagagtggtccactatagatcctattaattattttaatttaaaccctttgat 32469358  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17460778 - 17460635
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||  | ||||||||||||||  |||  ||||||    |||||||||| |||| |||||    
T  17460778 taattaatttcaagttttcattttgatcccacaattaataaaacgtacgttttggtccctcaaattttcctccgtttcccaaataaatcccgaccgttaa 17460679  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    |||||||   |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17460678 ctttaactttaaatgtctatggtggaccaatcttaaaagtggtc 17460635  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 35061260 - 35061339
Alignment:
Q  150 ttaaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactca 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35061260 ttaagattaggcttaataggtcatttaatcccctaattaattttcagttttcattttggtcccataactaataaaactca 35061339  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28611239 - 28611161
Alignment:
Q  289 ccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28611239 ccccaaatgtctatggtggaccgactttaaaaatggtccactatagatcctattaattatttaatttaaaccgtttgat 28611161  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 37956913 - 37956978
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||    
T  37956913 ttaggcttaataggtcatttggtctcttaattaatttcaaatttttattttggtcccttaattaat 37956978  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 244
Target Start/End: Original strand, 9472619 - 9472707
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  9472619 ttaggcttaataggtcatttgatcccctaattaatttgcaatttttattttggtcctataacttataaaacccacgtttcggtccctca 9472707  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 367
Target Start/End: Original strand, 17459269 - 17459463
Alignment:
Q  177 gtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||  | ||||  ||||||||| |||  ||||||  | |||||||||   |||    
T  17459269 gtcccttaaataatttcaagttttcattttggtcacacaattaataaaacgtacgtttaagtccctcactttttcctccgtttgccaaataaattctgac 17459368  T
Q  277 ggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
      |||| ||||||||||||||   | |||||||||| || ||||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  17459369 ttttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggacgaatcttaaaagtgatctaacatagatcctattaattattataatttaaaccgtttgat 17459463  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30749412 - 30749328
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccct 242  Q
    |||||||||| |||||||| |  | ||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30749412 aggcttaataagtcatttgatttcctaattaatttccagttttcattttagtcccataattaataaaactcatgttttggtccct 30749328  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4921057 - 4920966
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  4921057 gttaactttaacccccaaatgtctatggtagaccaactttaaaaatggtccaccataaatcctattaattattctaatttaaaccgtttgat 4920966  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16295215 - 16295150
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatta 343  Q
    ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16295215 gttaactttaactttaaatgtttttggtggaccaaccttaacagtggtccaccatagatcctatta 16295150  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 333
Target Start/End: Original strand, 34467502 - 34467679
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    ||||||||||| |||||  | | || ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |  | ||||||| ||||| ||| |    
T  34467502 taggcttaatatgtcatccgctaccctaattaattaccagtttttattttggtaccataattaataaaactcattgtgcgatccctcaggtttgcctctg 34467601  T
Q  257 tcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
      || |||||||||| | | | ||| | ||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34467602 ctaggcaaataaatccctggctgttgagtttaacttcaaatgtctatgatggacaaaccttaagagtggtccaccata 34467679  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1085511 - 1085295
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||||| |||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| |  |||||||| |   ||||||||||||||  |||      
T  1085511 aaaattgggcttattagattgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtaccacatttaataaaattggcgttttggtccctca--ttttc 1085414  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa--atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-t 348  Q
    ||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||    ||  |||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1085413 ctccgtttgccaaataaatcacaaccgttaagtttaataaaaatgatgtttatggtggatcatctttaagagtggtacaccatagatcctattaattatt 1085314  T
Q  349 ttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  1085313 ttaatttcgaccgtttgat 1085295  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 373
Target Start/End: Original strand, 6028787 - 6028930
Alignment:
Q  232 ttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccacc 330  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||  | ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |    
T  6028787 ttttggtccctcaagtttttcttcgtttgccaaataaatttccgacggttaactttaactctaaatgtatatggtggaccagtcttaaaagtggtccatc 6028886  T
Q  331 atagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
     |||| | || ||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  6028887 gtagaccttaataattttgttaattttaaccattcgatctattt 6028930  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Original strand, 1082983 - 1083153
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||| |  |||||||| |  ||||||||||| |||  ||| |||||    
T  1082983 ttaggcttattatatcgtttggtcccttatttaatttcatattttcattttggtcccacatttaataaaaatggtgttttggtccgtcatctttttctcc 1083082  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    ||  | ||| |||||| | |  |||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1083083 gtttgccaattaaatcccaagtgttaactttaactctaaatatctatggtggatcaaccttaaaagtggtc 1083153  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 8320871 - 8320965
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtat----ggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8320871 gttaattttaaccccaaatgtctatctatggtggaccatccttaagagcggtccaccatagattatattaattattttaatttaaaccgtttgat 8320965  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9474173 - 9474137
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaattt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9474173 ttaggcttaataggtcatttggtcccctaattaattt 9474137  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 30748597 - 30748669
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||| ||||||| ||||| | | ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  30748597 gttaagtttaacctcaaatatttgtggtgaacaaaccttaagagtggcacaccatagatcatattaattattt 30748669  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 270
Target Start/End: Original strand, 28561382 - 28561477
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaat 270  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| || || |||||||||  || |||||||||||||| |||  || |||  |||||||||||    
T  28561382 tggtcccttaaataattttaagttttcattttggtctcacaattaataaaacgtatcttttggtccctcaccttttcctacgtttgtcaaataaat 28561477  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7437851 - 7437794
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  || |||||||||||||    
T  7437851 taatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtatattttggtccctca 7437794  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15850654 - 15850569
Alignment:
Q  284 tttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatct 369  Q
    |||||||| |||||| || |||| |||||| |||   ||||||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||    
T  15850654 tttaaccctaaatgtctaaggtgaaccaacattataggtggtccaccatagatcttaatagatttttaattttaaccctttgatct 15850569  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30749322 - 30749226
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgatctatttt 374  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||    
T  30749322 gttaagtttaacctcaaatgtctatggta-accaaccttaagagtggttcactacagggcctattaattattttaatttaaaccgtatgatctttttt 30749226  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 245
Target Start/End: Original strand, 34468957 - 34469042
Alignment:
Q  160 gcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcac 245  Q
    ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| || || |||||||| | | ||||| |||||||||    
T  34468957 gcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcgcacaattaataaaaatgacgttttagtccctcac 34469042  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 102475 - 102415
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataact 218  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  102475 aggcttaattgatcatttggtcccctaactaatttcttgttttcattttggtcccataact 102415  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Original strand, 6030601 - 6030669
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| || ||||||||    
T  6030601 taggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttagtcccacaattaataaaa 6030669  T

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Target: scaffold0013 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 165 - 375
Target Start/End: Original strand, 32576 - 32788
Alignment:
Q  165 ataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaa 264  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| || | |||    
T  32576 ataggttatttggtcccgtaattaatttcaagtttttattttggtcacataactaataaaactcgtgttttggtgcc-catgtttgtctccatcggccaa 32674  T
Q  265 ataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatta---attatttaatttcaaccc 361  Q
    |||||||   || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    || |||||||| ||||     
T  32675 ataaatcctaactgttaactttaaccttaaatgtctatggtggaccaaccttaggagtggtccatcatagatcctattattttttttttaatttaaaccg 32774  T
Q  362 tttgatctattttt 375  Q
    |||||||| |||||    
T  32775 tttgatcttttttt 32788  T

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Target: scaffold0118 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43678 - 43481
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||| |||  ||||||  | ||||||| ||      
T  43678 ttggtccctcaaataattttaagtttttattttggtcccataattaataaaacgtatgtttaagtccctcactttttcctccgtttgccaaataagtcct 43579  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  43578 gacggttaagtttaaccccaagtgatgtctatggtggaccaatcttaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 43481  T

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Target: scaffold1251 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1251
Description:

Target: scaffold1251; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1206 - 1048
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||    
T  1206 ttaggcttaataggtcatttggtccctcaaataatttccagttttcattttggtcccataagtaataaaactcatgttttggtccctcaaattcacctcc 1107  T
Q  256 gtcagtcaaataaa-tctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
    |||||||||||||| ||  |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1106 gtcagtcaaataaattcatgggtgttaactttaaccccaaatgtctatggtggaccaac 1048  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 375
Target Start/End: Original strand, 123995 - 124183
Alignment:
Q  187 taatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaacttt 286  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||| ||  | ||||||||||   |||||||| |||    
T  123995 taatttcaagttttcattttggtcccacaattaataaaacgtacattttggtccctcactttttcctctgtttgccaaataaatccttacggttaagttt 124094  T
Q  287 aaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| || | ||||||||||||||    
T  124095 aaccccaaatatctatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcgtattaaattgttaatttaaatcgtttgatctattttt 124183  T

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Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 125335 - 125137
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||  |  |||||||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||       
T  125335 tggtccctcaaataatttcaaattttcattttggtcccacaattaataaaacgtaccttttggtccctcactttttcctccgtttgccaaataaatccta 125236  T
Q  275 acggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa--ttatttaatttcaaccctttgatc 368  Q
    |||||||| |||||||||||   |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  125235 acggttaagtttaaccccaaatgatgtatatgatggaccaaccttaaaagtggtccaccatagaccttattaaatttttttaatttaaaccctttgatc 125137  T

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Target: chr6 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18346869 - 18346657
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||| || |||||||| |   |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18346869 aggcttattagatcatttggtcccttatttaatttcatattttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttgatccctcacgtttgtctctgt 18346770  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaa---atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaat 353  Q
      | |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||   |||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  18346769 ttgccaaataaatc-cgactgttaattttaacctcaaatgatgtttacggtgaaccaaccttaagagtggtccactataaatcctattaattattttaat 18346671  T
Q  354 ttcaaccctttgat 367  Q
    || |||| ||||||    
T  18346670 ttaaaccgtttgat 18346657  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 343
Target Start/End: Original strand, 12669759 - 12669906
Alignment:
Q  197 tttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga-cggttaactttaaccccaaa 295  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||| |||| |||| |||  ||||||  |  ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  12669759 tttttattttggtctcacaattaataaaactcaagttttagtccgtcactttttcctccgtttgctaaataaatctctaactgttaactttaacctcaaa 12669858  T
Q  296 tgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12669859 tgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcatatta 12669906  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 367
Target Start/End: Original strand, 23392209 - 23392423
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctcc 255  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||  ||||||||| |||  ||||    
T  23392209 ttaggcttattagatcatttggtcccttatttaatttcgtgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgtttaagtccctcaccttttcctcc 23392308  T
Q  256 gtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg-tg-tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaa 352  Q
    ||  | ||||||||||   |  ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23392309 gtttgccaaataaatcctaaatgttaagtttaaccccaaatgatgctaaggtggatcaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattttaa 23392408  T
Q  353 tttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||| ||||||    
T  23392409 tttcaaccgtttgat 23392423  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5187747 - 5187537
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||| |||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| |   ||||| || ||| || ||| |    
T  5187747 aaaactaggcttattagattgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttggtcccataattaataaaaatggcgttttagttccttaccttttt 5187648  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaa--tgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat- 348  Q
     |||||  | ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||   ||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  5187647 gtccgtttgccaaataaatcctgacggttaagtttaacccaaatgttgtctatagtggaccaaccttaaaagtggttcaccatagatcctattaattata 5187548  T
Q  349 ttaatttcaac 359  Q
    |||||||||||    
T  5187547 ttaatttcaac 5187537  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23397473 - 23397235
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  23397473 aggcttattagatcatttggtcccttatttaatttcgtgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttcctccgt 23397374  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttc 356  Q
      | |||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | | |||||||| | |||||||     
T  23397373 ttgccaaataaatcccgaccgttaaatttaacttcaaatgtctatggtggaccaaccttaaaagtagtccaccgtataccttattaattttgttaatttt 23397274  T
Q  357 aaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
    |||| |  ||||||||| ||  |||| |||| |||||||    
T  23397273 aaccatccgatctatttatcataaaatggaccgttagat 23397235  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7308567 - 7308491
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgtt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7308567 taggcttaataggtcatttggccccttaattaatttcaagttttcattttggtcctataagtaataaaactcatgtt 7308491  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 395
Target Start/End: Original strand, 29380189 - 29380426
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| || ||| |||| |   ||||| ||||||||| |||   |||||     
T  29380189 ggcttattagatcatttggtcccttatttaatttcttgttttcattttggtcccacaattaacaaaaatggcgttttagtccctcaccttttcttccgtt 29380288  T
Q  259 agtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttca 357  Q
     | |||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| | |||||||| | ||||||| |    
T  29380289 tgccaaataaatcccgaccgttaattttaacttcaaatgtatatggtggatcaaccttaaaagtagtccatcgtagaccttattaattttgttaatttta 29380388  T
Q  358 accctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
    ||| || ||||||||| ||  |||| |||| |||||||    
T  29380389 accattcgatctatttatcataaaagggaccgttagat 29380426  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32507130 - 32506969
Alignment:
Q  173 tttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc- 271  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||| ||||| |  |||||||| |  |||||| ||||||||| ||| |||| ||  | ||||||||||     
T  32507130 tttggtcacttatttaatttcatgttttcattttgatcccacatttaataaaaatggtgttttagtccctcacatttttctcagtttgccaaataaatcc 32507031  T
Q  272 tcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32507030 ttgactgttaagtttaaccccaaatatctatggtggaccaaccttaagagtggtctaccata 32506969  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Original strand, 34093387 - 34093485
Alignment:
Q  165 ataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  34093387 ataggtcatttggtcccctaattaatttcaagtttttatttttgtc--------aataaaactcatgttttggtccctcaggtttgtttccgtcggtcaa 34093478  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 328
Target Start/End: Original strand, 7310291 - 7310443
Alignment:
Q  176 ggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcga 275  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| ||| |||| |||||||    |||||||||||||     
T  7310291 ggtcctttaaataattttaagttttcattttggtcccataattaataaaacgtatgtttaagtccttcaggtttttctccgtttaccaaataaatctcgg 7310390  T
Q  276 cggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtcca 328  Q
    | ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  7310391 ctgttaagtttaactccaaatgtctatggtgaaccaaccttaaaaatggtcca 7310443  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29381850 - 29381637
Alignment:
Q  157 taggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccg 256  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||   |||| || ||| ||||| || |||||||| | | ||||| |||| |||  |||  |||||    
T  29381850 taggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcttattttcattttgatcccacaattaataaaaatgacgttttagtccttcatcttttcctccg 29381751  T
Q  257 tcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaa 352  Q
    |    |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||   | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29381750 tttaccaaataaatc-caacagttaagtttaaccccaaatgatgtctgtggtggacaaaccttaagagtgatccaccatagatcctattaattattttaa 29381652  T
Q  353 tttcaaccctttgat 367  Q
    |||||||| ||||||    
T  29381651 tttcaaccgtttgat 29381637  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 17837732 - 17837825
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||| ||||||||||||||   | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17837732 gttaagtttaaccccaaatgatgtctatggtggacaaacattaagagtggtccaccatagatcctattaattattttaatttcaaccgtttgat 17837825  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17839264 - 17839020
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| |||      
T  17839264 aaaaataggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcttgttttcattttggtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttc 17839165  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-tt 350  Q
    ||||||  | |||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||  |||||||| ||| |||||   |||| | |||||||| | ||    
T  17839164 ctccgtttgccaaataaatcccgaccgttaattttaacttcaaatgtagatggtggattaaccttaaaagtagtccattgtagaccttattaattttgtt 17839065  T
Q  351 aatttcaaccctttgatctatttttccaaaaaaggacggttagat 395  Q
    ||||| |||| || ||||||||| ||  |||| |||| |||||||    
T  17839064 aattttaaccattcgatctatttatcataaaagggaccgttagat 17839020  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Original strand, 11722903 - 11722994
Alignment:
Q  278 gttaactttaacccc-aaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  11722903 gttaactttaacccccaaatgtctatggtggaccgactttaaaaatggtccaccatagatcctattaattattctaatttaaaccgtttgat 11722994  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7311705 - 7311632
Alignment:
Q  295 atgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  7311705 atgtctatggtgaaccaaccttaagagtggtccaccataaatcctattaattattttaatttaaaccgtttgat 7311632  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 11967334 - 11967406
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11967334 gttaactttaacctcaaatgtctattgtggaccaaccttgagaggggtccatcatagatcatattaattattt 11967406  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Original strand, 16208533 - 16208603
Alignment:
Q  170 tcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtcc 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16208533 tcatttggtcccttaaataattttcaatttttattttggtcccatatctaataaaagtcatgttttggtcc 16208603  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 272
Target Start/End: Original strand, 12780518 - 12780638
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||  | | ||||||    
T  12780518 aaaattaagcataataagttatttgatcccttaattaatttttagtttttatgttgatcccataattaataaaattcatgttttagtcatttatgtttgt 12780617  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatct 272  Q
    | || | | ||||||||||||    
T  12780618 ccccattattcaaataaatct 12780638  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Original strand, 12784705 - 12784817
Alignment:
Q  160 gcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtca 259  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| | | ||||||| || | |    
T  12784705 gcttaataagttatttgatcccttaattaatttttagattttatgttggtctcataattaataaaattcatgttttagtcctttatgtttgtccccatta 12784804  T
Q  260 gtcaaataaatct 272  Q
     ||||||||||||    
T  12784805 ttcaaataaatct 12784817  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Original strand, 29722672 - 29722815
Alignment:
Q  170 tcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaa 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||| |||  |||| |    ||||||||    
T  29722672 tcatttggtcccttatttaatttcatgttttcattttgatcccataattaataaaaatggcgttttagtccctcacattttcctccattttgcaaataaa 29722771  T
Q  270 tctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaac 313  Q
    |||| || ||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  29722772 tctcaactgttaaatttaatccaaaatgtatattgtggaccaac 29722815  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 233683 - 233597
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctca 244  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||    
T  233683 aggcttaatagatcaattggtcctttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaaaacacgttttagtccctca 233597  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 232174 - 232284
Alignment:
Q  159 ggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtc 258  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||||||| |||  ||||||     
T  232174 ggcttaatagatccattggtcccttaaataatttcaatttttcattttggtcccataattaataaaa--cacgttttagtccctcactttttcctccgtt 232271  T
Q  259 agtcaaataaatc 271  Q
     | ||||||||||    
T  232272 tgccaaataaatc 232284  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6452614 - 6452453
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaat-ct 272  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||  | ||||  ||||||||  |||  ||||||  | ||||||||| ||    
T  6452614 ttggtcccctaaataatttcaagttttcattttggtcccataattaataaaacgtacgtttgagtccctcattttttcctccgtttgccaaataaatcct 6452515  T
Q  273 cgacggtt-aactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccata 333  Q
     ||| ||| || |||||||| |||| | ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  6452514 tgaccgttaaagtttaacccaaaatatctatagtgtatcaactttaagagtggtccaccata 6452453  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7312281 - 7312184
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||    ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7312281 gttaactttaaccccaaatgtattagatggaccaacattgtaggtggttcaccgtagatcttattaattttttaatttcaaccatttgatcttttttt 7312184  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 32505786 - 32505884
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctatt-aattatttaa-tttcaaccctttgatctattttt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  32505786 gttaagtttaaccccaaatgtctataatggac-aacattaagagtggtccaccatagaccttattaaattttttaagtttaaaccgtttgatctattttt 32505884  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 1367479 - 1367549
Alignment:
Q  229 atgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgt 298  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  1367479 atgttttggtcccttatgtttgtcttcgttagtcaagtaaatctctgatggttaagtttaaccccaaatgt 1367549  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29677095 - 29677038
Alignment:
Q  325 tccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttccaaaaa 382  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  29677095 tccaccatataccctattaattttttaattccagccctttgatctatttttcaaaaaa 29677038  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 7308352 - 7308404
Alignment:
Q  160 gcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtccc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7308352 gcttaataggttatttggtcatttaattaatttcaagttttcattttggtccc 7308404  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2688049 - 2687930
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgt 251  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| || |||||||| |   ||||| ||||||||| ||| |    
T  2688049 aaaaataggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatgttttcattttagtcccacaattaataaaaatggcgttttagtccctcaccttttt 2687950  T
Q  252 ctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
     |||||  | ||||||||||    
T  2687949 atccgtttgccaaataaatc 2687930  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 271
Target Start/End: Original strand, 6701373 - 6701490
Alignment:
Q  154 aattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtct 253  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||| || |||||||| |  | |||| ||||||||| |||  ||    
T  6701373 aatttggcttattagatcgtttggtcccttatttaatttcatattttcattttggtcccacaattaataaaaatggtattttagtccctcacattttcct 6701472  T
Q  254 ccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    ||||  | ||||||||||    
T  6701473 ccgtttgccaaataaatc 6701490  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 54288 - 54109
Alignment:
Q  174 ttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc 273  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    ||||||||||||||  |||  ||||||  | ||||||||||      
T  54288 ttggtccctcaaataatttcaagttttaattttggtcgcacaattaataaaacgtgcgttttggtccctcaaattttcctccgtttgccaaataaatcgt 54189  T
Q  274 gacggttaactttaaccccaaatg---tgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattattt 350  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54188 gactgttaagtataaccccaaatgatgtctatggtggaccaaccttaaaagtggtccaccatagatcctattaattattt 54109  T

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Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 318
Target Start/End: Original strand, 52614 - 52749
Alignment:
Q  183 taattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcgacggttaa 282  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||   | ||||||||||||||  ||| |||||||  | |||||||||| |||| |||||    
T  52614 taattaatttcaagttttcattttgatcccacaattaataaaatgtacgttttggtccctcagatttttctccgtttgccaaataaatcccgacagttaa 52713  T
Q  283 ctttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaa 318  Q
    |||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  52714 ctttaactttaaatgtatatggtggaccaaccttaa 52749  T

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Target: scaffold0128 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 375
Target Start/End: Original strand, 21985 - 22196
Alignment:
Q  158 aggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgt 257  Q
    |||||||||||||  |||| | || ||||||||||  ||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  21985 aggcttaataggtgttttgattccctaattaatttacagtttttatattgatcacatagttaataaaactcatgttttggtcccttaggtttgcctcctt 22084  T
Q  258 cagtcaaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaa-ttatttaatttc 356  Q
    ||||||||||||||       |||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||     
T  22085 cagtcaaataaatc-------ttaagtttaacccaaaatgcctatggtggaccaacattgtaggtggtccaccatagaccctattaatttctttaattta 22177  T
Q  357 aaccctttgatctattttt 375  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  22178 aaccatttgatttattttt 22196  T

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Target: scaffold0620 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0620
Description:

Target: scaffold0620; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Original strand, 8721 - 8819
Alignment:
Q  165 ataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaa 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  8721 ataggtcatttggtcccctaattaatttcaagtttttatttttgtc--------aataaaactcatgttttggtccctcaggtttgtttccgtcggtcaa 8812  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 109847 - 109648
Alignment:
Q  175 tggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctcg 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||  |  |||| ||||||||| ||| ||||  |  | ||||| |||| |     
T  109847 tggtcccttaaataatttcaagttttcattttggtcctacaattaataaaacgtacattttagtccctcacttttttctcaatttgccaaatgaatccca 109748  T
Q  275 acggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattat-ttaatttcaaccctttgatctattt 373  Q
    ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| | |||| | |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  109747 actattaactttaacttcaaatgtatatggtggaccaaccttaaaaatagtccatcgtagaccttattaattttgttaattttaaccatttgatctattt 109648  T

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Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 367
Target Start/End: Original strand, 108654 - 108722
Alignment:
Q  300 tatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaattatt-taatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  108654 tatggtggaccaaccttaaaagtggtccaccatagatgctattaattattataatttaaaccttttgat 108722  T

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Target: scaffold0219 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8188 - 8099
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccatagatcctattaatta-tttaatttcaaccctttgat 367  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8188 gttaattttaaccccaaatgtctatggtggatcaaccttaagag-ggtccatcatagattatattaattattttaatttaaaccgtttgat 8099  T

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Target: scaffold0201 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Original strand, 21245 - 21302
Alignment:
Q  278 gttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccaccataga 335  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21245 gttaagtttaaccacaaatgtctatggtggaccaaccttcagagtggtccaccataga 21302  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 334225 - 334150
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttgg-tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcat 230  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  334225 ttagacttaataggtcattttgatccccaaattaatttcaagttttcattttagttccataactaataaaactcat 334150  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44932 - 44857
Alignment:
Q  156 ttaggcttaataggtcatttgg-tcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcat 230  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  44932 ttagacttaataggtcattttgatccccaaattaatttcaagttttcattttagttccataactaataaaactcat 44857  T

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Target: scaffold0148 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 396
Target Start/End: Original strand, 14820 - 14937
Alignment:
Q  279 ttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaacctta-agagtggtccaccatagatcctattaattatttaatttcaaccctttgatctatttttcc 377  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||  ||| ||| || |||||||||||   |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||     
T  14820 ttaactttaacctctaatgtctatgatggaccaatattataga-tgatccaccatagacattattaattttttaatttaagccatttgatctatttttca 14918  T
Q  378 aaaaaaggacggttagatt 396  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  14919 aaaaagcgacggttagatt 14937  T

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Target: scaffold1152 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2491 - 2426
Alignment:
Q  262 caaataaatctcgacggttaactttaaccccaaatgtgta-tggtggaccaaccttaagagtggtc 326  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2491 caaataaattccgactgttaactttaactccaaatatgtaatggtggaccaaccttaaaagtggtc 2426  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 271
Target Start/End: Original strand, 18833 - 18922
Alignment:
Q  182 ttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaactcatgttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatc 271  Q
    |||| |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||  | ||||||||||    
T  18833 ttaaataattttaagttttcattttggtcccatatttaataaaacttatgttttagtccctcactttttactccgtttgccaaataaatc 18922  T

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Target: scaffold0019 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 63177 - 63074
Alignment:
Q  231 gttttggtccctcacgtttgtctccgtcagtcaaataaatctc-gacggttaactttaaccccaaatgtgtatggtggaccaaccttaagagtggtccac 329  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  63177 gttttagtccctcacatttttctccgtttgccaaataaatccctgactgttaagtttaacttcaaatgtctatgatggatcaatcttaagaatggtccac 63078  T
Q  330 cata 333  Q
    ||||    
T  63077 cata 63074  T

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Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 61842 - 61915
Alignment:
Q  152 aaaattaggcttaataggtcatttggtcccttaattaatttcaagtttttatcttggtcccataactaataaaa 225  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  61842 aaaattaggcttattagaacgtttggtcccctaaataatttcatgttttcattttggtctcataattaataaaa 61915  T

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