View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10182_low_9 (Length: 362)

Name: NF10182_low_9
Description: NF10182
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10182_low_9
NF10182_low_9
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (52-343)||(24216329-24216620)
chr4 (86-280)||(16841525-16841719)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (88-338)||(37698106-37698356)
chr5 (54-305)||(37380959-37381210)
chr5 (86-342)||(37641189-37641448)
chr5 (54-342)||(37703947-37704235)
chr5 (86-305)||(37712935-37713154)
chr5 (86-305)||(37595641-37595860)
chr5 (86-305)||(37825206-37825425)
chr5 (88-304)||(37534419-37534635)
chr5 (54-305)||(37436980-37437231)
chr5 (52-306)||(37391584-37391838)
chr5 (86-305)||(37399451-37399670)
chr5 (54-340)||(37430036-37430322)
chr5 (54-320)||(37411924-37412189)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (56-306)||(14554313-14554563)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 52 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24216620 - 24216329
Alignment:
Q  52 tatgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaaga 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24216620 tatgtgagattcactagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaaga 24216521  T
Q  152 tagtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24216520 tagtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaactaaggtccagaccaatcacgtaatttgacctagtgtcacacatgaccccatcccactc 24216421  T
Q  252 gcaacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaacacatagaccaaatatcgggttcagatgaagtgttgacaa 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24216420 gcaacaatctgcaccatttttccaggattccgtcctgaaataaaaagtggaacacatagaccaaatatcgggttcagatgaagtgttgacaa 24216329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16841719 - 16841525
Alignment:
Q  86 gcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagatt 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||    
T  16841719 gcattgaagacccagaaaaattattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtcttaactggaggatagtgctattgggatgtaattcacctttcaaatt 16841620  T
Q  186 gttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggatt 280  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16841619 gttgcaactgaggtccaaaccaaccacgtaatctgattcagtgtcacacgtgacaccatcccacttgcaacaatccgtaccgtttttccaagatt 16841525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 88 - 338
Target Start/End: Original strand, 37698106 - 37698356
Alignment:
Q  88 attgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  37698106 attgaagaccaagaaaaattattaaaagccaaattaagttgttgaaggcgtctaagctggaagatagtgctattgggatgtaattcacctttcaaattgt 37698205  T
Q  188 tgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatcct 287  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||  ||||    
T  37698206 tgcaactgaggtccaaaccaatcacgtaatccgactcagtgtcacacgtgacaccatcccacttgcaacaatctgtattgtttttccaagattctgtcct 37698305  T
Q  288 gaaataaaaagaggaacacatagaccaaatatcgggttcagatgaagtgtt 338  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  37698306 ggaagaaaaagaggaacatctagaccaaatatcaggttgagacgaagtgtt 37698356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37381210 - 37380959
Alignment:
Q  54 tgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagata 153  Q
    |||||||||||| | |||| |||| | |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  37381210 tgtgagattcactaaatcatcaatactaacatgcaataaagacccagaaaaattattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtctaagctggaagatt 37381111  T
Q  154 gtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgc 253  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| | |    
T  37381110 gtgctattgggatgtaattcaccattcagattgctgcaactgaggtccagaccaatcacatgatctgacatggagtcgcacgtgacaccatcccacccac 37381011  T
Q  254 aacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaaca 305  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  37381010 aacaatctgtattatttttccaagattctatcttgaaagaaaaagtggaaca 37380959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 342
Target Start/End: Original strand, 37641189 - 37641448
Alignment:
Q  86 gcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagatt 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37641189 gcattgaagacaaagaaaaattattaaaagccaagttgagttggtgaaggtgtttaagctgaaagatggtgctattgggatgtaattcaccttttagatt 37641288  T
Q  186 gttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||  ||    
T  37641289 gttgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcacaacaatctgtattgtttttccaagattctgtc 37641388  T
Q  286 ctgaaataaaaagaggaacacatagaccaaatatcg---ggttcagatgaagtgttgaca 342  Q
     ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  37641389 ttgaaagaaaaagagggacaactagacaaaatatcgtccggtttagatgaagtgttgaca 37641448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 342
Target Start/End: Original strand, 37703947 - 37704235
Alignment:
Q  54 tgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagata 153  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37703947 tgtgagattcactaaatcgccaataccaataggcattgaagatccagaaaaatgattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgtagatt 37704046  T
Q  154 gtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgc 253  Q
    |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37704047 gtgctattaggttgtaattcacctttcagattgttgcaactgagatccaaaccaatcacgtgatcagacacggtgtcgcacgtgacaccatcccactcgc 37704146  T
Q  254 aacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaacacatagaccaaatatcgggttcagatgaagtgttgaca 342  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||  || | ||| |||||||  |||||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||    
T  37704147 aacaatctgtgccggttttccaagattctgtcttaaaagaaaaagacaaacacatagacagaaaaccgggtttagatgaagtgttgaca 37704235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 86 - 305
Target Start/End: Original strand, 37712935 - 37713154
Alignment:
Q  86 gcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37712935 gcattgaagaccaagaaaaatgattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtttaagctgaaagatggtgctattgggatgtaattcaccttttagatt 37713034  T
Q  186 gttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||  ||    
T  37713035 gttgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcacaacaatctgtactgttttgccaagattctgtc 37713134  T
Q  286 ctgaaataaaaagaggaaca 305  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  37713135 ttgaaagaaaaagaggaaca 37713154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 305
Target Start/End: Original strand, 37595641 - 37595860
Alignment:
Q  86 gcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagatt 185  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37595641 gcattgaagactcagaaaaattattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtttaagctgaaagatggtgctattgggatgtaattcacctttaagatt 37595740  T
Q  186 gttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||  ||    
T  37595741 gttgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcacaacaatctgtactgttttcccaagattctgtc 37595840  T
Q  286 ctgaaataaaaagaggaaca 305  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  37595841 ttgaaagaaaaagaggaaca 37595860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 86 - 305
Target Start/End: Original strand, 37825206 - 37825425
Alignment:
Q  86 gcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagatt 185  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  37825206 gcattgaagacaaagaaaaatcattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtttaagctgaaagatggtgctattgggatgtaattcaccttttagatt 37825305  T
Q  186 gttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||  ||    
T  37825306 gttgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcacaacaatctgtactgttttcccaagattctgtc 37825405  T
Q  286 ctgaaataaaaagaggaaca 305  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  37825406 ttgaaagaaaaagaggaaca 37825425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 304
Target Start/End: Original strand, 37534419 - 37534635
Alignment:
Q  88 attgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgt 187  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  37534419 attgaagaccaagaaaaatgattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtttaagctgaaagatggtgctattgggatgtaattcaccttttagattgt 37534518  T
Q  188 tgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatcct 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||  || |    
T  37534519 tgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcacaacaatctgtactgttttcccaagattctgtctt 37534618  T
Q  288 gaaataaaaagaggaac 304  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  37534619 gaaagaaaaagaagaac 37534635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 305
Target Start/End: Original strand, 37436980 - 37437231
Alignment:
Q  54 tgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagata 153  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||| |||| | | |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||     
T  37436980 tgtgagtttcactaaatcactaataccaataggtattgaagactcagaaaaatgattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtttaagctgaaagatg 37437079  T
Q  154 gtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgc 253  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  37437080 gtgctattgggatgtaattcacctttcagattgttgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcac 37437179  T
Q  254 aacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaaca 305  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  37437180 aacaatctgtactgttttcccaagattctgtcttgaaagaaaaagagaaaca 37437231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37391838 - 37391584
Alignment:
Q  52 tatgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaaga 151  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  37391838 tatgtgagattcactaaatcaccaataccaacatgcaatgaagacccaaaaaaaaaatttaaagacaagttgagttgttgaaggtgtctaagctgaaaga 37391739  T
Q  152 tagtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactc 251  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  37391738 tagtgctattgggatgtaaatcaccattcaaattgttgcaactgaggtctagttcaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactt 37391639  T
Q  252 gcaacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaacac 306  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  37391638 gcaacaatttgtactgtttttccaagattctgtcttgaaagaaaaagaggaacac 37391584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37399670 - 37399451
Alignment:
Q  86 gcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagtgcaatttggatgtaactcacctttcagatt 185  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||| |||||||| |||||||| || ||    
T  37399670 gcattgaagacccagaaaaattattaaaagccaaattaagttgttgaaggtgtctaagctgaaagatgatgctattgggatgtaattcaccttttagttt 37399571  T
Q  186 gttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaacaatctgtaccatttttccaggattccatc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||  ||    
T  37399570 gttgcaactgaggtccagaccaatcacgtgatctgacatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcacaacaatctgtactgttttcccaagattctgtc 37399471  T
Q  286 ctgaaataaaaagaggaaca 305  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  37399470 ttgaaagaaaaagaggaaca 37399451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 340
Target Start/End: Original strand, 37430036 - 37430322
Alignment:
Q  54 tgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagata 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||     
T  37430036 tgtgagcttcactagatcaccaataccagcatgcaccgaagacccgaaaaaatcattaaaagccaagttgagttgttgaaggtgtttaagttgaaagatg 37430135  T
Q  154 gtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgc 253  Q
    |||| ||| |    ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37430136 gtgctattggccgctaattcaccgttcagattgttgcaactaaggtccagaccaatcacataatcgtacatgatgtcgcacgtgacaccatcccactcgc 37430235  T
Q  254 aacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaacacatagaccaaatatcgggttcagatgaagtgttga 340  Q
    | |||||||| ||  ||||||| |||||  || ||||| |||||||||||||   |||||||| | | |||| ||||||||||||||    
T  37430236 agcaatctgtgccggttttccaagattctgtcttgaaagaaaaagaggaacagtgagaccaaaaaccaggttgagatgaagtgttga 37430322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 37412189 - 37411924
Alignment:
Q  54 tgtgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagata 153  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  || ||||||  |||||||   |||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  37412189 tgtgagattcaccaaatcactaatatcatcatgcaccgaagacctgaaaaaatcattaaaagcca-gttgagtcgttgaaggtgtttaagtttgaagata 37412091  T
Q  154 gtgcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgc 253  Q
    |||| |||  ||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||  | |  ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  37412090 gtgctattgagatgtaattcacctttaagattgttgcacctaaggtccaaaccaatcacatgatccaaaacggtgtcgcacatgacaccataccactcgc 37411991  T
Q  254 aacaatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaacacatagaccaaatatc 320  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||  |  | ||| |||||||||||||  ||| |||||||||    
T  37411990 aacaatctgtattatttttccaagaatctgttttcaaagaaaaagaggaacaactaggccaaatatc 37411924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 306
Target Start/End: Original strand, 14554313 - 14554563
Alignment:
Q  56 tgagattcaccagatcaccaatcccaacatgcattgaagaccaagaaaaattattaaaggccaagttgagttgttgaaggtgtctaagcttgaagatagt 155  Q
    |||| ||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||||| | ||| || |||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14554313 tgagtttcactaaatcgccaataccaagaggcattgaagacccaaaaatatcattaaaagctaggttgagttgttgaaggtgtctaagctggaagatagt 14554412  T
Q  156 gcaatttggatgtaactcacctttcagattgttgcaattgaggtccagaccaatcacataatctgacatagtgtcacacgtgacaccatcccactcgcaa 255  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||||| ||  ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14554413 gctattaggatgtaattcaccattcaaattgttgcaactaaggtctagttcaatcacgtgacctgatatggtgtcgcacgtgacaccatcccactcgcaa 14554512  T
Q  256 caatctgtaccatttttccaggattccatcctgaaataaaaagaggaacac 306  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||  || ||||| |||||||| |||||    
T  14554513 caatctgtactctttttccaagattctgtcttgaaagaaaaagagaaacac 14554563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University