View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10187_low_20 (Length: 353)

Name: NF10187_low_20
Description: NF10187
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10187_low_20
NF10187_low_20
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-341)||(15229282-15229622)
chr4 (1-341)||(1901670-1902010)
chr4 (1-341)||(15283446-15283786)
chr4 (3-341)||(15389896-15390234)
chr4 (12-341)||(6571277-6571606)
chr4 (12-340)||(34187479-34187807)
chr4 (18-341)||(31125036-31125359)
chr4 (12-341)||(5007297-5007626)
chr4 (3-340)||(14666433-14666770)
chr4 (3-340)||(24590874-24591211)
chr4 (12-340)||(36343034-36343362)
chr4 (12-341)||(39852062-39852391)
chr4 (18-341)||(30755184-30755507)
chr4 (18-341)||(33672316-33672639)
chr4 (12-302)||(18799170-18799460)
chr4 (12-341)||(54834811-54835140)
chr4 (18-341)||(14099971-14100294)
chr4 (12-340)||(14761823-14762151)
chr4 (18-341)||(21971131-21971454)
chr4 (18-341)||(27161834-27162157)
chr4 (18-302)||(40104195-40104479)
chr4 (3-340)||(24114077-24114414)
chr4 (96-340)||(17014551-17014795)
chr4 (273-341)||(24460281-24460349)
chr4 (24-87)||(14731187-14731250)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-341)||(19454929-19455268)
chr2 (1-341)||(21701671-21702011)
chr2 (18-341)||(27805118-27805441)
chr2 (12-341)||(27778627-27778956)
chr2 (18-341)||(9348489-9348812)
chr2 (18-341)||(12588221-12588544)
chr2 (12-340)||(37376566-37376894)
chr2 (18-341)||(13935051-13935374)
chr2 (12-302)||(27818385-27818675)
chr2 (12-341)||(34287759-34288088)
chr2 (12-341)||(34292819-34293148)
chr2 (18-341)||(16827845-16828168)
chr2 (18-341)||(16893313-16893636)
chr2 (18-341)||(32051209-32051532)
chr2 (12-341)||(39050329-39050658)
chr2 (12-341)||(40234916-40235245)
chr2 (18-341)||(19415006-19415329)
chr2 (12-341)||(259260-259589)
chr2 (3-340)||(28883610-28883947)
chr2 (18-341)||(12715109-12715432)
chr2 (12-341)||(11633692-11634021)
chr2 (3-340)||(23127074-23127411)
chr2 (18-341)||(21675689-21676012)
chr2 (18-341)||(31877692-31878015)
chr2 (3-340)||(27432952-27433289)
chr2 (3-340)||(12656938-12657275)
chr2 (96-340)||(20839390-20839634)
chr2 (19-341)||(34863092-34863414)
chr2 (273-341)||(34302968-34303036)
chr2 (18-341)||(39891485-39891808)
chr2 (12-341)||(37949829-37950158)
chr2 (19-341)||(37684416-37684738)
chr2 (19-341)||(37699681-37700003)
chr2 (273-341)||(3785162-3785230)
chr2 (273-341)||(27119196-27119264)
chr2 (273-341)||(31890993-31891061)
chr2 (273-341)||(34157518-34157586)
chr2 (229-341)||(37926992-37927104)
chr2 (12-106)||(11640117-11640211)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-341)||(16625160-16625500)
chr3 (1-341)||(18531747-18532087)
chr3 (12-341)||(20575406-20575735)
chr3 (18-341)||(29663529-29663852)
chr3 (3-340)||(18052623-18052960)
chr3 (18-341)||(18226567-18226890)
chr3 (3-340)||(8297333-8297670)
chr3 (3-340)||(15891266-15891603)
chr3 (12-341)||(28114513-28114842)
chr3 (12-340)||(7074582-7074910)
chr3 (12-340)||(20067413-20067741)
chr3 (12-341)||(10397503-10397832)
chr3 (3-340)||(22386138-22386475)
chr3 (18-341)||(5607881-5608204)
chr3 (3-310)||(6193676-6193983)
chr3 (12-341)||(11108908-11109237)
chr3 (18-341)||(4345246-4345569)
chr3 (18-341)||(5015088-5015411)
chr3 (19-341)||(5468362-5468684)
chr3 (12-341)||(5594916-5595245)
chr3 (3-340)||(4722992-4723329)
chr3 (3-340)||(15739654-15739991)
chr3 (3-340)||(35882127-35882464)
chr3 (18-302)||(18244115-18244399)
chr3 (12-340)||(18290913-18291241)
chr3 (12-340)||(18306214-18306542)
chr3 (18-341)||(22869415-22869738)
chr3 (18-341)||(22884474-22884797)
chr3 (18-341)||(31963032-31963355)
chr3 (12-341)||(4418289-4418618)
chr3 (3-340)||(8288031-8288368)
chr3 (3-340)||(29147315-29147652)
chr3 (12-340)||(18275612-18275940)
chr3 (12-340)||(32440524-32440852)
chr3 (3-250)||(4795303-4795550)
chr3 (12-250)||(48467297-48467535)
chr3 (11-340)||(18331997-18332326)
chr3 (18-341)||(10644446-10644769)
chr3 (18-341)||(17983515-17983838)
chr3 (18-341)||(24329535-24329858)
chr3 (18-341)||(51783399-51783722)
chr3 (12-341)||(8213108-8213437)
chr3 (12-341)||(21676063-21676392)
chr3 (18-341)||(6541021-6541344)
chr3 (18-341)||(7997938-7998261)
chr3 (18-341)||(47024829-47025152)
chr3 (273-341)||(5652860-5652928)
chr3 (12-301)||(28022645-28022934)
chr3 (273-341)||(4626417-4626485)
chr3 (273-341)||(5713700-5713768)
chr3 (273-341)||(5724610-5724678)
chr3 (273-341)||(5767690-5767758)
chr3 (273-341)||(17993501-17993569)
chr3 (229-341)||(28340766-28340878)
chr3 (229-341)||(36995759-36995871)
chr3 (24-87)||(7090873-7090936)
chr3 (25-100)||(20441500-20441575)
chr3 (25-100)||(41438626-41438701)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-341)||(22889876-22890216)
chr5 (1-341)||(25200436-25200776)
chr5 (96-341)||(25264686-25264931)
chr5 (3-340)||(23893615-23893952)
chr5 (18-341)||(40471964-40472287)
chr5 (12-341)||(9318869-9319198)
chr5 (3-340)||(15657176-15657513)
chr5 (12-340)||(41676127-41676455)
chr5 (3-340)||(11550763-11551100)
chr5 (12-341)||(12133573-12133902)
chr5 (12-341)||(26481809-26482138)
chr5 (3-340)||(30936042-30936379)
chr5 (18-339)||(33517780-33518101)
chr5 (12-340)||(33293943-33294271)
chr5 (12-341)||(3790959-3791288)
chr5 (3-340)||(24686573-24686910)
chr5 (3-340)||(24971427-24971764)
chr5 (12-341)||(28650653-28650982)
chr5 (3-340)||(33778896-33779233)
chr5 (12-341)||(43079670-43079999)
chr5 (18-341)||(24682864-24683187)
chr5 (18-341)||(24725391-24725714)
chr5 (3-340)||(23750866-23751203)
chr5 (18-341)||(15757272-15757595)
chr5 (12-341)||(18499145-18499474)
chr5 (3-340)||(22997530-22997867)
chr5 (3-340)||(23716404-23716741)
chr5 (18-341)||(8663890-8664213)
chr5 (18-341)||(13323244-13323567)
chr5 (18-302)||(37669937-37670221)
chr5 (18-341)||(30169893-30170216)
chr5 (18-341)||(37357058-37357381)
chr5 (12-341)||(28958201-28958530)
chr5 (18-341)||(30030839-30031162)
chr5 (18-341)||(30153442-30153765)
chr5 (18-341)||(37756404-37756727)
chr5 (18-341)||(6875729-6876052)
chr5 (12-340)||(18125811-18126139)
chr5 (18-341)||(31824822-31825145)
chr5 (18-341)||(34617942-34618265)
chr5 (18-302)||(37769441-37769725)
chr5 (18-341)||(31432864-31433187)
chr5 (18-341)||(2512475-2512798)
chr5 (273-341)||(13440067-13440135)
chr5 (273-341)||(9548116-9548184)
chr5 (273-341)||(11326315-11326383)
chr5 (273-341)||(13184222-13184290)
chr5 (229-341)||(18373950-18374062)
chr5 (229-341)||(5639422-5639534)
chr5 (229-341)||(32594689-32594801)
chr5 (25-100)||(34467047-34467122)
chr5 (271-340)||(20390438-20390507)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (1-341)||(16042722-16043062)
chr7 (1-341)||(16448402-16448742)
chr7 (12-341)||(5145744-5146073)
chr7 (3-340)||(5129393-5129730)
chr7 (3-340)||(5160920-5161257)
chr7 (12-341)||(26318273-26318602)
chr7 (12-341)||(26536274-26536603)
chr7 (12-302)||(26436667-26436957)
chr7 (3-300)||(10915313-10915610)
chr7 (3-340)||(16501806-16502143)
chr7 (18-341)||(26514197-26514520)
chr7 (18-341)||(31126336-31126659)
chr7 (3-340)||(11423182-11423519)
chr7 (18-341)||(31562794-31563117)
chr7 (3-340)||(2155974-2156311)
chr7 (3-340)||(16516842-16517179)
chr7 (18-341)||(3446722-3447045)
chr7 (18-341)||(9620067-9620390)
chr7 (18-341)||(11442295-11442618)
chr7 (18-341)||(26273498-26273821)
chr7 (18-341)||(16734864-16735187)
chr7 (18-341)||(16749918-16750241)
chr7 (18-341)||(17524948-17525271)
chr7 (18-341)||(17527944-17528267)
chr7 (18-341)||(24590945-24591268)
chr7 (19-341)||(26668318-26668640)
chr7 (273-341)||(2108567-2108635)
chr7 (171-341)||(45388789-45388959)
chr7 (273-341)||(45733973-45734041)
chr7 (273-334)||(31088033-31088094)
chr7 (273-341)||(4201060-4201128)
chr7 (25-100)||(800159-800234)
chr7 (12-94)||(18542209-18542291)
chr7 (229-341)||(4143650-4143762)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (5-341)||(16206549-16206885)
chr1 (1-174)||(20462482-20462655)
chr1 (18-341)||(10964084-10964407)
chr1 (18-341)||(51639632-51639955)
chr1 (18-341)||(28586395-28586718)
chr1 (18-341)||(41791826-41792149)
chr1 (279-341)||(20462656-20462718)
chr1 (18-341)||(10946493-10946816)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-341)||(22079379-22079719)
chr8 (3-340)||(16284849-16285186)
chr8 (3-340)||(27607383-27607720)
chr8 (3-340)||(18792107-18792444)
chr8 (18-341)||(19675856-19676179)
chr8 (12-341)||(19206837-19207166)
chr8 (3-340)||(19689498-19689835)
chr8 (18-341)||(9356038-9356361)
chr8 (18-341)||(3327984-3328307)
chr8 (3-340)||(14559024-14559361)
chr8 (3-340)||(16278954-16279290)
chr8 (3-340)||(2135737-2136074)
chr8 (18-341)||(29830737-29831060)
chr8 (18-302)||(12091240-12091524)
chr8 (18-341)||(31355940-31356263)
chr8 (18-341)||(33260138-33260461)
chr8 (18-302)||(28360471-28360755)
chr8 (273-341)||(33245177-33245245)
chr8 (171-341)||(31488350-31488520)
chr8 (273-341)||(19658675-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (1-341)||(17090907-17091247)
chr6 (9-302)||(27628206-27628499)
chr6 (12-341)||(16675545-16675874)
chr6 (12-340)||(29550881-29551209)
chr6 (12-341)||(3697487-3697816)
chr6 (18-341)||(26776071-26776394)
chr6 (3-340)||(22933342-22933679)
chr6 (3-340)||(23855787-23856124)
chr6 (3-340)||(24303080-24303417)
chr6 (3-340)||(15422779-15423116)
chr6 (19-304)||(27271078-27271363)
chr6 (26-340)||(26919800-26920114)
chr6 (3-340)||(27020535-27020873)
chr6 (12-341)||(29502821-29503150)
chr6 (3-340)||(13297413-13297750)
chr6 (3-340)||(24865114-24865451)
chr6 (12-341)||(27045794-27046123)
chr6 (166-341)||(20162176-20162351)
chr6 (166-341)||(22170480-22170655)
chr6 (3-341)||(27288831-27289169)
chr6 (3-340)||(16751251-16751588)
chr6 (1-94)||(20162086-20162179)
chr6 (1-94)||(22170652-22170745)
chr6 (18-302)||(26114910-26115194)
chr6 (18-341)||(27009142-27009465)
chr6 (18-302)||(27486541-27486825)
chr6 (18-302)||(28208866-28209150)
chr6 (18-341)||(30556477-30556800)
chr6 (18-341)||(4759176-4759499)
chr6 (18-341)||(4544236-4544559)
chr6 (18-341)||(4526698-4527021)
chr6 (18-341)||(16942488-16942811)
chr6 (3-181)||(26990286-26990464)
chr6 (18-302)||(4722634-4722918)
chr6 (12-341)||(29574419-29574748)
chr6 (96-328)||(34913563-34913795)
chr6 (229-341)||(4774506-4774618)
chr6 (273-341)||(8891930-8891998)
chr6 (273-341)||(8903165-8903233)
chr6 (273-341)||(28163166-28163234)
chr6 (273-341)||(33373875-33373943)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (18-341)||(5755-6078)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (243-341)||(46134-46232)
scaffold0124 (3-340)||(31853-32190)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (12-341)||(958-1287)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (3-340)||(31157-31494)
scaffold0089 (3-340)||(45504-45841)
scaffold0089 (3-328)||(38600-38925)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (3-340)||(28693-29030)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (12-302)||(10975-11265)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (18-341)||(7430-7753)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (18-302)||(9364-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (18-341)||(13448-13771)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (18-341)||(24719-25042)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (273-341)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (273-341)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (229-341)||(7707-7819)
scaffold0159 (229-341)||(21260-21372)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (109-302)||(27711-27904)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 15229282 - 15229622
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15229282 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaatggaaaact 15229381  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15229382 tgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 15229481  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15229482 actattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggca 15229581  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229582 agttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 1901670 - 1902010
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1901670 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaaagaatggaaagct 1901769  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||    
T  1901770 tgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgcctttcaaggtttg 1901869  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1901870 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggca 1901969  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1901970 agttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15283786 - 15283446
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283786 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 15283687  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  15283686 tgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 15283587  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  15283586 actattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggctgtcggctagggca 15283487  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15283486 agttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15390234 - 15389896
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  15390234 tcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaaagaatggaaagctcg 15390135  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||  ||  ||||    
T  15390134 ttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgcttttcagggtttgac 15390035  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  15390034 tatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagctaccggctggggcaag 15389935  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  15389934 ttaatacaactccttaagaataagcacagagagggtctc 15389896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 6571277 - 6571606
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  6571277 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 6571376  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  6571377 atggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 6571476  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  6571477 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 6571576  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  6571577 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 6571606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34187807 - 34187479
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  34187807 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 34187708  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | |||||    
T  34187707 atggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactgcttttcaaggattgactgtcgaagg 34187608  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  34187607 tacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 34187508  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  34187507 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 34187479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31125359 - 31125036
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  31125359 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggtg 31125260  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  31125259 aagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 31125160  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  31125159 gcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 31125060  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31125059 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 31125036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 5007297 - 5007626
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  5007297 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 5007396  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||| ||    
T  5007397 atggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaggg 5007496  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  5007497 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 5007596  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5007597 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5007626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 14666433 - 14666770
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  14666433 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 14666532  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  14666533 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14666632  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 301  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| |||||||     
T  14666633 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcag 14666731  T
Q  302 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  14666732 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 14666770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24591211 - 24590874
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  24591211 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 24591112  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  24591111 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 24591012  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  24591011 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaag 24590912  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  24590911 ttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 24590874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36343362 - 36343034
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  36343362 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 36343263  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  36343262 atggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaagg 36343163  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  36343162 tacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 36343063  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| || || || ||||||||    
T  36343062 cttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 36343034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 39852062 - 39852391
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  39852062 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 39852161  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    | || |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  39852162 acggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 39852261  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  39852262 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 39852361  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39852362 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 39852391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 30755184 - 30755507
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||| |    
T  30755184 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaagctcgttaccattcatggtg 30755283  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  30755284 aagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 30755383  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  30755384 gcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggatggggcaaggtgatacagctctgt 30755483  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30755484 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 30755507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33672639 - 33672316
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  33672639 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 33672540  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  33672539 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 33672440  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  33672439 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 33672340  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  33672339 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 33672316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18799460 - 18799170
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  18799460 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 18799361  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  18799360 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 18799261  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18799260 tgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaag 18799170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 54834811 - 54835140
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  54834811 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 54834910  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||  ||||||||    
T  54834911 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgatcattgaagg 54835010  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  54835011 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 54835110  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  54835111 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 54835140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 14099971 - 14100294
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  14099971 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 14100070  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  14100071 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 14100170  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  14100171 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 14100269  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  14100270 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 14100294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14762151 - 14761823
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  14762151 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 14762052  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| |||||||    
T  14762051 atggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgttgaagg 14761952  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
     ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||     
T  14761951 aacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacag 14761852  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  14761851 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 14761823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 21971131 - 21971454
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  21971131 ctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 21971230  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | ||    
T  21971231 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttccagggtttgaccattgaaggtgcaga 21971330  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  21971331 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 21971429  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  21971430 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21971454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27162157 - 27161834
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  27162157 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 27162058  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  27162057 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 27161958  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  27161957 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 27161859  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27161858 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27161834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40104479 - 40104195
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  40104479 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 40104380  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  40104379 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 40104280  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    |   |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40104279 gtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaag 40104195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 24114077 - 24114414
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  24114077 tcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 24114176  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || || |||| |||  | ||    
T  24114177 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgcttttcaaggattaac 24114276  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  24114277 tgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 24114376  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24114377 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24114414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 340
Target Start/End: Original strand, 17014551 - 17014795
Alignment:
Q  96 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 195  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| ||    
T  17014551 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaag 17014650  T
Q  196 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 295  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  17014651 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 17014750  T
Q  296 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17014751 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 17014795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24460349 - 24460281
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460349 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 24460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14731250 - 14731187
Alignment:
Q  24 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 87  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14731250 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 14731187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19455268 - 19454929
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455268 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 19455169  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  19455168 tgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatcttt-tcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 19455070  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19455069 actattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggctgccggatggggca 19454970  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454969 agttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21702011 - 21701671
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  21702011 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaaagaatggaaagct 21701912  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  21701911 tgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 21701812  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21701811 actattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggccggggca 21701712  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21701711 agttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 27805118 - 27805441
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27805118 ctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttcatggag 27805217  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  27805218 aagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 27805317  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  27805318 gcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 27805417  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27805418 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 27805441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 27778627 - 27778956
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  27778627 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 27778726  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||| |||    
T  27778727 atggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattggagg 27778826  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  27778827 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 27778926  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27778927 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27778956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9348812 - 9348489
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| ||| || ||||||||||| || |||||||    
T  9348812 ctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaacggaaagcttgttaccgttcatggag 9348713  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  9348712 aagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 9348613  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  9348612 gcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 9348513  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9348512 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 12588221 - 12588544
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  12588221 ctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttcatggag 12588320  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  12588321 aagaagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 12588420  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  12588421 gcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 12588520  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12588521 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 12588544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 37376566 - 37376894
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||| | ||| |||||||||||  | |    
T  37376566 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaaaagtggaaagcttgttaccattc 37376665  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  37376666 atggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaagg 37376765  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  37376766 tacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttagtacag 37376865  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37376866 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 37376894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13935374 - 13935051
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  13935374 ctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttacaatccatggtg 13935275  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  13935274 aagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 13935175  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  13935174 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 13935075  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13935074 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 302
Target Start/End: Original strand, 27818385 - 27818675
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  27818385 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 27818484  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||| |||    
T  27818485 atggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattggagg 27818584  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27818585 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaag 27818675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 34287759 - 34288088
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  34287759 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 34287858  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||| | || | |||  |||| ||||||||    
T  34287859 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactactttccaaggtttgaccattgaagg 34287958  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  34287959 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 34288058  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34288059 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 34288088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 34292819 - 34293148
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  34292819 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 34292918  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||| | || | |||  |||| ||||||||    
T  34292919 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactactttccaaggtttgaccattgaagg 34293018  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  34293019 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 34293118  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34293119 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 34293148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16828168 - 16827845
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  16828168 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggtg 16828069  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  16828068 aagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 16827969  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  16827968 gcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 16827869  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16827868 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 16827845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 16893313 - 16893636
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  16893313 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggtg 16893412  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  16893413 aagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 16893512  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  16893513 gcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 16893612  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16893613 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 16893636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 32051209 - 32051532
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  32051209 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggtg 32051308  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  32051309 aagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 32051408  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  32051409 gcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 32051508  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  32051509 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 32051532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39050658 - 39050329
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||||||| |||    
T  39050658 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatgaaaagcttgttacaatcc 39050559  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || || || || | |||  |||||||||||||    
T  39050558 atggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttccaaggtttgactattgaagg 39050459  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | || |  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  39050458 tgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 39050359  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39050358 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 39050329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 40234916 - 40235245
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  40234916 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 40235015  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||| || | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  40235016 atggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 40235115  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  40235116 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 40235215  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  40235216 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 40235245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19415329 - 19415006
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  19415329 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 19415230  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  19415229 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 19415130  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  19415129 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtaatacagctctg 19415031  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19415030 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 19415006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 259589 - 259260
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  259589 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 259490  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  259489 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagggttgaccattgaagg 259390  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  259389 tgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacag 259290  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  259289 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 259260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 28883610 - 28883947
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28883610 tcttacagctgtctcttgggtagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28883709  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||||||| |||  | ||    
T  28883710 ttaccattcatggagaggaagcatacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaac 28883809  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28883810 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28883909  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28883910 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 28883947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12715432 - 12715109
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  12715432 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 12715333  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  12715332 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 12715233  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  12715232 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 12715133  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12715132 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 12715109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11634021 - 11633692
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  11634021 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 11633922  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  11633921 atggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 11633822  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | ||||||  || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  11633821 tgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 11633722  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11633721 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11633692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23127411 - 23127074
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  23127411 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 23127312  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  23127311 ttaccatacatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcataggggcaggatctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 23127212  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  23127211 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 23127112  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||    
T  23127111 ttaatacagctttgtgagaacaagcataaggaaggtct 23127074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21676012 - 21675689
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  21676012 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 21675913  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  21675912 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 21675813  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  21675812 gtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagaccgccggctggggcaaggtgatacagctctg 21675714  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  21675713 cgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21675689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 31877692 - 31878015
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31877692 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31877791  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31877792 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31877891  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  31877892 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgtcggctggggcaaggtgatacagctctgt 31877991  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31877992 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 31878015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27433289 - 27432952
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||| |||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  27433289 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcggtgacctttactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 27433190  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  27433189 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 27433090  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  27433089 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 27432990  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27432989 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 12656938 - 12657275
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  12656938 tcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 12657037  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||| | ||||| || ||||||| |||  | ||    
T  12657038 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgcctttcaaggattaac 12657137  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  12657138 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 12657237  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12657238 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 340
Target Start/End: Original strand, 20839390 - 20839634
Alignment:
Q  96 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 195  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  20839390 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 20839489  T
Q  196 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 295  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  20839490 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 20839589  T
Q  296 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20839590 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 20839634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 34863092 - 34863414
Alignment:
Q  19 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 118  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  34863092 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 34863191  T
Q  119 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 218  Q
    |||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||    
T  34863192 agaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagag 34863291  T
Q  219 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 318  Q
       ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  34863292 tcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtg 34863391  T
Q  319 agaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  34863392 agaacaagcgtaaagaaggtctc 34863414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34303036 - 34302968
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303036 caagaaggacaggctgccggctggggtaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagagggtctc 34302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 39891485 - 39891808
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  39891485 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 39891584  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||  |||||| || | ||    
T  39891585 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgatcattgaaagtgcaga 39891684  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  39891685 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 39891783  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39891784 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 39891808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37950158 - 37949829
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||| |||    
T  37950158 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgtcacaatcc 37950059  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  37950058 atggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 37949959  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  | ||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||  ||  | || || || ||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  37949958 tgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacag 37949859  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37949858 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 37949829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37684738 - 37684416
Alignment:
Q  19 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 118  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37684738 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37684639  T
Q  119 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 218  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37684638 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37684539  T
Q  219 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37684538 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37684440  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37684439 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 37684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37700003 - 37699681
Alignment:
Q  19 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 118  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37700003 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37699904  T
Q  119 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 218  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37699903 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37699804  T
Q  219 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37699803 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37699705  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37699704 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 37699681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 3785162 - 3785230
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3785162 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 3785230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 27119196 - 27119264
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27119196 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 27119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31891061 - 31890993
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891061 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 31890993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 34157518 - 34157586
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34157518 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 34157586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Original strand, 37926992 - 37927104
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  37926992 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 37927091  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  37927092 taaagaaggtctc 37927104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11640211 - 11640117
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttac 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  11640211 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttac 11640117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16625500 - 16625160
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625500 cttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 16625401  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16625400 tgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 16625301  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16625300 actattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggctgccggctggggca 16625201  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625200 agttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 18531747 - 18532087
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18531747 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaatggaaagct 18531846  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||  ||    
T  18531847 tgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgcctttcaaggtttg 18531946  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18531947 actattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggca 18532046  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532047 agttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20575735 - 20575406
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  20575735 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 20575636  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  20575635 atggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 20575536  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  20575535 tgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 20575436  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20575435 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 20575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29663852 - 29663529
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||||||| || ||||| |    
T  29663852 ctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtg 29663753  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  29663752 aagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 29663653  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  29663652 gcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 29663553  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29663552 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 29663529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 18052623 - 18052960
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18052623 tcttacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18052722  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  18052723 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18052822  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  18052823 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 18052922  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18052923 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18052960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 18226567 - 18226890
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  18226567 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggtg 18226666  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  18226667 aagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 18226766  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  18226767 gcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 18226866  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  18226867 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 18226890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 8297333 - 8297670
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  8297333 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 8297432  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  8297433 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 8297532  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 301  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||     
T  8297533 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcag 8297631  T
Q  302 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  8297632 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 8297670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15891603 - 15891266
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  15891603 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 15891504  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  15891503 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 15891404  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || |||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  15891403 tgtcgaaggtacggagcctaaaaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 15891304  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15891303 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28114842 - 28114513
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||| || |    
T  28114842 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgagaggaatggaaagcttgttaccgttc 28114743  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||| ||    
T  28114742 atggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaggg 28114643  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  28114642 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 28114543  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28114542 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28114513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 7074582 - 7074910
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  7074582 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 7074681  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  7074682 atggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaagg 7074781  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  7074782 tacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 7074881  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  7074882 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 7074910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 20067413 - 20067741
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  20067413 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 20067512  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  20067513 atggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggtttaactctcgaagg 20067612  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||     
T  20067613 tacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggccggggcaagttaatacag 20067712  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20067713 cttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 10397503 - 10397832
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  10397503 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 10397602  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  10397603 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 10397702  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| ||||||||| |  ||||     
T  10397703 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaaggtgatacag 10397802  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10397803 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10397832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22386475 - 22386138
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  22386475 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 22386376  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  22386375 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 22386276  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  22386275 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 22386176  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22386175 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22386138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5608204 - 5607881
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  5608204 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 5608105  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | ||| ||||| ||||||||| | ||    
T  5608104 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtctgaccattgaaggtgcaga 5608005  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  5608004 gtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 5607906  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5607905 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5607881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 6193676 - 6193983
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  6193676 tcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 6193775  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  6193776 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 6193875  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    |   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  6193876 tgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 6193975  T
Q  303 ttagtaca 310  Q
    ||| ||||    
T  6193976 ttaataca 6193983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11109237 - 11108908
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  11109237 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 11109138  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  11109137 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagggttgaccattgaagg 11109038  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  11109037 tgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacag 11108938  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11108937 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4345569 - 4345246
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || |||||| ||||||| |    
T  4345569 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagcatggaaaactcgttacaatccatggtg 4345470  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  | || ||||||||| | ||    
T  4345469 aagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttaaccattgaaggtgcaga 4345370  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  4345369 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 4345270  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4345269 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 4345246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 5015088 - 5015411
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  5015088 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 5015187  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  5015188 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 5015287  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  5015288 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 5015387  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5015388 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 5015411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 5468362 - 5468684
Alignment:
Q  19 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 118  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  5468362 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 5468461  T
Q  119 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 218  Q
    |||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  ||||  |||||||| | |||    
T  5468462 agaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagag 5468561  T
Q  219 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 318  Q
    |  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  5468562 cctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtg 5468661  T
Q  319 agaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  5468662 agaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5595245 - 5594916
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  5595245 tgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 5595146  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  5595145 atggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 5595046  T
Q  212 tacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 310  Q
    | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  5595045 tgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgataca 5594947  T
Q  311 actccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5594946 gctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 4722992 - 4723329
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4722992 tcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4723091  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || || |||| |||  | ||    
T  4723092 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgcttttcaaggattaac 4723191  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  4723192 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 4723291  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  4723292 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15739991 - 15739654
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  15739991 tcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 15739892  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  15739891 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 15739792  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  15739791 tgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 15739692  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15739691 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15739654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 35882127 - 35882464
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  35882127 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 35882226  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  35882227 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 35882326  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || || |  || || | ||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  35882327 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagctgccggctggggcagg 35882426  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  35882427 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 35882464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Original strand, 18244115 - 18244399
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  18244115 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 18244214  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  18244215 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 18244314  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18244315 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 18244399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18291241 - 18290913
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  18291241 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 18291142  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| |||||||    
T  18291141 atggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgttgaagg 18291042  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
     ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||     
T  18291041 aacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacag 18290942  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18290941 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18290913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18306542 - 18306214
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  18306542 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 18306443  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| |||||||    
T  18306442 atggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgttgaagg 18306343  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
     ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||     
T  18306342 aacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacag 18306243  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18306242 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18306214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22869738 - 22869415
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  22869738 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 22869639  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  22869638 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 22869539  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  22869538 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 22869440  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  22869439 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 22869415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22884797 - 22884474
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  22884797 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 22884698  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  22884697 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 22884598  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  22884597 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 22884499  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  22884498 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 22884474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31963355 - 31963032
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31963355 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31963256  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31963255 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31963156  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  31963155 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 31963057  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31963056 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31963032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 4418289 - 4418618
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| ||| || |||||||||||  | |    
T  4418289 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaagggaaagcttgttaccattc 4418388  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  4418389 atggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaagg 4418488  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  4418489 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 4418588  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4418589 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8288368 - 8288031
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  8288368 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 8288269  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  8288268 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgcttttcaaggattaac 8288169  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||| |||||||||| |    
T  8288168 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgctggctggggcagg 8288069  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  8288068 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 8288031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29147652 - 29147315
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  29147652 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 29147553  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  29147552 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 29147453  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  29147452 tgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagttgccggctggggcaag 29147353  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29147352 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29147315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18275940 - 18275612
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  18275940 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 18275841  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| |||||||    
T  18275840 atggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgttgaagg 18275741  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
     ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||| ||| |||| ||||     
T  18275740 aacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggagcaggttaatacag 18275641  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18275640 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18275612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 32440524 - 32440852
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||||||  | |    
T  32440524 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgtggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttgttaccattc 32440623  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  32440624 atggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaagg 32440723  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  32440724 tacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 32440823  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  32440824 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4795550 - 4795303
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4795550 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4795451  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  4795450 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 4795351  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 250  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||    
T  4795350 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttcttt 4795303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 48467297 - 48467535
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||| |||    
T  48467297 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgtcacaatcc 48467396  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  48467397 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 48467496  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 250  Q
    | | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48467497 tgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttcttt 48467535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 340
Target Start/End: Original strand, 18331997 - 18332326
Alignment:
Q  11 ctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtc 110  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  |     
T  18331997 ctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccatt 18332096  T
Q  111 catggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaag 210  Q
    | |||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||    
T  18332097 cgtggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaag 18332196  T
Q  211 gtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 310  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18332197 gtacggagcccaagagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaataca 18332296  T
Q  311 actccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
     || |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  18332297 gcttcttgagaacaagcataaggaaggtct 18332326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 10644446 - 10644769
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  10644446 ctgggaagatcgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 10644545  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | ||    
T  10644546 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcaga 10644645  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  10644646 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 10644744  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10644745 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10644769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17983838 - 17983515
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  17983838 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 17983739  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | ||    
T  17983738 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcaga 17983639  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  17983638 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 17983540  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  17983539 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 17983515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 24329535 - 24329858
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  24329535 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 24329634  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  24329635 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 24329734  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  24329735 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 24329833  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24329834 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 24329858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 51783399 - 51783722
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  51783399 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 51783498  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  51783499 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 51783598  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  51783599 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 51783697  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  51783698 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 51783722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 8213108 - 8213437
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| | |||||| || || |||||| |||    
T  8213108 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgacgaatggaaaactcgttacaatcc 8213207  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||| |    
T  8213208 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaag 8213307  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||||||| ||||||||| |  ||||     
T  8213308 tgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaaggtgatacag 8213407  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  8213408 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 21676063 - 21676392
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | || ||| |||    
T  21676063 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaaatcgtcacaatcc 21676162  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  21676163 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 21676262  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||||||| ||||||||| |  ||||     
T  21676263 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaagatgatacag 21676362  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  21676363 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21676392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6541344 - 6541021
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  6541344 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 6541245  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||| || | ||    
T  6541244 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaagtgcaga 6541145  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  6541144 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 6541046  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  6541045 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 6541021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 7997938 - 7998261
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  7997938 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 7998037  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  7998038 aagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 7998137  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  7998138 gtctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 7998236  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7998237 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 7998261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 47024829 - 47025152
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || || || ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  47024829 ctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcaaaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 47024928  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| |||||||| || | |||  |||| |||||| || | ||    
T  47024929 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaaggaactgctttccaaggtttgaccattgaaagtgcaga 47025028  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  47025029 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 47025127  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  47025128 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 47025152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 5652860 - 5652928
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5652860 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 5652928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Original strand, 28022645 - 28022934
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  28022645 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 28022744  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
     ||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  28022745 gtggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 28022844  T
Q  212 tacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 301  Q
    | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  28022845 tgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagaccgccggctggggcaa 28022934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 4626417 - 4626485
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  4626417 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 4626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 5713700 - 5713768
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5713700 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 5724610 - 5724678
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5724610 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5767758 - 5767690
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5767758 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17993569 - 17993501
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  17993569 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 17993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Original strand, 28340766 - 28340878
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  28340766 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctgggggaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 28340865  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  28340866 taaagaaggtctc 28340878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36995871 - 36995759
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  36995871 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 36995772  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  36995771 taaagaaggtctc 36995759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7090936 - 7090873
Alignment:
Q  24 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 87  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090936 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 7090873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 20441500 - 20441575
Alignment:
Q  25 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  20441500 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 41438626 - 41438701
Alignment:
Q  25 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  41438626 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 41438701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 22889876 - 22890216
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22889876 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaatggaaagct 22889975  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||  ||    
T  22889976 tgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactacctttcaaggtttg 22890075  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  22890076 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagctgtcggctggggca 22890175  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890176 agttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 25200436 - 25200776
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25200436 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaatggaaagct 25200535  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  25200536 tgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 25200635  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25200636 actattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctggggca 25200735  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25200736 agttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 96 - 341
Target Start/End: Original strand, 25264686 - 25264931
Alignment:
Q  96 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25264686 aagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaag 25264785  T
Q  196 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 295  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25264786 gtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctg 25264885  T
Q  296 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25264886 gggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 23893615 - 23893952
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| |    
T  23893615 tcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaaagagtggaaagctcg 23893714  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| || |||| |||  | ||    
T  23893715 ttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgcttttcaaggtttaac 23893814  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||| | |  | |  |||||||||||||||| || || || || | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||||      
T  23893815 tgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagccgccggctggggcaga 23893914  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23893915 ttaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40472287 - 40471964
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| ||| || ||||||||||| || |||||||    
T  40472287 ctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaacggaaagcttgttaccgttcatggag 40472188  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  40472187 aagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 40472088  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  40472087 gcctaagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 40471988  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  40471987 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 40471964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 9318869 - 9319198
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||| ||| || |||||||||||  | |    
T  9318869 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaagggaaagcttgttaccattc 9318968  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  9318969 atggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 9319068  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  9319069 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtggtacag 9319168  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9319169 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9319198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15657513 - 15657176
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||  | ||| |||||||    
T  15657513 tcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataagaagtggaaagcttg 15657414  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  15657413 ttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 15657314  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  15657313 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaag 15657214  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15657213 ttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 41676127 - 41676455
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  41676127 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 41676226  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| ||||| |    
T  41676227 atggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgttgaatg 41676326  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  41676327 tacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 41676426  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  41676427 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 11550763 - 11551100
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  11550763 tcttacagctgtctcgtggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaaaaagtggaaagcttg 11550862  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  11550863 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 11550962  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  11550963 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 11551062  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11551063 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 12133573 - 12133902
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||| ||| || |||||||||||  | |    
T  12133573 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaagggaaagcttgttaccattc 12133672  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  12133673 atggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 12133772  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  12133773 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 12133872  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12133873 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 12133902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 26481809 - 26482138
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  26481809 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattc 26481908  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  26481909 atggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 26482008  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  26482009 tgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 26482108  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26482109 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26482138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 30936042 - 30936379
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  30936042 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 30936141  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  30936142 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 30936241  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  30936242 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 30936341  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  30936342 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 33517780 - 33518101
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  33517780 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcataaggaatggaaagcttgttaccattcatggtg 33517879  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  33517880 aagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggattgaccattgaaggtgcgga 33517979  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  33517980 gcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 33518079  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtc 339  Q
    ||||| ||||  ||||||||||    
T  33518080 gagaacaagcgtaaagaaggtc 33518101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 33293943 - 33294271
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  33293943 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 33294042  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  33294043 atggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaagg 33294142  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  33294143 tacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 33294242  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33294243 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 3790959 - 3791288
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  3790959 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 3791058  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||| ||    
T  3791059 atggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaggg 3791158  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  |||||  ||||||| |||| || ||||| |||| ||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  3791159 tgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 3791258  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3791259 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3791288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24686910 - 24686573
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  24686910 tcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 24686811  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  24686810 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 24686711  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||| |||||||||||||    
T  24686710 tgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgtcggctggggcaag 24686611  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24686610 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 24971427 - 24971764
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  24971427 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 24971526  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  24971527 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 24971626  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  24971627 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 24971726  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24971727 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 28650653 - 28650982
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  28650653 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 28650752  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || || || | |||  |||| ||||||||    
T  28650753 atggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttccaaggtttgaccattgaagg 28650852  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  28650853 tgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacag 28650952  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28650953 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28650982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 33778896 - 33779233
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  33778896 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 33778995  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  33778996 ttactattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 33779095  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  33779096 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 33779195  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33779196 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33779233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 43079670 - 43079999
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  43079670 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 43079769  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || || || | |||  |||| ||||||||    
T  43079770 atggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttccaaggtttgaccattgaagg 43079869  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  43079870 tgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacag 43079969  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  43079970 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 43079999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 24682864 - 24683187
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  24682864 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 24682963  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  24682964 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 24683063  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  24683064 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 24683163  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24683164 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 24683187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 24725391 - 24725714
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  24725391 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 24725490  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  24725491 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 24725590  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  24725591 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 24725690  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24725691 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 24725714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23751203 - 23750866
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  23751203 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 23751104  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  23751103 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 23751004  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  23751003 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 23750904  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23750903 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23750866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15757595 - 15757272
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  15757595 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 15757496  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  15757495 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 15757396  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  15757395 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 15757297  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  15757296 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 15757272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18499474 - 18499145
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  18499474 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 18499375  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  18499374 atggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 18499275  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||  ||||||| ||||||||| |  ||||     
T  18499274 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaaggtgatacag 18499175  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  18499174 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 18499145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22997867 - 22997530
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  22997867 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 22997768  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  22997767 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 22997668  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    |   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  22997667 tgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 22997568  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22997567 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22997530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23716741 - 23716404
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  23716741 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 23716642  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  |  |    
T  23716641 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattagc 23716542  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  23716541 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 23716442  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23716441 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23716404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8664213 - 8663890
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  8664213 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 8664114  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  8664113 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 8664014  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  8664013 gtctaaggaag-ttggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 8663915  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  8663914 cgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8663890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13323567 - 13323244
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  13323567 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 13323468  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  13323467 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 13323368  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  13323367 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 13323269  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13323268 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13323244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37670221 - 37669937
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37670221 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37670122  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37670121 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37670022  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37670021 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 37669937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 30169893 - 30170216
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  30169893 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 30169992  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  30169993 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 30170092  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  30170093 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 30170192  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  30170193 gagaacaagcgcaaagaaggtctc 30170216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37357381 - 37357058
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37357381 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37357282  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37357281 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37357182  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37357181 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37357082  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37357081 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 37357058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28958530 - 28958201
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  28958530 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 28958431  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  28958430 atggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 28958331  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  28958330 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 28958231  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28958230 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28958201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 30030839 - 30031162
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  30030839 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 30030938  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  30030939 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 30031038  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  30031039 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 30031137  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30031138 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30031162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 30153442 - 30153765
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  30153442 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 30153541  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  30153542 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 30153641  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  30153642 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 30153740  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30153741 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30153765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 37756404 - 37756727
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37756404 ctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37756503  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37756504 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37756603  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37756604 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37756703  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37756704 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 37756727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 6875729 - 6876052
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  6875729 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 6875828  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  6875829 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 6875928  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  6875929 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 6876027  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  6876028 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 6876052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18126139 - 18125811
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  18126139 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 18126040  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||| ||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || || ||||  ||  | ||| | |||||    
T  18126039 atggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccgcttttcagggattaactgtcgaagg 18125940  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  18125939 tacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttaatacag 18125840  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18125839 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31825145 - 31824822
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31825145 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31825046  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31825045 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31824946  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  31824945 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 31824847  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31824846 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31824822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 34617942 - 34618265
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  34617942 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 34618041  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  34618042 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 34618141  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  34618142 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 34618240  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34618241 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 34618265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37769725 - 37769441
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37769725 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37769626  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37769625 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37769526  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37769525 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 37769441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 31432864 - 31433187
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31432864 ctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31432963  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| | || ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31432964 aagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31433063  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  31433064 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 31433162  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31433163 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31433187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 2512475 - 2512798
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  2512475 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 2512574  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| || | || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||| || | |||  | || ||||||||| | ||    
T  2512575 aagaagcacacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactgctttccaaggtttaaccattgaaggtgcaga 2512674  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  2512675 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 2512773  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  2512774 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 2512798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13440135 - 13440067
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13440135 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9548184 - 9548116
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  9548184 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 9548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 11326315 - 11326383
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11326315 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 11326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13184290 - 13184222
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184290 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13184222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18374062 - 18373950
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  18374062 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 18373963  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  18373962 taaagaaggtctc 18373950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Original strand, 5639422 - 5639534
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  5639422 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 5639521  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  5639522 taaagaaggtctc 5639534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32594801 - 32594689
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  32594801 ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 32594702  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  32594701 taaagaaggtctc 32594689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 34467047 - 34467122
Alignment:
Q  25 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  34467047 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 34467122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20390507 - 20390438
Alignment:
Q  271 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  20390507 ttcaagaaggaaaagctgaaggctgggggaagttagtacagctgcccgagaacaagcacaaagaaggtct 20390438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 16042722 - 16043062
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16042722 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtgaagaatggaaagct 16042821  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  16042822 cgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttg 16042921  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16042922 actattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggctgccggctggggca 16043021  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043022 agttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16448742 - 16448402
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16448742 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaatggaaagct 16448643  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |||| | |||  ||    
T  16448642 tgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactaccttccaaggtttg 16448543  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16448542 actattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggca 16448443  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448442 agttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5146073 - 5145744
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  5146073 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 5145974  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  5145973 atggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 5145874  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  5145873 tgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 5145774  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5145773 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5145744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 5129393 - 5129730
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  5129393 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 5129492  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  5129493 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 5129592  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  5129593 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 5129692  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5129693 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5129730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 5160920 - 5161257
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  5160920 tcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 5161019  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||| ||||| || || |||| |||  ||||    
T  5161020 ttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattgac 5161119  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||  | ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  5161120 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagctgccggctggggcagg 5161219  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5161220 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26318602 - 26318273
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||| ||| || |||||||||||  | |    
T  26318602 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaagggaaagcttgttaccattc 26318503  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  26318502 atggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 26318403  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  26318402 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 26318303  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26318302 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26318273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26536603 - 26536274
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  26536603 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 26536504  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  26536503 atggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 26536404  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  26536403 tgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacag 26536304  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26536303 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 302
Target Start/End: Original strand, 26436667 - 26436957
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||| |||    
T  26436667 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtgaagaatggaaaactcgtcacaatcc 26436766  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  26436767 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 26436866  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26436867 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaag 26436957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10915610 - 10915313
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||| |  || |||||||    
T  10915610 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaaaaagcggaaagcttg 10915511  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  10915510 ttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 10915411  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||    
T  10915410 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggca 10915313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16502143 - 16501806
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16502143 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16502044  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16502043 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16501944  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  16501943 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16501844  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16501843 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16501806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 26514197 - 26514520
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  26514197 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 26514296  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  26514297 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 26514396  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  26514397 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgt 26514496  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26514497 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 26514520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 31126336 - 31126659
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31126336 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31126435  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31126436 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31126535  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  31126536 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 31126635  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31126636 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 31126659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11423519 - 11423182
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  11423519 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 11423420  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  11423419 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 11423320  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||| ||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  | || |||||||||| |    
T  11423319 tgtcgaaggtacgaagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagccgctggctggggcagg 11423220  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11423219 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11423182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31563117 - 31562794
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31563117 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31563018  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31563017 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31562918  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  31562917 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 31562818  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31562817 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 31562794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 2155974 - 2156311
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  2155974 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 2156073  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  2156074 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 2156173  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||  ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  2156174 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagctgccggctggggcagg 2156273  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  2156274 ttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 2156311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16517179 - 16516842
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16517179 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16517080  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16517079 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16516980  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||| ||||||||| |    
T  16516979 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcagg 16516880  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16516879 ttaataaagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16516842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 3446722 - 3447045
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  3446722 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 3446821  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  3446822 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 3446921  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  3446922 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 3447020  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3447021 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3447045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 9620067 - 9620390
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  9620067 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 9620166  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  9620167 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 9620266  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  9620267 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 9620365  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9620366 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9620390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 11442295 - 11442618
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  11442295 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 11442394  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  11442395 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 11442494  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  11442495 gtctaaggaag-ccggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 11442593  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11442594 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11442618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26273821 - 26273498
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  26273821 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 26273722  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  26273721 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 26273622  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  26273621 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 26273523  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26273522 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26273498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16735187 - 16734864
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  16735187 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 16735088  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  16735087 aagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 16734988  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  16734987 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 16734888  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16734887 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 16734864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16750241 - 16749918
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  16750241 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 16750142  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  16750141 aagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 16750042  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  16750041 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 16749942  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16749941 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 16749918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 17524948 - 17525271
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  17524948 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 17525047  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  17525048 aagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 17525147  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  17525148 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 17525247  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  17525248 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 17525271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17528267 - 17527944
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  17528267 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 17528168  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  17528167 aagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 17528068  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  17528067 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 17527968  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  17527967 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 17527944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24591268 - 24590945
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  24591268 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 24591169  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  24591168 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 24591069  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  24591068 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagaccgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 24590969  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24590968 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 24590945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26668640 - 26668318
Alignment:
Q  19 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 118  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  26668640 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaaaaatggaaaactcgttacaatccatggtga 26668541  T
Q  119 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 218  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  26668540 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 26668441  T
Q  219 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  26668440 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 26668342  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26668341 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 26668318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2108635 - 2108567
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2108635 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 2108567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Original strand, 45388789 - 45388959
Alignment:
Q  171 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 270  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  45388789 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 45388888  T
Q  271 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  45388889 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 45388959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 45733973 - 45734041
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733973 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 45734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31088094 - 31088033
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaaga 334  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31088094 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaaga 31088033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 4201060 - 4201128
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4201060 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4201128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 800234 - 800159
Alignment:
Q  25 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  800234 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 800159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Original strand, 18542209 - 18542291
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgg 94  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18542209 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaagaatgg 18542291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4143762 - 4143650
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  4143762 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 4143663  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  4143662 taaagaaggtctc 4143650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16206885 - 16206549
Alignment:
Q  5 ttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgtt 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16206885 ttatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtgaagaatggaaagcttgtt 16206786  T
Q  105 acagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgacta 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||    
T  16206785 acagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgcctttcaaggtttgacta 16206686  T
Q  205 ttgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagtt 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16206685 ttgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggctgccggctggggcaagtt 16206586  T
Q  305 agtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16206585 aatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 20462482 - 20462655
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462482 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 20462581  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 174  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20462582 tgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctg 20462655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 10964084 - 10964407
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  10964084 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 10964183  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  10964184 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 10964283  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  10964284 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 10964382  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10964383 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10964407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 51639632 - 51639955
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  51639632 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 51639731  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  51639732 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 51639831  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  51639832 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 51639930  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  51639931 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 51639955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 28586395 - 28586718
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  28586395 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 28586494  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  28586495 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 28586594  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  28586595 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 28586694  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28586695 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 28586718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41792149 - 41791826
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  41792149 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 41792050  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  41792049 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 41791950  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  41791949 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 41791851  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  41791850 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 41791826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 341
Target Start/End: Original strand, 20462656 - 20462718
Alignment:
Q  279 ggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462656 ggacaggctgccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 20462718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 10946493 - 10946816
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  10946493 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 10946592  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | ||    
T  10946593 aagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcaga 10946692  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  10946693 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 10946791  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10946792 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10946816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22079719 - 22079379
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  22079719 cttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaaagaatggaaagct 22079620  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||  ||  ||    
T  22079619 cgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgcttttcagggtttg 22079520  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| | |||||| ||  || ||||||||||||    
T  22079519 actatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtcctagaaggtcaagctaccggctggggca 22079420  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22079419 agttaatacaactccttgagaataagcacagagagggtctc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 16284849 - 16285186
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||    
T  16284849 tcttatatctgtctcttgggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaaaaagcggaaagcttg 16284948  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| || |||| |||  | ||    
T  16284949 ttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgcttttcaaggtttaac 16285048  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||  || ||  ||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  16285049 tgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagctgccggctggggcagg 16285148  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16285149 ttaatacaacttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27607720 - 27607383
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  27607720 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaaatggaaagcttg 27607621  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||| || ||    
T  27607620 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggactaac 27607521  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  27607520 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 27607421  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27607420 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27607383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 18792107 - 18792444
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18792107 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18792206  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  18792207 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18792306  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  18792307 tgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaag 18792406  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18792407 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18792444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 19675856 - 19676179
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  19675856 ctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 19675955  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  19675956 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 19676055  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  19676056 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 19676155  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19676156 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 19676179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19207166 - 19206837
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  19207166 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 19207067  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  19207066 atggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 19206967  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  19206966 tgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 19206867  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19206866 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 19206837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 19689498 - 19689835
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  19689498 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 19689597  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  19689598 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 19689697  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  19689698 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 19689797  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  19689798 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 19689835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 9356038 - 9356361
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  9356038 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 9356137  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  9356138 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 9356237  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  9356238 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 9356336  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9356337 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9356361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3328307 - 3327984
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  3328307 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 3328208  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  3328207 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 3328108  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |     
T  3328107 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacaactctgt 3328008  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3328007 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 3327984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 14559024 - 14559361
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||  || |  || |||||||    
T  14559024 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgccaaaagcggaaagcttg 14559123  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  14559124 ttacaattcatggagaggaagcatacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14559223  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |   || ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  14559224 tgtcgaaggtacggagcccaagagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 14559323  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||    
T  14559324 ttaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtct 14559361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 16278954 - 16279290
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16278954 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16279053  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || | ||||| |||  | ||    
T  16279054 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg-ctttcaaggattaac 16279152  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 301  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||     
T  16279153 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcag 16279251  T
Q  302 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16279252 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2136074 - 2135737
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  2136074 tcttacagttgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 2135975  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  2135974 ttaccattcatggagaggaagcatacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 2135875  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| ||||||| |    
T  2135874 tgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcagg 2135775  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  2135774 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 2135737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 29830737 - 29831060
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  29830737 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 29830836  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  29830837 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 29830936  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  29830937 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 29831035  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29831036 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29831060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12091524 - 12091240
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  12091524 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 12091425  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  12091424 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagggttgaccattgaaggtgcaga 12091325  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12091324 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactaccggctggggcaag 12091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 31355940 - 31356263
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  31355940 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 31356039  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  31356040 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 31356139  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |    
T  31356140 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctg 31356238  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31356239 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31356263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 33260138 - 33260461
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  33260138 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 33260237  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  | || ||||||||| | ||    
T  33260238 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttaaccattgaaggtgcaga 33260337  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  33260338 gcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggttggggcaaggtgatacagctctgt 33260437  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  33260438 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 33260461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28360755 - 28360471
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  28360755 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 28360656  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  28360655 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 28360556  T
Q  218 -gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
     ||| | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28360555 ggctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 28360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 33245177 - 33245245
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33245177 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 33245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31488520 - 31488350
Alignment:
Q  171 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 270  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  31488520 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 31488421  T
Q  271 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31488420 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19658743 - 19658675
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19658743 caagaaggacaagctgctggctggggcaagataatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 19658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17091247 - 17090907
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||    
T  17091247 cttcttatagctgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtgaggaatggaaagct 17091148  T
Q  101 tgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctg 200  Q
     || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||| |||| |||  ||    
T  17091147 cgtcacagtccatggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgcttttcaaggattg 17091048  T
Q  201 actattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggca 300  Q
    || |||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  17091047 accattgaaggtacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggctgccggttggggta 17090948  T
Q  301 agttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  17090947 agttgatacaactctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27628499 - 27628206
Alignment:
Q  9 agctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacag 108  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  27628499 agctgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacag 27628400  T
Q  109 tccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattga 208  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||    
T  27628399 tccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattga 27628300  T
Q  209 aggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    |||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27628299 aggcgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 16675545 - 16675874
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || |    
T  16675545 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccgttc 16675644  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  16675645 atggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 16675744  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  16675745 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 16675844  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16675845 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16675874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 340
Target Start/End: Original strand, 29550881 - 29551209
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |    
T  29550881 tgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaagcttgttaccattc 29550980  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | |||||    
T  29550981 atggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaagg 29551080  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||     
T  29551081 tacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaagttagtacag 29551180  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29551181 cttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29551209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 3697487 - 3697816
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||| |||    
T  3697487 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgtcacaatcc 3697586  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  3697587 atggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 3697686  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  3697687 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 3697786  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3697787 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26776394 - 26776071
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||| |||||  ||||| |||||  | ||||| |    
T  26776394 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgtaaggaatgaaaagctcgttaccattcatggtg 26776295  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| ||||    
T  26776294 aagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcgga 26776195  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| |     
T  26776194 gcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggatggggcaaggtgatacagctctgt 26776095  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26776094 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 26776071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22933679 - 22933342
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  22933679 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 22933580  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || || |||| |||  | ||    
T  22933579 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgcttttcaaggattaac 22933480  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  22933479 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 22933380  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22933379 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23856124 - 23855787
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  23856124 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 23856025  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || || |||| |||  | ||    
T  23856024 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgcttttcaaggattaac 23855925  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  23855924 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 23855825  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23855824 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24303417 - 24303080
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  24303417 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 24303318  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  24303317 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 24303218  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  24303217 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 24303118  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24303117 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24303080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15423116 - 15422779
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  15423116 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 15423017  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  15423016 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 15422917  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  15422916 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 15422817  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15422816 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27271363 - 27271078
Alignment:
Q  19 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 118  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||| ||||||| ||    
T  27271363 tgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtgaagaatggaaaactcgtcacaatccatggtga 27271264  T
Q  119 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 218  Q
    |||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| |||||||||   |||    
T  27271263 agaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgtagag 27271164  T
Q  219 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagtt 304  Q
    |  |||| |  |||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27271163 cctaagagggatggagctgccatggcttcattaaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaagtt 27271078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 340
Target Start/End: Original strand, 26919800 - 26920114
Alignment:
Q  26 accatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaaca 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||    
T  26919800 accatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagca 26919899  T
Q  126 tatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga 225  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||||||||||| |||||    
T  26919900 tacctggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaaga 26919999  T
Q  226 agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataa 325  Q
     |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||    
T  26920000 gggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaa 26920099  T
Q  326 gcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| || ||||||||    
T  26920100 gcataaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 27020535 - 27020873
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  27020535 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 27020634  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  27020635 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 27020734  T
Q  203 tattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 301  Q
    | | |||||||||||| || | || |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  27020735 tgtcgaaggtacggagcctaaggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaa 27020834  T
Q  302 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27020835 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27020873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 29502821 - 29503150
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  29502821 tgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 29502920  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  29502921 atggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 29503020  T
Q  212 tacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 310  Q
    | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  29503021 tgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgataca 29503119  T
Q  311 actccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29503120 gctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29503150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13297750 - 13297413
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  13297750 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcgatgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 13297651  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  13297650 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 13297551  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  13297550 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagctgccggctggggcagg 13297451  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13297450 ttaatacagcttcgcgagaacaagcataaggaaggtct 13297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 24865114 - 24865451
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  24865114 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 24865213  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  24865214 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagccgggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 24865313  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||| |||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||| ||||||||||| |    
T  24865314 tgtcgaaggaacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgtcggctggggcagg 24865413  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24865414 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24865451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 27045794 - 27046123
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  27045794 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 27045893  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| |||||||     
T  27045894 atggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaga 27045993  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  27045994 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 27046093  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27046094 ctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27046123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Original strand, 20162176 - 20162351
Alignment:
Q  166 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  20162176 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 20162275  T
Q  266 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  20162276 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctc 20162351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22170655 - 22170480
Alignment:
Q  166 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22170655 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 22170556  T
Q  266 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  22170555 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctc 22170480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27289169 - 27288831
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  27289169 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 27289070  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| || |||| |||  | ||    
T  27289069 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgcttttcaaggattaac 27288970  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||| ||||  || | |  |||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  27288969 tgtcgaaggtacagagcctaaaagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagactgctgggtggggcaag 27288870  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     |  |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27288869 gtgatacagctccgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27288831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 16751251 - 16751588
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16751251 tcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16751350  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16751351 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16751450  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||| ||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  16751451 tgtcgaaggtatggaacctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16751550  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16751551 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16751588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20162086 - 20162179
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgg 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  20162086 cttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtgaagaatgg 20162179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22170745 - 22170652
Alignment:
Q  1 cttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgg 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22170745 cttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtgaagaatgg 22170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26115194 - 26114910
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  26115194 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 26115095  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  26115094 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 26114995  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26114994 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 26114910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 27009142 - 27009465
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  27009142 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 27009241  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  27009242 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 27009341  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  27009342 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctg 27009440  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27009441 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27009465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Original strand, 27486541 - 27486825
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  27486541 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 27486640  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  |||||||| || || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  27486641 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 27486740  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27486741 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27486825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Original strand, 28208866 - 28209150
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  28208866 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 28208965  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  28208966 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagggttgaccattgaaggtgcaga 28209065  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28209066 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 28209150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30556800 - 30556477
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  30556800 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 30556701  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || || || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  30556700 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 30556601  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  30556600 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 30556502  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30556501 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30556477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 4759176 - 4759499
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  4759176 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 4759275  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  4759276 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 4759375  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  4759376 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgt 4759475  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4759476 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 4759499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4544559 - 4544236
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  4544559 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 4544460  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| || |||||| | ||    
T  4544459 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcaga 4544360  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  4544359 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 4544261  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4544260 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 4526698 - 4527021
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  4526698 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 4526797  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||  | ||    
T  4526798 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggcgcaga 4526897  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  4526898 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 4526997  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4526998 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 4527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16942811 - 16942488
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  16942811 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 16942712  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  ||||  |||||||| | ||    
T  16942711 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcaga 16942612  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  16942611 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 16942512  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16942511 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 16942488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Original strand, 26990286 - 26990464
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  26990286 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 26990385  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgaggg 181  Q
    ||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  26990386 ttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggatctgcagaggg 26990464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4722918 - 4722634
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  4722918 ctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 4722819  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| || |||||| | ||    
T  4722818 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcaga 4722719  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4722718 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 4722634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Original strand, 29574419 - 29574748
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| | |    
T  29574419 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaattc 29574518  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    | || |||||  |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  29574519 acggtgaagaggcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 29574618  T
Q  212 tacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 310  Q
    | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  29574619 tgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgataca 29574717  T
Q  311 actccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29574718 gctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29574748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34913795 - 34913563
Alignment:
Q  96 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 195  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  34913795 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 34913696  T
Q  196 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 295  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||  | ||  ||||||||||    
T  34913695 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagagtcaagctgccggctg 34913596  T
Q  296 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  34913595 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 34913563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Original strand, 4774506 - 4774618
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||||    
T  4774506 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagca 4774605  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  4774606 taaagaaggtctc 4774618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8891998 - 8891930
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8891998 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8903233 - 8903165
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903233 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8903165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 28163166 - 28163234
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28163166 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 28163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33373943 - 33373875
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33373943 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 33373875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6078 - 5755
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  6078 ctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataaggaatggaaaacttgttaccattcatggtg 5979  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  5978 aagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 5879  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    ||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  5878 gcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 5779  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5778 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 5755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  243 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 31853 - 32190
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  31853 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 31952  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  31953 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 32052  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  32053 tgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagctgccggctggggcaag 32152  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||  ||||| || ||||||||    
T  32153 ttaatacagcttcgtgagagcaagcataaggaaggtct 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1287 - 958
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  1287 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 1188  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  ||||  |||| ||    
T  1187 atggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgacctttgaggg 1088  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaa 311  Q
    | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| | | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||     
T  1087 tgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaagttattcaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacag 988  T
Q  312 ctccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    || || ||||| ||||  ||||||||||||    
T  987 cttcgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 31157 - 31494
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  31157 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 31256  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  31257 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 31356  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  31357 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 31456  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31457 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45841 - 45504
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45841 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttg 45742  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  45741 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 45642  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  45641 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 45542  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  45541 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 38925 - 38600
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  38925 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 38826  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  38825 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 38726  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  38725 tgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 38626  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||| |||| || || ||||| |||||    
T  38625 ttaatacagcttcgtgagaacaagca 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 340
Target Start/End: Original strand, 28693 - 29030
Alignment:
Q  3 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 102  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28693 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacccctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28792  T
Q  103 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 202  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  28793 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 28892  T
Q  203 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28893 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28992  T
Q  303 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 340  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28993 ttaatatagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 302
Target Start/End: Original strand, 10975 - 11265
Alignment:
Q  12 tgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtcc 111  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||    
T  10975 tgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatcc 11074  T
Q  112 atggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaagg 211  Q
    |||| |||||| |||| || || ||| ||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||    
T  11075 atggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaagg 11174  T
Q  212 tacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    | | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11175 tgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7753
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |    
T  7430 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaagctcgttacaatccatggtg 7529  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || || || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  7530 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 7629  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  7630 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 7728  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7729 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 7753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Original strand, 9364 - 9648
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  9364 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 9463  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  9464 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaagggttgaccattgaaggtgcaga 9563  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    ||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9564 gcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 9648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13771 - 13448
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  13771 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 13672  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | ||    
T  13671 aagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcaga 13572  T
Q  218 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 316  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  13571 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 13473  T
Q  317 cgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13472 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25042 - 24719
Alignment:
Q  18 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 117  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  25042 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 24943  T
Q  118 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 217  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || || || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  24942 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 24843  T
Q  218 gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 317  Q
    |   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  24842 gtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 24743  T
Q  318 gagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24742 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 24719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Original strand, 22073 - 22141
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22073 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 119642 - 119574
Alignment:
Q  273 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 341  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  119642 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 119574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7819 - 7707
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  7819 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 7720  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  7719 taaagaaggtctc 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21372 - 21260
Alignment:
Q  229 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 328  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  21372 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 21273  T
Q  329 caaagaaggtctc 341  Q
     ||||||||||||    
T  21272 taaagaaggtctc 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 302
Target Start/End: Original strand, 27711 - 27904
Alignment:
Q  109 tccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattga 208  Q
    ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||| |||||| || ||||| || | |||  ||||  ||||    
T  27711 tccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcaggatttgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttga 27810  T
Q  209 aggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 302  Q
    |||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27811 aggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University