View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10200_low_16 (Length: 248)

Name: NF10200_low_16
Description: NF10200
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10200_low_16
NF10200_low_16
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (19-234)||(123369-123584)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (19-234)||(9582893-9583108)
chr7 (19-234)||(16119849-16120064)
chr7 (23-234)||(23515067-23515278)
chr7 (19-234)||(14551098-14551314)
chr7 (19-234)||(8717865-8718080)
chr7 (19-234)||(13673856-13674071)
chr7 (19-234)||(18593352-18593567)
chr7 (19-234)||(18618117-18618332)
chr7 (19-227)||(4312564-4312772)
chr7 (19-227)||(538755-538964)
chr7 (19-227)||(12567020-12567229)
chr7 (19-226)||(12548805-12549012)
chr7 (19-227)||(8780936-8781146)
chr7 (21-227)||(9003958-9004165)
chr7 (19-227)||(20108375-20108584)
chr7 (20-226)||(48801777-48801983)
chr7 (19-224)||(9264939-9265145)
chr7 (19-227)||(13657873-13658081)
chr7 (19-227)||(11921307-11921512)
chr7 (19-227)||(16532100-16532311)
chr7 (19-227)||(16633351-16633562)
chr7 (19-227)||(16465616-16465821)
chr7 (19-82)||(15206584-15206647)
chr7 (19-88)||(4461242-4461311)
chr7 (19-75)||(825783-825839)
chr7 (19-75)||(14221718-14221774)
chr7 (19-75)||(15916776-15916832)
chr7 (19-75)||(18287761-18287817)
chr7 (19-75)||(27291496-27291552)
chr7 (19-77)||(5397273-5397331)
chr7 (19-68)||(15065935-15065984)
chr7 (19-72)||(9194544-9194597)
chr7 (23-75)||(6713072-6713124)
chr7 (20-75)||(15348532-15348587)
chr7 (35-75)||(15522517-15522557)
chr7 (20-59)||(4791383-4791422)
chr7 (146-227)||(15065779-15065858)
chr7 (146-227)||(18287612-18287691)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (19-234)||(15699555-15699770)
chr6 (19-234)||(22165549-22165764)
chr6 (19-234)||(22243812-22244027)
chr6 (19-234)||(22061503-22061718)
chr6 (19-227)||(24855245-24855453)
chr6 (19-234)||(22767116-22767331)
chr6 (19-234)||(20170242-20170458)
chr6 (19-227)||(18448140-18448349)
chr6 (19-227)||(23023093-23023302)
chr6 (23-227)||(20107784-20107989)
chr6 (19-227)||(25625691-25625899)
chr6 (19-224)||(2181063-2181269)
chr6 (19-219)||(18854026-18854226)
chr6 (19-227)||(25631269-25631477)
chr6 (19-227)||(21560554-21560762)
chr6 (19-226)||(29595697-29595904)
chr6 (19-227)||(25963248-25963457)
chr6 (19-227)||(25967895-25968104)
chr6 (19-222)||(30671807-30672011)
chr6 (99-227)||(19585622-19585750)
chr6 (130-233)||(20016339-20016443)
chr6 (19-88)||(18184874-18184943)
chr6 (19-76)||(35270971-35271028)
chr6 (19-82)||(18731868-18731931)
chr6 (19-82)||(20218981-20219044)
chr6 (19-82)||(22113006-22113069)
chr6 (19-75)||(11204004-11204060)
chr6 (23-75)||(23517835-23517887)
chr6 (19-75)||(29686601-29686657)
chr6 (187-227)||(29686449-29686489)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (19-234)||(20595831-20596046)
chr5 (19-234)||(20602117-20602332)
chr5 (19-234)||(20608408-20608623)
chr5 (19-234)||(15735534-15735749)
chr5 (44-234)||(23710701-23710892)
chr5 (19-234)||(23748051-23748266)
chr5 (19-227)||(24940540-24940749)
chr5 (19-234)||(18072900-18073115)
chr5 (19-234)||(24953174-24953389)
chr5 (37-226)||(20622170-20622359)
chr5 (19-234)||(20790714-20790929)
chr5 (19-227)||(23600636-23600845)
chr5 (19-227)||(24219752-24219961)
chr5 (23-227)||(20444843-20445048)
chr5 (19-213)||(21387410-21387605)
chr5 (19-223)||(20916456-20916660)
chr5 (61-227)||(22948518-22948685)
chr5 (103-226)||(20575510-20575633)
chr5 (19-75)||(22317513-22317569)
chr5 (19-75)||(25006808-25006864)
chr5 (19-75)||(30759655-30759711)
chr5 (19-82)||(18484212-18484275)
chr5 (19-69)||(25116171-25116221)
chr5 (19-75)||(26847803-26847859)
chr5 (19-69)||(25175261-25175312)
chr5 (23-75)||(22855723-22855775)
chr5 (20-64)||(27270563-27270607)
chr5 (146-227)||(22317639-22317719)
chr5 (146-227)||(22855572-22855651)
chr5 (20-68)||(17412736-17412784)
chr5 (146-226)||(25006934-25007012)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (19-234)||(11496614-11496829)
chr4 (19-234)||(13822913-13823128)
chr4 (19-228)||(42709731-42709940)
chr4 (19-233)||(15254349-15254563)
chr4 (19-226)||(10630758-10630965)
chr4 (19-227)||(3354646-3354855)
chr4 (19-226)||(18291945-18292153)
chr4 (19-227)||(18081459-18081669)
chr4 (19-227)||(45234232-45234441)
chr4 (19-226)||(17484910-17485118)
chr4 (19-226)||(56580539-56580748)
chr4 (19-226)||(38426745-38426938)
chr4 (19-224)||(8092427-8092634)
chr4 (19-82)||(14653998-14654061)
chr4 (21-75)||(15865647-15865701)
chr4 (19-75)||(10650547-10650603)
chr4 (19-75)||(15260109-15260165)
chr4 (19-75)||(16682913-16682969)
chr4 (19-70)||(15409534-15409585)
chr4 (19-75)||(9488878-9488934)
chr4 (20-68)||(17296250-17296298)
chr4 (146-225)||(15260235-15260312)
chr4 (187-227)||(12515042-12515081)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (19-234)||(10602472-10602687)
chr3 (19-234)||(13504881-13505096)
chr3 (19-234)||(11947407-11947622)
chr3 (19-234)||(16448760-16448975)
chr3 (19-234)||(15556942-15557157)
chr3 (19-234)||(9360971-9361186)
chr3 (19-234)||(7600355-7600570)
chr3 (19-234)||(16373565-16373780)
chr3 (19-234)||(12187076-12187291)
chr3 (19-234)||(37942378-37942593)
chr3 (20-226)||(12193491-12193697)
chr3 (23-234)||(6814868-6815079)
chr3 (19-234)||(10147011-10147226)
chr3 (19-234)||(15645001-15645216)
chr3 (19-234)||(10160173-10160388)
chr3 (20-234)||(13187418-13187632)
chr3 (20-226)||(3245589-3245795)
chr3 (19-226)||(2721305-2721511)
chr3 (19-227)||(13097711-13097919)
chr3 (19-227)||(4382751-4382961)
chr3 (19-226)||(13001425-13001634)
chr3 (19-227)||(10546936-10547148)
chr3 (19-227)||(20156515-20156722)
chr3 (19-227)||(1992803-1993011)
chr3 (19-227)||(13690608-13690816)
chr3 (19-227)||(11398215-11398424)
chr3 (19-227)||(14348588-14348797)
chr3 (19-224)||(22637702-22637908)
chr3 (19-226)||(3279191-3279399)
chr3 (19-224)||(17387839-17388045)
chr3 (19-227)||(12160207-12160416)
chr3 (136-234)||(16655798-16655897)
chr3 (27-234)||(17045697-17045902)
chr3 (27-234)||(17047857-17048062)
chr3 (19-75)||(27356728-27356784)
chr3 (19-76)||(13601220-13601277)
chr3 (19-75)||(3339226-3339282)
chr3 (19-75)||(12776534-12776590)
chr3 (19-75)||(13136210-13136266)
chr3 (19-75)||(20584262-20584318)
chr3 (19-70)||(15946773-15946824)
chr3 (19-77)||(14445768-14445826)
chr3 (19-75)||(15619283-15619339)
chr3 (19-227)||(20225754-20225960)
chr3 (19-75)||(13195458-13195514)
chr3 (19-74)||(8686387-8686442)
chr3 (19-58)||(13068318-13068357)
chr3 (19-50)||(2005499-2005530)
chr3 (187-234)||(13601062-13601108)
chr3 (146-227)||(12776660-12776739)
chr3 (146-227)||(15946619-15946698)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (19-234)||(22665062-22665277)
chr2 (19-234)||(117543-117758)
chr2 (19-234)||(22044660-22044875)
chr2 (19-234)||(25357511-25357726)
chr2 (19-227)||(11615-11823)
chr2 (19-234)||(16775651-16775866)
chr2 (19-234)||(17590407-17590622)
chr2 (19-234)||(24795285-24795500)
chr2 (19-234)||(27627580-27627796)
chr2 (19-227)||(25144757-25144966)
chr2 (19-226)||(5500265-5500473)
chr2 (19-227)||(25804267-25804475)
chr2 (19-226)||(23798922-23799129)
chr2 (24-225)||(25370890-25371091)
chr2 (19-227)||(23643950-23644160)
chr2 (99-227)||(24502168-24502297)
chr2 (19-173)||(24178193-24178348)
chr2 (19-88)||(25337651-25337720)
chr2 (19-75)||(23159385-23159441)
chr2 (19-75)||(23570642-23570698)
chr2 (19-75)||(27631655-27631711)
chr2 (19-75)||(27768816-27768872)
chr2 (19-70)||(24171510-24171561)
chr2 (19-88)||(24506796-24506865)
chr2 (23-88)||(24321314-24321380)
chr2 (19-75)||(23257570-23257625)
chr2 (146-227)||(27631506-27631585)
chr2 (38-80)||(23648123-23648165)
chr2 (20-65)||(29955868-29955913)
chr2 (187-227)||(15532753-15532792)
chr2 (20-64)||(19805618-19805662)
chr2 (20-68)||(21512567-21512615)
chr2 (187-227)||(24019228-24019267)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (19-234)||(15678-15893)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (19-234)||(27046874-27047089)
chr1 (19-234)||(17094601-17094816)
chr1 (19-234)||(21798662-21798878)
chr1 (19-234)||(20237456-20237671)
chr1 (23-224)||(8653126-8653327)
chr1 (19-227)||(52938621-52938830)
chr1 (19-227)||(3989944-3990154)
chr1 (19-220)||(19364043-19364244)
chr1 (19-107)||(14070632-14070720)
chr1 (23-77)||(19875648-19875702)
chr1 (19-82)||(21784472-21784535)
chr1 (19-82)||(4027832-4027895)
chr1 (19-82)||(8947515-8947578)
chr1 (22-75)||(16382578-16382631)
chr1 (146-226)||(21784598-21784677)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (19-234)||(21382093-21382309)
chr8 (19-234)||(21098794-21099009)
chr8 (19-234)||(21104115-21104330)
chr8 (19-234)||(23911441-23911655)
chr8 (19-234)||(8314467-8314683)
chr8 (19-234)||(8322846-8323062)
chr8 (19-227)||(21843524-21843733)
chr8 (19-227)||(21939996-21940206)
chr8 (19-227)||(20038981-20039189)
chr8 (19-226)||(23454945-23455154)
chr8 (19-226)||(17620755-17620961)
chr8 (19-227)||(16418620-16418830)
chr8 (19-198)||(24034049-24034230)
chr8 (30-226)||(14352181-14352378)
chr8 (19-208)||(21538573-21538765)
chr8 (19-130)||(20712537-20712649)
chr8 (19-75)||(11346953-11347009)
chr8 (19-75)||(19767684-19767740)
chr8 (19-75)||(22370102-22370158)
chr8 (19-70)||(20002279-20002330)
chr8 (158-227)||(20712470-20712539)
chr8 (19-75)||(22033555-22033611)
chr8 (19-75)||(22099655-22099711)
chr8 (19-75)||(22102552-22102608)
chr8 (19-70)||(21831181-21831232)
chr8 (19-70)||(22817755-22817806)
chr8 (146-227)||(22102403-22102482)
chr8 (20-68)||(18572977-18573025)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (19-234)||(615-831)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (19-234)||(1038-1253)
scaffold0404 (19-82)||(3461-3524)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (19-227)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (19-224)||(2852-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (19-227)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (19-219)||(11064-11264)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (19-226)||(14662-14869)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (19-227)||(2287-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (19-227)||(831-1041)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (19-224)||(482-687)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (19-227)||(7941-8149)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (19-226)||(120954-121162)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (19-227)||(58628-58838)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (19-177)||(164403-164562)
scaffold0011 (20-88)||(172248-172316)
scaffold0011 (19-82)||(161995-162058)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (19-227)||(1108-1318)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (19-227)||(97726-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (19-227)||(510-718)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (19-224)||(13002-13207)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (19-137)||(10206-10325)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (21-180)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (21-180)||(232789-232948)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (19-224)||(35104-35307)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (19-166)||(8720-8869)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (19-120)||(38508-38610)
scaffold0096 (149-199)||(38625-38675)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (19-227)||(5090-5295)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (160-227)||(2859-2926)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (19-82)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (19-82)||(50506-50569)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (19-77)||(912-970)
[»] scaffold0566 (2 HSPs)
scaffold0566 (19-75)||(2762-2818)
scaffold0566 (146-227)||(2612-2692)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (19-70)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (23-82)||(22159-22218)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-225)||(37722-37922)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (19-64)||(18218-18263)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (19-87)||(1834-1902)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (19-75)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (19-75)||(54849-54905)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (19-82)||(37743-37806)
scaffold0116 (146-226)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (20-75)||(1193-1248)
scaffold0094 (187-227)||(1041-1080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-82)||(22756-22818)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (19-82)||(45228-45291)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (19-69)||(72572-72622)
scaffold0037 (19-69)||(84762-84812)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (35-75)||(83174-83214)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (187-227)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 123584 - 123369
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123584 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 123485  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123484 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 123385  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  123384 gtgtgtgtgaagtcca 123369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9583108 - 9582893
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583108 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 9583009  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583008 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 9582909  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  9582908 gtgtgtgtgaagtcca 9582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 16119849 - 16120064
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119849 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatatacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 16119948  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119949 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 16120048  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  16120049 gtgtgtgtgaagtcca 16120064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23515278 - 23515067
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515278 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 23515179  T
Q  123 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515178 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 23515079  T
Q  223 gtgtgatgtcca 234  Q
    |||||| |||||    
T  23515078 gtgtgaagtcca 23515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14551314 - 14551098
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551314 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 14551215  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat-ttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551214 catgtcccctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaattttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 14551115  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14551114 tgtgtgtgtgaagtcca 14551098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8718080 - 8717865
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8718080 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 8717981  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717980 catgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 8717881  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  8717880 gtgtgtgtgaagtcca 8717865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13674071 - 13673856
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13674071 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 13673972  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13673971 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatcttttttctacccaacgatcaagttttaagtgagt 13673872  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  13673871 gtgtgtgtgaagtcca 13673856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 18593352 - 18593567
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  18593352 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagta 18593451  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18593452 catgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 18593551  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  18593552 gtgtgtgtgaagtcca 18593567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18618332 - 18618117
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  18618332 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagta 18618233  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18618232 catgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 18618133  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  18618132 gtgtgtgtgaagtcca 18618117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4312772 - 4312564
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||| |     
T  4312772 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaact 4312673  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4312672 tatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 4312573  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  4312572 gtgtgtgtg 4312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 538755 - 538964
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  538755 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 538854  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagca-tttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||| ||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  538855 catgtctcctgaagggttttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 538954  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  538955 tgtgtgtgtg 538964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12567229 - 12567020
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  12567229 catcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagaacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 12567130  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
     ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12567129 tcatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 12567030  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  12567029 tgtgtgtgtg 12567020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 12548805 - 12549012
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| ||||||||| |||||||      
T  12548805 catcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaat- 12548903  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12548904 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtccactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagcttcaagtgag 12549003  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||    
T  12549004 tgtgtgtgt 12549012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 8780936 - 8781146
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    || || |||||||||||||||||  |    
T  8780936 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaaa 8781035  T
Q  119 c--atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |  |||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  8781036 cttatgtctcctcaaaggcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagtttcaaggta 8781135  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  8781136 gtgtgtgtgtg 8781146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9004165 - 9003958
Alignment:
Q  21 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||| ||||||||||||||||| |      
T  9004165 tcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagtttatcatatgacaattcaattaaaactt 9004066  T
Q  120 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 219  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004065 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaattacaaactcaagcatttcttgtgatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 9003966  T
Q  220 tgtgtgtg 227  Q
    | ||||||    
T  9003965 tatgtgtg 9003958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20108584 - 20108375
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    ||||| |||| |||||||||||| |    
T  20108584 catcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcataaaacaaggttatcatatgagaattcaattaaaac 20108485  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      |||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20108484 tgatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 20108385  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  20108384 tgtgtgtgtg 20108375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 48801777 - 48801983
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||   ||||||   ||||||||||||| |||     
T  48801777 atcaaactcccccacacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcatacacatagtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaatcaaaa 48801873  T
Q  117 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  48801874 ctcatgtctcctcaaaggctttaatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtaaaaagtga 48801973  T
Q  217 gtgtgtgtgt 226  Q
    || |||||||    
T  48801974 gtatgtgtgt 48801983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 9264939 - 9265145
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaag-c 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||    || || ||||||||||||| |||  |    
T  9264939 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataagcaagattaacatatgacaattcaataaaaaac 9265038  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      |||||||||||| | |||  ||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9265039 ttatgtctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 9265138  T
Q  218 tgtgtgt 224  Q
    |||||||    
T  9265139 tgtgtgt 9265145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13658081 - 13657873
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||    ||    ||||||||| ||||||| ||    
T  13658081 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcgtaaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 13657982  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  13657981 catatctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcccttttccacccaacaatcaagtttcaaatgagt 13657882  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  13657881 gtgtgtgtg 13657873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 11921307 - 11921512
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||| ||   ||| |||||||||  |||||||||    
T  11921307 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcataaacatggtagca-taacattt---tcacatgacaattacattaaagca 11921402  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    || |||||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  11921403 cacgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaacgcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatctagtcctaagtgag 11921502  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  11921503 tgtgtgtgtg 11921512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16532311 - 16532100
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |    | ||| |||||||||  ||||||||    
T  16532311 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagc 16532212  T
Q  118 acatgtctcctcaagggc-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagtttcaagtg 215  Q
    |||||||||||||| ||| || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||| | || ||    
T  16532211 acatgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattg 16532112  T
Q  216 agtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||    
T  16532111 agtgtgtgtgtg 16532100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 16633351 - 16633562
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |    | ||| |||||||||  ||||||||    
T  16633351 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagc 16633450  T
Q  118 acatgtctcctcaagggc-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagtttcaagtg 215  Q
    |||||||||||||| ||| || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||| | || ||    
T  16633451 acatgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattg 16633550  T
Q  216 agtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||    
T  16633551 agtgtgtgtgtg 16633562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 16465616 - 16465821
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||      || ||  ||||||| |  |||||| ||    
T  16465616 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcataa-----catttctcatgacaaatacattaaaaca 16465710  T
Q  119 catgtctcctc-aagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    || |||||||| || |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |  || |||   ||||||    
T  16465711 cacgtctcctcaaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccatcagtctagtcctaagtga 16465810  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  16465811 gtgtgtgtgtg 16465821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 15206584 - 15206647
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15206584 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcatagacatagcagca 15206647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 4461242 - 4461311
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca 88  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4461242 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggcagcataaaca 4461311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 825839 - 825783
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  825839 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 825783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 14221718 - 14221774
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14221718 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 14221774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 15916776 - 15916832
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15916776 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15916832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18287817 - 18287761
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18287817 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 18287761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27291552 - 27291496
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27291552 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27291496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 5397331 - 5397273
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatag 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5397331 catcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatag 5397273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15065984 - 15065935
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggca 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15065984 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 15065935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Original strand, 9194544 - 9194597
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaa 72  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9194544 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaa 9194597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 6713072 - 6713124
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6713072 aaactcccctatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 6713124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15348587 - 15348532
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15348587 atcaaacttccccaaacttgaatctttgtttgtcctcaagtaaaaggcataaacat 15348532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15522557 - 15522517
Alignment:
Q  35 acttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15522557 acttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacat 15522517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 59
Target Start/End: Original strand, 4791383 - 4791422
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaag 59  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4791383 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaag 4791422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15065858 - 15065779
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||    
T  15065858 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatctcaagtgagtgtgtgtgtg 15065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18287691 - 18287612
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  18287691 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtctgtgtg 18287612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15699770 - 15699555
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699770 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 15699671  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699670 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15699571  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  15699570 gtgtgtgtgaagtcca 15699555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 22165549 - 22165764
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165549 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22165648  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22165748  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  22165749 gtgtgtgtgaagtcca 22165764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22244027 - 22243812
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244027 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22243928  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243927 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22243828  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  22243827 gtgtgtgtgaagtcca 22243812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 22061503 - 22061718
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061503 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22061602  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061603 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22061702  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  22061703 gtgtgtgtgaagtcca 22061718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 24855245 - 24855453
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24855245 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 24855343  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24855344 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 24855443  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  24855444 tgtgtgtgtg 24855453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 22767116 - 22767331
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22767116 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtaacatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 22767214  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22767215 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 22767314  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
     |||||||||| |||||    
T  22767315 agtgtgtgtgaagtcca 22767331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20170458 - 20170242
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagtt-atatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  20170458 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagtttaaatcaaatgacaatt-aattaaagc 20170360  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20170359 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtga 20170260  T
Q  217 gtgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20170259 gtgtgtgtgtgaagtcca 20170242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18448349 - 18448140
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  18448349 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacttggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 18448250  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  18448249 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcatcccaacagtcaagtttcaagtgac 18448150  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  18448149 tgtgtgtgtg 18448140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23023302 - 23023093
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| || ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  23023302 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcttaaacatggtagcataagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 23023203  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23023202 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 23023103  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    |||| |||||    
T  23023102 tgtgcgtgtg 23023093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 20107784 - 20107989
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcaca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || | || |||||||||||||| ||| |  |    
T  20107784 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagataaa-catatgacaattcaattgaaaactta 20107882  T
Q  121 tgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgt 220  Q
    ||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20107883 tgtctcctcaaaggctttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgt 20107982  T
Q  221 gtgtgtg 227  Q
    |||||||    
T  20107983 gtgtgtg 20107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25625899 - 25625691
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  25625899 catcaaactcccccatacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggtgtaaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 25625800  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     ||||||||| |||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25625799 tatgtctccttaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 25625700  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  25625699 gtgtgtgtg 25625691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2181269 - 2181063
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2181269 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 2181170  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |  | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  2181169 acatgtctcctcaagggcttaaatttcgagcgcacattaatcacaaacttaagcatttctcgtaatccttattcaactcaacaaccaagtttcaagtgag 2181070  T
Q  218 tgtgtgt 224  Q
    |||||||    
T  2181069 tgtgtgt 2181063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18854226 - 18854026
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  18854226 catcaaactcccccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaataca 18854127  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18854126 catgtctcctcaagggctttaatttccagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 18854027  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  18854026 g 18854026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 25631269 - 25631477
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||   ||||||   |||||||||||||||||    
T  25631269 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaggaaaaatgcataaacatggtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaattaaa 25631365  T
Q  116 gcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtg 215  Q
     |  || |||| |||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25631366 acttatatctcttcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtg 25631465  T
Q  216 agtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||    
T  25631466 agtgtgtgtgtg 25631477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 21560554 - 21560762
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    ||    ||| ||||| ||||||| ||    
T  21560554 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgtcaatttaattaaaaca 21560653  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21560654 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 21560753  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  21560754 gtgtgtgtg 21560762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29595904 - 29595697
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |    ||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  29595904 catcaaactccctcacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcataaataagattatcacatgacgatttaattaaaaca 29595805  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  29595804 catgtctccccaagggctttaatttcaagtgtacactaataaaaaactcaaacatttcttgtaatcctttttcaacccaataatcaagtttcaaatgact 29595705  T
Q  219 gtgtgtgt 226  Q
    ||||||||    
T  29595704 gtgtgtgt 29595697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25963457 - 25963248
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||   || || |||||||||||||||||      
T  25963457 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 25963358  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
       ||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  25963357 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 25963258  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  25963257 tgtgtgtgtg 25963248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25968104 - 25967895
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||   || || |||||||||||||||||      
T  25968104 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 25968005  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
       ||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  25968004 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 25967905  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  25967904 tgtgtgtgtg 25967895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 30671807 - 30672011
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||   || || |||||||||||||||||      
T  30671807 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 30671906  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
       ||| ||| ||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  30671907 ttgtgtttccccaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaattgag 30672006  T
Q  218 tgtgt 222  Q
    |||||    
T  30672007 tgtgt 30672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Original strand, 19585622 - 19585750
Alignment:
Q  99 atgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 198  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||  ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19585622 atgacaatacaattaaaactcatgtctcctaaaaggcttttatttcaaacgtacactaatcacaaacacaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 19585721  T
Q  199 cgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19585722 caatcaagttttaagtgagtgtgtatgtg 19585750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 20016339 - 20016443
Alignment:
Q  130 aagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtga 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016339 aagggcttaaatcccaaaatgtacactaattgcaaactcaagtatttcttgaaatctttattctatccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtga 20016438  T
Q  229 tgtcc 233  Q
     ||||    
T  20016439 agtcc 20016443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 18184874 - 18184943
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca 88  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18184874 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca 18184943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35271028 - 35270971
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacata 76  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35271028 catcaaacacccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacata 35270971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18731931 - 18731868
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  18731931 catcaaactcctccacacttgaatcttagcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 18731868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 20218981 - 20219044
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20218981 catcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagca 20219044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 22113006 - 22113069
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22113006 catcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagca 22113069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11204060 - 11204004
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11204060 catcaaactcccccacacttaaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 11204004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Original strand, 23517835 - 23517887
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  23517835 aaactcccccatacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcatacacat 23517887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 29686657 - 29686601
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  29686657 catcaaactctcccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaagaggcataaacat 29686601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29686489 - 29686449
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29686489 tattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgtg 29686449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 20595831 - 20596046
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595831 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20595930  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595931 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20596030  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  20596031 gtgtgtgtgaagtcca 20596046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 20602117 - 20602332
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602117 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20602216  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602217 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20602316  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  20602317 gtgtgtgtgaagtcca 20602332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 20608408 - 20608623
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608408 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20608507  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608508 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20608607  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  20608608 gtgtgtgtgaagtcca 20608623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15735749 - 15735534
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735749 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 15735650  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15735550  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  15735549 gtgtgtgtgaagtcca 15735534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 23710701 - 23710892
Alignment:
Q  44 tttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaatt-caattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710701 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 23710800  T
Q  143 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23710801 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttatttaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 23710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23748266 - 23748051
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23748266 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 23748167  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23748166 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 23748067  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  23748066 gtgtgtgtgaagtcca 23748051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24940749 - 24940540
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24940749 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 24940650  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24940649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtaaactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 24940550  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    || |||||||    
T  24940549 tgagtgtgtg 24940540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18073115 - 18072900
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18073115 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagca 18073017  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18073016 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgag 18072917  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18072916 tgtgtgtgtgaagtcca 18072900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 24953174 - 24953389
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24953174 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggtataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 24953272  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24953273 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 24953372  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24953373 tgtgtgtgtgaagtcca 24953389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20622359 - 20622170
Alignment:
Q  37 ttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaagggct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622359 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacaattaaatcaaatgacaatttaattaaagcacatgtctcctcaagggct 20622260  T
Q  137 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20622259 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtgtgtgtgt 20622170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 20790714 - 20790929
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20790714 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagca 20790812  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  20790813 catgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacctaacaatcaagtttcaagcgag 20790912  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20790913 tgtgtgtgtgaagtcca 20790929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 23600636 - 23600845
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||| | |    
T  23600636 catcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattagaac 23600735  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23600736 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 23600835  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  23600836 tgtgtgtgtg 23600845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24219961 - 24219752
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  24219961 catcaaactcccccacacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 24219862  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24219861 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 24219762  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  24219761 tgtgtgtgtg 24219752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 20444843 - 20445048
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagcacat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20444843 aaactcccccacacttgaatctttgattgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaaacacat 20444942  T
Q  122 gtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 221  Q
    |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20444943 gtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtg 20445042  T
Q  222 tgtgtg 227  Q
    ||||||    
T  20445043 tgtgtg 20445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21387605 - 21387410
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    || || |||||||||||||| ||| |    
T  21387605 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaatgcataaacatagcagcacacacaagactaacatatgacaattcaattgaaaac 21387506  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaag 213  Q
      |||||||||||| | |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21387505 ttatgtctcctcaaagactttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaag 21387410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Original strand, 20916456 - 20916660
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||     ||  || | ||||||| ||| ||| |     
T  20916456 catcaaactcccctacacatgaatttttggttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagctgcataaaataagattacataggacaattaaatcaaaact 20916555  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20916556 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaccgtacactaatcacgaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 20916655  T
Q  219 gtgtg 223  Q
    |||||    
T  20916656 gtgtg 20916660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22948685 - 22948518
Alignment:
Q  61 aaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaag-cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatc 159  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||    || || |||||||||||||||||  |  |||| | ||||| ||||| |||  |||  |||||||||||    
T  22948685 aaaaggcataaacatggcagcataaacacgattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgttttctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatc 22948586  T
Q  160 acaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22948585 acaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 22948518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20575633 - 20575510
Alignment:
Q  103 caattcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgat 202  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  20575633 caattcaatcaaaactcatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccgacaat 20575534  T
Q  203 caagtttcaagtgagtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  20575533 caagtttcaagtgagtgcgtgtgt 20575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 22317513 - 22317569
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22317513 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22317569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 25006808 - 25006864
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25006808 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 25006864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 30759655 - 30759711
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30759655 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 30759711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 18484212 - 18484275
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  18484212 catcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 18484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 25116171 - 25116221
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25116171 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 25116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 26847859 - 26847803
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26847859 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaccaaaaggcatagacat 26847803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 25175261 - 25175312
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaag-aaaaaggcat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25175261 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaaggcat 25175312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22855775 - 22855723
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22855775 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22855723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27270607 - 27270563
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27270607 atcaaactcccccacacttgaatcattgcttgtcctcaagcaaaa 27270563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Original strand, 22317639 - 22317719
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22317639 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22317719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22855651 - 22855572
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||   |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22855651 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtaa-acttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22855572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17412784 - 17412736
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggca 68  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17412784 atcaaactcccccatacttgaatcattgtttgtcgtcaagcaaaaggca 17412736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 25006934 - 25007012
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25006934 aatgtacactaatcataacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgt 25007012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 11496614 - 11496829
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496614 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 11496713  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496714 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 11496813  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  11496814 gtgtgtgtgaagtcca 11496829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13823128 - 13822913
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823128 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 13823029  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823028 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 13822929  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  13822928 gtgtgtgtgaagtcca 13822913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 42709731 - 42709940
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709731 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 42709830  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709831 catgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 42709930  T
Q  219 gtgtgtgtga 228  Q
    ||||||||||    
T  42709931 gtgtgtgtga 42709940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15254563 - 15254349
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  15254563 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacgtagttgcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 15254464  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15254463 catgtctccttaagggtttaaatccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 15254364  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcc 233  Q
    |||||||||| ||||    
T  15254363 gtgtgtgtgaagtcc 15254349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10630965 - 10630758
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10630965 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacatat-tatcatatgacaatttaattaaagc 10630867  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10630866 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 10630767  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||    
T  10630766 tgtgtgtgt 10630758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3354855 - 3354646
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  3354855 catcaaactcccccacacttgaatagttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 3354756  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3354755 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 3354656  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  3354655 tgtgtgtgtg 3354646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18292153 - 18291945
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  18292153 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagaaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 18292054  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18292053 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaagtcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 18291954  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
     ||||||||    
T  18291953 cgtgtgtgt 18291945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 18081459 - 18081669
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaca-aacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  18081459 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 18081558  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  18081559 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 18081658  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  18081659 gtgtgtgtgtg 18081669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 45234232 - 45234441
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  45234232 catcaaactcccccagacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtggcataaaacaagattatcatatgacaattaaattaaaac 45234331  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45234332 taatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaactatcaagtttcaagtgag 45234431  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  45234432 tgtgtgtgtg 45234441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 17484910 - 17485118
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  17484910 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaaacaagattatcacatgacaatttaattaaaac 17485009  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      ||||||||||| ||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17485010 ttatgtctcctcaggggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 17485109  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||    
T  17485110 tgtgtgtgt 17485118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 56580539 - 56580748
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |    |||||  |||||||| |||||||||    
T  56580539 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatctgacaattaaattaaagc 56580638  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||   ||||||| | ||||||    
T  56580639 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcatttttcaacccataaatcaagtcttaagtga 56580738  T
Q  217 gtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||    
T  56580739 gtgtgtgtgt 56580748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38426938 - 38426745
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||             ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  38426938 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa--taatat------------tatcatatgacaatttaattaaaaca 38426853  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38426852 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaagccaacaatcaagtttcaagtgagt 38426753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 8092427 - 8092634
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaag 116  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||    ||  | | |||||||||| | |||     
T  8092427 catcaaactttcccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaagacataaacatagtaacaataaacaagattaatatacgacaattcaactgaaaa 8092526  T
Q  117 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |  ||||||| | || |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  8092527 cttatgtctcattaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtga 8092626  T
Q  217 gtgtgtgt 224  Q
    ||||||||    
T  8092627 gtgtgtgt 8092634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 14653998 - 14654061
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14653998 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 14654061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15865701 - 15865647
Alignment:
Q  21 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15865701 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15865647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10650603 - 10650547
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10650603 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 10650547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 15260109 - 15260165
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  15260109 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcatagacat 15260165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 16682969 - 16682913
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16682969 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcatcaagcaaaaggcatagacat 16682913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15409585 - 15409534
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15409585 catcaaactcccccacactagaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15409534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 9488878 - 9488934
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9488878 catcaaactcccccatacttcaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatgaacat 9488934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Original strand, 17296250 - 17296298
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggca 68  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17296250 atcaaactcccccatgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 17296298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 225
Target Start/End: Original strand, 15260235 - 15260312
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  15260235 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtg 15260312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12515081 - 12515042
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12515081 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 12515042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 10602472 - 10602687
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602472 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 10602571  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602572 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 10602671  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  10602672 gtgtgtgtgaagtcca 10602687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 13504881 - 13505096
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13504881 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 13504980  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504981 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 13505080  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  13505081 gtgtgtgtgaagtcca 13505096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11947622 - 11947407
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11947622 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 11947523  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11947522 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaaatgagt 11947423  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  11947422 gtgtgtgtgaagtcca 11947407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 16448760 - 16448975
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16448760 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 16448859  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448860 catgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 16448959  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  16448960 gtgtgtgtgaagtcca 16448975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 15556942 - 15557157
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15556942 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagca 15557041  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557042 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15557141  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||| ||| |||||    
T  15557142 gtgtgtatgaagtcca 15557157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 9360971 - 9361186
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |    
T  9360971 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagga 9361070  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9361071 catgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 9361170  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  9361171 gtgtgtgtgaagtcca 9361186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7600570 - 7600355
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7600570 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 7600471  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7600470 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 7600371  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  7600370 gtgtgtgtgaagtcca 7600355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 16373565 - 16373780
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16373565 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 16373663  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16373664 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 16373763  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16373764 tgtgtgtgtgaagtcca 16373780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 12187076 - 12187291
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12187076 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 12187174  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12187175 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 12187274  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12187275 tgtgtgtgtgaagtcca 12187291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37942593 - 37942378
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37942593 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 37942495  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37942494 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcctgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 37942395  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37942394 tgtgtgtgtgaagtcca 37942378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 12193491 - 12193697
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 119  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12193491 atcaaactcccccatacctgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 12193589  T
Q  120 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12193590 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 12193689  T
Q  219 gtgtgtgt 226  Q
    ||||||||    
T  12193690 gtgtgtgt 12193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6815079 - 6814868
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 122  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6815079 aaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcacatg 6814981  T
Q  123 tctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814980 tctcctcaagggcataaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 6814881  T
Q  222 tgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||| |||||    
T  6814880 tgtgtgaagtcca 6814868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10147226 - 10147011
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10147226 catcaaactcccccatacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagca 10147128  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10147127 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 10147028  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10147027 tgtgtgtgtgaagtcca 10147011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15645216 - 15645001
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15645216 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagca 15645118  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15645117 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgag 15645018  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15645017 tgtgtgtgtgaagtcca 15645001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 10160173 - 10160388
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  10160173 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcgaatgacagtt-aattaaagca 10160271  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10160272 catgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 10160371  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10160372 tgtgtgtgtgaagtcca 10160388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 13187418 - 13187632
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13187418 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcac 13187516  T
Q  120 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13187517 atgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcgagtttcaagtgagt 13187616  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  13187617 gtgtgtgtgaagtcca 13187632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 3245589 - 3245795
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||| |      
T  3245589 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaactt 3245688  T
Q  120 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 219  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  3245689 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagta 3245788  T
Q  220 tgtgtgt 226  Q
    |||||||    
T  3245789 tgtgtgt 3245795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2721511 - 2721305
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    ||| | ||||||||||||||||| |     
T  2721511 catcaaactcccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattataatatgacaattcaattaaaact 2721413  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     |||||||||||| |||||  |   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2721412 tatgtctcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 2721313  T
Q  219 gtgtgtgt 226  Q
    ||||||||    
T  2721312 gtgtgtgt 2721305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13097919 - 13097711
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    ||    ||||||||| ||||||| ||    
T  13097919 catcaaactcccccacatttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 13097820  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13097819 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 13097720  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  13097719 gtgtgtgtg 13097711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4382961 - 4382751
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaca-aacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  4382961 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 4382862  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  4382861 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 4382762  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  4382761 gtgtgtgtgtg 4382751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 13001425 - 13001634
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  13001425 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 13001524  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  13001525 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 13001624  T
Q  217 gtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||    
T  13001625 gtgtgtgtgt 13001634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 10546936 - 10547148
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagtta-tatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  | || ||||| ||||||||| | |  ||||    
T  10546936 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacgatattatcatatgacaattaattcgaagc 10547035  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat--ttttattcaacccaacgatcaagtttcaagt 214  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  10547036 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttttcaacccaacaatcaagtcttaagt 10547135  T
Q  215 gagtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||||    
T  10547136 gagtgtgtgtgtg 10547148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 20156515 - 20156722
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||||| |    
T  20156515 catcaaactcccccacacttgaatctt-gcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagcataaacaagata-atcatatgacaattaaattaaaac 20156612  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
     ||||||||||||| |||||  ||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20156613 tcatgtctcctcaaaggcttttatttcaattttacactaatcacaagctcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgag 20156712  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  20156713 tgtgtgtgtg 20156722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1993011 - 1992803
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||||| ||||||||| ||||||| |     
T  1993011 catcaaactctctcccacttgaatctttgcttatgctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattaaattaaaact 1992912  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  1992911 tatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaactcaacaatcaaatttcaagtgagt 1992812  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  1992811 gtgtgtgtg 1992803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13690816 - 13690608
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    |||   ||||||||| ||||||| ||    
T  13690816 catcaaactcccccacacttgaatctttagttgtcatcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattatttcatgacaatttaattaaaaca 13690717  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13690716 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtccactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 13690617  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  13690616 gtgtgtgtg 13690608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11398424 - 11398215
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    || || | |||||||||||| ||| |    
T  11398424 catcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaacaagattaacatacgacaattcaattgaaaac 11398325  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      ||||||| |||| |||||  ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11398324 ttatgtctcttcaaaggcttttatttaaagcgtacactaatcataaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 11398225  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  11398224 tgtgtgtgtg 11398215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 14348588 - 14348797
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || || || |   || || ||||||||||||||||| |    
T  14348588 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatggtaacataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaac 14348687  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
       ||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  14348688 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccaaacaatcaagttctaagtgag 14348787  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  14348788 tgtgtgtgtg 14348797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22637908 - 22637702
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||    ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22637908 catcaaactcccctacacttgaatctttacttgtgctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaac 22637809  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      ||| |||||||| | |||  ||  |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22637808 ttatgcctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaacttaagcaattcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 22637709  T
Q  218 tgtgtgt 224  Q
    |||||||    
T  22637708 tgtgtgt 22637702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3279399 - 3279191
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||| |  | | || ||||||||| ||||||| |    
T  3279399 catcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcaacataaacaatacttaacatatgacaattaaattaaaac 3279300  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
       ||||||||||| | |||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  3279299 ttgtgtctcctcaaagacttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcgaacatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 3279200  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||    
T  3279199 tgtgtgtgt 3279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17388045 - 17387839
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||    |||||  |||||||||||||||| |    
T  17388045 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccttaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatgtgacaattcaattaaaac 17387946  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      || ||||||||| |||||  ||  |||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17387945 ttatatctcctcaaaggcttttatttcaagcacacactaatcacaaactcaagcaattcttgaaatctttattcaacccaacaatcaagtttaaagtgag 17387846  T
Q  218 tgtgtgt 224  Q
    |||||||    
T  17387845 tgtgtgt 17387839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 12160207 - 12160416
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  ||| |    ||||| ||||||||| ||||||||     
T  12160207 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtggcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaaga 12160306  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||  ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  12160307 acatgtctcctcaaatgtttttatttcaaagagtacactaataaaaaactcaagcatttcttgtaattctt-ttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 12160405  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  12160406 gtgtgtgtgtg 12160416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16655897 - 16655798
Alignment:
Q  136 ttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16655897 ttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 16655798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17045902 - 17045697
Alignment:
Q  27 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    || || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17045902 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17045803  T
Q  126 cctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 225  Q
    |||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  17045802 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17045706  T
Q  226 tgatgtcca 234  Q
    ||| |||||    
T  17045705 tgaagtcca 17045697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17048062 - 17047857
Alignment:
Q  27 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    || || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17048062 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17047963  T
Q  126 cctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 225  Q
    |||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  17047962 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17047866  T
Q  226 tgatgtcca 234  Q
    ||| |||||    
T  17047865 tgaagtcca 17047857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 27356728 - 27356784
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27356728 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 27356784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13601277 - 13601220
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacata 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13601277 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacata 13601220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 3339226 - 3339282
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3339226 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 3339282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 12776534 - 12776590
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12776534 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 12776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 13136210 - 13136266
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13136210 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 13136266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20584318 - 20584262
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20584318 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 20584262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15946824 - 15946773
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15946824 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15946773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 14445768 - 14445826
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  14445768 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcatagacatag 14445826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 15619283 - 15619339
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15619283 catcaaactgccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 15619339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 20225754 - 20225960
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 117  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |    || || |||||||  ||||| ||| |    
T  20225754 catcaaactcccccatacttaaatctttgtttgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagcataaataagattaacatatgacaaaacaattaaaaac 20225853  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      |||||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    ||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  20225854 ttatgtctcctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtga-acctattcaacccagc-aacaagtttcaagtaag 20225950  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  20225951 tgtgtgtgtg 20225960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 13195458 - 13195514
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13195458 catcaaactcccacacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacat 13195514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Original strand, 8686387 - 8686442
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaaca 74  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  8686387 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaagcataaaca 8686442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13068357 - 13068318
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13068357 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaa 13068318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 2005530 - 2005499
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgctt 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005530 catcaaactcccccacacttgaatctttgctt 2005499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13601108 - 13601062
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13601108 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 13601062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Original strand, 12776660 - 12776739
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12776660 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactt-attcaacccaacaa-caagtctcaagtgagtgtgtgtgtg 12776739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15946698 - 15946619
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||    
T  15946698 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatctcaagtgagtgtgtgtgtg 15946619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22665277 - 22665062
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665277 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22665178  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665177 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22665078  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  22665077 gtgtgtgtgaagtcca 22665062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 117758 - 117543
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  117758 catcaaactcccccacacttgcatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 117659  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117658 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 117559  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  117558 gtgtgtgtgaagtcca 117543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 22044660 - 22044875
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22044660 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 22044759  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22044760 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22044859  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  22044860 gtgtgtgtgaagtcca 22044875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25357726 - 25357511
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25357726 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 25357627  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25357626 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 25357527  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  25357526 gtgtgtgtgaagtcca 25357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 11615 - 11823
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  11615 catcaaactcccccacacttgcctctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 11714  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11715 catatctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 11814  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  11815 gtgtgtgtg 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16775866 - 16775651
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16775866 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 16775767  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16775766 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 16775667  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  16775666 gtgtgtgtgaagtcca 16775651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17590622 - 17590407
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17590622 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcagcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 17590523  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17590522 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttctggaaatctctattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 17590423  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||| ||||| |||||    
T  17590422 gtgtatgtgaagtcca 17590407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 24795285 - 24795500
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24795285 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtaccatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 24795384  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24795385 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 24795484  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  24795485 gtgtgtgtgaagtcca 24795500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27627796 - 27627580
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  27627796 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttgaatcaaatgacaaattaattaaagca 27627697  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcc-caaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27627696 catgtctcctcaagggcttaaatcctaaaatgtacattaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 27627597  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27627596 tgtgtgtgtgaagtcca 27627580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 25144757 - 25144966
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  25144757 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 25144856  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25144857 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 25144956  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  25144957 tgtgtgtgtg 25144966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 5500265 - 5500473
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5500265 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 5500364  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5500365 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcacgtaaaccttattcaactcaacaatcaagtttcaagtgag 5500464  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||    
T  5500465 tgtgtgtgt 5500473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 25804267 - 25804475
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    || || ||||||||||||||||| |     
T  25804267 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcacaaacaagattaacatatgacaattcaattaaaact 25804366  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     |||| ||||||| |||||  |   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25804367 tatgtatcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaaatttcaagtgagt 25804466  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    ||| |||||    
T  25804467 gtgcgtgtg 25804475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 23798922 - 23799129
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||     ||  || ||||||||||||| ||| |     
T  23798922 catcaaactcccccacacttgaatctttgattatcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaact 23799021  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23799022 catgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtatcctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 23799121  T
Q  219 gtgtgtgt 226  Q
    ||||||||    
T  23799122 gtgtgtgt 23799129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 25370890 - 25371091
Alignment:
Q  24 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagcaca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||||   ||||||||||||| ||| | ||    
T  25370890 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtaacaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaactca 25370986  T
Q  121 tgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgt 220  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25370987 tgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaattacaaactcaagcatttcttataatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtgt 25371086  T
Q  221 gtgtg 225  Q
    |||||    
T  25371087 gtgtg 25371091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23644160 - 23643950
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| |    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  23644160 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagc 23644061  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaa-atgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    || ||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| || ||||||| | |||||     
T  23644060 acgtgtctcctcaaaggcttttatttcaaggagtacactaatcacaaactcaagcatttcctgtaatcctttttcaaccctacaatcaagtcttaagtgg 23643961  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    ||| |||||||    
T  23643960 gtgcgtgtgtg 23643950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24502297 - 24502168
Alignment:
Q  99 atgacaattcaattaaag-cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaaccca 197  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24502297 atgacaattcaattaaaaacttatgtctcctcaaatgcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccca 24502198  T
Q  198 acgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24502197 acaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24502168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 24178193 - 24178348
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    ||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  24178193 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaatttaattaaaaac 24178292  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcat 173  Q
      ||||||||||||  ||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24178293 ttatgtctcctcaaaagcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcat 24178348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Original strand, 25337651 - 25337720
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca 88  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  25337651 catcaaattcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaatatagcagcataaaca 25337720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 23159385 - 23159441
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23159385 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 23159441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 23570642 - 23570698
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23570642 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 23570698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 27631711 - 27631655
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27631711 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27631655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 27768816 - 27768872
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27768816 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 27768872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24171561 - 24171510
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24171561 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 24171510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24506865 - 24506796
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  24506865 catcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagcataaaca 24506796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24321380 - 24321314
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaaca-tagtagcacaaaca 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  24321380 aaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcgtaaacattagtagcataaaca 24321314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 23257570 - 23257625
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23257570 catcaaactcccc-atacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 23257625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27631585 - 27631506
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  27631585 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgtg 27631506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23648165 - 23648123
Alignment:
Q  38 tgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtag 80  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  23648165 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagtag 23648123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 29955913 - 29955868
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaag 65  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29955913 atcaaacttcccgatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 29955868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15532792 - 15532753
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15532792 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 15532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 19805618 - 19805662
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 64  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  19805618 atcaaactcccccacactagaaccattgcttgtcctcaagcaaaa 19805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Original strand, 21512567 - 21512615
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggca 68  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21512567 atcaaattcccccatgcttgaatccttgcttgtcctcaagcaaaaggca 21512615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 24019228 - 24019267
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24019228 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24019267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15893 - 15678
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15893 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 15794  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15793 catgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15694  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  15693 gtgtgtgtgaagtcca 15678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27047089 - 27046874
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047089 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagctccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 27046990  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046989 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 27046890  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  27046889 gtgtgtgtgaagtcca 27046874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 17094601 - 17094816
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17094601 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagca 17094700  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094701 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 17094800  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  17094801 gtgtgtgtgaagtcca 17094816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 21798662 - 21798878
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21798662 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaatttaaagc 21798761  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21798762 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatttttattctacccaacgatcaagttttaagtgag 21798861  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21798862 tgtgtgtgtgaagtcca 21798878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20237671 - 20237456
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20237671 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatgcagtagcacaaataattttatcaaatgacaattcgattaaagca 20237572  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20237571 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaaccacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagctttaagtgagt 20237472  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    || ||||||| |||||    
T  20237471 gtttgtgtgaagtcca 20237456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8653327 - 8653126
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||   ||||||||||||| ||| | |    
T  8653327 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaatcaaaactc 8653231  T
Q  120 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 219  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  8653230 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgtgtg 8653131  T
Q  220 tgtgt 224  Q
    |||||    
T  8653130 tgtgt 8653126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 52938621 - 52938830
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||| ||| |    
T  52938621 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataatcatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaatc 52938720  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  52938721 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 52938820  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  52938821 tgtgtgtgtg 52938830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3990154 - 3989944
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  3990154 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 3990055  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaat-gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3990054 acatgtctcgtcaaaggcttttatttcaaagagtgcactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 3989955  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  3989954 gtgtgtgtgtg 3989944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19364244 - 19364043
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||     ||  || ||||||||||||| ||| |     
T  19364244 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagcagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaact 19364145  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  19364144 catgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccaacaatccagttctaagtgagt 19364045  T
Q  219 gt 220  Q
    ||    
T  19364044 gt 19364043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14070720 - 14070632
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaatt 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  14070720 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt 14070632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 19875648 - 19875702
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19875648 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 19875702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 21784472 - 21784535
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  21784472 catcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 21784535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4027895 - 4027832
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4027895 catcaaactcccccacccttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 4027832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 8947515 - 8947578
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  8947515 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaggaaaagacatagacatagcagca 8947578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Original strand, 16382578 - 16382631
Alignment:
Q  22 caaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16382578 caaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaataaacat 16382631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 21784598 - 21784677
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  21784598 aatgtacactaatcacaacttcaagtatttcttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 21784677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21382309 - 21382093
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaatt-caattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21382309 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagc 21382210  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382209 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 21382110  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21382109 tgtgtgtgtgaagtcca 21382093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 21098794 - 21099009
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21098794 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 21098893  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21098894 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagt 21098993  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  21098994 gtgtgtgtgaagtcca 21099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 21104115 - 21104330
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21104115 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 21104214  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21104215 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagt 21104314  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  21104315 gtgtgtgtgaagtcca 21104330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23911655 - 23911441
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23911655 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcgattaaagca 23911556  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23911555 catgtctcctcaagggcttaaatcccagatgtacactaatcacaaacttaaacatttcttgtaatttttattcaacccaa-gatcaaatttcaagtgagt 23911457  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    |||||||||| |||||    
T  23911456 gtgtgtgtgaagtcca 23911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8314683 - 8314467
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  8314683 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacatttaaatcaaatgacaattaaatttaaagc 8314584  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8314583 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgag 8314484  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8314483 tgtgtgtgtgaagtcca 8314467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 8322846 - 8323062
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  8322846 catcaaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttaaatcaaatgacaaattaattaaagca 8322945  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8322946 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 8323045  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8323046 tgtgtgtgtgaagtcca 8323062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 21843524 - 21843733
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  21843524 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 21843623  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21843624 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 21843723  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  21843724 tgtgtgtgtg 21843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 21939996 - 21940206
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||     || |||| ||||||||| |||||||||    
T  21939996 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagc 21940095  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaat-gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21940096 acatgtctcctcaaaggctttcatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtctgaagtga 21940195  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  21940196 gtgtgtgtgtg 21940206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 20038981 - 20039189
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||     |||| |||||| || || |||   |    
T  20038981 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagatcatcacatgacattttaactaagata 20039080  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20039081 catgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacaataatcacaaactcaagtatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 20039180  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  20039181 gtgtgtgtg 20039189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23455154 - 23454945
Alignment:
Q  19 catcaaactccccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaag 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    |  || |||||||||||||| |||     
T  23455154 catcaaactccccccacacttgaatctttgcttgtcctcgagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagactcacatatgacaattcaattgaaaa 23455055  T
Q  117 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
       |||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23455054 tttatgtctcctcaaaggctttcatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaatccaacaatcaagtttcaagtga 23454955  T
Q  217 gtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||    
T  23454954 gtgtgtgtgt 23454945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17620961 - 17620755
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    ||    ||||||||| ||||||| ||    
T  17620961 catcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 17620862  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17620861 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtaccctaatcataaactcaagcattctttgtaatcctttttcaa-ccaacaatcaagtttcaagtgagt 17620763  T
Q  219 gtgtgtgt 226  Q
    ||||||||    
T  17620762 gtgtgtgt 17620755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 16418620 - 16418830
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  |||||| |    
T  16418620 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaaac 16418719  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16418720 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 16418819  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  16418820 gtgtgtgtgtg 16418830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24034230 - 24034049
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagc-acaaac-agttatatcaaatgacaattcaatt-aaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||| || | ||  | |||||||||||||| |||    
T  24034230 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacgagat-taatatatgacaattcaattgaaa 24034132  T
Q  116 gcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 198  Q
     |  |||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24034131 acttatgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactgatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 24034049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 14352181 - 14352378
Alignment:
Q  30 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaa-ttaaagcacatgtctcc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| | || || | ||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  14352181 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaacaagata-attatatgacaattaaaattaaaactcatgtctcc 14352279  T
Q  128 tcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 226  Q
    ||   |||||  ||  |||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14352280 tccgaggcttttatttcaagcgtacactaattactaactcaagcattctttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgt 14352378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21538765 - 21538573
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21538765 catcaaaatcccccacacttaaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaac 21538666  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacac--taatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtt 208  Q
      |||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21538665 ttatgtctcctcaaagactttaatttcaatcgtacactataatcacaaactccagggtttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtt 21538573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20712649 - 20712537
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  20712649 catcaaactcccctacacttaaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaacattatcatatgacaatttaatcaaagc 20712550  T
Q  118 acatgtctcctca 130  Q
    |||||||||||||    
T  20712549 acatgtctcctca 20712537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 11346953 - 11347009
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11346953 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 11347009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19767740 - 19767684
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19767740 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 19767684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22370158 - 22370102
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22370158 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22370102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20002330 - 20002279
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20002330 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 20002279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20712539 - 20712470
Alignment:
Q  158 tcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20712539 tcacaaactcaatcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtctcaaatgagtgtgtgtgtg 20712470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 22033555 - 22033611
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22033555 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22033611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 22099655 - 22099711
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22099655 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatagacat 22099711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22102608 - 22102552
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22102608 catcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 22102552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21831232 - 21831181
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21831232 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 21831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22817806 - 22817755
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  22817806 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaagacata 22817755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22102482 - 22102403
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22102482 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgcgtgtgtg 22102403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Original strand, 18572977 - 18573025
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggca 68  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  18572977 atcaaactcccccatacttgaattttttcttgtccttaagcaaaaggca 18573025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 615 - 831
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  615 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaagcataaatatggtagcacaaacaattttatcaaatcacaattcgattaaagca 714  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag-tttcaagtgag 217  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  715 caagtctcctcaagggattaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttttaagtgag 814  T
Q  218 tgtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    ||||||||||| |||||    
T  815 tgtgtgtgtgaagtcca 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1038
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1253 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 1154  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1153 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 1054  T
Q  219 gtgtgtgtgatgtcca 234  Q
    || ||||||| |||||    
T  1053 gtatgtgtgaagtcca 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3524 - 3461
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3524 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagca 3461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 220
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||  ||||||||| |||||||  |    
T  428 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcgtatgacaatttaattaaaata 329  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  328 catgtctcctcaagggctttaatttaaagcgtacactaatcacaaactgaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 229  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  228 gtgtgtgtg 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 2852 - 3058
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2852 catcaaactcccacatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 2951  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2952 acatgtctccttaagggctttaatttcatgtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 3051  T
Q  218 tgtgtgt 224  Q
    |||||||    
T  3052 tgtgtgt 3058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 251870 - 252079
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |  |||||  |||||||| ||||||| |    
T  251870 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaatggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatttgacaatttaattaaaac 251969  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  251970 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactagtcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagttccaagtgag 252069  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  252070 tgtgtgtgtg 252079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11264 - 11064
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11264 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 11165  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11164 catgtctcctcaagggctttaattttaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaaaaattaagtttcaagtgagt 11065  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  11064 g 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 14662 - 14869
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  14662 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgaaaatttaattaaaaca 14761  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14762 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacattattcataaactcaagcatttcttgtaaaccttatgaaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 14861  T
Q  219 gtgtgtgt 226  Q
    ||||||||    
T  14862 gtgtgtgt 14869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 2287 - 2496
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  2287 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 2386  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  2387 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 2486  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  2487 tgtgtgtgtg 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 831
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  1041 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaattaacattatcatatgacaattaaattaaagc 942  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  941 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 842  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  841 gtgtgtgtgtg 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 687 - 482
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |||||    ||||| |||||||||||||||||       
T  687 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgtataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaatt 588  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     ||||||||||||  ||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  587 aatgtctcctcaaaagcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaaccattttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 488  T
Q  219 gtgtgt 224  Q
    ||||||    
T  487 gtgtgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8149 - 7941
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||     || | |||||| || || |||| ||    
T  8149 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaagcaaaaggcataaacacggtagcataaacaagatcattacatgacattttaactaaaaca 8050  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
    |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8049 catgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacactaatcacaaactcgagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 7950  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  7949 gtgtgtgtg 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 121162 - 120954
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaa-atgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    ||| |  | ||||||||| |||| || |    
T  121162 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatatttttatatgacaatttaattgaaac 121063  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||||| |||||| |    
T  121062 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaaaccttattcaacccaacaaccaagttccaagtgtg 120963  T
Q  218 tgtgtgtgt 226  Q
    |||||||||    
T  120962 tgtgtgtgt 120954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 58628 - 58838
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  ||||||||    
T  58628 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagc 58727  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  58728 acatgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaaccatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 58827  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  58828 gtgtgtgtgtg 58838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 164403 - 164562
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcac-aaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  164403 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 164502  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttct 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  164503 acatgtctcctcaagggcttcaatttaaagcgcacactaatcacaaactcaagcatttct 164562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 172316 - 172248
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaaca 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  172316 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaaca 172248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 162058 - 161995
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  162058 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 161995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1108
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  ||||| ||    
T  1318 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaggc 1219  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  1218 acatgtcccctcaaaggcttttatttcaaagagtacattaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 1119  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||    
T  1118 gtgtgtgtgtg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 97726 - 97936
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  ||||||||    
T  97726 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagc 97825  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 216  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  97826 acatgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 97925  T
Q  217 gtgtgtgtgtg 227  Q
    || ||||||||    
T  97926 gtatgtgtgtg 97936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 510 - 718
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||     ||  || ||||||||||||| ||| |     
T  510 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaact 609  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     || ||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  610 tatatctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 709  T
Q  219 gtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||    
T  710 gtgtgtgtg 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 13002 - 13207
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||    ||||| || | |||||||||||| |     
T  13002 catcaaactccgccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaagaggcataaacatagtagcataaccaagattatcatataataattcaattaaaact 13101  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 218  Q
     |||||| ||||| |||||  ||  ||   ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13102 tatgtcttctcaaaggcttttatttcatgcgtacactaataccatactcaagcatttcttgtaatctttattaaacccaagaatcaagtttcaagtgagt 13201  T
Q  219 gtgtgt 224  Q
    | ||||    
T  13202 gcgtgt 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 10206 - 10325
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  10206 catcaaactcccccaaacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 10305  T
Q  118 acatgtctcctcaagggctt 137  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10306 acatgtctcctcaagggctt 10325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12609 - 12450
Alignment:
Q  21 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagc-acaaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||   ||||||||||||| |||      
T  12609 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaat 12513  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 180  Q
     ||||||||||||| | |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512 tcatgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 232789 - 232948
Alignment:
Q  21 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagc-acaaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||   ||||||||||||| |||      
T  232789 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaat 232885  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 180  Q
     ||||||||||||| | |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232886 tcatgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 232948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 35104 - 35307
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||        | |||||||||||| |||| ||    
T  35104 catcaaactcccccacacttgaatctttccttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca--------agatgacaattcaactaaaaca 35195  T
Q  119 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaa------tttttattcaacccaacgatcaagtttcaa 212  Q
    ||||||||||  | ||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||      ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  35196 catgtctcctttaaggctttaatttcaagtgtacagtaatcacaaactcaagcattcttggtaatcttttttttttttcaacccaacaatgaagtttcaa 35295  T
Q  213 gtgagtgtgtgt 224  Q
     |||||||||||    
T  35296 atgagtgtgtgt 35307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8869 - 8720
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  8869 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 8770  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaact 166  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  8769 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaact 8720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 38508 - 38610
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagtta-tatcaaatgacaattcaattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |  || ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  38508 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcacaaaaaaatattatcatatgacaatttaattaaaac 38607  T
Q  118 aca 120  Q
    |||    
T  38608 aca 38610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 149 - 199
Target Start/End: Original strand, 38625 - 38675
Alignment:
Q  149 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  38625 gtacattaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaac 38675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5295 - 5090
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattc-aattaaagc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  || |   ||| || |||||||||| ||| |||||    
T  5295 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagcaataaaaaagataacatatgacaattcaaataaaagc 5196  T
Q  118 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 217  Q
      |||||||||| | || || | | |  ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  5195 ttatgtctcctctaaggtttcatttc--aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaacaat-aagtctcaagtgag 5100  T
Q  218 tgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||    
T  5099 tgtgtgtgtg 5090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2926 - 2859
Alignment:
Q  160 acaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2926 acaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42300 - 42237
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  42300 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 42237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 50506 - 50569
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  50506 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 50569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 912
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  970 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatag 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2818 - 2762
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2818 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2692 - 2612
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||||    
T  2692 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacatgtcttaagtgagtgtgtgtgtg 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 12794 - 12743
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12794 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 82
Target Start/End: Original strand, 22159 - 22218
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  22159 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagca 22218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37922 - 37722
Alignment:
Q  23 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacat 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||    ||  | |||||||||||||| ||| |  ||    
T  37922 aaactcccccacacttgaatcttttcttgccctcaagcaaaagccataaacatagcaacataaacaaaattaaaatatgacaattcaattaaaatcttat 37823  T
Q  122 gtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 221  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  |    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37822 gtctcctcaaaggctt-aatttcaagtgtacactaatcacaacatcaagtattccttgcga-acctattcaacccaac-aacaagtttcaagtgagtgtg 37726  T
Q  222 tgtg 225  Q
    ||||    
T  37725 tgtg 37722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18263 - 18218
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18263 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 18218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1902 - 1834
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcacaaac 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1902 catcaaactcccccacacttgaatctttgattgttctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaac 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 10776 - 10720
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10776 catcaaactcccccacactttaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 10720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 54849 - 54905
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54849 catcaaactcccccacgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacat 54905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 37743 - 37806
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  37743 catcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaatagacatagcagca 37806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 37869 - 37948
Alignment:
Q  146 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  37869 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-atcaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1193
Alignment:
Q  20 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1248 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacat 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1080 - 1041
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1080 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22818 - 22756
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  22818 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaag-caaaggcatagacatagcagca 22756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 45228 - 45291
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagca 82  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  45228 catcaaactcccccacacctgaatctttgcttgttctcaagcaaaagacatagacatagcagca 45291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 72572 - 72622
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  72572 catcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 72622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 84762 - 84812
Alignment:
Q  19 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  84762 catcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 84812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 83174 - 83214
Alignment:
Q  35 acttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacat 75  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  83174 acttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacat 83214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 5830 - 5869
Alignment:
Q  187 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5830 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University