View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10201A_low_42 (Length: 370)

Name: NF10201A_low_42
Description: NF10201A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10201A_low_42
NF10201A_low_42
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (150-370)||(44241358-44241579)
chr1 (150-370)||(29001732-29001953)
chr1 (150-370)||(9869106-9869327)
chr1 (150-370)||(31072319-31072540)
chr1 (148-370)||(4599529-4599753)
chr1 (150-370)||(1174606-1174828)
chr1 (150-370)||(6238656-6238877)
chr1 (150-370)||(39053338-39053559)
chr1 (150-370)||(39059710-39059931)
chr1 (150-370)||(42091897-42092118)
chr1 (150-370)||(45015782-45016003)
chr1 (150-370)||(26621470-26621692)
chr1 (150-370)||(41305514-41305736)
chr1 (150-367)||(44916334-44916560)
chr1 (150-367)||(11913262-11913479)
chr1 (150-370)||(41297517-41297739)
chr1 (181-370)||(27240161-27240352)
chr1 (150-370)||(43686628-43686851)
chr1 (150-370)||(32797737-32797945)
chr1 (150-370)||(1115982-1116205)
chr1 (150-370)||(41299188-41299410)
chr1 (239-370)||(23764521-23764653)
chr1 (214-370)||(5445028-5445184)
chr1 (155-370)||(28413678-28413895)
chr1 (150-229)||(23762336-23762415)
chr1 (172-370)||(38672788-38672989)
chr1 (155-370)||(39806058-39806274)
chr1 (155-367)||(2824824-2825037)
chr1 (159-285)||(47646755-47646883)
chr1 (156-297)||(23251426-23251568)
chr1 (155-262)||(5357752-5357861)
chr1 (155-262)||(45620149-45620258)
chr1 (154-198)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (150-370)||(2646-2867)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (150-370)||(37026049-37026270)
chr7 (150-370)||(26601913-26602134)
chr7 (150-370)||(15914639-15914860)
chr7 (150-370)||(39432909-39433129)
chr7 (150-370)||(15949160-15949381)
chr7 (150-370)||(3924093-3924314)
chr7 (150-370)||(36875546-36875767)
chr7 (150-370)||(5049912-5050133)
chr7 (150-370)||(14287716-14287937)
chr7 (150-370)||(14298901-14299122)
chr7 (150-370)||(6795439-6795660)
chr7 (150-370)||(23612390-23612611)
chr7 (150-370)||(9642916-9643139)
chr7 (150-370)||(1948633-1948855)
chr7 (150-367)||(2446650-2446868)
chr7 (150-370)||(6020864-6021086)
chr7 (150-370)||(8185392-8185614)
chr7 (150-370)||(8192952-8193174)
chr7 (150-370)||(48353480-48353702)
chr7 (150-354)||(21642535-21642740)
chr7 (153-370)||(45433586-45433805)
chr7 (150-370)||(19089808-19090030)
chr7 (150-370)||(48347096-48347318)
chr7 (150-370)||(33850643-33850864)
chr7 (150-370)||(5056307-5056529)
chr7 (150-370)||(1378948-1379169)
chr7 (150-370)||(8142446-8142667)
chr7 (7-152)||(42422112-42422257)
chr7 (155-370)||(10831130-10831347)
chr7 (155-370)||(11024922-11025139)
chr7 (150-224)||(13774130-13774204)
chr7 (155-370)||(21901193-21901411)
chr7 (321-370)||(1942046-1942095)
chr7 (155-216)||(27954243-27954303)
chr7 (155-198)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (150-370)||(13671817-13672038)
chr6 (150-369)||(27670096-27670316)
chr6 (150-370)||(31547896-31548117)
chr6 (150-370)||(32328493-32328714)
chr6 (150-370)||(1428423-1428644)
chr6 (150-370)||(34711557-34711778)
chr6 (150-370)||(9864760-9864982)
chr6 (150-370)||(4186686-4186907)
chr6 (150-370)||(11058150-11058371)
chr6 (150-369)||(21262574-21262795)
chr6 (150-370)||(4020235-4020457)
chr6 (150-370)||(4026661-4026883)
chr6 (150-370)||(34655251-34655473)
chr6 (150-370)||(34648800-34649022)
chr6 (150-370)||(4738323-4738545)
chr6 (150-362)||(7069702-7069916)
chr6 (217-370)||(29906891-29907045)
chr6 (217-370)||(30117335-30117489)
chr6 (245-370)||(7062578-7062705)
chr6 (150-293)||(1167480-1167630)
chr6 (150-212)||(7062516-7062578)
chr6 (155-348)||(10081567-10081762)
chr6 (155-291)||(9846601-9846738)
chr6 (150-187)||(29907044-29907081)
chr6 (150-187)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (150-370)||(4973564-4973785)
chr5 (150-370)||(22359965-22360186)
chr5 (150-370)||(22313831-22314052)
chr5 (150-370)||(5876219-5876440)
chr5 (150-370)||(34357288-34357509)
chr5 (150-370)||(34359079-34359300)
chr5 (150-370)||(2957859-2958081)
chr5 (150-370)||(2966328-2966550)
chr5 (150-370)||(29980460-29980681)
chr5 (150-370)||(30041244-30041465)
chr5 (150-370)||(40958617-40958838)
chr5 (150-370)||(25894649-25894871)
chr5 (150-370)||(2438802-2439022)
chr5 (150-367)||(12505765-12505991)
chr5 (152-370)||(42150819-42151039)
chr5 (150-370)||(29414669-29414890)
chr5 (155-370)||(33794093-33794309)
chr5 (155-370)||(9843350-9843566)
chr5 (155-370)||(2156125-2156339)
chr5 (159-261)||(19853484-19853588)
chr5 (155-262)||(12918955-12919064)
chr5 (155-262)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (150-370)||(21341882-21342103)
chr2 (150-369)||(2021448-2021668)
chr2 (150-370)||(21331994-21332215)
chr2 (150-370)||(42931372-42931593)
chr2 (150-370)||(16856487-16856707)
chr2 (150-370)||(12950797-12951018)
chr2 (150-370)||(16817330-16817550)
chr2 (150-370)||(36782184-36782406)
chr2 (150-370)||(34834812-34835033)
chr2 (150-370)||(34841256-34841477)
chr2 (150-370)||(29484927-29485149)
chr2 (150-370)||(45011983-45012205)
chr2 (150-370)||(15852550-15852772)
chr2 (150-370)||(43267859-43268081)
chr2 (150-370)||(2157613-2157834)
chr2 (150-370)||(2164029-2164250)
chr2 (150-370)||(13901957-13902178)
chr2 (150-370)||(21067958-21068179)
chr2 (150-299)||(45700644-45700793)
chr2 (155-370)||(41455607-41455823)
chr2 (150-314)||(11909950-11910116)
chr2 (155-314)||(17784443-17784604)
chr2 (159-297)||(13162892-13163032)
chr2 (155-314)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (150-370)||(55462772-55462993)
chr4 (150-370)||(16405343-16405568)
chr4 (150-370)||(16838359-16838579)
chr4 (150-370)||(27590306-27590527)
chr4 (150-370)||(41372987-41373209)
chr4 (151-370)||(37368315-37368536)
chr4 (150-370)||(13594107-13594330)
chr4 (150-370)||(7780408-7780629)
chr4 (150-370)||(8103882-8104104)
chr4 (150-370)||(30238261-30238482)
chr4 (150-370)||(17456855-17457077)
chr4 (150-367)||(36754791-36755017)
chr4 (150-337)||(30211536-30211724)
chr4 (150-297)||(5660549-5660696)
chr4 (173-368)||(13003809-13004006)
chr4 (155-370)||(2947846-2948062)
chr4 (276-370)||(48914900-48914996)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (150-370)||(12768745-12768966)
chr8 (150-370)||(11358193-11358415)
chr8 (150-370)||(7311350-7311571)
chr8 (150-370)||(8013320-8013541)
chr8 (150-370)||(36005482-36005703)
chr8 (150-370)||(36425730-36425952)
chr8 (150-370)||(6464576-6464797)
chr8 (150-370)||(36075968-36076189)
chr8 (150-366)||(15012393-15012610)
chr8 (150-370)||(36021799-36022021)
chr8 (150-370)||(41242116-41242337)
chr8 (150-370)||(1238214-1238436)
chr8 (150-370)||(16710668-16710890)
chr8 (150-293)||(26250591-26250734)
chr8 (150-370)||(31017400-31017608)
chr8 (150-337)||(45068416-45068604)
chr8 (155-370)||(7933931-7934148)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (150-370)||(4311486-4311707)
chr3 (150-370)||(10941304-10941525)
chr3 (150-370)||(32746371-32746592)
chr3 (150-370)||(6036267-6036488)
chr3 (150-370)||(24179074-24179296)
chr3 (150-370)||(9570548-9570771)
chr3 (150-370)||(27501967-27502189)
chr3 (150-370)||(13014987-13015208)
chr3 (150-370)||(9577050-9577273)
chr3 (150-367)||(43995073-43995300)
chr3 (150-370)||(25893231-25893458)
chr3 (150-370)||(43931583-43931799)
chr3 (150-370)||(23068465-23068686)
chr3 (160-297)||(20651135-20651272)
chr3 (246-370)||(41353862-41353987)
chr3 (222-370)||(41354142-41354291)
chr3 (155-370)||(4590795-4591012)
chr3 (306-370)||(3577095-3577159)
chr3 (155-370)||(20952759-20952984)
chr3 (155-262)||(4644354-4644463)
chr3 (155-212)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (150-370)||(49692-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (150-367)||(15175-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (150-370)||(5005-5226)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (150-367)||(3264-3481)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (150-370)||(8881-9103)
scaffold0510 (150-370)||(2560-2782)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (150-291)||(12014-12155)
scaffold0513 (308-370)||(11951-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (266-370)||(99915-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (173-368)||(24268-24465)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44241579 - 44241358
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44241579 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 44241480  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44241479 aatgaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttcatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 44241380  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44241379 aatgatatttggtgtcgaacgg 44241358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29001953 - 29001732
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29001953 tattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgacc 29001854  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29001853 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 29001754  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29001753 aatgatatttggtgtcgaacgg 29001732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9869327 - 9869106
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9869327 tattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 9869228  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  9869227 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagtcattaaaacaaactaccaattatcttttaacttag 9869128  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9869127 aatgatatttggtgtcgaacgg 9869106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31072540 - 31072319
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31072540 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 31072441  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  31072440 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttagcttag 31072341  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31072340 aatgatatttggtgtcgaacgg 31072319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 148 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4599753 - 4599529
Alignment:
Q  148 agtattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4599753 agtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaa 4599654  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaact 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  4599653 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaact 4599554  T
Q  346 tagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4599553 tagaatgatatttggtgtcgaacgg 4599529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1174828 - 1174606
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1174828 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgctc 1174729  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  1174728 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaactta 1174629  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1174628 gaatgatatttggtgtcgaacgg 1174606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6238877 - 6238656
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6238877 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6238778  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  6238777 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6238678  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6238677 aatgatatttggtgtcgaacgg 6238656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 39053338 - 39053559
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39053338 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39053437  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  39053438 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39053537  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39053538 aatgatatttggtgtcgaacgg 39053559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 39059710 - 39059931
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39059710 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39059809  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  39059810 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39059909  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39059910 aatgatatttggtgtcgaacgg 39059931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42092118 - 42091897
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42092118 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 42092019  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  42092018 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 42091919  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42091918 aatgatatttggtgtcgaacgg 42091897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45016003 - 45015782
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45016003 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 45015904  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  45015903 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 45015804  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45015803 aatgatatttggtgtcgaacgg 45015782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26621692 - 26621470
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26621692 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 26621593  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  26621592 aaggaaccctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 26621493  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26621492 gaatgatatttggtgtcgaacgg 26621470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 41305514 - 41305736
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  41305514 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttaatc 41305613  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  41305614 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttaaactta 41305713  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41305714 gaatgatatttggtgtcgaacgg 41305736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 44916560 - 44916334
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |     
T  44916560 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgtttggtt 44916461  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtc 340  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |     
T  44916460 aaggaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagttaacttagtttttaaaacaaacaacaaactatcttt 44916361  T
Q  341 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44916360 taatttagaatgatatttggtgtcgaa 44916334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 11913262 - 11913479
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  11913262 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacatgtgatgcttggtc 11913361  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtct-aactt 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   || |||||||| |||||  |||| | | |||||    
T  11913362 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttag---tttaaacaaacaaacaatctatcttttaaactt 11913458  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913459 agaatgatatttggtgtcgaa 11913479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41297739 - 41297517
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  41297739 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 41297640  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  ||||||    
T  41297639 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 41297540  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  41297539 gaatgatatttggagtcgaacgg 41297517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 181 - 370
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240352
Alignment:
Q  181 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgcc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgcc 27240260  T
Q  281 ttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27240261 ttattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttggaatggtatttggtgtcgaacgg 27240352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43686851 - 43686628
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  43686851 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttaaatgagacgctcgatc 43686752  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtctaactt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  | ||||||    
T  43686751 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 43686652  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  43686651 ggaatggtatttggtgtcgaacgg 43686628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32797945 - 32797737
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  32797945 tattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 32797846  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||            |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32797845 aaggaactctaatcctaacaagtttttacgccctattactc------------ttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 32797759  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32797758 aatgatatttggtgtcgaacgg 32797737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 1115982 - 1116205
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggt---gttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttg 246  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1115982 tattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttg 1116081  T
Q  247 atcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaact 345  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||||    
T  1116082 attaaggaactctaatcataagaagtttcacaccttattactctcaacttttactcttgcaacttagttact-aaacaaacaacaaattagcttttaact 1116180  T
Q  346 tagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1116181 tagaatgatatttggtgtcgaacgg 1116205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 41299188 - 41299410
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41299188 tattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 41299287  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  41299288 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 41299387  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41299388 gaatgatatttggtgtcgaacgg 41299410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 239 - 370
Target Start/End: Original strand, 23764521 - 23764653
Alignment:
Q  239 gacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23764521 gacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc 23764620  T
Q  338 gtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764621 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 23764653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Original strand, 5445028 - 5445184
Alignment:
Q  214 catgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttag 312  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5445028 catgtatggtcattaggttatgtgtgaggcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaacttttactcttgcaacttag 5445127  T
Q  313 ttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5445128 ttactaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttagaatgatagttggtgtcgaacgg 5445184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 28413678 - 28413895
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  28413678 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattggtaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 28413777  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28413778 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 28413876  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28413877 gatatttggtgtcgaacgg 28413895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 23762336 - 23762415
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23762336 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 370
Target Start/End: Original strand, 38672788 - 38672989
Alignment:
Q  172 ttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaaca 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || || || ||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||      
T  38672788 ttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaaggaactctaattccaatg 38672887  T
Q  270 agtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt-ctaacttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  38672888 ttttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatctttcaaacttagaatgatatttggtgtcgaa 38672986  T
Q  368 cgg 370  Q
    |||    
T  38672987 cgg 38672989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39806274 - 39806058
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39806274 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 39806175  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||    
T  39806174 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaatttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatc-tttaacttaaaat 39806077  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  39806076 gatatttggtgtcaaacgg 39806058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 367
Target Start/End: Original strand, 2824824 - 2825037
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||| ||| ||||  || ||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  2824824 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatgggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcataatcaag 2824923  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  2824924 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaactttcacttttatacttggttactaaaacaaacaacatattatcttttaacttagaatg 2825022  T
Q  353 atatttggtgtcgaa 367  Q
    |||||||||||||||    
T  2825023 atatttggtgtcgaa 2825037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47646883 - 47646755
Alignment:
Q  159 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 256  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||  |||| |||| ||||    
T  47646883 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatccgtatatgtgatcattaggttatatgtgattcttggtcaacgaac 47646784  T
Q  257 tctaatactaacaagtttcacgccttatt 285  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47646783 tctaatcataacaagttttacgccttatt 47646755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23251568 - 23251426
Alignment:
Q  156 ttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat--gatcattagattacgtgtgacgcttgatcaagg 253  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  23251568 ttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaagg 23251469  T
Q  254 aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    ||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23251468 aactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttt 23251426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 5357752 - 5357861
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5357752 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattgggaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 5357851  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  5357852 gaactctaat 5357861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 45620149 - 45620258
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||    
T  45620149 tttggacacgaataatcttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgaagcttaatcaag 45620248  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  45620249 gaactctaat 45620258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9316181 - 9316137
Alignment:
Q  154 gtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9316181 gtttggacacgaatgatgttgttgagcaatatgtgataatatcaa 9316137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2646
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867 tattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 2768  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2767 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcagcttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2668  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2667 aatgatatttggtgtcgaacgg 2646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37026270 - 37026049
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37026270 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 37026171  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37026170 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttacaacttagttagtcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 37026071  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37026070 aatgatatttggtgtcgaacgg 37026049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26602134 - 26601913
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26602134 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattaggttatgtgtgacgcttgatc 26602035  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26602034 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 26601935  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26601934 aatgatatttggtgtcgaacgg 26601913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15914860 - 15914639
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15914860 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 15914761  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15914760 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15914661  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15914660 aatgatatttggtgtcgaacgg 15914639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39433129 - 39432909
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433129 tattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 39433030  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttaga 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39433029 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaactttatcatttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaga 39432930  T
Q  350 atgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  39432929 atgatatttgttgtcgaacgg 39432909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15949381 - 15949160
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||    
T  15949381 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatatgcgacgcttgatc 15949282  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15949281 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15949182  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15949181 aatgatatttggtgtcgaacgg 15949160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 3924093 - 3924314
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3924093 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 3924192  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  3924193 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 3924292  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  3924293 aatgatatttggtatcgaacgg 3924314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36875767 - 36875546
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36875767 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36875668  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  36875667 aaggaactccaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 36875568  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36875567 aatgatatttggtgtcgaacgg 36875546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 5049912 - 5050133
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5049912 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5050011  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| |||||| |    
T  5050012 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttgg 5050111  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5050112 aatgatatttggtgtcgaacgg 5050133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14287937 - 14287716
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14287937 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14287838  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14287837 aaggaactctaatcctaacaagatttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14287738  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14287737 aatgatatttggtgtcgaacgg 14287716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14299122 - 14298901
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14299122 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14299023  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14299022 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14298923  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  14298922 aatgatatttggtgtcaaacgg 14298901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6795660 - 6795439
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6795660 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6795561  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  6795560 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6795461  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6795460 aatgatatttggtgtcgaacgg 6795439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23612611 - 23612390
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23612611 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 23612512  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  23612511 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgtaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 23612412  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  23612411 aatgatatttcgtgtcgaacgg 23612390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 9642916 - 9643139
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9642916 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9643015  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtctaactt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  | ||||||    
T  9643016 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 9643115  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9643116 agaatgatatttggtgtcgaacgg 9643139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 1948633 - 1948855
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  1948633 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatt 1948732  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  1948733 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 1948832  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  1948833 gaatgatatttggtgttgaacgg 1948855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2446868 - 2446650
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2446868 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2446769  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  2446768 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2446669  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2446668 aatgatatttggtgtcgaa 2446650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 6020864 - 6021086
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020864 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 6020963  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  6020964 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 6021063  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  6021064 gaatggtatttggtgtcgaacgg 6021086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 8185392 - 8185614
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8185392 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8185491  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  8185492 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8185591  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  8185592 gaatggtatttggtgtcgaacgg 8185614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 8192952 - 8193174
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8192952 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8193051  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  8193052 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8193151  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  8193152 gaatggtatttggtgtcgaacgg 8193174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 48353480 - 48353702
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48353480 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48353579  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  48353580 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48353679  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  48353680 gaatggtatttggtgtcgaacgg 48353702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21642740 - 21642535
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21642740 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcattaggttatgtgtgatgcttgatc 21642641  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21642640 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 21642541  T
Q  349 aatgat 354  Q
    ||||||    
T  21642540 aatgat 21642535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 153 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45433805 - 45433586
Alignment:
Q  153 tgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45433805 tgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgattaag 45433706  T
Q  253 gaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaa 350  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45433705 gaactctaatcctaacaagtttttacgccttattactctcaacttttactcttgaaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaa 45433606  T
Q  351 tgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45433605 tgatatttggtgtcgaacgg 45433586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19090030 - 19089808
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19090030 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 19089931  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  19089930 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 19089831  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19089830 gaatgatatttggtgtcgaacgg 19089808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 48347096 - 48347318
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48347096 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48347195  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  48347196 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48347295  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  48347296 gaatggtatttggtgtcgaacgg 48347318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 33850643 - 33850864
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  33850643 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 33850742  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  33850743 aaggaactctaatcctaacaagtttaacgccttactactctcaacttttactattgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattgacttttaacttag 33850842  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  33850843 aatgatatttggtgtcaaacgg 33850864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 5056307 - 5056529
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5056307 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5056406  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| | | ||||     
T  5056407 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 5056506  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  5056507 aaatgataattggtgtcgaacgg 5056529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1379169 - 1378948
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1379169 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1379070  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  1379069 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1378970  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1378969 aatgatatttggtgtcgaacgg 1378948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 8142446 - 8142667
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8142446 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8142545  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  8142546 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgtaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8142645  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8142646 aatgatatttggtgtcgaacgg 8142667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42422257 - 42422112
Alignment:
Q  7 gagagcatgtagctcttgtgctgctttgaaaatagtccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaacacaacgcttatcact 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  42422257 gagagcatgtagctcttgtgctgttgtgaaaatattccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaatgcagcgcttatcact 42422158  T
Q  107 ccttggtggtctacaaagtaaatgtcaatcttaaaagttatagtat 152  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42422157 tcttagtggcctacaaagcaaatggcaatcttaaaagttatagtat 42422112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831347
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10831130 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10831229  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10831230 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 10831328  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10831329 gatatttggtgtcgaacgg 10831347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 11024922 - 11025139
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11024922 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 11025021  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11025022 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 11025120  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11025121 gatatttggtgtcgaacgg 11025139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Original strand, 13774130 - 13774204
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774130 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 13774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 21901193 - 21901411
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21901193 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaag 21901292  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtctaacttagaa 350  Q
    ||||||| || |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  21901293 gaactctgattctaacgttttt-acgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaacttagaa 21901391  T
Q  351 tgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21901392 tgatatatggtgtcgaacgg 21901411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1942095 - 1942046
Alignment:
Q  321 acaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1942095 acaaacaacaaattatcgtttaacttataatgatatttggtgtcgaacgg 1942046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27954303 - 27954243
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27954303 tttggacacgaatgatgttgttgaggaatatgtgataatatc-gagtaaagctagaatccat 27954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28442671 - 28442628
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28442671 tttggacacgaatgatgttgttgagcgatatgtgataatatcaa 28442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 13671817 - 13672038
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671817 tattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 13671916  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  13671917 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgcattattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaataaacaacaaattatcgtttaacttat 13672016  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13672017 aatgatatttggtgtcgaacgg 13672038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27670316 - 27670096
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27670316 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgattattaggttacgtgtgacacttgatc 27670217  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27670216 aaggaactctaatcctaacaagtttcacactttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 27670117  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27670116 aatgatatttggtgtcgaacg 27670096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31548117 - 31547896
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548117 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 31548018  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  31548017 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaactaag 31547918  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31547917 aatgatatttggtgtcgaacgg 31547896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 32328493 - 32328714
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32328493 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttatatgtgacgctcgatc 32328592  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  32328593 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 32328692  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  32328693 aatgatatctggtgtcgaacgg 32328714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 1428423 - 1428644
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1428423 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1428522  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  1428523 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1428622  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1428623 aatgatatttggtgtcgaacgg 1428644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 34711557 - 34711778
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34711557 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34711656  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  34711657 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34711756  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34711757 aatgatatttggtgtcgaacgg 34711778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 9864760 - 9864982
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9864760 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 9864859  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||||    
T  9864860 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaactta 9864959  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9864960 gaatggtatttggtgtcgaacgg 9864982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4186907 - 4186686
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4186907 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 4186808  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  4186807 aaggaactctaatcctaacaagttctacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 4186708  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  4186707 aattatatttggtgtcgaacgg 4186686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 11058150 - 11058371
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11058150 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 11058249  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  11058250 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 11058349  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11058350 aatgatatttggtgtcgaacgg 11058371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Original strand, 21262574 - 21262795
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21262574 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 21262673  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21262674 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 21262773  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262774 gaatgatatttggtgtcgaacg 21262795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 4020235 - 4020457
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4020235 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4020334  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  4020335 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4020434  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4020435 gaatggtatttggtgtcgaacgg 4020457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 4026661 - 4026883
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4026661 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4026760  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  4026761 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4026860  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4026861 gaatggtatttggtgtcgaacgg 4026883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34655473 - 34655251
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34655473 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34655374  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  34655373 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34655274  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  34655273 gaatggtatttggtgtcgaacgg 34655251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34649022 - 34648800
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34649022 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34648923  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | || || ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  34648922 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagatactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34648823  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  34648822 gaatggtatttggtgtcgaacgg 34648800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 4738323 - 4738545
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738323 tattgtttggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4738422  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  4738423 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4738522  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  4738523 gaatggtatttggtgtcgaacgg 4738545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 7069702 - 7069916
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7069702 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 7069801  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  7069802 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 7069901  T
Q  348 gaatgatatttggtg 362  Q
    ||||| |||||||||    
T  7069902 gaatggtatttggtg 7069916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29907045 - 29906891
Alignment:
Q  217 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29907045 gtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 29906946  T
Q  316 ttaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29906945 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacgg 29906891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 217 - 370
Target Start/End: Original strand, 30117335 - 30117489
Alignment:
Q  217 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 315  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  30117335 gtatggtccttaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 30117434  T
Q  316 ttaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30117435 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacgg 30117489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Original strand, 7062578 - 7062705
Alignment:
Q  245 tgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtcta 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||    
T  7062578 tgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttta 7062677  T
Q  343 acttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7062678 acttggaatggtatttggtgtcgaacgg 7062705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 293
Target Start/End: Original strand, 1167480 - 1167630
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaaga-------aaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacg 242  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| |       ||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||    
T  1167480 tattatttggacacgaacgatattgttgagggatacatgataatataaaaaataaaaaaaaaactagaatccgtatatgatcatcaggttatgtgtgacg 1167579  T
Q  243 cttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 293  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167580 cttgatcaaagaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaa 1167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Original strand, 7062516 - 7062578
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7062516 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 10081567 - 10081762
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10081567 tttggacacgaataatcttgttgagcgatatgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10081666  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc-aactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10081667 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaaattttactcttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9846738 - 9846601
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  || | |||| || || ||| || |||||||| |||||     
T  9846738 tttgaacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcgataaaatgctagaatccgtatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaac 9846639  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 291  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||    
T  9846638 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattaatctc 9846601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29907081 - 29907044
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29907081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 29907044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 187
Target Start/End: Original strand, 30117299 - 30117336
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30117299 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 30117336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4973785 - 4973564
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4973785 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattatgttacgtgtgacgcttgatc 4973686  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4973685 aaggaactctgatcctaacaagtttcaccccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 4973586  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4973585 aatgatatttggtgtcgaacgg 4973564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22360186 - 22359965
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22360186 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22360087  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22360086 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 22359987  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  22359986 aataatatttggtgtcgaacgg 22359965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22314052 - 22313831
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314052 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtacggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22313953  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22313952 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaataacaaattatcgtttaacttag 22313853  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22313852 aatgatatttggtgtcgaacgg 22313831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5876440 - 5876219
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5876440 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 5876341  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5876340 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 5876241  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  5876240 aatgatatttggtgttgaacgg 5876219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 34357288 - 34357509
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34357288 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34357387  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  34357388 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34357487  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34357488 aatgatatttggtgtcgaacgg 34357509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 34359079 - 34359300
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34359079 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34359178  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  34359179 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34359278  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34359279 aatgatatttggtgtcgaacgg 34359300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2958081 - 2957859
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2958081 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2957982  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  2957981 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2957882  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  2957881 gaatggtatttggtgtcgaacgg 2957859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2966550 - 2966328
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2966550 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2966451  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  2966450 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2966351  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  2966350 gaatggtatttggtgtcgaacgg 2966328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29980681 - 29980460
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29980681 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 29980582  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  29980581 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 29980482  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29980481 aatgatatttggtgtcgaacgg 29980460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 30041244 - 30041465
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30041244 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 30041343  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  30041344 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 30041443  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30041444 aatgatatttggtgtcgaacgg 30041465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 40958617 - 40958838
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40958617 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 40958716  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||| |    
T  40958717 aaggaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaataaccaattatcttttaacttgg 40958816  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40958817 aatgatatttggtgtcgaacgg 40958838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 25894649 - 25894871
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25894649 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcgatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 25894748  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  25894749 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 25894848  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  25894849 gaatggtatttggtgtcgaacgg 25894871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2439022 - 2438802
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2439022 tattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgcatg-tcattaggttacgtgtgacgcttgatt 2438924  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||     
T  2438923 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcacttttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattttcttttaacttat 2438824  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||| |||||| ||| ||||    
T  2438823 aatgatttttggtatcggacgg 2438802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 12505765 - 12505991
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12505765 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgggactcttgatc 12505864  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta--tta------aaacaaacaacaaattatcgtc 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||      ||| |||||||||| |||| |     
T  12505865 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttattattcgcaacatagttaacttagtttctaaataaacaacaaactatcttt 12505964  T
Q  341 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12505965 taacttaaaatggtatttggtgtcgaa 12505991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 152 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42151039 - 42150819
Alignment:
Q  152 ttgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaa 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  42151039 ttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgattaa 42150940  T
Q  252 ggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaacttaga 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  ||||||||    
T  42150939 ggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttaga 42150840  T
Q  350 atgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  42150839 atgatatttggagtcgaacgg 42150819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 29414669 - 29414890
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414669 tattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 29414768  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||    ||   | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  29414769 aagaaattctaatcctaataagttttacgccctattactctcgactttcaattttatatttgcttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaacttag 29414868  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  29414869 aatgatatttggtgttgaacgg 29414890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33794309 - 33794093
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  33794309 tttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaa 33794210  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  33794209 gaactctaattccaac-atttttacgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacatacaacaaattatc-tttaacttagaat 33794112  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33794111 gatatttggtgtcaaacgg 33794093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9843566 - 9843350
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9843566 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 9843467  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  9843466 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 9843368  T
Q  353 atatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9843367 atatttggtgtcgaacgg 9843350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 2156125 - 2156339
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2156125 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacactagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 2156224  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||   ||||||||||| | | ||||||||||    
T  2156225 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaactttcacttttacacttggttactaaaaca---aacaaattatcttttaaacttagaat 2156320  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2156321 gatatttggtgtcgaacgg 2156339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 261
Target Start/End: Original strand, 19853484 - 19853588
Alignment:
Q  159 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 256  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19853484 gacatgaatgatgttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaacgaac 19853583  T
Q  257 tctaa 261  Q
    |||||    
T  19853584 tctaa 19853588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 12918955 - 12919064
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  || | ||||| ||| || |||||||| | ||||    
T  12918955 tttggacacgaatagtcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtggttattaggttatgtttgacgcttaaccaag 12919054  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  12919055 gaactctaat 12919064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 30580195 - 30580304
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  30580195 tttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtgataatatcgataaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaac 30580294  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  30580295 gaactctaat 30580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 21341882 - 21342103
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21341882 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21341981  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21341982 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagtcattaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 21342081  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21342082 aatgatatttggtgtcgaacgg 21342103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Original strand, 2021448 - 2021668
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2021448 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 2021547  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2021548 aaggaactctaatcctaacaagttttacaccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2021647  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2021648 aatgatatttggtgtcgaacg 2021668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 21331994 - 21332215
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21332093  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  21332094 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgaaatttagtcattaaaacaaacaaccaactatcttttaacttag 21332193  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21332194 aatgatatttggtgtcgaacgg 21332215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 42931372 - 42931593
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42931372 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacatttgatc 42931471  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| |    
T  42931472 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatctgttaacttgg 42931571  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42931572 aatgatatttggtgtcgaacgg 42931593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 16856487 - 16856707
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16856487 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16856586  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  16856587 aagaaactctaatcctaacaagtnttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16856685  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  16856686 aatgatatttgctgtcgaacgg 16856707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12951018 - 12950797
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12951018 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 12950919  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  12950918 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 12950819  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12950818 aatgatatttggtgtcgaacgg 12950797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 16817330 - 16817550
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16817330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16817429  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  16817430 aagaaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16817528  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  16817529 aatgatatttgctgtcgaacgg 16817550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 36782184 - 36782406
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36782184 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36782283  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  36782284 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36782383  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  36782384 gaatggtatttggtgtcgaacgg 36782406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 34834812 - 34835033
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34834812 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34834911  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  34834912 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34835011  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34835012 aatgatatttggtgtcgaacgg 34835033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 34841256 - 34841477
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34841256 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34841355  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  34841356 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34841455  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34841456 aatgatatttggtgtcgaacgg 34841477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29485149 - 29484927
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29485149 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 29485050  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  29485049 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 29484950  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  29484949 gaatggtatttggtgtcgaacgg 29484927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45012205 - 45011983
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45012205 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 45012106  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  45012105 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 45012006  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  45012005 gaatggtatttggtgtcgaacgg 45011983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15852772 - 15852550
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15852772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttaagtgtgacgcttgatc 15852673  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  15852672 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 15852573  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  15852572 gaatggtatttggtgtcgaacgg 15852550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43268081 - 43267859
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  43268081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 43267982  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||     
T  43267981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttg 43267882  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  43267881 aaatgataattggtgtcgaacgg 43267859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2157834 - 2157613
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2157834 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2157735  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  2157734 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2157635  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2157634 aatgatatttggtgtcgaacgg 2157613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2164250 - 2164029
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2164250 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2164151  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  2164150 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2164051  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2164050 aatgatatttggtgtcgaacgg 2164029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 13901957 - 13902178
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13901957 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 13902056  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  13902057 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 13902156  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13902157 aatgatatttggtgtcgaacgg 13902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 21067958 - 21068179
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||    
T  21067958 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgatgcctgctc 21068057  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21068058 aaggaactctaatcctaa-aagtttcacaccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaatacaaacaaacaaattatcttttaactta 21068156  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21068157 gaatgatatttggtgtcgaacgg 21068179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 299
Target Start/End: Original strand, 45700644 - 45700793
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  45700644 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattaggttatgtgtgacgtttgatc 45700743  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45700744 aaggaactctaattctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 45700793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41455823 - 41455607
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| | | |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455823 tttggacacgaataatcttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacggtggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 41455724  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41455723 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaatg 41455625  T
Q  353 atatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41455624 atatttggtgtcgaacgg 41455607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 11909950 - 11910116
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga--tcattagattacgtgtgacgcttga 247  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||   ||||| |||||  || || ||||||    
T  11909950 tattatttggacacgaataatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaaagctagaatccgtatatgtggtcattggattatatgggatgcttga 11910049  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagtt 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||    
T  11910050 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcacttttattcttgcaaattagtt 11910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 314
Target Start/End: Original strand, 17784443 - 17784604
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17784443 tttggacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 17784542  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 314  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17784543 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13163032 - 13162892
Alignment:
Q  159 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 256  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||  |||||||  |||  || ||  |||| |||| ||||    
T  13163032 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatctgtatatgtgatcattatgttatatgcgattcttggtcaatgaac 13162933  T
Q  257 tctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13162932 tctaatcctaacaagttttacgccttattactctcaacttt 13162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 314
Target Start/End: Original strand, 17789096 - 17789257
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  17789096 tttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaatcaag 17789195  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 314  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17789196 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 55462772 - 55462993
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 55462871  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  55462872 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 55462971  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55462972 aatgatatttggtgtcgaacgg 55462993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16405568 - 16405343
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatat----caaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16405568 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctt 16405469  T
Q  246 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaac 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16405468 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 16405369  T
Q  345 ttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  16405368 ttagaacgatatttggtgtcgaacgg 16405343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 16838359 - 16838579
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 16838458  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16838459 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 16838557  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16838558 aatgatatttggtgtctaacgg 16838579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27590527 - 27590306
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27590527 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27590428  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  27590427 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 27590328  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27590327 aatggtatttggtgtcgaacgg 27590306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41373209 - 41372987
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41373209 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41373110  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  41373109 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactta 41373010  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  41373009 gaatgataattggtgtcgaacgg 41372987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 151 - 370
Target Start/End: Original strand, 37368315 - 37368536
Alignment:
Q  151 attgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37368315 attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatca 37368414  T
Q  251 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaacttag 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | |||||| |    
T  37368415 aggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttgg 37368514  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  37368515 aatggtatttggtgtcgaacgg 37368536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13594330 - 13594107
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13594330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 13594231  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtctaactt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  | ||||||    
T  13594230 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 13594131  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13594130 agaatgatatttggtgtcgaacgg 13594107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7780629 - 7780408
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7780629 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 7780530  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  7780529 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttatcatttgcaatttcgttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaactta 7780431  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  7780430 gaatgatatttagtgtcgaacgg 7780408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8104104 - 8103882
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104104 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 8104005  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  8104004 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 8103905  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  8103904 gaatggtatttggtgtcgaacgg 8103882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30238482 - 30238261
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30238482 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 30238383  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  30238382 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 30238283  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30238282 aatgatatttggtgtcgaacgg 30238261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17457077 - 17456855
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17457077 tattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 17456978  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  17456977 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttgtcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 17456878  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  17456877 gaatggtatttggtgtcgaacgg 17456855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 36754791 - 36755017
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  36754791 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggtaatgtgtgacgcttgatt 36754890  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtc 340  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| |||| |     
T  36754891 aaggaacttcaatcctaataagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaatatagttaacttagttactaaaacaaacaacaaactatcttt 36754990  T
Q  341 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36754991 taatttagaatgatatttggtgtcgaa 36755017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 30211536 - 30211724
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  30211536 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaagttatgtgtgacgcttgatt 30211635  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 337  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30211636 aaggaactctaatcataacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatc 30211724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 297
Target Start/End: Original strand, 5660549 - 5660696
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5660549 tattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattaggttacatgtgatgcttgatc 5660648  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660649 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 5660696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 368
Target Start/End: Original strand, 13003809 - 13004006
Alignment:
Q  173 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  13003809 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 13003908  T
Q  271 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaac 368  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13003909 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaac 13004006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2948062 - 2947846
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  2948062 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 2947963  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  2947962 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 2947864  T
Q  353 atatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2947863 atatttggtgtcgaacgg 2947846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 276 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48914996 - 48914900
Alignment:
Q  276 acgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48914996 acgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttggaatggtatttggtgtcgaacgg 48914900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12768966 - 12768745
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12768966 tattgtttggacacgaatggtcttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattaggttacgtgtgaagcttgatc 12768867  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12768866 aaagaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcaatttagttattaaaacaaacaacgaattatcatttaacttag 12768767  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12768766 aatgatatttggtgtcgaacgg 12768745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 11358193 - 11358415
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358193 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 11358292  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  11358293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 11358392  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  11358393 gaatggtatttggtgtcgaacgg 11358415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7311571 - 7311350
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7311571 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 7311472  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  7311471 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 7311372  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7311371 aatgatatttggtgtcgaacgg 7311350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 8013320 - 8013541
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8013320 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8013419  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  8013420 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8013519  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8013520 aatgatatttggtgtcgaacgg 8013541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 36005482 - 36005703
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36005482 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36005581  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  36005582 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 36005681  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36005682 aatgatatttggtgtcgaacgg 36005703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 36425730 - 36425952
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36425730 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 36425829  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  36425830 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36425929  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  36425930 gaatggtatttggtgtcgaacgg 36425952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 6464576 - 6464797
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6464576 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6464675  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  6464676 aaggaactctaatcctaacgagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6464775  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6464776 aatgatatttggtgtcgaacgg 6464797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36076189 - 36075968
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36076189 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36076090  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| || ||||||      
T  36076089 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactattgtttaacttga 36075990  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36075989 aatgatatttggtgtcgaacgg 36075968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15012610 - 15012393
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||     
T  15012610 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatagtcattaggttccgtgtgacgcttgatt 15012511  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15012510 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccctattactctcaacttttactcttgcaacttagtaactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 15012411  T
Q  349 aatgatatttggtgtcga 366  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012410 aatgatatttggtgtcga 15012393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 36021799 - 36022021
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36021799 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36021898  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| | | ||||     
T  36021899 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 36021998  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  36021999 aaatgataattggtgtcgaacgg 36022021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 41242116 - 41242337
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41242116 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41242215  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||| | ||||||      
T  41242216 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcatttaacttga 41242315  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  41242316 aaagatatttggtgtcaaacgg 41242337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1238436 - 1238214
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  1238436 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatcaggttatttgtgacgcttgatc 1238337  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattg-caacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||||||    
T  1238336 aaggaactctaatcctaacaagttttacgctctattactctcaacttttactttttcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattattttttaactta 1238237  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1238236 gaatgatatttggtgtcgaacgg 1238214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 16710668 - 16710890
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16710668 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 16710767  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |  ||||||    
T  16710768 aaggaactctaatcctaacaagttttatgccctattgctctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacatactatctttcaactta 16710867  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  16710868 gaatgatatttggagtcgaacgg 16710890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 293
Target Start/End: Original strand, 26250591 - 26250734
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  26250591 tattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagattacgtgtgacgcttgatt 26250690  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 293  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250691 aaggaactctaatcctaacaaatttcacgccttattaatctcaa 26250734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31017608 - 31017400
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg--tatgatcattagattacgtgtgacgcttga 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31017608 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtatatggtcattaggttacatgtgacgcttga 31017509  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaactta 347  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||              ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31017508 ttaaagaactctaatcctaactagtttcacgccttattattc--------------gcaactttgttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactta 31017423  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  31017422 aaatgatatttggtgtcgaacgg 31017400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 337
Target Start/End: Original strand, 45068416 - 45068604
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45068416 tattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttacgtgcgacgcttgatt 45068515  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 337  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45068516 aaagaactctaatcctaacaaattttacgttttattactctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatc 45068604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 7933931 - 7934148
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  7933931 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 7934030  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaa-cttagaat 351  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| |||||||||| |  || |||||| ||| ||||||||    
T  7934031 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaaccatcaactatcgtttaaccttagaat 7934129  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7934130 gatatttggtgtcgaacgg 7934148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 4311486 - 4311707
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  4311486 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgattgatc 4311585  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4311586 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttag 4311685  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  4311686 aatgatatttggtgttgaacgg 4311707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 10941304 - 10941525
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10941304 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 10941403  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10941404 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10941503  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  10941504 aattatattaggtgtcaaacgg 10941525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32746592 - 32746371
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32746592 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 32746493  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  32746492 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 32746393  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32746392 aatgatatttggtgtcgaacgg 32746371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6036488 - 6036267
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6036488 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgagtgacgcttgatc 6036389  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  6036388 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcattttcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 6036289  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  6036288 aattatatttggtgtcaaacgg 6036267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24179296 - 24179074
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179296 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 24179197  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||     
T  24179196 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 24179097  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  24179096 gaatggtatttggtgtcgaacgg 24179074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 9570548 - 9570771
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9570548 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9570647  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtct-aactt 346  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| | | |||||    
T  9570648 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9570747  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  9570748 agaatgataattggtgtcgaacgg 9570771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 27501967 - 27502189
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27501967 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27502066  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtct-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  27502067 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 27502166  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  27502167 gaatggtatttggtgtcgaacgg 27502189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13015208 - 13014987
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13015208 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 13015109  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  13015108 aagaaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 13015009  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13015008 aatgatatttggtgtcgaacgg 13014987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 9577050 - 9577273
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9577050 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9577149  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtct-aactt 346  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| | | |||||    
T  9577150 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9577249  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  9577250 agaataataattggtgtcgaacgg 9577273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43995300 - 43995073
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaa-gaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43995300 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttggt 43995201  T
Q  249 caaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt---------gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt 339  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  43995200 taaggaactctaatcctgacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagtcaacttagtttctaaaacaaacaacaaactatctt 43995101  T
Q  340 ctaacttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43995100 ttaacttagaatgatatttgatgtcgaa 43995073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25893458 - 25893231
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25893458 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 25893359  T
Q  250 aagg-----aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtcta 342  Q
    ||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  | ||    
T  25893358 aaggaatttaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattaacttttta 25893259  T
Q  343 acttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25893258 acttagaatggtatttggtgtcgaacgg 25893231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43931799 - 43931583
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgt--gtgacgcttga 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43931799 tattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa-------gaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtatgtgacgcttga 43931707  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaactt 346  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43931706 ttaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattatccgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactt 43931607  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||| |||||||||||| ||||    
T  43931606 agaatggtatttggtgtcggacgg 43931583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23068686 - 23068465
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  23068686 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgatgctcgatc 23068588  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtctaactt 346  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  | ||||||    
T  23068587 aaagaactctaatcctaacaagtttc-cgccctattaatttcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 23068489  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  23068488 agaatgatatttggtgacgaacgg 23068465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 297
Target Start/End: Original strand, 20651135 - 20651272
Alignment:
Q  160 acacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactct 259  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651135 acacgaatgatattgtcaagggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcattaaattacgtgtgatgcttgatcaaggaactct 20651234  T
Q  260 aatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20651235 aatcctaacgagtttcacgccttattaatctcaacttt 20651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 246 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41353987 - 41353862
Alignment:
Q  246 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaac 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41353987 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgtcctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 41353888  T
Q  345 ttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41353887 ttaaaatgatatttggtgtcgaacgg 41353862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 370
Target Start/End: Original strand, 41354142 - 41354291
Alignment:
Q  222 atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaa 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||    
T  41354142 atcattaggttacgtgtgacgcttgctcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaa 41354241  T
Q  321 acaaac-aacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354242 acaaacaaacaaattattttc-aacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 41354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4591012 - 4590795
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4591012 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 4590913  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||   | || |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||    
T  4590912 gaactctaattccaac-gtttttacgccctattactctcaactttaacttttatatttggttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttggaat 4590814  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  4590813 gataattggtgtcgaacgg 4590795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Original strand, 3577095 - 3577159
Alignment:
Q  306 aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3577095 aacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttagaataatatttggtgtcgaacgg 3577159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 370
Target Start/End: Original strand, 20952759 - 20952984
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||  |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  20952759 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaagcgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 20952858  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt-atcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaacaacaaatta-tcgtctaa 343  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||     ||| ||||||  ||||| || | |||    
T  20952859 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttattcttgcaaattagttaacttagttgcaaagaaacaaacaattactcttttaa 20952957  T
Q  344 cttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20952958 cttagaatgatatttggtgtcgaacgg 20952984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 4644354 - 4644463
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| | ||||    
T  4644354 tttggacacgaatagtcttgttgaacgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaaccaag 4644453  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  4644454 gaactctaat 4644463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2785922 - 2785865
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 212  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2785922 tttggacacaaatgattttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaat 2785865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 49912 - 49692
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  49912 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatg 49813  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49812 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 49714  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49713 aatgatatttggtgtcgaacgg 49692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15393 - 15175
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15393 tattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctggaat 15294  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  15293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttactattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaagttag 15194  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  15193 aatgatattttgtgtcgaa 15175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5226
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5005 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5104  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||| ||||||      
T  5105 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 5204  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5205 aatgatatttggtgtcgaacgg 5226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3481
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3264 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattaggttaagtgtgaagcttgatc 3363  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  3364 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 3462  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3463 aatgatatttagtgtcgaa 3481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 8881 - 9103
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  8881 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 8980  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |  ||||||    
T  8981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 9080  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  9081 gaatgatatttggagtcgaacgg 9103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 370
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2782
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  2560 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 2659  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtctaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  2660 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 2759  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2760 gaatgatatttggtgtcgaacgg 2782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12014
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12155 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 12056  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12055 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctc 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 308 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12014 - 11951
Alignment:
Q  308 cttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaacgg 370  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12014 cttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttagaatgatatttggagtcgaacgg 11951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 266 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 100020 - 99915
Alignment:
Q  266 aacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtc 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100020 aacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 99921  T
Q  365 gaacgg 370  Q
    ||||||    
T  99920 gaacgg 99915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 368
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24465
Alignment:
Q  173 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  24268 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 24367  T
Q  271 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtctaacttagaatgatatttggtgtcgaac 368  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24368 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaac 24465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University