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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1023-Insertion-7 (Length: 728)

Name: NF1023-Insertion-7
Description: NF1023
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1023-Insertion-7
NF1023-Insertion-7
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (10-728)||(6585530-6586248)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 615; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 6586248 - 6585530
Alignment:
Q  10 tggatgctgtatctatttggtaaaagttctttagcatccctttctccaaattctcattgtgctgtatagacagtatagacataatattcaatttagtggg 109  Q
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T  6586248 tggatgctgtatctatttggtaaaagttctttagcatccctttctccaaattctcattgtgctgtataga-agtatagacataatattcaatttagtggg 6586150  T
Q  110 catgtgaaacctatcaaattcttatattagaaataactcatatttataaaaccaaattataaattcaaaggtgttactcttaataaaatatttttaggtt 209  Q
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T  6586149 catgtgaaacctatcaaattcttatattggaaataactcatatttataaaaccaaattataaattgaaaggtgtcactcttaataaaatatttttaggtt 6586050  T
Q  210 ttatcgcttttcgatacatgaatggataaactcttatgataccaatattataatattagtttttatattgggtctaacacatttatataaccgattttca 309  Q
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T  6586049 ttatctcttttccatacatgaatggataaactcttatgataccaatattataatattagtttttatattgggtctaacacatttataaaaccgattttca 6585950  T
Q  310 agatgccactcttatcctaaattatttttagggcaattgaggttttcctaataaaagtgataaatattttctattttgttcctcctaacacaacaaaagt 409  Q
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T  6585949 agatgccactcttattctaaattatttttagggcaattgaggttttcctaataaaagtgataaatattttctattttgttcctcctaacacaacaaaagt 6585850  T
Q  410 taaatcaagaatagctattgatgtgtgtttccataattgcagtatgaacataaatggttgggatatgatgatcgcgctagggtttaacgttgcaataagg 509  Q
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T  6585849 taaatcgagaatagttattgatttgtgtttccataattgcagtatgaacataaatggttgggatatgatgatcgcgctagggtttaacgttgcaataagg 6585750  T
Q  510 tgattatcgctttctctatttcttttcttaacaaatttagcctctttaaagccaacaatttattttcttttcttaagtgaatagttagtcacagnnnnnn 609  Q
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T  6585749 tgattatcgctttctctatttcttttcttaacaaatttagcttctttaaagtgaacaatttattttcttttcttaagtgaatagttagtcacagtttttt 6585650  T
Q  610 natactgattatgtttaatttatgaacagtgtgagagtatcaaatgaacttgaagcaggtgattttggaactgc-aagttctcagtgatagtggattccc 708  Q
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T  6585649 tatactgattatgtttaatttatgaacagtgtgagagtatcaaatgaacttggagcaggtgattttcgagctgcaaagttctcagtgatagtggtttccc 6585550  T
Q  709 tcacatcaatatccattggt 728  Q
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T  6585549 tcacatcaatatccattggt 6585530  T

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