View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10230_low_2 (Length: 394)

Name: NF10230_low_2
Description: NF10230
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10230_low_2
NF10230_low_2
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (74-394)||(844701-845021)
chr1 (76-394)||(6711023-6711342)
chr1 (79-394)||(45490852-45491167)
chr1 (77-394)||(1351412-1351728)
chr1 (73-394)||(42510401-42510722)
chr1 (76-394)||(35387288-35387606)
chr1 (77-394)||(16386734-16387051)
chr1 (79-394)||(16451009-16451324)
chr1 (79-384)||(12890120-12890425)
chr1 (79-394)||(32270240-32270550)
chr1 (77-390)||(28340284-28340597)
chr1 (77-394)||(41972792-41973108)
chr1 (76-392)||(7183797-7184113)
chr1 (79-394)||(51264377-51264692)
chr1 (79-390)||(24339619-24339929)
chr1 (128-394)||(26118192-26118458)
chr1 (128-394)||(30105657-30105923)
chr1 (79-390)||(50540226-50540537)
chr1 (78-394)||(41967826-41968142)
chr1 (78-394)||(17887828-17888145)
chr1 (83-394)||(31004019-31004329)
chr1 (74-394)||(44738019-44738338)
chr1 (74-394)||(16476132-16476451)
chr1 (78-394)||(51703141-51703455)
chr1 (78-394)||(16437259-16437559)
chr1 (77-394)||(50304532-50304848)
chr1 (80-394)||(17327626-17327940)
chr1 (123-394)||(32289321-32289592)
chr1 (77-390)||(42512751-42513060)
chr1 (78-394)||(1601049-1601368)
chr1 (77-394)||(46154780-46155104)
chr1 (76-389)||(6029283-6029595)
chr1 (72-393)||(39281770-39282090)
chr1 (73-394)||(11772609-11772929)
chr1 (78-387)||(26764779-26765082)
chr1 (130-394)||(45658755-45659018)
chr1 (81-394)||(38086973-38087285)
chr1 (76-390)||(16704605-16704919)
chr1 (128-394)||(15539867-15540132)
chr1 (79-390)||(13994056-13994366)
chr1 (161-377)||(42705231-42705448)
chr1 (186-394)||(5109718-5109925)
chr1 (79-393)||(3414831-3415146)
chr1 (80-394)||(6143963-6144276)
chr1 (141-382)||(49303343-49303583)
chr1 (125-352)||(20494927-20495137)
chr1 (76-309)||(25539735-25539967)
chr1 (82-378)||(10384253-10384548)
chr1 (78-292)||(38663014-38663227)
chr1 (166-394)||(50382377-50382608)
chr1 (128-282)||(34663858-34664012)
chr1 (68-357)||(570258-570549)
chr1 (213-394)||(7837149-7837330)
chr1 (164-366)||(25343213-25343416)
chr1 (213-368)||(504394-504549)
chr1 (283-394)||(8838983-8839094)
chr1 (211-359)||(6771382-6771530)
chr1 (216-367)||(39792826-39792977)
chr1 (221-358)||(26733579-26733716)
chr1 (230-382)||(17291612-17291763)
chr1 (318-394)||(38663228-38663304)
chr1 (311-394)||(21071728-21071811)
chr1 (253-394)||(7837430-7837571)
chr1 (214-358)||(40610739-40610883)
chr1 (211-284)||(46815816-46815889)
chr1 (190-281)||(16643272-16643361)
chr1 (238-304)||(23799604-23799670)
chr1 (202-320)||(46447669-46447787)
chr1 (212-376)||(2761551-2761715)
chr1 (167-266)||(32467926-32468025)
chr1 (337-394)||(40811348-40811405)
chr1 (215-271)||(33316435-33316491)
chr1 (256-360)||(35335759-35335863)
chr1 (195-359)||(47242528-47242690)
chr1 (78-241)||(8838820-8838987)
chr1 (221-356)||(31574378-31574513)
chr1 (297-375)||(33316499-33316577)
chr1 (202-275)||(20986333-20986406)
chr1 (136-200)||(21071664-21071727)
chr1 (205-305)||(21763169-21763269)
chr1 (213-281)||(30105007-30105075)
chr1 (285-376)||(8780601-8780691)
chr1 (256-358)||(3560163-3560265)
chr1 (168-275)||(34283912-34284021)
chr1 (71-108)||(26118463-26118500)
chr1 (222-275)||(40856172-40856225)
chr1 (195-244)||(49799375-49799424)
chr1 (186-266)||(15324146-15324226)
chr1 (76-108)||(30105928-30105960)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (76-394)||(8672972-8673290)
chr8 (76-394)||(41709647-41709965)
chr8 (77-394)||(34101379-34101696)
chr8 (76-394)||(34062998-34063316)
chr8 (76-394)||(45446325-45446643)
chr8 (77-394)||(29672240-29672557)
chr8 (79-392)||(32019920-32020233)
chr8 (76-379)||(29563158-29563461)
chr8 (74-394)||(6386444-6386764)
chr8 (74-394)||(27103827-27104147)
chr8 (76-394)||(31513500-31513818)
chr8 (77-382)||(3251585-3251890)
chr8 (128-390)||(4052404-4052664)
chr8 (128-394)||(37664200-37664466)
chr8 (76-394)||(25478118-25478431)
chr8 (80-394)||(7394731-7395045)
chr8 (123-394)||(5968781-5969052)
chr8 (128-394)||(30542939-30543205)
chr8 (81-394)||(12753242-12753554)
chr8 (71-394)||(22999123-22999446)
chr8 (123-394)||(7591364-7591634)
chr8 (79-394)||(13406852-13407167)
chr8 (136-394)||(10466995-10467252)
chr8 (128-394)||(14004961-14005227)
chr8 (76-394)||(37618309-37618626)
chr8 (83-394)||(15001344-15001654)
chr8 (77-394)||(31731935-31732238)
chr8 (77-308)||(32303588-32303819)
chr8 (123-394)||(41548536-41548806)
chr8 (76-394)||(40388911-40389228)
chr8 (79-394)||(17805563-17805879)
chr8 (164-394)||(39642841-39643071)
chr8 (76-394)||(30501016-30501333)
chr8 (136-394)||(29610972-29611229)
chr8 (73-394)||(35225530-35225850)
chr8 (79-393)||(45113929-45114242)
chr8 (213-394)||(37861866-37862046)
chr8 (136-394)||(17520532-17520782)
chr8 (84-394)||(37474598-37474888)
chr8 (115-394)||(16485726-16486004)
chr8 (202-394)||(21272680-21272855)
chr8 (164-394)||(10656603-10656833)
chr8 (115-394)||(16595067-16595344)
chr8 (123-320)||(27109532-27109730)
chr8 (221-384)||(22756338-22756501)
chr8 (164-358)||(10320232-10320424)
chr8 (130-368)||(6460188-6460417)
chr8 (147-359)||(10932678-10932888)
chr8 (211-359)||(36426201-36426347)
chr8 (186-366)||(11944855-11945035)
chr8 (341-394)||(38047481-38047534)
chr8 (168-358)||(54133-54322)
chr8 (322-379)||(32303540-32303597)
chr8 (81-165)||(21272588-21272672)
chr8 (128-190)||(37861803-37861865)
chr8 (195-352)||(5892057-5892214)
chr8 (186-263)||(11926878-11926955)
chr8 (73-153)||(955094-955174)
chr8 (164-246)||(32918843-32918925)
chr8 (172-382)||(10531244-10531456)
chr8 (222-275)||(14958975-14959027)
chr8 (193-271)||(15351722-15351800)
chr8 (202-265)||(5859518-5859581)
chr8 (211-271)||(3361783-3361843)
chr8 (221-317)||(3800937-3801033)
chr8 (74-108)||(14005232-14005266)
chr8 (164-260)||(28746281-28746377)
[»] chr2 (75 HSPs)
chr2 (77-394)||(34338681-34338998)
chr2 (88-394)||(9732832-9733138)
chr2 (77-394)||(35114656-35114973)
chr2 (73-394)||(2644989-2645309)
chr2 (77-394)||(33366481-33366798)
chr2 (76-394)||(32497785-32498103)
chr2 (77-394)||(37308527-37308843)
chr2 (75-394)||(18685705-18686024)
chr2 (74-391)||(16104142-16104459)
chr2 (77-394)||(30326234-30326550)
chr2 (79-390)||(42706231-42706543)
chr2 (73-382)||(5278748-5279057)
chr2 (80-382)||(17540588-17540891)
chr2 (79-394)||(19513591-19513906)
chr2 (123-394)||(7258813-7259085)
chr2 (128-394)||(33889165-33889431)
chr2 (79-394)||(39461187-39461502)
chr2 (80-382)||(30798402-30798703)
chr2 (77-394)||(40692176-40692485)
chr2 (77-394)||(44284508-44284817)
chr2 (167-394)||(7761475-7761702)
chr2 (83-394)||(42365454-42365765)
chr2 (76-390)||(3913366-3913679)
chr2 (80-394)||(2085946-2086250)
chr2 (77-394)||(4641387-4641702)
chr2 (72-375)||(12672395-12672676)
chr2 (142-391)||(32766409-32766658)
chr2 (76-303)||(37003861-37004089)
chr2 (78-394)||(28824459-28824773)
chr2 (76-394)||(6896040-6896356)
chr2 (79-394)||(38992973-38993284)
chr2 (164-394)||(10399772-10400002)
chr2 (82-394)||(11114749-11115058)
chr2 (77-391)||(40832374-40832692)
chr2 (71-320)||(26418788-26419037)
chr2 (76-394)||(16177785-16178100)
chr2 (77-394)||(13829310-13829614)
chr2 (224-394)||(26981611-26981781)
chr2 (83-373)||(8112183-8112468)
chr2 (78-308)||(9717113-9717326)
chr2 (164-394)||(30712815-30713048)
chr2 (81-393)||(27462705-27463014)
chr2 (188-379)||(41366027-41366218)
chr2 (79-260)||(18793297-18793478)
chr2 (235-392)||(38623208-38623365)
chr2 (123-313)||(1247073-1247254)
chr2 (123-321)||(12939275-12939474)
chr2 (313-394)||(37863268-37863349)
chr2 (164-374)||(41934539-41934749)
chr2 (287-394)||(18793195-18793300)
chr2 (164-382)||(45463037-45463241)
chr2 (322-394)||(9717317-9717389)
chr2 (225-360)||(26796247-26796382)
chr2 (228-356)||(15303180-15303308)
chr2 (164-281)||(20907547-20907664)
chr2 (164-329)||(35472967-35473132)
chr2 (329-394)||(37003793-37003858)
chr2 (188-275)||(18127009-18127096)
chr2 (230-390)||(18278926-18279084)
chr2 (186-318)||(36843442-36843574)
chr2 (164-310)||(37088231-37088377)
chr2 (136-300)||(130224-130393)
chr2 (227-350)||(12217650-12217772)
chr2 (166-275)||(13249421-13249530)
chr2 (222-366)||(40876554-40876697)
chr2 (211-376)||(16062014-16062178)
chr2 (130-200)||(26981785-26981856)
chr2 (249-359)||(35170150-35170260)
chr2 (295-361)||(6453249-6453315)
chr2 (340-394)||(12939220-12939274)
chr2 (228-305)||(40767180-40767256)
chr2 (233-324)||(38786503-38786592)
chr2 (211-306)||(1230916-1231011)
chr2 (254-391)||(83315-83455)
chr2 (201-358)||(2394265-2394421)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (73-394)||(10932460-10932781)
chr7 (80-394)||(43158589-43158903)
chr7 (78-394)||(26994128-26994444)
chr7 (74-394)||(36769472-36769792)
chr7 (78-394)||(47953066-47953382)
chr7 (77-394)||(3922606-3922923)
chr7 (77-394)||(11321788-11322105)
chr7 (80-394)||(21784749-21785063)
chr7 (81-394)||(18470563-18470874)
chr7 (74-394)||(18386397-18386716)
chr7 (81-394)||(41211103-41211417)
chr7 (76-394)||(46633571-46633884)
chr7 (79-394)||(32873675-32873987)
chr7 (79-394)||(1870011-1870327)
chr7 (128-388)||(40753081-40753341)
chr7 (79-394)||(30849149-30849464)
chr7 (74-394)||(43189145-43189466)
chr7 (89-394)||(26371712-26372017)
chr7 (76-394)||(43368076-43368393)
chr7 (128-379)||(29661249-29661500)
chr7 (160-394)||(47316601-47316835)
chr7 (138-394)||(11250558-11250809)
chr7 (76-394)||(38301223-38301534)
chr7 (156-390)||(44748649-44748883)
chr7 (71-366)||(30598939-30599234)
chr7 (79-394)||(3891945-3892244)
chr7 (76-394)||(9913400-9913716)
chr7 (76-394)||(9927088-9927404)
chr7 (75-394)||(48894591-48894909)
chr7 (77-384)||(34295324-34295623)
chr7 (83-375)||(329352-329643)
chr7 (76-394)||(43213828-43214140)
chr7 (79-394)||(21133248-21133564)
chr7 (115-390)||(1363551-1363824)
chr7 (77-379)||(23349209-23349510)
chr7 (77-394)||(37966850-37967166)
chr7 (86-390)||(11822116-11822411)
chr7 (77-394)||(20127163-20127481)
chr7 (78-266)||(47947636-47947824)
chr7 (79-394)||(26910313-26910624)
chr7 (167-394)||(17237041-17237268)
chr7 (238-394)||(16963174-16963330)
chr7 (77-331)||(46408771-46409021)
chr7 (84-382)||(22723947-22724244)
chr7 (88-390)||(22724438-22724739)
chr7 (83-301)||(26652748-26652965)
chr7 (136-394)||(48445456-48445713)
chr7 (221-390)||(34519527-34519696)
chr7 (130-379)||(46448562-46448810)
chr7 (164-332)||(34117414-34117581)
chr7 (82-308)||(41665564-41665789)
chr7 (77-201)||(12982178-12982302)
chr7 (164-331)||(15035219-15035386)
chr7 (297-394)||(26700572-26700669)
chr7 (186-317)||(22631722-22631853)
chr7 (150-243)||(16963055-16963149)
chr7 (167-291)||(46627135-46627259)
chr7 (221-304)||(48699417-48699500)
chr7 (130-205)||(47442765-47442840)
chr7 (221-394)||(21408530-21408702)
chr7 (136-309)||(29372767-29372939)
chr7 (195-358)||(2048945-2049107)
chr7 (211-368)||(29455778-29455933)
chr7 (201-329)||(42332058-42332186)
chr7 (189-269)||(21408328-21408408)
chr7 (221-285)||(35645466-35645530)
chr7 (322-390)||(41665505-41665573)
chr7 (79-145)||(47316835-47316901)
chr7 (211-263)||(7958635-7958687)
chr7 (221-273)||(8054400-8054452)
chr7 (229-309)||(8360580-8360659)
chr7 (212-272)||(8453285-8453344)
chr7 (213-287)||(29773646-29773720)
chr7 (186-263)||(29992729-29992805)
chr7 (297-361)||(3359773-3359837)
chr7 (195-303)||(30052938-30053046)
[»] chr4 (103 HSPs)
chr4 (74-394)||(23521751-23522071)
chr4 (72-394)||(24002207-24002530)
chr4 (77-394)||(20802426-20802743)
chr4 (71-394)||(56154489-56154812)
chr4 (76-394)||(29785432-29785750)
chr4 (77-394)||(49151995-49152311)
chr4 (112-394)||(20517917-20518199)
chr4 (77-390)||(21202614-21202926)
chr4 (77-390)||(21579900-21580213)
chr4 (78-390)||(55065231-55065543)
chr4 (78-394)||(12600761-12601077)
chr4 (77-389)||(52319200-52319509)
chr4 (77-394)||(37865627-37865944)
chr4 (76-382)||(33176939-33177245)
chr4 (76-394)||(38486152-38486465)
chr4 (140-394)||(2725028-2725281)
chr4 (128-390)||(33552741-33553003)
chr4 (76-391)||(9512238-9512553)
chr4 (123-394)||(55593805-55594076)
chr4 (79-394)||(6776460-6776769)
chr4 (83-394)||(52949602-52949911)
chr4 (76-394)||(36743583-36743901)
chr4 (130-394)||(36497144-36497408)
chr4 (74-309)||(43640970-43641205)
chr4 (128-394)||(1231236-1231502)
chr4 (82-394)||(50178387-50178699)
chr4 (147-394)||(50727808-50728055)
chr4 (147-394)||(50735822-50736069)
chr4 (148-394)||(46680405-46680651)
chr4 (77-382)||(34929789-34930094)
chr4 (72-390)||(36885815-36886119)
chr4 (73-392)||(20694246-20694560)
chr4 (167-390)||(38812484-38812707)
chr4 (125-387)||(54542912-54543173)
chr4 (76-392)||(47642388-47642703)
chr4 (77-394)||(44649059-44649373)
chr4 (135-394)||(24210250-24210510)
chr4 (80-394)||(42869859-42870162)
chr4 (128-394)||(47361309-47361570)
chr4 (130-394)||(44324237-44324500)
chr4 (128-394)||(29616095-29616357)
chr4 (143-382)||(4325731-4325970)
chr4 (76-393)||(9807030-9807345)
chr4 (76-394)||(29592774-29593086)
chr4 (148-394)||(32181209-32181454)
chr4 (77-394)||(3649511-3649827)
chr4 (137-394)||(11055977-11056233)
chr4 (164-394)||(41711808-41712038)
chr4 (73-394)||(2786835-2787155)
chr4 (137-394)||(39078596-39078852)
chr4 (83-390)||(16320402-16320706)
chr4 (76-360)||(37695470-37695753)
chr4 (85-394)||(50186411-50186719)
chr4 (222-394)||(2629846-2630018)
chr4 (74-382)||(7554864-7555171)
chr4 (210-394)||(50729437-50729621)
chr4 (73-394)||(22318279-22318599)
chr4 (210-394)||(28115259-28115442)
chr4 (115-394)||(26083251-26083528)
chr4 (136-308)||(23327850-23328024)
chr4 (164-394)||(53200538-53200769)
chr4 (77-260)||(14296471-14296654)
chr4 (80-303)||(37931798-37932020)
chr4 (77-260)||(14314719-14314902)
chr4 (247-394)||(42772832-42772979)
chr4 (256-394)||(6973808-6973946)
chr4 (164-382)||(30942749-30942968)
chr4 (96-327)||(7001748-7001976)
chr4 (281-390)||(14296645-14296754)
chr4 (281-390)||(14314893-14315002)
chr4 (236-390)||(25978511-25978664)
chr4 (221-358)||(9947947-9948084)
chr4 (81-300)||(13110207-13110425)
chr4 (211-358)||(45577619-45577770)
chr4 (202-376)||(44355768-44355942)
chr4 (164-309)||(43739422-43739567)
chr4 (283-394)||(56487182-56487288)
chr4 (169-263)||(42772724-42772818)
chr4 (167-288)||(43893541-43893662)
chr4 (322-394)||(23328015-23328087)
chr4 (215-358)||(21098546-21098689)
chr4 (186-300)||(52755503-52755617)
chr4 (221-357)||(3579142-3579279)
chr4 (201-326)||(52673809-52673934)
chr4 (222-288)||(38520518-38520584)
chr4 (168-382)||(43189670-43189883)
chr4 (128-206)||(53343560-53343638)
chr4 (297-382)||(44640417-44640502)
chr4 (167-260)||(56487281-56487374)
chr4 (195-272)||(40792409-40792486)
chr4 (230-357)||(10587062-10587189)
chr4 (78-142)||(11055161-11055225)
chr4 (213-394)||(31445771-31445952)
chr4 (170-309)||(41897338-41897477)
chr4 (77-123)||(2725283-2725329)
chr4 (340-394)||(13110443-13110497)
chr4 (312-358)||(51518482-51518528)
chr4 (211-304)||(7381285-7381378)
chr4 (222-271)||(34559963-34560012)
chr4 (222-263)||(41720862-41720903)
chr4 (358-394)||(2114191-2114227)
chr4 (77-137)||(38520438-38520498)
chr4 (211-275)||(41262007-41262071)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (79-390)||(29584749-29585060)
chr3 (76-394)||(28675661-28675979)
chr3 (72-394)||(1344603-1344925)
chr3 (80-390)||(21221261-21221570)
chr3 (76-394)||(51259676-51259994)
chr3 (79-394)||(2134944-2135259)
chr3 (85-394)||(12349067-12349376)
chr3 (74-384)||(4851364-4851672)
chr3 (128-394)||(20609544-20609810)
chr3 (79-388)||(47958334-47958643)
chr3 (128-394)||(34026590-34026856)
chr3 (125-394)||(44116859-44117128)
chr3 (123-394)||(40094421-40094692)
chr3 (76-394)||(24571153-24571470)
chr3 (81-387)||(3864578-3864883)
chr3 (128-394)||(42636299-42636565)
chr3 (76-382)||(53557703-53558009)
chr3 (82-394)||(25927223-25927536)
chr3 (77-394)||(31882918-31883234)
chr3 (79-394)||(25860317-25860632)
chr3 (78-394)||(38213227-38213543)
chr3 (76-394)||(39052734-39053053)
chr3 (73-394)||(33364674-33364994)
chr3 (84-394)||(50386352-50386661)
chr3 (75-394)||(51925104-51925422)
chr3 (160-394)||(20255000-20255233)
chr3 (78-359)||(26282315-26282599)
chr3 (163-387)||(51296539-51296763)
chr3 (73-394)||(5442159-5442468)
chr3 (77-382)||(21373812-21374107)
chr3 (176-394)||(49748807-49749025)
chr3 (82-394)||(29645943-29646255)
chr3 (128-394)||(3695203-3695449)
chr3 (78-394)||(22484639-22484954)
chr3 (167-394)||(54622693-54622919)
chr3 (136-394)||(3964220-3964477)
chr3 (167-394)||(3867545-3867772)
chr3 (210-394)||(19906767-19906951)
chr3 (186-394)||(50678779-50678987)
chr3 (216-394)||(24721496-24721674)
chr3 (81-266)||(53046670-53046850)
chr3 (75-394)||(10747088-10747389)
chr3 (164-392)||(45690804-45691026)
chr3 (264-394)||(41682949-41683079)
chr3 (207-394)||(52300439-52300628)
chr3 (77-221)||(43175441-43175585)
chr3 (247-394)||(6179467-6179615)
chr3 (215-355)||(34351303-34351443)
chr3 (212-355)||(39215404-39215547)
chr3 (164-268)||(41694923-41695027)
chr3 (135-394)||(44000192-44000450)
chr3 (319-394)||(43175589-43175664)
chr3 (164-394)||(44267701-44267925)
chr3 (164-309)||(25954410-25954554)
chr3 (195-394)||(8253664-8253862)
chr3 (228-360)||(26847349-26847482)
chr3 (164-260)||(32621828-32621924)
chr3 (293-356)||(53046605-53046668)
chr3 (202-366)||(32768589-32768755)
chr3 (186-350)||(25395595-25395760)
chr3 (168-384)||(28624828-28625041)
chr3 (222-311)||(8648536-8648625)
chr3 (190-356)||(17264606-17264773)
chr3 (211-394)||(8066954-8067136)
chr3 (222-289)||(14155461-14155528)
chr3 (201-341)||(36772016-36772154)
chr3 (222-280)||(23322158-23322216)
chr3 (261-394)||(30258928-30259061)
chr3 (211-291)||(26106623-26106703)
chr3 (212-284)||(51813399-51813470)
chr3 (293-336)||(53046517-53046560)
chr3 (211-289)||(42547371-42547449)
chr3 (216-266)||(53046562-53046607)
chr3 (221-306)||(389459-389544)
chr3 (75-108)||(20254945-20254978)
chr3 (222-275)||(45871423-45871475)
chr3 (73-109)||(40083189-40083225)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (72-394)||(7523037-7523360)
chr5 (76-394)||(35701147-35701465)
chr5 (78-394)||(2351552-2351868)
chr5 (76-394)||(32528585-32528903)
chr5 (81-394)||(11963216-11963529)
chr5 (77-370)||(21739093-21739381)
chr5 (115-390)||(31770503-31770778)
chr5 (77-379)||(6284221-6284524)
chr5 (71-394)||(8136704-8137025)
chr5 (128-394)||(24181532-24181798)
chr5 (71-394)||(41790371-41790693)
chr5 (128-394)||(29241300-29241566)
chr5 (78-357)||(4818085-4818364)
chr5 (75-394)||(34794756-34795075)
chr5 (77-394)||(39918379-39918695)
chr5 (128-394)||(7208138-7208404)
chr5 (128-394)||(31879984-31880250)
chr5 (123-390)||(40489254-40489521)
chr5 (128-394)||(41459511-41459776)
chr5 (128-390)||(39788114-39788377)
chr5 (77-394)||(22493327-22493643)
chr5 (76-394)||(31644318-31644633)
chr5 (78-394)||(3735230-3735545)
chr5 (121-361)||(28090461-28090701)
chr5 (76-394)||(4689606-4689923)
chr5 (83-394)||(7770187-7770497)
chr5 (128-394)||(23091212-23091478)
chr5 (73-390)||(7725721-7726037)
chr5 (155-382)||(553345-553573)
chr5 (78-387)||(24036105-24036411)
chr5 (138-338)||(5571608-5571806)
chr5 (77-298)||(40182335-40182556)
chr5 (98-390)||(700513-700805)
chr5 (77-394)||(18470336-18470652)
chr5 (138-394)||(32092890-32093144)
chr5 (80-338)||(5673018-5673271)
chr5 (186-368)||(22432243-22432425)
chr5 (164-391)||(8560893-8561119)
chr5 (195-394)||(27838982-27839180)
chr5 (78-394)||(37148497-37148797)
chr5 (210-394)||(5598484-5598668)
chr5 (211-394)||(17031162-17031345)
chr5 (1-76)||(11145712-11145787)
chr5 (298-394)||(4664923-4665019)
chr5 (195-359)||(11090811-11090974)
chr5 (77-165)||(20119642-20119730)
chr5 (76-153)||(548218-548295)
chr5 (167-304)||(6311658-6311794)
chr5 (253-357)||(35955046-35955150)
chr5 (221-327)||(24206386-24206492)
chr5 (188-272)||(29788489-29788572)
chr5 (350-394)||(5571565-5571609)
chr5 (187-247)||(1338601-1338661)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (76-394)||(2614766-2615084)
chr6 (79-394)||(24203236-24203550)
chr6 (76-394)||(3259548-3259871)
chr6 (83-394)||(17867712-17868023)
chr6 (83-394)||(17877495-17877806)
chr6 (77-382)||(24242535-24242840)
chr6 (74-394)||(15276878-15277198)
chr6 (77-394)||(32409793-32410110)
chr6 (78-394)||(3932748-3933064)
chr6 (80-394)||(11212131-11212445)
chr6 (123-373)||(32132342-32132592)
chr6 (88-394)||(10324052-10324358)
chr6 (128-394)||(166864-167130)
chr6 (77-394)||(10959872-10960188)
chr6 (156-394)||(11613732-11613970)
chr6 (128-394)||(34176752-34177018)
chr6 (93-394)||(15277221-15277522)
chr6 (77-394)||(10485030-10485345)
chr6 (78-384)||(17443135-17443440)
chr6 (168-394)||(11279090-11279316)
chr6 (186-394)||(11382044-11382250)
chr6 (77-394)||(14925397-14925713)
chr6 (77-394)||(31870038-31870357)
chr6 (82-394)||(18057396-18057707)
chr6 (81-370)||(4494079-4494352)
chr6 (77-394)||(3379583-3379898)
chr6 (74-390)||(34683938-34684246)
chr6 (76-359)||(8177858-8178141)
chr6 (79-394)||(23636097-23636411)
chr6 (169-394)||(3290635-3290847)
chr6 (90-387)||(11675322-11675619)
chr6 (187-394)||(9902599-9902806)
chr6 (164-394)||(18597099-18597329)
chr6 (80-394)||(14807959-14808254)
chr6 (76-394)||(32859922-32860239)
chr6 (86-394)||(29054239-29054544)
chr6 (77-228)||(29814736-29814887)
chr6 (77-228)||(28502330-28502482)
chr6 (164-394)||(7396067-7396294)
chr6 (168-376)||(35004087-35004295)
chr6 (222-368)||(9613990-9614136)
chr6 (76-176)||(32805348-32805448)
chr6 (232-390)||(9200332-9200491)
chr6 (168-368)||(27824620-27824817)
chr6 (77-153)||(11381964-11382040)
chr6 (215-352)||(28967277-28967414)
chr6 (215-271)||(27756314-27756370)
chr6 (343-394)||(33041403-33041454)
chr6 (198-356)||(5650684-5650841)
chr6 (170-324)||(16542286-16542440)
chr6 (221-359)||(28068824-28068962)
chr6 (337-394)||(14925158-14925215)
chr6 (168-289)||(29424613-29424734)
chr6 (79-142)||(11279012-11279075)
chr6 (76-143)||(11613968-11614035)
chr6 (211-272)||(29202990-29203050)
chr6 (343-387)||(13415861-13415905)
chr6 (212-319)||(24785060-24785168)
chr6 (186-269)||(15400651-15400734)
chr6 (186-269)||(15412438-15412521)
chr6 (186-269)||(15428032-15428115)
chr6 (253-331)||(2122770-2122848)
chr6 (297-358)||(2122902-2122963)
chr6 (205-241)||(4064277-4064313)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (77-394)||(23448-23763)
scaffold0054 (202-361)||(19903-20062)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (76-394)||(101819-102137)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (78-374)||(17982-18278)
scaffold0169 (78-309)||(12529-12760)
[»] scaffold0208 (1 HSPs)
scaffold0208 (72-394)||(2247-2568)
[»] scaffold0729 (1 HSPs)
scaffold0729 (79-394)||(4487-4796)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (78-394)||(51311-51626)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (81-394)||(15047-15360)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (130-394)||(19000-19262)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (78-394)||(5347-5663)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (128-394)||(372872-373138)
[»] scaffold0957 (1 HSPs)
scaffold0957 (115-392)||(2406-2682)
[»] scaffold0360 (2 HSPs)
scaffold0360 (128-394)||(15281-15551)
scaffold0360 (195-327)||(13554-13686)
[»] scaffold0650 (1 HSPs)
scaffold0650 (130-394)||(1551-1814)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (75-394)||(13595-13913)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (73-394)||(42859-43177)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (253-394)||(19064-19205)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (168-317)||(33530-33678)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (222-368)||(108239-108385)
scaffold0021 (222-368)||(111009-111155)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (168-317)||(7443-7596)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (76-108)||(338757-338789)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 845021 - 844701
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  845021 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttat 844922  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  844921 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 844822  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844821 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 844722  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  844721 tgttctgtcctgtccttcatt 844701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6711342 - 6711023
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggttt-gcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  6711342 agggtgtgtttggttttgcaaaacatcaagtactggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaattttttatg 6711243  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6711242 gcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtt 6711143  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711142 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 6711043  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6711042 gttctgtcctgtccttcatt 6711023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45491167 - 45490852
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  45491167 gtgtgtttggtatgcaaaacagcaattactggacagaacaatataagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttgtatggcat 45491068  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45491067 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 45490968  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45490967 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttc 45490868  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45490867 tgtcctgtctttcatt 45490852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1351728 - 1351412
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  1351728 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 1351629  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351628 attgagta-ttttttgttttatatgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 1351530  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1351529 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 1351430  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1351429 tctgtcctgtccttcatt 1351412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Original strand, 42510401 - 42510722
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42510401 ttaagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttta 42510500  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42510501 tggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 42510600  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42510601 tttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagag 42510700  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  42510701 ttgtcctgtcctgtccttcatt 42510722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 35387606 - 35387288
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35387606 agggtctgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataataatacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacagcacatgacaaattttttatgg 35387507  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35387506 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggttt 35387407  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35387406 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35387307  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  35387306 ttctgtcatgtccttcatt 35387288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 16386734 - 16387051
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16386734 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaatacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 16386833  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16386834 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 16386933  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16386934 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaactgt 16387033  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  16387034 tctgtcatgtccttcatt 16387051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 16451009 - 16451324
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  16451009 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacatggcagaatagcacaggacaaattttttatggcat 16451108  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16451109 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 16451208  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16451209 gagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgtta 16451308  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  16451309 tgtcctgtccttcatt 16451324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 79 - 384
Target Start/End: Original strand, 12890120 - 12890425
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  12890120 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatggcat 12890219  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12890220 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatcttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgat 12890319  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890320 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 12890419  T
Q  379 tgtcct 384  Q
    ||||||    
T  12890420 tgtcct 12890425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 32270240 - 32270550
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||     |||||| ||||||||||||    
T  32270240 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatag-----gacaaattttttatggcat 32270334  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32270335 tgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 32270434  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270435 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctctacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 32270534  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  32270535 tgtcctgtccttcatt 32270550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28340597 - 28340284
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  28340597 gggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaatttttttatggc 28340498  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28340497 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 28340398  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340397 atgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 28340298  T
Q  377 tctgtcctgtcctt 390  Q
    ||| ||||||||||    
T  28340297 tctatcctgtcctt 28340284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 41972792 - 41973108
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  41972792 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggc 41972891  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  41972892 attaagtaattttttgttttatacgatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtagtgtggtttg 41972990  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972991 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 41973090  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  41973091 tctatcctgtccttcatt 41973108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 76 - 392
Target Start/End: Original strand, 7183797 - 7184113
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7183797 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaatacaggacaaattttttatgg 7183896  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7183897 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatactatattggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggttt 7183996  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7183997 ggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacatatcaaacactggacaactaaagtta 7184096  T
Q  376 ttctgtcctgtccttca 392  Q
    |||||||||||| ||||    
T  7184097 ttctgtcctgtctttca 7184113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 51264377 - 51264692
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  51264377 gtgtgtttggtttgcaaatcagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacaggacaaattttttatggcat 51264476  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51264477 tgagtaattttttgttttatacgatttttaaaggacaaaatgctattttagtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 51264576  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51264577 gagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattc 51264676  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||    
T  51264677 tgtcttgtccttcatt 51264692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 79 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24339929 - 24339619
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24339929 gtgtgtttggtctgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 24339830  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt-gg 277  Q
    ||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24339829 tgaataattttttgttttatacgatgtttgggggacaa--tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgttgtggttttgg 24339732  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24339731 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 24339632  T
Q  378 ctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||    
T  24339631 ctgtcctgtcctt 24339619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26118458 - 26118192
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26118458 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 26118359  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26118358 ggtattttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtc 26118259  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26118258 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttatgtcatgtccttcatt 26118192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30105923 - 30105657
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30105923 agaacagtacaacacaaggcagaacaacactggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 30105824  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30105823 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 30105724  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30105723 ctttacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcctgtccttcatt 30105657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 79 - 390
Target Start/End: Original strand, 50540226 - 50540537
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  50540226 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacacgtcagaacagcacagggcaaattttttatggcat 50540325  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50540326 tgagtaatttgttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgat 50540425  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  50540426 gaaggacaaaaatatgagtttatgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagctgttt 50540525  T
Q  379 tgtcctgtcctt 390  Q
    ||| ||||||||    
T  50540526 tgttctgtcctt 50540537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41968142 - 41967826
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||  ||| |||| || |||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  41968142 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtgctggacagaacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcggaacaatacatgacaaattttttatgaca 41968043  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41968042 atgagtaattttttgttttatacaatttttgggagacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgg 41967943  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41967942 taagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgtt 41967843  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||    
T  41967842 ctgtcctgtccttcatt 41967826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 17887828 - 17888145
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   ||| || | || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  17887828 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacagaatagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggca 17887927  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17887928 ttgagtaatttgttgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 17888027  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17888028 gcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgt 17888127  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||| |||| ||||||    
T  17888128 tttgtcatgtcattcatt 17888145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Original strand, 31004019 - 31004329
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || |||| |||||||  ||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||     
T  31004019 gtttggtttgcaaaacagcaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacagcgcaatacaagggagaacatcacaggacaaa-tttttatggcattgaa 31004117  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31004118 taattttttgttttataggatttttgggggacgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 31004217  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31004218 gacaaaaacatcagtttttgtcctgtcccgtgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtc 31004317  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||    
T  31004318 ctgtccttcatt 31004329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44738338 - 44738019
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||    
T  44738338 taaggatgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtagaagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttat 44738239  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44738238 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaataaaaa-ctattttgctattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggt 44738140  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44738139 ttggtgagggacaaaaatatgagttttggtcctgtcccttgcctccaagttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaattagagt 44738040  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  44738039 tgttctgtcttgtctttcatt 44738019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16476451 - 16476132
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||  ||| |||||| ||| |||    
T  16476451 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataagatagaacaacacgacataaggcataacaccacatgacaaa-tttgtat 16476353  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16476352 ggcattgaataattttatgttttatacaatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggt 16476253  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16476252 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaat 16476153  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| || |||| |||||||||    
T  16476152 tgtcctctcctctccttcatt 16476132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51703455 - 51703141
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  51703455 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatataacagaacaacacaaggcaaaacaatacatgacaaattttttatggca 51703356  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51703355 ttgagtaattttttgttttataccatttt-gagggacaaaatgttatttttgtattttagacaacatgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtt-gg 51703258  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51703257 tgaggaacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgccttcagtttatcctgtacttgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgtt 51703158  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||||||||||    
T  51703157 ctgtcttgtccttcatt 51703141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 16437259 - 16437559
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||               |||||||||||| |||||||||||    
T  16437259 ggtgtgtttggtttgtaaaacagcaaatactggacagaacagtataagatagaacagtaca---------------gtacaggacaaa-tttttatggca 16437342  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16437343 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 16437442  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16437443 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctctagtttgtcctgtagctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgtt 16437542  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || | ||||||||||||    
T  16437543 ctattctgtccttcatt 16437559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 50304532 - 50304848
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  50304532 gggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgac 50304630  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  50304631 attgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttaaacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 50304730  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
      ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50304731 cagagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtttcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 50304830  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50304831 tctgtcctgtccttcatt 50304848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17327940 - 17327626
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||| ||||||||| || || || |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||    
T  17327940 tgtgtttgatttgcaaaaaagtaagtattggacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcgtt 17327841  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||    
T  17327840 gagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatattattttggtattttagataatttgtacatgagacaaaaagttgtgctgtgatttggtg 17327741  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17327740 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgactccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgtttt 17327641  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||||||||||    
T  17327640 gtcttgtccttcatt 17327626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32289592 - 32289321
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||||||  | |||| |||  ||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32289592 aagatagaagagtataacataagccagaacaacataggataaatattttatgacattgaataattttatgttttatataatttttgagggacaaaatgct 32289493  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  32289492 attttggtattttaaacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccaat 32289393  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32289392 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcttgtccttcatt 32289321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 42513060 - 42512751
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||   | |||  |||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |    
T  42513060 gggtgcgtttggtttgcaaaaca---agtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatcac 42512965  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42512964 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaattctattttgatattttagacaatttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttg 42512865  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42512864 ctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 42512765  T
Q  377 tctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||||    
T  42512764 tctgtcctgtcctt 42512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 1601049 - 1601368
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagataga-----acagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||| || |||| |||     |||  ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  1601049 ggtgtgtttggtctgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagaaagaacaacacaacacaacacaaggcagaacaacacaagacaaatttttta 1601148  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1601149 tggcaatgagtaattttttgttttgtacgatttttggtggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 1601248  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1601249 tttggtgagggacaaaa--atgagtttttgttctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaccgttttacaaatcaaacactgaacaactaaag 1601346  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  1601347 ttgttctgtcatgttcttcatt 1601368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 46154780 - 46155104
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||| |||||| |||||||| |    
T  46154780 gggtgtgtttagtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtataacacaagacataacggcacatgacaaattttttatgac 46154879  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg-------ttg 269  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||    
T  46154880 attgaataattttttgttttataagatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtgctgtagtttg 46154979  T
Q  270 tggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 369  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46154980 tagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcacctccagtttgtccagtacctgaaataattttacaaatcaaacactgaacaatta 46155079  T
Q  370 gagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  46155080 gagttgttctgtcatgtccttcatt 46155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 76 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6029595 - 6029283
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || ||||  |||  ||| |||||   ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  6029595 agggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttttatgg 6029497  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
     ||||| || ||| ||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6029496 tattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 6029397  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6029396 ggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttg 6029297  T
Q  376 ttctgtcctgtcct 389  Q
    ||||||||||||||    
T  6029296 ttctgtcctgtcct 6029283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 72 - 393
Target Start/End: Original strand, 39281770 - 39282090
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||| |||||  ||| |    
T  39281770 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtataagatagaacagcacaacacaatgcataacaacacatgacaac-tttgt 39281868  T
Q  172 atggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    ||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  39281869 atgacattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtg 39281968  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  39281969 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaa 39282068  T
Q  372 gttgttctgtcctgtccttcat 393  Q
    ||| |  |||| ||||||||||    
T  39282069 gttatcttgtcatgtccttcat 39282090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11772929 - 11772609
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | || ||||  ||| |||| || |||| | ||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  11772929 ttaagagtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaacacaacacaaggcagaatagcacaggacaaa-ttttta 11772831  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||  |||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11772830 tggttttgaattattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtatttaaaacaatttgtaggtgggacaaaaagttgtgctgtgg 11772731  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11772730 tttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgcctccagattgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggag 11772631  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  11772630 ttgttatgtcctgtccttcatt 11772609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 78 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26765082 - 26764779
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||    
T  26765082 ggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcagaacaatataggacaaa-tttttatagca 26764984  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| |     ||| || ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26764983 ttgaat-----ttttttatatacgatttttgagggacgaaatattattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttcgg 26764889  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26764888 tgagggacaaaaatataagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttatcttgtacctaaaacaattgtacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 26764789  T
Q  378 ctgtcctgtc 387  Q
    ||||| ||||    
T  26764788 ctgtcatgtc 26764779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Original strand, 45658755 - 45659018
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45658755 aacagcacaacacaagacagaatagcacatgacaaa-tttttatggctttgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgctattttgg 45658853  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  45658854 tatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgtctccagtttgtcct 45658953  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45658954 gtacttgaaacagttttacaaatcagacactagacaactggagttgttttgtcctgtccttcatt 45659018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38087285 - 38086973
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38087285 gtgtttggtttgcaaaacattaagtactggacataacagtacaagacagaacagtacaacataaggcagaacagcacaggacaaa-tttttatggcattg 38087187  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    | || | ||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38087186 aataatattttgctttatgcaatttttggggaacgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacttgggacaaaaagttgtgatgtggtttagtga 38087087  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  38087086 aggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccattgcatccattttatcctgtacttgaaactgttttataaatcaaacacaggacaactgaagttgttttg 38086987  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||    
T  38086986 tcctatccttcatt 38086973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 390
Target Start/End: Original strand, 16704605 - 16704919
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||  ||| ||||| | |||| ||||||  | |||| || |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  16704605 agggtgagtttggttttcaaaacagaaagtactggacataacaacacaagacagaacaacaaaacataaagcagaatagtacaagacaaa-tttttatgg 16704703  T
Q  176 cattgagtac-ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    |||| | ||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  16704704 cattaaataaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaaagctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaagagttgtgatgtggtt 16704803  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||    
T  16704804 tggtaagggacaaaaatatatgtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagtt 16704903  T
Q  375 gttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||||||    
T  16704904 gttctgtcctgtcctt 16704919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15540132 - 15539867
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15540132 agaacagcacaacacaaggcataacaacacatgacaag-tttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttatttt 15540034  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15540033 ggtgttttagacaacttctacgtatgacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaaagacaaaagtttcaggttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtt 15539934  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15539933 ctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctgtccttcatt 15539867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 79 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13994366 - 13994056
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||   ||||||||| |||||| |  |||  |||| |||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||  ||    
T  13994366 gtgtgtttggtttgcaaaacaataagtacagaacaaaacaacataagacaacacaacacaatacaaggcagaacaacacaagacaaattttgtatgatat 13994267  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||| || |||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13994266 tgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 13994168  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13994167 gagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccatgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttc 13994068  T
Q  379 tgtcctgtcctt 390  Q
    |||||| |||||    
T  13994067 tgtcctatcctt 13994056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42705448 - 42705231
Alignment:
Q  161 acaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42705448 acaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgacatttcagacaacttgtacgtgggacgaaaa 42705349  T
Q  261 gttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42705348 gttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttttttcccgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 42705249  T
Q  360 tggacaactagagttgtt 377  Q
    || ||||  |||||||||    
T  42705248 tgaacaatcagagttgtt 42705231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 186 - 394
Target Start/End: Original strand, 5109718 - 5109925
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5109718 tttttttttttatacaatttttgggggacaaaatgttattttgc-attttagacaacttgtactttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggac 5109816  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5109817 aaaaacatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcctg 5109916  T
Q  386 tccttcatt 394  Q
      |||||||    
T  5109917 cacttcatt 5109925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 79 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3415146 - 3414831
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||  ||| |  |   ||||||||||||    
T  3415146 gtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatataacacaagacaaaacaacacatgtaattttttttatggcat 3415047  T
Q  179 tgagtactttttt-gttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  3415046 tgagtaatttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaactagtacgtgggataaaaaattatgatgtagtttgg 3414947  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3414946 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccctcgtctccagattgtccagtacctaaaatagttttacaaatcaaacactggataattagagttgtt 3414847  T
Q  378 ctgtcctgtccttcat 393  Q
     |||| | ||||||||    
T  3414846 ttgtcatatccttcat 3414831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6144276 - 6143963
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||| || |||||||  ||  |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||    
T  6144276 tgtgtttggtttgcaaaacagtaatcactgaacagaacagtacaagatagggcaacacaacataaggcagaacatcacaagacaaa-tttttatggtatt 6144178  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    || || |||| |||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  6144177 gaataattttctgttttatatgatttttgggtgacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttctacgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttgccg 6144078  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  6144077 agggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtctctgaaactgttttacaaatcaaacattggacaactgcagttgttct 6143978  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||    
T  6143977 gtcctgtccttcatt 6143963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 141 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49303583 - 49303343
Alignment:
Q  141 acaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagaca 240  Q
    |||||||||||||  ||| |||||   ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  49303583 acaaggcagaacatcacatgacaactattttacgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgttattttagtattttagaca 49303485  T
Q  241 acttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 340  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  49303484 acttgtacgtaggataaaaaattgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttctcttgtcccttgtctccagtttgtcttatacctgaaac 49303385  T
Q  341 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49303384 agttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttgtc 49303343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 125 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20495137 - 20494927
Alignment:
Q  125 gatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctat 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20495137 gatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctat 20495038  T
Q  225 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20495037 tttggtattttagacaacttgtacgtgggaca-----------------ttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 20494955  T
Q  325 gtcctgtacctgaaacagttttacaaat 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20494954 gtcctgtacctgaaacaattttacaaat 20494927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 309
Target Start/End: Original strand, 25539735 - 25539967
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || ||||  ||| |||| || |||| | |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  25539735 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaagacataacaatacaacacaaggcagaatagcacaggacaaa-tttttatgg 25539833  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    | |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25539834 ctttgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtaggtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 25539933  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25539934 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtc 25539967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 378
Target Start/End: Original strand, 10384253 - 10384548
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattga 181  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   || |||| || ||||  |||||| |||||||| |||| ||||  || ||||||  ||||||| |||||||    
T  10384253 tgtttggtttgcaaaacagtaagtactgggcataacagtacaagaccgaacagcacaacacagggcaaaacaacactggacaat-tttttattgcattga 10384351  T
Q  182 gtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag 281  Q
     || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  10384352 ataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttgaatttttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgaa 10384451  T
Q  282 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10384452 ggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcatccaatttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttc 10384548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 292
Target Start/End: Original strand, 38663014 - 38663227
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||  |||| | |||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  38663014 ggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacaggacaaa-tttttatgaca 38663112  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  38663113 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgc 38663212  T
Q  278 tgagggacaaaaata 292  Q
    |||||||||||||||    
T  38663213 tgagggacaaaaata 38663227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50382608 - 50382377
Alignment:
Q  166 atttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 265  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50382608 atttttatggtattgaataatattttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttttgtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 50382509  T
Q  266 gttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg---cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||   ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  50382508 gttgtggtttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctccagtttgttatgtccctgaaacagttttaaaaatcaaacactaa 50382409  T
Q  363 acaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||  |||||||||| |||  | |||||||||    
T  50382408 acatgtagagttgttttgtattctccttcatt 50382377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 282
Target Start/End: Original strand, 34663858 - 34664012
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34663858 agaacagtacaacataaggtagaagagcacatgacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttatatgatttttgagtgacaaaatgttatttt 34663957  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    | |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34663958 gatattttagacaatttataagtgggtcaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 34664012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 357
Target Start/End: Original strand, 570258 - 570549
Alignment:
Q  68 tagtattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaat 167  Q
    |||||||  ||||| ||||| | |||||||||| || || || |||||| | || |||||||||||  |||||| || ||||||||  ||| || ||| |    
T  570258 tagtattttgggtgcgtttgatgtgcaaaacagtaagtattagacaaaatagtacaagatagaacaacacaacataaagcagaacaacacaagataaa-t 570356  T
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg- 266  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||     
T  570357 ttttatggtactgaatacttttttatcttatacaatttttggtggaaaaaatgttattttgatattttagacaacttatacgcgagacaaaaagttgtgc 570456  T
Q  267 -ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctc-ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 357  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||| | ||||||||||||| || |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  570457 attgtggtttggtgagggacaaaaatttctgtttttatcatgtccctttgcctccagtttatcttgtcgctgaaacaattttataaatcaaac 570549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Original strand, 7837149 - 7837330
Alignment:
Q  213 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctct 312  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||  | | |||||||| |||| ||    
T  7837149 acaaaatactattttgatattttagacaacttgtctgtgagacaaaaagttgtgatgtgatttggtaatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtccct 7837248  T
Q  313 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || | |||||||||    
T  7837249 tgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttctatcatatccttcatt 7837330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 25343416 - 25343213
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25343416 aaatttttatgacattgaataattttttgctttatgcgatttttgagggacgaaatactattttggatttttggacaacttgtacgtgcgacaaaaagtt 25343317  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt-ctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 362  Q
    ||  | |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| | |  |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | ||    
T  25343316 gtactatggtttagtgaaggacaaaaatatgtgtttttatcctatccatttgcatccagtttgtcctgtatatgaaactgttttataaatcaaacgcagg 25343217  T
Q  363 acaa 366  Q
    ||||    
T  25343216 acaa 25343213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 504549 - 504394
Alignment:
Q  213 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctct 312  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| | | |||||||||  |||| ||    
T  504549 acaaaaagctactttggtattttagacaacttctatgtgggacaaaaaattgtgttatggtttagtgagagacaaaattttcagtttttgtgttgtccct 504450  T
Q  313 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  504449 tgcctcaagtttgtcttgtccctaaaacaattttgcaaatcaaacgctgtacaact 504394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 283 - 394
Target Start/End: Original strand, 8838983 - 8839094
Alignment:
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8838983 gacaaaaatatcagtttttgtcatgtccatttcctccagtttgtcttgtaccagaaacagttttacaaatcaaacattggacaattggagttgttctgtc 8839082  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||    
T  8839083 ttgtccttcatt 8839094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 359
Target Start/End: Original strand, 6771382 - 6771530
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||     
T  6771382 ggacaaaatattattttgatattttagtcaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtgatttagtgagtgacaagaattttagtttttgtcttgtcc 6771481  T
Q  311 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6771482 cttgtctctaatttatcatgtccctaaaacagttttataaatcaaacac 6771530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 367
Target Start/End: Original strand, 39792826 - 39792977
Alignment:
Q  216 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgc 315  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||| | ||| |||     
T  39792826 aaatgttattttattattttagacaatttgtacgtgaaacaacaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaagaatttcaatttttgtcatatcttttgt 39792925  T
Q  316 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 367  Q
    ||||| ||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39792926 ctccaatttatcttgtccctaaaacagttttgcaaatcaaacactgtacaac 39792977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 358
Target Start/End: Original strand, 26733579 - 26733716
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||  | | ||| |    
T  26733579 ctattttggtattttagacaacttgtacatgaggcaaaaagttgtgttatggtttagtgggggacaagaatttcagtttttgtcatgtccatcgtctcta 26733678  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||    
T  26733679 gtttgtccggtcctaaaaacagttttacaaatcaaaca 26733716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 230 - 382
Target Start/End: Original strand, 17291612 - 17291763
Alignment:
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||  || ||||    
T  17291612 tattttatataacttgtacgagggacaaaaagttttgttgtggtttagtg-gggacaaaaatttatgtttttgtcctgtctcttgacttcaacttatcct 17291710  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    || |   |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||    
T  17291711 gtcctaaaaacagttttacaaatcaaataccgtacaactggagttgtcctgtc 17291763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 394
Target Start/End: Original strand, 38663228 - 38663304
Alignment:
Q  318 ccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38663228 ccagtttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcttgtccttcatt 38663304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 394
Target Start/End: Original strand, 21071728 - 21071811
Alignment:
Q  311 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||    
T  21071728 cttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattgaagttgttctgtcatgtacttcatt 21071811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 394
Target Start/End: Original strand, 7837430 - 7837571
Alignment:
Q  253 gacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaat 352  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||  | | |||||||| |||| | |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  7837430 gacaaaaagttgtgatgtgatttgataatggacaaaaaattcaatttttgtcatgtcccctgcctctagtttgtcatgttcctgaaacagttttataaat 7837529  T
Q  353 caaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||| || | |||||||||    
T  7837530 caaacactgaacaactgaagttattctatcatatccttcatt 7837571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 358
Target Start/End: Original strand, 40610739 - 40610883
Alignment:
Q  214 caaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc-tct 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||| | || | |    
T  40610739 caaaatgttattttggtattttagacaacttatatatgtgataaaaagttgtgttgtggtttgatgagggagaagaat-tttgtttttgtcatatctttt 40610837  T
Q  313 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    ||||| || |||||||||   | | |||||||||||||||||||||    
T  40610838 tgccttcaatttgtcctgccgccggaacagttttacaaatcaaaca 40610883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 46815889 - 46815816
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  46815889 ggacaaaatgttattttggtattttagacaactagtacgtgggaaaaaaggttgtgatatggtttagtgaggga 46815816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16643361 - 16643272
Alignment:
Q  190 ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag 281  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16643361 ttgttttatacgattttgg--ggacgaaatggtatttttgtattttagacaacctgtatgtgggacaaaaagttgtgtcgtgatttggtgag 16643272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23799670 - 23799604
Alignment:
Q  238 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 304  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23799670 acaacttaaacgtgcgataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtc 23799604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 320
Target Start/End: Original strand, 46447669 - 46447787
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 301  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||   |||| | |||||| | |||||||    
T  46447669 atttttgatggacaaaagactattttgatattttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtaatttaaggaggaataaaaattttagttttt 46447768  T
Q  302 gtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    |||  ||| ||||||||||    
T  46447769 gtcaggtcccttgcctcca 46447787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2761715 - 2761551
Alignment:
Q  212 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctc 311  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||  |  ||||||||  |||| |    
T  2761715 gacaaaaatctatttttgtattttagataatttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttagtgagggatataaaattttgtttttgttttgtccc 2761616  T
Q  312 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||| ||||| || |||  |  ||||| |||||||||| ||||||   |||||| |||||||    
T  2761615 ttgcctctagtttatcatgtcgcataaacaattttacaaattaaacaccatacaacttgagttgt 2761551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32468025 - 32467926
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||   | ||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32468025 tttttatggtattgactaattttttgtcttatatgattttttgtgaacaaaaaactattttgatattgtagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtg 32467926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40811405 - 40811348
Alignment:
Q  337 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  40811405 aaacagttttataaatcaaacgctggacaactaaagttgttttgtcatgtccttcatt 40811348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Original strand, 33316435 - 33316491
Alignment:
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  33316435 aaaatgctatttttgtaatttagacaacttgtacgtgtaagaaaaagttgtgttgtg 33316491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 360
Target Start/End: Original strand, 35335759 - 35335863
Alignment:
Q  256 aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||  ||  ||||||||||||||||||    
T  35335759 aaaaaattgtgtggttgtttagtgagagacaagaatatcggtttttgtcatgtctcttgtctccattttgttatgtctctacaacagttttacaaatcaa 35335858  T
Q  356 acact 360  Q
    |||||    
T  35335859 acact 35335863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47242690 - 47242528
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    ||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  |  | |||  |||| || |||||| |     
T  47242690 ttatacaattttt-atgtacaaaagactattttggtattttagacaactaacacgtgagacaaaaagttgtactaggttttaatgagagaaaaaaat-tt 47242593  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  47242592 agtttttgtcttgtcacctacctccagtttgtcatgtcccataaacaattttacaaattaaacac 47242528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 241
Target Start/End: Original strand, 8838820 - 8838987
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||| ||||||  ||||||||||  |||| |  |||  || |||||||||| |||    
T  8838820 ggtgcgtttggtttgcaaaacagtaaatactagacataactgtataagacagaacaacacaacacaagatagaaaaacacataac-aaatttttatagca 8838918  T
Q  178 ttgagt-acttttttgtt----ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaa 241  Q
    |||| | | |||||||||    |||||  ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  8838919 ttgaataatttttttgttttaattatatgatttttgggggacgaaatgccattttgatattttagacaa 8838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 356
Target Start/End: Original strand, 31574378 - 31574513
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||| |||||| ||||||  || ||||| || | |||| | |||||||||| ||| ||||  |||||    
T  31574378 ctatttttgtattttaaacaacttgtatataggacaataagttgcgttgtgaattagtgagagatacaaattttagtttttgtcatgtttcttatctcca 31574477  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 356  Q
    ||||||  |||   ||||| ||||||||||||||||    
T  31574478 gtttgttttgtttttgaaatagttttacaaatcaaa 31574513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 33316499 - 33316577
Alignment:
Q  297 tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  33316499 tttttgttttgtctcttgcgtccagtttgttttgtccctgaaacagatttacagatcaaatactgtagaactagagttg 33316577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20986406 - 20986333
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||  |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20986406 atttttgttggacaaaatactatttttctattgtaaacaacttattcgtgggacaaaaagttgtgttatggttt 20986333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 200
Target Start/End: Original strand, 21071664 - 21071727
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  21071664 acaacacaaggcagaacaatacatgac-aaatttttattacattgaataattttttgttttatac 21071727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21763269 - 21763169
Alignment:
Q  205 tttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 304  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||  | ||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  21763269 tttgatggaccaaaagttattttggtattttagacaattcgtattttggctaaaaagttgtgatgtagtttggtgagggacaagaatttcagcttttgtc 21763170  T
Q  305 c 305  Q
    |    
T  21763169 c 21763169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 281
Target Start/End: Original strand, 30105007 - 30105075
Alignment:
Q  213 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag 281  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||  |||||||||| |||||    
T  30105007 acaaaatgttattttggtattttagacaacttgtaatttggataaaaatttacgttgtggtttagtgag 30105075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8780691 - 8780601
Alignment:
Q  285 caaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||| | |||||||| | ||||||||| | |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  8780691 caaaaatttcagtttttggcatgtctcttgtccccagtttgttatgtccatgaaacagttttac-aatcaaacacagtacaactacagttgt 8780601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3560265 - 3560163
Alignment:
Q  256 aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | | | |||||||  ||||  |||| | ||||||||||| |  || | |||| ||||||||||||    
T  3560265 aaaaagttgtgttgtggtttagtaagggacaaaactttaaatttttgttttgtccattgctttcagtttgtcctatctctaagacagatttacaaatcaa 3560166  T
Q  356 aca 358  Q
    |||    
T  3560165 aca 3560163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34284021 - 34283912
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagaca--acttgtacgtgggacaaaaagttgt 265  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||  || ||| |||||| | ||||||||  |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| || ||||||||||    
T  34284021 ttttatggtattgaataagtttttgccttgtacgattttttatggacaaaagactattttgatattttatatataacttgtacgtgagataaaaagttgt 34283922  T
Q  266 gttgtggttt 275  Q
    ||||||||||    
T  34283921 gttgtggttt 34283912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26118500 - 26118463
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatact 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26118500 tattacgggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtact 26118463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 275
Target Start/End: Original strand, 40856172 - 40856225
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| |||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40856172 tatttttgtattttagataatttatatgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 40856225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 244
Target Start/End: Original strand, 49799375 - 49799424
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaactt 244  Q
    |||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49799375 ttattcaattttttatggacaaaagtctattttggtattttagacaactt 49799424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 15324146 - 15324226
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||  |  || ||||||||||||||    
T  15324146 ttttttgtcttatacgatgtttgatggacaaattactattttgatattttagacaatttacagttgagacaaaaagttgtg 15324226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 30105960 - 30105928
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30105960 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtact 30105928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8673290 - 8672972
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8673290 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaaatttttatgg 8673191  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8673190 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 8673091  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8673090 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttg 8672991  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||||||    
T  8672990 ttttgtcctgtccttcatt 8672972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 41709647 - 41709965
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41709647 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaatttttttatgg 41709746  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41709747 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgttggacaaaaagttgtgctgtggttt 41709846  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41709847 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcatttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 41709946  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41709947 ttctgtcctgtccttcatt 41709965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 34101379 - 34101696
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  34101379 gggtgtgtttggtttgcaaaaaagtaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacaggacaaattttttatggc 34101478  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  34101479 gttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaaaaaaaagttatgttgtggtttg 34101578  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34101579 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtgttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34101678  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  34101679 tctgtcttgtccttcatt 34101696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 34062998 - 34063316
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||| |||||||||    
T  34062998 agggtgtgtttggtttgcaaaaccgcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagcacaacacatgacaaattttttatgg 34063097  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34063098 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 34063197  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063198 ggcgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 34063297  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34063298 ttctgtcatgtccttcatt 34063316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 45446325 - 45446643
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  45446325 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 45446424  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45446425 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 45446524  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45446525 ggtgaggaacaaaaatatgagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgtcgtgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtta 45446624  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || |||| | |||||||||    
T  45446625 ttttgtcttatccttcatt 45446643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29672557 - 29672240
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  |||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  29672557 gggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagaactggacagaacaatacaagatagaacagtgcaacacaagacagaacaacacaggacaaatttttcatggc 29672458  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29672457 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 29672358  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29672357 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacgaatcaaacactggacaactagagttgt 29672258  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  29672257 tctgtcttgtccttcatt 29672240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 79 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32020233 - 32019920
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  32020233 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 32020134  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32020133 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctgtggtttggt 32020034  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32020033 gagggataaaaatatgagtttttgtcctaccccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttc 32019934  T
Q  379 tgtcctgtccttca 392  Q
    ||||||||||||||    
T  32019933 tgtcctgtccttca 32019920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 76 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29563461 - 29563158
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  29563461 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgg 29563362  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29563361 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 29563262  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29563261 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcgagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 29563162  T
Q  376 ttct 379  Q
    ||||    
T  29563161 ttct 29563158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Original strand, 6386444 - 6386764
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  6386444 taagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaaaacaaattttttat 6386543  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6386544 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggt 6386643  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6386644 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcttttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactacagt 6386743  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||  |||||||||||    
T  6386744 tgttatgttttgtccttcatt 6386764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Original strand, 27103827 - 27104147
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  27103827 taagggtgtgtttgatttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 27103926  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27103927 ggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggt 27104026  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27104027 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagt 27104126  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  27104127 tgttctgttctgtccttcatt 27104147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31513818 - 31513500
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  31513818 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 31513719  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  31513718 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctaggacaaaaagttgtgctgtggttt 31513619  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31513618 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatctacctgaaacaattttacaaatcaaacactggataactagagttg 31513519  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31513518 ttctgtcatgtccttcatt 31513500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 77 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3251890 - 3251585
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  3251890 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaattttttatggc 3251791  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  3251790 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggataaaaagttgtgatgtggtttg 3251691  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3251690 gtgagggacaaaaatataagtttttgttctgtcgcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactagagttgt 3251591  T
Q  377 tctgtc 382  Q
    ||||||    
T  3251590 tctgtc 3251585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 4052404 - 4052664
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4052404 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttt--gttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 4052501  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4052502 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtc 4052601  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4052602 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 4052664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37664466 - 37664200
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37664466 agaacagtacaacacaatgcagaacagcacaagacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagcgacaaaatgctatttt 37664367  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37664366 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtc 37664267  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37664266 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttattctgtcctgtccttcatt 37664200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 25478118 - 25478431
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||    
T  25478118 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtacttgacaaaacagtataagatagaacaatacaacacaaggcagaacag-----gacaaattttttatgg 25478212  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  25478213 cattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgattt 25478312  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25478313 gatgagggacaaaaatatgagtttttttcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttg 25478412  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||||||    
T  25478413 ttatgtcctgtccttcatt 25478431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7395045 - 7394731
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| |    
T  7395045 tgtgtttggtttgcaaaacagtaggtacttgacagaacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacagcataggacaagttttttatggcact 7394946  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7394945 gagtaattttttgttttatgcgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggtttggtg 7394846  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7394845 agggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttgtaaatcaaacactggacaactagagttgttct 7394746  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||||||||||    
T  7394745 gtcatgtccttcatt 7394731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5969052 - 5968781
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5969052 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtt 5968953  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5968952 attttggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagt 5968853  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5968852 ttgtcatgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcatt 5968781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30543205 - 30542939
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30543205 agaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaatattttatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttatttt 30543106  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30543105 ggtattttagacaacttgtacgtgggacgaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtc 30543006  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  30543005 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttatgtcatgtccttcatt 30542939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12753554 - 12753242
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||||||| || || |  ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  12753554 gtgtttggtttgcaaaacag-aagtattggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacaacacatgacaaaaattttatggcattg 12753456  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12753455 agtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 12753356  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12753355 ggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcatttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagtcttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttg 12753256  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||    
T  12753255 tcctgtccttcatt 12753242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Original strand, 22999123 - 22999446
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttt 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  22999123 tatttagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacaatacaaaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacagaacaaa-tttt 22999221  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa-gttgtgttg 269  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |     
T  22999222 tatgacattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttgatattttagacaagttgtacgtgggacaaaaaagttttgcta 22999321  T
Q  270 tggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22999322 tggtttgctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaaccg 22999421  T
Q  370 gagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  22999422 gagttgttctgtcatgtccttcatt 22999446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7591634 - 7591364
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7591634 aagaaagaacagtacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgct 7591536  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7591535 attttgatattttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 7591436  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7591435 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcatt 7591364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13407167 - 13406852
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||    
T  13407167 gtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatagcat 13407068  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  13407067 tgagtaattttttgttttatacgatttttggggcacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaaattatgctgtggtttggt 13406968  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13406967 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgttccttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaattaaacactagacaactagagttgttc 13406868  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||| |||||||||    
T  13406867 tgccctatccttcatt 13406852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 136 - 394
Target Start/End: Original strand, 10466995 - 10467252
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 235  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10466995 acaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatgacatagaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatatttt 10467093  T
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacct 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467094 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacct 10467193  T
Q  336 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10467194 aaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 10467252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14005227 - 14004961
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  14005227 agaacagtacaacacaagacagaacaacataggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattttttatggacaaaatgttatttt 14005128  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14005127 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgatggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtc 14005028  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  14005027 ctgtacctcaaacagttttacaaatcaaatactggacaactaaaattgttatgtcctatccttcatt 14004961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37618626 - 37618309
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||| | || ||||  ||| |||| || || | | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  37618626 agggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggacataacagtacaaaacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaa-tgtttatgg 37618528  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37618527 cattgaataattttttgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttggtatttaaaacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 37618428  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37618427 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttg 37618328  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  37618327 ttctgtcatgtccttcatt 37618309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Original strand, 15001344 - 15001654
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||| |||||     
T  15001344 gtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggtattgaa 15001443  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || |||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001444 taattttctgttttatatgatttttgggggacaaa-tgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 15001542  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15001543 gacaaaaatttcagtttttgttctgtctattgcctccagtttgtcctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtc 15001642  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||    
T  15001643 ctgtccttcatt 15001654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 31731935 - 31732238
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  31731935 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaaaagtataagatagaacagtacaacacaagacagaatagcacatgacaaaatttttatggc 31732034  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  31732035 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtactgtggtttg 31732134  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732135 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtc--------------gttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgt 31732220  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31732221 tctgtcctgtccttcatt 31732238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 77 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32303819 - 32303588
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32303819 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 32303720  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303719 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 32303620  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303619 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 32303588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Original strand, 41548536 - 41548806
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  41548536 aagaaagaacaacacaatacaagggagaacatcacaggacaaa-tttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgtt 41548634  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41548635 attttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtctgctgaggtacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 41548734  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41548735 ttgtcatgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtccttcatt 41548806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 40388911 - 40389228
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||  | || ||||  ||| || | || |||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  40388911 agggtgcgtttggtttgcaaaatggtaagtactggacataagagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacaacacaggaaaaaatttt-atgg 40389009  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40389010 cattgaataattttttattttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcatttaaaacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 40389109  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40389110 ggtgagagataaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttg 40389209  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  40389210 ttctgtcatgtccttcatt 40389228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 17805563 - 17805879
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || |||| |||| |  ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||     
T  17805563 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacaaaacagtacaagacagaataacacaacacaaggtagaacaacacaggacaaattttttagggcaa 17805662  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgag-ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||    
T  17805663 cgagtaattttttgttttatacgatttttgggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaagagttgtgctttggtttgg 17805762  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  17805763 tgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctctagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttggt 17805862  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||  |||||||||||    
T  17805863 ctgttatgtccttcatt 17805879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Original strand, 39642841 - 39643071
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39642841 aaatttttatgacattgaataattttttgttttatacaatttttgggggatgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgggacagaaagtt 39642940  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39642941 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttaaaaatcaaacactgga 39643040  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39643041 caactgaagttgttctgtcatgtccttcatt 39643071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 30501016 - 30501333
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| || | || |||| ||||||  |||||| ||| || ||||  | |||||||| ||||||||     
T  30501016 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaaatacttgacataatagtacaagacagaacaacacaacataagacaaaacaccataggacaaa-tttttatga 30501114  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30501115 cattgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 30501214  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  30501215 ggtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaactgaagttg 30501314  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  30501315 ttctgccatgtccttcatt 30501333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 136 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29611229 - 29610972
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 235  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29611229 acaacacaaggcataacaacacaggacaaa-tttttatggtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgctattttggtgtttt 29611131  T
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacct 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  29611130 agacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgttctgtccct 29611031  T
Q  336 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  29611030 gaaacagttttacaaatcaaacattggacaactgaagttgttctgtcatgtccttcatt 29610972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Original strand, 35225530 - 35225850
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||| || | || |||| || |||  |||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||    
T  35225530 ttaaggatgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagacaggacaacacaacacaagacagaacaacacaagacaaa-ttttta 35225628  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||| ||||| || |||  |||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  35225629 tggtattgaataatttcctgttttatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtgg 35225728  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  35225729 tttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaaccaaacactggacaactggag 35225828  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  35225829 ttgttctgtcctatccttcatt 35225850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 393
Target Start/End: Original strand, 45113929 - 45114242
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||| || ||| ||| |||| |||    
T  45113929 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagagcagcacaacacaaggcataacaacacatgataaa-tttgtatgacat 45114027  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||| || |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||||||||    
T  45114028 tgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacctatgacaaaaagttgtactgtggtttggt 45114127  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||      
T  45114128 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctctcccttgcatctcgtttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattgaagttgtca 45114227  T
Q  379 tgtcctgtccttcat 393  Q
    |||||||||||||||    
T  45114228 tgtcctgtccttcat 45114242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Original strand, 37861866 - 37862046
Alignment:
Q  213 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctct 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  37861866 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttatgatgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcact 37861965  T
Q  313 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  37861966 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttactaatcaaacattgaacaactagagttg-tatgttctgtccttcatt 37862046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 394
Target Start/End: Original strand, 17520532 - 17520782
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg-agtactttttt-gttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatt 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||        
T  17520532 acaacacaagacagaacagtacaggacaaa-tttttatagcgttggattattttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgg---- 17520626  T
Q  234 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtac 333  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| || || ||    
T  17520627 ----acaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa-tataagtttttgccctgtcccttgcctccattttatcatgcac 17520721  T
Q  334 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17520722 ctaaaacacttttacaaatcaaacaccggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 17520782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 394
Target Start/End: Original strand, 37474598 - 37474888
Alignment:
Q  84 tttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||   | | | || || |||| ||||||| |||| |||||| | ||||| ||| |||||| |||||||| |||||| |    
T  37474598 tttggtttgcaaaacagcaagtacagcatatagcagtacaagaaagaacagcacaatacaagggataacagcacatgacaaa-tttttatgacattgaat 37474696  T
Q  184 acttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggg 283  Q
    | |||||| |||||||| ||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||                   ||||||||| ||||||    
T  37474697 aattttttattttatacgatttttggggaaaaaaacgctagtttggtattttagacaacttgtac-------------------tgtggtttgctgaggg 37474777  T
Q  284 acaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcc 383  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  37474778 acaaaaatataagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtca 37474877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 115 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16486004 - 16485726
Alignment:
Q  115 aacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac 214  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| | |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||| || |||| ||| |||||  ||||||| | |||    
T  16486004 aacaatacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaaaacaaa-tttttatggtattgaataattttctgtattatatgatttttgggtgac 16485906  T
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||  |||    
T  16485905 gaaatgctatttttgtattttagaaaacttatacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgttctgtcctttg 16485806  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| || |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||    
T  16485805 ccttcaatttgtcatgtccctgaaactattttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttctatcatgtccttcatt 16485726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 394
Target Start/End: Original strand, 21272680 - 21272855
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 301  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21272680 atttttaaaggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 21272779  T
Q  302 gtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||                  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  21272780 gtcctgtc-----------------gctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctctcgtgtcattcatt 21272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10656833 - 10656603
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||| |||||||| ||||||   ||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10656833 aaatttttatgttattgaataattttttcttttatacgattttttgtggacaaattgttattttgatattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagtt 10656734  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||  || ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  10656733 gtgttgtggttttgtgaaggacaaaaaattcagtttttgtcctgtcttttgcctctagtttgtcatgtctctaaaaaagatttacaaatcaaatactgga 10656634  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |   ||||||||| | |||||||||||    
T  10656633 caattgaggttgttctgacatgtccttcatt 10656603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16595344 - 16595067
Alignment:
Q  115 aacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac 214  Q
    |||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||| | | |||| ||||| ||| ||||| || ||||| || |||||| |||||||  | ||    
T  16595344 aacagtataagacagaacaacaaaacacaaggcagaaaagtaaatggcaaacttttt-tggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtgaac 16595246  T
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |    |||||||||||||| ||||    
T  16595245 aaaaagctatttttgtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattagcgagggacaaaacttcatgtttttgtcctgtcccttg 16595146  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||| |  |||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  16595145 cctacagtttgttctgtcccagaaaca-atttacaaatcaaacaatatacaactggtgttgtcctgtcatgtccttcatt 16595067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27109730 - 27109532
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtactttttt--gttttatacaatttttgagggacaaaatg 220  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||  ||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  27109730 aagatagaacaacacaatacaatgcagaacggtacaggacaaa-ttttaatagcattgaataattttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatg 27109632  T
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| || |||| ||||||||||    
T  27109631 ttattttggtattttaaacaatttgtacgcgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtaaggaacaaaaatatctgattttatcatgtcccttgcctcca 27109532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22756501 - 22756338
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  22756501 ctatttttgtattttagataacttgtacgtgatacaaaaagttgtgttgtggtataatgagggataaaaatttatgtttttgtcttgtctcttgcctcaa 22756402  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 384  Q
     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| ||||||    
T  22756401 atttgtcctatcccagaaacagttttacaaatcaaacattgtataactggagttgttttgtcct 22756338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10320424 - 10320232
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  10320424 aaatttttatggtattgaataatttttggttttatacgattgttgttagacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgtggtaaaaagtt 10320325  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||| | | ||| |||| ||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  10320324 gtgttgtggtttggtgagggataagaatttctgttttttttc-gtcccttg-ctcaagtttgtcatgtccctaaaacggttttacaaatcaaaca 10320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 368
Target Start/End: Original strand, 6460188 - 6460417
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    ||||| ||| |||| ||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||  || |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  6460188 aacagcacagcacagggcagagtagcacaggacaaa-tttttatggtattgaataatttt--gtcttatacgattttttatggacaaaatgttattttgg 6460284  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc 328  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||        |||||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  6460285 tattttagacaacttatacgtgggacaaaaaagttgtgatgtggtttggtgagagacaaa--------tttttgtcttgtcccttgcctccagattgtca 6460376  T
Q  329 tgtacctgaaacagttttac-aaatcaaacactggacaact 368  Q
    |||  || |||||| ||||| |||||||||| || ||||||    
T  6460377 tgtctctaaaacagctttacaaaatcaaacaatgtacaact 6460417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 359
Target Start/End: Original strand, 10932678 - 10932888
Alignment:
Q  147 cagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 246  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10932678 cagaacagtgcaagacaaa-tttgtatggtattgaataatttttggtcttataaaaaattttatggacaaaagactattttggtattttagacaaattgt 10932776  T
Q  247 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 346  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||| | |||||| ||| ||  ||||| ||||    
T  10932777 acgtggaactaaaagttgtgatgtggtttagtgagggac-aaaattttagtttttatcatgtctcttgcctctactttgtcttgtcccataaacaatttt 10932875  T
Q  347 acaaatcaaacac 359  Q
    | |||||||||||    
T  10932876 ataaatcaaacac 10932888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 211 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 36426347 - 36426201
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||| | | |||||||||| | ||     
T  36426347 ggacaaaagactattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaagatgtgttgtggtttagtaaatgacaaaatttttagtttttgtcttatcc 36426248  T
Q  311 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||||||| || ||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  36426247 cttgcctcaagattgtcgtgt--ctgaaccaattttacaaatcaaacac 36426201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 366
Target Start/End: Original strand, 11944855 - 11945035
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| || ||    
T  11944855 tttttagtcttatacaatttttgaggcaaaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagttgtagtgtggtttagtggggaac 11944954  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
     | | | |||||||||    ||||||||||||| |||||||| | | | | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  11944955 tagagtttgagtttttactatgtctcttgcctctagtttgtcatctccataaaacaattttacatatcaaacactgtacaa 11945035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 341 - 394
Target Start/End: Original strand, 38047481 - 38047534
Alignment:
Q  341 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38047481 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 38047534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 358
Target Start/End: Original strand, 54133 - 54322
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||| || ||||||   ||| |||||  ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||     
T  54133 ttttatggtattgaataattttttgtcttaaacgattttttgtggataaaatattattttg-tattttcgataacttgtatgtgggacaaaaagttgtga 54231  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    |||||||| |  | |||||||||| |  ||||||||| |||| ||||  ||| | ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||    
T  54232 tgtggtttagcaaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtcccttgtgtccggattgtcatgtctcagaaacagttttacaaatcaaaca 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 32303597 - 32303540
Alignment:
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32303597 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgttct 32303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 165
Target Start/End: Original strand, 21272588 - 21272672
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21272588 gtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacaatacaagatagatcagtacaacacaaggcagaacagcataggacaaa 21272672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 190
Target Start/End: Original strand, 37861803 - 37861865
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37861803 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaattttt 37861865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Original strand, 5892057 - 5892214
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    ||||||||||||| |  |||||||   || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| |||||| ||| |     
T  5892057 ttatacaatttttcacagacaaaaaattaatttggtaatttagacaacttatacgtgtgacaaaaagttgtgttacggtttaatgaaggacaataatttc 5892156  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaat 352  Q
    |||||||||| |||||| | | || |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  5892157 agtttttgtcttgtctcgttcgtctagtttgtcatgtctctaaaatagttttacaaat 5892214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11926955 - 11926878
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  11926955 tttttagtcttatacaatttttgaggcacaaaagactattttggtattttagacaaattgtacatgagacaaaaagtt 11926878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 955174 - 955094
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 153  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  955174 ttaagagtgtgtttggtttacaaaacagcaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaaca 955094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 246
Target Start/End: Original strand, 32918843 - 32918925
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 246  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  32918843 aaatttttatgacattaaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggtattaaaaacaacttgt 32918925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 382
Target Start/End: Original strand, 10531244 - 10531456
Alignment:
Q  172 atggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    |||| ||||| || |||||| | |||||  |||||| | ||||||||   |||||||||||| || |||| ||||| ||| || |||||||||| || ||    
T  10531244 atggtattgaataattttttatcttataagattttttatggacaaaagattattttggtattctaaacaatttgtatgtgagataaaaagttgtattttg 10531343  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacc--tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacta 369  Q
    |||| |||||| |||| ||| | ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||| | | ||    ||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  10531344 gtttagtgaggaacaagaatttcagtttttatcatgtcttttgcatccggtttgtcatatgcccaataaatagttctacaaatcaaacattgtacaacta 10531443  T
Q  370 gagttgttctgtc 382  Q
    |||||||| ||||    
T  10531444 gagttgttttgtc 10531456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 275
Target Start/End: Original strand, 14958975 - 14959027
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14958975 tattttgatattttagaca-cttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 14959027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Original strand, 15351722 - 15351800
Alignment:
Q  193 ttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    |||||||| |||||||   || |||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  15351722 ttttatacgatttttggttgataaaatgttattttggtattttagacaatttgtaactgagacaaaaagttgtgttgtg 15351800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5859581 - 5859518
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 265  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  5859581 attttttatggacaaaatactattttagtattttagataacttgtacgtatgacaaaaagttgt 5859518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3361843 - 3361783
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  3361843 ggacaaaatgttattttggtagattagacaacttgtacttgagagaaaaagttgtattgtg 3361783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3801033 - 3800937
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcct 317  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |  ||||||||| |||| |||||||    
T  3801033 ctatttttgtattttagataactagtatgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttaatgaggaacaaaaacttatgtttttgtcttgtcccttgcct 3800937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14005266 - 14005232
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14005266 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtact 14005232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 28746281 - 28746377
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||  | || ||| |||||||  | |||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  28746281 aaatttttatgacattgaataatttttgatcttgtacgatttttggtgaacaaaattttattttggtattttaaatagcttgtacgtaggacaaaaa 28746377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 34338681 - 34338998
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34338681 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatggc 34338780  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34338781 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 34338880  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34338881 gtgagggtcaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 34338980  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34338981 tctgtcctgtccttcatt 34338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 88 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9733138 - 9732832
Alignment:
Q  88 gtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtactt 187  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  9733138 gtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggcattgaataatt 9733039  T
Q  188 ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9733038 ttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 9732939  T
Q  288 aaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732938 aaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 9732839  T
Q  388 cttcatt 394  Q
    |||||||    
T  9732838 cttcatt 9732832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 35114656 - 35114973
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  35114656 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacggcacaggacaaattttttatggc 35114755  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35114756 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttg 35114855  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35114856 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagttgt 35114955  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||| |||||||||||    
T  35114956 cctgtcttgtccttcatt 35114973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2645309 - 2644989
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  2645309 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacttgatagaacagtataagatagaacagtacaacataaggcagaacagcactggacaaatttttta 2645210  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2645209 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtgg 2645110  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645109 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctctc-cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 2645011  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  2645010 ttgttctatcctgtccttcatt 2644989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 33366481 - 33366798
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33366481 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggc 33366580  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33366581 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgggagaaaaagttgtgttgtggtttg 33366680  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33366681 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagaattgt 33366780  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| | |||||||||    
T  33366781 tctgtcatatccttcatt 33366798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 32497785 - 32498103
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32497785 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacaatacaagatagaacagtacaacaaaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 32497884  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32497885 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 32497984  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32497985 ggtgaggtacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 32498084  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| | || ||||||||    
T  32498085 ttctgccatgcccttcatt 32498103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 37308527 - 37308843
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  37308527 gggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggc 37308626  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37308627 attgagtaatttttttgttt-tacgattttttagggacaaaatactattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 37308725  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37308726 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37308825  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37308826 tctgtcctgtccttcatt 37308843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 18685705 - 18686024
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18685705 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatg 18685804  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18685805 gcattgagtaattttttgttttataggatttttgagggacaaaatgttattttaatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtt 18685904  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18685905 tggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 18686004  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  18686005 attctgtcatgtccttcatt 18686024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 74 - 391
Target Start/End: Original strand, 16104142 - 16104459
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  16104142 taagggtgtatttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagggcaaattttttat 16104241  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16104242 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggt 16104341  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16104342 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcgtgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagt 16104441  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttc 391  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16104442 tgttctgtcctatccttc 16104459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30326550 - 30326234
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30326550 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaccgtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttatgga 30326451  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30326450 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 30326351  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30326350 gcgagagac-aaaatatgagtttttgtcctgtcccctgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgc 30326252  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30326251 tctgtcctgtccttcatt 30326234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 79 - 390
Target Start/End: Original strand, 42706231 - 42706543
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42706231 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagcacttgacataacagtacaagatagaacaatacaacacaagacagaacagcacaggacaaattttttatggcat 42706330  T
Q  179 tgagtactttt-ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42706331 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 42706430  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42706431 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgtt 42706530  T
Q  378 ctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||    
T  42706531 ctgtcctgtcctt 42706543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 73 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5279057 - 5278748
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5279057 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttta 5278958  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5278957 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgctgtgg 5278858  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||    
T  5278857 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacctaacaattagag 5278758  T
Q  373 ttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||    
T  5278757 ttgttctgtc 5278748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 80 - 382
Target Start/End: Original strand, 17540588 - 17540891
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||    
T  17540588 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacatattttttatggcatt 17540687  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt-ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17540688 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactatttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 17540787  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17540788 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattgttc 17540887  T
Q  379 tgtc 382  Q
    ||||    
T  17540888 tgtc 17540891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19513906 - 19513591
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  19513906 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggataaaacagtacaagatagaacagtacaatagaagacagaacagcacgggacaaattttttatggtat 19513807  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19513806 tgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 19513707  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19513706 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctcccgtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggaaaactagagttgttc 19513607  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  19513606 tgtcctgtccttcatt 19513591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Original strand, 7258813 - 7259085
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7258813 aagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaaatgt 7258912  T
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7258913 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag 7259012  T
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7259013 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacagctagagttgttctgtcatgtccttcatt 7259085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 33889165 - 33889431
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33889165 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacataacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttatttt 33889264  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33889265 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggaaaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 33889364  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33889365 ctgtatctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 33889431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 39461187 - 39461502
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39461187 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcat 39461286  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttg---tgttgtggttt 275  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||   ||||||| |||    
T  39461287 tgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacagcttgtacgtgagataaaaagttgtgttgttgtgattt 39461386  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39461387 ggtgagggacaaaaa---caatttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 39461483  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  39461484 ttctatcctgtccttcatt 39461502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 80 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30798703 - 30798402
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||    
T  30798703 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagta--acataagacagaacagcacatgacaaattttgtatggtatt 30798606  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30798605 tagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtg 30798506  T
Q  280 agggacaaaaatatgagt-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30798505 agggacaaaaatatgagttttttttcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 30798406  T
Q  379 tgtc 382  Q
    ||||    
T  30798405 tgtc 30798402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 40692176 - 40692485
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40692176 gggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatactagacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggc 40692275  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40692276 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatt--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgttctgtggtttg 40692367  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40692368 gtgagggacaaaaatacgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcttgtacctaaaacagtttcacaaattaaacactggacaactagagttgt 40692467  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  40692468 tctgtcttgtccttcatt 40692485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 44284508 - 44284817
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  44284508 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaaca--------caaggcagaacagcacatgacaaattttttatggc 44284599  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  44284600 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgttattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggttta 44284699  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  44284700 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactctagttgt 44284799  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  44284800 tctgtcatgtccttcatt 44284817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 167 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7761702 - 7761475
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7761702 tttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtg 7761603  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761602 ctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 7761503  T
Q  367 ctagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761502 ctagagttgttctgtcctgtccttcatt 7761475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Original strand, 42365454 - 42365765
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    |||||||||||||||||| || || |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  42365454 gtttggtttgcaaaacagtaagtattggaaaaaacaacataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagataaattttttatggcattgag 42365553  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  42365554 taattttttgttttatatgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtccgtgatataaaaagttgtgttgtggtttgatgaag 42365653  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42365654 gacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactagacaactagagttgttatgtc 42365753  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||    
T  42365754 atgtccttcatt 42365765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 76 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3913679 - 3913366
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  | | |||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||    
T  3913679 agggtgtgtttgatttgcaaaacagtaaatacttgatagaacagtataagacagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggataaa-tttttatgg 3913581  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3913580 cattgaataatattttgttttatacgatttttggggagcaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtggttt 3913481  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3913480 ggtgagggacaaacatgtgagtttttgtcctgtttcttgcctccagtttgtcatatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattg 3913381  T
Q  376 ttctgtcctgtcctt 390  Q
    || |||| |||||||    
T  3913380 ttttgtcatgtcctt 3913366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 2085946 - 2086250
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||    
T  2085946 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgccatt 2086045  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||      
T  2086046 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtatttcagacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtactgtggtttgggt 2086145  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2086146 agggacaaaaatatgagtttttg---------ttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg-tct 2086235  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||||||||||    
T  2086236 gtcttgtccttcatt 2086250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 4641387 - 4641702
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| || || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||  |    
T  4641387 gggtgtgtttgctttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtaaaatatagaacagtacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatacc 4641486  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4641487 attgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 4641586  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4641587 gtgagagacaaaaatatgaatttttgttccgtccc--acctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactaaagttgt 4641684  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| | |||||||||    
T  4641685 tctgtcttttccttcatt 4641702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 72 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12672676 - 12672395
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
T  12672676 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactagacataa-aatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaa----------------- 12672595  T
Q  172 atggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
        ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12672594 ----cattgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgggataaaaacttgtgttgtg 12672499  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12672498 gtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcccgtcccttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacacaggacaactaga 12672399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 142 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32766658 - 32766409
Alignment:
Q  142 caaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaa 241  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32766658 caagggagaacaacacaggacaaa-tttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggacgaaatgttattttggtattttagacaa 32766560  T
Q  242 cttgtacgtgggacaaaaa-gttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaac 340  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32766559 cctgtacgtaggacaaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaac 32766460  T
Q  341 agttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  32766459 agttttacaaatcaaacactggacaattatagttgttctgttctgtccttc 32766409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 76 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37004089 - 37003861
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtaca-ggacaaaatttttatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  37004089 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtaaaacagcacaaggacaaattttttatg 37003990  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37003989 gcattgaataattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 37003890  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37003889 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgt 37003861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28824773 - 28824459
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||  |||| || |||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  28824773 ggtgtgtttggtt-gcaaaacagtaagtactggactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaatacatgacaaa-tttttatgaca 28824676  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    | || ||  |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  28824675 tggaataaatttttgttttatacaatttttggggtgcgaaatgctattttagtattttagacaacttgcacgtgagataaaaagttgtgatgtggtttgg 28824576  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28824575 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgacccttgactccagtatgtgctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtt 28824476  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||||||||||    
T  28824475 ctgtcatgtccttcatt 28824459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 6896040 - 6896356
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||   ||||||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  6896040 agggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtacta-acagaacagtataatgcagaacaacacaacacaaggcataacaacacatgacaaa-tttttatgg 6896137  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
     ||||| || ||| ||||||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6896138 tattgaataatttcttgttttatatgccttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgttgttt 6896237  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6896238 ggtgagggacaaaaatttcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttg 6896337  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  6896338 ttctgtcctgtctttcatt 6896356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38993284 - 38992973
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||    |||||| ||    
T  38993284 gtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacaatataagataggacagcacaacataaggcagaacaacacaagacaaa----ttatggtat 38993189  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||| || |||| ||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38993188 tgaataattttctgtattatattatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgac 38993089  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  38993088 gaggaacaaaaattgtagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctcttcctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttattc 38992989  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||    
T  38992988 tgtcatgtccttcatt 38992973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10400002 - 10399772
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  10400002 aaatttttatggcattgaataattttttgttttatacgacttttgggggacaaaatgctattttggatttttagacaacttatacatgagacaaaaagtt 10399903  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10399902 gtgttgtggtttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtatcttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactgaa 10399803  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  10399802 caactgaagttgttctatcatgtccttcatt 10399772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 394
Target Start/End: Original strand, 11114749 - 11115058
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattga 181  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||   || |||| ||||||  |||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||||    
T  11114749 tgtttggtttgcaaaacagtaagtactaaacataattgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaacaatataaga-aaaatttttatggcattga 11114847  T
Q  182 gtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag 281  Q
     || ||||| ||||||||| ||| ||   |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11114848 ataatttttcgttttatacgattgttagcggacgaaatactattttggaattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgag 11114947  T
Q  282 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgt 381  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||    
T  11114948 gaacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaactg-aacag-tttacaaatcaaacattggacaattggagttgttttgt 11115045  T
Q  382 cctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||    
T  11115046 cctgtccttcatt 11115058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 77 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40832692 - 40832374
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagca---aatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   | || || ||| || | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||    
T  40832692 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtagtaagtattagacagaatagtacaagatagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaa-tttttat 40832594  T
Q  174 ggcattgagtactt--ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
       ||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40832593 attattgaattattatttttgttttatacgatttttgggggacgaaatactattttggtattttagactacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtg 40832494  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 371  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |    
T  40832493 gtttggtgagggacaaaaatatccgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaatagctttacaaatcaaacactggacaacttaa 40832394  T
Q  372 gttgttctgtcctgtccttc 391  Q
    |||||| |||| ||| ||||    
T  40832393 gttgttatgtcatgtgcttc 40832374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 71 - 320
Target Start/End: Original strand, 26418788 - 26419037
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |||| |  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||    
T  26418788 tattcagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatttgacagaacagtgcaagacagaacagcacaacgcaaggcagaacaacacatgacaaaaattt 26418887  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26418888 tatggcaatgagtaattttttgttttatacaatttttgggggataaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgt 26418987  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  26418988 ggtttggtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcatgtccctcgcctcca 26419037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16178100 - 16177785
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| |||| |  |||| | | ||  ||||||||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| |    
T  16178100 agggtgtgattggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtgcaagacatatcaacacaacacaagatagaacaacacacgacaaa-tttttatag 16178002  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||  ||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16178001 cattgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacgaaattccattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggttt 16177904  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16177903 ggtaagcgacaaaaatatcagtttatgtcctgtccattgcctccagtttatcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttg 16177804  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || |||| | |||||||||    
T  16177803 ttatgtcatatccttcatt 16177785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 13829310 - 13829614
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || || |  |||||||| || ||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||      
T  13829310 gggtgcgtttggtttgcaaaacagtaattattggacaaaacagtacaaagcagaacagcacaacacaaggcagaacatcacagaacaaa-tttttatgat 13829408  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |     
T  13829409 attgaataattttttgttttatatgatttttgagggacgaaatgatattttggtgttttagataacttgtacctgggacaaaaagttgtgatgtggtcta 13829508  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13829509 gtgatggacaaaaatttcagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcct------------gtttcacaaatcaaacactggacaactagagttgt 13829596  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13829597 tctgtcctgtccttcatt 13829614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26981781 - 26981611
Alignment:
Q  224 ttttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  26981781 ttttggtattttagacaacttgtacgtagaacaaaaagttttgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcatttgcctcccgtt 26981682  T
Q  324 tgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26981681 tgtcttgtatctggaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgttctgtccttcatt 26981611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 373
Target Start/End: Original strand, 8112183 - 8112468
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||        || |||||| ||| |||| |||||||    
T  8112183 gtttgatttgcaaaacagtaagtactcgacggaacaatataagatagaacaatacaacacaaatca--------catgacaaattttgtatgacattgag 8112274  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgctattttggtatttt-agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8112275 taattttttgttttatacgatttttaagggaaaaaaatgttattttggtatttttagactatttgtatctggaacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 8112374  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca-ctggacaactagagt 373  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8112375 gagacaaaaatatgagtttttgtattgtctcttgcctccagtttgttctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacaccttgacaactagagt 8112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 308
Target Start/End: Original strand, 9717113 - 9717326
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||                 || |||||||||||||||    
T  9717113 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacac-----------------gataaaatttttatggca 9717195  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9717196 ttgggtaattttttgtttgatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 9717295  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9717296 tgagggacaaaaacatgagtttttgtcctgt 9717326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Original strand, 30712815 - 30713048
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30712815 aaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttttg-gggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttctacgtgggataaaaagtt 30712913  T
Q  264 gtgttgtggtt----tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30712914 gtgttgtggttaatttggtgagggacaaaaatttcagtttgtgtcctgtcccttgcctccaggttgttctgtccctgaaacagtattacaaatcaaacac 30713013  T
Q  360 tggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  30713014 tggataactggagttgttttgtcatgtctttcatt 30713048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27463014 - 27462705
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  | |||||| |  || | ||||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||| |||| |||||    
T  27463014 gtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggataaaacagtgcaaaacagaacagcacaacacaaggtagaacaacacatgacaaa-tttatatgacattg 27462916  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    | || ||||||||||| ||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |||||  |||| | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  27462915 aataattttttgtttt-tacgatttttagggcacgaaatgctattttggtatttttgacaatatgtatg-gtgataaaaagttgtgttgtggtttggtga 27462818  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |     
T  27462817 gggacaaaaataacagcttttgtcttgtcccttgtctacagtttgtcatgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaattgttata 27462718  T
Q  381 tcctgtccttcat 393  Q
    ||||||| |||||    
T  27462717 tcctgtctttcat 27462705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 188 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41366218 - 41366027
Alignment:
Q  188 ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 287  Q
    |||||| ||||| |||||||   ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41366218 ttttgtcttatataattttttgtggatacaatgttattttggtattttagacaacttgtatgtgagacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaa 41366119  T
Q  288 aaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| | ||||||||||    
T  41366118 aaatttcagtttttgtcctatctcttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgtttcacaaatcaaacattgcacaattggagttgttct 41366027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18793478 - 18793297
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| ||    
T  18793478 gtgtgtttggtttgcaaaataataagtactggacaaaacagtataaaatagaacagtacaacataaggtagaacatcacaagacaaattttttatgggat 18793379  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18793378 tgagtaattttttgttttatacaatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagactaaaa 18793297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38623365 - 38623208
Alignment:
Q  235 tagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacc 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||| ||    
T  38623365 tagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttttccattgcctcaagtttgtcctgtccc 38623266  T
Q  335 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  38623265 tgaaacagttttacaaatcaaacattggataactgaagttgttatgtcatgtccttca 38623208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 313
Target Start/End: Original strand, 1247073 - 1247254
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||    
T  1247073 aagacagaacaacacaacacaaagcagtacagtacaagacaaa-tttttatggcattgaataattttttattttatacgatttttggggaacgaaatgct 1247171  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctctt 313  Q
    |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1247172 att--------ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttggtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtctctt 1247254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12939474 - 12939275
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtact--tttttgttttatacaatttttgagggacaaaatg 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| || ||| |||| ||  |||||| || |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  12939474 aagacagaacagcacaacacaaggcagaacaacacaagataaa-ttttaataacattgaatattgttttttgttttatatgatttttgggggacaaaatg 12939376  T
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  12939375 ttattttggtatcttagacaacttgtacgtgagataaaaagttgtgctgtggtttggtgaaggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcccttgcctcca 12939276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 313 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37863349 - 37863268
Alignment:
Q  313 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37863349 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 37863268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 374
Target Start/End: Original strand, 41934539 - 41934749
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||||| || ||||| |  |||| ||| |||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41934539 aaatttttacggtattgaatgattttatgtcttatatgatttttggtggacaaaatgttattttggtattttagacaacttatacgtaggacaaaaagtt 41934638  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||   | ||| || ||||||||||||||| |||||  |    
T  41934639 gtgttgtggtttagtgaagtacaagaatttcagtttttgtcttgtcttttgcatccagtttatctcatcccttaatcagttttacaaatcacacactata 41934738  T
Q  364 caactagagtt 374  Q
    ||||| |||||    
T  41934739 caacttgagtt 41934749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18793300 - 18793195
Alignment:
Q  287 aaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgt 386  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  18793300 aaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcc--tttgtactgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgagcaactagagttgttctgtcatgt 18793203  T
Q  387 ccttcatt 394  Q
    ||||||||    
T  18793202 ccttcatt 18793195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 45463241 - 45463037
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  45463241 aaatttttattgcattaaataattttttgttttatacgatttctg-gggacgaaatgttattttgatattttagacaatctgtacgtatgacaaaaagtt 45463143  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||             ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   || |    
T  45463142 gtgttgtggtttggtgagtgacaaaaata-------------tgtctattgcctcctgtttgtcttgtacctgaagcagttttacaaatcaaatgttgaa 45463056  T
Q  364 caactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  45463055 caactggagttgttatgtc 45463037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 322 - 394
Target Start/End: Original strand, 9717317 - 9717389
Alignment:
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9717317 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 9717389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 225 - 360
Target Start/End: Original strand, 26796247 - 26796382
Alignment:
Q  225 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| | | ||||| |||| ||  ||||||  |||||    
T  26796247 tttggtattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgcgttgtgctttagtgagggacacaaattttaatttttatcctatccattgcctgaagttt 26796346  T
Q  325 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 360  Q
    ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  26796347 gttttgtccttgtaacagttttacaaatcaaacact 26796382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15303308 - 15303180
Alignment:
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  15303308 ggtattttagacaacttacatgtggaacaaaaagttgtgatgtagtttgataaaggacaaaaatttatgtttttgtcatgtgtcttgcctctagtttgtc 15303209  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 356  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15303208 ctgtctctgaagcagttttacaaatcaaa 15303180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Original strand, 20907547 - 20907664
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  20907547 aaatttttatgtcattgaataattttttgttttgtacgatttttgggggataaaatgttattttagtattttatacaatttgtacataggacaaaaaatt 20907646  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgag 281  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  20907647 gttctgtggtttggtgag 20907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35473132 - 35472967
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||| |||| ||| | || ||||| || |||||||| |||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35473132 aaattttgatggtattaaataatttttggtcttatacaaatttttatggacaaaaggatattatggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaatt 35473033  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    |    ||||||| |||||| | || ||| | |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  35473032 gcagagtggtttagtgaggaataagaatttcagtttttgacttgtcccttgcctccaatttgtcct 35472967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37003858 - 37003793
Alignment:
Q  329 tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37003858 tgtacctgaaacagatttacaaatcaaacactggacaacttgagttgttatgtcctgtccttcatt 37003793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18127096 - 18127009
Alignment:
Q  188 ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18127096 ttttgttttgtacaatgtttgatggacaaaacgttattttgctattttacataacttgtacttgagacaaaaagttgtgttgtggttt 18127009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 390
Target Start/End: Original strand, 18278926 - 18279084
Alignment:
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||| | |||  ||| |||||||||||| |    
T  18278926 tattttatacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgacgtgatttagtgaggaacaaaaattttagtttttgtgccgtcctttgtctccagtttgtctt 18279025  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  18279026 gtccctaaaaca-ttttataaatcaaacattgcacaacta-aattgtcatgtcctgtcctt 18279084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 318
Target Start/End: Original strand, 36843442 - 36843574
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    ||||||||  |||||||||||||   ||||| | | || ||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  36843442 ttttttgtcatatacaatttttggtagacaataagatagttttgtattttagataaattatacgtgggacaaaaggtgattttgtggtttggtgagggac 36843541  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctc 318  Q
    | |||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  36843542 acaaatttcggtttttgtcttgtctcttgcctc 36843574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 310
Target Start/End: Original strand, 37088231 - 37088377
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||| ||||| |||||  | |||| ||| |||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | |||  ||||| |    
T  37088231 aaatttgtatggtattgaacaattttgtgtcttatccgatgtttgatggacaaaatgctattttggtattttaaacatcatgtatttaggatgaaaagat 37088330  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||    
T  37088331 gtgttgtggcttagtgagggacaagaatttcagtttttgtcttgtct 37088377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 130224 - 130393
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 235  Q
    |||||||||||||||| || | | || ||| |||||||   ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||    
T  130224 acaacacaaggcagaatagcataagataaattttttattatattgaataattttatgtattatataatttttgtaggatgaaatgatattttggtatttt 130323  T
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaa-----agttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 300  Q
    ||| || ||||||||  || ||||     | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  130324 agataatttgtacgtaagataaaaatattaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttaagtttt 130393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12217772 - 12217650
Alignment:
Q  227 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg-cctccagtttg 325  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||   |||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  12217772 tggtattttagacaacttaaaattgggacaaaaagttatgttgtggttcaatga--gacaaaaaatttagtttttgtcatgtctcttgtcccccagtttg 12217675  T
Q  326 tcctgtacctgaaacagttttacaa 350  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  12217674 ccctgtccctgtaacagttttacaa 12217650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13249530 - 13249421
Alignment:
Q  166 atttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgt 265  Q
    ||||||| | |||||| || |||||| || ||| | || ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  13249530 atttttaagacattgaataattttttattatattctatatttgatggacaaaagtctattttgatattttaaacaacttgtactttggacaaaaaattgt 13249431  T
Q  266 gttgtggttt 275  Q
    ||||||||||    
T  13249430 gttgtggttt 13249421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 40876697 - 40876554
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccag 321  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||  || |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||| |    
T  40876697 tattttggtatattaaacaatttgtacttgg-atgaaaagttgtgttgtggtttaatgaaagataaaaatttgagcttttgtcatgtcccttacctccgg 40876599  T
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    | |||| ||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40876598 tgtgtcatgtccttaaaatagttttacaaatcaaacattggacaa 40876554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16062178 - 16062014
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | || ||||| |||||||||| ||| |  ||||||||| | ||    
T  16062178 ggacaaaatgttattttgtcattttagacaa-ttgtatgtgggacaaaaaagttgtatcgtagtttgatgagggacaagaatttatgtttttgtcatatc 16062080  T
Q  310 tcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     ||| || ||| ||| |  |||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  16062079 ccttaccaccaatttattttgtgtctg-aacagttttacaaatcaaaaactgtacaacttgagttgt 16062014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26981856 - 26981785
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt-atggcattgagtacttttttgttttatac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||    
T  26981856 aacagcacaacacaaggcagaacagcacaggataaatttttttatgacaatgagtaattttttgttttatac 26981785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35170260 - 35170150
Alignment:
Q  249 gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctc-cagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 347  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |  |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  35170260 gtgggacagaaagttgtgttgttgttcagcgagggacaaaaatttcaatttttgtcgtgtctcttgccccatagtttgttttgtccctggaacagtttta 35170161  T
Q  348 caaatcaaacac 359  Q
    | ||||||||||    
T  35170160 c-aatcaaacac 35170150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6453315 - 6453249
Alignment:
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 361  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6453315 agtttttgtcttgtcccttacctccggtttatcctgtccctgaaacaattttaaaaatcaaacactg 6453249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12939274 - 12939220
Alignment:
Q  340 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  12939274 cagttttataaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttatccttcatt 12939220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 305
Target Start/End: Original strand, 40767180 - 40767256
Alignment:
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcc 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |   | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  40767180 ggtattttagacaacttgtacctctaa-aaaaagttatgttgtggtttagtgagggacaaaaaatttagtttttgtcc 40767256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38786592 - 38786503
Alignment:
Q  233 tttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 324  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||  || |||||| | ||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  38786592 tttagacaacttatacgtgagacaaaatgttgtgttttggtttagtga--gagaaaaatttcagtttttatcttgtccattgcctccagttt 38786503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 306
Target Start/End: Original strand, 1230916 - 1231011
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcct 306  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||  || |||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||| |  ||||||||||||    
T  1230916 ggacaaaaagatatttttgtattttaggtaatttgtacatgagacaaaaagttgagatgtggtttagtgaaagacaaaaagaatagtttttgtcct 1231011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 391
Target Start/End: Original strand, 83315 - 83455
Alignment:
Q  254 acaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct---cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 350  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  ||||| ||| | ||    ||| |||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  83315 acaaaaagttgtgttatggtttagtgagagacaaaaagttttgttttagtcatatccttccttacctctagtttgtcatgtcccacaaacagttttacaa 83414  T
Q  351 atcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttc 391  Q
    |||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||||||    
T  83415 atcaaacactgtgcaactgaagttgtcttgtcatgtccttc 83455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 358
Target Start/End: Original strand, 2394265 - 2394421
Alignment:
Q  201 aatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggaca-aaaatatgagttt 299  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||||||||| | | | || || ||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||| | |||||    
T  2394265 aatttttggaggacaaaaaactattattgtattttagacaacatatgcatgagataaaaagttgtgctgtgctttagcgagggacacaaaatttcagttt 2394364  T
Q  300 ttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    |||| || |||| ||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  2394365 ttgt-ctttctcatgcttcaaatttgtcctg-ccctgaaatagttttacaaattaaaca 2394421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10932781 - 10932460
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10932781 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacacggcagaacagcataggacaaatttttta 10932682  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10932681 tggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtag 10932582  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10932581 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagag 10932482  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10932481 ttgttctgtcctgtccttcatt 10932460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43158903 - 43158589
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | | | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43158903 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagatagagcagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagtacaggacaaattttttatggcatt 43158804  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43158803 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggta 43158704  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43158703 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 43158604  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||||||||||    
T  43158603 gtcttgtccttcatt 43158589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26994444 - 26994128
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26994444 ggtgtgtttggtttgcaaaacagaaagtactggacagaacaggacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggca 26994345  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26994344 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 26994245  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26994244 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 26994145  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||    
T  26994144 ctgtcctgtccttcatt 26994128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36769792 - 36769472
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  36769792 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 36769693  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36769692 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 36769593  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769592 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 36769493  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  36769492 tgttctattctgtccttcatt 36769472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 47953066 - 47953382
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  47953066 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47953165  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47953166 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 47953265  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47953266 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 47953365  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| ||||||    
T  47953366 ctgtcctgtcgttcatt 47953382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3922923 - 3922606
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3922923 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaccagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 3922824  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3922823 attgagtatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagataacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 3922724  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3922723 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactagagttgt 3922624  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  3922623 tctgtcatgtccttcatt 3922606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11322105 - 11321788
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11322105 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtatcggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatggc 11322006  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11322005 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 11321906  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11321905 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtccgttgcctccagtttgtcctgtacctgaatcagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 11321806  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  11321805 tctgtcatgttcttcatt 11321788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 21784749 - 21785063
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||||    
T  21784749 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaatcttttatggcatt 21784848  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21784849 gagtaattttatgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21784948  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784949 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcatgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttct 21785048  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||||||||||    
T  21785049 gtcatgtccttcatt 21785063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Original strand, 18470563 - 18470874
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  18470563 gtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattg 18470662  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18470663 agtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtga 18470762  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18470763 gagacaaaaatatgagtttttgtcctg--tcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactcgacaactagagttgttcta 18470860  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||    
T  18470861 tcctgtccttcatt 18470874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Original strand, 18386397 - 18386716
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  18386397 taagggtgagtttggtttgcaaaacagcaagtattggacaaaacggtacaaaatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttat 18386496  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18386497 gacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 18386596  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18386597 ttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaat 18386695  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18386696 tgttctgtcctgtccttcatt 18386716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41211417 - 41211103
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  41211417 gtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacataggacaaattttttatggcattg 41211318  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41211317 agtaattttttgttttatacgattttttagggataaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtg 41211218  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41211217 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgggcaacttgagttgttct 41211118  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||    
T  41211117 gtcctgtccttcatt 41211103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 46633571 - 46633884
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  46633571 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacataatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatgg 46633670  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46633671 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 46633770  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46633771 ggtgagggataaaaatatgagtttttgtcttg-----ttcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 46633865  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46633866 ttctgtcatgtccttcatt 46633884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32873987 - 32873675
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  32873987 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatggcat 32873888  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32873887 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggt 32873788  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||     
T  32873787 gaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatccggtacctgaaacaattttacaaatcaaacaatggacaactaga---gttt 32873691  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  32873690 tgtcctgtccttcatt 32873675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 1870011 - 1870327
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||| |||    
T  1870011 gtgtgtttggtttgcaaaacagcatgtactgtacataacagtacaatatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgataaattttttatgacat 1870110  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttg-agggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1870111 tgagtaattttttgttttatacgatttttttagggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 1870210  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1870211 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtt 1870310  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||  ||||||||||||    
T  1870311 ctgcactgtccttcatt 1870327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 128 - 388
Target Start/End: Original strand, 40753081 - 40753341
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40753081 agaacagtacaacacaaagcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 40753180  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40753181 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 40753280  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40753281 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacgagagttgttctgtcatgtcc 40753341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 30849464 - 30849149
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  30849464 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacaacacaggacaatttttttatggcat 30849365  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30849364 tgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 30849265  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30849264 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaatcattggacaactagaattgttc 30849165  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||    
T  30849164 tgtcttgtccttcatt 30849149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43189466 - 43189145
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||    
T  43189466 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaatagtgcatgacaaattttttat 43189367  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43189366 ggcattgagtaatttgttgtttcatacgatttttggggggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtgg 43189267  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43189266 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacctccagtttgtcctgtacctgaaacatttttataaatcaaacactggacaactagag 43189167  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||| |||||| ||||    
T  43189166 ttgttttgtcatgtcctccatt 43189145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 89 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26372017 - 26371712
Alignment:
Q  89 tttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttt 188  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  26372017 tttgaaaaacagtaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacataaaacagaacatcacatgacaaattttttatggcattgaataattt 26371918  T
Q  189 tttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaa 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26371917 tttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaa 26371818  T
Q  289 aatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcc 388  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26371817 aatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttgcaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatcc 26371718  T
Q  389 ttcatt 394  Q
    ||||||    
T  26371717 ttcatt 26371712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 43368076 - 43368393
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||      
T  43368076 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacatgacaaa-tttttatca 43368174  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43368175 cattgaataattttttgttttatacgattttggagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggttt 43368274  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43368275 gctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcccgtctcttgcctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttg 43368374  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43368375 ttctgtcctgtccttcatt 43368393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 29661249 - 29661500
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29661249 agaatagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatagcattgagtaattttttgttttatacgatttttgtgggacaaaatgctatttt 29661348  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29661349 ggtattttagataacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29661448  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661449 atgtacctgaatcagttctacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 29661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 160 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47316835 - 47316601
Alignment:
Q  160 gacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  47316835 gacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtaatttagacaacttgcatgtgagacaaaa 47316736  T
Q  260 agttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47316735 agttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacac 47316636  T
Q  360 tggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  47316635 tggacaactagagttattctgtcatatccttcatt 47316601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 138 - 394
Target Start/End: Original strand, 11250558 - 11250809
Alignment:
Q  138 aacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttag 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11250558 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctagtttggtattttag 11250657  T
Q  238 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctga 337  Q
    ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11250658 acaacta-----tgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgattttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 11250752  T
Q  338 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11250753 aacaattttacaaatgaaacactggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 11250809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 38301223 - 38301534
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  ||||      |||||||||     
T  38301223 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaacacag------atttttatga 38301316  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38301317 cattgaataattttttgtttaatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagacaacttgt-cgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 38301415  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38301416 gctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattggagttg 38301515  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38301516 ttctgtcctgtccttcatt 38301534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 156 - 390
Target Start/End: Original strand, 44748649 - 44748883
Alignment:
Q  156 acaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac 255  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748649 acagaacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac 44748748  T
Q  256 aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44748749 aaaaagttgtattgtggtttggtgagggacaaaaatttgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaa 44748848  T
Q  356 acactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44748849 acactggacaactagagttgttttgtcctgtcctt 44748883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 71 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30599234 - 30598939
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  30599234 tatttagggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttt 30599135  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    ||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||    
T  30599134 tatgaaattgagtaatttgttgttttatacgatttttaggggacaaaatgttattttggtattttagataatttgtacttgagacaaaaagttgtgttgt 30599035  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30599034 ggtttgatgagggacaaaaatatgagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacagtggacaa 30598939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3892244 - 3891945
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||    
T  3892244 gtgtatttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcatatgacaaattttttatggcat 3892145  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3892144 tgagtaattttttgttttacacgatttttgaggaacaaaatgctattttggtattctagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtgatttggt 3892045  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||                |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3892044 gagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcc----------------ttacaaatcaaacattggacaactagagttgttc 3891961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 9913400 - 9913716
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  9913400 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaa-tttttatgg 9913498  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
     ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9913499 aattgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggttt 9913598  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9913599 ggtgagcgac-aaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttg 9913697  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9913698 ttctgtcctgtccttcatt 9913716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 9927088 - 9927404
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  9927088 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacaccacatgacaaa-tttttatgg 9927186  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
     ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9927187 aattgaataatttttagttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacctgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggttt 9927286  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9927287 ggtgagcgac-aaaatatcaatttttgtcctgtcccttgcctctagtttatcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacaccggacaactggagttg 9927385  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9927386 ttctgtcctgtccttcatt 9927404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 48894591 - 48894909
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||| || ||||  |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||  |||||||     
T  48894591 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatatttgacataacagtacaagaccgaacagtacaacacaaggtaaaacagcactggacaat-tttttatt 48894689  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48894690 gcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacaaaatgttattttggatttttagatgatttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtt 48894789  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48894790 tagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagtt 48894889  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48894890 gttctgtcctgtccttcatt 48894909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34295623 - 34295324
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |    
T  34295623 gggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaa-tttttatgac 34295525  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34295524 attgaataattttttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 34295425  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     |||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34295424 ctgagggacaaaaatatcagtttttg-------tcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgt 34295332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 83 - 375
Target Start/End: Original strand, 329352 - 329643
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||     
T  329352 gtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaatgcagaacagcacaacacaaggcataacagtacatgacaaa-tttttatggtattgaa 329450  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  329451 taatttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagg 329550  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  329551 gacaaaaatttcagtttttgtcttgtcctttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactggagttg 329643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43214140 - 43213828
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||     | |||| |  |||| | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||     
T  43214140 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtac-----ataacagtgcaagacaaaacagcacaacacaaggtagaacagcacaggacaaa-tttttatga 43214047  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43214046 cattgaatcattttttgttttataggatttttgaggcacgaaatgctattttggtatttttgacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 43213947  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| || |||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  43213946 ggtgaaggacaaaaatatcagcttttatcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtactgaaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttg 43213847  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  43213846 ttctgtcctgttcttcatt 43213828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 21133248 - 21133564
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||    
T  21133248 gtgtgtttggttggcaaaatagtaagtactatacataacaatacaagaaagaacatcacaacacaaggcagaacaacacagtacaaattttttatgacat 21133347  T
Q  179 tgagtactttt-ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||      
T  21133348 tgagtaatttttttgttttatacgatttttgggagacgaaatgctattttggtattttagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttat 21133447  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||    
T  21133448 tgagggaaaataatatcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaattaaacattaaataactagagttgtt 21133547  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || || | |||||||||    
T  21133548 ctatcatttccttcatt 21133564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 115 - 390
Target Start/End: Original strand, 1363551 - 1363824
Alignment:
Q  115 aacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac 214  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1363551 aacaatataagatagaacaacacatcagaaggtagaacaacacatgacaaa-tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttg-ggtac 1363648  T
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  1363649 gaaatgctatttttgtatttttgacaacctgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttgatgagggacaaaaatatcagcttttgtcatgtcccttg 1363748  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  1363749 cctccagtttgtcctgtacatgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttgtcctatcctt 1363824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23349510 - 23349209
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |  ||| |||| || |||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |    
T  23349510 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtaatggacataacagtacaagatagaacaaaacaacataaggtagaacagcacatgacaaa-tttttataac 23349412  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23349411 attgaataattttttgttttctacgattgttgggggacgaaatgtcattttagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 23349312  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  23349311 gtgagggacaaaaatatcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacttgaaatagttttacaattcaaacactggacaactggagtagt 23349212  T
Q  377 tct 379  Q
    |||    
T  23349211 tct 23349209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 37966850 - 37967166
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||     
T  37966850 gggtttgtttggtttgcaaaatagtaagtactagacataataatataagacataacagcacaacacaaagcagaatagtacataacaaa-tttttatggt 37966948  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||| | || ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |     
T  37966949 attaaataattttttgttttatacgatttttttgggacgaaatgctattttggatttttagataacttgtacgtggaacaaaaagttgtgatgtggtcta 37967048  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  37967049 gtgaaagacaaaaatatgggtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggagaactaaagttgt 37967148  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||| |||||||||||    
T  37967149 tttgtcatgtccttcatt 37967166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 390
Target Start/End: Original strand, 11822116 - 11822411
Alignment:
Q  86 tggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtac 185  Q
    ||||||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |      
T  11822116 tggtttgcaaaacagtaagtactgaacataacagtataaaatagaacaacacaacacaaggcagaacaacataggacaaa-tttttatggcattgaat-- 11822212  T
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||   ||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11822213 tttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttgaatttttaaacaac------gtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagtgaaggac 11822306  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 385  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11822307 aaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctcaaacagttttacgaatcaaacactggacaagtgaagttgttctgtcctg 11822406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 20127163 - 20127481
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||  || || |||| | ||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| | ||    
T  20127163 gggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtacgatagaa--cagtacaagacaaaacaacacaacacaagatagaacagcacatgacaaa-tttttgtagc 20127259  T
Q  177 attgagt----acttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||| |    | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20127260 attgaattattatttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgtcattttggtattttacacaaattgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtgg 20127359  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20127360 tttgctgaggaacaaaaatatcagcttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttaaaaatcaaacactggacaactggag 20127459  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  20127460 ttgttctgtcctatctttcatt 20127481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 78 - 266
Target Start/End: Original strand, 47947636 - 47947824
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  47947636 ggtgtgtttgctctgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 47947735  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47947736 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 47947824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26910624 - 26910313
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||| |||  | ||||||||| |||||||  || ||||||  |||||||| ||    
T  26910624 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacaatataggataggacatcataacacaaggtagaacagcgcaagacaaa--ttttatggtat 26910527  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||| || |||| || |||||   ||||||| | ||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26910526 tgaataattttctgatttatg--atttttgggtgacgaattactatttttgtatttttgacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgttgtggtttggc 26910429  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26910428 gagggacaaaaattgcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttgccctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactgtagttgttc 26910329  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||    
T  26910328 tgtcatgtccttcatt 26910313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 394
Target Start/End: Original strand, 17237041 - 17237268
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  17237041 tttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgagacaaaaagttgtg 17237140  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17237141 ttgtggtttagtgaatgacaaaaatatgagtttttgtcatgttccttgcatccagtttgtactgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaa 17237240  T
Q  367 ctagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17237241 ctggagttgttctgtcatgtccttcatt 17237268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 238 - 394
Target Start/End: Original strand, 16963174 - 16963330
Alignment:
Q  238 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctga 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16963174 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtattgtggtttgataagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctctagtttgtcatgtacctga 16963273  T
Q  338 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16963274 aacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttctgtcctgtccttcatt 16963330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 77 - 331
Target Start/End: Original strand, 46408771 - 46409021
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||        ||||||||||    
T  46408771 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacatcacat-------tttttatggc 46408863  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  46408864 attgagtaattttttattttatacgatttttgagagacaatatgctattttgatattttagacaacttgtatgtcggacaaaaagttgtgctgtggtttg 46408963  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc----tcttgcctccagtttgtcctgt 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||    
T  46408964 gtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtccctttcttgtctccagtttgtcctgt 46409021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22724244 - 22723947
Alignment:
Q  84 tttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagt 183  Q
    |||||||||||||| || ||||||   |||||| | |||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||||||| ||||| |    
T  22724244 tttggtttgcaaaatagtaaataccggacaaaatagtataagataggacaacacaacataaggcagaacaacacaagataaa-tttttatggtattgaat 22724146  T
Q  184 acttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggg 283  Q
    | |||| ||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  22724145 aattttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttatacaacttgtacgtgggataaaaagttgcgttgtggtttggcgatgg 22724046  T
Q  284 acaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22724045 acaaacattgcagtttttgtcctgtcccttacctcgagtttgtccggtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtc 22723947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22724739 - 22724438
Alignment:
Q  88 gtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtactt 187  Q
    |||||||||| || || ||||  ||| |||| || ||||||||| |  |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||| ||| ||||| || ||    
T  22724739 gtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaatatcacaacataaggcagaacaacacaagataaa-tttttctggtattgaataatt 22724641  T
Q  188 ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 287  Q
    || ||| |||||  ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22724640 ttctgtattatatgatttttgggcgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgcgctgtggtttggtgagggacaa 22724541  T
Q  288 aaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    ||||   || ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  22724540 aaattgcagcttttgtcatatcccttgcctccagtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacgctgaacaactggaattgttctgtcctatc 22724441  T
Q  388 ctt 390  Q
    |||    
T  22724440 ctt 22724438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 301
Target Start/End: Original strand, 26652748 - 26652965
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||  |||| |||| ||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||||     
T  26652748 gtttggtttgtaaaacatcaagtacagtacataacagtataagaaaaaacagcacaatacaagggagaacagcataggacaaa-tttttatgacattgaa 26652846  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26652847 taattttttgttttatacgatttttggcggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgctgagg 26652946  T
Q  283 gacaaaaatatgagttttt 301  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26652947 gacaaaaatatcagttttt 26652965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 394
Target Start/End: Original strand, 48445456 - 48445713
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 235  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||    
T  48445456 acaacacaaggcataacaacacatgacaaa-tttttatggtattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgttattttcgtgtttt 48445554  T
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacct 335  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  48445555 agacaacttgtatgcgagacaaaaagttgtcctgtgatttggtgaaggacaaaaatttcagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgttctgtccct 48445654  T
Q  336 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  48445655 caaacagttttacaaattaaacattggataactggagttgttctgtcttttccttcatt 48445713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 221 - 390
Target Start/End: Original strand, 34519527 - 34519696
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34519527 ctatttttgtattttagacaacttgtacctgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaaattgcagtttttgtcctgtcccttgcctcca 34519626  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34519627 gcttgtcatgtccctgaaactgttttacaattcgaacactggacaactgaagttgttctgtcctgtcctt 34519696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46448810 - 46448562
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |  ||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  46448810 aacagtacaagacaaggcaaaacaacattggacaat-tttttattgcattgaataattttttgttttataagatttttaggggacgaaatgttattttgg 46448712  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
      ||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |     
T  46448711 atttttagataatttatacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttagtgacggacaaaaatatgagtttttatcatgtcccttgcatccagtttgtacc 46448612  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  46448611 gtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactgaagttgttct 46448562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 332
Target Start/End: Original strand, 34117414 - 34117581
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  34117414 aaatttttatggcattgaataatttttcgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggcattttagacaacttgtacatggaacaaaaaatt 34117513  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgta 332  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||  |||||||||||||    
T  34117514 gtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttatcatatc-cttgccttaagtttgtcctgta 34117581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41665789 - 41665564
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattga 181  Q
    |||||||||| |||||||| || |||   ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| || ||| || || ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  41665789 tgtttggtttacaaaacagtaagtacggaacataacaatacaagataggacagcacaacataacgcataatagcacaagacaaa-tttttatggtattga 41665691  T
Q  182 gtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag 281  Q
     || |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41665690 ataattttctgttttatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggcgag 41665591  T
Q  282 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 308  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||    
T  41665590 ggacaaaaattgcagtttttgtcctgt 41665564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 201
Target Start/End: Original strand, 12982178 - 12982302
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12982178 gggtgtgtttggtttgcaaaagagcaagtactggagagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggc 12982277  T
Q  177 attgagtacttttttgttttataca 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  12982278 attgagtaattttttgttttataca 12982302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15035386 - 15035219
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  15035386 aaatttttatggtattgaataattttttgttttgtacgatttttggtgggcaaaatgttattttgatattttagacaatttgtatgtggtacaaaaagtt 15035287  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgt 331  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| | | |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15035286 gtgttgtggtctggtgaggaacaagaatttcaattttcgtcctgtcctttgcttccagtttgtcctgt 15035219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 297 - 394
Target Start/End: Original strand, 26700572 - 26700669
Alignment:
Q  297 tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  26700572 tttttgtcctttctcttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttatacaaatcaaacactggacaactggaattgttatgtcatgtccttcatt 26700669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 317
Target Start/End: Original strand, 22631722 - 22631853
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22631722 ttttttgttttatacgatttttgggggacgaaatatcattttggtattttagacaacttgtacgtataacaaaaagttatgttgtggtttggtgaaggac 22631821  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcct 317  Q
    |||||||| |||| |||||  ||| |||||||    
T  22631822 aaaaatatcagttattgtcgcgtcccttgcct 22631853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 243
Target Start/End: Original strand, 16963055 - 16963149
Alignment:
Q  150 aacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtactttt-ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 243  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963055 aacagcacatgacaaattttttatggcattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaact 16963149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Original strand, 46627135 - 46627259
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||    
T  46627135 tttttatggcattgaataattttttgttttatacaatttttgggagacgaaatactatttttgtattttagacaatccgtacgtgagacaaaaaattgtg 46627234  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaat 291  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||    
T  46627235 ctgtggtttgatgagggataaaaat 46627259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Original strand, 48699417 - 48699500
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  48699417 ctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaatagttgtgttgtggtttagtgagggacaagaatttcagtttttgtc 48699500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 47442765 - 47442840
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaattt 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47442765 aacagtacaacataaggcagaacactacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacaattt 47442840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21408702 - 21408530
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||  |||||||||||  | |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  21408702 ctatttttgtattttagataacttgtacatgaaataaaaagttatgttgtggtttaatgagggacaaatgtttt-gtctttgtcatgtcccttgcctcca 21408604  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||  ||| ||  |||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  21408603 gtttgtgttgtcccaaaaacagctttacaaatcaaatattgtacaactagagatgtcatgtcatgtccttcatt 21408530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29372939 - 29372767
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 235  Q
    ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||| |||| ||| | || ||||| || |||||  |||||||  ||| |||| | || ||||  |||||    
T  29372939 acaacgcaagtcagaacaatacaagacaaactttt-atggtattaaataatttttggtcttatatgatttttggtggataaaaggttaatttgaaatttt 29372841  T
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  29372840 agacaacttgtacatggaacagaaagttgtgttgtggtttagtgacggacaaaaattttagtttttgtcgtgtc 29372767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 358
Target Start/End: Original strand, 2048945 - 2049107
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    ||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| |     
T  2048945 ttatacaattttttatggacaaaaa-ctatttttgtattttttataacttctacgtgggacaaaatgttttgttgtggtttagtgatggacaaaaattta 2049043  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
      |||||||  |||  |||||||| ||||||||| || ||  ||||| |||| |||||||||||    
T  2049044 tatttttgttatgttccttgcctctagtttgtcccgtcccaaaaacaatttttcaaatcaaaca 2049107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29455933 - 29455778
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | || |||||| ||| | | |||||||  ||||     
T  29455933 ggacaaaacgctattttggtattttata--actagtatgtgggacaaaaagttgtgttgttgttaagcgaaggacaagaatttcactttttgttatgtcc 29455836  T
Q  311 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
    |||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  29455835 cttgcctccaatttctactgtctctgaaatagtgttacaaatcaaacattgcacaact 29455778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 329
Target Start/End: Original strand, 42332058 - 42332186
Alignment:
Q  201 aatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 300  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||| |  |||||    
T  42332058 aatttttggtggataaaatgttattttgatatttaagacaatttgtatgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggtgaagaactagaatttatgtttt 42332157  T
Q  301 tgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  42332158 tgtcctgtcatttgcctccaatttatcct 42332186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21408408 - 21408328
Alignment:
Q  189 tttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 269  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21408408 tttgtcttatacaatttttgatggacaaaaggttcttttcgtattttaaacaacttatacgtaggacaaaaaattgtgttg 21408328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Original strand, 35645466 - 35645530
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35645466 ctattttattattttagacaacttgtacgtacgataaaaagttgtgttgtggtttagtgagggac 35645530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 322 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41665573 - 41665505
Alignment:
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41665573 tttgtcctgttcttgaaacagttttataattgaaacactggacaactggagttgttctgtcctatcctt 41665505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47316901 - 47316835
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaag 145  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  47316901 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacggtacaagatagaacagtacaacacaag 47316835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 263
Target Start/End: Original strand, 7958635 - 7958687
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7958635 ggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacttcagacaaaaagtt 7958687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8054452 - 8054400
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  8054452 ctattttggtattttaaaaaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatggt 8054400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 309
Target Start/End: Original strand, 8360580 - 8360659
Alignment:
Q  229 gtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| | | |||||||| ||||    
T  8360580 gtattttagacaacttgtacgagg-acaaaaagttgtgatgtggtttagtgtgagacaagaattttattttttgtcatgtc 8360659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Original strand, 8453285 - 8453344
Alignment:
Q  212 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  8453285 gacaaaatgttattttgatattttagacaatttgtacg-aggacaaaaagttgtgatgtgg 8453344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29773720 - 29773646
Alignment:
Q  213 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 287  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || | |||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29773720 acaaaaagttattttggtattttaaaccatttgtactttggaaaaaatgttgtgttgtggtttagtgacggacaa 29773646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29992805 - 29992729
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||| || |||||| |||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29992805 tttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaattattttg-tattttagataacttgtacgtgagacaaaaagtt 29992729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3359837 - 3359773
Alignment:
Q  297 tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 361  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3359837 tttttgtcatgtcccttacctctagtttatcttgtgccagaaacagttttacaaatcaaagactg 3359773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 30052938 - 30053046
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    ||||||||||||||| | |||||   |||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||| || ||  ||| ||| |||| |||||| ||| |     
T  30052938 ttatacaatttttgatgaacaaacaactattttgatattttagacaacttatatgcgagacaaaaaattatgccgtgttttagtgaaggacaagaatttt 30053037  T
Q  295 agtttttgt 303  Q
    |||||||||    
T  30053038 agtttttgt 30053046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 103)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Original strand, 23521751 - 23522071
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  23521751 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttat 23521850  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521851 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 23521950  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521951 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcttccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 23522050  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  23522051 tgttttgtcctgtccttcatt 23522071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Original strand, 24002207 - 24002530
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24002207 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttt 24002306  T
Q  172 atggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24002307 ttggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgt 24002406  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24002407 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactag 24002506  T
Q  371 agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  24002507 agttgttctgtactgtccttcatt 24002530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20802743 - 20802426
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20802743 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 20802644  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20802643 attgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 20802544  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20802543 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactaaagttgt 20802444  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20802443 tctgtcctatccttcatt 20802426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Original strand, 56154489 - 56154812
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  56154489 tatttagggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttt 56154588  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  56154589 tatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgt 56154688  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56154689 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaa 56154788  T
Q  371 agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  56154789 agttgttctgtcctaaccttcatt 56154812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29785750 - 29785432
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  29785750 agggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactgaacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 29785651  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29785650 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagctgtgttgtggttt 29785551  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29785550 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 29785451  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  29785450 ttctgtcatgtccttcatt 29785432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49152311 - 49151995
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49152311 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggc 49152212  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49152211 attgagtaattttttgttttatacgatttttgatggacaaaatgttattttggt-ttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgtggtttg 49152113  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  49152112 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcgtgtcccttgcatccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggataactaaagttgt 49152013  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  49152012 tctgttctgtccttcatt 49151995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 112 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20518199 - 20517917
Alignment:
Q  112 caaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagg 211  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20518199 caaaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatagaatttttgagg 20518100  T
Q  212 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20518099 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaagaagttatgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgactttttgtcctgtctc 20518000  T
Q  312 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20517999 ttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 20517917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 77 - 390
Target Start/End: Original strand, 21202614 - 21202926
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||| || |||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  21202614 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacaaaacagtacaagacagaacagcacaacacaaaacagaacagcacatgacaaattttttatggc 21202713  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202714 aatgagtaattttttgttttatacgatttttg-gggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 21202812  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21202813 gtgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 21202912  T
Q  377 tctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||||    
T  21202913 tctgtcctgtcctt 21202926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 77 - 390
Target Start/End: Original strand, 21579900 - 21580213
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  21579900 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggt 21579999  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21580000 attgagtaatttttagttttatacgatttttgagggacaacatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttg 21580099  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  21580100 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaattagaattgt 21580199  T
Q  377 tctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||||    
T  21580200 tctgtcctgtcctt 21580213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 55065543 - 55065231
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  55065543 ggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtataagataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaa-tttttatggca 55065445  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55065444 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 55065345  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  55065344 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaataactagagttgt 55065245  T
Q  377 tctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||| |||||||    
T  55065244 tctgtcatgtcctt 55065231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 12600761 - 12601077
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  12600761 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacttgacaaattttttatggca 12600860  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12600861 ttgagtagttttttgttttaaacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttga 12600960  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12600961 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 12601060  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12601061 ctgtcatgtccttcatt 12601077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 77 - 389
Target Start/End: Original strand, 52319200 - 52319509
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  52319200 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggc 52319299  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52319300 attgagtaattt---gttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttgacattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 52319396  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52319397 gtgagggacaaaaatatgagttttcgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgt 52319496  T
Q  377 tctgtcctgtcct 389  Q
    ||||| |||||||    
T  52319497 tctgttctgtcct 52319509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 37865627 - 37865944
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||   ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||    
T  37865627 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacgggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaatttttttatggc 37865726  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37865727 attgaataattttttgttttatacgatttctgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtgatttg 37865826  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865827 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtctcttgcctccagattgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 37865926  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||| |||||||||||    
T  37865927 tatgtcgtgtccttcatt 37865944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 76 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33177245 - 33176939
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  ||||||||    
T  33177245 agggtgtgcttggtttgcaaaacggtaagtacttgacagaacagtataagatagaacagtacaacacaagacagaacaacaaaggacaaatattttatgg 33177146  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33177145 cattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtgcgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 33177046  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  33177045 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaaattg 33176946  T
Q  376 ttctgtc 382  Q
    |||||||    
T  33176945 ttctgtc 33176939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 38486465 - 38486152
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| |  ||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38486465 agggtgtgtttcgtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtgcaagatagaacag-----cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgg 38486371  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38486370 cgttgagtaattttttgttttatactatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgttagacaaaaagttgtgctgtggttt 38486271  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38486270 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 38486171  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  38486170 ttctgtcatgtccttcatt 38486152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 140 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2725281 - 2725028
Alignment:
Q  140 cacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725281 cacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac 2725182  T
Q  240 aacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaa 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2725181 aacttgtacgtgg-acaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctaaaa 2725083  T
Q  340 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725082 gagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 2725028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33553003 - 33552741
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33553003 agaacagtacaacacaaggcaaaacaacacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 33552904  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  33552903 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccaatttgtc 33552804  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33552803 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtcctgtcctt 33552741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 76 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9512553 - 9512238
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| || ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  9512553 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtacgtgacagaacagtacaagatagaatagtgcaacaaaagacagaatagcacatgacaaattttttatgg 9512454  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9512453 cattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 9512354  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9512353 ggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgttacttgcctccagtttatcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 9512254  T
Q  376 ttctgtcctgtccttc 391  Q
    |||| || ||||||||    
T  9512253 ttctatcatgtccttc 9512238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Original strand, 55593805 - 55594076
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55593805 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacaatgcaaaacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgtt 55593904  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55593905 attttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggactaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 55594004  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55594005 ttatcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagagttgttctgtcctgttcttcatt 55594076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 6776460 - 6776769
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||      |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6776460 gtgtgtttggtttgcaaaacagc------tggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 6776553  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776554 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 6776653  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776654 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 6776753  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  6776754 tgtcctgtccttcatt 6776769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Original strand, 52949602 - 52949911
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||||     
T  52949602 gtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaatagcacaggacaaa-tttttatgacattgaa 52949700  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52949701 taatttt-tgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgctgagg 52949799  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52949800 gacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatgaaacactggacaactagagttgttttgtc 52949899  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||    
T  52949900 gtgtccttcatt 52949911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36743901 - 36743583
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||||| | | |||  || ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  36743901 agggtgtgtttggtttgaaaaatagtaagtactagatagaacggtacaagatagaataatacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatgg 36743802  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36743801 cattgagtaatttgttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagttt 36743702  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36743701 ggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaattcaaacactgaacaactagagttg 36743602  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || |||  | |||||||||    
T  36743601 ttttgttatatccttcatt 36743583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Original strand, 36497144 - 36497408
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  36497144 aacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaaaaatttatagcattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacagaatgctattttga 36497243  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36497244 tattttagacaacttgtatgttggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgtctccagtttgtcct 36497343  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  36497344 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctatccttcatt 36497408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 309
Target Start/End: Original strand, 43640970 - 43641205
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43640970 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaaatttttat 43641069  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43641070 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggt 43641169  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43641170 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 43641205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 1231236 - 1231502
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1231236 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaagataaattttttatggcattatgtaatattttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 1231335  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  1231336 gatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttttgtgagggacaaaaatatgagtttttgtccagtctcttgcctccagtttatc 1231435  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1231436 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctatccttcatt 1231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50178699 - 50178387
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattga 181  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  50178699 tgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacatcacaatacaagggagaacatcacaggacaaa-tttttatgacattga 50178601  T
Q  182 gtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa-gttgtgttgtggtttggtga 280  Q
     || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  50178600 ataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgctgtggtttgctga 50178501  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50178500 ggcacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctg 50178401  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||    
T  50178400 tcctgtccttcatt 50178387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50728055 - 50727808
Alignment:
Q  147 cagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 246  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50728055 cagaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgt 50727956  T
Q  247 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50727955 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttt 50727856  T
Q  347 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50727855 acaaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 50727808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50736069 - 50735822
Alignment:
Q  147 cagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgt 246  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50736069 cagaacagcactggacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgt 50735970  T
Q  247 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50735969 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagtttt 50735870  T
Q  347 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50735869 acaaatcaaacacttgacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 50735822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 148 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46680651 - 46680405
Alignment:
Q  148 agaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  46680651 agaacagtacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgattttttagggacaaaatgctattatggtattttagacaatttgta 46680552  T
Q  248 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 347  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46680551 cgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 46680452  T
Q  348 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46680451 caaatcaaacactgaacaactagaattgttctgtcctgtccttcatt 46680405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 77 - 382
Target Start/End: Original strand, 34929789 - 34930094
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  34929789 gggtatgtttggtttgcaaaacagtaaaaactagacaaaacagtacaaaataaaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaaatttttatggc 34929888  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  34929889 attcagtaaatttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtatatggggcaaaaagttgtgctgtggtttg 34929988  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34929989 gtgaggaacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttattctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttat 34930088  T
Q  377 tctgtc 382  Q
    ||||||    
T  34930089 tctgtc 34930094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 72 - 390
Target Start/End: Original strand, 36885815 - 36886119
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||               ||||||| |||||    
T  36885815 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcgagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacaca---------------ggacaaatttttt 36885899  T
Q  172 atggcattgagt-acttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  36885900 atggcattgagttaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttaggtattttagacaatttgtacgtgggataaaaagttgtgctgt 36885999  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36886000 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 36886099  T
Q  371 agttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||| |||| |||||||    
T  36886100 agttgttttgtcttgtcctt 36886119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 73 - 392
Target Start/End: Original strand, 20694246 - 20694560
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |  | | |||| || |||||||||||     ||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||    
T  20694246 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtaatggatagaacagtacaagatagaaca-----acacaaggcagaatagcacatgacaaattttgta 20694340  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20694341 tggcaatgagtaattttttgttttatataatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgttggacaaaaagttgcgttgtgg 20694440  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20694441 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgccttcagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaattaaacactggacaactagag 20694540  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttca 392  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  20694541 ttgttctgtgttgtccttca 20694560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 38812484 - 38812707
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812484 tttttatgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttgcggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 38812583  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38812584 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 38812683  T
Q  367 ctagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  38812684 ctagagttgttatgtcctgtcctt 38812707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 125 - 387
Target Start/End: Original strand, 54542912 - 54543173
Alignment:
Q  125 gatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctat 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  54542912 gatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaagacaaattttttatgtcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatat 54543011  T
Q  225 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  54543012 tttggtattttagacaacttgtacgtgggac-aaaagttgtgctatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaattt 54543110  T
Q  325 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  54543111 gtcctgtacttgaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgtc 54543173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 76 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47642703 - 47642388
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  47642703 agggtgcgtttggtttgcaaaacaacaagtatagtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaggataaa-tttttatga 47642605  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47642604 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 47642505  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47642504 gctgagggacaaaaatatcagtttttatcttgtctcttacctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttg 47642405  T
Q  376 ttctgtcctgtccttca 392  Q
    |||||||||||||||||    
T  47642404 ttctgtcctgtccttca 47642388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44649373 - 44649059
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||  |||| |||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||| ||| |    
T  44649373 gggtgcgtttgatttgcaaaacggcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagtacaatacaagggagaacaacacatgacaaa-ttttgatgac 44649275  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44649274 attgaataatttt--gttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 44649177  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  44649176 ctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaaactggataactggagttgt 44649077  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44649076 tctgtcctgtccttcatt 44649059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 394
Target Start/End: Original strand, 24210250 - 24210510
Alignment:
Q  135 tacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgctattttggtatt 233  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24210250 tacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctattttggtatt 24210349  T
Q  234 ttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtac 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24210350 ttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaataatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtac 24210449  T
Q  334 ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24210450 ctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaattagagttgttccgtcctatctttcatt 24210510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 42869859 - 42870162
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||         | || ||||| |||||||||||||    
T  42869859 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactcgacagaacagtacaagatagaacagtacaacataagg---------atagaacaaattttttatggcatt 42869949  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  42869950 gagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaa---gttgtgctgtggtttggt 42870046  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  42870047 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcccccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactagagttgtta 42870146  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||    
T  42870147 tgtcatgtccttcatt 42870162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47361570 - 47361309
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  47361570 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgatattgagtaattttttgttttatacgaatttttagggacaaaatgctatttt 47361471  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  47361470 ggtattttagacaactt----gttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatga-attttgtcttgtcccttgcctccggtttgtc 47361376  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47361375 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcatt 47361309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 44324500 - 44324237
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44324500 aacagcacaacataaggcagaacagcacatgacaaa-tttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttgg 44324402  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  44324401 tatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcccgtcttttgcctctagtttgtcct 44324302  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44324301 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 44324237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 29616095 - 29616357
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  29616095 agaacagtacaacacaagacagaacaacacatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttaagggacaaaatgttatttt 29616194  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29616195 ggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtc-----agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 29616289  T
Q  328 ctgtacc-tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29616290 ctgtaccttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatcatgtccttcatt 29616357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 143 - 382
Target Start/End: Original strand, 4325731 - 4325970
Alignment:
Q  143 aaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaac 242  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4325731 aaggcagaacaacacacgacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatgcgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttagacaac 4325830  T
Q  243 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4325831 ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgcggttttgtgagagacaaaaatatgagtttttctcctgtcccttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacag 4325930  T
Q  343 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4325931 ttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttttgtc 4325970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 393
Target Start/End: Original strand, 9807030 - 9807345
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  9807030 agggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatgg 9807128  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  9807129 cattgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtactgtggttt 9807228  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9807229 ggtga-ggacaaaaagttgagtttttgtcctgtccattgcatctagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttg 9807327  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcat 393  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  9807328 tcctgtcctatccttcat 9807345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 29592774 - 29593086
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | || || |||| ||||||     |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||    
T  29592774 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggacatatcagtacaagacagaaca-----acacaaggcagaacagaacaagacaaatttttt-tgg 29592867  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  29592868 cattgaataattttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgccattttggatttttagacaacttttatgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 29592967  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  29592968 agtgaagtacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaaggtg 29593067  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29593068 ttctgtcctgtccttcatt 29593086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 148 - 394
Target Start/End: Original strand, 32181209 - 32181454
Alignment:
Q  148 agaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 247  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32181209 agaacagcacaggacaaa-tttgtatgacattgaataattttatgttttatactatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgta 32181307  T
Q  248 cgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttta 347  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32181308 cgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacttgaaacagtttta 32181407  T
Q  348 caaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  32181408 caaatcaaacactggacaactaaagttgtcatgtcctatccttcatt 32181454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 3649511 - 3649827
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || ||||  |||| ||| |||||   ||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||||     
T  3649511 gggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacaacacagtataatgcagaacagcacaacacaaggcataacagcacatcacaaa-tttttatggt 3649609  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||| ||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3649610 attgaataatttcttgttttatatgttttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 3649709  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3649710 gtgagggacaaaaattttagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgt 3649809  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  3649810 tctgtcttgtccttcatt 3649827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 137 - 394
Target Start/End: Original strand, 11055977 - 11056233
Alignment:
Q  137 caacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttta 236  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  11055977 caacacaaggtagaacagtacgggacaaa-tctttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgaggcacgaaatgttattttggtattttt 11056075  T
Q  237 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctg 336  Q
    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11056076 gacaatctgtacatgggacataaagttgtgttgtggtttggtaagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctg 11056175  T
Q  337 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  11056176 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgaccttcatt 11056233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Original strand, 41711808 - 41712038
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41711808 aaatttttatgctattgaataattttttgttttatacgatatttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacctgtacgtgagacaaaaagtt 41711907  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41711908 gtactgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtctttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactgga 41712007  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  41712008 caactagagttgttctgttctatcattcatt 41712038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Original strand, 2786835 - 2787155
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||  |||||  |||||| |||||| ||||| ||  |||||  ||||||    
T  2786835 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagaccgaacaacacaacataaggcaaaacagcactagacaat-ttttta 2786933  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2786934 ttgcattgaataattttttgttttataagatttttgggggacgaaatgttattttggatttttagataatttgtacgtgggacaaaaatttgtgatgtgg 2787033  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2787034 tttagtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatccagtttgtactgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactagacaactagag 2787133  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  2787134 ttgttatgtcatgtccttcatt 2787155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 137 - 394
Target Start/End: Original strand, 39078596 - 39078852
Alignment:
Q  137 caacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttta 236  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| || |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39078596 caacacaaggcataacaacacaggataaa-tttttatggtattgaataatttcttattttatatgatttttgggggacaaaatgttattttggtgtttta 39078694  T
Q  237 gacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctg 336  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39078695 gacaactcgtacgtaggacaaaaatttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcctatctcttgcctccagtttgttctgtccctg 39078794  T
Q  337 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39078795 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 39078852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 390
Target Start/End: Original strand, 16320402 - 16320706
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||| ||||||  |||| | |||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||     
T  16320402 gtttgatttgcaaaacagcaagtactgtataaagcaatacaagaaagaacaacacaatagaagggagaacaacacaagacaaa-tttttatggcattgaa 16320500  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||  ||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16320501 taatttt--gttttatacgagttttgggggatgaaattctatttttgtattttaggcaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 16320598  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16320599 gacaaaaatatcagtttttatcctgtcccttgcctccagtttttcctatacctgagacagttttacaaatcaaatactggacaactggagttgttctgtc 16320698  T
Q  383 ctgtcctt 390  Q
    | ||||||    
T  16320699 cagtcctt 16320706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37695753 - 37695470
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  37695753 agggtgcgtttagtttgcaaaacaacaagtactgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaa-tttttatgg 37695655  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695654 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttgatattttagacaacctgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 37695555  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 360  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37695554 gatgagggacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttacctccaatttatcatgtacctgaaacagttttccaaataaaacact 37695470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 394
Target Start/End: Original strand, 50186411 - 50186719
Alignment:
Q  85 ttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagta 184  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||  |||| ||||||| | || || |||||| ||| || ||||  | |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  50186411 ttggtttgcaaaacagtaagtacttgactgaacagtataagacaaaatagcacaacataagacataacaacataggacaaa-tttttatgacattgaata 50186509  T
Q  185 cttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 284  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50186510 attttttattttatacgatttttggggtgcgaaatgctatttttgtattttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 50186609  T
Q  285 caaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 384  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  50186610 caaaaatatgagtttttatcccgtcccttgcctctagtttgtcctgcacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctttctt 50186709  T
Q  385 gtccttcatt 394  Q
    ||||||||||    
T  50186710 gtccttcatt 50186719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 222 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2630018 - 2629846
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||    
T  2630018 tattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatttggtctggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcctttgcctctag 2629919  T
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2629918 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacacgggacaactagagttgttatgtcatgtccttcatt 2629846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7555171 - 7554864
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || |  ||  |||| || |||| | ||||  |||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||    
T  7555171 taagggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtattggacttaacagtacaagacaaaacaacacaacacaagacagaacatcacacgacaaa-tttttat 7555073  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7555072 ggcattgaataattttttgttttatacgatttttggaggccgaaatgctattttggatttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttatggt 7554973  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  7554972 ttagtgaaggacaaaaatacgagtttttatcatgtctcttgcattcagtttgttttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctgaaat 7554873  T
Q  374 tgttctgtc 382  Q
    |||||||||    
T  7554872 tgttctgtc 7554864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 210 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50729621 - 50729437
Alignment:
Q  210 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  50729621 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgatagacaaaaatttcagtttttgtcatgtc 50729522  T
Q  310 tcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50729521 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcttgtccttcatt 50729437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22318599 - 22318279
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||  ||| || | || ||   ||||||| |||||||||| || ||||  ||| |||||| ||||||    
T  22318599 ttaagggtacgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaagagtacaatgcagaacagcacaacacaagacataacaacacatgacaaa-ttttta 22318501  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||  ||||| || ||| ||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22318500 tgatattgaataatttcttgttttatatgatttttggatgacaaaatgttattttggtgttttagacaacttctacgtaagacaaaaagttgtgttgtgg 22318401  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |    
T  22318400 tttggtgagggacaaaaatttcaaattttgtcctgtctcttgccttcagtttgttctgtccctaaaacagttttacaaatcaaacactagacagctgggg 22318301  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  22318300 ttgttctgtcatgtccttcatt 22318279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 210 - 394
Target Start/End: Original strand, 28115259 - 28115442
Alignment:
Q  210 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  28115259 gggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatcaatttttctcctgtc 28115358  T
Q  310 tcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||    
T  28115359 ccttgcctccagtttgtcttgtacc-aaaacagttttacaaatcaaacactagacaacttgagttgttctgccctttgcttcatt 28115442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 115 - 394
Target Start/End: Original strand, 26083251 - 26083528
Alignment:
Q  115 aacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac 214  Q
    ||||||||||   ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  |||||||||   |||||| |||||    
T  26083251 aacaatataatgcagaacaacacaacacaaggcataacagtacacgacaaa-tttttatggtattgaataatttcatgttttatatgctttttgggggac 26083349  T
Q  215 aaaatgctattttgg-tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctctt 313  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||    
T  26083350 gaaatgttattttgggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgtccctt 26083449  T
Q  314 gcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  26083450 gcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactaaacaactgaagttgttctgt--tgtccttcatt 26083528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 308
Target Start/End: Original strand, 23327850 - 23328024
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattt 234  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||||    
T  23327850 acaacacaaagtagaacattacaggacaaattttttatggcaatgagtaattttttgttttatacgatttttggggggataaaatgttattttggtattt 23327949  T
Q  235 tagacaacttgtacgtgggacaaaa-agttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23327950 tagacaacttgtacgtgggacaaaaaagttgtgttgtggtttgctgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgt 23328024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 53200769 - 53200538
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa-gt 262  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53200769 aaatttttatggtattgaataattttttgttttgtatgatttttgagggacgaaatactattttgatgttttagacaacttgtacgtgggacaaaaaagt 53200670  T
Q  263 tgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 362  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||      
T  53200669 tgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcatgttccttgcctccagtttatcctgtctctgaaacagttttgcaaatcaaacactaa 53200570  T
Q  363 acaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| ||  |||| || |||| |||||||||||    
T  53200569 acagctgaagttattatgtcttgtccttcatt 53200538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 260
Target Start/End: Original strand, 14296471 - 14296654
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||  ||| ||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14296471 gggtgtgtttgatttgcaaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14296570  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14296571 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 14296654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 80 - 303
Target Start/End: Original strand, 37931798 - 37932020
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||| | || |  | || |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  37931798 tgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtacaagacataataacataatacaaggcagaacagcacaagacaac-tttttatggcatt 37931896  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931897 gaataatttttcgttttatacaatttttgggggacgaaatgctattttgacattttaaacaacttgtatgtaggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 37931996  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37931997 agggacaaaaatatgagtttttgt 37932020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 260
Target Start/End: Original strand, 14314719 - 14314902
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || ||||  ||| ||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14314719 gggtgtgtttgatttgctaaacaataagtactggacagaacagaacaatatagaacagtacaacacaaagcagaacagcacaggacaaattttttatggc 14314818  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14314819 attgagtaattttttgttttatacgatttttgggagacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 14314902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 394
Target Start/End: Original strand, 42772832 - 42772979
Alignment:
Q  247 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  42772832 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctcaagtttgtcatgtacctgaaacaatttt 42772931  T
Q  347 acaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  42772932 acaaatcaaacacttgaaaactaaagttgttatgtcatgtcattcatt 42772979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6973946 - 6973808
Alignment:
Q  256 aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6973946 aaaaagttgtgttgtggtttggcgagggacaaaattatgagtttttgtcctgtcaattgcctcccgtttgtccagtacctgaaacagttttacaaatcaa 6973847  T
Q  356 acactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  6973846 acactggacaacaaaagttgttctatcctgtccttcatt 6973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 164 - 382
Target Start/End: Original strand, 30942749 - 30942968
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| |||    
T  30942749 aaatttttatagcattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggatgaaatgatattttggtgttttagacaacttatatgtgaggcaaaatgtt 30942848  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgag-tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 362  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  30942849 gtgttgtggtttggtgagagacagaaatttcagttttttgtcccgtctcttgcctccaatttgttctgtccctgaaacagttttataaatcaaacactga 30942948  T
Q  363 acaactagagttgttctgtc 382  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  30942949 ataactggagttgttctgtc 30942968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 327
Target Start/End: Original strand, 7001748 - 7001976
Alignment:
Q  96 aacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttt 195  Q
    ||||| |||||||  |||||| | || |||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || |    
T  7001748 aacagtaaatactggacaaaatagtacaagacagaacatcacaacacaagacagaacaatacaggacaaa-tttttatggcattgaataatttttggtct 7001846  T
Q  196 tatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatga 295  Q
    ||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  7001847 tatacgatttttggtggacaaa-tgttattttggtattt-agacaacttatacatagaacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaattttt 7001944  T
Q  296 gtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7001945 gtttttgttctgtctcttgcctcgagtttgtc 7001976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 390
Target Start/End: Original strand, 14296645 - 14296754
Alignment:
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14296645 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14296744  T
Q  381 tcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||    
T  14296745 tcctgtcctt 14296754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 281 - 390
Target Start/End: Original strand, 14314893 - 14315002
Alignment:
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14314893 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaattagagttgttatg 14314992  T
Q  381 tcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||    
T  14314993 tcctgtcctt 14315002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25978664 - 25978511
Alignment:
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacct 335  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| |||    
T  25978664 agacaacttgtaagtgagacaaaaagttgtgatatggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgttcattgcctccaatttgtcatgt-cct 25978566  T
Q  336 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||| |||||||    
T  25978565 gaaacagttttacaaatcaaacactggataattgaagttgttttgtcatgtcctt 25978511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 358
Target Start/End: Original strand, 9947947 - 9948084
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||| |    
T  9947947 ctattttggtattttgaataacttgtacgtgagacaaaaagttgtaatgtggtttagtgagggataagaattttagtttttgtcatgtctcttgcctcaa 9948046  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9948047 gtttgtcatgttccttaaacagttttacaaatcaaaca 9948084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 300
Target Start/End: Original strand, 13110207 - 13110425
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  13110207 gtgtttggtttgcaaaacagtaagtagtggataaaacaatacaagatagaacaacatagcacaaggtagaacaacgcagaacaaa-tttttatggcattg 13110305  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg-tttggtg 279  Q
      || ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  13110306 cataattttt-gttttgtatgatttttgggggacgaaatgctattttggatttttagacaaattttacgtgggacaaacagttgtgttgtggttttagtg 13110404  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttt 300  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13110405 aaggacaaaaatatgagtttt 13110425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 211 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45577770 - 45577619
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat---atgagtttttgtcctg 307  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||   ||   |||||||| ||    
T  45577770 ggacaaaatgtcattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttagcgaggaacaagaatttcatttttttttgtcatg 45577671  T
Q  308 tctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacag-ttttacaaatcaaaca 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  45577670 tctcttgcctccagtttgtcatgtccataaaacagcttttacaaatcaaaca 45577619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44355942 - 44355768
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaag-ttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 300  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||    
T  44355942 atttttgatggacaaaagactattttggtatatcatacaacttgtacgtaagacaaaaaaattgtgttgtggtttaatgagggacaaaaatttcaatttt 44355843  T
Q  301 tgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  44355842 tgtcctctctcttacctccagtttgtcctatccctaaaacag-tttacaaatcaaacaccacacaactagatttgt 44355768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 309
Target Start/End: Original strand, 43739422 - 43739567
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||| ||| ||| | || ||||| || |||||||||||||   ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43739422 aaatttttttggtattaaataatttttggtcttatacaattttttgtggataaaatgttattttaatattttagacaacttgtatgtgggacaaaatgtt 43739521  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  43739522 gtgttgtggtttggtgagggacaataatttcagtttttgtcatgtc 43739567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 56487288 - 56487182
Alignment:
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  56487288 gacaaaaatataaatttttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctatatctgaaacagttttacaaatcaaac-----acaactagagttgttctgtc 56487194  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
     |||| ||||||    
T  56487193 atgtctttcatt 56487182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 263
Target Start/End: Original strand, 42772724 - 42772818
Alignment:
Q  169 tttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42772724 tttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttggaggaaaaaatgttattttggtattttagataacttatacgtgggacaaaaagtt 42772818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 288
Target Start/End: Original strand, 43893541 - 43893662
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||    
T  43893541 tttttatggtattgattttttttttgttttatataatttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacctgcacgtgagacaaaaaattgtg 43893640  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaa 288  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  43893641 ttgtggtttagtgaaggacaaa 43893662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 394
Target Start/End: Original strand, 23328015 - 23328087
Alignment:
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23328015 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaagtcaaacacatgacaactagagttgttctgtcatatccttcatt 23328087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 358
Target Start/End: Original strand, 21098546 - 21098689
Alignment:
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | | |||||||||  | ||| |    
T  21098546 aaaatgttattttagtattttagacaaattttacgtgcgacaaaaagttatgttgtggtttagtgagagacaagaatttcaatttttgtcc--tttctag 21098643  T
Q  315 cctccagtttgtcctgta--cctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    ||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21098644 cctgcagttagtcctatatccctgaaacagttttacaaattaaaca 21098689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 300
Target Start/End: Original strand, 52755503 - 52755617
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  52755503 ttttttgttttatacaatgtttgatggaaaaaatgttattttgctaatttacacagcttgtgcttggaacaaaaagttgttttgtgctttggtgagggac 52755602  T
Q  286 aaaaatatgagtttt 300  Q
    || ||| | ||||||    
T  52755603 aagaattttagtttt 52755617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 357
Target Start/End: Original strand, 3579142 - 3579279
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa-aaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||| ||| || |||| |   |||||||| |||| ||||||||     
T  3579142 ctattttggtattttagacaacttgaatgttggacaaaaagttgtgatatggtttagtgatggaaaataaatttacttttttgtcatgtcccttgcctca 3579241  T
Q  320 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 357  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  3579242 agtttgtcctgcccctaaaacagatttacgaatcaaac 3579279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 326
Target Start/End: Original strand, 52673809 - 52673934
Alignment:
Q  201 aatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 300  Q
    ||||||||  ||||||||   |||||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  52673809 aatttttggtggacaaaaatttatttttgtattttagataactcatacgtgagacaaaaaattgtgttgaggtttagtgagggacaaaaatttctgtttt 52673908  T
Q  301 tgtcctgtctcttgcctccagtttgt 326  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||    
T  52673909 tgtcatgtcccttgactccagtttgt 52673934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Original strand, 38520518 - 38520584
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaa 288  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  38520518 tattttggtattttatacaacttgtgcgtgggacaaaaaattatgctgtggtttggtgagggacaaa 38520584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43189883 - 43189670
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| || |||   |||||| | | |||||| |||||| ||| |||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  43189883 ttttatggtattgaataattttttgtcttatacgatatttagtggacaataagttatttttgtattt-agataacttgcatttgggacaaaaacttgtgt 43189785  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 367  Q
     ||||||| |||||  |||||||  |  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |  |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43189784 cgtggtttagtgagacacaaaaaattatgtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgtcatatttcaaaaacaattttacaaatcaaacactgtacaac 43189685  T
Q  368 tagagttgttctgtc 382  Q
    || | ||||| ||||    
T  43189684 taaaattgttatgtc 43189670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53343638 - 53343560
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttt 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  53343638 agaacagtacaacacaatgcagaacaacacatgacaaattttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttt 53343560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 382
Target Start/End: Original strand, 44640417 - 44640502
Alignment:
Q  297 tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  44640417 tttttgtcttgtctcttgcctctagtttgtcattttccataaacagttttacaaatcaaacactgtacaactgaagttgttctgtc 44640502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 56487374 - 56487281
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  56487374 tttttatgtcattgattgattttttgttttatatgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttaaacaacttgtacgcgtgacaaaaa 56487281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 40792409 - 40792486
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  40792409 ttatacgatttttgatggacaaaaagctatttttgtattttagataacttgtacatgaaacaaaaagttgtgatgtgg 40792486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 357
Target Start/End: Original strand, 10587062 - 10587189
Alignment:
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| | || || ||||||||  ||| |||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||   ||||||| |    
T  10587062 tattttggataacttatacgtgggacaaataattatgatgtggtttaatgaaggacaataatttcagtttttgtcttgtctcatgcctttggtttgtcat 10587161  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaac 357  Q
    || | |||| || |||||||||||||||    
T  10587162 gttcttgaaccaattttacaaatcaaac 10587189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 142
Target Start/End: Original strand, 11055161 - 11055225
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacac 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||||||  |||||||    
T  11055161 ggtgtgtttcgtttgcaaaacagcaagtactatacaatacagtacaagacagaacaacacaacac 11055225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31445952 - 31445771
Alignment:
Q  213 acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctct 312  Q
    |||||| | |||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||  ||||  |    
T  31445952 acaaaaagttatttttgtattttagataatttgtacgtgtggcaaaaagttgtgatgttgtttagtg-gggacaaaggtttatgtttt-gtgttgtcctt 31445855  T
Q  313 tgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac--tggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| ||||||| | |  |  |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  31445854 tgcctcccgtttgtcatatctcaaaaacagttttacaaatcaaagacattgtacaactagagttgtcatgtcatgtccttcatt 31445771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41897477 - 41897338
Alignment:
Q  170 ttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 269  Q
    |||||| ||||| || |||||  || ||||||||||||   ||| ||||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    
T  41897477 ttatggtattgaataatttttgattgtatacaattttttgtggataaaaaactatttttgtattttatataacttttacgtaggataaaaagttgtgctg 41897378  T
Q  270 tggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    | ||||   |||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  41897377 ttgtttatcgagggacacaaatttttgtttttgtcctgtc 41897338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2725329 - 2725283
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatata 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  2725329 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatata 2725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Original strand, 13110443 - 13110497
Alignment:
Q  340 cagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||    
T  13110443 cagttttacaaatcaaacactggacaactgaaatttttctgtcatgtctttcatt 13110497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 358
Target Start/End: Original strand, 51518482 - 51518528
Alignment:
Q  312 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51518482 ttgcttccagcttgtcctgtatcagaaacagttttacaaatcaaaca 51518528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 304
Target Start/End: Original strand, 7381285 - 7381378
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 304  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||||| | || ||||||||||||| ||||||  | |  ||| ||||||| ||||||||||    
T  7381285 ggacaaaaaactatttttgtattttagataatttgtacgcgtgaaaaaaagttgtgttatggtttaatcaaagactaaaatatcagtttttgtc 7381378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34560012 - 34559963
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  34560012 tattttggtactttagacaacttctatgtatgacaaaaagttgtgttgtg 34559963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 263
Target Start/End: Original strand, 41720862 - 41720903
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41720862 tatttttgtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagtt 41720903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 394
Target Start/End: Original strand, 2114191 - 2114227
Alignment:
Q  358 actggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2114191 actggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 2114227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 137
Target Start/End: Original strand, 38520438 - 38520498
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || |  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38520438 gggtgtgtttggtttgcaaaacaactagtattggacagaacagtataagatagaacagtac 38520498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 41262007 - 41262071
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||    
T  41262007 ggacaaaagactaatttgctattttagacaacttgtaggtgagacaaaacattgtgtggtggttt 41262071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 79 - 390
Target Start/End: Original strand, 29584749 - 29585060
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  29584749 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagtacagaacaaattttttattgcat 29584848  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584849 tgagtaattttttattttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 29584948  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584949 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 29585048  T
Q  379 tgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||    
T  29585049 tgtcctgtcctt 29585060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 28675661 - 28675979
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  28675661 agggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatgg 28675760  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28675761 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 28675860  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28675861 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattg 28675960  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  28675961 ttctgtcctgttcttcatt 28675979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1344925 - 1344603
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||  |||||    
T  1344925 attaagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacatcacatgacaattttttt 1344826  T
Q  172 atggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1344825 atggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtg 1344726  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1344725 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttctgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactaga 1344626  T
Q  372 gttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1344625 gttgttctgtcctgtccttcatt 1344603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 80 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21221570 - 21221261
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21221570 tgtgtttggtttgcaatacagcaagtactagacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacaagacaaattttttatggcatt 21221471  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21221470 gagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 21221371  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21221370 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccag-ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagttgttct 21221272  T
Q  380 gtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||    
T  21221271 gtcctgtcctt 21221261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51259994 - 51259676
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51259994 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaagacaaaatttttatgg 51259895  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51259894 cattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgccgtggttt 51259795  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51259794 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 51259695  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  51259694 ttctgtcatgtccttcatt 51259676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 2134944 - 2135259
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  2134944 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactagacagaacgttacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggcat 2135043  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2135044 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaagtgctattttggtattttagataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 2135143  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135144 gagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 2135243  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  2135244 tgtcctgtccttcatt 2135259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 85 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12349376 - 12349067
Alignment:
Q  85 ttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagta 184  Q
    ||||||||||||| ||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12349376 ttggtttgcaaaagagcaagtattggacataacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatggcattgagta 12349277  T
Q  185 cttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 284  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12349276 attttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacataaagttgtgctgtggtttggtgagaga 12349177  T
Q  285 caaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcct 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12349176 caaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttatgtcct 12349077  T
Q  385 gtccttcatt 394  Q
    ||||||||||    
T  12349076 gtccttcatt 12349067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 74 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4851672 - 4851364
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4851672 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacaaaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaagacaggacaaattttttat 4851573  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4851572 ggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggg 4851473  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4851472 ttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcctgtcccttgcctccaaattgtcttgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 4851375  T
Q  374 tgttctgtcct 384  Q
    |||||||||||    
T  4851374 tgttctgtcct 4851364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20609810 - 20609544
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20609810 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgacattgagtaattttttgttatatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 20609711  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20609710 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccaccagtttgtc 20609611  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20609610 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 20609544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 79 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 47958643 - 47958334
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||    
T  47958643 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagatagaacactacaatacaaggcagaacagcatagaacaaattttttatgtcat 47958544  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47958543 tgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtagtttggt 47958444  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47958443 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttttcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 47958344  T
Q  379 tgtcctgtcc 388  Q
    | | ||||||    
T  47958343 tatactgtcc 47958334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 34026590 - 34026856
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34026590 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34026689  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34026690 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtc 34026789  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34026790 ctatacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaaatagagttgttctgtcctgtccttcatt 34026856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 125 - 394
Target Start/End: Original strand, 44116859 - 44117128
Alignment:
Q  125 gatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctat 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44116859 gatagaacagtacaacacaagtcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctat 44116958  T
Q  225 tttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 324  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116959 ttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgcagtggtttgatgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagttt 44117058  T
Q  325 gtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44117059 gtcctgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtccagtccttcatt 44117128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 123 - 394
Target Start/End: Original strand, 40094421 - 40094692
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40094421 aagatagaacaatacaacacaaggcagaacaacacatgacaaaatttttatggcattgagtaattttttgttttatgcgatttttgagggacaaaatgct 40094520  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40094521 attttggtattttagacaatttgtacgtgaaacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 40094620  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40094621 ttgttctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 40094692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 24571153 - 24571470
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24571153 agggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacaga-cactataagatagaacaatacaacataaggcagaacagtacatgacaaattttttatgg 24571251  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24571252 cattgagtaatttgttgttttattcgatttttgggggacaaaatcctatttttgtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggttt 24571351  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24571352 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 24571451  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||||||    
T  24571452 ttttgtcctgtccttcatt 24571470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 81 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 3864883 - 3864578
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3864883 gtgtttggtttgcaaaacagtaagtactgcacagaacagtacaagatagaacattacaacataacgcataacagcacaggacaaattttttatggcattg 3864784  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3864783 agtaattttttgttttatatgatttttg-gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggcga 3864685  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3864684 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaactaaagttgttctg 3864585  T
Q  381 tcctgtc 387  Q
    |||||||    
T  3864584 tcctgtc 3864578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42636565 - 42636299
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42636565 agaatagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattaagtaattttttgttttaaacgatttttgagggacaaaatgttatttt 42636466  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42636465 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgtc 42636366  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42636365 ctatacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagaattgttctgtcctgtccttcatt 42636299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 76 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53558009 - 53557703
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  53558009 agggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtacttgacagaacaatacaaggtataacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 53557910  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  53557909 cattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgcagtggttt 53557810  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53557809 ggtgagggacaaaactatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacattgaacaactagagttg 53557710  T
Q  376 ttctgtc 382  Q
     ||||||    
T  53557709 ctctgtc 53557703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 82 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25927536 - 25927223
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaa-cagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  25927536 tgtttggtttgcaaaaacaacaagtaccggacaaaacagtataagatagaacagtacaatacaaggtagaacagcacaagacaaattttttatggcattg 25927437  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25927436 agtgattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgttttggtaa 25927337  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25927336 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtatttgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagttgttctg 25927237  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| |||||    
T  25927236 tcctgtccatcatt 25927223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31883234 - 31882918
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |    
T  31883234 gggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaagggagaacaacacaggacaaa-tttttatgac 31883136  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31883135 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 31883036  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31883035 ctgaggcacaaaaatatcagtttttgtcgtgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 31882936  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31882935 tctgtcatgtccttcatt 31882918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25860632 - 25860317
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||  ||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||     
T  25860632 gtgtgtttggtttgcaaaacggtaagcactggacagaacagtacaagatagaacagcacaacaaaaggcataacaacacaggacaaattttttatggcaa 25860533  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25860532 tgagtaattttttgttttatacgatttttggagaacaaaatgctatttcggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtggtttggt 25860433  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25860432 gagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 25860333  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||  ||||||||||    
T  25860332 tgtcaagtccttcatt 25860317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 38213227 - 38213543
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||| || |||| | ||||  | ||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  38213227 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattgtacagaacagtacaagacaaaacaacataacattaggcagaacagcacatgacaaattttttatggca 38213326  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38213327 atgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatggtattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttcg 38213426  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38213427 tgagtgacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagattgtcctatacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 38213526  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||| ||||||    
T  38213527 ctatcctgtctttcatt 38213543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39053053 - 39052734
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt-atg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||| ||||| ||     
T  39053053 agggtgtgtttggtttgcaaaatagtaaatgctgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagatagaacaacacatgacaaatttttttata 39052954  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39052953 gcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 39052854  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39052853 tggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgtccattgcctccagtttgtcctgtgcctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactagagtt 39052754  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| |||| |||| ||||||    
T  39052753 gttttgtcttgtctttcatt 39052734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33364994 - 33364674
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||| |||| || |||| |||||  ||||||   ||||||||| ||||||    
T  33364994 ttaagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtacaaaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagagagaacaacccaggacaaa-ttttta 33364896  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    || |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33364895 tgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgatgtgg 33364796  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  33364795 tttgctgaggggcaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaataaaacactggacaactgaag 33364696  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  33364695 ttgttctgtcttgtccttcatt 33364674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 84 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50386661 - 50386352
Alignment:
Q  84 tttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || || | ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |    
T  50386661 tttggtttgcaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaaaaaagaacagcacaatacaagggagaacagcacaggacaaa-tttttatcacattgaat 50386563  T
Q  184 acttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggg 283  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  50386562 aattttttgttttatacaatttttggggaacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgctgtggtttgttgaggc 50386463  T
Q  284 acaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcc 383  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50386462 acaaaaatatcaatttttgtcatgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactggagttgttctgtcc 50386363  T
Q  384 tgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||    
T  50386362 tgtccttcatt 50386352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 51925422 - 51925104
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || ||||  | | |||| || |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  51925422 aagggtgcgtttggtttgcaaaacggtaagtactggatataacagtacaagacataacagcacaacacaaggcagaacagcacatgacaaa-tttttatg 51925324  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51925323 gcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtattaaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 51925224  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51925223 tggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactggagtt 51925124  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  51925123 gttctgtcctatccttcatt 51925104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 160 - 394
Target Start/End: Original strand, 20255000 - 20255233
Alignment:
Q  160 gacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaa 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20255000 gacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgta-gtgggacaaga 20255098  T
Q  260 agttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20255099 agttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 20255198  T
Q  360 tggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20255199 tggacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 20255233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 78 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26282599 - 26282315
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  26282599 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacaagacagaacagcacatgacaaattttttatggca 26282500  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26282499 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttga 26282400  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctga---aacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |   || |||||||||||||||||||    
T  26282399 tgagagacaaaaatataagtttttgtcccgtctcttacctccagtttgtcttgtaccttaaataatagttttacaaatcaaacac 26282315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 387
Target Start/End: Original strand, 51296539 - 51296763
Alignment:
Q  163 aaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagt 262  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  51296539 aaaaattttatggtattgagtaattttttgttttatacgattttttggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacttaggacaaaaaat 51296638  T
Q  263 tgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51296639 tgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgg 51296738  T
Q  363 acaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  51296739 acaattagagttgttctgttctgtc 51296763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Original strand, 5442159 - 5442468
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||| | ||||  ||| |||||| ||||||    
T  5442159 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaatagcaagtactggacagaacagtacaatttagaacagtacaatacaaggtataacaacacatgacaaatttttta 5442258  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5442259 tggcattgaataattttttgttttatacgatttttgagggataaaatgctattttgatattttagacagcttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtga 5442358  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    ||||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5442359 tttggtgagggacaaaaa------------ctctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagctttacaaatcaaacactggacaactagag 5442446  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  5442447 ttgttctgtcatgtccttcatt 5442468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 77 - 382
Target Start/End: Original strand, 21373812 - 21374107
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||        ||||||||| ||||||||||    
T  21373812 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacaatacaagacagaacagcacaacacaagaca--------caggacaaa-tttttatggc 21373902  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || |||||  |||||||| |||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21373903 attgaataattttta-ttttatacgatttttggccgaagaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 21374001  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  21374002 gtgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactagacaactgaagttgt 21374101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 176 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 49749025 - 49748807
Alignment:
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749025 cattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgttattttggtatttaaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 49748926  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  49748925 ggtgagggacaaaaatatcagtttttgtcatgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactaaacaacttgagttg 49748826  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  49748825 ttctatcctatccttcatt 49748807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 394
Target Start/End: Original strand, 29645943 - 29646255
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattga 181  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |  ||| ||||||| |||| | ||||  |||||| |||| | ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  29645943 tgtttggtttgcaaaataacaagtattggacagaacaatacaagacaaaacaacacaacataaggtataacatcacaagacaaa-tttttatggcattaa 29646041  T
Q  182 gtactttt-ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
     || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29646042 ataatttttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttggtattttaaacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtga 29646141  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  29646142 gggacaaaaatatatgtttttgtcctatcccttgcctccagtttatcgtgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttg 29646241  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    || |||||||||||    
T  29646242 tcttgtccttcatt 29646255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3695449 - 3695203
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3695449 agaacagtacaacacaaggcagaacag-----gacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacaatttttgggggataaaatactatttt 3695355  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||               ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3695354 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaggttgtgatgtggtttgg---------------tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtc 3695270  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3695269 atgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcctgtccttcatt 3695203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22484954 - 22484639
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| |||||||||| |||  |||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |    
T  22484954 ggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacataacagtataagataggacaacacaacataaggtagaacagcacaagacaaa-tttttatggta 22484856  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || |||| ||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22484855 ttgaataattttctgtattatataatttttgggtgacgaaatgctatttttgtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttgg 22484756  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
      ||| ||||||||   || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  22484755 caaggaacaaaaattgtagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaatcactggacaattggagttgtt 22484656  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||    
T  22484655 ctgtcctgtccttcatt 22484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 167 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 54622919 - 54622693
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54622919 tttttatggcattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtg 54622820  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  54622819 ttgtggtttcgtgagcgacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatttagtttgt-cagtacctgaaacagttttacaaatcaaataccggacaa 54622721  T
Q  367 ctagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  54622720 ctgaagttgttttgtcatgtccttcatt 54622693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 136 - 394
Target Start/End: Original strand, 3964220 - 3964477
Alignment:
Q  136 acaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt 235  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||  ||||| || |||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3964220 acaatacaaggcagaacagcacaagacaaattttgtatgatattgaataattttatgttttatatgatttttg-gggacgaaatgctattttggtatttt 3964318  T
Q  236 agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacct 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| | |    
T  3964319 agacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtccagttccttgcctccaatttgtcatgtccat 3964418  T
Q  336 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3964419 gaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttctgtcctatccttcatt 3964477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 167 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3867772 - 3867545
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3867772 tttttatggtattgaataatttcttgttttatatgatttttgggggacaaaatgctattttggtgttttagaaaacttgtacgtaggacaaaaagttgtg 3867673  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
     |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3867672 ctgtggtttggtgagggacaaaaatttcaggttttgtcatgtctcttgtctccagtatgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaccggacaa 3867573  T
Q  367 ctagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  3867572 ctggagttgttctgtcttgtccttcatt 3867545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 210 - 394
Target Start/End: Original strand, 19906767 - 19906951
Alignment:
Q  210 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19906767 gggacgaaatgctattttggtgttttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtc 19906866  T
Q  310 tcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  19906867 ccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgttttatcctgtccttcatt 19906951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 394
Target Start/End: Original strand, 50678779 - 50678987
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    ||||||||||||||  |||| || || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50678779 ttttttgttttataggatttatgtggaatgaaatactattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagac 50678878  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  50678879 aaaaatatcagtttttgtcctgttctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagtttttcaaatcaaacactggacaacttgaattgttatgtcttg 50678978  T
Q  386 tccttcatt 394  Q
    | |||||||    
T  50678979 tacttcatt 50678987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 216 - 394
Target Start/End: Original strand, 24721496 - 24721674
Alignment:
Q  216 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgc 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||  || |    
T  24721496 aaatgctattttggtgttttagacaacttgtatgtgggataaaaagttgtgttgtggtttgttgaggtaccaaaattttagtttttgtcctgtcctttac 24721595  T
Q  316 ctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24721596 ctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 24721674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53046850 - 53046670
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  53046850 gtgtttggtttgcaaaacaacaagtactgaacagaacaatacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacagaacaaattttttatggcattg 53046751  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  53046750 agtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtg 53046670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 10747088 - 10747389
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||||| || |||| ||||||  |||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  10747088 aagggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtacagtataaaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaacagcacaagacaaa-tttttatg 10747186  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
     |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||                  ||||||    
T  10747187 acattgaataattttttgttttatacgatttttggggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacg------------------tgtggt 10747268  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |    
T  10747269 ttgctgacgaacaaaaatatcagtttttgtcctatctcttgtctccagtttgtcctgtacctaaaatagttttacaaatcaaacactgaacaactgaaat 10747368  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  10747369 tgttttgtcctgtccttcatt 10747389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45691026 - 45690804
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  45691026 aaatttttatagcattgaataattttt-gttttatacgatttttggaggacgaaatgcgattttggtattttagacaacttatgcgtgagacaaaaagtt 45690928  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    ||| ||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45690927 gtgctgtggt-----gagggagaaaaatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccaatttatcctgtacctgaaacagttttgcaaatcaaacactgga 45690833  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttca 392  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  45690832 caactgaagttgttctatcctgtccttca 45690804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41683079 - 41682949
Alignment:
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683079 gtgttgtggtttgctgagggacaaaagtatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 41682980  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  41682979 caactgaagttgttttgtcctgtccttcatt 41682949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 394
Target Start/End: Original strand, 52300439 - 52300628
Alignment:
Q  207 tgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcct 306  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  52300439 tgagggacgaaatgatattttggtgttttagacaacttgtac-tgggacaaaaaattgcgttgtggtttggtgatggacaaaaatttcagtttttgtcct 52300537  T
Q  307 gtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag---agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |    |||||||||||| |||||||||||    
T  52300538 gtcccttacctgcagtttgtcccgtctctgaaacagttttatgaatcaaacattggacaacaaccgaagttgttctgtcatgtccttcatt 52300628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 77 - 221
Target Start/End: Original strand, 43175441 - 43175585
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||     
T  43175441 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacaaaacagtacaagatagaacagtataatacaagacagaacagcacacgataaattttttatggt 43175540  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgc 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43175541 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgc 43175585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 394
Target Start/End: Original strand, 6179467 - 6179615
Alignment:
Q  247 acgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggg-acaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttt 345  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  6179467 acgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttggcgaggggacaaaaattacagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgacctgtttctgaaactgttt 6179566  T
Q  346 tacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6179567 tacaaatcaaacactggacaactggagttgttttatcctgtccttcatt 6179615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34351443 - 34351303
Alignment:
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| ||     
T  34351443 aaaatgttattttgatattttagacaacttgtatgtgcgacaaaaagttgtgttgtggtttgatgagggacaataatttttgtttttgtcgtgtctattt 34351344  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34351343 cctctagtttgtcatgtccctgaaacagttttacaaatcaa 34351303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39215547 - 39215404
Alignment:
Q  212 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||| ||||  |||||| | |||||||||| |||| |    
T  39215547 gacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaaattatgatttggttcggtaaggggtaaaaatttcagtttttgtcttgtccc 39215448  T
Q  312 ttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39215447 ttacctccggtttgtcctgttcttgaaacagttttacaaatcaa 39215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41695027 - 41694923
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41695027 aaatttttatgacattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttcagtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagtt 41694928  T
Q  264 gtgtt 268  Q
    |||||    
T  41694927 gtgtt 41694923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 394
Target Start/End: Original strand, 44000192 - 44000450
Alignment:
Q  135 tacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattt 234  Q
    |||| |||||| || |||| |||| |||||| |||| |||| ||||| || ||||| || |||||| |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||    
T  44000192 tacatcacaagacaaaacaatacaagacaaactttt-atggtattgaataatttttggtcttatacgatttttggtggacaaaaaactatttttgtattt 44000290  T
Q  235 tagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacc 334  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  |  ||||||||| ||||  ||||||  ||||| || | | ||    
T  44000291 cagataacttgtacgtgggacaaaaaattgtgatgtggtttagtgagggaaaaaaaattctgtttttgtcatgtcctttgccttgagtttatcatttccc 44000390  T
Q  335 tgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
      |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  44000391 aaaaacagttttacaaatgaaacacggtacaactagagttgtcatgtcatgtcattcatt 44000450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 319 - 394
Target Start/End: Original strand, 43175589 - 43175664
Alignment:
Q  319 cagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43175589 cagtttgtcctatacctgaaatagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgttctgtccttcatt 43175664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Original strand, 44267701 - 44267925
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  44267701 aaatttttatcgtattcaataattttttgttttatatgatttttggatgacgaaatgctatttttgtattttagacaatttgtatgtgggataaaaagtt 44267800  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
     ||||||||||||| ||||||||     || | |||||||| |||| ||| ||| ||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||  | |    
T  44267801 atgttgtggtttggcgagggaca-----attattttttgtcatgtcccttacctacagtttgtcatat-cctaaaactgttttacaaatcaaacatcgaa 44267894  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||  ||||||||  || |||||||||||    
T  44267895 caactgaagttgttcgatcatgtccttcatt 44267925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 309
Target Start/End: Original strand, 25954410 - 25954554
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  25954410 aaatttttatgatattgaataattttttattttatacgctttttg-gggacgaaatgttatattagtattttaaacaacttatatgtgagacaaaaagtt 25954508  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25954509 gtgctgtaatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcgtgtc 25954554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 394
Target Start/End: Original strand, 8253664 - 8253862
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||| ||||||| || || ||||| ||  |     
T  8253664 ttatacaatttttgatgaataaaatgttattttggtattttagacaacttttaattggggcaaagagttgtgtcgtggtttagt-agagacaagaacttc 8253762  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| || |||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  8253763 agtttttatcatgttccttgactccagtttgtcttgtccttgaaacaactttacaaatcgaacattatacaactagagttgtcttgtcttatccttcatt 8253862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 360
Target Start/End: Original strand, 26847349 - 26847482
Alignment:
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa-gttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgt 326  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||  | |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26847349 ggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaaagttttgttgtgattttataagggacatgaatttcagtttttgtcctgtctcttgcctccaatttgt 26847448  T
Q  327 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 360  Q
      | |  || |||||||||||||||| |||||||    
T  26847449 tatatcacttaaacagttttacaaattaaacact 26847482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 260
Target Start/End: Original strand, 32621828 - 32621924
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa 260  Q
    ||||| |||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32621828 aaattgttatgctattgaataattttttgttgtatacaatttttgatggacaacatattattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaa 32621924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53046668 - 53046605
Alignment:
Q  293 tgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53046668 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctgaaacagttttacaaatcaaa 53046605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 366
Target Start/End: Original strand, 32768589 - 32768755
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 301  Q
    ||||||| | ||||||| | |||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||    
T  32768589 atttttgggtgacaaaaggttattttagtattttagacaaatagtaattggaacggaaagttgtgatgtggtttagtgagggacaataatttcaattttt 32768688  T
Q  302 gtcctgtctcttgcctccagtttgtcctg--tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    ||| |||||||||| |   ||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32768689 gtcatgtctcttgctttttgtttgtcatgtctccctgaaacaattttacaaatcaaacactgtacaa 32768755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 350
Target Start/End: Original strand, 25395595 - 25395760
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||  || ||||||  ||||||||    
T  25395595 ttttttgttttatacgatttttagtgaacaaaatgttattttggtattttagacaacttatatttaggataaaaagttgcattttggtttaatgagggac 25395694  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg-cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaa 350  Q
    || ||| | |||||||||| | | ||||| || |||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  25395695 aagaatttcagtttttgtcttatgtcttgccccccaacttgtcatgtccctaaaacagttttacaa 25395760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28625041 - 28624828
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac-aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||   ||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||    
T  28625041 ttttatggtattgaataattttttgtcttataagatttttggtagactaaaatg--atttttgtattttagataacttatacgtaggacaaaaatttatg 28624944  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaa 366  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| ||||||||| || |||  |  ||||| |||||||||||||||| |  ||||    
T  28624943 ttgtgctttaatgagggacaaaaatttctg-ttttatcctatctcttgtctccagtttatcatgtcacataaacaattttacaaatcaaacattatacaa 28624845  T
Q  367 ctagagttgttctgtcct 384  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  28624844 cta-agttgttccgtcct 28624828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8648625 - 8648536
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctc 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| |||| || ||| |||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  8648625 tattttggtattttagacaatttgtacttgtgacaaaaagttgtgatgtagtttagttaggaacaagaatttcagtttttgtcatgtctc 8648536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17264773 - 17264606
Alignment:
Q  190 ttgttttatacaatttttgagg--gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 287  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |  |||||||| |||| ||| ||    
T  17264773 ttgtcttatacaatttttgtggtcgacaaaaa-ctatttttgtattttacacaacttgtacgtgggacaaaatttttttatgtggtttagtgaaggataa 17264675  T
Q  288 aaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 356  Q
     ||| | || ||||||| ||| |||||| ||| ||||||  |||   || |||||||||||||||||||    
T  17264674 taatttcagcttttgtcatgtatcttgcttcctgtttgttatgtttttgtaacagttttacaaatcaaa 17264606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8067136 - 8066954
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||  | || ||| |||| ||||| |||| | |  ||||||| ||||     
T  8067136 ggacaaaaagctattttgatattttatataacttgtacgtgtgacaaaaagttgtactatgattttgtgaaggacacaaatttta-attttgtcttgtca 8067038  T
Q  311 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||||| |  ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||  | | | |||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  8067037 cctgcctcaatcttgttttgtccctgaaacaattttacaaatcaaatgcggtataactagtgttgttatgtcttgtccctcatt 8066954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14155528 - 14155461
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  14155528 tattttgatattttagacaacttgtacttgagacaaaaagttgtgttatgatttagtgagggataaaa 14155461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 341
Target Start/End: Original strand, 36772016 - 36772154
Alignment:
Q  201 aatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttt 300  Q
    ||||||||  ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||| || | ||||  |||| | || |||    
T  36772016 aatttttggtggacaaaagtcaattttcgtattttagacaacttgtacttgttacaaaaggttgtgttgtagtttagttaaggac--aaattttagattt 36772113  T
Q  301 tgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaaca 341  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||    
T  36772114 tgtcttgtctcttgcctttagtttgtcatgtccttgaaaca 36772154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 280
Target Start/End: Original strand, 23322158 - 23322216
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23322158 tattttgatatattagacaacttgtacgagagataaaaagttgtgttgtggtttagtga 23322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Original strand, 30258928 - 30259061
Alignment:
Q  261 gttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact 360  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||| |||| | |||||||||| || |  ||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||| |    
T  30258928 gttgtattgtggtttagtggggtacacaaatttcagtttttgtcttgcccattgcctcgagtttatcctgtctttgaaacaattttacaaatcaaacatt 30259027  T
Q  361 ggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | | |||||| |||||   ||| |||||||||||    
T  30259028 gtataactagggttgtcgcgtcttgtccttcatt 30259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 291
Target Start/End: Original strand, 26106623 - 26106703
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaat 291  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||| | | ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26106623 ggacaaaaagttattttgctattttagaaaacttatactttgaacaaaagattgtgttgtggtttagtgaggaacaaaaat 26106703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 51813399 - 51813470
Alignment:
Q  212 gacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggga 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  51813399 gacaaaatgttattttggtattttatacaacttgtatttggaacaaaaag-tatattgtggtttagtgaggga 51813470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53046560 - 53046517
Alignment:
Q  293 tgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctg 336  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53046560 tgagtttttgtcctgtcccttacctccagtttgtcctatacctg 53046517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42547449 - 42547371
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaa 289  Q
    |||||||| | || ||| |||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  42547449 ggacaaaaagttaattttgtatatttgataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtagtttagtaagagacaaaa 42547371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53046607 - 53046562
Alignment:
Q  216 aaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  53046607 aaatgctattttggtattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtg 53046562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Original strand, 389459 - 389544
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |  | || ||||||||||| ||||||  || |||||||| || | ||||||||||||    
T  389459 ctattttggtattttagacaacttatatttaagccagaaagttgtgttttggtttcctgggggacaaatatttcagtttttgtcct 389544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 108
Target Start/End: Original strand, 20254945 - 20254978
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatact 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20254945 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtact 20254978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 275
Target Start/End: Original strand, 45871423 - 45871475
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  45871423 tattttcgtattttagacaa-ttgtatgcaggacaaaaagttgtgttgtggttt 45871475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 109
Target Start/End: Original strand, 40083189 - 40083225
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatacta 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40083189 ttaagggtgtgtttggcttgcaaaacagcaagtacta 40083225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Original strand, 7523037 - 7523360
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7523037 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacaggaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatttttt 7523136  T
Q  172 atggcattgagtactttt-ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7523137 atgacattgagtaatttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgt 7523236  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7523237 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 7523336  T
Q  371 agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||||||||||| |||||||||    
T  7523337 aattgttctgtcctatccttcatt 7523360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 35701147 - 35701465
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  35701147 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaataacacaggacaaattttttatgg 35701246  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35701247 caatgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttatgttgtggttt 35701346  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701347 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccagaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 35701446  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| || |||||||||||    
T  35701447 ttctatcttgtccttcatt 35701465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 2351552 - 2351868
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  2351552 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggataaattttttatggca 2351651  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2351652 ttgagtaattttttgttttgtacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 2351751  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2351752 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctataccttaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgtc 2351851  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||    
T  2351852 ctgtcctgtccttcatt 2351868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 32528585 - 32528903
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  32528585 agggtgtgtttgatttgcaaaatagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 32528684  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528685 cattgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 32528784  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32528785 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttg 32528884  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  32528885 tcctgtcatgtccttcatt 32528903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Original strand, 11963216 - 11963529
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11963216 gtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaagcagaataacacatgacaaattttttatggcattg 11963315  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11963316 agtaattttgtattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgcacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga 11963415  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11963416 gggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 11963515  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||    
T  11963516 tcctgtccttcatt 11963529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 77 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21739381 - 21739093
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||| ||||||||||    
T  21739381 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacaatataagatagaacagtacaacacaagacagaacag-----gacaaattttttatggc 21739287  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21739286 attgtgtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 21739187  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21739186 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 21739093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 115 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31770778 - 31770503
Alignment:
Q  115 aacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31770778 aacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatatgatttttgagggac 31770679  T
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31770678 aaaatgctattttggtatttcagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttg 31770579  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31770578 cctccagtttgtcttgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcatgtcctt 31770503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 77 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6284524 - 6284221
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||    
T  6284524 gggtgtgtttgatttacaaaacagcaagtactggacagaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagtacagcacaagacaaattttttatggc 6284425  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt-ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6284424 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttttggtattttggacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 6284325  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6284324 ggtgagggacaaaaaaataagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacctgaagcagttttacaaatcaaacactggacaactaaagtta 6284225  T
Q  376 ttct 379  Q
    ||||    
T  6284224 ttct 6284221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Original strand, 8136704 - 8137025
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttt 170  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||| || | || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||    
T  8136704 tattatgggtgtgtttggtttgtaaaacagtaagtactggacagaatagtacaagatagaacagtacaacacaaggcataacaacacaggacaatttttt 8136803  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8136804 tatggcattgagtaatgttttgttttatactattttttggggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtaggacaaaaagttgtgttgt 8136901  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8136902 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaaacaaacactggacaactag 8137001  T
Q  371 agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  8137002 agttgttctgtcctatccttcatt 8137025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24181798 - 24181532
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  24181798 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatctttgggggacaaaatgctatttt 24181699  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24181698 ggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttatgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttggctccagtttgtc 24181599  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24181598 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttttgtcatgtccttcatt 24181532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 41790693 - 41790371
Alignment:
Q  71 tattaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||    
T  41790693 tattgagggtgtgtttggtttacaaaacagtaagtactggacagaacagtataaaatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaatattt 41790594  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41790593 tatggcattgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttagtattttagacaatttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgt 41790494  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41790493 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtttattgcctccagtttgtcctgta-ctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaa 41790395  T
Q  371 agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | ||||||||||||||| ||||||    
T  41790394 aattgttctgtcctgtctttcatt 41790371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 29241300 - 29241566
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29241300 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 29241399  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  29241400 gatattttagccaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggacaaaaatatgagcttttggcctgtcccttgcctccaatttgtc 29241499  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29241500 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctggcctggccttcatt 29241566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 78 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4818364 - 4818085
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  4818364 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtgcaacacaaggcagaacaacacaagacaaattttttatggca 4818265  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4818264 ttgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 4818165  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4818164 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgttccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaac 4818085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 34794756 - 34795075
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||| ||    
T  34794756 aaggatgtttttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgataaattttttgtg 34794855  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34794856 gcattgaataattttttgttttatacgaattttggggaacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtt 34794955  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34794956 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatattggacaactagagtt 34795055  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  34795056 gttctgtcatgtccttcatt 34795075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 39918379 - 39918695
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||| |     
T  39918379 gggtgtgtttggtttgcaat-cagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggtagaacaacacaggacaaatattttatagt 39918477  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39918478 attgagtaattttatgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttg 39918577  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39918578 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 39918677  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
      ||||||||||||||||    
T  39918678 cttgtcctgtccttcatt 39918695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7208404 - 7208138
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7208404 agaacagtacaatacaagacggaacagcacgggacaaatattttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaggaacaaaatgctatttt 7208305  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  7208304 ggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttggttctgtctcttgcatccagtttgtc 7208205  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7208204 ccgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgttctgttctgtccttcatt 7208138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31880250 - 31879984
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31880250 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacatgacaaattttttatgacattgaataattttttgtattatacgattgttgggggacaaaatgctatttt 31880151  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31880150 ggtattttagacaacttgtacgtaggacaaatagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtc 31880051  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  31880050 ctgtacctgaaacagttttactaatcaaacactgaacaactagagttgttatatcttgtccttcatt 31879984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 123 - 390
Target Start/End: Original strand, 40489254 - 40489521
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40489254 aagattgaacagtacaacataaagcagaacaatgcatgacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgtt 40489353  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40489354 attttggtattttagacaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcccgtcccttgcctccagt 40489453  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40489454 ttgtcttctacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaattagagttattctgtcctgtcctt 40489521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 41459511 - 41459776
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41459511 agaacagtacaacacaaggtagaacagcacaggacaaaaatttaatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 41459610  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  41459611 gatattttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgctctggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt-tcttgtcccttgcctccagtttgtc 41459709  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41459710 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactaaacaactagagttgttctgtcatgtccttcatt 41459776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 128 - 390
Target Start/End: Original strand, 39788114 - 39788377
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaa-tgctattt 226  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  39788114 agaacagtacaacataatgcagaacagcacatgacaaattttttatggtattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaaatgttattt 39788213  T
Q  227 tggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgt 326  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  39788214 tagtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcctttgcctacagtttgt 39788313  T
Q  327 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39788314 cctgtacctgaaacagttttacaaatcaaatactggacaactagaattgttctgtcctgtcctt 39788377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22493643 - 22493327
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| || |  ||| |||| |  |||| |||| |  ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22493643 gggtgtgtttggttcgcaaaacaacaagtattggacagaacagtgcaagacagaataacacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatggc 22493544  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22493543 aatgagtaattttttgttttatacgatttttgcgg-acaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgtgacaaaaagttgtgctgtggtttg 22493445  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22493444 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcctttggctccagtttatcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgt 22493345  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22493344 tctgtcctgtccttcatt 22493327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 31644318 - 31644633
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||  | || |||| || |||| |||| || |||| |||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||     
T  31644318 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcatgtacagtgcagaacagtacaaga-agaatagcacaatacaaggtagaacaacacaagacaaa-tttttatga 31644415  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || |||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31644416 cattgaataattttatgttttatatgatttttaggggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 31644515  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31644516 ggtgagggacaaaaatatgagtatttgtcttg-ctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 31644614  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  31644615 ttctgtcccgtccttcatt 31644633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 3735230 - 3735545
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| || |||| |||| || |||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  3735230 ggtgcgtttggtttgcaaaacagcaggtactgtacagaacagtacaagaaagaatagcacaatacaagggagaacagcataggacaaa-tttttatgaca 3735328  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3735329 ttgaataattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgg 3735428  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3735429 tgatggacaaaaatatcagtttttgtcctgtccattgcctccattttgtcatgtacctgaaacggttttacaaatcaaacactggacaactggagttgtt 3735528  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  3735529 ctgtcatgttcttcatt 3735545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28090701 - 28090461
Alignment:
Q  121 ataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatg 220  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28090701 ataagatagaacagtacaactcacggcagaacagtacaggacaaattttttatattattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatg 28090602  T
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28090601 ttatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtagtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcca 28090502  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 361  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28090501 gtttgccttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 28090461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4689923 - 4689606
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||     
T  4689923 agggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtaatggacataacagtacaagacagaacaacacaacataaggcagaacaacacatgacaaa-tttttatga 4689825  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689824 cattgaataattttttgttttatacgacttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 4689725  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4689724 ggtgagggacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttg 4689625  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4689624 ttctgtcatgtccttcatt 4689606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7770497 - 7770187
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   || |||| ||||||  |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| ||||||     
T  7770497 gtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataatcgtacaagacagaacaacacaacacaagacagaatagcacaggacaaa-tttttatgacattgaa 7770399  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7770398 taattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtgaag 7770299  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7770298 gacaaaaatatgtgtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctatc 7770199  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||    
T  7770198 atgtccttcatt 7770187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23091478 - 23091212
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23091478 agaacagtacaacacaagatagaacaacacaagacaaatttcttatggcattgagtaatgttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttatttt 23091379  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  23091378 gatattttagacaatttatacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttgatgacggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttatc 23091279  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||| ||||||    
T  23091278 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaacttgagtagttatatcttgtcattcatt 23091212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 73 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 7726037 - 7725721
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||| || |||  ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  7726037 ttaagggtgtgtttgatttgcaaaacagtaagtactagacataacagtacaagacagtacatcacaacacaaggtagaatagtataggacaaa-ttttta 7725939  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7725938 tggaattgaataattttttgttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggatatttagacaacttatacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 7725839  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  7725838 tttaatgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacaattttactaatcaaacactggacaactgaag 7725739  T
Q  373 ttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  7725738 ttgttttgtcctgtcctt 7725721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 155 - 382
Target Start/End: Original strand, 553345 - 553573
Alignment:
Q  155 tacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgaggg-acaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtggg 253  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  553345 tacaggacaaatattttatggcattgaataattttatgttttatacgatttttggggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtggg 553444  T
Q  254 acaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  553445 acaaaaagttgtgttgtggtttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttataaatc 553544  T
Q  354 aaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  553545 aaacactagacaattaaagttgttctgtc 553573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 387
Target Start/End: Original strand, 24036105 - 24036411
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||  ||| |||||| |||| |   ||    
T  24036105 ggtgtgtttggtttgcaaaacaataagtactgtactgaacagtacaagacagaacagcacaacataagacagaacaacacatgacaaatttttga---ca 24036201  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24036202 ttgaataattttttgttttatacgatttttggggtgcaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttgg 24036301  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24036302 tgagggacaaaaatatgagattttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctgtacctgaaacagttttccaaatcaaacactggacaacttgaattgtt 24036401  T
Q  378 ctgtcctgtc 387  Q
     |||||||||    
T  24036402 ttgtcctgtc 24036411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 138 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5571806 - 5571608
Alignment:
Q  138 aacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttag 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5571806 aacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaa--tgctattttggtattttag 5571709  T
Q  238 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctga 337  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5571708 acaacttgtacgttggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgaatttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctga 5571609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 298
Target Start/End: Original strand, 40182335 - 40182556
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  40182335 gggtgtgtttggtttccaaaacagcaagtactggacagaacaatacaagaaagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacatgacaaattttttatggc 40182434  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40182435 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 40182534  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtt 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  40182535 gtgagggacaaaaatataagtt 40182556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 700805 - 700513
Alignment:
Q  98 cagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgtttta 197  Q
    |||||||||||  ||| |||| || |||| | || | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  700805 cagcaaatactggacataacagtacaagacaaaataatacaacacaaggtagaacagcacatgacaaaatttttatggcaatgagtaattttttgtttta 700706  T
Q  198 tacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 297  Q
    ||  ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  700705 tatgattttcgggggacaaaataatattttggtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgaggaacaaaaatatgaat 700606  T
Q  298 ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    ||||||  |||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  700605 ttttgttttgtcccttgtctcttgtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaatcattgaacaactagagttgttttgtcatgtcctt 700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18470652 - 18470336
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||| || || ||||  |||  ||| |||||   ||||||| |||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||||||||     
T  18470652 gggtgcgtttggtttgcaaaatagtaagtactggacagcacagtataatgcagaacagcacaatacaagacataacagcacagaacaaa-tttttatggt 18470554  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||| ||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18470553 attgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacgaaatgttattttggtgttttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgctgtggtttg 18470454  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18470453 gtaagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgccttcagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactggagttgt 18470354  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  18470353 tctgtcttgtccttcatt 18470336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 138 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32093144 - 32092890
Alignment:
Q  138 aacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttag 237  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32093144 aacacaaggcagaacagcacaacacaaa-tttttatggtattgaaaatttttatgttttatataatttttgggggacgaaatgctattttggtattttag 32093046  T
Q  238 acaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctga 337  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  32093045 ataatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggtga-ggacaaaaatttcagtttttgtcctatcctttgcctccaatttgtcctgttcctga 32092947  T
Q  338 aacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  32092946 aacaattttacaaatcaaacactgcacaactggagttgttctgtcttgtccttcatt 32092890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 338
Target Start/End: Original strand, 5673018 - 5673271
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||  ||| |||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||  |||||||||| |    
T  5673018 tgtgtttggtttacaaaacagtaagtacttgacagaacagtacaagatataacagcacaacacaaggcataacatcaaaggacaaatattttatggcaat 5673117  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5673118 gagtaattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttgatattttagac-----gtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 5673212  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaa 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  5673213 agggacaaaaatatgagtttttgacttgtcccttgcctccagtttatcgtgtacctgaa 5673271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22432425 - 22432243
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22432425 tttttttttttatacgatttttgggggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacttgagacaaaaaattgtgttgtggtttgatgagggac 22432326  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22432325 aaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttatcctgaacctgaaacagttttacaaatcaaacataggacaact 22432243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 164 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8561119 - 8560893
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8561119 aaatttttatggcattgattaattttttgttttatacgatttttg-gggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacctggaacaaaaagtt 8561021  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8561020 gtgatgtggtttggtgaggaacaaaaatatcagtttttgtcttgtcctttgctttcagtttgtcctgtatctgaaacagttttacaaatcaaacactgaa 8560921  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttc 391  Q
     ||||  ||||||| ||||  |||||||    
T  8560920 taactgaagttgttatgtcacgtccttc 8560893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 195 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27839180 - 27838982
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  27839180 ttatacgatttttggaggacaaaaggctattttggtattttagacaacttgtacatgagacaaaaagttgttttatggtttggtgagggacaaaaattta 27839081  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     |||||  |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27839080 tgtttta-tcctgtccattgccttcagtttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcatgtccttcatt 27838982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37148797 - 37148497
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  37148797 ggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacaaaacagtataatacagaacagcacaacacaaggtataacagcacaggacaaa-tttttatggta 37148699  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||| || |||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||               |||||||  |||||||||    
T  37148698 ttgaataatttcttattttatattctttttgggggacgaaatgctattttggtgttttagacaactt---------------agttgtgccgtggtttgg 37148614  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  37148613 tgaggaacaaaaatttcagtttttgtcccgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacaattgacaactggagttgtt 37148514  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| | |||||||||    
T  37148513 ctgtcatatccttcatt 37148497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 210 - 394
Target Start/End: Original strand, 5598484 - 5598668
Alignment:
Q  210 gggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  5598484 gggacgaaatgttattttgatattttagacaagttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgttgtttgatgaaggacaaaaatatctgtttttgtcctctc 5598583  T
Q  310 tcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  5598584 ccttgcctccagtttgtctcgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattggacaacttgagttgttctgttctgtgcttcatt 5598668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 211 - 394
Target Start/End: Original strand, 17031162 - 17031345
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||| ||||||| |  ||||||||||||||     
T  17031162 ggacaaaaagctatttttgtattttaaataacttgtacgtgggacgaaaagttgtgctgtgatttaatgaggggcaaaaatttatgtttttgtcctgtcc 17031261  T
Q  311 cttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||  |||| |||||||||||    
T  17031262 tttgcctccaatttgtactgtccctgaaacagttttacaaatcaaacattatacaagtggagttgtgttgtcttgtccttcatt 17031345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11145787 - 11145712
Alignment:
Q  1 gcatacaatggaagtgactgtataatgttatttttgagcttgattgtgttcgtattactgttttaaatagtattaa 76  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11145787 gcatacaatggaagtgagtgtataatgttatttttgagcttgattgtgttcgtgttactgttttaaatagtattaa 11145712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 394
Target Start/End: Original strand, 4664923 - 4665019
Alignment:
Q  298 ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4664923 ttttgtcatgtcccttgcctcctgtttgtcctgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggataactggagttgttctgtcatgtccttcatt 4665019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11090974 - 11090811
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    |||||||| |||| | ||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||| |     
T  11090974 ttatacaaatttttatggacaaaaaact-ttttgatattttagacaacgtgtacgtgagacaaaaagttgtgtcgtggcttagtgagggtcaagaatttc 11090876  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    |||||| ||||  |||||  |||| |||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  11090875 agttttcgtccaatctctgacctctagtttgtcatgttccaaaaacaattttacaaattaaacac 11090811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Original strand, 20119642 - 20119730
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |  ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20119642 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacagaacagtacaagatagaacagcacaacacaaggcagaacagtacatgacaaa 20119730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 153
Target Start/End: Original strand, 548218 - 548295
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  548218 agggtgtgtttggtttgcaaaacattaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaaca 548295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6311794 - 6311658
Alignment:
Q  167 tttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtg 266  Q
    ||||||||| |||||  | | |||||| ||||| | ||||||  |||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  6311794 tttttatggtattgaacattattttgtcttataaattttttggtggacaagaggttattttggtaatttagacaatttgtatttgggactaaaagttgtg 6311695  T
Q  267 ttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtc 304  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  6311694 ttgtggtat-gtgaggaacaaaaattttagtttttgtc 6311658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Original strand, 35955046 - 35955150
Alignment:
Q  253 gacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaat 352  Q
    |||||||| |||| |||| |||| ||| || |||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  35955046 gacaaaaatttgttttgtagtttagtgcggaacaagaatttcagtttttgtcttgtctcatgcctccagtttgtcatgtctttgaaacaattttacaaat 35955145  T
Q  353 caaac 357  Q
    |||||    
T  35955146 caaac 35955150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 327
Target Start/End: Original strand, 24206386 - 24206492
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  ||||| | || ||| |  | ||||||| ||||||||||||| |    
T  24206386 ctattttagtattttagataacttgtacgagaaacaaaaagttatgttgtggtttaatgaggaagaagaatttatggttttgtcttgtctcttgcctcta 24206485  T
Q  321 gtttgtc 327  Q
    |||||||    
T  24206486 gtttgtc 24206492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29788572 - 29788489
Alignment:
Q  188 ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29788572 ttttgtcttatacaatttttggttgatcaaatgttattttaatattttagacaacttgaacgtggg-caaaaagttgtgttgtgg 29788489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5571609 - 5571565
Alignment:
Q  350 aatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  5571609 aatcaaacactggacaactagagttgttttgttttgtccttcatt 5571565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Original strand, 1338601 - 1338661
Alignment:
Q  187 tttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgta 247  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1338601 tttttgttatatacgatatttgatggacaaaaaattattttgatattttagacaacttgta 1338661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 2614766 - 2615084
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2614766 agggtgtgtttggtttgcaaaacaacaagtactggacaaaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacaaattttttatgg 2614865  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2614866 cattgagtaattttttattttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt 2614965  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2614966 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacaattttacaaatcaaacagtggacaactagagttg 2615065  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  2615066 ttctgtcttgtccttcatt 2615084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 24203236 - 24203550
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24203236 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacatgatagaacagtacaacacaaggcaaaacagcacaggacaaattttttatggcat 24203335  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24203336 tgagtaattttttgttttatacaatttt-gagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttggt 24203434  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203435 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactatagttgttc 24203534  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| |||||||||||    
T  24203535 tgtcatgtccttcatt 24203550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 3259548 - 3259871
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcaga-----acagtacaggacaaaatttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||     |||  ||| |||||| ||||    
T  3259548 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaggattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacatgacatgacaaattttt 3259647  T
Q  171 tatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgt 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3259648 tatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgttgt 3259747  T
Q  271 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259748 ggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 3259847  T
Q  371 agttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||| |||||||||||    
T  3259848 agttgttttgtcatgtccttcatt 3259871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Original strand, 17867712 - 17868023
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17867712 gtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgag 17867811  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17867812 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagg 17867911  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17867912 gacaaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtc 17868011  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||    
T  17868012 ctgtccttcatt 17868023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 83 - 394
Target Start/End: Original strand, 17877495 - 17877806
Alignment:
Q  83 gtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgag 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17877495 gtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaacatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcattgag 17877594  T
Q  183 tacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagg 282  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17877595 taattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttgatgagg 17877694  T
Q  283 gacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtc 382  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17877695 gacaaaaatatgagtttttatcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacagctagagttgttctgtc 17877794  T
Q  383 ctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||    
T  17877795 ctgtccttcatt 17877806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 77 - 382
Target Start/End: Original strand, 24242535 - 24242840
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  24242535 gggtatgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagataaaagagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatgac 24242634  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24242635 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 24242734  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24242735 gtgagggacaaaaatatgagtttttgttgtgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 24242834  T
Q  377 tctgtc 382  Q
    ||||||    
T  24242835 tctgtc 24242840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 74 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15277198 - 15276878
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttat 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  15277198 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgacaaaaattttat 15277099  T
Q  174 ggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15277098 ggcattgagtaattttttgttttataagatttttgagggacaaaatgctattttgttcttttagacaacttgtacgtgggaaaaaaagttgtgatgtggt 15276999  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15276998 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacattagacaactagagt 15276899  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15276898 tgttctgtcatgtccttcatt 15276878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32410110 - 32409793
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |    
T  32410110 gggtgtctttgatttgcaaaacagtaaatactagacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgac 32410011  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32410010 attgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatactattttggtattttagacaacttgtgagtgggacaaaaagttgtgatgtggtttg 32409911  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32409910 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgtctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttat 32409811  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||| |||||||||||    
T  32409810 tctgtcatgtccttcatt 32409793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3933064 - 3932748
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3933064 ggtgtgtttggtttgcaaaataacaagtattggataaaacagtataagatagaacagtacaacacaagacaaaacagcacaggacaaattttttatggca 3932965  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3932964 ttgaataattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgg 3932865  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3932864 tgagagacaaaaatatgagtttttgtcctgccccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagaattgtt 3932765  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||    
T  3932764 ctgtcctgtccttcatt 3932748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 11212131 - 11212445
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  11212131 tgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaatgttttatggcctt 11212230  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11212231 gagtaattttttgttttattcgatttttgagggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgcacgtgagacaaaaggttatgttgtggtttggtg 11212330  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212331 agggacaaaagtatgagtttttgtcatgtcccttatctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 11212430  T
Q  380 gtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| ||||||||||    
T  11212431 gtcccgtccttcatt 11212445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 123 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32132592 - 32132342
Alignment:
Q  123 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgct 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32132592 aagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaatttgttgttttatacgatttttgggggacaaaatgct 32132493  T
Q  223 attttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagt 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32132492 attttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggattggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagt 32132393  T
Q  323 ttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32132392 ttgtcctgtacctaaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 32132342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 88 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10324358 - 10324052
Alignment:
Q  88 gtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtactt 187  Q
    ||||||||||||| || |||   ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  10324358 gtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaagatagaacattacaacacaaggtagaacagcacagaacaaattttttatgggattgagtaatt 10324259  T
Q  188 ttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 287  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10324258 ttttgttttatacgattttttggggacaaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaa 10324159  T
Q  288 aaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10324158 aaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactgaacaactagagttgttctgttctgtc 10324059  T
Q  388 cttcatt 394  Q
    |||||||    
T  10324058 cttcatt 10324052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 167130 - 166864
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  167130 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgacattgagtaattttttgttttatatgatttttaagggacgaaatgctatttt 167031  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  167030 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgttatgtcccttgcctctagtttgtc 166931  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  166930 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaagtagagttgttctgtcatatccttcatt 166864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 10959872 - 10960188
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||| || |||| ||||||  ||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  10959872 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggatagaacagtacaagacagaacatcacagcacaaggcagaacaacacatgacaaa-tttttatggc 10959970  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| |  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10959971 attgaatgatattttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctatttttgtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 10960070  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10960071 ttgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgccttcagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 10960170  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| |||||||||    
T  10960171 tctgtcctatccttcatt 10960188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 156 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11613970 - 11613732
Alignment:
Q  156 acaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggac 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11613970 acaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttatacaacttgtacgtgggac 11613871  T
Q  256 aaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11613870 aaaaagttgtgctgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgttccttgtctccattttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaa 11613771  T
Q  356 acactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11613770 acactggacaactaaagttgttctgtcctgtccttcatt 11613732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Original strand, 34176752 - 34177018
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34176752 agaacagtacaacataagacagaacagcacaggacaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctatttt 34176851  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34176852 ggtattttagactacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagagacaaaaatatgagtttttgtcatgtcacttgcctccagtttgtc 34176951  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34176952 atgtacctgaaacagttttacaaatcaaacaagtgacaactagagttgttctgtcttgtccttcatt 34177018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 93 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15277522 - 15277221
Alignment:
Q  93 caaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttg 192  Q
    |||||||| || ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||    
T  15277522 caaaacagtaagtactggacagaacagtataagatagaacagtacaacacaaggtaaaacaacacagaacaaattttttatagcattgagtaatttgttg 15277423  T
Q  193 ttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaata 292  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15277422 ttttatacgatttttggaagacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggataaaaagttgtgatgtggtttggtgagggacaaaaata 15277323  T
Q  293 tgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttca 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15277322 tgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtaccttaaacaattttacaaatcaaacactggacaaatagagttgttttgtcttgtctttca 15277223  T
Q  393 tt 394  Q
    ||    
T  15277222 tt 15277221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 10485030 - 10485345
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||  |||| |||| || |||| ||||||| |||| |||||| | ||||  |||||||||| | |||||| |    
T  10485030 gggtgcgtttggtttgtaaaacagcaagtacagtacagaacagtacaagaaagaacagcacaatacaaggga-aacaacacaggacaaa-tatttatgac 10485127  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10485128 attgaataattttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 10485227  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10485228 ctgagggacaaaaatatcagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaataattttacaaatcaaacactggacaactggagttgt 10485327  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||| |||||||||||    
T  10485328 tttgtcttgtccttcatt 10485345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 384
Target Start/End: Original strand, 17443135 - 17443440
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  17443135 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatattggacagaacagtacaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatgaca 17443233  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17443234 ttgaataattttatgttttatacgatttttggaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttgg 17443333  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17443334 tgagggataaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcatctagtttgtcctgtacctgaaatggttttacaaatcaaacactggacaactaaagttgtc 17443433  T
Q  378 ctgtcct 384  Q
    |||||||    
T  17443434 ctgtcct 17443440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 168 - 394
Target Start/End: Original strand, 11279090 - 11279316
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11279090 ttttatggccttgagtaattttttgttttattcgatttttgagggataaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgt 11279189  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279190 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccatgcctccagtttgtcctgtacttgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 11279289  T
Q  368 tagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11279290 tggagttgttctgtcccgtctttcatt 11279316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 186 - 394
Target Start/End: Original strand, 11382044 - 11382250
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11382044 ttttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag--ac 11382141  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11382142 aaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaattaaacactggacaactagagttgttctgtcatg 11382241  T
Q  386 tccttcatt 394  Q
    |||||||||    
T  11382242 tccttcatt 11382250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14925713 - 14925397
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||   ||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  14925713 gggtgtgtttggtttgcaaagaagtaagtacgggacataacagtaaaagatagaacaacacaacacaaggcataacagcacaggacaaa-tttgtatgac 14925615  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  14925614 attgaataattttatgttttatacgatttttaggggacggaatgctattttggtattttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtttg 14925515  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14925514 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttacatctagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 14925415  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
      ||||||||||||||||    
T  14925414 catgtcctgtccttcatt 14925397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31870357 - 31870038
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||| || |||| ||||||  |||| | |||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  31870357 gggtgcgtttggtttgcaaaacatcaagtattgtacataacagtacaagaaagaacaacacaatataagggagaacaacacatgacaaa-tttttatggc 31870259  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31870258 attgaataattttttgttttatacgagttttgggggacgaaatgctatttttgtattttagacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 31870159  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcc---tgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31870158 gtgagggacaaaaatatcagtttttgttttgtcccttgcctctagtttgttctgttgttcctgagacagttttacaaatcaaacactggacaactggagt 31870059  T
Q  374 tgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  31870058 tgttatgtccagtccttcatt 31870038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 394
Target Start/End: Original strand, 18057396 - 18057707
Alignment:
Q  82 tgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattga 181  Q
    ||||||||||||||||||| || || |  | | |||| || |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  18057396 tgtttggtttgcaaaacagtaagtattggatagaacagtaaaagatagaacagcacaacacaaggcataatagcacaggacaaa-tttgtatgacattga 18057494  T
Q  182 gtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgag 281  Q
     || |||| |||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18057495 ataattttatgttttatacgatttttagaggacgaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtgag 18057594  T
Q  282 ggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || |    
T  18057595 ggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttacatctagtttgtcatgtatctcaaacagttttacaaatcaaacattggacaattgaagttgtcctat 18057694  T
Q  382 cctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||    
T  18057695 cctgtccttcatt 18057707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 81 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4494352 - 4494079
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  4494352 gtgtttggtttgcaaaacagtaagtactagacagaacagtacaggatagaacagcacaacataaggcagaacaacacaggacaaattttttatggcaatg 4494253  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||| |||||||                 ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4494252 agtaattttttg-----------------gggacaaaatgttatttcggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtactgtggtttggtga 4494170  T
Q  281 gggacaaaaatatgagt-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactag 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4494169 gggacaaaaatatgagttttttgtcctgtcacttgcctccagtttgtcctgtacctgaaagagtcttacaaatcaaacactggacaactag 4494079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 3379583 - 3379898
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||    ||| ||||||| |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| | |    
T  3379583 gggtttgtttggtttgcaaaaccgcaagtatcggacagaacaatacaagacagaataacacaacacaatgcagaacagtacatgtcaaa--ttttaag-c 3379679  T
Q  177 attgagtactttt-ttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    |||||  | |||| ||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3379680 attgaacaatttttttgttttatatgatttttggaggacgaaatgctattttggtatttaagacaacttgtatgtgagacaaaaagttgtgctatggttt 3379779  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3379780 ggtgagcgacaaaaatatcagtttttgtcttgtctcttgcctccagtttgtcctgtatctgaaacagttttataaatcaaacactggacaactaaagttg 3379879  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| || |||||||||||    
T  3379880 ttctatcatgtccttcatt 3379898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34684246 - 34683938
Alignment:
Q  74 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatt-ttta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| || |||| || |||  |||||| |||||| ||||  |||||| ||||   ||||    
T  34684246 taagggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtattggacaaaacagtacaagacaggacaacacaacataaggcataacaacacaggataaaaaagttta 34684147  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtatttt-agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    || || |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34684146 tgacaatgagtaattttttgttttatacgatttttggaggacaaaatgctattttggtatttttagacaacttgtacgtggaacaaaaagttgtgttgtg 34684047  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 371  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34684046 gtttggtgagggacaaaa--atgagtttttgtcgtgtcccttgcctccagtttgtcatgtacc--------ttttacaaatcaaaaactggacaactaga 34683957  T
Q  372 gttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |||| |||| ||| |||||    
T  34683956 gttggtctgacctatcctt 34683938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 76 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8178141 - 8177858
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||  | | ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| || |||| || |    
T  8178141 agggtgtgtttggtttgcaaaacatgaagcactggatagaacaatacaagatagaatagcacaacacaagacagaacagtacatgac-aagttttaatag 8178043  T
Q  176 cattga--gtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 273  Q
    ||||||   |  ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8178042 cattgaacatttttttttgttttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgaacgtgggacaaaaagttgtgttgtggt 8177943  T
Q  274 ttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8177942 ttggtaagggacaaaaatatca-tttttatcctgtcccttgcctccagtttgttttgtacctgaaacagttttataaatcaaacac 8177858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Original strand, 23636097 - 23636411
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  23636097 gtgtgtttggtttgcaaaacagtaaatactggatataacagtacaagacagaacaacacaacagaaggcagaactgtacatgacagt-tttttatggcat 23636195  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  23636196 tgaataattttttgttttatacaattttggggggacgaaatgctattttggatttttaaataacttgtacgtgagacaaaaatttgtgttgtggtttaat 23636295  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23636296 gaataacaaaaatatgagtttttatcctattccttgcatccagtttatcatgtacctaaaacaattttacaaatcaaacactgaacaactgaagttgttc 23636395  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||| | |||||||||    
T  23636396 tgtcatatccttcatt 23636411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 169 - 394
Target Start/End: Original strand, 3290635 - 3290847
Alignment:
Q  169 tttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgtt 268  Q
    |||||| |||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  3290635 tttatgacattgaataattgtttgttttatatgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttatacgtggga--aaaagttgtgtt 3290732  T
Q  269 gtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3290733 gtggtttggtaagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccagtt-----------tgacacagttatacaaatcaaacactgaacaact 3290821  T
Q  369 agagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3290822 agagttgttctgtcatgtccttcatt 3290847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11675619 - 11675322
Alignment:
Q  90 ttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtactttt 189  Q
    ||||||||||| || || |  ||| ||||||| |||| ||||||  |||||| |||| | || || ||| |||||| ||| ||| ||||||| || ||||    
T  11675619 ttgcaaaacagtaagtattggacataacaatacaagacagaacaacacaacaaaaggtaaaatagcacatgacaaa-tttctatagcattgaataatttt 11675521  T
Q  190 tt-gttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaa 288  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11675520 tttgttttatacgatttttgggggacgagatgccatttaggtattttacaaagcttgtacgtgggataaaaagttgtgttatggtttggtgagagacaaa 11675421  T
Q  289 aatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||    
T  11675420 aatatcagtttttgtcctgtcctttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactggaattgttttgtcttgtc 11675322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9902806 - 9902599
Alignment:
Q  187 tttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggaca 286  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  9902806 tttttggtttatatgatttttgggggacgaaatgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttaatgagggaca 9902707  T
Q  287 aaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgt 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||| |    
T  9902706 aaaatatcagtttttgtcctgtcccttacctctagtttgtcctatacctgaaacagttcaacaaattaaacactgaacaactgaagttgttctatcctat 9902607  T
Q  387 ccttcatt 394  Q
    ||||||||    
T  9902606 ccttcatt 9902599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18597329 - 18597099
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18597329 aaatttttatggtattgaataattttttgttttatatgatttttgagggacgaagtactattttagcgttttagacaacttatacgtgggacaaaaagtt 18597230  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18597229 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagattttgtcatgtcccttgcctccggtttgtcatatccctgaaacagttttacaaatcaaacactgaa 18597130  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||  | ||||||  ||| ||||||||||    
T  18597129 caactgaaattgttcaatcccgtccttcatt 18597099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14808254 - 14807959
Alignment:
Q  80 tgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| || |||| ||||||  |||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||    
T  14808254 tgtgtttggtttgcaaaacaacaaatattgtacagaacagtacaagaaagaacaacacaatacaagggagaatagcacaggacaaa-tttttatggaatt 14808156  T
Q  180 gagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 279  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808155 gaataatttttagttttatacgatttttgggggatgaaatgttattttggtactt-agacaacctatacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtg 14808057  T
Q  280 agggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttct 379  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||| |||||                  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14808056 agggacaaaaatatcaatttttatcctatcccttgcctctagttt-----------------attttacaaatcaaacactggacaactggagttgttct 14807974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 32859922 - 32860239
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| || || |  ||| |||| || ||||||| |||  |||| | |||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  32859922 agggtgtgtttgatttgtagaacagtaagtattggacataacagtacaagataggacaacacaatataaggcagaacagcacaatacaaa-tttttatgg 32860020  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
     ||||| || |||| ||| ||||   ||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  32860021 tattgaataattttctgtattatttgatttttgggtgacgaaatgttatttttgtattttagaaaacttgtacgtgagacaaaaggttgtgctgtggttt 32860120  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    || || ||||||||||   || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32860121 ggcgatggacaaaaattgcagcttttgtcatgtcccttgcctccagtttgtcatgtccctgaaactgttttacaaatcaaacactggacaattggagttg 32860220  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    || |||| |||||||||||    
T  32860221 ttttgtcatgtccttcatt 32860239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 394
Target Start/End: Original strand, 29054239 - 29054544
Alignment:
Q  86 tggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtac 185  Q
    |||||||||||| |  || ||||  ||| |||| || ||||||| |||  |||||| ||| |||||||| ||| || |||  |||||||| ||||| ||     
T  29054239 tggtttgcaaaataataagtactggacataacagtacaagataggacaacacaacataagacagaacagcacaagataaa--ttttatggtattgaataa 29054336  T
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggac 285  Q
    |||| ||| |||||  ||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29054337 ttttctgtattatatgatttttgggtgacgaaatgttattttg-tattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgctgtggtttggcgagggac 29054435  T
Q  286 aaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctg 385  Q
    ||||||   |||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | || |||||| |||    
T  29054436 aaaaattgtagtttttgtcatgtcccttgcttccaatttgtcctgttcctgaaactgttttacaaatcaaacattggacagctttaattattctgttctg 29054535  T
Q  386 tccttcatt 394  Q
    |||||||||    
T  29054536 tccttcatt 29054544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 29814736 - 29814887
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  29814736 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttatggc 29814835  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttg 228  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29814836 attgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 29814887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 28502330 - 28502482
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta-tgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| |||    
T  28502330 gggtgtgtttggtttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacaacacaggacaatttttttattgg 28502429  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttg 228  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28502430 cattgagtaatgttttgttttatacgatttttgggggacaaaatgttattttg 28502482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7396294 - 7396067
Alignment:
Q  164 aaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagtt 263  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||  || | |||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7396294 aaatttttatggtattgaataatttt--gtctcataccatttttgatggacaaaacactatttttgtattttagataacttgtacgtgagacaaaaagtt 7396197  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgga 363  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | | |  ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||   |    
T  7396196 gtgtagtggtttagtgagggacaagatt-tctgtttttgtcctgtccattgcttccagcttgtcatgtcccagaaacagctttacaaatcaaacaccata 7396098  T
Q  364 caactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||  | ||||| |||| |||||||||||    
T  7396097 caactgaaattgttttgtcatgtccttcatt 7396067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35004295 - 35004087
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    |||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||| |  |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35004295 ttttatgatattgaatagtttttggtattatacaattttttattgacaaaaatctattttgatattttagaaaacttgtacgtgggacaaagagttgtgt 35004196  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 367  Q
    |||||||   |||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |   |||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  35004195 tgtggttatatgagagacaaaaaatttagtttttgtcttgtctcttgtctccggtttatcttgtcctataaaccgttttacaaatcaaacaccgcacaac 35004096  T
Q  368 tagagttgt 376  Q
    | |||||||    
T  35004095 tggagttgt 35004087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 222 - 368
Target Start/End: Original strand, 9613990 - 9614136
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccag 321  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||  | |  ||||||| |||| |||||||||||    
T  9613990 tattttagtattttagacaacttatacgtggaacaaaaaattgtgttgcggtttagtgagtaacaaaaacttcaaattttgtcatgtcccttgcctccag 9614089  T
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9614090 tttatcctgtccttgaaacagttttacaaatcaaacattgtacaact 9614136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 176
Target Start/End: Original strand, 32805348 - 32805448
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  32805348 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcacatgacaaattttttatgg 32805447  T
Q  176 c 176  Q
    |    
T  32805448 c 32805448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9200491 - 9200332
Alignment:
Q  232 ttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctctt-gcctccagtttgtcctg 330  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  9200491 ttttaaacaatttgtatgtgggacaaaaagttgttatatggtttggtgagggagaagaatttttgtttttgtcttgtctcttagcctctagtttgtcatg 9200392  T
Q  331 tacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtcctt 390  Q
    |   | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||| |||||||    
T  9200391 tctttaaaacagttttacaaatcaaacattgtacaacttgagttgtcatgtcttgtcctt 9200332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27824817 - 27824620
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    |||||||| ||||| || |||||  | |||||  |||||||  |||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||     
T  27824817 ttttatggtattgaataatttttgatcttatatgatttttgttggacaaaaagctatttttgtattttggataactcgtacgtgggacaaaaagttgtga 27824718  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaac 367  Q
    |||||| |  ||||||||   ||| |   || || || | || |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27824717 tgtggtataatgagggac---aattttttttcttctcttatcccttgcctctagtttgtcctttcccaaaaacagttttacaaatcaaacactgtacaac 27824621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 11381964 - 11382040
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11381964 gggtgtgtttggtttgcaaaatagtaagtactgaacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaaca 11382040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28967414 - 28967277
Alignment:
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||  ||||   ||||  |  |  |||||||||| ||||| ||    
T  28967414 aaaatgctattttgataatttagacaacttgtacttgaaataaaaagttgggttgtggttcagtgaaaaacaatcacttttgtttttgtcccgtctcgtg 28967315  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaat 352  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  28967314 cctccagtttgtcatgttcttggaacagttttacaaat 28967277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Original strand, 27756314 - 27756370
Alignment:
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27756314 aaaatgttattttgatattttagacaacttatacgggggacaaaaagttgtgttgtg 27756370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 394
Target Start/End: Original strand, 33041403 - 33041454
Alignment:
Q  343 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  33041403 ttttacaaatcaaacactggacaactggagttgttctgtcctattcttcatt 33041454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5650841 - 5650684
Alignment:
Q  198 tacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagt 297  Q
    |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||   ||| || || ||| ||| ||| |||||| | || ||| |||||| |||||||| | |||    
T  5650841 tacaatttgtggtggacaaaaagctactttggtattttgcgcaatttatatgtgagaccaaatgttgtgctatgatttagtgaggaacaaaaatttcagt 5650742  T
Q  298 ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaa 356  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  5650741 ttttgtcgtatctattgccttcagtttgtcttgt-cctgaaatagttctacaaatcaaa 5650684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16542440 - 16542286
Alignment:
Q  170 ttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 269  Q
    |||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||||  | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| |||| | |    
T  16542440 ttatggtattgaataattttttatcttatacaatttttgttgcataaaaggttattttggtattttagacaacttgtacttgaaataaaaatttgtatag 16542341  T
Q  270 tggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagttt 324  Q
    || ||| ||||| ||||| ||| | | ||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  16542340 tgattttgtgagagacaagaattttaatttttatcatgtcttttgccttcagttt 16542286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 359
Target Start/End: Original strand, 28068824 - 28068962
Alignment:
Q  221 ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctcca 320  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||| |||| |||| || |||||||| ||| | | ||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  28068824 ctattttggtattttataccacttgtacgtaagacaaaaaattgtattgttgtttagtaagggacaagaatttcactttatgtcccgtcccttacctcca 28068923  T
Q  321 gtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacac 359  Q
     |||||  | | ||| || || |||||||||||||||||    
T  28068924 ttttgttatttccctaaaccaattttacaaatcaaacac 28068962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14925215 - 14925158
Alignment:
Q  337 aaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  14925215 aaacaattttacaaatcaaacactggacaactgaagttgtcatgtcctgtccttcatt 14925158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29424734 - 29424613
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || || |||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||    
T  29424734 ttttatggtattgaataatttttggtcttgtacgttttttggtggacaaaaaactatttttgtattttagataacttgtacgtaggtctaaaaattgtgt 29424635  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaa 289  Q
    ||| |||| |||| ||||||||    
T  29424634 tgtcgtttagtgatggacaaaa 29424613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 142
Target Start/End: Original strand, 11279012 - 11279075
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacac 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11279012 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacac 11279075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11614035 - 11613968
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacaca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||| || | |||||||||||||||||||    
T  11614035 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtattggacagaacagtacacgatagaacagtacaacaca 11613968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29203050 - 29202990
Alignment:
Q  211 ggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  29203050 ggacaaaatgctcttt-ggtattttaaacaacttgtacttgagagaaaaagttgtgttgtgg 29202990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 387
Target Start/End: Original strand, 13415861 - 13415905
Alignment:
Q  343 ttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtc 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  13415861 ttttacaaatcaaacactgtacaactagagttgttatgttctgtc 13415905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 319
Target Start/End: Original strand, 24785060 - 24785168
Alignment:
Q  212 gacaaaatgctattttggtatttt-agacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtct 310  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||  ||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||     
T  24785060 gacaaaataccattttagtatttttagactgcttgtacttggacaaaaaaattgtgttgtggtttagtgagcgacaagaatttcagtttttgtcatgtcc 24785159  T
Q  311 cttgcctcc 319  Q
    |||||||||    
T  24785160 cttgcctcc 24785168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15400734 - 15400651
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 269  Q
    |||||||| | ||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  15400734 ttttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtacttaagacaaaaagttgtgttg 15400651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15412521 - 15412438
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 269  Q
    |||||||| | ||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  15412521 ttttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtacttaagacaaaaagttgtgttg 15412438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15428115 - 15428032
Alignment:
Q  186 ttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttg 269  Q
    |||||||| | ||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  15428115 ttttttgtctcatacaatgtatgatggacaaaagactattttgatattttaaacaatttgtacttaagacaaaaagttgtgttg 15428032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 331
Target Start/End: Original strand, 2122770 - 2122848
Alignment:
Q  253 gacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  |   ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  2122770 gacaaaaagttgtgttgtggtttagtagcggacaaaaaattatatttttgtcctgtctcttaccttcaatttgtcctgt 2122848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Original strand, 2122902 - 2122963
Alignment:
Q  297 tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaaca 358  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| || ||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  2122902 tttttgtcctgtcttttacctccagtttatcttgttccagaaacaatttttcaaatcaaaca 2122963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 4064277 - 4064313
Alignment:
Q  205 tttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaa 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4064277 tttgatggacaaaatgctattttggtattttaaacaa 4064313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Original strand, 23448 - 23763
Alignment:
Q  77 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  23448 gggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactggacagaacagtacaagatagaacaatacaacacaaggcagaacagcactggacaaattttttatggc 23547  T
Q  177 attgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttg 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23548 attgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaa--tgttattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggtttg 23645  T
Q  277 gtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23646 gtgaaggacaaaaatatgagtttttgtcatgtcccttgcctcaagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 23745  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  23746 tctgtcctgcccttcatt 23763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 361
Target Start/End: Original strand, 19903 - 20062
Alignment:
Q  202 atttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagttttt 301  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  19903 atttttgatgaacaaaagactattttggtatttcaaacaacttgtacgtgaaacaaaaagttgtacagtggtttagtgagtgacaagaatttcagttttt 20002  T
Q  302 gtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactg 361  Q
    ||| | || |||  || || |||||| | |  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20003 gtcatatcccttttctacaatttgtcttatctctaaaacagttttacatatcaaacactg 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 76 - 394
Target Start/End: Original strand, 101819 - 102137
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatgg 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  101819 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtaccggacagaacagtataagatagaacagtacaatataaggtagaacagcacaggacaaattttttatgg 101918  T
Q  176 cattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggttt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  101919 cattgagtaattttttgttttatacgattttttagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgatgtggttt 102018  T
Q  276 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  102019 ggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtccgttgcctccaagttgtcctgtacatgaaacagttttacaaatcaaacactggataactagagttg 102118  T
Q  376 ttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  102119 ttctgtcatgtccttcatt 102137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 78 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18278 - 17982
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  18278 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 18179  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 18079  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcatgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 17982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12760 - 12529
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  12760 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggatagaacagtacaagatagaacagtacaacacatgtcagaacagcacaagacaaattttttatagca 12661  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12660 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 12561  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12560 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtc 12529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2568 - 2247
Alignment:
Q  72 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttt 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  2568 attaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaagatagaatagtacaacacaaggcagaacagcacatgacaaatttttt 2469  T
Q  172 atggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtg 271  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2468 atgacattgagtaattttttgttttataggatttttatgggacaaaaaactattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtg 2369  T
Q  272 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactaga 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  2368 gtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacact-gaaaactaaa 2270  T
Q  372 gttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  2269 gttgttctatcctgtccttcatt 2247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0729 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0729
Description:

Target: scaffold0729; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4796 - 4487
Alignment:
Q  79 gtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||||      |  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4796 gtgtgtttggtttgcaaaacagc------tggacagaacagtacaagatagaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggacaaattttttatggcat 4703  T
Q  179 tgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 278  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4702 tgagtaattttttgttttatacgattttttagagacaaaatgatattttgatgttttagacaacttttacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggt 4603  T
Q  279 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4602 gagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtcccttgcctccaatttgtgctatacctaaatcaattttacaaatcaaacactggacaactagagttgttc 4503  T
Q  379 tgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||    
T  4502 tgtcctgtccttcatt 4487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Original strand, 51311 - 51626
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| ||    
T  51311 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacagaacagtacaatatagaacagtataatacaagacagaacagcacaagacaaattttttatgaca 51410  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  51411 ttgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgctattttgatattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtggttt-g 51509  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgtt 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  51510 tgagggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcatccagtttgttctgcacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattaaagttgtt 51609  T
Q  378 ctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||  |||||||||||    
T  51610 ctgttttgtccttcatt 51626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 394
Target Start/End: Original strand, 15047 - 15360
Alignment:
Q  81 gtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattg 180  Q
    |||||||||||||||||||| || |||   ||| |||| || || |||||||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||  ||||||||||||    
T  15047 gtgtttggtttgcaaaacagtaagtaccggacagaacagtacaaaatagaacagtacaacataaggcagaacaacacatgaaaaaaaatttatggcattg 15146  T
Q  181 agtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtga 280  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15147 agtaatttgttgttttataagatttttgggggacaaaatactattttagtattttagacaacttgtacgtgagacaaaaagttgtgttgtggtttggtgg 15246  T
Q  281 gggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctg 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15247 gggacaaaaatatgagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaattagagttgttttg 15346  T
Q  381 tcctgtccttcatt 394  Q
    || |||||||||||    
T  15347 tcttgtccttcatt 15360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19262 - 19000
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19262 aacagtacaacacaaggtagaacagcacatggcaaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgaaggacaaaatgttattttgg 19163  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19162 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgctgtgatttggtgagggacaaaaatatgag-ttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 19064  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  19063 gtacctg-aacagttttacaaatcaaacactggacaaatataattgttctgtcctgtccttcatt 19000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5663 - 5347
Alignment:
Q  78 ggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggca 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  5663 ggtgcgtttggtttgcaaaacagcaagtactggacataacagtacaagacagaacaacacaacacaaggcagaacagcacaggacaaa-tttttatgaca 5565  T
Q  178 ttgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttgg 277  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5564 ttgaataattttttgttttatacgatttttggggctcgaaatgttatttttgtattttaggcaacttgtatgtgggacaaaaagttgtgatgtggtttgg 5465  T
Q  278 tgagggacaaaaatatgag-tttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5464 tgagggacaaaaatatgtgttttttgtcctgtcccttgcctccagtttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactgaagttgt 5365  T
Q  377 tctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  5364 tctgttctgtccttcatt 5347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 373138 - 372872
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  373138 agaacagtacaacataaggcagaacaatatagaataaattttttatggcattgagtaattttttgttttatacgatttttgagggacaaaatgatatttt 373039  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |     
T  373038 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttatggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatatcccttgtctccagtttttt 372939  T
Q  328 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  372938 ctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacatttgacaactaaaattgttctgtcatatccttcatt 372872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0957 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0957
Description:

Target: scaffold0957; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2682 - 2406
Alignment:
Q  115 aacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggac 214  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2682 aacagtataagatagaacaatacaacacaaggtagaacaacacatgacaaattttttatgagattgggtaattttttgttttatacgatttttgggggac 2583  T
Q  215 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  2582 aaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgagacaata-gttgtgttgtggtttggttagggacaaagatatgagtttttgtcctgtcccttt 2484  T
Q  315 cctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttca 392  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2483 cctccaatttgtcttgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttatgtcttgtccttca 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15551 - 15281
Alignment:
Q  128 agaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctatttt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||    
T  15551 agaacagtacaacacaaggcagaacagcacaggataaattttttatgacattgagtaattttttgttttatacgatttttgagg----aaatgctatttt 15456  T
Q  228 ggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttg--------tcctgtctcttgcctcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||| |||||||||    
T  15455 ggtattttagacaacttgtacatgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcatgtgatcttgtcccttgcctcc 15356  T
Q  320 agtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  15355 agtttatcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactgaacaactagagttgttctatcatgttcttcatt 15281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13554
Alignment:
Q  195 ttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatg 294  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| |||| |     
T  13686 ttatacgatttttgatggacaaaatactattttggtattctagacaacttgtacatgtgacaaaaagttgtgtcgtattttagtgagagacacaaatttc 13587  T
Q  295 agtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtc 327  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  13586 aatttttgtcatgtctattgcctccaatttgtc 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0650 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0650
Description:

Target: scaffold0650; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 130 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1551
Alignment:
Q  130 aacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttgg 229  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1814 aacagcacaacacaagagagaacaacacagaacaaa-tttttatggtattgaataattttttgttttatatgacttttgagggacgaaatgctattttgg 1716  T
Q  230 tattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcct 329  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1715 ttttttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcttgtcccttgcctccagtttgtcct 1616  T
Q  330 gtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  1615 atccttgaaacagttttacaaatcaaacactggagaactgaagttgttctgttttgtccttcatt 1551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13913 - 13595
Alignment:
Q  75 aagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaatttttatg 174  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||  ||| |||| |||||   ||||||  | || |||||||| ||  | |||||||||| ||||||||    
T  13913 aagggtgcgtttgatttgcaaaacagtaagtactggacagaacagtataatgcagaacaacaaaatacaaggcataattgcacaggacaaa-tttttatg 13815  T
Q  175 gcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtt 274  Q
    | ||||| || ||| ||||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  13814 gtattgaataatttcttgttttatatgctttttgggggacggaatgctattttggtgttttagacaacttgtaagtgggacaaaaagttgtactgtggtt 13715  T
Q  275 tggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagagtt 374  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13714 tggtgagggacaaaaatttcagtttttgtcctatcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacaattttacaaatcaaacactggacaactggagtt 13615  T
Q  375 gttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13614 gttctgtcctgtccttcatt 13595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 73 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43177 - 42859
Alignment:
Q  73 ttaagggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatactatacaaaacaatataagatagaacagtacaacacaaggcagaacagtacaggacaaaattttta 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| | || || ||   ||||||| |||| |||||||| || | |||||  |||| |||||     
T  43177 ttaagggtgcgtttggtttgcaaaacagtaagtactagacagagcagtacaatgcagaacagcacaatacaaggcataataatacagatcaaa-tttttg 43079  T
Q  173 tggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 272  Q
    ||| ||||| || ||| ||||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078 tggtattgaataatttcttgttttatatgattgtttggggacaacatgctattttggtgttttagacaa-ttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtgg 42980  T
Q  273 tttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaactagag 372  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  42979 tttggtgagggacacaaatttcagtttttgttctgtcccttgcctccagtttgttctgtccctgaaacagttttacaaatcaaacactggacta-tggag 42881  T
Q  373 ttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  42880 ttgttctgtcttatccttcatt 42859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 253 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19205 - 19064
Alignment:
Q  253 gacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccagtttgtcctgtacctgaaacagttttacaaat 352  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19205 gacaaaaagttgtgttgagctttgatgagggacaaaaatttcagtttttgtcctgtccattgcctcctgtttattctgtccctgaaacagttttacaaat 19106  T
Q  353 caaacactggacaactagagttgttctgtcctgtccttcatt 394  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  19105 caaacactggataactggaattgttatgtcctatccttcatt 19064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33678 - 33530
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatgctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 267  Q
    |||||||  ||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33678 ttttatgatattgaataatttttggtcttatacaagttttgatggacaaaagcctattttggtattttatacaatttgtacgtgggacaaaaagttgtgt 33579  T
Q  268 tgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcct 317  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||| |||| |||||||    
T  33578 tgtggtttgatgagggacaagaatttca-tttttgtcatgtcccttgcct 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 108385 - 108239
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccag 321  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||| | |  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  108385 tattttggtactttagacaatttgcacttgagacaaaaagttgtattgtgctttagtgaatgacaaaatttttggtttttgtcttgtctcttgcccccag 108286  T
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
    |||||| ||| |||   | |||||||||| ||||||| || ||||||    
T  108285 tttgtcatgtcccttgtatagttttacaattcaaacattgtacaact 108239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 111155 - 111009
Alignment:
Q  222 tattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaagttgtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcctccag 321  Q
    |||||||||| |||||| || ||| || || ||||||||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||| | |||||||||| |||||||| || | ||    
T  111155 tattttggtactttagataatttgcacttgagacaaaaagttctattgtgctttagtgaatgacaaaaatttcagtttttgtcttgtctcttacccctag 111056  T
Q  322 tttgtcctgtacctgaaacagttttacaaatcaaacactggacaact 368  Q
     || || ||| ||| | | ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  111055 cttatcatgtcccttagatagtattacaaatcaaacattgtacaact 111009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7596 - 7443
Alignment:
Q  168 ttttatggcattgagtacttttttgttttatacaatttttgagggacaaaatg-ctattttggtattttagacaacttgtacgtgggacaaaaa---gtt 263  Q
    |||||| | ||||| || ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||    
T  7596 ttttatagtattgaataatttttggtcttatataatttttaatggacaaaaaatctattttggtattttagacaactcgtacgtgagacaaaaaaatctt 7497  T
Q  264 gtgttgtggtttggtgagggacaaaaatatgagtttttgtcctgtctcttgcct 317  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||  ||| |||||||    
T  7496 gtgttgtgatttagtgagagacaagaatttcagtttttgtctagtcacttgcct 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 108
Target Start/End: Original strand, 338757 - 338789
Alignment:
Q  76 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaaatact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  338757 agggtgtgtttggtttgcaaaacagcaagtact 338789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University