View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10233A_low_153 (Length: 267)

Name: NF10233A_low_153
Description: NF10233A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10233A_low_153
NF10233A_low_153
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (11-241)||(125781-126010)
scaffold0011 (197-241)||(38267-38311)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (11-256)||(663-907)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (11-256)||(14258261-14258505)
chr7 (11-246)||(15719816-15720050)
chr7 (11-241)||(16579584-16579813)
chr7 (11-241)||(16585850-16586079)
chr7 (11-241)||(16460831-16461060)
chr7 (11-246)||(16998413-16998647)
chr7 (11-246)||(14273335-14273569)
chr7 (11-244)||(8468539-8468772)
chr7 (11-246)||(16550712-16550937)
chr7 (11-246)||(46580741-46580965)
chr7 (11-198)||(8940118-8940304)
chr7 (11-198)||(32301156-32301342)
chr7 (11-244)||(17232740-17232973)
chr7 (11-198)||(15112812-15112998)
chr7 (11-198)||(32160910-32161095)
chr7 (11-198)||(16323920-16324105)
chr7 (37-240)||(1490146-1490348)
chr7 (11-246)||(16614725-16614950)
chr7 (11-131)||(1858897-1859017)
chr7 (51-246)||(14981541-14981725)
chr7 (11-131)||(13918591-13918711)
chr7 (11-131)||(25927314-25927434)
chr7 (11-126)||(2530202-2530316)
chr7 (11-143)||(17060490-17060621)
chr7 (51-178)||(15411017-15411144)
chr7 (11-198)||(15116352-15116535)
chr7 (11-131)||(39722105-39722225)
chr7 (11-126)||(45170153-45170268)
chr7 (11-105)||(32972-33066)
chr7 (11-105)||(12704806-12704900)
chr7 (11-105)||(12714729-12714823)
chr7 (11-105)||(12718533-12718627)
chr7 (11-105)||(16907348-16907442)
chr7 (11-105)||(18283231-18283325)
chr7 (11-105)||(26292260-26292354)
chr7 (11-105)||(70912-71006)
chr7 (11-105)||(75021-75115)
chr7 (11-105)||(12723444-12723538)
chr7 (11-105)||(16114106-16114200)
chr7 (11-105)||(16117259-16117353)
chr7 (11-105)||(18279268-18279362)
chr7 (26-131)||(15084035-15084140)
chr7 (11-80)||(20487527-20487596)
chr7 (192-246)||(11092677-11092731)
chr7 (162-243)||(16185913-16185992)
chr7 (197-244)||(11392123-11392170)
chr7 (197-246)||(11084935-11084984)
chr7 (42-198)||(16462189-16462347)
chr7 (197-239)||(38519335-38519377)
chr7 (197-241)||(9033462-9033507)
chr7 (197-241)||(11661233-11661277)
chr7 (197-233)||(32301077-32301113)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (11-241)||(18700373-18700602)
chr3 (11-198)||(324103-324289)
chr3 (11-246)||(17691774-17692008)
chr3 (11-246)||(35961596-35961821)
chr3 (11-246)||(52989788-52990012)
chr3 (11-246)||(54876456-54876690)
chr3 (14-246)||(21837245-21837476)
chr3 (11-198)||(43889692-43889878)
chr3 (11-256)||(16796314-16796540)
chr3 (11-198)||(11914082-11914268)
chr3 (11-198)||(12469769-12469955)
chr3 (11-178)||(14966056-14966223)
chr3 (11-150)||(22652036-22652174)
chr3 (11-131)||(12339640-12339760)
chr3 (11-131)||(4588920-4589040)
chr3 (14-131)||(5223238-5223355)
chr3 (70-198)||(16979092-16979220)
chr3 (11-131)||(11300577-11300697)
chr3 (37-200)||(17046177-17046339)
chr3 (11-126)||(15964816-15964931)
chr3 (11-126)||(15968740-15968855)
chr3 (11-126)||(15972664-15972779)
chr3 (11-131)||(37439783-37439903)
chr3 (11-102)||(16643135-16643226)
chr3 (13-131)||(19775607-19775725)
chr3 (11-105)||(4107544-4107638)
chr3 (11-105)||(4111396-4111490)
chr3 (11-105)||(7109566-7109660)
chr3 (11-105)||(7113501-7113595)
chr3 (11-105)||(11069936-11070030)
chr3 (11-105)||(11165676-11165770)
chr3 (11-105)||(22321532-22321626)
chr3 (11-105)||(22336587-22336681)
chr3 (11-105)||(27409791-27409885)
chr3 (11-105)||(28949592-28949686)
chr3 (11-105)||(55022735-55022829)
chr3 (11-148)||(14569026-14569163)
chr3 (11-105)||(30065814-30065908)
chr3 (137-246)||(17685711-17685819)
chr3 (11-131)||(11854575-11854695)
chr3 (14-105)||(15617242-15617333)
chr3 (11-80)||(14670908-14670977)
chr3 (11-69)||(41813-41871)
chr3 (11-72)||(15465068-15465129)
chr3 (11-105)||(14499193-14499287)
chr3 (11-69)||(16325249-16325307)
chr3 (11-80)||(14682407-14682476)
chr3 (115-246)||(24513771-24513891)
chr3 (128-246)||(24178705-24178812)
chr3 (36-198)||(6805696-6805860)
chr3 (37-138)||(13026420-13026521)
chr3 (37-138)||(13030012-13030113)
chr3 (197-246)||(5841787-5841836)
chr3 (197-246)||(14965999-14966048)
chr3 (197-246)||(22651974-22652023)
chr3 (197-241)||(9577586-9577630)
chr3 (197-241)||(10542508-10542552)
chr3 (11-47)||(16979218-16979254)
chr3 (34-86)||(37427814-37427866)
chr3 (196-241)||(15265100-15265145)
chr3 (197-242)||(32403075-32403120)
chr3 (197-241)||(15245979-15246023)
chr3 (122-170)||(36527756-36527804)
chr3 (206-246)||(45220417-45220457)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (11-220)||(23069349-23069557)
chr2 (11-246)||(27472250-27472474)
chr2 (11-246)||(34874278-34874502)
chr2 (11-198)||(24917979-24918165)
chr2 (11-198)||(21914779-21914966)
chr2 (11-246)||(23707354-23707578)
chr2 (11-198)||(21081802-21081988)
chr2 (11-198)||(22459628-22459814)
chr2 (11-246)||(24670826-24671050)
chr2 (11-246)||(34492200-34492425)
chr2 (50-246)||(24316190-24316384)
chr2 (11-176)||(18358799-18358964)
chr2 (11-246)||(24681247-24681469)
chr2 (11-131)||(30345138-30345258)
chr2 (11-131)||(31345051-31345171)
chr2 (11-131)||(41531151-41531271)
chr2 (11-131)||(1283228-1283348)
chr2 (70-198)||(20320723-20320850)
chr2 (11-105)||(24628626-24628720)
chr2 (11-105)||(27601661-27601755)
chr2 (13-105)||(12901661-12901753)
chr2 (11-105)||(10101792-10101886)
chr2 (11-105)||(24649222-24649316)
chr2 (11-101)||(27379580-27379670)
chr2 (11-101)||(27383626-27383716)
chr2 (11-80)||(9784667-9784736)
chr2 (170-246)||(27485345-27485422)
chr2 (197-246)||(13101762-13101811)
chr2 (197-241)||(39828109-39828153)
chr2 (11-178)||(20915214-20915386)
chr2 (23-73)||(39827952-39828002)
chr2 (197-241)||(34136901-34136945)
chr2 (111-198)||(24815507-24815593)
chr2 (197-241)||(21073608-21073652)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (11-256)||(48603263-48603507)
chr1 (11-246)||(51326612-51326847)
chr1 (11-256)||(22130972-22131205)
chr1 (11-246)||(50000593-50000817)
chr1 (11-246)||(27653288-27653522)
chr1 (11-246)||(29764346-29764571)
chr1 (14-198)||(48520380-48520563)
chr1 (11-168)||(46198433-46198590)
chr1 (11-198)||(12271423-12271609)
chr1 (11-131)||(33797456-33797576)
chr1 (11-106)||(13881447-13881542)
chr1 (11-131)||(1925276-1925396)
chr1 (11-131)||(20924290-20924410)
chr1 (11-131)||(20228956-20229076)
chr1 (83-198)||(20316505-20316619)
chr1 (11-105)||(1010588-1010682)
chr1 (11-105)||(16375606-16375700)
chr1 (11-105)||(21407220-21407314)
chr1 (122-246)||(636042-636165)
chr1 (11-105)||(52639406-52639500)
chr1 (11-80)||(41781654-41781724)
chr1 (197-246)||(11809492-11809541)
chr1 (197-246)||(23072993-23073042)
chr1 (197-246)||(25263084-25263133)
chr1 (197-246)||(43630375-43630424)
chr1 (197-241)||(14800490-14800534)
chr1 (197-241)||(14809364-14809408)
chr1 (197-241)||(20958069-20958113)
chr1 (197-241)||(21043397-21043441)
chr1 (11-61)||(43543133-43543183)
chr1 (197-241)||(23967675-23967719)
chr1 (197-241)||(28312475-28312519)
chr1 (197-237)||(47190566-47190606)
chr1 (197-241)||(48520293-48520337)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (11-246)||(2779-3013)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (11-233)||(119842-120063)
scaffold0034 (197-241)||(117192-117236)
scaffold0034 (197-241)||(117138-117182)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (11-241)||(22805758-22805987)
chr6 (11-256)||(19773608-19773843)
chr6 (6-246)||(18913775-18914005)
chr6 (6-246)||(18937033-18937263)
chr6 (11-198)||(15705509-15705695)
chr6 (11-246)||(15174163-15174388)
chr6 (11-246)||(17377863-17378087)
chr6 (11-198)||(28103964-28104151)
chr6 (11-198)||(15817587-15817771)
chr6 (14-197)||(15875253-15875435)
chr6 (11-198)||(17743246-17743432)
chr6 (11-131)||(27416005-27416125)
chr6 (11-131)||(23414819-23414939)
chr6 (11-131)||(27556577-27556697)
chr6 (11-131)||(18917413-18917533)
chr6 (11-106)||(14979453-14979548)
chr6 (11-241)||(19656076-19656297)
chr6 (11-131)||(16760134-16760254)
chr6 (11-131)||(31477957-31478077)
chr6 (11-126)||(22948952-22949067)
chr6 (11-131)||(1644547-1644667)
chr6 (11-126)||(22952908-22953023)
chr6 (11-126)||(23871396-23871511)
chr6 (11-126)||(23875352-23875467)
chr6 (11-126)||(18955910-18956025)
chr6 (11-105)||(8243726-8243820)
chr6 (11-105)||(11566727-11566821)
chr6 (11-105)||(19870455-19870549)
chr6 (11-105)||(22862811-22862905)
chr6 (11-105)||(23394933-23395027)
chr6 (11-105)||(23989785-23989879)
chr6 (11-126)||(14472115-14472230)
chr6 (11-73)||(18696480-18696542)
chr6 (11-69)||(23956148-23956206)
chr6 (11-70)||(18706301-18706360)
chr6 (11-105)||(12618991-12619083)
chr6 (92-148)||(23538745-23538801)
chr6 (53-148)||(17105771-17105865)
chr6 (42-104)||(18259926-18259989)
chr6 (11-159)||(22376621-22376774)
chr6 (36-198)||(20411532-20411696)
chr6 (197-246)||(18927729-18927778)
chr6 (197-246)||(28708480-28708529)
chr6 (197-241)||(20078286-20078330)
chr6 (197-241)||(27573163-27573207)
chr6 (200-241)||(18453143-18453184)
chr6 (6-86)||(20136770-20136851)
chr6 (6-86)||(22196018-22196099)
chr6 (197-241)||(17743159-17743203)
chr6 (201-241)||(23538690-23538730)
chr6 (27-79)||(23538798-23538849)
chr6 (197-241)||(27573109-27573153)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (11-256)||(17048200-17048434)
chr4 (11-244)||(13591992-13592213)
chr4 (11-198)||(15008122-15008309)
chr4 (11-198)||(10694955-10695142)
chr4 (11-198)||(10908721-10908908)
chr4 (11-246)||(15884123-15884348)
chr4 (11-198)||(14746649-14746835)
chr4 (11-246)||(15497101-15497326)
chr4 (13-168)||(40619717-40619872)
chr4 (11-131)||(43256224-43256344)
chr4 (11-170)||(19857417-19857576)
chr4 (11-241)||(53631320-53631541)
chr4 (51-198)||(26013350-26013498)
chr4 (11-126)||(14954314-14954429)
chr4 (11-126)||(25689714-25689829)
chr4 (11-131)||(10712695-10712815)
chr4 (11-131)||(10926465-10926585)
chr4 (11-126)||(27533870-27533985)
chr4 (11-131)||(12487550-12487670)
chr4 (11-105)||(9556395-9556489)
chr4 (11-105)||(14757569-14757663)
chr4 (11-105)||(4561481-4561575)
chr4 (11-105)||(17810137-17810231)
chr4 (11-103)||(5757085-5757177)
chr4 (23-170)||(14650716-14650866)
chr4 (11-69)||(28385529-28385587)
chr4 (11-105)||(33742245-33742337)
chr4 (34-198)||(19738234-19738399)
chr4 (11-54)||(10056650-10056693)
chr4 (197-251)||(13592219-13592273)
chr4 (197-246)||(9923202-9923251)
chr4 (37-138)||(15990254-15990355)
chr4 (201-246)||(11479612-11479657)
chr4 (200-237)||(15791739-15791776)
chr4 (197-241)||(24047415-24047459)
chr4 (11-80)||(50160269-50160340)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (11-243)||(17461118-17461349)
chr8 (13-246)||(23478199-23478422)
chr8 (11-198)||(37515574-37515760)
chr8 (11-198)||(18833431-18833617)
chr8 (11-198)||(19879985-19880172)
chr8 (11-246)||(22238085-22238308)
chr8 (11-198)||(26453867-26454054)
chr8 (11-246)||(23409626-23409850)
chr8 (13-178)||(19808430-19808595)
chr8 (11-170)||(19929556-19929717)
chr8 (42-198)||(5760550-5760705)
chr8 (11-131)||(21828161-21828281)
chr8 (97-256)||(44384821-44384969)
chr8 (11-126)||(18862792-18862907)
chr8 (83-198)||(22352905-22353019)
chr8 (11-102)||(23659371-23659462)
chr8 (11-131)||(21410789-21410909)
chr8 (11-131)||(21805281-21805401)
chr8 (11-105)||(21976817-21976911)
chr8 (11-105)||(22111796-22111890)
chr8 (11-105)||(43251678-43251772)
chr8 (11-95)||(16402068-16402152)
chr8 (11-105)||(19278430-19278524)
chr8 (11-80)||(23914023-23914092)
chr8 (11-69)||(8414418-8414476)
chr8 (11-69)||(11775008-11775066)
chr8 (11-131)||(14397928-14398040)
chr8 (11-67)||(21972732-21972788)
chr8 (195-242)||(37515487-37515534)
chr8 (197-251)||(16799437-16799491)
chr8 (196-241)||(5760517-5760562)
chr8 (111-198)||(18302800-18302886)
chr8 (197-241)||(22253280-22253324)
chr8 (197-241)||(28397511-28397555)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (11-256)||(22107500-22107734)
chr5 (11-246)||(17010844-17011069)
chr5 (11-198)||(263015-263201)
chr5 (11-210)||(6765684-6765883)
chr5 (11-198)||(33895711-33895897)
chr5 (11-242)||(29447838-29448058)
chr5 (11-131)||(18356131-18356251)
chr5 (11-131)||(20910982-20911102)
chr5 (13-131)||(10753203-10753321)
chr5 (11-131)||(40723734-40723854)
chr5 (11-105)||(15236982-15237076)
chr5 (11-105)||(19472867-19472961)
chr5 (11-105)||(20295712-20295806)
chr5 (11-69)||(33473272-33473330)
chr5 (11-86)||(18356296-18356370)
chr5 (11-86)||(20910863-20910937)
chr5 (84-131)||(11220587-11220634)
chr5 (84-131)||(11225173-11225220)
chr5 (84-131)||(11228996-11229043)
chr5 (197-246)||(19076340-19076389)
chr5 (197-246)||(41861578-41861627)
chr5 (84-131)||(11230985-11231032)
chr5 (197-239)||(23469766-23469808)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (11-239)||(365-592)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (11-246)||(3393-3627)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (11-246)||(1940-2174)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (11-244)||(85367-85600)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (11-243)||(15565-15797)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (11-198)||(286-472)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (11-246)||(7007-7231)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (11-198)||(5615-5802)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-246)||(53904-54128)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (11-246)||(10340-10564)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-198)||(33074-33261)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (11-198)||(169815-170001)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (59-241)||(13490-13671)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (16-210)||(10155-10348)
scaffold0107 (11-91)||(15480-15560)
scaffold0107 (197-241)||(36141-36185)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (11-198)||(22477-22664)
scaffold0046 (197-241)||(17032-17076)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (11-198)||(1358-1544)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (11-198)||(4188-4374)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (11-198)||(4188-4374)
scaffold0306 (7-157)||(14906-15056)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (11-198)||(1231-1417)
scaffold0017 (11-198)||(7982-8168)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (11-198)||(7704-7889)
scaffold0278 (196-241)||(7615-7660)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (11-198)||(24663-24847)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (11-198)||(67130-67316)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (11-160)||(465-614)
[»] scaffold0096 (3 HSPs)
scaffold0096 (11-168)||(21064-21221)
scaffold0096 (197-241)||(21017-21061)
scaffold0096 (197-241)||(20963-21007)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (11-246)||(70536-70754)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (11-246)||(6968-7192)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (44-198)||(6851-7004)
scaffold0741 (6-59)||(4330-4383)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (11-184)||(35-214)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (11-131)||(71236-71356)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (11-241)||(1314-1535)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (95-217)||(20652-20773)
scaffold0018 (11-47)||(20769-20805)
scaffold0018 (111-198)||(7481-7567)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (137-256)||(3514-3632)
scaffold0165 (137-256)||(7578-7696)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (11-131)||(20276-20396)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (11-131)||(31058-31178)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (11-131)||(36233-36353)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-131)||(207649-207769)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (11-131)||(189524-189644)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (23-198)||(15449-15625)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-131)||(14234-14354)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (11-113)||(39205-39307)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-131)||(234-354)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (11-131)||(11648-11768)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (81-246)||(78234-78388)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (11-131)||(32807-32927)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (11-105)||(65675-65769)
scaffold0029 (11-131)||(80554-80674)
scaffold0029 (11-105)||(61759-61853)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (11-105)||(58866-58960)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-120)||(36089-36198)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (13-105)||(12287-12379)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (14-105)||(5251-5342)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (11-95)||(80482-80566)
scaffold0037 (95-131)||(80585-80621)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (23-170)||(56861-57011)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (11-105)||(315-409)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (11-105)||(4022-4116)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (25-159)||(7574-7711)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (11-77)||(17562-17628)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (11-105)||(67449-67542)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (23-170)||(166426-166576)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (53-131)||(6854-6932)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (11-69)||(176078-176136)
scaffold0001 (11-69)||(168724-168782)
scaffold0001 (34-198)||(446479-446645)
scaffold0001 (23-73)||(497538-497588)
scaffold0001 (201-241)||(497387-497427)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (11-80)||(6225-6294)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (42-198)||(11565-11723)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (11-68)||(105078-105135)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (123-198)||(21820-21894)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (23-105)||(8969-9051)
scaffold0347 (197-241)||(8851-8895)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (11-104)||(1129-1225)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (197-246)||(7987-8036)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (197-246)||(2674-2723)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (197-246)||(7763-7812)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (197-246)||(77818-77867)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (199-241)||(1855-1897)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (199-241)||(18285-18327)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (200-246)||(47-93)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (11-61)||(36096-36146)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (197-246)||(5654-5703)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (197-246)||(362728-362777)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (122-170)||(10486-10534)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (197-233)||(8130-8166)


Alignment Details
Target: scaffold0011 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 126010 - 125781
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  126010 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 125911  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125910 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 125812  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  125811 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 125781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 38267 - 38311
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38267 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 38311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 907 - 663
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  907 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 808  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 709  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  708 agtcttaagttgttgatgttgtcttagttgttgaagataatgatgt 663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14258505 - 14258261
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14258505 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttgagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 14258406  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14258405 tgtaatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcattccaaagtattccaaagtattgg 14258307  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14258306 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgatgaagatgatgatgt 14258261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15720050 - 15719816
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15720050 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 15719951  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15719950 tgtactgtttctgttgctgatgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattgg 15719852  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15719851 agtcctaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 15719816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16579813 - 16579584
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16579813 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 16579714  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579713 tgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 16579615  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16579614 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 16579584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 16585850 - 16586079
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16585850 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtgtaaaatgtattatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 16585949  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585950 tgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 16586048  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16586049 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 16586079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 16460831 - 16461060
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  16460831 tgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcatcaatattgttatgttgtgaattgct 16460930  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460931 tttgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 16461029  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16461030 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 16461060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16998647 - 16998413
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16998647 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgttgaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 16998548  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  16998547 tgtaatgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtatttccaaagtgttccaaagtattgg 16998449  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16998448 agccttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 16998413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14273569 - 14273335
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||    |    
T  14273569 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgcgaatattt 14273470  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| || ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14273469 tgtactatttctgttgctattgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattgg 14273371  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14273370 agtcttaagttgttaatgttgtttaagttgttgaag 14273335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8468772 - 8468539
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8468772 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 8468673  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagt-attccaaagtattg 209  Q
    |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  8468672 tgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgtttccaaaatattg 8468574  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 244  Q
    | || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8468573 gagtattaagttgttaatgttgtctaagttgttga 8468539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 16550712 - 16550937
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16550712 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16550811  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||          ||||||||||||||    
T  16550812 tgtgttgtttctattgatgttgaataatgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtc----------attccaaagtattg 16550900  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16550901 gagtcttaaggtgttgatgttgtctaagttgttgaag 16550937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 46580741 - 46580965
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  46580741 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgctgtgaattgct 46580840  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  46580841 tgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 46580929  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46580930 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 46580965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8940304 - 8940118
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8940304 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 8940205  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8940204 tgtactgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 8940118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32301342 - 32301156
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32301342 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32301243  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32301242 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtggtggtctaagttgtaaagttg-caagttgtcgttccaaagtatt 32301156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17232973 - 17232740
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | || ||||    
T  17232973 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttataaattgct 17232874  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagt-attccaaagtattg 209  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  17232873 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattg 17232775  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 244  Q
    | || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17232774 gagtattaagttgttaatgttgtctaagttgttga 17232740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15112998 - 15112812
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  15112998 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaatttct 15112899  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15112898 tgtactgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 15112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 32160910 - 32161095
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32160910 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaat-tgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 32161008  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  32161009 tgtgctgtttctgttgctgttgcatattgattaagttacaggtgttggtctaagttgtaaaattgt-aagttgtctttctaaagtatt 32161095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16324105 - 16323920
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16324105 tgttgttggttatgtgaaatg-ttatatgccttttgtggaaaatgcatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 16324007  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16324006 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcgggtgttggtctaagttgtaaagttgt-tagttgtctttccaaagtatt 16323920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Original strand, 1490146 - 1490348
Alignment:
Q  37 atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaata 136  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| | ||||| | || || || ||||||||| |||| |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  1490146 atgcattatgtggaatatatatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtactttttctgttgttgttgaata 1490245  T
Q  137 ttgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaa 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1490246 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 1490344  T
Q  237 gttg 240  Q
    ||||    
T  1490345 gttg 1490348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16614950 - 16614725
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16614950 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaacgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttttgaattgct 16614851  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgc--aggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtat 207  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||   |||| |||||  || |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||          ||||||||||||    
T  16614850 tgtgttgtttctattgatgttaaata--aatcaagttgcgaagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtc----------attccaaagtat 16614764  T
Q  208 tggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16614763 tggagtcttaaggtgttgatgttgtctaagttgttgaag 16614725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 1858897 - 1859017
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1858897 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgct 1858996  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1858997 tgtgctgtttctgttgctgtt 1859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 246
Target Start/End: Original strand, 14981541 - 14981725
Alignment:
Q  51 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgca 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14981541 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgca 14981640  T
Q  151 ggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14981641 ggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 14981725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 13918591 - 13918711
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13918591 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatatggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 13918690  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  13918691 tgtgctgtttctgttgctgtt 13918711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 25927314 - 25927434
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25927314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 25927413  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25927414 tgtgctgtttctgttgatgtt 25927434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 2530202 - 2530316
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2530202 tgttgttggttatgtgaaata-ttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 2530300  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  2530301 tgtgctgtttctgttg 2530316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 17060490 - 17060621
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | ||||||| ||||    
T  17060490 tgttgttggttatgtgaaatatttatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatgttggtct-ttgtgaattgct 17060588  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatca 143  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17060589 tgtactgtttctattgctgttgaatattgatca 17060621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Original strand, 15411017 - 15411144
Alignment:
Q  51 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgca 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15411017 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgca 15411116  T
Q  151 ggtgttggttcaagttgtaaagttgtaa 178  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15411117 ggtgttggtctaagttgtaaagttgtaa 15411144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15116535 - 15116352
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  15116535 tgttgtttgttatgtgaaatgtgcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttacgttgttgatgtttttcattaatattgttattttgtgaatttct 15116436  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15116435 tgtattgtttctgttgctgttgcacattgatcaagttgcaagtgttggt---ctttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 15116352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 39722225 - 39722105
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  39722225 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 39722126  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  39722125 tgtgctgtttatgttgctgtt 39722105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 45170153 - 45170268
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| || |    
T  45170153 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgtt 45170252  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||| ||||||||||||    
T  45170253 tgtactgtttctgttg 45170268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33066 - 32972
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  33066 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 32972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 12704806 - 12704900
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12704806 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 12704900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12714823 - 12714729
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12714823 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 12714729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12718627 - 12718533
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12718627 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 12718533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 16907348 - 16907442
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16907348 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 16907442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18283325 - 18283231
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  18283325 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 18283231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26292354 - 26292260
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  26292354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 26292260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 70912 - 71006
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  70912 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 71006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 75021 - 75115
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  75021 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgtcgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 75115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12723538 - 12723444
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12723538 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagctgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 12723444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16114200 - 16114106
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16114200 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 16114106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16117353 - 16117259
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16117353 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 16117259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18279362 - 18279268
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  18279362 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaa 18279268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15084140 - 15084035
Alignment:
Q  26 gaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgtt 125  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15084140 gaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgtt 15084041  T
Q  126 gatgtt 131  Q
    | ||||    
T  15084040 gctgtt 15084035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20487596 - 20487527
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20487596 tgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgttgatt 20487527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11092731 - 11092677
Alignment:
Q  192 aagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11092731 aagttttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 11092677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16185992 - 16185913
Alignment:
Q  162 aagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16185992 aagttgtaaagttgtaa-gttatctttccaaagtgttccaaagtattggagtcctaagttgtt-atgctgtctaagttgttg 16185913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 244
Target Start/End: Original strand, 11392123 - 11392170
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 244  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11392123 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 11392170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11084984 - 11084935
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  11084984 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtttttgaag 11084935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16462347 - 16462189
Alignment:
Q  42 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt-ttcattaatattgatatgttgtgaaatgctt--gtgctgtttctgttgatgttgaatatt 138  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  || || ||||||||  ||| |||||||||| ||| ||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16462347 ttatgtggaatatgcatgatgttgaaggtgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagatgtttatgtgctgcctctgttgttgttgaatatt 16462248  T
Q  139 gatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
     || | |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16462247 aattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgttgttccaaagtatt 16462189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38519377 - 38519335
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38519377 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagtt 38519335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 9033462 - 9033507
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaag-tggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9033462 ttccaaagtattggagtcttaagttgtttgatgttgtctaagttgt 9033507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11661277 - 11661233
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  11661277 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 11661233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32301113 - 32301077
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32301113 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc 32301077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 18700373 - 18700602
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18700373 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgggaaatgtatgatgtttaagtttttgatgtttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 18700472  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18700473 agtgctgtttctgttgctgttgaatatagatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 18700571  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18700572 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 18700602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 324289 - 324103
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  324289 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 324190  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  324189 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 324103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 17691774 - 17692008
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||  |||| ||||    
T  17691774 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttcgttaatattgttatgtgttgaattgct 17691873  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17691874 tgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattgg 17691972  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17691973 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 17692008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 35961596 - 35961821
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  35961596 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatatttttatgttgagaattgct 35961695  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||          |||||||||||||    
T  35961696 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattg 35961784  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35961785 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 35961821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 52989788 - 52990012
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52989788 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 52989887  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  52989888 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 52989976  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52989977 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 52990012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 54876456 - 54876690
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| || ||||    
T  54876456 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgacgcatttccttaatattgttatgttgtaaattgct 54876555  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||     
T  54876556 tgtactgtttctgttgctgttgcataatgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaaatattga 54876654  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  54876655 agtcttaagttgttaatgttgtctgagttgttgaag 54876690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21837476 - 21837245
Alignment:
Q  14 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgt 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||   |||||    
T  21837476 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgttgatgcttttcatgaatattattatgttgtgaatgacttgt 21837377  T
Q  114 gctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggt 213  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  21837376 actgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgttgatgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaaatgttccaaagtattggagt 21837278  T
Q  214 cttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21837277 cttaagttgttgatattatctaagttgttgaag 21837245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 43889692 - 43889878
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43889692 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtctctcattaatattgttatgttgtgaattgct 43889791  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43889792 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaaattgt-aagttgtcgttccaaagtatt 43889878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16796540 - 16796314
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16796540 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 16796441  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||         |||||||||          ||||||||||||||    
T  16796440 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt---------aagttgtcg----------ttccaaagtattgg 16796360  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16796359 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 16796314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 11914082 - 11914268
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11914082 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 11914181  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11914182 tgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 11914268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12469955 - 12469769
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  12469955 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtgtgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattggt 12469856  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12469855 tgtgttgtttttgttgctgttgaatatttataaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttcaaaagtatt 12469769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14966223 - 14966056
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  14966223 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 14966124  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaa 178  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14966123 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaa 14966056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22652174 - 22652036
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22652174 tgttgttggttatgtgaaataattatatgcattatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatactgttatgttgtgaattgct 22652076  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgca 150  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22652075 tgtgttgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgca 22652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12339760 - 12339640
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12339760 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 12339661  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  12339660 tgtgctgtttctgttgctgtt 12339640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 4588920 - 4589040
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4588920 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 4589019  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  4589020 tgtgctgtttctgttgctgtt 4589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 5223355 - 5223238
Alignment:
Q  14 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgt 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  5223355 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtttgt 5223256  T
Q  114 gctgtttctgttgatgtt 131  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  5223255 gctgtttttgttgctgtt 5223238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16979220 - 16979092
Alignment:
Q  70 tgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt- 168  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  16979220 tgttgttggttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtc 16979121  T
Q  169 aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16979120 taagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 16979092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 11300577 - 11300697
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11300577 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 11300676  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  11300677 tgtgttgtttctgttgctgtt 11300697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17046339 - 17046177
Alignment:
Q  37 atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaata 136  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| | || || || ||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  17046339 atgcattatgtggaatatatatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgattgtactgtttctgttgctgttgaata 17046240  T
Q  137 ttgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattcc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17046239 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtnttcc 17046177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15964931 - 15964816
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15964931 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15964832  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  15964831 tgtgctgtttctgttg 15964816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15968855 - 15968740
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15968855 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15968756  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  15968755 tgtgctgtttctgttg 15968740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15972779 - 15972664
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15972779 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttttgttgtgaattgct 15972680  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  15972679 tgtgctgtttctgttg 15972664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 37439783 - 37439903
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37439783 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 37439882  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  37439883 tgtgctgtttatgttgctgtt 37439903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16643226 - 16643135
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  16643226 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcagtaatattgttatgttgt 16643135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19775725 - 19775607
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  19775725 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgtttg 19775626  T
Q  113 tgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  19775625 tgctgtttctgttgctgtt 19775607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 4107544 - 4107638
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  4107544 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaa 4107638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 4111396 - 4111490
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  4111396 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 4111490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7109660 - 7109566
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  7109660 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 7109566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7113595 - 7113501
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  7113595 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 7113501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11070030 - 11069936
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11070030 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 11069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 11165676 - 11165770
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11165676 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 11165770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22321626 - 22321532
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22321626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 22321532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22336681 - 22336587
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22336681 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 22336587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 27409791 - 27409885
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  27409791 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 27409885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28949686 - 28949592
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  28949686 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 28949592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 55022829 - 55022735
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  55022829 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 55022735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Original strand, 14569026 - 14569163
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatg-tgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgc 109  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||| |||| |||||||||||| | |    
T  14569026 tgttgttggttatggtaaaatatgtatataccttatgtggaaaatgtatgatgttaaaga-gttgatgtttgtcattattattcatatgttgtgaattac 14569124  T
Q  110 ttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttg 148  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14569125 ttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 14569163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30065908 - 30065814
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  30065908 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 30065814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Original strand, 17685711 - 17685819
Alignment:
Q  137 ttgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  17685711 ttgatcaagttgcaggtgttgatctaagttgtaaagttgtaa-gttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttatctaa 17685809  T
Q  237 gttgttgaag 246  Q
    ||||||||||    
T  17685810 gttgttgaag 17685819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11854695 - 11854575
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11854695 tgttgttggttatgtgaaatgtttatatgtcttatgaggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgctccgtattaatattgttatgttgtgaattgct 11854596  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    || ||||||| ||||| ||||    
T  11854595 tgagctgtttatgttgctgtt 11854575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15617333 - 15617242
Alignment:
Q  14 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15617333 tgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 15617242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14670977 - 14670908
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14670977 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgttgatt 14670908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41871 - 41813
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41871 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 41813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15465129 - 15465068
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgt 72  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15465129 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttatgttgt 15465068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14499287 - 14499193
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  14499287 tgttgtgggttatgtaaaatattaatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagtggttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 14499193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 16325249 - 16325307
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16325249 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttacgtggaaaatgtatgatgtttaagt 16325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14682476 - 14682407
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  14682476 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaattgacgatgtttaagttgttgttgatt 14682407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24513891 - 24513771
Alignment:
Q  115 ctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtc 214  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||           |||||||||||||| |||    
T  24513891 ctgttgctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattggagtc 24513803  T
Q  215 ttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24513802 ttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 24513771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 24178705 - 24178812
Alignment:
Q  128 tgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgat 227  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  24178705 tgttgaatattaattaatttgcaggtgttggtttaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattggagtcttaaggtgttgat 24178793  T
Q  228 gttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24178794 gttgtctaagttgttgaag 24178812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Original strand, 6805696 - 6805860
Alignment:
Q  36 tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt-ttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgtttctgttgatgttg 132  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||  ||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||||| |||||    
T  6805696 tatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaaagttgttatgttgtgagttgtttatgtgctgcatctgttgttgttg 6805795  T
Q  133 aatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||| || | |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  6805796 aatattaattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgttgttccaaagtatt 6805860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 13026420 - 13026521
Alignment:
Q  37 atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaata 136  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  13026420 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgatta 13026519  T
Q  137 tt 138  Q
    ||    
T  13026520 tt 13026521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 13030012 - 13030113
Alignment:
Q  37 atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaata 136  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || || || ||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  13030012 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttattatgtgaattgcttgtgctgtttctgctgttgttgatta 13030111  T
Q  137 tt 138  Q
    ||    
T  13030112 tt 13030113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5841836 - 5841787
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5841836 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtataagttgttgaag 5841787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14966048 - 14965999
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  14966048 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcaatgttgtctaagttgttgaag 14965999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22652023 - 22651974
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  22652023 ttccaaagtattggagtcttaaattgttaatgttgtctaagttgttgaag 22651974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9577630 - 9577586
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9577630 ttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 9577586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 10542508 - 10542552
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10542508 ttccaaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 10542552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 16979254 - 16979218
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgt 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16979254 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgt 16979218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37427866 - 37427814
Alignment:
Q  34 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt 86  Q
    ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37427866 tatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatt 37427814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15265145 - 15265100
Alignment:
Q  196 attccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  15265145 attccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 15265100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 242
Target Start/End: Original strand, 32403075 - 32403120
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 242  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32403075 ttccaaagtgttggattcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 32403120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15246023 - 15245979
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  15246023 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 15245979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36527804 - 36527756
Alignment:
Q  122 tgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  36527804 tgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 36527756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 45220417 - 45220457
Alignment:
Q  206 attggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45220417 attggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 45220457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 23069349 - 23069557
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23069349 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 23069448  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069449 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagctgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 23069547  T
Q  211 ggtcttaagt 220  Q
     |||||||||    
T  23069548 agtcttaagt 23069557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27472474 - 27472250
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  27472474 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgct 27472375  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  27472374 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 27472286  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27472285 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 27472250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 34874278 - 34874502
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34874278 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 34874377  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  34874378 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 34874466  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34874467 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 34874502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24918165 - 24917979
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24918165 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 24918066  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24918065 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 24917979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21914966 - 21914779
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  21914966 tgttgtaggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttatttaatattgttatgttgagaattgct 21914867  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21914866 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 21914779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 23707354 - 23707578
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23707354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 23707453  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  23707454 tgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 23707542  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23707543 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 23707578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 21081802 - 21081988
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21081802 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttattgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 21081901  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21081902 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 21081988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 22459628 - 22459814
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22459628 tgttgtcggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgttgaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 22459727  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22459728 tgtactgtttcggttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 22459814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24671050 - 24670826
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24671050 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgggttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 24670951  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           |||  |||||||||    
T  24670950 tgtactgtttctgttgctgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttcacaagtattgg 24670862  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24670861 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 24670826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 34492200 - 34492425
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  34492200 tgttgttggttatgtgaaataattatataccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgctttttattaatattgttatgttgagaattgct 34492299  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||          |||||||||||||    
T  34492300 tctgatgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagtcgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattg 34492388  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34492389 gagtcttaagttgttgatgttgtataagttgttgaag 34492425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Original strand, 24316190 - 24316384
Alignment:
Q  50 aaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgc 149  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  24316190 aaaatgtatgatgtttaagttgt-gatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgc 24316288  T
Q  150 aggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  24316289 aggtgttggtctaagttacaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattggagtcttaaattgttaatgttgtctaagttgttgaag 24316384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Original strand, 18358799 - 18358964
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  18358799 tgttgttggttttgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattattatgttgtgaatttct 18358898  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgt 176  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  18358899 tgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaaagttgt 18358964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24681469 - 24681247
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24681469 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcgtcattagtattgttatgttgtgaattgct 24681370  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||           ||||||||||||||    
T  24681369 tgtactgtttctgttgctgttg--tattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttg-caagttttc----------tttccaaagtattgg 24681283  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24681282 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 24681247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 30345138 - 30345258
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30345138 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 30345237  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  30345238 tgtgctgtttctgttgctgtt 30345258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31345171 - 31345051
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||| ||||||||||| | ||    
T  31345171 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttaatgcttcacactaatattgttatgttgtgaattact 31345072  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31345071 tgtgctgtttctgttgctgtt 31345051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 41531151 - 41531271
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41531151 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 41531250  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  41531251 tgtgctgtttatgttgctgtt 41531271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1283348 - 1283228
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1283348 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 1283249  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  1283248 tgtgttgtttctgttgctgtt 1283228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 198
Target Start/End: Original strand, 20320723 - 20320850
Alignment:
Q  70 tgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgta 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  || |||||    
T  20320723 tgttgatgcttttcattaatattgtcatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgaatactgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgta 20320822  T
Q  170 aagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20320823 aagttat-aagttgtcgttccaaagtatt 20320850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 24628626 - 24628720
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  24628626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 24628720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27601755 - 27601661
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  27601755 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 27601661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 12901661 - 12901753
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12901661 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 12901753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 10101792 - 10101886
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  10101792 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgtttcacattaatattgttatgttgtgaa 10101886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24649316 - 24649222
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  24649316 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgcttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 24649222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Original strand, 27379580 - 27379670
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  27379580 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 27379670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Original strand, 27383626 - 27383716
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  27383626 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttg 27383716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9784736 - 9784667
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  9784736 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaaattgttgttgatt 9784667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Original strand, 27485345 - 27485422
Alignment:
Q  170 aagttgtaaagttgtcgttccaaagtattc-caaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27485345 aagttgtaaagttgtctttccaaagtgttttcaaagtattggggtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 27485422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 13101762 - 13101811
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13101762 ttccaaagtattggagtcttaaatggttgatgttgtctaagttgttgaag 13101811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 39828109 - 39828153
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39828109 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 39828153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20915386 - 20915214
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattat--atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt-ttcattaatattgatatgttgtgaaat 107  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  || || |||||| || ||| ||||||||||  |    
T  20915386 tgttgttagttatgtgatatagttatttatgcattatgtggaatatgtatgatgttgtagttgttattgtttattcatttatgttgttatgttgtgagtt 20915287  T
Q  108 gctt--gtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaa 178  Q
    | ||  ||| || |||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||  |||||  ||||||||||    
T  20915286 gtttatgtgttgcttctgttgttgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaa 20915214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Original strand, 39827952 - 39828002
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 73  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39827952 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 39828002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34136945 - 34136901
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34136945 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 34136901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Original strand, 24815507 - 24815593
Alignment:
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  24815507 tgtgctgcgtctgttgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgtagttccaaagtatt 24815593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 21073608 - 21073652
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  21073608 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 21073652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48603507 - 48603263
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||  || ||||    
T  48603507 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgatggaaattgct 48603408  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48603407 tgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgttaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattcaaaagtattgg 48603309  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603308 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 48603263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51326847 - 51326612
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51326847 tgttgttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 51326748  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagt-attccaaagtattg 209  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  51326747 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtataagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattg 51326649  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  51326648 gagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 51326612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 22130972 - 22131205
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttt-aagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||            |||||||| |||    
T  22130972 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttttaagttgttgatgcttctcat------------gttgtgaattgc 22131059  T
Q  110 ttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22131060 ttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaa-gttctcgttccaaagtattccaaagtactg 22131158  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131159 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 22131205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 50000817 - 50000593
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50000817 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgtgaattgct 50000718  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  50000717 tgtgctatttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagtggtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 50000629  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50000628 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 50000593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 27653288 - 27653522
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  27653288 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtagaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 27653387  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  27653388 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagatgcagatgttggtctaagttataaagttgt-aagttgtctttccaaagtgtttcaaagtattgg 27653486  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  27653487 agtcttaagttgataatgttgtctaagttgttgaag 27653522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 29764346 - 29764571
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29764346 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgttttcaattaatattgttatgttgtgaattgct 29764445  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||          |||||||||||||    
T  29764446 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattg 29764534  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29764535 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 29764571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48520563 - 48520380
Alignment:
Q  14 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgt 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48520563 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtataatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgcttgt 48520464  T
Q  114 gctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48520463 gctgtttctattgccgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaaattgtaaagttg-caagttgtcgttccaaagtatt 48520380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 46198433 - 46198590
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46198433 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgaggcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 46198532  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt 168  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  46198533 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 46198590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12271609 - 12271423
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12271609 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaattttgttatgctgtgaattgct 12271510  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12271509 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 12271423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 33797576 - 33797456
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33797576 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 33797477  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  33797476 tgtgctgtttctgttgctgtt 33797456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 13881447 - 13881542
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13881447 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaaa 13881542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 1925276 - 1925396
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1925276 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 1925375  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1925376 tgtgctgtttctgttgctgtt 1925396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20924290 - 20924410
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20924290 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 20924389  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20924390 tgtgctgtttctgttgctgtt 20924410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20228956 - 20229076
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20228956 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 20229055  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20229056 tgtgctgtttctgttgctgtt 20229076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20316619 - 20316505
Alignment:
Q  83 cattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagtt 182  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||    
T  20316619 cattgatattgacatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagtttcaggtgttggtctaaattgtaaagttgt-aagtt 20316521  T
Q  183 gtcgttccaaagtatt 198  Q
     |||||||||||||||    
T  20316520 atcgttccaaagtatt 20316505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1010682 - 1010588
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  1010682 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 1010588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 16375606 - 16375700
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  16375606 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 16375700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21407314 - 21407220
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  21407314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 21407220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Original strand, 636042 - 636165
Alignment:
Q  122 tgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtg 221  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  636042 tgttgctgttgtatattgatcaagttgtacgtgttggtctaagttgtaaagttgtaa-gttgtctttctaaagtattccaaagtattggattcttaagtt 636140  T
Q  222 gttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  636141 cttgatgttgtctaagttcttgaag 636165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 52639500 - 52639406
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  52639500 tgttgttggttatgtgaaatatttatacgccttatgtggaagatgtttgatgtctaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 52639406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 41781654 - 41781724
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgg-aaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41781654 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaaatgtacgatgtttaagttgttgttgatt 41781724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 11809492 - 11809541
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11809492 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 11809541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23073042 - 23072993
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23073042 ttccaaagtattggagacttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 23072993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 25263084 - 25263133
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25263084 ttccaaagtattggagtcttaagttgtttatgttgtctaagttgttgaag 25263133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 43630375 - 43630424
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  43630375 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttttctaagttgttgaag 43630424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14800534 - 14800490
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14800534 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 14800490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14809408 - 14809364
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14809408 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 14809364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20958113 - 20958069
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20958113 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 20958069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 21043397 - 21043441
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21043397 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 21043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43543183 - 43543133
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgat 61  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43543183 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 43543133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23967719 - 23967675
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  23967719 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 23967675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28312519 - 28312475
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  28312519 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 28312475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47190606 - 47190566
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaag 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47190606 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttatctaag 47190566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48520337 - 48520293
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  48520337 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 48520293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 2779 - 3013
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2779 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 2878  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2879 tgtactgtttctgttgctcttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattgg 2977  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2978 attcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 3013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 120063 - 119842
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  120063 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattattatgttgtgaattgct 119964  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119963 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtatagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 119865  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtc 233  Q
     ||||||||| ||||||||||||    
T  119864 agtcttaagttgttgatgttgtc 119842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 117236 - 117192
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  117236 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctatgttgt 117192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 117182 - 117138
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  117182 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 117138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22805987 - 22805758
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22805987 tgttgttggttatgtgaaatatttatattcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 22805888  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22805887 cgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcattccaaagtatcccaaagtattgg 22805789  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22805788 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 22805758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 19773608 - 19773843
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19773608 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 19773707  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19773708 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgtaggtgtt-gtctaagttgt---------aagttatcgttccaaagtattccaaagtattgg 19773797  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19773798 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgatgaagatgatgatgt 19773843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18914005 - 18913775
Alignment:
Q  6 tttggtgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18914005 tttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaa 18913906  T
Q  106 atgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaag 204  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||          ||||||||    
T  18913905 ttgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaag 18913817  T
Q  205 tattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18913816 tattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 18913775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18937263 - 18937033
Alignment:
Q  6 tttggtgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18937263 tttgatgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgagaa 18937164  T
Q  106 atgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaag 204  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||          ||||||||    
T  18937163 ttgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaag 18937075  T
Q  205 tattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18937074 tattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 18937033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 15705509 - 15705695
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15705509 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtataagttgatgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 15705608  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15705609 tgtgctgtttctgttgctgtttaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 15705695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 15174163 - 15174388
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | ||    
T  15174163 tgttgttggttatgtgaaataattatatgacttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattact 15174262  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||          |||||||||||||    
T  15174263 tgtgctatttatgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattg 15174351  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15174352 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 15174388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 17377863 - 17378087
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17377863 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17377962  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  17377963 tgtattgtttctgttgttgttgtatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 17378051  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17378052 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 17378087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 28103964 - 28104151
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28103964 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 28104063  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaag-ttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28104064 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagtttcaggtgttggtctaagtttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 28104151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 15817587 - 15817771
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15817587 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtagttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 15817686  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    | || |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15817687 tttg-tgtttct-atgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 15817771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15875435 - 15875253
Alignment:
Q  14 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15875435 tgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgataattttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgt 15875336  T
Q  114 gctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtat 197  Q
    | ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  15875335 gttgtttctgttgctgttacatattgatcaagttgcaagtgttggtctatgttgtaaaattgt-aagttgtctttccaaagtat 15875253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17743432 - 17743246
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17743432 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 17743333  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  17743332 tgtgttgtttctattgctgttgaagattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttg-caggttgtcgttccaaagtatt 17743246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 27416005 - 27416125
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27416005 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 27416104  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  27416105 tgtgctgtttctgttgctgtt 27416125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23414939 - 23414819
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23414939 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 23414840  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  23414839 tgtgctgtttctgttgctgtt 23414819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27556697 - 27556577
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27556697 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 27556598  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  27556597 tgtgctgtttctgttgctgtt 27556577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 18917413 - 18917533
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18917413 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 18917512  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  18917513 tgtgctgtttctgttgctgtt 18917533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 14979453 - 14979548
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14979453 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgattttcattaatattgttatgttgcgaaa 14979548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 19656076 - 19656297
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattata--tgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatg 108  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || ||||||||| |||| |||||| ||    
T  19656076 tgttgttagtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 19656175  T
Q  109 cttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtatt 208  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||    
T  19656176 catgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtcaaagttgtaaagttgtaa-gttgtc----------attccaaagtatt 19656264  T
Q  209 ggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19656265 ggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 19656297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16760254 - 16760134
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16760254 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 16760155  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16760154 tgtgctgtttctgttgctgtt 16760134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 31477957 - 31478077
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31477957 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 31478056  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31478057 tgtgctgtttctgttgctgtt 31478077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22949067 - 22948952
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22949067 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 22948968  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  22948967 tgtgctgtttctgttg 22948952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1644667 - 1644547
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1644667 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgct 1644568  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1644567 tgtgctgtttctgttgctgtt 1644547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22953023 - 22952908
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  22953023 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 22952924  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  22952923 tgtgctgtttctgttg 22952908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23871511 - 23871396
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23871511 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 23871412  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  23871411 tgtgctgtttctgttg 23871396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23875467 - 23875352
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23875467 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgagaattgct 23875368  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  23875367 tgtgctgtttctgttg 23875352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 18955910 - 18956025
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| |||     
T  18955910 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 18956009  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    || |||||||||||||    
T  18956010 tgcgctgtttctgttg 18956025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8243820 - 8243726
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  8243820 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 8243726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11566821 - 11566727
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11566821 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 11566727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19870549 - 19870455
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19870549 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 19870455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22862905 - 22862811
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22862905 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 22862811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23395027 - 23394933
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  23395027 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 23394933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23989879 - 23989785
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  23989879 tgttgttggttaggtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 23989785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14472230 - 14472115
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||  ||   | |||||||| ||||||||||| |||     
T  14472230 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtataatgttgaagttattgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 14472131  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  14472130 tgtgctgtttctgttg 14472115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18696542 - 18696480
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 73  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696542 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 18696480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23956206 - 23956148
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956206 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 23956148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18706360 - 18706301
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 70  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18706360 tgtttttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagtt 18706301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 12618991 - 12619083
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  12618991 tgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaa 12619083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23538801 - 23538745
Alignment:
Q  92 tgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttg 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23538801 tgatatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttg 23538745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17105865 - 17105771
Alignment:
Q  53 atgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttg 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  17105865 atgtatgatgttaaagt-gttgatgtttgtcattattattgatatgttgagaattgcctgtgttgtttctgttgctgttgaacattgatcaagttg 17105771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 104
Target Start/End: Original strand, 18259926 - 18259989
Alignment:
Q  42 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaat-attgatatgttgtga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  18259926 ttatgtggaaaatgtatgatgttcaagttgttgttgattatcattgatcattgttatgttgtga 18259989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 22376621 - 22376774
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataat--tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt-aatattgatatgttgtgaaat 107  Q
    |||||||||| |||||| ||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||  |    
T  22376621 tgttgttggtaatgtgatatagtaatatatgtattatgtgaaaaatgtatgatgttgaggttgttgttgattaccattgattattgttatgttgtgagtt 22376720  T
Q  108 gctt--gtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggt 159  Q
    ||||  ||||||  |||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22376721 gcttacgtgctgcctctgctgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggt 22376774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Original strand, 20411532 - 20411696
Alignment:
Q  36 tatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt-ttcattaatattgatatgttgtgaaatgctt--gtgctgtttctgttgatgttg 132  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||  || || ||||||||  ||| ||||||||||  || ||  ||||||  ||||||| |||||    
T  20411532 tatgcattatgtggaatatgtatgatgttggagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagctgtttatgtgctgcctctgttgttgttg 20411631  T
Q  133 aatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||| || | |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20411632 aatattaattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgttgttccaaagtatt 20411696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18927778 - 18927729
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  18927778 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtcgttgaag 18927729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28708529 - 28708480
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28708529 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtataagttgttgaag 28708480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 20078286 - 20078330
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20078286 ttccaaagtactggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 20078330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 27573163 - 27573207
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27573163 ttccaaagtatttgagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 27573207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18453184 - 18453143
Alignment:
Q  200 caaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18453184 caaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 18453143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20136851 - 20136770
Alignment:
Q  6 tttggtgttgttggttatgtgaaataattatatgcc-ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt 86  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20136851 tttgatgttgttagttatgtgatataattgtatatcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatt 20136770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Original strand, 22196018 - 22196099
Alignment:
Q  6 tttggtgttgttggttatgtgaaataattatatgcc-ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt 86  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22196018 tttgatgttgttagttatgtgatataattgtatatcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatt 22196099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17743203 - 17743159
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  17743203 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 17743159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23538730 - 23538690
Alignment:
Q  201 aaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23538730 aaagtattggagtcttaagtcgtcgatgttgtctaagttgt 23538690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23538849 - 23538798
Alignment:
Q  27 aaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgat 79  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23538849 aaatatttatataccttatgtgaaaaatgtatgatg-ttaaggtgttgatgat 23538798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 27573109 - 27573153
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27573109 ttccaaagtattggagtcttaagttattgacgttgtctaagttgt 27573153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 17048200 - 17048434
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17048200 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 17048299  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||    
T  17048300 tgtgctgtttctgttgttgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattgg 17048388  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048389 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 17048434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 13591992 - 13592213
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13591992 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgatgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 13592090  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||          ||||||||||||||    
T  13592091 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgaaggtgttggtctaagttgtagagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattgg 13592179  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 244  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13592180 agtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttga 13592213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15008309 - 15008122
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15008309 tgttgttggttatgtgaaataattatatatcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 15008210  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15008209 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcgtttcaaagtatt 15008122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 10694955 - 10695142
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10694955 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10695054  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10695055 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtccaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 10695142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 10908721 - 10908908
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10908721 tgttgttggttatgtaaaataattatattccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatatttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10908820  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10908821 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtccaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 10908908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 15884123 - 15884348
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  15884123 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgttatgttgagaattgct 15884222  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||  |||| || |||||||||          ||||||| |||||    
T  15884223 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagatgtctaagtcgt-aagttgtcg----------ttccaaattattg 15884311  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15884312 gaatcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 15884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 14746649 - 14746835
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14746649 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 14746748  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  14746749 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttttctttccaaagtatt 14746835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 15497101 - 15497326
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  15497101 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgagaattgat 15497200  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||    ||||      |||||||||||||    
T  15497201 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgattaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagtt----ttcc------ttccaaagtattg 15497289  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15497290 gagtcttaagttgttgatgttgtctaaattgttgaag 15497326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40619872 - 40619717
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  40619872 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaggttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 40619773  T
Q  113 tgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt 168  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  40619772 tgctgtttctgttactgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgt 40619717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 43256224 - 43256344
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43256224 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgatatgttgtgaattgct 43256323  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  43256324 tgtgctgtttctgttgctgtt 43256344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19857576 - 19857417
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  19857576 tgttgttggttatgtgaaatgttcataagccttatgtggagaatatatgatatttaagttgttgatgtttttcattaatattgtcatgttgtgaattact 19857477  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19857476 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaggatgcaggtgttggtttaagttgtaa 19857417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 53631320 - 53631541
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattata--tgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatg 108  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || ||||||||| |||| |||||| ||    
T  53631320 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 53631419  T
Q  109 cttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtatt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||    
T  53631420 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaa-gttgtc----------attccaaagtatt 53631508  T
Q  209 ggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  53631509 ggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 53631541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26013498 - 26013350
Alignment:
Q  51 aaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgat--gttgaatattgatcaggttg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  26013498 aaatgtatgatgcttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgggttgcatattgatcaagttg 26013399  T
Q  149 caggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26013398 cagatgttggtttaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 26013350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 14954314 - 14954429
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14954314 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 14954413  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  14954414 tgtgctgtttctgttg 14954429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25689829 - 25689714
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25689829 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 25689730  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  25689729 tgtgctgtttctgttg 25689714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10712815 - 10712695
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10712815 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgct 10712716  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  10712715 tgtgctgtttctgttgctgtt 10712695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10926585 - 10926465
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  10926585 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttgtgttgtgaattgct 10926486  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  10926485 tgtgctgtttctgttgctgtt 10926465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27533985 - 27533870
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| |||     
T  27533985 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 27533886  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  27533885 tgtgctgtttctgttg 27533870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12487670 - 12487550
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12487670 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 12487571  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  12487570 tgtgctgtttctgttgctgtt 12487550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9556489 - 9556395
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  9556489 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 9556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 14757569 - 14757663
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  14757569 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 14757663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 4561481 - 4561575
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||    
T  4561481 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaataatgttatgttgtgaa 4561575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17810231 - 17810137
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  17810231 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 17810137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 5757085 - 5757177
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||    
T  5757085 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttggtgcttcacattaatattgttatgttgtg 5757177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14650866 - 14650716
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||    
T  14650866 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 14650767  T
Q  121 -ctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
     |||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||  |||||||||    
T  14650766 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaa 14650716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28385587 - 28385529
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28385587 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 28385529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 33742337 - 33742245
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  33742337 tgttgttggttatgtgaaatatttatgt--cttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgctgtgaa 33742245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19738399 - 19738234
Alignment:
Q  34 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt-ttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgtttctgttgatgt 130  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||  ||| |||||||||| ||| |  |||||||  ||||||| | |    
T  19738399 tatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattaacgttgttatgttgtgagatgtttatgtgctgcctctgttg-ttt 19738301  T
Q  131 tgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  19738300 tgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgttgttccaaagtatt 19738234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10056693 - 10056650
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaat 54  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10056693 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaat 10056650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Original strand, 13592219 - 13592273
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgat 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  13592219 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagtagttcaagttgat 13592273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9923251 - 9923202
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9923251 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtcgttgaag 9923202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 15990355 - 15990254
Alignment:
Q  37 atgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaata 136  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| | || || || ||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||    
T  15990355 atgcattatgtggaatatgtatgatgttgatgttgtggttgtttatcgttaatattgttataatgtgaattgcttgtgttgtttctgctgttgttgatta 15990256  T
Q  137 tt 138  Q
    ||    
T  15990255 tt 15990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 246
Target Start/End: Original strand, 11479612 - 11479657
Alignment:
Q  201 aaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  11479612 aaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagtcgttgaag 11479657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15791776 - 15791739
Alignment:
Q  200 caaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaag 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15791776 caaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaag 15791739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 24047415 - 24047459
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  24047415 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgaccaagttgt 24047459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 50160340 - 50160269
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatat--gccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||  |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  50160340 tgttgttggtgatgtgatatagttatatatgtgttatgtggaaaatgtatgaagttgaagttgttgttgatt 50160269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 17461118 - 17461349
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17461118 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtaagatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17461217  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17461218 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtttgtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattgg 17461316  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 243  Q
     ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  17461317 agtcttaagttgttaatgatgtctaagttgttg 17461349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23478422 - 23478199
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttg 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23478422 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtttatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgcttg 23478323  T
Q  113 tgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggg 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||  ||||| | |||||||||          ||||||||||||||     
T  23478322 tgctgtttcttttgatgttgaatattgatcaagttggagatgttggtttaagttgtctaagttat-aagttgtcg----------ttccaaagtattgga 23478234  T
Q  212 gtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23478233 gtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 23478199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37515760 - 37515574
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37515760 tgttgttggttatgtgaaatatttatgtgccttatgtggaaaaagtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgatatgttgtgaattgct 37515661  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37515660 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtagagttg-caagttgtcgttccaaagtatt 37515574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18833617 - 18833431
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18833617 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttttttatgcttctcattaatattgatatgttgtgaattgct 18833518  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18833517 tgtgctgtttatgttgttgttgaatattgatcaagttgtaggagttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccgaagtatt 18833431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19880172 - 19879985
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  19880172 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatttttatgttgagaattgct 19880073  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19880072 tgtgttgtttctgttgatgttgaatattgaccaagttgcagatgttggtttaagtggtctgagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 19879985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 22238085 - 22238308
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22238085 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaa-tgtatgatgtttaagttgttgatcctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 22238183  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  22238184 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 22238272  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22238273 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 22238308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26454054 - 26453867
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26454054 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 26453955  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagtt-gtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26453954 tgtgttgtttctgttgcagttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttggctaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 26453867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23409850 - 23409626
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23409850 tgttgttggttatgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatatttaagttgttgatgttcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 23409751  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  23409750 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 23409662  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23409661 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 23409626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 19808430 - 19808595
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttg 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  19808430 ttgttggttatgtgaaatatttatatgcctcatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatatttttatgttgtgaattgcttg 19808529  T
Q  113 tgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaa 178  Q
    |  || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19808530 taatggttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaa 19808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 19929556 - 19929717
Alignment:
Q  11 tgttgttggttat-gtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgc 109  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  19929556 tgttgttgattattgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattaatattgttatgctgtgaattgc 19929655  T
Q  110 ttgtgctg-tttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  19929656 ttgtgctgttttatgttgctgttgaatattaattaagttgcaagtgttggtccaagttgtaa 19929717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5760705 - 5760550
Alignment:
Q  42 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgat 141  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760705 ttatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtagttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattgcttgtgttgtttctgttgttgttgaatattgat 5760606  T
Q  142 caggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    || |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5760605 caagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcattccaaagtatt 5760550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 21828161 - 21828281
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21828161 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 21828260  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21828261 tgtgctgtttctgttgctgtt 21828281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 44384821 - 44384969
Alignment:
Q  97 tgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagta 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||              
T  44384821 tgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagtcgtcg---------- 44384909  T
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384910 ttccaaagtattggagtcttaagctgttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 44384969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 18862792 - 18862907
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18862792 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 18862891  T
Q  111 tgtgctgtttctgttg 126  Q
    ||||||||||||||||    
T  18862892 tgtgctgtttctgttg 18862907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22353019 - 22352905
Alignment:
Q  83 cattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagtt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22353019 cattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagtt 22352921  T
Q  183 gtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||||||||||||||||    
T  22352920 gtcgttccaaagtatt 22352905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23659462 - 23659371
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23659462 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgtttttcattaatattgttatgttgt 23659371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21410909 - 21410789
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21410909 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 21410810  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21410809 tgtgctgtttctgttgctgtt 21410789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21805401 - 21805281
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21805401 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 21805302  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21805301 tgtgctgtttctgttgctgtt 21805281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 21976817 - 21976911
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  21976817 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 21976911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22111890 - 22111796
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  22111890 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 22111796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43251772 - 43251678
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  43251772 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 43251678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 95
Target Start/End: Original strand, 16402068 - 16402152
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgat 95  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16402068 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatactcttcattaatattgat 16402152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 19278430 - 19278524
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  19278430 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttctgaa 19278524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23914092 - 23914023
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23914092 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtacgatgtttaagttgttgttgatt 23914023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 8414418 - 8414476
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8414418 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 8414476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11775066 - 11775008
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11775066 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 11775008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 14397928 - 14398040
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  14397928 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgc--------gaagatgtatgatgtttaagttgttgttgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 14398019  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  14398020 tgtgctgtttctgttgctgtt 14398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 21972732 - 21972788
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21972732 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaa 21972788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37515534 - 37515487
Alignment:
Q  195 tattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37515534 tattccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 37515487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16799491 - 16799437
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgat 251  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16799491 ttccaaagtatttgagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgtttaagttgat 16799437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5760562 - 5760517
Alignment:
Q  196 attccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5760562 attccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 5760517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Original strand, 18302800 - 18302886
Alignment:
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  18302800 tgtgttgtctctgttgttgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgttgttccaaagtatt 18302886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 22253280 - 22253324
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  22253280 ttccaaagtattggagtcttaagatgttgatgttgtccaagttgt 22253324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28397555 - 28397511
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28397555 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 28397511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Original strand, 22107500 - 22107734
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22107500 tgttgttggttatgtcaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgct 22107599  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||          ||||||||||||||    
T  22107600 tgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattgg 22107688  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22107689 agtcttaagttgttgatgttgtctaagtttttgaagataatgatgt 22107734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17011069 - 17010844
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17011069 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 17010970  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||          |||||||||||||    
T  17010969 tgtgctgcttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgccg----------ttccaaagtattg 17010881  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17010880 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 17010844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 263201 - 263015
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  263201 tgttgttggttatgtgaaataattatgtgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 263102  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | |||  ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  263101 tgtgctgtttctgttgttgttgcatatagatcaagttgcaggtataggtctaagttgtaaaaatgt-aagttgtctttccaaagtatt 263015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6765883 - 6765684
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6765883 tgttgttggttgtgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 6765784  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagt-attccaaagtattg 209  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  6765783 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcatgtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattg 6765685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 33895711 - 33895897
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33895711 tgttgtgggttttgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaactgct 33895810  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  33895811 tgtgctgtttatgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtattggtctaagttgtaaagtcgt-aagttgttgttccaaagtatt 33895897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29448058 - 29447838
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttg-ttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29448058 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaa-tgtataatgtttaaattgattgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 29447960  T
Q  110 ttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    ||||| || | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           |||||||||||||    
T  29447959 ttgtgttgctcctgttgatgttgagtattgattaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattg 29447871  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgtt 242  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29447870 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgtt 29447838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18356251 - 18356131
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  18356251 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttgagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 18356152  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  18356151 tgtgatgtttctgttgctgtt 18356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20910982 - 20911102
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  20910982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgtt 20911081  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  20911082 tgtgttgtttctgttgctgtt 20911102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 10753321 - 10753203
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10753321 ttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgctatgttgtgaattgcttg 10753222  T
Q  113 tgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  10753221 tgctgtttctgttgttgtt 10753203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 40723734 - 40723854
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  40723734 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataatagtattgttatgttgtgaattgct 40723833  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  40723834 tgtgttgtttctgttgctgtt 40723854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 15236982 - 15237076
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  15236982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 15237076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 19472867 - 19472961
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  19472867 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 19472961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20295806 - 20295712
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  20295806 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 20295712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 33473272 - 33473330
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473272 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 33473330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18356370 - 18356296
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt 86  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18356370 tgttgttggttatctgaaatatttatatgctttat-tggaaaatgtatgatgtttaagttgttgttgattatcatt 18356296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 20910863 - 20910937
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt 86  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  20910863 tgttgttgattatgtgaaatatttatatgccttat-tggaaaatgtatgatgtataagttgttgttgattatcatt 20910937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11220634 - 11220587
Alignment:
Q  84 attaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11220634 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11220587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11225220 - 11225173
Alignment:
Q  84 attaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11225220 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11225173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11229043 - 11228996
Alignment:
Q  84 attaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11229043 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 11228996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19076389 - 19076340
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19076389 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtttaagttgttgaag 19076340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 41861578 - 41861627
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41861578 ttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 41861627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11231032 - 11230985
Alignment:
Q  84 attaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  11231032 attaatattgttatgttgtgaattgcttgtgttgtttctgttgctgtt 11230985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23469808 - 23469766
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 239  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23469808 ttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaagtt 23469766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 592 - 365
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  592 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaaaatgtacgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 493  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  492 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagctgtaaagttgt-aagttgtctttcaaaagtgttccaaactattgg 394  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagtt 239  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  393 agtcttaagttgttaatgttgtctaagtt 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3627
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3393 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgaattatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 3492  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| | | ||| || ||||||||| |||||||||||||     
T  3493 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcagatgttggtctaagttgtaaagttct-atgttttctttccaaagtgttccaaagtattga 3591  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3592 agtcttaagttgttattgttgtctaagttgttgaag 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 1940 - 2174
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1940 tgttattggttatgtgaaatatttatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatacttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 2039  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||     
T  2040 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttacaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtatttgcaaagtgttccaaagtattga 2138  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  2139 agtcttaagttgttaatgttgtctatgttgttgaag 2174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 85600 - 85367
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  85600 tgttgttggttatgtgaaatgttcagatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 85501  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagt-attccaaagtattg 209  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  85500 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagatgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgtttccaaagtattg 85402  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttga 244  Q
    | || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  85401 gagtattaagttgttaatgttgtctaagttgttga 85367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15797 - 15565
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaata-attatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgc 109  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15797 tgttgttggttatgtgaaaaatattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgc 15698  T
Q  110 ttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15697 ttgtattgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaagtgttggtcgaatttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattg 15599  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttg 243  Q
    | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  15598 gagtcttaagttgttaatgatgtctaagttgttg 15565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 472 - 286
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| | ||    
T  472 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttacgtcgtgaatttct 373  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  372 tgtgctgtttctattgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 7007 - 7231
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  7007 tgttgttggttatgtgaaatatgtatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 7106  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  7107 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 7195  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7196 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 7231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5615
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  5802 tgttgttggttatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatatagttatgttgtgaattgct 5703  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5702 tgtgatgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 5615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 53904 - 54128
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53904 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 54003  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||||||||||||||    
T  54004 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttccaaagtattgg 54092  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  54093 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 54128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10340
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10564 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttta-gtttttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 10466  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattg 209  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||          |||||||||||||    
T  10465 tgtgctatttctgttgctgttgaatattcatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcg----------ttccaaagtattg 10377  T
Q  210 gggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10376 gagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 10340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33261 - 33074
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  33261 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgcttttaattaatattgttatgttgagaattgct 33162  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33161 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcagatgttggtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 169815 - 170001
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  169815 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 169914  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  169915 tgtactgtttctgttactgttacatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 170001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 241
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13671
Alignment:
Q  59 gatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13490 gatgtttaagttgttgatgcttctcattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctattgaatattgatcaagttgcatgtgttgg 13589  T
Q  159 ttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13590 tctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggagtctaaagttgttgatgttgtctaagttgt 13671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 210
Target Start/End: Original strand, 10155 - 10348
Alignment:
Q  16 ttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgc 115  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |    
T  10155 ttggttatgtgaaatgtttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaattttgttattttgtgaattgcttgtac 10254  T
Q  116 tgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10255 tgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgcaaagttgt-aagttgtctttccaaagtgttccaaagtattgg 10348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Original strand, 15480 - 15560
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatat 91  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  15480 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcgcattaatat 15560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36185 - 36141
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36185 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 36141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 22477 - 22664
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  22477 tgttgttgattatgtgaaataattatatgtcttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 22576  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt-aaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22577 tgtgctgtttttgttgctgttgaatatttatcaagttgcagatgtttgtttaagttgtctaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 22664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Original strand, 17032 - 17076
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  17032 ttccaaagtattggagtcctaagttgatgatgttgtctaagttgt 17076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1544
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1358 tgttgttggctatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgttaaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 1457  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1458 tgtactgtttttgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 1544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4188
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaaaattgt-aagttgtctttccaaagtatt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4374 - 4188
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4374 tgttgttggttatatgaaattattatatgtcttatgtggaaaatgtctgatgtttaagttgttgatgtttttcattaatattgttatgttgtgaattgct 4275  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  4274 tgtgttgtttctgttgctgttgcatattgatcaaattgcaggtgttggtctaagttgtaaaattgt-aagttgtctttccaaagtatt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15056 - 14906
Alignment:
Q  7 ttggtgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| || | | | ||| |||||||||||| ||  ||     
T  15056 ttggtgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgggaaaaatgtatgatgttaaagttgtagacgctctccataaatattgatatgatgaaaat 14957  T
Q  107 tgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttg 157  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  14956 tgcttgcactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagtcgcacgtgttg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 1231 - 1417
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1231 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaattgct 1330  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1331 tgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgcatgggttgacctaagttttaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 1417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 7982 - 8168
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  7982 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaaattgttgatgcttttcattaatattgttaagttgtgaattgct 8081  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8082 tgtgttgtttctgttgctgttcaatattgatcaagttgcatgggttgacctaagttttaaagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 8168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7889 - 7704
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  7889 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgaagtt-aagtggttgatgcttctcattaatattgacatgttgtgaattgtt 7791  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7790 tgtgttgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttgctctaaattgtaaagttat-aagttgtcgttccaaagtatt 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7660 - 7615
Alignment:
Q  196 attccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  7660 attccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 24663 - 24847
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24663 tgttgatggttatgtgaaatatttatatgccttatctggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg-ctttcattaatattgttatgttctgaattgct 24761  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24762 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgtt-gtttaagttgtaaagtt-tgaagttgtctttccaaagtatt 24847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 67316 - 67130
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  67316 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgaataatgtgaaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgttgtgaattgct 67217  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  67216 tgtactgtttctgttgttgttgcatattgatccagttgcaggtgttggtctaagttataaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 67130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 614 - 465
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  614 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattattatgttgtgaattgct 515  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggtt 160  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  514 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtt 465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21221 - 21064
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  21221 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttctcagtaatattgttatgttgtgaattgct 21122  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgt 168  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  21121 tgtgctatttttgttgctgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt 21064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21061 - 21017
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21061 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 21017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21007 - 20963
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  21007 ttccaaagtattggagtcttaagttgtcgatgttgtccaagttgt 20963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 70536 - 70754
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  70536 tgttcttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatatatgatgtttaagttgttgatgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 70635  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    |||| ||||||      ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||           ||| ||||||||||    
T  70636 tgtgttgtttc------tgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaaattgt-aagttgtc----------tttcaaaagtattgg 70718  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  70719 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 70754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 6968 - 7192
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || | |||| | ||||    
T  6968 tgttgttggttatgtgaaatttttatatgcgttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatactgttacgatgtgtattgct 7067  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattgg 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||           ||| |||| |||||    
T  7068 tgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtc----------tttcaaaagaattgg 7156  T
Q  211 ggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7157 agtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 7192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 6851 - 7004
Alignment:
Q  44 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6851 atgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgctcttcattaatattgttatgatgtgaattgcttgtactgtttctgttgttgttgcatattgatca 6950  T
Q  144 ggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  6951 agttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaatgtatt 7004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4383
Alignment:
Q  6 tttggtgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatg 59  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  4330 tttgctgttgttggttatgtgaaatatttatatacgttatgtggaaaatgtatg 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 35
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  214 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttaggtggaaaatgtatgatgtttaagttgttggtgcttttcattaatattgttatgttgtgaattgtt 115  T
Q  111 tgtgctgtttc------tgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgt 184  Q
    ||| |||||||      ||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  114 tgtactgtttctgtttctgttgctgttgcatattaagcaagttgcaggtgttggtctaatttgtaaagttgtaaagttgt 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 71356 - 71236
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  71356 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 71257  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  71256 tgtgctgtttctgttgctgtt 71236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1535
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattata--tgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatg 108  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || ||||||||| |||| |||||| ||    
T  1314 tgttgttggtaatgtgatatacttatacatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgtggttgtttatcgttaatattgttatgatgtgaattg 1413  T
Q  109 cttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtatt 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||    
T  1414 cttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaa-gttgtc----------attccaaagtatt 1502  T
Q  209 ggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1503 ggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20773 - 20652
Alignment:
Q  95 tatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaag 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20773 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgttgaatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtcgttccaaag 20675  T
Q  195 tattccaaagtattggggtctta 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  20674 tattccaaagtattggagtctta 20652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20805 - 20769
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgt 47  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20805 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgt 20769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Original strand, 7481 - 7567
Alignment:
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7481 tgtgctgcgtctgttgttgttgaatattgattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgtagttccaaagtatt 7567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3632 - 3514
Alignment:
Q  137 ttgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaa 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3632 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaa-gttgtcgttccaaagtattcgaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 3534  T
Q  237 gttgttgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3533 gttgttgaagatgatgatgt 3514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7696 - 7578
Alignment:
Q  137 ttgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaa 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7696 ttgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaa-gttgtctttccaaagtattctaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtctaa 7598  T
Q  237 gttgttgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7597 gttgttgaagatgatgatgt 7578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 20276 - 20396
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20276 tgttgttggttatgtgaaatatttatataacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 20375  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20376 tgtgctgtttctgttgctgtt 20396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31178 - 31058
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31178 tgttgttagttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttttgaattgct 31079  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31078 tgtgctgtttctgttgctgtt 31058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 36233 - 36353
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36233 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 36332  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  36333 tgtgctgtttctgttgctgtt 36353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 207649 - 207769
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  207649 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatcttgtgaattgct 207748  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  207749 tgtgctgtttttgttgctgtt 207769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 189524 - 189644
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  189524 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 189623  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  189624 tgtgctgtttctgttgctgtt 189644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15625 - 15449
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  15625 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgatgtgaattgcttatgtgctgttt 15526  T
Q  121 -ctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
     ||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15525 cctaatgttgttgaatattaatcaagttgcaggtgttggtctaagttgt-aagttgt-aagttgtcgttccaaagtatt 15449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 14234 - 14354
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14234 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtggaagatatatgatgtttaagttgttgatactttatattaatattgttatgttgtgaattgct 14333  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  14334 tgtgctgtttctgttgctgtt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39307 - 39205
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39307 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgct 39208  T
Q  111 tgt 113  Q
    |||    
T  39207 tgt 39205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 354 - 234
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  354 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 255  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  254 tgtgctgtttctgttgctgtt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 11648 - 11768
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11648 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 11747  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  11748 tgtgctgtttctgttgctgtt 11768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 78388 - 78234
Alignment:
Q  81 ttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaag 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  78388 ttcattaatattgctatgttgtgaattgcttgtactgtttctgttgctgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aag 78290  T
Q  181 ttgtcgttccaaagtattccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
     ||||           |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  78289 ctgtc----------tttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 78234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Original strand, 32807 - 32927
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32807 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgacttatgtgaaagatgtatgatgtttaaattgttgatacttcatattaatattgttatgttgtgaattgct 32906  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  32907 tgtgctgtttctgttgctgtt 32927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 65675 - 65769
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  65675 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 65769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 80674 - 80554
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| || |    
T  80674 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgat 80575  T
Q  111 tgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  80574 tgtgctatttctgttgctgtt 80554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 61759 - 61853
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  61759 tgttgttgaatatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 61853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 58866 - 58960
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  58866 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 58960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 36089 - 36198
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||| ||||||||||| |||     
T  36089 tgttgttggttatgtgaaatacttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatacttcataataatattgttatgttgtgaattgca 36188  T
Q  111 tgtgctgttt 120  Q
    ||||||||||    
T  36189 tgtgctgttt 36198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12379 - 12287
Alignment:
Q  13 ttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12379 ttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 12287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Original strand, 5251 - 5342
Alignment:
Q  14 tgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  5251 tgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 5342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 95
Target Start/End: Original strand, 80482 - 80566
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgat 95  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  80482 tgttgttggttatatgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgat 80566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 131
Target Start/End: Original strand, 80585 - 80621
Alignment:
Q  95 tatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  80585 tatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 80621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 57011 - 56861
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| |||| |||||| || |  |||| |||||    
T  57011 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtcgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgtttatgtgttgttt 56912  T
Q  121 -ctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
     |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  56911 cctgttgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggtctaagttgtaa 56861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 315
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  409 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtgaaagatgtttgatgtttaagttattgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 4022 - 4116
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  4022 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtttaatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttatgaa 4116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7711 - 7574
Alignment:
Q  25 tgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgttt-c 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||| ||||| |    
T  7711 tgaaatatttatatgccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgttgtttcc 7612  T
Q  122 tgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggt 159  Q
    | ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  7611 tattgctgttgaatattaatcaagttgcaagtgttggt 7574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 17562
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatg 77  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17628 tgttgttggttatgtgaaatatttatatgccttatgtggaagatgtatgatgtttaagttgttgatg 17562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 67449 - 67542
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  67449 tgttgttggttatgt-aaatatttatatgccttatgtggaagatgtttgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaa 67542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 170
Target Start/End: Original strand, 166426 - 166576
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||| ||||  |||||| |||    
T  166426 tgtgaaatatttatatgccttatgtggaatatgaatgatgttgaagttgttgatgcttatcattgatattgttatgctgtgaattgcttatgtgctattt 166525  T
Q  121 -ctgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
     |||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||  |||||||||    
T  166526 cctgttgttgttgaatattagtcaagctgcaagtgttggtctaagttgtaa 166576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6932 - 6854
Alignment:
Q  53 atgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaaatgcttgtgctgtttctgttgatgtt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6932 atgtatgatgtttaagttgttgatgcttcacattaatattgttatgttgtgaattgcttgtgctgtttctgttgctgtt 6854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 176136 - 176078
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176136 tgttgttggttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 168782 - 168724
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 69  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168782 tgttgttgcttatgtgaaataactatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagt 168724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 446645 - 446479
Alignment:
Q  34 tatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt-ttcattaatattgatatgttgtgaaatgct--tgtgctgtttctgttgatgt 130  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || |||||| |  ||||||||||||||  || |  |||| || |||||||| |||    
T  446645 tatatgcattatgtggaatatgtatgatgttgaagttgttattgtttattcattgacgttgatatgttgtgagctgtttatgtgttgcttctgttgttgt 446546  T
Q  131 tgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||||||| || | |||||| ||||||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  446545 tgaatattaattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaaa-atgttgttccaaagtatt 446479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 497588 - 497538
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgtt 73  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  497588 tgtgaaatatttatataacttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtt 497538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 497427 - 497387
Alignment:
Q  201 aaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  497427 aaagtattgaagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgt 497387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 6225 - 6294
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6225 tgttgttggttatgtgaaatatttatatggcttatgtggaaaatatacgatgtttaagttgttgatgatt 6294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 11565 - 11723
Alignment:
Q  42 ttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaat-attgatatgttgtgaaatgctt--gtgctgtttctgttgatgttgaatatt 138  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  11565 ttatgtgaaaagtgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgatatgttgtgagttgcttacgtgctgcctctgttgttgttgaatatt 11664  T
Q  139 gatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    ||| | |||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11665 gattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgt-aagatgttgttccaaagtatt 11723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 105135 - 105078
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 68  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105135 tgttgtcggttatgcgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaag 105078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21894 - 21820
Alignment:
Q  123 gttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaaagttgtaaagttgtcgttccaaagtatt 198  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21894 gttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgt-aagttgtctttccaaagtatt 21820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8969
Alignment:
Q  23 tgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcattaatattgatatgttgtgaa 105  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  9051 tgtgaaatatttatataccttatgtggaaaatgaatgatgttgaagttgtgaattcttatcattgatattgttatgttgtgaa 8969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8895 - 8851
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8895 ttccaaagtattggagtcataagttgttgatgttgtctaagttgt 8851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1129
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatat--gccttatgtggaaaatgtatgatgtttaagttgttgatgattttcatt-aatattgatatgttgtga 104  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  1225 tgttgttggtaatgtgaaatagttatatatgcattaattggaaaatgtatgatgttgaagttgttgttgattatcattgattattgctatgttgtga 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8036 - 7987
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8036 ttccaaagtgttggagtcttaagttgttgatgttgtctaagttgttgaag 7987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 2674 - 2723
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2674 ttccaaagtattggagccttaagttgttgatgttgtataagttgttgaag 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7812 - 7763
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7812 ttccaaagtattggagtctttagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 7763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 77867 - 77818
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  77867 ttccaaagtattggagtcgtaagttgttaatgttgtctaagttgttgaag 77818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1855
Alignment:
Q  199 ccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1897 ccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 18285 - 18327
Alignment:
Q  199 ccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18285 ccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtccaagttgt 18327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 93 - 47
Alignment:
Q  200 caaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  93 caaagtattggagtcttaagttgttagtgttgtctaagttgttgaag 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 36096 - 36146
Alignment:
Q  11 tgttgttggttatgtgaaataattatatgccttatgtggaaaatgtatgat 61  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36096 tgttgttggttatgtgaaatgttcatatgccttatgtggagaatatatgat 36146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Original strand, 5654 - 5703
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  5654 ttccaaagtattggagtcttaagttgttaatgttgtctaactcgttgaag 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 362777 - 362728
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtctaagttgttgaag 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  362777 ttccaaagtattggaatcttaagttgttaatgttgtctaaattgttgaag 362728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10534 - 10486
Alignment:
Q  122 tgttgatgttgaatattgatcaggttgcaggtgttggttcaagttgtaa 170  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  10534 tgttgttgttgcatattgatcaagttgcaggtgttggtctaagttgtaa 10486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 8130
Alignment:
Q  197 ttccaaagtattggggtcttaagtggttgatgttgtc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8166 ttccaaagtattggagtcttaagttgttgatgttgtc 8130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University